3K02A

Crystal structures of the gach receptor of streptomyces glaucescens gla.o in the unliganded form and in complex with acarbose and an acarbose homolog. comparison with acarbose-loaded maltose binding protein of salmonella typhimurium.
Total Genus 134
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
134
sequence length
388
structure length
388
Chain Sequence
ELSGTVTFWDTSNEAEKATYQALAEGFEKEHPKVDVKYVNVPFGEANAKFKNAAGGNSGAPDVMRTEVAWVADFASIGYLAPLDGTPALDDGSDHLPQAAASTRYEGKTYAVPQVIDTLALFYNKELLTKAGVEVPGSVAELKTAAAEITEKTGATGLYLRGDDPYWFLPYLYGEGGDLVDEKNKTVTVDDEAGVRAYRVIKDLVDSKAAITDASDGWNNMQNAFKSGKVAMMVNGPWAIEDVKAGARFKDAGNLGVAPVPAGSAGQGSPQGGWNLSVYAGSKNLDASYAFVKYMSSAKVQQQTTEKLSLLPTRTSVYEVPSVADNEMVKFFKPAVDKAVERPWIAEGNALFEPIRLQMANVLSGETSPDEAAANTGDAYRKLLKDYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of the Solute Receptor GacH of Streptomyces glaucescens in Complex with Acarbose and an Acarbose Homolog: Comparison with the Acarbose-Loaded Maltose-Binding Protein of Salmonella typhimurium.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Streptomyces glaucescens
molecule keywords Acarbose/maltose binding protein GacH
total genus 134
structure length 388
sequence length 388
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k02A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k02A02
5I57B 2VGQA 4LQ2A 2B3FA 4Z7EA 2UYFA 4C1UA 1PBPA 1LBBA 3GBAA 4C0RA 2XXUA 4MBPA 4XXUA 2UVHA 2VOZA 4HCWA 3CSBA 3THIA 1I6QA 3C31A 2D5WA 1UTBB 4WEDA 1UQWA 5DVFA 4GD5A 3IAZA 1SQYA 4FORA 3IOUA 3PUZE 3OSQA 1TT1A 5JTYB 2DYXA 2OWTA 2A5SA 3T9VA 4OFLA 4BDNA 2F7CA 1NNPA 4RPNA 5I2NB 1P1OA 5A5XA 2ZXTA 1XHYA 4OETA 1B46A 5CI5A 3T96B 1QUJA 4WKMA 3WAFA 3PPNA 3MZ9A 4YB6A 2NXOA 3S9NC 2ZMBA 1SI1A 3KN7A 3IL1B 3O6GA 1ZBMA 5IAIA 2Y7IA 4FATA 4G4PA 4ELQA 1Y3PA 4NF5B 1B7HA 5ICTA 4EF2A 4F19A 1IQ7A 4IY5A 3H6WA 3GZGA 5H8QB 3S2VA 4U23A 