4N07A

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j-l483y-n754s) in complex with glutamate and bpam-344 at 1.87 a resolution
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
262
structure length
261
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Synthesis, pharmacological and structural characterization, and thermodynamic aspects of GluA2-positive allosteric modulators with a 3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-dioxide scaffold.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 91
structure length 261
sequence length 262
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n07A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n07A02
2HZLA 3K2DA 1JW4A 5ICQA 4FECA 4X48A 1D3KA 2XXYA 3TZAA 1A54A 4ELRA 2RF1A 3Q29A 3S9NC 2ZNSA 1OQHA 1IUDA 1M5DA 4I9DA 1H43A 2PYYA 5TPAA 2Y7RA 4F29A 2ZYKA 4ND9A 1AOVA 4ZECA 3IOVA 4HTGA 2PX1A 5CBRA 1AH5A 5B70A 3IOTA 5L9OA 3MVZA 3FXRA 3VXCA 5DEXA 3TCGA 1XT8A 5JK4A 4E0XA 4O3BA 3ECRA 3CFXA 2QS1A 3KBRA 3UA8A 3TYHA 1QKAA 2DWAA 2GRVA 3HV1A 3PPQA 4FE8A 1EH3A 4GLIA 2WKYA 3IJOB 3PUVE 2F35A 4PETA 1URSA 3M3FA 5DT6A 3RT8A 3KGCA 4PFTA 1M5BA 2VGQA 4DZ1A 3Q26A 3HO7A 3MWBA 1PDAA 2V3TA 2VD2A 3MVXA 3TFLA 4F2OA 2Y7WA 5BWJA 4YICA 5KDTB 1Y3PA 3D4GA 1B5JA 3B6WA 4IB2A 3M8UA 3G3KA 5H8FB 3MVYA 3S9LC 4RJZA 2UVGA 2DE2A 3IR1A 4QFPA 1RYOA 4GFRA 4ZEIA 4N6PA 5AA4B 3KSJA 1YPNA 4YAHX 3CFLA 1JQFA 5I2KB 3W9VA 1SW1A 1LAGE 1LGBC 3H6VA 4M4GA 4MFIA 3U94A 5DYHA 4GRKA 5TP9B 1OIBA 4G68C 1M5FA 5M2VA 3PPNA 1UTHA 4NTLA 1ZU0A 2HEUA 4GD5A 2LAOA 4OESA 4ECFA 4HW8A 5H8NB 3K6VA 4QF9A 1M5EA 1LAFE 2O1MA 1URGA 1UTBB 1YCJA 4NF8B 1II5A 1OLAA 1NNKA 2NVUB 3IX1A 1A55A 1O63A 2DVZA 1B7UA 4F1VA 5EYFA 1BKAA 2YLNA 3R26A 3IAZA 3MUQA 1MH3A 4U2RA 3IOUA 4N07A 1UIUA 