4JWYA

Glun2d ligand-binding core in complex with propyl-nhp5g
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
281
structure length
269
Chain Sequence
QHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLNEKRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARGTTVSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D
publication title Structural determinants of agonist efficacy at the glutamate binding site of N-methyl-d-aspartate receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 85
structure length 269
sequence length 281
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-03-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4jwyA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4jwyA02
3CIJA 5DEXB 3K6WA 2O84X 5I57A 4AB6A 4IO2A 4O3CA 1FQEA 4RPOA 2I58A 4BDOA 1NNPA 5M2VA 2P0SA 2F97A 1Z7ME 1Y1MA 1SD3A 1ZBMA 1B32A 3FVOA 4DXCA 3BFTA 2DS9A 3TAJA 4HTGA 1HSLA 2RF1A 4UA8A 2X7PA 3HCQA 3FJ7A 3S4UA 1B7HA 2ONRA 1L5TA 4FATA 4BDRA 1IXHA 4KR5A 2ZNSA 4MFIA 1IQ7A 1S9TA 3MUQA 5I58A 1M5CA 3FVKA 3QSLA 5I84A 4JBZA 2ZYMA 4ZE8A 2O68A 4GXSB 1O64A 3OSRA 1ZU0A 4H5GA 1DTZA 3CG3A 4LQ5A 2HZKA 2VD2A 1MXYA 1NH7A 1AH5A 4HCYA 1MM7A 3P7IA 3CSGA 2QS1A 4NWDA 1RYXA 1PB9A 4MBPA 3TPAA 2VD3A 2CMOA 2Y7IA 2VHAA 4YMAA 1D9VA 5ICQA 2OLBA 2DXYA 4O3AA 3H3GA 1ZIUA 4R6YA 1FTKA 2XXTA 4IY6A 3CR9A 3MVYA 1MPCA 5DYHA 2ABHA 1Z7NE 4R9GA 1IITA 1SW5A 1EZOA 3FGSA 3MAMA 4LZ5A 3FXQA 3ZKLA 3PPQA 1OIBA 2YJPA 3H4ZA 4RPNA 3QAXA 1S50A 1SYIA 4H8JA 4EUOA 1R9LA 4QFNA 3KBRA 4ISUA 2ZYKA 3DELB 2QS4A 2Z22A 4F3GA 5CRYA 1IZ1A 3M3FA 5AA1A 1H43A 3I5OA 1IXIA 4OESA 3VXBA 5FHNA 2QJEA 4K3FA 5FHOA 4EQBA 1P1OA 1HSJA 5B70A 4R2BA 3PUYE 2Z8FA 2A5TA 3QIMA 4PP0A 4MF3A 3UIFA 4NE4A 4LP2B 1OLCA 5LOMA 1USYE 4RNSA 2F7BA 4H0WA 4OERA 3UN6A 