4N07A

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j-l483y-n754s) in complex with glutamate and bpam-344 at 1.87 a resolution
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
262
structure length
261
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Synthesis, pharmacological and structural characterization, and thermodynamic aspects of GluA2-positive allosteric modulators with a 3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-dioxide scaffold.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 91
structure length 261
sequence length 262
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n07A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n07A02
4G68A 3FUZA 4FORA 3T66A 1DMBA 2RC8A 4OQOA 1F9BA 3G7WA 2O1MA 3PMVA 4O3BA 1LAHE 3V89B 4R2FA 1MXUA 1MPDA 4GXSB 4WXJA 3UIFA 4O3AA 3HPIA 2O7IA 3DM0A 1ZKBA 3FV2A 2AYSA 3S9LC 4DXUA 4LONB 5AE4A 1WVJA 5EYFA 2XXXA 3EN3A 3H3GA 3EPEA 1VE4A 4DXBA 2E1SA 1LSTA 3TQWA 2XHDA 3W9VA 3ZKKA 1OLCA 2PYYA 1Q35A 5CMCA 2Y7IA 2QSXA 2NXOA 2F8DA 2Y7PA 4H1XA 2IEEA 1ZLQA 4XIGQ 1Y9UA 2O69A 3TCGA 5DVJA 3CRBA 4Q0CA 1B7ZA 2O7UA 3K1PA 4ESWA 3TMGA 4GOTA 2YLNA 4R2BA 3S2VA 4H67A 2R9JA 4H6DA 4TQUQ 3C9HA 2F78A 3GBBA 3GZGA 1IITA 4MBPA 3DP8A 3CG3A 2DWHA 5H8QB 4JB7A 3VFJA 4ND9A 3UN6A 1B32A 2ZMBA 1P1NA 4ELRA 3QYTA 4OEUA 3PUVE 4NF8B 4NWDA 5J1DA 2FA7A 1N76A 3R7XA 1PDAA 1IIWA 2CMOA 3KOTA 2BJJX 3O2AA 1H76A 3H03A 3ILUB 1UIVA 2W7YA 1Y3NA 1US4A 1CE2A 3S9MC 1AIVA 3OXNA 5I2KA 1POY1 2FNCA 1N3XA 4NF4B 4EQBA 3OO7A 5ELVA 1MY1A 2I49A 3PUYE 3VDFA 4FEBA 1IXHA 2I0CA 1P99A 4PFTA 3FVOA 1OLAA 2DSFA 5I56A 5ICTA 2GRVA 3MQ9A 2RCAA 3T9HB 2GHBA 2RCBA 4DZ1A 4OYVA 4AQ4A 4BDRA 2ZYKA 3RNNA 4TOZA 4ELPA 3MJNA 4DCYA 4GWOA 1A54A 1LAXA 3KOSA 5IAIA 3PGFA 4R6YA 4WKMA 1FTOA 