4JWYA

Glun2d ligand-binding core in complex with propyl-nhp5g
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
281
structure length
269
Chain Sequence
QHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLNEKRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARGTTVSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D
publication title Structural determinants of agonist efficacy at the glutamate binding site of N-methyl-d-aspartate receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 85
structure length 269
sequence length 281
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-03-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4jwyA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4jwyA02
3MWBA 3RQTA 4LZ5A 2RKMA 1EZPA 1B3EA 4KD5A 1NNKA 1B6HA 4NF4A 3QUJA 5I57B 5H8NB 4GQOA 1JW1A 2F78A 2XXUA 3QUFA 5DEXA 4FIMA 3EF7A 3TQWA 2UYFA 1NL5A 4NE4A 2GH9A 5I2KA 3KOSA 3PPOA 4H6DA 2F35A 4QFKA 1FTJA 4X1DA 4G8HA 2A5TA 2HZLA 3H6TA 4XTCQ 5I58A 4NF6A 4F3GA 4HS7A 1B52A 2I49A 2R9JA 2I3WA 1MY4A 2XXYA 3RT8A 3KBRA 2Y7PA 3MW0A 1Z7ME 2AL5A 4BDRA 4F39A 1B46A 1LFGA 5CBRA 1J1NA 5LOMA 3QXMA 3V5AA 4H8IA 4IO6A 4QHQA 3QYTA 3O6HA 4GD5A 2W7YA 3QK6A 3E13X 3ECRA 3IB2A 3AXFA 1MPCA 3LUYA 3LBSA 4WEPA 1UTHA 3CRBA 3B6TA 1Q35A 4QRZA 5JK4A 3WAFA 1SD3A 1H76A 1MQJA 2QJEA 3CG3A 4OVJA 2RINA 1VE4A 4YKPA 3DP8A 3C31A 3N6TA 3FZVA 5H8FB 4F3BA 1B0HA 2F7BA 4H5GA 1LAGE 4KHZE 4H67A 1P1QA 1SBPA 1UTBB 4R74A 2XXTA 3LC8A 4LUBA 4RK9A 2YPNA 4RPOA 4GFRA 2WKYA 3CFXA 1EU8A 3O66A 2HAVA 1B0LA 1R6ZA 4Q30B 2PYYA 4Z7EA 5I57A 1LAHE 5F7VA 1Y3QA 2V25A 3TTRA 1OIBA 3ILTB 4ELRA 1XT8A 2KLFA 4G8MA 5M2VA 3DELB 1B58A 3I3VA 1GV8A 4LATA 3E3KA 3OXNA 1R9QA 2PBWA 3FJGA 2DWAA 1XS5A 3KG2A 2GHBA 3I5OA 2D3IA 3C4MA 2R6GE 1NNTA 3BFTA 3R7XA 