3N26A

Cpn0482 : the arginine binding protein from the periplasm of chlamydia pneumoniae
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
DRNRIWIVGTNATYPPFEYVDAQGEVVGFDIDLAKAISEKLGKQLEVREFAFDALILNLKKHRIDAILAGMSITPSRQKEIALLPYYGDEVQELMVVSKRSLETPVLPLTQHSSVAVQTGTFQEHYLLSQPGICVRSFDSTLEVIMEVRYGKSPVAVLEPSVGRVVLKDFPNLVATRLELPPECWVLGCGLGVAKDRPEEIQTIQQAITDLKSEGVIQSLTKKWQLSEVAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Exploiting antigenic diversity for vaccine design: the Chlamydia ArtJ paradigm.
pubmed doi rcsb
source organism Chlamydophila pneumoniae
molecule tags Transport protein
molecule keywords Amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding p
total genus 65
structure length 231
sequence length 231
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n26A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n26A02
4ECFA 3D4GA 4BDLA 3E4RA 1IXIA 2QS1A 4RJZA 3OEKA 2FYIA 3L6HA 1B3LA 1IEJA 3PPOA 4GWOA 3EPEA 4JSOA 4LA9A 4BDNA 4ZEBA 4H8IA 2Q88A 1B4HA 1OLCA 2V3TA 2DOJA 3E13X 3MAMA 1MY0A 3MVWA 4JSDA 5DYHA 4F3PA 2DXYA 1QVSA 4G8NA 1O64A 2PMSA 3G3HA 3OOAA 4JB7A 2Z8DA 1POY1 5DEXA 5AE4A 3TCFA 3FUZA 1S7YA 3H6VA 1UIUA 1XVXA 5I2KB 2F7BA 1SW2A 2HCAA 3C9HA 1F9BA 3M8UA 1VR5A 3OMBA 1PBPA 4PFWA 4IO2A 3MW0A 4OEUA 4EXLA 2GFEA 3O6HA 3FIRA 2ONRA 3IJOB 1SVXB 4QSDA 4IO4A 2Q89A 4YAHX 3TODA 3K2DA 4RPNA 1LLSA 4GRKA 3KOTA 4NF6A 3CFLA 3FJGA 3T9UA 2F34A 4O3BA 1PB9A 1Z7NE 2ZYNA 3WAFA 4NF5A 1MY1A 5BWJA 1AH5A 1Q35A 3KN3A 1NFTA 3M3KA 5DEXB 1XC1A 4Q0CA 4IGRA 1FQCA 4KD5A 1SI1A 1Z7ME 2VP1A 3FGSA 1IIWA 1B7HA 3LSLA 2GH9A 3MZBA 4OHNA 5H8FB 2RF1A 4F2QA 3MVZA 4GVOA 4OFLA 5KZTA 3HO7A 3C4MA 1TWYA 3CG3A 1B9JA 5AA4A 3LSFB 4HCYA 1ZIUA 4NF8B 1JW4A 1US5A 1MPBA 3K6WA 3MP6A 3N6TA 3GBAA 5H8QB 3V5AA 3BFTA 1LB8A 4QHQA 1Y3QA 2VOZA 4FEBA 