1Z7NE

Atp phosphoribosyl transferase (hiszg atp-prtase) from lactococcus lactis with bound prpp substrate
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
204
structure length
203
Chain Sequence
MIKIAITKGRIQKQVTKLLENADYDVEPILLGRELQIKTKDDLQIIFGKPNDVITFLEHGIVDIGFVGKDTLDENDFDDYYELLYLKIGQCIFALASYPDFSNKNFQRHKRIASKYPRVTKKYFAQKQEDIEIIKLEGSVELGPVVGLADAIVDIVETGNTLSANGLEVIEKISDISTRMIVNKSSFKFKKDKIIEMVERLED
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Activation of the hetero-octameric ATP phosphoribosyl transferase through subunit interface rearrangement by a tRNA synthetase paralog.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit
molecule tags Transferase
source organism Lactococcus lactis
total genus 56
structure length 203
sequence length 204
chains with identical sequence F, G, H
ec nomenclature ec 2.4.2.17: ATP phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2005-03-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01634 HisG ATP phosphoribosyltransferase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1z7nE01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1z7nE02
1FQEA 4LZ5A 2Y7IA 3C4MA 1NNTA 4KPTA 2DVCA 1B3HA 1BIYA 1MS7A 1MXUA 2F35A 2XXUA 3K1PA 1YCJA 2Y7KA 1BTJA 3MQ9A 1MPCA 1QUIA 4RNSA 1B58A 1MQGA 2ZNUA 1PB9A 3U1OA 2LAOA 4I1DA 2HZLA 5TU0A 2Z8DA 3QYTA 1D4NA 3IAZA 5EHMA 1S7YA 3VV5A 1MH4A 1B52A 3VXCA 5DVIA 3QUJA 1O63A 3TQLA 1BLFA 3FJGA 4L17A 4R75A 3EPEA 3PV0E 4RK9A 2H98A 1IQ7A 2XD2A 1FTKA 1ZU0A 1YPNA 5M2VA 5ICQA 3O29A 4PQJA 2H9BA 1SYHA 1OQGA 3OENA 3TZAA 3CSGA 4YICA 3RNNA 3ECRA 5A5XA 2QSXA 3KN8A 4WXJA 2GRVA 3FVNA 3L6GA 2XXIA 1OVTA 3KSJA 3Q25A 3PGFA 2UYFA 5EHSA 1UTBA 4YB6A 4ZS9A 1Y3NA 2ANJA 2ZNTA 1USYH 5DVFA 3H4ZA 2DQVA 3JV9A 2AL5A 3K6UA 4G8HA 4KR5A 3T66A 4KQPA 1XVYA 4YB5A 3OSQA 2F78A 3FD3A 5KDTB 5F7VA 5HBCA 3RPWA 1AL3A 2AL4A 2THIA 1A54A 2ONKE 1FQAA 3IO6A 2DWJA 5ELVA 2XXPA 4H67A 2HZKA 3HCQA 4H1XA 2A5SA 4QSDA 1T0KA 4NF8A 5DTBA 2O1LA 2I48A 3SEXA 3Q28A 2PMSA 4LA9A 3ZS6A 5L9OA 4R2BA 2O7UA 2B3BA 3RQTA 1NMUA 3S9EA 3D4CA 2OWSA 1Y1MA 5EYFA 4EXKA 