3T96B

Iodowillardiine bound to a double cysteine mutant (a452c/s652c) of the ligand binding domain of glua2
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGCRDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDCGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanism of AMPA Receptor Activation by Partial Agonists: DISULFIDE TRAPPING OF CLOSED LOBE CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t96B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t96B02
1FTLA 1US5A 1D9YA 4RK2A 1H44A 1OIBA 2XXIA 3ILUB 3PUXE 1B4HA 1SI0A 1VR5A 4R73A 4G68B 4G8MA 3FJ7A 1I6AA 4H1XA 4C1TA 2DXRA 2UVIA 3O66A 4GLIA 3M8UA 5M2VA 1N84A 2HFBA 2OBGA 4KYEA 4NF8A 5L9MA 4O3BA 1Q1KA 3T9UA 3SEYA 2QJEA 3CSGA 5JTYB 3TCFA 4OETA 5DVIA 4R72A 5AE4A 4LP2B 2ANJA 3ZKKA 5DVJA 1MY1A 3N6UA 3TYHA 1LFGA 5A5XB 3Q26A 4LUBA 1DMBA 4M4GA 4KCDA 1MH3A 2H5YA 2ONRA 4QFPA 4U23A 3T93B 1FTKA 1MY0A 1FQFA 2V93A 2ZYOA 4YMBA 2DP8A 3K6UA 1OMPA 2ZNSA 3FXRA 3VFJA 3PUWE 2GHBA 3CFZA 3FXQA 1QJMA 4KCCA 4TLLB 2V25A 1BTJA 1ZIUA 3IO6A 3LSLA 3VXCA 4U4XA 3C35A 3FVNA 3LUYA 5A5XA 4Q8RA 4YB6A 1JW1A 5HPQA 3HCQA 3O28A 1NH8A 2Z8DA 1H3DA 4I1DA 5CM6A 3A09A 1IXGA 1RKMA 3EN3A 3IOWA 3B7DA 2DWJA 4IB2A 2F6GA 4TOZA 3B6QA 2RCAA 1TWYA 1NNPA 2UYFA 4MH5A 3H06B 3RTFB 4H6DA 1MXVA 4GVOA 1OVBA 4GL8A 3OEKA 3RNNA 1R1NA 4EQBA 2H99A 3IOVA 3K00A 4IY6A 3CR9A 4JWOA 1CE2A 2QS3A 4M1VA 2O7UA 3BBRA 1B5IA 4NWDA 2O7IA 3G3GA 4OYVA 1JETA 3W9WA 1B5JA 1M5FA 3H3GA 3MP1A 1IZ1A 4DDDA 1M5EA 4ESWA 1LBCA 1DPPA 3QYTA 4ONYA 3MJNA 2UYEA 5HBCA 4AB6A 5H8NA 4IY5A 4XKQA 2A5TB 4DCXA 4XKPA 2F97A 3ODBA 4PFTA 3TMGA 1IXCA 3N94A 1P1NA 1MDP1 1UIVA 4F3SA 3V83A 4GL0A 1OQGA 5K2XA 4GQOA 1B6HA 2DE3A 4R74A 1LCFA 1XS5A 1XOCA 2XXYA 3GBBA 1M5DA 3BFUA 