1DTZA

Structure of camel apo-lactoferrin demonstrates its dual role in sequestering and transporting ferric ions simultaneously:crystal structure of camel apo-lactoferrin at 2.6a resolution.
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
689
structure length
689
Chain Sequence
ASKKSVRWCTTSPAESKKCAQWQRRMKKVRGPSVTCVKKTSRFECIQAISTEKADAVTLDGGLVYDAGLDPYKLRPIAAEVYGTENQPQTHYYAVAIAKKGTNFQLNQLQGLKSCHTGLGRSAGWNIPMGLLRPFLDWTGPPEPLQKAVAKFFSASCVPCVDGKEYPNLCQLCAGTGENKCACSSQEPYFGYSGAFKCLQDGAGDVAFVKDSTVFESLPAKADRDQYELLCPNNTRKPVDAFQECHLARVPSHAVVARSVNGKEDLIWKLLVKAQEKFGRGKPSAFQLFGSPAGQKDLLFKDSALGLLRIPKKIDSGLYLGSNYITAIRGLRETAAEVELRRAQVVWCAVGSDEQLKCQEWSRQSNQSVVCATASTTEDCIALVLKGEADALSLDGGYIYIAGKCGLVPVLAESQQSPESSGLDCVHRPVKGYLAVAVVRKANDKITWNSLRGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGPLFKDTDSCRFDEFFSQSCAPGSDPRSKLCALCAGNEEGQLKCVPNSSERLYGYTGAFRCLAENVGDVAFVKDVTVLDNTDGKGTEQWAKDLKLGDFELLCLNGTRKPVTEAESCHLPVAPNHAVVSRIDKVAHLRQVLLRQQAHFGRNGEDCPGKFCLFQSKTKNLLFNDNTECLAKLQGKTTYDEYLGPQYVTAIAKLRRCSTSPLLEACAFLMR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Camel lactoferrin, a transferrin-cum-lactoferrin: crystal structure of camel apolactoferrin at 2.6 A resolution and structural basis of its dual role.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal transport
molecule keywords APO LACTOFERRIN
total genus 191
structure length 689
sequence length 689
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1dtzA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1dtzA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1dtzA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1dtzA03