1XHYA 1MPBA 2NUVA 2O1LA 2OWSA 1OVTA 3TEPA 1DTGA 1FQEA 1PB7A 4P11A 3K1NA 1ZTYA 3OOAA 3TMGA 4RPNA 4DCYA 2I58A 4ZE8A 3O28A 2V84A 1A8FA 2RC8A 4G2ZA 1N3WA 2P1SA 2XX7A 4R6YA 5AA2B 3E4RA 5I56B 2Q88A 3QXMA 2ANJA 4OMBA 3VV5A 1I6AA 1SW4A 4PQJA 4H5FA 5I58B 2O51A 3O6GA 4R72A 1SW5A 4RY1A 1B40A 4Q30B 2AIXA 5CRYA 4ESWA 5KZTA 3UIFA 3K00A 4LZ8A 5HM4B 2Y84A 4QFKA 2HFBA 5I57B 2UXAA 4TLMB 2DWJA 1XVXA 2R9JA 4JWYA 4ELQA 4ONYA 2PT2A 4F1UA 3EHTA 4WKMA 4ZE9A 3TAJA 1TFDA 1N84A 4YB7A 4JB7A 1MG1A 3PUXE 4DDDA 1KWHA 4FEBA 4AB5A 1NH8A 3JYRA 1JW5A 2I0BA 1SVXB 2W7YA 1MY4A 1VFEA 1S7YA 4R9GA 1FQDA 4TLLB 4Q8RA 3QSLA 3V5AA 4F3PA 1NH7A 1OVBA 2OZZA 2ZYOA 3K02A 3K4UA 2F6PA 4KYEA 1O7TA 3BFTA 3CR9A 4QFOA 1MXUA 5IKBA 4OFJA 2XXRA 2XD3A 1BTJA 1USYE 3EHSA 5CMBA 1USYH 1POTA 1Y4TA 3I5OA 5I2NB 3USDA 2X7QA 1EU8A 1B3LA 1MQJA 1MXWA 2ONSA 4OYVA 4BLAA 5CMMA 4IY6A 3KZGA 3G3GA 2P0SA 3CRBA 2ABHA 3K6XA 4LQ2A 4BDNA 5ITPA 5ICTA 4AB6A 4JDFA 3TQWA 4ZEKA 2RCAA 4L17A 1MXVA 4PP0A 3RGYA 1MDP1 4OQOA 3S9EA 1YAEA 3TTKA 1MY0A 3FD3A 4G8NA 4C0RA 1QUIA 1S50A 4YKKA 4QRZA 3RTWB 3QUFA 1NNFA 2QMWA 3GLBA 4R73A 3O6HA 4IGTA 4WEDA 5H8HA 2NOOA 4DLDA 2DSFA 1LLSA 4X1DA 2F6GA 3TCHA 4BDOA 3K1MA 4Q0CA 5EHMA 5A5XB 4LVQA 1GVCA 4U4XA 1IXCA 2OBGA 2O69A 1Y3NA 1QULA 1Q1KA 2DWIA 3LBSA 4R6KA 1LAHE 4FEDA 5L9SA 4BDRA 3W15C 5KDTA 3JZJA 3IO4A 5I59B 5H8FA 3MP8A 3FXQA 3N5LA 3PUZE 3W9WA 3KJTA 1JW1A 2E0SA 5CI5A 1SQYA 4XKRA 4LQ5A 3E3KA 3H03A 4IO3A 2QJEA 1IQ7A 4OFLA 3RNNA 1WDNA 2QPQA 2YPNA 1FTLA 4OEUA 4EQ9A 1Q35A 4GQOA 2ZNTA 4OENA 3EHUA 3KFMA 2ONKE 1Y20A 2BJJX 2F97A 2UVIA 1MQIA 2F36A 3IK6B 4GVOA 4XTCQ 5DVFA 3T66A 2HZKA 3EQ1A 4KI0E 4OETA 2I3VA 1MS7A 2H98A 1LB9A 1B51A 5EHSA 1FTJA 3H6TA 1MY2A 3Q27A 1P99A 4K3FA 4XKPA 3QAXA 1N0TA 3RN8A 2O84X 2Q8JA 2RC7A 4NF4A 1H76A 2XX9A 3LR1A 