4N07A

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j-l483y-n754s) in complex with glutamate and bpam-344 at 1.87 a resolution
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
262
structure length
261
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Synthesis, pharmacological and structural characterization, and thermodynamic aspects of GluA2-positive allosteric modulators with a 3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-dioxide scaffold.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 91
structure length 261
sequence length 262
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n07A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n07A02
1ANFA 1US4A 2P2AA 5AA2D 4DLDA 1PDAA 4C0RA 3KSJA 1P1OA 5FTHA 1JQFA 2ALUA 4Q5TA 4YKIA 3IOVA 5I2KB 4HCYA 1PC3A 4Z7EA 1PBQA 3GZGA 1NMUA 1NNTA 3FGSA 4JBZA 3BBRA 3MP1A 2XX9A 1POY1 3T9XB 3TYHA 1MXXA 2OJTA 4IO2A 3MVWA 1DPEA 3FXRA 5TPAB 1FCKA 2I4CA 5F7VA 1B5IA 2ESNA 2H9BA 2UVGA 2VHAA 1MY1A 4OFLA 2B65A 1FQFA 2OWTA 2QS2A 4OWDA 4U22A 4R2BA 1JETA 2BJJX 4EF1A 4EF2A 1FQDA 3T93B 4X48A 3VE1B 2F5XA 2QMWA 4FECA 1HSLA 2ZXTA 3KEIA 5CMMA 1IITA 3PD9A 3OSQA 4YU0A 3UORA 2DVZA 3TCHA 5I57A 3OELA 1ZBMA 1CB6A 1OLCA 3K00A 2ZYOA 4YB6A 4UA8A 3T9HB 5JTYA 3EPEA 2ONSA 4IY6A 2PX1A 1MPBA 1LAXA 3PUZE 1USYE 2VOZA 3E3KA 3W9VA 3OXNA 1MY4A 1IXHA 3QXMA 2V3TA 3MZBA 2WKYA 1ELJA 1XOCA 3O6HA 4R6HA 3CSGA 2V25A 5DT6A 1Q1KA 4OERA 4DCXA 3QSLA 4G8HA 4JWOA 2XXHA 1II5A 1B3GA 1URSA 3V89B 4FE8A 2ONRA 2QJEA 3IB2A 3KG2A 1SW2A 4LP2B 2I0CA 1A7LA 3IJOB 1MQHA 1MH3A 1MQDA 1B4ZA 2PT1A 4IO7A 1VFDA 4HW8A 1B3FA 3HPIA 1P1NA 3K6VA 1N7XA 1HSJA 4ELQA 2ZYMA 1URDA 3FATA 3S2VA 4AB6A 1T0KA 4OMBA 1ZJLA 4NF8B 1FTMA 4ZS9A 1SBPA 3E9XA 3ZS6A 1NFTA 3FVKA 1H43A 3ZKLA 4KCDA 