3K00A

Crystal structures of the gach receptor of streptomyces glaucescens gla.o in the unliganded form and in complex with acarbose and an acarbose homolog. comparison with acarbose-loaded maltose binding protein of salmonella typhimurium.
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
388
structure length
388
Chain Sequence
ELSGTVTFWDTSNEAEKATYQALAEGFEKEHPKVDVKYVNVPFGEANAKFKNAAGGNSGAPDVMRTEVAWVADFASIGYLAPLDGTPALDDGSDHLPQAAASTRYEGKTYAVPQVIDTLALFYNKELLTKAGVEVPGSVAELKTAAAEITEKTGATGLYLRGDDPYWFLPYLYGEGGDLVDEKNKTVTVDDEAGVRAYRVIKDLVDSKAAITDASDGWNNMQNAFKSGKVAMMVNGPWAIEDVKAGARFKDAGNLGVAPVPAGSAGQGSPQGGWNLSVYAGSKNLDASYAFVKYMSSAKVQQQTTEKLSLLPTRTSVYEVPSVADNEMVKFFKPAVDKAVERPWIAEGNALFEPIRLQMANVLSGETSPDEAAANTGDAYRKLLKDYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Acarbose/maltose binding protein GacH
publication title Crystal Structures of the Solute Receptor GacH of Streptomyces glaucescens in Complex with Acarbose and an Acarbose Homolog: Comparison with the Acarbose-Loaded Maltose-Binding Protein of Salmonella typhimurium.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces glaucescens
molecule tags Transport protein
total genus 138
structure length 388
sequence length 388
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k00A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k00A02
2Y7IA 4ZEBA 3P7IA 4ZEKA 5CMKA 5AA2A 3EHSA 1SI0A 4QFPA 4FECA 1D4NA 2XXUA 3T66A 3UA8A 2QMWA 2ANJA 3B7DA 1N7WA 4R9FA 4I62A 1FTKA 1B3EA 4PP0A 1DSNA 2GFEA 1B4ZA 4LUBA 1P1UA 2QPQA 3OO9A 2V84A 5KCJA 1WVJA 2DVZA 1DMBA 3C34A 4JSDA 3V8XB 3FVNA 4OFJA 1S50A 3H3GA 5EYFA 4MH5A 1SVXB 2UYFA 2V3UA 4GFRA 3E3KA 2YPNA 4YB7A 3MZBA 4KYSA 2AYSA 3RUMA 3ILTB 4ZECA 4XKPA 4O3BA 3B6TA 2OWSA 2QL3A 2P2AA 1AL3A 3PPNA 2NVUB 1QW0A 3M3KA 2VGQA 1R9QA 2GHBA 1JW5A 1BTJA 1MXVA 1TFAA 3G3FA 1FQCA 4H65A 3I6VA 4KHZE 2HAVA 2QS4A 3VVFA 1NNFA 