1MQDA 1LFHA 1B05A 3O66A 4I8CA 3OSQA 1B7HA 4H65A 3T22A 1CE2A 3T93B 4UACA 2DE3A 2Y7PA 2X26A 3LSWA 4NEDA 4EF2A 3RY3A 1URDA 4EXKA 1TT1A 2G29A 2XXTA 1NMUA 2RKMA 3MQ9A 3E9XA 4MF3A 2I48A 2IEEA 4GL0A 1N7XA 4POWA 5L9MA 3SEXA 3GZGA 3HCQA 2DWHA 4KR5A 3OEMA 4IY5A 1UTHB 4H5GA 4NMYA 3S4UA 3T96B 4IGRA 1LB8A 3SESA 3OSRA 4G77A 4H6DA 3VXBA 5CM6A 1P1WA 3IL1B 3PPPA 1N7WA 1HSEA 2KLFA 4BDQA 1B3GA 2F7BA 2XXVA 4U1OA 4OXVA 4G4PA 1POY1 1XVYA 3FASA 4ZZAA 3UORA 1WODA 1VFDA 1US5A 2FNCA 3OENA 4R2FA 4XKNA 5DEXB 1L5TA 3THIA 3H7MA 4IO2A 3UP9A 3VLVA 1RKMA 3RLFE 3WAFA 5KCJA 3FIRA 2VHAA 2ZYNA 2CZLA 4KYSA 4I1DA 3Q25A 1I69A 5KCJB 3O2AA 5B7DA 2Q2AA 1MPDA 3Q28A 3T9UA 3PPOA 3PPRA 3I3VA 5ELVA 3TCFA 1EZPA 1SI1A 4HS7A 4ZEBA 2G93A 1EZ9A 4P0IA 3EN3A 4PFWA 4YMBA 3IB0A 2I0CA 1B4HA 2GHBA 4ISUA 1HSJA 1FTMA 5AA3A 4RXLA 1JEVA 2D3IA 3TTMA 4YMAA 4FIMA 5DVIA 4ZEFA 3FV2A 3C34A 4KHZE 4X9TA 2Z22A 5I57A 4KYDA 4NF6A 4O3CA 3C36A 4HCWA 2H9BA 4PE5B 4QSCA 3SDFA 4BDMA 2AL5A 3MZ9A 1Y9UA 3ZS6A 4FATA 5LOMA 2VD3A 3KEIA 4F3SA 4M1VA 3SEVA 4NWCA 3BBRA 3KN8A 1N04A 2ZXTA 1N3XA 1I6BA 4I62A 3CSGA 3ILUB 2UVJA 5H8QA 4ELPA 1FTKA 3E13X 3PU5A 5HBCA 3PD9A 3GBBA 2F78A 5ITOA 4GOTA 5TP9A 1AMFA 3KJ7A 3OEKA 4JSOA 1BIYA 1IXHA 2REGA 1RYXA 3DP8A 4NF5B 3CFZA 3FGSA 4ZZEA 3SEYA 4DXUA 4R2BA 3IORA 1JVXA 4NWDA 5CBSA 2I6EA 3C31A 2Q2CA 4TQUQ 4H1XA 3H06B 2F7CA 1NFTA 5ISUA 1UTBA 1B5HA 1ZMGA 4NF8A 4U1ZA 1LCTA 1Z7ME 3O97A 3R6UA 4KPTA 5AA2A 3MP6A 2D21A 3K0VA 3C35A 3LUYA 3RUMA 3FVKA 4FJPA 1IEJA 3BKIB 1S9TA 2DVCA 2QS3A 1MQHA 2UYEA 3MPKA 1MXZA 3VDFA 4F19A 1QKBA 1VR5A 4F2QA 2R6GE 1Y1ZA 2ONRA 3O6IA 2QMXA 5FHNA 3H3GA 5I59A 1B52A 2Z8DA 2H5YA 1LBBA 4XXUA 4OVJA 3RQTA 3L6GA 3KOTA 5CC2A 4RA1A 4OTEA 4QFNA 1LBCA 1A40A 2F7AA 3CG3A 3OMBA 3N6TA 4LP2B 4POXA 4XIGQ 4DXBA 1A7LA 1J1NA 2ZYMA 