1XT8A

Crystal structure of cysteine-binding protein from campylobacter jejuni at 2.0 a resolution
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
248
structure length
248
Chain Sequence
LNSLDKIKQNGVVRIGVFGDKPPFGYVDEKGNNQGYDIALAKRIAKELFGDENKVQFVLVEAANRVEFLKSNKVDIILANFTQTPQRAEQVDFCSPYMKVALGVAVPKDSNITSVEDLKDKTLLLNKGTTADAYFTQNYPNIKTLKYDQNTETFAALMDKRGDALSHDNTLLFAWVKDHPDFKMGIKELGNKDVIAPAVKKGDKELKEFIDNLIIKLGQEQFFHKAYDETLKAHFGDDVKADDVVIEG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords putative amino-acid transporter periplasmic solute-binding p
publication title An ATP-binding cassette-type cysteine transporter in Campylobacter jejuni inferred from the structure of an extracytoplasmic solute receptor protein.
pubmed doi rcsb
source organism Campylobacter jejuni
molecule tags Transport protein
total genus 74
structure length 248
sequence length 248
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1xt8A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1xt8A02
3K6UA 4PQJA 2XD2A 2XXTA 1PB7A 5AA2A 3DM0A 2H9BA 2XXQA 1OMPA 2Q9TA 2QMXA 3O6GA 3MPKA 1HSJA 3TTRA 4QHQA 4DXUA 4G8NA 4C1TA 2RCBA 1A8EA 1DOTA 4ELOA 1Y4CA 4ZEDA 3SETA 3GXAA 1B7UA 1SQYA 3IOUA 1D4NA 4EQBA 5A5XA 1O63A 4P11A 2HZKA 4JWXA 1MXVA 3T9UA 2F7CA 4F3GA 4AB5A 3B6TA 3TUSA 3RLFE 2XXRA 1SYHA 3PUVE 1B3EA 5FHMA 3PMXA 1FTOA 2QRYA 2W7YA 1UIUA 1SD3A 1PBQA 3RGYA 4R72A 4N13A 4EDPA 1JQFA 4R9FA 2NWJA 5EYFA 3TCHA 4NF5A 3RTFB 1S9TA 3TTNA 3H6WA 1B32A 5EHMA 4P0IA 4OHNA 1P99A 5I58A 5H8QA 1EH3A 1VFDA 2G93A 2XXHA 3ILUB 4ECFA 2PYYA 4OYVA 3H4ZA 5AA4A 3PV0E 4U4XA 5CI5A 4DDDA 4KR5A 3PD9A 2ZNTA 2X7PA 3MC2A 5ICQA 1B5JA 4U22A 3RT8A 4KYDA 3TCGA 3C33A 1B1HA 1POTA 2I0BA 1WVJA 4JDFA 1II5A 3CI8A 3ILTB 1IXHA 3FASA 3ZS6A 1USYE 4C1UA 4YAHX 3QXMA 3DLNA 3OEKA 1EZ9A 2OZZA 2VHAA 1SBPA 3EHSA 3KG2A 