3T96B

Iodowillardiine bound to a double cysteine mutant (a452c/s652c) of the ligand binding domain of glua2
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGCRDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDCGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Mechanism of AMPA Receptor Activation by Partial Agonists: DISULFIDE TRAPPING OF CLOSED LOBE CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t96B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t96B02
2PBWA 2HCAA 4IO6A 3OSRA 4ZECA 3FVKA 4KCDA 5M2VA 4NF5A 1PB9A 1IITA 2A5TB 4F29A 1OIBA 4EF2A 3PMXA 4H67A 4R72A 1ZMGA 2O1LA 3HV1A 1A55A 4KHZE 2XX8A 3CRBA 3CIJA 2F7BA 4GWOA 1N84A 3TUSA 1IXGA 3FD3A 3FXUA 4GD5A 2PMSA 1QJMA 4G8NA 4LVQA 5JEIA 1LB9A 1UIVA 1URDA 3SETA 2I0BA 4LUBA 3RTWB 1D9VA 1P1WA 3PPOA 2XXYA 2F8DA 1POTA 1BP5A 5DEXA 3U94A 2F36A 1UTBA 3MQ9A 1S9TA 2GHAA 1MXWA 3S9NC 4ZZEA 1SBPA 3FXRA 4P11A 3T9HB 3TTNA 2QMWA 5I2KA 2UYFA 1MY3A 2I4BA 2XXXA 5L8DA 3L6HA 4LZ8A 1LBCA 1B52A 4ISUA 2ONRA 4FIMA 1B4ZA 2PT2A 3RLFE 3C31A 5IAIA 2GRVA 1LAHE 1R9QA 4XIGQ 1QULA 4DCXA 3PUXE 1OMPA 3T9VA 5B7DA 2QS1A 3ILTB 1B7ZA 1GGGA 3KOTA 3TTMA 3UK4A 5A5XB 1NMUA 4NF8A 1NL5A 4Q5TA 4NMYA 5TP9B 2H9BA 1B0LA 2DVZA 2OJTA 5L9OA 2RINA 1NNPA 1ZTYA 3TYHA 4QFLA 5I2NA 1SW4A 3IJXB 3A3UA 4R9FA 3K6VA 3HO7A 5EHSA 4IO5A 3IOVA 5EHMA 3BFUA 4QFKA 3GBBA 1TFAA 1SVXB 4G2ZA 3ECRA 3KZGA 1N3XA 4EQBA 1AL3A 4KYSA 1DTZA 1MY0A 4PQJA 2Q9TA 1P1QA 4H8JA 4OENA 3TZAA 4HCYA 3LUYA 4F3SA 1B1HA 3Q28A 4MH5A 4RK9A 1O64A 1MDP1 4ZE8A 4H8IA 2V3TA 4ZEKA 4U1ZA 4HTGA 4OERA 3G3FA 1QVSA 2RKMA 3FJMA 3SKPA 4FEDA 2Q88A 4F18A 2DWHA 3O6IA 4ZEDA 3LBSA 1EH3A 1RYOA 4BDRA 4H5GA 3IK6B 3O6GA 1A8FA 1B5JA 4R75A 4NF6B 4AB5A 1I69A 3L6GA 4AQ4A 4DZ1A 2F97A 1H43A 1LSTA 5DYHA 3H6UA 3V5AA 4DDDA 1O7TA 2IEEA 3E4RA 5K2YA 5ICTA 2UVJA 2DXYA 1D9YA 1DPEA 4C1UA 5L9SA 1IQ7A 1FQEA 1MXXA 1ANFA 4QRZA 2QS4A 2QS3A 4MFIA 1B1XA 3FIRA 4YKJA 3RGYA 1MM7A 3EQ1A 2I49A 5DT6A 1MXZA 1LCFA 2LAOA 