1QKAA 1B52A 1NNFA 4H1XA 4IO7A 2A5TB 5H8NA 5ITOA 5IAIA 1BTJA 3RY3A 4L17A 3PPPA 5KDTA 3CG1A 3PUYE 4KQPA 1S9TA 3ONMA 4R72A 1MQIA 3IO4A 2Q9TA 3MP1A 3Q25A 3SETA 1M5EA 4LQ5A 3LBSA 3MWBA 1QUKA 3HSTA 3G3KA 3KEIA 1NKXA 2A5TA 5KCJA 2PX1A 2DQVA 3LC8A 4N13A 2PYYA 1B1XA 5EYFA 4YMBA 2F6PA 3C33A 4QFLA 1N0TA 3VV5A 1FQBA 4YKPA 4H67A 1MQGA 3DP8A 3FVOA 1RYOA 2HEUA 3GXAA 5H8SA 1CB6A 1LB9A 3DP6A 3S2VA 4EQ7A 4HW8A 4G8HA 4YB6A 1LCFA 2CMOA 4ZDMA 2XX7A 3MBPA 4NWDA 1M5DA 4IGTA 4IY5A 1UTBB 3T9VA 1R1NA 3RTWB 2YJPA 4R6YA 4QFPA 1N7XA 4FEDA 1MY2A 4BDRA 5H8HB 3IORA 3M3LA 5ELVA 3K0VA 4U1ZA 2OBGA 4IO6A 5F1QA 5AA2A 1N3WA 5DVIA 1P1WA 3HN0A 3G3JA 4LZ5A 1T0KA 3H06B 1II5A 1IZ1A 2THIA 1N7WA 4MFIA 4P11A 2AL4A 2ALUA 5CMMA 2NVUB 3SESA 3U72A 1JVYA 1US4A 3MC2A 3ECRA 4XKPA 5F7VA 1SYIA 1N84A 4OVJA 1Y1MA 4XTCQ 4DXCA 5TP9A 3FV2A 2F78A 3EQ1A 3JYRA 4ND9A 1SW1A 4YKIA 2QRYA 2RCAA 5AA2D 1MQDA 1LFGA 3OO9A 5JK4A 3QYTA 4PFYA 4BDQA 3K01A 1QUJA 4FATA 2IA4A 2H99A 4AB5A 3FJ7A 3IL1B 2DE2A 1JEUA 1H45A 3D4CA 1Y4CA 2QMWA 3TTRA 3K6UA 3VVFA 1H44A 1OIBA 3KOSA 4G8MA 3CFZA 1QULA 2W7YA 4LP2B 1URGA 4IB2A 1MXVA 4JWXA 2O69A 4H8JA 2OWSA 2XXXA 3DELB 4KR5A 4XKNA 3TFLA 3Q26A 3IB2A 3O66A 1MXWA 5JTYB 3TMGA 1UTHB 2DVZA 4I62A 2FA7A 4ZS9A 1A8EA 4TOZA 3KGCA 3OSRA 1B5IA 3I5OA 2XXHA 1BIYA 2QS3A 2I48A 3KJ7A 3KG2A 3OD7A 1ELJA 4G77A 4GL8A 2V3UA 4OENA 1FTOA 1GV8A 1MQJA 2RKMA 4F1VA 1B46A 1MPCA 3TQLA 5CC2A 1B05A 3B6QA 1LFIA 4F3SA 2AL5A 5I56B 4ISUA 2H98A 3TTMA 4DIGA 4U4XA 3WAEA 2Y7RA 2QJEA 1N3XA 1LBBA 5TU0A 3BBRA 3TAJA 2XXVA 5CI5A 4JDFA 4N07A 1EZPA 3H03A 3V8XB 2RC7A 1HSEA 3MUQA 1QJMA 1SI0A 1D4NA 2O84X 2ONKE 3GBBA 1BP5A 5I2NB 3E9XA 1EZ9A 1DTGA 3TYHA 4DXBA 3HHFA 2ZNSA 1UTBA 1VE4A 3Q29A 3SEYA 4EF2A 1MXXA 2QPQA 2Y84A 1H43A 3IOVA 4H5GA 4NTLA 4EXKA 4EQBA 2XXQA 1MXYA 4RXLA 4OEVA 1D9VA 2YLNA 4F31B 