4U4SA 1QW0A 1H43A 3OXNA 3U1OA 4IO6A 3FVGA 1POY1 4K3FA 4POWA 4EXKA 3QAXA 3FXUA 2I6EA 2OK2A 2PVUA 5DEXA 2VD3A 4ZZAA 3ODBA 2V25A 3CVGA 2UVGA 4LQ5A 1B40A 1P1NA 4JXIA 2F6PA 1FQCA 4KHZE 2M8CA 1BKAA 5K2YA 4H8IA 1MQGA 1B3LA 4Q0CA 2D21A 4Q5TA 1YPNA 1LFIA 3N6TA 1YTVA 1GGGA 3BFTA 4ESWA 4ELPA 2X26A 5ISUA 4KCCA 3G7WA 3VE1B 3MPLA 2GRVA 4I1DA 2XXIA 1SW2A 3GZGA 1LFGA 1MRPA 4LZ7A 3RTWB 1BP5A 4QSEA 5FTHA 1NFTA 5H8NA 1DSNA 1I6QA 3H6VA 1OQGA 3GBAA 2QS1A 3N26A 4YB7A 3TODA 3IAZA 3H06B 1MXWA 1QKAA 2HCAA 1XT8A 1P1OA 4Z7EA 1Y20A 4EQ9A 4F3PA 3PD8A 5I57A 1KWHA 4IGTA 2ABHA 3KEIA 4NF8B 4ZE8A 3U94A 1O7TA 1L5TA 1SI0A 4ISUA 4NF5B 3PUYE 3OELA 2XHDA 4LQ2A 5H8QB 4G77A 3CFXA 3T22A 1ZIUA 2I4BA 1RKMA 3JZJA 5H8FB 2I58A 3CSBA 4OFJA 4OERA 3T9HB 2PBWA 4JSDA 4WEDA 3M8UA 3C9HA 4TLMB 3O97A 3FUZA 5AA4B 3TYHA 2QS2A 2R71A 5H8HA 2PT1A 3IOVA 3EHTA 3RNNA 3S9LC 3W9VA 3WAEA 4Q8RA 1ZLQA 2P0SA 2O6AA 2DWJA 3K01A 5LOMA 4GD5A 2ZMBA 4LA9A 1T0KA 4PFYA 1XC1A 4F1YA 5CMKA 1Z7ME 1MPDA 4R2BA 2H98A 1MXYA 3H3GA 1IQ7A 3PMWA 5DYHA 4HCYA 2V3TA 3JV9A 3S9MC 3LUYA 3C36A 1ZJLA 3TELA 3OO7A 2F35A 3O6IA 3SDFA 3MP6A 1N0TA 1S50A 4OETA 4QFLA 3IB2A 1Y3PA 4NWDA 4EQ7A 3T9VA 2ZXTA 1MQJA 2V84A 5L9SA 3HCQA 1N84A 1P1QA 2ZYOA 4F18A 2ZNUA 2G29A 3W9WA 3Q25A 1GVCA 5F1QA 3MZ1A 2NXOA 1B46A 3FZVA 3ONMA 1BIYA 2PT2A 5HPQA 3TTKA 4F39A 4UA8A 1LAFE 4RA1A 3TTMA 3U93A 2QMWA 1SYIA 3QUFA 4U23A 4NF6A 3L6GA 3TEPA 4AQ4A 1M5CA 3RUMA 4M4GA 4YKIA 5I2NB 1NNFA 5H8NB 3MP8A 3QIMA 1VE4A 3KN8A 2O69A 2DWIA 3HHGA 3G3HA 4TLLB 5I56B 2B65A 1D3KA 4GRKA 2AIXA 4MH5A 3C34A 4ZEKA 3LSWA 2P2AA 3PPPA 2QS4A 3SEWA 3VVDA 4ZDMA 5I57B 2XX8A 1MXXA 2VP1A 2WKYA 4DZ1A 2LAOA 3CIJA 1B51A 3CRBA 2F8DA 3BFUA 2DS9A 1US4A 2F7AA 5CBRA 1ZTYA 1PBPA 2XXUA 4MFIA 2FYIA 4PE5B 3KSJA 3V8XB 3I5OA 3FD3A 5IAIA 1MPCA 3PPOA 2DWAA 1LAGE 1NNTA 2X7QA 2UVHA 2AL5A 2XX7A 4YB6A 4GXSB 1Y1ZA 