1MXUA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with bromo-willardiine (control for the crystal titration experiments)
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Probing the Function, Conformational Plasticity, and Dimer-Dimer Contacts of the GluR2 Ligand-Binding Core: Studies of 5-Substituted Willardiines and GluR2 S1S2 in the Crystal
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxuA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxuA01
3RY3A 3PPOA 4LUBA 2QPQA 3C33A 1NFTA 3C32A 3O6GA 3T66A 3E9XA 4N07A 1PBPA 5DT6A 1LBBA 1MH4A 1MXYA 4ZE8A 4F29A 2DXYA 4NF5A 3CR9A 2Q8JA 2QMWA 3H4ZA 2QS1A 4R9FA 1H45A 4R6HA 3G7WA 2F8DA 1UIVA 3FJ7A 1I6AA 5I84A 2RC9A 3I6VA 1SYIA 4GIZA 3FXQA 3VV5A 5AE4A 4F2QA 3RTFB 1B4ZA 2Z8FA 3BKIB 3K6VA 1SW4A 5DVIA 2O7UA 4JWYA 2OWSA 2A5TA 5EHSA 3UORA 1MXWA 3TTMA 1BLFA 4POXA 4QF9A 2CMOA 1L5TA 3RNNA 4OMBA 5H8FB 2XXVA 1KWHA 4R75A 5F7VA 1SDXA 3FD3A 1P1QA 3U1OA 1B6HA 4MFIA 2F7AA 3FXRA 3GBBA 2Q2AA 1SW5A 4NE4A 4Z7EA 1LGBC 3CFZA 2ESNA 2F35A 3TTKA 3C31A 3K1MA 4FE8A 4P0GA 5L9OA 4DIGA 3THIA 2X7QA 4ELQA 3MUQA 1HSLA 2ONSA 1MQDA 4BDOA 4GLIA 3KOTA 3QIMA 2V84A 3JV9A 1TWYA 3R7XA 5K2YA 3JZJA 3SEXA 3EF7A 1RYOA 1B4HA 1JEUA 3MW0A 3OEKA 2XXHA 3G3IA 3MZ9A 4ZECA 3RTWB 2HFBA 1MQHA 3KG2A 1FTOA 5KCJB 1OIBA 1JW4A 4WKMA 3K6WA 4FECA 4UA8A 4YKJA 1VE4A 4ELRA 2UXAA 1Z7NE 4F39A 3H6VA 3MP6A 4BDRA 4H67A 1GVCA 1R9QA 4X1BA 1EZOA 3IORA 3SEVA 4OERA 3FIRA 4RJZA 4PE5B 3KSXA 4QSCA 2I49A 1FQBA 3O6IA 3VDFA 3MZBA 3VFJA 2Q2CA 4POWA 4E0XA 4RPOA 3FV2A 4BLAA 1D9YA 5CRYA 1YCJA 2OCUA 1N7XA 3T9HB 4BDNA 4YAHX 3VLUA 4JSOA 2Y7PA 2D3IA 1AIVA 3KFMA 1ZLQA 1FTKA 4C0RA 5TU0A 5DYHA 3OELA 1B3HA 1B1HA 1DPPA 1A99A 2DWHA 2Y7WA 3PUVE 3O97A 2REJA 4ZE9A 