2XXRA

Crystal structure of the gluk2 (glur6) wild-type lbd dimer in complex with glutamate
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
248
structure length
248
Chain Sequence
SLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWW
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 2
publication title Conformational Flexibility of the Ligand-Binding Domain Dimer in Kainate Receptor Gating and Desensitization
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 86
structure length 248
sequence length 248
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-11
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxrA02
1AMFA 5FTIA 2X7QA 3VVFA 4YKIA 2HEUA 3HSTA 3K1PA 2B3BA 5ITOA 3B6TA 1XT8A 1MQJA 5TU0A 4F19A 1B2HA 1SW1A 3O66A 3R7XA 2CZLA 4GOTA 1II5A 5F1QA 5ELVA 3KG2A 2A5SA 4JSOA 3IO6A 3G3HA 1RYXA 4NF6A 3Q26A 3G3GA 3KSXA 4OETA 3TYHA 2D5WA 1IXHA 2DS9A 4F18A 2QS4A 4EDPA 2DWHA 4R72A 4HTGA 3SEUA 5IAIA 2QPQA 5I57B 3O2AA 4PFTA 3H7MA 3HN0A 1LGBC 1GTKA 4QSEA 5KCJA 1OIBA 2HQ0A 4I62A 4GLIA 1MPBA 3TUSA 1Y20A 3TCFA 5HBCA 3A3CA 1TT1A 3TFLA 4H0WA 4WKMA 2Z8EA 5AE4A 1ZJLA 4RK2A 3IORA 1FQBA 1D9YA 1H44A 1Y3NA 4O3AA 2Y7WA 3LSWA 1IITA 3IOUA 3KOSA 3MC2A 2QJEA 2YPNA 3MPKA 4KR5A 3B6QA 1OLCA 3SKPA 2V93A 2KLFA 3O6HA 3P7IA 3OOAA 3RLFE 2I3WA 4QFKA 4DIGA 1PB8A 3C33A 3FV1A 3VDFA 3EHUA 1WVJA 4BDOA 4NF4B 1Y1ZA 3PUVE 2GRVA 3BFTA 5ICTA 2Q88A 2DWAA 5HM4B 4ZEKA 1MDP1 2H99A 2WKYA 1N0TA 4U23A 2F36A 2P1SA 5CI5A 3Q27A 1M5EA 2ONKE 3SDFA 4X1DA 2OWSA 1TFAA 4N07A 5I57A 2Z8DA 1FTLA 3G7WA 4R2FA 3MJNA 3C35A 4ELRA 4H8IA 3FVGA 3SETA 4F29A 3MVWA 3SEVA 1H45A 3MPLA 3U72A 4BLAA 1A8FA 3USDA 5I58B 1URDA 1N04A 1JEUA 1OQHA 1KWHA 3CI8A 3ECRA 3PGFA 1LCTA 4AB6A 1A99A 2Q2CA 2I3VA 5K2YA 4HCWA 4UA8A 1FTJA 4GD5A 1MXXA 4R9GA 3A09A 1VSOA 1FQDA 1HSJA 1QKAA 3HV1A 3SEWA 5H8SA 2ZNSA 1IEJA 3CFZA 2HZLA 4NMYA 1B4ZA 1Y1MA 2O1LA 4NF4A 2XD2A 2ALUA 4JDFA 3U94A 2ZMBA 2AYSA 1QUKA 2UYFA 4LZ5A 2HAVA 5FTHA 4RYAA 1DOTA 2NXOA 1US5A 2UVJA 2RCBA 