1MXUA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with bromo-willardiine (control for the crystal titration experiments)
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Probing the Function, Conformational Plasticity, and Dimer-Dimer Contacts of the GluR2 Ligand-Binding Core: Studies of 5-Substituted Willardiines and GluR2 S1S2 in the Crystal
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxuA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxuA01
5H8QB 5L9MA 3TKDA 5KDTB 3C4MA 1JNFA 3N6TA 1EZOA 4OEUA 1TFDA 3HHGA 3LR1A 2QS1A 3IOUA 5AA3A 5I57A 2O7IA 1USYE 4POWA 3ODBA 1GGGA 2UVJA 3OO7A 2RC7A 1MM6A 1BTJA 2D3IA 1P1QA 3KEIA 3R6UA 1MS7A 4R9FA 4IGRA 3SEWA 3DM0A 3SKPA 3S4UA 1QJMA 1N7XA 1B3GA 4R75A 3N94A 3UORA 1B40A 4R6KA 1B7HA 2RCAA 3Q29A 3KBRA 3TCFA 1URDA 1SW4A 2R6GE 4RYAA 1OLAA 4OETA 4DCXA 3M3LA 3TPAA 3K6WA 4IGTA 1B6HA 4O3BA 1B5JA 1SVXB 2I49A 3CIJA 5ICTA 2YLNA 2F5XA 1DTZA 4NF4B 1OVTA 1US5A 1S7YA 4NWDA 4OHNA 2G93A 4I1DA 1LAHE 2HXWA 5TP9A 2QS4A 4ZEFA 2PX1A 5DVJA 3ZKKA 4HS7A 3WAEA 1MRPA 1R9LA 1B7UA 5ITPA 2V3QA 4WEPA 4JB7A 4U4SA 1IITA 1QUJA 3V5AA 3FXRA 3OOAA 1Z7ME 1QKAA 1JVXA 4PP0A 3MVXA 4UACA 3LSLA 4GQOA 3RN8A 1L5TA 3PMWA 3TTRA 4DZ1A 4QF9A 3LC8A 4X9TA 2PT1A 4ELRA 3IO4A 2XXYA 1Y3NA 3OO6A 4LONB 2DQVA 1UTBA 1UQWA 1LAGE 5KZTA 2Q8JA 3DELB 1LAXA 4OYVA 3S9EA 5CMBA 1DOTA 4I9DA 3LSWA 4Z7EA 2DXYA 4BDQA 2GRVA 3MP8A 1LB9A 3FVOA 4H5FA 1N84A 2Y7WA 1HSLA 2FYIA 4Q30B 3SEVA 3FVKA 1Y3PA 4U22A 3S9LC 4XTCQ 2R71A 2FA7A 2B3BA 3TTLA 1FQDA 3T9VA 1N04A 3QUFA 1LCTA 3PD9A 2GFEA 2I3WA 5AA2A 4H0WA 2HQ0A 1WDNA 3I3VA 3O28A 1R9QA 4BDOA 4H8IA 4LQ2A 1LGBC 4OESA 3U92A 2QSXA 5A5XB 1NKXA 3E4RA 3T96B 4G68A 3H6TA 2DVZA 3FXUA 2H99A 5DT6A 1I69A 1US4A 1MPBA 