3N26A

Cpn0482 : the arginine binding protein from the periplasm of chlamydia pneumoniae
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
b'DRNRIWIVGTNATYPPFEYVDAQGEVVGFDIDLAKAISEKLGKQLEVREFAFDALILNLKKHRIDAILAGMSITPSRQKEIALLPYYGDEVQELMVVSKRSLETPVLPLTQHSSVAVQTGTFQEHYLLSQPGICVRSFDSTLEVIMEVRYGKSPVAVLEPSVGRVVLKDFPNLVATRLELPPECWVLGCGLGVAKDRPEEIQTIQQAITDLKSEGVIQSLTKKWQLSEVAY'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding p
publication title Exploiting antigenic diversity for vaccine design: the Chlamydia ArtJ paradigm.
pubmed doi rcsb
source organism Chlamydophila pneumoniae
molecule tags Transport protein
total genus 65
structure length 231
sequence length 231
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n26A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n26A02
1N84A 2DVZA 3VVFA 5K2XA 1B3LA 2XD3A 4IGTA 2Y7PA 1CE2A 1USYE 1EH3A 4OEUA 3C9HA 3LC8A 3EHSA 5F1QA 3HHFA 4Z7EA 4G4PA 3MP1A 3V8XB 1B51A 5I2KA 1UTBA 1Q35A 4UA8A 3IOUA 3OSQA 3C33A 4Q5TA 4K3FA 1BIYA 2RCBA 5EYFA 2XXRA 3PMWA 1L5TA 3BKIB 1JVXA 3CRBA 2QSXA 4EUOA 4GL0A 3CG3A 3HO7A 3DP8A 3SDFA 5A5XA 1MS7A 3O6IA 5DVJA 3MVYA 2V3QA 4IGRA 5I2NB 5CMBA 3IK6B 1N3XA 2A5TB 2H9BA 5H8HB 3RNNA 4AB6A 3RTFB 3H6WA 1B1HA 1DSNA 3T9VA 5KCJA 3TQWA 3FUZA 3TCFA 2QJEA 2OJTA 3MP8A 3TTLA 4LZ8A 1N7WA 4ZECA 3U92A 3ILUB 5I56B 2Z23A 4EQ9A 5B70A 2F97A 3K1NA 4G8MA 4R72A 3OELA 1I6BA 4H8IA 3ZSFA 3FIRA 4EF2A 4X1DA 3FJ7A 5HBCA 3TTNA 3C31A 1YTVA 1NH8A 3K1MA 4QSEA 3FV2A 3B6QA 2I0BA 3SEWA 3JYRA 3B7DA 4F2QA 2XXVA 2UVJA 4PQJA 3CFLA 3K4UA 2XXUA 3ONMA 1FQDA 1JVYA 2H25A 1DPPA 1FW0A 3GXAA 1NH7A 2ZYNA 3IL1B 5ICTA 3U72A 2DOJA 2YJPA 1EZPA 3O2AA 1MY3A 4H6DA 3PUXE 3TQLA 1VR5A 1NL5A 1YAEA 4IO7A 3WAEA 4NF4B 2P0SA 2I3VA 4YKIA 3H4ZA 1Y4CA 4P0GA 5EHMA 3LSFB 4U4SA 4DDDA 4P0IA 