1B32A 4KFQA 5AE4A 3IL1B 4NTLA 1XVXA 3CFLA 3UIFA 4AB5A 2HZKA 2HZLA 4FIMA 4OVJA 5EHSA 2PT2A 1JEUA 3N6UA 3TAJA 2XD2A 1B2HA 4GRKA 2XX9A 2UVIA 2UVJA 1A7LA 2B3FA 4H8JA 2R9JA 4HS7A 1RYOA 3VLWA 3IO6A 4FJPA 4I1DA 4XXUA 4BDOA 1FTMA 2H9BA 1UIUA 1XS5A 3KOTA 4YB5A 4LP2B 3BFTA 3VE1B 5CMMA 3FGSA 4JSOA 1B5JA 3FIRA 3EQ1A 4JDFA 4F29A 2ZXTA 3DM0A 1NH7A 1PB7A 3TTRA 3K00A 3DP6A 4P0GA 1GTKA 1PBPA 5CC2A 2VHAA 3Q25A 1RKMA 2H99A 5H8QB 1H44A 4O3CA 3LR1A 5AA2D 3GLBA 3TZAA 3U72A 4KPTA 3S9EA 2LAOA 5DVJA 4Q8RA 3MPKA 4HCYA 4BDRA 4G8MA 2F6GA 1Y4CA 3L6GA 4RY1A 2NOOA 3OO7A 4M4GA 4G4PA 1IIWA 3VV5A 4F1YA 3MVYA 4PFYA 1IXIA 1Q35A 4QFNA 3CIJA 3H6VA 1US4A 3TCGA 3OO8A 2Z8EA 3TTMA 3IX1A 3LC8A 5I57B 5DVFA 1H3DA 1VR5A 4Q0CA 3KN3A 2OBGA 3BFUA 3FD3A 1H45A 4R73A 1VFEA 4AQ4A 1D9YA 1QVSA 3O2AA 1N3WA 4R6KA 3OXNA 4F39A 2Y7RA 3O29A 3C32A 3KJ7A 2DS9A 2OWTA 3HV1A 1A55A 1GGGA 5IKBA 2ZNTA 3LUYA 1SYIA 5HBCA 1FQEA 1J1NA 2OJTA 1FQAA 1F9BA 3U92A 3TODA 2I49A 3EHTA 1H76A 2QS2A 3MPLA 2IEEA 3T9VA 2XXPA 3PMXA 4YU0A 3PUXE 5H8FB 3DP4A 4ND9A 3SDFA 2QS1A 3SETA 4OMBA 4G68B 3TCHA 3VDFA 3IR1A 5L8DA 4E0XA 1QKAA 3FJGA 3ILUB 4C1TA 4XTCQ 1YCJA 4GL0A 5L9MA 4LZ5A 1A8FA 1OVTA 3RPWA 3BKIB 2X26A 3IO4A 3N5LA 5H8NA 1JQFA 2F97A 5ICQA 3VVEA 1OLCA 3VXBA 1NNKA 3FUZA 1ATGA 1WODA 4F18A 5FTHA 3SEVA 2PVUA 1D9VA 3S9MC 1ZJLA 4LQ2A 1HSLA 4KYEA 1PBQA 4OZ9A 1OIBA 2D5WA 1Y3PA 3IB0A 3H4ZA 3QAXA 3H6TA 3HPIA 4X48A 5H8QA 4OYVA 1TT1A 3U94A 2RC7A 2PX1A 1DTZA 2CZLA 2D21A 4R74A 1D3KA 4PFWA 4QFKA 3SESA 2GHAA 2WKYA 4K3FA 4PE5B 3A3UA 4KYDA 2XXTA 1LFGA 2KLFA 1JW4A 2HXWA 4GL8A 4IGTA 4R2BA 1Y1ZA 3DLNA 4YMBA 5AA1A 1B4HA 4H67A 3VLVA 1B05A 4ESXA 1NL5A 4LZ7A 4DE8A 4WEDA 5B70A 1O7TA 3UP9A 1SW5A 3RLFE 1LGBC 1LLSA 3Q26A 1B7UA 3PUYE 3KOSA 3K6XA 1PEBA 3EF7A 3KFMA 4DCYA 1P1NA 5I57A 1PDAA 1JNFA 3M3FA 3S9NC 1B7HA 4X9TA 3U93A 4MLVA 5ISUA 4QRZA 4RXLA 2V25A 4XKRA 4L17A 4IO6A 5LOMA 1LSTA 4Q5TA 4H1XA 3TTKA 1MPCA 5J1DA 