2GHBA 4C1UA 4KCDA 2V3QA 1MY4A 3TZAA 2V25A 2R71A 4DCXA 2XXYA 1FQAA 1AMFA 5ISUA 4P0IA 3JV9A 4X9TA 2F97A 2DWAA 4LZ8A 3CFXA 1NL5A 1FQFA 4YICA 3QAXA 1ZJLA 4ZEKA 3TDJA 2Z8FA 1AIVA 3K1MA 3FXUA 4OZ9A 2PT2A 2M8CA 1DSNA 2ZYOA 3Q27A 4E0XA 4OETA 3T66A 4AQ4A 4ELQA 1JETA 4POXA 4ZZAA 4GF8A 3PMWA 2RC9A 4E0WA 2HZLA 2I3WA 4DXUA 1MQHA 3ZSFA 1B5HA 2DWIA 4JXIA 3VE1B 1JEVA 4RNSA 1MXZA 1N76A 1MH3A 1D3KA 1FTLA 3U8QA 3IK6B 3VVDA 5ICTA 3QK6A 3RGYA 1B0HA 2Z8EA 2OK2A 4BDMA 4R6KA 1MDQA 4UACA 3I6VA 4NF4B 5CMKA 2I0BA 3PPNA 2DE4A 3VLWA 1B4ZA 1MDP1 5HM4B 5JEIA 1D9YA 3KZGA 5L9OA 2PVUA 1YTVA 1LAGE 2I0CA 2REGA 2UYFA 3MZ9A 4H65A 3UGWA 2Y7PA 1B5JA 3FD3A 2A5SA 1I6AA 3FJMA 4I9DA 2UVHA 4IO5A 4I8CA 1DTZA 4GLIA 2PT1A 2F7AA 4QFNA 4NF4A 2NXOA 3QIMA 1TT1A 4TLLB 3KFMA 4WKMA 1JVXA 1A40A 1RYXA 5M2VA 5H8HA 3IR1A 4BLAA 1OVBA 1QKBA 3CI8A 3K1NA 4HTGA 4GOTA 2REJA 3LR1A 4R6HA 1MM7A 3UA8A 1SQYA 1Y3PA 1YAEA 3U94A 4QFKA 1Y20A 4OXVA 1B3FA 4R2BA 3Q28A 1KWHA 5JTYA 1ZMGA 5BUUA 1A8FA 4PFUA 3UP9A 1B1HA 1LGBC 2LAOA 3U1OA 4FIMA 3W9VA 1SBPA 2F6GA 4KYDA 4LUBA 4TQUQ 3OSQA 1ATGA 3IOUA 2Z22A 4X1BA 4ZE9A 1A99A 1MXUA 4YKJA 3RT8A 4RK9A 4U21A 5HBCA 3RQTA 4G68C 3ZKKA 2WKYA 2PBWA 1PBQA 2DVCA 4ZEIA 4ZEDA 4OESA 1FQDA 1PEBA 4WEDA 3TELA 1JW5A 3RNNA 3RPWA 2I6EA 1DOTA 1PC3A 2XXUA 3MPLA 2I4BA 4R75A 1VSOA 1XT8A 5TP9B 2F35A 2O7IA 1PB7A 2B3FA 2F7CA 3OO8A 1I6BA 5KDTB 1TXFA 3PU5A 1EH3A 2VD3A 3PGFA 4F2OA 2H5YA 3EHSA 1ZLQA 3MVXA 2NWJA 4U22A 1A7LA 1DPPA 2XD3A 4MLVA 3TKDA 4DLDA 4GFRA 3GZGA 3OENA 3SDFA 5CMBA 3TTNA 5AA2B 2QS2A 2B65A 1NH7A 1JNFA 4AB6A 3RT6B 2OCUA 4MF3A 1O7TA 4NWCA 4G68B 4WXJA 3N6UA 5EHSA 3B6WA 4LVQA 4DDDA 4KYEA 4EDPA 4OYVA 2O51A 4I1DA 3VVEA 5TPAB 4KYSA 4FAJA 1OQGA 2XXWA 2O1LA 3O6GA 1JW1A 1WODA 5ITPA 3CIJA 2XXRA 1XHYA 2O7UA 4G68A 4Q8RA 3S9EA 3VXCA 1MG1A 4YMAA 4GQOA 2UXAA 5HPQA 