3FD3A

Structure of the c-terminal domains of a lysr family protein from agrobacterium tumefaciens str. c58.
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
207
structure length
207
Chain Sequence
RVTLNIATNADSLGTWFLDAVSKFTGGSDYLVNIAVDDQDHTVEWLRGGRVLAAVTAHDKPVQGCRVTPLGVLRYHATASPDFMARHFADGVTPAALARAPGLTFNQKDRLQASWIRTALGEDVSYPTHWLPSTDGFVKASLAGMGWGLNPVQLVAEHLAAGRLVELMPGTPLDIPLYWQVNRLAAERLAGLTANMVGTARVVLMPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription regulator
molecule keywords chromosome replication initiation inhibitor protein
publication title Structure of the C-terminal domains of a LysR family protein from Agrobacterium tumefaciens str. C58.
rcsb
source organism Agrobacterium tumefaciens str.
total genus 61
structure length 207
sequence length 207
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-11-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fd3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fd3A02
2A5TB 1HSLA 5CMBA 3FZVA 4N13A 1LFIA 3BFTA 2ZMBA 4QF9A 3C34A 3K02A 3R7XA 1EZOA 4NF8A 4LZ7A 4R6KA 1B3LA 1TFAA 5H8QB 3HV1A 3VXBA 3C9HA 1UTHA 4JDFA 1OQGA 3OSQA 1BTJA 2RF1A 3L6HA 5CBRA 2RINA 2NWJA 3ILUB 1ZJLA 1MPCA 3MQ9A 1USYE 4EQ9A 1JETA 2XXQA 4OFJA 3JV9A 3G3FA 4GXAA 1M5BA 3KJTA 5K2XA 1MQDA 2D5WA 3OEMA 3FJ7A 2ZXTA 3FXUA 1MXYA 3V89B 1P1WA 2ALUA 2PT2A 1MQIA 1DTZA 4U1ZA 2R9JA 1Y9UA 1PDAA 3ZKLA 4E0XA 4GF8A 4Q30B 3CFXA 4C0RA 4XKQA 5H8FA 5TPAB 2GFEA 2I3VA 2B3FA 4F2OA 1RYXA 4YICA 1NMUA 2V3TA 4IB2A 3IJOB 4OQOA 3W15C 3WAFA 5DVFA 1ANFA 3WAEA 1A54A 1MY3A 1B7HA 5L9MA 3USDA 1MXVA 4DXBA 3MPKA 1OMPA 5A5XA 2ESNA 1GR2A 4LATA 4UA8A 4AQ4A 2O7IA 3LBSA 1FQAA 3U8QA 1ZKBA 4F3BA 2F5XA 2W7YA 3U1OA 3PV0E 1A99A 2NOOA 3D4GA 3M3FA 2XXTA 3O9PA 2ZYMA 4UACA 4DCYA 4G4PA 4C1UA 4FECA 1DPEA 5I57B 5ICQA 3LR1A 2F7CA 3VVFA 4YB6A 