1Y3QA 1Y4TA 4OWDA 2VGQA 2WKYA 3B6QA 1LFIA 4WEDA 3Q26A 3K00A 2XXUA 3KFMA 1RYXA 4DXBA 3T9HB 2Y7RA 3H03A 3G3IA 3MJNA 1Y1ZA 5J1DA 4TOZA 1M5FA 3MVZA 4OFLA 4NWCA 4OFJA 5HBCA 1AOVA 1BP5A 3T66A 4ZEDA 2XXRA 1S9TA 2ANJA 3RY3A 3LUYA 1N76A 4GOTA 5HM4B 2UYEA 1B52A 2O7UA 3IB1A 4LZ8A 2H4IA 3PV0E 4YKIA 5DEXB 1O64A 4ZZEA 2Y7PA 2ZYMA 3FXQA 3GXAA 3VVFA 5LOMA 3QYTA 3OSRA 1IEJA 3LSFB 4OTEA 3FASA 2O1LA 3K1PA 1UTHB 3MWBA 4KFQA 3M3KA 2PVUA 2PYYA 4Q5TA 3D4CA 3K1MA 3KG2A 4BDLA 1XVXA 4QSDA 3VLWA 3FJMA 2BJJX 3E3KA 4GWOA 3T9XB 2P0SA 1MY1A 1VE4A 3MP6A 3OENA 2I48A 3CG1A 3KJ7A 3THIA 5H8NB 4P0IA 3E13X 4QHQA 4OXVA 1JEUA 2GH9A 1EZPA 3QIMA 1P1NA 3QSLA 4LVQA 4JBZA 3PUYE 2F34A 2RINA 1LB8A 1WVJA 4ZZAA 4G8NA 4R6HA 2PMSA 4ELPA 4G77A 2P2AA 2DE2A 5H8NA 5JTYB 1FTLA 5H8SA 2A5SA 3ILTB 1JVYA 3FUZA 4LZ5A 1QW0A 1P1UA 4YMBA 4GLIA 4N13A 1SW5A 5B70A 4GL0A 3KGCA 3EPEA 1MPCA 3MBPA 1MY4A 1IZ1A 2XXVA 4C1UA 3FVGA 3TYHA 4MFIA 4P11A 2RCBA 4L17A 2AL4A 2M8CA 1Y4CA 2DWIA 4EUOA 3PUZE 3VLVA 3V83A 1LFHA 3MAMA 3RT8A 5ELVA 1NNPA 4NF6A 3TTMA 2XXTA 2DE3A 2XXQA 3HSTA 4C1TA 2X7QA 3H6WA 4YZZA 5I59B 2QJEA 3G3GA 4AQ4A 2F8DA 3VV5A 1YPNA 4Z0IA 3PPNA 3B6WA 4F1UA 2H9BA 3O9PA 3C33A 3G3FA 1D3KA 3OELA 1SW1A 5CMCA 5K2XA 3IO6A 4DXCA 5I56A 3IJXB 4FE8A 1MH4A 2I3VA 3MW0A 5I57B 1ZMGA 1P1WA 4G4PA 2HFBA 3O6HA 1B46A 3SETA 3PU5A 3OD7A 1AL3A 1B5HA 3C34A 4ECFA 2D21A 3H6UA 3K0VA 4XXUA 1ZLQA 3T9UA 2YJPA 3R7XA 1VFDA 1FQEA 4PETA 1Z7NE 3UGWA 3PMXA 1T0KA 2UXAA 4GL8A 1NNFA 2REJA 3WAFA 4O3CA 1MXZA 1XC1A 4IY5A 1LCFA 4F1YA 1RKMA 2UVGA 5CRYA 3V89B 3IOTA 3EN3A 1ATGA 3O2AA 1ZIUA 2HCAA 2IA4A 4HCWA 1VFEA 5TP9B 1O7TA 4LUBA 2Q9TA 3PPOA 1B3FA 1FQCA 1NL5A 1B3EA 1ZJLA 3LBSA 3TQLA 4O3AA 3IX1A 2Q89A 2OCUA 3VVEA 1ZBMA 1OQGA 5FHOA 2H5YA 