1MXUA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with bromo-willardiine (control for the crystal titration experiments)
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Probing the Function, Conformational Plasticity, and Dimer-Dimer Contacts of the GluR2 Ligand-Binding Core: Studies of 5-Substituted Willardiines and GluR2 S1S2 in the Crystal
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxuA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxuA01
2DWJA 2ONSA 1F9BA 4JWOA 1R9QA 4ZEKA 4NF5A 1N7WA 2F7AA 5FHNA 1MXWA 2FA7A 1EZPA 4LQ5A 5JTYB 4R75A 3ODBA 1OQHA 2H9BA 5H8QB 2AL4A 4KYDA 3UA8A 4O3BA 1FTMA 4AQ4A 2UVIA 4YU0A 3TDJA 1QUKA 3G3JA 1LSTA 1N3WA 5IKBA 3MQ9A 4O3AA 4DXCA 1NH8A 3DP8A 5I2KB 2D3IA 2AIXA 4I8CA 1XT8A 4YKKA 5CBRA 3MP6A 3VXBA 3IOVA 4GQOA 4U21A 1MQDA 4GD5A 4R9GA 2RCAA 4XIGQ 4NE4A 3GLBA 3HO7A 5H8FB 1MG1A 2X7PA 2RINA 5L9OA 2HQ0A 5KDTB 1MPBA 1II5A 4OFOA 5I57B 1GV8A 1A7LA 1PEBA 1MRPA 4KR5A 1H43A 4N07A 2ONKE 1VSOA 2ZYNA 2Y7PA 1EZOA 4U2RA 1MXUA 3F11A 4YMAA 4IO5A 3VDFA 4ONYA 3CFZA 3H3GA 4RA1A 3VLUA 2XD2A 3JZJA 1JW5A 3E4RA 4R6HA 4BDQA 1IQ7A 3PMVA 3QK6A 3ZKKA 5FTHA 4LP2B 1IIWA 4YKIA 4H5FA 1LFGA 3FIRA 2QS1A 4G2ZA 4JB7A 3SEWA 4NMYA 1LBBA 4I62A 3IL1B 3TELA 4IY6A 4U22A 4DZ1A 1RKMA 3BKIB 3KGCA 1AIVA 3N94A 4EUOA 3HN0A 4YB5A 3VV5A 4G68C 2UYEA 4PFUA 2F5XA 4ZE9A 2OBGA 2RC9A 2A5TA 1B7ZA 4KCDA 4ZS9A 2QMWA 5I58B 2Q2AA 3IOTA 4BDLA 2O84X 2G29A 4JWXA 2F6PA 1LGBC 3O6HA 4MH5A 3PUZE 3K6XA 4JDFA 1P1NA 3VVDA 3O28A 3CFLA 2W7YA 1B5JA 2R6GE 2XHDA 4POXA 2GFEA 4G68B 3Q27A 4OYVA 1LBCA 1NNPA 4IGRA 3U94A 1T0KA 1SW5A 4MLVA 5AA4A 1QKBA 3MVZA 3IORA 4Z7EA 2O69A 2DWHA 2X7QA 1N3XA 3QIMA 3ILTB 2Y7RA 1OIBA 3IR1A 3QUFA 1TFAA 2HFBA 2ABHA 3DP6A 4ZEBA 