3K02A

Crystal structures of the gach receptor of streptomyces glaucescens gla.o in the unliganded form and in complex with acarbose and an acarbose homolog. comparison with acarbose-loaded maltose binding protein of salmonella typhimurium.
Total Genus 134
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
134
sequence length
388
structure length
388
Chain Sequence
ELSGTVTFWDTSNEAEKATYQALAEGFEKEHPKVDVKYVNVPFGEANAKFKNAAGGNSGAPDVMRTEVAWVADFASIGYLAPLDGTPALDDGSDHLPQAAASTRYEGKTYAVPQVIDTLALFYNKELLTKAGVEVPGSVAELKTAAAEITEKTGATGLYLRGDDPYWFLPYLYGEGGDLVDEKNKTVTVDDEAGVRAYRVIKDLVDSKAAITDASDGWNNMQNAFKSGKVAMMVNGPWAIEDVKAGARFKDAGNLGVAPVPAGSAGQGSPQGGWNLSVYAGSKNLDASYAFVKYMSSAKVQQQTTEKLSLLPTRTSVYEVPSVADNEMVKFFKPAVDKAVERPWIAEGNALFEPIRLQMANVLSGETSPDEAAANTGDAYRKLLKDYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords Acarbose/maltose binding protein GacH
publication title Crystal Structures of the Solute Receptor GacH of Streptomyces glaucescens in Complex with Acarbose and an Acarbose Homolog: Comparison with the Acarbose-Loaded Maltose-Binding Protein of Salmonella typhimurium.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces glaucescens
total genus 134
structure length 388
sequence length 388
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k02A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k02A02
5DVIA 2Y7IA 3H03A 4DLDA 3FVKA 4YB6A 1USYE 2ABHA 3K6XA 2V3QA 5I59B 1QKBA 5DT6A 5TPAB 2F97A 2ZYNA 3W9VA 1FW0A 1EZ9A 5B70A 5A5XB 5HPQA 2V3UA 2Z8DA 1P1OA 2QS2A 5TP9B 1SW2A 3IO6A 1IQ7A 1F9BA 5DVFA 1MM7A 3G7WA 4MH5A 3TTLA 1MY2A 1SW4A 4YKKA 4NWDA 4YZZA 2O68A 5H8QB 3KOTA 3PUVE 1A8FA 3TTMA 3U94A 3ILTB 5ICQA 1FTOA 1BP5A 3PPPA 1B3EA 1D4NA 1R6ZA 4F3GA 3K0VA 3N6TA 4O3BA 3W15C 1AL3A 4FEBA 3UP9A 4R74A 1SBPA 5HM4B 4LVQA 3RT8A 4OZ9A 3MZBA 4M1VA 4OESA 3IOTA 2HAVA 3Q26A 3G3FA 3PPRA 5KCJA 3K2DA 3A3UA 3K1MA 1Y3PA 