3CRBA

Crystal structure of the complex of c-lobe of lactoferrin with 2-chromenone at 2.6 a resolution
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal structure of the complex of C-lobe of lactoferrin with 2-chromenone at 2.6 A resolution
rcsb
total genus 111
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2008-04-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3crbA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3crbA02
2FA7A 2OK2A 2DWIA 1I6AA 2I4BA 2THIA 3FUZA 5AE4A 3KJTA 4U22A 2OJTA 3OSRA 2QS2A 5KDTB 3DP8A 2GFEA 3LSWA 2NOOA 3TUSA 4F18A 1H45A 1A99A 3RQTA 4HW8A 1SVXB 3OEKA 4I8CA 4MH5A 1JETA 1R9QA 1SYIA 3H3GA 2H9BA 4U4XA 4H65A 4RY1A 5CI5A 3FZVA 5I58B 2ZYNA 4YMBA 5A5XB 2B3FA 5DEXB 3B6QA 3OOAA 1SYHA 1B46A 4HTGA 1B4HA 4AB6A 4XKRA 4FORA 3IK6B 4NF8B 5I2NA 1ANFA 4GF8A 4XXUA 3VFJA 2QPQA 1GTKA 2VOZA 2NXOA 3O97A 4GVOA 1SW2A 5L8DA 1IXIA 3C35A 4IGRA 3C34A 3H06B 4HS7A 1SDXA 4DZ1A 3C36A 3FXUA 1PB8A 1USYH 2QS1A 4YAHX 4HCWA 4GL0A 2XXUA 1D4NA 4RK9A 4UA8A 3SEVA 4ZZEA 4RA1A 4DE8A 1ZLQA 4LA9A 3HHGA 2RKMA 3S9EA 1FW0A 4OEUA 4LATA 4JB7A 5H8HB 3TTMA 1CE2A 4FIMA 4WEDA 3TMGA 1QKAA 4OFOA 1B58A 1MH3A 1P99A 1VE4A 3RTFB 4GL8A 1PBPA 4ZZAA 4YKIA 4YU0A 2OZZA 4PFYA 1N3WA 3H6VA 1F9BA 3BBRA 3FIRA 2XXWA 3R26A 5DVJA 4OETA 5CM6A 4QF9A 3G7WA 1P1UA 3G3HA 2BJJX 1B4ZA 3K6UA 3FJMA 5EHMA 2XXVA 1YTVA 2R6GE 5FTHA 4KR5A 4OWDA 4DXCA 3FJGA 3A3CA 4GIZA 2P1SA 2R9JA 1MPDA 1POTA 1EU8A 1TFDA 2XXYA 3KOSA 5I57A 3TCHA 2QMWA 1PBQA 4IO4A 4F22A 2P2AA 3MP8A 4M4GA 2Q8JA 4FE8A 4YKJA 2AIXA 2DYXA 3MVZA 1H3DA 1LB9A 1IUDA 4F2OA 3KZGA 2D5WA 3MC2A 3B6TA 3JYRA 1NNPA 3KSXA 3QAXA 3OO7A 2I3WA 3G3FA 3TELA 4QFNA 3VVDA 5H8NB 4TLMB 4GWOA 3TQLA 4ELPA 1TWYA 1MQJA 3T22A 3VXBA 