1M5FA 2IEEA 4QFNA 3HCQA 1N76A 3EN3A 1UQWA 2O6AA 3QUJA 3SKPA 3UN6A 1YCJA 4X1DA 2DWIA 3PV0E 1QVSA 4LQ2A 3M3LA 1I6AA 5HM4B 2ZYOA 4NTLA 2KLFA 2XX7A 4RNSA 2VGQA 3KEIA 3MAMA 3DLNA 3EHUA 3MVWA 4C1UA 1B7UA 2DVCA 3B6WA 1SW4A 5B7DA 2DYXA 3IOWA 5DVFA 1RYXA 4NEDA 1YPNA 4RPNA 1QKAA 3HHFA 4C1TA 3H6UA 1ZKBA 1JW1A 3PMWA 1VFDA 1JETA 5TPAA 1EU8A 1LAFE 5M2VA 2DP8A 4EXKA 1MDP1 2F36A 4EDPA 2Y7KA 1LCTA 2PX1A 5A5XA 1MQIA 1B4ZA 4ZECA 3I3VA 1YAEA 5FTIA 4GF8A 3IB0A 1DPEA 4H6DA 3CSBA 4Q5TA 1JEVA 2Y7WA 2RCBA 3FXRA 3MZ1A 3T66A 1Q1KA 4XKPA 1LB8A 4F31B 4ZEIA 3PU5A 1NH7A 1PB7A 4QFLA 3OSRA 2Y84A 1MM7A 3K02A 3TCHA 4X48A 4F2OA 1J1NA 5AA2D 3QSLA 5ISUA 2LAOA 5KCJA 3MUQA 4OHNA 3K1PA 2ZXTA 4G8MA 3VFJA 5BWJA 2YLNA 3TCGA 4H5GA 1Y4CA 3T93B 4I9DA 4DDDA 4F29A 4F2QA 2D5WA 2I0BA 3O9PA 3OO8A 3RUMA 1QW0A 2CMOA 1P1QA 3MVYA 3S2VA 4OTEA 5CM6A 2NWJA 5I59A 1MY1A 1UTHB 5EHMA 2Z22A 4NF6B 1B1HA 4H1XA 3C9HA 1DSNA 2DVZA 5B70A 1B4HA 5DEXB 4ZEDA 1ZMGA 4LZ7A 1Z7NE 3K1NA 2I6EA 5FHMA 3TKDA 3BBRA 4DCYA 2O1LA 4H8JA 1M5EA 1JEUA 4C0RA 3PUXE 1VE4A 3KSXA 4IB2A 2V3TA 2A5SA 2FNCA 4ELRA 4GRKA 2GHBA 1QJMA 3TFLA 4R6KA 1FTKA 3TPAA 1BP5A 2XXVA 2REJA 1UIVA 3DM0A 4XKRA 1B0LA 1DTGA 1FTOA 2O68A 2G93A 2Z8FA 3TTNA 1B3EA 5DYHA 2F97A 1FCKA 2V3QA 3FJGA 1JNFA 3B7DA 4NF4A 5L9SA 2BJJX 4YB6A 4PFTA 3V8XB 1EH3A 1CB6A 4F22A 3A09A 5H8HB 4N13A 5FHOA 1A8EA 3GBBA 1SW1A 2V3UA 4ZZEA 3O2AA 4FEBA 4OFLA 5JEIA 4F1YA 3S9MC 3SDFA 4ELOA 3CFXA 1TFDA 4F3GA 3MC2A 1US4A 4F1VA 3G3GA 1H3DA 2RC8A 2I3VA 4N6PA 5H8NA 1I6QA 3USDA 2M8CA 1N84A 1JVYA 4L17A 3T22A 3G3FA 3KOTA 1FQFA 1B2HA 2R9JA 2HXWA 1WODA 3CI8A 4POWA 3KFMA 3K1MA 1ZLQA 3LSLA 4RYAA 2F6GA 3TODA 1ATGA 3B6QA 1HSJA 3W9WA 2OWSA 3RT8A 3C34A 4QF9A 2I4CA 3K6VA 4IO3A 4PP0A 4IO6A 3TTKA 