3S2VA 2I4BA 4ESWA 4ND9A 1QUKA 2Y7KA 3IB2A 4IO5A 1M5CA 1EZ9A 3FJ7A 3KN8A 1XHYA 3SDFA 3U94A 3QXMA 1FW0A 2OZZA 4H1XA 1MQDA 4GFRA 1MG1A 1MQJA 4M4GA 3VFJA 1UIUA 2X7PA 1OIBA 4TLLB 5F1QA 4F18A 1B51A 4Q0CA 4U2RA 3PPPA 1UTBB 3L6GA 4PFUA 1MY2A 1AH5A 2RF1A 3PD8A 4KCCA 2ZYOA 1MM7A 3ZKLA 3RQTA 3KN3A 3D4GA 1B4ZA 3Q28A 3VDFA 1NFTA 3R26A 5B7DA 1Q1KA 5AE4A 4RY1A 3TQWA 1URGA 4EQ9A 1MQGA 2F7BA 4I62A 3C35A 3W9VA 3DLNA 4KD5A 3PPQA 1MXUA 3RTFB 3CSBA 3HPIA 3DP8A 3TFLA 3S9MC 4ZEIA 2QMXA 4H6DA 5CI5A 5AA2B 2VD2A 4F2QA 1KWHA 1B4HA 3VVDA 4BDRA 4U23A 2ZNSA 5DVIA 4F31B 4JWYA 3IK6B 2QL3A 2XD2A 3EHTA 3O6IA 4ZE9A 4G68B 4OEVA 1BLFA 2FNCA 2P1SA 4F19A 4HW8A 1FTKA 2G29A 5I2NB 3KSJA 3ECRA 3H3GA 4ESXA 4ZS9A 5I84A 2I58A 4G2ZA 3QK6A 2O69A 3MVYA 5I2NA 4NMYA 5IKBA 4I8CA 4AB6A 4NTLA 3U1OA 2Q88A 2DSFA 2F78A 3RNNA 2QMWA 3UA8A 4OZ9A 3TCHA 2O1MA 1B3HA 4E0WA 4U21A 4OENA 1A40A 2GHAA 3PUWE 5JEIA 1QUIA 2ZYKA 1A54A 2NOOA 1D9YA 1QKBA 3K2DA 1P1OA 3OEKA 1MPDA 3FVNA 2UVIA 5AA4A 5CC2A 1OMPA 3KN7A 2XD3A 4E0XA 1B58A 2DE4A 2ZNUA 3FGSA 5CMMA 1NNTA 2ONRA 1ELJA 4G68C 1LFGA 3RT6B 4KQPA 2YPNA 2DVCA 4YMAA 3MVWA 4QRZA 2QS3A 2NVUB 2I0BA 4EDPA 1FQFA 4PFTA 2DOJA 1SI1A 3T93B 1O63A 3H6VA 1PB9A 1QVSA 3CRBA 1MXXA 2VOZA 1HSJA 3KOTA 2PT2A 4MH5A 3OMBA 4FEDA 3EHSA 3VLUA 1I6BA 4RNSA 1MQIA 4U4XA 4KYEA 2UYFA 2XXWA 3JV9A 4BLAA 3CI8A 2Q2AA 4GXSB 3CVGA 3LSXA 1PB8A 2XXXA 2PBWA 1J1NA 2V84A 2V3TA 3MZBA 4N07A 4ONYA 4UA8A 5KCJA 2XXHA 2I6EA 4RPOA 3M8UA 4NE4A 3KOSA 3RPWA 2OLBA 3MPLA 2V3UA 1JW4A 4TLMB 3C31A 1XOCA 3MPKA 1H3DA 2V25A 1WODA 2VP1A 1SI0A 4YAHX 2F97A 3FV2A 4G8HA 2F7AA 2F7CA 3B6TA 1MDP1 1R6ZA 5EHSA 1QULA 4YKKA 3JZJA 4F3PA 2RC8A 1MH3A 1TWYA 3O66A 5M2VA 3FJGA 1SD3A 1FTOA 5BWJA 3BBRA 5DTBA 4X1BA 3PUVE 5JK4A 3CSGA 