2QS4A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core dimer in complex with ly466195 at 1.58 angstroms resolution
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
SNRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
publication title Binding site and ligand flexibility revealed by high resolution crystal structures of GluK1 competitive antagonists.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 77
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs4A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs4A02
2AL4A 2PMSA 3P7IA 2VD3A 4ZE8A 3FVNA 2B3FA 3PV0E 2Q2AA 3R7XA 1N84A 2HEUA 2I3WA 3C35A 4F3BA 3MAMA 4KYDA 1D9YA 3T93B 4QFLA 3IAZA 3WAEA 2HZKA 4MLVA 4UA8A 3IOTA 1P1UA 4YKPA 2F6GA 4DCYA 5A5XA 2R9JA 1Y1ZA 3PGFA 3MPKA 2RINA 4FECA 5DT6A 4EQ7A 3QK6A 3MVWA 2F97A 2VGQA 3MC2A 5I58B 1ZBMA 3JV9A 3VVFA 4NF8B 1UIUA 4P0GA 1PB7A 4TLLB 1O64A 4LP2B 3U1OA 1BLFA 1S9TA 3OO8A 1AIVA 5JK4A 2ZNUA 4GQOA 5B70A 1ANFA 1MDP1 4KCDA 2OWSA 2Q88A 3TCFA 1ZJLA 3OELA 1Y9UA 4FIMA 2WKYA 3SKPA 5ICTA 3UIFA 4LZ8A 4R75A 2R71A 1FW0A 3Q29A 4EUOA 3KJ7A 2ABHA 1B4ZA 4C1UA 4LQ2A 2Y7WA 4BDRA 2OZZA 4NF6A 3O2AA 1NMUA 3RGYA 2VOZA 5DEXB 4R2FA 4NMYA 3U8QA 1Y1MA 4IO4A 2Z23A 3K02A 4FORA 3S9MC 3KBRA 3IOVA 3SESA 3VE1B 2XXPA 2OLBA 4RXLA 3K0VA 4R6HA 4U2RA 2XXUA 2P0SA 4M4GA 5AA2A 3C32A 3IO4A 2I0BA 1QUIA 1MPDA 4G68B 1LBBA 2X7PA 1DPEA 5KZTA 3N26A 5LOMA 4IY5A 3PUVE 2F35A 2LAOA 1MS7A 4DXBA 4NF4A 1N7XA 3KN3A 1XVXA 1MXWA 2F8DA 3PD8A 1QULA 1R9QA 5I2KB 1N0TA 1M5BA 4JXIA 2ANJA 3FIRA 4ELQA 2H9BA 4R6KA 1N3XA 3JZJA 1PB8A 2E1SA 1B4HA 2ESNA 3C34A 1FQFA 2A5TA 3EQ1A 1R6ZA 5TPAA 4XKRA 1ELJA 1GTKA 4AB6A 3TFLA 5I2NB 3E13X 4HCYA 2REGA 1BKAA 2QS4A 1H3DA 3GZGA 3VLWA 3EHSA 4YMAA 4GFRA 3TCGA 1XOCA 