3TYHA

Crystal structure of oxo-cupper clusters binding to ferric binding protein from neisseria gonorrhoeae
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
309
structure length
309
Chain Sequence
DITVYNGQHKEAAQAVADAFTRATGIKVKLNSAKGDQLAGQIKEEGSRSPADVFYSEQIPALATLSAANLLEPLPASTINETRGKGVPVAAKKDWVALSGRSRVVVYDTRKLSEKDLEKSVLNYATPKWKNRIGYVPTSGAFLEQIVAIVKLKGEAAALKWLKGLKEYGKPYAKNSVALQAVENGEIDAALINNYYWHAFAREKGVQNVHTRLNFVRHRDPGALVTYSGAAVLKSSQNKDEAKKFVAFLAGKEGQRALTAVRAEYPLNPHVVSTFNLEPIAKLEAPQVSATTVSEKEHATRLLEQAGMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Metal transport
molecule keywords FbpA protein
publication title Crystal structure of oxo-cupper clusters binding to ferric binding protein from Neisseria gonorrhoeae
rcsb
source organism Neisseria gonorrhoeae
total genus 109
structure length 309
sequence length 309
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tyhA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tyhA02
2QS1A 3QSLA 3PUXE 3DELB 2D21A 2F7BA 1H3DA 1QW0A 4TLLB 1XOCA 1IXHA 1O63A 1FTLA 3TTNA 3RT6B 3VLWA 1MS7A 1US5A 3O97A 3KSJA 3ECRA 4GXSB 4ZEBA 2VOZA 3S9MC 5DVJA 5H8FB 2ZYKA 5KCJB 4F31B 1JW5A 5J1DA 4AB5A 4QF9A 4U2RA 1QUJA 1NNFA 1GVCA 2UVIA 1B51A 3FJ7A 1JW4A 2VD3A 3PUZE 5H8SA 4IO4A 4DXBA 1RKMA 3C31A 5F1QA 4R2FA 3T96B 3TUSA 1OLAA 1SI0A 4YU0A 3TDJA 1JVYA 3MUQA 4OESA 2FA7A 2XXYA 4OYVA 5ISUA 3EHTA 1IXGA 1H44A 2DWHA 2DWIA 4OEVA 1MY3A 2V3QA 2B3BA 4H65A 3FASA 4KR5A 2Q9TA 3MJNA 3R6UA 3TMGA 3VDFA 3IAZA 2D3IA 4BDMA 2DOJA 4EQ7A 3TCHA 1IXCA 3PGFA 1OLCA 1UQWA 1AIVA 4POWA 1B05A 1FQDA 1QULA 2O69A 2XXWA 4EF1A 1JNFA 3UP9A 4G68A 2DVCA 4XKQA 4U21A 1P1OA 1OVTA 4Q30B 3C9HA 5I2NB 3FATA 1PEBA 4U1OA 3KGCA 4BDLA 5FHOA 4PFUA 2RF1A 1FTKA 3Q26A 3KZGA 1B6HA 2ANJA 1NMUA 3K1NA 4NF8A 1LBCA 1B40A 1Y4TA 2UVGA 3FVKA 2HAVA 1XVYA 