3TTRA 3OELA 5ITPA 2H25A 1B58A 2IA4A 4IO2A 4QSDA 3I6VA 4RPOA 4FEBA 3PMXA 5I56A 1IUDA 3PD8A 3VFJA 2HZKA 1MY3A 2UXAA 4QRZA 3OO6A 3ZS6A 4ELPA 2Z22A 1A40A 4WXJA 2RKMA 1OLAA 5DYHA 4EF1A 5JEIA 5L8DA 1IZ1A 3I5OA 3Q29A 3ILUB 4RNSA 1P1QA 5I58A 2I48A 4ZE8A 1H3DA 4R6YA 3EHTA 1GR2A 3KJTA 3H6VA 2G29A 2Q2AA 4OZ9A 4JWYA 4GWOA 4YKKA 3K00A 2B3FA 1HSEA 2QRYA 4DCXA 2XXUA 4YMAA 3CRBA 1MY4A 4GVOA 2W7YA 1Q35A 4F31B 3K02A 4TQUQ 3TAJA 4H65A 1N7XA 3EHSA 2O84X 4ISUA 4OERA 5DTBA 4C1UA 1R1NA 1B4HA 4AQ4A 1MPDA 1EZPA 2E0SA 1BKAA 4LZ7A 3RY3A 1B5IA 2D3IA 4OHNA 3E4RA 1NH7A 3UIFA 1OVTA 3RUMA 2V3UA 3O6GA 3UN6A 3CG1A 5CMMA 1UIVA 1B3FA 2XXTA 1NH8A 1MG1A 5B7DA 3TCHA 3DP6A 3TTLA 3VVDA 1PDAA 3O97A 5JTYB 3T93B 3IAZA 1BP5A 1ZIUA 1ZMGA 3H6UA 3RN8A 1FQAA 3WAFA 4ZZEA 2VGQA 1EZ9A 2I4BA 3MP1A 2DVCA 1LSTA 4KQPA 2V3TA 2AIXA 2V84A 1LAHE 3RNNA 2O51A 2OCUA 1I6AA 4ONYA 4YB7A 2H5YA 4XKPA 3RQTA 4LA9A 4GL8A 2REJA 1SQYA 3H03A 3V89B 5DVJA 5CM6A 5EHSA 2XD3A 3IK6B 3RT6B 4HCYA 3T9VA 5H8NB 4OMBA 4RPNA 1B1XA 1EH3A 4H1XA 1DTZA 3TDJA 4HW8A 2NWJA 3LUYA 4DCYA 4OWDA 3OEKA 4ZDMA 2AL4A 3ZSFA 2GH9A 2DE4A 2O68A 5L9OA 3TCGA 2GFEA 1A7LA 4XKQA 1B5JA 1LFGA 2PT2A 3K6XA 4MF3A 4RY1A 5JTYA 2UVIA 2QL3A 1PBQA 3QUJA 1M5BA 3MVYA 3TQWA 1N3XA 3GBBA 1LFIA 4NF8B 2Y7IA 1XHYA 1PB7A 2PT1A 3FXQA 3JYRA 3CSGA 4DDDA 3MZ9A 1DPPA 2XXIA 4KCCA 3QXMA 4RXLA 1Y3QA 4EXKA 1USYE 3IO4A 4LATA 2DWIA 2XHDA 4R74A 4G77A 2VD2A 4N6PA 4LUBA 4E0WA 3IL1B 5TPAB 1F9BA 2V3QA 4TLLB 4YKJA 3T66A 4L17A 4YU0A 3OSRA 1ZKBA 1VFDA 1BTJA 1T0KA 5H8NA 5EYFA 2NOOA 3FUZA 3VXCA 4IGTA 2Y7RA 3ODBA 2O7IA 4N13A 1MRPA 2HCAA 3K2DA 3FATA 3LBSA 3FIRA 1Z7ME 2XXXA 1S9TA 1CB6A 2F97A 4U1ZA 1S50A 4H5GA 1AL3A 4QHQA 1PC3A 2R6GE 3ILTB 4PQJA 4YICA 2RC8A 3DLNA 3Q28A 1JW5A 3TTMA 3IOVA 3K6WA 4G4PA 2ABHA 1OVBA 2V25A 3IR1A 4NF8A 2PVUA 3TTKA 1IXGA 4F3GA 1DSNA 4QFNA 5ICQA 1QULA 1GV8A 2D21A 5K2XA 4ZEFA 4Q5TA 4KYSA 2DYXA 4R6HA 3FASA 4IO3A 4P0IA 1MH4A 4KFQA 3S9MC 2B65A 5TPAA 2DVZA 2I6EA 3K0VA 2XX7A 2HFBA 3OD7A 4FAJA 4TOZA 1MH3A 3OEMA 