1SW2A

Crystal structure of prox from archeoglobus fulgidus in complex with glycine betaine
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
270
structure length
270
Chain Sequence
ERVVIGSKPFNEQYILANMIAILLEENGYKAEVKEGLGGTLVNYEALKRNDIQLYVEYTGTAYNVILRKQPPELWDQQYIFDEVKKGLLEADGVVVAAKLGFRDDYALAVRADWAEENGVEKISDLAEFADQLVFGSDPEFASRPDGLPQIKKVYGFEFKEVKQMEPTLMYEAIKNKQVDVIPAYTTDSRVDLFNLKILEDDKGALPPYDAIIIVNGNTAKDEKLISVLKLLEDRIDTDTMRALNYQYDVEKKDAREIAMSFLKEQGLVK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Protein binding
source organism Archaeoglobus fulgidus
publication title Structural basis for the binding of compatible solutes by ProX from the hyperthermophilic archaeon Archaeoglobus fulgidus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords osmoprotection protein (proX)
total genus 99
structure length 270
sequence length 270
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1sw2A01
3.40.190.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Osmoprotection protein (prox); domain 2 1sw2A02
3H6WA 3RQTA 3H3GA 1R1NA 1HSEA 2F7AA 3PMXA 3O97A 1HSLA 4TLMB 5I2NA 3TFLA 1N04A 1JQFA 3I5OA 1N3XA 3TUSA 4RA1A 2H9BA 1LAXA 1CB6A 1B5JA 2PBWA 4XXUA 4RPNA 5TPAB 3TELA 4LA9A 4NF4A 4RYAA 4DXBA 1SI0A 3MQ9A 4G8MA 4EF2A 3VVEA 3ZKKA 2ALUA 2VD2A 1MY2A 3B7DA 1R6ZA 3KOSA 2NXOA 4LONB 4OESA 2NUVA 4OEVA 3FXRA 3UIFA 4AB5A 3TTMA 5DVIA 4X9TA 1A40A 4GIZA 3RGYA 4F2QA 3RY3A 1JEVA 3VXCA 3QYTA 2ESNA 3U92A 3MWBA 4X1DA 3V83A 2Y7IA 4RPOA 3MW0A 5FTIA 5ITPA 3C9HA 3FASA 1LCFA 2GRVA 5H8QB 3KZGA 3IL1B 3G7WA 3D4GA 3TCFA 3MUQA 5TP9B 4RJZA 4LQ5A 3VVFA 2P2AA 5M2VA 2P0SA 1FTLA 3CVGA 4F3GA 2UVGA 1IEJA 3HV1A 2O1MA 5ISUA 3MZ1A 3K4UA 4GL0A 4U1ZA 4MLVA 1QUJA 2AYSA 2G93A 4OYVA 2Y7KA 3S9LC 3VE1B 5H8FB 5CBRA 2DE4A 1Y20A 2XXYA 1SYIA 4LATA 1FCKA 4O3AA 5DEXA 2W7YA 4XKRA 4OFJA 3JZJA 