4IGRA

Crystal structure of the kainate receptor gluk3 ligand-binding domain in complex with the agonist za302
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
253
structure length
253
Chain Sequence
NRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGSGC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Chemoenzymatic synthesis of new 2,4-syn-functionalized (S)-glutamate analogues and structure-activity relationship studies at ionotropic glutamate receptors and excitatory amino acid transporters.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 3
total genus 83
structure length 253
sequence length 253
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4igrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4igrA02
1LAGE 1B58A 4O3AA 2F97A 1MPCA 1KWHA 4LP2B 3L6GA 3M3FA 1IIWA 2VP1A 1JW1A 1UIUA 4NEDA 4NF4A 3CRBA 3VLUA 3W9WA 2HAVA 4AB5A 4FATA 3G3IA 3PPOA 1MXUA 2BJJX 1QJMA 2DVCA 3UN6A 3RQTA 3M8UA 1N76A 4G8MA 4Z0IA 1B5IA 4KQPA 4X1BA 3PUWE 4EQ9A 4EF1A 3IJXB 2THIA 3S9NC 2HCAA 2KLFA 2Z8FA 2Q8JA 1OVBA 1WODA 2V93A 5A5XA 1GVCA 1FQFA 4RPOA 2DQVA 1PC3A 3FD3A 1TT1A 1IXHA 1XT8A 1IXGA 5DYHA 4ELPA 3PMVA 3TDJA 4LQ5A 1Y4TA 2UVGA 3DM0A 3HCQA 2OCUA 5KCJB 1OQHA 3CIJA 3VLWA 3P7IA 5AA1A 3SESA 1EU8A 2I58A 4GFRA 2Q2AA 1P1NA 3OO8A 4YKIA 5CRYA 1MH4A 4KHZE 3RPWA 1QUIA 3V83A 4YZZA 1JEUA 3RT8A 3I3VA 4KCCA 4PFTA 2ZMBA 2NXOA 4ESXA 2NOOA 1MY4A 2VD3A 1EH3A 1ZMGA 3FVOA 4H0WA 2O68A 5H8FA 4OFJA 4LA9A 4KFQA 3PPRA 1MQGA 4H6DA 1NH8A 4X9TA 4ELQA 3IK6B 1WDNA 5DVJA 3K2DA 3TFLA 2PMSA 4K3FA 5ICQA 1VFEA 3GLBA 4YB6A 1FQEA 4BDOA 2DE2A 3S4UA 5IKBA 3U94A 3HPIA 4GQOA 1B6HA 3C4MA 1B9JA 1QKAA 1MG1A 3H03A 3HSTA 1LGBC 4X1DA 1LB8A 1R9QA 3IB0A 4HW8A 1H76A 4AB6A 4RA1A 1MY0A 2PX1A 1WVJA 1UTHB 3EHSA 3QYTA 1POY1 3LR1A 2FNCA 