2CMOA

The structure of a mixed glur2 ligand-binding core dimer in complex with (s)-glutamate and the antagonist (s)-ns1209
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The Structure of a Mixed Glur2 Ligand-Binding Core Dimer in Complex with (S)-Glutamate and the Antagonist (S)-Ns1209.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
molecule tags Ion channel
source organism Rattus norvegicus
total genus 77
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-05-11
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2cmoA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2cmoA02
4DCXA 1N0TA 3KJTA 5H8FA 4OEVA 1H43A 1D9YA 3JZJA 1LCTA 4Z0IA 5BWJA 1FQAA 5ITPA 2DWJA 3CSGA 5DVIA 5I84A 4QSDA 1SQYA 1MXYA 2XX7A 1WDNA 2V93A 2VOZA 1Y3NA 2O7IA 3W9VA 1GTKA 4EQBA 4F19A 4F1YA 2X7PA 1B3GA 2ZNTA 2G29A 4LONB 4Q8RA 1URSA 3PMWA 4U2RA 3UORA 1SDXA 3PPNA 2VGQA 4E0WA 3OD7A 1IXGA 2Y7RA 3RNNA 1II5A 2O68A 2F34A 4QFNA 4RK2A 4U1OA 3A3CA 4PE5B 3PGFA 4ZEKA 2VD3A 1XC1A 3O2AA 3VDFA 4IGTA 3G3JA 4R2FA 1MRPA 3RTWB 3FV1A 1N7XA 1B5IA 4RY1A 3U93A 5CRYA 3MUQA 1MQGA 3ZKKA 2FNCA 4F3SA 2HEUA 1M5EA 2CMOA 1URGA 3SKPA 2PX1A 2F6GA 4HS7A 4IO7A 3IK6B 5AA4A 1QUKA 2QMXA 3CSBA 3OOAA 3BKIB 1USYE 2ZYOA 4DXUA 3KFMA 1MS7A 4RPOA 2QS2A 1D3KA 4HCYA 1ZJLA 1Y4CA 5I2KB 3TQLA 3KOTA 3OMBA 2OWSA 3I6VA 1Y3QA 1ELJA 4Q5TA 3VE1B 3U8QA 1IXIA 1LFIA 3UA8A 2E0SA 4DIGA 2B3BA 3KOSA 1DPPA 3MZ9A 4R2BA 3B6WA 1SYHA 2F7AA 1JW4A 3VXBA 3IB0A 5TU0A 3H6TA 4QFOA 1JVXA 2UYEA 3ODBA 1AH5A 3N5LA 4OWDA 1LFHA 3C4MA 1B3LA 1JW1A 4YB5A 3RLFE 4F2OA 3OENA 1PBQA 3SERA 2QRYA 3R26A 4NF8B 4XKRA 3CG1A 1B05A 1ATGA 1MH3A 5I57B 4R72A 4BLAA 3SETA 4ZE9A 2H4IA 2E1SA 2I0BA 3MJNA 4EDPA 3LR1A 3Q27A 4QF9A 2GH9A 3IO6A 2F7CA 2YPNA 4RK9A 3HV1A 2OJTA 