1SW2A

Crystal structure of prox from archeoglobus fulgidus in complex with glycine betaine
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
270
structure length
270
Chain Sequence
ERVVIGSKPFNEQYILANMIAILLEENGYKAEVKEGLGGTLVNYEALKRNDIQLYVEYTGTAYNVILRKQPPELWDQQYIFDEVKKGLLEADGVVVAAKLGFRDDYALAVRADWAEENGVEKISDLAEFADQLVFGSDPEFASRPDGLPQIKKVYGFEFKEVKQMEPTLMYEAIKNKQVDVIPAYTTDSRVDLFNLKILEDDKGALPPYDAIIIVNGNTAKDEKLISVLKLLEDRIDTDTMRALNYQYDVEKKDAREIAMSFLKEQGLVK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis for the binding of compatible solutes by ProX from the hyperthermophilic archaeon Archaeoglobus fulgidus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords osmoprotection protein (proX)
molecule tags Protein binding
source organism Archaeoglobus fulgidus
total genus 99
structure length 270
sequence length 270
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1sw2A01
3.40.190.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Osmoprotection protein (prox); domain 2 1sw2A02
1UQWA 2DP8A 3SESA 1NNTA 1ZIUA 1M5EA 2D3IA 4EXKA 2PT1A 1POTA 5FHOA 3O2AA 4L17A 3FV1A 4PETA 1IUDA 3QUJA 5I2KA 3F11A 1J1NA 3K00A 4K3FA 1SW4A 3A09A 4POXA 2HFBA 3EHUA 4YMBA 3DELB 3FVNA 1FQEA 1UTHB 4RK9A 1FW0A 3OXNA 3RGYA 2OLBA 2F35A 4GIZA 4R9FA 2ZYNA 1VFEA 1QUIA 2ZNUA 3SERA 4FE8A 3HV1A 4FEDA 5HBCA 3V89B 3WAFA 5CBSA 1IXIA 5I58A 1VFDA 4PFYA 1O63A 2F97A 5JK4A 2XXTA 4JBZA 2I58A 5AA2D 2UVJA 5F1QA 4XTCQ 4G8NA 4YAHX 4KCDA 3MAMA 4GOTA 3K1MA 3KGCA 1TXFA 3TDJA 1LAHE 4PQJA 1MQDA 2H99A 1B40A 3K1PA 4U23A 4DE8A 1TFDA 3IL1B 1BP5A 4H5GA 3SEUA 4QHQA 3RN8A 1KWHA 2O1LA 3LSLA 3TELA 3IR1A 3L6HA 4XIGQ 1AIVA 2DQVA 2ONSA 5TU0A 2FYIA 3T96B 4HCYA 4U22A 1D4NA 1POY1 1LFIA 3G3KA 1Q35A 4NF5B 1IXCA 3E4RA 3MJNA 5IAIA 1AOVA 3R7XA 4ZZAA 3ZS6A 4EUOA 1B52A 4RY1A 5ITPA 1LB9A 2O69A 4M4GA 2HCAA 