1IQ7A 2G29A 4H1XA 4I9DA 5BUUA 3Q25A 1P99A 3LSWA 4ISUA 3IL1B 3FVGA 1DPEA 4HTGA 2AIXA 5H8NA 4LUBA 4MFIA 1N3WA 2QMXA 2XXTA 4ESWA 4QHQA 1QVSA 5I2NB 4OQOA 4FEDA 1GTKA 3VXCA 4E0XA 1AH5A 4OTEA 1SI0A 3MVWA 2V84A 2YJPA 4F3GA 4OHNA 3RNNA 3K01A 4F1YA 3SEUA 4XIGQ 1SQYA 4GLIA 1R9LA 3OXNA 1MQIA 2GRVA 1SBPA 1B5HA 1L5TA 1JVXA 2M8CA 2XX7A 4R73A 2ZNUA 2P0SA 3KG2A 1AIVA 4YB7A 1B4ZA 5FHNA 3VE1B 3OENA 2ONSA 3B6TA 4GIZA 1B32A 5H8QB 3DLNA 2RCAA 1URGA 4I8CA 4WEDA 3MJNA 3OD7A 4GRKA 2NVUB 2V3TA 1B52A 1SYHA 4OENA 2DSFA 2R71A 3TZAA 2F36A 3K6WA 3EHTA 5JK4A 2RKMA 1IXIA 1JQFA 3KSXA 3TODA 3RTFB 2Y7IA 2Y7KA 3MZBA 5IAIA 5HBCA 4GXAA 3USDA 2I3WA 1NNKA 1B1HA 4GVOA 4M1VA 3TCFA 3H3GA 4LONB 1YTVA 5L9SA 2FYIA 2G93A 2OJTA 5ICTA 1FCKA 4EDPA 1B1XA 2VOZA 4R9GA 1SD3A 2E1SA 5EHMA 3MAMA 2ZYOA 3WAFA 1F9BA 1Z7ME 2H5YA 5TPAB 1XC1A 5CMMA 3PPPA 4MLVA 1MQDA 2CZLA 4KR5A 1B05A 4NE4A 3O9PA 1LSTA 3QAXA 5ISUA 3G3JA 3T66A 3TELA 4RK2A 5I56A 4F31B 4NF8B 1NNTA 3C32A 4H5GA 5KDTB 3O2AA 1URDA 2D5WA 2QL3A 2IA4A 3C36A 4Q5TA 3N6TA 3O6HA 1ZJLA 4EQBA 4DCYA 4RPNA 5KCJA 4KPTA 4G68B 3FJ7A 1IXCA 2DE3A 4WKMA 4WEPA 3KZGA 4G8HA 4GOTA 4ZEKA 4KI0E 3TQWA 2F78A 3KJ7A 1JW5A 3C33A 5AA4B 4PFYA 2ZYKA 4PFWA 2LAOA 4P0GA 1T0KA 3QK6A 2AYSA 3T22A 3TUSA 4THIA 4F3PA 4Q30B 3OO7A 4NF5B 5EHSA 1ZIUA 4JXIA 1UIVA 4GXSB 4N07A 2QSXA 3GXAA 1SI1A 3IOUA 4IY6A 3TTKA 1CB6A 4I1DA 2GFEA 4H8IA 1IUDA 3PV0E 4ONYA 3K1PA 2UYEA 3MPLA 3RN8A 2HAUA 2RINA 3T9VA 3QUJA 3RT6B 1LFHA 4TLMB 3PUVE 2Y7WA 3G3KA 4ND9A 3CG3A 1S9TA 5H8HB 4F1UA 3F11A 3B6WA 3U8QA 2V25A 3V8XB 4MLQA 4N13A 3KN8A 3U92A 1B3GA 1OLCA 4F18A 2H25A 3M3KA 3SEXA 1DTGA 5AA2B 3MBPA 3K02A 2UYFA 2A5TB 3K1MA 4ZEIA 5LOMA 3N5LA 1O63A 2P2AA 1NFTA 5I57B 2PBWA 2H9BA 3GBAA 4U1ZA 2Y84A 4NMYA 5JTYA 4FEBA 1OVTA 4IO6A 3DP8A 3OSRA 1MY3A 3VDFA 1B0LA 