3CI8A 4NE4A 1NH8A 4KD5A 4RNSA 3TMGA 2UVHA 1SW2A 2Q89A 5JK4A 1R1NA 5HPQA 2XD3A 1I69A 2RCBA 5B7DA 1JETA 3EPEA 4YKIA 2PBWA 4XKQA 4H8IA 2O1LA 5H8FA 2I6EA 4JWYA 4O3AA 3FVOA 1B0HA 3VVDA 1ZTYA 1Y3QA 2F7AA 4FE8A 4G68A 4IY6A 2DWAA 2Q9TA 4P0IA 4NF4B 2Y84A 2XHDA 2E0SA 2GRVA 3KSXA 1MDP1 3PU5A 4YMAA 4JXIA 4BDNA 4GOTA 4ZEFA 3B6WA 1LAXA 1FQBA 1HSJA 4R75A 3KJTA 4EF1A 4YKJA 4WXJA 1FW0A 3TEPA 3HSTA 2Z22A 4IO4A 2AL5A 1TFDA 3H6WA 1ELJA 1UIVA 2DVCA 1FTLA 1A8EA 2OCUA 4ZE9A 5L9OA 1B52A 2XXRA 4FORA 1NFTA 3I3VA 4TOZA 3KEIA 4EUOA 1MQJA 1JVXA 3MUQA 1AH5A 3EHUA 4N07A 2H4IA 5ITPA 3E4RA 2O6AA 3CR9A 3S9LC 1VSOA 2DE4A 2V93A 1URSA 3FV2A 4FEBA 4POWA 4U4XA 4U2RA 4X1BA 2P1SA 5A5XB 4RK2A 1S7YA 1B1HA 2BJJX 2Q2CA 1UQWA 2RKMA 5I2NB 5TP9B 1Y20A 3UGWA 2O7UA 3KN7A 2REJA 1LAFE 3EN3A 5CBSA 4G77A 3U8QA 3O28A 4OFOA 3T9HB 1B46A 3TKDA 3O6GA 1MQGA 4ZEDA 1R9LA 4KI0E 4NF6A 3TCFA 4OFLA 3C4MA 1LFIA 1P1QA 3KSJA 4NF5B 1B6HA 3UK4A 2QSXA 5AA4B 4ZDMA 3SEXA 2DQVA 3S2VA 3GZGA 5I59B 1XOCA 3N6TA 1AMFA 4LA9A 3ZKLA 1B7ZA 5ELVA 1MDQA 1JVYA 3G3GA 5IAIA 1IXGA 1FQFA 4F2OA 1SQYA 3PGFA 3MVZA 4KCDA 4NF4A 3K1MA 3IOVA 1S9TA 4F3SA 4POXA 1AIVA 3RNNA 3TQWA 4OTEA 3K6VA 4IB2A 2RINA 2VD2A 3KBRA 2QMXA 2H5YA 4Z0IA 1OQHA 5BWJA 3K0VA 4H5GA 4ELPA 3MVWA 1CE2A 3RN8A 1B1XA 2A5TB 3GBBA 3IOWA 3S4UA 3CFXA 5M2VA 1EZ9A 4IO5A 2ABHA 4EQ7A 3SEYA 1ZU0A 1DTGA 2RC8A 3LSXA 2OZZA 1N7XA 4E0WA 4F3PA 1MXWA 3VXCA 2F34A 1EZOA 1MH4A 3Q29A 1N84A 3TTLA 4U1OA 1SW4A 1LB9A 4JWXA 3LSLA 3WAEA 2O84X 3CG3A 3SKPA 4PFTA 2ZYMA 4ELRA 5EHMA 3H7MA 4R6YA 1DOTA 4NMYA 2ESNA 3R7XA 4UACA 2Q2AA 5A5XA 3I5OA 3PV0E 2G29A 4H0WA 4ZZAA 5CMCA 4JB7A 3MWBA 5I2NA 5TP9A 5DYHA 5K2YA 1UTBB 5I2KB 2F7BA 2I4CA 5TU0A 3TQLA 3Q28A 2Z8DA 4G8NA 2I3VA 3OO6A 1LAHE 4H5FA 4AB6A 1B3FA 4NF5A 3K6WA 5AA4A 2HQ0A 1NKXA 4EDPA 1DPEA 1MXXA 4QF9A 4OWDA 1XC1A 4DXBA 2DYXA 1B5IA 1PB8A 3OSRA 1P1OA 2Y7PA 5I59A 1QJMA 1IQ7A 1B3LA 4I9DA 4EXKA 4YZZA 5KZTA 1SW1A 