3KEIA 1LAFE 4F1VA 5AA2D 3RTWB 2Y84A 3VLWA 3G3HA 1IUDA 4ESWA 3TELA 3A09A 1Y4CA 5L9SA 1PC3A 1MXZA 2QPQA 1ANFA 1URDA 1TFAA 4HCYA 1BIYA 3QXMA 3L6GA 3U8QA 1HSJA 3TTLA 1MPCA 3FJMA 3IB1A 5KCJB 2P2AA 3IX1A 1A8FA 1N3XA 4R9FA 2VD3A 2DS9A 1HSLA 1O7TA 2OZZA 4H6DA 2GHAA 1MY4A 2RCBA 1LAXA 3DM0A 1URGA 3CFXA 2F7AA 1NFTA 1QW0A 2Z8DA 3KSJA 4NF4A 5AA2A 4R2FA 4GF8A 3KOTA 4NMYA 1GR2A 1B7UA 1MXYA 4TOZA 4HS7A 3T9UA 3V8XB 1P99A 2QS1A 3QUJA 1SW1A 5FTIA 5TU0A 1B1HA 1UIVA 4ZEIA 1B4ZA 2PX1A 5K2YA 4FAJA 3FJ7A 4QHQA 4DXCA 4FEDA 3O97A 5DT6A 3KG2A 3FVOA 1A7LA 1PEBA 4ESXA 5FHOA 1LSTA 4XTCQ 1B5HA 1N7WA 1DSNA 2HEUA 1H43A 1J1NA 4YU0A 4OTEA 3TFLA 3DP6A 4GFRA 4U2RA 1IXHA 1D4NA 3O28A 1Y4TA 4F1YA 2IA4A 5EHMA 3G3GA 3FV2A 1Q35A 1WODA 1JQFA 5CC2A 1QKAA 4BDLA 4OFOA 4ZECA 3EHUA 4ZEDA 3IOWA 1WDNA 3RGYA 3K1PA 3KOSA 4PE5B 1NKXA 3I3VA 1EZPA 4RNSA 4UA8A 4F29A 1KWHA 3VV5A 2AL5A 4NWDA 5EYFA 2I48A 3VVEA 2D3IA 3CG3A 2UVJA 1M5CA 5I59A 2YLNA 4POWA 3SESA 2Z22A 4F22A 4H5FA 1H3DA 4RJZA 3PMVA 3FXUA 1FTKA 4ZE8A 3RQTA 1AL3A 3VVFA 4RYAA 3W15C 2H25A 1B0LA 1R9QA 2W7YA 2V25A 4BLAA 4TLLB 2X7PA 4YICA 5CBSA 3CI8A 5H8HB 4PFTA 3CRBA 2D21A 3OEMA 2OJTA 4O3BA 3QYTA 4EDPA 2Y7RA 4IO7A 2A5TB 5HBCA 1URSA 4YMBA 3PUWE 4DE8A 1CE2A 1IEJA 4PETA 1ZIUA 1IZ1A 5L9OA 1R6ZA 4IGTA 5CMKA 3FXRA 4QFOA 3HN0A 1ZU0A 1Y1ZA 2CZLA 5CBRA 3PU5A 4H67A 4XKPA 3FJGA 3H03A 3PGFA 4XKRA 1OVBA 4DXUA 2QL3A 3T22A 1MXWA 2OK2A 1OQGA 4X1BA 2I58A 3IK6B 1MRPA 2XXTA 4F3BA 4AB6A 1LB9A 3FD3A 1N7XA 1N04A 1A8EA 1XC1A 2QS3A 4G77A 4GIZA 1N0TA 3LSWA 4KR5A 3ILTB 1L5TA 3R7XA 3SEVA 3MP8A 2Q2CA 3K6XA 3LR1A 2DVZA 3TTRA 5HPQA 4OMBA 4GL8A 5DEXB 2QS4A 4QFKA 2UVGA 2AYSA 2BJJX 3UP9A 4QF9A 2HQ0A 1XVXA 1XOCA 4KPTA 2XXPA 3L6HA 4NWCA 5TP9B 3FV1A 2G93A 1LLSA 3VFJA 3E4RA 5BUUA 2V84A 4GLIA 3MPLA 2H5YA 2B3BA 4FIMA 3KSXA 4U4XA 3H4ZA 1N3WA 3OSRA 5FHNA 1FQCA 2QRYA 2B65A 1TWYA 2PVUA 3A3UA 5H8NB 1ATGA 1FTMA 1VFDA 1Y1MA 1FTLA 3T9XB 2FA7A 