3FV2A

Crystal structure of the human glutamate receptor, glur5, ligand-binding core in complex with neodysiherbaine a in space group p1
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fv2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fv2A02
2F8DA 4OTEA 4NWDA 4R74A 1H3DA 4HTGA 3W9VA 1YPNA 3T9HB 4F22A 1AIVA 4F1UA 5FTIA 5JK4A 1FTKA 2PBWA 5J1DA 4BDMA 4EQ7A 2ZYKA 1MXUA 5TP9A 2CZLA 5H8FA 1MXXA 3HV1A 1QVSA 3D4CA 3VVDA 2ZYMA 4H8JA 3N6TA 4NF5B 2PVUA 3VLWA 4OZ9A 2I0BA 4G68B 1B0HA 4MH5A 3TTMA 1D9VA 2HAUA 1O63A 1B3HA 3FGSA 3PD8A 4PETA 4N6PA 1D4NA 3V8XB 3KEIA 5LOMA 1LAGE 5DVJA 3G3KA 3TYHA 3K6UA 3LSXA 1LFIA 2B3FA 1JVYA 1DTZA 2RKMA 3IB0A 4ESXA 3RT8A 4OYVA 4C1UA 1I6BA 2FYIA 3IB2A 4LUBA 1QULA 2R9JA 4BDQA 4OEVA 1LCFA 4F3PA 1URSA 5H8FB 4Z7EA 3K2DA 3D4GA 2DOJA 5ITPA 1VFEA 1AMFA 3A3CA 2OLBA 2AYSA 2DXYA 2O7IA 2RC8A 5EHMA 3K01A 4GOTA 3OENA 4GXAA 2I0CA 1XT8A 4I9DA 3JV9A 1PEBA 2GRVA 1Y9UA 3PV0E 4H8IA 3OSQA 4ISUA 1QW0A 2F35A 2VGQA 3TFLA 2QS4A 3PPNA 1PB8A 5K2XA 2Z8DA 1SYIA 3SERA 1OLAA 5FHNA 3IB1A 4LONB 3U94A 3TAJA 1DMBA 5CC2A 5AA4B 4QFKA 3O97A 3HPIA 4JWYA 2F97A 1VE4A 3MZBA 4QSEA 3FVKA 3PPOA 1DOTA 3QXMA 2A5TA 4LVQA 2LAOA 1LFGA 1FQCA 3O9PA 3H03A 3TCFA 2DSFA 2V3TA 3UP9A 3FIRA 2UVHA 2ONRA 3EPEA 2YJPA 3E3KA 1XOCA 3OD7A 2DE4A 4POWA 1Y1MA 1B5JA 1JQFA 3HHGA 2XXWA 4BDLA 4U22A 1B2HA 1US4A 1B6HA 3Q26A 1HSEA 1MM7A 1NNTA 4PFYA 1JVXA 3PUXE 2F6GA 2OK2A 4GVOA 4PP0A 4NMYA 3PMXA 4ZEIA 3VLUA 1LGBC 4EF2A 5L9OA 1ZJLA 5F7VA 2NXOA 4G8NA 1LBBA 3JZJA 4OETA 4R6KA 1QUKA 4ELQA 4H5GA 2F36A 4JB7A 3UORA 1Y4CA 3FXRA 1B5IA 1USYH 2I4BA 3H7MA 3S9EA 1B7UA 4H67A 1SBPA 4LQ2A 5DVFA 1IUDA 5DTBA 2NUVA 3VVFA 4E0XA 3KJ7A 4U4XA 2VOZA 3O2AA 