1SI1A 2Q89A 4LONB 3H06B 3IB0A 1B58A 2E0SA 3GBBA 5KDTA 3IO4A 3S9EA 3MC2A 2Q9TA 3KJTA 2DXYA 2RKMA 3TPAA 4G2ZA 2Q2AA 3CFLA 2QS4A 3PPNA 4R74A 4DZ1A 3TZAA 4XXUA 3JZJA 4WEPA 1PB9A 2O69A 2UVIA 3SEWA 3GXAA 3T9VA 1QJMA 1SW4A 1EZ9A 5A5XA 3K0VA 4F29A 5LOMA 5FHOA 4BDOA 5I58B 1J1NA 5H8SA 1SYIA 4NWCA 3PPPA 4BDRA 3Q27A 5EHMA 3VLUA 3IOUA 1FTLA 2GH9A 4E0WA 2H98A 1JVYA 1PBPA 3MVXA 2G93A 3M3LA 3K02A 1NL5A 2R9JA 3IR1A 2IEEA 2F97A 3N6TA 4OZ9A 3TCGA 1B2HA 1R6ZA 2QSXA 4AB5A 2ZYKA 3FUZA 2P1SA 3QUJA 1EZOA 2A5TA 3DP8A 5L8DA 3ILUB 4KHZE 3C33A 1AH5A 5H8NB 3QK6A 3RTFB 3ILTB 3N26A 4KFQA 1NH8A 3UK4A 3O28A 4YKPA 1MXYA 3LSXA 5F1QA 4MLQA 3PD8A 1OMPA 2O7IA 2YPNA 1QKBA 3K6XA 1UTBA 4QF9A 2XXWA 5TP9A 2XXPA 4H8IA 4M4GA 3O6GA 4NMYA 5H8QA 3TODA 1HSEA 3OEMA 2D3IA 3PMVA 2DS9A 2AL4A 4ZEIA 2UVJA 1EU8A 3CFXA 5AE4A 1JVXA 1RKMA 2HAVA 1XS5A 2XX8A 4RY1A 2ZMBA 2F6GA 1JEUA 4H67A 4MFIA 3LSWA 3KN8A 4JWXA 3UGWA 1LCFA 1YAEA 3FIRA 3C4MA 3IK6B 1PB7A 3CIJA 3D4CA 2ZYNA 3IO6A 3TMGA 4TLMB 3FV1A 3D4GA 3SESA 4U4SA 2XXTA 2RC9A 1URGA 1SD3A 4EQ7A 5ELVA 3TTRA 4LZ8A 4ZE9A 4ZECA 5HBCA 1IXCA 4GLIA 3EHTA 4XKQA 3S4UA 2REJA 3MZ9A 4IY5A 2Y7KA 1O63A 3CRBA 4ONYA 1SQYA 2VD3A 1YPNA 4HS7A 2ZNUA 5HM4B 2XXRA 3H4ZA 1FTOA 4G68B 1MM7A 1SW5A 3LUYA 5H8FA 2I58A 1GTKA 2B3BA 4Q8RA 3RQTA 1BLFA 2XHDA 5DVIA 2XXUA 1SW1A 1UQWA 1VE4A 2W7YA 3N6UA 4LUBA 1O64A 2NUVA 5DEXA 1KWHA 1M5DA 4KYEA 1Y1MA 3IX1A 2Z23A 4NF5B 1IEJA 4L17A 4R73A 5KCJA 2REGA 1MY2A 4I62A 3IAZA 4R9FA 4ELOA 2OBGA 1F9BA 3WAEA 3MVZA 2FNCA 5FTIA 4IO3A 1Y4CA 4F39A 1MH4A 2I48A 4EDPA 4WEDA 1IXGA 3I5OA 3R26A 1H44A 4R72A 1B52A 4GXSB 1OVBA 5ICQA 4X1BA 1OIBA 3SEVA 4IO5A 1B51A 3RN8A 3TFLA 4PQJA 2I3WA 1D4NA 3H6VA 4N07A 4PP0A 3K6WA 4OTEA 3N5LA 4XKRA 4MBPA 4K3FA 3EF7A 3QUFA 1Z7NE 3DLNA 3O6IA 3H6TA 3KGCA 3RPWA 4PFUA 