3FD3A

Structure of the c-terminal domains of a lysr family protein from agrobacterium tumefaciens str. c58.
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
207
structure length
207
Chain Sequence
RVTLNIATNADSLGTWFLDAVSKFTGGSDYLVNIAVDDQDHTVEWLRGGRVLAAVTAHDKPVQGCRVTPLGVLRYHATASPDFMARHFADGVTPAALARAPGLTFNQKDRLQASWIRTALGEDVSYPTHWLPSTDGFVKASLAGMGWGLNPVQLVAEHLAAGRLVELMPGTPLDIPLYWQVNRLAAERLAGLTANMVGTARVVLMPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure of the C-terminal domains of a LysR family protein from Agrobacterium tumefaciens str. C58.
rcsb
molecule tags Transcription regulator
source organism Agrobacterium tumefaciens str.
molecule keywords chromosome replication initiation inhibitor protein
total genus 61
structure length 207
sequence length 207
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-11-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fd3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fd3A02
1B1HA 2RF1A 3C9HA 4ZEBA 1MXVA 4DXBA 1IXIA 2NUVA 5F7VA 2OCUA 3MQ9A 2NWJA 4I62A 2ZNUA 1ANFA 5K2YA 1Q35A 1QULA 4OMBA 2Z8EA 2V3UA 4P0GA 1MXXA 1FCKA 3MWBA 2XX8A 2H5YA 1B58A 4X1DA 4EQ9A 5B7DA 3OEMA 3OXNA 3O2AA 4IGTA 1F9BA 4ZEFA 4G77A 5CRYA 2RC8A 4Q0CA 4IO7A 1B9JA 4F2OA 3TZAA 4LUBA 1M5DA 2YPNA 3LSLA 4IY6A 1SI1A 3TAJA 5IAIA 1XVXA 1WVJA 1SI0A 3CIJA 5EHMA 4H5FA 3SERA 1OIBA 1B51A 4P0IA 5AA4B 3H4ZA 1IZ1A 2O51A 3KN8A 4R73A 1US5A 4U4XA 4BDMA 4ZE9A 3N26A 4THIA 3U93A 4KCCA 3CFXA 4IGRA 2VD3A 4I8CA 2Y7WA 3C4MA 3KG2A 2DWIA 3HPIA 1DTZA 2QS3A 3V5AA 2OK2A 3E9XA 1B3HA 2P2AA 3OENA 4YB7A 3MC2A 1A99A 4EXLA 4WEDA 1UTBB 2NOOA 1YCJA 1FTJA 3SETA 2RC7A 1MH3A 2QSXA 5AA2A 3KJTA 2DXRA 1ZLQA 3QAXA 2D5WA 1DPPA 3IAZA 3CVGA 4BDRA 2PX1A 4ZEKA 3K6UA 4POXA 4F2QA 4G4PA 4DXCA 1SYHA 2F7AA 2F34A 4H8JA 1ZIUA 3MVZA 4MLVA 2I3WA 1FW0A 4QF9A 