3A09A 1FQBA 5FTIA 2Y7PA 5I59B 1HSJA 2HXWA 2OZZA 3K4UA 1P1UA 4PP0A 5F7VA 1HSLA 2XXVA 4PFUA 4EQ7A 5K2YA 5ELVA 1LLSA 2O84X 1URSA 1SW5A 1MDP1 3QIMA 5CBRA 2DWHA 5K2XA 1US4A 4YMBA 1LB9A 3EHUA 5CMCA 4ECFA 2AL5A 1XHYA 3FVNA 1Y1ZA 2Q2CA 4ZE9A 2RCBA 1MY2A 1TXFA 5CMKA 5B7DA 3CFZA 4FECA 1MXWA 4XKPA 4IO7A 3V89B 4LZ8A 3UK4A 3S9MC 2I0CA 4KCDA 3MW0A 3FJGA 4QFKA 4YMAA 3FV1A 5H8QA 1MH3A 1Q1KA 4TOZA 1MDQA 4DIGA 1SW4A 1R6ZA 2DOJA 4OETA 2OWSA 3IX1A 3VFJA 1LCTA 5TP9B 1Y1MA 1PDAA 1JVYA 2XXIA 4DXBA 4PE5B 3FZVA 4JSDA 4FE8A 4R6KA 3K6UA 1M5BA 3KJTA 1BLFA 1MXXA 2HZKA 1O64A 1LBBA 4RNSA 3TEPA 4WXJA 4ZEDA 3CFXA 3N26A 3HV1A 3O28A 1Y9UA 3TAJA 4F19A 3D4GA 3OO9A 3RLFE 3T9HB 3JV9A 1H3DA 2QJEA 2RC7A 2REGA 2RC8A 3D4CA 4EUOA 2VD2A 1M5EA 3MQ9A 1PB7A 3FV2A 1P1WA 3CG1A 1N84A 1Y3QA 5TPAA 4F2QA 3Q26A 1PBQA 1FTMA 4LQ2A 3VVDA 3HHFA 1GGGA 3OO6A 2REJA 1ATGA 3C31A 1EZOA 2ZYNA 1A8FA 3V5AA 4Q8RA 3IJOB 3IAZA 1I6BA 3H6TA 4OEVA 3KFMA 3SERA 3RY3A 2XXHA 4AQ4A 1PB8A 4DXCA 2X7QA 3EPEA 4YKJA 5DEXB 4NF8A 1MQJA 3WAEA 3HO7A 3ZSFA 3R6UA 1P1QA 5I2KB 1B7ZA 5KDTA 2XXXA 1LAFE 1MM6A 4ZECA 1OQGA 3SEWA 4F2OA 4C1TA 1NKXA 5HM4B 3MVYA 4G68A 1MXVA 1QUJA 3RGYA 5AA4A 2DE4A 2I6EA 2UVJA 1II5A 3E13X 2DXRA 3VLVA 2DWAA 4NF5A 1QW0A 3A3CA 3FIRA 4KYEA 2ABHA 3Q29A 1MM7A 4GD5A 4ZDMA 4MH5A 4TLLB 3ZKKA 2XHDA 3IO6A 4LZ7A 4QSEA 1A99A 3TMGA 3RUMA 2F34A 5ITOA 4JDFA 3FJMA 2XX8A 4XTCQ 3PU5A 4X48A 2HQ0A 3LSFB 3PGFA 2A5SA 2O7IA 1FTOA 1A55A 3FXUA 1Y4CA 5AE4A 1FTLA 4OXVA 2R9JA 3KBRA 3MVZA 1US5A 3TCHA 1B5JA 5H8HA 4XKRA 1MY1A 1B4HA 1CE2A 1YPNA 4EXKA 1B2HA 5M2VA 1FQDA 1UTBB 3BFTA 4IB2A 1PB9A 4U1OA 1NMUA 3KSJA 3U93A 2A5TA 3C35A 4F1VA 1GR2A 1JETA 4Z7EA 3E3KA 5CC2A 3H4ZA 2P1SA 1EZPA 2ALUA 4R74A 4DCXA 1A54A 1SVXB 5DVFA 1BKAA 1MPBA 5I59A 3G3HA 3DP4A 3N6UA 3KGCA 4ZEBA 4I62A 1JEVA 3UGWA 