4ZZAA 3S2VA 1P1QA 2ZYNA 3FJMA 1LB9A 3PPNA 4LA9A 1TT1A 3OSQA 4WKMA 5DEXB 1MS7A 4MBPA 1H43A 4C1UA 1Z7ME 2F7BA 3BFTA 3PPPA 4OQOA 5EHMA 4X1BA 3MVWA 2Y7IA 1QULA 4F39A 5ICQA 1ZJLA 3IO4A 5LOMA 2XXTA 1NL5A 5ITPA 1PB7A 3KG2A 1SD3A 4F2OA 2XD3A 2ONSA 4IGTA 4WXJA 4YKIA 3ONMA 3CRBA 3O6HA 3U72A 1JVYA 5CBRA 1EZOA 4G8NA 1MQJA 1SQYA 3HHGA 4YB5A 2F7AA 3RGYA 3V5AA 4X48A 3MW0A 5ISUA 3K4UA 1N7WA 3H6TA 3KN8A 3UP9A 4YKKA 1BLFA 3THIA 1PB8A 2Y7RA 2NWJA 4PQJA 4NWCA 3QUFA 2IA4A 3ECRA 3FGSA 1SYIA 4I62A 4IO3A 5AA4A 1MY3A 3VLVA 1OVTA 3EPEA 4RXLA 2H9BA 2O69A 2XXXA 1PBQA 3S9EA 2Z23A 2GFEA 5I56B 2RF1A 2ZYMA 3I3VA 4Z7EA 1SYHA 4JSOA 4Q5TA 4NMYA 3TZAA 3OO7A 3Q27A 3V89B 4ZECA 4POWA 3R7XA 1AH5A 5KCJA 4ZEBA 1MXXA 2G29A 3MZBA 4LATA 3LSWA 5TPAA 4R6YA 5H8HB 1BP5A 2M8CA 2RKMA 3IB0A 1CB6A 3CI8A 4G2ZA 4H0WA 3VVEA 4ZEDA 1Y20A 5CC2A 3H7MA 3IJXB 1IEJA 2XD2A 4NF4A 3MZ9A 4LZ5A 3MP8A 5KDTB 3S9MC 2AIXA 1P1WA 1SW5A 2GH9A 2Y7WA 4QSDA 5FHMA 5H8SA 3RT8A 4NE4A 5AA3A 3C36A 2NXOA 1MQDA 3K0VA 2DXYA 1B9JA 1N0TA 2Y7KA 4OFLA 2F8DA 3RLFE 3O29A 4MLVA 3FV1A 2GHAA 2RC9A 4YICA 3LSXA 3KZGA 4MFIA 1RYXA 1Y3PA 3FVOA 1B1XA 3HSTA 5H8HA 1URGA 3Q25A 3VV5A 4QHQA 2AL5A 3MUQA 5I58B 3KEIA 5EHSA 1J1NA 2ESNA 3B6WA 4NF8B 3MPKA 4UA8A 3OMBA 2XX8A 4LVQA 3T9HB 1FQDA 2Q8JA 5JTYA 4QFNA 4OFJA 3EF7A 5F1QA 3MZ1A 1WDNA 1WODA 4IO2A 1YAEA 2UXAA 4JXIA 3UN6A 5AA2A 3OOAA 5DT6A 1MQGA 4Z0IA 4C0RA 3ILTB 3MBPA 5JK4A 3UGWA 4OERA 5B7DA 4POXA 4OXVA 1IIWA 1ATGA 3KFMA 2UVGA 3U1OA 3ZKLA 1Y3NA 1NNFA 2I4BA 5I2NA 3SEVA 5I58A 1N04A 1IXIA 4R6HA 1QUJA 4JWYA 4OEUA 3RQTA 4G4PA 4G77A 1Y4TA 1VE4A 1XT8A 3FZVA 1QKAA 2P1SA 4ELQA 1GTKA 5AA2D 5I57B 1XHYA 1FQEA 3MP6A 2W7YA 1A40A 1YPNA 1USYH 3UIFA 3DLNA 3E9XA 3OO9A 1A7LA 2YLNA 1R9LA 1LSTA 2DE4A 2O1LA 