1P1OA 3LSLA 3PUWE 3DLNA 3V89B 4ZECA 5L8DA 3AXFA 3IR1A 3DP6A 1R1NA 2XXHA 4ELOA 4U4XA 4XIGQ 5ICQA 3N5LA 5IKBA 3FVGA 3CRBA 4RY1A 4DDDA 2H4IA 1XS5A 4F3PA 1FTOA 4OWDA 4U23A 4XTCQ 3M8UA 2IEEA 4H6DA 1B1XA 1JNFA 2QS1A 1PDAA 4YKJA 5HPQA 2F7AA 2V84A 3SEYA 4YB6A 1A40A 2Y7KA 1HSJA 2QRYA 1SD3A 4F31B 3TDJA 3H4ZA 5F7VA 2F7CA 2OK2A 1B32A 3T9UA 4GVOA 4KYSA 5BUUA 3E3KA 4Q30B 3KN7A 4U22A 4WEDA 4EXKA 1I69A 4R6YA 1VFDA 1MY4A 3DP8A 4ZZAA 4BDOA 5K2XA 3DP4A 2Z8FA 4LA9A 3PMWA 4RNSA 3LSFB 4YB5A 1QJMA 3QYTA 1NNTA 5AA4A 4G77A 4C0RA 1DSNA 3KFMA 2ONRA 3L6GA 4FE8A 1JEVA 2GHAA 3VVDA 1GGGA 3MZBA 4YZZA 1PC3A 1Z7NE 1YAEA 4I8CA 1KWHA 1LAXA 3FJMA 3MBPA 4R73A 2RCBA 4Q8RA 3IJXB 4KD5A 4IO2A 3H6UA 1A54A 5TU0A 3CFXA 4JWOA 2PX1A 4P11A 4BDLA 3PMXA 4GXAA 1N3WA 3FGSA 4MFIA 1MXXA 1B7HA 3VV5A 4F2QA 3G3KA 3ILTB 4NF6B 1FQEA 1MPBA 1ZKBA 5KDTA 2Y7PA 3F11A 1MH4A 4U1OA 3KJTA 1AL3A 1YPNA 4FEDA 3FV2A 3PUYE 1FTLA 2I0CA 2HCAA 1MQGA 3OSRA 1US4A 1FCKA 3OSQA 2Y7IA 3L6HA 4R2BA 5AA3A 1NL5A 3RQTA 3TTNA 3G3IA 4ESXA 4LZ7A 2VP1A 2UVIA 3Q26A 2NVUB 3FUZA 3OO6A 5AA2B 2YPNA 2RF1A 2ZYNA 4JWYA 3G3GA 4GXSB 2ONSA 4ZEKA 4QFPA 3FD3A 2ONKE 3IK6B 5KCJA 3SEUA 1N76A 2Q8JA 4H67A 4H8IA 1POY1 5HBCA 3PUXE 4BLAA 4ND9A 4NF4B 2F78A 3OMBA 1RYOA 4N6PA 3CG3A 1H76A 3ODBA 3LSWA 1B1HA 4KR5A 1LAFE 1B0HA 1N7WA 1SDXA 4YB7A 1BTJA 3B6QA 4GIZA 2RC8A 1AOVA 2A5TB 1DMBA 1SYIA 1I6QA 3ZSFA 3QIMA 3B6WA 5JTYA 2F6PA 4QSEA 2RC9A 4IO3A 4N07A 5FHMA 1IQ7A 1AMFA 4XKQA 2DE2A 3K1NA 3IOUA 4GWOA 4IB2A 2HZLA 4OYVA 1USYE 3FATA 3THIA 2Y7RA 3K2DA 1AH5A 4POXA 3ZKKA 2E0SA 3OOAA 3LBSA 3FVOA 1B3LA 1H44A 3BFUA 5H8FA 3TYHA 3PMVA 1ZTYA 3WAFA 2F36A 5CMBA 3SEWA 1IUDA 1DTGA 4YICA 1B0LA 1B3HA 4AB5A 4ISUA 3HHGA 4Z0IA 4XKPA 2QMXA 1QKAA 4BDNA 1JW1A 1M5DA 3FASA 4DLDA 2PT1A 