1SVXB 4F39A 1LB9A 2DWJA 3O29A 4L17A 5EHMA 1B3HA 3GXAA 3SEXA 1UIUA 2F6GA 1BIYA 4ZEDA 4TQUQ 1L5TA 2PT2A 3RY3A 3THIA 3SESA 1B5HA 5H8NB 4JB7A 2Z23A 3D4GA 2I3VA 1B7UA 2IEEA 4F3BA 2ESNA 4XKPA 1OMPA 1B7HA 2OWSA 3C32A 4I1DA 2V84A 1FQAA 3N6UA 1UTBB 4HW8A 1SBPA 4OHNA 5KDTA 3RPWA 1B3FA 4KHZE 4G2ZA 4RA1A 3U94A 3UN6A 1NH8A 1SD3A 2X7QA 4PFYA 2REGA 3EPEA 1P1UA 2RCBA 5CMMA 4ZE8A 4QFPA 3PD8A 2PYYA 1YPNA 5IAIA 1QUIA 1DMBA 1EZPA 2Z22A 4YB6A 4GL0A 3UA8A 2XXIA 1FCKA 4QFKA 2F7CA 2RC9A 3F11A 2RCAA 3VLUA 2XXRA 5CBRA 1N0TA 1JEVA 3U8QA 4M1VA 3OO9A 5I2KA 1Y3PA 1IUDA 1LFHA 1P1WA 2F35A 5F7VA 1TWYA 4YKPA 1JVXA 3KOTA 3ZSFA 2I48A 4E0XA 1S50A 1I6QA 4RPNA 4LZ5A 4JSDA 3C36A 3LSFB 4RY1A 4KI0E 1FTMA 4LP2B 4EQ9A 5HM4B 3U92A 1A8EA 4JWYA 3TZAA 4KFQA 2P1SA 4NTLA 4QSDA 4GOTA 2QL3A 4THIA 1SW1A 4RNSA 4O3CA 1DTGA 3G3HA 2O7IA 1VFDA 1AL3A 1VSOA 2ABHA 2F97A 1IITA 4KQPA 4PETA 4FEDA 1BLFA 1B3LA 3CIJA 1SW5A 2B3FA 4FECA 2YLNA 3GLBA 3S9NC 2G93A 2V3TA 4IB2A 3K1MA 1NNTA 4YAHX 4OMBA 2ZNUA 3KG2A 3W9WA 4GFRA 4GQOA 2A5TA 5AA4A 3BFUA 4MH5A 1M5BA 3CFLA 1FQFA 3PMVA 4G68B 4ZS9A 1IZ1A 1N7WA 3IOWA 2BJJX 1Y3NA 4YMAA 3H03A 1Q35A 4YMBA 1PBQA 3L6GA 3MW0A 2GHBA 3IB0A 4P0GA 4IO6A 2HFBA 3TKDA 4NF8B 4KD5A 4Q0CA 1ZKBA 1A54A 1POY1 3V89B 1UIVA 1MDQA 4P0IA 4F22A 3DP8A 4BLAA 2HQ0A 3FV2A 1SW4A 4H8JA 3OENA 3IOVA 4FORA 1I6AA 2XHDA 5ICQA 4GD5A 3IK6B 5H8HA 2Y7KA 3IOUA 3LBSA 3TFLA 3T93B 4WXJA 4KYDA 3TTLA 2NVUB 1MRPA 3K4UA 3H6WA 4EDPA 3B6QA 5DVFA 4JWXA 1II5A 4IGTA 2B65A 2F5XA 1SYIA 1B1HA 3K0VA 1Y1MA 4F3PA 2OJTA 1LAHE 2CZLA 1MXYA 1HSJA 3Q28A 3P7IA 4F3SA 3H3GA 2I4BA 4ZZEA 4NMYA 3E9XA 3SEWA 3ZKKA 1PB8A 1GTKA 3USDA 3UIFA 2ONRA 1Y3QA 1FTJA 1HSLA 4N13A 3VVEA 4R6YA 1B4HA 4P11A 1D9YA 4KCDA 1R9LA 1ANFA 1QKBA 1US4A 2ZMBA 3OOAA 4G8HA 4ONYA 1XT8A 3N5LA 3LR1A 3B7DA 1MPDA 3K1PA 1VR5A 4RPOA 2I0CA 1SQYA 3SERA 3SEYA 1MQHA 