1SW2A

Crystal structure of prox from archeoglobus fulgidus in complex with glycine betaine
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
270
structure length
270
Chain Sequence
ERVVIGSKPFNEQYILANMIAILLEENGYKAEVKEGLGGTLVNYEALKRNDIQLYVEYTGTAYNVILRKQPPELWDQQYIFDEVKKGLLEADGVVVAAKLGFRDDYALAVRADWAEENGVEKISDLAEFADQLVFGSDPEFASRPDGLPQIKKVYGFEFKEVKQMEPTLMYEAIKNKQVDVIPAYTTDSRVDLFNLKILEDDKGALPPYDAIIIVNGNTAKDEKLISVLKLLEDRIDTDTMRALNYQYDVEKKDAREIAMSFLKEQGLVK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis for the binding of compatible solutes by ProX from the hyperthermophilic archaeon Archaeoglobus fulgidus.
pubmed doi rcsb
source organism Archaeoglobus fulgidus
molecule tags Protein binding
molecule keywords osmoprotection protein (proX)
total genus 99
structure length 270
sequence length 270
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1sw2A01
3.40.190.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Osmoprotection protein (prox); domain 2 1sw2A02
3C32A 1GV8A 3LC8A 4DXCA 2P2AA 3MZ1A 4XKPA 4IO4A 4OERA 5FHNA 3PPNA 1JEVA 2DXYA 4F39A 2PBWA 2I6EA 2ZNUA 2GFEA 3KGCA 2M8CA 2NOOA 1MY0A 1IXCA 3KJTA 2P1SA 1QJMA 2R6GE 1D9VA 5HPQA 5K2XA 3OO7A 1VFEA 3VFJA 1DTGA 2D5WA 3TKDA 1XT8A 3DELB 5DYHA 4KYSA 3TELA 3PMWA 3K6XA 4EQBA 5CC2A 1A55A 4RY1A 5ISUA 1XVXA 1H76A 2XX7A 3TMGA 2XXXA 2F7BA 4F29A 2G29A 2I0BA 4PFUA 3PPPA 3FJMA 4I62A 3G3IA 3R6UA 4O3BA 3KG2A 4KPTA 1LAGE 4ZEKA 4ZE8A 1WODA 3PPOA 4R9GA 3ZS6A 3EHUA 1H44A 1MY2A 3K1PA 2A5SA 2AIXA 1I6BA 2XXVA 3E9XA 3O6GA 1SI1A 3O97A 4N6PA 5L9MA 2I0CA 2RKMA 3PPQA 2F36A 4YAHX 5TU0A 2GRVA 4QSDA 1UQWA 2I4BA 3TCFA 5H8SA 2E0SA 2ZXTA 4OMBA 4R74A 5TPAA 3G7WA 5AA4A 1FW0A 1KWHA 1R6ZA 2BJJX 2I49A 4NF4A 1II5A 5CMKA 2HCAA 3QK6A 4GL0A 4KYDA 4U2RA 5I2KA 1NMUA 1B0HA 4GF8A 2V3UA 2XXRA 1UTHA 2ABHA 4IO7A 3T66A 