1HSLA 1B2HA 1SYHA 1TFDA 1URSA 4H0WA 2CZLA 4POWA 4QFOA 3R7XA 3TTKA 3U93A 3VLVA 1MM6A 1A54A 1B0LA 4Z7EA 2I58A 1IQ7A 1B58A 1USYH 4M1VA 2XD2A 1ZKBA 2VGQA 3R6UA 4R74A 1P1QA 1UQWA 2DYXA 1MPDA 3H7MA 4LZ7A 3O28A 3PUVE 4MH5A 3U92A 5K2XA 2QSXA 2X26A 4H6DA 1HSJA 1R9LA 2XX9A 3QUJA 4M4GA 4YZZA 3W9WA 1UIVA 2DSFA 3FASA 4C1TA 3N26A 3UORA 4LQ2A 1DMBA 3IAZA 2ANJA 1EU8A 1FTKA 2AYSA 2HZKA 2Y7IA 3W15C 1GGGA 2O6AA 4Z0IA 4RY1A 2YPNA 3K6VA 4DZ1A 3L6GA 5H8FA 3IOWA 2ONSA 2HXWA 3PD8A 4ZEFA 4UA8A 3M3FA 3BKIB 3MQ9A 2ABHA 2NOOA 4GXAA 3O6IA 2O1MA 3SEUA 4R73A 3SEWA 5A5XA 1OVTA 1M5BA 4NF5B 1NNPA 2H9BA 4QSCA 4ONYA 1B51A 4RPOA 1SW4A 3CSBA 3SERA 3TUSA 4R2FA 1LAXA 1B3EA 3PUWE 4X48A 4ELPA 2D3IA 1Y9UA 2FNCA 1LAHE 3LUYA 3ODBA 3DLNA 3PUXE 3SEVA 3TTLA 4F3BA 3LSXA 2Q2AA 1L5TA 1MS7A 3PMXA 4PFTA 3H6UA 1N04A 5FHOA 5I58A 1LFHA 3H3GA 1Y4TA 2DS9A 4JBZA 4QRZA 3OO6A 5I2KA 2OLBA 2DP8A 4MBPA 3G7WA 4BDOA 4F39A 5AA4B 1B7ZA 4ZECA 2H4IA 4PQJA 2GHAA 2RCBA 3KSJA 3K00A 3RLFE 3K6XA 2O68A 4OWDA 3B7DA 3KJTA 1P1NA 4U23A 4KI0E 4OTEA 1ZU0A 3SKPA 5CMCA 4TLMB 3HV1A 3QSLA 4QF9A 5B7DA 4ZZEA 1USYE 1IXCA 5IKBA 1B3GA 1BKAA 2Y7KA 3EHTA 4DE8A 3OELA 1I69A 4HCWA 2P0SA 1H3DA 1Q1KA 4HS7A 5FTIA 1MY3A 4FORA 4NF6B 3PPQA 5TPAA 1M5CA 1YCJA 3N94A 1MRPA 3A3UA 5I57A 4KFQA 5L8DA 5DTBA 4FJPA 3H4ZA 3PMVA 1GR2A 3MZ1A 1IUDA 2H25A 2E0SA 2VHAA 5DT6A 4QSEA 3VFJA 3V83A 2OJTA 2HAUA 2QS4A 4U4SA 2DWHA 2ZMBA 4GD5A 3OEMA 5I57B 1SDXA 4NF8A 5H8QA 4F22A 3IJXB 3S9LC 4C0RA 2P2AA 4G2ZA 1FQEA 2G93A 1NH8A 3FV1A 3N5LA 5EHMA 3ILUB 5ICQA 3EF7A 2VD2A 3R26A 2R9JA 2XXIA 4G4PA 4IO3A 4R9GA 3T9XB 4FECA 5DVJA 3ZS6A 4PE5B 3S9NC 4ZE8A 4U2RA 4EUOA 3MVYA 4EQ9A 2UVJA 1M5FA 4K3FA 3MJNA 2X7QA 3S4UA 1EZOA 2V93A 1B40A 3VLUA 5K2YA 1NNKA 1YPNA 2AIXA 4LATA 4P0GA 3G3IA 4RA1A 3FVNA 3QXMA 4R9FA 2ZYKA 3CSGA 2ZYMA 1A55A 2I3VA 3G3GA 