3T96B

Iodowillardiine bound to a double cysteine mutant (a452c/s652c) of the ligand binding domain of glua2
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGCRDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDCGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanism of AMPA Receptor Activation by Partial Agonists: DISULFIDE TRAPPING OF CLOSED LOBE CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t96B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t96B02
5AA3A 5KCJB 4X48A 3HV1A 4PFWA 3VLUA 3U1OA 2QPQA 3HSTA 5LOMA 5HPQA 2A5SA 5J1DA 1B3HA 1N7XA 2F6GA 2B3FA 3B7DA 5KZTA 3ILUB 4F22A 1NFTA 3QAXA 3T96B 3FXRA 1URSA 3I3VA 3M3KA 3PD8A 3VXBA 4WKMA 1LBCA 5JEIA 4I8CA 4EQBA 3KSJA 4OMBA 1IXCA 1OLAA 1Y4CA 1A8EA 3DP4A 3LBSA 4ZZAA 4DCYA 4R6HA 4F3BA 1IIWA 3LSXA 1ATGA 1JVXA 4GL0A 4GXAA 4NF6B 4ND9A 4POWA 3MVXA 4X1BA 3JZJA 2GH9A 3MJNA 1MM6A 1FQDA 4NF5A 1ZMGA 4NEDA 4F3GA 3KN7A 3HHGA 1POTA 3FV1A 4DXCA 4KYEA 2D3IA 1PB8A 2RINA 2DWJA 3KN8A 3O28A 2D5WA 2DWIA 3PUXE 4G8NA 3RQTA 2V93A 1B05A 1M5FA 1NH8A 2G29A 3A09A 2V3UA 3LSWA 3MW0A 5A5XB 2O68A 3QSLA 4GF8A 4OYVA 2O7IA 1UTBA 2Z8EA 4X1DA 4I62A 5DEXA 4EQ7A 5I2KB 3SEXA 2THIA 5ICTA 1D4NA 2F6PA 2VP1A 3RT8A 3U94A 4THIA 5AA2A 3K0VA 4TLMB 2ZYMA 3QUJA 4ZE8A 3V5AA 3USDA 4YU0A 2REJA 1NKXA 2OZZA 1RKMA 3K02A 4F39A 2V25A 4LP2B 1SYIA 1Y3NA 4JSOA 5BUUA 3ECRA 1XHYA 2I58A 2I3VA 5CRYA 2ANJA 3FXUA 1YCJA 3IORA 2XXIA 3IOUA 4GVOA 1FCKA 5FHMA 4RXLA 3ZS6A 1B0LA 3D4GA 3MP6A 4ELOA 3S9LC 4YB7A 1LAHE 1L5TA 4FATA 1NNTA 3G3FA 1MQDA 4KYDA 2I3WA 3F11A 4P0IA 4YICA 3SERA 1B7ZA 3PU5A 5L8DA 4BLAA 1B4ZA 2QMXA 4NF8A 3PPOA 3CFXA 2XHDA 4ELRA 1B0HA 3KSXA 3MVWA 4KI0E 5B7DA 1EZOA 1RYOA 1GV8A 3JV9A 1P1UA 4M1VA 3FXQA 4MFIA 3VLVA 1D9VA 