4AB5A 1JVYA 1IXGA 1MPCA 3PUWE 4H5GA 5LOMA 1ZIUA 1KWHA 3EF7A 2XX8A 3VLVA 1LAXA 2DWJA 1B6HA 2UVGA 3LC8A 4R6YA 3VDFA 5L9SA 4M1VA 1MQHA 4U1ZA 4KI0E 1PC3A 3A3UA 2RCBA 4BLAA 5AA4A 2VD3A 3CSGA 3S9NC 5F7VA 4JXIA 5H8QA 2DE3A 1R6ZA 3H03A 4P11A 3H6TA 3THIA 3L6GA 4OMBA 4K3FA 2V93A 2F6GA 1XOCA 3Q25A 4YB7A 1MXWA 3R6UA 3FXRA 3LUYA 3GLBA 2GHAA 1JW5A 3BFTA 5K2XA 4JSDA 2DVCA 4MLVA 4C1TA 1Y3NA 3RGYA 3H4ZA 4EF2A 1IIWA 3N26A 4JWOA 2Z8EA 3G3KA 4R75A 4I62A 4U4SA 5DVIA 2LAOA 4G8HA 3LSFB 1MG1A 3FVNA 1B7UA 4FATA 3E3KA 3QUFA 1YCJA 2H4IA 2Q9TA 1URDA 3EHSA 2VGQA 1MY1A 3ILTB 4EQBA 3RLFE 3K02A 2GHBA 5JTYA 3IAZA 4LQ5A 1Y3QA 3QUJA 3KN3A 2M8CA 4R74A 2DE2A 1IITA 2PMSA 4I9DA 2ABHA 2CMOA 3TTRA 4EQ7A 4FEBA 3RTWB 5DT6A 2PX1A 1LSTA 1II5A 3ILUB 2VD2A 2Y7IA 3ODBA 5H8QB 1WVJA 2DE4A 1TXFA 1UTHA 2ZNUA 3M3FA 2ZYOA 3G3IA 1Z7NE 3WAEA 1WDNA 3QK6A 3C4MA 4R6KA 2XX7A 1SW5A 3MAMA 3O28A 1QKBA 4XIGQ 1MH4A 1R1NA 3GBBA 5I59A 3IB0A 1GR2A 4NE4A 2F7CA 2DXYA 2F36A 2F78A 3JZJA 1QVSA 1EZPA 2O7IA 1XC1A 3MZ9A 1JQFA 3VVEA 4BDNA 3AXFA 2KLFA 1NL5A 4YKPA 2Y7RA 4JWXA 4NF5A 4KYSA 3TZAA 1EH3A 1MQDA 3N5LA 4ZEIA 5JTYB 1M5DA 3ONMA 4OYVA 2DWHA 3Q27A 2I3VA 1LB8A 3PV0E 4OZ9A 3UORA 3DM0A 4EXLA 4NWCA 4JSOA 5KCJB 4NTLA 1BIYA 1B32A 1Y1MA 2XXPA 3P7IA 2UVIA 4L17A 1US4A 2IA4A 1UQWA 2I49A 4E0WA 3MVXA 3FVOA 3PU5A 4NF4B 5L9OA 4FJPA 4QSCA 2GRVA 1UTHB 2REJA 1N7WA 3I3VA 3PUZE 4XKNA 4H67A 2YJPA 4XKPA 3K2DA 4F31B 4DXBA 1DMBA 1LAHE 2H5YA 4F39A 3OO6A 2Y7PA 2Q2AA 2RF1A 5FHNA 3EHTA 2NVUB 4PP0A 4BDLA 5IAIA 2ALUA 2XD2A 4H8IA 5HM4B 2O6AA 2XXHA 5I59B 4R73A 1FTMA 1SD3A 4THIA 3FVKA 5ISUA 4PFTA 2ONRA 5HPQA 3PMVA 4BDRA 1HSEA 1US5A 1PEBA 3TDJA 1FTKA 1MXUA 3WAFA 4F1VA 1NNFA 3M3LA 4NF5B 5FTIA 4LUBA 4MF3A 3M3KA 1B7ZA 2E1SA 3T9HB 