2QS4A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core dimer in complex with ly466195 at 1.58 angstroms resolution
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
SNRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Binding site and ligand flexibility revealed by high resolution crystal structures of GluK1 competitive antagonists.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 77
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs4A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs4A02
4POXA 3PPNA 1USYE 2A5TB 1SD3A 3CSGA 3MZBA 4OETA 2P2AA 4R9GA 2H25A 3EHTA 3TTRA 4WEDA 2QSXA 3FXUA 1Z7NE 4F29A 1BIYA 3Q27A 3FXRA 4OXVA 4JWXA 4H8JA 4FEDA 3N94A 5AE4A 4Q8RA 3S9NC 4G68C 2XXXA 2XXQA 2I0BA 4QF9A 4R6YA 1NNPA 1ZBMA 4TQUQ 4DDDA 1B5JA 3IK6B 2Y84A 5CMKA 1NKXA 1FQDA 3TFLA 1AOVA 1MPCA 1QW0A 1XHYA 1LLSA 4Q0CA 1QJMA 1IXGA 2F8DA 4XTCQ 4DCXA 1TWYA 5F7VA 3Q29A 1B32A 4IO7A 3CG3A 3SEUA 4P0IA 4ZS9A 1I6BA 3HV1A 1NMUA 3GBBA 4RNSA 4RPOA 3WAFA 4F3SA 4I9DA 3G3GA 3RUMA 4H0WA 4U22A 1B4ZA 1FQAA 5AA3A 3MW0A 2PX1A 3KGCA 3OO7A 4ISUA 4H6DA 2I49A 1VSOA 4DCYA 3C4MA 2AIXA 1P1NA 2XXRA 2KLFA 2Q8JA 1SVXB 4K3FA 5I2KB 1SI0A 1II5A 2ZYMA 3M3LA 4KI0E 5DVIA 3U92A 1GR2A 1TFAA 3UIFA 3U8QA 2GHAA 4KPTA 4OWDA 4G2ZA 1OQHA 3CFZA 3BFUA 3SERA 5DVJA 3EN3A 5TP9B 4FEBA 5KDTB 1BP5A 1J1NA 5LOMA 1POTA 2XXVA 4RY1A 3V83A 3T96B 5FHOA 1MY3A 4GIZA 3LSXA 3BKIB 3A3CA 4R73A 2Y7KA 4U23A 2DYXA 4MBPA 3PUWE 3KJ7A 4LP2B 2Z23A 2NOOA 2OBGA 3T22A 3TTNA 2P1SA 1QUKA 1Y4TA 3H6TA 4U4SA 1ATGA 2H98A 4PFYA 3KOTA 4PE5B 1IUDA 3KSJA 1US4A 3L6HA 4O3BA 1D9VA 1POY1 1AMFA 1ELJA 2XD3A 1FTJA 1P99A 4HTGA 1SYIA 3DP4A 4UA8A 3RT6B 4R2BA 2F36A 3CFXA 2UYEA 4OHNA 1B3EA 1JW1A 4BDMA 3EPEA 1R1NA 3SEVA 3RT8A 2CMOA 3K6WA 3CFLA 4JWYA 5I59A 2B3FA 3G3KA 3H4ZA 4KD5A 3E4RA 3HSTA 3W9WA 4PFTA 4WKMA 1MPBA 1UTBB 5ITPA 4RA1A 3K1NA 4YMBA 4G8HA 1N3XA 4NF4B 3H03A 3LC8A 3TQWA 3ECRA 4KQPA 4NF6A 4DE8A 3T9VA 4ZE9A 3S4UA 5H8QB 1ZMGA 