3T9HB 4I1DA 4ZEDA 4ZEIA 1D4NA 3K6XA 1LAGE 1EU8A 4LQ5A 4DZ1A 3C33A 4GRKA 3OO7A 2DQVA 1VR5A 3O9PA 5H8QA 3IL1B 2UVGA 2I3VA 1B7UA 5L9SA 3V8XB 1UQWA 4KCCA 1O7TA 3Q27A 1S7YA 3O6HA 2GHBA 4OFJA 3LC8A 2O7IA 3TUSA 4HCWA 4DIGA 4Q5TA 1I6AA 4L17A 2AYSA 3MVXA 5BWJA 3U92A 3GXAA 3W15C 5ISUA 2QS2A 2Z22A 3RPWA 5J1DA 4ELRA 4E0XA 2PYYA 2UVHA 4ZEFA 3RN8A 5KDTB 3RLFE 4F39A 1B5IA 2A5SA 5H8HA 3E4RA 3FJGA 4R9GA 3C9HA 2V3UA 1TXFA 3RT8A 2XX7A 2YLNA 3TCHA 2CMOA 2CZLA 3TAJA 4PQJA 1M5CA 3DM0A 3GBAA 3TKDA 2NWJA 1MXYA 4ZZEA 5JEIA 3BBRA 1DTZA 2OJTA 2DSFA 1EH3A 5KCJB 4JDFA 4N13A 4MH5A 1NNKA 5I59A 2QS3A 4DCXA 1MH3A 1GVCA 3HCQA 4F1VA 1J1NA 3GLBA 2DWHA 2HAVA 3KN8A 1OQGA 2XX8A 2XXRA 5K2YA 3ILUB 3SERA 1UTHB 3R26A 1DPPA 4OZ9A 4F1UA 3KOSA 4WXJA 3CFLA 4LVQA 3LUYA 1EZPA 3ZS6A 3N6UA 1QUJA 1SI1A 4FEBA 4DE8A 1MY0A 3T96B 1A8FA 2HXWA 2ZMBA 2PVUA 5HM4B 4R9FA 5CRYA 1B40A 2UYEA 4F19A 2XXVA 3K1PA 4X1BA 3IB0A 3CSGA 3FJ7A 4PP0A 1NNFA 1A99A 3QUJA 5H8FB 4RPNA 4QFKA 1JW4A 4XKNA 1XHYA 1L5TA 4BDQA 2Q9TA 4YKKA 1P1WA 1FTJA 4OEVA 3IJOB 3MQ9A 3K1MA 1D3KA 4KYEA 3ZKLA 2RCAA 3QAXA 1IEJA 1FQAA 1LCTA 2F7BA 3I6VA 1CB6A 1Q1KA 4UACA 1TFDA 3KEIA 3IB2A 1B3EA 2ZYKA 2XHDA 1QW0A 3H03A 4F22A 3O6GA 2XD3A 3I3VA 4PETA 4BDMA 5H8QB 5A5XB 4U1ZA 1WVJA 1Q35A 1B58A 2XXIA 1M5EA 1NNPA 1SYHA 4H65A 4GF8A 2UYFA 2V3QA 3PPNA 4NEDA 4G2ZA 2HQ0A 3TPAA 3TEPA 1IZ1A 2D21A 1IITA 2OWTA 2I6EA 2THIA 1B46A 3W9WA 4RYAA 4EQBA 3PPRA 3OEKA 3MP1A 4X9TA 2O69A 3EHUA 3GBBA 3SEVA 1Y3PA 4KPTA 4H1XA 2DVZA 4JSDA 2NXOA 4H8JA 5AA1A 4YMBA 2V93A 3TQLA 2OCUA 3G7WA 3K01A 1MXZA 4NF8A 5H8HB 5TP9A 3C36A 3A3UA 4F2OA 4ZS9A 4YKIA 1SW2A 3OEMA 2Q89A 1USYH 3G3HA 2QPQA 2UVJA 2ZYOA 1FTMA 3MZ9A 3MP8A 1BIYA 3H6TA 4POWA 3H6VA 1JEUA 1MQIA 3N94A 4G8NA 1MQHA 1LFHA 4NTLA 1Y3NA 