3M8UA 3HN0A 4HW8A 4YKPA 5CM6A 1QKBA 3KN8A 2DXRA 4DIGA 5L9SA 4F22A 1A99A 4RA1A 4EQBA 3TFLA 3C31A 4P11A 3H6UA 3MP8A 1HSEA 4EXLA 2ONKE 1MY2A 4YKKA 4OESA 5H8HB 1P1WA 4OHNA 5I56B 4DXUA 5ICTA 2ZMBA 3FASA 1POTA 4ELOA 1FTJA 3JV9A 2I48A 4ZZEA 1JW1A 2Q88A 2P0SA 2ZYOA 2QRYA 1CB6A 2I3WA 2O7IA 3K1NA 1SI1A 4KR5A 3UN6A 3FZVA 1B0LA 2XXHA 4G2ZA 1P99A 1M5DA 1MXYA 3PPRA 2A5TA 2HAUA 5K2XA 5CMBA 3IK6B 1Y3NA 4HTGA 1LBBA 1Y9UA 2UXAA 4OQOA 4N13A 4TLMB 2DWJA 2FNCA 1O64A 1FQDA 3QIMA 2H25A 3IOTA 5TPAB 1Q1KA 4U21A 3SEWA 3E9XA 1I6AA 4DZ1A 4ESWA 5DT6A 3PMVA 3CSBA 4ISUA 1GR2A 4OEUA 1LFHA 3C35A 2R6GE 5KDTB 3RTFB 1FTOA 1LCFA 3FXUA 3G3KA 1QUKA 4THIA 3QK6A 5CBRA 1XVYA 3PPOA 2M8CA 1Y1MA 4C1UA 4QSCA 1UTBA 3CG1A 5I2KA 3RT6B 4U1ZA 3PPPA 1AOVA 1M5FA 4LATA 3R6UA 4MLQA 1VE4A 4GIZA 2QS3A 3PD9A 4F1UA 4RPOA 4GXSB 3L6HA 3ODBA 1R6ZA 3H06B 3V89B 1LB8A 4TQUQ 3SERA 4F19A 1MPBA 3MQ9A 1NNPA 1USYE 3QUFA 2HEUA 3TPAA 5I58B 5I84A 4FAJA 4YICA 2XXWA 4F2QA 3PUVE 4F1VA 2DSFA 2THIA 3F11A 4IGRA 2OK2A 1I6BA 2F36A 4IO3A 1N0TA 2O68A 1MXZA 4YB6A 1N76A 1M5EA 4TLLB 1IXCA 2XXQA 4UA8A 4BDMA 3G3JA 1IITA 3Q27A 5HM4B 3AXFA 4OERA 1JEVA 5H8HA 5I56A 1MQIA 3IAZA 2QJEA 1BIYA 2O69A 2VD3A 2IA4A 3G7WA 3WAFA 2RCAA 3T96B 1RYXA 5FHOA 1IEJA 2R71A 3HO7A 1URGA 1OMPA 3T22A 2ONSA 3ECRA 3IORA 3OD7A 3ZKKA 2F35A 4QFLA 3FJ7A 1ANFA 2XXVA 3RTWB 2GH9A 3W9WA 2B65A 2Y7WA 2DXYA 5TPAA 3FXRA 3KZGA 3A09A 2AL4A 4DDDA 5AA3A 3USDA 5DVIA 3T93B 3TTNA 2ONRA 1BKAA 1B5HA 4ELQA 3DP8A 3KG2A 3PUWE 4KQPA 2NWJA 3W9VA 1OLAA 2DWIA 3O6HA 4F31B 5KDTA 4JBZA 1N04A 3U1OA 4ONYA 2PT1A 4MFIA 3FVKA 3FXQA 2DOJA 1EH3A 3D4GA 1VFDA 1PC3A 3FVGA 1PB9A 3A3CA 2D3IA 2VP1A 3PMWA 3BBRA 4R9GA 1US5A 2A5SA 2DE3A 3TYHA 1XHYA 4FATA 3OSQA 3MC2A 3PD8A 2V3QA 3THIA 2F5XA 3CSGA 3K02A 3MBPA 1SD3A 4PQJA 5H8NB 4NWDA 1WDNA 2X7PA 4R6HA 3MP6A 1B58A 3G3IA 4RYAA 1MRPA 1UTHB 5ITOA 1B9JA 3HHFA 3MAMA 2NUVA 4GD5A 5I58A 4GF8A 1ZLQA 1MXUA 4LVQA 2RC9A 