3N26A

Cpn0482 : the arginine binding protein from the periplasm of chlamydia pneumoniae
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
DRNRIWIVGTNATYPPFEYVDAQGEVVGFDIDLAKAISEKLGKQLEVREFAFDALILNLKKHRIDAILAGMSITPSRQKEIALLPYYGDEVQELMVVSKRSLETPVLPLTQHSSVAVQTGTFQEHYLLSQPGICVRSFDSTLEVIMEVRYGKSPVAVLEPSVGRVVLKDFPNLVATRLELPPECWVLGCGLGVAKDRPEEIQTIQQAITDLKSEGVIQSLTKKWQLSEVAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding p
publication title Exploiting antigenic diversity for vaccine design: the Chlamydia ArtJ paradigm.
pubmed doi rcsb
source organism Chlamydophila pneumoniae
molecule tags Transport protein
total genus 65
structure length 231
sequence length 231
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n26A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n26A02
2UYEA 4PFUA 4F2OA 4F3BA 5A5XA 3IOTA 5ISUA 3GZGA 2H4IA 2NXOA 3OD7A 4KPTA 4G68B 3HV1A 4ELOA 4E0WA 5TPAB 3VFJA 3H6WA 5AE4A 2HCAA 4ZEFA 1NKXA 2QS4A 3FJ7A 3PUVE 1S9TA 1N7XA 3EHTA 2I4BA 3CI8A 1OIBA 2RINA 3RY3A 4BDQA 5H8FB 1DOTA 5DVFA 4ISUA 4X1DA 3SKPA 4THIA 1M5FA 3SEWA 4EQ9A 4F1VA 4KR5A 2ESNA 3KOSA 1QUKA 1Y3NA 1SYHA 3D4GA 1Q35A 3Q28A 4OYVA 3PMWA 3LBSA 3RGYA 3QIMA 4F31B 3U72A 5DTBA 5F7VA 2H9BA 3A09A 3UN6A 1MPBA 3TTMA 5TP9B 4R6HA 3MWBA 1H44A 3KOTA 4F3PA 3IK6B 1DTZA 1Y1ZA 3CRBA 2DWJA 4U23A 1SBPA 4NF8B 5TPAA 4F19A 1BIYA 4RYAA 2KLFA 1JEUA 3H06B 1IQ7A 1SVXB 1TT1A 2RC9A 3R26A 4MH5A 1XHYA 5H8FA 3VLWA 2NOOA 2QRYA 2M8CA 3UK4A 4YKJA 2XD3A 5CMCA 3H03A 3OSQA 3PPOA 2P0SA 4WXJA 3TODA 3G3GA 4O3BA 3SEXA 1H3DA 4R72A 2VD2A 3ILTB 3ECRA 1RKMA 2F6PA 3RLFE 1QW0A 2DWAA 2WKYA 4OQOA 2VHAA 1T0KA 4U1OA 1B3GA 5CMMA 1NL5A 4KCCA 2QPQA 3B6WA 5TP9A 5ITPA 2DWIA 4GXSB 4ONYA 1MY0A 3IB1A 1XC1A 2H99A 1QVSA 2OBGA 1H76A 3TZAA 2R6GE 1JVXA 1D3KA 1MS7A 1MM6A 