1SW2A

Crystal structure of prox from archeoglobus fulgidus in complex with glycine betaine
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
270
structure length
270
Chain Sequence
ERVVIGSKPFNEQYILANMIAILLEENGYKAEVKEGLGGTLVNYEALKRNDIQLYVEYTGTAYNVILRKQPPELWDQQYIFDEVKKGLLEADGVVVAAKLGFRDDYALAVRADWAEENGVEKISDLAEFADQLVFGSDPEFASRPDGLPQIKKVYGFEFKEVKQMEPTLMYEAIKNKQVDVIPAYTTDSRVDLFNLKILEDDKGALPPYDAIIIVNGNTAKDEKLISVLKLLEDRIDTDTMRALNYQYDVEKKDAREIAMSFLKEQGLVK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for the binding of compatible solutes by ProX from the hyperthermophilic archaeon Archaeoglobus fulgidus.
pubmed doi rcsb
source organism Archaeoglobus fulgidus
molecule tags Protein binding
molecule keywords osmoprotection protein (proX)
total genus 99
structure length 270
sequence length 270
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1sw2A01
3.40.190.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Osmoprotection protein (prox); domain 2 1sw2A02
1B4HA 2XX9A 3ZSFA 1MG1A 1RKMA 2FA7A 3L6HA 4MLVA 1GTKA 1LAHE 4C0RA 4ELRA 1ZIUA 3K6UA 4OXVA 1MY0A 2HAUA 1EU8A 3E13X 2UVIA 4H5GA 4UACA 3FIRA 1DTGA 1JEVA 4IO4A 4U22A 3TTKA 4DZ1A 4GXAA 4IB2A 1B0LA 2ONRA 4R73A 3FJMA 1VFDA 2ESNA 1KWHA 4TLMB 3RTWB 2OCUA 3MP6A 3V83A 1MXYA 3I6VA 4IO3A 3KBRA 3FXQA 5LOMA 1IIWA 1LLSA 1R1NA 4L17A 4MFIA 4QFOA 4R6YA 4M4GA 4AQ4A 1A7LA 4N13A 3T22A 4ECFA 2RCBA 5F7VA 2Y7RA 3CIJA 1MY4A 4OENA 1QVSA 1XVYA 3IOTA 4LUBA 3TKDA 1FQCA 4F39A 3O29A 1B46A 3UN6A 4O3CA 3OO6A 3OSRA 3Q28A 1OIBA 1MXXA 4JSDA 4P0GA 5CMMA 1R6ZA 4ZDMA 3KOSA 1UTHA 1Q1KA 3BBRA 1LB8A 4YMAA 1PEBA 3PUVE 5BUUA 4IO5A 1BP5A 1US5A 3KFMA 1MH3A 3RNNA 1LFHA 3TCGA 2XD3A 3LSWA 4YB7A 1EH3A 3IB2A 5EYFA 3HHGA 4H65A 4I8CA 1XC1A 4NF5A 5CMBA 3N5LA 5EHSA 4Z7EA 4PP0A 4FECA 4H67A 1QULA 1IITA 2RC8A 1OQGA 1TT1A 3QSLA 4H0WA 4EXKA 3A3UA 3FATA 4NE4A 1IEJA 2IA4A 5L8DA 3T9VA 3MZ1A 4NF4B 2ZNUA 2F6PA 1H76A 3JYRA 3K1MA 3MPKA 3MQ9A 4DCYA 3O6HA 2YLNA 3QYTA 2DVZA 1O64A 2GRVA 4I9DA 4QFKA 1FQEA 3QAXA 4C1TA 2HZLA 2OK2A 3FVKA 1AOVA 3T66A 