4H65A 2RC7A 3UK4A 2DP8A 2ALUA 1EH3A 1MY4A 4HS7A 2XHDA 5KZTA 4E0WA 4QSDA 4G4PA 1FQAA 2OCUA 2H5YA 3TCHA 3M3LA 5K2XA 1FW0A 4R75A 1A55A 4DLDA 2F5XA 1RKMA 3LSFB 5TP9B 3O6HA 1AL3A 4H67A 3GBBA 3C33A 4GXAA 4NMYA 3E4RA 5CBRA 4FAJA 4R6HA 1S7YA 4YICA 4RY1A 1N04A 3CFZA 4LATA 4F1YA 2RC9A 1A40A 3G3IA 1B40A 3PV0E 2ZXTA 1Y3NA 3JYRA 3KJ7A 5I56A 3GBAA 4R74A 1TWYA 3PUXE 1LGBC 4QFKA 1OLAA 3L6HA 1PB8A 3TUSA 4GL8A 3GZGA 4BDLA 4KHZE 2O69A 4Z0IA 4DCXA 3AXFA 1LLSA 4M4GA 5ITOA 3RY3A 2ONSA 4QFLA 3LUYA 3QXMA 2R9JA 3SEXA 2UXAA 3ZS6A 4FORA 3C32A 4I8CA 2PYYA 5KCJA 4U2RA 4JWYA 5I2KB 4FJPA 3VV5A 3K6XA 1B5JA 4U4SA 3VLVA 3O6GA 5BUUA 1M5EA 1B5HA 5H8HB 5ICTA 2OJTA 4NTLA 4EQ9A 1A7LA 2UYFA 3R6UA 3U8QA 1MG1A 3B6QA 4F2OA 4G8HA 2OBGA 1MXZA 5L9SA 3ODBA 2CZLA 1MQIA 4ELRA 5JEIA 4TLLB 1FTJA 4M1VA 4F3BA 3L6GA 3VVEA 2B65A 2Z8EA 4PQJA 1MXWA 3D4CA 3IJOB 4ZS9A 3VLWA 3USDA 3Q28A 3TMGA 1P1UA 1JVXA 3VVFA 4RK2A 1N0TA 3TELA 4IO5A 5L9MA 3MWBA 1MXVA 1B4ZA 3MVXA 3IOWA 1NNKA 1NKXA 4YKJA 4NF6A 2D5WA 4YB5A 1B05A 4IGTA 1A54A 4N6PA 1JEVA 1NL5A 3VVDA 1H45A 1SW4A 4GD5A 4GRKA 3KSXA 1OVBA 3N6UA 3MQ9A 4R9FA 5EHSA 3KJTA 1QKBA 2DWIA 3TDJA 2PVUA 2UVGA 1UTHB 2R6GE 2ZNTA 3JZJA 4E0XA 3A3UA 5DEXA 2A5SA 3U93A 2O7IA 1UQWA 4IGRA 3QUFA 4GWOA 4XKQA 1XHYA 4YAHX 2QS2A 5KDTB 3FJMA 3E3KA 4OVJA 1QULA 1M5DA 2FA7A 4X9TA 3O29A 1EZ9A 1QUIA 1B58A 3VE1B 4ESWA 2UVIA 1DPEA 4H6DA 3H6UA 5FHMA 3C35A 1LBBA 4ESXA 5EYFA 2RCAA 2XXUA 3PUWE 2PBWA 1Y3PA 4PE5B 4XKNA 4F19A 3HSTA 1I6QA 4PFTA 3QYTA 3SESA 4F3SA 1NNTA 1LCFA 1DSNA 2F6GA 2UYEA 1XC1A 1MRPA 1PBPA 3QUJA 3TQWA 1LB8A 5DVIA 4KD5A 3EPEA 3VLUA 1HSEA 2DE3A 3PD9A 3OO6A 3KN3A 1AIVA 1FTOA 3K01A 1H44A 2REJA 3N94A 2QPQA 3Q26A 1O63A 4F22A 1O7TA 3FZVA 4GL0A 2DE4A 3O28A 2I4BA 2ZYNA 3IOTA 3U72A 3VXCA 2UVHA 4KPTA 1PDAA 4JSOA 3FVGA 4QFPA 