1PB9A 2A5SA 3MP8A 4Q8RA 4Z7EA 3D4GA 3E3KA 3A3CA 5EHMA 1OLCA 4X1BA 1RYOA 3FVGA 4G68C 1M5DA 4JSDA 4QSDA 1UTHA 4YB7A 5K2YA 3QAXA 3C31A 4I8CA 1B3GA 3TMGA 3N94A 1B4HA 2RKMA 2I4CA 3G3IA 2HAVA 3P7IA 3T22A 4H0WA 3RQTA 2R71A 1P1QA 2RCBA 2XXQA 5CMMA 1LBCA 4BDQA 3RT6B 1EU8A 3B6WA 2Z8FA 3RLFE 4G68A 3KSXA 1RYXA 4Z0IA 4THIA 2V25A 4ZEFA 4KD5A 3JZJA 1BTJA 4ZDMA 4NWCA 4IO6A 3FXUA 3N5LA 3MVZA 3KFMA 4DXUA 3QIMA 1DTZA 1JETA 1PB7A 4RXLA 3H3GA 1YPNA 1US4A 3LR1A 4PFUA 2O84X 3IOWA 2ZNSA 1O64A 5AA4B 4NF5A 4F31B 4RNSA 5L8DA 1GVCA 2RF1A 4U21A 1XC1A 4F2OA 4AB5A 3JYRA 3UA8A 3QK6A 4LA9A 3KN8A 5DEXB 2Q89A 3K2DA 2QS1A 3CR9A 2I3WA 3PPPA 3QXMA 2ZMBA 2P2AA 4QFLA 3O9PA 3C4MA 3TTMA 2B3BA 1OQGA 4ND9A 4R72A 4LQ2A 3FUZA 1LB8A 3RUMA 2I6EA 3BFTA 4F1YA 1R9QA 2QS2A 1I6AA 3PD9A 5I57B 1LFHA 1B46A 4F22A 4OENA 3CG3A 1UIVA 1R1NA 3U1OA 1MXYA 5L9OA 1IQ7A 3CRBA 3SETA 1DPPA 4RPOA 2QSXA 3VXCA 2F34A 3DP6A 4KYEA 3S9NC 2F7AA 2PX1A 5AA3A 3T9HB 4I62A 2QMXA 2DE2A 1OIBA 2H5YA 1HSEA 4NWDA 3OO7A 2CZLA 4HTGA 2O7IA 1EH3A 1JVXA 3TODA 3CVGA 1LAGE 1QKAA 1A54A 1WODA 1FQBA 3KJTA 5ISUA 3IB2A 2D5WA 3FJMA 3OSQA 4GLIA 4DZ1A 1MM6A 2XXUA 4F19A 1Q1KA 2WKYA 1A99A 4GF8A 3C32A 1MXWA 2DWIA 2H4IA 3C33A 3H6TA 3UIFA 1BKAA 5CMCA 3FZVA 3Q29A 5AA4A 3LC8A 4OQOA 2F8DA 3PD8A 2VD2A 1OLAA 1VE4A 1A55A 2W7YA 1USYH 3THIA 4GWOA 3PMXA 3O6GA 5FTHA 2Q2AA 5DEXA 1YCJA 2XXVA 3N26A 4FJPA 3RT8A 3M3LA 3OO8A 3OEKA 2G29A 5H8QA 4RPNA 1GR2A 1SW5A 3T93B 4KPTA 3O28A 1GGGA 4G4PA 4OETA 5ICTA 3S2VA 2BJJX 2Q2CA 2OWTA 1LBBA 3OELA 1M5BA 3IX1A 2QS4A 3VXBA 4OEUA 2XXRA 3IO4A 3MZ9A 1LCFA 3G3FA 1CE2A 2HQ0A 3MQ9A 2VP1A 2DS9A 1D9YA 3C9HA 1ZU0A 4DXBA 1FTJA 4N07A 4NF8B 1EZPA 4ELQA 5H8FA 4F18A 3Q25A 2UVHA 2V84A 3C36A 2I3VA 5H8NA 2Y84A 1JVYA 4MH5A 1MQGA 3TEPA 5H8HA 3RY3A 3UK4A 4YMAA 3MW0A 3MVWA 1B5JA 2QPQA 4I1DA 5I2NA 3KN3A 4NF6B 3HHGA 2H25A 3BBRA 3CIJA 