4DE8A 2NWJA 4OEVA 3VXCA 1LAHE 3IOUA 4PETA 2QS3A 4ZS9A 3GXAA 1B3EA 1LLSA 1B52A 1MY3A 5DTBA 2RC7A 3PUZE 3HO7A 3DM0A 4HS7A 1R1NA 3B6QA 1DOTA 1MQIA 4GVOA 2WKYA 1BP5A 1JETA 1NMUA 3O9PA 2O84X 4KHZE 2V93A 4U21A 1SBPA 4E0WA 1MXXA 2HCAA 4QFPA 1LSTA 3H6WA 1T0KA 3ILTB 2ALUA 4ELOA 2A5SA 1B5JA 1IXIA 2KLFA 5H8HB 3MVYA 4G77A 4RK9A 2DXRA 2REGA 4OWDA 1NL5A 1XOCA 2NUVA 1MY2A 4TQUQ 4MF3A 1FQAA 2XXRA 1N3WA 4M1VA 2GHAA 2HEUA 2V3QA 1S9TA 1LAFE 3TPAA 5CBRA 3GZGA 3Q29A 4FEBA 2O51A 1GTKA 4H5FA 3TEPA 1Y1MA 2CZLA 3OD7A 4FJPA 5H8FA 2NVUB 4U1ZA 1MQJA 4H8JA 1UQWA 3CSBA 4KPTA 2RCAA 2XXUA 4OYVA 3MPLA 2XXTA 4F18A 3K1NA 3UN6A 1PB9A 3FUZA 3G3KA 3I3VA 5CMBA 2FNCA 3MAMA 4GF8A 1UTBB 1MY4A 3OO9A 3MJNA 4F1UA 3DELB 2XXYA 5ITPA 3V8XB 2XXXA 5FTHA 4KD5A 5I57A 3VLVA 4Q8RA 5CMMA 1IITA 3E13X 5H8QB 2H99A 1SI0A 5CBSA 3ECRA 5TPAB 1H44A 3MZ1A 5KCJA 1J1NA 3AXFA 2PX1A 3ZSFA 3FJMA 4GL0A 2DOJA 2V25A 3TZAA 4X48A 1FCKA 4AB5A 2DQVA 1MXVA 4R9GA 2ZYMA 3N26A 2ZYKA 5AA2B 3OSRA 2F36A 3HCQA 4I62A 1EZ9A 5IKBA 3RGYA 3TCFA 3R6UA 4HTGA 2GRVA 3FVNA 4MBPA 4HCYA 2PBWA 4QFOA 1A8FA 3H3GA 2Q9TA 2VD3A 5JTYB 3TCHA 2I6EA 3PUYE 3JYRA 2Y7RA 5L9MA 2UVJA 4C1UA 4ZEDA 3FVKA 5KDTB 4XIGQ 4GQOA 4U1OA 3G3FA 2XXIA 1BKAA 3T9VA 1OLAA 4QHQA 4HCWA 1GV8A 4O3BA 4ESWA 5CC2A 2THIA 1XVYA 3KJ7A 1Y9UA 3ZKKA 3EN3A 2F7BA 2QS2A 3N5LA 1ZIUA 4U4SA 4ZEFA 4YICA 1SI1A 3M8UA 2FYIA 1CE2A 3R26A 4R6KA 1Y3PA 2RINA 4G68B 3VXBA 4F1VA 2OZZA 2O68A 4XKQA 3S9EA 1POY1 4OESA 2O7IA 4RK2A 2B65A 3TQWA 3S9MC 3V5AA 4PP0A 1EU8A 2XX9A 3IJOB 2HAVA 2HXWA 1AMFA 3FGSA 2Q89A 5BUUA 2Z23A 3D4CA 3Q25A 2BJJX 3OO6A 4O3AA 3C35A 3KN8A 3PMWA 3M3KA 5FTIA 1MH3A 5H8HA 2GH9A 3UIFA 3EPEA 4OXVA 1XT8A 3PMXA 4JSDA 4PFWA 1D3KA 3BBRA 3FXUA 2I58A 3U93A 2AL5A 1IXCA 1OQHA 