1DTZA

Structure of camel apo-lactoferrin demonstrates its dual role in sequestering and transporting ferric ions simultaneously:crystal structure of camel apo-lactoferrin at 2.6a resolution.
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
689
structure length
689
Chain Sequence
ASKKSVRWCTTSPAESKKCAQWQRRMKKVRGPSVTCVKKTSRFECIQAISTEKADAVTLDGGLVYDAGLDPYKLRPIAAEVYGTENQPQTHYYAVAIAKKGTNFQLNQLQGLKSCHTGLGRSAGWNIPMGLLRPFLDWTGPPEPLQKAVAKFFSASCVPCVDGKEYPNLCQLCAGTGENKCACSSQEPYFGYSGAFKCLQDGAGDVAFVKDSTVFESLPAKADRDQYELLCPNNTRKPVDAFQECHLARVPSHAVVARSVNGKEDLIWKLLVKAQEKFGRGKPSAFQLFGSPAGQKDLLFKDSALGLLRIPKKIDSGLYLGSNYITAIRGLRETAAEVELRRAQVVWCAVGSDEQLKCQEWSRQSNQSVVCATASTTEDCIALVLKGEADALSLDGGYIYIAGKCGLVPVLAESQQSPESSGLDCVHRPVKGYLAVAVVRKANDKITWNSLRGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGPLFKDTDSCRFDEFFSQSCAPGSDPRSKLCALCAGNEEGQLKCVPNSSERLYGYTGAFRCLAENVGDVAFVKDVTVLDNTDGKGTEQWAKDLKLGDFELLCLNGTRKPVTEAESCHLPVAPNHAVVSRIDKVAHLRQVLLRQQAHFGRNGEDCPGKFCLFQSKTKNLLFNDNTECLAKLQGKTTYDEYLGPQYVTAIAKLRRCSTSPLLEACAFLMR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Metal transport
molecule keywords APO LACTOFERRIN
publication title Camel lactoferrin, a transferrin-cum-lactoferrin: crystal structure of camel apolactoferrin at 2.6 A resolution and structural basis of its dual role.
pubmed doi rcsb
total genus 191
structure length 689
sequence length 689
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1dtzA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1dtzA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1dtzA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1dtzA03
3VLVA 2NVUB 1A99A 3PUVE 1SYHA 3KFMA 2ZXTA 3S9NC 3C35A 2UVJA 3PPPA 1MPCA 3OD7A 5JEIA 2O1MA 4X1DA 5B70A 4R75A 1NNPA 2RC8A 2DE2A 4JSDA 5CMKA 2P0SA 3MZ9A 4JSOA 1B3LA 1B52A 4RXLA 2B3BA 2DWAA 3OSRA 1EZPA 4QFKA 1Q35A 5JTYB 5DVJA 4XKRA 1I6BA 4PP0A 1N7WA 3TELA 3V83A 1PB7A 3DP8A 2QRYA 3W15C 1D9VA 