2XXQA 3FJGA 1IXIA 3ODBA 4C1UA 2REJA 4QSEA 4FEBA 2QMWA 3CFXA 3K00A 4O3BA 4F2OA 2VGQA 5TPAA 4PFTA 2I3WA 4JDFA 4IO5A 3EHSA 1N7XA 4N6PA 1ATGA 3T9XB 1MQIA 3K01A 3A09A 2QS2A 2P0SA 3H6TA 2HCAA 3MAMA 1MXUA 4R73A 2HZLA 3OO8A 3QYTA 4IGRA 1ZTYA 2XXVA 4Q8RA 3HCQA 2XXHA 3RT8A 2PX1A 3N6TA 2V3UA 2VD2A 1A99A 1JETA 3KN7A 2R6GE 1N76A 2DP8A 5I84A 3M3FA 2AL5A 1DTZA 4NE4A 5FHMA 4NF5A 1MQDA 4GXAA 5AA4B 2QMXA 4X1BA 3OEKA 2GHAA 3IB1A 4C1TA 3SDFA 4LONB 3PUWE 4DCYA 1POTA 4IO7A 2IA4A 2H5YA 1SYHA 2ZYOA 4PP0A 1XVXA 3TYHA 3TODA 1ZIUA 2UYEA 4OVJA 1IQ7A 4YKJA 1QUKA 4FAJA 3FVNA 4Q5TA 1P99A 1USYE 5CRYA 1CB6A 1ELJA 1NNPA 3UORA 3PPNA 3O6IA 3DP4A 4G8NA 1NFTA 3T9UA 1Z7ME 5H8HB 4R6HA 1JW1A 5I57A 1URGA 4PE5B 1MQJA 2DSFA 3UK4A 1D9VA 4ISUA 2V25A 4OERA 4R9GA 4FATA 2UXAA 4GLIA 3S2VA 2H25A 3JZJA 5JTYA 3HHGA 1A55A 5EYFA 4F3GA 1TXFA 3PU5A 1WODA 4QRZA 3I3VA 2Z8FA 1S7YA 3MZBA 1B52A 3KJ7A 3QUJA 4U23A 2OWTA 3H4ZA 3FV1A 3G3GA 3MZ1A 4XTCQ 2GRVA 3FVGA 1EZ9A 2AIXA 1MPBA 3N94A 5AA2A 1OQGA 3G3KA 5H8QB 4NWDA 2XX9A 3Q25A 1IIWA 1LFGA 4ESWA 4YZZA 1UTHA 5ELVA 4DXCA 2O6AA 3O28A 1GV8A 3KSXA 3IL1B 3V5AA 4OENA 2Y7WA 4M4GA 1VE4A 3MZ9A 5B7DA 3MP1A 1OVBA 4ZEIA 3CG3A 4I62A 4KPTA 4QSCA 2V93A 1MH4A 3BBRA 3VV5A 3O9PA 1TFAA 3ILTB 4F29A 4UA8A 3MP8A 3B6TA 3K6XA 1NKXA 4NF4A 5TPAB 1FQCA 3K2DA 1M5DA 1SDXA 4NF6A 2I4CA 1MY0A 2DQVA 5CC2A 3KN8A 4DZ1A 2DXYA 4LZ7A 4DXUA 4WEPA 4ND9A 1M5FA 5FTHA 3C34A 2Q89A 2O7UA 3IO6A 3VVDA 3QK6A 3TCFA 4GWOA 1DPEA 2DE2A 2ZYMA 2D5WA 3FJMA 3RN8A 4DIGA 5ITPA 3VLVA 3OXNA 2VHAA 2R9JA 5DVIA 2E1SA 4X48A 3A3CA 1TT1A 1HSEA 3GBAA 4YB5A 3ONMA 5I56A 2DXRA 5K2YA 3CI8A 1LSTA 4R9FA 4QHQA 2I58A 4EXKA 2QSXA 4GL8A 4I9DA 2XXTA 3QXMA 1B3EA 3M3KA 4JXIA 3MVZA 5KCJA 3RTFB 3R7XA 3RTWB 3IO4A 1N04A 2OBGA 1A8FA 2AL4A 2F78A 2NUVA 2W7YA 4NEDA 4EQBA 3FXQA 1F9BA 5L8DA 5AA3A 2R71A 3B6WA 2XXXA 1PC3A 