5CMKA 4BDLA 2UXAA 2O1MA 3FIRA 1LCFA 1PDAA 1JW5A 1DOTA 3T9XB 1AOVA 4MLVA 2XD3A 5KCJA 4ISUA 5FHNA 1PB8A 4MFIA 4K3FA 3TFLA 1URGA 4KYDA 5H8QA 3IJOB 4C0RA 4JWYA 4BDNA 3U8QA 2FNCA 4KFQA 4LP2B 1FW0A 3VXBA 3VE1B 5I59A 2X26A 4NF5A 4P0IA 1TFAA 4F3SA 4U23A 4IO7A 3HHFA 2RC7A 1MQDA 4F1YA 2ZXTA 1MXYA 3K2DA 5JEIA 3H7MA 2QL3A 4NF4A 2VD3A 3IO4A 1FQDA 1SVXB 1URSA 3MZ9A 3T96B 1I6AA 3N6UA 3QXMA 4F31B 4DE8A 3H03A 1BP5A 3WAFA 4ESWA 4G77A 3U93A 2DP8A 3UN6A 3PD8A 4IY5A 3MP1A 2REGA 3GLBA 4GQOA 4DXCA 1B5IA 4PFTA 5K2YA 4OENA 3U92A 3PPOA 1P1QA 3M3KA 3FV2A 4GF8A 2DOJA 2UYEA 1B40A 4PETA 3P7IA 4BDRA 1IIWA 1USYE 3MBPA 4F3GA 4GL0A 1N84A 2XXVA 4HTGA 5B7DA 1OIBA 1XHYA 4RJZA 3USDA 4G4PA 1EZ9A 1VFDA 1B7HA 1US4A 1XS5A 1Y20A 5K2XA 3LR1A 2XHDA 3PPPA 4XKRA 4GXAA 2RF1A 3VVEA 3OEMA 1TFDA 4GOTA 3TCHA 2Z22A 4RPOA 2XXXA 4G8MA 5JK4A 1MY2A 4R6HA 4I62A 4U21A 4U1OA 2HAUA 3OO8A 1NNPA 4QFKA 5HM4B 2O68A 2ONSA 2Z8EA 3CFZA 3H3GA 5CI5A 3FGSA 1NNFA 4XKQA 4XIGQ 5ISUA 2Y7RA 3B6QA 4QHQA 5H8FA 3G7WA 3IB2A 1Y4CA 5H8HA 4PFWA 3RUMA 3K6XA 3SETA 1SYIA 1VSOA 4EXLA 1XT8A 1B9JA 3KBRA 3MPKA 1UTHA 3V83A 1I6QA 3KZGA 3PPQA 5FTIA 3KEIA 3TYHA 2ZYOA 4EQBA 3O66A 5IAIA 4ELQA 1B3FA 1H44A 3A3CA 4JWXA 2AIXA 2FA7A 1MM7A 5AA1A 3SEYA 2QS4A 1UIVA 3MVWA 2DWIA 1OMPA 4LQ2A 3KJTA 5DYHA 2G29A 3IR1A 1LBCA 5CBSA 4P0GA 4DZ1A 3VLUA 4FORA 3SDFA 3FVKA 1MDP1 4ZEKA 3B6WA 3TTMA 3SEUA 3TPAA 3IOTA 4IO5A 1Y9UA 5F1QA 2DS9A 2F7BA 2UVHA 4KCDA 4NF6A 1WVJA 1DMBA 1LBBA 1JEUA 3IK6B 2XXYA 4ZEIA 3VLWA 1NFTA 4Q8RA 3CRBA 4H6DA 1B0LA 2G93A 2QS1A 4MBPA 4F2OA 4EQ7A 2D21A 2NUVA 1IZ1A 3TCFA 1FTMA 3UK4A 1A8FA 3HSTA 2E1SA 3C36A 5I58A 4PFYA 4XXUA 3LSWA 1LFHA 1B3LA 1PB7A 2GHAA 1ZTYA 4OHNA 4ZZAA 2UVGA 5CC2A 2Y7WA 1B2HA 4I8CA 3W9WA 2DWAA 1N3XA 1SW1A 4U2RA 4M4GA 2RC9A 4ND9A 2IEEA 1P99A 1ANFA 4HCWA 2DE2A 1GR2A 4ESXA 2Q9TA 1SW4A 4XKNA 1OLCA 2DXYA 2OCUA 3FVOA 2GH9A 3QIMA 1FCKA 2F8DA 1B32A 3LBSA 4F18A 4KYEA 1B1HA 5I2NA 4KD5A 3SESA 1LAGE 4JWOA 4E0XA 1QW0A 4YZZA 4LVQA 3FXQA 2DWHA 4OERA 1LB8A 4UA8A 4Q30B 1NNKA 5I57B 3O2AA 4OQOA 5ITOA 3PD9A 5TPAB 2OJTA 5KZTA 3QK6A 1B1XA 1JVXA 2XXQA 3OXNA 1LCTA 3RTFB 