4JB7A 3T22A 1FTKA 1P1QA 4OHNA 3OO7A 4RPOA 4DXCA 3U92A 1FTLA 4OXVA 4F29A 3EN3A 1OLCA 3IOUA 3FXQA 3TQWA 4ZE8A 4OZ9A 4EUOA 4BDLA 3G7WA 2D5WA 1QUKA 1B5JA 3VXBA 4EQ7A 1MXZA 3ZKKA 4R6HA 3KN3A 4RPNA 3UORA 2VP1A 4KYDA 1VSOA 2H99A 4Z0IA 2XXHA 3CFXA 1FTOA 2DXRA 4YAHX 3T9UA 1LCTA 5L9OA 1YAEA 5ISUA 1LCFA 3LSXA 4YMBA 1DPPA 3Q28A 1M5BA 3A3UA 3H4ZA 5H8SA 1SYIA 4OETA 1B4HA 3V5AA 1DSNA 4QSDA 2UVHA 2E1SA 5I2KB 4NF4A 3CFLA 3RY3A 2FNCA 1BP5A 2VHAA 4OFOA 4WEDA 4LZ7A 4RJZA 2IA4A 3G3FA 1QUJA 2DYXA 2V3UA 3FVNA 4NF8A 4LZ8A 2QMWA 1MXVA 4KQPA 4GRKA 4YKIA 3KGCA 4U1ZA 3FZVA 3N26A 2XD3A 2G93A 3Q27A 1P99A 2XXYA 1NKXA 2A5TA 2QS1A 4QFLA 3WAFA 1S50A 2DQVA 3H06B 4YKPA 3W9WA 4LUBA 5IKBA 2ABHA 1ZBMA 1P1NA 4H5FA 4F3BA 4H65A 3K1NA 1VFDA 3VE1B 2DE4A 3FVGA 1BLFA 4HCWA 3KJTA 2DWJA 4U4XA 3B6TA 2WKYA 3K6UA 3FASA 3QXMA 4I62A 4KCCA 5CMMA 2PT2A 4JWYA 4NF6B 3HN0A 3CR9A 2XX9A 3T9VA 1GV8A 1MH4A 1SW5A 4O3AA 5TPAA 3MP6A 5BWJA 1M5FA 3BBRA 1I69A 4FATA 2DSFA 1EU8A 1OIBA 2ONSA 3IORA 4OMBA 3L6HA 4BDQA 3I3VA 3C32A 4THIA 5TP9A 1IITA 3KBRA 2QS4A 3SEUA 1YPNA 2ZMBA 4N07A 4EF1A 3M8UA 3FUZA 3VLUA 1VE4A 4ZEKA 2IEEA 3PPRA 4XKQA 5H8NB 3LBSA 3T9XB 5H8FB 1L5TA 4QHQA 3FXUA 3IK6B 1MH3A 2OJTA 4PFTA 2DVZA 4G2ZA 3SETA 5CMBA 2YLNA 3PPOA 4IO7A 4OYVA 5M2VA 4ZEIA 3T66A 3BKIB 4JWXA 4E0WA 3OXNA 2B65A 1F9BA 4ONYA 1B1HA 4EXLA 4C1UA 1QW0A 4IO3A 1S7YA 3THIA 5I59A 4XKPA 4F3SA 2PMSA 4IO5A 1ZTYA 5LOMA 2OK2A 4G68C 2Q89A 2REJA 3G3HA 5ELVA 4LVQA 5L9MA 1FQAA 3D4CA 2ZNTA 3WAEA 2H98A 3MWBA 4RNSA 2HXWA 1POY1 1OVBA 4C1TA 3SESA 3TTNA 5AA2A 5A5XA 2I0BA 2R9JA 3VV5A 2DOJA 4TLLB 1P1WA 5DT6A 2Y84A 2LAOA 4GQOA 1Y3PA 4KYSA 4HTGA 1B7UA 3PPNA 2XXWA 2AYSA 2HEUA 3C9HA 4F2QA 1NNTA 4RA1A 4F31B 3FGSA 2OZZA 2Q9TA 2UXAA 4NF5A 3P7IA 2X26A 3MP1A 4GFRA 3D4GA 4Q30B 4N13A 3IOTA 2H25A 1S9TA 5I57A 1B3EA 3K00A 3TCGA 2XXUA 3PUZE 4OTEA 3LC8A 3L6GA 4F3GA 5ICQA 3RPWA 2DVCA 4G68A 5CMCA 3JZJA 3ILTB 3FXRA 4YU0A 2VGQA 1MXUA 4F2OA 4LQ2A 3TTKA 2QMXA 3MW0A 2ZNUA 1JVYA 1Y20A 