3FV2A

Crystal structure of the human glutamate receptor, glur5, ligand-binding core in complex with neodysiherbaine a in space group p1
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
total genus 85
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fv2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fv2A02
3PU5A 3MVZA 3DP4A 4ZEKA 2CZLA 1Z7NE 4GL8A 4EUOA 3KFMA 2PT1A 3IB1A 3S9MC 3KBRA 1M5EA 3A3UA 2OJTA 3DP6A 1PB7A 2XXTA 3TQLA 1AMFA 3MC2A 1BTJA 4UA8A 1Y9UA 3SEXA 4RK9A 3O29A 1L5TA 1IZ1A 1MY0A 4IB2A 3MZ9A 4GOTA 2GH9A 1TXFA 4QSEA 4YKJA 1TFAA 4GIZA 3O2AA 1NL5A 3TMGA 1P99A 1LB9A 4MLQA 4KFQA 1LAGE 3IOUA 5F7VA 5I57B 4H8IA 4NWDA 3V89B 4F18A 5CMMA 2QMWA 1LCTA 4ZE8A 3VLVA 1N3WA 4NF6A 4F1VA 2I4BA 3TTRA 2ZMBA 1MQIA 5I2KA 1D4NA 3VVDA 2Y7PA 3MQ9A 4AB6A 1B7ZA 3IORA 5ELVA 1A8EA 3T96B 3KEIA 3EPEA 5I84A 4X1DA 1DMBA 5CC2A 4LQ5A 3KOSA 5JTYA 2XX9A 4N6PA 1LCFA 2P0SA 1MQHA 1P1OA 2OK2A 3PPQA 1HSEA 1FQCA 2QS1A 1SYIA 3SEYA 1R9QA 1A54A 1GR2A 1PBQA 1QKBA 4E0XA 3KOTA 2QS2A 3U94A 2I58A 3PUXE 2I3VA 4ZEFA 2DVCA 3QYTA 2E1SA 4OTEA 4EQBA 2NXOA 5I59A 3LR1A 5CBRA 5H8HA 4EXLA 4R6YA 1US4A 1B0HA 4Q30B 3AXFA 2V93A 3CG1A 3CFXA 3EHSA 1DSNA 4BDQA 1B0LA 4Q8RA 2XXRA 1ZIUA 4IGTA 4O3BA 4GL0A 4O3CA 3HPIA 2ONRA 1OVTA 1XVXA 4E0WA 4R9GA 1NNKA 4GFRA 3PV0E 1FTOA 4F3GA 5AA2D 3ODBA 3Q29A 3PGFA 5TPAB 3THIA 5DEXA 1QULA 1TFDA 4O3AA 4PFTA 3DELB 3U93A 5AA2A 2OBGA 3RTFB 4OMBA 5AA4A 2G29A 1OIBA 2REGA 5CMKA 4YMAA 3FUZA 3GXAA 1Y3QA 1ZU0A 1ZKBA 2OLBA 4RY1A 3SEVA 4HS7A 3FV1A 1P1QA 1BIYA 3FIRA 3N6TA 2THIA 5EHSA 4P11A 3N26A 2XD3A 1YPNA 3IJOB 1B5IA 2XXXA 3K6UA 4XXUA 3TTNA 2QSXA 1H43A 1PB8A 2ZNTA 2X7QA 3OO6A 2DOJA 4QSCA 1R6ZA 4OZ9A 4OWDA 3V83A 4U22A 1LBCA 