3T96B

Iodowillardiine bound to a double cysteine mutant (a452c/s652c) of the ligand binding domain of glua2
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGCRDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDCGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Mechanism of AMPA Receptor Activation by Partial Agonists: DISULFIDE TRAPPING OF CLOSED LOBE CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t96B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t96B02
3KZGA 4OMBA 4U4XA 4PFUA 4KYSA 2A5TA 3HSTA 4PE5B 1POY1 3ZS6A 1LBCA 3C31A 1YCJA 1SYIA 4KCCA 4U4SA 2THIA 1LLSA 3TDJA 4OERA 3DLNA 3LUYA 4GL8A 4FIMA 3IO6A 2QMXA 1B9JA 5CMCA 1EZ9A 3IB1A 1MQHA 3C32A 3HN0A 3KGCA 1NNPA 4L17A 4Z0IA 2Y7WA 1USYE 2IEEA 1LCFA 1B3FA 3H7MA 2VD3A 3MQ9A 1P1WA 1XHYA 4NF6A 3RTFB 2I0BA 4G68B 3ODBA 4H1XA 1URSA 4TQUQ 1TT1A 3E13X 2H4IA 1N76A 3Q25A 4LZ7A 4NTLA 1ZJLA 4ELPA 3CIJA 4GIZA 1URGA 3H3GA 1FQDA 2Z8FA 3OSQA 1LAHE 3PUVE 2Q8JA 5K2YA 4BDOA 5I2KA 3FVOA 2FNCA 4F1UA 3PMXA 2Z8EA 1B32A 1L5TA 2XXQA 2A5TB 3G3JA 3PUWE 1B3LA 5AA1A 3LSWA 2M8CA 1I69A 1JEVA 3SEWA 1TXFA 2QS1A 1MY0A 2RF1A 1D3KA 3OEMA 4FEDA 1SVXB 2UVIA 3B6WA 3FXUA 4U23A 4I62A 4RJZA 4LZ5A 3FZVA 4NF6B 5CMMA 2Z22A 1MY4A 1ZBMA 4U2RA 5BUUA 3S9MC 2XXWA 2H99A 3TKDA 5AE4A 4HS7A 1XC1A 2ONSA 2XXHA 3BBRA 2V25A 4QRZA 3VLVA 4XKPA 2NVUB 1FCKA 4KHZE 4N07A 4F1VA 2OLBA 5KCJA 5H8FA 3KJ7A 2HEUA 1F9BA 3OO6A 4IB2A 3RTWB 5IAIA 3ILTB 2REGA 1P1OA 1KWHA 3TTMA 3O29A 5I2KB 4ZEBA 2DP8A 2G93A 1BKAA 3IOUA 4QSCA 1M5EA 4F3GA 2I49A 2DS9A 1ZIUA 4TLMB 2QS3A 4KR5A 5ICQA 3OELA 1NFTA 2P2AA 3PPOA 2ZYMA 2Q9TA 1Y3PA 1S7YA 2O7IA 2Z8DA 1JETA 1LFIA 1GV8A 2GH9A 3MP6A 3QIMA 3U72A 2YLNA 2D21A 2VD2A 4LONB 3WAFA 4WKMA 4QFLA 1B7UA 3H6VA 