2VHAA 1SVXB 1I69A 4N6PA 4OQOA 3FASA 2NVUB 1PB7A 3TTLA 4LVQA 1MXWA 3MZ9A 3E13X 3SEYA 3VXCA 5I58A 1UIUA 2RCAA 4H8JA 1JETA 5H8FA 4AB5A 4R2BA 4OTEA 3FGSA 3KFMA 3BKIB 3O66A 1BIYA 1KWHA 2XXUA 4NF5B 1MPBA 2NOOA 5IKBA 1A7LA 1FW0A 1UTHB 3FD3A 2QS1A 2HZLA 2Q9TA 2QMWA 3O97A 4OERA 4R75A 3H06B 4TLLB 1XT8A 4IY5A 5CC2A 5I2NB 3K2DA 1HSLA 4G77A 2ALUA 4FE8A 1WODA 2O69A 4U23A 4ZE9A 5I57B 3TEPA 1PEBA 1S9TA 1CB6A 4YKKA 4EXKA 4RYAA 3C4MA 1SBPA 3LC8A 3TTRA 3RLFE 3L6GA 3IOVA 4IO2A 4Q8RA 2M8CA 5KDTA 1A55A 3MC2A 2F78A 3QYTA 1A54A 1A8FA 3HO7A 3N6UA 4G2ZA 2VD2A 4OEUA 4R73A 3KOSA 1P99A 2ESNA 4U1OA 1OQGA 1MDQA 1QULA 3RUMA 1MH3A 1LAFE 3OO7A 4ZECA 3IAZA 2DVZA 3W9WA 2BJJX 3SKPA 2F36A 1FQBA 1PBQA 2DWHA 4JDFA 1M5DA 5CI5A 1QKBA 5F1QA 4OHNA 3C34A 4G68B 4ZZEA 5L9OA 1B7HA 1M5CA 1OVTA 3KGCA 3AXFA 3K1NA 4QHQA 2V3TA 1SW4A 1H44A 2FYIA 3GBBA 4GQOA 5CMBA 3QUFA 4IGTA 3T9UA 4JSDA 3ZKKA 2F7AA 1A99A 1FQEA 1GGGA 3PPQA 4ZEIA 2OBGA 1ZKBA 3CSGA 1EZ9A 3E4RA 2PBWA 1SI0A 3H7MA 4F3PA 2PT2A 2Q2AA 2UYEA 3KZGA 3PMVA 4LZ8A 3THIA 3UORA 1OVBA 4I1DA 1MXYA 5EYFA 2I4BA 1LSTA 4H5FA 4Q0CA 1NNPA 4G68A 1LB8A 4FAJA 5CMCA 1SD3A 2RKMA 3CVGA 2IEEA 3EHTA 3IL1B 3R26A 4OEVA 1IZ1A 1FTOA 2VOZA 3PD9A 1UIVA 1MG1A 1MQGA 1MH4A 1SDXA 4RA1A 1YTVA 5H8HA 2XXWA 2WKYA 1DPEA 1TFAA 4DIGA 3S9EA 4FEBA 1IXHA 4ZDMA 2ZMBA 3DELB 2CZLA 1UTBB 2P1SA 3TQLA 5AA2B 3Q27A 5A5XA 3O6GA 1P1OA 4H5GA 3M3FA 3DLNA 4PFUA 3PMXA 3OMBA 1MY4A 3IOWA 3H6TA 4OFJA 4OESA 4H8IA 3S9MC 1Y3PA 1ANFA 1IXIA 3CIJA 2OWTA 3PUYE 3V8XB 5I59B 3OD7A 1BP5A 1MS7A 4ISUA 3IB2A 2XD2A 4BDNA 2PMSA 1B5HA 4GFRA 4EXLA 1PC3A 2NUVA 4IB2A 4MH5A 4TOZA 3MVYA 5K2YA 3IJXB 1SW2A 2NXOA 4DLDA 4GL8A 4UA8A 3VVFA 2O7UA 2A5TA 5IAIA 2REGA 4QSEA 2Q88A 2UVJA 3Q28A 2VGQA 2XX7A 2HAUA 3QIMA 