4UA8A

Eur_01830 (maltotriose-binding protein) complexed with maltotriose
Total Genus 136
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
136
sequence length
383
structure length
383
Chain Sequence
GKETITVMGPAEDLDDAQGAWLKTECEAFAKANPDFNIEFKYVTSSESDAKDVVTKDPKAAADVYMFANDQLEPLIKANAIAKLGGDTAEYVKSSNSEAMAATVTYDGDIYAVPYTSNTWFMYYDKRVFSEDDVKSLDTMLTKGKVSFPFDNGWYLNAFYAANGCTIFGDGTDKAAGYDFSGDKGTAVTNYIVDLFANPNFVMDNNEGSLGLAGLKDGSINAYFNGNWNYDKVKEALGEENVGVAALPTINIGGKDCQLKAFLGSKAIGVNPNCKNQEVAVKLAAFLGSEDAQLAHFKLRGQAPVNKDLATNEEVAADPVAAAMAKVSSDCSVAQPIIDMSGYWDAATPFGDAFQNGAEGQITKDNAAQKTEDFNTQLNDSLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Molecular details of a starch utilization pathway in the human gut symbiont Eubacterium rectale.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Eubacterium rectale dsm 17629
molecule keywords Carbohydrate ABC transporter substrate-binding protein, CUT1
total genus 136
structure length 383
sequence length 383
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ua8A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ua8A01
4G8MA 3G3IA 5JK4A 1S50A 1MM7A 2V3TA 4UA8A 5DYHA 5CM6A 4AB5A 3K1MA 2XX9A 5JTYA 4F1VA 1NNFA 1MM6A 1UTBA 1LFHA 4U1ZA 3K4UA 5F1QA 3KOSA 4BDRA 2O7IA 2THIA 1DSNA 1FQEA 4LUBA 3HN0A 3HCQA 3VE1B 1MY1A 2QS1A 3IR1A 4Q5TA 1BKAA 1MPBA 2FNCA 2V3UA 2P2AA 2ESNA 1VFEA 2VOZA 4MF3A 1CB6A 1KWHA 4QSDA 4DXCA 3LSFB 3PUXE 3RTFB 1ZBMA 4EF1A 4F19A 3HHFA 4QFPA 1M5CA 4R74A 1BIYA 3I5OA 1YCJA 3F11A 4PP0A 1RKMA 2VD2A 5FHOA 4ZS9A 4GLIA 3R26A 3FV1A 3P7IA 1JETA 4GXSB 2DYXA 3RY3A 4U1OA 3G3GA 4U4XA 2AL4A 4BDOA 4QHQA 2F78A 1N76A 2DVZA 1PBPA 4ISUA 2HAUA 3PMWA 3V8XB 4IY5A 1B5HA 3N5LA 2PX1A 3T9XB 4IO2A 3V89B 1A54A 3ECRA 5I2NB 4EQBA 1DPEA 1B3GA 3MZ1A 5I2NA 1N3WA 4RY1A 1WODA 3BFUA 3TAJA 2ZMBA 4U2RA 5HPQA 5KCJB 3CFXA 1URDA 4XXUA 3H4ZA 