2QMWA 4H67A 3KBRA 4O3BA 5KCJB 3MAMA 3PPRA 5H8FB 4Z7EA 1P1QA 4PFYA 1H45A 4KFQA 4LVQA 1UTBA 4X1BA 4ZZEA 2G29A 3TEPA 3RY3A 3EHTA 1MH4A 3FJ7A 1J1NA 3N26A 3O66A 1QULA 2AL5A 2GHAA 1B5IA 3C34A 3O28A 2QJEA 4BDMA 3M3KA 4R6HA 3SETA 1FW0A 3VE1B 1M5FA 3A09A 1GVCA 4EQBA 2O68A 4XTCQ 3O6IA 1SW5A 2QRYA 5A5XA 3R6UA 4XKQA 3VLWA 2CZLA 3FUZA 4DCYA 4XXUA 4AQ4A 2DQVA 3E3KA 3EPEA 4MLVA 1Y3QA 4OETA 3HO7A 2RC7A 3K1NA 3OSRA 2YJPA 1ZTYA 1VE4A 4IGRA 4YAHX 5F1QA 1UTBB 4KI0E 4ECFA 2QSXA 3K0VA 2H98A 3IJOB 2ZNSA 5DEXA 5H8QA 3IB0A 1N3XA 1MPBA 1LAGE 3HCQA 3GLBA 1QKBA 2DSFA 4JDFA 3FV1A 3FIRA 3CG3A 3BFUA 3MJNA 4ZEIA 2DWJA 4LZ8A 1B58A 1GGGA 1I6BA 2O51A 2R9JA 3K6VA 2F6GA 5AA4A 3S2VA 3V89B 4ESWA 1P1NA 1IUDA 3PUXE 3TTNA 3K6WA 4DLDA 1JVYA 1FQAA 3WAEA 1OQGA 2DWAA 3Q27A 3T9UA 3O9PA 1SW4A 4H8JA 5AA2D 2O1LA 5TPAA 1S50A 4I8CA 2B65A 5L8DA 1B6HA 3C35A 4LATA 4F1YA 1MXYA 3DM0A 4WXJA 2VHAA 1NKXA 4P0GA 3FVGA 3HHGA 2RC8A 2NOOA 5H8HA 3TAJA 3UN6A 5L9OA 5DEXB 5H8QB 4NF5A 2Q88A 1JNFA 2XXTA 4GOTA 3U1OA 4F39A 1B46A 3UIFA 3T9XB 4OXVA 4QFPA 2I58A 2Q2CA 3CFXA 3FATA 5IKBA 1LAXA 3H4ZA 5DTBA 3N5LA 1AIVA 1MDP1 3PU5A 3T93B 2QPQA 5AA4B 1MQDA 2QL3A 2Q89A 3W9WA 4IGTA 4EUOA 4X48A 3FVNA 5FHMA 1Y20A 4POXA 1A8FA 3RT6B 4RY1A 1B1HA 5TPAB 4OQOA 4YZZA 3ONMA 3W9VA 2DXRA 3CVGA 1US5A 3FV2A 3TELA 5ITPA 3E4RA 1B1XA 1VR5A 2ONRA 3VXBA 3PUZE 4Q8RA 5H8HB 4EDPA 5DT6A 3O6GA 3LBSA 4G68C 3CFZA 1NL5A 4HTGA 1N7WA 4PFTA 5CMBA 4RPNA 1H43A 3VVDA 2VOZA 3I5OA 2OWSA 4C0RA 4X9TA 2HXWA 3R26A 3MC2A 4GF8A 3GBAA 3CG1A 3N6UA 3RGYA 1B3HA 3K6UA 4H6DA 2XD3A 3UORA 4F22A 4RNSA 1HSJA 1QKAA 4QFKA 2I4BA 2HQ0A 3CI8A 4YB7A 1B4ZA 5M2VA 4R75A 1LAFE 3KOSA 3QSLA 4G8HA 1NH8A 3FVKA 4DCXA 4KPTA 4OFLA 4R6KA 3RUMA 1QUKA 1LSTA 2UVGA 2I3WA 5CC2A 3V8XB 