1H76A 4F29A 5EHMA 1IXGA 4EF2A 3S9NC 4KI0E 4ZEBA 2I0CA 2HZLA 2D5WA 3QUJA 3MZ9A 3PGFA 1ZTYA 4NF5A 1B1XA 4DIGA 2HAVA 3DP6A 2H25A 1H43A 4JSDA 1N0TA 2REGA 2ONKE 4NF6B 5AA1A 1OVBA 4GD5A 3VXCA 4RA1A 1I6AA 3K6UA 3A09A 4RJZA 4X1DA 3RTWB 3SEXA 3MZ1A 3FATA 3HHFA 4ZE8A 2ALUA 4QFLA 4YB7A 3MQ9A 3CR9A 4ZEKA 4KYSA 3G3KA 1NNKA 4ISUA 1DPEA 5K2YA 3OO9A 4NF8B 4K3FA 4OVJA 1ZKBA 1PB7A 3SESA 1NMUA 4F3GA 4KCDA 1DPPA 5I56B 4RXLA 1IXCA 1MY0A 4Q8RA 3EQ1A 4EXKA 1SYIA 2O68A 3DP4A 3TELA 1CB6A 3OEMA 3SEUA 1FQBA 3W15C 4NF8A 1BIYA 4R9GA 4MF3A 4IO3A 1PBQA 1GVCA 5DYHA 2W7YA 2ZMBA 2UVHA 1AMFA 4FJPA 1II5A 5I2KB 4F22A 4WKMA 3OXNA 4H65A 1B32A 1S50A 1H44A 4GF8A 3RGYA 2B3FA 1BKAA 3TDJA 3AXFA 4X48A 1TXFA 4OERA 5I2KA 2DWAA 1B9JA 5FHMA 3O97A 3V8XB 3JYRA 3HCQA 1JQFA 1RYOA 2X26A 2OBGA 5IAIA 4XKPA 4YKPA 4M1VA 1A8FA 2THIA 3CFXA 1IQ7A 1F9BA 2O6AA 1GR2A 3PUXE 2DYXA 4R72A 1FTMA 4ZECA 2GHBA 4JSOA 2XX7A 4GRKA 4LQ5A 2DP8A 5L8DA 4IO2A 1FQAA 4THIA 5H8QA 4JDFA 3C36A 3H7MA 5KDTA 2AIXA 3GBBA 5CM6A 4YB5A 3TEPA 4YB6A 1Y9UA 3VXBA 2DWHA 1URSA 4FEBA 5ICQA 1GTKA 1POY1 2Z23A 4LA9A 5ITOA 1USYH 3K01A 3FD3A 3MUQA 5CMKA 5H8FB 1A99A 4IO7A 2F6GA 1ZU0A 4IO6A 1B0LA 1R1NA 4U1OA 5AA2D 1JW5A 1N3XA 4GVOA 1M5BA 3E9XA 5H8FA 2ZNTA 3RUMA 3FIRA 5H8HB 2NWJA 3UP9A 3MC2A 2HEUA 4DE8A 2Z8EA 2VD3A 1A8EA 4EQBA 3P7IA 2Y84A 3TTKA 1DSNA 5CBSA 1IIWA 1XT8A 2QS2A 4NF4A 4JWXA 2Z8DA 1MXVA 5H8HA 2OWTA 4TQUQ 2F35A 4R73A 4KHZE 3U8QA 1D4NA 4F1VA 3GZGA 1XS5A 2RKMA 4YU0A 3N6UA 3O6GA 4EF1A 4IB2A 4YICA 4IO4A 1FTJA 2XXPA 4DCYA 1IXIA 3SERA 4DLDA 1B05A 3TAJA 4QFPA 3TUSA 3ILUB 1PC3A 3O29A 1EU8A 4YKJA 1M5EA 4LP2B 2O51A 4OQOA 3TZAA 1N7WA 1OLCA 1JETA 4GXAA 1H45A 1AIVA 4XKQA 5DVFA 3Q27A 4FORA 4F3SA 2NUVA 4R6YA 1PEBA 3CFZA 1SYHA 2Z8FA 2R9JA 