3W15C 3G3GA 4MBPA 3O9PA 4PP0A 2HZLA 3JZJA 1SW4A 3QUJA 4NF4B 5H8HA 1JW5A 3FXQA 2Z23A 3GLBA 3EHSA 3M3LA 3HHFA 4RPOA 4BDQA 1TFAA 3PUWE 4DCYA 4ESXA 2DE2A 2I4CA 1DOTA 1BLFA 3FV2A 3CSBA 5H8QB 3PU5A 1D3KA 3IB1A 3TTMA 5J1DA 1MY3A 2ANJA 2E1SA 3MVWA 2ZNTA 2REJA 1B7UA 1Y3PA 1ZTYA 2PX1A 3IB0A 5JTYA 3FJ7A 1N0TA 4NF5B 3V8XB 5B7DA 1NNTA 2H5YA 2V93A 3IR1A 1N76A 1O7TA 1ZJLA 3C9HA 3FUZA 3O6IA 4AB5A 2B3BA 2V25A 4E0XA 1FQDA 4GRKA 1S50A 4RK9A 3MVXA 3HO7A 2XXIA 3HHGA 1MQHA 4ZECA 4OESA 4TLMB 1LAHE 3PPRA 3HV1A 2UYEA 1B52A 1SI0A 4QF9A 1GVCA 2HAUA 3SEWA 3BFUA 1QKAA 2F35A 4GXSB 1P1NA 4UACA 1QUIA 5I56B 3FVNA 2RCAA 1FQBA 2XD2A 4IO2A 3B6TA 4FECA 1EH3A 4QFLA 3ZKKA 1HSEA 3E4RA 3O29A 1NNPA 3OEKA 3RNNA 1YTVA 2ZNSA 1POTA 4GXAA 3VLWA 1URDA 1MQGA 3HN0A 5EHMA 4JXIA 1UIUA 3ONMA 4JSDA 5HBCA 3PV0E 4C1TA 2H9BA 5H8NB 4OEVA 5LOMA 3S9NC 5B70A 4G68C 4O3AA 3PUXE 1MG1A 3ODBA 5I2NB 3QUFA 4RJZA 3K1MA 1NNFA 3H4ZA 4IO3A 4H67A 1IUDA 1NL5A 1WDNA 2P0SA 2Z22A 3KN8A 3CFXA 4R72A 3SEYA 4ZEBA 4F3GA 5KDTB 2DWJA 3N6TA 4NF5A 4QRZA 1UTBA 2Y7IA 4K3FA 4X1DA 1ZLQA 4AB6A 3EN3A 1OVTA 3FGSA 3GXAA 1LLSA 1OIBA 3CVGA 3IB2A 1LCFA 4KD5A 1IQ7A 3KJ7A 1N7XA 4R75A 3T9UA 2G93A 2NXOA 4ZE9A 1N84A 2RC8A 4KI0E 4WEPA 3ZKLA 1H45A 1I6AA 2QRYA 2XXYA 4ZEFA 1O63A 1MH4A 3A09A 4LATA 5CM6A 1LBBA 1Y9UA 2X26A 1FTLA 1JVYA 3R26A 3FXUA 3TCGA 4FEDA 5H8FB 5KCJB 1N3WA 1RKMA 1TWYA 3MZBA 4AQ4A 2QS2A 4YB7A 1UTHB 1B4ZA 4F3SA 1Z7ME 2I48A 1LCTA 2QL3A 2QPQA 4PFWA 4THIA 4U1OA 5AA3A 4EF1A 3IOWA 3MW0A 1S7YA 3U94A 3LSFB 1ZMGA 2XXUA 3ILUB 5JK4A 3UGWA 4WEDA 2OBGA 3LSLA 1M5EA 1GGGA 4X48A 3K6UA 3T9VA 2LAOA 1OLCA 2R9JA 3FXRA 3TODA 3VE1B 1B7HA 1SVXB 3K01A 4DZ1A 4H8IA 1ZBMA 1D9YA 2OJTA 1SBPA 2Q2CA 2V3QA 4LVQA 4QSCA 2YLNA 3OO6A 5BUUA 5BWJA 4OWDA 1NFTA 5H8FA 2THIA 4LONB 4HW8A 5KCJA 4FATA 2AL4A 4POXA 5ELVA 1JW1A 1QUJA 4MF3A 5JTYB 4U1ZA 3RTFB 3S4UA 