3VDFA 5KDTB 3PPOA 3QIMA 1BIYA 4FEBA 4G2ZA 4JBZA 4N07A 4XKNA 1AIVA 1FQCA 3MZBA 4UACA 3TEPA 1I6AA 3T9VA 4ZDMA 3I6VA 2QMWA 4F29A 3BFUA 1ZJLA 4QFPA 1URDA 2Z8FA 4XIGQ 3FVGA 4G8MA 4U23A 1ZKBA 4JSOA 2ANJA 2A5TA 5ISUA 1USYH 1MRPA 4GOTA 4NF4B 1QUJA 1MY4A 4MFIA 1KWHA 2A5SA 2R9JA 5H8FB 3PD8A 4FAJA 4U2RA 4R2FA 3C35A 3GZGA 1MY3A 3G3GA 4G68A 4Q30B 1MXYA 3CFZA 4QFNA 2QL3A 5K2XA 3THIA 3MVXA 3M8UA 1MY0A 4R2BA 3O9PA 2Q2AA 3LSXA 1MQHA 2VP1A 1B05A 1B52A 3U72A 1MDP1 3FXQA 4Z7EA 1P99A 2Z22A 3PPQA 4R9FA 3CG1A 4PFUA 1ZU0A 4ZEDA 3O29A 2XXTA 5TU0A 3OO9A 3G3HA 2REGA 1QJMA 1ZBMA 3IR1A 3MW0A 2XXHA 4RK9A 3OO6A 1UTHA 3CRBA 1PC3A 3GBAA 3ILUB 5H8NA 2OWTA 3OD7A 4ESXA 1II5A 4R6KA 2IA4A 1QKBA 3CG3A 4NWDA 4RXLA 5DT6A 3N6TA 2FNCA 1D3KA 5I59A 3HN0A 4KYDA 1US4A 1NH8A 2CZLA 3IORA 4ELPA 3W9VA 1I69A 5JTYA 3MZ9A 4QSEA 4ECFA 3S9LC 4O3CA 1DMBA 2OWSA 4JB7A 1MY2A 1PB9A 3T9XB 4XKQA 4G8HA 2H9BA 3E4RA 2ZYKA 3TKDA 4LQ5A 4X1BA 4C1TA 1MXUA 3PMWA 1H76A 4OFOA 3QK6A 3FVKA 4IB2A 3PUVE 4WXJA 4BDOA 1OQHA 1QKAA 1YPNA 5AA1A 3OELA 4PE5B 3OSQA 3K6WA 3S9EA 3EF7A 2PT2A 2AIXA 2A5TB 5HM4B 1Z7ME 3CSBA 3QUJA 1B7HA 1OLAA 3O6GA 1GR2A 1SBPA 4OERA 1MS7A 3SEXA 1OMPA 1OVBA 2ZYOA 4C0RA 2F78A 4LVQA 5CMMA 2UVJA 1JW1A 4KI0E 2QS1A 3RLFE 4XKRA 3OEKA 3KZGA 2RC9A 2V93A 1AH5A 3K02A 3QYTA 1AMFA 3G3FA 5CBRA 3FVOA 1B5JA 4OQOA 4G68B 1NNTA 3T9HB 1LFIA 4LZ8A 5AA2D 4ND9A 3EPEA 2B65A 2Y7KA 3Q26A 2HXWA 4R6HA 1TT1A 3KEIA 2DS9A 4JDFA 3C36A 3KSJA 5I58A 2F36A 3VLVA 3OSRA 4QFLA 3PD9A 1AL3A 1B0HA 1N3WA 5AA3A 3CFLA 1JETA 2QJEA 5KDTA 1ZMGA 1PBPA 4KCDA 3HHFA 2V84A 4UA8A 3D4CA 3SEWA 2ONRA 2Y7PA 4LZ7A 4BDQA 3MJNA 2Q9TA 4MLQA 1S50A 3CSGA 3JV9A 2FYIA 1IUDA 1FQEA 4NEDA 4U22A 3FGSA 3ZKLA 2F8DA 1O64A 4H6DA 1JQFA 1TFAA 3A09A 2RKMA 5CMKA 1MQJA 3SKPA 4HS7A 1M5CA 2HFBA 4JWXA 4RY1A 3V83A 5L8DA 1UTHB 3Q29A 1IXGA 4GWOA 4U1OA 4RA1A 