1MXVA 1D3KA 2AIXA 1B46A 5DVFA 4LZ7A 4ZEBA 4PP0A 5ITOA 3P7IA 1MQJA 1O7TA 4R9FA 1OMPA 2GHBA 3U8QA 4ECFA 1DTGA 1M5EA 1OQHA 1IUDA 4QRZA 1JEUA 2F8DA 4DCXA 4EDPA 1JNFA 4F1YA 4QFKA 2OK2A 4LZ5A 1VFDA 4P0GA 1MQHA 2Q8JA 1US5A 1ZBMA 4YMBA 3DP6A 2NWJA 5ICQA 1M5BA 2H98A 2I0BA 4G4PA 2DOJA 1B3LA 2PYYA 2UVHA 1B5IA 5AA4B 3IB1A 5I57A 3CRBA 4GLIA 4TQUQ 3ZKLA 1P1WA 3ODBA 1Y1MA 4LA9A 1J1NA 3G3JA 4R2FA 1N3WA 4QSDA 4X9TA 2DE4A 3TZAA 1B52A 3FJ7A 3OXNA 5I84A 4EF1A 3E3KA 1UTHA 1WVJA 2ZNUA 3PUWE 4YB6A 1R9LA 3KEIA 1B2HA 5DT6A 1N04A 4E0XA 1O64A 4DE8A 2XX9A 1FQAA 4ZEFA 1SYHA 3IR1A 5I58B 3LR1A 1RYXA 3I6VA 3MBPA 2QS3A 3KBRA 4BDLA 4C0RA 1S7YA 3FV2A 3C36A 1LAXA 2XXRA 4IO3A 1Y20A 4R6KA 2V3QA 5AA4A 1AL3A 4LONB 3IOTA 3Q29A 1D9YA 3SETA 1B9JA 5FHOA 2F7CA 2OCUA 4FECA 5M2VA 2ONRA 2Y7RA 3H6VA 4POXA 4F29A 2O1MA 1ZJLA 5FTIA 4C1TA 2AL5A 2DXYA 3MWBA 3K00A 1VR5A 5H8SA 4NWDA 3O6HA 1B6HA 5DVJA 5BWJA 4NF4A 3FATA 3FVOA 3H6WA 3MZ1A 4MF3A 3RN8A 1USYE 5F7VA 1NH7A 4BDMA 4H65A 3PPPA 5TPAB 1VE4A 2ZYOA 3FVKA 2A5TB 1URGA 2UVGA 1LFGA 5HM4B 4WEPA 3T9VA 3B6QA 4U2RA 4RPOA 4YB5A 2DE3A 1MY3A 2FNCA 1EH3A 3VDFA 1B3FA 5AA2D 5K2XA 4ZEDA 2QJEA 3UN6A 3N5LA 3K6XA 1H76A 4F2OA 3UK4A 2AL4A 3OO6A 2W7YA 1B7UA 1LGBC 3H3GA 4F1VA 2XXXA 2XXQA 3TUSA 1FTKA 3OOAA 3PMWA 1QKAA 4GOTA 2OJTA 3EHSA 4HS7A 3C33A 4BDOA 3OEKA 3U92A 2OLBA 2Q89A 4ESWA 3SEWA 3RY3A 4KD5A 2LAOA 3A3CA 1B1XA 4NF6A 2E1SA 4QFOA 1ZU0A 1BLFA 4KHZE 3DM0A 1TT1A 1MY0A 1DTZA 1LAGE 3C9HA 3EHUA 3N26A 4HCYA 2DXRA 1IEJA 4F18A 3CI8A 2KLFA 2B3BA 4P11A 4DDDA 2ABHA 4DXBA 5I56B 1MY2A 1P1QA 2X7QA 1R6ZA 1DMBA 2Y84A 3BFTA 1A40A 4KYSA 3OO8A 5EHMA 4Q30B 4NE4A 4Z0IA 4GWOA 2X26A 2DWAA 4KCCA 5L9SA 4GD5A 1LFHA 2AYSA 4ELPA 2QS2A 1AIVA 1AOVA 1S50A 3G3KA 4FEDA 3TTKA 