4IGRA

Crystal structure of the kainate receptor gluk3 ligand-binding domain in complex with the agonist za302
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
253
structure length
253
Chain Sequence
NRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGSGC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 3
publication title Chemoenzymatic synthesis of new 2,4-syn-functionalized (S)-glutamate analogues and structure-activity relationship studies at ionotropic glutamate receptors and excitatory amino acid transporters.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 253
sequence length 253
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4igrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4igrA02
4C1UA 1B5JA 4IO3A 1P1OA 3O28A 3ECRA 3CI8A 1N76A 4F2OA 3N26A 5A5XB 2IEEA 5B70A 1AIVA 4ONYA 3LUYA 3VVEA 4NF8B 3FZVA 1TFAA 4YB5A 3MJNA 3KN7A 3DM0A 2QS3A 4OETA 4DXCA 2Q88A 2RC9A 4GWOA 4OFJA 1JW1A 1MPBA 2G29A 3CVGA 5H8HA 2DE3A 2H5YA 5DTBA 5H8NA 1NKXA 5KCJB 3TCFA 2VHAA 1N7WA 1OMPA 1ZJLA 4PFTA 3SEVA 5K2XA 3MVWA 1D3KA 1TWYA 3GBBA 4WEPA 3K6UA 2PYYA 3UORA 4ZE8A 3CSBA 2I4CA 3PPQA 3LC8A 2UVGA 4F1UA 4I9DA 1ZLQA 5DEXA 1JW5A 2O68A 4IO6A 2REJA 3JV9A 1YPNA 1DOTA 3C4MA 3N5LA 4ELQA 3FVGA 3UIFA 2P1SA 1ZIUA 1IQ7A 2O84X 4BDNA 3K4UA 4F3GA 1QW0A 1FW0A 1B51A 2NWJA 1VR5A 3MWBA 3FASA 1POTA 2A5TA 3C9HA 1AMFA 3OSRA 3TEPA 2UYFA 4LQ2A 3CFLA 2GHAA 1GVCA 3FVKA 2OLBA 1NFTA 3MVZA 1GGGA 2F7CA 3IOTA 4RXLA 5CMMA 1DMBA 5TP9A 1USYE 1HSEA 3FATA 3TCGA 5I2KB 3M3KA 3TDJA 2V25A 1R9QA 4NF4B 2F7BA 3U8QA 1PBQA 4JWYA 4LQ5A 4EF1A 3LSLA 2Q2CA 1NL5A 3CG1A 1FQDA 3H6WA 2ZYKA 4OYVA 1JVYA 4AQ4A 3LBSA 1R1NA 2RC7A 5FHMA 1N3XA 4ZEIA 2P2AA 1IXHA 3FXUA 3ILUB 3EHTA 4XKNA 5ITPA 4RY1A 4ELOA 1IZ1A 2RC8A 4R75A 1Q35A 2YJPA 1N84A 