3T96B

Iodowillardiine bound to a double cysteine mutant (a452c/s652c) of the ligand binding domain of glua2
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGCRDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDCGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Mechanism of AMPA Receptor Activation by Partial Agonists: DISULFIDE TRAPPING OF CLOSED LOBE CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t96B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t96B02
5H8FA 3MAMA 1N7WA 3QAXA 1IXCA 3UK4A 3TELA 3H6WA 3MPLA 5H8NB 2Z23A 3CIJA 5TP9A 1MQJA 1Z7ME 3U92A 4TLMB 1PBQA 1XHYA 1TWYA 2ABHA 3IL1B 4JSDA 3BFUA 1B3FA 1MH3A 3O2AA 2M8CA 1JQFA 2B65A 4DE8A 2NXOA 3K6VA 3LSFB 2I3WA 1NNPA 2X7PA 3VE1B 1B1HA 3T9UA 1N3XA 3HV1A 1BP5A 3DP4A 3QUJA 5HBCA 1B0LA 3ECRA 1D9VA 5JTYB 1M5FA 4KHZE 3PMVA 4M1VA 4OQOA 1URGA 2UYEA 2VOZA 4FORA 1O7TA 4KCCA 1SYHA 4LATA 1M5BA 4YU0A 5CBSA 3Q26A 2R71A 1QUKA 4X1DA 2XX8A 3N94A 2DVCA 1DMBA 2H25A 3OO9A 2QMXA 4NE4A 4QFKA 4H5GA 2OLBA 4P0IA 3TMGA 4YZZA 2I6EA 1USYH 2RC8A 2PYYA 3H7MA 1FCKA 3LC8A 4F3BA 4JWOA 3QIMA 4F1UA 5H8SA 2DWJA 1MY2A 4U4XA 1Y3PA 1MXWA 1PDAA 1NNKA 3RT8A 4LA9A 2ANJA 3F11A 4OMBA 5K2XA 5BUUA 2VD2A 3OMBA 2I4CA 4ESXA 5DVFA 4X1BA 2O7UA 2PX1A 3IB0A 4RY1A 1ZU0A 4ZEIA 1SW2A 1MG1A 3KSJA 1LCFA 4R2FA 1B4ZA 3MVZA 4KD5A 4H6DA 5A5XB 2I58A 1KWHA 4H0WA 3ZKLA 3USDA 1S50A 5CI5A 1UTHB 1LFIA 4E0WA 4XKQA 1ANFA 4IB2A 1EH3A 1LAHE 3KN7A 3RLFE 1OLAA 3UN6A 3H4ZA 2PT1A 3OSQA 5L9OA 2GFEA 2A5TA 2G93A 2THIA 1FQFA 4F39A 3M8UA 3IB1A 2HFBA 1OVBA 4FEBA 1MXXA 4P0GA 4U2RA 2Y7RA 4Q0CA 5L9MA 5KDTB 1M5CA 1BIYA 3TUSA 3O6IA 1PEBA 3SETA 3S9MC 4F2QA 4RPOA 3FIRA 4NTLA 4JDFA 1AIVA 1B58A 2Z8DA 1B3LA 1Q35A 1MY3A 1ZJLA 3JZJA 4PQJA 1GTKA 1O64A 4F18A 1OIBA 3OEMA 3K2DA 3PMWA 1FQAA 4QFPA 4ZE9A 2Q8JA 5CC2A 2F36A 1UQWA 3K6WA 2HZKA 1UIVA 1LGBC 3WAFA 4RK2A 5CBRA 3K6UA 4G8MA 1II5A 4ONYA 1B5IA 3A3UA 4HS7A 5I2NB 2QS3A 3T96B 4DDDA 3TKDA 5J1DA 3MZ9A 3O6HA 