3FV2A

Crystal structure of the human glutamate receptor, glur5, ligand-binding core in complex with neodysiherbaine a in space group p1
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fv2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fv2A02
3RLFE 4YKJA 1ZTYA 3IB0A 5DVFA 3S9LC 1SW4A 3KN3A 4U23A 3E4RA 2V3TA 3KJ7A 1URGA 3KOTA 1LFHA 3T22A 1NMUA 4ZEBA 1LAHE 4RJZA 3K6XA 3KN7A 2H9BA 1Y9UA 4ZZEA 1MPDA 1LBBA 4E0WA 3C35A 1GV8A 1SW5A 3C34A 3LUYA 1B46A 2VD3A 1B51A 2DE3A 4LP2B 3TTKA 1FTLA 4R6YA 3W9VA 5ITPA 4FORA 4JB7A 3H03A 3FUZA 1SQYA 5I2NA 1GGGA 1VE4A 1IEJA 5KCJB 2UVHA 2DXRA 1I6QA 4LQ5A 3FXQA 4F2OA 3PUXE 3O6IA 1M5FA 4IY5A 3MUQA 5H8HA 3OSRA 3T66A 1ATGA 4OMBA 4DDDA 5AA1A 2O7UA 4KYEA 1FQFA 5BWJA 3FV1A 4EQ7A 3JZJA 2E0SA 3O9PA 5F7VA 3M8UA 5CM6A 3VXCA 4JDFA 5A5XA 1SYIA 1UTBA 1H44A 1Y20A 4RK9A 4DCXA 4LUBA 3FD3A 3DELB 2IEEA 5L9OA 3VFJA 4QFKA 4FE8A 3PU5A 1A54A 4EUOA 4RNSA 1P99A 3C4MA 3LSWA 3KSJA 2RC8A 1OQHA 2QPQA 2ESNA 4XKRA 1JW1A 3AXFA 4ELQA 1ZMGA 3LC8A 1Y1ZA 5FHOA 4RYAA 5EHMA 4EXKA 2OK2A 4PFUA 5CMMA 2REJA 1B3EA 5LOMA 1FTJA 4YMAA 1QJMA 5F1QA 1SD3A 3LSFB 3MBPA 5H8NA 3A3UA 2DWAA 3G3HA 1II5A 3ILTB 1TXFA 3IAZA 3MC2A 1MDP1 5KDTA 4NF5B 5J1DA 4U4SA 4PFWA 2XXTA 2QMXA 1BIYA 2QS4A 3SETA 4GLIA 1Z7NE 1MXZA 3MP8A 3B7DA 3PMVA 5L8DA 4DZ1A 3K02A 5L9SA 3K1NA 4R9FA 4N13A 1MH4A 2XXRA 2Y7WA 3KSXA 3VLUA 4K3FA 3V89B 4H5FA 3T93B 4ZE9A 4HCWA 3FV2A 3IOUA 4R75A 2CMOA 3HN0A 3EHUA 5AA4A 4TLLB 4NTLA 2QS3A 2Y7KA 2A5TA 1LBCA 1EZ9A 5I2KA 4OYVA 2XD3A 5H8QA 4ELRA 4IY6A 3MVZA 3ONMA 3EF7A 2PMSA 2AIXA 1M5CA 3GBAA 3HSTA 3PMWA 3SEUA 5FHNA 3FZVA 3PUYE 3N26A 3PUZE 3U94A 3OD7A 2UVJA 4ZDMA 2O69A 4IO4A 4IO3A 4JWYA 1FCKA 1LCTA 3PPOA 