2Q2CA 4DZ1A 3OENA 3OOAA 4HW8A 4P0IA 4I9DA 2IEEA 2Y7WA 2NWJA 3MPLA 5ISUA 2Y7RA 3DP8A 3O6IA 1B4HA 4U4XA 2DOJA 1FQCA 1CB6A 1I6AA 2O1MA 5AA2B 4YKIA 2LAOA 1BTJA 1FQDA 3LSWA 2QSXA 3PPRA 2D21A 1B9JA 1XOCA 1NNFA 2Q9TA 2DVZA 3IAZA 1JW5A 1I69A 3LSXA 3HPIA 4MLQA 3T66A 2XD2A 2AL5A 2QMXA 3IO6A 2VGQA 4KCCA 3S2VA 1POY1 3VFJA 2HAVA 5HPQA 3PD8A 3TTRA 4C0RA 3G7WA 3RGYA 2HCAA 3TQLA 3TTKA 5AA4B 1M5BA 3K1NA 5FTIA 2IA4A 1YCJA 2ANJA 3SKPA 1URDA 4ZDMA 2GRVA 3T22A 1LAXA 1N3WA 2AL4A 3CI8A 4POXA 4G8NA 3H03A 4RK9A 3IK6B 1MXUA 3HN0A 1N3XA 3FATA 3K4UA 4U21A 3W9WA 1KWHA 1D9YA 4JDFA 4ELPA 4F2QA 3RT6B 3FXUA 3MBPA 1J1NA 4F3PA 4F1VA 1DOTA 1ELJA 3OO7A 3TCFA 1H76A 1FTLA 2RINA 1Y9UA 3BKIB 2RC8A 2Q8JA 3RNNA 3IL1B 1MPDA 2NUVA 3CSBA 5CMMA 3V83A 1FCKA 3K6UA 3K6VA 3T9HB 2ONKE 4H1XA 2VOZA 5TP9A 3UGWA 2G29A 5L8DA 4ECFA 2X7QA 1N76A 3HV1A 1JEUA 4EF1A 4UACA 1MH3A 3S9LC 5J1DA 4U1ZA 3KN7A 3EHUA 1PB7A 2M8CA 2XD3A 1TXFA 3HO7A 3K00A 4OZ9A 3IJXB 1PEBA 2HZLA 1QKAA 5I2NB 3C36A 1Y3QA 2O7UA 1SVXB 4G2ZA 1ZKBA 1FTMA 2XXRA 3K2DA 2D3IA 3DLNA 1OQGA 4OYVA 4U22A 2OK2A 5JTYB 3CFLA 1Q35A 4TOZA 4R2FA 3CRBA 3H06B 1II5A 2XXPA 2XX9A 1VR5A 4R6KA 4THIA 3H7MA 1NFTA 2I3VA 4U1OA 5H8QB 3CVGA 2YLNA 1BLFA 5I2KA 1A99A 2V3QA 3QK6A 2Q89A 5H8HA 2WKYA 1YTVA 5CM6A 1AOVA 4LUBA 2UVJA 3O2AA 2PT2A 3T93B 5HM4B 3PPPA 5ITPA 1B3LA 5EHMA 4ND9A 3G3HA 1URSA 3T96B 1B7ZA 1N7XA 1URGA 3THIA 3I6VA 1XS5A 3O97A 4XKPA 2PMSA 1QVSA 1MH4A 2X26A 3PMXA 2B3BA 2F7AA 2ZMBA 4F39A 2GFEA 1PBQA 2HFBA 2H98A 3TYHA 1N84A 4ZE9A 1R6ZA 2Y7PA 2DWAA 1B52A 3OSQA 1JNFA 3K1PA 1B7UA 1UIVA 1ZJLA 4YKKA 1Y1ZA 5H8NB 3A3CA 1B2HA 4H5FA 1N7WA 2FYIA 4ZZEA 4DXBA 4FEBA 1VFDA 1ATGA 1B0HA 3I3VA 4FECA 4BLAA 3K02A 2O51A 4ZEBA 1B1XA 3IR1A 1USYH 4ZEKA 5DTBA 4G77A 1LFIA 5DT6A 1UTHA 4DXUA 2V3UA 3S9MC 4AQ4A 1MPBA 4GF8A 