2CMOA

The structure of a mixed glur2 ligand-binding core dimer in complex with (s)-glutamate and the antagonist (s)-ns1209
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The Structure of a Mixed Glur2 Ligand-Binding Core Dimer in Complex with (S)-Glutamate and the Antagonist (S)-Ns1209.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ion channel
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
total genus 77
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-05-11
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2cmoA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2cmoA02
1B3GA 1L5TA 3R7XA 1PC3A 4EQ7A 3FZVA 3PGFA 5DEXB 3S9LC 3EQ1A 3PUXE 3A09A 2GHBA 3OENA 4IGTA 2NOOA 1DPEA 1A40A 1GTKA 4F31B 1B58A 2O68A 3VV5A 5CMCA 5CI5A 1FQEA 4LA9A 1JEVA 4R6HA 3T93B 1UTHB 5I56A 2ANJA 3TMGA 4F3PA 3T9VA 2I0CA 3TODA 5J1DA 3K1PA 3OSRA 4PP0A 3N94A 3ZKLA 3FVKA 2GH9A 5KZTA 3PU5A 3IJXB 1II5A 1MH4A 4G68B 1TWYA 4F2QA 3CFLA 1DTGA 5EHSA 4F18A 4Z7EA 3TUSA 2UYFA 3Q27A 4QHQA 1MQDA 2CMOA 3E9XA 4YU0A 1ZKBA 2H4IA 3IAZA 2XXTA 3VVEA 2Y7KA 4BDRA 5DTBA 1HSLA 4F2OA 1SD3A 4KCCA 3O66A 3FASA 3HO7A 4LUBA 3FJ7A 4XXUA 1LCFA 1FQCA 1MM7A 2ZYKA 4OMBA 1XVYA 5AA4B 2QSXA 2B3FA 5JTYA 4QFPA 1B40A 3PUWE 2H25A 3MVZA 5CMMA 4U4XA 2XXVA 4ZECA 4E0XA 4LZ5A 1MY4A 3B6WA 1R9QA 4OWDA 3K6WA 3LR1A 3TCGA 1S50A 3FVGA 1PEBA 3PUZE 5I57A 1LBCA 1A54A 3SESA 2DOJA 2WKYA 4MBPA 4QSDA 5FTIA 1B46A 4ONYA 1IQ7A 3SERA 1I69A 2DXYA 4FIMA 4GXSB 2DWJA 4YKJA 3C34A 4JWYA 4KCDA 1Y20A 1MXUA 4BDMA 1JEUA 2PBWA 2RF1A 3K1NA 4IB2A 4RYAA 2XXWA 3SEWA 3KGCA 3PD9A 3BBRA 4G68C 1UQWA 1GR2A 2ZNUA 1M5CA 2XX9A 3TELA 1NL5A 1B7ZA 2Y7PA 3KOTA 2OWSA 4PQJA 3KSXA 2H9BA 4OHNA 4H65A 1PDAA 2NVUB 3MP8A 2AL5A 4U22A 4HW8A 1RYXA 4DXCA 1YAEA 