3PPNA 4KCDA 4R73A 4RPOA 2XXWA 4POXA 4WEPA 4ZEFA 3BKIB 5I56A 4QSCA 4N6PA 4AB5A 4R6KA 1LB8A 2HXWA 4XKPA 3G3IA 5I59A 3HO7A 3A3CA 3DP8A 2DWHA 4JBZA 4N07A 3MW0A 1MY1A 1I6BA 5I2NB 5I84A 2QSXA 4G8MA 3IJXB 4ZZAA 3Q26A 4LQ2A 3S9EA 5JTYA 3HCQA 1B4HA 4LVQA 3PD9A 3VLWA 5ITOA 4FAJA 5H8FB 1TFDA 1SBPA 4GD5A 1B3HA 1JETA 3R26A 4Q8RA 4DXBA 2YLNA 1A55A 1AIVA 1VFDA 2Z22A 5A5XB 3H7MA 2Y7IA 3OSQA 3P7IA 3PMXA 1XS5A 5IAIA 3UORA 1B4ZA 3M3LA 3E3KA 4YKPA 3IX1A 4F31B 2QS1A 3N6UA 2F36A 1MY2A 2DVCA 3KJTA 4KQPA 1LFGA 4QSDA 2ABHA 1N3WA 2DS9A 4IO2A 1CB6A 4TQUQ 4QFLA 1MH3A 4GWOA 2DOJA 2ONSA 1GTKA 3O97A 4H1XA 2O7IA 5CI5A 2LAOA 1RKMA 1N04A 4KFQA 4U2RA 3TAJA 5H8NB 1B52A 1N7XA 4YB7A 4OFOA 3V83A 4LZ7A 5KDTB 1QUKA 4EXLA 3BBRA 4EQBA 3CIJA 2V3UA 1F9BA 5CMBA 4GQOA 2O51A 1MXXA 1USYH 1JW4A 4IB2A 2DE2A 4FATA 4OESA 3G7WA 4XIGQ 3I6VA 2M8CA 1UTHA 4BDMA 3EPEA 5BUUA 1FQCA 3M3KA 4MF3A 4F22A 1GR2A 2HZKA 1N84A 1B5JA 5DEXA 2XXQA 3UA8A 1M5EA 4YKKA 4RPNA 4HTGA 3ILUB 1N3XA 2XX7A 2D3IA 5I2KB 2ZNUA 5DVJA 3QSLA 5H8QB 2DXYA 1MXWA 2V25A 3K1MA 3H3GA 4R6HA 1IQ7A 1O64A 3MJNA 2XXYA 3MQ9A 2QS2A 1OQGA 5DVIA 1MXYA 4U4XA 2ZYOA 2H98A 1FQEA 3PUVE 3H6WA 4MLQA 3C31A 2Y7RA 3FGSA 3CSBA 4ELOA 3O2AA 1IXCA 3I5OA 1S9TA 4RXLA 4F1YA 3OO7A 4IO5A 2F35A 2VGQA 3S4UA 4YB5A 3T9VA 1Y4TA 3RGYA 4ND9A 4MH5A 4HCYA 2OWSA 3TQLA 4G77A 5CC2A 4U1OA 4H8JA 3IO4A 4KI0E 4HW8A 2H99A 4NWDA 1DMBA 1POY1 4R2FA 1MM6A 5JTYB 2IA4A 3KBRA 3V8XB 2OBGA 1A7LA 2I49A 1B3GA 2R71A 4H67A 3CG1A 2XX8A 3K00A 2Z8FA 2HZLA 1B2HA 4F3BA 3I3VA 2UYEA 1R9LA 1N7WA 3B6TA 3GZGA 3PPQA 1LAXA 1USYE 2ZXTA 4H5GA 2XXHA 2VD2A 2P0SA 1DSNA 1IXHA 3PD8A 5HPQA 1TFAA 1B32A 4U1ZA 5B70A 4G8NA 4DIGA 4PFTA 5TP9B 3ZS6A 2ZYMA 2F7BA 