2NOOA 4G4PA 3SEUA 4PFWA 3S9LC 2VGQA 3GBAA 4QFLA 2HXWA 4F3GA 4Q30B 1AOVA 1FQAA 1WODA 3SETA 2B3FA 2Q8JA 2QS3A 3FXQA 3T22A 1ATGA 2Z22A 3H6WA 2AYSA 1N7WA 4F3PA 3LR1A 5BWJA 3HN0A 4TOZA 3H7MA 4OHNA 2KLFA 1DOTA 1WVJA 4E0XA 3PUVE 4OXVA 1I69A 2NVUB 1L5TA 1M5CA 5CBSA 3V83A 5I56B 4OENA 3K4UA 1UTHA 2F8DA 3ODBA 3M3KA 3PV0E 2XXQA 1ZU0A 4EQ9A 4QRZA 3MP6A 4GIZA 1RYXA 1Y3QA 4QFOA 5L9OA 3H3GA 5H8NA 4JXIA 5H8HB 3DP6A 2H4IA 5AA1A 4F31B 1QVSA 1B05A 1OLAA 1LB9A 1TFDA 3F11A 4RK9A 1N04A 1Y20A 1D9VA 1MDQA 3PU5A 2OK2A 2OCUA 5B7DA 1M5FA 5L9SA 1B5JA 1DSNA 2H99A 2XXVA 2A5SA 1ZLQA 4WXJA 2ZNSA 3LSFB 1IXIA 1MM6A 2DWIA 2HQ0A 3N94A 4G77A 1XT8A 1FW0A 3TELA 1Y4TA 1H45A 1USYH 1QW0A 3S9NC 4DXUA 2F35A 4F2QA 3SEYA 4R2FA 4G68C 1A8EA 3IJXB 3KSXA 1MQIA 3FXUA 4O3AA 3T9UA 4YZZA 4F22A 3FJMA 4R9GA 1NH7A 3DP4A 3VLVA 3UA8A 4GOTA 1B0HA 3EQ1A 5CRYA 3KN7A 4RPOA 5DVJA 3W9WA 3RGYA 3TQWA 2RC7A 2X7PA 3RTWB 4NF4B 1N76A 4P0GA 5I84A 2R71A 4IB2A 1JW1A 2Y7RA 5CMBA 5AA3A 3U93A 3TTNA 3U72A 4YICA 3TEPA 4EQBA 1SYHA 4GL0A 4GD5A 2R6GE 4ZE8A 4DXBA 5EYFA 2I3VA 5CC2A 1VSOA 3G3HA 5FHMA 1N3WA 2O1MA 2DQVA 4G68A 3IL1B 1IQ7A 3LSLA 4NTLA 4I9DA 1MDP1 4ZZEA 1XVYA 4R6KA 1BKAA 2Y84A 1M5EA 3UN6A 1EH3A 5KZTA 3KZGA 2RF1A 1YCJA 4I8CA 2HFBA 4NF6B 1MY3A 3JV9A 1ZMGA 1B3LA 3VXCA 1ZTYA 3HHFA 4H8JA 3KN3A 5I2NB 4F2OA 3IOTA 3BFUA 3R6UA 3U8QA 5AA2B 3MW0A 3I3VA 3TDJA 3B6TA 2YJPA 4H0WA 1NNFA 4OQOA 5B70A 1I6QA 1R9QA 1UIVA 3OO7A 3VLWA 2ABHA 4OEUA 1DMBA 4FIMA 5I57B 3PMXA 1MXWA 1OQGA 4YMAA 4OETA 2F6PA 3PMWA 3V5AA 3UP9A 4POWA 4F18A 5JTYB 1JW5A 2HZLA 3FJ7A 3OO8A 1YTVA 1US5A 4LA9A 4GL8A 1B3EA 1Q35A 1Y3NA 3U94A 4FEDA 1DPPA 3HO7A 4QFPA 1B46A 3O66A 4I1DA 3C32A 3LBSA 2H5YA 3ZSFA 4LATA 2H25A 3G3GA 4DE8A 1P1WA 1A54A 4U21A 3LC8A 1NKXA 3T96B 1B1XA 5HPQA 1IUDA 4DIGA 3B6WA 4U23A 