2VGQA 4ZEBA 3TAJA 5H8HB 4FATA 5ICTA 1D9YA 3UP9A 2Q2AA 2F6GA 4FJPA 3MP1A 1NNKA 1LFHA 1TT1A 4MBPA 2QSXA 4H8JA 3UORA 4JWYA 3VLUA 1ANFA 3G3JA 3I6VA 3BKIB 3IL1B 2KLFA 4XTCQ 2XX9A 3MVYA 4DLDA 3CSGA 3KOTA 4NTLA 4ZS9A 3KBRA 5ITOA 4IY5A 4G8MA 3MUQA 5JEIA 4LZ5A 3G3KA 3G3GA 1ATGA 3MAMA 4WEPA 2OCUA 3SKPA 3KSXA 2ANJA 3QK6A 3IOTA 2Q8JA 5CMBA 3RPWA 3ZKKA 3FATA 2O1MA 3MQ9A 2D5WA 4JSOA 1B3GA 1CB6A 4NF8A 4XKRA 2HEUA 2OWTA 3K4UA 2XXVA 4H0WA 3TQWA 1Y3NA 2HFBA 1JW1A 3HPIA 3T9XB 4ZEIA 3K1NA 5CBSA 4F22A 4WKMA 5DTBA 2XXXA 1SW4A 3L6HA 1SDXA 1MXUA 1IITA 4XKPA 3OO8A 4NF6B 4OVJA 4X1DA 2D3IA 5H8FA 1B58A 4G68C 4F19A 2RC8A 3O28A 4YKJA 1B5HA 2DWHA 2NUVA 5JTYB 3B6QA 5BWJA 2REJA 1B7HA 3R26A 1JETA 4PFWA 1A40A 2FNCA 4OZ9A 4YKPA 2O1LA 2VD2A 4LVQA 4DCXA 1US5A 2QPQA 4ZZEA 1YCJA 4YB5A 3LBSA 3N94A 3E4RA 1FTMA 1J1NA 5K2XA 5FTIA 3HO7A 3U8QA 2DE2A 4UACA 3I3VA 4RNSA 4XKNA 4GWOA 3SESA 3GBBA 3TPAA 1MDQA 2ZYMA 4O3BA 1ZKBA 3O6HA 4F1VA 3WAFA 3THIA 4FEBA 1O64A 2XD3A 1MH4A 5DVJA 3G3IA 5CRYA 1PDAA 3S4UA 1VSOA 3VDFA 4QFKA 3HHFA 1Z7NE 3TCFA 2PX1A 1MDP1 3PPRA 1Q35A 3PUWE 1QULA 1B52A 2QL3A 1OQHA 3AXFA 4OENA 4NF4A 4QRZA 1M5EA 1B7ZA 4R73A 2DE4A 4OEVA 5I2NA 1DTZA 1MS7A 3M3KA 3Q26A 3U72A 5I56A 3IR1A 2RINA 4C0RA 5KDTA 1XVYA 2UYEA 3CFLA 4U1OA 2Y7WA 1MY1A 4U21A 3IOWA 1MY2A 1URGA 2IA4A 3DP4A 3KN3A 3PU5A 4R9GA 1IXGA 3P7IA 4LP2B 5J1DA 3SEYA 1FTLA 1XHYA 3OO9A 4FE8A 1LLSA 4OFLA 2I48A 4PP0A 4ONYA 5F7VA 4OESA 1SVXB 4BDNA 4G2ZA 4BDLA 3K1PA 4LONB 1FTKA 1IXCA 1MPBA 2GHBA 3N6UA 3UN6A 4GL8A 4X9TA 4RK2A 3FVOA 2F34A 2Z23A 3PUZE 2NVUB 1H44A 4O3CA 5BUUA 2HAVA 4ESXA 4F2QA 2H25A 4EXLA 1IUDA 5DVFA 3VLVA 2DXRA 1F9BA 3A3UA 1M5BA 4F31B 1JEVA 5CC2A 5TP9A 4OXVA 2VOZA 5TPAA 3FVKA 5ITPA 4OTEA 1QKBA 4MLVA 4NE4A 2GHAA 1PC3A 4GQOA 2F97A 2F78A 3K00A 5H8SA 1MH3A 2PMSA 3SEUA 1B6HA 2YJPA 3MWBA 1CE2A 3V89B 2Y7KA 3S2VA 4F3SA 