1NNFA 4R9GA 4MLVA 4JBZA 4LUBA 3PUZE 4HTGA 4LQ2A 1POY1 3TQWA 1N76A 3LUYA 1DSNA 4H6DA 4XIGQ 3MP1A 4G8HA 4KR5A 5B70A 4KFQA 4XKNA 3HN0A 2RCBA 2P0SA 1QUKA 1GR2A 2I48A 4IGRA 3M8UA 3KJ7A 1QW0A 3FZVA 4U1ZA 3IO6A 2Y7IA 1GTKA 1PB9A 3RNNA 3N94A 3WAEA 4N07A 3T93B 2DS9A 2GHAA 5CBRA 4U21A 1I6BA 4PQJA 3C31A 4OXVA 4K3FA 5CMMA 4QFNA 2X7PA 5H8NA 3V83A 1IXGA 5AE4A 4KPTA 4ESXA 3RGYA 3UGWA 2FA7A 3N6TA 4OZ9A 4U4XA 3RTWB 3VLWA 4GXSB 5EHSA 3RTFB 1ZLQA 4NMYA 4EF2A 1LCTA 2ZYKA 3E9XA 2DE2A 3GBAA 1XOCA 3CR9A 3K6VA 2O6AA 3KG2A 1N0TA 4L17A 2ZYNA 4I9DA 1JW5A 1B5JA 2H99A 2I6EA 4U22A 4QFPA 1CE2A 3GLBA 3FJGA 3PV0E 1SQYA 3UA8A 2YJPA 4OETA 1HSEA 4F31B 3H6UA 4JWYA 2OWSA 3FJMA 2UVIA 3H4ZA 3VVEA 4UACA 2UYFA 3EN3A 1B3EA 2HAVA 2DQVA 1R9QA 4LATA 4N13A 4ZEKA 3TELA 4ELQA 3ZSFA 1B32A 2CMOA 5H8HB 2ONSA 1H43A 1MDP1 3FUZA 4YKJA 2H25A 2RC7A 3UIFA 1Z7ME 3U72A 4R74A 4RY1A 4QF9A 1BTJA 4KQPA 1TWYA 3TPAA 3OEMA 1FQCA 1Y1ZA 4G68C 4JB7A 2Z8DA 1GVCA 4PFYA 1TFDA 3IO4A 1B58A 4EQ9A 1LCFA 2E0SA 4MBPA 5FHNA 1WDNA 3TMGA 2H4IA 3B6TA 3B6WA 3Q26A 1USYH 4F3SA 1QVSA 3TAJA 5JK4A 1NNKA 1JQFA 1XVXA 3CFLA 3G3IA 4G8MA 4GIZA 1MQIA 3O9PA 4RNSA 4H67A 3TCGA 3OSRA 3VE1B 1QUJA 1T0KA 3LSFB 2I4CA 1B40A 5JTYA 2PT1A 5H8QA 1XC1A 2Y7PA 5KCJA 2R71A 4H1XA 2F97A 4NF4B 1O63A 3H03A 3K6WA 2G93A 4RK9A 3SDFA 4DXUA 3PUVE 3G7WA 1N3XA 5ELVA 3GXAA 1PBPA 5TP9B 5I2KA 5DEXB 2HXWA 2Q2CA 3CSBA 2H5YA 2RC9A 2I0CA 4O3BA 4OWDA 2VD3A 4Q5TA 2O1LA 5TP9A 4QFLA 4XTCQ 3MQ9A 4LQ5A 1ELJA 5FTHA 2O84X 2YLNA 2HFBA 2F5XA 2ZNTA 5ITPA 1B3GA 4IO4A 4KCDA 4XKRA 3C35A 3TCHA 2XXHA 2RC8A 5H8QB 4PFTA 5JTYB 3S4UA 1IQ7A 2HEUA 2HQ0A 4WEDA 4R72A 1DOTA 3T9XB 4BDRA 3M3LA 2B65A 3IJOB 2XXVA 2UXAA 4IO5A 4OENA 1FTMA 2V84A 1JEVA 4YKIA 4AB6A 1FTJA 1NL5A 5CBSA 3MZBA 