1I6QA 2XXPA 4ND9A 4OENA 1MXZA 3MVXA 2UYEA 4P0GA 2OCUA 3K6VA 1USYH 4ZEIA 2VD3A 4GXAA 2DE3A 2NOOA 3PPOA 5KDTA 5EHMA 5F7VA 1Y3QA 1P1NA 4RJZA 3IK6B 5I57B 3H4ZA 3OO7A 4OFOA 3CFLA 3FXUA 3TCHA 1WVJA 4Q30B 2P2AA 3UK4A 2NWJA 2O1MA 1OLCA 1IEJA 1B3LA 1SVXB 3N94A 4KQPA 2OLBA 5DTBA 3TZAA 1UIUA 3RGYA 1M5CA 1B5IA 2QRYA 1N76A 2H4IA 3SEUA 5AA2D 4U1ZA 1UQWA 3K6WA 3PU5A 1JW4A 4HTGA 1UTBA 4RNSA 2DXRA 4ZDMA 4MBPA 3LUYA 2YPNA 2BJJX 3GXAA 4FAJA 4U4SA 3K1NA 4YMAA 3MZ9A 1B58A 4F3BA 2QL3A 2P0SA 3D4CA 1Y3NA 1JEUA 3O6HA 3OMBA 1NNKA 2OWSA 3V8XB 5BWJA 3FXQA 2OZZA 2RF1A 3TTKA 3TKDA 3QAXA 3QK6A 3TMGA 4N07A 1EZOA 3MC2A 1DPPA 2O7IA 4U2RA 2QPQA 3RTFB 3TCGA 3I6VA 3ZKLA 1NNFA 4IB2A 1N7XA 1B7UA 1Y4TA 5ELVA 3CSGA 4DIGA 2V25A 3FASA 5CMBA 2HEUA 5JTYB 2THIA 4OFLA 3SETA 2I4CA 2ZNUA 4K3FA 3S9EA 1URDA 2AL5A 5CC2A 4BDOA 1N7WA 1L5TA 3DM0A 1II5A 3KN3A 3PUWE 1BTJA 4GXSB 4XTCQ 4MLQA 3JYRA 2F5XA 2CMOA 1NFTA 4KCDA 3TQLA 4R6HA 4N13A 2IA4A 2Q2CA 1ANFA 1NKXA 3WAFA 2Q2AA 2W7YA 2CZLA 1SQYA 5DVJA 5CMMA 1QUJA 4IGTA 4NF4A 5CMCA 1LAFE 3QUFA 4R73A 2PBWA 3C32A 5TU0A 2LAOA 3VV5A 3FV2A 2XXYA 2FNCA 4U4XA 5I56B 3B6TA 4R72A 1B3GA 3K4UA 2ESNA 2NVUB 1AIVA 4ZZAA 4N6PA 4G68C 4JSOA 4PP0A 3TEPA 4RPOA 1URSA 3PUYE 1ZLQA 3TAJA 3ECRA 4XKPA 4QRZA 3SEWA 1MQGA 4TLLB 3OXNA 3MBPA 4I62A 1OVTA 3PUXE 1JVXA 2RCAA 3O28A 1IIWA 3F11A 4THIA 1LFGA 3R6UA 2F78A 4EQ9A 2ONRA 3OENA 3QSLA 4EF1A 3CG1A 3BFUA 5CMKA 2DP8A 4R75A 4MF3A 1B0LA 2F34A 2XXIA 3ZKKA 4DZ1A 3KJ7A 3OD7A 5H8FB 1YCJA 3VVFA 3SEYA 2VD2A 2QJEA 4G77A 4BDNA 3RUMA 1MXYA 2O7UA 4OHNA 3IOWA 4TOZA 3G3JA 4Q0CA 1MQHA 4ELPA 3FV1A 1FTKA 1MY1A 3VXBA 2YLNA 3M3LA 4KHZE 1RKMA 2Z22A 3PD8A 2ZNTA 3EHSA 3MJNA 4F31B 4GFRA 4U23A 2VOZA 1PB8A 1QW0A 3TFLA 1DOTA 3BBRA 4MFIA 3K1PA 3HN0A 3KSXA 2QS1A 3MWBA 4GVOA 3VLUA 4NF5B 2QMXA 3MQ9A 1B40A 2GRVA 1SW1A 1MH4A 4OTEA 1ZBMA 4GWOA 2D3IA 1NH7A 5AA2B 2D21A 1QUIA 2Z8EA 1LSTA 4ONYA 3EN3A 4NMYA 4BDMA 4GOTA 1QUKA 