1FTJA 2I48A 4NF6B 3CVGA 3KEIA 1B0HA 3IOTA 3IO4A 3C9HA 3EF7A 1NNFA 2Q88A 4R2FA 1A8EA 3KOSA 3PMWA 5KZTA 2Z23A 1Y3PA 4M4GA 3E4RA 4E0WA 4U21A 3S9EA 2HFBA 4PETA 3OOAA 4BDNA 4YAHX 4R9FA 4NWDA 1SW1A 4RYAA 5BWJA 3G3GA 1N7XA 4G2ZA 2DP8A 1NH7A 3KN3A 1VSOA 5HPQA 3UA8A 3GZGA 2Z8DA 1XVXA 4PQJA 4H8JA 1FQCA 3QUFA 4OZ9A 3Q27A 5TP9A 3CI8A 2VHAA 1QUKA 2OBGA 1BIYA 4QRZA 3PPQA 4YICA 4KYSA 1M5FA 3H06B 4XKQA 2NWJA 1GV8A 4U22A 3FUZA 1BP5A 3LUYA 4R6HA 1J1NA 4IO2A 1DOTA 2XXUA 4L17A 1FTKA 3OELA 2GHAA 3SDFA 1ZBMA 3PUYE 4O3BA 4ZZAA 1M5CA 1B3EA 3T9XB 2UXAA 5I58B 2ZXTA 4G8NA 2Z22A 4JWXA 1A7LA 1AL3A 2F35A 2Z8EA 5FTHA 4YKKA 3TCGA 5DT6A 3QSLA 4OVJA 3MP8A 1YCJA 2I0BA 2RF1A 1Q35A 1H43A 4OWDA 3IOWA 3E9XA 2F6GA 2XXYA 3OEMA 1UTHA 4BDQA 3FXQA 5DEXA 2B3BA 2PT2A 3O29A 3TKDA 4KD5A 1PEBA 3VXBA 3O66A 1I6AA 4F22A 5I2KA 3TTRA 3LSXA 2HZLA 1VFDA 4KYDA 1B7HA 1D3KA 4RXLA 3U1OA 2CMOA 4QFPA 1JNFA 2QS4A 1QULA 3MVXA 2QS3A 2I4BA 5I2NA 3FATA 2AL4A 2H4IA 4F3BA 1N04A 1RYXA 1ZKBA 3ODBA 2X26A 2V3UA 3HHGA 4HS7A 1I69A 3R7XA 3MP1A 1YAEA 2XD2A 4QF9A 3B7DA 4OFOA 4JSOA 3MC2A 4ELRA 1A40A 3O6GA 3IORA 4IO5A 3A3UA 4R6YA 1UQWA 5I56B 2ZYMA 4R75A 4FIMA 4DE8A 1TFDA 2PYYA 3TTNA 3ECRA 4MF3A 1B51A 5ITPA 4G68C 4F39A 1MXZA 3K0VA 4BDLA 1DPPA 2QMWA 3TTLA 3H6VA 3MZ9A 4P11A 3ILTB 3OSQA 3JZJA 3K00A 1USYH 4NTLA 1MPDA 1D9VA 1I6QA 1ANFA 1FW0A 2I3VA 1IEJA 2ONRA 5H8SA 1UTBA 4ZZEA 5EYFA 3DELB 2PVUA 4POXA 2DXYA 3SETA 1Y20A 3C34A 2FA7A 2R6GE 3B6QA 1XOCA 4IGRA 3CSGA 3LBSA 1P1OA 1AOVA 2ZNTA 4FAJA 5L9OA 3MZ1A 4GL8A 2F8DA 3KOTA 1ZTYA 5DVIA 5J1DA 3OMBA 1LFGA 1R1NA 5L8DA 5CM6A 1B3LA 4NF6A 2ZNSA 2UVHA 4OMBA 1MS7A 2Q89A 3SKPA 1POTA 4JWYA 2IEEA 2XD3A 5FHOA 1EZ9A 3K6VA 1H45A 2O1LA 1SYIA 3PD9A 3UP9A 1Z7NE 4HCYA 3ONMA 4ZS9A 4LZ5A 3LC8A 1N3XA 3MP6A 2Q9TA 1B3FA 4POWA 2O1MA 1XS5A 2F7CA 