3N26A

Cpn0482 : the arginine binding protein from the periplasm of chlamydia pneumoniae
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
DRNRIWIVGTNATYPPFEYVDAQGEVVGFDIDLAKAISEKLGKQLEVREFAFDALILNLKKHRIDAILAGMSITPSRQKEIALLPYYGDEVQELMVVSKRSLETPVLPLTQHSSVAVQTGTFQEHYLLSQPGICVRSFDSTLEVIMEVRYGKSPVAVLEPSVGRVVLKDFPNLVATRLELPPECWVLGCGLGVAKDRPEEIQTIQQAITDLKSEGVIQSLTKKWQLSEVAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Chlamydophila pneumoniae
publication title Exploiting antigenic diversity for vaccine design: the Chlamydia ArtJ paradigm.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding p
total genus 65
structure length 231
sequence length 231
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n26A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n26A02
1LBBA 1DTGA 4LUBA 2DP8A 1SW2A 1XT8A 4Q8RA 4RY1A 3PV0E 3H7MA 3FV1A 5J1DA 3UORA 4O3BA 1LAFE 3O28A 1TWYA 2QS3A 1N0TA 2NXOA 2NWJA 2A5TB 2O1MA 4KCCA 4QFPA 5JTYA 4DXUA 2F35A 3FJ7A 5F1QA 3S4UA 1KWHA 5CMCA 4E0WA 3AXFA 1UTBA 3K00A 3CSGA 4X9TA 1B58A 3H6WA 1S50A 2F6GA 1RYOA 1H76A 2X7PA 3FVGA 4ELPA 3ILTB 1PB8A 5BUUA 3W9WA 2ZYKA 2GH9A 5I57B 3QUFA 1N76A 1MG1A 3UGWA 2GHAA 4RXLA 2F7AA 2I6EA 3O2AA 3VDFA 1TFDA 3N5LA 2ABHA 3EN3A 2Z8EA 3V5AA 3CI8A 3K1NA 1IEJA 4ESXA 3QUJA 5CMBA 1AH5A 3IB0A 1Y4CA 3K4UA 1P1QA 3I5OA 3W15C 1A54A 4H0WA 2PT1A 3MWBA 5I84A 2GRVA 3U1OA 2REGA 4DCYA 4F3GA 2PYYA 4RK2A 2XXYA 2O51A 4R6KA 3PD9A 1OLAA 2ZMBA 3FGSA 3IO6A 2I49A 1XVXA 1RYXA 3IO4A 2F78A 1A7LA 3THIA 3FVOA 2G93A 5L9OA 4BDRA 4ZE8A 3DELB 2UVHA 3VLUA 2YPNA 1T0KA 1LB8A 1YTVA 5CI5A 4RJZA 3KGCA 3C35A 3EHSA 3KSJA 3IL1B 4KYEA 3L6HA 3TCHA 1N84A 3FJMA 4LVQA 3JYRA 3QIMA 2P2AA 3C34A 2V3UA 3CRBA 2XXQA 3LUYA 4ESWA 1SVXB 4NF8B 1XC1A 4YKJA 5AA2A 1MY4A 5L9SA 4G8NA 1UIVA 4FEBA 1A8FA 