3FXQA 3FVGA 1B2HA 1YCJA 3ILTB 3H6WA 4G8NA 4LZ8A 2A5TA 4MFIA 5FHMA 3SEYA 3JYRA 2ONRA 2V3QA 3DP4A 1DSNA 1FQDA 2Q9TA 3H03A 1N7WA 4GVOA 4DIGA 1EU8A 4RK2A 3TPAA 3SERA 1EH3A 2KLFA 3H6VA 4WEPA 4QSCA 3QYTA 2F8DA 2V93A 5CM6A 4X1DA 2V3UA 4RPNA 3LSXA 1JW4A 3TODA 1A8EA 3MVYA 1UIUA 3Q28A 2R6GE 1JQFA 1MPDA 1IQ7A 2F34A 1R9QA 4OETA 2ANJA 1N3WA 2ONSA 1MXXA 4OEVA 3O66A 3G3JA 1DTGA 3V5AA 3T9XB 3TTNA 2IA4A 4BDOA 2ZNSA 4FATA 4IY6A 3S9NC 4U1OA 1LAGE 1US4A 1B3GA 1LAFE 5CMCA 1Z7NE 2F78A 2X26A 1FTKA 3RY3A 2AYSA 5HPQA 3PGFA 3OD7A 4IO7A 2XXRA 1D3KA 2F7BA 3V83A 3QUFA 2UXAA 5KZTA 2H98A 3LC8A 2DVCA 4KD5A 1AH5A 1B6HA 5I56A 1H3DA 2V25A 3GBAA 4EXKA 4G77A 1O64A 3IB0A 4RYAA 3SEXA 1XOCA 3F11A 1EZPA 2ZYOA 4NF5B 5I2KA 1NNPA 5EHSA 1SW2A 1P1UA 3SESA 1PC3A 2CMOA 5ISUA 3IOWA 1TFDA 1NFTA 3FJGA 3I5OA 4LONB 4QFNA 2QMWA 2QL3A 4O3AA 4F39A 1B46A 1SI0A 3VLVA 3FD3A 3U94A 2Z8FA 2XHDA 4OTEA 1LBCA 5DVJA 3G3KA 5KDTA 1A55A 3ONMA 5JK4A 1B0LA 1LGBC 4QFOA 4ZZEA 2QS2A 2UVGA 1NL5A 5ITPA 4EDPA 4OENA 1IEJA 2XXUA 1M5CA 5AA2B 4KCCA 1A7LA 2V84A 4OHNA 3OO6A 5AA4A 5CMKA 4XKPA 4R2BA 3OO7A 4ISUA 3CG1A 1GGGA 1B05A 4RJZA 4RK9A 1ZIUA 1SW1A 2R71A 4NF8B 1LFGA 1NNKA 4YZZA 3MP1A 2O69A 3KOTA 1UTHB 1JW5A 3K00A 4GL8A 3W9WA 2H4IA 4IO5A 5CBSA 3RPWA 4Q0CA 4KPTA 4NF6A 3ODBA 2F97A 1MY4A 3C32A 3V8XB 1MS7A 4H5FA 3GLBA 2QSXA 4X9TA 3A09A 3S2VA 4G68B 2NXOA 2OWSA 2XX9A 5FTHA 3PUZE 4X48A 1JW1A 1OIBA 2DE2A 1AL3A 1VR5A 1CE2A 3G3GA 2FYIA 2XXYA 5B7DA 4RA1A 5H8FB 3DM0A 2PT1A 1N04A 2NVUB 4BDLA 3DLNA 1Y4TA 4KR5A 3T93B 5I59A 4OFLA 4WEDA 1N76A 3VVDA 1IIWA 3UORA 3UIFA 4MH5A 3H7MA 3QXMA 1FQCA 3PUWE 2XXHA 1MG1A 4I9DA 5A5XB 3TQLA 3U92A 4OXVA 4KQPA 1LAHE 2HZKA 3PD8A 5J1DA 4MLVA 3O6GA 1XVYA 1I6BA 4TOZA 1B1HA 3IL1B 4OESA 3Q27A 3DELB 3O29A 2AL4A 3HHFA 2I48A 3RUMA 3TKDA 4KYSA 4EF1A 1S50A 3I6VA 4KHZE 4FJPA 3CSBA 3MVWA 1ZU0A 4DDDA 