1LGBC 1MY3A 3T66A 3FV1A 3Q26A 4YMAA 4F3SA 5JEIA 4JBZA 1A8EA 1ZBMA 2OBGA 1MXZA 4YB5A 2AYSA 3MPKA 1YAEA 4H8JA 3U8QA 4RYAA 4OVJA 2Z23A 1MQGA 2XHDA 1OLCA 4R6HA 3N94A 3QYTA 3O6IA 1HSLA 1SQYA 4ND9A 3T96B 2A5TA 1SBPA 4F3PA 2F7BA 2PT1A 3MVWA 1DOTA 4P0GA 4YICA 3C9HA 3TFLA 2FYIA 3KJ7A 3V8XB 1B1XA 1B1HA 4IB2A 3HN0A 2X26A 1NH7A 1Y1ZA 4RK2A 3IOUA 4DCYA 1RYXA 1SW1A 2ZNTA 4PQJA 3T93B 1I69A 1M5EA 4X1DA 1OLAA 3KFMA 1EZOA 5I2KA 3HSTA 2OCUA 4H0WA 5HBCA 2YLNA 1Y20A 3DELB 1FQEA 4O3CA 2V3TA 3CR9A 1FQDA 1D3KA 3GBAA 4POWA 3PMWA 5FHOA 5AA2D 3H6WA 4DXUA 2O68A 3UA8A 2XXXA 3HV1A 2P0SA 3BKIB 5ICTA 3OD7A 3EQ1A 5I2NB 1JNFA 3PUVE 1GV8A 3SEUA 2F5XA 4LZ8A 1QJMA 4ONYA 2GH9A 1PB7A 2QL3A 3IOVA 1B3FA 3SETA 5DVFA 3PPPA 2XXIA 3OMBA 3SEYA 3FATA 1MDQA 2VHAA 1IQ7A 3MZ1A 4NEDA 1H43A 1I6BA 4XKQA 1AMFA 2V3QA 3T9UA 1DTZA 4X9TA 3PD8A 2R71A 1DSNA 3VLUA 2QMXA 4Q5TA 1FQBA 4BDQA 2HEUA 1URGA 4R9GA 1ZTYA 3MQ9A 4Q0CA 4NWDA 1B5IA 4LVQA 5TU0A 3TTKA 4EDPA 5I2KB 4ZE9A 3RNNA 3I5OA 1DTGA 1ZJLA 3TCFA 3UGWA 3IB1A 4BDMA 4C1UA 1OQHA 2UXAA 2F6PA 4OENA 3RT8A 3U94A 4U2RA 1ELJA 2Q88A 4ESWA 3HO7A 4GLIA 4LQ2A 1O64A 3BFUA 4PFUA 4O3AA 5CBRA 3A09A 5L9MA 5CMBA 3E9XA 4PFWA 3O9PA 2V25A 3F11A 4G68A 2I4CA 4ELOA 3TAJA 1USYE 1L5TA 4FAJA 4QFLA 5CC2A 4LONB 1XT8A 1B5JA 4QSEA 4KCDA 5I57B 4EF1A 3CI8A 5JK4A 2Y7WA 4OQOA 4JWYA 5EYFA 3SEWA 3MUQA 2ZXTA 2HZKA 2XXRA 1B2HA 2I48A 1A54A 3G3JA 3HCQA 4DIGA 4GRKA 3PPOA 4LZ5A 4ZEDA 2HFBA 4FECA 2B65A 2NUVA 1AH5A 3N6UA 1URSA 4POXA 1UTBA 4BDOA 3OO8A 2PVUA 4Q8RA 3CG1A 2HAUA 1SI0A 2ZYKA 2REGA 4X1BA 1NMUA 2UVHA 1LCTA 1J1NA 3QXMA 4DDDA 1NNKA 1NNTA 3R7XA 3ZS6A 3TCGA 5EHSA 3PGFA 4GXAA 3IB2A 2QSXA 4JDFA 4ZEFA 4F3BA 4NMYA 1MY4A 4G8MA 1S50A 1B9JA 3CFZA 3K6XA 1MPBA 4C0RA 3LR1A 4R2FA 