5I2KA 3H03A 5BUUA 5DYHA 3CG1A 5J1DA 3O9PA 2HCAA 2F7CA 2I0BA 3TUSA 1LAGE 1H76A 4RXLA 1GR2A 3VDFA 3CG3A 3MP8A 2OLBA 1H3DA 4H65A 1P1QA 3Q25A 2DVCA 1LBCA 4GVOA 5TPAA 3B6QA 4F3BA 4EUOA 3VVEA 4NWDA 4RYAA 1NNPA 1DTZA 3C9HA 4FEBA 1D3KA 3OO9A 1WDNA 2PYYA 3RLFE 2V3UA 3TCFA 3KJ7A 3HSTA 3MJNA 2THIA 4QSCA 3FD3A 5CI5A 2XXXA 3PPQA 2DE4A 2I49A 3DM0A 1BP5A 4OYVA 4XIGQ 1Y3PA 1SVXB 5H8HA 5M2VA 1LAHE 4F19A 4FAJA 3C35A 3MPLA 5DTBA 2O51A 3CFZA 3K1MA 2QMXA 2RCBA 2XD2A 4FJPA 3MVYA 5CM6A 2O7UA 3CSBA 5ITPA 4LVQA 2DE2A 2DSFA 3G3IA 4TLLB 1TFAA 1RYOA 4BDMA 1LLSA 3FV2A 3MPKA 1IIWA 3ECRA 3BKIB 1P99A 2ONKE 1N3XA 4YB7A 1EZPA 1JNFA 1LB8A 4PE5B 4KPTA 4H6DA 1B32A 3HHGA 3L6HA 3Q28A 1PB8A 2A5TB 3PUWE 3O97A 3TTLA 4JDFA 3G3KA 3MUQA 1FQBA 3SEXA 1GVCA 2GHAA 3FASA 3K1NA 2LAOA 3G3JA 4P11A 5EHSA 2QS1A 1N84A 4F3SA 4KYDA 1M5BA 1A40A 4NF8A 2I6EA 4FATA 1B3HA 5TP9B 4R75A 1MXUA 2X7QA 3MQ9A 1A8FA 5H8QB 4GQOA 4XTCQ 2HAUA 2FA7A 2PT2A 3SERA 2UVHA 4BLAA 2NWJA 3TAJA 3VXBA 2PVUA 5K2XA 2CMOA 1BTJA 1Y1ZA 4QSEA 5AA4B 3CVGA 4HTGA 2AIXA 3PGFA 4KD5A 4O3BA 3MAMA 3VVFA 4F1VA 4YMBA 4O3CA 2O1LA 3MZ1A 3PPRA 4X1DA 1ZIUA 5I58A 3JYRA 2G29A 1AMFA 2NXOA 4LZ7A 3PPOA 4PETA 1B5HA 1LCTA 4OESA 5JK4A 1R1NA 2F36A 3W15C 5I59B 4OFJA 3Q26A 4NF6A 1QULA 3C34A 4BDLA 1XHYA 3G3FA 1B7UA 3M3FA 1DTGA 4IO6A 2V84A 5I2NA 3OO6A 3A09A 3OMBA 3TTMA 2HEUA 4OVJA 4GXAA 5AA2A 3IOWA 1N0TA 4Z0IA 4POXA 4KQPA 1I6AA 4ELRA 2GRVA 5CBRA 3RY3A 2RC8A 2Y7IA 2XD3A 2XXYA 2AL5A 2RINA 3THIA 3CI8A 3E4RA 1LFGA 1MQJA 2QRYA 3FVOA 3MBPA 1OQHA 5H8FB 1B4HA 1S50A 3BFTA 1O7TA 5IAIA 3ONMA 4ISUA 4EXKA 5DEXB 4ZZAA 3H6UA 1MS7A 4C1TA 4ZEFA 3OEKA 4IGRA 5KCJB 3C36A 1CE2A 4ZEBA 1B40A 3E13X 1B7HA 1MQGA 2DP8A 4NE4A 3T66A 4XKPA 4IO4A 1SDXA 2F34A 4H1XA 4HCWA 1BIYA 4G8MA 4GFRA 1OVTA 3KFMA 2F7AA 3IB1A 4TQUQ 