5L9SA 5TPAB 3RN8A 1Z7ME 3TYHA 4RA1A 3O2AA 4H8IA 3ECRA 2XXTA 2REGA 3RT8A 3Q29A 2UVHA 1P1OA 1XS5A 3F11A 1H76A 3G3JA 3IL1B 1TT1A 3CG3A 1M5BA 3VXBA 3HHFA 3KFMA 1JEVA 3LSLA 4FE8A 4ONYA 2XD2A 1HSJA 2ZMBA 2XXVA 3RGYA 3KEIA 2H25A 2E1SA 1QW0A 4EQ7A 1JW4A 5BUUA 5I59B 4YKPA 1MXXA 1VFEA 4FORA 2O1LA 2F7AA 4LP2B 2B65A 3EHUA 1NNPA 3H7MA 3G3GA 3UIFA 3PMWA 1POY1 4GF8A 2PVUA 1B0HA 2YJPA 3G3IA 5CRYA 2HAUA 1WDNA 5F1QA 2CZLA 1RYOA 1UTHA 4QRZA 1LBBA 4R2FA 4PFWA 1I6QA 5BWJA 1A54A 2ZYKA 2H4IA 3IB1A 3MP8A 3OENA 3KJTA 1O63A 4DZ1A 1JVYA 3FVKA 3FASA 5H8FA 4QSCA 4KHZE 4JBZA 1URDA 3IB0A 2UVJA 1XT8A 3SERA 4XXUA 4IB2A 2ZYOA 2V25A 3TMGA 4BDOA 5CBRA 3MVYA 4F1UA 1SW2A 5DVIA 5ITPA 2I48A 2UVIA 4GLIA 4MFIA 2E0SA 1P1QA 3ILUB 2GHAA 5FTHA 2XXRA 4K3FA 5CBSA 1USYE 1BLFA 2I6EA 3PD8A 4PFYA 3MVXA 3EQ1A 3P7IA 4I1DA 5IAIA 2XXXA 2XXQA 3U1OA 3PMXA 4ELOA 3CFLA 4ZZAA 4ZEIA 1PB8A 3K4UA 2QS3A 3IORA 4LA9A 4FIMA 3SEWA 1NH8A 1BIYA 4OFJA 3M8UA 4BDMA 4XKQA 3UK4A 4LZ8A 1Q35A 3IO6A 5A5XB 3KN7A 4IO2A 3IK6B 3K02A 2Q89A 4KCDA 5TP9B 4KPTA 1NH7A 2GFEA 3H4ZA 4MLQA 2X7PA 1SVXB 4E0WA 4G8MA 4OFOA 1OLAA 4MBPA 1B4HA 3H6TA 2KLFA 3SETA 4R74A 4OMBA 3MPLA 2O7UA 4R2BA 4IO6A 4QFNA 1N3XA 3MQ9A 3IO4A 1N84A 3K01A 3MJNA 3M3KA 1FCKA 2O7IA 3PPPA 4L17A 2B3BA 1PEBA 2Z8FA 4OHNA 4RK9A 1DPEA 1A8FA 1H43A 5IKBA 4NF4A 2HAVA 5H8NB 2O84X 4OENA 4DCXA 3HCQA 4FATA 3I3VA 3OD7A 1Z7NE 4P0IA 2ESNA 2Z8EA 3V83A 5LOMA 3SEXA 5JTYA 4G8NA 2XXHA 4OESA 2QS2A 3OO9A 2HZLA 1QVSA 4BLAA 1LAXA 1J1NA 3G7WA 1MM6A 2V93A 3DLNA 1JW5A 2X7QA 3GZGA 5JK4A 2A5SA 1P1NA 1WODA 1S9TA 2F5XA 2THIA 3GXAA 3B6QA 4PFTA 1QUIA 1SDXA 3OELA 1Y9UA 1ANFA 3N6UA 1UTBB 4YB6A 4EDPA 4Z7EA 1M5FA 2DP8A 5I84A 2IEEA 3C34A 3CSGA 2HEUA 1FQCA 3DM0A 3CSBA 3E13X 3MZBA 1R9QA 1II5A 2PBWA 4O3BA 5DYHA 3B7DA 4WEDA 1SW1A 1NFTA 2VOZA 3FD3A 2I4CA 2O69A 1GTKA 2RC8A 3MAMA 2Z8DA 3SKPA 4OXVA 2DWJA 3FV2A 2GHBA 4OYVA 3PMVA 2OBGA 4BDQA 4Q8RA 3MZ9A 3LSWA 3S4UA 4WKMA 5I58A 1LB9A 1HSEA 2DXYA 1LAFE 2PX1A 1Q1KA 5ICTA 2HXWA 4QSEA 5L8DA 4NWCA 1LCFA 2VP1A 2A5TA 5FTIA 1EZOA 5CMKA 3IOWA 3UGWA 3TTLA 1UIUA 3TEPA 4KR5A 1XOCA 4F39A 1SW5A 1IZ1A 3SDFA 1SI1A 4X48A 5AA4B 3C33A 1P1UA 5I57A 1LFHA 1B51A 2I0CA 5ELVA 4F1VA 3FXRA 3N94A 4ZEDA 3O9PA 2R6GE 5B7DA 3O6HA 2FA7A 5KZTA 1PDAA 2V3UA 1Y20A 2F35A 5I2KA 