1IXHA

Phosphate-binding protein (pbp) complexed with phosphate
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
321
structure length
321
Chain Sequence
EASLTGAGATFPAPVYAKWADTYQKETGNKVNYQGIGSSGGVKQIIANTVDFGASDAPLSDEKLAQEGLFQFPTVIGGVVLAVNIPGLKSGELVLDGKTLGDIYLGKIKKWDDEAIAKLNPGLKLPSQNIAVVRRADGSGTSFVFTSYLAKVNEEWKNNVGTGSTVKWPIGLGGKGNDGIAAFVQRLPGAIGYVEYAYAKQNNLAYTKLISADGKPVSPTEENFANAAKGADWSKTFAQDLTNQKGEDAWPITSTTFILIHKDQKKPEQGTEVLKFFDWAYKTGAKQANDLDYASLPDSVVEQVRAAWKTNIKDSSGKPLY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Phosphate transport
source organism Escherichia coli
publication title A low energy short hydrogen bond in very high resolution structures of protein receptor--phosphate complexes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PHOSPHATE-BINDING PROTEIN
total genus 111
structure length 321
sequence length 321
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-08-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ixhA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ixhA02
2F6PA 5EHSA 4C0RA 2XXXA 2H5YA 4YB7A 3MBPA 1R9LA 3KFMA 3MZBA 4FJPA 3OOAA 5H8FB 3PD8A 1A55A 3IB1A 3T9UA 3KJ7A 1FQDA 3O66A 2W7YA 2QS3A 2F7AA 4KI0E 3CG1A 2O7UA 2XD2A 4N6PA 4GRKA 4YAHX 3VVEA 1MY3A 1ZU0A 3MWBA 3T96B 3PV0E 1LAFE 4RY1A 1P99A 4MLQA 1L5TA 1WODA 3OO8A 3IOWA 2THIA 4MFIA 2E1SA 1B5HA 3TYHA 1QW0A 4F3SA 3ONMA 3E13X 3KN8A 1M5EA 1DMBA 1JW1A 3LSXA 3C32A 2WKYA 1Y1MA 2E0SA 1MXYA 4R9GA 3RQTA 2HZLA 4EXKA 2PX1A 3O6IA 1LLSA 2R9JA 3TQWA 1B52A 4HCWA 4DIGA 2Q9TA 3EHTA 3MPKA 3FVNA 3AXFA 1Y3QA 1Z7NE 4G68C 3TUSA 2VHAA 3H03A 1H76A 5HBCA 4EQ7A 1MQJA 1N3WA 3TELA 2Q88A 3PMVA 2XXVA 2DE3A 2Q2AA 3PPRA 3H6UA 4U1OA 5KDTA 1M5CA 1PEBA 4NTLA 4WKMA 1B7HA 4OFOA 3KOTA 2F5XA 4U4SA 4I1DA 3FJGA 5CMBA 4ZEFA 3KN3A 3IX1A 4DCYA 1KWHA 1TT1A 4G2ZA 1MY4A 2M8CA 4IO6A 1LBCA 