2CZLA 2Y7PA 3S2VA 4EQ7A 4NTLA 1Y3QA 1LB9A 4U21A 4H0WA 3SERA 1SW1A 3V89B 3W9VA 1N3XA 4OFOA 1JQFA 1POY1 4HTGA 4N13A 3TTRA 1QVSA 3N5LA 4U4SA 4FIMA 4EXLA 2DE4A 3MVYA 3TYHA 4YKIA 1S9TA 3CRBA 2XXHA 3E3KA 4Q5TA 3U72A 2DSFA 1VFDA 1SW5A 4ELPA 2V84A 4XTCQ 5L9SA 2Q89A 3A3UA 3RUMA 1O64A 3H03A 3MP1A 2HEUA 5I58A 3TQLA 2DOJA 3OOAA 4ELQA 3H6WA 3LSXA 5KDTA 3E13X 5DVFA 1IXIA 2CMOA 3FATA 3GBAA 4QFKA 5CBRA 1B3HA 1MXXA 1UTBB 4BDOA 3KFMA 4RXLA 3SETA 3TZAA 4NE4A 4WKMA 2F6GA 4G8MA 1A8EA 1B6HA 3EHTA 1MPBA 3B6WA 4I8CA 5CI5A 3QAXA 2OLBA 4XXUA 3VVFA 5KZTA 1Y3NA 4YU0A 3LR1A 3ZSFA 1PBPA 1YCJA 2UVIA 2XXPA 4DXUA 1T0KA 1MRPA 3PD8A 3EQ1A 3B6QA 3M3KA 1FCKA 1TT1A 3H7MA 1ELJA 3QIMA 1MH3A 2VGQA 4MFIA 3TQWA 3VXCA 1EZOA 2OK2A 2UYFA 3IOTA 2F78A 3MP6A 2W7YA 3UIFA 1A8FA 1FTKA 1R9QA 4FORA 3RQTA 4R6YA 4NF6A 2ESNA 3TEPA 2DYXA 1LFIA 1FTJA 1P99A 2XXQA 4JDFA 4OVJA 4YKJA 2IA4A 2NVUB 5FTHA 2NUVA 5I2KB 2DE3A 3WAEA 3UORA 3VV5A 3UA8A 1CE2A 1ANFA 1TXFA 2ONKE 3H6VA 4G77A 3SEXA 2Q2AA 2FNCA 1PBQA 1FQFA 1H43A 3C36A 4ONYA 4ZS9A 5H8HB 4DXBA 3LBSA 3RN8A 4OFJA 1J1NA 5FTIA 3M3FA 4OETA 3U92A 3I6VA 4Q30B 2QS3A 2RC9A 5DVIA 4QFNA 3RY3A 2V3TA 3TPAA 2DWHA 4G2ZA 1WVJA 1AOVA 4G8HA 3H6UA 3K4UA 3HPIA 2PMSA 2YPNA 3H6TA 1LB8A 1PB8A 2HAVA 3O2AA 4GFRA 3RGYA 3O6HA 4HCYA 2AYSA 3MQ9A 4ELOA 3A3CA 2H4IA 5I58B 4PFTA 3CG1A 5DEXB 1SW2A 2ZYMA 4H6DA 3ECRA 3F11A 4OTEA 3K00A 2DXRA 2X7PA 1MY1A 5FHOA 3FD3A 2F6PA 5AE4A 2IEEA 4YMBA 1B5HA 4OYVA 2UXAA 3FZVA 3RPWA 3MP8A 3C35A 4IB2A 4LZ8A 4LUBA 4QHQA 3IO4A 2A5TA 1A7LA 2O69A 2O84X 2PT1A 4R9FA 3KSXA 4C0RA 4FAJA 1AL3A 4Q0CA 3U8QA 4F31B 2Q9TA 2UVHA 1P1WA 4IY5A 1MQJA 3CI8A 3H3GA 5DEXA 3BBRA 1QUKA 3MJNA 3T9HB 2DWAA 4F2OA 3TAJA 2QJEA 2KLFA 1DPPA 2VOZA 4JB7A 3RT8A 4OHNA 2XD3A 4HCWA 4YKPA 2ZYOA 3T9XB 1QULA 4TQUQ 3VLUA 1MXYA 2I58A 4OEUA 2I3VA 1RYXA 4IY6A 1SYIA 3GZGA 4KYEA 4YB5A 