2HZLA 1R9LA 1II5A 4LZ8A 4OHNA 1FW0A 2HCAA 2A5TA 2XXIA 2VGQA 2DS9A 4THIA 4G77A 1F9BA 4YZZA 3TYHA 3S9MC 2G29A 2ZYOA 3MP6A 1OVTA 1B5IA 1MY3A 3MPKA 3O29A 3G3GA 4UACA 4DDDA 3OENA 3E3KA 4NF4B 1MM7A 3B6TA 3MZ9A 1M5BA 3CFZA 4GOTA 5FHMA 1D4NA 2DVCA 4FEDA 1GVCA 1US5A 4YMBA 3G3KA 3T66A 3A09A 2RF1A 1B52A 1FCKA 3OO7A 4N6PA 1DSNA 1I6AA 5I57A 4IO4A 1NFTA 2WKYA 1M5CA 3EHUA 3MP1A 3O6GA 4AB5A 1QKBA 3LBSA 3Q25A 3TTLA 2UVGA 2QSXA 3ODBA 2ZNSA 2W7YA 1MXUA 5F7VA 3BFTA 4I8CA 3SEXA 3QSLA 2O1LA 2R71A 4QHQA 4L17A 4LZ7A 1R9QA 1Q35A 4R75A 2H98A 4WEDA 1MQIA 1MDP1 2Y7KA 5CBRA 3V8XB 4MLVA 4R72A 4F1YA 2OK2A 2NVUB 2DXYA 4OESA 3JV9A 2DOJA 1BIYA 2YLNA 5H8QB 5H8HB 3BFUA 1LAHE 4GQOA 2IEEA 4GIZA 5IAIA 4NE4A 3HN0A 3H6TA 3OSQA 1QW0A 1D9YA 2VD3A 3K1PA 1MXXA 3VFJA 1B6HA 2ALUA 4ZE9A 3MC2A 1AMFA 1Y1MA 3P7IA 4LP2B 3LC8A 3TELA 1O64A 3C33A 4BDMA 3T9HB 3GBBA 4NEDA 3GZGA 3MVWA 4EQ9A 4I9DA 1A8EA 4NF8A 3MVZA 1S7YA 1JW4A 4BDLA 4QFLA 1B1HA 2UVIA 1MXZA 1N7WA 2XXRA 1B46A 4F1VA 2RC8A 3FVNA 1Y4TA 1EH3A 4ECFA 1Z7NE 3PUWE 1Y3PA 3IAZA 3PUVE 2O69A 2D5WA 4TLMB 3TQWA 3EQ1A 1DMBA 3KOSA 4G8HA 4NF4A 4OMBA 3TFLA 3K6VA 4LZ5A 3TQLA 3CFLA 3KEIA 5AE4A 2NOOA 3MW0A 3KG2A 1XOCA 2VD2A 3H06B 4F3SA 4I1DA 5L9MA 4E0XA 1FQEA 1VE4A 3O66A 2I4BA 1HSJA 3VLVA 4AQ4A 4FECA 3FZVA 1FQDA 3U94A 1URDA 4GL8A 2DE4A 5AA1A 5CM6A 3G3JA 1H43A 3PMWA 3TKDA 4MF3A 2F7CA 3CG1A 4NF6A 2QPQA 3S2VA 5EHSA 3UK4A 5DYHA 3HPIA 1IXHA 1LLSA 4XIGQ 3HCQA 2ZXTA 3T22A 2I0BA 1BKAA 1B05A 3U93A 3SETA 4M1VA 4DXBA 2AIXA 3M3LA 4ELQA 1ZLQA 5L8DA 4R9FA 5M2VA 1QKAA 5H8QA 5H8HA 5B70A 4FIMA 1DTZA 2XXXA 4RPOA 4OXVA 3T9XB 5AA4B 2DVZA 4POWA 2CZLA 3ECRA 3KBRA 1HSLA 1ZU0A 3LSWA 5AA2B 2XX7A 4R2FA 2I4CA 3U72A 1P99A 2DQVA 1OQHA 5I56B 2HXWA 3T93B 2AL5A 2AYSA 3SERA 1XVYA 4N13A 5BWJA 5AA3A 4XKPA 1CB6A 2UVJA 4LQ2A 4OVJA 3VVEA 