2REGA 4G8HA 3DM0A 2CZLA 2I0BA 1ZKBA 1DOTA 3IL1B 1MRPA 3VV5A 2OJTA 5CI5A 3SETA 1NNKA 1XVYA 3N5LA 3JYRA 1N7XA 4ELRA 1A40A 5I2NA 3HPIA 3KSJA 3MC2A 2NVUB 3V89B 3Q29A 4R74A 1A8EA 4ND9A 1FTOA 3V83A 3RLFE 1FTKA 1NMUA 5B70A 2O6AA 4F1VA 4JXIA 2F97A 3BFTA 4RPNA 1B3HA 1UTBA 4FORA 1IXIA 4PQJA 3U94A 5CMCA 5KDTB 4DXUA 3B6WA 3GBBA 2QMXA 3R6UA 2VGQA 4TLMB 3MVZA 2RCAA 4R6HA 3SKPA 4FATA 1SYIA 3S4UA 3MUQA 4KFQA 3VDFA 1FQBA 3ILUB 3H4ZA 2OWSA 4F2OA 3EHSA 2ALUA 5TU0A 3USDA 3K0VA 5AA1A 3MP6A 1EZPA 1MY1A 4N13A 3T9XB 1P1NA 3G3KA 3HCQA 3T66A 3V5AA 2PT2A 1H45A 3H7MA 2DOJA 5I2NB 1PB7A 1MM7A 3I6VA 2QSXA 2VOZA 1ATGA 3PPPA 3O9PA 2F35A 1AIVA 1BIYA 1B3LA 2QS4A 4G4PA 1O7TA 5FTIA 1SI1A 4JSOA 1HSJA 1QKBA 2I58A 3LR1A 2XXYA 4R6KA 2Y7WA 4OTEA 4Z0IA 5FHMA 1UTBB 3H06B 2ZNUA 4JDFA 1B3EA 4MLVA 4EQ9A 3QAXA 1PBQA 1Y4TA 2P2AA 4QSEA 3A09A 2Z22A 3QXMA 2KLFA 2XXTA 4ONYA 3RT8A 3PUYE 1SW4A 1MY2A 3CR9A 2DYXA 3T9VA 4OYVA 1GGGA 2H4IA 2OZZA 2I3VA 2X26A 3L6GA 4ZZAA 1EZ9A 1XOCA 2ZXTA 3Q27A 4PFTA 3OSRA 4Q8RA 4H5FA 4MBPA 1RYXA 3TTMA 2Z23A 1YPNA 3C4MA 5AA4A 3VE1B 1MH4A 3CSBA 3EN3A 2ONSA 4O3CA 3E4RA 4JB7A 1P1QA 3UK4A 1QVSA 3TDJA 5IAIA 3M8UA 4G8MA 4ZE9A 2NUVA 4EXLA 2XXIA 4OENA 5AE4A 4I62A 2DVZA 1WVJA 3UA8A 3OEKA 4PE5B 3LSFB 4NMYA 3JV9A 1PBPA 2H25A 1AH5A 2O7IA 3ECRA 3U72A 3FV2A 2Y7KA 4H5GA 2IEEA 4RK9A 2V3TA 1DSNA 2QL3A 4YKPA 4RA1A 1LFHA 3FIRA 5L9MA 4H67A 1GTKA 5F1QA 3B7DA 4U22A 2HFBA 2PT1A 3EPEA 4IO2A 2QPQA 1LB9A 4ZZEA 1H44A 4KPTA 5AA4B 1SW1A 3TAJA 5FHOA 3C31A 2QS2A 4XIGQ 4RYAA 3RTWB 1Y3NA 3RUMA 4THIA 2QMWA 3K6UA 1NNTA 4F31B 4DXCA 5A5XA 4GIZA 4LZ8A 4YB5A 2D3IA 1B0LA 2I3WA 4EF1A 4OFLA 2AL5A 1B7ZA 1PB8A 2LAOA 1M5BA 3A3CA 1J1NA 4YKJA 3MVYA 4O3BA 2XX9A 1SQYA 3D4GA 2ONRA 2ZYOA 5DEXA 1ZBMA 2V25A 3ILTB 1ZJLA 4LA9A 3EHUA 1LCFA 1FTLA 3OELA 2F34A 4GFRA 4EF2A 4F22A 4ZS9A 1TWYA 5J1DA 1B32A 3B6QA 2ZNSA 3BFUA 