2CMOA

The structure of a mixed glur2 ligand-binding core dimer in complex with (s)-glutamate and the antagonist (s)-ns1209
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Ion channel
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title The Structure of a Mixed Glur2 Ligand-Binding Core Dimer in Complex with (S)-Glutamate and the Antagonist (S)-Ns1209.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 77
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-05-11
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2cmoA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2cmoA02
3DP6A 4TQUQ 2OCUA 4Z7EA 2F36A 1OVBA 1O64A 3SERA 4OFOA 2HQ0A 3RY3A 2I4BA 3QUJA 4EDPA 1Q35A 4ZECA 4C1UA 5FHOA 4ZS9A 3B6WA 1R1NA 5ICTA 4Q5TA 2O1MA 2XXQA 2DVZA 5KZTA 3W15C 4GL0A 4E0WA 3H3GA 5AA1A 3K6WA 3I3VA 2F35A 4EXKA 3LBSA 1S9TA 4JXIA 1MXVA 4IB2A 4H5GA 1BLFA 4PP0A 5CMMA 1MQHA 1P1WA 5I58B 1NNKA 3PPOA 3UA8A 1FTKA 4PFUA 4DE8A 3PU5A 1B3GA 2VGQA 2R71A 3VLVA 1QUIA 4F29A 2UVHA 4JWXA 2V84A 1A99A 3QUFA 4OFLA 3K01A 5CRYA 2PYYA 1B58A 3TODA 4IO2A 2DYXA 4C1TA 2XHDA 3UK4A 2QMWA 3O6HA 2F34A 4XKNA 3CSGA 4WKMA 2F78A 3TMGA 1LFIA 2X26A 1FQFA 4YKPA 4ZEDA 1GR2A 1RYXA 4FIMA 3G3JA 5ITOA 3K1NA 3KJ7A 4YU0A 3OELA 5K2YA 4QFLA 3FUZA 2R9JA 4IO6A 3GBBA 1A8EA 4GRKA 3VVFA 4OWDA 4YB5A 3A3UA 1Q1KA 2V3TA 2QJEA 3IJOB 3QAXA 3TCHA 1M5BA 4FORA 3G3IA 4N13A 1N0TA 3TELA 3KGCA 2HAVA 4H1XA 1P1UA 4JSDA 3CI8A 1N7WA 1NKXA 2CMOA 3LSLA 5TP9B 4GXAA 4IY6A 2V3UA 1MQGA 4F3BA 4NEDA 3T93B 3U93A 2I4CA 4KYSA 5I2NA 3U8QA 3GXAA 1QKBA 2WKYA 1R9QA 5KCJB 1UTHB 4OETA 1LAGE 4LA9A 4U21A 5TPAA 5H8HB 5ISUA 1XOCA 2QRYA 2HCAA 3K6UA 1R6ZA 3O97A 5H8NB 2XXUA 5DVJA 3V5AA 3RTWB 2ESNA 1IEJA 2I49A 3LUYA 3PUZE 2RC8A 4NF4A 1VR5A 2ANJA 1N76A 