2QS2A 1D3KA 1GR2A 4Z7EA 4ZEFA 3SDFA 2HEUA 5TPAB 4ZZEA 1PBQA 4KPTA 3ZKKA 1NNFA 3MP8A 4Q5TA 1MXVA 3RPWA 3LSXA 1I6QA 1H45A 2ZYNA 4IY6A 3CVGA 3RLFE 2XXPA 1J1NA 2NUVA 3FXUA 1PB7A 4BDQA 1L5TA 1SD3A 4R6HA 3RGYA 4FORA 3IOTA 3B7DA 4ZDMA 2LAOA 3IJOB 3OO8A 3TTMA 5K2YA 3RN8A 1YAEA 2RCBA 4EDPA 2I58A 4GVOA 3F11A 4DIGA 1B7HA 5CBSA 3V89B 1DOTA 4PQJA 1B9JA 3IOUA 3IOVA 4FE8A 1LCFA 2Y7IA 1JEVA 3V83A 3USDA 3R7XA 3HSTA 3ZS6A 4IO5A 4KYDA 1AOVA 1B3EA 3HHGA 3MQ9A 4N07A 2PT2A 4H65A 3G3FA 4XTCQ 5DEXB 1FTMA 2P1SA 2XXUA 3RT6B 4QFKA 4U4XA 3IX1A 1M5EA 2ONKE 2UXAA 3HHFA 1IIWA 3IB2A 1RKMA 1ZJLA 4IGRA 2ZNTA 5AA4A 3PD8A 1USYE 2Y84A 4G8MA 4NWDA 1B5HA 3WAFA 2DE2A 4ZEIA 4RK9A 2VHAA 2Q8JA 1JVXA 4FAJA 3PPPA 2V3TA 4NWCA 2ESNA 3RQTA 4OYVA 4KR5A 2Q9TA 1MQJA 3DM0A 4U22A 4JB7A 2BJJX 4GRKA 3ILUB 5I56A 2P0SA 3FXRA 1UIUA 1Q1KA 4HW8A 3OO6A 3OEKA 2H25A 1QVSA 3PPNA 1SI1A 3K2DA 3FVKA 1FQBA 3KJ7A 1EZ9A 3E4RA 1EZPA 5H8NB 4LQ5A 4ND9A 2IA4A 3KFMA 1D9VA 5TPAA 4F18A 4OFLA 3TCGA 2F36A 2THIA 4RA1A 5JK4A 1IITA 4G68C 3OEMA 4QFNA 3HV1A 1SDXA 2DYXA 2HAVA 2X7QA 1B4HA 5EYFA 1I69A 1B4ZA 5IKBA 2R9JA 4OEUA 1FTLA 4R9GA 1B3LA 4NF6B 4LATA 4ISUA 2X26A 3RTWB 5EHMA 3C4MA 5KCJB 2ANJA 1QUIA 2OZZA 3OXNA 4GD5A 3K01A 1OMPA 4F22A 3PMVA 1JNFA 1QUKA 1R6ZA 4I62A 1UTHB 1B32A 2HAUA 4YAHX 3I3VA 1LFIA 2GFEA 2Y7RA 4XXUA 3H03A 3M3KA 2HFBA 1I6BA 4Q0CA 2V3QA 4JWOA 4X1DA 5A5XB 4GFRA 5DEXA 1MQGA 1SQYA 1IXGA 1MXWA 3Q27A 4IGTA 4U1OA 3DP8A 3QAXA 2QL3A 5ITOA 3G7WA 5TU0A 5ICTA 4ZEDA 2QS1A 3VVDA 2Q89A 4H67A 4RNSA 3DLNA 3QYTA 4QSEA 4NMYA 4PFUA 4U21A 3VE1B 2O84X 4Q30B 3O6IA 4H5GA 4P0IA 4F39A 5K2XA 4POXA 4QSDA 1WVJA 3TZAA 3VXBA 3W9VA 2V93A 2O6AA 1NMUA 1USYH 4TOZA 4G4PA 3KN3A 1WDNA 5AA2D 3A3UA 4OETA 3IJXB 5ISUA 3OSRA 5CRYA 4GLIA 1MPBA 1Y1ZA 2H4IA 1ZKBA 4OERA 4R74A 3LSLA 5H8NA 3ZKLA 4Z0IA 