4K3FA 4RK2A 5CMCA 2F6PA 5KZTA 4ZEKA 3SKPA 2H9BA 2YJPA 5AE4A 2NOOA 1RYOA 5CMKA 1DPPA 4WKMA 5AA1A 3CR9A 2Z8DA 3WAFA 4YKIA 3MBPA 5DEXA 1DSNA 4GRKA 1O64A 1A7LA 3MVWA 1EU8A 1NL5A 1YAEA 2ZYNA 4JWOA 2UVJA 5I57B 2O1LA 4IO3A 2M8CA 2I6EA 5CM6A 1B9JA 3PD9A 5I59A 5JTYB 1SI1A 3LSLA 4UACA 3IR1A 4F1UA 1NH7A 4XXUA 4WEDA 2XXUA 1AOVA 1MM7A 2O51A 1Y9UA 2LAOA 2H98A 2HXWA 3T9VA 5A5XA 5I2NA 3U93A 3PUVE 4IO2A 4U4SA 1LCFA 1XHYA 3T9HB 3MVXA 5AA2B 3MPKA 4Z7EA 3IORA 3IJOB 3N26A 1SW2A 4HTGA 1T0KA 4OFLA 4ZDMA 3CSGA 2Y7RA 4H1XA 2HEUA 5KDTB 3ILUB 5TU0A 3ZKLA 1B58A 3FD3A 3MWBA 4LQ5A 3PV0E 2OLBA 4LVQA 1H43A 4H8IA 5ITOA 3W9VA 1DOTA 1MDP1 3IB2A 5TP9A 3FZVA 5L9MA 2HZKA 5H8NA 3RLFE 4IY5A 4YICA 1GR2A 4JBZA 2VP1A 3CRBA 5EHSA 2H4IA 2DS9A 4NF4B 4AQ4A 1MXWA 1B5IA 4H6DA 3A3UA 4NF6B 2FYIA 1S9TA 2P2AA 5FHNA 4ELOA 3CSBA 4POXA 1BTJA 5I2KB 2ZNSA 3EHUA 3SETA 2XX7A 4MLVA 2Z8EA 3TEPA 3M8UA 4ESXA 3G3IA 3TQWA 5JEIA 4OFJA 4H67A 4F1VA 3JV9A 1FQEA 3MP6A 3OELA 3T22A 3ZS6A 1ZLQA 3O66A 2RINA 1PB9A 1B2HA 4EF2A 4U22A 3E4RA 1MXXA 3PMXA 1LAXA 2DWAA 4PQJA 1Y4CA 1MY4A 5I56B 4IY6A 4HCWA 3H7MA 1N3WA 1M5EA 2NXOA 3FGSA 1WVJA 2THIA 5DYHA 1USYH 3S4UA 4N07A 1LAFE 3TAJA 4H5GA 2F8DA 4BDNA 1ZMGA 4KYSA 2X7PA 4LUBA 4RYAA 5JK4A 4ZE9A 3S9EA 3TTKA 3EF7A 2Y7IA 2YPNA 4TOZA 3KJTA 2F7AA 2ONKE 3RUMA 1B3GA 3VVFA 2A5TB 3CVGA 4QFLA 3BKIB 4H0WA 3RQTA 4ELQA 2I0BA 3V8XB 1MPCA 5LOMA 3K6WA 3IJXB 5DEXB 3TCGA 3G7WA 3O6GA 2QRYA 4BDOA 3OSRA 1BKAA 3FXRA 3PPOA 3TPAA 3LSWA 1M5CA 2Y84A 3H6UA 4MF3A 1XS5A 3HO7A 5I58A 5I59B 2G29A 2O84X 2PT1A 5L9SA 3C4MA 5HBCA 3G3JA 2HAUA 5IKBA 4R6KA 3HHFA 2WKYA 3H6VA 3KBRA 4KYEA 4LQ2A 5A5XB 5ICTA 4OQOA 3KOSA 4EUOA 2OK2A 3OEMA 4X9TA 1R9QA 3CG1A 3V83A 3TTMA 3MVYA 2AYSA 2XD3A 2PBWA 4MFIA 4XKNA 4HCYA 4Z0IA 2Y7PA 4PFWA 2O68A 3D4CA 1H76A 4FJPA 1WDNA 2PVUA 1RYXA 3AXFA 3RGYA 3LSXA 1H45A 3MC2A 5TP9B 