2ZMBA 4ZEDA 3N26A 1MDP1 5I57A 1HSJA 1Y4TA 1BKAA 2A5TB 3FIRA 2R71A 4YZZA 1MPDA 4DE8A 5H8NA 1F9BA 5H8QA 1QW0A 1XOCA 1BTJA 2AL5A 3G3JA 2RINA 4FJPA 4GOTA 4NF6B 4R6HA 5DT6A 3IOVA 3KZGA 3DLNA 3MC2A 2XXTA 1OQHA 1XS5A 5AA2B 2XXWA 1B1HA 1JETA 3P7IA 1P1QA 4G4PA 4ND9A 3T93B 2FYIA 1SQYA 2FA7A 1MDQA 3C34A 4R2BA 1DSNA 3KBRA 3OMBA 4IGTA 4FEBA 5F1QA 1PB7A 1LSTA 5A5XA 1MQDA 4OZ9A 2ZYKA 1ATGA 1PDAA 3FJGA 1B46A 4X1BA 3TTKA 2B3FA 4F2QA 4IO6A 4MLVA 3L6HA 3TFLA 5HM4B 5AA4B 2H99A 5JEIA 1MM6A 1OQGA 4ECFA 1EZ9A 3MUQA 3N94A 3LUYA 1MM7A 4PE5B 1I6QA 4G8NA 3CSGA 4GQOA 3C4MA 5ITOA 4NEDA 3K1NA 4EUOA 4YMAA 3MPLA 4RK2A 4POWA 2VP1A 4DIGA 5ICQA 3RTWB 4EQ9A 3QXMA 2DP8A 3D4CA 3PGFA 2GHBA 2GH9A 3T96B 4GWOA 3TUSA 4BDLA 3Q28A 1OVBA 4HS7A 4WXJA 2Z8FA 4PQJA 3V5AA 3IORA 1EZPA 2O1MA 3FASA 1B1XA 2F97A 4GL8A 3CFZA 3QYTA 3SEVA 3EPEA 4QFPA 3UP9A 1DPEA 4UA8A 1FTMA 5I57B 3KEIA 2PT2A 3IOUA 3M8UA 1MQIA 1US5A 2D21A 3K02A 3OSRA 5DTBA 1I69A 3W9WA 2VHAA 1R1NA 3MBPA 3O28A 3WAFA 1M5BA 1ZIUA 3G3HA 1B3GA 1Q35A 1NKXA 3K6VA 4KHZE 3VXBA 4BDNA 2D3IA 1Y4CA 2O6AA 4H5FA 4H8JA 4ISUA 3TTLA 5CMBA 2YJPA 3IO6A 1B2HA 1BP5A 2Y84A 4BLAA 2DS9A 2ALUA 2OZZA 5AA1A 4LZ7A 3IL1B 1IIWA 1GR2A 3CG3A 3IX1A 4JWYA 3SKPA 3OXNA 4GIZA 1ZKBA 1US4A 2OWSA 1DTZA 3FV1A 5A5XB 3CFLA 3RLFE 2F34A 3I3VA 3KN3A 2HFBA 1GTKA 1SD3A 3OO8A 4RNSA 2XHDA 2X7QA 3T22A 1IITA 1UIVA 3PUYE 2H25A 4KCDA 3MZ9A 3HSTA 1NNKA 1MXWA 3OD7A 4LQ2A 5DVJA 5AA2A 4RA1A 4TOZA 1IXHA 3KOSA 4XIGQ 5AA2D 4RYAA 1B3FA 2UVJA 2VD3A 5ITPA 3DP4A 1JW4A 2RC7A 1FQEA 2GHAA 3ILTB 4KQPA 4Z0IA 1B32A 3UN6A 4TLLB 4F1UA 4OENA 1PB9A 3DM0A 1B3LA 3AXFA 1JNFA 4GVOA 1A40A 4H65A 4R73A 1MXUA 2O1LA 2QSXA 2Q88A 3OO9A 1VSOA 4XKQA 1TFDA 1JVXA 2UVGA 2Y7RA 3N6UA 1MXZA 4R2FA 2O7IA 4KCCA 5K2YA 4FE8A 1LFHA 2O68A 1Y1MA 2Y7KA 4ZZAA 3SEUA 5I2NA 3V83A 1IEJA 4BDMA 4E0WA 1DMBA 5TPAB 3RT6B 3TTNA 4Z7EA 