2UYFA 3MC2A 2V93A 3TTKA 4IGRA 5H8FA 4HS7A 4M4GA 4ZEFA 1URGA 4ZECA 1JW1A 2HZKA 2UXAA 1GTKA 1RYXA 2UVHA 4KYDA 3SETA 3MPKA 3R26A 3IX1A 4YKIA 4ZEBA 4PETA 1LCTA 3OO9A 4U22A 1FQFA 5I2NA 1H44A 1RYOA 2Z8FA 4I8CA 4THIA 4YICA 3LBSA 2O84X 1VSOA 4KR5A 2B3FA 4FIMA 1MM7A 1USYH 4QRZA 1I6QA 3FJMA 4POWA 3S4UA 1MH3A 2QS3A 3FVKA 1M5BA 5K2YA 3MPLA 2F34A 1B7HA 1PC3A 4JWYA 4F3SA 2O68A 1D4NA 1OVTA 1MQIA 4GQOA 4NMYA 2Y7RA 3CR9A 4ISUA 5FTHA 2DVCA 5TPAA 3RTFB 4EXLA 3Q26A 3TDJA 2Y7WA 3C34A 4FAJA 4RPNA 4OTEA 4YU0A 4YKJA 3BFTA 4BDNA 2YPNA 3E9XA 3IJOB 2F36A 4OZ9A 1B7UA 4E0WA 1MM6A 1D9VA 2O1LA 1MY3A 1YCJA 3PMWA 4MFIA 4GIZA 3ECRA 4FECA 4MLQA 3T9UA 3WAFA 3RPWA 4WEPA 3E3KA 3O9PA 3IORA 3IOUA 4EXKA 4F29A 1VFDA 4YMAA 3MWBA 4R6HA 1BP5A 5KDTA 4GVOA 3Q28A 3TODA 4L17A 2PMSA 1Y1ZA 2VHAA 2B65A 5DTBA 4ONYA 3T96B 2DP8A 4OEVA 1NMUA 3LSWA 2DE4A 4LA9A 1M5DA 4RJZA 5AA2D 4TLMB 5L8DA 3TCFA 2VD3A 1BKAA 1XHYA 1QUKA 2XXYA 3TUSA 2FYIA 3A3CA 3RGYA 1MQHA 5DEXB 3IOWA 3MW0A 4UACA 4F22A 3O6GA 4OXVA 4G4PA 3O28A 3TELA 4EQ9A 5I58A 3RN8A 4QSDA 3FASA 3O97A 1PEBA 3FATA 1B4HA 2UVJA 3MZ1A 2OWTA 3SEUA 3SEXA 5H8HA 1BIYA 1H3DA 4QSCA 2RC9A 4ESXA 5CBRA 2HQ0A 4H5GA 3BKIB 4RY1A 1B40A 1L5TA 1R1NA 1SI1A 4U1ZA 1I6BA 1A7LA 4R9FA 2XD3A 3OSRA 4FEDA 2HAVA 3LSLA 3JV9A 3VVDA 3OO6A 3TPAA 2ZYOA 3U92A 3H4ZA 4OERA 3QSLA 1SBPA 2OZZA 3OEMA 1OMPA 3W15C 4RK2A 1MQGA 1A8FA 3QXMA 4NWCA 2VGQA 4G68B 3BFUA 1QVSA 4KFQA 3IAZA 3FD3A 1Q1KA 2ALUA 2F6PA 2Y84A 3G3IA 4DLDA 5FHOA 3CFXA 4MH5A 2REJA 3VLUA 3ODBA 3K00A 4XKPA 3TTLA 3CVGA 5IKBA 1SYHA 1A55A 4C1TA 3RLFE 4O3CA 3RUMA 2HXWA 4QSEA 4DIGA 1DPEA 1MS7A 3ZSFA 1TT1A 4PFYA 2Z22A 1PBQA 3S9NC 2Q88A 4I62A 4F1YA 4ZZEA 1FQDA 1PB8A 1B5JA 4KD5A 3RTWB 4ZE9A 3FVNA 1B3EA 3JZJA 1JEVA 4KCCA 1SW4A 3MZBA 5L9OA 2UVIA 2VOZA 1MPBA 3ILTB 4JDFA 