4R2BA 3Q29A 1B4ZA 1Y20A 5AA2D 1ZJLA 1J1NA 3U72A 1YTVA 3FXUA 4ZECA 3K6VA 3S9LC 2ZXTA 3CFZA 1LAGE 3TTRA 4G77A 2O1MA 2RKMA 1QVSA 5HPQA 3UGWA 2NWJA 4FIMA 1GGGA 1LGBC 1KWHA 4C0RA 2FNCA 2Q8JA 4OWDA 4O3AA 1XC1A 1AMFA 1R1NA 1Q1KA 1MQGA 5DT6A 1ZU0A 4DDDA 3FVOA 1IEJA 1URDA 5CMBA 4BDRA 1D4NA 5L9OA 3C35A 3O6HA 4DLDA 2F36A 3MPLA 3VXCA 4H5FA 2E0SA 2X26A 2KLFA 2ZNTA 1A40A 2ALUA 3M3LA 3TELA 3U1OA 1LLSA 2Q88A 1TFDA 3VXBA 1EH3A 3OO7A 4LATA 3GBBA 2QS3A 2DVZA 3OSQA 4DCXA 4ZZAA 4KCCA 3OMBA 1PBPA 4HS7A 4FE8A 4R72A 4R74A 3MQ9A 3K6UA 4GIZA 3IX1A 4NF5B 3PPQA 3HN0A 4OETA 4RK9A 3SEVA 1NNKA 5K2XA 4QFOA 4AB6A 5H8FA 3FIRA 4XIGQ 4OTEA 1JEUA 4MBPA 4GVOA 4ELRA 1B0HA 1QKAA 4JSOA 1O7TA 1P1NA 4ZEFA 5CI5A 4G4PA 3H06B 3VE1B 3E3KA 3E13X 4ECFA 3FUZA 4NWCA 4F1YA 3QIMA 1FW0A 2ONSA 1LCTA 4OEUA 1OQHA 3KN3A 2F34A 1P1QA 1LFIA 4OZ9A 3W15C 1B7ZA 4MLQA 5I58B 1D3KA 3O2AA 1EZOA 3C33A 3GZGA 2A5SA 2OZZA 4G68C 3QUFA 3OO6A 3R26A 4YKKA 2DE3A 4E0WA 5BWJA 1URSA 4F18A 4X1DA 1LB8A 1FQBA 3HSTA 3DLNA 1VFEA 2CMOA 3K02A 3L6HA 1BP5A 2QPQA 1PDAA 3T66A 3DM0A 2QS4A 4EXLA 1B0LA 1R6ZA 1MY2A 2UYFA 3KEIA 4LZ8A 3VFJA 3LC8A 3EQ1A 2XX8A 3DP6A 4XKRA 3PPPA 4U1ZA 1MH3A 5FTIA 2DE4A 1I69A 2Q2CA 3PUYE 4GF8A 4F19A 3LUYA 4QFNA 1UTHB 2PMSA 2Q2AA 2QJEA 3IOTA 3EN3A 1FTOA 1MY1A 3KFMA 3G3FA 1B1XA 3PPRA 4RXLA 3Q27A 4U4XA 1B5JA 2H99A 1MM6A 4YB7A 5M2VA 3JYRA 3WAEA 5CBSA 3HV1A 3I6VA 4F2QA 3BFTA 4TLMB 2XD2A 1QJMA 3PMWA 5BUUA 1N84A 3I5OA 2RC8A 1ZBMA 1MXVA 4BDQA 5H8QA 1CE2A 1Z7NE 4RJZA 3TQLA 1LBBA 1UTBA 1AH5A 1B32A 2RC7A 4I8CA 5DTBA 4R75A 3SEUA 4G8MA 1OIBA 3RNNA 2XXPA 2DYXA 4DE8A 1I6BA 1N3XA 2OCUA 4OFOA 4ELPA 1B46A 1YCJA 2I49A 4OXVA 3QAXA 2GH9A 5B70A 1JQFA 2GFEA 1MXZA 4LA9A 1PB7A 1Y1ZA 3OD7A 1MG1A 2UVHA 3HPIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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