2NVUB 1AH5A 4NMYA 4XKNA 3S2VA 2CZLA 3KGCA 1N04A 3PUXE 4ELPA 2PBWA 1IEJA 1DTZA 3O97A 5ICTA 3K0VA 4POWA 3KFMA 2DSFA 2O51A 3N6UA 4U21A 5I57A 2QS1A 2ONKE 1AOVA 3I6VA 1TT1A 5AA4B 3RTWB 4EQ9A 1EU8A 4HCYA 4LP2B 2O7IA 3IORA 5KCJA 1P1WA 1LBCA 3KOSA 4YKJA 1NH7A 2HQ0A 4H67A 2KLFA 1BLFA 1XVXA 4XTCQ 4F22A 1HSEA 2UVJA 3VVFA 2HEUA 4IGRA 3MWBA 4RNSA 2F8DA 1MXYA 3G3JA 4LZ5A 4KR5A 4GWOA 3IJXB 4XKPA 1A8FA 5BWJA 1H43A 4RYAA 1AMFA 1CB6A 2I3VA 3TTLA 4GQOA 5H8HB 4DXBA 4NF5B 5H8NA 4C0RA 3PUZE 1XS5A 4TQUQ 3VDFA 3G7WA 1POY1 1GR2A 1I6QA 3N6TA 1B52A 3U94A 5IKBA 2F6GA 2DE3A 1MS7A 1MQGA 3FXUA 5DT6A 1JNFA 5I58B 3JV9A 3K1MA 3CFXA 3PPPA 4C1UA 2OK2A 1NH8A 1MXUA 5I2KB 4HW8A 4ZEFA 2D3IA 4K3FA 5JTYA 2FA7A 2PT2A 4LZ8A 3O6GA 3SEUA 1JVXA 2OZZA 5CM6A 1FW0A 1GGGA 4L17A 1N0TA 4QSDA 1LSTA 1PC3A 2NOOA 4ZEBA 4HTGA 1XVYA 2RF1A 3RQTA 3PU5A 3DP8A 4Q8RA 1B0HA 1S9TA 4DCYA 2REJA 3PPRA 3EHUA 2I0CA 3CG1A 4KFQA 1TFAA 1WDNA 4FEDA 3GZGA 1FQCA 1F9BA 3ILUB 4JWYA 4Z0IA 4H1XA 4PFWA 3MP1A 4H65A 1A8EA 2UVIA 4OEVA 1FQEA 3LSWA 4H5FA 3FV1A 2ONSA 3WAEA 3Q25A 2DOJA 4F2OA 1LFGA 5DYHA 1VR5A 1J1NA 4OESA 2ZNUA 1POTA 2I48A 4OFJA 3TYHA 4JSOA 3PPQA 4G68C 4ZZEA 5A5XA 1UTHA 1N7XA 4QSEA 2Z8FA 3IOUA 4TLLB 2XXYA 4NF4B 3B6WA 2XXWA 2Y7IA 3S9EA 2ZYMA 3A09A 1H44A 4F3SA 1H3DA 1QUIA 3KEIA 3PD9A 3FVKA 4GXAA 4R6HA 3SEVA 3C32A 3M3KA 5K2YA 3MVXA 5KDTA 3KG2A 3C4MA 2UVGA 4BDQA 5JEIA 4R9GA 3KBRA 3V5AA 3QUFA 1I6AA 2UVHA 2F6PA 2V25A 3OOAA 1MY4A 3D4GA 2D5WA 1USYE 1FTKA 4F3PA 3QSLA 3IOWA 1NMUA 4ZEDA 3IAZA 3FVGA 1SI1A 1SBPA 2Z22A 1LAGE 4YKIA 4ZS9A 2Y7KA 5I2NA 4OTEA 4GOTA 3RPWA 2LAOA 4BDLA 4OXVA 1QUJA 1MH4A 3EHTA 3FXQA 4R2BA 1IZ1A 2ZYNA 1MQDA 2H98A 4KYSA 5L8DA 3H6VA 3IOVA 1HSJA 4R75A 3FZVA 3UGWA 1BKAA 3VFJA 2F97A 3C31A 1QVSA 1GV8A 1SDXA 4O3CA 4WEDA 3MZ1A 2RINA 3B6QA 5F7VA 5I84A 1FTOA 5AA4A 4ND9A 3OENA 1LAFE 1SW4A 4G2ZA 4BDMA 4OENA 4ELOA 4EXKA 3IR1A 3Q27A 1LCTA 4R73A 1P1UA 1MY1A 4FJPA 3TTMA 1AL3A 1US4A 4U4SA 4U1OA 4DLDA 3FATA 2YJPA 