2AYSA 5H8HB 4YAHX 1HSLA 3TAJA 1I6BA 4U2RA 3THIA 3FV1A 1LAHE 4JDFA 3ONMA 4YICA 1FQBA 4QFOA 4OZ9A 1D9YA 1YAEA 4X1DA 1I69A 2RF1A 4MLVA 1N3WA 4UACA 3K00A 1MXUA 4YMAA 1NNFA 1BP5A 3KBRA 2UYEA 4BDLA 4P11A 1DSNA 4NF5B 2R9JA 3MP1A 3H6VA 4PQJA 1IXHA 2HFBA 3TZAA 4AB6A 2CMOA 4XTCQ 2F6GA 2YPNA 5TPAA 4ISUA 3WAFA 5K2YA 4TQUQ 4YKJA 4IO3A 2F7CA 4P0GA 5DEXB 5AA2B 3K1NA 5AE4A 1MQJA 2REJA 3K1MA 1XC1A 4N07A 3FZVA 4Q5TA 4TLMB 4GXAA 2XXIA 3U8QA 4JXIA 2ALUA 2QSXA 3IAZA 2PMSA 2D3IA 2R71A 3K0VA 5DT6A 4KI0E 2FNCA 4DLDA 3W15C 5EHMA 3W9WA 3IJOB 3VVFA 1MY4A 2DXRA 5EHSA 3T9UA 1IXGA 1FTJA 2QJEA 3T66A 1M5DA 1Y3QA 3D4CA 1MXVA 1OLCA 4XKNA 4YZZA 3DP8A 1B9JA 4YMBA 1I6AA 4Q30B 3D4GA 1AOVA 1MPDA 2YLNA 4ND9A 5AA2D 4H65A 1MH4A 4R73A 1B1HA 2RC9A 1KWHA 1MM7A 4IGTA 1ELJA 5HBCA 2RKMA 4I9DA 3LUYA 1PC3A 4N13A 5FHMA 1L5TA 2Y7PA 3R26A 5B70A 1RKMA 4G68A 4IY6A 3VVEA 4POWA 3ILTB 4MH5A 3VFJA 3U94A 1MPCA 2ZYNA 5TU0A 2XX9A 4F3BA 3T9VA 4U4XA 1D9VA 3LSFB 1NNTA 2QL3A 3QIMA 4FEBA 3S2VA 1ZMGA 2ABHA 4ELPA 1B7ZA 4HS7A 3TKDA 2XHDA 2F34A 3OMBA 4R9GA 4U22A 5H8SA 4QFPA 3V89B 4PE5B 1VFDA 3FVNA 1SYHA 4KFQA 4U4SA 1A55A 1H3DA 3K6XA 4C0RA 2XX7A 4JWXA 3EHSA 3EPEA 4NWDA 4YU0A 3VDFA 2DE3A 3DP6A 3KN8A 1M5EA 4F2OA 1A40A 3VLVA 1YCJA 3A09A 3SESA 4JWOA 2OK2A 3Q27A 3FGSA 1YPNA 3TTRA 5CMMA 2NXOA 1FQFA 3IB2A 4LZ7A 3K6WA 1B3HA 1B3FA 1OIBA 5AA3A 3LSXA 5TP9A 1MY2A 3O29A 1FQDA 3EF7A 4IO4A 1GGGA 2XXUA 1CB6A 4LQ5A 4F3PA 3UORA 3H6WA 4C1UA 3G3FA 4ZECA 1N0TA 4ZEBA 2Q8JA 1OQGA 2QPQA 2F97A 3MBPA 2DVZA 1IIWA 3FATA 2ONKE 4XIGQ 3MP6A 2I0BA 3QAXA 4KQPA 4G2ZA 4GVOA 1IEJA 5H8NA 2Y7WA 3GLBA 2QS1A 4GRKA 3FXUA 3K6VA 1B40A 4F2QA 3VE1B 2VHAA 5AA1A 4ECFA 3QK6A 1JEUA 3H3GA 4QFLA 2QRYA 3FJMA 4G4PA 3QYTA 3C36A 3C32A 3RTWB 3KGCA 2ZXTA 1B6HA 3ZKKA 2V3TA 3FXQA 1PBQA 4O3CA 1D4NA 3UP9A 2DVCA 2H99A 1TXFA 3TPAA 2ONSA 1ZTYA 5KDTB 3OXNA 4EF1A 4WXJA 4FEDA 4RYAA 1LLSA 2RINA 2QMXA 3O28A 4H8JA 4LONB 1ZIUA 4PETA 3MVZA 2GRVA 1Y4TA 3KN3A 4EQ9A 1ATGA 1UTBA 3OSQA 3IOUA 3ODBA 