3O66A 4XKNA 1JETA 4MLVA 4MF3A 3T9UA 1SW5A 2F78A 1EZOA 1MXZA 4YAHX 1SW1A 2ONSA 1JQFA 3KSXA 4H0WA 3BFTA 5I84A 1UTHB 4KPTA 3N5LA 5KDTB 2Y84A 1VFEA 2R6GE 5JTYA 2OCUA 4F31B 4IO5A 3W9VA 5AA1A 5AA4A 3HHGA 4U22A 1A99A 1P1OA 2H99A 2E1SA 2Y7RA 4NF8A 3PPRA 1PDAA 3TFLA 3PD9A 1H3DA 2WKYA 4F3GA 3C4MA 5CC2A 5TU0A 2QMWA 3RT8A 2RC8A 3RGYA 1ZU0A 3EHUA 3C32A 3E9XA 4OMBA 3KFMA 3OO7A 3K6VA 2I49A 4PFTA 4N07A 3S4UA 3V89B 3F11A 2HEUA 1B32A 1VFDA 5DYHA 1BKAA 2PBWA 4ONYA 2Q88A 2YPNA 1I6QA 2Z8DA 1LB8A 4GF8A 1FTMA 3GBBA 2DYXA 3MPKA 2F6PA 3TTMA 1B4ZA 3VVEA 2VP1A 3EQ1A 3ZKLA 1MQIA 2QRYA 4TLLB 4MLQA 4RYAA 4JB7A 2PVUA 4YKKA 5TP9A 3UIFA 1IXCA 1NMUA 4GLIA 4QFKA 2XXIA 5ITOA 4KQPA 4NF6A 1B3GA 5H8QB 4DCXA 4MBPA 1PC3A 1R9LA 2O84X 5FHOA 2Q8JA 1BLFA 3MJNA 4BDRA 4YMAA 2UVGA 3S9NC 1B40A 4OENA 2PT1A 4ELQA 5ICQA 1FTOA 3CVGA 4HCWA 4KI0E 1DOTA 2Y7IA 1JW4A 1MQGA 5CMCA 3MZ1A 1MM7A 3BBRA 1P1QA 2OK2A 3VV5A 3G3GA 3MP6A 2DE2A 3MQ9A 1VE4A 2I6EA 1OQGA 4YMBA 2RINA 1ELJA 1SYHA 1YPNA 3KN7A 3PU5A 2DSFA 1WVJA 1UIUA 3H6TA 4KR5A 3VXBA 3RUMA 4I8CA 3D4CA 1LCFA 4KFQA 4H5GA 3SEYA 3MVZA 4OFLA 3G3JA 5CRYA 4R2FA 2R9JA 3O6HA 1LLSA 1GVCA 4WEDA 1IXHA 4G77A 3PUZE 3TMGA 2V84A 3T96B 4R2BA 4F3BA 4ZZAA 1LAHE 2ONRA 4F3PA 2NUVA 4FORA 4YKPA 3T66A 3R26A 4H5FA 4QHQA 1OIBA 3O9PA 4DE8A 3OMBA 1R1NA 3FASA 4YZZA 4FEDA 4RNSA 5DEXB 1Y3QA 2XXHA 4JWOA 3H3GA 1NNKA 5IKBA 3MZBA 3QSLA 3TELA 1ZIUA 1N3WA 1WDNA 3Q27A 5EHSA 4I1DA 5DVFA 3T9XB 1LBBA 2I58A 2QMXA 1TT1A 2ZXTA 3KGCA 4JXIA 1NKXA 2RC7A 3USDA 3OENA 3EN3A 1N76A 2V25A 3G3HA 4YKJA 4ELPA 3TTRA 3QYTA 1O7TA 3OXNA 1D3KA 4HTGA 2VD3A 3H06B 2AYSA 4ESXA 1OLAA 4R9GA 4ECFA 4H65A 2HQ0A 3OD7A 5H8FB 4JDFA 5HM4B 4THIA 4P11A 1S9TA 1Y9UA 3TCHA 4AQ4A 2I48A 3GLBA 1MRPA 2O68A 1MQHA 4BDNA 4ESWA 4U23A 1ZLQA 4F22A 4OXVA 1P99A 4RXLA 4FE8A 2V3UA 3PPNA 