2XX7A 2V84A 1MXZA 4ESWA 2F6PA 3TUSA 1YTVA 4ZZEA 1LB8A 1OIBA 1MY3A 1PDAA 3TELA 4OEVA 5TPAB 2H9BA 2F5XA 1URSA 2XD3A 3CFLA 1IXHA 3C9HA 3TMGA 4ZEFA 3T93B 4LVQA 3Q26A 2QRYA 2E0SA 4GF8A 2DSFA 1B58A 3C4MA 2VGQA 4LQ2A 3VFJA 2Z8EA 2NUVA 3GBBA 5H8FB 3FUZA 4H67A 4YKJA 4ECFA 5H8HA 3R7XA 4FORA 3FVKA 3C34A 5H8FA 2RC8A 4TQUQ 1B1HA 4OESA 2F8DA 4F1YA 4X1DA 4OFJA 5AA4B 5M2VA 2QMXA 1JQFA 3CFZA 4BLAA 4YB5A 1B7HA 1M5DA 5CRYA 4FEDA 1HSJA 2PBWA 5TP9B 5EYFA 2D3IA 2OWSA 3CSBA 4N13A 2RINA 3PV0E 2H25A 3FJGA 5EHSA 1MXWA 3KZGA 1D4NA 2GFEA 2XXXA 3OXNA 4GWOA 4AB6A 1B6HA 1UQWA 3IL1B 2F34A 1A7LA 1B05A 2O84X 2GH9A 5AA2B 2I6EA 2REGA 3IOVA 3TEPA 2QL3A 4LZ7A 2PT2A 3FVOA 2OCUA 2Q2AA 3SEWA 3KN3A 4MBPA 4XKRA 4UACA 1DTGA 1R9QA 3TKDA 3OO6A 3TCFA 4NWDA 5FTHA 3H6WA 2O1MA 3SERA 2UYFA 3VDFA 2F6GA 4WXJA 5CMBA 4KR5A 1FQFA 2XXUA 4X9TA 1FQBA 3Q27A 4I1DA 4IO4A 2DE2A 1EH3A 1B2HA 3IAZA 1URGA 2UXAA 1NH7A 1A8FA 3KBRA 2QS2A 4NEDA 3PPOA 1MRPA 3FV2A 1RYXA 2H98A 4OQOA 2X7PA 1QUIA 5H8SA 3IX1A 4TLMB 3BBRA 4WKMA 3RGYA 4LATA 1MQIA 3TDJA 3K6UA 3QK6A 4MFIA 1LFGA 4PFYA 3M3FA 1UTHA 4G68A 5I57B 3MP1A 2DVCA 1IITA 2Y7IA 3S9NC 2E1SA 5DEXB 3A09A 3RN8A 3KGCA 4GRKA 2QSXA 1B4ZA 4O3CA 1ZMGA 1NL5A 2DOJA 3M3LA 1Y4CA 3PMXA 3LSLA 1N84A 4HW8A 3CIJA 1BP5A 2DXYA 4O3BA 1AOVA 1PBQA 3L6HA 2HZKA 5H8NA 1XHYA 3TPAA 5I58A 5BWJA 4N07A 1NNPA 3MVXA 4ZDMA 4PE5B 1Y9UA 4PQJA 2I3VA 4F3PA 1T0KA 3M3KA 5ITOA 3EHUA 4GIZA 2H4IA 4G4PA 5KDTA 1LFIA 2Y7WA 3K01A 4GD5A 2QPQA 2O68A 1Y1MA 3OELA 4TOZA 1I6BA 2X26A 3OO9A 5JEIA 1JW5A 3W9WA 1D3KA 1OVTA 3MP8A 4R9FA 4NF4A 3FVGA 4I8CA 3IO6A 2UVJA 3SDFA 1AH5A 1SW2A 4BDLA 4EQ7A 2VHAA 2XXQA 3S9EA 4U22A 2QJEA 3Q29A 2DWJA 1P1QA 3OO8A 4KQPA 1POY1 5H8QB 1QJMA 2A5SA 2A5TB 1A8EA 4FJPA 4IO3A 2Q9TA 3BFTA 4NF6B 4F2QA 4H0WA 2AL5A 3PUZE 3E3KA 4LA9A 4KPTA 1IEJA 1P1NA 1IQ7A 1B5JA 4NF6A 2V3QA 3MP6A 5ISUA 2VP1A 4QFNA 1SYIA 2RC7A 