4DCXA 1Y20A 1EU8A 3IAZA 1B4HA 5IKBA 3THIA 5L8DA 1R9LA 2H98A 1CB6A 2REGA 1Y1ZA 2Q8JA 4QSEA 2RF1A 1PC3A 1B5JA 1P1OA 4OFLA 4RPNA 4KFQA 4NMYA 3DP6A 3S9EA 1JEUA 3CIJA 3O66A 2HZKA 1B3EA 1USYE 4PETA 3IK6B 4PFYA 3G3KA 3GBBA 4YB6A 4YKKA 4F18A 3K0VA 4F3PA 4OQOA 1VR5A 2OCUA 3OELA 3PD9A 2F5XA 4XKNA 4XKRA 4ELRA 1LGBC 2O7UA 3IJOB 3VDFA 3U1OA 3EF7A 3G3FA 4JWOA 4YICA 3FVOA 1AH5A 3KN7A 5I56A 4H1XA 4O3CA 4N07A 4U4XA 4EF2A 2O51A 1SYHA 1FQAA 1LBCA 1NH7A 2DVCA 2DWIA 2ONSA 3PUVE 5CMCA 3VLVA 4EXKA 2RCBA 2F7AA 3H06B 3FVKA 2DQVA 3C31A 5M2VA 2XX8A 1QKBA 3PUZE 3QSLA 1B7ZA 1MS7A 2OWTA 2DVZA 1USYH 3MWBA 4LQ5A 4LA9A 1ZU0A 4U23A 1Q1KA 4P11A 4OXVA 4IGRA 1HSLA 1YPNA 3L6GA 1N7WA 3UK4A 4M4GA 4H5GA 4L17A 4I1DA 1A99A 4GLIA 1P1UA 3Q27A 4MLQA 1M5CA 3CR9A 4P0GA 1AMFA 4NF8A 1OLAA 2WKYA 4G68B 4GD5A 1B5IA 2PYYA 2HQ0A 1M5FA 5CRYA 5TP9A 2I3WA 2Z8DA 4F1VA 2QS4A 3MAMA 4I9DA 3SESA 3I5OA 5EHSA 1XC1A 4ZZEA 3TCHA 1B9JA 4R6KA 4IO5A 4F19A 4LZ5A 1B58A 1MPCA 3BFTA 3OEMA 3VVDA 4BDRA 3HCQA 4F1YA 5CBSA 3PMVA 1OMPA 3FVGA 1IXGA 4Q8RA 4JWXA 4U22A 1LAXA 5I59A 3MVZA 1FQCA 4P0IA 3IJXB 4NF8B 3B7DA 2QS1A 3K6WA 4EDPA 1URSA 3K2DA 1URGA 2VD2A 1RYOA 4X9TA 3LSWA 2QMWA 3TDJA 4QFOA 1D4NA 1IZ1A 2B65A 2HXWA 2Y7WA 4C1UA 4KR5A 4F22A 3Q25A 3USDA 3VVEA 1FTOA 2F7CA 3BKIB 1A54A 1N04A 1B0LA 1SDXA 3DP8A 3JV9A 5FHMA 3SDFA 3U93A 3S9MC 2F8DA 3PMXA 3JYRA 5CMMA 5I59B 4F3BA 2NWJA 3MPKA 1LFGA 3C33A 5F7VA 5IAIA 5ICTA 3OENA 2ONRA 3D4GA 3KOTA 3Q26A 2Z8EA 4ZEIA 1XVYA 1B51A 4DLDA 1NH8A 3R7XA 2PVUA 3KSJA 3Q29A 1YAEA 2QMXA 4ESWA 1XHYA 1B05A 1H3DA 3OSQA 1Z7NE 4JBZA 1MXVA 4G68A 5I84A 2XX9A 1LAFE 4ZDMA 1L5TA 5TP9B 4MH5A 3S9LC 1B40A 2ZYNA 5EYFA 4NWDA 1AIVA 1BIYA 1MY4A 4JSOA 4M1VA 4NWCA 4DDDA 5L9OA 1M5DA 4LP2B 1PEBA 1VE4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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