3T96B

Iodowillardiine bound to a double cysteine mutant (a452c/s652c) of the ligand binding domain of glua2
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGCRDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDCGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanism of AMPA Receptor Activation by Partial Agonists: DISULFIDE TRAPPING OF CLOSED LOBE CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t96B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t96B02
1CE2A 1B58A 1PDAA 3MZBA 3KGCA 4LA9A 4DXBA 4PFUA 1B3FA 4F22A 3CIJA 4XKPA 3PUWE 1UTHA 1B6HA 4KFQA 2UXAA 3Q28A 1FQFA 3Q25A 3GXAA 3OENA 2F6PA 4ZEBA 3O6HA 3S2VA 1B4ZA 1O63A 5IAIA 4OEVA 1SQYA 3MP1A 5I58A 3RT6B 4KCDA 4AB5A 4ZE8A 3G3JA 4GD5A 1UIVA 4R6HA 4Z0IA 3CVGA 3S9EA 3LBSA 4G68A 1FQDA 3GZGA 4OWDA 3QAXA 5CMKA 1DOTA 1P1WA 3IO4A 4NWCA 2YJPA 1I6AA 4X1DA 1B51A 3CG1A 2ESNA 1PB9A 1Z7NE 1AIVA 3C33A 3DM0A 2ZYKA 3G3KA 2XXWA 4MLQA 4YMAA 1MRPA 1B3LA 4IO4A 2RCAA 2YLNA 3LSWA 3KJ7A 4MBPA 1M5EA 1B0LA 1Y3PA 2HQ0A 4BDRA 2I3VA 4NTLA 3FXQA 1A7LA 4FIMA 1ELJA 4AQ4A 4Q8RA 2HFBA 1B05A 3H06B 5CMCA 2I4CA 4QHQA 2XXXA 1LB9A 4OYVA 3MP6A 3T9UA 4LZ5A 1QVSA 3OSRA 5H8FB 2I6EA 2BJJX 1CB6A 2H98A 4IO6A 2VHAA 2QS3A 3PPPA 1IITA 3MBPA 3K1NA 2NVUB 3E13X 4G4PA 4ZE9A 1VSOA 5AA2A 5I2KA 3H4ZA 3C31A 3KN3A 5KCJB 1LBCA 2RF1A 4DXCA 2DE4A 1O64A 2F8DA 4XTCQ 3PMVA 2QS4A 1FCKA 3C34A 5I2NB 4Q30B 3VVEA 3PV0E 4PFYA 4BDNA 5J1DA 3IX1A 5DTBA 3MVYA 1US4A 2HEUA 1JEVA 3DP8A 3OMBA 4G8NA 3N5LA 5DVJA 4XXUA 3H6TA 1BKAA 3IB0A 4PETA 5L9OA 1RYOA 3I6VA 3VVDA 3N6UA 4NWDA 3EQ1A 4ZDMA 1O7TA 3PPOA 4JXIA 4F3PA 1MPCA 3MUQA 3KOSA 1MQHA 1T0KA 3QUFA 3UGWA 3M3LA 4THIA 4OEUA 2H5YA 4O3AA 1LSTA 4DCYA 3IOWA 4O3CA 4R2BA 1QW0A 1LAGE 4BLAA 3MZ1A 