4BDNA 3O2AA 2OWSA 1FQCA 1XC1A 1MPCA 1B1HA 3AXFA 1PEBA 4WKMA 1MY0A 3QYTA 4GRKA 4R6YA 3KBRA 5FHNA 1LGBC 2Z8EA 1UIUA 1B9JA 1TXFA 3IORA 2DWHA 4ND9A 4EXLA 3UIFA 4JWYA 4JSDA 3KOTA 3USDA 3SKPA 4DDDA 1FQEA 3I6VA 4PFYA 1MXVA 3EN3A 4MLVA 2D21A 2Q88A 3RUMA 4G8NA 5ICTA 3TTKA 1I6BA 1P1UA 2IA4A 4DXCA 2PMSA 2QL3A 3GLBA 3K01A 1R9LA 4MH5A 3TKDA 3HCQA 4RK2A 1LAFE 4U4XA 3L6GA 4ESXA 3VVDA 2X26A 1AIVA 1LFHA 1AL3A 3O29A 4NF5A 1SI0A 5ITOA 5CMKA 2ANJA 2DOJA 4H5GA 3OENA 3WAFA 4DCYA 4KYSA 4QFNA 4LZ5A 4RJZA 1LFIA 2F78A 2O68A 1B6HA 1S9TA 4UACA 2FYIA 4ZEDA 4N13A 1UTHB 2Y7WA 4N6PA 4P0IA 3EHSA 2V3QA 1VFEA 4NEDA 5TU0A 1S7YA 2DWAA 4QSDA 1B7ZA 1GGGA 2UYFA 1TT1A 3C31A 3ZKKA 5ISUA 3RT6B 2O84X 2DWJA 2ZNTA 3FZVA 4IGTA 1D9YA 3M8UA 3FJGA 3RNNA 2F7BA 3RT8A 4YAHX 1MRPA 3U92A 2GHBA 2O6AA 2P0SA 1NNKA 2OZZA 4BDQA 2HZKA 2E1SA 2V93A 3KOSA 4M1VA 5DVFA 3OSRA 1ZKBA 3EHUA 1VR5A 4OFOA 4KR5A 3FVGA 1XVXA 3K1PA 1Z7ME 5CMCA 1A99A 2VP1A 4ZDMA 1MPDA 4PFTA 5AA4A 4THIA 3VFJA 1JEVA 2DYXA 2XX7A 1MG1A 4U1ZA 3CR9A 3VV5A 4RA1A 3QIMA 1QUKA 4ZEKA 1QUJA 4X9TA 4Q0CA 4C1UA 4H5FA 4KI0E 5I59A 5L9MA 3TQLA 4ESWA 2Q2CA 3A3CA 1FTJA 2GFEA 5I56A 1LSTA 3PUYE 4YB5A 3DELB 1MXZA 4XKNA 5KDTB 1GV8A 4GWOA 4YKKA 4QFKA 4RNSA 3B7DA 4KCCA 4LQ5A 3G7WA 1FTKA 2XXIA 4MF3A 2CZLA 1LBBA 3R7XA 3K6UA 5A5XB 2DXRA 4F1UA 3A3UA 4JB7A 4RPNA 2Z8FA 3OOAA 5K2YA 1A55A 3HV1A 3K2DA 1B0LA 4JSOA 4FORA 1QUIA 3Q29A 4ECFA 3SDFA 2VD2A 3S9MC 4GF8A 1JW4A 3U1OA 1QKAA 2I4BA 3MWBA 2M8CA 4AQ4A 1IZ1A 4YKJA 4OEVA 2Y7PA 2YLNA 3V8XB 3P7IA 2PBWA 4LQ2A 5JEIA 4U2RA 3QAXA 2D5WA 3OD7A 3FVNA 1UTBB 2UXAA 4NF4A 4U1OA 2Z8DA 5IKBA 4F1YA 1Y9UA 3PUXE 1POTA 4QHQA 2QPQA 1TWYA 2RCAA 2DE3A 4ELPA 2UYEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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