1O63A 4H0WA 1B5IA 5H8NB 2DE2A 3FJGA 4GXSB 3FVNA 3BKIB 2IEEA 1B5HA 2F7BA 2X26A 2PYYA 5CMBA 4KPTA 2PMSA 4OWDA 2D3IA 2H25A 1FQAA 2DVZA 2I48A 5ITPA 5AE4A 3VLWA 5I59B 1TXFA 5J1DA 4R72A 4YKJA 3T9UA 2PT1A 3KSXA 1LFGA 3LR1A 5JTYB 3Q27A 4EF1A 3K01A 4IY5A 1B6HA 2OLBA 2H4IA 2UYEA 2I0CA 2O7UA 3ZSFA 3RQTA 1H45A 2XD2A 3RPWA 1URSA 4YAHX 4ESWA 1CB6A 3ECRA 1IXHA 2E0SA 1T0KA 5ICTA 4BDLA 1P1QA 1N7WA 1SQYA 2BJJX 1RYXA 4OYVA 5CI5A 3K4UA 4ELQA 4YMBA 4H1XA 3B6QA 1N3XA 3KGCA 2M8CA 2F6PA 2THIA 4EQ7A 3HCQA 3K2DA 3P7IA 2REJA 3UP9A 3PUYE 1SDXA 4IO6A 4K3FA 5L9OA 3EN3A 3SDFA 2UXAA 1B3GA 3C32A 2R6GE 1XT8A 1XOCA 3S9NC 5A5XA 1WODA 4EUOA 2XD3A 3I3VA 2Q2CA 2DYXA 3K1PA 4FORA 3MZ1A 1BP5A 4IO2A 4YB6A 3PGFA 4H8IA 2B3FA 1OVTA 3TDJA 3S4UA 3VVEA 1A55A 3MVWA 2GH9A 1RKMA 3A3CA 3K6VA 2UVGA 3UGWA 4FEDA 2QS4A 3C31A 2Z23A 1R6ZA 4PP0A 3DELB 5I58B 3HHGA 3N94A 4F18A 3FV2A 4EF2A 1NMUA 2F35A 3E3KA 4AQ4A 2GHAA 1OLCA 3M3FA 4ZS9A 3G3JA 2I3VA 5I57A 3U1OA 3L6GA 4OEVA 3DP4A 2YJPA 2HAVA 3IOUA 1R1NA 3VVDA 3UN6A 4TQUQ 2DWJA 1MM7A 3PPRA 2HQ0A 4ZZEA 1LCFA 3KJ7A 3HSTA 2PVUA 2XXYA 4BDNA 1NH7A 1HSJA 4MH5A 2XXXA 3B7DA 3PU5A 3KBRA 2Y84A 4OTEA 1AOVA 3LSFB 3PUWE 3MPLA 3OO8A 4OXVA 4ZZAA 5DYHA 1VSOA 5TP9A 1XC1A 3E13X 3W15C 4DCXA 4PETA 4RPNA 2HAUA 3SESA 4U1ZA 4M4GA 4YMAA 2ONKE 2XXVA 5DVIA 3F11A 4OFJA 4ZECA 4GFRA 4Q8RA 5L9MA 1B7ZA 1N04A 4HCWA 4E0WA 3ILTB 4P11A 4F3SA 4ZE8A 3RN8A 1EZPA 3CI8A 1JVYA 2WKYA 4M1VA 1A40A 1MPCA 1B0LA 4G68C 1A8EA 2H99A 4O3AA 5HPQA 1P1WA 2DE3A 3FATA 3TFLA 2NXOA 2I4BA 1JW5A 1B3LA 3LSWA 5CC2A 3TCGA 3RTFB 3K1NA 3VV5A 1B7UA 3R6UA 4YKIA 3N5LA 3VLUA 4MBPA 3K0VA 3V8XB 3MAMA 5A5XB 1LAGE 2HZKA 3EHTA 1LAHE 4TLLB 1N84A 5I2KA 1Y4TA 4F19A 4WKMA 1NL5A 2I4CA 2AYSA 4QSCA 4RYAA 1SYIA 4RNSA 3PV0E 3JZJA 1NNPA 1B4ZA 2O84X 1M5BA 4JXIA 3BFTA 3O6IA 4EXKA 3G7WA 3LBSA 3T93B 2O69A 5LOMA 5JEIA 