1B3EA 2DWAA 3PPOA 4BDRA 4AB6A 3K6XA 2Y84A 3OOAA 4FORA 4QFKA 1FCKA 5JTYA 3MUQA 1M5EA 5AA2D 4MBPA 3GZGA 2Y7RA 2Q8JA 2VHAA 1NNTA 2Z8DA 3PPPA 3IJXB 2VP1A 2UVJA 4O3BA 4LP2B 4LQ2A 4IO6A 2H5YA 1GTKA 3TZAA 4YKPA 4P0GA 1D9YA 4YB7A 1LCTA 1H44A 1PBQA 3FXRA 4I1DA 4IGRA 5DEXA 3JZJA 3N5LA 1SBPA 2Q2CA 3N6UA 4HS7A 1ZLQA 1MM7A 2Y7KA 3N6TA 2DWHA 3FVNA 1JEVA 3PMVA 4R9FA 4QHQA 3TTRA 2XXPA 4ZEIA 2O68A 2HCAA 1II5A 3IAZA 4G68A 4MLQA 2OWTA 4HCWA 2PVUA 4OEUA 1POY1 3RTWB 2I4CA 5CI5A 3FIRA 4GQOA 4M4GA 2DVZA 1B58A 3UP9A 3EHTA 2O1LA 1B52A 3EN3A 4RY1A 2Y7WA 2AL5A 1R1NA 4GRKA 2PMSA 3SDFA 3DP8A 3PU5A 1N84A 5I56B 4GOTA 3MVXA 5L8DA 2G93A 3UA8A 2PYYA 4GL0A 5I2KB 4NWDA 4ZE9A 3SEUA 4U22A 5TP9B 3CIJA 2IEEA 3FV1A 1SDXA 3Q25A 5I58A 3RTFB 4I62A 1L5TA 1B51A 1N0TA 1EZ9A 4JWXA 4F18A 1FQEA 4G8MA 1MH4A 2I4BA 5EYFA 3ZS6A 2XXIA 4YMAA 2GHAA 4X1BA 4F3PA 4H8IA 5BUUA 4N07A 5KDTB 1S7YA 3VV5A 4ELOA 4R72A 1NH7A 4GLIA 4TLLB 2XD2A 5K2YA 3TEPA 4N6PA 4WXJA 1XVXA 3TELA 2E0SA 5AA4B 4P0IA 3W9VA 2CZLA 4HTGA 2QMXA 3CRBA 3PUXE 3MC2A 2DWIA 1R6ZA 2HAVA 1ZBMA 2ABHA 2I6EA 1MH3A 3A3UA 4PFTA 1QVSA 4O3CA 2DXYA 1B5JA 4I8CA 3MP8A 1P99A 4IO4A 1QJMA 2A5SA 3KZGA 2I3WA 4NF6B 1US5A 1SD3A 1PB8A 4LUBA 4NTLA 2H25A 3HPIA 3CR9A 1A40A 3HN0A 4EUOA 2QS4A 3QSLA 2LAOA 3PMWA 2RC9A 5KCJA 4KYEA 2HFBA 3LSFB 3ECRA 1NNFA 2QJEA 1QUJA 3R6UA 2P2AA 1Q1KA 3TCFA 5TP9A 1B4HA 2Y7IA 5I59B 4OFOA 1B0HA 3MW0A 4XIGQ 3RGYA 1HSEA 4ZEDA 3PPNA 3B7DA 1FTJA 1FQFA 5AA1A 1D9VA 3IO6A 4DZ1A 3KOSA 1NKXA 1TT1A 4FEBA 3HO7A 1PB7A 3LSLA 2XX7A 4OZ9A 1B1XA 2DP8A 4ELQA 4ZE8A 2OBGA 2OZZA 4NWCA 4ECFA 1NH8A 4ZECA 4OWDA 1YAEA 1IUDA 1FTLA 3TQWA 3IR1A 5I2NA 3T22A 4R6HA 2P0SA 4H1XA 4ZZAA 2ZYNA 3QK6A 4LZ5A 3SEWA 3O6HA 5JTYB 3TUSA 3K1PA 1SW5A 4F1VA 4U4SA 3U72A 1LAXA 2DWJA 4JWOA 5FHNA 2YJPA 3SETA 5LOMA 2DQVA 3TAJA 1Y3PA 1B7ZA 1OLCA 3S9EA 3BBRA 1LBBA 