3FGSA 2GH9A 4NF4B 3K6XA 4U4XA 5L9MA 1B40A 4GWOA 3FXRA 1USYE 4JB7A 5JTYB 4JBZA 4DLDA 1LAXA 1SW2A 5TU0A 4IO4A 4RY1A 4U4SA 4Q0CA 4RJZA 2QPQA 1MXYA 1OIBA 1B3HA 3PUXE 4ELOA 1QKBA 3T9UA 4NWCA 2OK2A 4BLAA 3IB2A 3CFLA 3ZS6A 5A5XB 5CI5A 1M5DA 2F6PA 1NNPA 3G7WA 3BFUA 2RC9A 3JYRA 4EXLA 1LAHE 4H67A 1RKMA 3L6HA 4JWOA 4OEUA 3I6VA 2GHBA 4QSCA 4OESA 5I84A 4IO3A 2ANJA 2V3QA 5F1QA 2YLNA 1OMPA 3BBRA 3KN7A 2DWIA 2NUVA 5I58A 1Y3NA 3VV5A 2OLBA 3UIFA 2UVIA 4QFLA 3VVFA 2QS1A 4U23A 2PT1A 3G3FA 1HSEA 4N6PA 5FHMA 2XXQA 2I49A 1VR5A 2D3IA 1SDXA 3TTMA 2D21A 1O7TA 2B3FA 4ZEFA 5H8FB 2HEUA 4F3SA 3BKIB 5AA2A 4R72A 4P0IA 1VE4A 3MPKA 1LFIA 2XXRA 3FVKA 3I5OA 5DTBA 4O3CA 5I57A 1TFAA 2WKYA 2DYXA 2ONKE 1H44A 1DSNA 2I4CA 2O69A 4DXUA 2VGQA 4U2RA 2X7PA 3H7MA 3PPNA 1B7UA 3TPAA 3SEYA 4RK9A 3SEVA 2XXPA 1N0TA 4R2BA 3DP6A 1S50A 3OEKA 4OFLA 4LATA 5CBSA 3FASA 2DS9A 4BDMA 5CMBA 1TWYA 1D4NA 4G77A 3IR1A 1RYOA 3S9LC 1MRPA 4DDDA 1XVYA 4FORA 2YPNA 4OERA 3W9VA 3T93B 3ILUB 3AXFA 3Q28A 4HCWA 1ZU0A 2ESNA 3T96B 4QFOA 3LSLA 4ZE8A 1S7YA 2H98A 4OYVA 4UACA 2H99A 3PMXA 3H6WA 1ELJA 4YKPA 4C1UA 5B70A 1PBPA 3MUQA 4UA8A 3THIA 3GBBA 3PUZE 5H8NB 3UORA 3O6IA 4FJPA 4DZ1A 2F7AA 2O51A 4H65A 1AMFA 4F29A 3VVEA 3EN3A 3EQ1A 4QSDA 3IB1A 2DWJA 1BTJA 3U72A 3CSBA 4EF2A 2B65A 1OLAA 4G4PA 3M3LA 2W7YA 1DMBA 3IOVA 1N7WA 4GL0A 4GF8A 5AA3A 4YB5A 4YU0A 3HN0A 2XXWA 1D9YA 1NL5A 2O7UA 1IITA 2DVZA 1JW4A 2QRYA 3QXMA 3N94A 3O97A 3S2VA 5JEIA 1FQAA 3MWBA 3TQLA 2XX9A 3R26A 2F7BA 3RTWB 1MQHA 3CR9A 4IY5A 1B46A 1ZLQA 3W15C 4TQUQ 2O6AA 2QS2A 2E0SA 4MBPA 4IGTA 2F5XA 2OWTA 4XKNA 4XXUA 1LBCA 3TYHA 3ZKLA 1LCFA 1DTZA 4LVQA 5AA2D 3PD8A 2Y7RA 1IZ1A 4H5FA 4QFNA 3H6UA 3K1NA 4BDRA 4C0RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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