3UP9A 2Y84A 3HHFA 4LVQA 1NH7A 1VE4A 1O7TA 3CFXA 1BP5A 2F78A 1LCTA 1LFGA 5CBSA 2REJA 1Y9UA 4DE8A 2Q89A 5JTYB 4R2FA 4DXBA 5DVJA 1N0TA 2VD3A 4I9DA 2DWAA 1YTVA 3MPKA 3TYHA 1H3DA 2Q88A 4Q8RA 1M5BA 4U4SA 3GLBA 1Z7NE 3U8QA 5JK4A 3EF7A 3MVYA 4UACA 3ILUB 5ELVA 3I5OA 2F5XA 3CG1A 4POXA 4G8MA 4IO6A 1B4ZA 1URSA 2VHAA 1TFAA 3FJMA 1QW0A 2QS3A 3S2VA 3RN8A 3IR1A 3PMWA 2ZNTA 4E0WA 5CMBA 4IY5A 4JXIA 1FTJA 4C1UA 3H7MA 4AB6A 4F3GA 3HCQA 4NMYA 2PX1A 1B0LA 3LSFB 4FORA 3TTKA 1SQYA 1MXWA 3FV1A 2Q2AA 2XX8A 4R2BA 2QJEA 1PB7A 4ZEBA 2Q2CA 1MM6A 2ONSA 4JSDA 3K6XA 3HHGA 3VXCA 2V25A 3PUVE 4H8IA 3FVOA 1R9LA 4ND9A 3IL1B 4OEVA 4P0GA 1O63A 3IO4A 2XXXA 2Z8DA 2QS4A 3VVDA 4YKPA 4YMBA 3PPRA 2VOZA 2GHAA 3W9WA 4LQ5A 4G4PA 3F11A 1URDA 2XXIA 3FVNA 1XS5A 2X7QA 4H5FA 2H98A 4DDDA 1ZLQA 2YPNA 4M1VA 1US5A 1WODA 4R9GA 3RTFB 1JVXA 2YLNA 4AB5A 1B5IA 3IOVA 4Q0CA 3USDA 4MH5A 1N84A 1LAFE 2QMWA 3WAFA 5DEXA 4JBZA 1DPPA 1SI1A 1B1XA 3RLFE 4LZ8A 2O1MA 5HBCA 4QRZA 3WAEA 4JDFA 1ANFA 4OETA 1FCKA 5EYFA 2DVCA 3O6HA 4X1DA 1S7YA 1LBBA 2DE3A 1SW5A 5ISUA 5K2YA 4FEBA 1MPCA 1R1NA 4O3BA 3B6QA 1MY1A 3O9PA 4GOTA 3L6GA 4WEPA 3MVWA 1SYHA 2DP8A 1GV8A 4G68A 4JB7A 5CBRA 4QFLA 4JSOA 4IY6A 2F6GA 4RA1A 3QAXA 3LUYA 2I49A 1DSNA 2F35A 4ZS9A 1UTBB 4GLIA 3MBPA 1S9TA 2UVGA 4XKNA 1SBPA 1LB8A 5H8QB 2HCAA 3C35A 5ITOA 3IORA 1O64A 5HM4B 3QUJA 2F7BA 2O6AA 2Z8EA 4R73A 5AA4A 2ABHA 3JYRA 1XVXA 4WXJA 4C0RA 1JW4A 4GRKA 4L17A 2H99A 4GFRA 4GIZA 1IIWA 2CZLA 4BLAA 3ZS6A 3FUZA 4GXAA 1JETA 5I59B 3S4UA 3E13X 1B1HA 4AQ4A 3DP4A 3QK6A 1QVSA 1SI0A 3N26A 5A5XB 4H6DA 3E3KA 1OLAA 1N3XA 3G3KA 1XOCA 3H6UA 4YKIA 1JQFA 3U92A 4TQUQ 3OO8A 3KJTA 3TAJA 3G3JA 2XXUA 1B7HA 1TXFA 1DTZA 4ZE8A 1ZBMA 3TFLA 3HN0A 2P1SA 5H8NB 4EQ9A 2XXPA 3MJNA 2XXQA 3ODBA 2UVIA 1NH8A 4H5GA 1MQIA 