1BIYA 2DSFA 3QXMA 4R74A 4KI0E 4MLVA 5H8NA 3TUSA 5FTHA 1D9VA 2F35A 1FTKA 1WVJA 4GFRA 4RPOA 1NNPA 1UQWA 3UP9A 2F7CA 3ONMA 3PUVE 3CRBA 4ESXA 3VLWA 5FHMA 1POY1 4M1VA 2Y7RA 5FTIA 3IJXB 2QMWA 4DIGA 5DEXA 4GL8A 1GR2A 2XX9A 2O6AA 2DWIA 4H1XA 4GOTA 1R1NA 3PGFA 4HTGA 3D4GA 1BLFA 1Z7ME 1N3XA 1MXWA 3IORA 1R9QA 4GL0A 4OZ9A 1SVXB 1MQDA 1P1OA 1N84A 1B5JA 4LQ2A 5DVFA 3S9NC 2DE2A 3A09A 3K02A 4OXVA 2WKYA 5KDTA 4LUBA 3C4MA 4KHZE 4P0IA 3FVOA 5I56A 1BP5A 2Y7KA 4MF3A 3V5AA 1QUKA 4F31B 3FASA 3TCGA 1SW5A 2GH9A 1KWHA 1MXYA 2ONKE 3K2DA 4LATA 4QSCA 3T22A 5TPAA 5CMBA 2I49A 4RK9A 5HPQA 2DQVA 3K6XA 4JWOA 3SDFA 1I6BA 3EPEA 2UVIA 1HSEA 5HM4B 4ESWA 4C1UA 5M2VA 4G8HA 2ONSA 2PT2A 3MVXA 4XIGQ 1B7UA 3MZ9A 3UN6A 3R26A 3O28A 4YKJA 1S9TA 3IO6A 4X1BA 3KN7A 3EHTA 3OEMA 4POWA 4G8MA 1MXZA 2DP8A 2OLBA 1H76A 3RN8A 3IL1B 4H5FA 4FATA 3PUZE 3KBRA 1IXIA 2THIA 2UYEA 1XVYA 1D9YA 1A8FA 3D4CA 3QIMA 4P0GA 3PPQA 2Y7IA 3JZJA 1IXCA 4IY6A 4MH5A 3FVGA 3U72A 4UA8A 2F6GA 3FXUA 3H6VA 2ZMBA 3IK6B 4OETA 4BDLA 3VFJA 2QPQA 4PE5B 1FTMA 2X7QA 2XXPA 1TT1A 2DWJA 4OVJA 2CMOA 3PUXE 1H3DA 3SEWA 3DP6A 1JNFA 1B5IA 1URSA 3KSXA 2G93A 2AIXA 3UORA 4I62A 4H0WA 5K2XA 4FORA 4RY1A 5H8HB 3MPLA 3SEYA 4DLDA 2I3WA 2NWJA 4GXSB 4F39A 2I58A 3G3GA 1NMUA 4K3FA 5JTYB 3EHSA 5CC2A 2ALUA 4EF2A 2AYSA 3SERA 2PMSA 5ITOA 4RK2A 4JSOA 1EZ9A 4ZEDA 3QK6A 3ZS6A 3TTLA 1MQGA 3HPIA 3K1PA 3M8UA 1UTBA 1B52A 3I3VA 5IKBA 3RY3A 5I58B 3IOTA 1A99A 1M5BA 3KJTA 5HBCA 1QUIA 2XD2A 1NNFA 3HCQA 3A3CA 4H67A 3KFMA 5EHSA 2Y84A 4G68B 3M3FA 5EYFA 3IOUA 1M5CA 4JBZA 1SDXA 4U2RA 3L6GA 3TKDA 4NF4B 2XXTA 3SEXA 1XS5A 2P2AA 4OQOA 3N26A 2UYFA 3CG3A 4H6DA 2V93A 4LONB 1MM6A 1NH7A 1NNTA 1QUJA 4RYAA 3LR1A 1MPBA 2ZYMA 1PC3A 4YB7A 2DVZA 3OOAA 5AA4B 1N7XA 3IR1A 4R9GA 