3FJGA 3QK6A 3R6UA 2RC8A 2XXPA 3HN0A 4N07A 1UTBA 3RT6B 5DTBA 2ZMBA 3VVFA 2A5SA 4ELOA 4GF8A 4DXCA 4R6KA 2CMOA 1EU8A 4IO4A 4OZ9A 4F1VA 3K01A 3U92A 4QSEA 1FTMA 1MPDA 3L6GA 1GV8A 1UTHB 1MRPA 2HXWA 3IOTA 1B3EA 1P1UA 3KN7A 3IB1A 3N26A 1B4ZA 4OFOA 3SETA 4DZ1A 4GOTA 2NOOA 4NF6B 1B5HA 1MQIA 1AL3A 5HM4B 1NNTA 3B6TA 3H6VA 1SW1A 2E1SA 4KFQA 1T0KA 5H8FA 1N76A 2I0CA 1B46A 2F78A 3FIRA 1BIYA 4JWXA 5F7VA 3RPWA 2F6PA 1D4NA 4FAJA 2VOZA 1AIVA 2O6AA 2DWIA 1A54A 4L17A 4QFLA 1UTHA 5FHNA 5H8NB 3TCGA 4TLMB 3VE1B 4QFOA 4F3PA 1B52A 3GLBA 4JB7A 4KYSA 1VFEA 2NUVA 2Z8EA 3LR1A 1O7TA 4U22A 3DP4A 2O51A 1XVXA 1PB9A 2X7QA 4ZDMA 3UA8A 5KZTA 3IJOB 1TFAA 2V84A 1BKAA 3QUJA 3SEWA 1Y1ZA 3DM0A 3FXUA 3PUVE 3OO6A 2UVJA 1GGGA 1JW4A 2DSFA 1S7YA 2E0SA 1B3LA 4GXSB 4JBZA 5CMMA 1M5CA 2R71A 2X7PA 2Z22A 3A3CA 5L8DA 3RUMA 4EXLA 3FVGA 1LGBC 2VD2A 4ELPA 2ZNTA 1US4A 3CG3A 3DP8A 1EZ9A 2DVCA 2I0BA 3QSLA 4KR5A 1LAFE 2QMWA 2Y7PA 5EYFA 1MXUA 3QXMA 1POY1 4BDNA 1AOVA 1QUIA 2XXQA 2ABHA 2H98A 1L5TA 4H5FA 4JSDA 3KBRA 4DXBA 4AB5A 2X26A 4N6PA 5IKBA 3T96B 1YTVA 2DWHA 4K3FA 1QUKA 4F1UA 1SI1A 4FEDA 1A99A 3PPQA 4HTGA 4LQ2A 5DYHA 1A8EA 4OHNA 3JZJA 4G68A 4DCYA 3EHTA 3G3HA 1DTGA 2V3UA 3PPOA 2XXUA 1N3XA 4PE5B 4R75A 5ELVA 3CFLA 2KLFA 4FJPA 4UACA 1ZBMA 3R26A 3SDFA 1Y9UA 4GIZA 1Z7NE 2O68A 4NEDA 4XXUA 3JV9A 1UQWA 3CG1A 5CMCA 4OVJA 4DIGA 4R2FA 1QKBA 2H4IA 4WEPA 5J1DA 1ZMGA 1FQCA 4EDPA 4NF4B 1Y1MA 2XHDA 4R9FA 1P1OA 4DXUA 1P99A 1MY4A 4F1YA 1JW5A 3OENA 3Q29A 4P0GA 3CFXA 5TPAB 3K6VA 1B2HA 4BDRA 4ZZEA 3OO8A 2HCAA 4TQUQ 1TXFA 3K6XA 3PV0E 1IITA 1N3WA 4U4SA 5FTIA 1I6BA 3FVKA 3H4ZA 1D9VA 3IAZA 1HSJA 1B40A 3MVZA 3PU5A 1MM7A 1ZTYA 1LAGE 3M3FA 3C4MA 4RY1A 5L9SA 1OLCA 3OXNA 5L9OA 2P0SA 2RINA 1FTJA 2V3QA 4EUOA 2Y84A 