3R7XA 2Y7IA 1YTVA 3IO6A 5H8HB 3PMVA 4N6PA 1B3GA 2NVUB 1JEVA 1KWHA 3R26A 3LSLA 3TFLA 2Y7RA 1MPBA 1P99A 3RT6B 3K6XA 2B65A 2F5XA 3OXNA 3OO8A 5BWJA 4XKNA 4G68B 4NEDA 1A7LA 3MAMA 3KN8A 3T9UA 1A99A 2ALUA 3FGSA 4E0WA 3K0VA 2QS2A 1ZBMA 2DVCA 4GRKA 3S4UA 5K2XA 3G7WA 3CFLA 4R6KA 3MP8A 3MVWA 4BDMA 4OZ9A 1MXYA 5HM4B 4U1OA 2ZNUA 3MP6A 3B6QA 4THIA 3USDA 2I0CA 2Y7WA 3VVFA 3T66A 4G8MA 2H5YA 3K00A 4R2BA 4GIZA 3VXCA 5J1DA 4RXLA 2GHBA 2DWIA 2VP1A 4MLQA 1OQHA 4JWXA 1M5CA 3JYRA 1LAFE 5I56A 1MPDA 4XKQA 1MM6A 3DP8A 3GZGA 3O66A 1NNTA 1LFIA 4KR5A 3FV2A 3B7DA 1Z7ME 2HZLA 3KJTA 1FQFA 3CSGA 3IB0A 2ZYNA 1LFHA 2NOOA 5JTYB 2ZMBA 1VE4A 2A5TA 3QIMA 1JW5A 3F11A 1FTKA 2O7UA 1GV8A 3V8XB 1QW0A 5FHNA 3G3HA 1TFDA 4WEDA 2Z8EA 3IJOB 4KYEA 1MS7A 4LONB 1N04A 3H6WA 2I3VA 3O2AA 1MQGA 3PPNA 4HS7A 3ZKKA 1Y1ZA 4LZ5A 1LAXA 2DYXA 3FVNA 3N26A 1D3KA 2IA4A 3FZVA 4G8HA 2DWJA 4H5FA 1BKAA 4LQ5A 2D21A 3G3KA 1Y20A 1B6HA 1R1NA 4QHQA 2KLFA 4UA8A 4K3FA 3MP1A 3MZ1A 4GXAA 3V89B 4F2OA 2ONKE 3N6UA 4HW8A 4OXVA 4OQOA 1IEJA 3KOSA 1N76A 1POY1 2O69A 3S9LC 1TWYA 4JBZA 2H98A 1RYXA 5I84A 3TEPA 3H03A 5TU0A 5A5XA 2XXIA 2F7AA 3CG1A 2VD3A 5TP9A 5CC2A 1GR2A 1JVXA 1M5EA 1MRPA 3H7MA 1URGA 4KFQA 1N0TA 3CI8A 3SEWA 3MZ9A 1SW5A 4IO4A 2ZYMA 2Z23A 4R73A 3WAEA 1N7WA 1B4HA 1OLAA 4ELRA 3Q29A 1D4NA 1LLSA 3KN3A 4GLIA 4U22A 1B9JA 4R2FA 1F9BA 3K2DA 2HXWA 3RTFB 1MXUA 1CB6A 3FJ7A 2Z8DA 1UQWA 2E1SA 5I59B 4ZE9A 2H25A 3PD9A 2V93A 3VV5A 4F19A 3OD7A 1S7YA 1FTOA 2XXQA 5JK4A 4GFRA 4DXUA 3AXFA 1USYE 2B3FA 4N07A 2UXAA 3ODBA 2VHAA 4KD5A 4RPOA 3G3IA 4IGRA 3C32A 1URSA 4YKIA 3DLNA 4O3CA 2ZYOA 2O51A 4JB7A 3C4MA 3OO7A 3PPRA 5CMCA 1HSEA 3IOWA 4OETA 5FTHA 2F6GA 3H4ZA 1DOTA 3VE1B 1Y1MA 3T93B 4NF6A 4KPTA 3PMWA 2B3BA 3MC2A 1I6QA 1YCJA 1PB8A 1IXIA 3KG2A 1JW1A 1SW2A 2XD2A 1MQDA 3O29A 3EN3A 3KJ7A 2RCAA 5TPAB 5HPQA 3HPIA 3RY3A 1USYH 5DVJA 3LC8A 3UGWA 3N6TA 1NNFA 5DVIA 1ZU0A 5CBSA 4M4GA 1T0KA 4JSOA 3D4GA 2OK2A 2QRYA 1MXVA 1TT1A 2D5WA 2XX9A 4XKRA 5H8HA 2HEUA 2DP8A 