4JWYA 4XIGQ 3TTMA 4RK2A 3C35A 4YICA 3H03A 1LAXA 4RXLA 5B70A 1AIVA 3QIMA 4FAJA 4L17A 2XXIA 1MY4A 2DXRA 1LSTA 4KCDA 3O97A 1IUDA 1VE4A 4QF9A 3BKIB 3IO6A 4OFOA 3PMXA 4I8CA 2Q2AA 3VLUA 3PMWA 1FTLA 1MPCA 3FV2A 3LC8A 1QUKA 3CR9A 4F2OA 2H5YA 3RGYA 2O69A 2XXPA 1M5DA 1TWYA 5AA1A 1SYHA 1I6QA 3MWBA 2XXHA 2DYXA 3JYRA 4U21A 1TT1A 4JWXA 3Q26A 1XHYA 3BBRA 1IXHA 1DOTA 3EF7A 4DZ1A 3Q28A 1B2HA 3RNNA 4DCYA 2O68A 4LUBA 3IAZA 4JXIA 1B5JA 3IK6B 3KJ7A 1MXZA 3MVYA 1EZPA 1DPPA 1MY1A 1I6AA 3G3JA 4KYDA 4QSDA 1QUJA 4EF2A 1UTBA 3O9PA 4POWA 1IIWA 2UVIA 3H6UA 4HCWA 4U23A 3TYHA 4ZZEA 4FE8A 3K4UA 1B40A 2QJEA 1NH7A 4DIGA 5F1QA 1H45A 1FCKA 4C0RA 1ANFA 1F9BA 3C33A 4DLDA 5I2NB 3KJTA 3QXMA 1MXWA 3PPPA 5A5XB 1URGA 2Z22A 4KHZE 3Q27A 1JW5A 2PVUA 3VXBA 1FTKA 1MQDA 4OENA 4Z0IA 2I49A 5LOMA 3E4RA 3WAEA 1SI0A 3TCGA 2HCAA 3V5AA 4YB7A 3FJGA 2RC9A 1HSJA 4ESXA 1N3XA 1BLFA 3RQTA 2F36A 1NFTA 1SVXB 2F78A 3K0VA 3RPWA 1PEBA 4LA9A 5KDTA 5ISUA 1QKAA 5H8NA 4FORA 5FTHA 5AE4A 3HHGA 2XXVA 3EHTA 3OO7A 4ZEIA 3B7DA 1RKMA 3PPOA 5K2YA 3O28A 4FATA 2ZYNA 2I0BA 3K00A 3M3FA 1EH3A 2ZXTA 1MH3A 1XOCA 3G3KA 4QFOA 5KZTA 4R6HA 3MZBA 3TODA 2IEEA 5M2VA 2O84X 1J1NA 4U1ZA 2PT2A 1UTHA 1MY2A 3CI8A 4HCYA 3OD7A 3QAXA 3U8QA 4LATA 3PPRA 1JVYA 4OFJA 1MDQA 2DXYA 1VFDA 4G68A 1XVYA 4LVQA 2I4CA 4KI0E 4ZEBA 3DM0A 1UQWA 3FZVA 4M1VA 4NF5A 1P1NA 3GLBA 1IXGA 3VXCA 1URSA 4YKPA 4WEPA 3WAFA 4F39A 2AL5A 1M5BA 2DP8A 3HN0A 4OFLA 3H6TA 3PD8A 3ZKLA 5I56A 5TP9B 5CMBA 3IOTA 1A99A 2F7CA 4U4XA 1US5A 3IJXB 2OWTA 2OZZA 3K1PA 1D9VA 2LAOA 1LGBC 2F35A 2UYFA 2D3IA 4X1BA 2GHBA 1N7WA 4BDMA 4PFWA 4TOZA 3T9XB 3G3HA 3HHFA 5I58B 3K1NA 2B3BA 3FXQA 4PFYA 3R6UA 3P7IA 1IXCA 3PUVE 1I69A 4YKKA 3CVGA 3SDFA 5CBSA 2D21A 2I3WA 