1IEJA 1SI1A 2F34A 3VDFA 4F1YA 3WAFA 2Q89A 2NVUB 3VLWA 2B3BA 4FATA 2THIA 2QS2A 2I4CA 3PUVE 3RLFE 1JNFA 1GR2A 3E4RA 3EF7A 3FZVA 4OETA 3I6VA 2ANJA 3CFZA 3H03A 1CB6A 1XVYA 3DP6A 3KSJA 2H4IA 3K6UA 3U8QA 5BUUA 5I59A 2X26A 1MXWA 3H7MA 3LR1A 4E0XA 4FJPA 4GRKA 4PFUA 3T93B 2XX7A 4LZ5A 5CBSA 4R73A 1MPBA 3TPAA 2D3IA 1B5JA 4JSDA 4ZDMA 1EZ9A 3K0VA 3D4GA 2UYFA 1MXVA 3S9LC 1FQAA 5I58B 3AXFA 2AL4A 4ZEDA 3EHTA 3C36A 3OEKA 4NTLA 3LUYA 1B3FA 4O3BA 3N94A 5FTHA 2VHAA 3IB2A 4KYSA 4GOTA 1IQ7A 4ZEFA 5FHNA 1DMBA 4LA9A 2VD2A 5H8NA 2RC9A 4GL8A 1SVXB 3FD3A 4POWA 3UP9A 4DXUA 4Q30B 1MQDA 3L6HA 4YB7A 3PPPA 4I62A 3TODA 2QS1A 3VLUA 3KN8A 4LUBA 2FYIA 3FVKA 2VGQA 4AB5A 5CMMA 2IA4A 1IZ1A 3CSBA 2ABHA 5TPAB 3KOTA 4RJZA 4LVQA 5AA2B 1QUKA 3O29A 3K01A 4UACA 1BTJA 3PPOA 1QJMA 4WXJA 4G68A 2F6GA 2XXWA 3GBAA 2Y7WA 4C0RA 1MH4A 3Q25A 1SW2A 1SW4A 4Z0IA 1I6AA 3A3CA 3QUFA 2X7QA 1OVTA 4JWYA 3S9MC 3FJGA 2DWIA 2F5XA 3PGFA 1B2HA 4F39A 1VSOA 4QFLA 3OSRA 5LOMA 2F7AA 4HW8A 4KHZE 1DPEA 2OBGA 2ZYMA 3OO9A 4YICA 3HN0A 1UIVA 5H8FA 3E13X 1LSTA 2FA7A 1MDQA 2HCAA 2BJJX 3PD8A 3PPQA 1XS5A 5JEIA 2V93A 4G68C 1Y1MA 3IJOB 4FIMA 2UVIA 4OFJA 2LAOA 4O3AA 4NF5B 1XHYA 2FNCA 1XOCA 1US5A 2YLNA 3UN6A 1QKAA 3PMVA 1IXGA 4M1VA 2Q2AA 3ILTB 4QF9A 1TFDA 3B6TA 3ZKKA 1LFHA 4M4GA 4QSCA 1HSLA 1ANFA 3VFJA 3CFXA 3RQTA 3K1PA 3K6XA 1B4HA 3R7XA 4ELRA 2UYEA 5I2NA 1A8FA 2A5TA 5I2KB 3U93A 3U1OA 1B9JA 3RN8A 1UTBB 3C35A 4NMYA 1LB9A 3TDJA 1QW0A 4LATA 1SBPA 5H8HA 3IB1A 2OLBA 2P2AA 4N13A 2DVCA 4KCDA 4R6KA 2VOZA 1USYH 4L17A 2DS9A 1LBCA 4C1UA 4QFPA 3A3UA 4H1XA 4BDOA 3MZ9A 1TXFA 5I56A 2REJA 3M3FA 3CG1A 4F29A 1MPDA 4G2ZA 1S7YA 3SEVA 3K02A 4GWOA 2NWJA 1URSA 4DZ1A 1GTKA 5A5XB 3PUWE 3SKPA 2O6AA 2UXAA 1OQHA 4RY1A 3G7WA 5CI5A 1O63A 1HSEA 2F8DA 1Y20A 2F36A 3IO4A 2I3WA 3VLVA 3FXRA 4F1VA 4R6YA 3W15C 