1BLFA 4F2QA 5HBCA 1IIWA 2X7QA 1Y1MA 2A5SA 1MXWA 1CE2A 4YU0A 4NF8A 3FASA 1IITA 1UTHA 1P1UA 2ZYKA 4BDLA 3DP8A 3M3FA 5HPQA 2O84X 2XXXA 2H9BA 3HV1A 1Y4TA 5B70A 3TQLA 2PT2A 3VVEA 4EF2A 3S9EA 3GXAA 1ATGA 3VV5A 4LQ2A 1LGBC 2XXVA 1UIVA 4P11A 1MM7A 4IY5A 3G3FA 3OENA 2ALUA 3MUQA 3M8UA 1N84A 4ZEKA 3RPWA 5FHNA 1BTJA 2UVJA 1MQJA 1PB8A 2V3UA 4ZECA 3QK6A 4P0IA 4ZS9A 1SI0A 3HPIA 2ANJA 3PPPA 3QUJA 3ILUB 4KYDA 2XX7A 3IB2A 3MVWA 2V84A 4G8NA 2FA7A 2RCAA 3VLUA 2HAUA 4N13A 4OTEA 1FTLA 2CMOA 5DVIA 2HZLA 4NF8B 2P1SA 3OO8A 4BDNA 4IY6A 4MFIA 4ESXA 5JTYA 1NMUA 1OLAA 3IAZA 3FJGA 1UTHB 2UYEA 2QS4A 1QVSA 2KLFA 4IO2A 3TCGA 4GQOA 3I6VA 3LSLA 5I56A 1BIYA 3OMBA 5ITOA 4JSOA 3PGFA 1MQGA 1AOVA 1O7TA 1AMFA 4TLLB 5KZTA 2UVHA 3CSBA 3MZ9A 3LR1A 2I6EA 3FJMA 3K01A 3KN8A 3IK6B 2AIXA 3S9LC 4F18A 2V93A 4R2BA 1T0KA 1H76A 3EN3A 4GLIA 1Z7NE 4FEBA 1B5JA 1ZU0A 3B6QA 4QFOA 1DTZA 3ZSFA 3K1MA 4YKPA 4JWOA 3O2AA 3IJXB 4ISUA 3BFTA 2F7AA 3EHUA 5JTYB 1NNKA 3H06B 4OENA 5CBRA 3H6UA 1DSNA 5I59A 3OO9A 1ZMGA 5I57A 5I56B 1GTKA 2XD2A 2NWJA 1MQIA 4O3AA 3VDFA 2O1MA 3K2DA 1D9YA 4BDQA 5EYFA 4EQ7A 2F97A 2XXPA 3EHSA 2ONKE 4NWCA 3H6TA 1JW5A 1B4HA 3V5AA 2D5WA 2Y7RA 4DDDA 5CM6A 1M5DA 1Y4CA 4OZ9A 4YICA 1IXCA 2X7PA 2ZYNA 3IOWA 2XHDA 5F7VA 1B0HA 4UACA 2I0CA 4IO3A 1FQFA 3IR1A 3K4UA 2BJJX 3KG2A 3SEUA 4FATA 4MH5A 4OWDA 2YPNA 1QW0A 3MVYA 4E0XA 2D3IA 2Y7IA 3Q28A 3D4GA 5H8NA 2REJA 2H5YA 4I1DA 3Q26A 1A55A 3F11A 2F5XA 5CBSA 1QUIA 3QYTA 3TCFA 1OVBA 2F34A 5I59B 1XVXA 3DP6A 5I57B 4JWYA 2RKMA 2OK2A 1N0TA 3TMGA 4X1DA 1R1NA 1MXZA 2XX9A 1B40A 3FXQA 2F6PA 3MZ1A 5DVFA 2R71A 3KN7A 2Y84A 3L6HA 2XXYA 5A5XB 4PETA 4F19A 4GD5A 2F8DA 2E0SA 3OOAA 3G3KA 4XIGQ 5HM4B 2ESNA 3T9HB 2NUVA 1DPEA 1IXGA 3MPKA 1HSLA 2AL4A 4EXLA 3OD7A 1P99A 