3GBBA 3TTRA 2UXAA 2QMWA 3T66A 4EQBA 3O6IA 2NVUB 3FD3A 3O97A 1IIWA 3CFZA 3EQ1A 3PGFA 4PE5B 3TQWA 1DTGA 3TCFA 5AE4A 2XX8A 3EPEA 3IJXB 3G7WA 1B4ZA 1PBQA 3D4CA 1SYHA 4WEDA 3DLNA 3HN0A 3FXRA 3S9MC 5KDTB 1MXZA 1N3XA 2DXRA 3OOAA 5KZTA 2I0CA 2YLNA 3U93A 4U4XA 1EZOA 2UYFA 2PMSA 2Q9TA 3ZKKA 3RTFB 3U8QA 3DP8A 4RK2A 4LUBA 1D3KA 1QUJA 1NKXA 5I56B 1XOCA 4TOZA 4FEBA 3S9EA 4NE4A 1XVXA 2LAOA 5BWJA 4G77A 4TLLB 3VE1B 4ECFA 2R6GE 4EQ7A 1NNKA 4QFPA 4MLVA 4R75A 2AL4A 5AA1A 1NNPA 3USDA 4I9DA 4F1UA 4G2ZA 3U92A 4XXUA 3SEWA 1MY3A 1H45A 1MXXA 1JEVA 3KZGA 4EXLA 3WAEA 1NH8A 2XXWA 5L9SA 4NF8A 5K2XA 3OO9A 3K01A 5I59B 3BFUA 4NEDA 1B6HA 1LAXA 2G93A 1ZBMA 1TWYA 1P1UA 1SBPA 4YICA 2O51A 3EHTA 3HO7A 2YJPA 3MPKA 1JQFA 4NF6A 4AQ4A 2VD3A 4G8MA 1LSTA 3KG2A 3H06B 4FATA 3CFXA 4JSOA 2HZLA 1SDXA 4O3AA 3V5AA 4ZE9A 2NWJA 2ONRA 4YB6A 4GXAA 1XT8A 2DE4A 3ILTB 4PFTA 4R6HA 1BLFA 2ANJA 2VHAA 2F6PA 3PUXE 3UN6A 4ZEBA 5L9MA 3SEXA 4X9TA 2DWAA 3H6WA 4ELOA 3R26A 5KDTA 1Z7ME 1JNFA 1B32A 3PUVE 4R2FA 3LSWA 3ZSFA 2HAUA 3VVEA 3ONMA 4NTLA 2F78A 4Q30B 3RPWA 4ZEIA 3DP4A 2XXPA 3VLVA 3B6TA 4NF4B 2GH9A 4M1VA 1AMFA 1R6ZA 4R2BA 5IKBA 1MQHA 3SEVA 2REGA 3UP9A 3MC2A 4F3BA 3G3GA 4NMYA 2RC8A 5CI5A 3CFLA 3TQLA 4MF3A 3H6VA 3TCHA 3U94A 3I5OA 4ZEKA 4E0WA 4JXIA 1UIUA 4WKMA 2X26A 1Y4TA 2QL3A 4RA1A 5EHSA 2NOOA 3TKDA 1SW1A 1HSJA 4JB7A 5CRYA 4OZ9A 4F3SA 2UVGA 1MH3A 1URGA 4IO4A 3T9VA 3OMBA 3OD7A 1JEUA 5I59A 1I6QA 3I3VA 4ONYA 4JWYA 2QJEA 3OSRA 3GXAA 1H44A 4QF9A 1MY2A 2XD3A 3R6UA 1B3EA 4Q0CA 1SI0A 4LQ5A 4OEVA 1H43A 1N7XA 4KFQA 4KYSA 2Y7WA 1IZ1A 4H8JA 4BDMA 3A3UA 4UA8A 1MXVA 3TPAA 2P1SA 1LFGA 2Y7PA 1NMUA 4GRKA 4U1ZA 3GZGA 4PP0A 1JW5A 3ZKLA 3FV2A 3GLBA 3VVFA 2GRVA 4IO5A 3MWBA 2Y7RA 5TPAB 1B0LA 1P1OA 1N84A 4BDOA 4MFIA 3KOSA 1CB6A 3EF7A 3BKIB 4ZEDA 2UVIA 1OVBA 4IGTA 1WDNA 3PMVA 5HM4B 2F5XA 5TP9B 4HCWA 1FQDA 2VGQA 5CMBA 