2RCAA 3H6UA 2LAOA 4R6KA 2FNCA 1OQGA 4JSOA 4OEVA 2E0SA 2Q89A 1P1OA 3H6VA 2I0BA 5KCJB 1GGGA 2B3FA 4JWYA 3W15C 4EF2A 3E4RA 3USDA 4IY5A 1QKBA 3RPWA 4PETA 2ZNUA 3RT8A 1SW5A 3IORA 5EYFA 1QULA 3MP8A 3JV9A 3O6HA 4XTCQ 4ZZAA 1LFGA 5CMBA 1MXWA 4RA1A 4G8HA 4FECA 2UYFA 5M2VA 1IXIA 2D21A 5J1DA 4ZS9A 2O68A 2XXHA 2A5SA 3CFLA 1B7UA 1KWHA 1A99A 4EUOA 4IB2A 2REGA 2YPNA 2R71A 2DP8A 1P1QA 4RPNA 3KN8A 3M3KA 1ZTYA 3K6WA 3QUJA 1LSTA 5I2NA 3O6GA 2P2AA 5CRYA 5ITOA 4EDPA 2XX9A 4PFYA 3PUWE 3K1PA 1B7HA 4OFLA 1POY1 3TQWA 4GF8A 1S50A 4UA8A 3B6TA 4QFNA 4I1DA 3WAFA 1QJMA 1FTMA 1F9BA 1TWYA 4OEUA 3SEYA 2UVGA 1VFEA 3VDFA 3C36A 2PVUA 2ZYKA 1FTOA 4DZ1A 3ODBA 5CMKA 1Y4CA 1N84A 1FQFA 2UVIA 1SDXA 2XXWA 3P7IA 3KN3A 3HHFA 2I0CA 5L9OA 3JYRA 3OENA 1II5A 3N6UA 3G3HA 3O28A 3ZSFA 5BWJA 4P0IA 4TOZA 1NMUA 4NF4A 1POTA 3QYTA 1MY3A 3VVFA 1US5A 3O9PA 2Z8DA 3FVGA 4EQBA 4OFOA 3LC8A 3H6TA 5IKBA 2DXRA 4QSDA 2PX1A 1XVYA 1B58A 4BDMA 3PMXA 2DS9A 3F11A 5DT6A 2Z23A 2DE2A 3FXRA 3TQLA 4XXUA 1MH4A 1ZKBA 1P1UA 3LUYA 3E3KA 1UTBB 2F7CA 3IX1A 1QUIA 5JEIA 2CMOA 2XX7A 3SEUA 4TLLB 4M4GA 4R2FA 3ILUB 1H45A 3FJGA 3QUFA 2GH9A 3MZBA 5EHMA 1DSNA 2DOJA 3TCGA 4GD5A 1ELJA 1B0HA 1LAXA 2O6AA 4OERA 3V5AA 5I56B 2HFBA 4YKKA 1B1HA 1IZ1A 2XXPA 4YKIA 1JQFA 4RK2A 1FW0A 5CM6A 4DXUA 2DWHA 4X9TA 4R9GA 1Y3QA 1ZU0A 3L6HA 2X7QA 2ZYMA 4LZ8A 4LZ5A 4R2BA 3MZ1A 4M1VA 4OMBA 3ONMA 1UTBA 2O51A 3U93A 3GLBA 2P1SA 4NTLA 4IO4A 4X1BA 2HQ0A 3EN3A 3WAEA 4QSEA 3PD8A 3KFMA 2QS1A 1PC3A 5AA2A 4GIZA 2HAUA 3K2DA 1A54A 4F39A 1FQCA 3M8UA 4RK9A 4G68C 4FIMA 4O3AA 5I57A 4YMBA 1SQYA 2OLBA 2F78A 4BDNA 4ECFA 1URSA 4H6DA 3M3LA 3PGFA 4YAHX 4IY6A 5L8DA 2B65A 1VSOA 3AXFA 1NNFA 3U1OA 4IGRA 4JWOA 2HAVA 4H5FA 1Y9UA 1XS5A 4EXKA 1DPEA 2I3WA 4Q0CA 1LBCA 1XOCA 3TFLA 4P0GA 2Q8JA 2PBWA 2DVCA 3CSBA 1LBBA 1USYE 3K01A 2QJEA 