3KJ7A 1B7UA 2R9JA 2F7AA 4BDQA 1SDXA 3LC8A 1Y20A 4IB2A 4DXUA 3G7WA 1UIUA 4JWYA 4IY6A 1N7XA 3LSXA 4YMBA 3K0VA 3B7DA 1SBPA 3MVYA 1XOCA 3FVNA 4M1VA 3CVGA 4EF2A 4JBZA 2GHBA 3RQTA 1XS5A 4WEPA 5K2XA 1B4HA 4F31B 1Y3NA 1B5IA 3TQWA 1SVXB 1R9LA 1IXGA 3EPEA 4QFOA 5HBCA 2RKMA 3A3UA 1JW1A 3G3JA 4QSCA 2DWAA 1MDQA 5L9SA 1QW0A 3TTMA 5ICTA 3TTRA 1EU8A 1LBBA 3E13X 4OERA 3O6HA 4ZEIA 3OMBA 1B46A 4NTLA 5CBSA 1MXYA 4ZEBA 3TTKA 2OBGA 2H99A 2XXVA 1WVJA 1IZ1A 5A5XB 3CSGA 5DVIA 1XT8A 1SD3A 1RYOA 4OETA 5KZTA 1OMPA 5A5XA 4G68C 1M5EA 3PPRA 1PB9A 2RCAA 5I2KB 4ZECA 1NH8A 2F7BA 1FTLA 2F35A 3CI8A 4NWCA 1QULA 4OENA 2ZNUA 2O51A 1MQGA 3IOTA 5I2KA 4C1TA 1GVCA 3OSQA 5L9OA 1GTKA 1JNFA 4KCCA 5LOMA 1TFAA 4LONB 4NF5B 1ZKBA 3KN8A 4H5GA 3I3VA 3T9UA 3VXCA 4GL0A 3TCHA 4GOTA 1B0HA 3H7MA 3EHSA 4C0RA 3PPNA 3UK4A 1JW4A 4R6HA 3WAFA 4U4SA 5KCJA 4PFUA 2UYEA 4FAJA 1ELJA 4TLLB 3QUJA 1B3FA 2ONSA 2R6GE 2QMWA 4DDDA 3THIA 3T96B 2I0BA 1WDNA 5DVFA 5AA2D 2WKYA 1PC3A 2Y7RA 5TPAA 2DXRA 1I69A 3RUMA 1Q35A 1I6QA 2H5YA 2XX8A 3S4UA 3K02A 3PPQA 1TXFA 4IO7A 1OVBA 2G93A 3FATA 1P1WA 4XKNA 1ANFA 4KYDA 2B3FA 3HO7A 3K2DA 2HCAA 1BTJA 3PUYE 4HCWA 4H5FA 5AA3A 4YZZA 1NFTA 4YAHX 2Y84A 1F9BA 1FTMA 3H6UA 3KSXA 3MVWA 2VD3A 1M5BA 4IGRA 1B3LA 3UA8A 5CC2A 5AA4A 1SW5A 4WEDA 4OZ9A 3KFMA 1JVXA 2OZZA 2RCBA 4Z7EA 1ZJLA 2XXPA 1PB8A 2YJPA 2AYSA 1MPCA 4QFLA 4HS7A 5TP9A 1B1XA 4G77A 5L9MA 3TCGA 4U23A 4L17A 1D9VA 1POTA 3MPKA 1S9TA 3VXBA 5FHNA 5AA2A 1N3XA 4ND9A 3N6TA 4ELRA 4RK2A 3ZKLA 1MXXA 2DS9A 4JWOA 3GXAA 3FD3A 3O2AA 2B3BA 1NNTA 2DE3A 4DE8A 1J1NA 4X1BA 1M5FA 1I6AA 3SESA 2CZLA 4YKPA 3T9HB 4H8JA 2UVHA 2ZYMA 1MQDA 1MG1A 4GQOA 1FW0A 3UIFA 4KI0E 4F29A 4ZE9A 3DP6A 4LP2B 4ELQA 5ELVA 3KEIA 4GVOA 4QRZA 5ICQA 4JDFA 2Z8DA 1B52A 3OENA 3CG1A 3MVZA 3RTWB 5I59B 2DP8A 4BDNA 2UVIA 1A99A 3QIMA 1OLAA 4Z0IA 1FCKA 3RPWA 4KCDA 3C35A 5I57A 1FQDA 1B32A 4R2BA 