2R6GE 1NNFA 1UIVA 3V8XB 2I48A 5K2YA 1B3HA 1MPDA 1NH8A 1MM7A 1YAEA 1M5BA 4OEUA 3VFJA 3AXFA 1LAFE 3IX1A 3FJ7A 5KCJB 2QMXA 2DOJA 2DWJA 4KCCA 4JDFA 3S9MC 4POWA 4U1OA 2E0SA 3FXQA 2A5TA 4LZ7A 4IY6A 1NFTA 3EF7A 1MQIA 5L9MA 3OSRA 1DPEA 1IXHA 1XVXA 3HPIA 4O3AA 3GXAA 2I4CA 1BKAA 5H8SA 3OXNA 4MFIA 4YICA 1HSEA 3QK6A 3T66A 1B51A 3RN8A 5B7DA 4ESWA 2RINA 2Q9TA 3N26A 1B46A 3JZJA 3P7IA 3DELB 3FD3A 3QUFA 1MXUA 3PV0E 4XXUA 4I62A 4OMBA 2O7IA 4ELPA 5DTBA 4LQ5A 4YKPA 2W7YA 4R6HA 1UQWA 3QIMA 2QL3A 1S9TA 3O2AA 1B7HA 3TTMA 3MP8A 5CBRA 2NUVA 1DTGA 3UGWA 4RXLA 2OLBA 2QS2A 3K00A 3CVGA 3E3KA 5FTHA 2ALUA 1GV8A 4PQJA 3FASA 3MQ9A 2I58A 1H76A 3PMWA 2UVGA 5I2KA 3UORA 2HZKA 2YLNA 5L9SA 2F5XA 1JNFA 4F1VA 3ZSFA 4NWCA 4PETA 4C1UA 2V93A 3CI8A 4RK9A 2ESNA 2IEEA 3V89B 5JTYB 1Y3PA 2Q89A 5TP9A 1DSNA 5KDTA 1ZTYA 3SDFA 3PPPA 1O63A 3PU5A 4MH5A 4H5FA 4YZZA 3QYTA 4L17A 1B3FA 4PFUA 5KZTA 3MAMA 4GXSB 1ANFA 3WAEA 2FYIA 4XKNA 1B3LA 1MXWA 1N04A 2VP1A 3M8UA 4IO6A 1LCTA 5ITOA 3TAJA 2UVJA 4NF8B 3T9UA 4QFOA 4NWDA 4RJZA 3H6UA 1B6HA 2O69A 3UA8A 3FVOA 3C35A 3R7XA 3FJGA 2XX9A 1HSLA 3KN7A 2XXYA 1BLFA 5CM6A 1HSJA 3PD8A 5CC2A 2ZYNA 3PUVE 4OFLA 4F3BA 1OVTA 4U21A 1MDQA 3OEKA 1TFDA 4KR5A 4RPNA 2G29A 4NE4A 5ICQA 4QFPA 4LATA 4ND9A 4YMAA 1LAHE 1JQFA 3HN0A 4ZEDA 3CG1A 1UTBA 1LFHA 2I4BA 2QS1A 1Y9UA 3IL1B 5HBCA 3FUZA 1M5DA 2HAVA 4NF4A 3D4GA 1NH7A 2RCAA 2DE2A 4WXJA 2DS9A 5H8QA 1B5HA 2Z22A 1EZOA 2Q2CA 4JSDA 1FW0A 3O28A 1P1QA 4WEPA 2D3IA 1NNKA 2Z8DA 3LBSA 3HCQA 1MXYA 4GVOA 4N6PA 1UTHB 1OLAA 4JSOA 1VR5A 2E1SA 1TXFA 5KCJA 3OSQA 2XXHA 2DSFA 3R26A 4H8IA 1YCJA 3U94A 3Q26A 3C34A 2Z8FA 1P1UA 3S9EA 1PB8A 3OENA 4F2OA 1GGGA 4LUBA 2OZZA 4GF8A 3TUSA 3PGFA 5AA2B 2ANJA 1FQCA 3MJNA 1H3DA 2DWAA 4HW8A 1OIBA 1B1XA 2B65A 1Z7ME 4ELRA 2XX8A 3VE1B 3G3IA 2HEUA 3K01A 4LONB 3BBRA 5I57B 3EHSA 4Q5TA 2O6AA 4Z0IA 1LFGA 4BDLA 1SW2A 4KYSA 4ONYA 2WKYA 5EHSA 1YPNA 3W15C 3IR1A 1ZU0A 1USYH 3IO6A 4X9TA 3CSBA 3G7WA 1MH3A 3L6GA 1QUIA 3I6VA 1MQGA 5AA1A 