1XOCA 3D4GA 3K1NA 3SKPA 4AB5A 3UORA 3E3KA 1B7ZA 3IB0A 2XXHA 4G8NA 1QJMA 3EHUA 3TUSA 1MM6A 1VE4A 5BWJA 2R71A 3CI8A 3GBAA 2ONRA 3ZSFA 4JSDA 5JTYB 4C1UA 1OVBA 2GFEA 5AA3A 4YKIA 2I3VA 3SEVA 2P0SA 4FAJA 3M8UA 1US5A 4F3PA 4GVOA 2AYSA 2I6EA 3TTRA 1R9QA 3V89B 1RKMA 4JDFA 1MDQA 1P1WA 3MP6A 3FASA 4OESA 1FQBA 4RXLA 1B5JA 4RPNA 4F29A 5I2KB 3DP6A 3N5LA 4KI0E 4XKPA 5IKBA 4R6YA 3TDJA 4ELRA 5L9SA 5I56B 1MXXA 2QS3A 2Y7PA 3WAEA 4DCXA 2H4IA 2NOOA 1MPBA 2HXWA 1LAHE 1JNFA 4I9DA 1MY0A 1Q35A 1QKAA 2A5TA 2BJJX 4QFOA 4RY1A 1B05A 4OZ9A 3OO7A 4XTCQ 3Q29A 3DLNA 1B3EA 2HFBA 3R26A 4C1TA 1SQYA 2I0CA 3GZGA 2XX9A 3CVGA 4IGTA 4N13A 4YAHX 1DPPA 1EU8A 5TP9A 3PMXA 3FJMA 3C9HA 3MVXA 2DE4A 4FE8A 3B7DA 3S9MC 3RLFE 3K1MA 3EHSA 4F22A 2E0SA 4TOZA 3FVGA 4ZDMA 1A8EA 1L5TA 4WKMA 1MY4A 1Z7ME 2XXRA 3SEWA 5AA2A 2QRYA 2YLNA 3OEKA 4LONB 1NH8A 3T9VA 1B4HA 3ONMA 4QFLA 2H5YA 1TT1A 4GD5A 2Q88A 1MQJA 1UQWA 3BFTA 3EF7A 4QF9A 1QKBA 3MZ1A 1PBPA 2F7CA 1DTGA 1JETA 1TWYA 1O7TA 2I58A 2Q8JA 4ZE9A 1ELJA 1ZKBA 4MF3A 4OWDA 3PUVE 1N3WA 1MH3A 4LQ5A 4QFNA 3CSBA 2Q2AA 3LSXA 2V3QA 2XXWA 3S4UA 4DCYA 1ZJLA 2HQ0A 1RYXA 4GIZA 3S9NC 4N6PA 2RKMA 2QS2A 3O97A 5AA2D 1Z7NE 2ZMBA 5LOMA 2ZYKA 2HCAA 1POY1 3TKDA 3MVYA 4DLDA 4EQ9A 1ATGA 2ABHA 2ZNSA 3OO9A 1SI1A 1B0HA 2NVUB 3MJNA 1MXWA 1N76A 4YKPA 1B46A 1H3DA 3HN0A 3HO7A 3E4RA 4NE4A 3I5OA 3N6TA 4R2FA 4FECA 4ELOA 1UTBB 3MPLA 2QPQA 3LSFB 3MWBA 4HCYA 5DT6A 4X9TA 1A40A 1PBQA 1M5BA 5BUUA 1I6BA 3V8XB 4JXIA 3MVZA 4BDOA 4H5GA 3S9LC 2RC8A 1D9YA 3LUYA 1LFIA 2GHBA 2YJPA 4IGRA 5B70A 1OLAA 3E13X 3Q26A 3M3FA 1DSNA 5CM6A 1M5CA 4NF8B 2PX1A 4LUBA 1B5HA 1A55A 4R72A 4NMYA 3ODBA 2O69A 4X1DA 1KWHA 2D3IA 3PMWA 3O6HA 3UGWA 4THIA 5H8NB 4ZECA 2NXOA 1POTA 1Y1ZA 2DYXA 4R9GA 4GXSB 4FJPA 3JYRA 1ZMGA 4RA1A 4U4SA 3PUZE 3DM0A 2DE3A 2F6GA 3DP4A 2M8CA 3S2VA 3LSLA 4G68C 5KCJB 3QAXA 4FEDA 3IOWA 3A3UA 4OFLA 5KDTA 1MY3A 2ALUA 1P1UA 1EZPA 3HPIA 1CE2A 5H8QB 1DTZA 2B65A 3CIJA 1FTOA 3K6VA 1QVSA 4MH5A 4X1BA 4ZZEA 3THIA 2RCAA 1O64A 1IITA 3OD7A 1FTJA 2H99A 5CMBA 5AE4A 5I59B 3K00A 4NF5B 3PUXE 3KGCA 3MW0A 1Y3PA 2VHAA 1OQHA 4H0WA 1MY1A 1NL5A 1CB6A 