3FUZA 1FTOA 4QFLA 4GL8A 3FATA 5FHOA 1CB6A 1B9JA 3H6UA 4LUBA 1MPCA 1OMPA 1MY1A 2V3QA 3H4ZA 2PVUA 1H45A 4N13A 1FQAA 3OO9A 4NE4A 4H67A 4YKIA 1MM6A 4ZEDA 5I2KA 1HSLA 2V3UA 4R74A 4F3BA 1VE4A 5FTHA 1MH4A 5AA1A 3SERA 4UA8A 2DP8A 1GV8A 4BDLA 1DOTA 3F11A 2QS2A 3MP1A 1A8EA 1MM7A 1Y1MA 5FHMA 1TWYA 1EZOA 1IXIA 3MZBA 3KG2A 4JWOA 4NF4B 1ANFA 3CIJA 3D4CA 5CMCA 1LCFA 5F7VA 5TU0A 2FYIA 3LC8A 2OK2A 4DIGA 1AIVA 1B3HA 3QUJA 3TQLA 1T0KA 2GH9A 5DVJA 4NF5A 1BP5A 3A3UA 4KFQA 2XD2A 2Q89A 2RC9A 4GXAA 3FXUA 1PC3A 3CVGA 3PMWA 4G8HA 2DYXA 1SYIA 4G68B 2RCBA 1B2HA 1Z7NE 4JWXA 2THIA 5TPAB 4F1YA 1PEBA 3B6TA 3BFUA 1FQBA 3KN7A 3C9HA 1ZBMA 1B4ZA 1A99A 2GHAA 2RINA 3CG1A 3MBPA 4MH5A 4Z0IA 1FCKA 1NL5A 1B7ZA 1SI0A 2O6AA 3IJXB 3ONMA 4U23A 4WEPA 2O7UA 4PFYA 2Z8EA 5A5XA 1H3DA 2HCAA 3DM0A 3GBAA 2F5XA 1XOCA 2A5TB 4IO6A 2DS9A 2I3WA 4C1TA 2QL3A 5BUUA 1ZIUA 4Z7EA 1PB9A 3IB1A 1ZLQA 2DQVA 4MBPA 3OO8A 1SYHA 1OQGA 2OCUA 1GTKA 3U1OA 5JTYA 3OO7A 3A09A 3HN0A 2HAUA 2F8DA 2Z23A 2XXUA 3VVEA 5I84A 1JEUA 3UN6A 1H44A 1MXXA 2ALUA 2ZNUA 3K6WA 3TPAA 3V8XB 4U21A 1VSOA 2XXQA 5DTBA 1FQCA 2O68A 3P7IA 1ELJA 3K6UA 4H0WA 3VE1B 4EQ7A 4OEVA 3MJNA 3S2VA 2E1SA 1MXYA 1PBPA 4RK2A 2XXIA 4FAJA 1DSNA 4NF6B 2Y7IA 3LSXA 2V93A 2PT1A 2NXOA 4KCCA 2ESNA 4LA9A 1D4NA 3KSXA 4R9FA 4RNSA 1F9BA 4YU0A 1GR2A 4H8IA 2A5SA 3PD8A 3HPIA 3SEWA 4F18A 4QSDA 1SDXA 2QRYA 3N6UA 1SD3A 1PBQA 2CMOA 3UK4A 3TELA 2OLBA 2PBWA 3IO6A 3K01A 2FA7A 3TTRA 3O29A 2AL4A 2Z8FA 3O9PA 2DE4A 1B5IA 4F39A 3ILTB 4LATA 4THIA 1P1OA 3OXNA 3VLWA 1JVYA 5IAIA 4C1UA 4F3GA 3PMXA 1QVSA 2B3FA 5K2XA 4R6HA 5J1DA 1B32A 3QK6A 4OERA 3S9MC 4EUOA 2F34A 2GFEA 5H8HB 2H99A 1P1UA 3FVGA 5I56A 5H8QB 1D9VA 1P1NA 4YZZA 2PMSA 1ZKBA 3JV9A 2IA4A 1XS5A 3OO6A 3FJ7A 3DELB 4DXCA 4P0GA 2QSXA 4G8MA 3OD7A 3LSLA 3N94A 4TOZA 2XHDA 