2UVJA 4DE8A 4NF8A 3I5OA 3DM0A 1BP5A 3S9MC 1A54A 4MLQA 3PPPA 1WODA 5CMCA 3UA8A 1PB9A 2ONKE 4NE4A 1URGA 2UYEA 2Z22A 5EYFA 1MXYA 1B58A 1D3KA 3W9WA 3FVGA 3G7WA 4NF6A 2HQ0A 2UYFA 3MVXA 3RTFB 3TMGA 4R6HA 4FE8A 1SQYA 2YPNA 3VXBA 2F7AA 1LFHA 3VE1B 5CI5A 5L9MA 1EU8A 2DYXA 4HCYA 1MY2A 4HW8A 4IGRA 3THIA 2ZNUA 4MBPA 4PFUA 4LQ5A 2UVGA 1QUJA 2QS3A 1JW5A 4RA1A 3Q25A 3OO8A 1QUIA 1B46A 4FEBA 3A09A 2QS1A 3ZS6A 3HN0A 1B7ZA 5F1QA 3OEMA 4Q30B 2PYYA 2ABHA 1AOVA 3CG3A 2VP1A 4U2RA 5CBSA 1T0KA 3IK6B 2THIA 3EHTA 2IEEA 4DDDA 1H43A 4QSCA 2B65A 1A99A 3C32A 3GBBA 4L17A 3RLFE 1Z7ME 1MY4A 2Y7RA 4NF6B 3KSJA 4GIZA 1Y4TA 5ICQA 4THIA 4F2OA 1MH4A 4BDOA 1P1UA 2I3VA 1Q35A 1OVBA 3L6HA 1ANFA 2O69A 3IJXB 4OENA 5KDTA 3L6GA 4F29A 4ZEDA 1B3LA 2DP8A 2O68A 3SESA 3DLNA 1H76A 3M3FA 1ZMGA 3TCGA 1XVXA 4IO4A 4NF4A 3R7XA 1XHYA 1EH3A 4ELOA 1JW4A 1B3GA 3VFJA 2PX1A 3PD9A 1RYOA 2ANJA 4GD5A 2PMSA 4OMBA 4ECFA 1YCJA 5TU0A 1ZIUA 3OXNA 2R71A 3BFUA 1N7XA 3SETA 3TZAA 3PPRA 1F9BA 4FORA 2X7QA 3KSXA 3MVYA 3BFTA 1UTBB 3MZ9A 1B05A 1MQDA 3CFLA 3UIFA 4AB5A 4MF3A 1B40A 1NMUA 4F3BA 5I58B 2Z8EA 4G68A 4LA9A 1MDQA 4R75A 2AL4A 3C34A 1SYHA 3E4RA 1OVTA 1POY1 3O28A 2HZLA 4E0WA 3K6VA 1WVJA 1MPBA 4KFQA 4XKNA 1MQJA 4QHQA 4NEDA 4KYDA 1LBCA 2XXPA 4YMBA 1A8EA 2H9BA 1GV8A 2HZKA 3K1NA 1A40A 5A5XB 1R6ZA 3T93B 2D3IA 2I48A 1NH8A 1TFDA 2DWHA 2QMXA 4QFOA 1P1NA 2O1MA 2QPQA 4QFPA 2RCBA 3I6VA 3QAXA 3KOSA 3OMBA 3FVNA 3I3VA 3UGWA 1FQDA 4ZEBA 3U92A 1BLFA 4GRKA 1IITA 4TLMB 1BIYA 1FQBA 4NWCA 1Y3PA 4WXJA 4XXUA 3EF7A 1NNKA 4UA8A 3M3LA 3MAMA 3EN3A 2XD2A 1US5A 2RCAA 2X26A 5CMBA 5K2YA 3MP1A 1JEVA 3CR9A 3RUMA 2KLFA 3U8QA 3ZKLA 3C31A 5AA4A 4FECA 1LAXA 5TPAA 4DZ1A 2E0SA 4OFJA 3Q28A 2Y7PA 