4G2ZA 5AA2D 4OQOA 5H8FA 1QUJA 3SKPA 1B0LA 1R9QA 4HS7A 3ZSFA 2O1LA 1JEUA 1YPNA 2ZYKA 3G3JA 3VVEA 3G3KA 4E0XA 4I62A 4GFRA 1GVCA 3GXAA 4POWA 4YU0A 4BDQA 5AE4A 4XXUA 1P1WA 4GIZA 3TTNA 1B5HA 3IB1A 3PUWE 4LZ8A 3TQWA 2W7YA 4M4GA 3KZGA 2OJTA 1UTHB 2ONRA 4ZS9A 1MY0A 1BP5A 2THIA 4YICA 5DEXB 1R6ZA 1TWYA 3KG2A 4H65A 3QYTA 5CRYA 1DTGA 3GBBA 4H8IA 1B7HA 2NXOA 3FIRA 3MZBA 1B3LA 1SI1A 3FVKA 4C0RA 1VR5A 4ESXA 3IOVA 2UVIA 1IITA 5CBSA 2Q88A 3VE1B 2PBWA 4X48A 5CMCA 1ZKBA 3HPIA 1QKAA 1NNKA 3FJ7A 3MPLA 3RN8A 2ANJA 4C1UA 1A8FA 2PT1A 1VFEA 1QULA 3H6VA 4O3CA 3QIMA 1N76A 1FTKA 3MVYA 3HHGA 2REGA 1S50A 3FJGA 1OMPA 5TU0A 1XT8A 1PB9A 4RK2A 3IB2A 1ZLQA 3QUJA 3WAEA 1EU8A 3OOAA 1B6HA 4ZECA 2RCAA 2VOZA 4NF6A 1B7UA 2VP1A 3O66A 4YB6A 3O6HA 4IGTA 2GHAA 4IO6A 1NNPA 1IIWA 4BDNA 4BDOA 3OO6A 2OCUA 4U22A 4U21A 3KGCA 2B3BA 1OLAA 2G93A 2I0CA 1LSTA 4GXSB 3DP6A 3RQTA 3PPPA 1US5A 1SYHA 4BLAA 3THIA 2QL3A 4LONB 4OENA 3IORA 2XXUA 3LSXA 4NMYA 4XKNA 4FJPA 3DP4A 3D4GA 4Z7EA 2XX9A 3SEVA 3SESA 1AMFA 1L5TA 3TZAA 2V3QA 4OHNA 4F3GA 4EF2A 3MP1A 3VDFA 2D21A 3O29A 1Y3PA 2YPNA 1MPCA 4QFNA 3CSGA 3ZKLA 1PB7A 3K2DA 3B6WA 4NF4A 3K1PA 1BKAA 2ZNSA 3OELA 3SERA 4TLMB 4X1BA 2HAUA 4I9DA 1IXGA 4GRKA 1D4NA 2RINA 3T9XB 5AA3A 3VVFA 3KN8A 4PP0A 3TTRA 4QSEA 1JEVA 4C1TA 5DYHA 2Z8DA 5TPAA 1A99A 4OWDA 1ZU0A 1H45A 4WEDA 1OLCA 5TP9A 1NL5A 3PPRA 3Q29A 3TEPA 3RUMA 3QXMA 5K2XA 1FQAA 3OO9A 4JSOA 1URSA 2O68A 1RYXA 4OEVA 2AL5A 4NF8B 1WVJA 3K01A 1LGBC 2A5SA 4R72A 2UXAA 1LAGE 1OVBA 3SEYA 3W15C 4OVJA 2F97A 1P1QA 2R9JA 4JWXA 3HHFA 3QAXA 4NWCA 3UN6A 3UP9A 3OEKA 3ODBA 4RY1A 1B9JA 4KCCA 3HV1A 2OWTA 3E13X 1Y1MA 3EN3A 3H06B 3BFUA 4ZEKA 1XHYA 3PGFA 1TT1A 1AOVA 3R7XA 5IKBA 1DTZA 1SVXB 