1Z7NE 3O29A 4IY6A 3TCFA 4ELQA 2XXQA 3KEIA 4G8MA 4IGTA 5DYHA 4GL0A 2DWIA 2RC9A 3IR1A 4XTCQ 2XX8A 1ZU0A 1R9LA 3OENA 5DEXA 4U2RA 3EHSA 2QL3A 3PD8A 4F18A 2UVGA 4C0RA 3IAZA 4YKKA 4MLQA 1PB9A 2OWTA 4ZZAA 3QK6A 2Z22A 3BFUA 3ZKLA 2OWSA 2I48A 3GLBA 2AIXA 3M3LA 3UIFA 1JEUA 1A8FA 1LB8A 1JW5A 4GWOA 1I6AA 4FEDA 3VVEA 1YCJA 2HAVA 2Y7IA 5CM6A 3TFLA 3USDA 4U4SA 3HV1A 1USYH 3F11A 1N0TA 1N7XA 3SDFA 4ND9A 2DP8A 4WKMA 1SW4A 4TLMB 5I56A 3RTFB 4QRZA 3VVDA 2XHDA 2ALUA 1ZLQA 1QULA 3FJMA 4MH5A 1AH5A 1Q1KA 1NFTA 2O68A 3JYRA 4X1BA 3RTWB 1D9YA 1SVXB 1HSEA 5L9SA 4OENA 2CMOA 4Z7EA 1B0HA 2F78A 1MY2A 4QFPA 1MQDA 4F1VA 2GFEA 4HW8A 4DIGA 4DCXA 3RGYA 1NNFA 3GZGA 5KDTB 1B05A 3SEWA 2NXOA 1LAFE 5HBCA 1VFEA 3S4UA 3MVXA 4F22A 1RYXA 2UYFA 3PMXA 4U21A 3M3KA 4JBZA 1LBBA 4KR5A 1IZ1A 3G3KA 5H8HB 4R2FA 1UTBA 3ECRA 1R9QA 2Y7WA 1UTHA 1IEJA 3H3GA 2QJEA 3IO6A 3OELA 1GTKA 5EHSA 5AA4A 2GHAA 4FECA 3IO4A 5AE4A 4H1XA 2OCUA 3JV9A 5AA1A 4P11A 3S9MC 4M1VA 5EHMA 1XOCA 2Q2CA 4XKNA 5AA3A 5I2NB 1LGBC 1H43A 1N3XA 4YZZA 2Y7RA 1LFHA 1JETA 1JW1A 1POTA 4GXAA 1R6ZA 2PX1A 4NE4A 1O63A 4ZZEA 1IIWA 1CE2A 1M5CA 4ELOA 3MUQA 4O3BA 2D3IA 5I84A 3MPLA 4GD5A 3W9VA 3HPIA 3PD9A 1H3DA 3U8QA 2ESNA 4LA9A 3FVOA 3FIRA 4ZECA 2Z8EA 3TZAA 5EYFA 3FV2A 3O6GA 4X9TA 1LLSA 2NUVA 4BLAA 4DXBA 3PUYE 3UA8A 3OEMA 1Y1ZA 2F7CA 1XHYA 5JTYA 3MZBA 4OEVA 2UVIA 2H5YA 2O7UA 1DMBA 2HQ0A 4ESXA 2ONKE 2F97A 3GBAA 2HZLA 2X7QA 3GBBA 4FE8A 3SKPA 1FW0A 2ANJA 3H6UA 2O51A 3CSGA 4PETA 3OO9A 1IQ7A 1MM7A 1CB6A 1EH3A 4AQ4A 1B3GA 3IJXB 1QVSA 1Y9UA 3IJOB 1B7HA 2NWJA 1MDP1 2Y7PA 1OQHA 3O6HA 5F7VA 3ZS6A 4AB6A 1FQDA 1JEVA 1D3KA 2OLBA 2V3TA 3FVKA 4NWCA 2UYEA 1MY0A 3PMWA 3Q25A 4Q5TA 4G77A 1ZKBA 1OLAA 1P1OA 2GH9A 3K2DA 1DTZA 4WXJA 4I9DA 3PPQA 4U1OA 4DLDA 1NMUA 1AOVA 3S9LC 2I0CA 5I2KA 3V89B 3PUWE 5AA2D 1MPDA 4ZS9A 1TFDA 3H6VA 1URGA 2KLFA 3UP9A 3G3GA 1DOTA 1JW4A 2PYYA 2NOOA 3MP8A 3OSQA 1SI1A 1MXXA 3TPAA 4X48A 5KZTA 4H0WA 4IO2A 3N5LA 4R6YA 5DVIA 2V25A 2Z8FA 1EZOA 1SW1A 3QUJA 