2AL5A 1NNTA 1FCKA 5BWJA 1SDXA 5KCJB 3MBPA 3OO8A 2ESNA 3QK6A 5CBRA 3SEUA 2DWHA 2O7UA 3RY3A 2Z22A 3MUQA 2NXOA 1EU8A 1LAFE 4F2OA 1AMFA 2A5SA 3IOTA 2F7BA 3A09A 3LBSA 3H6UA 4HCYA 3SEXA 1UQWA 3MAMA 1LCTA 3T9HB 5ITPA 3W9WA 4NF4A 2ZYOA 2PX1A 2O1MA 4GVOA 1PB9A 3IAZA 3FVNA 5I57B 4EDPA 4LONB 1FQBA 4ZEBA 1IITA 3OOAA 1B0HA 3SERA 1D4NA 3TAJA 1QULA 1SYIA 2GH9A 1LFIA 1FTJA 4HS7A 1J1NA 3S2VA 1ZMGA 1UTHA 3CSGA 5KDTA 1Z7ME 1PBQA 1LAXA 3OEMA 3TYHA 4KYDA 5FHMA 3RPWA 1OVBA 3MVWA 1B46A 2HFBA 1JEUA 2XX9A 4U1ZA 4KD5A 4BDQA 3T22A 1IUDA 3M8UA 3UORA 4F1UA 1B1XA 1JEVA 1MY4A 1US4A 1LAGE 4RK2A 3HPIA 3UK4A 3UGWA 2ZYKA 3G3FA 4OQOA 4TQUQ 4QSDA 2DXRA 1WODA 1IIWA 1N7XA 5HPQA 4X9TA 4G8NA 4H8JA 3E3KA 3UA8A 5AA4B 2DQVA 3ECRA 4PETA 4RK9A 3TKDA 4NF8B 2GHAA 4EF1A 4EXKA 1H43A 4GFRA 3RT6B 3QUJA 1HSJA 2DWJA 2G93A 5F7VA 3SETA 1MY2A 1Q1KA 1QUJA 2OZZA 3IOWA 3LSXA 2D5WA 1B0LA 3IB0A 3V5AA 2F35A 4PP0A 1B7UA 3Q28A 3O28A 5H8QA 2Z8EA 3MPLA 4R74A 2XXYA 1ZJLA 1Z7NE 1B3HA 1B5HA 1A7LA 3IR1A 3QAXA 1FTKA 2OWTA 4DXCA 2I4BA 3S9EA 3M3KA 5L8DA 3KOSA 3CIJA 3DLNA 4FEBA 4F19A 2B65A 1F9BA 4NWCA 1N0TA 1MY1A 3FJMA 2RCAA 1N04A 2PYYA 5KZTA 3PUYE 3HV1A 1ZBMA 1DTZA 4XXUA 4EQBA 3IX1A 4BLAA 3KJTA 4RA1A 1AH5A 5TP9B 5IAIA 1RYOA 1LFGA 3I5OA 4NF6B 2ZNSA 3FATA 1URDA 1MQJA 2PT2A 4GIZA 4JBZA 4BDMA 1M5CA 3FVGA 1Y3PA 4NEDA 1B7HA 2HZKA 5ISUA 3KJ7A 4OVJA 4YU0A 3IOVA 2G29A 3V83A 4H67A 3HCQA 4GQOA 4NWDA 1JW1A 3N26A 1B58A 3JZJA 5I57A 4YB5A 4OYVA 4PE5B 3MVXA 5L9MA 4GD5A 2ONKE 4DXBA 1SQYA 2XX8A 2D21A 3MW0A 4XKQA 3FXQA 1MG1A 1POTA 1MY0A 4IO2A 2V3TA 1R6ZA 4YB6A 4EQ7A 1M5FA 5DEXA 1P1NA 2H98A 4NE4A 1QVSA 4R9FA 3KEIA 3BFUA 2HAUA 2QS3A 1OLCA 2AIXA 4F18A 5CM6A 3N6UA 1OMPA 1B7ZA 1Y1ZA 3N6TA 1A40A 1JW5A 2DP8A 1ATGA 4ZEKA 1QUIA 2XXQA 3QIMA 2GRVA 1B05A 2GHBA 3Q29A 3RTWB 1IXIA 3IORA 2ZNTA 4XIGQ 