1A55A 1B32A 3MP6A 4MBPA 3I5OA 1N84A 2CMOA 3W9VA 4I1DA 1Z7ME 1II5A 1R1NA 3H6VA 2VD3A 5H8SA 3FASA 5JK4A 4NF8B 4IY6A 1Y1ZA 1SDXA 1JW4A 4JB7A 3C4MA 5IAIA 1MM7A 4FECA 2DWIA 4P0IA 3KGCA 2F7AA 1OLCA 2Z23A 5H8FA 3E9XA 3OXNA 5H8QB 3FXUA 3KG2A 1MQGA 2UVJA 3OSQA 1JVXA 2DE3A 1MG1A 5B7DA 4FEBA 5FHOA 4X48A 3T66A 2I6EA 5HPQA 4THIA 3TTLA 2VGQA 4F1YA 3FVGA 1I6BA 4G4PA 1LFIA 3QK6A 1IITA 5KCJB 3C34A 3FXRA 3ILUB 2RCAA 2FNCA 4DXCA 3EQ1A 4IO5A 2YJPA 1NNTA 1FTMA 2A5SA 4NF4A 1B4HA 1DPEA 4JDFA 3BFUA 4FIMA 2ZYKA 1MH4A 1POTA 1N0TA 4ELRA 3UA8A 1B3FA 1OMPA 1LLSA 4Q5TA 3LSFB 3UIFA 1M5CA 4OXVA 4GD5A 3GBBA 4MF3A 3TCFA 2VP1A 3N5LA 3UP9A 3FVKA 3B6TA 4PETA 4DXBA 4R74A 2YPNA 5TU0A 3G3GA 4GLIA 1XC1A 3S2VA 2RKMA 4ZE9A 4GWOA 3MP8A 5L8DA 4P0GA 1H44A 3FJMA 4JBZA 4NE4A 1PC3A 3CFZA 4F31B 4ELOA 1SW4A 3N94A 1D3KA 1MXVA 1UIVA 4FJPA 2Q2CA 2AIXA 3MPLA 2REJA 4OEVA 3K02A 4C1TA 1JEVA 4XKQA 4U4SA 3B6QA 3QUJA 4ECFA 4QFPA 5CM6A 2QRYA 4NF6B 3PD9A 1P1WA 4XTCQ 5I2KB 3U72A 1CE2A 2DSFA 4OETA 5L9OA 1RYOA 3JZJA 1MM6A 3QUFA 3RLFE 5CMCA 5DTBA 4X9TA 4F19A 1NNPA 4KYSA 2UVHA 2B3FA 1LBBA 2DVZA 4ESWA 1FW0A 1N7XA 3EHUA 2A5TA 5JTYB 1B1XA 3O6IA 4WKMA 1OQHA 4U2RA 3LSXA 4FEDA 3PUZE 2H98A 3UGWA 4ZECA 4AQ4A 3C36A 2DWAA 2XHDA 1PBPA 3PUWE 1GTKA 1MXUA 3LSWA 3B6WA 4R2FA 2M8CA 5AA3A 4Q0CA 4QFKA 1B6HA 3W9WA 3T93B 1LB8A 3IR1A 3C9HA 3CIJA 3SEUA 3CG3A 5I59B 2ONSA 4PP0A 5H8HB 4H6DA 3HV1A 2F7BA 3QSLA 2DQVA 4F3PA 1VSOA 1HSLA 4G8HA 1QVSA 4XKRA 1T0KA 2ALUA 3S9LC 1B5HA 3OEMA 3CRBA 4KPTA 2H99A 4H65A 3U1OA 3ZKKA 4XKNA 3RY3A 3PMVA 5I57A 3IO4A 4LZ5A 4POXA 4JWOA 5DVJA 4R75A 2V3UA 4EQ9A 3TCHA 2O1LA 1ZLQA 2XX7A 2W7YA 5DEXB 2Z8EA 4PE5B 1CB6A 2Z8FA 3KN7A 2OWSA 4F22A 4H1XA 1JNFA 3FVOA 3TUSA 