3CFLA 5ISUA 3GLBA 4P11A 4POWA 2PMSA 3N6UA 1B3GA 1NMUA 4BDRA 4RA1A 3C32A 4F3BA 3UA8A 5H8FB 1S7YA 1SDXA 3G3IA 5I56B 5DT6A 1GVCA 3QAXA 4EQ7A 2LAOA 3TPAA 1UTHB 2DQVA 1RYOA 2XX9A 3KSJA 4KHZE 1UTBB 4ZEDA 1FQEA 4POXA 2UVHA 3M3KA 1QUJA 3VE1B 3DELB 4Q30B 3V5AA 1SD3A 2DSFA 3A3UA 5CC2A 3IX1A 3QK6A 4X9TA 1N76A 3H06B 3O9PA 5M2VA 1URGA 4KPTA 1GGGA 2AL5A 2ZYMA 1LFHA 1CE2A 1SYIA 3EQ1A 4FORA 1FQFA 4OQOA 3THIA 4TLMB 4NF5B 1R6ZA 2OZZA 4U4SA 4I9DA 4MLVA 2F6PA 3VXBA 1LAGE 1P1UA 2NVUB 3GBAA 4R75A 3G3FA 1NKXA 3PPPA 3LSFB 1R9QA 2Q9TA 3T9HB 1EU8A 1WDNA 3L6HA 3QIMA 3EF7A 2QS1A 1ANFA 3K01A 3BFUA 4GRKA 3TODA 5H8FA 4C1TA 3BBRA 3QUFA 1Y4CA 1D3KA 3MWBA 4IO6A 5TP9B 4NE4A 3UK4A 1QKBA 1AIVA 1N3WA 1O7TA 4DZ1A 2Y7PA 3KGCA 1UTHA 5DVFA 1H76A 4UACA 1UTBA 2ZYKA 4JWXA 4FECA 3WAEA 5FHMA 4MFIA 4OYVA 3KJ7A 2ZXTA 4I1DA 2X7PA 3MP8A 4PFWA 4MH5A 5AA2B 2H4IA 1I6QA 3PV0E 2O6AA 1UIUA 1B3EA 4KCDA 1B3LA 1JQFA 1FTMA 1SI1A 1MQGA 2ZNTA 3KFMA 1B32A 4R9FA 3E13X 3U1OA 3PD9A 1PB9A 1A8EA 1LLSA 4ZE9A 4GQOA 3UP9A 4JSDA 2Q89A 3OSQA 4IO7A 3N94A 4FIMA 5DVIA 4NF5A 3K6UA 2DWJA 3MP6A 5AA4B 1LB8A 1JW1A 2F7AA 4YKPA 5CMKA 3S9LC 5I59B 5KZTA 2DXYA 4F1UA 5EHMA 1P1OA 1Y3PA 3H6TA 2QMWA 1UQWA 4XKNA 4IO4A 1SYHA 3S2VA 1I69A 4ESWA 3LR1A 4FE8A 2OLBA 3KZGA 1ZLQA 1AOVA 3K1MA 1JETA 4F22A 4F3PA 3PUYE 4G8NA 3BKIB 3FZVA 5TP9A 2GHBA 4XXUA 3RT8A 1OQGA 5A5XB 2CMOA 4P0GA 3VLVA 1MXVA 3DP8A 5L9MA 2OWTA 4WEPA 4QFPA 4QFLA 4ND9A 1B05A 1P1NA 1LAXA 3VLUA 2XXRA 3VLWA 1NL5A 2I0CA 3DP4A 1YTVA 2P2AA 5AA2A 3S9EA 4OENA 3N5LA 2O7UA 3MVXA 1TXFA 3MZBA 3PMWA 4QFOA 3RGYA 4FJPA 3CFXA 5FHOA 3LSXA 1TWYA 2OK2A 4RK9A 4OTEA 4AB5A 1MXWA 3RTFB 1MDQA 4ECFA 2P0SA 4OXVA 3OENA 1B46A 5AA4A 1FTOA 1JEVA 4H6DA 3VV5A 2DOJA 5LOMA 3TQLA 1MXZA 4EUOA 5I59A 1QVSA 3JV9A 5CBRA 4KYEA 1BIYA 1Y9UA 3U8QA 3FGSA 4LQ5A 3QYTA 2PBWA 4DXUA 4O3BA 2THIA 4JB7A 1MM6A 3MW0A 4ELQA 1D9VA 4E0XA 2NUVA 1MXYA 4MBPA 4C0RA 4Q8RA 1MQIA 5F7VA 5A5XA 1B7UA 2RC7A 3S9NC 3M3LA 3W15C 3OO7A 3TKDA 1JNFA 3TTNA 1I6BA 1B7ZA 1SVXB 2XXWA 5KDTB 