3VDFA 4PE5B 4NF5A 3CFXA 4ELOA 4QFOA 4WEDA 1IQ7A 3O6IA 3DP4A 1Y4TA 2V3UA 3FGSA 4R6HA 2E0SA 3DLNA 5AA4A 1S9TA 3RLFE 3MC2A 5CMKA 1GR2A 1POY1 4H0WA 4ZEFA 1B7ZA 1ZTYA 1TFDA 3OMBA 3KBRA 3N26A 3PPNA 4U2RA 1DTGA 5I2NB 4H5FA 2QJEA 2V3TA 4OXVA 2CMOA 4OVJA 5CBSA 4F31B 2XXWA 2R71A 4HW8A 1LLSA 1TT1A 2H4IA 4PFWA 4YMBA 4NF4B 3N6UA 4G2ZA 3OO9A 4KYDA 2P1SA 2XD3A 2ANJA 1B5HA 2FA7A 3EF7A 3O66A 3PUWE 3KN3A 4PQJA 4QF9A 4U4XA 2QS3A 2Q8JA 3LR1A 4WKMA 3DP8A 2OWSA 5JEIA 3O9PA 4R72A 4KYEA 4MF3A 2RKMA 4F39A 3EQ1A 1LGBC 1B3LA 3K0VA 3R6UA 4EXLA 4U4SA 1MY4A 1IITA 1T0KA 4QFNA 1BLFA 2DXYA 5J1DA 3KJTA 1D9YA 1MXZA 3V89B 1ZJLA 1IUDA 5DTBA 4F3SA 3U1OA 3V5AA 1N7WA 2OCUA 5EHSA 4ZS9A 3Q25A 2PT1A 1NNFA 2UYFA 1Y1ZA 4HS7A 4Q0CA 2F5XA 4BDRA 2QMWA 4PFTA 4IO2A 4YB6A 3SEUA 1S7YA 5DT6A 2QL3A 1JNFA 3I3VA 4DXUA 2Z23A 2PYYA 5HPQA 3T9HB 3GLBA 2XX9A 1O63A 2O84X 4IB2A 3FJMA 3A3CA 1MH4A 3TTRA 2PT2A 2O68A 1SQYA 5ICTA 4H1XA 1B32A 3G3KA 2ZXTA 2NVUB 4ESXA 2XXHA 1MPDA 3H06B 4JWYA 4GXAA 3FZVA 4C0RA 2HXWA 3MZ9A 1FQDA 4XKPA 1NMUA 3KEIA 1TFAA 3SERA 5AA2A 1MM6A 1URGA 5DEXB 4Z7EA 3DP6A 3H6TA 2QMXA 2B3BA 1OLAA 1VFEA 2XX8A 3K1NA 1XS5A 4NF5B 4F3PA 2R6GE 3LSLA 2PVUA 3HSTA 4ISUA 2H5YA 3TZAA 5AA4B 2ABHA 2ONRA 3C32A 2ONKE 5FHMA 2Y7PA 1Q35A 2CZLA 1JW5A 2XXRA 4ELQA 3FXQA 1Y3NA 3IK6B 3EN3A 1UTHA 4YZZA 5LOMA 3ZSFA 2V93A 1N76A 2I48A 3FVGA 2WKYA 3FUZA 4P11A 2ZYOA 4OFOA 2DYXA 4GVOA 5JTYA 1PB7A 4GFRA 1GGGA 2HAVA 4YKJA 1UIVA 2DVZA 1A54A 3G3FA 1PBQA 4IO5A 4JXIA 3K6VA 4DZ1A 5B7DA 2F97A 3KGCA 3UP9A 4M4GA 3KOTA 4BDLA 4GRKA 4YKPA 3VLWA 1IXGA 1UQWA 5L9MA 3M3FA 1B9JA 1P1NA 4R74A 1ZIUA 1B2HA 1LAFE 1IZ1A 3T96B 1MQHA 3QIMA 1XHYA 3BFTA 3Q29A 2F34A 1PEBA 4U22A 1B4HA 1H76A 1M5BA 2THIA 4MFIA 3HHGA 1SI1A 1EH3A 3B6WA 5H8SA 1EZ9A 2O69A 3S9NC 2UVHA 1B3EA 2PMSA 2Q2AA 1MXUA 3E9XA 1DOTA 3O2AA 3OEMA 1FTJA 3KFMA 3DM0A 1URDA 3OEKA 5AA1A 