3IK6B 1HSLA 3KJTA 1Y3NA 2P0SA 4JBZA 4UACA 5CMBA 3MJNA 3C9HA 3IOTA 3M3FA 5H8HA 3PD8A 4GLIA 1OQGA 2NWJA 2VD3A 3VLWA 3O66A 3OO6A 5ISUA 4JXIA 4QHQA 2ZNSA 4EDPA 3RGYA 3BBRA 1CE2A 1B6HA 5AA1A 1Z7NE 4ZE8A 4R6KA 1B7ZA 5I58A 3VVDA 3A3CA 1H76A 4LVQA 4POXA 5TPAB 3VXCA 3SKPA 5I2KA 2O84X 1NKXA 3K1PA 2PVUA 5DVIA 5ITOA 3DP6A 2XXXA 2DWHA 1B5JA 1N3WA 4EF2A 2X7QA 3FUZA 4NWDA 3MVWA 3BKIB 5ELVA 4F19A 4THIA 2PMSA 1I6BA 3G3HA 3E4RA 1JVYA 2OWSA 4ZZAA 2W7YA 3ZSFA 3OXNA 3UP9A 2V3QA 4MF3A 1OMPA 2XXIA 4G8NA 2XXRA 2NUVA 4OWDA 4ELRA 4G68B 4OFLA 1EZPA 2DXRA 3UORA 4BLAA 3BFTA 4YB7A 5B70A 3T9XB 1PBPA 4GVOA 1WODA 2I0BA 1R1NA 2H5YA 1IXGA 2AYSA 3CG3A 4XIGQ 4FE8A 4IY6A 4GRKA 5AA2D 1VSOA 4IO7A 1EZ9A 4IY5A 4KPTA 4ISUA 5L9SA 1NNTA 3MC2A 5AA2B 5B7DA 3SEYA 4Q5TA 1OLCA 3RNNA 3MZBA 4FIMA 2F7AA 2HZLA 4IO5A 1VFEA 1B7UA 4OEUA 3FVOA 3KSXA 1QULA 3CFZA 1I69A 3G3GA 4WEPA 3TDJA 3W9VA 2XX9A 5I56B 1DPPA 2P1SA 4GFRA 5CMCA 3TCGA 3U1OA 3B6TA 4NF4A 1WVJA 1B32A 3PUYE 1B1XA 1US5A 4OZ9A 1YCJA 2RCBA 4NWCA 4PP0A 3U72A 1SD3A 4OERA 3ODBA 1SQYA 3OELA 2OJTA 1UTBB 2ONRA 5FTIA 3U8QA 2O69A 3EF7A 5DEXB 3M3LA 1ZLQA 4YKKA 4QSCA 1S7YA 3EN3A 3VXBA 1SVXB 2B3BA 1LB9A 4NF8B 4PE5B 1DOTA 1D3KA 2QSXA 3H6UA 4LONB 2F35A 3K02A 3R26A 3TCFA 4N07A 2AL5A 1MPCA 4ZDMA 2ZMBA 1B4HA 3KN3A 4XKRA 2Q89A 4AB5A 2DXYA 1DTGA 3FJMA 4BDOA 5ITPA 4FECA 3R7XA 3HSTA 3GLBA 2QRYA 4X48A 1MDP1 1JW5A 2O6AA 4YB5A 4ZEKA 1MM7A 3HN0A 2D21A 3ILTB 2BJJX 4QFNA 1B2HA 1MY0A 1MQHA 4YAHX 1RYOA 3AXFA 2DE4A 1B5HA 1Y1MA 1NFTA 5AE4A 2DP8A 1QJMA 1ZTYA 1Y4TA 1MRPA 3S9NC 3TZAA 2QMWA 2YPNA 3HPIA 2Y7WA 4X9TA 2F34A 3FVNA 4UA8A 2HAUA 3C35A 4ELQA 3MP6A 4IO6A 1LAXA 2VHAA 4IGTA 5CRYA 3G3FA 2HCAA 3N26A 1M5EA 3S9LC 2XHDA 3B7DA 5KCJB 5FHNA 2A5SA 4PFTA 2P2AA 3QYTA 2V93A 1MXVA 4OYVA 3OO8A 4Z7EA 1GVCA 4GD5A 2IA4A 3OSRA 4F3GA 3K4UA 1A55A 1YTVA 2RC9A 4H8IA 3T9VA 4NF6B 1B05A 1Y1ZA 3HHGA 4DZ1A 3IB2A 2DE2A 4ESWA 4DXUA 1D9YA 3T93B 1B7HA 3D4CA 3R6UA 1RKMA 3CVGA 3FASA 5TPAA 2Q88A 