3K00A

Crystal structures of the gach receptor of streptomyces glaucescens gla.o in the unliganded form and in complex with acarbose and an acarbose homolog. comparison with acarbose-loaded maltose binding protein of salmonella typhimurium.
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
388
structure length
388
Chain Sequence
b'ELSGTVTFWDTSNEAEKATYQALAEGFEKEHPKVDVKYVNVPFGEANAKFKNAAGGNSGAPDVMRTEVAWVADFASIGYLAPLDGTPALDDGSDHLPQAAASTRYEGKTYAVPQVIDTLALFYNKELLTKAGVEVPGSVAELKTAAAEITEKTGATGLYLRGDDPYWFLPYLYGEGGDLVDEKNKTVTVDDEAGVRAYRVIKDLVDSKAAITDASDGWNNMQNAFKSGKVAMMVNGPWAIEDVKAGARFKDAGNLGVAPVPAGSAGQGSPQGGWNLSVYAGSKNLDASYAFVKYMSSAKVQQQTTEKLSLLPTRTSVYEVPSVADNEMVKFFKPAVDKAVERPWIAEGNALFEPIRLQMANVLSGETSPDEAAANTGDAYRKLLKDYK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of the Solute Receptor GacH of Streptomyces glaucescens in Complex with Acarbose and an Acarbose Homolog: Comparison with the Acarbose-Loaded Maltose-Binding Protein of Salmonella typhimurium.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Acarbose/maltose binding protein GacH
source organism Streptomyces glaucescens
molecule tags Transport protein
total genus 138
structure length 388
sequence length 388
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k00A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k00A02
2O68A 2H99A 3C4MA 1FQEA 3MVZA 1RKMA 3RTWB 3IK6B 1FQBA 2ZNSA 3TZAA 4IGTA 5CBRA 4FEDA 3JZJA 4UA8A 1TFDA 3K1NA 4R2BA 2UVJA 2Q2CA 3UGWA 1B4HA 3RLFE 1HSEA 4DXUA 3FJ7A 3H03A 4RYAA 1US5A 4XKQA 2RINA 5KDTA 3PD8A 2I0BA 1T0KA 5H8HB 3G3JA 3IOVA 4RK2A 2Q88A 1XS5A 4IO4A 3S2VA 3M3KA 3S9NC 3O6IA 2DYXA 3TQLA 4HCYA 1VFEA 4ZEIA 2OZZA 3K6VA 4ELRA 2A5SA 3RQTA 1JNFA 1MY0A 1PB9A 1D3KA 3S9MC 2NVUB 3N6TA 3C33A 4QFNA 2B3BA 3OENA 1XC1A 3G3GA 4FJPA 3KOSA 2OLBA 4GF8A 4IY5A 2CZLA 3OO7A 4HCWA 2H4IA 4KI0E 1P1OA 2V3UA 1FTMA 4E0WA 3CG1A 