4GF8A 2BJJX 2F35A 3B6QA 2UVJA 2ZNTA 3IJOB 4YKIA 2DP8A 4ONYA 1EZOA 3MVXA 4JWOA 2I0CA 4F19A 3Q26A 5AA2B 4IGRA 4Q8RA 1HSJA 3PU5A 1MQGA 3GBAA 4OEUA 2QS1A 1H44A 2QPQA 1DTZA 2Z8EA 1B6HA 1MDP1 5K2YA 4QRZA 3QSLA 3RTWB 4NF8A 3PD8A 2OWTA 1AMFA 4KI0E 1QUIA 1VR5A 1UTHB 3IB0A 4KPTA 4FE8A 1RYOA 1IXCA 1WDNA 1B0HA 1D4NA 2DWAA 2HZLA 3MAMA 3K1MA 5JTYB 4PP0A 3FATA 1B7HA 4YB7A 3PD9A 1NH7A 4G68C 3IORA 2YLNA 3IAZA 2Z8FA 1USYE 3RPWA 2GHAA 3GXAA 4I1DA 3IB1A 3PGFA 1AL3A 4H65A 4R6YA 5DVJA 2RC8A 3H4ZA 4UA8A 4YMAA 1R9QA 3CSBA 4XKQA 1MXVA 3IJXB 4GWOA 1CE2A 4O3CA 5FHOA 2DSFA 2HQ0A 2VGQA 5A5XA 1OQHA 3VV5A 4NMYA 1RYXA 4ECFA 1JETA 3LC8A 1ZKBA 4R73A 1MY0A 2F78A 3UK4A 2AL4A 1ATGA 2D3IA 2HCAA 3OELA 4DIGA 1MG1A 3K01A 3E4RA 3IO6A 3IOVA 1ZMGA 3EHTA 4HTGA 4ZECA 3QAXA 4N07A 2XHDA 1SYHA 2G29A 3O6HA 2DE3A 4ZE8A 2GH9A 1Y9UA 4NTLA 1B58A 1N0TA 4LP2B 3T93B 1A8EA 2OLBA 2XXUA 4OENA 3S9MC 1DSNA 4YU0A 5JK4A 1Y1MA 3H03A 1MXWA 3OXNA 3PMVA 1B3HA 3W9VA 4BDMA 4X48A 1H45A 1FQBA 3U93A 3RUMA 1ZLQA 2XXIA 3OO8A 3KN8A 3L6GA 1FQFA 1R9LA 1POTA 2O6AA 1I69A 3IOUA 1IIWA 2O1LA 4PETA 3LSWA 1Q1KA 2DWJA 4G8HA 1MQIA 4NF8B 4OWDA 1OQGA 3LUYA 1US4A 3S4UA 3PPOA 1J1NA 4DCXA 3K00A 4OQOA 1OMPA 3UORA 3OSRA 4R9GA 4KD5A 1SDXA 5I58A 3VFJA 3A09A 1H43A 5H8NA 5IKBA 3F11A 4JB7A 4R9FA 3MZBA 5I56A 1TWYA 3HO7A 1VE4A 2RF1A 3RTFB 2QRYA 3N5LA 5I57A 2XXTA 3FV1A 3SDFA 3RNNA 2FNCA 4NWCA 1XVXA 3TODA 2AL5A 5CMMA 1LFGA 2DOJA 3W9WA 5ELVA 1AIVA 1S50A 4QFPA 4OHNA 2X7QA 1YPNA 4LZ5A 3ONMA 4TQUQ 2F36A 5DVFA 1PB9A 2A5SA 1B52A 5A5XB 1N84A 4MLQA 2Z8DA 4DDDA 2REGA 2Q89A 3S9EA 5F1QA 3OO7A 2DVCA 4WXJA 3USDA 1DMBA 1B05A 2ZNSA 5HM4B 1B4ZA 3RT6B 1BIYA 4KYSA 3MP8A 1NNTA 2Q88A 5CC2A 2PX1A 1N3WA 1B7UA 4NWDA 1B1HA 1B5IA 1LCTA 3B6TA 2H99A 4H8JA 3FJ7A 4JWXA 3TCHA 4F1YA 5CMCA 3C33A 1US5A 4H5GA 4GL8A 5ICQA 2ZYNA 5IAIA 2AIXA 5B70A 1BKAA 1A8FA 3UN6A 3RT8A 