4X1DA 3ZSFA 4RPNA 3K01A 2B3BA 1N3XA 5JTYB 1BLFA 3JYRA 3O66A 1NNTA 1POY1 4M1VA 4BLAA 1XT8A 3OOAA 2I4BA 1OVBA 1I6QA 3V5AA 3K4UA 4NEDA 4XKNA 4OXVA 3OEMA 3LSFB 3R26A 1B3GA 5CI5A 1T0KA 2HCAA 2REGA 2ALUA 1MM7A 4WKMA 3CFZA 4I8CA 3MJNA 2E1SA 5H8SA 4LONB 3O97A 3QXMA 2V3TA 1EZPA 4IO2A 4LQ5A 2XX7A 4F3GA 1MS7A 4R72A 2YLNA 4H6DA 4XIGQ 1L5TA 3RT8A 2UVGA 4YAHX 4DXCA 3W15C 1QULA 4GLIA 4NF8B 3V83A 2O1MA 4EQ9A 2Q8JA 4PETA 3K2DA 4GWOA 2W7YA 3PUZE 3K1PA 1Z7ME 5F7VA 1OQGA 4EF2A 3VLUA 1Z7NE 4MBPA 3C33A 2UYEA 1DPPA 2ZNSA 4RK9A 1URDA 5FHMA 1QUIA 2ZYKA 1ZMGA 3MZ1A 3IJOB 3O9PA 1B40A 2XXYA 4DCXA 1MQDA 3MZ9A 2Z8FA 5FHNA 1M5BA 5DTBA 2XX8A 3N26A 3N94A 3TUSA 3KGCA 1IXHA 2F7CA 3RGYA 4QSDA 2Z23A 4Q30B 3MVXA 3QSLA 5DEXB 3OENA 3LBSA 3IB2A 3GXAA 1B51A 3LSWA 2XXXA 5AA2B 2I58A 2H98A 4JWOA 3QUJA 4G68C 3CRBA 4WEPA 2Y7KA 3D4CA 2XXIA 1MG1A 1MY0A 2DWHA 4U23A 4QSEA 3JZJA 3TDJA 3UORA 1YAEA 1GVCA 3SEUA 2ZYNA 2I0CA 3O6IA 4IY5A 4QFOA 1IZ1A 2DP8A 4R2FA 3OMBA 3GBAA 4BDQA 1A40A 3H03A 2PMSA 3FJMA 1TWYA 1UTHA 5KCJB 3VFJA 1MM6A 2YJPA 3C9HA 4OETA 2AIXA 4PFUA 3B6QA 1B3HA 3IB1A 1O63A 3IOUA 1MY1A 2X7QA 1MPDA 3HCQA 3HHGA 5JTYA 1LBCA 4Z7EA 2I0BA 4FEDA 1GV8A 2O51A 1SDXA 1YPNA 2DE2A 4MF3A 1MH3A 2FA7A 4GXAA 2CMOA 2PYYA 3TELA 3PPQA 5JEIA 3RY3A 3RQTA 3ONMA 3C36A 4QHQA 4BDLA 2HFBA 3OEKA 1IUDA 1TXFA 1ZIUA 4HCWA 1BP5A 4OENA 3CVGA 4RJZA 4G8HA 1QUJA 4GQOA 3G3HA 4ZS9A 4GVOA 4DLDA 1YTVA 5F1QA 3M3LA 4ZE8A 2VOZA 1USYH 1Y4TA 2RF1A 3IJXB 1H43A 2F78A 5BUUA 4N6PA 3E13X 4NF8A 2OLBA 4IO7A 4NF6B 3MP1A 1II5A 2F8DA 4F3BA 2F6PA 3K6UA 3DELB 1A54A 3ZS6A 1NMUA 4LZ8A 3FV1A 1EU8A 3T9XB 2ZNUA 2G93A 4U22A 5FTIA 1SBPA 1MY4A 4ECFA 1FCKA 1LAGE 3T9UA 1ZBMA 4C0RA 1SYHA 3QYTA 4OEVA 2FYIA 3OELA 1M5CA 4U4SA 1ZKBA 1MQHA 1KWHA 3FATA 2NXOA 3MW0A 4NWCA 5CRYA 1LCTA 4ZEIA 5DEXA 4KCCA 1MY3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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