3IOWA 3S2VA 1DMBA 1H44A 5DEXA 2ONRA 4M4GA 4DLDA 2NOOA 5FTIA 1P1OA 4IGTA 4EUOA 1FTJA 3GZGA 4ZE8A 4PETA 1Y3PA 2Q89A 1JEVA 2I4CA 4DCYA 3MPLA 1US4A 1OLCA 3JV9A 3QXMA 1VE4A 2XD2A 4R6KA 3H03A 5I56B 2F36A 2F97A 3I6VA 3QUFA 5I56A 4P0GA 3VLVA 3IOUA 4RPNA 3U92A 1LAGE 3DP8A 2M8CA 1SI0A 1OQGA 2Q8JA 2Q88A 3MQ9A 3H6VA 3O66A 1XVXA 2OK2A 2HAVA 1O64A 1TWYA 2P1SA 3C33A 3TTLA 3IK6B 3K6VA 3PUVE 4E0XA 3A3CA 2NXOA 2I58A 4R72A 4MLQA 1P99A 1ZTYA 4FE8A 4H65A 1ZU0A 3BKIB 4P0IA 5CMMA 3W15C 5TU0A 4F3SA 2HEUA 2FYIA 3ONMA 1B3HA 1IIWA 4POXA 2ZNSA 3PPPA 1UIVA 4MLVA 5B70A 1GGGA 5H8QA 2OWTA 1XC1A 2DWIA 4EXLA 2A5TA 3MAMA 3PD8A 5I84A 4NE4A 5ITPA 4NF8B 4FIMA 4MH5A 1LAHE 4H8IA 3H06B 4F3BA 3FIRA 4THIA 3C31A 4NF8A 1P1UA 3CR9A 4OYVA 1GR2A 4LZ5A 3IORA 4OHNA 1A40A 3G3FA 1N7WA 3HSTA 3FASA 1MH3A 3SEYA 4O3AA 3ODBA 2PVUA 3CRBA 2ZXTA 3B6QA 4ZEDA 5BUUA 4ESXA 3SEVA 4F3GA 1O63A 3VLUA 2ANJA 1NKXA 3DP4A 4F18A 5JTYB 3VVEA 5CBRA 1UTBB 1MY4A 2ABHA 2O6AA 4XKQA 2Z23A 1LAFE 2HFBA 4R75A 4H6DA 2G29A 1MPDA 3IO4A 4FATA 2I3WA 4OVJA 4QFKA 3KN7A 2RF1A 4OFLA 3O6IA 3OSRA 1MXVA 2XXHA 1B9JA 1AIVA 5CMCA 1R1NA 1TT1A 2Y7PA 2ZYOA 3K1PA 1US5A 1L5TA 4JSDA 3EN3A 1MQJA 2O1LA 5FHMA 3TYHA 3L6GA 1B51A 1FQAA 2D5WA 4I62A 1S7YA 3TFLA 2HQ0A 1Y1ZA 4JWXA 4YU0A 3K1NA 1CE2A 2IEEA 1JEUA 1MS7A 4KYSA 5AA1A 5DVJA 2REJA 4AQ4A 2Y7KA 2GHAA 3KSJA 3CG3A 1XVYA 4C1UA 4DIGA 2I0CA 4PFWA 3PGFA 1QKAA 4DZ1A 3UGWA 1LLSA 4NF5A 1YAEA 1QVSA 3H3GA 1EZOA 3QYTA 4ELOA 1ZLQA 1QKBA 1LB9A 3ZS6A 3IB1A 4RA1A 1EZ9A 4OTEA 3MJNA 1PEBA 2AIXA 4GFRA 4KHZE 3N26A 3FXQA 3R6UA 1LSTA 1H43A 4FEBA 2D21A 4RXLA 4G8NA 2QS4A 5IAIA 2ZYNA 3MWBA 2BJJX 4OEUA 3LBSA 3LUYA 3ILTB 3H6TA 1DOTA 2ZNTA 2V93A 4KFQA 4QSEA 1VR5A 3Q25A 2XXWA 4F2OA 1USYE 3B6TA 3GBAA 4XIGQ 3KJTA 4DXBA 3KG2A 3SETA 1N04A 3K00A 3OEMA 3K6WA 4R9GA 3RLFE 1MY2A 1H76A 1SW1A 3TTNA 1SYHA 4F39A 3VVFA 3TZAA 3TQLA 3OEKA 3U1OA 