3PUYE 4FIMA 3K02A 3G3HA 2I4CA 4RK2A 4G68B 4OEVA 4ZEBA 4F19A 4IY6A 3C35A 3KSXA 1S50A 1PC3A 4OXVA 4QRZA 3CG1A 4OTEA 3F11A 2V25A 1SW5A 3PU5A 4Z7EA 1VR5A 4P11A 1LAFE 1HSLA 2DXRA 4F1VA 1P1NA 4NWCA 3HHGA 1IXGA 4EF1A 4JSOA 4AB6A 4F39A 1Y4TA 3KOTA 1A99A 1N7WA 4Z0IA 4IO6A 3IOVA 2O7IA 1XVXA 3I3VA 3PPNA 3VDFA 1B4ZA 1FQFA 1I69A 3KJ7A 3N94A 4F2QA 5H8SA 4OYVA 1B6HA 1JVYA 1FQCA 2F7AA 1MG1A 2PT2A 3UIFA 1NKXA 4WEPA 3PUWE 4BLAA 1DPEA 1WODA 5FHOA 3O6GA 2CZLA 3B6TA 3T9UA 3AXFA 4KHZE 1EZOA 1PEBA 3BBRA 4LZ8A 4ZE8A 2CMOA 4HS7A 4F1UA 4TLMB 2WKYA 4OFOA 4IB2A 2VGQA 1ZIUA 4PE5B 1F9BA 5CBRA 5H8FB 4H8JA 4YKKA 3BFUA 5H8HB 2Q2CA 2PBWA 2ESNA 1FTLA 2ZYNA 1UTHB 4GFRA 3U94A 4MLQA 4GL8A 5L8DA 3RT6B 3FZVA 1A7LA 2Z23A 3MUQA 4YMBA 3H6UA 3T93B 3H6TA 3LC8A 1ZBMA 3KFMA 4DDDA 1LFGA 2P2AA 4R73A 3G3FA 2F36A 2XXTA 4H5FA 4R6KA 1D9VA 1R6ZA 3TAJA 4JBZA 4NWDA 4GRKA 1JW1A 4EDPA 1M5DA 3IB1A 4PP0A 3RGYA 2V93A 2O6AA 1XC1A 2NWJA 3TTNA 3A09A 3RN8A 3FXUA 4IO3A 3CR9A 4RYAA 2YPNA 1WDNA 4KYSA 4ZEFA 5H8NA 3W15C 4NF6B 5ICTA 1JEVA 3PMVA 3OSRA 2UVJA 4IO4A 5AA4B 3ILTB 3KN7A 1II5A 4NTLA 2IA4A 1SD3A 4YU0A 3VLVA 3CFLA 3ZKLA 5I58B 3ILUB 1Y3QA 3UA8A 4EUOA 3FXRA 1M5EA 3VFJA 2I0BA 1MPDA 5FTHA 3OELA 1IEJA 3G3JA 5DEXB 2OBGA 2O84X 1EH3A 2RCBA 3H06B 3MZBA 4ELPA 3SERA 2I3WA 4FATA 3TODA 1B51A 2VOZA 1IXHA 3KN3A 4OEUA 2XX7A 4TLLB 1GVCA 1HSJA 3O28A 1M5FA 1LLSA 3R6UA 4X48A 2X7QA 3N26A 3GXAA 4G68A 5I2NB 3G3KA 5HPQA 3KG2A 5J1DA 1SW2A 3IX1A 1P1OA 1H43A 3OMBA 2H25A 4POWA 1GTKA 3TEPA 2P1SA 3TELA 3QUFA 5I84A 2UVIA 4HW8A 2OLBA 2W7YA 3O9PA 3DP8A 4OVJA 1IXIA 4POXA 4U4XA 4GWOA 4NEDA 4R9FA 4QSCA 4JB7A 3PPRA 1N04A 3I6VA 4BDQA 5L9MA 2F34A 1H76A 3FUZA 5FHMA 3T9HB 1VFEA 3RT8A 2QJEA 3CG3A 1MXVA 4O3BA 5A5XB 4H8IA 1J1NA 1IXCA 1R1NA 3H6WA 4O3AA 3E9XA 3K0VA 1RYOA 1IUDA 1SDXA 3C32A 3K4UA 2B3FA 1N7XA 4GLIA 4R74A 4TQUQ 3FATA 1GGGA 1QULA 1SI0A 2F5XA 4IO2A 3RY3A 3TMGA 2O51A 3TTKA 1JW4A 5DVJA 2RINA 2HAVA 4Q5TA 1NH7A 3CFXA 1N0TA 3EHTA 3RTWB 3G3IA 2F97A 3GBBA 1R9LA 5I57A 2Y84A 3IORA 4YB7A 5TPAA 2V3UA 5CRYA 5ITPA 3FV1A 3TQWA 1H45A 1BKAA 1TXFA 3IJXB 4FEBA 1UIUA 4YKJA 4QFPA 3MC2A 