4RA1A 2F7AA 5DVFA 3EHSA 4GRKA 4OTEA 5ITPA 2ABHA 1D9YA 2Z8EA 2Z8FA 4AB5A 1NMUA 2Y7WA 1B40A 3IB1A 1FTKA 4YKJA 3SESA 5AA2D 1POY1 1MY3A 3A09A 1Z7ME 1AL3A 1SW5A 3H3GA 5DYHA 1CB6A 1JEUA 1YAEA 2ALUA 3BFUA 2QJEA 4LP2B 5I2KB 5CM6A 2OBGA 2F7BA 4YICA 3CR9A 3CRBA 3MBPA 4LONB 3HSTA 4PETA 3EHTA 4U2RA 1JETA 4U1OA 5I59B 1A99A 3W15C 4QFNA 5ISUA 5JTYB 1A8FA 1NL5A 1MQIA 4YKPA 5DTBA 3Q25A 3U72A 4ELOA 3N94A 1SW1A 4F1VA 2Y7PA 3LUYA 3C34A 2O7UA 3USDA 1NH8A 2XX7A 1BIYA 1SI1A 3Q26A 4O3BA 3G3KA 3U8QA 3VXCA 3OEKA 2V93A 4XKQA 2G29A 2HFBA 2XXIA 4ZEFA 1Y9UA 3KJTA 3CSGA 2R9JA 4HS7A 3IJXB 3OD7A 4XXUA 2ANJA 3TFLA 1D4NA 1PB8A 2O68A 4G8HA 2F6GA 3ZS6A 5I84A 2RCAA 3QIMA 1IUDA 2D21A 4O3AA 1B9JA 1A8EA 1JQFA 3C9HA 5J1DA 1AH5A 3FVNA 2Z22A 3K4UA 1LSTA 5H8NB 1SBPA 1UTBB 3TUSA 4RNSA 2VOZA 1O63A 3OEMA 1FQDA 3CG3A 3CFLA 1FTLA 2QMXA 3A3CA 3H03A 4BDLA 3TAJA 2V3QA 1MM7A 4KHZE 4LATA 3S9NC 1J1NA 1JVYA 2I48A 5H8HB 1QUIA 3TDJA 1QKAA 4HTGA 1MQJA 4EXLA 5FHMA 2QS3A 1BKAA 4EQBA 2HQ0A 3V89B 5L9OA 1VE4A 1FTMA 3K2DA 1USYH 4U4XA 5KCJB 1F9BA 2I4BA 1ZKBA 3B6WA 3K6WA 4GIZA 3WAEA 2V3TA 2NXOA 1H43A 1OLCA 2F8DA 4PQJA 5F1QA 3G3FA 4ELQA 1B7HA 4ZECA 2UVJA 3DELB 4NF4A 1UIVA 2I3WA 1IXGA 2DXRA 1B58A 3MWBA 1B3GA 3FV1A 3K6XA 3E3KA 4H8JA 3LR1A 3MVXA 2F35A 4LVQA 3MPLA 2ZNTA 3CFXA 1NFTA 2YJPA 3VE1B 3U93A 2H98A 2XXXA 1M5CA 3DM0A 4TLLB 4ISUA 1A55A 1YTVA 1B51A 4H8IA 1N7WA 1B5JA 1I6BA 2B3FA 4OVJA 3W9WA 4OEVA 4BLAA 2O69A 3OOAA 3TZAA 1US4A 3UA8A 1TWYA 1N76A 3IJOB 5AA2A 1GGGA 5I58A 4GOTA 2DWJA 5DEXB 1H3DA 1B3EA 3M3KA 5AA1A 3SEVA 4R2FA 4HCYA 5FHOA 2WKYA 1ELJA 3W9VA 4G68C 2PVUA 4JDFA 1N84A 1XVXA 2P0SA 4TOZA 3FVOA 3TYHA 4FORA 2V3UA 1LFIA 2OWTA 1QW0A 3SDFA 2P2AA 4RK9A 3TQWA 2R6GE 1I6AA 3K0VA 4Q8RA 3BKIB 5KDTB 3TTMA 5I59A 1QKBA 2RKMA 4E0XA 1N7XA 1FTJA 4R9FA 1H44A 4MF3A 4ONYA 2F36A 2D3IA 3FZVA 4HCWA 2UYFA 1Y4CA 4QSDA 4XKPA 4BDQA 2DXYA 5CC2A 3VFJA 5I57B 1SYIA 4IO7A 1P99A 3PUZE 1UIUA 3IOWA 3OO8A 4NF5B 3O28A 4THIA 4ZZEA 4KD5A 4G77A 4ZE8A 1FQFA 1P1OA 1MXUA 3IAZA 2A5SA 4GVOA 1LCTA 1MY2A 4G4PA 4JXIA 1N3WA 1QJMA 3T93B 3U92A 