3E3KA 3ZKLA 4OMBA 3RUMA 5I59B 5I2NA 1URDA 2OWTA 2P1SA 3DM0A 4XXUA 1NNTA 2ZNTA 3IO6A 3O9PA 4NMYA 4THIA 3T9HB 5I56A 2UYEA 1FW0A 4FE8A 3VDFA 4F18A 1P1OA 3P7IA 2Z23A 3H6WA 5CBSA 5CM6A 3FZVA 1P99A 4ELRA 2ZXTA 2R6GE 2B3BA 2F8DA 2HAVA 2QMXA 3G3FA 4YB5A 1R6ZA 3IB1A 4OQOA 3UIFA 3C34A 4EF1A 4ELOA 5J1DA 3CVGA 3K1PA 1ZTYA 1J1NA 2I49A 2IEEA 1QW0A 1UTHA 1P1UA 3PPRA 4RK2A 3FVGA 4WEPA 1AOVA 2V84A 3T93B 3TQWA 1PB8A 2ZNUA 4O3CA 1PDAA 2GRVA 2RC8A 3TEPA 1GVCA 3C31A 5FTHA 4F3GA 3PV0E 3H6TA 3JZJA 4YKKA 3C36A 1Y1ZA 1Y3NA 2UVGA 1B3HA 2G29A 4F1YA 1OMPA 1RKMA 3VXBA 5FHMA 2Q2CA 3EN3A 3EHUA 1XVYA 1S50A 2BJJX 3S9MC 3HCQA 1FTJA 3LSWA 4DCYA 1OQHA 4YU0A 3F11A 1OLAA 4GXSB 2D21A 4PP0A 2XHDA 4KCCA 2I4CA 3PUZE 2F5XA 4F1UA 3IB0A 1GTKA 4U1OA 3MP8A 5CRYA 1IITA 4XKQA 4F19A 4JWOA 4KHZE 3O97A 2E1SA 4GL0A 2DWJA 1LSTA 3THIA 3TPAA 3B6TA 1ANFA 3HPIA 5H8NB 2OZZA 3V89B 3MPKA 4MLQA 1BLFA 3GLBA 3IOTA 4GIZA 1AL3A 4LONB 3IX1A 1JQFA 4ESWA 4NEDA 1R9QA 2XXPA 5I59A 3FVKA 4N6PA 3T96B 1SD3A 3KN8A 3OO7A 3CRBA 3KBRA 3UK4A 2ESNA 5CBRA 3TCHA 2DE3A 1XOCA 2DXRA 3K4UA 2HFBA 4H5FA 4IY6A 3KSXA 2HQ0A 3ILTB 3AXFA 3O29A 4JWYA 1TFAA 4XIGQ 5DVFA 3RN8A 3SEXA 3RTFB 3A3CA 3FXQA 1WVJA 3KN7A 4OERA 1QUIA 1VFDA 3FXRA 2NUVA 4OFOA 3PD9A 3A09A 4YB7A 4X1DA 5FHNA 2RINA 2XX8A 1IXGA 4Q30B 3TCGA 1FCKA 3HHGA 1LCTA 1LAFE 4Q5TA 1NMUA 3UN6A 4XKRA 1VFEA 2XXTA 5I58B 1B7UA 5AA3A 1LBCA 2KLFA 2D5WA 4NE4A 4PETA 3USDA 5AA1A 3OXNA 2QL3A 2UVIA 3BFUA 5KCJB 3I3VA 2Y7WA 3CR9A 1H76A 2Q8JA 3T22A 5L9SA 1SW5A 1XS5A 1B6HA 3QUFA 4O3AA 3O2AA 1DPEA 5L9MA 4F29A 1I6QA 5A5XB 3FATA 1B32A 3K02A 1FTMA 5I84A 3DP4A 4ESXA 1O63A 5B70A 4KPTA 1MH4A 4OFJA 1WDNA 1ZBMA 2X7PA 4RYAA 5LOMA 2F36A 1CE2A 1IXHA 3C32A 1POTA 3C35A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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