1QVSA 3L6HA 4ZEIA 4EF1A 3K6XA 2B3FA 5L8DA 1NNPA 3CI8A 3O28A 5BWJA 4M1VA 3WAEA 3TQWA 1WODA 2OBGA 3ILUB 3T9XB 1JVYA 3TMGA 4I8CA 3DELB 4GXSB 1AH5A 3FD3A 3FVNA 3TQLA 3IOWA 4KFQA 2XX7A 5AA3A 4ESWA 2HFBA 2B65A 3O29A 3K02A 3AXFA 3GZGA 3SETA 4RY1A 5I58B 5L9SA 5H8NB 1Z7ME 1PB8A 3OD7A 4JBZA 4JSOA 3TTLA 1FQAA 1B3GA 4IO4A 1LAHE 1LBBA 5I56B 1SW4A 1UIUA 3HHFA 1NL5A 3U8QA 2RCAA 5I57B 3MP1A 3Q27A 1QULA 3BFUA 2Q2CA 4LVQA 2X7PA 1NFTA 4KCDA 3BBRA 5H8HA 3PUVE 4Z0IA 4WEPA 4PFYA 1N7XA 1JW1A 5DYHA 3TCGA 3EHSA 1I6BA 4C1UA 3C36A 2I58A 2NOOA 1P1OA 1VSOA 3IO4A 4G77A 1B3FA 4OETA 3PMWA 2D5WA 3E3KA 2NWJA 4MBPA 3TPAA 1MXYA 4DLDA 4ND9A 4EQ9A 3E13X 1MQJA 4IO6A 5KCJA 5EYFA 1D3KA 3LSXA 4KHZE 2XXQA 3ODBA 3H6VA 3PUZE 1BP5A 3W15C 4RXLA 3H7MA 1QJMA 1B1XA 2F6PA 3PPQA 3S2VA 2REJA 4P0IA 4FAJA 3C34A 3CG3A 3KSXA 4QSDA 3MJNA 5F7VA 2V25A 1LFHA 1FTMA 4BDQA 2F7CA 4E0WA 2DWIA 1FTOA 3FIRA 2I4BA 4G4PA 4LZ8A 1NH8A 4FATA 4EQ7A 1JW4A 2RC9A 4F2OA 5I84A 1MM7A 1ANFA 3ZKLA 4Q30B 4RNSA 1VFDA 4F29A 2XD2A 1NNKA 4FECA 2DXRA 1FTKA 3SKPA 2F8DA 2X26A 4R2BA 2Y84A 4EUOA 3IX1A 4ZEKA 3HPIA 5AE4A 2VOZA 2QSXA 1B40A 5I2KA 2A5TA 2UYEA 4DXCA 4EQBA 1A7LA 3FVOA 1XC1A 2HEUA 5HBCA 1UTBA 2RCBA 3SEYA 4FORA 1QKAA 1GTKA 1IXIA 3O6GA 5FHNA 1F9BA 3U94A 2QS4A 3MBPA 5AA2D 4O3BA 3G3HA 4E0XA 4JDFA 3VLVA 1SBPA 1M5FA 3OENA 2ZMBA 3TTNA 1JEUA 5CRYA 1I6QA 1MPBA 3EHUA 3MVYA 2M8CA 5H8HB 4FEBA 3R7XA 2XXXA 1GV8A 3IOTA 3KJ7A 5K2XA 3A3UA 4TLLB 3LBSA 1BTJA 1PDAA 1I6AA 3T66A 1LB8A 1MY1A 1TXFA 1URSA 2I3VA 4H8IA 3KG2A 4F22A 1ZU0A 3KN7A 3FV2A 3N94A 2DE2A 4QSEA 1SW1A 4YICA 4N6PA 5KCJB 4ZZEA 1H3DA 4DE8A 3UGWA 4KQPA 4XKNA 1FQCA 2IA4A 1QW0A 2VD3A 4OZ9A 2F7BA 4C1TA 3CIJA 4IGTA 3P7IA 4RK9A 1Y3QA 1MS7A 2I49A 4NEDA 1GVCA 3WAFA 3Q28A 4F1VA 3MP6A 4AQ4A 3VVDA 4FEDA 3FXUA 3QK6A 5FTHA 4ELPA 4BDOA 1JVXA 4ZDMA 4K3FA 4G68A 3OSQA 3QUFA 3TTKA 1B46A 4OMBA 