3G3FA 1URDA 4JWOA 4Q5TA 3H6TA 2F7AA 3U1OA 4M1VA 1H76A 2QMWA 5ICQA 4I1DA 4ZEIA 3R6UA 4PQJA 5ISUA 3JYRA 3T96B 5JK4A 3CRBA 2Q2AA 1PC3A 1P1OA 3CG3A 3TELA 2RF1A 4QRZA 4OFLA 5FTIA 5HBCA 2G29A 3TMGA 1XVYA 4NF6B 1B5IA 4BDRA 2H4IA 3U93A 3RT6B 1SDXA 3E9XA 3K4UA 3SDFA 4OETA 3LBSA 3VVDA 3CFZA 2F8DA 5FTHA 3RTWB 2UVGA 1WDNA 1AL3A 1A40A 1D3KA 5I57B 4OEUA 4DCYA 2DWJA 1Y3NA 1UIVA 5I58B 4YMBA 1CE2A 2V93A 2FA7A 2O84X 3CI8A 3C9HA 5CMKA 2DP8A 3SEWA 5L9MA 3USDA 1FTOA 2XXXA 2F5XA 1NFTA 2P1SA 1HSEA 4WXJA 5CBRA 1ELJA 3OMBA 1LLSA 1B58A 2DVZA 1FTMA 1LB9A 1MY3A 1Q1KA 3M3FA 1B7ZA 2Z8EA 2AYSA 4UA8A 4ZEDA 4YKIA 1NNTA 2VHAA 3IO6A 3S2VA 4G68A 3TTLA 1AH5A 3FVNA 4NF4B 4R74A 2PT2A 3VV5A 3TCHA 2H5YA 1Y4CA 3OXNA 1T0KA 1PEBA 3OEMA 4TOZA 5ICTA 1H43A 5JEIA 3MAMA 1FQDA 1B1XA 5TPAB 1MM7A 1XOCA 2QRYA 3N5LA 2Z23A 2GH9A 3K6VA 1ZBMA 3TPAA 3FXRA 1Q35A 4Q0CA 3VLVA 3TCGA 2X7PA 1S7YA 3IOWA 4OFJA 4P11A 2I0BA 2HAVA 4EF1A 4ELPA 4R2BA 1JVYA 2PX1A 3SEXA 1EZOA 2HEUA 4F29A 1NH7A 5HM4B 4FIMA 4MBPA 2ZMBA 3IJOB 1A8EA 3TKDA 4ZE8A 4ISUA 4NEDA 2RC9A 3N6TA 1HSLA 4F39A 3V5AA 4L17A 1SW2A 4GVOA 4LATA 3TCFA 3S9NC 1M5BA 3F11A 1I69A 4LA9A 2B3FA 1SI0A 2B65A 2NOOA 3ECRA 2ONKE 2Q8JA 1B0HA 2XXPA 3L6HA 4NF8A 1QKBA 1PB8A 3MP6A 4FEBA 3U92A 4QFPA 4KYDA 4Q30B 2I58A 2H25A 4PE5B 4QHQA 1XVXA 1YTVA 2Q2CA 4F18A 4AQ4A 1NKXA 2P2AA 4OXVA 3C33A 3K0VA 2DWIA 2XXIA 3MWBA 1LAFE 3BFTA 3G3GA 4KPTA 5AA2A 1MQHA 3UGWA 5B7DA 3RT8A 3MZ9A 1J1NA 2I4CA 4DXCA 3IOTA 3ZKKA 3RNNA 1O63A 1KWHA 2HQ0A 2DYXA 1MY4A 5FHMA 2NWJA 4OTEA 5EHSA 4KYSA 1MQJA 4UACA 2I48A 4F19A 3KFMA 2HCAA 3MZ1A 4IGRA 1UIUA 4G68B 3IK6B 3EHTA 2XHDA 4IO7A 1D9VA 1VSOA 2RC7A 3KEIA 3D4CA 5I57A 3RTFB 4GOTA 4EQ9A 4G8HA 1PBPA 