3DELB 4BDLA 3WAFA 4MBPA 2QJEA 4P0GA 1R9LA 2XX7A 5BUUA 3G3JA 3FVGA 3TQWA 1FCKA 4YU0A 3HCQA 4PFYA 3EHSA 3S9EA 2DQVA 1B51A 2O84X 3PUVE 4WEPA 3TDJA 1IIWA 4JSDA 4ZZAA 5AE4A 2W7YA 2OLBA 4YB6A 2HFBA 4O3AA 4G68A 1R6ZA 2HZKA 2RF1A 3UN6A 2H4IA 3MW0A 2OWSA 1A8EA 3ZKLA 3R6UA 2ESNA 3RUMA 1EU8A 3SERA 3MWBA 3H6VA 4EUOA 4OFOA 3ILUB 4FAJA 3C33A 1IUDA 1MQIA 4ONYA 1XVXA 2R71A 2ZXTA 1J1NA 2P0SA 1DPPA 3TTLA 1FQAA 2YLNA 4P0IA 1US4A 5AA4B 4ECFA 3B6TA 3QUJA 4GQOA 3PPQA 5AA2D 4NF4B 2AYSA 4ZEBA 4DLDA 4FJPA 5H8QB 3FASA 2F35A 4FATA 4YZZA 3VXBA 4YMAA 3TMGA 4RNSA 2ZNTA 3PUYE 1PBQA 5IKBA 2FNCA 1NNKA 3O97A 4BDQA 4KYDA 3SESA 1B3EA 3LSFB 4FEBA 3EHTA 2XHDA 3I6VA 5H8NB 1P1UA 5H8SA 5JTYA 1OVBA 2O6AA 4WKMA 2DSFA 3LSWA 4RK2A 3JZJA 3TQLA 4NF8B 3N94A 4XTCQ 2CZLA 2D3IA 4YKKA 2DXRA 2M8CA 1P1OA 4G4PA 2GH9A 4M1VA 3VVEA 3P7IA 4H6DA 4F3GA 4PP0A 3A3CA 4TLLB 1B40A 1SI1A 4GL8A 3IAZA 3HSTA 3C35A 1BIYA 3T22A 3E9XA 1B0HA 4X9TA 4Q0CA 1EZOA 2HAVA 1Y4CA 3VFJA 3QYTA 2Q2CA 4LA9A 4EQ9A 5ISUA 3DP6A 4R9GA 4R6YA 4ND9A 3KGCA 4H65A 4RY1A 2OWTA 1GTKA 4R6HA 2QL3A 1AOVA 1UTHB 3CFZA 2DE3A 3PUZE 4DXBA 2UYEA 2UVIA 4LP2B 1US5A 4EXKA 2NWJA 2REJA 1H44A 2BJJX 3TELA 3ZS6A 1Y4TA 3MUQA 4YICA 5FHOA 4GF8A 4IY6A 2DE2A 2DWAA 5I57B 2AL5A 2PX1A 3Q27A 5CI5A 3K6WA 1ZJLA 5CMBA 4PE5B 3OEMA 3KSJA 1UIUA 1B3LA 4NTLA 5LOMA 3EPEA 4EF1A 4C1TA 4IY5A 3KBRA 4TOZA 4LQ2A 3BBRA 4I62A 4H1XA 4DIGA 3RT8A 3MVYA 1XS5A 3O28A 1FW0A 1OLCA 4JWOA 5AA1A 1QUJA 3TCHA 1H3DA 2E0SA 4RYAA 1N7XA 1LB8A 5I59A 5KCJB 3QXMA 1AH5A 3MBPA 4E0XA 4QF9A 4MF3A 4Z0IA 4Q8RA 3N5LA 4L17A 1YPNA 1NKXA 3O6HA 2Y7KA 5AA3A 2OBGA 4PETA 4OEUA 2RC8A 2ANJA 5KDTB 4IO3A 1PBPA 4IO7A 3LSXA 2YPNA 4UACA 3TTKA 1I6AA 3RPWA 2ABHA 1N3WA 2CMOA 1LGBC 3UA8A 5H8FB 1SYIA 2YJPA 5ELVA 4ZEFA 3K1NA 4F1VA 1B05A 1A54A 3TCGA 4XXUA 3TCFA 1JVYA 2UVHA 1FQCA 4LATA 1B3HA 2I6EA 1SD3A 3FJGA 4GXSB 4I8CA 1ZKBA 1SQYA 4OESA 4I1DA 4U4XA 1LAGE 1DTGA 1NH7A 3KN7A 4TLMB 5TPAA 2I3WA 4PFTA 1NFTA 3ZSFA 3UP9A 3TAJA 3SEUA 