3MVZA 1OMPA 1PBPA 4K3FA 3B6WA 4LVQA 1NNFA 1B52A 3SEXA 3PU5A 1SW4A 3RPWA 4GXAA 5BUUA 1Z7NE 4DLDA 3E3KA 2M8CA 2HXWA 5AA1A 3KN3A 5I2NB 1SI0A 4XIGQ 4GIZA 4QF9A 1N7WA 3E9XA 2I49A 3CG3A 2FYIA 4LONB 1B51A 1DTGA 3HHFA 4JXIA 4M4GA 4F3SA 3F11A 4NWCA 4ZEIA 3ZKLA 3MQ9A 4H67A 4GFRA 1RKMA 4EQBA 1HSLA 4YB6A 4WEDA 2VOZA 2X26A 3SERA 3U93A 4F2QA 1POY1 3IOTA 3C34A 4OEVA 1URSA 1IXCA 5CBSA 2VP1A 3T22A 4EF2A 4H8JA 1ELJA 1ZU0A 2O1MA 2O69A 2A5TB 1FCKA 4Z7EA 1NNTA 3CSBA 2YJPA 3SEYA 1SW5A 3IB2A 1QUIA 1N84A 2RC9A 1USYH 3UGWA 3TMGA 2XXVA 1QJMA 2XXPA 3O29A 2F5XA 4ELOA 3D4CA 1NFTA 1Y4TA 1SW2A 5KDTA 4YMBA 3MUQA 3W9WA 1YAEA 3N26A 3OO9A 3KEIA 3K6VA 2Q8JA 2I0BA 3G3JA 1B3HA 1XC1A 1MY1A 1XVYA 1US4A 3I3VA 3PPRA 1XOCA 1NNPA 3O6IA 3H3GA 5JK4A 5I2NA 3C4MA 1FQCA 4YZZA 1M5FA 3N6TA 1LAFE 2XXYA 4KYDA 4FATA 1A54A 4JWOA 2Y84A 2F34A 3FV2A 3D4GA 2ONSA 4ZS9A 3HPIA 3C9HA 3IB1A 3FXUA 2G93A 1B7HA 1O64A 4LZ8A 3C31A 2I58A 3B7DA 4NWDA 2VHAA 1B9JA 1IIWA 1PEBA 1MQHA 3V8XB 2XX8A 3MBPA 2F7BA 3GXAA 3FJ7A 4KD5A 2ZYNA 3PUXE 3U92A 2A5TA 1D4NA 4O3CA 2F78A 3QSLA 3S4UA 2DE3A 4YB5A 3UORA 3JZJA 4R6KA 2I4CA 1P99A 2UYEA 1MY2A 4THIA 2QSXA 2QS2A 4X48A 3EPEA 3MZ1A 1ZBMA 4R73A 4F2OA 5AA2D 1LB9A 2ANJA 1B5HA 3IOWA 4GXSB 2BJJX 1MQDA 2RF1A 1B0HA 1MXUA 2H98A 1VR5A 1TFDA 4IGRA 1SBPA 2DXRA 3LC8A 4G68C 3W9VA 3SESA 4PETA 1JVXA 5CMCA 5L9SA 3VVEA 4YAHX 4BDNA 3O28A 3C36A 2Z8FA 5H8HB 4H5FA 1L5TA 4ZEBA 4DXBA 4OVJA 3OXNA 2PYYA 3RTWB 1XVXA 1J1NA 2QS3A 3OMBA 3IB0A 3KBRA 4X1BA 5FHNA 3FVOA 3K4UA 3KOTA 3MAMA 4OESA 3CIJA 1EZOA 4Z0IA 4IY6A 1H43A 2XXHA 1MM7A 3TZAA 4ESXA 3T9UA 3G3KA 2F7CA 3PPOA 1MS7A 2IEEA 2HAUA 4HS7A 1IQ7A 3HO7A 4GL0A 4MLQA 4R2BA 1POTA 2RINA 4PP0A 5DEXB 4I8CA 5I2KB 5AA3A 4FEDA 3PPNA 1JVYA 3ONMA 4OFLA 4BDLA 1XS5A 4G2ZA 1QW0A 3IJXB 4GF8A 3R6UA 4PFYA 5CRYA 4DXCA 5J1DA 1M5DA 4PFUA 1WODA 4XKRA 4Q0CA 2QMXA 4U2RA 4U1OA 1LBBA 4LQ2A 3FVNA 1P1WA 1A55A 2H9BA 4F1VA 2F6GA 3KN8A 5CMBA 1DMBA 3FD3A 4OEUA 4U4XA 4U22A 4KI0E 1YPNA 4RJZA 2XXQA 3K1NA 3PPQA 5H8HA 2VD3A 1DPEA 