5I59B 2V3TA 4NE4A 3HSTA 4YU0A 4FAJA 3D4CA 2D3IA 3K4UA 4PE5B 3RT6B 4YAHX 4ECFA 2O1LA 2DWAA 3PD9A 2DE3A 5FTIA 4HW8A 3MZ1A 1WODA 3UN6A 1TWYA 3SETA 4IY6A 4K3FA 1D9VA 4C1TA 1JQFA 4QSDA 2B65A 2XXXA 5FHNA 3FXQA 3M3KA 1Y3QA 3H3GA 4G68A 5TPAB 1UIVA 1HSLA 3LR1A 4TLMB 3EN3A 3TZAA 2P2AA 4EQ9A 4IO5A 5M2VA 3UGWA 1SQYA 3TTKA 4PFYA 1ATGA 4ONYA 3R6UA 5I2KA 3TMGA 1XVYA 2O1MA 2M8CA 3ONMA 1T0KA 3HPIA 4U21A 3B7DA 2I4CA 1MG1A 2H25A 3DELB 2O6AA 1OVBA 3S2VA 1MXVA 3RY3A 4ZDMA 3UORA 1SW4A 3SDFA 1B52A 4F1YA 1NKXA 3KGCA 3CI8A 5DVJA 1BP5A 1SBPA 3ECRA 4E0WA 1YCJA 1P1NA 4GL8A 4OFLA 1B3FA 1ZLQA 3PPOA 1ZIUA 2G93A 4TQUQ 1QKBA 1SVXB 1I6BA 2GH9A 2DVCA 1N04A 1MY1A 1GV8A 1B3GA 5DVFA 4AQ4A 3TTRA 1FQCA 2O68A 4QFNA 5AA4B 2H98A 1PEBA 4WEPA 4H5GA 1H43A 1MM6A 2XX9A 2O7UA 2HAUA 4OMBA 1MXUA 4FATA 1Z7ME 2FYIA 3MP6A 4G8HA 4NWDA 4RK2A 2Y84A 4OFOA 1XT8A 5I56A 1FQDA 3KG2A 1MY2A 1OLCA 3VDFA 5L9MA 1POTA 3VFJA 5TP9B 3U94A 2R6GE 3CSBA 2ZYMA 4LZ5A 2O84X 1P1QA 3MUQA 4NWCA 1R9LA 4G68C 1IXGA 3MWBA 3TQWA 3PPQA 3FXUA 3FVKA 3H6WA 5IAIA 3CVGA 3C31A 1OVTA 4NF5A 4PFUA 5EHMA 1O63A 3VLVA 3VVEA 1B51A 1ZMGA 1EZ9A 1B9JA 3M3LA 4LONB 4M1VA 4MLQA 1JETA 1XC1A 3CR9A 4THIA 3O66A 4G8MA 2Z8DA 3FV1A 3G3JA 1MPCA 5CBSA 3IB1A 1PB9A 1TT1A 1IXIA 1CE2A 4RK9A 4QRZA 3K6UA 3MJNA 3IOWA 3IX1A 1LCFA 1TFAA 2X26A 1URSA 5CMMA 1F9BA 4OTEA 2H5YA 5H8SA 3MW0A 4Z7EA 1VFEA 3QSLA 2DS9A 3CIJA 3T9VA 1LGBC 1H45A 2HFBA 3U72A 3KSXA 4U4SA 4OXVA 4O3AA 1VE4A 1LBCA 3Q25A 4GL0A 3A3CA 3T66A 3VLUA 3EF7A 3RTWB 3KOTA 3USDA 3K6WA 5AE4A 3K00A 3OD7A 3S9NC 4KHZE 3VXCA 3HN0A 4G4PA 5JTYB 4I9DA 2DYXA 1A7LA 4EXLA 1LFGA 4Q0CA 4P0IA 4QFOA 3S9LC 1LSTA 3T22A 3A09A 1LB9A 3O6IA 5ITPA 3CFZA 2AIXA 4QF9A 1A8EA 4O3BA 2I4BA 5I57A 4WKMA 4DXUA 2GRVA 5AA2D 3UP9A 4FJPA 