4YB6A 4ELOA 3MPKA 3LC8A 1DTGA 3RUMA 3MP6A 3C9HA 4OFLA 3R7XA 1LAFE 4IO6A 3S9NC 5KDTA 3WAFA 2AYSA 4DIGA 3E9XA 2I4CA 3E13X 3FJGA 5I59B 3G3JA 4OQOA 1B0LA 2G93A 5F1QA 4EF2A 4C1TA 4OWDA 3S9EA 1LAGE 1QJMA 2OWTA 1A8FA 5CI5A 5IKBA 4N13A 2Q88A 2O6AA 2HXWA 4X48A 3KN8A 3RPWA 3H6WA 4IO7A 2HEUA 3MZ9A 3OELA 4TLMB 4ELQA 3PUZE 4X1DA 3EF7A 3O9PA 1P1QA 2QRYA 1B3HA 3SETA 2B3FA 4IB2A 4WEPA 3LR1A 3O66A 3HHFA 4P0GA 4RJZA 3FV1A 4NF4B 4KQPA 4YKPA 4X1BA 2W7YA 1XT8A 1DPPA 2NVUB 3KG2A 3FD3A 1JW4A 4JB7A 2I0BA 1ZMGA 1B1HA 2PX1A 1US4A 3PPNA 2OZZA 4QF9A 3PPOA 5BWJA 1MY1A 2FNCA 4XIGQ 4MLVA 1WVJA 1H3DA 4RYAA 4Z7EA 4LZ7A 3DP4A 3MP1A 4KI0E 3IO4A 3ILUB 3Q27A 2YPNA 4NEDA 3IX1A 3F11A 3Q25A 4EXKA 1QUJA 2H4IA 3SEYA 2XXQA 1A8EA 5AA2A 4NF8B 2DXRA 3FXRA 3V8XB 1MQJA 5H8FB 3SEWA 2GHAA 1P1NA 4PFWA 3OEMA 2Z8DA 4KYDA 4OHNA 1B3EA 3FV2A 4IO4A 1GR2A 1XVYA 3KFMA 2AIXA 5A5XB 3JV9A 1ANFA 4JWXA 4OENA 4L17A 3N26A 3BFUA 2QS3A 4I62A 1OQHA 4FIMA 4IO3A 4FEDA 4TQUQ 2DWHA 4PETA 3EHSA 4PFUA 5AA4A 5AA2D 3GLBA 5CBSA 4OEUA 3RT8A 3OMBA 4EXLA 2ZNUA 4KFQA 5CMCA 5IAIA 3U1OA 3ZKKA 1GV8A 2F6PA 3DP6A 4ZECA 1T0KA 4QSCA 2F78A 5TPAB 2DQVA 3EQ1A 1QW0A 4G68B 1R9QA 4XXUA 3OO9A 4O3BA 1D4NA 4F31B 4NF5B 3VDFA 2HAUA 2REGA 1YAEA 4Q8RA 2HQ0A 4Q5TA 3V89B 2XXXA 1MS7A 1QUKA 4ZEDA 4LONB 3T9UA 4QHQA 2I6EA 1OVTA 1FQFA 1DMBA 3W9VA 2PT1A 4LA9A 1WDNA 4LVQA 2Z23A 1FQBA 1MQHA 1LFGA 3IB2A 1Y4CA 5DVJA 3EHTA 1LSTA 3SERA 2Q2AA 1UTBB 1VFEA 4BDQA 3BBRA 3RN8A 1US5A 2Y84A 4N07A 1SI1A 1SDXA 3CFXA 5I57B 5I2NA 1SW1A 1MXXA 4OETA 3ILTB 4GLIA 3IOVA 1LBCA 2QL3A 3TTLA 3PMWA 4OMBA 5JTYA 4KCDA 2BJJX 4LZ8A 3H6TA 2GH9A 3TZAA 1IXCA 4MH5A 3GXAA 1M5FA 4GOTA 4KYSA 3HHGA 4IY5A 1BKAA 3R26A 2XXYA 5H8QA 3WAEA 4OTEA 5CC2A 5H8SA 4QSEA 3LSLA 4Q30B 2XX8A 3SDFA 3IB1A 4WEDA 2F35A 3B7DA 3PGFA 2H99A 3TFLA 