4EQBA 3I5OA 2PT1A 4NE4A 1JW1A 2XXYA 4R75A 3T9XB 3OEMA 4GXSB 3UN6A 3PUWE 4TLLB 3S9NC 4H1XA 4NMYA 5ICQA 3TUSA 3A3UA 1CE2A 1O7TA 1MY0A 2I49A 1UIVA 1B0LA 1MQIA 1LBCA 1FQEA 3OSRA 1OMPA 3OEKA 1EU8A 5L9OA 2XXWA 4OERA 4ELQA 4DXUA 4NF6B 2F78A 4F19A 5I2NB 1B3GA 3C4MA 4H6DA 4NF8B 4IO7A 1DTZA 1Y4CA 4LUBA 1Y1ZA 3KOTA 1FW0A 4GL0A 4R6HA 2I3WA 4G68C 3V8XB 3N6TA 1WVJA 3HSTA 4F31B 1TWYA 3VLUA 4KCCA 3T93B 3TODA 4RJZA 3GBAA 1IQ7A 1IXIA 5I56A 1O64A 3C35A 1A8EA 2AIXA 2OCUA 4KYDA 1AIVA 1FTOA 4EF2A 4X9TA 2DQVA 3S9LC 4R6KA 4PP0A 4BDRA 2QMWA 4GOTA 1B1XA 2G93A 4ZDMA 1PBPA 2OZZA 3ZSFA 1SI0A 2WKYA 4F1YA 3TFLA 1N04A 3VV5A 4ZZEA 3MC2A 2UXAA 4GWOA 3RUMA 3RNNA 4U23A 4DCYA 5H8HA 4OFLA 3OO7A 4DE8A 4F3SA 4ZE9A 3CIJA 5KCJA 3BBRA 1LAGE 1ZJLA 1DTGA 1B3EA 3WAEA 3PPRA 1IUDA 3HN0A 1MDP1 3TTNA 1XVXA 2P0SA 2VD3A 3G3HA 3A3CA 2PYYA 2XD3A 3CR9A 1TFAA 3USDA 5H8QA 2IA4A 4Z0IA 3V5AA 2G29A 4NF5A 4G77A 1MXWA 2Y7RA 2I3VA 4F3GA 1NKXA 3AXFA 1MQHA 3L6HA 1QJMA 5CI5A 3MW0A 2DOJA 1BKAA 1VR5A 2O51A 2PT2A 3O6GA 3IOVA 4M1VA 5DEXA 3VLWA 3T22A 1MPBA 1OVTA 2DE2A 1B5IA 3QUFA 4ZS9A 2D5WA 3QXMA 3EHTA 1GVCA 1Y3NA 3CG1A 4KD5A 3R6UA 1R1NA 2DYXA 4F29A 1A99A 1T0KA 4OTEA 1JETA 1JVXA 1S50A 3SEUA 2HCAA 3K1PA 4F22A 2BJJX 4TOZA 3PPOA 3IOTA 4NTLA 3FVOA 3H6UA 3PUYE 5CM6A 1D3KA 1B52A 2X26A 5I59A 3FVGA 1TFDA 1B5HA 3PUXE 4ZEKA 3HHGA 4O3AA 2OJTA 2M8CA 2HZKA 5CMCA 4ZE8A 3QSLA 3LBSA 3Q25A 3TCHA 3M3FA 4H5GA 1FQAA 1GR2A 3FJGA 3MZ1A 5DTBA 4F18A 1B4ZA 4LVQA 3K6UA 1MY3A 3GBBA 4RPOA 1USYH 1LGBC 1B2HA 3IR1A 2DWAA 3G3KA 4JSDA 1UTHB 2DWIA 3HO7A 2Q88A 4FAJA 3CFZA 1M5CA 4H5FA 4ELRA 3OOAA 1SQYA 1R9LA 4GIZA 1N7XA 1OVBA 3E3KA 4G68B 2DS9A 1URSA 3KG2A 1GV8A 5H8FB 1MQDA 2ZNSA 3PUZE 2Q2CA 1PB9A 2VGQA 1DPPA 1DMBA 4IO5A 4H67A 4JWYA 2UYFA 4YKIA 3OO6A 4ESWA 4RK2A 1H45A 3PD9A 4R6YA 2RCBA 1A7LA 3I6VA 4I8CA 4FJPA 3U93A 3U92A 1AH5A 3RLFE 3T9HB 2OLBA 4UA8A 1R6ZA 3O6IA 3ZKLA 1SBPA 2OWSA 3PPNA 4NEDA 3LC8A 4AB5A 4EUOA 3RQTA 2O1MA 2F6PA 5A5XA 1QULA 1OQHA 1MG1A 