3RPWA 3VVDA 4YU0A 2ZNTA 3IOWA 1JVYA 3O6IA 3RY3A 3HO7A 2GHBA 3SETA 4C1TA 2F6PA 5JEIA 2HFBA 4NEDA 1LBBA 1B7UA 4QSDA 4IO4A 4F2QA 1JEUA 4FE8A 3FJMA 3PMXA 3LSWA 3A3UA 1PB7A 4ZDMA 4GXAA 1B5IA 1ZIUA 5I2NB 1P1WA 3JYRA 1ZKBA 3MZ9A 1M5CA 2O1MA 1US5A 2QJEA 1DMBA 1JVXA 5JTYA 1Y1ZA 2DVZA 2XXIA 3KN8A 5TU0A 3KFMA 2M8CA 3MZ1A 4IO2A 3K1MA 4GL8A 3PPRA 2UVHA 4OTEA 2XHDA 1UIUA 5EYFA 5ELVA 3TKDA 3TPAA 1LBCA 4HCWA 4HCYA 3TODA 4U2RA 4FIMA 4XKRA 4NF8A 1I69A 3CRBA 4LZ8A 3KEIA 3ODBA 1MQJA 1LCFA 4F19A 4KYDA 4JB7A 3K4UA 2DE3A 2F7BA 1SW4A 3U1OA 1SBPA 1NNTA 4EQ9A 2ONKE 1Q1KA 1T0KA 4LA9A 4G8NA 1MG1A 3O6GA 3GZGA 4M4GA 2F6GA 4YAHX 1XS5A 4FORA 4YKKA 2NWJA 3FZVA 4U4XA 2RC8A 1VFDA 4ZEIA 1FTLA 1QKAA 1B7ZA 2GH9A 2ZMBA 3W9VA 5CI5A 2Q88A 3UK4A 4F1UA 4GOTA 1ZJLA 3K02A 5HPQA 4ECFA 3IJXB 4OYVA 3C9HA 4IO5A 1N3WA 3USDA 4IB2A 3VXBA 5CMBA 1D3KA 1S50A 2RKMA 2ZYOA 2VHAA 2DVCA 3VDFA 1UTHA 1MRPA 1Y3NA 2B3BA 1QUJA 3K0VA 2YJPA 2DWIA 4UACA 2F7CA 1PC3A 3TTKA 4N07A 1EZPA 2XXPA 2I3WA 5DVFA 5AA2A 3VVFA 2ONSA 3V5AA 4BDNA 3UN6A 2PVUA 3VV5A 1IZ1A 3IOUA 2OK2A 2UVIA 3EHUA 1LFIA 5I57A 2RC7A 1JETA 4IGRA 1B52A 1B1HA 3RNNA 3S9LC 4F39A 2XXWA 3VVEA 2G93A 4NTLA 1ZLQA 3RGYA 3TQLA 5H8FB 5DT6A 1AL3A 1URSA 3RTFB 4ZZEA 4IY5A 5FHMA 3FVKA 1WVJA 1MY1A 3HHGA 3LSLA 2I3VA 4TLLB 3I5OA 3OO9A 3UP9A 4H1XA 3TZAA 4R72A 3FV1A 3E13X 1JEVA 4G68B 2VGQA 1N0TA 4NF5B 3QSLA 3TTLA 4QSEA 2ZXTA 3O9PA 2XD2A 5JK4A 3G3HA 5CMMA 1TT1A 3MWBA 3IORA 2Q2AA 5I2NA 1CB6A 4QHQA 1PEBA 3FVGA 3F11A 3MP1A 1R9LA 2LAOA 4QFLA 4OZ9A 3MVZA 1AIVA 3DLNA 3TCGA 5J1DA 3THIA 2AYSA 4EQ7A 2A5SA 1B0HA 1MS7A 3GBAA 5BWJA 3KSXA 4I8CA 4QFKA 1XVYA 2O84X 3MUQA 4N13A 1URDA 3BFTA 5CBSA 1PB9A 4IGTA 1RYXA 2FA7A 1SW1A 3OELA 1LB8A 4F1YA 4LQ2A 1IQ7A 2Y7IA 3Q28A 4NMYA 5A5XB 3M3KA 2HCAA 2OCUA 2DXRA 3EQ1A 4G77A 3IB0A 4THIA 3C32A 1O64A 4MF3A 4XKQA 4R9FA 2R9JA 1R6ZA 3H7MA 4KCDA 5B70A 4DXBA 5EHMA 2RF1A 1NL5A 2GFEA 4LZ5A 4ZEFA 2P0SA 4F22A 3LSFB 4JXIA 2ONRA 4XIGQ 4YB7A 3U93A 2QS3A 4ESXA 2O1LA 