2Q88A 4QFOA 1Z7ME 1B6HA 1MPBA 1MQJA 3OMBA 1N76A 2OBGA 3K4UA 1D4NA 3SEVA 4DXUA 2RCAA 3OO8A 3K1MA 1HSJA 4PE5B 3K6WA 4GIZA 1II5A 1OQGA 3IB1A 1OMPA 3V8XB 4KI0E 1N3WA 3N6TA 2RC7A 4NF6A 1BKAA 3HO7A 4PQJA 1QUIA 1T0KA 2QS3A 4RK2A 2QSXA 2VOZA 1XC1A 1UIUA 4OEUA 3T93B 1Y4TA 2O7IA 3K6VA 4GLIA 1SBPA 3K1PA 2I3WA 3EF7A 4EF2A 3TMGA 3CVGA 1Y4CA 2FA7A 2GRVA 4RYAA 1MY4A 1LB9A 2YPNA 3G3IA 1B4ZA 1TT1A 3HHGA 4POXA 3I6VA 3TYHA 1N84A 1MY3A 4BDOA 4FIMA 4XIGQ 1IXCA 1M5DA 5H8NA 4QSCA 1QKBA 4ZEFA 5H8FA 4O3CA 1LFIA 3TTRA 1USYE 3EHUA 2D21A 1IXHA 3SEXA 3CSBA 1H76A 3S2VA 4PFUA 3KOTA 1B9JA 2F6GA 2DXYA 3E3KA 4Q8RA 4YMAA 5HPQA 4FORA 4G8NA 2I3VA 3PUXE 3K02A 5FHNA 4F1UA 3H6WA 1ATGA 1NH8A 4POWA 2XXIA 4RK9A 2P1SA 3KN8A 1A7LA 1I6QA 2G29A 4OFLA 3RN8A 1GGGA 1YTVA 5CRYA 5FHMA 3RLFE 5L8DA 1B7ZA 5H8QB 1IXIA 3R6UA 3E4RA 5FTIA 2RINA 1MS7A 4MBPA 1NL5A 5ITPA 1SW2A 3VDFA 2Q8JA 3IX1A 1A40A 1UIVA 3TTLA 1FQFA 3BFTA 3KJ7A 2FYIA 1TWYA 5DTBA 1FCKA 3CRBA 2X7PA 3H03A 4IO4A 1SQYA 4KCDA 2M8CA 2REGA 4NF4B 4DZ1A 1Y1MA 4NTLA 5DVFA 1FQCA 4H8IA 4IO6A 1KWHA 2RCBA 3TTMA 4F1YA 1MXWA 2V93A 2HFBA 1XT8A 3B6QA 3EPEA 4NF8B 4EQ9A 1XVYA 3ODBA 4R9FA 3UK4A 3O9PA 3CG1A 1PC3A 2PT1A 1LFGA 4MF3A 1US4A 4IY5A 2A5TB 3PU5A 1TFAA 3FATA 4ESWA 1SI0A 3T9HB 3OOAA 4H8JA 4G4PA 1P1UA 3TKDA 4H67A 3CFZA 1ZMGA 2F6PA 1LSTA 1OVTA 3ONMA 3VXCA 4YB5A 3I5OA 4ZE9A 3O66A 2Q2AA 3E13X 4OESA 3IB2A 3U94A 5TPAB 4DDDA 3TDJA 3MBPA 3UGWA 3KG2A 3A3CA 3PGFA 1SDXA 3HCQA 4IB2A 1PB8A 4GL8A 5H8QA 4LP2B 3IOVA 3OEKA 4I1DA 2XXTA 4KPTA 1HSLA 3K0VA 4QF9A 2PBWA 4JDFA 3LSLA 2BJJX 5K2YA 3N94A 5TP9B 1Y3NA 3U72A 2I4BA 3B6WA 1FQBA 2DS9A 4N6PA 5K2XA 1FTJA 2GHBA 3R7XA 4H6DA 3MQ9A 3Q26A 2A5SA 4H5GA 3KOSA 4L17A 3EQ1A 4G8HA 3S9EA 2E0SA 1O64A 5CI5A 3O28A 1WDNA 4F19A 3U1OA 3U93A 1B1XA 2QS2A 1B5IA 3QUFA 4HCYA 1PBPA 4F3PA 2ZYOA 1IXGA 2Y7KA 1Y3QA 3DP4A 1MQIA 3PV0E 4KD5A 3TEPA 1MG1A 5KCJB 2XXVA 5KDTA 1O7TA 4ISUA 1B3HA 4QFNA 4YB6A 4YKJA 4EQBA 2RKMA 5I59B 1XS5A 2O1LA 2F34A 1LAGE 2O69A 