1JEVA 4WEPA 3TTNA 1XVYA 3DLNA 4RJZA 5L9MA 5I56B 4R9GA 1LB9A 5H8FB 1F9BA 2D3IA 3MVXA 1B3HA 1B46A 1B7HA 3DP4A 3DM0A 4F3PA 2QMWA 2Y7RA 4GXSB 1EZ9A 3TTKA 1B32A 4EXLA 1DTZA 3K1PA 2H98A 2DOJA 2B65A 4EF1A 4RNSA 4Q0CA 2F6GA 4ZZAA 1Z7ME 2PVUA 2XXRA 4F39A 1B1XA 2ZNUA 3GXAA 1M5DA 4HS7A 1QUKA 3U72A 3U8QA 1NNKA 3K0VA 3FASA 2ZXTA 3RY3A 5I58B 1R6ZA 2DSFA 2I4CA 5I59A 1FTJA 1AIVA 3GBAA 1PBQA 3IB0A 1EZOA 2ONKE 2HEUA 5AA4B 4U1ZA 4LZ5A 4ZE9A 4WEDA 1HSJA 4LA9A 4PFYA 3Q28A 1GTKA 4JSOA 4F22A 3BFUA 4KHZE 4Q5TA 4G8HA 1MG1A 5TPAB 2QL3A 5CMCA 2P0SA 3USDA 3VE1B 2R6GE 4ZEDA 4DDDA 4QF9A 4KR5A 3B6QA 2AYSA 3GBBA 5AE4A 3ODBA 1N76A 4BLAA 4C1TA 3HO7A 4G4PA 2UVGA 2R71A 3KJTA 1I6BA 3S4UA 4R6KA 2ONSA 1ELJA 3T9VA 4JWXA 1JVXA 4FEBA 4BDNA 3E4RA 4G2ZA 1EH3A 1NH8A 5H8HA 1A40A 3U1OA 3MW0A 3CVGA 3IL1B 3H6UA 5TU0A 3TYHA 4GL0A 1LFGA 3IB1A 5M2VA 3M3LA 3EPEA 1SW5A 4ELQA 2R9JA 3ILTB 3ZS6A 3ZKLA 3FXRA 3HHFA 2XXIA 3H4ZA 1WDNA 5H8SA 3FATA 1Z7NE 1JVYA 4EF2A 5L8DA 4NEDA 4KYSA 1PDAA 2ZMBA 1SQYA 3TKDA 2Q8JA 3PUWE 1YCJA 5CM6A 3O6GA 1GR2A 4BDQA 1IXHA 3IJOB 1N3WA 3R26A 4POWA 1DPEA 5FTIA 1USYE 1PB7A 4LQ5A 3N5LA 1A8EA 4P0IA 1R9LA 4N07A 4POXA 1OQHA 1PBPA 3W9WA 4MH5A 3FVKA 3MUQA 5H8FA 5A5XB 2LAOA 3EHSA 1XVXA 1ZU0A 4RPNA 3QUFA 3EF7A 5FHMA 4X1BA 3LSWA 2B3FA 1SI1A 3HCQA 1LCTA 4Q30B 1JETA 4OZ9A 4TLMB 4DE8A 4P11A 1H76A 1UIUA 4YAHX 4OTEA 4AB6A 4QSEA 1B5HA 1SD3A 4G8NA 1NNTA 3CSBA 4EQ9A 1POY1 5I2NB 1MDQA 4NF6B 3DP8A 2ALUA 3TUSA 4H8IA 1P99A 3FUZA 4E0XA 1XT8A 1ZLQA 3IO4A 1MY4A 1HSLA 1J1NA 1MY2A 1Y9UA 3UIFA 1O7TA 4QHQA 5I57B 4ZEBA 4H67A 3SERA 1AH5A 4KFQA 1H43A 4OHNA 5FHOA 1H3DA 3H7MA 2A5TA 3O28A 4YB5A 2H25A 3LSFB 1MXZA 3IO6A 2YLNA 2I3WA 4N13A 1URGA 1UTBA 5F7VA 2DQVA 3FVOA 3T66A 3OEMA 3PMVA 4JDFA 2ZYOA 1YTVA 5TP9B 2O1MA 4NF5B 3B7DA 3ECRA 1QKBA 2FYIA 3PPOA 3QIMA 1B1HA 3RUMA 1MM6A 2XD3A 4RXLA 1YPNA 2I49A 2IA4A 4GIZA 1ZMGA 1MY3A 3OSRA 3R6UA 2V3QA 3CRBA 3FV1A 4JWYA 3MPLA 