1LBBA 1Y3QA 4X1BA 3I5OA 1AMFA 3M3LA 3H06B 3K4UA 3KEIA 1MQJA 3G3GA 1PEBA 2Q8JA 3QUFA 3T96B 4KCCA 4F3BA 3GBAA 3ONMA 3M3FA 1LCTA 2I4CA 4BLAA 1I6BA 4U2RA 3VLUA 3MVZA 1OVTA 2I48A 3DM0A 1WODA 1QKAA 3HHFA 2A5SA 4O3BA 2QMXA 2DOJA 2UVGA 4NWCA 3W15C 1Y9UA 2F78A 1GVCA 4F1UA 4F39A 1XC1A 4R74A 2V25A 4OVJA 3H3GA 5CRYA 1XHYA 4ZEIA 3UIFA 4YKPA 4RPNA 2GFEA 3TODA 3IOTA 2XXWA 1JNFA 4NE4A 5AA4A 4GL0A 2PYYA 4OMBA 5ITOA 1B3FA 4NF4A 3MZBA 1P1NA 1M5DA 3SEXA 4OHNA 3IORA 5H8QA 2F34A 4X1DA 1IZ1A 4QSEA 4POWA 1YAEA 3IB2A 3VLVA 1SYHA 1VFEA 1S50A 1FTJA 2I58A 3T9XB 3C9HA 3PD8A 1PC3A 4YAHX 1FQDA 1MY2A 3U1OA 2R9JA 5DVFA 1IXCA 4GOTA 2XD3A 3TPAA 2AIXA 2FA7A 5FHMA 5H8NA 1WDNA 3U8QA 5ICQA 1WVJA 2XXTA 5ITPA 3M8UA 2AL4A 4HCWA 3OO6A 4G68C 4DXCA 3FV1A 4QSCA 3K02A 5AA2B 4ELQA 5I58B 1B5IA 3TTRA 2XXRA 3A09A 3D4CA 1FTLA 1BTJA 4RA1A 4U4SA 1H45A 1PB7A 1MDQA 4NF5B 4C0RA 2ZNSA 2G29A 2QSXA 3OEKA 3THIA 1MQHA 4IGTA 3MPKA 3C34A 3IL1B 3IX1A 1MPCA 2RC9A 3VDFA 3DP4A 4XKPA 4MLVA 4POXA 4EDPA 4F22A 1TXFA 3SEYA 3E3KA 3OO9A 4N13A 4ESWA 3RQTA 4JXIA 1ELJA 4X48A 2DS9A 3U92A 2F7CA 3IR1A 4KI0E 3IO4A 4H0WA 4JWYA 3PGFA 2V84A 1UTHA 1MY4A 5DEXB 3S9MC 4RJZA 1UTBB 4I9DA 3KSXA 2VOZA 3VVDA 2WKYA 2QPQA 2Q2AA 3PV0E 5I2KB 2VGQA 4OEVA 5FTIA 1ATGA 3W9WA 4Q30B 4GVOA 5I57A 1QKBA 4JDFA 1VFDA 3SDFA 1JW4A 2Y7PA 3RNNA 5F1QA 4QFOA 1B7UA 1Z7NE 4PFWA 4ZDMA 4FE8A 3QK6A 2OCUA 3CG3A 4OYVA 4G77A 2Z8FA 3EF7A 3M3KA 3SEVA 3C36A 2P1SA 1Q35A 1AIVA 3FUZA 3GXAA 1Y3PA 5KZTA 1ZIUA 2Q89A 1M5FA 3OMBA 3GLBA 3H6TA 1VR5A 2X7QA 1QUIA 1FTMA 5I2NB 2RCBA 4Z7EA 3JV9A 5KCJA 1O63A 3CR9A 1XVYA 3CVGA 1DSNA 1MH3A 4QFNA 5CM6A 5F7VA 4U21A 3OSQA 1JEUA 5KDTA 1Y3NA 3O9PA 1II5A 3EHUA 3PU5A 4QFPA 1H76A 4F2QA 4BDOA 4PFUA 1MG1A 1VSOA 4DCYA 2G93A 4OFLA 3E13X 2F6PA 3BKIB 5H8FA 3LR1A 1NH8A 1EZ9A 1B5HA 4EXLA 2X7PA 3OOAA 3FVOA 2V3QA 1OQGA 3U93A 3KFMA 2R6GE 1B32A 3B6WA 3S2VA 3K6UA 2PVUA 2XXHA 4WXJA 4TQUQ 2HAUA 2O7IA 4FORA 3PUWE 5CMKA 2ZYKA 1JQFA 4EQ7A 4DE8A 4YB5A 5CMMA 1MY1A 