1B7ZA 2H25A 1TFAA 1DMBA 1ZLQA 1BKAA 3FVGA 4HCWA 4PE5B 2I58A 4YAHX 3EHTA 4NF4B 5B70A 1IIWA 3FXUA 5CBRA 4Q0CA 1ANFA 4G2ZA 3MWBA 1RKMA 1ZMGA 4LQ5A 1TXFA 1WODA 2XXRA 2Z23A 4QFNA 2Y7IA 3CFLA 3RQTA 2XXWA 4IGTA 1Y4CA 4YKIA 2QS1A 3N94A 4GD5A 3G3KA 4RY1A 1MY0A 4N07A 3ZKKA 2Q88A 4DZ1A 4LZ8A 1Y1ZA 5H8QA 2ZYNA 2XXPA 4KPTA 2OWTA 3V8XB 1TWYA 3V83A 2QL3A 1GGGA 4PFYA 3TQWA 4ELPA 1UQWA 4FE8A 4MBPA 2P0SA 4FAJA 3S9LC 2E0SA 3IJXB 4EQBA 2UYFA 1NNTA 5I84A 5I57B 3MJNA 4G8MA 5HM4B 3FJ7A 3GLBA 4ESXA 2RF1A 1SD3A 1NH7A 4TLMB 3C32A 5A5XA 1LCFA 4P0IA 4OFJA 3WAFA 2NWJA 3CIJA 1FTOA 1FQEA 1PBPA 2QS3A 5A5XB 3S2VA 5F1QA 4H67A 1D3KA 5AA2B 4OENA 1JVXA 1OMPA 3QXMA 3DM0A 4H6DA 3SKPA 4ZE9A 3PV0E 3K02A 1FTMA 4POXA 1TT1A 3ZSFA 5JTYB 4EUOA 4OMBA 3PD9A 3RT8A 1Y3QA 4FEDA 1B5JA 1MY1A 4EXLA 4TLLB 4JWYA 3M3KA 2AIXA 1MQJA 4O3CA 3ONMA 3RPWA 3FV1A 2GHBA 3B6TA 1XVXA 2Y7KA 3PUWE 1LFHA 2DQVA 2Q2CA 3DLNA 5L9OA 1QJMA 4G8NA 4OEUA 1WDNA 3K0VA 3MVXA 3OXNA 2O7IA 2H99A 5I56B 2REGA 4GQOA 3T9XB 1B4HA 5CI5A 2IEEA 1GV8A 3MP8A 3SEUA 1MPCA 3HSTA 3L6HA 3SEVA 2G29A 4G68A 3MP1A 4R6YA 3KOSA 4GLIA 4IO7A 1SW4A 1UTBB 4BLAA 4HCYA 1MH3A 2F5XA 3ODBA 4OZ9A 4WEDA 1N3XA 1JQFA 4ZEBA 3RNNA 1DTZA 1I69A 1Y20A 2R6GE 4R9GA 4QFKA 3TTLA 4Q8RA 3N26A 3FASA 3T9UA 4QSCA 3IO6A 3FZVA 5DEXA 4U2RA 2PT1A 1SYHA 3A09A 2OZZA 3TAJA 3KOTA 2Q89A 4QSEA 4LATA 2X7PA 4ZZEA 2HZKA 1OLAA 2ALUA 4R2FA 3TDJA 3USDA 1ZJLA 3E3KA 4DCYA 5F7VA 2G93A 1DPPA 3PUYE 3GBAA 3JV9A 4K3FA 2ONKE 3QK6A 3H6VA 1M5EA 4F19A 5ELVA 3MQ9A 3U92A 2PMSA 5KDTB 3IX1A 2O84X 2RKMA 1JVYA 3K1PA 3LSXA 4YB6A 1A40A 3IO4A 1FQDA 2HFBA 2XXTA 3IB1A 3RGYA 4KFQA 4ZZAA 2KLFA 1M5FA 2XX7A 4F1UA 3U94A 4GL8A 4PQJA 2I48A 3RTFB 3IB2A 1XVYA 2AL4A 5FHNA 1B40A 1LAXA 4XKRA 5HPQA 4OQOA 3KJTA 1O7TA 1I6AA 1SW5A 2HEUA 