1UQWA 2GFEA 1I6QA 4EDPA 2GH9A 2PBWA 1NL5A 3W9VA 2D5WA 3OELA 2NXOA 4RA1A 2XXHA 2PMSA 3WAEA 2VP1A 3FXUA 2O7UA 3V89B 1FQAA 1Q35A 1B05A 4ESXA 4F1VA 3VV5A 2Z23A 1SW4A 2E0SA 2X26A 5I84A 5CMKA 3IOWA 4KCDA 1QJMA 3BBRA 1IXCA 2G29A 2DWJA 4PE5B 4OETA 1A7LA 1ATGA 4TQUQ 2I3VA 4N6PA 1B6HA 4EUOA 1SI0A 2P2AA 3PUZE 2V25A 1EZPA 3MAMA 4C1UA 4KYEA 2X7PA 1SVXB 1OVTA 5DVIA 4JBZA 4YMBA 5HPQA 1JQFA 5A5XA 3KJ7A 4UACA 4FE8A 5DEXB 4TOZA 4H65A 1NFTA 2FA7A 4RPOA 3O97A 2O69A 3PU5A 4Q8RA 3MWBA 1OQGA 2O7IA 1URSA 3MPKA 4NWCA 2O1LA 3UP9A 3KOTA 4F3BA 2RCBA 4AB5A 1A54A 2Z22A 4U23A 3I5OA 5ITOA 4ESWA 2AL5A 1Y4TA 2QPQA 4MLQA 2QRYA 4QSCA 4IY6A 4ND9A 1B3LA 2RC7A 2UVIA 3E13X 3VLVA 3OMBA 1AMFA 2W7YA 1QUJA 4GD5A 3E9XA 3HV1A 4NE4A 3I3VA 3KEIA 4FIMA 1IUDA 1LAFE 1AL3A 4LATA 5B7DA 4LVQA 2OWSA 4R72A 4KPTA 3M3FA 2BJJX 3OOAA 3UA8A 3KN7A 4G68A 4GFRA 3JYRA 5TP9A 1Y4CA 4NF5A 4U4SA 1JEUA 2HQ0A 3TEPA 4R2FA 1LAHE 2IEEA 3C9HA 4NMYA 4YICA 5DT6A 5AA3A 2Z8EA 5H8NB 2V3TA 1B4ZA 3RTFB 5IAIA 2VHAA 1MPBA 3MJNA 1B0HA 2Y7IA 3EQ1A 1DPPA 2X7QA 4AQ4A 4XXUA 2O84X 1UTHB 1YAEA 3T96B 1LBBA 2VD2A 5ICTA 5LOMA 4YMAA 3TMGA 3KGCA 4QFKA 4YKIA 2QSXA 3L6GA 4U4XA 3UK4A 2P1SA 2I4BA 2XXYA 3C34A 1Y3PA 1UIVA 3DELB 5CMBA 2GHAA 1N0TA 2F78A 4BDOA 1TWYA 3O29A 1SW2A 2M8CA 3S9EA 3B6TA 5HM4B 2I0CA 4F3SA 5AA2A 1N84A 4I9DA 2F6PA 1US4A 3ZKKA 1MQGA 2QS3A 4IO6A 1Y3QA 3MQ9A 3SDFA 3PGFA 4DXBA 1JW4A 3CG3A 1B52A 5AA1A 1LAGE 2ZYNA 3VDFA 2OWTA 3BKIB 4DIGA 1Q1KA 3MVYA 1NNPA 4QFLA 1Y20A 3KG2A 5DEXA 1B3EA 3SEXA 4I1DA 4NF4B 2PT2A 2E1SA 4XTCQ 4GLIA 3O6HA 3T9HB 5JTYB 2QS2A 2F7BA 4LONB 3SEVA 2DS9A 4P0GA 3Q26A 1XOCA 4H8JA 1NMUA 4KCCA 4YZZA 3CI8A 3O9PA 3EHTA 4GVOA 3FIRA 4DXCA 3KN8A 2XXQA 5DTBA 3V5AA 5ICQA 5DVJA 2H5YA 4ZZEA 2DVZA 3K6WA 4QFOA 2QMXA 1B5IA 1LB8A 5JEIA 1SDXA 3G7WA 3H06B 4F31B 1A99A 3FVNA 2F8DA 2DVCA 3IOTA 1P1QA 4O3CA 5ELVA 4NF8B 4QSDA 2GRVA 2OCUA 3ZSFA 2QS4A 2VGQA 2ZYMA 4XKNA 4OFLA 3C35A 