2VD2A 3KBRA 1B5HA 1NH8A 1QKAA 5I59A 3VVEA 4YMAA 5ISUA 1Y3PA 2XX8A 5H8HA 5F1QA 3H6WA 2DS9A 2HZKA 2DYXA 1R1NA 5L9SA 1NKXA 3H4ZA 2HZLA 1HSJA 1LB8A 4NF6A 3FIRA 3SDFA 3LSLA 3M3FA 3N94A 1PBPA 2NVUB 1Y20A 2O51A 4R6YA 3V83A 5AA2D 1B58A 4GLIA 4N6PA 3PD9A 1FTJA 2VP1A 1Y1ZA 1DPEA 1QULA 3RUMA 3OO9A 1POTA 3PUVE 5DTBA 2QPQA 1SW4A 1NH7A 3O6IA 2FA7A 3TZAA 2XXVA 1I69A 1SW5A 4R75A 4KR5A 5ICQA 3HN0A 3PUXE 3K01A 2ESNA 2Z23A 3C33A 4MLVA 2AL4A 1XVXA 5CM6A 4KCCA 1M5DA 1UTBB 2Y84A 1FCKA 4C0RA 2O1MA 2ONKE 3HHFA 2AL5A 1BLFA 5B70A 4IO5A 3FXUA 3MVYA 1B7ZA 3OSRA 4ZECA 1ZIUA 1B9JA 1QJMA 2QS1A 4GVOA 3MW0A 1QKBA 5A5XB 5I56A 4OZ9A 5TPAB 4JXIA 1DSNA 2VHAA 3IJXB 2QS3A 4OFLA 3Q25A 4TLLB 3FVOA 4R73A 4IB2A 1SW1A 1LAGE 3Q29A 4QRZA 4EF2A 2Z8FA 4BDQA 5CI5A 1ZLQA 3HHGA 2I48A 3K6XA 2DXRA 3B6TA 1B7HA 3PPRA 3PD8A 2HCAA 4LATA 4MBPA 4ND9A 4JWYA 4EUOA 4WEDA 5BUUA 4FEDA 5CBSA 3LBSA 1SVXB 1HSLA 3VLWA 4X48A 4FEBA 1US4A 3U92A 4RPNA 4AQ4A 2F7BA 4GD5A 3KSXA 2O84X 3IB2A 5DEXA 4KHZE 1L5TA 3O28A 4EQ9A 4TQUQ 3MVWA 4BDOA 3FUZA 3RQTA 3MC2A 3TTNA 2RCAA 5KCJA 3JV9A 2A5TB 5ITOA 4PETA 4GQOA 4YKJA 1POY1 5ICTA 2PT2A 4G4PA 4OQOA 2H98A 1JNFA 2R71A 4NTLA 2XHDA 1ZU0A 4DCYA 3FGSA 5CBRA 2I3VA 3DP4A 2LAOA 1FTOA 4N13A 1EZ9A 4MF3A 3CI8A 3RGYA 1GGGA 4F22A 2PBWA 1MY1A 4X1DA 3I5OA 1JETA 1OIBA 1EH3A 1LBCA 4O3BA 2OBGA 4BDLA 2AYSA 3K1MA 2YJPA 3L6GA 3MPLA 1PB7A 4F3PA 4XTCQ 1Q35A 4MLQA 3UGWA 2QL3A 3SEXA 3SEUA 3GXAA 2UVHA 4FORA 3EHTA 2XXQA 2UXAA 3GBBA 4LA9A 1O7TA 1IEJA 3FZVA 4PQJA 2FYIA 4YKKA 4JBZA 1TXFA 1NMUA 1MPDA 1B7UA 3MVXA 4QHQA 4LZ8A 4THIA 1UIVA 3ONMA 3KN3A 4ELOA 2OWTA 1R9LA 4L17A 4OESA 1LB9A 4GXSB 5H8SA 3PMVA 4X1BA 1EZPA 1I6BA 1B46A 4EF1A 4KI0E 1XHYA 2XD3A 3DP6A 3TUSA 1JEUA 3UK4A 1IZ1A 4DE8A 3E3KA 1LAFE 5H8FB 5JTYA 5JEIA 3DM0A 