2RCAA 4AB6A 3DP4A 1VFEA 4KQPA 1POY1 1URGA 4KYSA 4F2QA 3K02A 1GTKA 2KLFA 3D4CA 4YB5A 3VLWA 2E0SA 4FJPA 4ZEBA 3EF7A 3U92A 1FQFA 4H8JA 1FTKA 1PEBA 1YPNA 4IO7A 2QJEA 2Y7PA 1FTJA 3HO7A 1QULA 1SW5A 4G68B 5KCJA 3RTFB 1YCJA 2RC7A 1BP5A 4YB6A 4YKIA 1LB9A 4QRZA 3K6WA 3SEYA 3U8QA 1LAXA 2PVUA 1SYHA 3S9NC 1LFHA 3RNNA 4U2RA 4H1XA 1QJMA 5HM4B 3Q29A 1UTHA 1VR5A 3E13X 3SKPA 2H99A 5I58B 1LSTA 3TAJA 4F3BA 4IO2A 3M8UA 2M8CA 1JQFA 3TDJA 5A5XA 2FA7A 3OELA 5FTIA 2DWJA 1NH7A 3K6UA 1NNTA 3KZGA 5LOMA 4FATA 3G3HA 4JSDA 5H8FB 4IO3A 3ZSFA 3KJTA 3C31A 5I2NB 5B7DA 2V25A 1IXCA 2XXHA 4F1UA 2XX9A 2O7UA 1URSA 3TTNA 2Q2CA 1R1NA 1NL5A 1PB9A 2H5YA 3FD3A 3IORA 4IY5A 1N3XA 1JW5A 1MM6A 1JEUA 3MAMA 4HTGA 1XS5A 1MQDA 1UQWA 2Z8FA 4QF9A 3I6VA 3MVXA 4EQ7A 1MY1A 2O7IA 2VOZA 2QRYA 1H3DA 1Y3NA 5FHNA 4DLDA 3MUQA 1B5JA 3MJNA 3PMXA 1IXIA 4OZ9A 3ONMA 4WXJA 3TODA 2Z22A 1MY0A 1AL3A 5ITPA 1WODA 3RUMA 3RY3A 3KN8A 5KDTB 2ZYMA 2HQ0A 3TTKA 1LFGA 3KSXA 4OFOA 3WAEA 3UIFA 5H8SA 3IOWA 4NTLA 1LAGE 3TTRA 1N3WA 3CG3A 3R6UA 5I59B 1ZIUA 1MH3A 4PETA 1B0HA 5TP9B 2DXRA 3QK6A 1JVYA 4IO6A 4ZEKA 3T96B 4RYAA 1POTA 3IB1A 3IK6B 3FV2A 2I3WA 2OWTA 3CR9A 5CC2A 1Y20A 1OLCA 4GXAA 5DVFA 4JBZA 3SESA 4F2OA 3K0VA 3KN7A 4GWOA 4EXLA 4X1BA 3TUSA 1P1WA 3C36A 4BLAA 3MZBA 1ELJA 1H44A 3PUYE 2I3VA 3G3IA 4ELOA 4G68A 4PFTA 1IQ7A 1P1OA 3PPOA 3FJGA 1SI0A 3VV5A 1FQCA 1N04A 3PUZE 4G2ZA 2PMSA 1A99A 4ELRA 1SW4A 3T9UA 4H5FA 4PE5B 4WKMA 3FIRA 2B65A 4KCDA 4PFYA 4OQOA 2DSFA 3PU5A 1MPCA 1ZBMA 5I58A 3VVFA 2Q2AA 2XXTA 3Q28A 1BLFA 4IB2A 2RC9A 1MH4A 3E9XA 2F7BA 4H8IA 1US4A 4C0RA 1B1XA 1GV8A 5H8FA 3L6GA 5I2NA 5JEIA 3CSBA 4BDNA 3RT8A 5I2KB 3MVYA 4ZS9A 1HSEA 3O97A 4F3PA 1LGBC 3DP6A 2XXWA 2XD3A 1DPPA 5KZTA 1NKXA 1LBCA 3TPAA 4JWYA 3UA8A 3UN6A 1JW1A 4R73A 5DVIA 2B3BA 4MBPA 1A40A 4JSOA 2F6PA 4F31B 3H6UA 