4ZE8A 4BDMA 1XOCA 1JW5A 5TP9A 3K6UA 4LZ5A 4KYEA 3KFMA 1DTGA 3UP9A 1B51A 2O51A 2YJPA 2OLBA 1Z7NE 2Q2CA 3FVGA 4XKNA 4PP0A 4F19A 5K2XA 4OVJA 1PBPA 1JETA 5H8NA 4NTLA 3KBRA 1B1XA 3MZ9A 1MY4A 1NNFA 2AL4A 3PU5A 3R6UA 2XXVA 3G3HA 3VXCA 1LAFE 3HHFA 3TQLA 3C35A 1LFGA 5HM4B 2G93A 5CMKA 3IOVA 2NWJA 1ATGA 1NH8A 4RK9A 1UTHB 5H8SA 3FXUA 5I2KB 2UYEA 4QFNA 4Q5TA 4XKRA 5A5XB 1GGGA 4YZZA 1MDQA 1H45A 1P1OA 4LVQA 4JBZA 3U8QA 4WEDA 3U94A 5I56B 4RXLA 4JWOA 4U21A 4I9DA 2XXTA 5DYHA 3I6VA 3RT8A 1LGBC 4Z7EA 1Y4TA 1JQFA 3V8XB 3L6HA 4FJPA 3MVXA 1B5HA 2DS9A 4XTCQ 3HN0A 3RQTA 1NKXA 1S7YA 3FXQA 2DE3A 5H8FB 1UTHA 5I84A 2P2AA 4ZEIA 3O29A 1SDXA 3OO8A 1NL5A 1TFDA 5A5XA 4N6PA 1ZTYA 2A5TA 4C0RA 1XVYA 3C36A 5I2NB 1MQJA 2ZNUA 1B3FA 1JW4A 4OETA 2QJEA 1B5IA 3PPPA 3HHGA 1SD3A 3C32A 3EQ1A 1VFEA 3TAJA 1QJMA 5FTIA 3HCQA 2AL5A 4YMBA 1A8EA 4IB2A 4DE8A 4NEDA 4QHQA 3UK4A 1MG1A 2DWAA 1FTJA 2E0SA 2OCUA 4LUBA 3C31A 1FTMA 4R6KA 3H6TA 3HSTA 3E13X 4GFRA 2D21A 2QMWA 1LB9A 1XS5A 3QAXA 5TPAB 1N7WA 5I59A 4LZ8A 1UQWA 1FTKA 4MF3A 1AOVA 3K4UA 3N5LA 1B9JA 2OWSA 4KQPA 1QKAA 3OENA 3M3FA 2XXIA 4N13A 4ZZAA 4M1VA 3I3VA 2RF1A 3GBAA 4KYSA 2DE2A 4ZS9A 4YB5A 2I58A 4ZDMA 3K02A 5EHMA 1IEJA 1URDA 3G3FA 3SEVA 3CSBA 3CSGA 1FQCA 4G8NA 3VV5A 5JEIA 5HBCA 1B0HA 4F1UA 4KPTA 1SW1A 3GXAA 1MXZA 3RT6B 1NH7A 1JNFA 3IOTA 4DCXA 1UIUA 1LCFA 2R6GE 5KDTB 2ESNA 2I48A 5BUUA 4PQJA 2Q9TA 2DVZA 1FTLA 3VVFA 5AA3A 1AMFA 1PB9A 3LSXA 4P11A 1EZOA 3VLWA 5M2VA 4P0IA 1B52A 4KCDA 5AA4A 4BDOA 2DOJA 1S9TA 2ONSA 2HAUA 1B4ZA 3PPNA 1FQAA 4GF8A 4ZEKA 3OELA 1EU8A 4IY6A 2I3VA 1FQEA 1D9YA 5L9SA 3W9WA 5I58B 1SW2A 3RY3A 3A3UA 3G3KA 4NF5A 1LBBA 5I57B 2NOOA 1RKMA 2DWIA 3MVYA 2H25A 3VVEA 1B0LA 4OFJA 4F18A 5CMMA 5H8HB 3G3JA 5DVFA 3KEIA 4H5FA 2GHAA 1QW0A 1ZMGA 2D3IA 3VE1B 2GFEA 3LSFB 4LZ7A 