5AA4B 3IO6A 4H1XA 5ITOA 1T0KA 2G29A 1CB6A 2Y84A 3O2AA 1GVCA 1HSJA 5H8SA 4R9FA 3OEMA 3D4CA 5ITPA 3OO9A 3B7DA 2XX9A 4OHNA 4OESA 1M5FA 1Y3PA 3IORA 4OFLA 1LFGA 3IR1A 1LFIA 3RUMA 2I0BA 2RCAA 1OVBA 1XVYA 2ONKE 3DLNA 5CMKA 3U92A 2V3UA 3KSJA 1P1NA 3C31A 1UTBB 2D21A 1S7YA 2ZMBA 3LSLA 1XHYA 3PPRA 3VE1B 1N3XA 4G4PA 1Q35A 4N6PA 1N0TA 1LAGE 2FNCA 3T9XB 4R2BA 1O63A 4EUOA 5I58A 2AL5A 3KN7A 3IJOB 3KOTA 3USDA 5I84A 1RYOA 1EZ9A 3FVGA 1Z7ME 1SW4A 3KG2A 3SKPA 2OWTA 1MRPA 1IXCA 2I6EA 3S2VA 3Q29A 1A7LA 3VLWA 1QUJA 4LP2B 2O84X 4WKMA 2F97A 2B3BA 3K1PA 3OSQA 1LFHA 3MJNA 1BKAA 3FGSA 4ZEBA 4YZZA 1JW1A 2W7YA 1JEVA 3V89B 3UIFA 1B7HA 1JVXA 4IO3A 3RT6B 3TTNA 5B70A 1IEJA 4PETA 1OVTA 3V83A 2DSFA 3M8UA 3TTLA 2O7UA 2H25A 3FV2A 3JV9A 4G68C 3ZKLA 3DP6A 3IOTA 1IZ1A 3KN8A 5DYHA 5H8HA 3Q28A 3W9VA 1LLSA 4KQPA 4ELQA 3H7MA 3MWBA 3HHFA 1P1OA 1Y4CA 3EHUA 1Y4TA 2I0CA 1NKXA 2Z8FA 1VFDA 1O7TA 4ELRA 4QFKA 4HCYA 2DQVA 4QSDA 2AL4A 3MPLA 4TQUQ 2IEEA 4OERA 1BLFA 3SESA 3KGCA 1ZKBA 3K1NA 1Q1KA 1B52A 4ZECA 1B0HA 3FXQA 3HPIA 3IL1B 2XD3A 4QHQA 3KEIA 1MY0A 1P1QA 4IO5A 1B0LA 4KYEA 4N07A 4F19A 4E0XA 4ISUA 5CMMA 1TT1A 1JW4A 3K00A 3MVYA 3O6HA 5I56A 3V5AA 2Z8DA 4X48A 4F3GA 4KCCA 1MM6A 3ZSFA 4F1UA 2YPNA 4R72A 1B05A 1OIBA 1NH8A 4OFJA 4G77A 3T9VA 1MS7A 4YKKA 2QRYA 3EPEA 5CRYA 1QULA 4ZE8A 3SERA 3U72A 3UP9A 3E4RA 4RPNA 1MM7A 2Y7KA 4GFRA 5H8NA 4MBPA 3MP1A 2F35A 3MW0A 3RY3A 5TP9A 1ZU0A 2Z22A 4RPOA 2UYEA 3K01A 3VV5A 2HCAA 4G8NA 1FTJA 2NWJA 1PDAA 5J1DA 3CG3A 3IO4A 5IKBA 3TPAA 2RC7A 4F1YA 4N13A 5F1QA 3K1MA 2PBWA 3RPWA 1JEUA 1UIUA 4OEVA 3UK4A 1N7XA 3OELA 3EN3A 3TKDA 3W15C 3U93A 1LBCA 1A40A 1AIVA 3TEPA 2A5TB 5CMCA 1ATGA 2DVZA 2PT2A 4U23A 5I56B 2O51A 2XXTA 1FCKA 2X7PA 2DXRA 3DP4A 4IY6A 2X7QA 1MDP1 