4DCYA 5L9OA 4PQJA 4TLLB 2XXWA 4H8IA 1M5FA 2XX8A 3W9VA 2A5SA 4QSCA 4MLQA 5H8FA 1I6QA 1MXXA 4ZEDA 4N6PA 3O9PA 1ATGA 3G3IA 4FORA 4RA1A 1RYOA 3T9UA 4PFWA 2UYEA 1BP5A 4X9TA 2PT2A 1IXCA 1SW5A 1QUIA 2QMXA 1L5TA 4IGTA 4F3BA 2ZNSA 3Q28A 3LSWA 3PD9A 1MQDA 1B3LA 2XXTA 2NXOA 2Y7RA 2UXAA 2VOZA 1D4NA 3SKPA 2O7IA 4G4PA 1TFDA 1YTVA 4QSDA 4GF8A 1MDP1 2H99A 3MVYA 3JZJA 2XXHA 1AL3A 1I69A 4PP0A 2I3VA 3H6UA 4FIMA 3H3GA 3R26A 4XKRA 4ZZEA 1FQCA 4L17A 4R74A 1SBPA 4G8HA 2R71A 4HW8A 4EQBA 4QHQA 1FTLA 3CFZA 4H0WA 4JSDA 1R6ZA 4GVOA 4F3PA 2DYXA 3KZGA 1B40A 4WKMA 1BIYA 5DYHA 1BTJA 4G2ZA 3RTWB 3QAXA 3RQTA 1T0KA 4OENA 3A3CA 1A54A 4U4SA 1PB7A 2H98A 2XX9A 1B1HA 1JW4A 4ESWA 2QJEA 1D9VA 4LZ5A 4E0XA 3PUVE 2XXYA 3GLBA 1ZTYA 2DWJA 1LLSA 3MP1A 2I4BA 3KGCA 4QRZA 4LA9A 1XC1A 3OSQA 4MBPA 3EN3A 3VE1B 1FQFA 3PPRA 3EHUA 3R6UA 4NF5A 3SETA 3ZKLA 3PGFA 2O6AA 1AH5A 1SQYA 4TQUQ 5I56A 3C35A 4RPNA 4R2FA 2F5XA 2F36A 4ZDMA 4OXVA 1URSA 2QPQA 3ONMA 3OO9A 2W7YA 5HBCA 3HHFA 1PB9A 3KJ7A 4QF9A 4YKKA 1S50A 2VP1A 2ZYOA 3HSTA 3TAJA 4R6YA 2ZXTA 4MH5A 1ANFA 2V3UA 3OD7A 4MFIA 3V8XB 4WEDA 5A5XA 5AA4B 3HO7A 4U22A 3HV1A 4NF8A 3PPPA 3KBRA 4KPTA 4FJPA 4KCCA 1EH3A 2PMSA 1GV8A 3ILTB 4OQOA 3CR9A 3PMVA 1TT1A 4LVQA 3UA8A 4OHNA 1LAGE 5CM6A 1ZBMA 1B32A 3MAMA 3W9WA 4I1DA 2F6PA 4IY6A 3MZ9A 1PDAA 3DP6A 1QKBA 4M4GA 4H67A 1P99A 1GR2A 1LAHE 1II5A 1MPCA 1MH4A 4ISUA 2FNCA 2QS1A 3T93B 3WAEA 3BBRA 3C31A 2F6GA 3O6IA 1FTKA 1AOVA 1QUKA 3U92A 2KLFA 5L9MA 5B7DA 1B58A 3T9XB 3IOUA 3E3KA 3N6TA 5I84A 5K2YA 2I49A 2DWIA 3H06B 3O29A 1URGA 2XXQA 3TUSA 5DT6A 2HXWA 3F11A 3IJOB 4G68A 3RTFB 4IB2A 4NE4A 1MQGA 2V3TA 3PPNA 3TTKA 1MXUA 3ZKKA 2F8DA 3N6UA 5ISUA 3FJ7A 3K0VA 4QFKA 3I5OA 5HM4B 5DVIA 2QS4A 4NF6B 3KSJA 1NNPA 3IK6B 5LOMA 2Z8DA 5M2VA 3IJXB 1B0HA 3UGWA 4YKJA 1O64A 3SEWA 2VD3A 