4HCYA 1YTVA 3IO6A 4IY5A 1TFAA 2ZYKA 3V8XB 1IQ7A 1F9BA 4QF9A 4EQBA 1A8FA 1NH7A 1R6ZA 4KR5A 5JK4A 3VVDA 4U1ZA 3O6GA 2XXPA 3GBAA 5ICTA 4KYEA 4JWXA 4JBZA 3IB0A 2O1LA 5A5XB 3C36A 3MW0A 4GLIA 5I84A 4OXVA 4YB6A 1IXHA 1SVXB 3GXAA 3E3KA 1USYE 1POY1 1JEUA 4OWDA 4ZE8A 1ZLQA 3IJXB 4ZEKA 2ANJA 2V3QA 5I56A 1JQFA 1B2HA 2GH9A 4BDLA 1JVYA 1BP5A 3H3GA 1P1UA 1TFDA 3S9EA 3CFLA 2H9BA 4BDMA 5DEXB 1SDXA 3VLWA 4GL0A 4R2BA 2FNCA 3PPOA 3G3GA 3UGWA 2GFEA 1FQEA 3OD7A 4IO5A 3H6WA 3UIFA 2GRVA 5AA2D 1D4NA 1UIUA 3HV1A 1ANFA 1N76A 2UVJA 1SBPA 2XX7A 4ZEBA 1MQHA 1MPBA 2DQVA 2DSFA 2OBGA 3SEXA 3E9XA 3FATA 1XC1A 4JSDA 2IA4A 4IB2A 2VD3A 1CE2A 4E0XA 4KYDA 3QUFA 1I69A 3K6WA 1IXGA 5BWJA 3ZKKA 3VFJA 5I56B 4U21A 4EDPA 4F19A 5AA2A 2Z8FA 1N3XA 3K4UA 1USYH 4G77A 1PDAA 3HSTA 1FTMA 4R9FA 3OEMA 3QUJA 1MXZA 5B7DA 5KCJA 1OQHA 4IO3A 3BBRA 1RKMA 3CIJA 4YU0A 1VFEA 3O6HA 4FEDA 2YLNA 1MXVA 4H8JA 1B3GA 4AQ4A 4U23A 2ABHA 3N94A 3OMBA 1B1XA 1WDNA 1ELJA 3UN6A 3C33A 1M5FA 4YMBA 5DVJA 5K2XA 4ECFA 4DCXA 4NF4A 1BLFA 1FQAA 4QFNA 2PBWA 3ODBA 3IK6B 3Q26A 4DE8A 1EU8A 3GLBA 2RCBA 3MP1A 1VE4A 4RJZA 2Z8DA 3TTNA 1M5DA 2ZYMA 2D5WA 2Y7RA 4FIMA 5DVIA 1I6AA 3P7IA 5AA2B 2HZKA 1GR2A 4YICA 4QRZA 3KSXA 3MPLA 3SDFA 2X7PA 1B0HA 3SEUA 3PUZE 3OXNA 1PC3A 2V84A 4OEUA 4P0GA 5KCJB 3SEVA 3F11A 4F3GA 1FCKA 1VFDA 1B5JA 4OHNA 3C9HA 3OO7A 2FA7A 4XKQA 3MZ9A 4ZEIA 3LSLA 4BDQA 1SW2A 5I58A 4PFWA 2GHBA 3SEYA 1LFGA 3VXCA 3K2DA 4NF4B 4FAJA 1TXFA 1B46A 4FE8A 2O51A 5EHMA 4YZZA 1S9TA 3FVOA 3TCGA 1Q35A 1JW4A 4GOTA 4LONB 1QUIA 2DWJA 3ZS6A 3RT6B 4WEDA 3LBSA 1OMPA 5L9SA 4Q0CA 3TTRA 2XXRA 3RPWA 2A5TA 4F18A 4ESWA 4OEVA 3PMWA 5L8DA 3CSGA 2UYEA 4XTCQ 4LZ7A 4OESA 4KYSA 2Z8EA 3VVFA 2DVCA 2XX8A 4NWCA 1N7WA 1D9YA 3DP6A 3KG2A 2QJEA 2F78A 3TTKA 2Q2CA 3IB2A 1P1OA 3G3JA 5I58B 3IOTA 2FYIA 5CM6A 5LOMA 3PD9A 1YCJA 4U4XA 3S9NC 3TMGA 4DZ1A 5FHNA 4RXLA 2PYYA 