3OO8A 4LATA 3G3JA 1B3LA 3PPRA 1OQHA 3IORA 3TMGA 3CG3A 3GBAA 4POXA 3FZVA 1MDQA 1B7ZA 3ONMA 3IR1A 5HPQA 3T22A 4R74A 1YCJA 4JXIA 4FIMA 2ZYNA 4FECA 4EQ7A 1MY3A 1M5DA 2F6PA 2XX8A 4QFOA 3G3HA 2VHAA 1PDAA 5AA4B 4GIZA 1SBPA 2I4CA 1CE2A 2CMOA 2ZXTA 3IL1B 1VR5A 2Y7IA 5A5XA 4R2BA 1A55A 3U93A 3TTNA 2QRYA 3ZSFA 3HV1A 4EXLA 2QPQA 2A5TB 3ZS6A 1I6QA 3C9HA 1LSTA 1JW1A 1PBPA 3K1NA 1GV8A 4XKNA 4RK9A 2DS9A 1YTVA 3N5LA 1VSOA 1LBCA 2ESNA 2A5TA 2XXIA 1NH8A 4PQJA 4HTGA 2HZKA 2NXOA 3H06B 4MBPA 4RPNA 4HCYA 2DWJA 1B1HA 1SW2A 1YAEA 3W9WA 4G8MA 4ELOA 3CFLA 1DMBA 4QFKA 4IY6A 3SEYA 2V93A 4KR5A 5FTIA 3M3FA 5KCJB 4H8JA 3UIFA 2OK2A 5BUUA 2E0SA 2LAOA 2E1SA 3H4ZA 3QAXA 3B7DA 3EF7A 5CBRA 2DXRA 3KZGA 1UIVA 4F39A 4RK2A 5DEXA 4AB5A 1B5IA 3A3CA 4JWOA 3EHUA 3PMVA 3A3UA 1NH7A 4N6PA 5TPAB 2HAUA 5L9SA 4H5GA 2Q2CA 4DDDA 1UTHA 3I6VA 1MXWA 3TODA 4PE5B 3FV1A 1SQYA 2KLFA 3BFUA 5TPAA 2ONSA 4QSEA 4F3BA 3GLBA 3K02A 4BDMA 4NF5B 2F36A 1HSEA 5F7VA 2AYSA 3IOWA 1EH3A 3C32A 3K6VA 1LAFE 2IEEA 3VE1B 1B2HA 1POTA 2AL5A 3HO7A 5FTHA 4BDNA 5FHNA 3TCGA 4H67A 5EYFA 4U1ZA 4P0GA 5JTYA 1TT1A 1LBBA 1MXYA 5ISUA 5I58B 3F11A 4NEDA 2B65A 2H98A 4ZDMA 1IXHA 3HN0A 2O84X 4FAJA 4OFOA 4PFYA 1IUDA 3K4UA 4R2FA 4QFNA 4XIGQ 3I5OA 4LZ7A 1XVYA 4FATA 3Q25A 1Q35A 1A7LA 5I58A 3RLFE 3G7WA 4C0RA 1SDXA 2OJTA 3MP1A 3UN6A 4PFWA 4XKRA 2XX9A 3K6XA 1JEVA 3IB0A 4WXJA 4QSCA 2CZLA 1MQHA 3IAZA 1D9VA 2Z22A 4KPTA 3OSQA 1DTGA 1Y20A 4DXUA 5TU0A 4MLVA 3KSXA 3USDA 1LLSA 4KYDA 2XHDA 3UK4A 2OWSA 4MLQA 1Y1MA 5L9OA 4OMBA 3BKIB 2ABHA 3IOVA 1FCKA 5I59A 1ANFA 4F2OA 1B0HA 4ELQA 3KJTA 2RC9A 3IJOB 3N26A 1N3WA 1TFAA 1P99A 3U72A 3BFTA 3L6HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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