2PVUA 1LBCA 3U72A 4IO3A 2V3UA 2ZNUA 3HSTA 5BWJA 4Z0IA 2AL4A 3OOAA 4JDFA 4DXBA 3I5OA 5CI5A 3LBSA 5ICTA 2ZNSA 4IO2A 1Y4TA 1OVBA 1ZU0A 4KI0E 5B7DA 4N6PA 3W9VA 2UVHA 4ISUA 2P1SA 4IO6A 3SDFA 3OSQA 1MG1A 3RQTA 3KZGA 4JXIA 5L8DA 1URGA 3CFLA 1QVSA 2I4CA 5A5XB 3O29A 2F6PA 3IB0A 4OTEA 2B3FA 2ZYNA 2HZKA 5I59B 3EHUA 5I2KB 2YLNA 5B70A 4F3GA 3SESA 3QK6A 1PC3A 1LFHA 1DSNA 3OXNA 3QAXA 4U2RA 1UTBA 5DVJA 1MY1A 1RYXA 1ZJLA 1S7YA 3HV1A 4ZEKA 3FJGA 5HM4B 3T96B 4BDLA 3GLBA 4QSEA 1ATGA 3DP4A 5I58B 5H8NB 2XX8A 1IZ1A 2ONKE 1A8EA 4R6YA 3FZVA 4RYAA 3KSJA 4EXKA 4OZ9A 4NEDA 3M3FA 5TPAA 4UACA 3MP8A 3FASA 4TLLB 3G3GA 3E4RA 1N0TA 2VP1A 3K1PA 2I48A 3TMGA 4RNSA 3WAEA 1B9JA 3PPNA 4IGTA 4XTCQ 5AA2A 3KBRA 1DTGA 4FIMA 2Q88A 1LB8A 1B7UA 3H06B 3EHSA 2QS4A 4F31B 3PPRA 4R2BA 2ANJA 3TAJA 2HAUA 1IXHA 4IY5A 5JTYA 3KEIA 3Q27A 4DCYA 2GFEA 3DP6A 4DZ1A 3KN3A 2VGQA 2DYXA 1LAXA 5KDTA 1Y3QA 3OEMA 5AA4B 2IA4A 4XKPA 3O66A 4NMYA 1PB7A 4QFLA 4LZ7A 2F5XA 2B3BA 3TQLA 4ZEBA 4H5GA 3IAZA 1XHYA 3HPIA 4I1DA 4OQOA 1B3LA 1FQEA 3IOTA 5ITOA 2YJPA 4LQ5A 3CFXA 2RC8A 1MS7A 3VVFA 4PFYA 4G8HA 3DP8A 2ZXTA 3LSLA 3M3LA 2QMXA 1D9VA 3IOWA 4RPNA 2O1MA 4G68A 1B32A 4TOZA 5TP9B 4K3FA 1XVXA 3SKPA 2O6AA 2HZLA 3EQ1A 1FQCA 1DMBA 3IJXB 2RCBA 3TKDA 2OWTA 5I2NB 1B1XA 1QUKA 2R71A 3OO8A 1B51A 1Y3NA 2A5TB 1IXGA 4RXLA 3LSFB 2F6GA 4OENA 4H8IA 2PYYA 3QYTA 2M8CA 4PQJA 1UTHB 4G8NA 1N76A 1CB6A 3O6HA 2DE4A 1US5A 4DCXA 2ABHA 2VHAA 3C36A 4JWOA 3HHGA 2DWJA 1IQ7A 4IGRA 1JW1A 1FQDA 3UA8A 3K00A 5CMCA 4ZZEA 1MPCA 1DTZA 1R6ZA 2XXWA 3KGCA 3G3HA 2AIXA 2UYEA 3RT6B 1LFIA 1QJMA 2XHDA 4JWXA 1US4A 3H6TA 3IK6B 5EHMA 1P1OA 1WVJA 3U92A 3FVGA 2P2AA 1MPBA 1MY0A 1GGGA 1MM7A 1NKXA 3HHFA 1A7LA 4NF6B 1FTJA 1ZKBA 1H3DA 3N6TA 1BTJA 5I59A 1M5DA 2NXOA 