4WXJA 1MH3A 4IO7A 1XHYA 5I56A 1ZIUA 1MM7A 3U92A 4YKPA 1DSNA 1MY1A 3OSQA 5F1QA 3VXCA 3FJMA 2RF1A 2UYFA 2YPNA 4DCYA 1P1WA 2XXTA 1IXIA 1D4NA 4ZS9A 1IIWA 2Q9TA 4PFWA 4M4GA 1SYIA 3OO6A 2DE2A 1FQDA 5KDTB 4RK9A 3Q25A 4YKKA 2XXPA 5I58A 5DVFA 2I6EA 3SETA 2QJEA 5FHNA 4OYVA 2RC8A 3UORA 5BUUA 3RPWA 5AA4A 2XHDA 1Y3NA 3D4CA 1B3FA 4IO5A 4MF3A 4YKJA 1LAXA 3SKPA 2Y7PA 5TPAA 3K00A 1JW1A 1QVSA 4OEVA 3A3CA 3TPAA 1N04A 4PFUA 4C0RA 4R6HA 3VVFA 2VD3A 3E3KA 4R9FA 3S9LC 1JW5A 1LFIA 1WVJA 4ONYA 1CE2A 1L5TA 4X1DA 1R1NA 3GZGA 2DE3A 3PPQA 3K2DA 2Q89A 1QKAA 3FVGA 4NF4A 3PUYE 1MS7A 3GLBA 3IOUA 3Q27A 1MRPA 4DZ1A 3HPIA 3VLWA 1B5JA 2FNCA 1B51A 3PMWA 1PC3A 4DCXA 1P1NA 2UYEA 5CC2A 5BWJA 4R75A 3U94A 4ZE8A 4F1YA 3K6XA 1H44A 1NNFA 4Z7EA 4HTGA 1SYHA 1LLSA 3PPPA 4IB2A 2OBGA 1LGBC 1PEBA 2HZKA 1EU8A 1VR5A 5EHMA 4OESA 4OENA 4L17A 4KQPA 2XXWA 4LP2B 1Y1ZA 4U1OA 4IGRA 4O3AA 5HBCA 2RCAA 1QULA 2RKMA 3V8XB 3D4GA 2OK2A 4ZEFA 4BDLA 5I59B 1BIYA 1SBPA 2V84A 4OWDA 1TXFA 3K1MA 5EYFA 1CB6A 3H6TA 3TODA 3TELA 1H45A 1KWHA 4NTLA 4U2RA 4R73A 4OMBA 3IORA 3TFLA 4I62A 1MQDA 4F29A 2NWJA 3M8UA 3MVWA 2DXYA 3TQWA 3ONMA 2F34A 3PD9A 3MP1A 3LSLA 5K2YA 5EHSA 1N3XA 4F1UA 1TFAA 4GWOA 2REJA 4NWDA 1BKAA 3RGYA 4QFPA 5J1DA 4ECFA 2F5XA 1MDP1 5I2NA 4NF6A 4OVJA 3K6UA 1FTKA 3C32A 3MZ1A 4FECA 1FQFA 5AA2D 1DOTA 5I57A 2XXVA 3MC2A 3JV9A 5CRYA 4ELPA 2F7CA 3PPNA 4PFTA 3QK6A 3A3UA 2XX8A 4F2QA 2RC9A 5DYHA 4H1XA 1QUIA 3PUVE 3HSTA 3PMXA 3VVDA 3IR1A 2DWAA 2ESNA 1FTLA 4I8CA 3TDJA 1D9YA 2F97A 2Y84A 5H8QB 4OFOA 2ABHA 3VLUA 2HAVA 4F3GA 2PT1A 3LR1A 4JXIA 3LC8A 2YJPA 1B40A 4OERA 1FCKA 2F7AA 3I6VA 2HXWA 3H6VA 1I6AA 4M1VA 1NKXA 4IO2A 2XD2A 3TCHA 2DXRA 3TAJA 1A8FA 4ZECA 1S50A 3G3FA 4ZEKA 3LUYA 3F11A 2XX7A 1N7WA 1S7YA 1D9VA 2O51A 1S9TA 4LZ7A 3PUXE 1BTJA 2HFBA 2KLFA 3THIA 1ANFA 3RN8A 3IAZA 1LSTA 5K2XA 3T9XB 3OXNA 1O64A 4GL8A 3IJXB 4F19A 2ONRA 2GHBA 2I48A 1LBCA 3K01A 4XIGQ 3IB2A 1IQ7A 3LSXA 4MLVA 