2HCAA 1GR2A 3UA8A 4QSDA 3MPLA 3KSXA 1R9QA 1ZLQA 1DTGA 1II5A 1XOCA 1MPDA 4PP0A 3CR9A 4GWOA 5H8NB 4RYAA 4OYVA 2I3VA 4WEPA 5K2XA 4BLAA 5J1DA 4F29A 1YTVA 3TFLA 4F3SA 2HZKA 1M5BA 1MRPA 3G3GA 3U94A 2Y7KA 3TQWA 5AA3A 4BDRA 3SEXA 5FTIA 1IXIA 2UYFA 2PX1A 5ELVA 5CI5A 1N3WA 5B7DA 2F35A 4OESA 4LP2B 4OFJA 3LC8A 3DELB 3TTRA 4YKKA 4MLQA 3SERA 3G7WA 2HFBA 3IORA 1PEBA 3C33A 1Z7ME 1QUJA 4QFNA 1RYOA 2X26A 3S9NC 2ZNUA 4IO4A 4ZDMA 3PD9A 1URDA 4DIGA 2F7BA 3S4UA 2PBWA 1B0LA 4LA9A 3PUYE 2OBGA 2V3TA 1MDQA 4NE4A 1VFEA 3IO4A 4OEUA 3Q29A 3QUFA 4NF5B 3ZKKA 2ZYOA 1LCTA 1EH3A 1MH3A 4KD5A 1DPPA 3TODA 5I84A 4LQ5A 1NH7A 1B2HA 2RC9A 3JV9A 4YMBA 1JQFA 3K1PA 4M4GA 3BKIB 4F2OA 3SESA 2I4CA 1AH5A 1XT8A 4DXBA 2H25A 1JEUA 1SYHA 1I6AA 1MS7A 2RCBA 3VVFA 1SW2A 3TTLA 1XS5A 2E1SA 1IQ7A 4YB6A 1LB9A 1Q1KA 1WVJA 4ZE8A 1JW4A 3DP4A 1UQWA 1LBBA 4G8MA 3C9HA 2VP1A 4KQPA 3U92A 1O64A 1M5CA 2DOJA 4FE8A 4WEDA 1S9TA 1YPNA 3U93A 4PQJA 1MY1A 4HW8A 1TFDA 4ELOA 2FYIA 4QHQA 4JSDA 2OZZA 4IO7A 1EU8A 1DMBA 4JXIA 2DVCA 1FQCA 1B05A 3LSXA 3V83A 3M3LA 3OO7A 3QXMA 4GVOA 1JW1A 1RYXA 3L6GA 4R6YA 3MWBA 2WKYA 4ELRA 4Q0CA 4H8IA 1FTMA 3KJTA 1PB9A 2PVUA 3FXRA 4C1TA 3GZGA 2RINA 4K3FA 1ZKBA 3R7XA 1FTOA 1YAEA 5JEIA 1D4NA 1SQYA 4E0WA 1B7HA 2IA4A 3SDFA 3MVZA 2DWHA 3N6TA 1N04A 2B3FA 3SKPA 1D9VA 3KOTA 2HAVA 3FGSA 4ZZAA 4U22A 3TCHA 4EF1A 2PYYA 1POTA 3T66A 4R72A 3CSGA 3IOTA 3PD8A 2XX8A 5EHSA 5KDTA 2OCUA 4OEVA 1A99A 1SW1A 2XXUA 5I58A 3UK4A 4AB6A 4RXLA 2R6GE 2DE2A 1Y3NA 3U8QA 3RLFE 3THIA 3EQ1A 3RNNA 4Q30B 3D4CA 3IOVA 3PPQA 1SI1A 5TP9A 4IO6A 1USYH 5AA2A 4N6PA 5JK4A 1IEJA 4KCDA 1OIBA 4YMAA 3TYHA 3IL1B 4GL0A 1PB7A 4F31B 3VFJA 4RPOA 3UGWA 1PC3A 3CRBA 1SDXA 3P7IA 1LFGA 2I48A 4NWDA 4YKJA 3PMVA 3VXCA 4TOZA 1Q35A 4R74A 2DE3A 