2OJTA 4IY6A 2ZXTA 3MAMA 1B7HA 4OMBA 1FQBA 5I58B 1LCTA 3V89B 2R6GE 3HSTA 1JW1A 5FTHA 2KLFA 3B7DA 1MRPA 5EYFA 3M3KA 1MXWA 1P99A 4F22A 3MVYA 4R6KA 2ZYOA 3CG3A 2F6GA 5IKBA 1Q35A 2ANJA 4HCWA 1IXHA 5M2VA 4POWA 2IEEA 2PX1A 2Q89A 3RT6B 1TXFA 3FVGA 1AOVA 1CB6A 2A5TA 3DLNA 3MPLA 4WEPA 3S9NC 3SEXA 4ZZEA 5J1DA 1ZTYA 4UACA 2O51A 2VGQA 3R7XA 4OETA 4YKIA 2DS9A 4F29A 5CBSA 1QULA 4M4GA 4POXA 1M5BA 4JDFA 1H44A 1FQCA 3DP8A 3CIJA 1B4HA 3T66A 1O63A 4H0WA 2DVZA 4PQJA 2VP1A 1O64A 2V84A 1B1XA 3RNNA 2Z23A 1M5FA 3MUQA 1MQIA 1R1NA 1PEBA 4UA8A 3H06B 5K2YA 2UYFA 2I6EA 5TPAA 4F19A 1LBCA 1B3FA 3SDFA 2QMWA 2A5SA 4H67A 1MPDA 4PFTA 4JSDA 4P11A 3H6WA 1MXVA 1URGA 4E0WA 4GIZA 3E13X 3LSXA 2R9JA 1SD3A 1FTMA 2RINA 1S9TA 1VE4A 2E0SA 2G93A 4C1TA 4F2QA 3RY3A 3PMVA 3OOAA 2OWTA 5H8QA 1N04A 3IR1A 4R6YA 4YB7A 4ISUA 3FXRA 4KCCA 3O66A 5KDTB 4H65A 1LAXA 1XOCA 2XX8A 5AE4A 3HHGA 4I9DA 4GL0A 1FQAA 1H45A 2I48A 3K6UA 4YICA 2P1SA 3VE1B 1GV8A 3DELB 1ZMGA 3QIMA 1NMUA 3U8QA 1GVCA 3S2VA 4NE4A 3UA8A 2X7QA 3QXMA 4MLVA 4EUOA 4KR5A 4ZEFA 1VSOA 3TTRA 2DWIA 1BLFA 3PV0E 3CFXA 3E4RA 4ZE8A 5H8NB 3TTNA 3KN7A 1Y1ZA 1ZKBA 5I57A 1A54A 4LQ2A 4X48A 4FEDA 4AB6A 2ZYMA 3IAZA 2QS4A 3VDFA 5L9MA 2DWJA 4XKQA 4ELRA 1JNFA 2DE2A 1SI1A 3SKPA 1MG1A 3PMXA 3PD9A 4LP2B 3T9UA 1IXCA 1TT1A 4GD5A 2QS3A 5FTIA 4G8MA 1GR2A 1JQFA 5F1QA 2Y7WA 2O84X 3TODA 2ONSA 2Y84A 3KFMA 2XXQA 2B65A 1MY3A 2DOJA 3T9XB 2QSXA 2OBGA 1MY0A 4ZEDA 2AYSA 4H6DA 3IORA 1FCKA 4U1OA 1US5A 3TDJA 2H5YA 4KPTA 1B05A 3S9MC 4C1UA 3GLBA 4LZ8A 3KZGA 1B4ZA 3KJTA 4DXBA 4KYEA 4R2BA 2XD3A 4DXCA 3SEVA 3VFJA 1Z7ME 5ITPA 3HCQA 4IO2A 4KYDA 3SESA 3N26A 1YTVA 1TFDA 3IL1B 2HZLA 3PPNA 3OSRA 2RKMA 5DEXB 4QSDA 4RYAA 2FYIA 2O1LA 4JWXA 4ELOA 2GHAA 2ONKE 1A7LA 4Z7EA 3B6QA 2RC7A 3QYTA 3MW0A 4NF4B 4IO7A 4JWYA 1IXIA 3UN6A 1XC1A 4G4PA 1JETA 1LGBC 2XXRA 4ELQA 1QKAA 4OEUA 4BDRA 1B6HA 3OO9A 1PB7A 4U22A 5DYHA 4YMBA 3C36A 5CBRA 2G29A 3M3FA 4I8CA 3I5OA 