4KHZE 3T9XB 2AYSA 3KZGA 2Y7IA 3PPOA 3ZSFA 1VFEA 1D9VA 3IOTA 3CR9A 1PBPA 1OIBA 3FJGA 2I3VA 4EF1A 3CSBA 1Y1ZA 1I6QA 1PB9A 3R26A 1T0KA 3BFUA 4YB5A 1PBQA 1YCJA 3VLWA 3B7DA 1LAGE 1LSTA 2DSFA 3S9EA 4BDOA 3G3HA 3G3IA 5TPAB 1MPBA 1DOTA 3CSGA 2HQ0A 1QUKA 1I6AA 4KFQA 3BKIB 3TCHA 4R72A 5ICTA 1B4HA 1B9JA 2XD2A 4JWXA 3M8UA 1USYH 3OELA 1AOVA 4O3AA 1B3FA 4FE8A 2QL3A 4R9FA 4PFYA 3TDJA 1GGGA 3FV2A 4O3CA 2O1LA 1P1NA 4IO2A 2RCAA 4F3SA 4TLLB 3TCFA 5L9OA 2Y7RA 2Q9TA 5H8HB 1KWHA 2ONRA 3KBRA 4RXLA 4MLQA 4RPNA 4F1YA 5EHMA 3SEUA 3IJOB 3O28A 3KOSA 1P1OA 1BTJA 3K6VA 4KQPA 2OK2A 2THIA 3FXQA 2RC8A 2YJPA 4F1VA 4OYVA 4FECA 2PT1A 2Y7WA 2AIXA 4G8NA 5K2XA 2I6EA 3MUQA 1PB8A 2Z8FA 3VFJA 2XHDA 5B70A 1EZPA 3THIA 4NF8B 4OTEA 5KDTB 4IO4A 3KN3A 4UA8A 1MXXA 2UVJA 3VVFA 3TQWA 3RT6B 2VGQA 5IAIA 3PMVA 1Z7ME 3CIJA 4FJPA 4OXVA 1NKXA 5L9SA 3G7WA 4BDLA 5HPQA 1B5HA 3GBBA 2H5YA 3MP1A 4G2ZA 4WEDA 1USYE 1Y3PA 3V83A 3KN7A 2E1SA 1B05A 5B7DA 5ITPA 1FTLA 2I58A 4XIGQ 2Q8JA 5ICQA 2AL4A 4IO5A 4OERA 4PE5B 4ZEKA 3DP6A 2PVUA 1QKAA 5FHOA 2OJTA 4F3BA 1D3KA 2FNCA 3RY3A 3E4RA 5TP9B 5IKBA 4QF9A 4N07A 4ELOA 3R6UA 4FEDA 3IK6B 3RGYA 3IX1A 1F9BA 5I84A 4NF6A 4THIA 3VE1B 3H06B 1WDNA 3UA8A 4ZZAA 4LZ7A 3QIMA 4F19A 3QSLA 3C36A 3TTRA 1IXCA 3EN3A 1MQJA 1B3HA 5KCJA 4EQBA 3FXRA 3MP6A 5I2NB 4MLVA 4BDQA 3CG3A 2HEUA 3OO7A 4OFLA 3JV9A 3KFMA 3G3FA 1SYIA 2DXRA 3U1OA 4NWCA 3UIFA 2A5TB 3VDFA 2O69A 1Q1KA 4QSEA 1QUJA 3RT8A 1OMPA 2RINA 4NF5B 1LB9A 1N76A 4NTLA 1UTBA 1IXIA 3OEMA 3EPEA 2V3UA 3OOAA 2RC7A 3H6VA 3RQTA 4YKKA 3U72A 3O6IA 5H8QA 2BJJX 5I58B 1Y3NA 3MPLA 2G29A 1MH3A 1NFTA 5H8SA 2Z22A 3RPWA 2V93A 4H0WA 3H4ZA 3Q25A 2UXAA 2DVZA 3DP8A 1FQBA 4ZEIA 4EDPA 1Y1MA 4N13A 1NNPA 4R74A 3TTNA 1CB6A 3MVXA 1SW1A 1FW0A 4KD5A 1LGBC 3IB0A 2RC9A 3FIRA 2M8CA 