4DDDA 3Q26A 4ELOA 3PMXA 5ISUA 4TQUQ 1LAFE 2A5TB 3FVNA 1ZU0A 4KYSA 4R6KA 3TMGA 3IB1A 4ELQA 4YB6A 2H4IA 4IY5A 2I0CA 3N94A 3HN0A 3CFLA 3VE1B 2GHAA 1DSNA 3SETA 4R9FA 5AE4A 2HAVA 4KCCA 5I2KB 1SW1A 2UVJA 4LP2B 4ZEFA 1B32A 3ZKKA 2XXYA 1GV8A 2B3FA 3B7DA 3O66A 1TWYA 3E3KA 1LCTA 2RC7A 1GGGA 1ZIUA 4RXLA 5BUUA 1LFHA 1DMBA 2XX7A 4U21A 3RPWA 3K0VA 2NOOA 3TDJA 4H65A 1URDA 1VFDA 3F11A 2Y7WA 3E9XA 3G3IA 4H8IA 2XX8A 3TYHA 5I59B 1P99A 4ISUA 4NF8B 4QFLA 2PT1A 2V25A 1MY2A 3V8XB 2XXIA 3RGYA 5H8FA 2OCUA 2VP1A 3VVFA 2FNCA 2RCBA 4RPNA 2O68A 2H9BA 2UVGA 1I69A 3T66A 4GIZA 1A8EA 2FA7A 2Q8JA 1B2HA 2OJTA 1P1NA 3G7WA 5KCJA 1MQJA 2O51A 3B6WA 3V83A 1PB8A 3U1OA 3EHUA 4OMBA 4U4SA 1J1NA 2HCAA 1FTLA 5I2NA 2PX1A 3TPAA 3SEVA 1SD3A 1MQIA 1XC1A 4QFPA 4YZZA 4QSDA 2RINA 1OQGA 3K00A 3LSLA 5CRYA 4E0WA 3VXBA 1IZ1A 1Y9UA 3CFXA 5AA3A 1B7HA 1IEJA 1MXUA 2I0BA 3WAFA 4OESA 3TTKA 4FECA 3DP4A 3FIRA 4EQ9A 2OBGA 4F2QA 2OWTA 1HSLA 4KD5A 1IIWA 3CR9A 3O29A 4IO7A 3USDA 4EUOA 2VGQA 3M3KA 4H5GA 1PEBA 1PBQA 3O97A 4ND9A 3OSQA 2E0SA 5EHMA 5TP9B 1JEUA 1SW4A 1VE4A 5A5XB 4NF6A 3T93B 3RTWB 4IGTA 2AL5A 4YMBA 3O6IA 4OHNA 4IO5A 3RT8A 4GXAA 3FGSA 3PMWA 4FJPA 4NF5B 2XD3A 4FE8A 1MY4A 4QSEA 2GFEA 1PBPA 1FQEA 1LLSA 4WEPA 2ZNUA 1Q35A 3FXRA 3OELA 3C9HA 2G29A 1H45A 4F2OA 1YPNA 1Y3NA 1JETA 4N6PA 2F5XA 2DWAA 4ZEKA 3TZAA 2V84A 1A55A 4Q5TA 2I4BA 5JK4A 4F1VA 5ICTA 4U23A 2DS9A 3FUZA 5DT6A 4GQOA 2HZLA 5JEIA 1ZMGA 3HV1A 2Z23A 1VR5A 1QKBA 5H8QA 1R9LA 4YKIA 1XT8A 3OD7A 3S9MC 3R6UA 4R2FA 2O1LA 2IEEA 3TCFA 3V89B 3MQ9A 2LAOA 4F3SA 3OO7A 3ECRA 2DYXA 2ZYOA 3FJMA 1QULA 2ZNTA 4OERA 4BDQA 4HW8A 1N76A 3ZSFA 1B3GA 3EF7A 1MXXA 2X7PA 3MPKA 5L9SA 2D5WA 3U92A 2QSXA 3TAJA 4U4XA 1JVYA 1NH8A 4F1YA 2V3TA 3QUJA 4OTEA 3OO8A 5I84A 