3TQWA 3I3VA 3ONMA 3LBSA 5I2KA 4F1YA 3U72A 2RC8A 3HV1A 2PMSA 2PT2A 1D3KA 5I56A 2H99A 3VVDA 2NUVA 3MVZA 5L8DA 4F18A 1A99A 4NF8B 3N6UA 4IO4A 1B1HA 2UVIA 4G68A 2UVGA 1ZJLA 3U1OA 3DP4A 4OWDA 4Z0IA 4NWCA 1POY1 5JEIA 3BFTA 2O69A 1HSJA 3FIRA 1US4A 3V5AA 3W9WA 3N5LA 3VLWA 1AH5A 1MQJA 4GQOA 2O6AA 3Q27A 1H3DA 1PBQA 1N3WA 3ILUB 4XKNA 1VFEA 1WDNA 4AB5A 2B3FA 2YJPA 4FECA 5FHOA 1RYXA 2VHAA 3HO7A 5IAIA 1Y1MA 3FVOA 1MDP1 1P1QA 3C4MA 3U92A 4NF6B 3T96B 5I2NA 1GTKA 3E9XA 2I3VA 4EXKA 1NH8A 1PDAA 2DWAA 3T9HB 2X26A 2REJA 1TFAA 4U21A 4EQ7A 4ECFA 1J1NA 3WAEA 3G3GA 4F39A 1UTHB 4PFUA 2F8DA 3RN8A 4QF9A 1B5JA 1BIYA 5H8HB 4RA1A 2X7PA 4F3PA 4KFQA 4E0XA 4XXUA 3H6TA 3L6GA 2XXWA 5AA4A 2I3WA 5AA2A 2GFEA 4C0RA 3FVNA 3EHTA 4WXJA 2PYYA 1DMBA 2A5TB 2PVUA 4PFWA 3IOVA 1H43A 4DE8A 2FA7A 4GLIA 4ZS9A 1JW5A 3FJ7A 3A3CA 1I6AA 3EPEA 1ATGA 4EDPA 3C9HA 3FUZA 2DQVA 2B3BA 4R9GA 2F36A 4KD5A 2ALUA 1CE2A 4JXIA 4QFOA 3THIA 1R9QA 1M5EA 4H8IA 5FHMA 1SW5A 1A55A 2Q88A 1PBPA 3FGSA 1FTJA 3Q28A 4X9TA 3EHUA 3P7IA 5I59A 3CSBA 4PFYA 4TLMB 3L6HA 4DXUA 4QFLA 5A5XA 5L9OA 1VR5A 3LC8A 1O7TA 2DXYA 5HBCA 3CFZA 3KGCA 4F2OA 3FJMA 3GZGA 2WKYA 5TP9A 3FD3A 2XXVA 3MVWA 1MXUA 2RC9A 2Y7KA 4OEVA 3O6GA 5H8SA 4F1UA 1LFHA 1B9JA 1OLAA 3IB1A 4ZEBA 3O2AA 1FQDA 5JK4A 5KCJB 2DWHA 3O6IA 1LB9A 3TPAA 1Y4CA 3LR1A 3CR9A 1BKAA 4FATA 4QFNA 5LOMA 2F35A 2UVJA 5AA3A 3OELA 1UIVA 1WODA 2I58A 1MS7A 3CI8A 3PMWA 3RTWB 1AMFA 3EF7A 4OYVA 4LQ5A 1LAHE 2UVHA 3TUSA 4KYSA 1FQFA 4FJPA 2XD2A 4WKMA 1EU8A 3QUJA 2NXOA 1SYHA 2V93A 1MXXA 1S50A 1D9VA 1N0TA 3OEMA 3MP8A 3DP6A 2XXXA 2Z8FA 2RCBA 1UTBB 4FIMA 3Q29A 3KG2A 2HCAA 1B51A 1T0KA 4QFKA 3MP6A 4G8NA 4IO6A 4P0IA 4QSCA 3UORA 4XIGQ 2ZNSA 4RY1A 3K02A 3H7MA 2F6PA 2AL4A 3VXCA 2F7CA 3LSFB 2XXHA 2PT1A 2ZYKA 1YPNA 1IUDA 1B7ZA 4ZE9A 1XHYA 3LSWA 4HCYA 1LFIA 1A8EA 3MPKA 5H8NA 2OK2A 4I1DA 4XKRA 3OSQA 4RK2A 1H76A 3PPQA 3K00A 3H3GA 4R2FA 4ZECA 1N3XA 2I49A 1JEVA 3G3KA 1NNTA 