4Z0IA 1ZJLA 2VP1A 2I4CA 1JVXA 2V3UA 1JEUA 3SKPA 2HZLA 4RNSA 4R72A 1YTVA 2H98A 3OMBA 5JK4A 4OWDA 4EUOA 1ZIUA 3TTRA 4QFPA 3K6WA 2GH9A 2V84A 4NF6B 3PPQA 3SEWA 4G68C 2R71A 2XXWA 1T0KA 4XKQA 3K2DA 3SDFA 2F7BA 2H9BA 4HCWA 5I57A 1QUIA 4F3PA 3B7DA 3I5OA 3K6XA 3MUQA 2QS4A 3KSJA 3IO6A 1M5EA 1N7XA 4ELOA 3BBRA 5B70A 2HCAA 3IO4A 4GRKA 4JSOA 3K1MA 1QUJA 3PD8A 3SESA 3HV1A 1URSA 5HPQA 1BTJA 4F2OA 4HCYA 2XX7A 3B6QA 1DSNA 3B6TA 2X26A 2RKMA 1MPCA 1B3GA 3H6WA 1A40A 2XD2A 4NF6A 5L9MA 4LQ2A 3T22A 1SQYA 3IR1A 4H8IA 2Y7KA 1KWHA 1FW0A 2O6AA 4IGTA 1GR2A 3H06B 2QL3A 3TYHA 5TP9B 2OK2A 3TEPA 4KI0E 4U2RA 1ANFA 4F3GA 5CC2A 3TFLA 1SW5A 4F1VA 2PBWA 1B58A 3JYRA 3ZS6A 1SVXB 3A09A 2PT2A 2I0BA 2THIA 4XXUA 1N04A 1US5A 2HEUA 3O6IA 4E0XA 5H8NB 4EF2A 1SI0A 3FXRA 5DVIA 2DXRA 1EZPA 3FJGA 1BLFA 2QS1A 4LQ5A 4BDLA 5ITPA 1ZU0A 5AA1A 3PUZE 2I6EA 5ITOA 2RINA 4GXAA 4I1DA 3CI8A 2ZNSA 1NNPA 5F7VA 1MQDA 1O7TA 2H4IA 3GLBA 2I3WA 3N26A 4H0WA 3QUJA 3K1NA 3OD7A 4HW8A 2ZYMA 4R75A 3E4RA 2PVUA 2XXPA 1MRPA 2F35A 4U1OA 3KJ7A 1LBCA 5KZTA 3U72A 2F7CA 3U1OA 4YB7A 5BWJA 3KZGA 5AA2A 4GLIA 4TLLB 4RPOA 3MAMA 3IB1A 1IZ1A 1P1QA 4H8JA 1B3HA 3SEYA 2H5YA 4POXA 4F39A 2ANJA 3AXFA 3PV0E 3DP4A 4KHZE 4F3BA 4RA1A 4U23A 2XXUA 4R9GA 3H6UA 3V83A 1YPNA 2ABHA 2CZLA 1ELJA 4PFUA 4YKKA 4EDPA 2H99A 3O66A 2A5TB 1A99A 2G29A 4HTGA 2XX8A 5ISUA 2X7QA 1GV8A 3PD9A 4DDDA 3D4GA 5CM6A 2DXYA 1QKBA 3UA8A 1OIBA 4IO3A 2LAOA 3KSXA 1S50A 4LATA 1N3WA 3KGCA 1B2HA 2F6GA 4DXCA 3C4MA 4FE8A 5CRYA 3TZAA 5JTYB 1Y1MA 2VD2A 4GL8A 2Z8EA 4JXIA 4P0GA 3PPRA 2X7PA 1EZ9A 3M8UA 1LAGE 3U93A 3N6TA 2XX9A 4UA8A 1P1UA 4IO7A 1HSLA 5TU0A 1B6HA 1M5CA 5I59B 1OQGA 3WAEA 3N6UA 4MLVA 2QPQA 3VLVA 4X9TA 4OMBA 3PUXE 1WODA 3LUYA 3M3KA 3EHSA 3MP8A 3H7MA 3IB0A 1YAEA 4YB6A 3LR1A 5H8QA 3VXBA 3V5AA 1UTBB 1OVBA 