3PPPA 1OVBA 4NF8B 3KOTA 2P2AA 1WVJA 3G3IA 1CE2A 5FTHA 3VV5A 2ANJA 4I62A 4ELPA 1AH5A 2I48A 4IY6A 3P7IA 3FV2A 2DE2A 3MP6A 2DVCA 3IO4A 2ZYNA 1AIVA 1MXWA 2AYSA 3TODA 1OQHA 5DVJA 2PX1A 2I0CA 3TPAA 3PMVA 2ZNTA 3PD8A 1FCKA 2THIA 4DCYA 5ELVA 3OO6A 1JVYA 3PV0E 3PPNA 3KN7A 4JB7A 4JSOA 5CC2A 3KFMA 4PE5B 1UTBA 2QS2A 4KQPA 5I59B 2I4BA 3LSFB 3ZKKA 4LA9A 1EZ9A 4BDOA 1M5FA 1WODA 1QULA 2UVIA 2XX8A 2H98A 3KZGA 1I6QA 2QRYA 2RCAA 3H03A 4QSCA 3SESA 4H8JA 1A55A 3DP4A 5AA2B 4C1UA 1B2HA 2ONKE 4G2ZA 3H06B 3TAJA 3G3JA 1XC1A 1QUKA 3IX1A 3O9PA 4F29A 4WXJA 4ELQA 1ZU0A 3IOUA 1SVXB 3RTFB 5EYFA 5CM6A 3OSQA 2ZNUA 4WKMA 4NTLA 2Z8DA 3RY3A 1P1OA 4GIZA 3KN3A 4GWOA 2F7AA 5DTBA 3S9EA 4YICA 4FEDA 4FATA 3OSRA 1AL3A 3O29A 2O69A 1XVYA 3LSWA 1FQFA 4N6PA 3LR1A 3T9UA 3KSXA 1DTZA 3UGWA 1MY0A 4F22A 2Q89A 2VHAA 5IKBA 4TLLB 4OEVA 1N76A 2DWJA 1RKMA 3T9VA 3O6GA 1DPPA 3TMGA 3VLWA 3KJ7A 2D21A 4ESXA 2AIXA 2IA4A 3U93A 4OYVA 3PU5A 4ESWA 1I6BA 3IOVA 2E1SA 1YCJA 3TEPA 4THIA 2CMOA 4BDNA 1D4NA 4NF4B 5CMBA 3CSBA 2QMWA 4QFNA 2PMSA 5DEXB 3C9HA 1B1XA 1JNFA 4R75A 3FASA 5A5XA 3C33A 2DE3A 3MVZA 1NNPA 1B7ZA 3MBPA 4EF1A 2A5TB 1BIYA 1HSEA 3C36A 5I58B 4NF6B 4G77A 3QIMA 1FQBA 3L6HA 3VE1B 4OFLA 4GVOA 1RYOA 1I6AA 4DXBA 1B3HA 2ZYKA 4POWA 3SEVA 4X1BA 1RYXA 1ZBMA 1H44A 4JWXA 2V3QA 3K6XA 3M8UA 3N6UA 1HSLA 5H8HA 4JDFA 4U4XA 3K6WA 3OMBA 4ND9A 1HSJA 1PBPA 5ICQA 1UTHB 3RUMA 5H8SA 5B70A 1QUIA 1FTLA 4O3CA 1LLSA 3IB0A 3HCQA 3JZJA 3PD9A 3SKPA 3GXAA 3OO7A 2VD2A 4Q8RA 2XX9A 4PQJA 2UYEA 4ZS9A 4OTEA 5DT6A 3RNNA 3MPKA 4QFOA 2V3TA 3GZGA 3BKIB 1ZJLA 4HCWA 5FHNA 1OLAA 3HSTA 1JETA 4YU0A 3C34A 3MVWA 1B5IA 2UVJA 1B40A 3E4RA 4OWDA 1B5HA 1LB9A 5B7DA 4I9DA 3QAXA 4OENA 3N5LA 2Y84A 4OXVA 1SW5A 2Q2AA 1NMUA 1B4ZA 2P1SA 4XKRA 3M3FA 3F11A 3JV9A 5KZTA 3UN6A 3ZSFA 4IGRA 3N94A 3MVYA 