2HEUA 3U93A 5JTYA 1AH5A 3WAEA 4F3SA 4RK2A 3ZSFA 4IO7A 5I2NB 4U23A 3KBRA 1A8FA 2B65A 4HS7A 5H8QA 1NNTA 5ICQA 2CZLA 3T9HB 2YPNA 2XX8A 3IB2A 4OEVA 3RTFB 5ITOA 4QSCA 3K4UA 4HTGA 3H7MA 3S9NC 2ZYMA 3RGYA 2DXYA 5I2KA 1B3FA 1I6BA 3VLWA 2RKMA 2GHAA 3UGWA 3TTMA 3K6UA 5CI5A 1Y9UA 1SYIA 1YTVA 1D9VA 4G4PA 3ECRA 1MY2A 3MZBA 3IO6A 1H45A 3LUYA 4M4GA 5H8FA 5J1DA 3PPRA 4KYSA 2XXQA 5KDTA 3OO9A 1MY0A 3VLVA 2V84A 2B3BA 5I57A 4OESA 4QHQA 3RT6B 1FQBA 3RPWA 3VE1B 5CMCA 1S7YA 3EPEA 1RYOA 1B32A 3OSQA 4OMBA 1B6HA 3Q26A 5TP9B 1BIYA 4F18A 3M3KA 1Z7ME 4KFQA 3Q28A 3IAZA 4QRZA 2UYFA 1R9LA 3MJNA 1N7XA 5DVIA 2OK2A 1MXXA 2THIA 1QUJA 1GVCA 5DT6A 3RTWB 1LFHA 2Q89A 3OENA 3C4MA 1BTJA 2HCAA 3S4UA 1B3HA 1D3KA 4H67A 3MPLA 4OZ9A 3IO4A 2XXIA 1BKAA 2XD3A 2Z8EA 3G7WA 3E9XA 4G8NA 3U8QA 3GXAA 4R6YA 3MP1A 2DOJA 1MXZA 3I6VA 3C35A 2PT1A 4P11A 1PB8A 5AA1A 3FGSA 2H25A 3H6TA 3D4CA 4JXIA 3W9VA 3CIJA 3EHSA 1O7TA 1P1WA 4F3BA 1XVYA 1US5A 2Z8DA 2IA4A 2GRVA 5I58A 3T9UA 2O7UA 3SEUA 2DE4A 3TTLA 1A55A 3MWBA 2P0SA 1R1NA 3VVFA 1UTBB 3K01A 1MH3A 2AL5A 3U1OA 1LLSA 4THIA 3PD9A 4MLQA 3M3FA 3UP9A 4FE8A 2F34A 3FD3A 4R2FA 1IEJA 4OWDA 3S9LC 1FTJA 3TUSA 1B3LA 2XXWA 3O6IA 3TEPA 2ANJA 1MPDA 1B0HA 4DIGA 1Y3PA 3H4ZA 4Q30B 1PBPA 4Q0CA 4GXAA 4OERA 2UVGA 3FJ7A 3IB1A 2XX9A 5ELVA 5I84A 3PUVE 1SI1A 1O63A 3OEKA 3IX1A 3BFTA 3N5LA 4YKPA 4WEDA 4YZZA 3UORA 5EYFA 1B40A 3OMBA 4I1DA 4WKMA 1MXVA 1AL3A 3PUWE 3RY3A 4U1ZA 3D4GA 4RPOA 5AA2B 4H0WA 4XKQA 4KPTA 4JWYA 4JBZA 1EZ9A 3CG1A 3H03A 1OQGA 1TT1A 1LAHE 3FVNA 2QS2A 3TMGA 4BLAA 3VVEA 4PE5B 4EF2A 1MQJA 4G8HA 2HAVA 2QS4A 5CBSA 4LVQA 1B7HA 5CRYA 5L8DA 5CC2A 4R73A 4MF3A 4ELPA 2O1MA 1DMBA 3CG3A 4Z0IA 1Q35A 1NFTA 3SESA 2VOZA 4M1VA 4FECA 5HBCA 3G3HA 3A3UA 3H6WA 3HHGA 1R6ZA 4KD5A 