2G93A 1YAEA 4EF1A 5AA2B 4GF8A 2QS4A 1JQFA 4MH5A 3TEPA 1FQFA 4F1UA 3JV9A 5AA4B 3VVFA 4ND9A 1KWHA 4IO2A 3S4UA 3MVWA 3OO8A 3R7XA 1USYH 5DVFA 4EQ7A 1Y1MA 1N76A 2H4IA 2QMXA 2IA4A 2UYEA 3H06B 3K01A 1ELJA 1S9TA 4BDNA 1Y3PA 1B05A 3ZS6A 1YTVA 4BDOA 3OEKA 1POY1 1M5FA 1B3EA 3A09A 4KCCA 2QS3A 4LP2B 5J1DA 3SKPA 2ZYOA 3I3VA 3G3IA 4DCXA 3F11A 4NTLA 3ECRA 4PQJA 2YLNA 3E13X 3USDA 3M3LA 4IGRA 4G8MA 1ZJLA 3ONMA 5EHMA 1B46A 3BFTA 4YZZA 3T9HB 3SETA 4UACA 2Q9TA 1B7UA 3PUYE 1MPBA 3K6VA 1EZ9A 1B4ZA 1GGGA 1B9JA 3TELA 2VD2A 3HCQA 2XXYA 3K1MA 3OENA 2Y84A 4G2ZA 1MXXA 1SD3A 1SW1A 3T9UA 3TFLA 1B7HA 3IB2A 3TPAA 2FYIA 4YKIA 4IO7A 1FTJA 1WDNA 1UIUA 1Y4TA 5TPAA 4MLVA 2PBWA 1LFHA 4H5FA 3RN8A 1FQEA 4OYVA 2ESNA 3FGSA 4DDDA 4BLAA 2PX1A 3TTKA 3UORA 5HM4B 1OQGA 3GZGA 2AYSA 3VLWA 1EZOA 3S9EA 1DTGA 4H67A 1MQJA 4KR5A 1B1HA 1Q35A 4OESA 4LZ8A 4ELPA 1OLAA 1XT8A 2R6GE 2DWJA 5FHNA 5FTIA 1Q1KA 3SERA 3H7MA 4LONB 5HBCA 3MPKA 4OERA 2V84A 3MVXA 2F5XA 4TLLB 1IEJA 1UTBB 3CSBA 3VE1B 4U1OA 2NOOA 1XS5A 1AL3A 1R9LA 2X26A 1A40A 3OSRA 1MDP1 2WKYA 2BJJX 4LZ7A 3K2DA 3D4CA 4ZS9A 1BKAA 3EN3A 3C31A 3TKDA 2ONKE 3OMBA 3IL1B 3MJNA 2ZNSA 3VVEA 3R26A 1USYE 1O64A 4EDPA 2DS9A 5BWJA 2OCUA 4QHQA 3VFJA 3ZSFA 2PMSA 4H8JA 1B51A 4GXAA 4G68C 2DWHA 4JSDA 3K6WA 2E0SA 3RT8A 2V25A 2HZLA 4EXKA 3N6UA 3O6GA 3KN8A 3DP8A 5ITPA 2NVUB 1NH8A 2RINA 4YB5A 5KDTB 2GRVA 5EYFA 5H8NB 1SQYA 2HEUA 4G8NA 3RTWB 2NWJA 3K6XA 1LFGA 1URDA 5K2XA 3TZAA 2KLFA 2Y7WA 5DT6A 4RA1A 1LAFE 4F29A 5L9SA 2Y7RA 1ZBMA 1PDAA 3TDJA 5ITOA 4BDRA 1P1UA 3V8XB 3FD3A 2O1MA 2XXUA 1IQ7A 2RC7A 2FA7A 3M3KA 1O7TA 2O51A 2DE2A 2ANJA 1UTHB 3GBAA 1WVJA 1D9YA 1JEUA 3H4ZA 3HSTA 3TQWA 4C1UA 4LQ2A 2HXWA 1AOVA 2XD2A 4I9DA 4IO6A 1Y20A 4N13A 