4QFLA 3EHTA 3R26A 1H3DA 2XXXA 3S9MC 1B9JA 1ZTYA 2G29A 1EZOA 2ONRA 4GRKA 5K2XA 5AA2D 2H4IA 5BWJA 1BP5A 3G7WA 2H5YA 2F8DA 5L9SA 1SYHA 2V93A 1QUJA 3BBRA 4U22A 2PT1A 1BTJA 2UVHA 3HV1A 2ZNSA 4YB5A 4KFQA 3TDJA 5AA3A 4EQ7A 5TP9A 2DSFA 1XVXA 4LONB 1F9BA 1MH4A 3K6VA 3B6QA 3MZ9A 4F3PA 3HN0A 1B5JA 1OMPA 4OETA 4POXA 3VVEA 4F1UA 1SW2A 4ZEKA 4DCXA 4Q5TA 4JWOA 2NWJA 3FIRA 1N3XA 4TLMB 1LSTA 2NVUB 3TCGA 3V8XB 4RA1A 1FW0A 3K1PA 5JTYA 3JYRA 3G3FA 3MJNA 4F31B 4F1VA 2VP1A 3W9VA 3RN8A 3ONMA 3KN8A 4DIGA 4RK2A 2F36A 4IO3A 1JQFA 2QL3A 1B51A 4G4PA 2X7QA 1MY3A 3RLFE 5ITPA 2O6AA 1MQGA 1Y3PA 4R73A 1MPDA 4DZ1A 1S9TA 1QVSA 4QSEA 2XXVA 4ZZAA 1S50A 3RPWA 2Z8EA 3CR9A 3MAMA 4NF5A 2QMXA 1S7YA 4IO5A 3V89B 3KSJA 2REJA 4DXUA 1A8EA 3H7MA 4AQ4A 5KCJA 2RC9A 3MC2A 3V83A 2FA7A 3OEKA 3TCHA 2DWIA 4OHNA 3RGYA 4C0RA 4RJZA 2O1MA 1US4A 3CVGA 1LCFA 3SDFA 3TTKA 3M3LA 1N7WA 3C35A 2XX7A 2DP8A 1PB9A 1H45A 4MBPA 2F5XA 4MLQA 4M1VA 4KCDA 3FXRA 3TQLA 4QF9A 4NEDA 3IO6A 4IO2A 1IZ1A 1P99A 4MFIA 1AOVA 1PB7A 4ZEBA 5DYHA 4EUOA 3G3GA 2F97A 1ZIUA 4R6KA 2R71A 4JBZA 1B05A 1SI0A 3B7DA 2B3FA 3LSXA 1FTMA 1XHYA 3VFJA 1YPNA 1QKAA 1M5BA 1FQDA 3PUYE 2DYXA 2I0BA 2FNCA 5A5XB 1NNFA 2HFBA 5J1DA 2O7UA 4TOZA 1IEJA 3TTLA 4LVQA 2OBGA 4NMYA 3HHFA 3FUZA 2O68A 4KCCA 4EXKA 3EPEA 1R9LA 3U1OA 3TZAA 3EQ1A 4FECA 1KWHA 3SERA 1Y1MA 2LAOA 4KYEA 4H1XA 1Y20A 3DLNA 3UIFA 3CG1A 3TTMA 5HBCA 4Q0CA 5F1QA 3ODBA 1SYIA 4QFPA 5H8HB 3OENA 3K1MA 4U1ZA 1IITA 2V84A 2OZZA 5DVFA 1PC3A 4GLIA 3IOTA 3D4CA 5ISUA 2I6EA 5AA4A 3C32A 3TELA 1B7UA 2REGA 4JWYA 4ZE9A 1ZMGA 1SQYA 5JEIA 2ZYOA 3H6UA 1O64A 2Z8FA 1MXXA 2F6PA 5DVIA 2Y7KA 4WEDA 4F18A 2FYIA 1UIVA 3N26A 3T9HB 1Y3NA 2ALUA 1DTGA 1IXCA 3VDFA 4ONYA 5CMMA 5CBSA 1IUDA 1A99A 3Q29A 2OWSA 3S4UA 3W15C 2D5WA 3FJMA 1NH7A 3Q26A 3K2DA 5HM4B 4ELOA 2DWHA 