3IX1A 4KPTA 1D9YA 2H98A 4H6DA 5KZTA 4GOTA 3MBPA 4UACA 4XTCQ 2UVJA 3SEXA 4GQOA 4RJZA 1NFTA 3KBRA 4ECFA 2PYYA 1QUIA 3C33A 1MQIA 4KD5A 2OWSA 3ZKKA 1VR5A 1D9VA 3CSBA 3PPQA 5TP9B 5BUUA 5ELVA 4RNSA 5TPAA 1B5HA 2DOJA 1MXVA 5CBSA 1LAFE 4F2QA 3PUXE 3G3GA 3S9LC 2WKYA 2HAVA 4KHZE 2O1MA 3CRBA 1R9LA 2QS4A 4IO7A 4NF6A 2Q89A 4KYDA 3GZGA 1BP5A 4U21A 4MLQA 1DPPA 2QJEA 2ZYMA 2I58A 4H5FA 3CIJA 1DPEA 2CZLA 1B3EA 1N04A 1BTJA 1IXHA 1UIVA 1VFEA 1LCFA 4O3BA 3H6UA 4TLLB 2D3IA 1YPNA 4IO2A 4OXVA 3E13X 3FASA 4F29A 1MXYA 2O1LA 4ZS9A 2ZNSA 3OENA 4QFPA 3FJ7A 1FQFA 3MP6A 3N6TA 3RN8A 3VXCA 2VP1A 4Q30B 5H8FA 3LSXA 3K4UA 5FHMA 1XS5A 4Z0IA 3S9MC 3K6WA 5BWJA 3I6VA 1A8FA 4MFIA 3ECRA 4IGTA 1POY1 3D4GA 5ICQA 3O29A 1OMPA 3TQWA 4U1OA 3PUYE 5TPAB 3UN6A 2ANJA 1Y9UA 2G93A 2V84A 3U1OA 3IJXB 5M2VA 1M5CA 5AA3A 1B40A 3K6VA 2F34A 2Q2CA 4G68B 3LBSA 1I6QA 1A55A 5KCJA 3QSLA 5AA2A 4NF6B 4IO6A 4IY5A 1XVXA 4WEPA 2H99A 1QW0A 1RKMA 1AOVA 3CVGA 2QS3A 1P1WA 4GD5A 4QFOA 2UYFA 2A5SA 4NF4A 2XXQA 1H44A 3S4UA 2ESNA 1FTOA 3SDFA 3MZBA 4QRZA 1PB9A 1QUKA 3FD3A 4OTEA 5KDTA 4Z7EA 4WXJA 3C32A 2HQ0A 3GXAA 3L6HA 4I1DA 5B7DA 4FEDA 1M5BA 1OQGA 4ZDMA 4G2ZA 2OLBA 1ZMGA 2RC8A 5H8FB 5AA1A 1N84A 2RINA 3K0VA 4PE5B 4YB6A 2HZLA 4KFQA 3B6WA 3CFLA 3PMXA 1B51A 2ONSA 2DS9A 5K2YA 1VSOA 5A5XA 4GXSB 5DEXA 4P0IA 3CFXA 4ZEKA 3TODA 3PD9A 3QIMA 3O6GA 1AL3A 2E0SA 4EXKA 1FQCA 4EQ9A 3W9WA 1B3HA 1MXXA 4NF8A 3IOWA 3OXNA 5DTBA 3PPNA 2HXWA 1TFAA 4RXLA 5AA2B 1N76A 1GGGA 2O69A 1WODA 1FTLA 2DWAA 1H76A 3VVFA 3O66A 2F7AA 2RC9A 4TOZA 2F8DA 1FQAA 1B3LA 1S9TA 4AQ4A 4ESXA 1MY2A 4DLDA 2DP8A 4LZ7A 1SI1A 3TYHA 1LBBA 4DCXA 1B3GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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