4X1DA 4AB5A 1A8FA 3VXCA 3TEPA 5DEXB 3OEMA 1R9QA 4YKIA 3RLFE 2O51A 2XXUA 1MY2A 1VE4A 1D9YA 3D4CA 4PP0A 5BUUA 2VD2A 4BDQA 3FGSA 1VFEA 4R75A 3KN3A 1LAXA 1LAGE 2O7UA 1D4NA 3PMVA 3ILUB 4OESA 5CRYA 3VLUA 1MQDA 3U72A 3B7DA 1WODA 2OWSA 3JV9A 2X7PA 1A8EA 2H5YA 5ISUA 3TCHA 4QFNA 1A7LA 1LGBC 4U1ZA 1LSTA 4KHZE 4GLIA 4DXCA 4F3GA 2Z8EA 3FATA 2V3UA 1QULA 2THIA 3K1PA 1L5TA 1S7YA 2XX7A 3G3FA 1I6QA 4FJPA 2V84A 2H4IA 1FQFA 3HHFA 3FV2A 4H5GA 4MLQA 2DWHA 3FIRA 3MP6A 3OD7A 4TOZA 2REGA 1PDAA 5TPAB 2V3QA 3TMGA 3KG2A 2GRVA 1Y3QA 1IXCA 2PT1A 5H8NB 3MVXA 3TDJA 4PFWA 4F31B 1O7TA 1IIWA 5H8FA 1OMPA 5L9OA 3GLBA 1MY0A 2ZNSA 1H44A 3KBRA 2DP8A 1RYOA 3N5LA 1MXVA 1DOTA 4Q30B 1M5EA 3ZS6A 3QUJA 3CIJA 3OOAA 2HAUA 1MY4A 1JW4A 2X7QA 3PUZE 1N76A 3ILTB 4ZZAA 4OFOA 4G68A 3O66A 4EXLA 1PBQA 4NF5A 1XOCA 3IOVA 3DP8A 1EH3A 5AA4B 1A55A 4BDRA 1H45A 4OFJA 3MBPA 3N6UA 2F7AA 4YKJA 4AB6A 2IA4A 4DIGA 3PPQA 3MVWA 4LVQA 1B4HA 3OO6A 5L8DA 2PT2A 5AA2D 3TELA 4H67A 5H8HB 3FVNA 1A54A 4EXKA 3A09A 2QMWA 3DP6A 2V3TA 4X48A 4RK2A 1IEJA 4FATA 1B05A 2VOZA 2F78A 3IJOB 2QS4A 1B3GA 1B2HA 4RYAA 4QRZA 3LUYA 1P1OA 5I84A 1FQBA 2I0CA 3C36A 5FTIA 2OWTA 5K2XA 5A5XA 3H3GA 4DXUA 1Y4CA 2H99A 4GL0A 4O3CA 4E0WA 3C33A 5F1QA 3KOSA 5I58B 3IB1A 5M2VA 4QSCA 2BJJX 3SEXA 3RQTA 4EDPA 1GTKA 3SKPA 1MH4A 3K6VA 4G8MA 1B9JA 1BTJA 1F9BA 4OENA 5I56B 2ZNUA 4P11A 4TLMB 4GFRA 2NVUB 4AQ4A 2PBWA 3IO4A 1CE2A 4YB6A 5DEXA 1IITA 4EF2A 3N6TA 2RC9A 1SYHA 1Q35A 4EF1A 2H9BA 1I6AA 3IOTA 4R74A 1B58A 1DPPA 1MM6A 5ICTA 3MPLA 1MXZA 2OJTA 2ZYKA 1OVBA 3QXMA 1SQYA 1KWHA 3O29A 1WDNA 1YTVA 3RTWB 4JWOA 1DTZA 4Z7EA 2Y7WA 1SDXA 1OLCA 1AH5A 1N7XA 2VD3A 3C31A 3H6VA 4OERA 4FECA 3M3FA 4KFQA 4GD5A 1EU8A 3K6UA 2F97A 4DZ1A 2D21A 2AL5A 3B6QA 3OO8A 3KJTA 4R6KA 4OVJA 3VLVA 3PD9A 4MLVA 4GWOA 2Y7PA 4ELOA 5TPAA 2NXOA 2HQ0A 4HS7A 2HXWA 5DYHA 2CZLA 1MDP1 1MXXA 4ZE8A 4R2FA 1H43A 5H8NA 2Y7RA 2QPQA 1B0LA 3O97A 1B40A 4H65A 1IXIA 3T9HB 2D5WA 3T93B 3IAZA 3SEYA 1A40A 1EZ9A 2X26A 3SESA 