2I3VA 4IO4A 3G3KA 5KDTB 1B3EA 4YB5A 3HV1A 4WEPA 4KHZE 2R6GE 3K6WA 2THIA 3FVKA 4RK9A 4FJPA 2XXYA 1IITA 3FVGA 5ISUA 3MZ1A 4F39A 3D4CA 3OD7A 3R6UA 1MQJA 4PFUA 2I4BA 3TCHA 4ELRA 1JEUA 5AA3A 1MS7A 1H45A 1N76A 4YKKA 1I6AA 4JDFA 3ZKKA 2DSFA 1SW4A 4EQBA 3LBSA 1IXIA 3W9VA 2DQVA 4LUBA 4F18A 3SETA 1DMBA 4F3PA 4NF6A 3MVZA 4GL0A 4U1OA 3PUYE 1UTBA 1B0HA 4MLVA 1GGGA 4LZ7A 1I69A 3PMWA 1MXUA 4ZE9A 1B2HA 2V3UA 1MQIA 1IIWA 3S9MC 1GV8A 2Q2AA 3HO7A 1PDAA 4DCXA 2F5XA 1JW4A 3VXBA 4F1UA 4K3FA 3UORA 2VD2A 4NEDA 4ELOA 1XVYA 2R71A 1FTJA 3O29A 5IKBA 1FCKA 2XXQA 3JV9A 4N07A 4Q8RA 2HZLA 3SEYA 1OVTA 1MXVA 3TDJA 3BFTA 5F1QA 2IEEA 1Y3NA 3I5OA 3C35A 2HAVA 1S7YA 5A5XB 1UIUA 1NH7A 1AMFA 3MC2A 3TCFA 4WXJA 2XX8A 2PYYA 4NF5A 3TPAA 3G3IA 5JEIA 3RNNA 4LZ8A 4AQ4A 2NUVA 5B70A 4FE8A 3TEPA 3MQ9A 5DVIA 5CRYA 1IXGA 1UTHB 4GQOA 1B58A 3HSTA 1Y20A 3D4GA 3OXNA 3KN8A 3B6QA 4M1VA 4R75A 2XX7A 4F3GA 3BFUA 5KCJA 3K4UA 3Q29A 5I58A 3TODA 3UGWA 2VP1A 4NE4A 1LAHE 2UXAA 5ITOA 3K02A 3JYRA 3E9XA 2HAUA 4DIGA 2F7BA 3CG1A 2X7QA 4G68C 3H6VA 4KQPA 3KJTA 3VDFA 1MH3A 4E0XA 3U1OA 3C4MA 1A54A 4G8MA 3VLVA 1QJMA 1MQHA 4OESA 3O66A 3H3GA 3OOAA 2OWSA 3W9WA 1JVXA 4YKPA 1B9JA 1XT8A 3H06B 4PFYA 3KFMA 1MPBA 1Z7ME 4U4SA 4F31B 4KD5A 4H8IA 4HTGA 2OCUA 1JEVA 2Q89A 4DDDA 4GXSB 4NF4B 2AL4A 1SW5A 2H98A 1DOTA 1ZMGA 3S9EA 1BP5A 1IXCA 1TFDA 1NH8A 4G8HA 5TPAB 4YKIA 1DPPA 3AXFA 2Z23A 3UK4A 2H99A 3SEUA 4ELPA 3KJ7A 1SYHA 3GLBA 1OIBA 3LC8A 2XXWA 5H8FA 1FQDA 2Z8FA 1ELJA 5FHMA 4THIA 3I6VA 1NL5A 4ZZEA 2ZYKA 3IO6A 4POXA 4EUOA 4BDOA 2UVIA 1PB9A 2ONRA 1YAEA 1POTA 5L9MA 1B4HA 2RCAA 1QULA 4MF3A 1M5BA 5LOMA 1US4A 3CIJA 5CM6A 4IB2A 1Q1KA 5HM4B 3FIRA 2XD3A 3IR1A 2O84X 3SEWA 4IO6A 2ZYMA 1PB8A 4ZZAA 3G7WA 5J1DA 1FQAA 4R74A 5AA4B 3UIFA 4F2QA 3OO6A 1D3KA 1EZ9A 4I9DA 3O2AA 3M8UA 1B32A 3TTMA 3P7IA 3K6UA 4ZEBA 2XD2A 3CSGA 3LSLA 2V3TA 4G68A 4LA9A 3TQLA 3N6TA 2DP8A 2O6AA 2DVCA 4IO2A 2XXIA 1OLAA 3EHTA 