3EF7A 4ESXA 1B6HA 3CI8A 5CMKA 1SW2A 3FVOA 5I58A 3TODA 4G68A 4YB5A 1LAXA 2XXWA 3IOWA 3UGWA 2UVHA 2NWJA 3T9VA 3MPLA 1JNFA 1M5CA 2XXXA 3KN3A 4R75A 3U93A 2H25A 1Y3QA 3QYTA 1IITA 1FW0A 3MC2A 1WVJA 4RK9A 4MLVA 1IZ1A 2XXHA 3LSFB 4GIZA 4LZ5A 3KOSA 2ZMBA 4OFOA 1R6ZA 3ODBA 4JSDA 2A5TA 4YKPA 4MLQA 2REJA 3M3LA 4IO4A 3RPWA 4U4SA 1BLFA 5I2NA 5JEIA 1LFGA 1LSTA 1P1QA 1R9LA 3TKDA 2I4BA 3G3HA 5K2YA 4E0WA 4OHNA 1R1NA 1R9QA 2I49A 2UYFA 4QHQA 1DMBA 3PGFA 4HCYA 1UQWA 4YKJA 3TTNA 1MY3A 3ZSFA 3WAEA 5H8NA 4QSEA 3ZKKA 2HXWA 1QJMA 4ZDMA 1GGGA 3G3JA 3IB2A 3T9HB 4OWDA 1JETA 1B3FA 4F31B 3VFJA 3I6VA 1I6QA 3TUSA 2H4IA 1O64A 2V25A 3FVNA 3K1PA 4ZS9A 3U92A 4KD5A 3N26A 3SETA 4F22A 1NNPA 2HQ0A 3FJGA 2XX8A 1YTVA 3R7XA 1ATGA 4LONB 3PMVA 3DP6A 5L8DA 3C32A 4U22A 4AQ4A 2YJPA 1B58A 3G3IA 3B7DA 2DOJA 1B1HA 1N76A 3TTLA 2B3BA 1XC1A 1UIVA 1MDQA 3QIMA 1MQGA 3MAMA 1TFAA 3VVFA 1LFIA 3MZ1A 2XXPA 2OWTA 3B6QA 3FV1A 2Y7KA 4RPOA 4IO7A 3TDJA 4EDPA 3PUYE 2HAVA 3M3KA 1Y4CA 2D5WA 4KCDA 1DPEA 4YB6A 2Q9TA 3FZVA 4JBZA 1QW0A 4ELOA 1B3EA 2DXRA 3GXAA 4LZ7A 1NKXA 3A3CA 3PUWE 3ZKLA 1DPPA 4EQBA 2M8CA 3CSBA 3MW0A 5JTYB 1NNTA 4GXSB 2VP1A 1QUKA 1B0LA 2X7PA 1B46A 3T9XB 4RYAA 5F1QA 4X1BA 3U8QA 5H8SA 4EF1A 2R71A 3HHGA 5AA2D 3VVDA 4DCXA 1ZJLA 4FORA 1OLCA 4Q5TA 2O7IA 4H8JA 1IIWA 2AYSA 3EPEA 1B1XA 3SEUA 3DLNA 4DE8A 1IXGA 2DXYA 2VOZA 1D9YA 3DP4A 3FJMA 4XKQA 3RT6B 3SKPA 3HHFA 1QUJA 3G3FA 3VLUA 5FTIA 3V89B 3RTFB 5HPQA 3V83A 1MRPA 2P2AA 1AL3A 3C4MA 2OJTA 4OZ9A 3L6HA 1SBPA 2QS4A 5AE4A 3U72A 4GF8A 4KQPA 3PV0E 3C33A 4EXLA 3H6WA 4WXJA 5AA4A 1US4A 4O3AA 3OELA 1B0HA 1DTZA 4IO5A 4JXIA 2I4CA 1PB8A 1FQFA 1TXFA 3HSTA 3MVWA 4PFUA 3AXFA 4GWOA 2B65A 3G7WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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