3O2AA 1P1UA 3SEUA 2P0SA 4EXLA 2RC8A 1USYE 1IXHA 3H3GA 4WKMA 4KR5A 3K6WA 4JWYA 3U93A 2VD3A 4KQPA 2FYIA 3DELB 1ANFA 3UA8A 5F1QA 4WEDA 4OFJA 4AB6A 1Y3QA 1B3EA 2XXQA 2YPNA 3KEIA 1LAHE 3LC8A 2X26A 1OQHA 1ZLQA 2F97A 1JW4A 3RUMA 3T9XB 4LZ8A 3W9VA 4FEDA 4GRKA 4G77A 1OIBA 2Q9TA 1GVCA 1NL5A 4GWOA 4R6YA 2Z8FA 3H6UA 2B65A 4F1UA 3Q27A 1LAXA 3C32A 4JDFA 4HS7A 4C1TA 3K6VA 2QJEA 1B1XA 1N3WA 4JWXA 4U1ZA 3H03A 3KOTA 1NFTA 3GLBA 4TLLB 1JQFA 3C35A 4HCYA 1PB7A 4DCXA 1OVTA 3TQLA 5KZTA 2XXUA 3LSFB 1FTJA 1UTHB 2QL3A 5CBRA 2Q89A 4ZEIA 2OK2A 2R9JA 1JW1A 1HSJA 1Q1KA 1AOVA 5H8HA 3CI8A 4FAJA 3FJGA 2IA4A 4N07A 3DLNA 2DWHA 1XHYA 2QS2A 3VDFA 5I57A 3RQTA 4TLMB 3PU5A 2F78A 4RNSA 5JTYA 1I6QA 1WODA 1URGA 2V3UA 3TQWA 3TEPA 3IJOB 5B7DA 4DXUA 3O9PA 4R72A 1DPEA 3CFZA 2Z8EA 1DTGA 4P11A 3RLFE 2QMXA 4YKKA 3PPNA 4YKPA 2H99A 4ELRA 5DVIA 4TOZA 1A40A 4LQ5A 1TFAA 1MY0A 4I1DA 4OENA 1MH3A 3IB2A 4XKNA 4G68C 4QFNA 4QF9A 1Y4CA 1SBPA 3LUYA 3FJ7A 2ZXTA 1ZTYA 2XXVA 4F29A 5F7VA 1H44A 1M5DA 3H7MA 1D4NA 3BBRA 3K01A 4F19A 4NF4A 3G3HA 1OLAA 1AL3A 4F3GA 5ITPA 1YAEA 4RA1A 2DE3A 4BDOA 4OFLA 2D21A 2Y7PA 4H8JA 1MH4A 1YCJA 4QRZA 4U22A 3VV5A 5ICQA 5AA2B 1ZBMA 4YICA 3FV2A 1S50A 1NNKA 3MVZA 1POTA 3MJNA 5AA4A 3TTMA 4KYEA 2NXOA 4IGRA 1B46A 3H6WA 1B7ZA 5H8SA 2NUVA 1P1QA 5L8DA 4POXA 4I9DA 1SI0A 1OVBA 2A5TA 2GRVA 4X9TA 4KPTA 3VLVA 2F7AA 1Y1ZA 4QFOA 3SKPA 1LB8A 1B4HA 4WXJA 1TXFA 1XOCA 4GLIA 3S4UA 3MVWA 2REJA 4EQBA 4EDPA 4N13A 1UIUA 3I5OA 4IB2A 5DYHA 2XXHA 1B0HA 4JB7A 4EF1A 2O84X 1B5HA 3TCHA 2OZZA 5AA2D 4M4GA 2I48A 3W15C 2Q2CA 3OXNA 3PD9A 1D3KA 3MWBA 3HHGA 5H8NB 3AXFA 4YU0A 4NMYA 4QFKA 3KSJA 3THIA 3CSBA 5ELVA 2DXRA 1SW2A 4EQ7A 4BDMA 4PP0A 5I59A 1M5FA 1LBBA 1MY3A 4NF8A 5LOMA 3GBAA 3Q29A 1N04A 5CBSA 3TODA 