2QMXA 2XXRA 3TMGA 1BTJA 1LBCA 1H3DA 3IX1A 4N13A 5BWJA 4YB5A 3TTNA 2I58A 1R9LA 5I57B 3RUMA 3GLBA 3IO4A 4BLAA 3M3LA 2HEUA 3IJXB 1I6BA 4NF6A 2AL4A 3IOVA 3UK4A 4ZEIA 3G3KA 2I49A 3O6HA 4YKPA 5H8SA 1BKAA 1B1XA 4XTCQ 1A54A 1HSEA 1J1NA 5DTBA 1YAEA 2GRVA 1PBQA 3K6XA 1N7XA 3TQLA 1GV8A 5CMCA 1M5EA 4U4SA 1Y3PA 4I1DA 2B3BA 4LA9A 1URGA 3PPNA 1FQBA 4EQBA 2ONSA 5I56A 4PFYA 4WEPA 3DLNA 4F39A 4KR5A 1LGBC 4FJPA 3FZVA 5TP9B 2DWHA 1P1NA 4X9TA 5B70A 4YICA 3RTWB 4QSDA 3FIRA 1B3FA 3ZKKA 4H67A 1FTKA 4ELRA 4QFKA 1VFDA 5H8QA 4LP2B 3UIFA 4KQPA 3DP8A 1DTGA 4NF5A 3PPPA 4H65A 3T96B 1GVCA 4IO4A 1Z7NE 5TPAA 3W9WA 5BUUA 4YZZA 1OQGA 3RT6B 1IIWA 2P1SA 1DOTA 4GL8A 1ATGA 3TTRA 2DOJA 2UVIA 2ZNSA 4FECA 4GD5A 4XXUA 2P0SA 3TTMA 2DVCA 1N0TA 1LSTA 4QFOA 3MPKA 1POTA 4E0XA 2Q89A 1ZTYA 4TLMB 5I2KB 1MG1A 5FHMA 5ELVA 2Q88A 3H6VA 1TWYA 3LC8A 4R9GA 1SD3A 3MUQA 2D21A 4JWOA 3O66A 3ODBA 2O1LA 4G8NA 2DWAA 2XXPA 3FXRA 3U92A 3MP1A 3A3UA 2Z8DA 4KHZE 2DQVA 1MPBA 3EQ1A 3IOTA 3TODA 4F22A 1LAXA 5H8HA 5CBSA 1MQDA 2DE4A 4R6YA 1NKXA 3KFMA 1UIVA 1MPDA 3M3KA 1BLFA 4X48A 1LLSA 3DM0A 3RNNA 4NF6B 3IB2A 2XX7A 2O7IA 3WAFA 4F3GA 1JNFA 3H6TA 4OESA 5I2NA 1H44A 4LQ2A 1LCTA 4YKKA 4OHNA 2NVUB 4DIGA 4RK2A 5F1QA 3USDA 2O6AA 5DVFA 1Y3NA 5ITOA 2VOZA 2F6GA 1USYE 4NF8A 3PUXE 3FV1A 1MQGA 2DXYA 3H6WA 3FJ7A 1SW5A 2G93A 1QVSA 4HCYA 3OO7A 3B6WA 2UVHA 3FXUA 1TFDA 5I56B 2UYFA 5DEXA 3Q28A 3TPAA 1Q1KA 4PFWA 1VE4A 4F1UA 2DSFA 4ELOA 1Y20A 1MXWA 4OENA 2OZZA 4I9DA 2YLNA 4F1YA 3BBRA 1Y9UA 4U21A 4R74A 1R9QA 4GF8A 4ISUA 4NE4A 5H8QB 2QS2A 3PMVA 1P1UA 3CR9A 4NF5B 2Y7IA 3SEYA 4YU0A 3RGYA 3U94A 3C34A 3R7XA 4L17A 2V3QA 5TPAB 1D4NA 3KOSA 1LAFE 4Q5TA 4NTLA 3EHUA 2XXQA 3SEVA 3QSLA 3TELA 2ESNA 4F31B 2I0BA 5KCJA 3T66A 2ZMBA 4KD5A 1CE2A 4IO5A 2RCAA 2OJTA 2QPQA 1YTVA 1GTKA 1B3EA 3IL1B 1B46A 5M2VA 4DCYA 1MH4A 1PEBA 2RINA 1Y1ZA 1MM6A 