1B3LA 4UA8A 1ZTYA 4AB6A 2F6GA 3KG2A 4XKPA 2H98A 1H3DA 4GOTA 3MZ9A 5BUUA 4OTEA 3DP4A 3KSXA 1II5A 4GF8A 3PMVA 3DELB 4NF8A 1MY4A 3K6XA 1PDAA 2V3QA 2XX9A 1B52A 1B9JA 4GVOA 2FNCA 5CBSA 1B0HA 2O6AA 3BFUA 4YMBA 1L5TA 3P7IA 1T0KA 2XX8A 1LB8A 3THIA 2I0BA 1Z7ME 2QS2A 1SQYA 5FHMA 1NH8A 2Z8FA 3T96B 1EZPA 3CG3A 2H4IA 4PFWA 1JNFA 3KEIA 3TEPA 3UN6A 3SEXA 5ICQA 4Z0IA 1XC1A 2A5TA 3CSBA 1FTJA 3W9WA 4IGRA 2XXIA 3KZGA 4BDOA 3WAEA 3IL1B 4BDQA 2O51A 3MVYA 4R2BA 1IXCA 4RPOA 4LUBA 1HSJA 3M3FA 2UVJA 1USYE 1A7LA 1B32A 2REJA 1MXUA 3IR1A 4U22A 1PBQA 3UIFA 3C36A 4NF6A 1FCKA 4RPNA 4HTGA 1MPDA 3A3CA 3ECRA 2I0CA 1YAEA 2I3WA 1UIUA 4BDRA 1MXXA 1Y9UA 4KD5A 3FXRA 1Y3PA 5DVFA 3QYTA 4I9DA 3KN8A 2A5SA 3UP9A 3W9VA 1NL5A 4YKKA 3TQLA 5DTBA 4GWOA 1B1XA 2F7CA 1MDQA 2IA4A 2D21A 5AA4A 1N7XA 5I2NB 1SVXB 2DE2A 5CMCA 3T22A 3S9MC 2VP1A 4JB7A 5AA4B 4RA1A 2Z8DA 2B65A 3N5LA 5TPAB 3VV5A 5H8FA 4L17A 4H0WA 2O7UA 4AQ4A 4RK9A 4R72A 3PPNA 3H03A 4JWOA 4O3BA 3M8UA 4GXSB 2GRVA 3G3FA 5JK4A 1OVTA 3SETA 4ISUA 3K6VA 4THIA 3FVNA 3D4CA 3UORA 1H76A 4G68C 1EZ9A 1FQAA 2DOJA 1BIYA 2YLNA 2Y7PA 1IXIA 4H5FA 2Q8JA 3TTMA 2GH9A 2ZNTA 3B7DA 1B3FA 5L9SA 4OVJA 5J1DA 3EHUA 1F9BA 1MY3A 4DDDA 4XTCQ 4FECA 1A54A 4X9TA 1MPBA 3U1OA 4QHQA 2B3FA 3S4UA 5DT6A 1S7YA 2XXHA 5EHMA 1SI1A 1QULA 5B7DA 2ABHA 2THIA 1FQCA 5H8QB 4MLVA 4BDNA 1MXYA 1R9LA 3MPKA 1NMUA 1MRPA 4PFTA 2XD3A 1JW4A 3MP6A 4I62A 3O6IA 3T9HB 1CE2A 1ELJA 4G4PA 5ITPA 3KBRA 1QW0A 2P1SA 1O63A 4TOZA 1WVJA 4KCCA 4KHZE 3EF7A 2DE4A 4N6PA 1EU8A 4DLDA 3S9EA 3IOUA 1JETA 2I3VA 4MH5A 3MVWA 3MBPA 2UVIA 1IUDA 5IKBA 4ZEKA 1H44A 3O2AA 3KSJA 1B5IA 2F97A 4I1DA 1JEUA 1XHYA 1SW1A 4YMAA 3OO7A 2FYIA 2RCAA 1FW0A 3O6GA 1P99A 3CR9A 3OENA 3Q27A 1MQIA 3RLFE 4X1BA 3PUVE 4EF1A 5I59A 1Y3NA 3FJGA 3ILTB 2DXYA 4ESWA 