1POY1 2OK2A 3DELB 1RYXA 3K1MA 1SYIA 1XVYA 2O69A 4IO2A 4F1VA 1B46A 2OCUA 3U93A 4XKPA 1LGBC 2O51A 4QFPA 4BDLA 4DXBA 2ONSA 2UVJA 2Y7IA 1OVTA 3TQLA 4R2BA 4OFOA 1UTBB 3PD8A 1ZKBA 3K01A 1R9LA 1B4HA 1FQAA 3S4UA 3PMWA 3IX1A 1FTJA 3OENA 3HHGA 2D5WA 4ECFA 3VV5A 1XVXA 3FV2A 4GL8A 3FGSA 1H44A 3OOAA 3H7MA 4GRKA 5I2NB 1IXGA 2Y7PA 4C1TA 5BWJA 3QUFA 4PFUA 4F29A 2ONKE 5FHOA 4C0RA 4KD5A 4ESXA 2DXRA 3C32A 4LONB 3UP9A 2AYSA 5I59A 3OXNA 2XXIA 1M5EA 4ZEFA 4I62A 4KFQA 1KWHA 2QSXA 4KYEA 3Q26A 3UK4A 4OEUA 4GQOA 3D4CA 1Y3NA 1LSTA 3TYHA 2B3FA 3OO7A 4X48A 3G3HA 3FUZA 2XXPA 5DVJA 1P1QA 4YZZA 3HPIA 1Y1MA 3HN0A 2DXYA 4UA8A 1MQHA 3T22A 1LFIA 2HEUA 3PMXA 4F1YA 4RPOA 2RINA 4JSOA 1NH7A 1Y4TA 4G8MA 2QRYA 2QL3A 4R73A 4YMBA 4U1ZA 1YAEA 3ODBA 1EZPA 2AIXA 5I57A 4EXLA 5AA2A 1B9JA 1LFGA 4YKIA 5JTYA 5AE4A 1O7TA 4X1BA 3SESA 5EYFA 5HPQA 1B3HA 5H8NB 2O7UA 5AA3A 2I6EA 2DP8A 2I0BA 2PVUA 3BFUA 5F7VA 1FQEA 3VVFA 4XIGQ 1QKAA 1LAFE 5CMBA 3SEXA 2OWSA 1Y20A 1XT8A 1Z7NE 3T9HB 4HTGA 4H5FA 1B7ZA 5DEXB 3A09A 4H5GA 4YMAA 3VVDA 1USYH 5I58B 4ND9A 1LCTA 1NNFA 5KZTA 3O6HA 1EZ9A 3OO6A 3B6QA 5KDTA 4QFOA 3S9EA 4YKPA 2CMOA 2D3IA 2OJTA 3K02A 4IO7A 2A5TB 2PX1A 4OESA 4P11A 1JVXA 2R9JA 3O2AA 3IAZA 4X1DA 1H3DA 4H8JA 1UIVA 3VXCA 1LB9A 4JXIA 2Q89A 1MY0A 4AB5A 4H1XA 2F78A 1US5A 4LZ8A 1WDNA 2HFBA 1OLAA 3V83A 3K6VA 4F2QA 3PU5A 2ALUA 4R9GA 3SEUA 2CZLA 4GD5A 3OEKA 1JEUA 3AXFA 4DZ1A 4G8NA 3A3UA 1VFDA 4IO5A 2F97A 2UVHA 2QS2A 3CG3A 3G3GA 1MDQA 4FE8A 1SD3A 2H25A 2Y7WA 2XXVA 3MBPA 5CMKA 3KG2A 1B5HA 1VSOA 3DP8A 4FECA 4LUBA 2I58A 3GBAA 4IY5A 3B7DA 3KEIA 4ZEKA 1LFHA 4JDFA 5TPAA 1SI0A 2X26A 4OWDA 4QFLA 4GXSB 1SVXB 4POXA 3G3FA 2R6GE 1TXFA 5H8FB 1PBPA 4JWXA 1IIWA 2VGQA 4U4XA 3SDFA 5H8QA 1D9YA 5CRYA 5CBSA 2Y84A 3MPKA 1NNKA 5EHMA 1LBCA 3E4RA 2DS9A 4LP2B 2E1SA 4RYAA 