2M8CA 4EF2A 3KOTA 5ELVA 3MZBA 2OK2A 1MY4A 1B7ZA 1OMPA 4XKRA 1S50A 2NXOA 3TUSA 1B9JA 4YU0A 4KYDA 2XHDA 3SDFA 1LLSA 1FTLA 3LUYA 4H67A 4O3BA 5A5XB 3IB0A 4IO7A 2XX9A 2ZYOA 4DIGA 5CM6A 4YKIA 1NH7A 2E1SA 5CC2A 2Z8EA 1MY1A 3KJ7A 3ODBA 1B3FA 4R6YA 1BIYA 4C1UA 1TT1A 4KHZE 5LOMA 3W15C 3H03A 3PPQA 1B5IA 3JV9A 4LATA 3K02A 4C1TA 3SEYA 3FGSA 1H76A 2DWJA 2UYEA 4PFWA 1USYE 1ZMGA 3O29A 1MDP1 1MY0A 3FJ7A 2DVZA 1WVJA 1FQCA 1MQIA 2XX7A 1F9BA 2HZKA 5I57A 4P0GA 3KEIA 1P1NA 2GFEA 3FATA 3FVKA 4LONB 3KSJA 4IO2A 5I84A 1ZJLA 3FXQA 3TTKA 2AYSA 5TP9A 4C0RA 4ESWA 4R73A 5DTBA 1B58A 4AB6A 2PBWA 4RJZA 1B3HA 2XXXA 5H8SA 5BUUA 1MQJA 3Q28A 3W9VA 3HSTA 2GHBA 4IO3A 3V83A 1P1WA 1H3DA 2THIA 2Q8JA 5FHMA 1LCTA 1QULA 3KBRA 1S7YA 3MZ1A 1B7HA 3K6VA 3IB1A 1SYIA 5A5XA 4U1OA 1B1XA 4OESA 3K6XA 2ESNA 1QVSA 1AL3A 3M8UA 2V93A 4F3GA 4BDRA 3LBSA 3K6UA 4XKNA 5FTIA 4IY5A 3TCGA 4TLMB 1QJMA 5F7VA 1SVXB 4OERA 1MRPA 5KCJB 1B3LA 3TFLA 1MDQA 2Y7KA 4ESXA 5M2VA 3LSXA 4H5FA 3L6GA 1B5HA 4R74A 4WXJA 4MLQA 4QFNA 3IO6A 4XKQA 3HHFA 4P0IA 2RC7A 1XVYA 2B3FA 1Y9UA 1ZKBA 3S9LC 3VLUA 4KI0E 1LAFE 3EN3A 3LSFB 4OVJA 4HW8A 4BLAA 5EYFA 2ABHA 4GQOA 2FA7A 1FTOA 1B1HA 2I0BA 3E9XA 1GV8A 2Z23A 4O3CA 3O6HA 2V3QA 3IOVA 4E0XA 3M3KA 3B7DA 4JWXA 4HS7A 1A8FA 1SI1A 2R9JA 4ISUA 4G68B 2DVCA 1P99A 2XXYA 4OFOA 1B2HA 1FTKA 3G3JA 1XHYA 2OCUA 3PUYE 3QSLA 1JW4A 1QW0A 3VV5A 2HXWA 2DWHA 3B6QA 2P0SA 2F7CA 2OJTA 1ZTYA 3H7MA 4YKPA 3OENA 1HSLA 1IITA 3RTWB 3N6TA 4ZE8A 3PUZE 3K0VA 2PVUA 3PPRA 3I6VA 3IOUA 2PT2A 4KCCA 3HCQA 4BDLA 2H9BA 1NNFA 3TTLA 2REJA 4ZECA 3HPIA 3U72A 3MVXA 5AA2B 2OZZA 1N7WA 4IY6A 5DVFA 4LZ7A 3MUQA 2PYYA 1GTKA 3MP6A 4G8HA 4F1VA 3EHSA 3PPNA 5KCJA 1OVTA 2NUVA 1RKMA 2QS3A 1B51A 3AXFA 4OYVA 3MVYA 4OFJA 4OXVA 3GBAA 2DXYA 2A5TB 3VFJA 3TZAA 5I56A 2F6GA 1A8EA 4FIMA 4YKKA 1DMBA 3VDFA 1FQFA 5DVJA 2V3TA 2E0SA 1ATGA 2RINA 4KQPA 