3H06B 1B51A 3SEYA 1AL3A 4X1DA 1QUJA 3Q26A 1LFGA 2O69A 1EZOA 4IY5A 4OHNA 3R26A 1B1HA 1BTJA 3K2DA 1LAFE 1MS7A 1B3HA 1IITA 1NNPA 4XIGQ 3VXBA 2OLBA 5DYHA 4BDLA 1N84A 2NUVA 4IO5A 3MW0A 1JEVA 3PPPA 5L8DA 3KN7A 4DXUA 1LBBA 3JZJA 2XD2A 2QPQA 5AA2D 1POY1 5EYFA 1JW1A 3ZS6A 1S50A 4H65A 4OERA 1PB9A 4ELRA 2W7YA 5CMBA 2DS9A 3VVDA 1VFDA 4G68B 4YZZA 4YB7A 4NE4A 5AA3A 1LB9A 3C34A 2UYEA 1ZIUA 5CMKA 2M8CA 1LGBC 2V93A 3SEWA 3K00A 4YICA 4WEPA 4U23A 2DWIA 4U4XA 1P1QA 1GVCA 3K1MA 1MQDA 4FJPA 3TZAA 4XKQA 2AL5A 2QMXA 3RT6B 1ATGA 4R9FA 3KFMA 1USYH 2V25A 4QF9A 2Z22A 4ELOA 1NNFA 5DEXB 3IB0A 2Y7RA 4ECFA 2DP8A 3O29A 1OQGA 1DOTA 4KI0E 3CFZA 4DXCA 2Q2AA 3FD3A 3FGSA 1HSEA 3I5OA 2GHAA 3D4GA 3F11A 1URGA 3KN3A 3R7XA 4OYVA 1ZKBA 4POWA 4ELQA 4JDFA 3TFLA 3N6TA 3HPIA 1AOVA 1N3WA 2I6EA 4AB5A 1B05A 4NTLA 3H4ZA 4FATA 3OSQA 2NXOA 4GIZA 3S9NC 1MM7A 1AH5A 1B7HA 2XXXA 1B46A 5FTIA 2ZMBA 1M5DA 3Q25A 3FV2A 1MXZA 4P11A 4M4GA 4F31B 3RN8A 4ND9A 1J1NA 1NFTA 3TPAA 4F2OA 1DPEA 4IO4A 2ONRA 1LAHE 1AMFA 4I8CA 3C33A 3TTRA 2LAOA 2HZLA 3HV1A 2DWHA 3VXCA 3EN3A 2YPNA 5I58A 3JYRA 2RINA 3VFJA 2YJPA 1QUKA 1PB7A 4NF8B 4F18A 1PC3A 1I6QA 1GTKA 4R73A 1JW5A 2P2AA 3E13X 3MC2A 3OMBA 2Q9TA 4OXVA 1BP5A 4JBZA 1LSTA 3C9HA 1IXHA 4H8JA 3PUXE 3E4RA 4QFOA 2H9BA 1SBPA 2QS4A 1N04A 2ZYOA 1XS5A 2UVGA 1M5CA 3ZKLA 3VLUA 1B2HA 2DWJA 3TCFA 4F22A 2DVCA 2OWSA 3VLWA 3OEMA 1URSA 4F3SA 2ZYMA 2A5TB 3MAMA 4KR5A 4Q30B 3FVKA 1ZBMA 3HO7A 2NOOA 3H6WA 1B5HA 5L9MA 5LOMA 2O1LA 4ZEFA 3I6VA 4RYAA 4U1ZA 3GZGA 4F3PA 1US4A 1H45A 4OESA 3H6TA 3B6QA 3VDFA 2VOZA 4QFPA 3BKIB 3L6GA 3E9XA 4LVQA 4NF6B 3T9VA 3CFXA 3EHSA 2HXWA 4R75A 1D9VA 5TP9A 1IQ7A 1P1OA 2PVUA 3MZBA 4LZ5A 3C35A 3UGWA 4QRZA 4F1VA 1MH4A 1B4ZA 5KCJA 1UTHA 4EF2A 1XT8A 1OIBA 4JSOA 3IOWA 5H8HA 4PETA 5TU0A 