3L6HA 1B1HA 2RCBA 3U93A 3K6WA 4NTLA 4LONB 4PFUA 1DSNA 5CRYA 3TCHA 5AA2B 3F11A 5B70A 3LC8A 5I2KB 1DPEA 3RY3A 4OWDA 2R9JA 4G8HA 1PC3A 4AQ4A 3KJ7A 3G3JA 1MG1A 1B58A 4THIA 2FNCA 3FASA 4I8CA 3UK4A 4O3CA 4PFWA 1NKXA 4RA1A 5I2NB 3S9NC 5TU0A 1MPBA 4LQ5A 2Q88A 3IORA 4H65A 2GRVA 2PMSA 4RJZA 2VP1A 2YJPA 4YU0A 1FCKA 4U21A 4QSCA 3DP6A 2PYYA 2ZYKA 4U1OA 1UIUA 5K2YA 1SW4A 2G93A 3PMXA 4ZE8A 4BDQA 2HAVA 3G3FA 1B51A 3HV1A 1MPCA 2IEEA 3C9HA 4H8JA 5H8QA 3SERA 1XVYA 4FECA 3EHSA 2DYXA 3O9PA 4FE8A 1QW0A 4GD5A 1Y4CA 1Q35A 3K1PA 2Z8FA 4FATA 4QRZA 4HS7A 1B32A 2ZXTA 4QFKA 4ZS9A 4EQ9A 1NH7A 1A55A 3HHFA 3K1NA 1UTBB 2NVUB 4ELRA 3TPAA 1ZKBA 4XIGQ 4YB7A 4KD5A 1LFIA 1D3KA 5ICTA 4KHZE 3G7WA 3PD8A 1II5A 1USYE 4P0IA 3O97A 3LSFB 1B7ZA 3TELA 2O1MA 2HZLA 3VLUA 1DOTA 2PT1A 1GVCA 4ECFA 2Q2AA 5H8FB 1FQBA 4IO7A 3VDFA 2DWAA 3TTMA 2QL3A 3M3LA 3I5OA 4H5GA 5DEXA 4U1ZA 3RTWB 2XXWA 4RPOA 3S9LC 2XXVA 1LBBA 2I3WA 4JDFA 4ZEIA 3TTLA 3BKIB 1LB8A 1A8FA 3IB2A 2LAOA 3PUZE 2DQVA 4H67A 3C33A 3TODA 4BLAA 4FEBA 1NFTA 2D3IA 3JYRA 4F2QA 4F18A 2ONKE 3CVGA 1NNKA 3KGCA 3MVYA 3MVXA 4LZ8A 5FTHA 3TDJA 1POTA 3ZSFA 3O2AA 3TEPA 4R9GA 4F29A 1KWHA 4GRKA 4RPNA 5AA4B 2AYSA 2I49A 1WVJA 1MY2A 3GZGA 2B3FA 1LFHA 1B0HA 3KOTA 3TQLA 3LBSA 3USDA 2QRYA 2F5XA 4BDOA 4BDLA 2OJTA 4X1DA 5TP9B 3GBAA 3TTRA 4QF9A 1URDA 1FQAA 4ISUA 2HZKA 2QS2A 1SBPA 1JNFA 2Q2CA 2DOJA 1NMUA 1MDQA 1ANFA 3E4RA 5CMKA 4F31B 2OCUA 2UVHA 3MPLA 2I48A 3CSBA 2I3VA 3KSJA 3MWBA 4YZZA 3MAMA 2B65A 4EQ7A 3TUSA 1B0LA 4F19A 4IGRA 2REGA 3I6VA 1PBPA 3OSRA 3PMVA 3PUYE 4OESA 4XKNA 1S9TA 3O6IA 4GWOA 4EF1A 2F34A 2ZNUA 3QAXA 2RC7A 3G3IA 3SKPA 3EQ1A 2QS1A 4Q0CA 2HEUA 1IQ7A 3OELA 3HO7A 4R2BA 2F7CA 1I6QA 2I6EA 3KJTA 2HAUA 4FIMA 1IUDA 3TAJA 3VLWA 1PDAA 5DVFA 1MH4A 