3EHTA 4AB6A 2IA4A 3KG2A 5JTYA 3L6GA 2Q8JA 1MY2A 3D4CA 3TTMA 4QFOA 4NF8A 4G8HA 2B3BA 3CG1A 1R9QA 3T93B 1Z7ME 1MDP1 2PX1A 2F97A 1IQ7A 3Q27A 1EH3A 5KCJB 2QS2A 1Y20A 4BDQA 1R6ZA 5EHSA 1HSEA 2Z23A 4R74A 3S9EA 2PT1A 2REGA 4NF4A 4ECFA 2A5SA 1XC1A 1M5FA 1AH5A 5FHNA 3F11A 5AA4B 2QMXA 3KJTA 3FGSA 5LOMA 1N0TA 2ZXTA 4LP2B 1Y3QA 3K0VA 2ONRA 1UTBA 1WDNA 5ICQA 3SERA 1MXWA 1MH4A 3IK6B 4G2ZA 1DTZA 3UORA 1B46A 4JWXA 4NF5B 4RYAA 2ZYNA 3IJXB 2AIXA 3Q25A 4IY5A 4EQ7A 2OBGA 3PPOA 5KCJA 3O6HA 4IO4A 1O64A 3MVWA 3CFZA 1Y4CA 1IUDA 5CMBA 3FV1A 2V25A 2ZNTA 3B6WA 5CBSA 1FQBA 5DT6A 3LC8A 4OFLA 4JSDA 3EF7A 4OESA 3EHUA 5F1QA 4YAHX 3ZKLA 2F7AA 3T9XB 1IXGA 2HFBA 4X1DA 2RC7A 2Q89A 1DPPA 4Q8RA 2UVGA 3THIA 4EF1A 3OSQA 1FCKA 3TTNA 4U4XA 4R73A 3OOAA 3DELB 3DP6A 2NVUB 3Q29A 1NNTA 2V3QA 3C33A 4PFWA 1OQHA 4QFLA 4U4SA 4GL0A 4NE4A 4QF9A 4BLAA 2XXQA 1N84A 2DQVA 3MP6A 4OENA 1USYE 4X1BA 3IB2A 3FZVA 3KN3A 1TWYA 1XT8A 3KN8A 1PB7A 3K01A 3K6VA 2DWJA 1POTA 2P0SA 3TKDA 2WKYA 4YKPA 4IO2A 2I4BA 1O63A 3PMXA 4QFKA 1NNKA 1B1HA 3G3GA 1LB8A 2P1SA 3MVZA 3H6VA 3USDA 4C1UA 3P7IA 3CIJA 1HSJA 4F31B 3M3LA 3T9VA 4IO5A 1J1NA 1I69A 1B3LA 4G8MA 3MP1A 1IXIA 1MXXA 2F5XA 1I6AA 1MY0A 3KN7A 3TCHA 3DLNA 2QRYA 1P1WA 4IO6A 3CFLA 3N94A 3IL1B 3MBPA 4G77A 1XVXA 5CI5A 3QK6A 3HO7A 2NUVA 4Q30B 4AB5A 4H65A 1VR5A 3FIRA 1NFTA 4ZEDA 3FJ7A 3UGWA 3PUWE 1LLSA 1II5A 2XXHA 4OHNA 5DEXA 2M8CA 1H43A 5B7DA 1GVCA 1TFAA 5FHMA 2Z8DA 3ONMA 1CB6A 3QUFA 1ZBMA 1B05A 2XXRA 1TXFA 4K3FA 4FATA 1Y3PA 4X48A 2KLFA 2OJTA 3QIMA 5AA2B 1MXVA 2DYXA 1LFIA 2D5WA 2ONKE 1R9LA 4N07A 2Q2AA 1D3KA 4ELQA 1MXYA 1JVYA 1LFHA 2V3TA 3OEKA 1AL3A 4GD5A 1IXCA 4F2QA 1QULA 4PE5B 1DOTA 1SYIA 4OFOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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