3TYHA 2E1SA 3BFUA 1URGA 4NF6B 4F3SA 2DQVA 1IXCA 1M5DA 3RTWB 3EF7A 1MQIA 1B5JA 1D9VA 2RC8A 4ZDMA 3R6UA 5F1QA 5DVJA 3KBRA 1NH7A 3N6TA 2G93A 1PB8A 4OVJA 3UGWA 3S2VA 4HTGA 4KCDA 3GXAA 3OO9A 3V89B 2XXQA 1B0LA 3FV2A 3OOAA 1PBPA 3CFZA 3MPKA 4YB5A 4OHNA 3KN7A 3TTNA 2DE4A 4POXA 2W7YA 1IIWA 1ZMGA 3KJ7A 4HCWA 3U94A 4FJPA 4EQ7A 3S9LC 3FJMA 4RNSA 3VV5A 4Q5TA 4GL0A 1EH3A 4F22A 3PPPA 4QSCA 4R75A 3RTFB 3PV0E 4NF6A 1BKAA 4QFKA 4QFOA 3VLVA 1YAEA 3VXCA 5KZTA 2AL5A 2ZYNA 3K0VA 3EQ1A 1Z7NE 1A40A 3V8XB 3FATA 4DE8A 1SW4A 3PUYE 1VFDA 5ICQA 4DIGA 1MXXA 3DP6A 4ND9A 3MZ9A 2O84X 5I58A 2FA7A 1UTHB 1A55A 3IAZA 4NWCA 4BLAA 2THIA 1FTJA 4H5GA 1LAGE 3S9MC 3SESA 1DPPA 4I8CA 4L17A 4GFRA 2CZLA 4PP0A 2QSXA 3T22A 4MFIA 4RY1A 1Y4TA 3EPEA 2ALUA 3OSRA 3MVYA 1B3EA 4H1XA 3TKDA 2I58A 3THIA 5H8NB 1B5HA 2Z8EA 1MRPA 4R6YA 4N07A 1AL3A 3TPAA 2ONRA 2F35A 3PUXE 3S9EA 1L5TA 4JSDA 2XX8A 3C32A 2NVUB 1FQEA 2F34A 4C0RA 3G3KA 5I2NB 3OELA 2D5WA 2HEUA 1Q1KA 3I6VA 2ZXTA 4QF9A 4FATA 4TLMB 3IOVA 2VD3A 3UORA 3LR1A 1UTHA 5TU0A 5CBSA 4DXBA 2QL3A 2XD2A 2YLNA 1HSJA 3T9HB 1LFHA 1B6HA 2I48A 3HCQA 1IXHA 4P11A 4JXIA 1B7ZA 4G2ZA 5H8NA 4YKPA 1N04A 1B05A 1UQWA 2AYSA 4ESWA 5IAIA 4KD5A 2XHDA 3M3FA 2VOZA 2I49A 1B32A 1FCKA 4NF4B 2F36A 4N13A 1URDA 3K00A 4U21A 3TUSA 4FORA 1SW2A 4OENA 4R9FA 3IJOB 4H67A 3CSGA 4G8MA 4ZEDA 4KYEA 4ELPA 2F6GA 3FASA 1SI0A 3MBPA 5CC2A 4YICA 2PYYA 2Y7WA 3TAJA 4C1TA 3OO8A 2Q9TA 1JW4A 4AB5A 1VE4A 3FGSA 4K3FA 2O69A 2QMXA 1EZPA 3CG1A 4KHZE 4U2RA 2DVZA 5JK4A 3DM0A 3G3FA 4NWDA 1NFTA 1MDP1 4OWDA 1R6ZA 5HBCA 3FD3A 5I2KB 1WVJA 1YTVA 2V84A 1Y3PA 3W9VA 4H8JA 1QUJA 4PQJA 4YB7A 5B70A 4GXAA 1UIUA 1RYOA 2OWTA 3TCHA 3MC2A 1EZOA 1MDQA 3T9UA 2Q88A 2HZLA 4QHQA 3PPRA 3N94A 3ZKKA 4PFTA 5H8SA 2O7UA 1FTKA 3C34A 1HSLA 1IITA 3G7WA 1MQGA 5L9SA 5KDTA 3RT6B 1FQDA 1SD3A 2UVJA 