3FVOA 1B05A 4TQUQ 1I6BA 1VR5A 3H4ZA 3CSBA 4EF1A 4N13A 2I4BA 4ELPA 4F3PA 3T9XB 2RCAA 2DSFA 4YZZA 1R9LA 3QUFA 1AH5A 4ELRA 1N0TA 3H6UA 3VLWA 4QSCA 2ZXTA 4H6DA 1Y3PA 4FAJA 5J1DA 2ZYKA 2FNCA 1M5FA 4X1DA 3TTNA 1Y3NA 4EQ9A 2HEUA 4R9GA 4ZZEA 1XS5A 4P11A 1ZLQA 1PEBA 3Q27A 1ANFA 1Y3QA 3MP1A 3CG1A 1L5TA 4LP2B 3PPOA 4H8IA 1D9VA 3Q26A 1YTVA 3ECRA 4LZ8A 1SW2A 1PBPA 2X7QA 2ZYMA 1IEJA 1Y4CA 1Y1ZA 1EZ9A 1PDAA 1UTBB 4OWDA 2QRYA 5HPQA 1DOTA 4QFKA 2Z22A 5AA2A 2IA4A 4QSEA 3MBPA 3PU5A 3C35A 1MXUA 4JWOA 3FIRA 1YAEA 1QKBA 2V3UA 2YPNA 5FHNA 2DYXA 4UACA 3OEMA 1FTMA 5DVIA 4BDNA 1Z7NE 1MPBA 4QFOA 2RC9A 2A5TA 3CSGA 4YKJA 3OO6A 1SD3A 4RYAA 5H8QB 4F39A 4NF4A 4DCYA 2CMOA 3FJGA 4MBPA 3M3FA 4IGRA 4XKPA 1URSA 1VSOA 2F36A 4QRZA 2X7PA 3MPLA 5B70A 4JDFA 4EDPA 3TYHA 4U2RA 4KR5A 1OQHA 1IXHA 4GL0A 3G3HA 1O7TA 1MS7A 1QUKA 1SQYA 2I48A 1NL5A 4N6PA 3T9UA 1S9TA 1MH4A 4OMBA 4IB2A 5H8FB 3V8XB 3C34A 2KLFA 1B7UA 3ILUB 5H8NB 3KN7A 4GL8A 1MG1A 4OTEA 2I49A 2XD2A 5JTYB 4LZ5A 3N6UA 5H8HB 2IEEA 3IK6B 2OWSA 2F7BA 1II5A 5I2NB 3RNNA 2AIXA 4U4SA 3O66A 2O1MA 4POWA 2H98A 4GD5A 1LGBC 1A7LA 1DPEA 2ALUA 5ITOA 3QYTA 1IXGA 1UTBA 3K6WA 3VVDA 2XXHA 2O6AA 5DYHA 2O68A 3IOTA 4FORA 1T0KA 5I2KB 4Q5TA 4FECA 4GXSB 4WEPA 4F2QA 5B7DA 4H65A 2Q88A 4DLDA 4GVOA 2AL5A 5ICQA 2DOJA 4OFLA 3UGWA 2ONKE 3CI8A 2B65A 1PC3A 5TPAA 1JW1A 4F29A 1DSNA 3IORA 4OHNA 4H1XA 1ELJA 4DCXA 2D21A 5I58B 4YB5A 1MM7A 2Y7IA 1N04A 4R6KA 1FCKA 4ZS9A 4GFRA 2O7UA 1N76A 3PV0E 4DXCA 1MPDA 3IJOB 3S4UA 1PB8A 5DT6A 4LVQA 3PMWA 3PUWE 2OBGA 3FASA 2GHAA 2VOZA 1TFAA 1B0HA 1FQAA 1URDA 1A40A 3K4UA 3TAJA 1I69A 5CMKA 1N3WA 3W9WA 5JEIA 3DM0A 5JTYA 2XXIA 2Z8DA 1M5CA 3UORA 3K1NA 1Y1MA 1NFTA 2ZNTA 3SKPA 3IAZA 1MPCA 3E13X 4X48A 4DDDA 2DE3A 1US5A 5CBRA 1Y20A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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