3A3UA 2ONKE 1OQHA 2DS9A 3CVGA 3H3GA 1EZOA 2QMXA 4OQOA 3SEXA 5I59A 1IXGA 4C1TA 1JVYA 5H8FB 4G77A 5A5XA 2NUVA 4NF6B 3D4GA 1IZ1A 1US4A 4KI0E 2Z23A 1FTOA 2HZLA 4ELPA 3CRBA 1VSOA 2ESNA 2HAVA 1SDXA 2QPQA 1A55A 3A3CA 4HCYA 5H8NA 4OZ9A 5KCJB 3K0VA 3HPIA 4KYEA 1Y4CA 3IO6A 1Y3QA 2R71A 4GL0A 5AA2D 1JW1A 4POWA 2D3IA 2I4BA 4I8CA 2UYEA 3PV0E 3FGSA 5TU0A 1NNTA 3C9HA 2X7PA 1ATGA 2I48A 3K00A 4JWOA 2DE2A 1FTMA 4R6KA 4NEDA 4QSCA 2E0SA 1FQDA 3TZAA 3N6TA 1MS7A 4KPTA 4U1ZA 5TPAA 2R9JA 3LSLA 2QRYA 4PFTA 3O6GA 1LFHA 4TOZA 5L8DA 3QYTA 3IB1A 2V3QA 1MY2A 3RNNA 2OZZA 4GVOA 4EXKA 2F7AA 4X48A 3MAMA 3MQ9A 4OVJA 4DZ1A 3K4UA 4RY1A 2REGA 1H76A 4EXLA 3GZGA 3PPNA 1P1WA 3I3VA 4YICA 3N6UA 1MY3A 3Q29A 2O84X 3Q28A 1FTKA 3PPQA 4P0IA 1RYOA 1LAXA 3OO9A 4NF4B 3L6HA 5F1QA 3LSXA 3KJ7A 1SVXB 1ZJLA 1FQAA 1N7XA 5H8HA 3IOWA 5DT6A 1WVJA 3S9MC 3KG2A 3K02A 5AA1A 1A8EA 5FTHA 2UVHA 4FATA 3M3KA 3EHTA 3ONMA 5L9MA 4K3FA 1MPDA 3JZJA 1B7UA 4G8HA 2QS1A 2I3WA 1MDQA 3TKDA 3GXAA 1URGA 2OCUA 5BWJA 5DVIA 4RK9A 4OENA 4H1XA 1N3WA 2FYIA 3DLNA 1AMFA 4I1DA 3C4MA 1AH5A 1NNKA 2F34A 3C31A 4R6YA 5BUUA 5DYHA 3ECRA 4NF8A 3TEPA 5KDTA 4F29A 4ZE9A 1VR5A 3CFZA 3TPAA 4OFJA 4R75A 3FXUA 4U21A 5CMKA 4X1BA 1I6BA 4EF2A 4OFOA 2O7UA 4FAJA 3MC2A 3LSWA 2A5SA 3UK4A 1IITA 2PMSA 1B3LA 1M5FA 3O29A 4F39A 3W15C 3C33A 1MY0A 3QXMA 4F22A 3EHSA 5I2KB 2RKMA 2V84A 2F8DA 1EZ9A 4GWOA 3TTLA 1QKBA 5AA2B 1LAHE 3MZ9A 3P7IA 4NWDA 4DLDA 3K1MA 1UIUA 3H6WA 2ZYMA 2O51A 1XT8A 3FD3A 4ZEFA 3TTMA 3M3FA 3DM0A 1J1NA 3I6VA 1N04A 2NXOA 2F7CA 5TP9A 3IOUA 5LOMA 2HFBA 2HAUA 2D21A 4U1OA 1D9YA 1IXHA 3LBSA 1IUDA 3U94A 3OXNA 4YMAA 4XKPA 4RK2A 1XC1A 3OEKA 1Y4TA 4LATA 1HSEA 2IEEA 5I56B 4MF3A 3RUMA 1NNFA 3SETA 3AXFA 3N5LA 5I2NA 4OEUA 4ELRA 2R6GE 4PFUA 2XX7A 4I62A 1MDP1 2DQVA 4ZEDA 