3E9XA 4GOTA 4UACA 4KQPA 2H25A 4LQ2A 3G3JA 3TTRA 1QKAA 2GRVA 3PUZE 1LGBC 3O2AA 1WODA 4NE4A 3SETA 4Z0IA 1ZIUA 1SW1A 2OK2A 1AIVA 3FVKA 3Q27A 5I2KA 1M5CA 4HCYA 4LQ5A 4MLQA 3G3IA 3HSTA 3BFTA 3K1MA 2ONKE 3QK6A 3C31A 4IO5A 3KSXA 4ZZEA 3EHUA 4U22A 1ZBMA 4H65A 3O97A 1B9JA 2UXAA 1I6QA 2V93A 3K6VA 4F3GA 2ANJA 3PPNA 3VXBA 4LP2B 2OZZA 1I69A 5AA2B 2REJA 3TTKA 3LSLA 4R74A 1N3XA 2R9JA 3I3VA 4XKRA 1BTJA 3KSJA 3TMGA 5I57B 2ABHA 1MM7A 4XKQA 4DXCA 1MQHA 4QRZA 1R9QA 2PMSA 3MAMA 4F1YA 4F29A 3CR9A 3KZGA 2AIXA 4BDOA 3W9WA 4H8IA 3Q25A 3O6IA 5DEXA 1ZLQA 1D9YA 4PE5B 4LA9A 2ONSA 3TDJA 4BDLA 5H8QA 4YB6A 4QFLA 2H98A 1OMPA 3CVGA 4GWOA 5JTYB 2PT2A 3FIRA 3HHGA 3FUZA 4BDRA 3S4UA 2HXWA 4I9DA 1I6BA 2UVHA 3MVXA 2QS3A 1USYH 3SDFA 4MLVA 5AA1A 4ZEIA 4GRKA 1CB6A 1N7WA 2F8DA 4HS7A 1B3HA 3IJXB 4LVQA 3MQ9A 3KEIA 2O7IA 4H0WA 2V3TA 3PMVA 4ELRA 2F5XA 3IB2A 4RJZA 3MUQA 4EXLA 4U4SA 3QAXA 4FAJA 4KYDA 1AMFA 4U4XA 1MXZA 3JZJA 4G77A 1PDAA 1Z7ME 1HSEA 2XXXA 2QS2A 1NNTA 4N6PA 5JTYA 1TFAA 3FV1A 4IGTA 2YJPA 2X7PA 1OVTA 3PD9A 3KGCA 1A8EA 3KG2A 1M5BA 1NNKA 4Z7EA 1MXUA 2RF1A 5FHNA 4WEDA 3FXUA 4DCXA 4G8NA 3GBAA 3U92A 1OLAA 4C1UA 3MVWA 4O3CA 2F97A 2NWJA 3E13X 1R9LA 5I58B 2Z8FA 4XKNA 2D3IA 3H3GA 1JVYA 4LUBA 4OFJA 3SERA 1B40A 3IO4A 2OCUA 3CFXA 5K2YA 4DCYA 3FXQA 5H8HB 2XXVA 2Y7IA 4G68A 1J1NA 1MQDA 4GVOA 4WKMA 1R1NA 1MPCA 1N0TA 2IEEA 4JDFA 5AA2D 4QFPA 3O66A 3IL1B 1LFIA 1NNPA 1IEJA 4KYSA 2ZNSA 4TQUQ 4LONB 3K6XA 1O7TA 3N26A 4IO3A 4GLIA 3VE1B 4JBZA 4OESA 3ZS6A 2F7BA 1A8FA 4JWXA 1MY1A 4AQ4A 2VP1A 1IUDA 1DTGA 3D4CA 2NUVA 4DLDA 1JW1A 4F18A 2XXRA 2B3BA 2BJJX 4KFQA 1EZ9A 5DVIA 3K6UA 2V3QA 5H8HA 4OTEA 1B4HA 3T96B 1AOVA 1B5IA 1TFDA 2ZMBA 3UIFA 4NF8A 2PT1A 2Y7RA 4JB7A 3TEPA 4FE8A 1LB9A 5CI5A 1MXVA 1Y1MA 1MPDA 1DMBA 5AA4B 3OEMA 5I84A 3R7XA 3LSFB 1SYIA 4Q30B 2ZYOA 