4WXJA 3FVOA 5H8NA 1QVSA 3Q29A 1VFEA 1YCJA 3CVGA 1FTLA 1LLSA 3T66A 2XXVA 3FJMA 3TUSA 4LZ7A 4F1YA 3G3HA 3PD8A 5H8FB 3TTKA 2DXRA 3RUMA 1SYIA 3PPQA 3CG1A 1B0LA 3C31A 3K4UA 4XXUA 3OO9A 1SI0A 1IXGA 4ZE8A 4UACA 2FA7A 1D4NA 2XXYA 1VSOA 2DWAA 3N6UA 3LSWA 3AXFA 2F7AA 2CZLA 2PBWA 2Y7WA 4HW8A 1LBCA 2ZYKA 4KCDA 3OOAA 2RC7A 1KWHA 1YPNA 3IOTA 2RC9A 4NWCA 3SESA 2RCBA 4RNSA 3FXQA 3Q28A 4E0XA 4U4SA 5M2VA 1A8FA 1UIVA 5EHSA 4GFRA 3O9PA 2X7QA 1SW2A 1MY2A 4HS7A 4NF5A 2QSXA 3HHFA 3EQ1A 4M1VA 1I6BA 3OD7A 1POTA 5CM6A 3O28A 3DP8A 3OO6A 1IZ1A 4NF5B 1FQBA 5I57A 4H8IA 1DSNA 3MPLA 3PMXA 4QSDA 1Y1MA 4YKJA 4DXBA 3PPRA 2VD3A 3HCQA 2PX1A 4KQPA 4OEVA 2OK2A 4F3GA 4F2QA 2NVUB 3IK6B 3TTNA 1VE4A 3LC8A 2Y84A 3OEKA 1D9YA 4ONYA 4ZDMA 4P0GA 4R74A 5AA2A 3M3LA 3SDFA 5FTHA 3CRBA 4NWDA 3OO8A 1QKAA 1US5A 1MDP1 3V89B 1Z7NE 5JTYA 4NMYA 4FEBA 1LCTA 1MG1A 5H8SA 1P1NA 1PEBA 3TYHA 5I2KA 1MM6A 4MFIA 5I59B 3MZ1A 2OJTA 4IO3A 5I2KB 3TCGA 3H6UA 1Y4TA 1YTVA 3VVEA 4R6KA 1A55A 3H7MA 3O66A 1SDXA 2E1SA 1EH3A 5JEIA 4R6HA 3QIMA 2O68A 5I56A 2ONSA 3OSRA 3MUQA 1ZU0A 3IORA 4DCXA 2GFEA 4ZEIA 4DIGA 1HSLA 3LSFB 3IAZA 3IOVA 1MXWA 4G8HA 1UTBA 2D5WA 5K2XA 4C0RA 5CC2A 3PGFA 4X48A 3R6UA 1OLCA 1PB8A 2F6PA 3C4MA 3HHGA 2UXAA 2DSFA 2ZXTA 1CB6A 3EPEA 1AIVA 4EQ7A 4EQ9A 4G77A 1URDA 4BDMA 2OBGA 5DVIA 5BWJA 3G7WA 1DTGA 2DE3A 2PT2A 4RK2A 2Z8EA 2VHAA 1H43A 4RJZA 2H5YA 4MLQA 2F7BA 4MF3A 4RXLA 3BBRA 2VD2A 2BJJX 4LQ2A 4KYDA 1TFDA 3LR1A 1B3EA 2B3BA 1B6HA 4LP2B 3FIRA 1RYOA 4LONB 1B7UA 3TKDA 3QSLA 2D3IA 5KDTA 2HAUA 3BFTA 2AYSA 4F39A 2ZNUA 3PMWA 4KYEA 4O3AA 3HN0A 3MVZA 3G3GA 2ZNSA 5HBCA 3U72A 4U1OA 3FATA 1OQHA 2F8DA 5IAIA 5AE4A 3VE1B 3ILUB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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