3O6IA 4R9GA 4RY1A 1PBQA 1BIYA 5H8HA 1US5A 4EDPA 3IOWA 2V84A 3ILUB 3MVWA 1XVXA 1NH7A 3IB0A 3Q29A 1PDAA 4ZEDA 3OO6A 2YJPA 3VVFA 5BUUA 5ICTA 4PFWA 3SERA 3TQLA 3RT6B 1ELJA 4BDRA 3EHTA 4GF8A 4OWDA 4E0XA 4NMYA 1LAHE 3MJNA 1DPEA 1MXYA 3DP6A 3CG3A 5AA2B 3K6XA 4YICA 4OQOA 3TUSA 1JNFA 5A5XB 1MRPA 2HAUA 3N6UA 2F7AA 4ELPA 3LR1A 3MVZA 4UA8A 2THIA 3HSTA 1ZIUA 2AL4A 3GXAA 5I2NA 1M5EA 4U22A 1URSA 4M4GA 3LUYA 1URDA 4ELRA 5TU0A 1PEBA 3CI8A 3MC2A 2ZYNA 4ECFA 3R26A 2XXPA 3KSXA 3RNNA 1B0LA 1A55A 5FTHA 5I58B 2DE3A 2VD2A 4OVJA 1JVXA 4NF5B 4JWOA 1H44A 2I49A 1B2HA 4BDMA 4P0GA 4GVOA 4BDNA 5I57B 4AB5A 4KHZE 1H45A 2H9BA 5HM4B 3SEYA 4I8CA 4HS7A 4R2BA 2HCAA 2DWHA 2F35A 4G68B 4JXIA 1B5HA 2W7YA 2I58A 3C4MA 3UN6A 3TODA 3DELB 5KCJA 1QJMA 2O84X 2H4IA 3MVYA 3KSJA 1MDQA 1NNKA 4TOZA 2ZNSA 1A54A 1QKAA 4F39A 1LAXA 2V3QA 1SD3A 1BTJA 5DEXB 4ZDMA 3MZ1A 5IAIA 3CIJA 3TAJA 4EXKA 1DTGA 2ONRA 4DE8A 1MQHA 2I4CA 4U23A 4OERA 3C34A 2B3FA 5ITOA 1B3FA 1B51A 3G3JA 3A09A 3K01A 2F8DA 1B32A 3VLWA 4LQ5A 5J1DA 3IL1B 5CBRA 3C31A 1LBCA 2XD2A 4R74A 1FQEA 3B7DA 3C36A 4WEPA 5JK4A 3H6TA 3RQTA 1R1NA 2XXRA 3FV1A 3FD3A 3QSLA 4DCYA 1ZJLA 4R72A 2F36A 3VFJA 1RYOA 3QYTA 1AMFA 3KZGA 5I56B 1TXFA 3T96B 1VR5A 4YB7A 2CZLA 1EZ9A 1AIVA 2PVUA 2O6AA 2VD3A 5I58A 2QPQA 3O97A 4K3FA 1ANFA 4FEBA 2RF1A 4UACA 3DLNA 4MLVA 1B40A 4KYEA 2AL5A 4MFIA 2XXXA 4FAJA 1WODA 3QIMA 2I6EA 1N04A 4KFQA 4LZ5A 2HZKA 1WVJA 3E9XA 1FTMA 1MQGA 4LATA 2Z8DA 1JQFA 4Q0CA 1B46A 4R6KA 2ZYMA 1J1NA 1GR2A 2ZYKA 2R6GE 3MAMA 4NWDA 3HHFA 3QAXA 4QSEA 4TQUQ 5F1QA 3TCHA 1AL3A 4XXUA 3C33A 3PMVA 1UTBB 3AXFA 3M3FA 1MM6A 1UTHB 3MPKA 3ZSFA 4LONB 4R73A 3DM0A 1RKMA 3LSWA 3KN7A 1A8EA 4NEDA 1GVCA 4P0IA 5AA4B 5CC2A 2P2AA 3RT8A 4GXSB 4PFYA 2F5XA 4FJPA 1IUDA 3O2AA 2F7BA 3FJ7A 5FHOA 3LSFB 5CBSA 3H7MA 3RUMA 1B58A 5B7DA 2R71A 4OFJA 1UQWA 4ZEBA 2XX7A 3FJGA 4GOTA 4IGRA 1MY1A 2Z23A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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