5IAIA 5FTIA 2I0CA 4IO2A 4YU0A 2D5WA 5H8QB 3FXUA 3D4CA 3LSFB 5AA4A 1MQGA 3QUJA 4JWOA 5I2NB 2I3VA 1N3XA 1M5DA 2AL5A 4KYSA 4N07A 2DYXA 2XXTA 3TTNA 5JK4A 4FE8A 4ELPA 2DS9A 4Q5TA 1PB7A 3MVWA 1LAFE 2I49A 3PU5A 3MP1A 4RXLA 3G3GA 1B4ZA 2G93A 5H8SA 1S50A 2O1MA 1NNKA 2DVCA 2ZMBA 2XXQA 3IB0A 3LSLA 4FEBA 1MPDA 4WKMA 3ECRA 4BDMA 4ZEKA 4GXSB 3HN0A 5M2VA 3RPWA 3T9XB 5H8FA 3MJNA 4FAJA 2UYEA 3PPPA 4WEPA 4EDPA 4NEDA 4I1DA 2PX1A 3LBSA 3FUZA 4KCCA 4NF8A 5FHNA 4EQ7A 3O2AA 1MY1A 2ONSA 3H6TA 1RYXA 1IZ1A 3KGCA 3MZ9A 3UP9A 2RF1A 4R72A 2QMWA 3RGYA 3VVDA 4AB6A 4HW8A 3FXRA 3I3VA 4LA9A 1H45A 2OJTA 5H8QA 1D3KA 4LZ8A 4FEDA 4MLQA 4XKRA 5IKBA 1LCFA 2ZXTA 4G68B 1D9VA 1SW2A 3O6GA 4JWXA 4WXJA 5HPQA 4XTCQ 5CI5A 2OLBA 1JW4A 4RY1A 3FD3A 1IXCA 1UTHB 4I62A 4F22A 1MXVA 4BDNA 3RT8A 1FCKA 1DMBA 2H9BA 3EPEA 4YAHX 3S9MC 1Q35A 3IO4A 1ZBMA 4WEDA 1MQHA 1VFEA 2REJA 3C33A 1Y4TA 3EF7A 4IGTA 1P1WA 4GQOA 3CSBA 2F5XA 4OFJA 1Y3NA 4LQ5A 3SERA 3QUFA 3SKPA 3Q27A 2RINA 3ONMA 4F19A 4ZE9A 5I57A 5KCJA 5L9SA 1FQBA 2XXRA 3C35A 2Q2AA 2QS1A 3O97A 2A5TA 2VGQA 1Y20A 3PV0E 1I69A 3EQ1A 3OO9A 4F31B 2BJJX 4KCDA 1MPCA 1JNFA 1PB9A 2Y7KA 2Q88A 4N6PA 4QFPA 5DVIA 3S4UA 3ZKKA 1B5HA 4EF2A 3K1NA 1XS5A 1Y1MA 1MDQA 1UTBA 2QSXA 2DWIA 2GHBA 5TPAA 3OENA 1JW5A 3GLBA 1MS7A 1GVCA 5I56A 1LBBA 1AMFA 4ZEBA 2NVUB 1DPPA 3ILTB 3OSQA 1ZU0A 1T0KA 4OFOA 5AA2B 4ESXA 4JBZA 1HSJA 1II5A 4UA8A 2HEUA 3MP8A 3Q29A 5ELVA 1MM6A 3ZKLA 3S9LC 2IEEA 4F3GA 2DE3A 2O1LA 4U4SA 4DXCA 3RY3A 1LAGE 1N04A 4EF1A 1URGA 3I5OA 3SEXA 3G7WA 5ICQA 3PGFA 3R26A 3RTFB 3V5AA 2Q9TA 4DXBA 2QPQA 5H8HA 2H25A 2B3BA 4G8MA 2DQVA 1FTOA 3FJ7A 2DOJA 4F2OA 4U21A 2XX8A 1M5EA 3PUWE 2XXHA 2V25A 4PFUA 1DSNA 3F11A 2DWHA 3N6TA 3FGSA 3E4RA 5I56B 3TELA 4DXUA 2PBWA 1WDNA 1P1NA 4BDRA 1WVJA 1DTZA 3CVGA 4F3BA 1QUJA 2Z23A 1TXFA 4NF6B 4EUOA 4C1UA 5EHMA 3OXNA 5TP9B 4OWDA 3G3HA 1HSEA 1B7UA 1JVXA 3KEIA 5H8NA 2FYIA 3JV9A 1A54A 4F3PA 1QUKA 3K00A 4U1ZA 5HM4B 4PFYA 3TPAA 5AE4A 4YB6A 1AIVA 5CRYA 4QRZA 3CFZA 1YPNA 4KI0E 2NOOA 3MAMA 1Z7NE 3KJ7A 4OFLA 3UORA 2DE2A 3PMWA 1GR2A 3GBAA 1USYE 2NWJA 