2UYFA 2XXVA 1FQAA 4O3CA 2DE3A 1SW1A 3B6WA 1M5FA 4ZECA 3H6VA 3UP9A 4UA8A 1MQHA 5DTBA 1B40A 5KDTA 2QS4A 3GBAA 1PC3A 1M5DA 1Z7ME 4KD5A 3R26A 3GLBA 4KI0E 4OTEA 1ATGA 3BKIB 1SYIA 1VFDA 4HCYA 3TCFA 1B3HA 1A55A 3C9HA 3MZ1A 4DZ1A 1ZMGA 2Z8DA 5I59A 4MFIA 4P0GA 5TP9A 2R6GE 2Z23A 4YKKA 4JDFA 3IR1A 2REJA 4EF2A 3KOTA 3OO9A 4GF8A 4EXKA 1FTOA 2I48A 4NF5B 4OWDA 1TT1A 5CMKA 2PBWA 3H3GA 1LCTA 2Y7WA 2F97A 5HBCA 3PPRA 4TQUQ 1VSOA 2XHDA 3N26A 2F5XA 2OLBA 2OBGA 4OFJA 1P1UA 1AIVA 4DCXA 2F34A 4XKRA 4HCWA 2RINA 1N7XA 3N6TA 1EZOA 2D21A 3S9EA 1OQGA 1DPEA 4XKNA 1XHYA 1IZ1A 2VP1A 3OOAA 3VXCA 1B0LA 1MPDA 5DVJA 4R2BA 1MDQA 4JWXA 4QSCA 2OCUA 2Q88A 4ONYA 5HPQA 2XX8A 2QMWA 4OENA 1GGGA 3MBPA 3TEPA 1QUJA 1NNKA 1PDAA 1MS7A 2CMOA 2RKMA 3LR1A 3PPQA 4MLQA 4C1TA 3O6HA 4KFQA 5DT6A 3JZJA 5I2KA 1ANFA 3FATA 3K1MA 2UYEA 4PFWA 1B3FA 5JTYB 3CFXA 2PX1A 2DWHA 2O68A 3B6QA 1TFAA 5FTHA 5ELVA 4F29A 4QFOA 2OWSA 4H6DA 1UTBB 3N94A 1B3GA 1ZTYA 4TLLB 1B7ZA 1OIBA 3QXMA 1O7TA 1O63A 2DWAA 3PGFA 4DE8A 4HS7A 2H9BA 1BTJA 1Y9UA 1MXYA 3N6UA 3M3FA 3CIJA 1OVBA 2GHBA 4C1UA 3FUZA 2F8DA 3EPEA 4YICA 2HZKA 4EUOA 1MY2A 3LSFB 3K6XA 4U4SA 1B2HA 4YKPA 1NH8A 2B3FA 2OJTA 2ZNUA 4BDOA 1EU8A 1Y3QA 1B51A 3SEWA 4YMAA 1CE2A 4JXIA 2D3IA 2AL4A 5FHOA 3PUXE 3GXAA 2A5SA 1MRPA 4RPNA 3S9LC 1IUDA 2ONSA 4X48A 4ZZAA 4NF5A 4K3FA 2FYIA 2E1SA 4KHZE 4P11A 4R6YA 5ICQA 1SBPA 4F19A 4EQBA 2FNCA 2QMXA 3FXQA 2I0CA 4GXSB 4YB7A 4PP0A 2DWIA 1B7UA 3TMGA 3BBRA 3T9VA 3O9PA 4DXCA 3FASA 3A3CA 2YJPA 3OD7A 4U1ZA 1NNPA 3C32A 3MPLA 4EF1A 4LA9A 4O3AA 3SEUA 4M4GA 3SEVA 3OMBA 4GL0A 2ONRA 3D4GA 2XD2A 4YU0A 3EHTA 4U23A 4MH5A 4WEPA 2V84A 3Q26A 4OEVA 1JETA 4XKQA 1P1NA 1S9TA 1PBPA 1TXFA 5CMMA 3H4ZA 4LONB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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