3B6WA 1A54A 5L9SA 3PV0E 1XC1A 5AE4A 2M8CA 4OESA 2UVHA 2QL3A 3TTKA 3ODBA 3K00A 1P1WA 4OWDA 2H5YA 4EXLA 4OHNA 5L9OA 1M5BA 1Y4TA 4N6PA 1FTLA 1AOVA 2XXXA 4QFOA 4G8HA 1URGA 2RKMA 2HZLA 1B5IA 2PMSA 3IJXB 4R6HA 4MH5A 3O6GA 4U4XA 4U1OA 2XHDA 3QXMA 2ALUA 3FV1A 4IO6A 4QFNA 4WKMA 4IY6A 5AA2D 3FXUA 1Y3NA 1I69A 4FAJA 3DM0A 4DLDA 2XD2A 2P1SA 3TEPA 4X48A 1AL3A 3THIA 3I3VA 4GXSB 1SI0A 1H44A 2QPQA 2RF1A 4ZE9A 3LSLA 3LSWA 4JWXA 4RPOA 4BDLA 3R6UA 1M5EA 2O1LA 4KCCA 4POXA 3C34A 2XXPA 3KZGA 3ZS6A 1NFTA 3FGSA 5CMKA 1R9QA 4IO3A 3DELB 2O51A 5DVIA 2QS4A 2CMOA 3K2DA 1B52A 5AA3A 1B3EA 2O69A 3TCGA 4KYEA 5J1DA 1M5DA 4OTEA 4JSOA 1XVXA 3TZAA 2E0SA 5DT6A 3EPEA 2NOOA 5DTBA 5M2VA 2I0CA 5JK4A 4LZ7A 3CR9A 4FECA 1H45A 4ZEIA 4DIGA 3MWBA 3CI8A 2O7IA 1II5A 2F7CA 4IB2A 4WEPA 5ELVA 1RKMA 2GFEA 1DTGA 2Y7KA 4O3CA 3VE1B 1A55A 4RPNA 2X7PA 1T0KA 1SD3A 3O97A 3K6WA 4XTCQ 5I58A 2DXYA 3P7IA 4TOZA 4GXAA 4XKPA 1D9YA 1MXXA 2W7YA 3DP4A 1MPCA 1A8EA 1ZTYA 3IO6A 1MXYA 5K2YA 5I59B 4ZS9A 2REGA 2IEEA 4ISUA 1PBPA 4LQ5A 4X1BA 1ZKBA 1RYXA 1PB7A 3OO6A 4Q0CA 1GV8A 4Q8RA 2ZNUA 4OEVA 1D9VA 1NNFA 1NNPA 2B3FA 3Q26A 2CZLA 5TPAA 2Q9TA 4LQ2A 1GGGA 2Z8FA 5AA2A 1H76A 3G3IA 2R71A 1S50A 3M3LA 1MH3A 3H6VA 4TLMB 3VVDA 1XT8A 1PB8A 4IO4A 3L6GA 4ND9A 4OZ9A 2XXTA 2Q2CA 3KN3A 4E0WA 1KWHA 3HSTA 3GZGA 4I9DA 5H8NB 1FQCA 4C1TA 4MFIA 1O64A 1P1UA 3PMXA 4OFOA 2DE4A 3KG2A 4PFYA 5FTIA 1PEBA 3JV9A 4PFWA 3MC2A 4ELOA 4U2RA 4ZZEA 2OWSA 4U21A 1AIVA 2DWAA 3G3KA 3SESA 2ZMBA 3U94A 1QKBA 3KBRA 4R75A 4XKRA 1TFAA 4QRZA 3VXCA 1YCJA 2DE3A 4G68B 1TWYA 4F3SA 2HAVA 1MM6A 1POY1 2HXWA 1LGBC 3FVOA 1FQEA 4OERA 1BP5A 4ZE8A 2KLFA 4NF5A 1B6HA 1FQFA 4LP2B 5H8SA 5B7DA 4DCYA 3TUSA 5JTYB 1MXUA 1MDP1 4IY5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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