2Y7RA 1URDA 3PPRA 2XXIA 4PFTA 4EDPA 1YTVA 4U4SA 2UVGA 4NWDA 3T9XB 1LAFE 5FTIA 3PMWA 1POY1 1DMBA 1L5TA 2Q88A 4KPTA 4LQ5A 1ZLQA 1IXIA 1M5DA 3RT6B 3TFLA 1LCTA 4XIGQ 4OZ9A 3VVFA 3S9NC 1URSA 4IY5A 3H6WA 2NOOA 3CSGA 2QS4A 1A8FA 1M5EA 4PFUA 1FTKA 3G3KA 2ABHA 1SW1A 4PP0A 4KYDA 4L17A 3PPQA 2IEEA 1DOTA 5BUUA 4YKJA 2Q2CA 3CIJA 2H9BA 3TUSA 1MQDA 4PFWA 4RPNA 2PT2A 5TU0A 2F7CA 2RC7A 2Q9TA 5TP9B 3IB1A 1WDNA 3O28A 1SI1A 3OD7A 4ZEDA 3OELA 4R2FA 5K2YA 3EN3A 4P0IA 2XXHA 3TCFA 4XKQA 4I8CA 5CMCA 2ZMBA 1LBBA 1NH8A 1JVXA 1MQHA 4U1OA 1PBQA 3K1NA 5EHMA 3MPLA 5CRYA 1VFDA 4E0XA 4LZ8A 2ESNA 3MP8A 5JTYB 4R6YA 4U23A 4ZEIA 2DS9A 1ANFA 1MDQA 2UXAA 3BFUA 3OOAA 4PETA 3T96B 2DOJA 4FJPA 4EQBA 1MXYA 2HEUA 4FAJA 1GGGA 2VD3A 1VSOA 2HAUA 4LQ2A 4RXLA 3EHSA 1B3GA 3O6IA 4OERA 4X9TA 4LP2B 1URGA 3DM0A 2PVUA 1QW0A 1FQAA 3FVNA 2I4CA 1POTA 2XHDA 3IR1A 3T93B 1TT1A 4NF5B 2VGQA 1M5CA 1DPEA 1VR5A 4GXSB 3PUWE 1SDXA 1MXVA 4R9GA 2I3VA 5FHMA 3GBAA 1UIUA 1ZKBA 2Y7IA 5KCJB 1ELJA 1MXZA 2HXWA 3SETA 3QSLA 4IGTA 2Z22A 4LZ7A 1MRPA 4PFYA 1MH3A 4F19A 2NUVA 1Y4CA 3A09A 1P1UA 1MPBA 3IAZA 5TPAB 1D9VA 3UP9A 4UA8A 3U94A 5EHSA 1B1HA 4RY1A 5L9MA 2DXRA 2X7PA 4H5FA 3FV1A 2HZKA 4XKPA 3A3CA 4G68A 2DQVA 1LB8A 1Q1KA 4F1YA 1MM7A 3MZ1A 1FQCA 2G93A 3FXUA 4ZZEA 4X48A 1DSNA 4GF8A 3T66A 3S9LC 1YAEA 4KI0E 4YKKA 3W9WA 1QJMA 4ECFA 4K3FA 2BJJX 4IO4A 2YLNA 4OMBA 3MQ9A 5L8DA 4YB7A 3Q25A 4F2QA 3B6WA 1BLFA 4DLDA 5I84A 5H8QA 1JW4A 5L9OA 2XXRA 5KDTA 3PUVE 4G68C 4FEBA 3FXQA 1MQIA 2O7IA 4HCYA 1N04A 5HPQA 3K0VA 3U72A 2XD3A 2VOZA 4KYSA 1PDAA 1PB8A 3GBBA 1XOCA 2F6GA 3EHUA 4ZEFA 3KGCA 3IK6B 3ILUB 4DDDA 1B32A 5H8NA 1Y9UA 1US5A 4QSDA 5I56B 1IQ7A 1D9YA 5I2NB 1USYH 2Y7WA 3UK4A 2HQ0A 4U2RA 2OJTA 3VVDA 1Y4TA 3ZS6A 3FVKA 2XXQA 4MH5A 5AA4B 1IXGA 4YMAA 4MLVA 2Z23A 4TQUQ 1GVCA 2QPQA 