1OQHA 3H7MA 3VLUA 3IO4A 3USDA 2PMSA 4LATA 1WVJA 1YCJA 3O9PA 2F36A 3SERA 1OMPA 3VXCA 5H8HA 1PBQA 1A40A 4QSEA 2PT1A 4R73A 3C34A 1FQBA 1VFEA 1N84A 1P1QA 2O69A 5I2KA 2Y7KA 3OO8A 3IJXB 1LFHA 2O1MA 5M2VA 3KBRA 4ISUA 4LQ5A 2M8CA 3MBPA 1BLFA 3U93A 3LSXA 1S9TA 2F8DA 3IORA 3C32A 2PT2A 3FGSA 3EPEA 1Y3QA 2DE4A 1M5EA 3N6UA 4G8NA 3DLNA 4YB7A 3SKPA 5I56A 1M5FA 4QSDA 5BWJA 4H1XA 1B5JA 4GVOA 4NF8B 2O1LA 3VVDA 3IJOB 4LVQA 1B52A 2ONKE 5DEXA 3K6VA 3M3LA 1SD3A 2DXRA 4JSOA 1QUKA 2O51A 4R72A 1RKMA 4U21A 1B05A 4JWXA 3PPQA 1D9YA 1MY3A 3M3KA 5JK4A 4LONB 3MW0A 3R26A 1TXFA 1ZJLA 1DTGA 3MJNA 3IOTA 1XS5A 1B5IA 3G3FA 3K2DA 4PQJA 4H5GA 2F6GA 3T93B 3MAMA 3KN3A 5H8NA 2GH9A 3FATA 4C1TA 1RYXA 4PP0A 1LCTA 1P1WA 2V93A 3S4UA 3ZS6A 2I0CA 1NNFA 2ZNSA 2P1SA 3PV0E 4R9GA 5KDTA 4H65A 3PD9A 2I3WA 4I62A 4F2OA 4KI0E 1FQFA 3B6WA 2GHBA 3OO7A 1YTVA 4RK2A 4DCYA 1BTJA 1DPEA 1SBPA 2Y7WA 1POY1 4P0GA 5B7DA 4OZ9A 1A99A 3QSLA 3MZBA 3E13X 3ONMA 3MVYA 2ESNA 5CMBA 3RN8A 1ZKBA 1LFIA 2DXYA 1SDXA 4YZZA 1MG1A 3V5AA 3ILUB 4EXLA 4TQUQ 4XKNA 1US5A 2QMXA 2RC8A 2F6PA 5AE4A 5I57A 3CR9A 3EF7A 4R6YA 4BDMA 3V83A 4U1ZA 3K0VA 3RT6B 2RF1A 3E3KA 3C36A 3PUXE 3DP4A 3S9LC 1P1UA 4YAHX 4M4GA 1JNFA 1ZTYA 1EH3A 3RY3A 4NF6B 3SDFA 5JTYA 2ZNTA 1B51A 3CVGA 5F7VA 1B3HA 3Q27A 5I2NA 1F9BA 1NNKA 3PMXA 2QSXA 3T66A 4OERA 3QIMA 2DWAA 3FVNA 4JB7A 2RC7A 4KYSA 1MM6A 2YPNA 1SW2A 2DE2A 2GRVA 2LAOA 4GRKA 4IGRA 1I6BA 4ECFA 4X1DA 1JETA 1NMUA 2I4CA 1VSOA 5EHSA 3FASA 3O6IA 3BBRA 3U92A 1LFGA 2DWIA 3TKDA 3LUYA 3OENA 1S50A 2E1SA 1B3LA 1II5A 2NVUB 1D9VA 5H8QA 4NTLA 2XXHA 4TLMB 3LSFB 2ABHA 3TUSA 3QAXA 3T9HB 4MLQA 1UTHA 4X9TA 3PPRA 2O7IA 3MWBA 2I49A 4L17A 2UYEA 4KCDA 4MH5A 4P0IA 3PUVE 2XXXA 3TTKA 4KCCA 4EF1A 4LZ5A 1R1NA 1USYH 2RINA 2ONSA 1VE4A 4LP2B 2O68A 2I0BA 1ZLQA 4IY6A 1AIVA 5I58B 4QRZA 1USYE 3PPPA 3N94A 5FTHA 1BKAA 1B1XA 2Q88A 4EXKA 4ZDMA 2QJEA 1CB6A 1QUIA 3ODBA 4GOTA 3HHGA 4E0WA 2WKYA 2RC9A 3KZGA 