4GXSB 1R6ZA 3RQTA 2O6AA 5BWJA 5KDTB 1TFAA 4GXAA 3TZAA 1FTKA 4R73A 1MM6A 4NMYA 3MP1A 1EZOA 5I58B 1B52A 4QF9A 3K02A 2LAOA 3KFMA 1UIUA 2VGQA 1B3EA 2UXAA 1CB6A 4Q5TA 4DZ1A 4ELQA 1MXUA 3UP9A 3K6XA 3MP8A 2Z23A 2Y7PA 3TPAA 1Y1ZA 2XXRA 5TP9B 5CRYA 2ZMBA 4AB5A 4U1ZA 2Q2AA 4ZEFA 3I3VA 5AA2B 1VFDA 3SEVA 3IX1A 1LFHA 1MG1A 4FORA 1EZPA 1MY2A 4I9DA 1B3GA 1RKMA 4NEDA 4F3BA 5ISUA 4OVJA 3RN8A 1WDNA 4FECA 3CFLA 4GFRA 4RK2A 3JYRA 3MZBA 3H6WA 4YB5A 4G77A 4FAJA 4EXKA 2GRVA 3O97A 1ELJA 2ZXTA 4MBPA 1SD3A 3E9XA 3B7DA 3G3IA 2GFEA 4OFOA 4POWA 3H03A 1OMPA 1OLCA 1A54A 2DYXA 1JVXA 1IZ1A 3T22A 3KN3A 4DXUA 1O63A 5FTHA 4NF4A 1MPCA 2F7CA 1PBQA 2V3QA 2PMSA 1MY3A 3W15C 2OJTA 4EQ9A 3T96B 4H5FA 3TUSA 2O69A 2PT1A 1NNTA 4U21A 4JWXA 3HHFA 1AL3A 1I6QA 4QSEA 3RT8A 4H65A 3JZJA 4XKNA 4ONYA 4F3PA 4JBZA 3C36A 1A40A 4PFWA 2B3BA 4DXCA 2DE4A 5I2NA 3K00A 4ZEDA 3B6TA 1US4A 4HCYA 1MXVA 3A3CA 4R9FA 2XXIA 2ZNTA 3GBBA 1OVTA 5DVJA 1H3DA 3TTKA 3A3UA 3OEKA 3PV0E 4FJPA 4RK9A 5LOMA 4O3CA 4R9GA 2O7UA 5L9MA 4NF4B 4DE8A 1A8EA 2DWIA 3MBPA 1QJMA 1LB8A 4XKRA 3N94A 3G3HA 3ZKLA 3PPNA 4LUBA 3FD3A 1TWYA 3EF7A 2ABHA 5CMKA 2AYSA 1PBPA 4ZE9A 3ECRA 2OWTA 3KEIA 2DXYA 4C1UA 1FQEA 4IO5A 5TU0A 5H8SA 4JB7A 1ANFA 2P0SA 1MXXA 4UA8A 3T9VA 1IXHA 1BP5A 1WODA 2F78A 1VSOA 1SBPA 2QS2A 3KSJA 1R9LA 3AXFA 3USDA 1FTJA 4H5GA 4THIA 3PMWA 4R2FA 4GRKA 4M1VA 5I2NB 1HSEA 3MVXA 4OHNA 4G4PA 5L9SA 1B51A 1B5HA 3O6HA 1DOTA 4MF3A 5EHMA 4ND9A 4G2ZA 1N7XA 2DVZA 4HCWA 3LSFB 3OXNA 4G68A 2F36A 1XVYA 2NXOA 4RA1A 1A7LA 4U1OA 3QAXA 2W7YA 4H0WA 4YKIA 5ICTA 1H44A 1B7ZA 2GHBA 5DYHA 1OQHA 4KYEA 1NNFA 3SEYA 1PDAA 1FQBA 3C4MA 5FHOA 1Y9UA 3MW0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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