3MZBA 5CBSA 1N7XA 2DWHA 1B7UA 4ELOA 2A5TB 2THIA 3V83A 1VE4A 1R9QA 2AIXA 4LZ8A 4FAJA 3RT6B 3EN3A 3U93A 1UTBB 4FATA 5KZTA 2DE4A 3CFLA 3AXFA 1ZTYA 1MXXA 1P1UA 4TLLB 5L9OA 3T22A 4U21A 4WKMA 2Z8DA 4H5FA 2REGA 3PV0E 3BFTA 2Q2AA 3QYTA 3CSGA 3TTLA 5L9SA 1GV8A 3T93B 3O2AA 1B0LA 1OMPA 4KYDA 4XKPA 3G3KA 3OO9A 1MPCA 1RYOA 4H6DA 1MXYA 2WKYA 1B3GA 3ILUB 1MXUA 2ZYKA 4OQOA 4R74A 2XXXA 3CIJA 4JSDA 3H3GA 4OXVA 1GVCA 3QUJA 2NUVA 3N26A 1OVBA 2UVHA 1MQHA 4PP0A 3LBSA 3B6WA 3W15C 1LFHA 1M5CA 1IEJA 5IKBA 2V93A 4OEUA 1II5A 4MFIA 2Z8FA 5H8QA 4BDMA 2ZNTA 3KN3A 4GOTA 4YB7A 1USYH 3TTMA 3OEKA 2CMOA 1BLFA 2O6AA 4F18A 1M5EA 5CI5A 2Y7KA 5KCJB 3CFZA 5I2KB 3IX1A 4RY1A 2ANJA 1URDA 3K02A 3L6HA 2HAUA 2Y7WA 1I69A 1FQCA 3T9UA 1TT1A 1AOVA 3CFXA 5H8NA 3A09A 4THIA 4LUBA 2PX1A 1LCFA 2HZLA 3G3HA 3WAFA 4DLDA 4ISUA 4GQOA 3KZGA 2XX9A 4YU0A 5ITPA 1A55A 1UTHA 1IZ1A 1B7ZA 4YB6A 2NOOA 1B58A 3DP6A 4IO3A 3SESA 4Z0IA 3MP8A 3N94A 5CMMA 2G93A 3TTRA 2VOZA 1NH7A 2DWIA 1POTA 5FTHA 3UN6A 5ISUA 3KFMA 3RT8A 2XXUA 3VVEA 1OIBA 4G8MA 3R7XA 2F36A 3FGSA 3TCFA 4F2OA 3C31A 1VSOA 1MXWA 4MBPA 3PPRA 1VFDA 4G68C 3SEYA 3Q29A 3C36A 2H9BA 3QAXA 4O3BA 4JB7A 3QXMA 4EQBA 4QRZA 1IXGA 2QS1A 1PB8A 3OO8A 3SEWA 2D21A 4GXAA 3K4UA 4X48A 1QW0A 3KBRA 1BP5A 4G68B 4PETA 2I58A 1GGGA 1MQJA 4U22A 3MBPA 3N6UA 4PQJA 1ZBMA 3FJGA 5JTYA 4X9TA 1DTGA 3CR9A 4EQ7A 1OLCA 1B2HA 4H0WA 1Y1MA 2OJTA 3P7IA 1ZJLA 3H6WA 3OD7A 1IITA 4BDRA 1ZKBA 4FORA 3O66A 3MP6A 3SEUA 2AL4A 3VFJA 1B9JA 1MXVA 3G3IA 4HW8A 4KD5A 1MH4A 1RYXA 3HN0A 4H5GA 3VXBA 3EHUA 4EXKA 1DMBA 4ZDMA 1M5FA 1MPDA 1FW0A 4G77A 3KSJA 1WODA 1SW1A 4JWOA 5JK4A 4XKRA 4LQ2A 3QSLA 4R6YA 3FV2A 2DP8A 4NF8A 2PYYA 1MQIA 2UXAA 3KSXA 4OFJA 3HHGA 4K3FA 3RNNA 3MZ9A 2HCAA 3FXQA 3TCGA 5KCJA 5AA2B 1OLAA 1FTOA 5I2KA 5B70A 2F35A 3FD3A 1O63A 4GRKA 1M5BA 3FZVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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