5I58A 1MDQA 2RCBA 2GFEA 3Q25A 2XD2A 1WODA 4P0IA 5M2VA 5DT6A 4MFIA 2QJEA 1QVSA 5H8SA 3OENA 4THIA 3Q27A 2I3VA 4KR5A 1B05A 2X26A 1YCJA 4NE4A 1LFIA 1DPPA 1LCFA 2PVUA 2YJPA 2ALUA 2O1MA 3KOSA 3WAFA 2F78A 1M5DA 3K6WA 1OVTA 4BDLA 4G4PA 4GXAA 2RKMA 2Y84A 5H8HB 4YAHX 1D9YA 3TDJA 3VXBA 2F6GA 2KLFA 4KD5A 1QW0A 3QK6A 3L6GA 1ZJLA 4XTCQ 2NUVA 1JQFA 3T9UA 2UYFA 3TYHA 1N0TA 1EZPA 1O7TA 2FNCA 4R9GA 4LZ5A 3QUFA 1RYOA 1UTBB 2AL4A 1NH8A 5KZTA 3TTMA 2DQVA 3C36A 3C32A 1MG1A 2I3WA 4KHZE 1MXVA 1OIBA 4F3PA 1MS7A 1MQGA 1IXIA 1ZIUA 3EQ1A 3JV9A 2WKYA 3A09A 3MPKA 3LSLA 1QUIA 4JSDA 1PBQA 4O3BA 5KCJA 4FECA 1MPBA 1IZ1A 1US4A 2X7QA 1DOTA 4ONYA 1IUDA 2OZZA 4MLVA 2Q9TA 3CFLA 4DE8A 1FQBA 3B6QA 4RA1A 1FW0A 4H6DA 1ANFA 3RPWA 5ELVA 3H6UA 4WKMA 4OZ9A 3O28A 1HSJA 3PV0E 1B40A 2FYIA 2HFBA 3EHSA 3U8QA 3UIFA 4OERA 2GRVA 2R6GE 1POTA 3TFLA 2ZYNA 3FATA 3FXUA 1P1UA 4AB6A 1B1HA 3DM0A 1UQWA 2CZLA 1EH3A 3O6GA 2PYYA 1BLFA 1MQDA 4QF9A 5AA2B 3FASA 3UK4A 2V84A 1JVXA 4JXIA 3Q28A 1Y3QA 4F1VA 3MVWA 3GLBA 4PFYA 4DLDA 3K6UA 2F34A 4GL0A 4XKQA 4ESWA 2BJJX 3CFXA 1R1NA 4GF8A 2D5WA 1XC1A 1SW1A 5AA4B 1YAEA 2I4BA 1H3DA 2NVUB 4F1UA 3IL1B 3T9HB 1DPEA 3S9MC 4EDPA 1B3FA 2A5TB 2DSFA 2DE4A 3FJMA 3CR9A 2GHBA 3MVXA 3DLNA 3FVOA 3LR1A 3U72A 4F3SA 2XXVA 3RY3A 4NF5A 3TODA 4FEDA 4X9TA 4DXUA 2E1SA 3H4ZA 4O3AA 3TUSA 3FVGA 2ZNTA 3W9WA 5EYFA 1PDAA 3IR1A 1MQIA 1P1NA 4X1DA 5DTBA 1I6AA 4Z0IA 1BTJA 4H0WA 2OLBA 5I56B 4P0GA 4ECFA 2O6AA 3OO8A 1MXUA 1Z7ME 5I59B 2F6PA 4PETA 2Q89A 4YZZA 4GL8A 4QFOA 2F7CA 3CVGA 2I6EA 1JNFA 1NNFA 2Y7PA 5K2YA 4G68C 4F2QA 1JW5A 1MRPA 3N94A 4I8CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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