3K2DA 4AQ4A 1MDQA 1N76A 3JZJA 1EZ9A 3TCGA 1LFIA 3PGFA 1B46A 3C31A 4U1ZA 4JB7A 3PPQA 4Q0CA 1PB7A 1LSTA 2H9BA 1ZBMA 3KSXA 2B3FA 3SEVA 4DXCA 3B6WA 4HW8A 1MXYA 1B3LA 4C1TA 1LCTA 5K2XA 2DSFA 2VD2A 3Q26A 3TTKA 4FECA 4E0XA 4GD5A 1ZKBA 5JEIA 3TDJA 3UA8A 1VSOA 4OEVA 4XKRA 2P1SA 4LZ5A 4OQOA 4ZEFA 3RPWA 2NVUB 3TELA 3CRBA 2DE4A 4OWDA 3FIRA 3OO8A 5FHOA 5HPQA 1NL5A 2GH9A 4R72A 4YB7A 4H0WA 2ZNUA 4NF4B 4LATA 5DVFA 2H98A 1AL3A 4WEPA 1UQWA 3KOSA 3JV9A 1B7HA 5JTYB 1YTVA 4U1OA 1POTA 2Y7IA 4QFKA 4RNSA 5KDTA 5HM4B 3KJ7A 1B58A 1MS7A 3U72A 1IITA 4THIA 2V3QA 4GFRA 2AL5A 3KSJA 2P2AA 3CI8A 5FHNA 3IX1A 3C9HA 4YB5A 3O66A 2FYIA 5DVJA 2UVGA 1MY1A 3FJ7A 3TQWA 1XHYA 1SW4A 2ZYMA 4HTGA 3H06B 3FUZA 4HCWA 3T96B 1B7UA 3N26A 4DXBA 1LB8A 3RT6B 2Z23A 2HQ0A 4OVJA 1Y3PA 3H03A 2Q2AA 3PV0E 2V84A 1EH3A 3HPIA 1SD3A 2F36A 3MPKA 2Y7KA 4QSDA 4N6PA 1LFGA 1MQGA 4QF9A 3LR1A 5CC2A 3SEYA 3Q28A 2Q9TA 2Z22A 1URGA 2ANJA 1MH3A 4RXLA 4JSOA 2F7BA 4NF6A 3EN3A 5I2NA 1H44A 3TCFA 2H5YA 4NF8A 1QUKA 2NOOA 4DDDA 5M2VA 2I58A 3DP4A 5CMBA 3PU5A 1P99A 5I58B 1Y1MA 1P1WA 3CFXA 1DOTA 4QHQA 4KYEA 4DIGA 1XVYA 1F9BA 3TQLA 3JYRA 4OETA 1B32A 2QS4A 3MVWA 1BTJA 1US5A 4I62A 3S9MC 2A5TB 4U21A 1B05A 3E9XA 5AA4A 4POXA 4OEUA 1NMUA 3MUQA 5I56B 2D21A 2W7YA 4G8HA 2LAOA 4KYSA 4PFUA 3IJXB 5ISUA 3DELB 2XX8A 3VXCA 3PUVE 4EXLA 4IY5A 2DWHA 4EXKA 2AL4A 5J1DA 1FTKA 2O6AA 2RC7A 3BFUA 3M3LA 3W9VA 5I57B 2NWJA 4LQ2A 3HV1A 3KZGA 4RPNA 3L6GA 1JNFA 1IXCA 4YKKA 1FTLA 4R9FA 4HCYA 2O68A 4X1BA 5L9MA 3N5LA 1RYXA 1SYIA 1MRPA 4GQOA 5I2KB 2ZNTA 5F7VA 3TTMA 2F8DA 1ZLQA 3E4RA 4ESXA 4GL8A 1N7WA 1JQFA 2Y84A 1S7YA 1ZU0A 4RY1A 1QKBA 2XXPA 3BFTA 1EZPA 5KCJB 1VE4A 4MF3A 5ITOA 1US4A 3R7XA 3QUJA 1NNKA 3BKIB 5EYFA 3RTFB 4IGRA 1MXZA 3MWBA 2ONRA 3S9EA 3CVGA 4XKPA 2RCAA 1FTMA 2I4BA 5H8QB 1QKAA 3O97A 4M4GA 3ZS6A 3VVDA 1QUJA 2OWTA 4BDNA 3RY3A 2NUVA 5AA2A 3B6TA 1AMFA 1B5JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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