1B7UA 2F35A 4ZEKA 3GXAA 4IO5A 1B3HA 5I84A 2DVZA 4YKPA 1B7HA 3C34A 5JEIA 2QPQA 2VHAA 4H8IA 1R9QA 4KYDA 2Q89A 3CIJA 2D21A 3DELB 4RYAA 5ITOA 3W9VA 1H45A 4O3AA 1B05A 4DE8A 4F3GA 2PVUA 3U94A 3G3KA 1PEBA 3WAEA 1I69A 1DTZA 2DE2A 4I9DA 1N7XA 4ND9A 4F3BA 3UORA 5I59B 4DLDA 3MQ9A 2REJA 4KI0E 3TKDA 1Y3QA 1TFDA 3TTNA 1LAXA 2I58A 3IOUA 1F9BA 2PT2A 1MQHA 1MM6A 1OLAA 1ZLQA 3C32A 3H6UA 3T66A 1S50A 5IAIA 2HQ0A 4F22A 1YCJA 1AMFA 4MF3A 2OK2A 1VSOA 2AL4A 3ZS6A 1M5BA 3E13X 2F36A 4HW8A 3PD9A 4PP0A 1EZPA 1MXZA 2BJJX 1JVXA 1URSA 3IL1B 2DS9A 3H03A 5I2KA 4OMBA 5I59A 1H76A 3V8XB 4RK9A 2FA7A 1SVXB 1GR2A 5I56A 1IXHA 4HCYA 1B3GA 3TFLA 5I57A 1B3FA 3OEMA 4GFRA 1SW2A 3IX1A 1JEVA 1MXWA 3IR1A 4OEVA 3U8QA 3QIMA 1JQFA 2XXHA 3K2DA 2QMXA 2XX9A 2FYIA 3FATA 1ZU0A 3PPRA 4IO6A 4LZ7A 1VFDA 5FHOA 3T22A 3T9XB 5BUUA 2A5TA 3N6TA 3KOSA 3SEXA 4YKJA 3VVDA 1XC1A 4BDMA 2R6GE 1OQHA 4NF6A 3TTKA 3W15C 2B3BA 2PX1A 4OTEA 1ELJA 3D4CA 1FTOA 3IK6B 1R6ZA 4XTCQ 3H6WA 4ZEFA 5BWJA 3E3KA 4E0WA 2XXRA 3KSXA 4FORA 1HSEA 2H25A 1HSLA 2P2AA 3P7IA 4KQPA 4OENA 2I4CA 3N5LA 5H8QB 4HCWA 4RNSA 2XX7A 3EHUA 2ALUA 2CZLA 4X9TA 4ZE9A 4NF5B 2QSXA 3AXFA 3K1MA 4G68C 3VXBA 2V3TA 4U2RA 3TQWA 4XKRA 1QVSA 3C31A 1LAHE 4YAHX 1RYOA 1MXYA 2Q9TA 3OD7A 2OWSA 3FD3A 5AA1A 5CI5A 2O84X 1EH3A 3PGFA 5CMBA 4ESXA 3M3KA 3SEUA 3FV2A 3S4UA 3RN8A 2OWTA 2QS4A 4NF5A 3D4GA 3HPIA 2PBWA 2YPNA 1O64A 4N13A 3FUZA 3SESA 3T9VA 5CBSA 4PFYA 1O63A 4EF2A 2VGQA 2D5WA 1JEUA 1LLSA 4GXAA 4P11A 4Q30B 1LCTA 2OLBA 3KN3A 1FW0A 2THIA 5KDTA 4E0XA 4MLQA 2WKYA 4WEDA 3A3UA 3K02A 2VD3A 2OZZA 3Q28A 3O6GA 4PETA 5TP9A 5KCJB 3PMWA 3WAFA 4EXKA 1SDXA 3MC2A 4YMAA 4KPTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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