4HCYA 2PMSA 4OWDA 2Q2CA 3UORA 1ATGA 2XXTA 1II5A 3MZBA 1LCTA 3S9LC 1QUJA 5H8HB 3O29A 2XHDA 3MW0A 1LAXA 4IO6A 3O97A 4U21A 4JB7A 3EQ1A 1B7ZA 1NMUA 1R6ZA 3FJ7A 2DE4A 2QS3A 2O7UA 3SEUA 3ZKKA 4RPOA 1SQYA 5DTBA 4G8HA 1MH4A 3VVDA 2F7CA 3VV5A 3U94A 3ZSFA 4OMBA 3VLWA 1B0LA 3JZJA 1GV8A 4Q30B 4PFTA 5B7DA 4RYAA 2LAOA 1USYH 3M8UA 4HTGA 2Z22A 3RT8A 1LBCA 1EZPA 4OXVA 5L8DA 4ZZAA 4H1XA 2IA4A 2NVUB 1SW4A 2UVGA 3WAEA 5HM4B 2RC9A 4F1UA 2HXWA 4YMAA 3LR1A 3C36A 3U93A 4NMYA 4R6YA 5DT6A 2ZYKA 3T9VA 2DQVA 3V5AA 5AE4A 1Z7ME 4IO5A 1VFDA 3SKPA 1BLFA 3DELB 4X48A 3USDA 3PU5A 1MQHA 3RNNA 4JXIA 4LQ5A 4RK9A 3D4GA 4R2FA 1ZIUA 5CMKA 1MDP1 3N94A 3QAXA 3FXUA 1Z7NE 1LGBC 3N6UA 3K6XA 4KD5A 4I9DA 2CMOA 4G2ZA 4YB7A 5K2YA 5I59A 2V25A 2GRVA 3IB0A 1UTHB 3SEXA 4G68B 3Q28A 2YPNA 4FECA 2ONKE 2HZLA 1N0TA 1OQHA 2Z8FA 2YLNA 4OFOA 2XXRA 3OO7A 1FQCA 1H3DA 3MZ9A 3D4CA 3FGSA 1MY0A 3E9XA 4EDPA 4YKKA 1QUKA 3KOTA 1Y3QA 4QF9A 2X7QA 4RJZA 1HSLA 4XKPA 3EHTA 3HHGA 1JVYA 4N6PA 1TFDA 2I48A 5H8NB 1Y4TA 3PD9A 2ALUA 4YB6A 2OLBA 2NWJA 1NNKA 4KYEA 1VSOA 5I58B 4GL8A 1FTOA 3MC2A 4ZEKA 3UP9A 3G3KA 3O9PA 3TODA 3O6GA 2PT1A 3IJXB 3E4RA 3PMVA 4P11A 4Q0CA 1SI1A 3IB2A 2B65A 5KDTB 2XXYA 1HSEA 3O28A 3G3HA 3U72A 1MXUA 4BDMA 3V83A 5IKBA 2O69A 3DM0A 4DCXA 1PB7A 1H45A 4NF4B 4GXAA 3LSWA 3HPIA 3AXFA 3C32A 2KLFA 3S9MC 2XXIA 1AL3A 1IUDA 4LZ8A 3FXRA 2PYYA 4XTCQ 5CI5A 4RNSA 1LCFA 4POWA 4F22A 2OJTA 3FZVA 3MBPA 1D9YA 4YKIA 4Q8RA 4ELPA 3W9VA 1Q1KA 3MUQA 5F7VA 1FTKA 1A55A 1IXIA 1B40A 2FA7A 2I49A 2R71A 3B6WA 4E0WA 3QSLA 2DWHA 3PUWE 3T66A 4EXKA 3EF7A 2I4BA 3HV1A 3GLBA 4ONYA 4EQ9A 4R73A 1YPNA 3RT6B 1IXCA 2W7YA 4JSOA 1DTZA 5J1DA 2P0SA 3ILUB 3OD7A 1DPPA 3IJOB 3UN6A 3T22A 3OOAA 1B3EA 1O7TA 3JYRA 1AMFA 3FJMA 5EHMA 3U8QA 4YICA 4K3FA 3DLNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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