3SESA 2G29A 2R9JA 1PB7A 3TODA 4QRZA 2FNCA 3TCHA 1FQBA 3HCQA 1QKBA 5I59B 3DM0A 3C34A 3VLUA 1EZOA 2Y7PA 4WXJA 2DYXA 2XXHA 1URDA 1R9LA 3ONMA 3EHSA 3G3KA 4O3AA 4OVJA 1MDQA 3PV0E 3CI8A 4EF1A 2RCAA 3TQLA 3TTKA 1UIUA 1P1NA 5HM4B 4YMBA 1ATGA 3GXAA 1ELJA 3MPKA 3TFLA 2XD2A 4IO4A 5H8QB 5CMKA 2Y84A 4R6YA 3CFLA 2RKMA 4G68A 1YAEA 5EHMA 2DS9A 3I3VA 1B3GA 3TTNA 3VVEA 3C33A 2QL3A 4E0XA 4O3BA 3H6TA 3S4UA 1IXHA 1JEVA 4R74A 2XX7A 3ZS6A 3QK6A 2E1SA 3LUYA 3FJGA 1B51A 5DTBA 3GBBA 4ZECA 3V8XB 4GXSB 4BDRA 3MW0A 1IITA 4I9DA 4LQ5A 1FTLA 2QS4A 2IEEA 4FAJA 3FJ7A 1MPDA 1DPEA 1MQIA 5AA2A 5JK4A 5DVJA 2R6GE 2V3TA 1IQ7A 1JW1A 4PFYA 2VGQA 4OETA 2HXWA 4MH5A 3KJ7A 1A99A 4MLVA 5I56A 2XXUA 3UIFA 3CSGA 3TQWA 2XXVA 3W15C 2UYFA 3MUQA 2O68A 4R9FA 2AL4A 4U1ZA 1MM6A 3Q28A 2GRVA 3DELB 4WKMA 1XOCA 1FTJA 4YB6A 1B9JA 4H8JA 4NF5A 4PFUA 3SEXA 3RT6B 1URSA 2V3UA 2UXAA 3OD7A 1Y3QA 1ZMGA 3E3KA 4MLQA 3V83A 1NL5A 3SERA 1UTBA 4F31B 3LSXA 3C36A 3PPOA 3H3GA 3PMXA 5FTHA 2B3FA 5DEXA 1N76A 2ESNA 5F1QA 5H8FB 2ZYOA 4YICA 4F1YA 4MFIA 2H99A 4I1DA 3KZGA 4NF8A 4AQ4A 5TP9B 4RPNA 3ZKKA 3RY3A 2F78A 1ZBMA 4RK9A 4GL0A 3L6GA 4EXLA 1SYIA 3G3IA 1VE4A 4IO2A 1P1OA 3PGFA 3RN8A 4LUBA 3PPNA 4QF9A 3LSLA 3T22A 1SW1A 3PUVE 4QFLA 2F5XA 4I62A 2XXTA 4MBPA 4FATA 5EHSA 2DQVA 1BTJA 1MXZA 4BDNA 4HCWA 1R9QA 2ALUA 2DWIA 1B46A 1T0KA 4OHNA 4JB7A 4F29A 3V89B 1LFHA 3KN8A 2RC7A 2F7BA 3VLVA 2FYIA 1IUDA 2HAVA 1B3EA 2E0SA 1NNFA 1FQDA 1QW0A 1SW5A 1A54A 3W9WA 4F1VA 3U93A 2QJEA 1LLSA 4KYDA 1P99A 3K1NA 3IO6A 1JETA 2WKYA 1PB8A 4R72A 2I4BA 1B40A 2CMOA 1Q1KA 3DLNA 1RYXA 3CRBA 3MQ9A 5AA3A 3O29A 4IO3A 1Y9UA 2OBGA 3RTFB 5FHOA 2GH9A 2ZXTA 4N13A 1M5DA 5TU0A 2REGA 3THIA 4GL8A 3SEWA 4NEDA 5HPQA 4KI0E 2O1MA 3TTRA 4RJZA 2O1LA 3FV2A 1ZKBA 3VV5A 3K01A 1VFDA 2V84A 2XXQA 2QPQA 1XT8A 5FHMA 3HO7A 1OQHA 4G77A 5IAIA 4U23A 1LBBA 2YLNA 3P7IA 2H4IA 4NF6A 3GBAA 1ZIUA 3TAJA 3IJOB 1TXFA 2F7CA 3HHFA 1XC1A 3I5OA 2Q2CA 2ZYKA 4KQPA 3OEKA 4LQ2A 1IIWA 1SI0A 4PETA 4YMAA 