3OEMA 3S2VA 4YICA 1WODA 1EU8A 3BKIB 3CSGA 1DPPA 1N7XA 3Q25A 2IA4A 4MLVA 1SI1A 1OLCA 4U23A 4GL0A 1MS7A 3FD3A 4HS7A 4KYSA 3B6TA 2H9BA 3RUMA 5L9SA 3M3FA 3P7IA 3Q27A 5ICTA 2XXXA 1LCFA 1MH3A 4NWCA 3E13X 3BFTA 1MXYA 1XOCA 2GFEA 4ZZAA 4Q8RA 1QULA 1NNTA 2P0SA 1JNFA 3H4ZA 4XTCQ 5CI5A 3O6GA 4U21A 1PC3A 4IO4A 1UIUA 3RNNA 1YCJA 4OVJA 1IXIA 5TU0A 4GXAA 3MVXA 3GXAA 4RNSA 2NUVA 1UTHB 3UN6A 1LAXA 1M5CA 2XHDA 4PFYA 2ZYNA 2Z22A 5KCJA 4O3AA 1MPDA 1MY3A 5FTIA 3TTNA 1JQFA 3FJMA 3RLFE 1P1WA 3KSXA 3RT6B 2V93A 4KR5A 4FAJA 1ZMGA 3USDA 1Q1KA 5JK4A 3G3JA 3MPLA 3FV1A 1F9BA 2Y7KA 2NVUB 2UVIA 4YB6A 1ZU0A 4OFLA 3PUXE 1OQGA 5F1QA 3TZAA 5CBRA 5I2NA 4NF5B 3IOWA 4NEDA 2I48A 1B7UA 3IL1B 2ZNUA 5ITOA 4LATA 5I56B 3MZBA 4PE5B 4ZEBA 2DQVA 4POWA 1HSJA 1Y3PA 1M5DA 1B3FA 4DDDA 3DP4A 3RGYA 4DE8A 3GZGA 4KI0E 3T9VA 2E0SA 5AA2D 4QFNA 5EHSA 4NWDA 3R7XA 3THIA 4PETA 4QSEA 4YU0A 4EXKA 3IO4A 1B4ZA 2LAOA 3L6HA 2QMWA 3Q29A 1A40A 4HCYA 1M5BA 1P1NA 3L6GA 4KYDA 5I2KA 5ICQA 4E0WA 3FXQA 4DXUA 1FQBA 1Y9UA 1B2HA 2XXRA 3RN8A 4NF4A 3OELA 3VLVA 3T96B 2DOJA 4ZE9A 3V5AA 3H6VA 1BLFA 1B1XA 3QYTA 1FTMA 4IGRA 5JEIA 3K2DA 4F22A 3EHSA 4U1OA 3M8UA 3VFJA 3C34A 4AB6A 3IB1A 3K6WA 3IOVA 1FTOA 3FJGA 4Q30B 4EQ7A 4XXUA 3G3KA 2DWAA 3TTMA 1MXVA 2THIA 2F35A 4K3FA 3FVNA 2B65A 3EQ1A 4N13A 3WAFA 4O3CA 1Y1ZA 4EDPA 1CB6A 2XXUA 5I58A 1DPEA 4UACA 2D21A 3T66A 4R72A 4NTLA 2HQ0A 2XD2A 3FIRA 1ELJA 3ZSFA 3O97A 3KFMA 4FATA 3VLUA 4KHZE 3H6TA 3JYRA 4U2RA 2VD2A 4N07A 4G68B 4LZ7A 3IO6A 3EPEA 2FA7A 1B7HA 1B3GA 2HAVA 5DVFA 3C36A 1J1NA 3LR1A 1VFEA 2Z8FA 3VLWA 5H8SA 3EF7A 4BDMA 2HCAA 3MZ1A 4OEVA 4GLIA 3FXRA 2AL4A 3M3LA 4XKQA 3O66A 1S7YA 5AA1A 2F34A 5CMCA 3H03A 4DCXA 3G7WA 4P0IA 1SW2A 5FTHA 4BDQA 5IAIA 5H8HB 3KOTA 2XX7A 2FYIA 4KCDA 3U1OA 2ESNA 1N3WA 4F19A 2ZMBA 3OO8A 2V3QA 2OWTA 