3T96B 2P0SA 4PFUA 2F6PA 1MY2A 4ELRA 1B52A 1MDP1 1PEBA 3EN3A 2OZZA 3G3KA 3UN6A 3S9NC 2DWHA 3MWBA 2DVZA 2DSFA 1UTHA 2X26A 4IY6A 1RYXA 3IJOB 3CR9A 1M5BA 5FHNA 4XKPA 1XOCA 4ECFA 4R74A 1MQDA 3GBAA 4NF4A 3IX1A 3QUFA 4AB6A 3PU5A 3FXRA 3C36A 3FVKA 5FHMA 3SEWA 3CG3A 5I2KA 4GL0A 2D21A 3TQWA 3QIMA 3P7IA 4C1UA 1MH4A 3B7DA 1ZBMA 5AA4B 1OVBA 3MZ1A 3K6VA 4GOTA 3THIA 1B5JA 2Q2CA 4NWCA 1ANFA 5AA2A 1QUIA 5B7DA 4GIZA 5I58A 4JSDA 1OVTA 1EZOA 3T22A 1P1WA 1CB6A 3LC8A 4DDDA 1XVYA 1JEVA 4FECA 1MG1A 1LCFA 4NWDA 1SBPA 1MM7A 2PT1A 4YKIA 2B3FA 4FAJA 2DE4A 1Y1MA 1LFGA 1BIYA 4G8HA 4GF8A 4IO2A 1NNKA 3MPKA 2QS4A 1B1XA 2RCBA 1MXXA 4WKMA 2V25A 4GL8A 2F97A 3SEVA 3VLUA 1SYIA 4ONYA 2I49A 4M1VA 3S9MC 1P99A 2DVCA 4H67A 2I4CA 3VV5A 4GWOA 1FQCA 1SI1A 3TTRA 3TTLA 3VXCA 3S9EA 2NXOA 2V3TA 4FIMA 3UP9A 4RJZA 3TMGA 3HSTA 5DYHA 5H8QA 3E13X 3U72A 1N84A 3W15C 3TELA 4G68C 3DP8A 1GV8A 5I59B 4ZZAA 4YKPA 3VVFA 4O3AA 1OLAA 1TFDA 5H8HB 3FV2A 3K00A 3MAMA 2RC7A 3KZGA 1MPCA 3Q26A 5KDTA 1GVCA 4G8MA 2RKMA 1WODA 4NF6B 4EXLA 2RINA 2THIA 5JK4A 2RC8A 5CMCA 1A7LA 1QW0A 4H0WA 4I8CA 4DLDA 3C34A 1B0HA 4OHNA 1ZKBA 3IOUA 1P1QA 2UYFA 4R6KA 2I0CA 1H44A 2ONRA 4NF5A 1WVJA 1RKMA 1OMPA 1N76A 4U4XA 3C9HA 1PB9A 4P11A 4I9DA 3O6GA 1MM6A 3A3UA 1FQEA 3PUYE 3O6HA 3O29A 1JQFA 4FE8A 4DXBA 2DQVA 3RN8A 1Z7NE 2F36A 1B32A 1NNTA 5H8NB 3G3GA 3S4UA 2Z8DA 3QUJA 2UVIA 4PFWA 3K1NA 2UVGA 3ZKLA 3T93B 2REGA 2GHBA 1DTZA 3M8UA 3K4UA 5TP9A 2ZMBA 2REJA 1CE2A 3T9HB 2XXTA 2ZXTA 2RC9A 3E9XA 3PUWE 2P2AA 1FTKA 1NNPA 1Y4TA 4ZE8A 2R9JA 1B0LA 2DXYA 1HSEA 2HFBA 4Q0CA 3TODA 4MH5A 5DT6A 3TTKA 4YMBA 4RNSA 2XXYA 5I56B 2QJEA 4H5GA 1IXCA 2F8DA 4U21A 4R6HA 2XXIA 1M5FA 4Q30B 4ISUA 1MXWA 3MQ9A 2OLBA 3MP6A 5KZTA 3K0VA 4OMBA 3LUYA 1Z7ME 4HCWA 1OQGA 3H6UA 1B4HA 3TTMA 