1SI1A 4BDRA 4Z0IA 1FQFA 3C4MA 4IO5A 4Q30B 1JNFA 1B05A 3HN0A 2ONSA 3K0VA 3LSFB 4I62A 2V3QA 5DVIA 2H99A 1OLCA 4RXLA 3DP8A 1Y4TA 1N76A 2V3UA 1I6BA 3KFMA 4RJZA 2CMOA 3VXCA 3RT6B 5L9OA 3MVZA 4H67A 3OSRA 4RY1A 3D4GA 2E1SA 1H45A 4GXAA 1OLAA 5L8DA 4NWCA 4M1VA 4P0GA 4NF4B 3F11A 5FHOA 3EN3A 4LZ8A 1FQBA 3ZSFA 5I2KB 3O66A 1ELJA 3SEXA 3VXBA 2Z22A 4U2RA 4H5FA 5JTYA 1R1NA 4R6KA 1MY3A 3Q28A 1IEJA 2Y7IA 1P1UA 4O3AA 4G68B 5KDTB 4L17A 1MQDA 3JYRA 2BJJX 4LATA 1R9LA 1B0HA 3RN8A 4E0XA 4QFNA 1XVXA 4GVOA 4H65A 2DVZA 3CFZA 5HM4B 4OMBA 5I59A 1A8FA 2DQVA 5FHNA 1XOCA 4OFOA 2Z8FA 2DXYA 1GV8A 1QUJA 3UK4A 3H03A 3SEVA 1AL3A 1D9VA 2HAUA 1LAXA 1UQWA 1FTJA 4FIMA 3MZBA 1Y1MA 1YAEA 1LGBC 3A3CA 1URDA 4F1UA 3T93B 4AB6A 2Y84A 1MY0A 3IJOB 1LBBA 3H7MA 4EF1A 5TP9B 5B70A 1AMFA 1OVTA 3C32A 4R2FA 5JK4A 5TPAB 1H76A 1VFEA 4IB2A 1OVBA 3IX1A 3S9NC 4QFOA 3CR9A 2I3VA 4QF9A 2HXWA 2O7UA 1WODA 1QVSA 3VFJA 1JEUA 4GOTA 1UTHA 1FQDA 3V5AA 3VVFA 2REGA 1NNPA 1UTBB 1HSEA 3TZAA 5KCJA 3PUXE 3OENA 2O68A 3MBPA 1H3DA 4EF2A 3H6UA 3IORA 1N3XA 1DPPA 2R6GE 3MZ9A 1ZBMA 2R9JA 4RPNA 1NH7A 5M2VA 2Q89A 3MVXA 1SW1A 4DE8A 1B0LA 4KPTA 1LCTA 1N7WA 4R75A 4DCYA 4YICA 4GIZA 3S9EA 3M3FA 4PETA 1Y3QA 2I4CA 2ZNSA 2IEEA 3IO4A 2YLNA 3KGCA 1URSA 4THIA 1BLFA 4OEUA 4JWOA 4IO3A 1M5DA 1ZU0A 5CMCA 4G4PA 3TFLA 2XXPA 3U92A 3TQLA 1PB9A 1N3WA 3R7XA 4F29A 1JW4A 3KN7A 5TU0A 4POXA 2Q2CA 5CM6A 4F2OA 3E13X 2A5TA 4ZE9A 1PEBA 4PFUA 1AOVA 4LUBA 3O9PA 2I0CA 3K02A 4IO7A 5EHSA 2RC9A 3FJGA 1QJMA 2FA7A 2ZYNA 3KOSA 2AL4A 2THIA 1JVYA 5I59B 4GL0A 2ONRA 3PPQA 3KJ7A 1MXZA 1IXIA 3GLBA 5B7DA 1TFAA 3EHUA 3Q29A 3OO6A 3IJXB 3QYTA 2F7BA 3VVEA 3UGWA 1TFDA 2ALUA 1N04A 2O51A 1RYXA 4HCWA 4HW8A 2CZLA 4KYSA 1LBCA 5CMMA 1LB8A 1LAHE 3FIRA 5HBCA 2XXYA 4YU0A 1SW5A 1VR5A 4I8CA 2OJTA 3CG3A 2OWSA 4NMYA 2F36A 4GLIA 3TTLA 1R9QA 2Q88A 2O7IA 3QSLA 2Z8DA 1EU8A 4F3BA 