1LB9A 2O69A 1II5A 1VFEA 3QUFA 4EXLA 1H76A 5I2KA 1OLCA 5L9SA 1YAEA 5F1QA 1B5IA 3PU5A 4L17A 1MPDA 4PFUA 1FTMA 2ONRA 3KJTA 3PMVA 4YU0A 1SYHA 1Y4CA 2UVIA 3MWBA 5I58A 3K0VA 1URSA 4OFJA 2W7YA 1WDNA 2Y7IA 1B58A 4ZEIA 3LC8A 4H6DA 2OK2A 4OFLA 3TFLA 1P1NA 4DXCA 4XXUA 3VLWA 2V3TA 1R9LA 3S9LC 2Y84A 1TT1A 4X1DA 4XKRA 2DWIA 3PD8A 2OLBA 2PT2A 4P0IA 2HQ0A 5M2VA 1N7WA 1NNKA 1JQFA 2F34A 1AOVA 3W9WA 4F3PA 1YPNA 3DLNA 1N84A 1QUIA 1MDP1 4EQBA 2IEEA 3FVOA 4THIA 2FA7A 4FEDA 4IB2A 4YB6A 1A40A 2Y7KA 1ELJA 2OJTA 4RY1A 4KR5A 4BDMA 4I8CA 2Z8EA 4YKPA 1H43A 5AA4A 1USYE 1NNFA 3CRBA 2F97A 1AL3A 3U94A 1POTA 2F7CA 3UGWA 2ZYOA 1NH8A 5CMKA 1N3XA 2NOOA 3QUJA 4WEDA 2XXQA 2LAOA 2Z22A 4LONB 4R2FA 4KYSA 4G68C 3SEWA 4ELPA 2H98A 4KQPA 2QRYA 4IO5A 1LCFA 1M5EA 2H9BA 3QXMA 2G29A 2P0SA 1ZTYA 5FHMA 4R72A 1B3FA 5HBCA 5TP9A 4FATA 2PT1A 2DWAA 1BIYA 3ONMA 1ZBMA 2XD2A 3TODA 3S4UA 2I0CA 1OQGA 1FQFA 3B7DA 4FAJA 4HW8A 3MP1A 5I2NA 1B5HA 1NH7A 1USYH 4FORA 1XS5A 2DVCA 4KCCA 5JK4A 2XX7A 4GWOA 5K2XA 4KYDA 1B7ZA 5DEXB 1A55A 1UTHA 1O7TA 3BFUA 4MLVA 4ECFA 3H03A 3TDJA 4TLMB 4F2OA 1B40A 3USDA 1UIUA 1M5CA 3B6TA 4YB7A 3RN8A 3UP9A 3IOVA 1B7HA 1ZMGA 1TXFA 1DPEA 5FHNA 3N94A 4R74A 4OETA 3G3JA 1B46A 5AA2D 3P7IA 1HSEA 1FTLA 1PBQA 2ZNTA 1Q35A 5ICQA 1QUJA 3QSLA 3H6UA 5I57B 3T93B 4YKIA 3HN0A 1IIWA 1B0LA 1JNFA 1SW2A 3V83A 1EZPA 2E1SA 4NF6A 4IY6A 4PFTA 3RPWA 4OFOA 3RUMA 3C34A 4NF8B 4N13A 1HSJA 4OHNA 2DE2A 2VOZA 5H8QA 3H7MA 3UK4A 4YMAA 4ESXA 4NF4B 1A54A 1LFGA 4F3BA 1Y1ZA 2H4IA 2R6GE 2QL3A 5EYFA 3K6UA 4EF1A 2DS9A 4F22A 1JEVA 4YZZA 3SETA 4GD5A 4OVJA 3KOSA 3U8QA 5I56B 3IR1A 1MQGA 3K6XA 3W15C 3IX1A 4LZ8A 4X9TA 4IO4A 3ZKLA 1B3GA 3TUSA 3LR1A 4AB6A 1I6QA 3ILUB 3CI8A 3MQ9A 2VD2A 4NWCA 4LQ2A 1P1UA 1MRPA 3RT8A 4LP2B 