1FQAA 2XD2A 3KG2A 3M8UA 1M5FA 3EHUA 4Z0IA 2VD2A 1A40A 3QXMA 4U23A 3MZBA 3RUMA 2HZKA 4OZ9A 3MC2A 4R6KA 4NWDA 1NKXA 2V84A 5ITOA 4Q30B 2HCAA 2PT2A 5B7DA 4GFRA 1O7TA 1EZ9A 1S9TA 3U94A 1P1QA 4OEUA 5I58B 1LB9A 1DPEA 2DWAA 4FIMA 1NNFA 2XXPA 1B6HA 1BTJA 3KN3A 4M1VA 4POXA 3C32A 4IY5A 4NMYA 4RPNA 3PMXA 2QS2A 2RC7A 3H6WA 3MVZA 1SI0A 4R74A 3LC8A 4QHQA 4ZS9A 1B3FA 2QS4A 3KSJA 4E0WA 4R75A 1DOTA 3H7MA 2A5TB 3HHFA 3KZGA 4Q0CA 5B70A 1SQYA 3H6VA 3MUQA 4OERA 4DLDA 1VSOA 1PDAA 3N26A 5BWJA 1OQHA 1L5TA 1B1XA 3FASA 5H8FB 1N0TA 1SVXB 4KPTA 4H6DA 2F78A 2Q89A 5K2YA 5JTYA 1PBPA 3P7IA 5JEIA 4PFTA 4GD5A 1NNTA 4OHNA 3C4MA 2F7CA 4YZZA 3B6TA 5K2XA 4DE8A 1OVBA 3AXFA 1B2HA 2GFEA 5TPAB 3WAFA 1BLFA 1IQ7A 2THIA 4LZ7A 2M8CA 3T9UA 4LZ5A 2XXVA 5CBRA 3KSXA 3M3LA 1JW1A 1B52A 3ILUB 4MBPA 5HBCA 3VLWA 3E9XA 1R9QA 1IXHA 2GHAA 1B0HA 3IX1A 3K02A 4NF8B 4NF6A 4YB5A 3V8XB 3VV5A 4DDDA 4F2QA 3N6UA 5I2NA 3IOVA 3HO7A 2CMOA 3B7DA 4IO6A 3KN7A 4X48A 4F1YA 4KFQA 5TU0A 4MH5A 4IY6A 1NNPA 3PPOA 4OYVA 3R6UA 5FTHA 3SEYA 3TTRA 3H06B 4POWA 2PMSA 3O6IA 3O66A 3O9PA 4K3FA 1MXZA 4OETA 1SD3A 4TQUQ 4YKIA 4YKKA 3TQLA 4DCXA 3PPQA 2R71A 1URDA 4P0IA 2E0SA 2VP1A 3T9HB 1IXIA 3VXBA 3S9EA 5CBSA 4R6HA 4QSCA 4H5FA 1ATGA 1XT8A 4R2BA 4F1UA 1ZTYA 3T96B 3IL1B 2ONKE 1MH4A 1HSLA 4OQOA 3MW0A 4IGRA 2Y84A 4GWOA 2I4CA 4PFWA 4GL8A 4X1DA 4QSEA 3VLVA 4G2ZA 1WODA 2W7YA 2XXUA 3OO7A 2O84X 1R9LA 3GZGA 4JWYA 4XKNA 4GLIA 3DP8A 3JZJA 5TP9A 3FJGA 3IK6B 1SYHA 2UVHA 2X7PA 2F97A 1LFGA 1B32A 1POTA 2DE4A 1Y3QA 3BFTA 2Z8DA 4NWCA 1P1UA 1XHYA 5KZTA 2VHAA 2ZNSA 1OMPA 3DP6A 2HAVA 3UGWA 4GF8A 2O51A 3PPRA 4F18A 4YMBA 3GXAA 2O6AA 1ANFA 4EQ9A 1EZPA 1LBCA 3R7XA 4JSOA 3TODA 1OLAA 2HXWA 1SW4A 2GH9A 3H4ZA 1XOCA 3MVYA 3TMGA 3EN3A 3VLUA 1TFDA 1S7YA 3FV2A 4FJPA 4ZEIA 4RPOA 5I2KA 4QF9A 3K01A 1FW0A 3K1PA 3TTLA 2ZYOA 2H99A 3U1OA 4ESWA 4H1XA 2RC9A 1I6QA 2I58A 3IOUA 1ZLQA 3TCFA 5A5XA 5CMCA 5A5XB 1MDP1 2AIXA 2DP8A 2O7IA 4X1BA 3UK4A 2PT1A 1TFAA 2F34A 2VD3A 4OMBA 2XXWA 3CG1A 3VDFA 5KDTA 4XIGQ 4DIGA 1SDXA 1Y3PA 4PE5B 1CE2A 2XHDA 4G8NA 5DVJA 1ZJLA 4BDOA 3PD9A 4P11A 