2XXYA 2DWJA 3K6WA 2I58A 1R9QA 4U4SA 2H4IA 3MZ1A 1SW1A 2DVCA 3QIMA 3V83A 2A5SA 1ZKBA 3V5AA 4EQ9A 1S7YA 4RPNA 4RXLA 4IO7A 4F19A 3T9VA 4YZZA 3Q27A 3RN8A 1NKXA 2QRYA 1MPDA 3O6IA 1ZBMA 1NFTA 5EHSA 3RGYA 4KD5A 2Q88A 1ELJA 2P1SA 5H8NB 1CB6A 5AA3A 4KI0E 5CMMA 3FV1A 5I2KA 3PGFA 4GWOA 3B6TA 4OXVA 3K4UA 1O7TA 2GH9A 3TUSA 3PUVE 5TPAB 3C35A 1I6AA 4O3AA 5FTHA 1DTGA 4DLDA 3QUJA 1ZTYA 4ZE8A 5L9SA 4YKPA 3O66A 4PQJA 1TT1A 1N84A 3KJTA 1MS7A 3OOAA 1Y3NA 1R9LA 1ZLQA 2QJEA 3N6UA 5I59A 3S9LC 3VDFA 1MDP1 1OMPA 4IY5A 2VD3A 4P0GA 4G2ZA 3TTKA 3PMVA 3FASA 4JSDA 1FW0A 4GF8A 5JTYB 2F5XA 3WAFA 4RPOA 5ICTA 2V3UA 4GLIA 2PT2A 3ILUB 2V93A 2AIXA 4RNSA 5I2KB 4POXA 1GTKA 3MBPA 3ZSFA 3LBSA 4N13A 2H5YA 4EF1A 3S4UA 1M5EA 2CMOA 1EZPA 3PMWA 1OIBA 3TDJA 2O84X 2ZYNA 3ONMA 1PDAA 3OO6A 3G3HA 1NH7A 4JWXA 2ZXTA 4XTCQ 3C9HA 3FVOA 1P99A 1FCKA 1MPCA 5I59B 4XKPA 3KN7A 1LAFE 1P1WA 2XXXA 3HCQA 3QK6A 3P7IA 3UN6A 2RF1A 4X48A 3FZVA 3WAEA 3BBRA 2YLNA 1SW5A 4YB7A 1B0LA 2NVUB 4OHNA 4R2FA 4XKRA 3TCHA 5AA2B 2ALUA 3QYTA 4YB5A 4ELRA 3SEXA 1B52A 3PUWE 4R2BA 4FATA 4R73A 4FAJA 4BDNA 1IXIA 3TTNA 3CRBA 2UVIA 1OQGA 4KYSA 2H99A 1LB8A 3T96B 2FA7A 2DE3A 5IKBA 3VLVA 5CRYA 4JWOA 4JDFA 2O51A 4Z0IA 1LSTA 4EUOA 1D9YA 4IO3A 4LZ5A 3H6VA 4F1VA 5I56A 1EZ9A 4KYEA 3B6QA 2DE2A 2XXRA 5AA1A 3QSLA 3OO7A 1S9TA 4H1XA 1TWYA 4G68C 4R9GA 1MQIA 4YB6A 4IO6A 4C1TA 4EQBA 1PB7A 1N3XA 3FJ7A 4ZECA 3TQWA 2NOOA 1XS5A 1MQGA 1YTVA 3MP8A 4O3BA 3U72A 4WEDA 5DT6A 3CG1A 2QMWA 1YAEA 2I4CA 4O3CA 4F1YA 1VR5A 3LUYA 1DPEA 2GHAA 1B7HA 4OFOA 3G3IA 2M8CA 2DVZA 4H0WA 5BWJA 4Q5TA 3KN8A 3K02A 4OERA 2V25A 3UK4A 3VXCA 2Q2CA 3MQ9A 4RY1A 5I56B 3MP6A 3OO9A 1A7LA 4U1OA 2ESNA 5FHOA 2B3BA 1ZU0A 1UTHB 3SEWA 1NNPA 