3B6TA 5FHNA 3MPKA 4ZECA 2XXTA 1M5FA 1FTOA 2UXAA 2R71A 4KYEA 1QKBA 4YB5A 2DE4A 4EUOA 4BDOA 3TYHA 4EQBA 4I1DA 4F3PA 4OEVA 3QAXA 2FNCA 4IO3A 2YPNA 5AA4A 4OQOA 3PPOA 1OQGA 3SEWA 1SI1A 5CMCA 1XC1A 4ZEKA 1PBPA 2UYFA 4BLAA 1LB9A 2V25A 3ZKKA 4GQOA 2DXYA 2PMSA 3IB2A 3H6WA 5H8HA 5IAIA 3K2DA 1FQEA 4ELQA 4XKPA 3G3JA 3KZGA 3CR9A 3K6XA 4C0RA 4F18A 1Y20A 1N7WA 2RCBA 1GVCA 2ABHA 3LR1A 5IKBA 1RKMA 4JBZA 3PUXE 3B6WA 4ZEBA 5I59B 2REJA 3R6UA 3MVYA 3T9XB 2F34A 3OMBA 1Y1MA 1JW5A 3PUYE 1QVSA 4GRKA 3E9XA 4X1BA 1FCKA 1XT8A 3ONMA 1SW5A 4P0GA 5HM4B 3S2VA 4NF6B 2AL4A 5I58A 4DLDA 2I6EA 2PYYA 3TCFA 3ZKLA 4FAJA 2HZLA 3DM0A 4M1VA 2DQVA 1A99A 1N84A 1FTMA 4G4PA 2QRYA 3O6HA 1FTKA 3VLWA 1MQHA 2O68A 1URGA 3MC2A 5I56A 2F35A 3H06B 4E0XA 3Q25A 3I3VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4POXA 5A5LA 3PPNA 1USYE 2A5TB 1SD3A 3CSGA 3MZBA 4PDDA 4OETA 2P2AA 4R9GA 2H25A 3EHTA 3TTRA 4WEDA 2QSXA 3FXUA 1Z7NE 3D1RA 3MYUA 4F29A 1BIYA 3Q27A 3FXRA 4OXVA 4N4UA 2VPOA 4JWXA 1FBDA 4H8JA 4FEDA 3N94A 5AE4A 1QGXA 4Q8RA 3S9NC 4G68C 2F3BA 2XXXA 2XXQA 2I0BA 2CZKA 4QF9A 4R6YA 4PCDA 1NNPA 1ZBMA 4TQUQ 4DDDA 4AS4A 2V4CA 1B5JA 1FBCA 3IK6B 3FBPA 2Y84A 5CMKA 1NKXA 1FQDA 3TFLA 1AOVA 1MPCA 1QW0A 1XHYA 1LLSA 5EQAA 4Q0CA 5EQ9A 1QJMA 1IXGA 2F8DA 4XTCQ 4DCXA 1TWYA 5F7VA 3Q29A 1YYZA 1B32A 4IO7A 3KBZA 3CG3A 3SEUA 4N91A 4P0IA 4ZS9A 1I6BA 4P56A 3HV1A 1NMUA 3GBBA 4RNSA 4RPOA 3WAFA 4F3SA 4I9DA 3G3GA 3RUMA 1IMEA 5IZ1A 4H0WA 4U22A 1B4ZA 1FQAA 5AA3A 3MW0A 2PX1A 4FBPA 3KGCA 3OO7A 4ISUA 4H6DA 2I49A 1VSOA 4DCYA 3C4MA 2AIXA 1P1NA 2XXRA 2KLFA 2Q8JA 3BIHA 1SVXB 4K3FA 5I2KB 1SI0A 1II5A 2ZYMA 3M3LA 4KI0E 5DVIA 3U92A 1GR2A 1TFAA 1NUYA 3UIFA 2XWOA 3U8QA 2GHAA 4KPTA 4OWDA 4G2ZA 4LN5A 4MNPA 4MIJA 1OQHA 4PC9A 3CFZA 4MEVA 3BFUA 5DVJA 3SERA 3EN3A 5TP9B 4FEBA 4GX4A 1FBGA 5KDTB 1BP5A 1J1NA 5LOMA 1POTA 2XXVA 4RY1A 2FVZA 4O8MA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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