2HZLA 3IO6A 4IO4A 4RPOA 4FORA 1MQHA 1LSTA 4BDMA 3EQ1A 2I49A 4DXCA 3QUJA 1B4HA 5DT6A 3IB1A 1UTHB 5AE4A 1QUIA 5I2KA 2GFEA 1Q1KA 3R6UA 4ZEFA 3PMVA 5AA1A 5KCJB 1M5FA 2P1SA 5AA2B 3EPEA 1MQIA 1B3FA 4I9DA 4H1XA 3FGSA 4YMAA 3T66A 4ELQA 2GH9A 1AH5A 4G68A 4GF8A 4JBZA 1A55A 1B9JA 3K2DA 4G8HA 4KFQA 4ZECA 3K1MA 2E0SA 1LCFA 2UXAA 5KZTA 1MG1A 2RC7A 4NEDA 1EZOA 3SERA 4KI0E 4YZZA 4H6DA 1GTKA 2ZYKA 4ELRA 3FXRA 1MY4A 1Y9UA 1JVXA 5A5XB 3OOAA 1JW5A 4FAJA 4TOZA 2NOOA 1QUKA 4XXUA 4HS7A 3O2AA 4H5GA 4WXJA 3BBRA 3VV5A 2UYFA 4HTGA 1NL5A 2DOJA 4PFTA 5IKBA 4BDOA 4FEDA 5I58B 3UA8A 1I6AA 4MF3A 4YMBA 1R6ZA 4EUOA 3B6WA 2Y7PA 2DE3A 3M3LA 1NKXA 2A5TB 4MLQA 1B1XA 4KCDA 2UVJA 3LSLA 4R6HA 3DELB 3UIFA 2V93A 1ZMGA 1OIBA 1FQAA 1TXFA 1NH8A 2AYSA 3H6TA 1HSLA 3ECRA 3EF7A 1B2HA 3FVNA 4JB7A 4N07A 2DYXA 3LR1A 3A09A 1UTBA 3OD7A 4KD5A 1A7LA 4N6PA 1PB8A 2DSFA 3TKDA 4OWDA 2HQ0A 1TWYA 1BTJA 1WDNA 1DPEA 3C31A 3K6WA 1N7XA 5DEXB 1S7YA 1I69A 4IO2A 4IGRA 3N5LA 1MM6A 3FV1A 3CG1A 1NMUA 2H4IA 5AA2D 3FV2A 3OMBA 3PPNA 3LSXA 3HV1A 3O29A 5L9MA 3FJMA 3IB0A 3V83A 1A99A 4GFRA 3D4CA 3LC8A 4KYEA 3KJTA 3Q27A 1FCKA 3B7DA 3USDA 3VLWA 3MJNA 1IZ1A 2QS3A 2Z8EA 2OLBA 4RYAA 3K6XA 3PGFA 1GR2A 3IK6B 2F5XA 4U1ZA 1LB9A 5I84A 1MM7A 3K6VA 3RY3A 3C35A 1DTGA 3TDJA 4YKKA 3HSTA 1IIWA 4QSCA 2XXWA 2DVCA 1FQEA 2H5YA 5AA3A 4X48A 1RYOA 2RF1A 4RK9A 1UIVA 2Y7RA 3T96B 2O84X 1USYH 1XS5A 2DP8A 4IY6A 3TMGA 1AIVA 2QJEA 4FECA 3FXQA 3E9XA 2RKMA 1B3HA 2UVIA 1FW0A 1B5IA 4QSDA 4X1BA 5ELVA 2OBGA 3MVWA 2ESNA 3DP6A 1P1WA 1EZPA 4BLAA 4E0WA 3MW0A 4DIGA 3W15C 3FJ7A 4XKQA 2A5SA 4XIGQ 3RQTA 1A54A 4QFPA 2B3BA 4KQPA 3ZKLA 4BDQA 3KZGA 4ND9A 4TQUQ 2RCAA 3OEMA 4DXBA 2B3FA 3OSQA 4R6YA 4R74A 2ONKE 1DMBA 2I3WA 4OQOA 2YPNA 3G3FA 1B4ZA 3E3KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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