3IJXB 1B7HA 4AB5A 4EQ9A 3SEUA 4F2OA 3R6UA 1TXFA 5TPAA 1P1WA 3CFLA 1A54A 3GLBA 4OQOA 3O97A 2DVZA 4M4GA 3D4GA 3M3KA 4OESA 4R6HA 1MG1A 5AE4A 2QSXA 2I58A 3RTWB 3WAEA 3PUZE 4R9FA 1N7XA 3H4ZA 2RCBA 3OO9A 1Y1ZA 1TWYA 2CZLA 3G3HA 4HTGA 4O3AA 2B65A 2GRVA 1Z7NE 4UACA 1OLCA 1MM6A 1LFHA 5H8FA 2M8CA 4IO7A 2OWTA 3FVOA 3O2AA 4RYAA 5ICTA 1O63A 4EF2A 3HO7A 3DP6A 3A3UA 1LAXA 2XXPA 1EH3A 2OK2A 4P0GA 4YAHX 1BKAA 3TTNA 4JXIA 3FD3A 2A5SA 4OEUA 1LGBC 4FORA 3MUQA 4E0WA 3SEXA 5IAIA 1II5A 4O3BA 1O7TA 1A7LA 4GL0A 4GXAA 4N07A 3T22A 4YZZA 3E9XA 5I56A 5I2NA 3VLVA 3MP1A 3TKDA 3K4UA 1GTKA 1N3WA 3K02A 3H3GA 1MY1A 4H0WA 4N13A 3TYHA 4DE8A 3IJOB 2H99A 3Q28A 3UA8A 3U8QA 3LSLA 1P1NA 3KEIA 4NWCA 4ZDMA 3ZKLA 1MXUA 2O51A 3K6UA 2QS3A 1TFAA 2XXWA 3VXBA 4GOTA 2ONSA 2QS1A 1NKXA 1SW4A 1MDP1 4YB6A 4AB6A 4G8NA 4NF8A 5FHOA 2P0SA 4Z0IA 1B3LA 4BDMA 3PGFA 1FTOA 3IL1B 2YJPA 1USYE 2XD2A 3USDA 4H65A 1FQEA 4XKNA 3FGSA 4MF3A 4F3SA 3IORA 3K01A 1A40A 3HPIA 2E0SA 2X26A 4P11A 4ZECA 4I1DA 1B4HA 1LBCA 4KR5A 4OFOA 4EXLA 3UORA 2NXOA 2OCUA 1N84A 3HHGA 4RNSA 1MS7A 1GR2A 4ISUA 4R72A 4BLAA 4FE8A 4YKIA 5I59A 1ATGA 4XXUA 3SEWA 2F34A 5I2KB 4DXCA 2DE4A 1CB6A 4HW8A 1I69A 4U21A 4BDQA 1B3FA 2GFEA 2HCAA 2RC8A 5CMKA 1IIWA 4BDLA 1VFEA 5AA2A 1UQWA 1JEUA 5CI5A 2O1LA 3H6VA 1QKBA 3KJTA 1JW5A 3K00A 1TFDA 4IB2A 2RF1A 4GL8A 4ZE8A 2Q8JA 4OFJA 3MZBA 3FVGA 3Q27A 3L6GA 4G68B 3CI8A 5ITOA 4JSDA 1NFTA 1N0TA 4C1TA 1PEBA 3CFZA 3THIA 1R1NA 3PMXA 3U92A 1T0KA 1H43A 2OLBA 3PUXE 2O84X 2ZXTA 3FATA 1D3KA 1OQGA 2AL4A 1AMFA 3VLUA 2H25A 1IXHA 1LFIA 1MY2A 1OVTA 5AA1A 2ZYMA 3FJ7A 3S2VA 2DXYA 1JEVA 5H8QB 3SEYA 3OO8A 3MVXA 5KDTB 2GHAA 3VXCA 4R2BA 2V3UA 3I6VA 4YMBA 2B3BA 3IOWA 3OEMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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