1H76A 1D4NA 4YICA 1A54A 2NUVA 3ILUB 5DVJA 1Y4TA 3EQ1A 5CMKA 4MFIA 2VHAA 3IOUA 5I56B 2OLBA 2PMSA 3FASA 3TZAA 3FVKA 1GGGA 4TLLB 4QFOA 1SQYA 1SYHA 2Q8JA 4IO4A 1HSLA 3A3CA 3FXUA 4YAHX 1FW0A 1MS7A 4ZZAA 2PYYA 2WKYA 3AXFA 3FV2A 4TLMB 3TYHA 4ND9A 1Y1ZA 1B58A 2F35A 1S50A 4P0IA 3PUYE 1IUDA 3M8UA 3CVGA 4PFWA 2VD3A 3FVOA 1USYH 1UTHA 3W15C 3V83A 2H5YA 4NF6A 1JVXA 3QXMA 2E1SA 4PETA 3R26A 4NF8B 5DEXA 2F78A 1N04A 1JQFA 4OFJA 2I4BA 4DCXA 4GL0A 3SETA 4U4XA 4ELQA 2AYSA 4U4SA 3OXNA 4FATA 2OJTA 2Y7IA 1SI0A 1XC1A 1Y20A 4NF4B 3OEMA 1DOTA 4ZDMA 3PPPA 3UK4A 3EF7A 3V89B 2DQVA 3TAJA 4KYEA 4UA8A 3TTRA 4YKJA 1B9JA 3L6GA 1KWHA 4ISUA 2RF1A 3MPKA 4ESWA 1XOCA 3CR9A 2QRYA 3IJXB 2P1SA 4U1OA 5H8HA 4P0GA 4OVJA 3TQLA 1DPPA 2I49A 5EHSA 2PVUA 1N0TA 2FYIA 3RLFE 4NF5B 3LC8A 1P1UA 5LOMA 2F7CA 4YMBA 4QFKA 2HAUA 2XXPA 1SBPA 4FEDA 5ITPA 1SD3A 1DTZA 2ESNA 2X26A 3FXQA 3PMXA 4XXUA 1B3GA 2QMXA 3CSGA 2V25A 5ICTA 3TQWA 4R74A 1PC3A 3JV9A 2XXYA 1BLFA 1ANFA 4GIZA 3ZS6A 3R6UA 2OZZA 4F1UA 3E3KA 5DTBA 3SEYA 5I2NA 4ZE8A 1MM6A 1MDQA 4LA9A 1GR2A 3IK6B 3DELB 4O3CA 2B3FA 2QL3A 1OLAA 3T9XB 3PD8A 3U92A 2I3WA 1D9YA 4YB7A 1LB9A 3K2DA 2DWAA 3U72A 1M5CA 3FJMA 4R72A 1B46A 3KN8A 1B05A 3K6WA 2QPQA 3OO6A 1PDAA 1WVJA 5F7VA 2VD2A 3T9VA 3OD7A 4RJZA 4IY5A 5KZTA 3GBAA 1CE2A 2H4IA 1NNFA 4OETA 3C32A 5K2XA 3WAFA 3KG2A 4F39A 4IO2A 3SEVA 3FUZA 4GOTA 4EXLA 1TWYA 2ZNTA 4GVOA 1SW2A 5TP9A 1OLCA 3H06B 4HCWA 3KN3A 2P2AA 3MVXA 4QSEA 3H6VA 1LCFA 3PPNA 1MQHA 3MP8A 1FTLA 4EQ9A 2O7IA 1OVTA 4QFPA 4DXBA 3N26A 3K0VA 2Q9TA 1IITA 1M5BA 1XHYA 4OENA 2A5TB 1VFEA 3LBSA 4GWOA 1JW4A 4X9TA 3RNNA 3LSFB 3MZ9A 2NVUB 1A99A 1OVBA 5HPQA 1B5IA 1ZU0A 1LAXA 2RC7A 2DXRA 1XS5A 2D21A 1NL5A 2H98A 3KJ7A 3O6GA 2HZKA 4R2BA 1URDA 4DLDA 1IXIA 4F3PA 