2ZNSA 5H8FB 1HSJA 3L6HA 1EZPA 2Y7WA 2XXTA 1Y9UA 3EF7A 1I6QA 3ONMA 4RK2A 3RT6B 3TCFA 2GFEA 3S2VA 2R9JA 3FIRA 1SI1A 4FORA 1B1HA 3GZGA 2Z8FA 4NWCA 3K4UA 2Z23A 2Y7KA 1N7WA 1NMUA 4AQ4A 2QSXA 3TFLA 1MM7A 1ZIUA 3G3HA 1MXXA 3TKDA 5CMKA 1OIBA 1PDAA 3K1MA 3IK6B 3U93A 3VV5A 1UQWA 2QL3A 2ZXTA 2XXPA 3OO9A 5DTBA 3TYHA 5HBCA 3QXMA 3WAFA 4YKPA 1YAEA 5TPAA 1JVYA 1LB9A 2HZKA 1QUIA 4NTLA 1TXFA 3HHFA 4O3CA 3PPNA 3KJTA 2F7BA 3BBRA 3C32A 4IO7A 5ISUA 1F9BA 3O6IA 3HCQA 2RF1A 4O3AA 3PPRA 3KOTA 3MP8A 3QK6A 3MPKA 3VVDA 4XKQA 3IX1A 1VFEA 1II5A 4JWXA 5CM6A 2P2AA 3EQ1A 2DYXA 3HPIA 2GRVA 1AH5A 1R1NA 3TDJA 4R6YA 3LSLA 2H9BA 3W9VA 3FVGA 1URDA 3O2AA 3OENA 4RPNA 1YPNA 4OVJA 5I59A 1XVYA 1Z7NE 1H3DA 1OLCA 3TTMA 1H45A 4GRKA 2DP8A 2YPNA 1JW1A 4Z7EA 4U4SA 1AMFA 1Q1KA 2PX1A 3IB0A 4BDQA 3TTNA 3RPWA 1N84A 3DP8A 3SEVA 3K6UA 3R6UA 1VSOA 4M4GA 4JXIA 5KDTB 3MAMA 3A3UA 2DSFA 1Q35A 1DPPA 3FVNA 3T66A 3UP9A 3S9NC 3MUQA 1LLSA 2D21A 2HCAA 2ONKE 3OSQA 4IY6A 3TODA 1ZTYA 4OFLA 4YAHX 3D4CA 1MXUA 1XS5A 2R6GE 4FIMA 1Y4TA 3KN3A 4ZS9A 5L9MA 1QJMA 5DVIA 3SESA 3I5OA 1EU8A 1IITA 3SEUA 3W15C 1MPCA 2XD3A 3BFUA 1LFIA 1US4A 2Z22A 4FJPA 4XKPA 3T22A 1MXZA 4EUOA 3O29A 4F19A 2XXYA 5I2NA 1B4HA 2F35A 1MRPA 4H0WA 4WXJA 4XXUA 1SW5A 1P1NA 1BKAA 1FTLA 3CFZA 4YZZA 5DYHA 5H8NB 2DVCA 4PE5B 3G3GA 3T9HB 3MPLA 2QRYA 4RJZA 5TU0A 1FQFA 1B51A 3PGFA 3R7XA 2XX8A 3V89B 4HW8A 3EPEA 4C1UA 1I6AA 1SW1A 4MLQA 4OFOA 3Q25A 5I56A 3CG1A 1JW4A 1MY1A 2O51A 1MPDA 3JYRA 1LBBA 4QSCA 4HCWA 3K01A 4F1UA 3CG3A 3MVZA 3ILTB 3K1PA 3OELA 2F34A 4IO6A 4YMAA 2I49A 4DZ1A 2QS4A 4NF8B 4ONYA 5AA1A 3VFJA 4E0WA 4PETA 2PVUA 4F2QA 2IA4A 1Y3QA 4JWOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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