4FIMA 1XVYA 2XXWA 4N6PA 2ZNTA 1VR5A 1XHYA 3D4GA 1DSNA 3HO7A 5IKBA 3MP6A 1ELJA 4O3BA 4HTGA 4IO3A 5EYFA 3H7MA 3TQWA 4FATA 2GHBA 4Z0IA 2CMOA 4GIZA 5FHNA 1QUIA 2H98A 4LONB 2XX9A 1I6QA 1H43A 1PB7A 4KYSA 4JWYA 5DVJA 1GGGA 4GLIA 4OFLA 4F1VA 1SW4A 1UIUA 5H8HB 1IXCA 4H5GA 3K1MA 3ZS6A 3KN7A 2I6EA 2F97A 1FQDA 2O1MA 4POWA 2G29A 4TOZA 3AXFA 1EH3A 2GFEA 1JVXA 4GXAA 5I2NB 2ZYNA 1UQWA 1HSLA 3Q25A 2Q8JA 2F5XA 2LAOA 4OVJA 3IO6A 2KLFA 3QXMA 3GBBA 4RPOA 4GQOA 5FTHA 5FTIA 2W7YA 4NF8B 4NWCA 3OOAA 1B32A 2E1SA 3UORA 3WAEA 4AB5A 4KFQA 1MQIA 3QUFA 3IJOB 3L6HA 1B2HA 1Y1MA 5DEXB 2Y7RA 1A7LA 3O28A 3KOTA 3SEUA 1EZOA 1POY1 3TCFA 1Y4CA 4OZ9A 4DLDA 5KZTA 1P1OA 1RYOA 3G3IA 3ONMA 1EU8A 5HBCA 1Y3QA 5FHOA 1B40A 4GVOA 5AA2B 2DP8A 3TTLA 1QW0A 1SVXB 4F3PA 3HV1A 2RCBA 1LB9A 1FTOA 3I5OA 4F3BA 1PDAA 1MY1A 2HCAA 3MVYA 4DZ1A 1MXZA 1IITA 3IB1A 3RY3A 2OBGA 4LATA 3N6UA 1LFHA 1JEUA 5L9SA 2ZYMA 1SW1A 3MBPA 2QRYA 1LB8A 2AL5A 4ONYA 2VGQA 5KCJB 3TCHA 1PB8A 3S9MC 1FTLA 2F7CA 3VE1B 3IOWA 1SW2A 4PFTA 2O68A 5AA4A 2PBWA 3LUYA 3TUSA 2VHAA 4XKPA 3R26A 4QRZA 5JK4A 2HZLA 3K00A 4DXUA 2VD2A 3GXAA 2R71A 4KYEA 3T22A 1S9TA 4MF3A 4DDDA 3IB0A 4EDPA 3DP6A 4HW8A 1S7YA 4FE8A 3FASA 1XS5A 4GRKA 3B6TA 3VVFA 3O97A 1UTBA 1VFEA 1LBBA 1D9VA 4C1UA 3H6UA 4R75A 1FQFA 4OETA 2XXIA 5EHSA 1O7TA 5ICQA 1NNKA 1IEJA 4GL0A 1D9YA 1B4HA 3H03A 3U8QA 3JYRA 1FTMA 1N76A 3KN3A 1JEVA 2V3TA 3RT8A 3IK6B 3VFJA 4NMYA 1NFTA 3PUZE 2ALUA 1A8FA 1MDQA 1NNFA 1DPEA 3TTKA 2X7PA 2V25A 3TYHA 2ABHA 3S2VA 4DE8A 5I84A 1QUKA 3H06B 4PQJA 2ZXTA 2XXUA 3UA8A 3H3GA 3FD3A 3MP8A 3C33A 4RJZA 3VXCA 1JW4A 3FUZA 2X7QA 4OEUA 1IQ7A 4QHQA 1WDNA 1EZ9A 1L5TA 3EHSA 4JSDA 4AB6A 4LZ5A 3OMBA 2FA7A 5CM6A 3V89B 3FJMA 2XHDA 4NF4A 3VXBA 1M5FA 3PMXA 5H8FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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