3LR1A 3KJTA 5JK4A 4F19A 1SDXA 4IGTA 1HSEA 3C36A 2O51A 4H65A 3PPOA 4LZ5A 1H44A 2E0SA 5AA4B 3N6UA 1P1OA 4E0WA 3N6TA 4DXUA 2ZMBA 3GZGA 3ZKLA 4XTCQ 4G68A 4BDRA 1URGA 4RK9A 4GLIA 3QAXA 1Y3QA 2QJEA 1UTBA 2ONRA 3KSJA 2QSXA 4WXJA 2I58A 2Q88A 1LFIA 3RQTA 4UACA 5IAIA 3FZVA 5BUUA 1AOVA 3VXCA 1ZBMA 3P7IA 4RXLA 2I48A 4WEPA 3OOAA 3THIA 3G3IA 3I5OA 2UXAA 3OO7A 4TOZA 5K2YA 1MY3A 4BDNA 1WDNA 1B5HA 1Y1MA 1IXGA 4GFRA 1MY4A 3HPIA 3C33A 5TPAB 1TXFA 3EHTA 2DSFA 3DP4A 1NMUA 3IJOB 4ESXA 4AB6A 3FATA 1POY1 3G3KA 5CMBA 3V5AA 5A5XB 3CRBA 2GH9A 4GL8A 2V93A 5AA2A 3K00A 1UIUA 1M5DA 4JSDA 4NWDA 3HSTA 1MQGA 4BDOA 4HCYA 2OCUA 4FORA 1LAGE 1O64A 1IXCA 3JYRA 2Q2CA 1MH4A 3LSXA 4OEUA 4KHZE 3UIFA 1FQDA 1ZIUA 1ELJA 4OQOA 3PGFA 4LATA 4BDMA 3MW0A 2UVJA 2OWTA 2NXOA 4NWCA 1MPCA 4H8IA 4KI0E 2H99A 1QUIA 2ZYKA 2PBWA 5L9MA 5KCJB 4K3FA 4DE8A 2XXRA 4GXSB 5CMMA 3T96B 4OXVA 2ALUA 3LSWA 1FQCA 2HZLA 4MBPA 3ONMA 3E13X 1OMPA 3Q25A 4ZEFA 1NNKA 1IZ1A 1P99A 2DE3A 1B52A 4JSOA 4KCCA 5TU0A 5I59B 1MXYA 2REGA 5H8SA 4TQUQ 3QYTA 4LZ8A 2PT2A 5I56A 3C31A 4HW8A 1B1XA 1VR5A 1GTKA 1NKXA 3FV1A 1FQAA 2XXXA 4EQBA 1B51A 3S9EA 3OELA 1ZTYA 2UVHA 4R9FA 2QS3A 3O97A 4XKNA 3FVGA 4PQJA 2ZNUA 2F8DA 2R71A 2XXUA 1PB9A 3KOSA 3HV1A 4FIMA 4FJPA 4QSDA 1POTA 1I69A 1XVXA 2I0CA 2DS9A 1QULA 5AA3A 1Y3NA 3BFUA 1A40A 3TCFA 3KZGA 1S9TA 1URSA 1L5TA 3O29A 1SVXB 4NF8A 4KQPA 4AB5A 4FAJA 4LONB 4ECFA 1ZJLA 1IXHA 4X1BA 1FQEA 2NOOA 2ZNSA 3R7XA 2VP1A 2XXTA 3KN7A 4RY1A 4Q8RA 2DE2A 4EQ7A 2XXHA 3B6TA 2YJPA 4G77A 4EF1A 5F1QA 5AE4A 3SEXA 5H8NB 2Z23A 3PPQA 4E0XA 3O66A 4LUBA 1AMFA 2F7BA 1USYE 3L6HA 1PBQA 3MBPA 3Q29A 4PFYA 3SERA 3RN8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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