1VR5A 4KCDA 5DVFA 3VVDA 2YPNA 1MXUA 3TYHA 2I3VA 4JB7A 2G93A 2UYFA 2QJEA 3B6WA 3L6GA 5HPQA 1VFDA 3KN7A 2GHBA 1P1WA 1FW0A 3TTLA 4QRZA 4BDQA 1D4NA 1B05A 1PDAA 3CG3A 4G8MA 3OO7A 4DDDA 4NF5B 3PUWE 1JVYA 3IO6A 2QSXA 3S9NC 3LSWA 3S2VA 5AA3A 3CG1A 1TFDA 3MPKA 4LZ5A 3CVGA 2X7PA 1PEBA 5AA1A 1ANFA 4GXAA 3Q26A 1S50A 1NNPA 4DLDA 4LVQA 3VE1B 1SQYA 1TFAA 1VSOA 1SVXB 1XC1A 3BFTA 4ZDMA 4RA1A 3O28A 3WAFA 4F19A 1LCTA 3A3UA 4Q5TA 1OMPA 4IO7A 2XD3A 3T9XB 3TELA 4QSDA 1QKAA 3K02A 1N04A 1O63A 3GBAA 1F9BA 2H25A 3V89B 3A3CA 3FV1A 3TTNA 3PV0E 3TCGA 1PB8A 1P99A 4WEPA 2O1LA 2I0BA 1NNTA 1I69A 5DEXA 1JVXA 4GOTA 3N6UA 1QULA 5CM6A 2UVGA 4O3CA 3E3KA 1SD3A 3Q28A 3LSXA 4AQ4A 3C9HA 4DXUA 4MLQA 4H1XA 5ISUA 3MVWA 2X26A 4F1YA 2F78A 1I6BA 4YB5A 4QFNA 3K2DA 5A5XA 2DVZA 3PPQA 2AYSA 1RKMA 3MVZA 2E0SA 3TTRA 4C1TA 4QFKA 4MH5A 2DE3A 2H5YA 1URDA 4LA9A 3IB1A 4R73A 4YMBA 3EHTA 2R9JA 3SEYA 4NTLA 3CSGA 5LOMA 3LUYA 1YTVA 3IB2A 3T22A 4XKNA 4H0WA 1M5BA 5JEIA 2I3WA 1QKBA 4G4PA 3RLFE 4U23A 5H8NA 2ZMBA 1QW0A 3K4UA 3F11A 1M5FA 1MM6A 1LAGE 4WXJA 4M4GA 4NF8A 1Y20A 4U22A 4ND9A 4KFQA 2D21A 3PPPA 2RKMA 4U4XA 1WODA 4JBZA 3SEUA 3K01A 4NF4A 4YKKA 1OVTA 2PMSA 3ZS6A 5H8SA 3C4MA 4GRKA 4H65A 1SW1A 3O2AA 4EQ7A 3IO4A 4P11A 3FATA 3IL1B 5IAIA 3OMBA 2D5WA 1AH5A 4EDPA 4ONYA 1IUDA 1IEJA 1EH3A 2Z8DA 2DSFA 3MVXA 4GXSB 5ELVA 5I56A 4G2ZA 4Q30B 4KYEA 3A09A 5J1DA 5KZTA 4EQ9A 4OEUA 4GL8A 1B2HA 2DP8A 1Z7ME 2OBGA 3D4GA 3VVEA 3ODBA 4LATA 3PD9A 4I9DA 3PUXE 4Q0CA 4F3SA 3SERA 1O64A 1MDQA 1JW5A 2I4BA 4EUOA 4NWDA 1Q1KA 3OENA 1GR2A 3T9UA 5FHOA 3PGFA 2XXPA 3MBPA 2RF1A 4GFRA 3MC2A 1MXZA 1B0HA 4ZZAA 3L6HA 4EF2A 3CIJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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