4LQ5A 5CMMA 3C33A 1UTBA 3KGCA 1SI1A 1MY1A 4F3SA 5DEXB 3PUYE 1I6QA 2REJA 3O97A 3UGWA 4AB5A 2Z22A 2I0CA 1QW0A 3IX1A 4F1YA 4KCDA 3DP6A 3VDFA 3OO9A 1QKBA 2XXWA 1B5IA 1UQWA 3UK4A 5H8HA 4IO2A 3S9LC 4C1TA 1BLFA 3OENA 1Y3QA 3LSWA 1Q35A 1GV8A 3THIA 1YPNA 4PFWA 4R75A 4NF4A 4F29A 2RCBA 4F3GA 5IKBA 1URDA 2F36A 2I49A 4ND9A 5B70A 3MZ1A 3T9UA 4OERA 1VFDA 3MBPA 4DCXA 2XXXA 2OCUA 4ONYA 1DPPA 1H76A 2I0BA 1IXCA 3AXFA 1B3HA 3M8UA 1UIVA 3FATA 1B40A 3RN8A 4HW8A 1MDP1 3S9MC 1QULA 2XD3A 1OLAA 4OVJA 2DOJA 5CC2A 2H9BA 2FNCA 5I58B 5L9SA 3C35A 4YMBA 3C4MA 5H8SA 2P1SA 3FVKA 1ZMGA 1XHYA 5H8NA 3PD9A 3B6QA 1MM6A 2B3BA 3CI8A 1GVCA 1Y4CA 1MQJA 1PB9A 2RKMA 4YU0A 4G68C 4QFLA 3IORA 5CRYA 4GWOA 5FTIA 5HBCA 1N3XA 3SEVA 2O84X 2DE3A 3OELA 1B4ZA 1IXHA 1LB9A 3K6VA 4YB5A 2RC7A 2VOZA 1OQHA 3TTKA 2GH9A 2HZLA 1MDQA 5F7VA 3LUYA 4ZS9A 1IXIA 3OO8A 3QAXA 3QUJA 4GIZA 4MF3A 2Q89A 5DT6A 1KWHA 5I84A 3RLFE 1HSJA 1O63A 3KN7A 3M3LA 2DXRA 1R9LA 3OSRA 3TDJA 3IK6B 1Y3NA 3D4CA 4L17A 1B32A 1URGA 1M5DA 1POTA 4P11A 1A8FA 3O2AA 4R6YA 1VFEA 1S9TA 1LSTA 3TTLA 1F9BA 4JBZA 4XXUA 1N7XA 4PE5B 2UYFA 4R74A 1URSA 1JNFA 3PPRA 4GD5A 4THIA 3VVEA 3K1MA 4H6DA 2QS1A 2GRVA 2PX1A 3S4UA 2AIXA 2UYEA 5KCJB 4U23A 3IB1A 4F2QA 5ICTA 3EHUA 1ATGA 3KJ7A 4G2ZA 4PFYA 3MPLA 1B9JA 2DE4A 2F6PA 3EQ1A 1T0KA 3HHGA 3KSXA 3E9XA 1MQGA 3TYHA 3U93A 2I58A 4H5GA 4ESXA 2RCAA 1WODA 5AA3A 3E3KA 4YKIA 4GXSB 5IAIA 4EXLA 1OVTA 2XX8A 3T9HB 3KSJA 3MZ9A 3HSTA 4Q5TA 2VGQA 3MZBA 4DXCA 2DS9A 1IXGA 3C31A 3O6IA 3RT6B 4FEDA 1SYIA 4F19A 2FA7A 3FJMA 3B6TA 2ZNTA 2YLNA 3EPEA 1MXWA 1Y20A 1D4NA 3PMXA 1P1NA 4DLDA 3Q26A 1RKMA 4HCYA 2HAUA 3K6WA 3CFZA 2DSFA 1MQHA 5I2NB 1BKAA 3T66A 3IO4A 4WKMA 1TWYA 1WVJA 1WDNA 3IOVA 2F35A 4JXIA 4EQBA 4EQ7A 2D21A 3R26A 2OJTA 2VD2A 4R73A 1OVBA 3VE1B 2M8CA 4TLMB 1I69A 1PEBA 2Q2AA 3EHSA 3OMBA 5H8QA 3E4RA 1UTBB 2HEUA 2Z8EA 