3PUXE 1B7ZA 1PC3A 3VVFA 4RYAA 3OELA 5DEXA 3SETA 3PMVA 4OESA 4RJZA 3GBBA 3TEPA 4FATA 2XXYA 1OVTA 4ND9A 2AYSA 2X7QA 3UIFA 1B3LA 2H5YA 3HPIA 3SEUA 2KLFA 2H4IA 1NH7A 2OZZA 1VR5A 1ZMGA 1MPBA 2REGA 3PUYE 1MRPA 4KR5A 3RQTA 4ZZAA 3VVEA 5CMKA 1LAXA 2I6EA 3K6VA 3L6GA 4X9TA 2DSFA 2ZYKA 4F29A 2Y7IA 4JB7A 2YPNA 2LAOA 3G3IA 1M5BA 3HCQA 3LSXA 4KQPA 4LQ2A 4GL0A 4NTLA 4RK2A 1EZOA 2AL4A 1PBQA 3HV1A 5L9MA 3OMBA 3RN8A 3ODBA 1B05A 2I0BA 1URSA 3QK6A 2NUVA 3C36A 2UVGA 1UQWA 1B3HA 2QL3A 3IO6A 3B6QA 3PD8A 3DLNA 1YCJA 4R9GA 2Q2CA 3SEWA 3C31A 3G3JA 3RT6B 1MQDA 2FNCA 2X26A 1B1HA 2ZYMA 3THIA 2E1SA 3IR1A 3KOTA 2Q8JA 1RYOA 2P1SA 2QRYA 3KN8A 4F3SA 3PPNA 5ICTA 3M3FA 1LGBC 4KYDA 2ZYNA 3CI8A 4ZEDA 3FVGA 2B65A 3IORA 3H6UA 4KYEA 2PYYA 4QFLA 2CZLA 1Y1ZA 3D4GA 3TCHA 3S2VA 5AA4B 2OWSA 4G68A 3DP4A 5DT6A 3RLFE 1B5IA 2UXAA 1MXWA 5AA3A 1GV8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3IFCA 1MG1A 4MLVA 1LAHE 4C0RA 4ELRA 4OXVA 4UACA 4H5GA 3FIRA 4IO4A 4AS4A 4IB2A 4R73A 2QVUA 3RTWB 5LOMA 1IMFA 4MFIA 2WYKA 1YYZA 4F39A 4ZDMA 5CMMA 2V4CA 1MXXA 3KOSA 3BBRA 3PUVE 4IO5A 1BP5A 1US5A 1K9ZA 4MNIA 2Q74A 4Z7EA 4FECA 4EXKA 2OX3A 5L8DA 3K1MA 3IFAA 3QYTA 2DVZA 3QAXA 2HZLA 4NGUA 4PF6A 4RA1A 2F7AA 4GRKA 4OVQA 2Z8FA 4PAFA 4IR8A 2Y7WA 4YKJA 3QMFA 3A09A 5DYHA 1YAEA 3EHTA 1EYIA 5I59B 3W15C 1NL5A 5IZZA 3Q25A 4F1VA 3C34A 2XXKA 1BIYA 3Q26A 1LBZA 2FIEA 4ZEFA 2XXIA 1Y9UA 4HS7A 2R9JA 4GBVA 2ANJA 1PB8A 2F6GA 3ZS6A 5I84A 3QIMA 3K4UA 1SBPA 2VOZA 1O63A 3OEMA 3CG3A 3S9NC 1J1NA 1JVYA 1QKAA 2KR0A 5L9OA 4N6DA 1USYH 4U4XA 3K6WA 1ZKBA 3WAEA 2NXOA 1H43A 1D9QA 4PGNA 3MWBA 4N07A 3K6XA 3MVXA 4QBAA 2CZKA 4TLLB 1NUYA 1A55A 1YTVA 1B5JA 1I6BA 3W9WA 3UA8A 3IJOB 4GOTA 1DK4A 1B3EA 3M3KA 4HCYA 3W9VA 1I6AA 1QKBA 3B8BA 1N7XA 1FTJA 2D3IA 2UYFA 5CC2A 4NG7A 1P99A 3IOWA 4NF5B 4ZZEA 1FQFA 2A5SA 1N3WA 3T93B 2I0CA 2D5WA 5ET8A 5JK4A 4FE8A 2R8TA 3MVWA 1LAFE 2I49A 1B4ZA 2ZMBA 1NUXA 3HN0A 3T9XB 3PPPA 4I1DA 2PX1A 2ONSA 1IZ1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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