1UTBA 1B1XA 3O6HA 4I1DA 5AA2D 3H4ZA 3GZGA 3T22A 4OFLA 4TLLB 2OWTA 4JBZA 2RINA 1IZ1A 2R6GE 3PPQA 5I58A 4I62A 1ATGA 2H25A 4RK9A 5ELVA 4KHZE 2G29A 3H06B 4YAHX 3KG2A 3ECRA 2HEUA 1MY0A 2XD3A 3H6WA 3IOTA 5DEXB 2ZYOA 2Z23A 4YU0A 1O64A 1QJMA 4U1ZA 2HFBA 1SI1A 3OSRA 3MPKA 1SVXB 2I49A 2Q9TA 2GFEA 3IOWA 2AL5A 4IGTA 5BUUA 3E9XA 1B51A 2DWIA 2REJA 4OVJA 3S2VA 5A5XA 4OESA 1N3WA 3U93A 3S9NC 4WEPA 3KZGA 4G4PA 5H8HB 3CSGA 2I3WA 3FD3A 1Y3QA 1IIWA 1M5BA 4MFIA 5I57B 5JEIA 2XX8A 1HSJA 3FXUA 3KFMA 4P11A 3IX1A 4HCWA 4X1BA 5IAIA 3LSFB 4G77A 1JW1A 3M3KA 3TELA 2XXIA 1HSLA 3O6GA 4IB2A 2QSXA 3T9UA 4YMAA 2XX7A 4LATA 3N5LA 3V89B 2QS2A 4QFLA 3EHUA 2VD2A 2ZNSA 3Q29A 2Q8JA 3HO7A 4AQ4A 2P0SA 4Q0CA 5HBCA 5CBRA 1UIVA 4IY6A 4M1VA 2XXUA 5I2NA 5B7DA 1JEUA 4U21A 1IQ7A 4H65A 1B1HA 5ITOA 1LLSA 1MH3A 3N26A 3CSBA 4YICA 3H6UA 2F34A 4Q8RA 1M5FA 1FTJA 1OLCA 3IO4A 4EDPA 2G93A 2REGA 1UIUA 1RYXA 4R6YA 3USDA 3MC2A 4MLVA 3SEVA 3FV2A 1BTJA 3LC8A 1P1QA 5H8NA 1R1NA 4DXBA 3KOTA 1B9JA 2ZMBA 2Z8FA 2DQVA 4TOZA 4ELPA 4ONYA 4C0RA 3C33A 1MG1A 5H8QB 2HAVA 3PU5A 1DSNA 3DP4A 1JNFA 4GL8A 2F78A 5DYHA 2XXQA 3FXQA 1A55A 4QRZA 1B4HA 2D21A 5I2NB 4ESWA 1SDXA 3IR1A 5DVIA 4I8CA 1N04A 3QUFA 3TODA 4LZ8A 1SW2A 1TXFA 4BDRA 5TP9B 3E13X 3N94A 1BKAA 3OEKA 4F3GA 2IA4A 4F2QA 5FHMA 1UQWA 3MVWA 4YKKA 2DXRA 2E1SA 2OWSA 5JTYA 2NWJA 3TEPA 2H98A 3A3UA 3B7DA 3K1PA 5B70A 3LSWA 1SW4A 4DXUA 4PFWA 4HS7A 1MY3A 2UXAA 2Q89A 4ZEKA 1Y20A 3U1OA 1N76A 4QF9A 2HCAA 3R6UA 5ISUA 3RQTA 3SEYA 1XVYA 3KBRA 1NL5A 3DP6A 1B3EA 1I69A 4F3SA 3MWBA 3SKPA 3FJMA 2OBGA 3AXFA 4R72A 1GGGA 3C36A 4EXKA 5I84A 4OWDA 3IL1B 3RPWA 4GQOA 2V3QA 3CFXA 3SDFA 1MXVA 3HSTA 1IXGA 1B5HA 2O6AA 5KZTA 4N07A 3DP8A 2X7PA 