4KFQA 4PP0A 5BWJA 1Y1ZA 1H45A 5ELVA 3CSGA 1LB8A 5FHOA 3TCHA 1QUKA 2E1SA 5JEIA 4POWA 1J1NA 2ONKE 1JEUA 3T9VA 3VFJA 3CVGA 3CG3A 3T96B 1DOTA 3P7IA 4R2FA 2OK2A 3BFUA 3G3IA 3KBRA 5H8HB 3TFLA 3IOTA 1JVXA 4ELRA 5DYHA 2D3IA 4K3FA 3H06B 1P1OA 4PFUA 4NF4B 3KN8A 4QFPA 1USYH 1ZTYA 1FQBA 5TPAA 3IOUA 3G3HA 4RXLA 1SW4A 1LCFA 1IZ1A 4QRZA 3K4UA 4KYDA 1O7TA 4R9GA 2O1MA 2PBWA 3QIMA 4M1VA 4H67A 1MY0A 2XXVA 1DMBA 4NEDA 4F1UA 2HXWA 4TQUQ 2Y7PA 3ZKKA 3FASA 5DVIA 3IB2A 3I3VA 3B6WA 4NMYA 5ITOA 3OXNA 5H8NB 4YKKA 4JSOA 2VD3A 4YAHX 4IGTA 4Z7EA 2O6AA 3KG2A 3G7WA 4BLAA 2HQ0A 4QSDA 2F6GA 2WKYA 3MJNA 5I57A 4DXUA 3K01A 5EHMA 1SQYA 1QUIA 1VSOA 2NUVA 2O7UA 2F7AA 4RPOA 3MWBA 3FVOA 1YTVA 3K0VA 2THIA 1BIYA 2O51A 3E13X 4ZEBA 1FTOA 4ESWA 3TTMA 5AE4A 3H6TA 1MRPA 2B65A 4ZEFA 3H6UA 4ZEKA 5L9OA 3KFMA 4PETA 4F31B 3L6GA 1QKAA 4H65A 3ZSFA 3OEKA 4U4XA 1TXFA 4H0WA 4LA9A 5DTBA 2YPNA 3PUVE 2X7QA 1LFHA 1BP5A 2UVIA 1B5HA 3GBBA 4LVQA 4Q8RA 3K6UA 1B7UA 4F22A 4RNSA 4E0WA 5M2VA 3N94A 3RQTA 3Q29A 3BKIB 2QRYA 4JWYA 1MY2A 5F1QA 1Y1MA 4OMBA 3VLWA 1LLSA 4GFRA 2OLBA 4FE8A 3VXCA 1RYOA 1FW0A 3RNNA 4XKNA 3VLUA 3MVZA 4PQJA 2QS3A 3MAMA 4XTCQ 3TMGA 4ZDMA 2RC8A 4BDNA 1MPBA 3N26A 3TCGA 1H43A 4QSEA 4U21A 4DE8A 1SVXB 4BDMA 2DYXA 4JSDA 3H4ZA 3RT8A 2ZYKA 1AOVA 1XS5A 1P1QA 5TU0A 2Z23A 4NE4A 2QPQA 4NF5A 3H3GA 4IO3A 1CB6A 4H8JA 4G8HA 1M5FA 3SKPA 2GHBA 1PBPA 3K1NA 4JB7A 1IITA 3K2DA 4EF2A 1VE4A 4POXA 3O28A 1MXUA 3EF7A 3GXAA 3PPQA 4FIMA 3KEIA 3HCQA 2Q88A 3FV2A 4Z0IA 2BJJX 3M3KA 2X7PA 4KI0E 4XKRA 1AMFA 1AIVA 4ELPA 5HM4B 2UVHA 1Z7ME 1XC1A 1SYHA 4IY5A 1ELJA 3FUZA 3UN6A 3C36A 3KN3A 1FTMA 4FAJA 3CFLA 4OYVA 1B3FA 1JVYA 2ZNUA 1I6AA 2REGA 3FGSA 1XT8A 2H99A 4YKJA 3A3CA 5AA2A 4BDQA 4U2RA 3MP6A 1MXZA 2G29A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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