3TCGA 2ZYMA 4O3CA 2OK2A 4DXUA 4E0WA 2D5WA 1S9TA 1AIVA 2Q89A 2A5TB 3ZKKA 4AQ4A 4M1VA 4ZEDA 4LZ7A 4U1ZA 3EN3A 2OWTA 5JTYA 2I49A 3O6IA 2DSFA 3V5AA 1QUJA 2I4BA 2Z8FA 4H65A 3T22A 2VD2A 4YMAA 3OOAA 1MXZA 3VVDA 2OZZA 2R9JA 4U22A 5TP9B 4F3BA 1MQIA 3QSLA 3C34A 1LB9A 4OFJA 1Q1KA 2X7PA 5I2KA 2XX8A 1MRPA 2R6GE 3W9VA 1YTVA 2F6PA 2QMXA 5I56A 1SBPA 3K01A 1LGBC 4PFUA 2PVUA 3MP8A 5AA2B 1MQHA 1B7UA 3BKIB 4Q0CA 3DELB 2REJA 3K6WA 3IL1B 4UACA 4EF2A 3Q27A 4NF4B 1JQFA 1AH5A 4ONYA 3L6HA 3R7XA 1HSEA 3UP9A 2QMWA 5CMCA 4G2ZA 3VVFA 3HV1A 4DIGA 3KOSA 1D3KA 3M3LA 3JZJA 2FYIA 2VP1A 4QSEA 5AA4A 1ZLQA 2V3TA 1LSTA 1YAEA 2DVZA 4ECFA 3TTLA 2KLFA 1AMFA 3EQ1A 4KCCA 5CMMA 3FJ7A 4LATA 1QUKA 2V84A 4OMBA 3G3GA 2PYYA 1LAXA 3C31A 1URDA 2PT1A 3OO6A 4WEDA 3IOUA 4DXBA 4BDMA 2HEUA 1B3GA 3U72A 3MAMA 5DEXA 4N07A 1GV8A 3C33A 4OETA 3H6VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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1Y3QA 3UA8A 4EUOA 3FXRA 1M5EA 3VFJA 2I0BA 1MPDA 5FTHA 3OELA 1IEJA 3G3JA 5DEXB 2OBGA 2O84X 1EH3A 2RCBA 3H06B 3MZBA 4ELPA 3SERA 2I3WA 4FATA 3TODA 1B51A 2VOZA 1IXHA 3KN3A 4OEUA 2XX7A 4TLLB 1GVCA 1HSJA 3O28A 1M5FA 1LLSA 3R6UA 4X48A 2X7QA 3N26A 3GXAA 4G68A 5I2NB 3G3KA 5HPQA 3KG2A 5J1DA 1SW2A 3IX1A 1P1OA 1H43A 3OMBA 2H25A 4POWA 1GTKA 3TEPA 2P1SA 3TELA 3QUFA 5I84A 2UVIA 4HW8A 2OLBA 2W7YA 3O9PA 3DP8A 4OVJA 1IXIA 4POXA 4U4XA 4GWOA 4NEDA 4R9FA 4QSCA 4JB7A 3PPRA 1N04A 3I6VA 4BDQA 5L9MA 2F34A 1H76A 3FUZA 5FHMA 3T9HB 1VFEA 3RT8A 2QJEA 3CG3A 1MXVA 4O3BA 5A5XB 4H8IA 1J1NA 1IXCA 1R1NA 3H6WA 4O3AA 3E9XA 3K0VA 1RYOA 1IUDA 1SDXA 3C32A 3K4UA 2B3FA 1N7XA 4GLIA 4R74A 4TQUQ 3FATA 1GGGA 1QULA 1SI0A 2F5XA 4IO2A 3RY3A 3TMGA 2O51A 3TTKA 1JW4A 5DVJA 2RINA 2HAVA 4Q5TA 1NH7A 3CFXA 1N0TA 3EHTA 3RTWB 3G3IA 2F97A 3GBBA 1R9LA 5I57A 2Y84A 3IORA 4YB7A 5TPAA 2V3UA 5CRYA 5ITPA 3FV1A 3TQWA 1H45A 1BKAA 1TXFA 3IJXB 4FEBA 1UIUA 4YKJA 4QFPA 3MC2A 3TCGA 2ZYMA 4O3CA 2OK2A 4DXUA 4E0WA 2D5WA 1S9TA 1AIVA 2Q89A 2A5TB 3ZKKA 4AQ4A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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