1NH8A 3MJNA 1SI0A 3W9WA 4U2RA 2I6EA 3THIA 3TODA 4F3PA 1MQIA 1MPDA 2DS9A 1IUDA 1S50A 3VLUA 3OENA 2A5TB 3FUZA 4OERA 2UVHA 4ISUA 4MH5A 5L9OA 2DWAA 1OLAA 2G29A 3FGSA 4IO4A 3N26A 2A5SA 1IITA 1GV8A 4EUOA 1VSOA 1Y3PA 2DWIA 3CFZA 1BKAA 4R2FA 3TFLA 1AMFA 5DYHA 2PMSA 3SERA 1DPPA 2R71A 4HW8A 3Q28A 4ZECA 4Q30B 3DELB 5ICQA 2I0CA 2HEUA 3G3FA 3G7WA 5IKBA 5CC2A 3FZVA 3CI8A 3FJ7A 4F1UA 1LGBC 3HO7A 2G93A 2ZMBA 4NF8A 1LAHE 5CBSA 4ELPA 4N07A 4LVQA 1LAGE 3CRBA 3K1NA 1N0TA 1JETA 1H43A 3FXUA 1LCTA 1CB6A 1UIVA 2O68A 4XKPA 3K02A 3IO4A 5I57A 3OO6A 2DXYA 4QFKA 1I6QA 5BUUA 4H6DA 3TPAA 1D3KA 2RKMA 5CMMA 3PPQA 1Z7ME 2ZNTA 4YKIA 5HPQA 2OLBA 1JEVA 3R26A 4X1BA 2H99A 4AB6A 1DTGA 3IOUA 1S7YA 2VD2A 4ZEDA 3RGYA 4LQ2A 4NF6A 4LUBA 1HSLA 2UVGA 1XS5A 3O2AA 4GXSB 5ITPA 1P1WA 1MQGA 3T22A 1A7LA 1LSTA 3RTFB 5H8HA 1GVCA 5KZTA 4F29A 5H8QA 4P0IA 2VP1A 2Q89A 4PETA 1A54A 3PUVE 3U93A 4OETA 2F8DA 3LC8A 3C34A 3KOSA 1MXXA 4NF8B 3KGCA 4HTGA 5H8NA 4AB5A 1FW0A 2X7QA 4OMBA 5DTBA 2REJA 1EH3A 2UXAA 3FV1A 5ELVA 5I57B 3TTLA 1B1HA 2AYSA 3MVWA 3FD3A 2ESNA 1B51A 3ZKLA 3MVXA 1D9VA 1FQCA 1AOVA 2P1SA 4GF8A 1DPEA 1MDP1 5CRYA 4G68A 3FVKA 3PGFA 3PMXA 4POXA 1MG1A 2ONKE 2Q8JA 2AL4A 4C1TA 2D21A 4UA8A 3K6XA 4NF6B 4HS7A 4C1UA 2OK2A 1II5A 1URGA 2B3FA 3GZGA 5H8HB 4XKRA 4G8NA 5H8QB 1B58A 2B3BA 4IY6A 3IORA 3KEIA 1URSA 1HSEA 4LP2B 1XT8A 5JEIA 3N6UA 2NWJA 1EZOA 3N6TA 2HCAA 1NL5A 5F7VA 4JWYA 3QK6A 3TCHA 3O97A 1R9QA 5H8NB 4NWDA 2F7BA 4WEPA 2I48A 1OIBA 3I5OA 3OSQA 4YKKA 3SEWA 1B9JA 1NNFA 2BJJX 4LQ5A 5DT6A 4MF3A 3KJTA 5TP9A 4X9TA 1QKAA 3K1PA 4G68B 1JNFA 4I9DA 1JVXA 4F39A 5TPAA 2RINA 1OVTA 4GD5A 1MQDA 3DLNA 4ZDMA 4KCCA 3DP8A 4QSDA 4BLAA 5M2VA 4BDOA 4TQUQ 2OWTA 1LBBA 1T0KA 3KZGA 4ELQA 2CMOA 3A3UA 1B40A 2DE2A 3TEPA 3M3LA 4KHZE 3O28A 3QSLA 2UVIA 2XXHA 1POTA 3MZ1A 3L6HA 3OO9A 4FECA 3MQ9A 4XKNA 1ZIUA 3S2VA 1SW5A 3CVGA 