3UP9A 4KYEA 5I58B 1Y4TA 2R71A 2OWSA 1IXGA 2O1LA 1SQYA 1D3KA 2V84A 3FASA 4JXIA 2QMWA 3TCGA 2VP1A 4GIZA 3W15C 3PMVA 1MQGA 3FIRA 1MM6A 4ONYA 1GVCA 3SEVA 3MVZA 1MDP1 2NXOA 2XXWA 2RKMA 3UA8A 1SYHA 4HCWA 3ONMA 4AB5A 4GQOA 4YU0A 2DSFA 2DWJA 4LQ2A 2F34A 3KOTA 1CE2A 3ECRA 3KZGA 4XTCQ 5HBCA 3MP8A 1ZLQA 1LCTA 4WXJA 3K0VA 1TFAA 3FUZA 1PC3A 1SW2A 3T9XB 3U94A 4RXLA 4DCYA 5H8NA 2Y7KA 4ZEFA 1TFDA 3DM0A 3MZBA 4POWA 1MQDA 1LB9A 4EQ7A 3M8UA 1IIWA 1AMFA 3B6TA 1P1WA 2I49A 4C1UA 3MC2A 4PFYA 3FVNA 5AA3A 4OFJA 1B51A 2RCBA 1WODA 3RLFE 4OEVA 3OEKA 3T9VA 1F9BA 3EN3A 4P11A 4YB7A 1LAHE 5I59A 1B3FA 3D4GA 1NH8A 5FTHA 1ZTYA 1SI0A 4QFOA 3V5AA 5DVFA 4R72A 5K2YA 3CG1A 3KEIA 1EZPA 1B3GA 3OD7A 1IEJA 3G3FA 3C31A 3TODA 2A5TB 3TTNA 3TKDA 5CMBA 1MY2A 4FE8A 5F7VA 2H25A 1B5IA 4JSDA 2THIA 1Y20A 2DE2A 3ZSFA 2XXIA 3MW0A 3N6TA 3N5LA 4NF4A 1JW1A 3MZ1A 4Q0CA 3U92A 4DE8A 3KOSA 1I6BA 3H6VA 3RTWB 3Q29A 1IUDA 5L9OA 3RTFB 2E0SA 4YMBA 4G8MA 1UIUA 1EU8A 1YPNA 3M3KA 3K1MA 1SBPA 2NOOA 2DYXA 1JVYA 2E1SA 4ZZAA 3C4MA 4F1UA 3PUVE 4F29A 5I56B 5AE4A 5B7DA 4RA1A 3LBSA 4OXVA 4I1DA 4NF8A 1XVXA 1TT1A 1OMPA 5TU0A 4YZZA 2XXHA 5H8FA 4OFOA 2GHBA 2V25A 3A09A 4GFRA 4ZEIA 3G3GA 4EDPA 1VSOA 1R1NA 2XXVA 1BP5A 3TEPA 2V93A 3MJNA 5A5XA 2F7CA 2I3WA 4JWOA 5ELVA 2P2AA 5KCJB 3SEUA 1JETA 1BIYA 4F18A 1B6HA 1B46A 5JK4A 3OXNA 2ZYOA 3MVWA 3B6WA 4QRZA 3IORA 3IB0A 2ESNA 2F8DA 1NMUA 1MY0A 2DVCA 3UORA 3PU5A 3KSJA 2H9BA 4R73A 5TPAA 4BDMA 4XKRA 1Q1KA 4U23A 4G68A 3TTMA 3KGCA 4H8IA 3G3KA 3IOUA 4NWCA 2F36A 4NF5A 2XX7A 1P99A 1MY3A 4NF6B 3OO8A 5CMKA 1GGGA 1JQFA 2I0CA 4WKMA 2P1SA 1POTA 1RYOA 4DDDA 4GVOA 1LFHA 1VE4A 1MDQA 2I48A 2KLFA 1UTBA 4BDNA 1GTKA 4G68C 2V3TA 3RQTA 3C34A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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