2V84A 2B3BA 2HZKA 4YB7A 1Y4CA 1B3EA 4O3BA 4F18A 3CIJA 3ZS6A 3MW0A 3TKDA 3FVOA 1SDXA 2ANJA 4MF3A 4ELRA 3B6WA 2X7PA 2Z8EA 1RKMA 1P1UA 1BKAA 2ONRA 3PV0E 3TCHA 1A8FA 2HAUA 4ELPA 3KN8A 1MY1A 1DTGA 5ELVA 1MY4A 4F3SA 3C33A 2REGA 2NOOA 4R9FA 4Q5TA 3TPAA 4JB7A 3TTLA 1A99A 1MM6A 4Z7EA 2OBGA 3DLNA 2GH9A 2DSFA 5I59B 2ZNTA 1MY2A 1A55A 2BJJX 3V89B 4BDRA 1B05A 2YLNA 3TTRA 1WVJA 3PPOA 4I8CA 3I3VA 3MP8A 2HZLA 4KQPA 2RKMA 3KN3A 4EQ9A 3U94A 3RPWA 4NMYA 5BUUA 2M8CA 3K6XA 3PUWE 5TP9B 2RF1A 2I0CA 4RK9A 5AA4A 5J1DA 1FCKA 2WKYA 1IEJA 3RT8A 5I57B 1CE2A 5AA2B 3K1NA 3PUYE 1N0TA 2PT1A 4GOTA 5JTYB 2O1MA 3MUQA 4G68C 1LB8A 3VDFA 3K1PA 4G77A 4YAHX 3KOSA 3TMGA 1I6AA 3RY3A 3QSLA 3S9NC 1US4A 1PB8A 1MRPA 4F31B 1UTHA 3IB2A 3I6VA 4Z0IA 3N94A 1LBBA 1JEVA 4GIZA 1A8EA 3CFXA 4THIA 1OVBA 1JETA 5L8DA 3VXBA 3KJTA 3SEYA 2Q2AA 1B52A 1NMUA 2Z23A 3S9LC 2F7AA 2G93A 1UQWA 3CRBA 1NH8A 4HCWA 1H43A 4RK2A 4EF2A 4OTEA 1B0LA 1S9TA 4R6KA 1HSLA 4FEDA 4Q0CA 4WXJA 2O1LA 3E9XA 5KDTB 3TQWA 1H45A 2AL5A 4P0GA 4OMBA 1IUDA 2RCBA 2DVCA 3S9MC 4BDOA 1SYHA 4OERA 3TELA 3MP6A 1QUJA 4GFRA 1I6BA 3MQ9A 3PUZE 4H65A 2DE4A 4ZS9A 2ABHA 2OZZA 1Z7ME 4EUOA 1QJMA 4NF6A 3SERA 2DVZA 4BLAA 3HCQA 3D4GA 1OIBA 4DIGA 1H76A 4F39A 1N04A 4JWOA 2GHBA 2ZYMA 3QXMA 3TFLA 2DE2A 4FEBA 2RCAA 1DSNA 4TOZA 4R6HA 2Q9TA 1PEBA 4OZ9A 1IITA 1B5IA 1MQIA 1B6HA 4DLDA 4M1VA 4ZECA 1UTBA 3IR1A 1SW4A 3OMBA 3IB0A 1XHYA 2DWHA 1MQJA 1VE4A 5TPAB 5IKBA 3IORA 2X7QA 3QK6A 3QUJA 2XD3A 5CC2A 1XS5A 2PBWA 3W15C 3MC2A 1A7LA 4TLMB 1URDA 3TODA 5H8QB 1EZOA 2Q8JA 1O63A 2H4IA 1QVSA 2YPNA 3U72A 3QIMA 3LSXA 2GRVA 1MG1A 1DTZA 5FHNA 4JBZA 1MXZA 1OQHA 1SW1A 4H6DA 1GTKA 3K00A 3LSFB 1MXWA 2I3WA 1Y3QA 1MM7A 4RJZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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