1FTOA 3OMBA 5AA2B 4ONYA 4UACA 3K00A 5TPAA 1B6HA 3B6TA 4OEUA 3K1MA 4GWOA 4ZS9A 3HCQA 1AH5A 1P1NA 4DZ1A 4P11A 5ITPA 1JVYA 2AIXA 4AB5A 1MY1A 1JW5A 1MXXA 2YJPA 3H6UA 1B40A 4QFLA 3FZVA 4RXLA 2F97A 3N5LA 3TCGA 3C9HA 4EQ7A 4FECA 1AOVA 4I8CA 2NOOA 1B7ZA 3V89B 2DWHA 5CMMA 1A55A 4R2BA 2DOJA 5H8FB 2KLFA 4X48A 2F34A 4OVJA 2ZYNA 1T0KA 4JSDA 4OWDA 1SI0A 1MDP1 3TQWA 3A3CA 2DE3A 2HFBA 3Q28A 3CFLA 5ICQA 3EQ1A 1LBCA 3U72A 3EN3A 5AA4A 4IO5A 2REGA 4KYEA 4OEVA 1GTKA 2F78A 2H4IA 1YPNA 3RLFE 4OHNA 4Q30B 1LCFA 1QKBA 2QS2A 1JW1A 3PD8A 3KGCA 1MDQA 4OXVA 5K2XA 5I59B 4F3SA 2FNCA 4G68B 4JWYA 5I84A 1RYOA 4O3AA 3IOVA 3DP8A 3H6TA 3RT8A 1LAGE 3Q25A 1H44A 4OENA 2RKMA 4KFQA 2QMWA 1O64A 4XIGQ 2A5TA 1R9LA 4YMAA 1H76A 2HZKA 3TAJA 1MQDA 2FYIA 3BKIB 2NWJA 3MP1A 2F35A 5I2KB 1LB8A 1HSEA 2XXVA 3VE1B 3ECRA 4N13A 3TTNA 2VHAA 4N6PA 4RA1A 3K1NA 4H0WA 4OYVA 4PFWA 4OQOA 3M3FA 4NF8A 3ZSFA 1FQEA 3RUMA 3MVWA 2PBWA 2OLBA 3TYHA 1NNTA 4H8JA 3TMGA 3N26A 5I56B 4JBZA 2DWJA 5L8DA 1MH4A 3RTFB 5ELVA 3IB2A 3U94A 4G2ZA 4HW8A 2ZNUA 4ZEKA 3MPKA 5TP9A 4DLDA 2R9JA 3PPOA 1MY0A 3QK6A 1MQGA 3B7DA 3EHSA 3GBBA 2HCAA 4I1DA 4RPOA 3TZAA 3HPIA 3SEXA 2I6EA 4R6HA 1VR5A 4U22A 4ZEFA 3UA8A 2CMOA 1M5DA 1MM7A 2ANJA 1Z7NE 1PB7A 1GVCA 1MPDA 2GFEA 3GXAA 2ZYOA 2Q8JA 4IO3A 2XHDA 4FEBA 2P0SA 3O6HA 4BDQA 1Y9UA 2Y7PA 4Q5TA 4QFPA 5CMCA 3K01A 4QSCA 2Q9TA 2Z8EA 4RY1A 4MFIA 1DTZA 4KYDA 4R6KA 5AA1A 2H9BA 2ALUA 3MVXA 1OLCA 5DTBA 3F11A 3HHFA 2XX9A 3CFZA 2REJA 3MUQA 2G29A 2E0SA 1MY2A 2X26A 4XKQA 2XXRA 1LGBC 2OBGA 3DELB 2V3QA 1QVSA 4Z0IA 3ZKLA 4JWOA 4JXIA 5H8SA 4YKJA 3WAEA 2HXWA 4O3CA 3QUFA 4GXAA 1EU8A 4ND9A 3C33A 3OELA 1EZOA 4BDRA 1B3GA 4EQ9A 2O7UA 3FUZA 3JZJA 3RPWA 3OEKA 1SVXB 3FXQA 3MP6A 4DXBA 3OO9A 4QFNA 1O63A 4Q0CA 3G3JA 1FW0A 1SYIA 3Q26A 5DVJA 1B3FA 5KZTA 4OFJA 3UN6A 3IB0A 5DYHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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