2IA4A 4KI0E 3B6QA 2V3UA 3OO7A 1EU8A 3UP9A 4G4PA 3T9VA 2I4CA 1CE2A 1N3WA 4FEDA 3B7DA 1H43A 1GTKA 3OEKA 1NH8A 4E0XA 1XVXA 4NMYA 3C33A 3LSWA 1MH3A 5B7DA 3VVEA 2Z22A 4LATA 3A3CA 5LOMA 2OJTA 2O1LA 3MP1A 4IO7A 1B2HA 5ELVA 3FZVA 4NEDA 1B52A 2RCBA 5EHSA 3IOUA 1O64A 5KDTB 1N76A 5AA4A 2X26A 5KCJA 3MW0A 3T66A 4R73A 3K1NA 2DYXA 3DP4A 3IOWA 3O29A 3CIJA 4IO2A 4PFWA 5FHOA 1JNFA 2OWSA 4ZE9A 1LLSA 1ZJLA 5I59B 1LCTA 1JETA 3PPQA 1IXGA 3CG3A 4HW8A 5FTIA 3KJTA 4ZEBA 3HN0A 1B4ZA 3RQTA 3K02A 5CBRA 5ICTA 3V83A 4ZECA 1D4NA 3HPIA 4LZ7A 2GHBA 3Q26A 4AB6A 2XXIA 4XKPA 4F1UA 3FVOA 1MXYA 5L9MA 1MG1A 2GFEA 2Q2CA 4ESXA 3U8QA 3MPLA 3DP8A 1OQHA 3T9XB 4WEPA 2DE3A 3OXNA 4OXVA 4RPOA 2DXYA 3T93B 3LSXA 2I3VA 1LAHE 1GVCA 2ZNTA 1I6AA 1B3LA 3H4ZA 2I6EA 2HZKA 4YMAA 2F7AA 4POWA 3IO6A 3QXMA 1MQJA 4YU0A 3ZKLA 5I59A 1FQAA 1P1NA 4EF1A 3FVNA 3L6GA 3SEVA 2RKMA 3IR1A 1M5EA 1O63A 4ZE8A 2XXUA 3C35A 4ELQA 1TXFA 3A3UA 1GR2A 5DEXB 1ATGA 2VGQA 1Y20A 3OO6A 3TTLA 4XIGQ 1GV8A 5H8QB 4MBPA 3N5LA 5BUUA 4RXLA 2FYIA 3VLUA 2Y7KA 4X48A 4I62A 1YCJA 2H5YA 1P99A 4IO6A 3C9HA 3DELB 3IB0A 4FEBA 2Y7PA 5AA3A 3VVDA 3RUMA 4OETA 3BBRA 1PEBA 1A7LA 1AH5A 1LAFE 4OZ9A 3MP6A 4GQOA 5HM4B 1MY2A 2A5TB 3K4UA 2Y84A 2DSFA 3GBBA 3HO7A 2O1MA 5FTHA 3TELA 5K2XA 3Q29A 4NF5B 1MY4A 3MJNA 2XXYA 1ANFA 3PU5A 2V25A 1FTLA 3I5OA 1B1XA 1P1WA 1B3FA 3C4MA 1OVBA 3TCFA 5A5XB 2AL4A 1JW5A 1PB7A 4U1ZA 1UIVA 4DDDA 3EHSA 1LB8A 4MF3A 1RYXA 1VR5A 2G29A 3BKIB 1LCFA 1PB9A 1WDNA 1SI1A 4ZEKA 1XT8A 3QSLA 1PBQA 1US4A 4F2QA 2XXTA 4GL8A 4Q8RA 1B46A 1BP5A 2Q2AA 1FQBA 2A5TA 1S7YA 3H7MA 2RC7A 3RNNA 5HPQA 5I56A 1YPNA 3DLNA 3S9NC 3MVZA 4NF5A 1JEVA 3UA8A 3OMBA 5FHMA 2QMWA 3RN8A 2GHAA 4YZZA 1OLCA 1B51A 5DYHA 1BLFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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