1FW0A 2ABHA 1LGBC 3FVGA 1JVYA 2XXXA 3B6QA 3KJ7A 3O97A 4ZEDA 1MXUA 1IUDA 3C35A 3RTFB 1O63A 5EYFA 3TCHA 4U23A 5L9OA 1B3EA 1DOTA 2DE3A 3UIFA 2V3UA 2B65A 1O64A 4RA1A 2OCUA 4U4SA 3T9VA 4G77A 4TOZA 2H25A 3H06B 1NFTA 3PUZE 3KSJA 4LP2B 5DEXB 1VE4A 1QVSA 2W7YA 1FQDA 4F3GA 3IAZA 2OK2A 3D4GA 3PPPA 4P0IA 1TWYA 2GRVA 2P1SA 1PC3A 3CVGA 2PYYA 3T9UA 3LSWA 1MQJA 5M2VA 3I3VA 5L8DA 1ZTYA 1US5A 4NE4A 3ZSFA 2AIXA 1A54A 5EHSA 2H5YA 1R9QA 3GLBA 4UA8A 3OEKA 5I2NA 5DVFA 1P1NA 4QFPA 2PMSA 1AIVA 4RXLA 2ZYKA 4LVQA 4F39A 3H6VA 1A8EA 3CRBA 4OERA 4WXJA 3C31A 4OFOA 4Z7EA 2Q89A 2NUVA 4ELQA 4YICA 4IGRA 1LSTA 2YLNA 4G68A 3QAXA 5F7VA 2KLFA 1YCJA 3WAEA 3QYTA 3V5AA 2XXPA 4BDMA 4H8JA 2I3WA 1LLSA 4JDFA 3E4RA 3OSQA 3OELA 1AOVA 4U1ZA 2CZLA 3S2VA 5J1DA 3LSXA 4QFLA 1AMFA 1IIWA 1JW5A 3FXQA 4I62A 2Z8EA 4E0XA 1PB8A 4F3BA 1Y9UA 4GRKA 2HQ0A 4DXCA 2O69A 4FJPA 3A09A 3ZS6A 3IO4A 2R6GE 2Q88A 3N6TA 3OEMA 3D4CA 1P1OA 3TPAA 1AL3A 3K02A 3IB1A 1J1NA 3RY3A 4PP0A 3FJ7A 3TYHA 1ZMGA 4AB5A 1BP5A 1D9VA 5CMMA 1Q1KA 3Q28A 4H1XA 3O9PA 4XIGQ 3SESA 3HPIA 3H7MA 3USDA 4F1VA 4OVJA 3MP8A 2UVJA 1B3HA 4XXUA 5JTYB 1IITA 4FATA 4OTEA 4BDRA 3QXMA 3U94A 4RYAA 2Q8JA 1MQHA 5HM4B 3EPEA 1B6HA 3EF7A 1PDAA 4ZEBA 4O3CA 1OQHA 1USYH 2X7QA 4ZEFA 3S9LC 1UTHB 1N04A 1GR2A 4ZEIA 1MXVA 1B1HA 4HTGA 2I58A 3HCQA 3QK6A 4R9FA 3IR1A 4NF4B 4LZ5A 2XXUA 3TAJA 3FJGA 2QSXA 3ECRA 2Y7IA 3PMXA 4KPTA 3QSLA 2NOOA 4U22A 3BBRA 3FVNA 2ZYMA 3BFTA 4NF8A 5K2YA 1DMBA 2Y7KA 1IQ7A 3V8XB 4H65A 1UIUA 5LOMA 1NL5A 4YU0A 5I57A 3OO8A 3EHUA 3GZGA 2M8CA 1D4NA 4GFRA 2DOJA 4ELPA 5CMKA 1SI0A 1MXZA 3CFZA 3KN7A 1A8FA 5FHOA 3H3GA 1VFDA 3CFLA 2H99A 3K6WA 5FTIA 4KFQA 2ONSA 1H45A 2RF1A 3VFJA 5AA2B 3TFLA 4DZ1A 4F18A 4G2ZA 1MY0A 2V84A 5I58B 3IL1B 2Z22A 2IEEA 4JSOA 1N3WA 3T66A 4M4GA 4JWXA 