3QXMA 2A5TB 1A40A 3FGSA 4G4PA 1Y20A 5I59A 3IO4A 2OWTA 4KYEA 3EPEA 4DXCA 3H03A 1QKAA 4C1TA 1R6ZA 1B3HA 2QS2A 1JEUA 3FXRA 5KZTA 2VP1A 4LZ7A 3L6HA 3UA8A 3FD3A 4N6PA 4RXLA 5M2VA 1N84A 1TFDA 2Q9TA 2Q2AA 3LR1A 3RUMA 4JWXA 1L5TA 3CR9A 5H8QA 3E13X 3O9PA 3EQ1A 3LBSA 4U22A 4GIZA 5CMMA 3K00A 4I8CA 4TOZA 1FTMA 1OVTA 4YKPA 2ZNTA 3TPAA 3H06B 3PUWE 2DWAA 1LB8A 3O28A 4EQ7A 1JW4A 3CSBA 4AB6A 3JYRA 1O63A 2OCUA 1YPNA 3KOTA 4EQBA 1Y4CA 4QFOA 4EUOA 1PB9A 3OO7A 5EYFA 1IXIA 1P1QA 2H9BA 4M4GA 2X26A 4DIGA 2GHBA 4RA1A 3MVYA 2I49A 4GF8A 3N5LA 2GHAA 5I57B 2DVZA 5LOMA 3T66A 2XD3A 1DSNA 3Q29A 3TEPA 1MPBA 4Q30B 3IX1A 1A7LA 3MBPA 4ECFA 2Z8EA 5ICQA 3E9XA 4XXUA 4OFOA 3K6XA 2XXPA 3SDFA 1H45A 3MP8A 2AIXA 1D4NA 4P11A 3T9HB 4KCDA 4DCXA 4G8HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5H8FA 1FJ9A 3MAMA 1N7WA 3QAXA 1IXCA 3UK4A 3TELA 3H6WA 3MPLA 5H8NB 2Z23A 3CIJA 5TP9A 1MQJA 1Z7ME 2P3NA 3U92A 4TLMB 1FBGA 5IZZA 1PBQA 1XHYA 4KXPA 4P1EA 1TWYA 2ABHA 3IL1B 4JSDA 3BFUA 1B3FA 1MH3A 3O2AA 2M8CA 1JQFA 5T3JA 2B65A 4DE8A 4O8MA 2NXOA 3K6VA 3LSFB 2I3WA 1NNPA 2X7PA 3VE1B 1B1HA 3T9UA 1N3XA 3HV1A 1BP5A 3DP4A 3QUJA 5HBCA 1RDYA 1B0LA 3ECRA 4PF8A 1D9VA 5JTYB 1M5FA 4KHZE 3PMVA 4M1VA 4OQOA 1URGA 2UYEA 2VOZA 4FORA 1O7TA 4KCCA 5ET6A 1SYHA 4LATA 2XWOA 1M5BA 2F3BA 4YU0A 4GWYA 5CBSA 1EYKA 3Q26A 2R71A 1QUKA 4X1DA 2XX8A 3N94A 2DVCA 1DMBA 2H25A 4NHBA 3OO9A 2KQZA 4I40A 5EYGA 2QMXA 1EYJA 4NE4A 4QFKA 4H5GA 2OLBA 5IZ1A 4P0IA 3TMGA 4YZZA 2I6EA 1USYH 2RC8A 4GWWA 2PYYA 3H7MA 1FCKA 3LC8A 4F3BA 4JWOA 3QIMA 4F1UA 5H8SA 2DWJA 1MY2A 4U4XA 4GWZA 1Y3PA 4GWUA 1MXWA 1PDAA 1NNKA 3RT8A 4LA9A 2ANJA 4MX6A 4OVSA 4GX3A 3F11A 4OMBA 5K2XA 5BUUA 2VD2A 3OMBA 2I4CA 4ESXA 1IMEA 3BIGA 5DVFA 4X1BA 2O7UA 2PX1A 3IB0A 4NQ8A 4RY1A 1AWBA 1ZU0A 4ZEIA 1SW2A 1MG1A 3KSJA 1LCFA 4R2FA 1B4ZA 3MVZA 4KD5A 4H6DA 5A5XB 2I58A 1KWHA 3LV0A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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