2NUVA 1Y3NA 4ONYA 1O63A 1QUIA 3FATA 4G68B 5I2NA 2P1SA 4OQOA 4TQUQ 2Y7IA 5A5XA 1FQDA 1A7LA 2Z8DA 1S7YA 4GRKA 2HAVA 3ILTB 3MBPA 4NF5B 3IOWA 3UK4A 3Q25A 1EU8A 2XX8A 4F2QA 4ZEDA 4F3SA 4R6KA 4RYAA 5I56B 4RJZA 1B3HA 4RNSA 3LBSA 5FHMA 4YB6A 1MXYA 1MY3A 1PB9A 2ABHA 1SBPA 1Y4CA 4OEUA 2RC8A 4HTGA 2ZYMA 3T9VA 1B58A 2HQ0A 4BDLA 1NKXA 1LAHE 1VR5A 4JSOA 1MS7A 3H6WA 2F6PA 1FQBA 4KD5A 1MRPA 5CRYA 4I62A 4GVOA 4DE8A 3VV5A 2ZNUA 2X7PA 1N04A 2VOZA 3MZ1A 3S9NC 3HO7A 3OOAA 5IKBA 3RT6B 1B52A 2GFEA 3VDFA 2B65A 4IY5A 3G3FA 2O6AA 3CSGA 2R71A 4RPOA 1MPDA 5H8FB 3KZGA 4KYEA 4GXSB 3RUMA 3O66A 4R73A 2V3QA 3D4GA 2P2AA 3SESA 4Z7EA 2UXAA 4PFUA 2RCBA 3MW0A 2AL4A 4YMBA 5TP9A 1A8FA 4NWCA 5ICQA 3KSJA 2HZKA 3M8UA 1SW2A 3L6HA 3DLNA 1YCJA 4OVJA 2D5WA 1RYXA 1QW0A 1SI1A 5CI5A 1H76A 5BUUA 1B3GA 4NF4B 1B3LA 2H25A 3C32A 4IO3A 4KQPA 1WODA 4H0WA 3H3GA 4ISUA 2Q89A 5I58A 2PYYA 4QFLA 4MFIA 3TAJA 5DYHA 3U92A 3PPNA 4YAHX 2I0CA 2XXWA 3LUYA 4M4GA 1IXIA 4H5GA 3OO9A 1SW5A 4ZZAA 1DTZA 2H9BA 2O7UA 2HAUA 4YU0A 3I6VA 3KSXA 1FQAA 1H3DA 4XKPA 3IOVA 2RF1A 1NNFA 3E3KA 4NF8A 3FVNA 3W15C 3L6GA 1BP5A 2UVGA 2V3TA 3IX1A 1S50A 2F97A 2XXQA 4NMYA 3IB0A 3T22A 2I48A 1ZMGA 2GHAA 4G77A 3A3CA 2QL3A 5H8QA 4TLMB 4ZDMA 4HW8A 3MP1A 1ATGA 2Q8JA 3KN3A 4QFNA 4R9FA 3SEWA 2O7IA 3UN6A 4DXUA 2HFBA 2VHAA 2Y7KA 2DE4A 3O6HA 4NEDA 4ELQA 3G7WA 2Q88A 3OELA 5KCJA 2QPQA 4N07A 2R9JA 4OHNA 2F8DA 1ZTYA 4IO4A 1OVBA 2F6GA 1GVCA 4K3FA 5ICTA 5DVIA 3FJ7A 4R72A 4GQOA 3LSLA 4WEDA 3MUQA 1AH5A 4RPNA 5JEIA 1JETA 4WXJA 4AB5A 2F34A 4R2BA 2A5TB 4F3BA 1NMUA 1VFEA 3CFLA 5L9MA 3MAMA 4QRZA 1QJMA 1GV8A 1JW1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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