3FD3A 1N3XA 3KG2A 3L6HA 4WEPA 1F9BA 4XKQA 1M5CA 1H3DA 4I1DA 1S50A 3TEPA 1KWHA 4LUBA 1LBBA 4LQ5A 3G3HA 2WKYA 3PV0E 4YB7A 3RT6B 3IOVA 2A5SA 4KD5A 4P0GA 5HPQA 3EQ1A 4H5FA 3TKDA 3PPQA 3R6UA 4ZZEA 3TCGA 2V3QA 1UQWA 4UACA 5H8QB 1A40A 3G7WA 4H6DA 3FATA 5AA1A 4F2QA 1A55A 3DLNA 4OETA 5CMBA 1DTGA 5AA3A 1B3FA 3TCFA 3W9WA 4KCDA 2Q9TA 1MDQA 5ELVA 5KDTB 2H9BA 1UTBA 5IAIA 3K6UA 2XD2A 2DP8A 3KGCA 3RT8A 3EHSA 5H8NA 4OENA 1MPBA 1N7WA 1S9TA 2GHAA 1OLCA 1H76A 2I6EA 3PPOA 2GFEA 4YZZA 1FTMA 1TT1A 2ZNUA 2DE2A 1SW2A 4G8NA 4NF5B 3AXFA 4KQPA 5A5XA 4NEDA 5TPAA 4IO6A 1SD3A 3M3KA 2HAUA 3G3IA 2XXRA 3MZBA 2Q2AA 2QMWA 3IORA 3IOWA 1B2HA 1VR5A 4MFIA 5IKBA 1BKAA 3WAFA 4N07A 1VSOA 3O66A 4HW8A 4IO3A 2Y7WA 3MVZA 3OO6A 2XX9A 3CIJA 1MQIA 4R9GA 1MY3A 1S7YA 5TP9B 2O6AA 4BDNA 5L9MA 1IXHA 1B40A 3IOTA 2HAVA 5AE4A 4GXAA 2I4BA 4IY5A 2D3IA 2Y7PA 5DVJA 1FQBA 4OFJA 3T9XB 4C1TA 1B51A 3H03A 3K1PA 2IA4A 4OYVA 4POXA 4PFTA 2NWJA 5K2XA 2ANJA 1FTLA 2A5TA 1FQFA 2D5WA 2ZNSA 3N6UA 1XS5A 4QFKA 1YAEA 3VLVA 2DWIA 1A99A 2XXWA 1YTVA 3FJMA 4XKNA 5HBCA 3OO7A 5FTHA 4YAHX 4QSEA 1P1UA 3LSFB 3DELB 3CFXA 1NNFA 4JWOA 5EHMA 3U1OA 4JB7A 3M3LA 4ZDMA 1LAHE 3FASA 5KCJB 4F1UA 3HO7A 2ALUA 1MY4A 2F78A 2HXWA 3VVDA 4LQ2A 3RPWA 4NMYA 3BFUA 4KYEA 3TDJA 3K2DA 4KYDA 3ILUB 3SEYA 2F35A 4YB6A 3C32A 4TLMB 4K3FA 4EQ7A 2DWAA 5CC2A 1I6AA 1QUJA 3N26A 1LAXA 1YPNA 2O7UA 1EU8A 3R7XA 3G3FA 4LZ7A 3KEIA 4F31B 4F29A 4H8IA 3KN8A 2O1LA 1R6ZA 4ZS9A 5I2NB 3OXNA 2F5XA 3JYRA 3ILTB 4QSCA 4ESWA 4KYSA 1I6QA 1B4ZA 1BTJA 4PFYA 1T0KA 4X9TA 1URDA 3F11A 4OXVA 3MP1A 1VFEA 1RYOA 2BJJX 2ZYNA 2PVUA 1XT8A 4G68B 2XXHA 4EXKA 3V89B 4ESXA 1TFAA 2G93A 4POWA 4IO4A 4OEUA 3MBPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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