1MXZA 1MXVA 4GQOA 3ILTB 2P2AA 2A5TA 1TT1A 4YZZA 4PFWA 1JNFA 3T9UA 4NF5A 2O7IA 1XHYA 2IA4A 3PD8A 2GRVA 4ESXA 2ZYOA 3OSQA 3GBAA 3CI8A 5I58A 4XKQA 2XXYA 3KSJA 2I4CA 1SW4A 2X26A 1B6HA 1MQGA 4KR5A 4ESWA 5CC2A 3DELB 2D5WA 3MZBA 4X9TA 3MZ1A 1P99A 2HZKA 4ISUA 1B52A 1A8FA 4GD5A 3HV1A 1OVTA 4LQ2A 4HCWA 1MRPA 4RNSA 4HTGA 3SEYA 1EU8A 3FATA 3RTWB 2DE4A 3V8XB 4N6PA 3KEIA 1QULA 1YPNA 4QFNA 1QJMA 3G3GA 2B3BA 4OESA 4DIGA 3T66A 4DXUA 1A99A 1NMUA 3UORA 5H8FA 4P11A 3UGWA 4QFOA 3V5AA 1CE2A 4Q5TA 4KYSA 4WKMA 4PETA 2KLFA 3MWBA 5I57B 1ELJA 4Q30B 2PYYA 5JEIA 2ZYNA 1BIYA 1ZMGA 3OD7A 3C32A 3W9VA 1M5DA 5CRYA 3VLUA 4EUOA 4IO7A 1GVCA 3LC8A 4DCXA 4Z0IA 1QUIA 4IGRA 4XTCQ 3T9HB 3MW0A 1OQGA 1HSJA 1OLCA 5DVFA 4U2RA 1ZTYA 1H44A 3KN8A 3PUYE 4F1UA 3O2AA 3B6TA 1SW2A 2B65A 3OMBA 2HXWA 4U23A 5M2VA 1M5EA 3QUFA 1LLSA 1B51A 1P1QA 4HS7A 4LONB 1A7LA 5FHNA 4DCYA 2OBGA 2F97A 1UIVA 3K6UA 3M3LA 1AL3A 1VFDA 3U93A 2ZXTA 1AIVA 4MFIA 2LAOA 1B3EA 5CM6A 2F36A 1B2HA 4H67A 3V89B 4NE4A 2F6PA 2OLBA 3VLVA 3EHUA 3VXBA 1MXYA 4NF4A 3ZKKA 3SKPA 2DWHA 4IO3A 2VD2A 1N7WA 1TFDA 1D4NA 3HSTA 4GF8A 1MQHA 2ZMBA 3UN6A 1ZIUA 3H6TA 2PT2A 1B0HA 2XXHA 1POTA 1UTHA 2QS2A 2NWJA 3PPPA 3TQLA 1H45A 4RJZA 2ALUA 1RKMA 4YAHX 2G93A 1DMBA 5AE4A 3T96B 1R6ZA 1JW5A 1BLFA 4LP2B 1OVBA 4ECFA 3OO6A 1IEJA 1ZU0A 4KYDA 3SEVA 1B32A 3Q26A 2DWIA 2ZNSA 4YB6A 1MG1A 1P1UA 3S9NC 2FA7A 2I0BA 3BFTA 5AA3A 2W7YA 4H8JA 1H43A 4TLMB 5F7VA 2DYXA 4ZZEA 3T22A 5FHMA 4BDNA 5I2KA 2VP1A 1B5JA 3K01A 3K2DA 3PMXA 3SDFA 1POY1 3IB2A 5AA2A 2RCBA 2GFEA 4GL8A 4QFKA 1BKAA 2XD3A 4YB7A 4RPOA 2P0SA 2V3TA 4XKRA 1LFIA 1EH3A 3D4CA 3H03A 1FQFA 4ZDMA 4ELQA 2OWTA 2XXRA 1Q35A 4M4GA 3O97A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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