1SW1A 1LFGA 1B7HA 1M5BA 1A40A 2NXOA 3CFXA 5EYFA 1IXHA 1FQBA 4QSDA 1EZPA 3MVXA 2HQ0A 3K1MA 3BFTA 1B46A 1XOCA 1HSLA 4NWDA 3Q25A 3I3VA 4FECA 5B70A 5L9MA 2FYIA 1CE2A 3PPPA 3HN0A 1RKMA 2O68A 1ZLQA 3VLWA 1BLFA 2VD2A 2XXUA 4ESXA 1XT8A 2PT1A 3RN8A 4ELOA 3HHGA 2NUVA 2Z22A 3QAXA 3K01A 5HBCA 1Q1KA 1SDXA 3MJNA 4OFJA 3U72A 2XXVA 3V83A 1B2HA 2V3UA 4ELPA 5CBRA 5DTBA 1HSJA 3MPLA 4ZS9A 3TKDA 4F31B 4BDNA 4IB2A 4F3PA 4OWDA 4YB7A 2ONSA 2THIA 2P2AA 3W9VA 1B58A 3FATA 3IB1A 3OENA 1SI0A 3K1PA 3Q26A 3IOUA 3UORA 1QUKA 4AB6A 2RC7A 4OTEA 4YMBA 1L5TA 2X26A 3QSLA 1DMBA 1PDAA 3OELA 2H99A 2OZZA 2REGA 2O1MA 2DE4A 3FXQA 1JETA 5I56B 4F1YA 4U23A 2XXPA 4KQPA 4IO2A 5AA2A 2Y84A 5I58A 1MH4A 4LZ7A 3CSBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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1SVXB 4G2ZA 3ECRA 3KZGA 1N3XA 4UABA 4EQBA 1AL3A 4KYSA 1DTZA 1Q9DA 4P8BA 1MY0A 4PQJA 2Q9TA 1P1QA 4H8JA 4OENA 1G0IA 3TZAA 4HCYA 3LUYA 4F3SA 1B1HA 1KA0A 3Q28A 4MH5A 4RK9A 4HE1A 1O64A 4MNIA 4N91A 2V4CA 1MDP1 4ZE8A 4H8IA 2V3TA 4ZEKA 4U1ZA 4HTGA 4OERA 3G3FA 1QVSA 2RKMA 3FJMA 3SKPA 4FEDA 2Q88A 4F18A 2PFYA 2DWHA 3O6IA 4DI4B 4ZEDA 3LBSA 4GX3A 1EH3A 1RYOA 4PF8A 4BDRA 4H5GA 3IK6B 1DBZA 5IGAA 3O6GA 1A8FA 1B5JA 1EYKA 1FPJA 4R75A 4NF6B 4AB5A 1I69A 3EKIA 5EYHA 3L6GA 4AQ4A 5I5PA 4DZ1A 2F97A 1H43A 1LSTA 5DYHA 3H6UA 3V5AA 4DDDA 4O94A 1O7TA 2IEEA 3E4RA 1LBYA 4P47A 5K2YA 5ICTA 1K9YA 2UVJA 2DXYA 4PTKA 1D9YA 1DPEA 4XFEA 4C1UA 5L9SA 1IQ7A 1FQEA 1MXXA 1ANFA 4QRZA 2QS4A 2QS3A 4MFIA 1B1XA 3FIRA 4YKJA 3RGYA 1MM7A 3EQ1A 4P9KA 3LV0A 2I49A 5DT6A 2WYPA 1LBVA 1MXZA 1LCFA 5ET5A 2LAOA 3R7XA 1IMCA 2Y7IA 1YTVA 3IO6A 5H8HB 3PMVA 4N6PA 1NV3A 3CHGA 1B3GA 2OWZA 2NVUB 1JEVA 1KWHA 1FPFA 3LSLA 3R26A 3TFLA 2Y5KA 2Y7RA 4GBVA 1MPBA 4O7MA 1P99A 3RT6B 3K6XA 2B65A 2F5XA 3OXNA 3OO8A 5BWJA 4XKNA 4XF5A 4G68B 4NEDA 1A7LA 2CEXA 3MAMA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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