2Q2CA 3QXMA 3N6TA 2F5XA 4GOTA 4HS7A 1UTBA 1MM7A 1NFTA 2I48A 4OEUA 4F3GA 4F18A 5H8NA 4IGRA 1SI0A 1B5HA 2YJPA 3M3FA 2RKMA 1B05A 3UK4A 2FNCA 3OO9A 3MVZA 3TODA 1RKMA 4EF2A 1ZU0A 1PBQA 3V83A 5CM6A 3HHFA 4MF3A 3I5OA 2UXAA 1US5A 2XXQA 3RTFB 3CG1A 4F29A 1B7ZA 4RJZA 3OENA 5EHSA 2DWIA 2QL3A 5CMKA 3RNNA 2FA7A 3IORA 4ESWA 3KZGA 3TTLA 1WDNA 5DTBA 2DXRA 5EYFA 3B6TA 4ZE9A 3HV1A 1LB8A 4QSCA 4TOZA 5CBRA 4O3CA 3D4GA 2PT2A 1OMPA 3KSJA 3TELA 3PU5A 1A55A 1MY3A 1OLAA 1JVYA 2ZXTA 4HTGA 5I56B 1VSOA 4GLIA 1LAHE 2PBWA 3O97A 3W9VA 2ZNSA 2GFEA 4OHNA 1HSEA 3IO6A 3QUFA 2REJA 2DXYA 1LFIA 2G29A 1Y4TA 1B6HA 5I58A 2VD2A 4H5FA 2Z8EA 1NH8A 4OQOA 4F3SA 4RPOA 1Y4CA 1MDQA 2W7YA 5CI5A 3G3FA 1RYXA 4LATA 5DVIA 4JSOA 1SW1A 2XXYA 1SW5A 4DXCA 3O29A 4OETA 5CC2A 4NF5B 2DWJA 2ALUA 2NOOA 3VXBA 2NUVA 1MQDA 4PFWA 3C4MA 5B7DA 1FTKA 1QUKA 3TTMA 1YTVA 2D5WA 2F34A 1II5A 4R72A 5DYHA 3V5AA 3OXNA 3MPLA 1MQJA 3Q28A 3RUMA 3T9XB 4MBPA 4X1DA 1PBPA 1IIWA 4KI0E 1B2HA 4LUBA 5FTHA 3HO7A 3U93A 4ZEBA 5DEXA 4GD5A 3O28A 4OENA 5ITOA 1MRPA 2V25A 4IO6A 2X7QA 1LLSA 4JBZA 2KLFA 1IXHA 2DOJA 2BJJX 2H99A 2XXWA 2ZNTA 1S50A 1B5JA 2P1SA 4ELPA 3H06B 4JWXA 5I84A 4R74A 2VHAA 4IGTA 3BKIB 1Y20A 2XXTA 4OERA 1JW5A 1JVXA 3BFTA 3JYRA 5CMCA 5FHOA 4JB7A 2QJEA 4H0WA 2DP8A 2OBGA 3MVYA 4I62A 5L9OA 4OESA 1FQBA 2IA4A 3EHTA 2I49A 3H7MA 3S9EA 5I57B 3PUZE 3S4UA 3E9XA 1UTHA 3SEXA 2O51A 2AL5A 1UTBB 2RC7A 4XXUA 5H8NB 4EDPA 2I58A 4OVJA 1M5FA 3EPEA 1GR2A 4KQPA 1EZOA 1P99A 4PFTA 5I2NA 3PPPA 2B3BA 3FXRA 1URDA 3K6VA 3LSXA 1QVSA 2XD2A 1DOTA 1NH7A 1OIBA 1OQHA 2DE4A 4X48A 3FZVA 4IO7A 3UA8A 1IXCA 5ELVA 2QSXA 4EF1A 4KFQA 1URGA 2QMWA 4RA1A 5F1QA 4QHQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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