2HXWA 4QFOA 3TQLA 3HN0A 2XD3A 1LAXA 4OFJA 2R6GE 4F3BA 4R73A 4NEDA 4NE4A 1B7UA 3IJOB 5TP9B 4RK2A 2QS1A 4R75A 4X48A 4GL8A 2V93A 5CMKA 4ESXA 1NNPA 5TPAB 4DXBA 1PB9A 2F7CA 3IAZA 3B6TA 4FEBA 1MXWA 1MH3A 1B4ZA 1N04A 4M1VA 2AIXA 2H98A 1UQWA 3T9HB 2UYFA 4K3FA 5JTYA 5EYFA 5ISUA 1B05A 3HHFA 1XHYA 4H1XA 4GVOA 5CBRA 4BDRA 3QYTA 4QHQA 2O69A 4F2QA 1FTJA 3LSWA 5I59A 1IXCA 4JWOA 3QIMA 4XXUA 3VXBA 2RF1A 1O63A 1AL3A 4WXJA 2I49A 3U8QA 4IGRA 3CFXA 4IGTA 4QFPA 1MS7A 4H65A 4QFLA 5FTHA 5K2YA 1US4A 4YMAA 1IEJA 3FVGA 3K00A 4IO7A 3S9MC 3S9LC 1URDA 2O1MA 1SYHA 2I4CA 4E0WA 3H6TA 4X1DA 4NF5A 4O3AA 4QSCA 3JZJA 3O29A 2F6GA 4M4GA 4OZ9A 2RC7A 1NFTA 3TCFA 1NKXA 1QUJA 3R7XA 2YJPA 4H0WA 5JTYB 1OLCA 1ZMGA 3PPNA 3C35A 2XXQA 3UORA 1MM6A 5I59B 4DDDA 3FXQA 4GXAA 1FQFA 3IOVA 2XHDA 3HHGA 3UP9A 1XVXA 5I2KA 3FASA 4R6YA 4BDNA 1Y1ZA 2PVUA 3TZAA 1MPCA 1Q1KA 2Y7PA 1QUKA 1N84A 4PP0A 4LZ5A 3Q25A 4POWA 4PFYA 3T93B 1Y9UA 2RC8A 4NF5B 1Y4CA 1A99A 3G3HA 4Z7EA 2I4BA 1B4HA 3D4CA 3KBRA 4P11A 1RYOA 2XXUA 4Q5TA 3CG3A 3PUXE 2NXOA 4I8CA 4KCDA 3WAFA 3SESA 1US5A 2B65A 3TKDA 3I3VA 2QRYA 2GHAA 3ZSFA 2NOOA 1VR5A 2O84X 3KN7A 3MP8A 3LUYA 1SD3A 1IIWA 3EF7A 3M3FA 5I2KB 2HAUA 4DLDA 3IR1A 4OQOA 1OQGA 4L17A 3M3KA 3G3IA 4RNSA 3RY3A 1OVBA 1QJMA 5HM4B 3K01A 1IZ1A 2Y7IA 3DP4A 4R72A 1DTZA 1UTHA 1Y20A 4RPOA 5DVFA 2YPNA 1JW5A 2HQ0A 2OCUA 4KQPA 2DE4A 2DXRA 3BKIB 1LFIA 1R1NA 1QULA 4ELOA 4TOZA 1B6HA 5H8SA 5ITOA 3MAMA 1B5IA 3U92A 1H3DA 2RC9A 5H8FA 1B3FA 2ZYNA 2DP8A 3FJMA 1MXUA 3H6VA 4TLLB 4GWOA 4GQOA 1BTJA 3W15C 2P0SA 1ZTYA 3K6VA 3PU5A 4PFUA 4F1YA 3RNNA 3FXRA 4LATA 4OVJA 1LB8A 4UACA 2HAVA 3W9VA 3WAEA 2XXWA 2V3UA 2Y84A 1MDQA 5AA3A 2F36A 4H8IA 3RN8A 3EQ1A 1I6BA 3K1MA 1YAEA 3VLVA 1UTHB 1MY0A 1O64A 4KD5A 2DWHA 3PUWE 3U1OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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