5HPQA 2REGA 3FJMA 4NEDA 1VFEA 4XTCQ 4EQ9A 3EN3A 4F1YA 5B70A 4LP2B 4ZECA 1LCFA 2E1SA 3M3FA 1B40A 1R9LA 3KN7A 4IB2A 4BDQA 2FA7A 1M5CA 3H4ZA 4BDMA 3FJGA 4QSCA 5H8QB 4IY5A 4G68B 3IJOB 5DEXA 2F8DA 2ZYOA 5I2KA 4DE8A 4F39A 2Y7KA 3ZKKA 3GZGA 1B1HA 3CR9A 1FW0A 3AXFA 2ZNUA 2FNCA 1LBCA 2YLNA 2GHAA 2UVGA 3M8UA 3TELA 4G8MA 4IO5A 1B0LA 4PE5B 3PUZE 4G8HA 1YCJA 2DP8A 3DM0A 3Q25A 2OJTA 4NF6B 3R26A 4EXLA 1MY0A 2Z23A 3T9XB 2OBGA 3PMVA 2F35A 1AH5A 1IXIA 3FVKA 3CVGA 4OFOA 2R9JA 1Q1KA 3PUWE 5KCJB 3TEPA 2ESNA 1ZTYA 3HCQA 1O63A 3V83A 1ATGA 5I84A 1NNKA 4ZZAA 1JW4A 3L6GA 5BWJA 1MPCA 4OFJA 2R71A 2ONRA 3T96B 2RCAA 1B6HA 3LSLA 5H8QA 3FXRA 4G68A 4NTLA 5IKBA 3H6WA 3HHGA 1VE4A 1FTKA 2DE2A 4JBZA 1BLFA 3OO8A 4M1VA 2PX1A 4U21A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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3C35A 4ELRA 4H8IA 3FVGA 3SETA 4F29A 3MVWA 3SEVA 2OX3A 1H45A 5T3JA 3MPLA 3U72A 4BLAA 3D1RA 1A8FA 3USDA 5I58B 1URDA 1N04A 1JEUA 1OQHA 1KWHA 3CI8A 3ECRA 3PGFA 1LCTA 4AB6A 1A99A 2Q2CA 2I3VA 1LBXA 4X8RA 5J16A 5K2YA 2XWKA 4HCWA 4UA8A 2QVVA 1FTJA 4GD5A 4PAFA 1MXXA 4R9GA 3A09A 1VSOA 1FQDA 1HSJA 1QKAA 3HV1A 4PGPA 3SEWA 5H8SA 2ZNSA 1IEJA 3E79A 3CFZA 2HZLA 4NMYA 1B4ZA 1Y1MA 2O1LA 4NF4A 2XD2A 2ALUA 4JDFA 3U94A 2ZMBA 4I40A 2AYSA 1QUKA 2UYFA 4LZ5A 2HAVA 4RYAA 5FTHA 1DOTA 2NXOA 1US5A 2UVJA 2RCBA 3TTRA 4GWXA 3OELA 5ITPA 2H25A 1B58A 2IA4A 4IO2A 4QSDA 3I6VA 4RPOA 1DBZA 2JJKA 4FEBA 3PMXA 5I56A 1IUDA 3PD8A 3VFJA 2VT5A 2HZKA 1MY3A 1YYZA 2UXAA 4QRZA 3OO6A 3PTYA 3ZS6A 2Z22A 4ELPA 1A40A 4WXJA 2RKMA 1OLAA 5DYHA 4EF1A 5JEIA 5L8DA 1IZ1A 3I5OA 3Q29A 3ILUB 4RNSA 1P1QA 5I58A 2I48A 5ET8A 4ZE8A 1H3DA 4R6YA 5EQAA 3EHTA 1FBCA 3LUZA 1GR2A 3KJTA 3H6VA 2G29A 2Q2AA 4OZ9A 4JWYA 4GWOA 4YKKA 3K00A 2B3FA 1HSEA 2QRYA 4DCXA 2XXUA 4YMAA 2P3NA 3CRBA 4MMPA 1MY4A 4GVOA 2W7YA 2XA5A 1Q35A 4F31B 4GBVA 3K02A 4TQUQ 1QGXA 3TAJA 4H65A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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