4POWA 2ONSA 4XTCQ 2E1SA 2ZNUA 1O64A 3PUXE 5TU0A 3I6VA 1M5DA 4EXKA 2OJTA 3M3LA 1WVJA 3T9UA 5I2KB 2A5TB 2F6GA 3PPPA 4N13A 1UTBB 3FVKA 1USYH 1B0LA 1MDQA 1P1UA 4LZ7A 2I6EA 2UXAA 3M3KA 1QKBA 4UACA 5I59A 2QS2A 3GBBA 3JYRA 4ZEDA 2O51A 1M5CA 4GD5A 1LSTA 1L5TA 3R26A 4MH5A 1A99A 4I9DA 3U72A 1OVBA 4QFKA 3PPRA 4OTEA 3CRBA 1ELJA 2H25A 5EHMA 4HCYA 3V8XB 2O7UA 1XOCA 1DPPA 4H67A 4IY6A 1B51A 1OVTA 3IB2A 3K6UA 4XIGQ 3MPKA 4GOTA 3PV0E 2FYIA 3T9VA 3VXBA 5L9OA 1O7TA 2I3WA 2R9JA 4QSCA 3TEPA 4P0GA 3PUYE 1II5A 1SW5A 4ZZAA 4IO3A 2GHBA 2Z22A 3BKIB 2KLFA 3K1PA 1P1QA 3CFLA 4QHQA 1LFIA 3CG1A 4QFLA 3ILTB 3CSGA 2VHAA 4NF6A 1MY3A 3TAJA 1FW0A 4ZE9A 2V3QA 3UA8A 1SD3A 1MH3A 3THIA 4KR5A 3EPEA 1EU8A 3D4CA 3G3GA 1NKXA 1ZBMA 3LSFB 3TYHA 3MVZA 4F1UA 3G3JA 5KDTA 1KWHA 3M8UA 4G8NA 1A55A 1YAEA 2I0BA 2DQVA 2UVIA 1LAGE 1Y3PA 4OERA 4LQ2A 4G68B 3OO6A 2YJPA 2Q9TA 2OK2A 2I4CA 4U23A 2ZYKA 1XT8A 3SEWA 3TDJA 4KCCA 4LUBA 2HZKA 4H6DA 3SESA 1SVXB 1FQEA 3ECRA 4IY5A 5TPAA 1MRPA 2RC7A 2D21A 1OIBA 4DCYA 2XXPA 3SEXA 4NE4A 1D9VA 4BDNA 4YAHX 4FJPA 5I59B 4RK2A 2OZZA 4ELRA 1MPCA 1P99A 3MVWA 3QXMA 2IEEA 2GFEA 1QUKA 4OFLA 3JV9A 1Z7NE 4GLIA 4AB6A 4YB5A 1XVYA 2ZYMA 2VP1A 2V84A 2RINA 4U21A 3CR9A 3K2DA 4TOZA 4R2FA 4FIMA 3HN0A 1EZPA 4F3BA 4Q5TA 4X1BA 1Y4CA 3RN8A 5H8QA 3N6TA 1MXXA 5BUUA 1MQDA 3QUJA 2O7IA 4PFUA 4ZEBA 1YCJA 2DS9A 1P1WA 4R6KA 5TP9A 4U1OA 2Y7RA 2LAOA 3IR1A 4GQOA 3OOAA 3T22A 1PC3A 4EDPA 4I62A 1PBPA 1LB9A 2H98A 3H6UA 3FJGA 3C31A 2XXVA 5CM6A 3C35A 3HCQA 5H8FA 1IXHA 4NF6B 1AOVA 3CFZA 1YTVA 2HAUA 4BLAA 3TKDA 3G3IA 1RKMA 4JSDA 3MPLA 1SW2A 3KSJA 3VLUA 5KZTA 4IO7A 3K6WA 4YKKA 4HCWA 4F18A 5CMBA 5ITOA 5KDTB 1LBCA 1OLCA 5CI5A 3ZS6A 2YPNA 2DWHA 4R75A 2Y7WA 3SEVA 4THIA 4L17A 1M5EA 4POXA 1DPEA 3C4MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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