2D3IA 4IO3A 4R75A 3PPRA 4ZS9A 5DEXB 3MC2A 3FZVA 1LCFA 3MW0A 4Q0CA 2GHBA 4LVQA 2ONRA 4YB5A 4PFWA 3BKIB 1RYXA 4DE8A 2ABHA 1EZPA 4GF8A 4NF6B 1US5A 4PQJA 3B6QA 2OWSA 4FEBA 4XKQA 4UACA 2VD2A 3VLUA 1QJMA 2XHDA 2O1MA 2PBWA 1LGBC 1OMPA 4R73A 1B9JA 1AH5A 3MAMA 5KDTB 2VOZA 3LSXA 5TU0A 3T9VA 5I56B 2UVHA 1BTJA 1DTZA 3ZKLA 3ODBA 4IO2A 2HXWA 3UIFA 1MXVA 1LFIA 4RJZA 3T96B 1H43A 3SESA 3GBBA 1IUDA 3S9LC 1FQBA 4O3BA 3FD3A 3HHFA 1B3HA 1FQAA 4G2ZA 5TPAB 1NKXA 3U8QA 5H8QB 1YTVA 5B70A 1AMFA 2XXRA 1MY1A 3TTRA 2DXYA 3BFTA 1Y1MA 1MG1A 1SI1A 3JYRA 4LZ7A 2HAUA 2W7YA 1EU8A 5TP9A 2O7UA 1S7YA 3PUYE 3TFLA 2Q2AA 5A5XA 2REGA 1VFEA 2F34A 1MDQA 1MS7A 3U94A 1II5A 2QRYA 3TTNA 2F7BA 4GVOA 2A5SA 4HCWA 2R71A 4NF5A 4X48A 2B3BA 3CSGA 4YAHX 2DVCA 1MPDA 2PYYA 2RC9A 4NE4A 5CI5A 4ZECA 3O6GA 2QS1A 1GTKA 4I8CA 2ZYNA 4DZ1A 3RTFB 1FW0A 2P1SA 3UK4A 4L17A 3R7XA 3B6TA 1A54A 1B1HA 2E1SA 2O69A 3EN3A 3OO6A 3KN8A 2O7IA 1ZJLA 1EH3A 5FHNA 1ATGA 4ECFA 3FATA 3K1MA 2R6GE 3P7IA 3MP8A 4EXKA 1JVXA 1F9BA 5AA1A 4ONYA 4PFTA 4NEDA 3IAZA 1DPPA 4JSDA 2Z22A 1MDP1 4U1OA 3FV1A 3T9HB 1EZOA 2ZNSA 1Y20A 3RNNA 4Z7EA 3W9WA 4XKRA 3IOVA 3TELA 1B40A 2F36A 4ZZEA 4C0RA 3E4RA 3FVKA 3BFUA 4E0XA 1Y4TA 1WDNA 3JV9A 1IXGA 1ZKBA 2Q88A 3HSTA 2CZLA 5L9MA 3ILUB 2RKMA 2M8CA 5BWJA 1OLCA 3KG2A 4F3BA 1MM7A 4MFIA 1N0TA 4ZZAA 1UTBB 3KZGA 3WAEA 1IQ7A 2DOJA 1LFGA 3K6UA 2KLFA 1SYHA 3QSLA 5I57B 1SYIA 5K2YA 3OEKA 2AL4A 2HZKA 1JW5A 3C36A 2ANJA 1TFDA 2V3QA 4OFOA 3PD8A 3A3UA 4KYDA 3K4UA 1FTOA 4ELPA 1N7WA 3OO9A 5FHOA 5CM6A 1QKAA 4F18A 1USYH 3VXCA 3G3FA 3HO7A 3QYTA 2Z8DA 5CMMA 2PVUA 1RKMA 2H25A 1R6ZA 1XVXA 3L6HA 1FQCA 1L5TA 3ILTB 3N6TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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