3TYHA 4TQUQ 4LONB 2Q9TA 3GBBA 2H9BA 3E3KA 3BKIB 4BDQA 3SERA 3MZ1A 2DVCA 4OERA 4AQ4A 2V3TA 3TCFA 4L17A 1M5DA 3T22A 3IJXB 1S7YA 4IY5A 4H5GA 2HFBA 2XHDA 3G3HA 4OVJA 4LZ7A 3D4GA 5I84A 3CVGA 5ITOA 3C33A 3R26A 3MP1A 4Q8RA 4X1BA 3S4UA 2F7AA 4F1VA 1I69A 3VVEA 4ZEKA 3TELA 1OQHA 3Q25A 3EQ1A 1Y9UA 3RQTA 5AA1A 5EHSA 1QJMA 2F7BA 1LCFA 5JTYA 1MY4A 1YAEA 1EH3A 3HHFA 1LBBA 1RYOA 1Z7NE 3C35A 1XVXA 4FE8A 1OQGA 4WEDA 5B7DA 2UXAA 1IITA 1Y20A 2H25A 2R71A 2XXTA 4IO5A 1N84A 4DDDA 1OIBA 4H5FA 4ESWA 4OXVA 1OMPA 1PC3A 1SI0A 5DEXA 4G2ZA 2Y7RA 3KEIA 4YB5A 3IX1A 4LATA 4JBZA 2HQ0A 4R9FA 3M8UA 4HS7A 5I2KB 1B32A 1MM6A 4RK9A 3B6WA 3IJOB 3RPWA 3KBRA 2DYXA 4X1DA 1SDXA 2XX7A 3T9VA 4EF2A 3ZSFA 1ZU0A 2GH9A 1MH3A 1LB8A 1NL5A 3HPIA 4FORA 4G68B 1GGGA 1IZ1A 1B52A 2GHBA 4LA9A 4KI0E 1A40A 4YKPA 2HAUA 3S9LC 4GRKA 5ISUA 1OVBA 5L9SA 3C34A 3PUZE 3O29A 1VFDA 3RLFE 4QHQA 3JV9A 3IO4A 1ZIUA 3PGFA 4DCYA 2E1SA 1DTGA 1LAGE 3ODBA 3UIFA 4JB7A 1DTZA 1MPCA 4HW8A 4YU0A 5CRYA 4NF8A 4EXLA 3OO8A 2M8CA 4QFPA 1PB9A 3CRBA 5FHNA 4IO3A 2Q8JA 1NNPA 3LSLA 3KOSA 4OQOA 1DPEA 1POTA 2HZKA 3OO6A 5I2NB 1B46A 4YKJA 1ELJA 3O9PA 5H8FA 1XS5A 4PE5B 4ESXA 1XT8A 5ICTA 4RPNA 1DSNA 1MPBA 4Q5TA 1EZPA 5KZTA 4GF8A 1HSEA 4F3SA 3V83A 5CI5A 3T93B 3FATA 5CM6A 2D5WA 2XX9A 3KN8A 3C31A 1P1UA 2HXWA 3JZJA 4YAHX 3IB0A 4BDLA 4NTLA 4IGRA 3FJGA 5BUUA 3VLVA 1TWYA 1IXGA 4H1XA 4NF6A 1SYIA 1FQEA 1MQDA 4PETA 2H98A 2ZMBA 1B3HA 5AA4B 1D9YA 1JVYA 1MDQA 3U93A 4GL8A 1I6BA 5K2XA 4G8HA 4H8JA 1QVSA 2DSFA 4NF5A 3AXFA 4RXLA 1B2HA 4NEDA 3GBAA 4OFJA 1XVYA 1UTHA 2REGA 3IB2A 3H6VA 3ZS6A 1KWHA 4DCXA 2Y7PA 4BLAA 2I0BA 1P1WA 1B0HA 1R9LA 3O97A 4LUBA 2I4BA 1Q1KA 5H8HA 2DE4A 3G3IA 4LZ5A 5I58A 1HSLA 3IOUA 1B5HA 3FZVA 2XXUA 3OEKA 4QSEA 3KSJA 3H6UA 3A09A 2I0CA 4EQBA 1FTLA 4O3AA 2AIXA 3K01A 3USDA 4O3CA 3UGWA 4JWOA 1LLSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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