4R9FA 2ONSA 5CMKA 1H45A 1FQAA 3KN3A 1B3FA 4H6DA 2Y84A 5AA2A 3H6TA 4GL0A 4AB6A 2W7YA 2RC9A 2DWAA 3MVZA 1L5TA 1MRPA 3LR1A 1B32A 4IO2A 1FTLA 3SEUA 3CVGA 3MJNA 1MQHA 4GXSB 1MM6A 3CIJA 4JXIA 3LSLA 3DELB 1LB9A 4M4GA 2V84A 2F7CA 2OJTA 1FTOA 5AE4A 4RJZA 2FNCA 3MW0A 3TQLA 1PBQA 4DIGA 1MXZA 1LAHE 4GFRA 2XX9A 3CFZA 3TTRA 2A5TB 3K00A 4ZEFA 1A8FA 4ZS9A 4EXLA 4OEUA 1IEJA 1CE2A 4G8MA 1URDA 4XKQA 3R26A 1AH5A 3BKIB 5CM6A 4BLAA 4KCCA 4H5FA 2PT1A 3F11A 1PC3A 2I6EA 5KCJA 2DS9A 2XXVA 1II5A 1TFAA 4ZZAA 3IORA 4TQUQ 3PUYE 3GXAA 2XXHA 1Q1KA 4KQPA 5L8DA 2Q2AA 3K1MA 4PE5B 1S50A 4DCXA 4LP2B 4X1DA 3ODBA 1MXWA 2Y7KA 3MUQA 3VVEA 3ZKKA 4QSDA 3RY3A 1OQHA 2OZZA 4ZZEA 1UTHA 1IXHA 1P1OA 1VSOA 3EQ1A 3IOVA 2O7UA 1MY1A 3IO6A 5HPQA 4KPTA 1M5CA 4G8HA 5H8SA 1Y1ZA 3TKDA 2XHDA 4ZE9A 4RK2A 1LCTA 2GHBA 4ZDMA 5M2VA 2WKYA 3MPLA 5KCJB 5DEXA 3G3GA 4X9TA 4NF8B 2OCUA 1DPPA 1GVCA 1M5DA 3CI8A 3O29A 4YKIA 3K0VA 2ZNTA 4WKMA 3JYRA 4ND9A 2Y7IA 1PBPA 3T9XB 3H3GA 5H8HA 4FJPA 3RTWB 1N0TA 1EZOA 4U23A 1KWHA 1H44A 3TTLA 1IXCA 4NTLA 5I57A 4QFNA 3FATA 3K6XA 3FUZA 2VHAA 4UACA 1J1NA 4JSOA 3HHFA 2Y7WA 3G3FA 1RKMA 4RYAA 3G3JA 2BJJX 3IOUA 3M8UA 4F18A 3GBAA 2RC7A 4LZ7A 4XIGQ 2O1LA 2P2AA 1QKBA 3ILTB 1SD3A 1Z7NE 1POTA 4OQOA 2D5WA 4YKJA 2F7BA 3PUZE 1N7WA 1FQEA 1GR2A 4F31B 1VFDA 4FIMA 3FJGA 1JETA 1FQFA 2XXTA 3GLBA 3KGCA 1USYE 4KR5A 4F39A 3OELA 2F6PA 3IAZA 1QKAA 3RNNA 3VV5A 3T66A 5KDTB 3EHSA 4DCYA 2HXWA 4NF5A 3W15C 1NNFA 4K3FA 1SI0A 1XC1A 4IO5A 4P0IA 4DXCA 3B6WA 3IJOB 4KCDA 2QL3A 1FTMA 3C4MA 4PFTA 1B4ZA 1AL3A 4NF4B 3TPAA 3RT6B 1I6QA 1WDNA 4FEDA 5HM4B 5H8QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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