3FD3A

Structure of the c-terminal domains of a lysr family protein from agrobacterium tumefaciens str. c58.
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
207
structure length
207
Chain Sequence
RVTLNIATNADSLGTWFLDAVSKFTGGSDYLVNIAVDDQDHTVEWLRGGRVLAAVTAHDKPVQGCRVTPLGVLRYHATASPDFMARHFADGVTPAALARAPGLTFNQKDRLQASWIRTALGEDVSYPTHWLPSTDGFVKASLAGMGWGLNPVQLVAEHLAAGRLVELMPGTPLDIPLYWQVNRLAAERLAGLTANMVGTARVVLMPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure of the C-terminal domains of a LysR family protein from Agrobacterium tumefaciens str. C58.
rcsb
molecule keywords chromosome replication initiation inhibitor protein
molecule tags Transcription regulator
source organism Agrobacterium tumefaciens str.
total genus 61
structure length 207
sequence length 207
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-11-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fd3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fd3A02
4NF6A 2O7UA 4XXUA 5H8FA 2XXRA 2DQVA 1O64A 1SQYA 3N6UA 4FORA 4ECFA 2R6GE 3LC8A 2AIXA 4EXLA 4F2OA 4C0RA 5FHMA 3IOVA 1XT8A 1AMFA 4ZEFA 1IXIA 1B9JA 5J1DA 4F18A 3VXBA 1I6BA 3IR1A 5AA4B 2XHDA 4ESWA 4LONB 2NVUB 5TP9A 3S9NC 4FEDA 1N0TA 5CMCA 4M4GA 4QFKA 5CMMA 4M1VA 3IX1A 3QIMA 2O69A 1H3DA 4WXJA 3Q26A 1OVTA 3KJ7A 4AB6A 4I1DA 4ESXA 1MXWA 2KLFA 3RTFB 2V93A 1Y3QA 2HZKA 4KD5A 3PMWA 4IO4A 4Z7EA 5FTIA 3MVZA 3FVGA 4THIA 3H06B 3M3LA 4I8CA 1USYE 3Q27A 4QFLA 2HQ0A 3S9EA 5A5XA 1XHYA 2I4CA 3G7WA 4QF9A 3W15C 3R26A 3KZGA 1EH3A 2Z22A 1QKBA 3FVNA 5DT6A 2HCAA 4BDRA 1MY3A 3FD3A 4ZECA 1XVXA 3DP4A 4R6YA 3HO7A 4QSCA 3V83A 3PPNA 5CRYA 4GIZA 5JTYB 5I59A 4LVQA 1SI1A 2GH9A 4R9GA 1SYHA 1J1NA 4U1ZA 1FQFA 2GFEA 1MPBA 4LATA 1NMUA 1Y3PA 1AOVA 1LCTA 2DWAA 3RNNA 3IB1A 2PX1A 3FVKA 3N5LA 3QAXA 4IO5A 2NWJA 3CFZA 3QUFA 1B1HA 2I49A 2AYSA 5AA2A 4QSDA 4PFTA 2RCAA 3QXMA 4KI0E 1RYXA 5H8HB 4OZ9A 5KDTA 3G3JA 1FTKA 3FJGA 1OVBA 3TFLA 1BP5A 3H3GA 4LQ2A 2HAVA 1QUKA 3VLVA 1CB6A 4K3FA 1TFAA 2XX8A 5CBRA 4LP2B 3CFLA 1JW4A 3FVOA 3I6VA 5IAIA 4R72A 1ZKBA 5TU0A 2H99A 4FATA 2XXWA 2ZNUA 1OLCA 1S7YA 1MY1A 4ELRA 4OENA 3ILUB 2VHAA 4NMYA 1ZBMA 4TLMB 2XXTA 2E1SA 3T22A 1SW1A 2IEEA 5AE4A 1F9BA 5H8QB 2F7BA 3TAJA 5LOMA 3O6IA 3MPKA 1N3XA 3FASA 1B46A 1A8FA 1M5FA 3PPOA 5I57A 2HXWA 3C32A 2QL3A 1FCKA 5F1QA 3G3FA 3ZS6A 2M8CA 4IO2A 3L6HA 1A7LA 2A5TA 1VR5A 4QFPA 1TT1A 1D9VA 4X1DA 3OSQA 3EHUA 2ZNSA 2CMOA 4HCWA 3T9VA 3GXAA 1IUDA 1POTA 1RYOA 3Q29A 5ISUA 3UIFA 3DM0A 3H6WA 4EXKA 3OO8A 1MPDA 2DXYA 3CIJA 3RN8A 4H5FA 1NNPA 3MVWA 4PQJA 5L9SA 4ELOA 3UK4A 2DVCA 3TTRA 3HHFA 4RPOA 5JEIA 3CI8A 3OOAA 4H0WA 1H76A 1N3WA 4F1VA 4JBZA 1TWYA 1QVSA 2YPNA 4MLQA 2RKMA 3K6UA 2XXVA 3Q28A 4EF2A 2QS3A 3LSLA 3PV0E 2X7PA 1B3HA 5I2KB 2PVUA 1R9LA 4F3BA 1MRPA 1Y20A 1A55A 2H98A 4OFOA 1DMBA 5ITPA 3CFXA 4POWA 2F97A 4I62A 3B6TA 3K01A 1LAHE 4F31B 3MWBA 1B3EA 3EPEA 3CRBA 1LBCA 3G3KA 4U22A 4C1UA 4Q8RA 2UVJA 2FYIA 3ZSFA 3IJOB 2OLBA 4H6DA 2HZLA 5TPAA 2DE2A 1NL5A 3KEIA 4ZZEA 1MY0A 2XXYA 1OLAA 3IOUA 3B6QA 4C1TA 1KWHA 2ABHA 5I2NB 2Y84A 3E3KA 3MUQA 2NXOA 4YB5A 1EU8A 5HM4B 4DCXA 2I58A 3MJNA 4H67A 3PUYE 3BBRA 1UTHB 2ZNTA 2V25A 4XKPA 1MS7A 1I69A 4NF8B 4OYVA 2F35A 2DWHA 3UORA 1ZU0A 1IZ1A 4Q30B 4FECA 1VFDA 4PETA 4F2QA 4RXLA 1ZJLA 2OWSA 2Q2CA 4UA8A 1MM7A 1B4ZA 3MZ9A 4PFYA 1XVYA 3VV5A 2P0SA 1M5BA 1HSLA 2P2AA 1US5A 4G68B 4U4SA 1MQDA 1MXXA 5KCJB 1Y9UA 3TYHA 1AH5A 4Q0CA 4G8NA 3JYRA 4DLDA 2UYFA 4OHNA 4IO6A 1NKXA 2ZYKA 4R6KA 5KZTA 1MPCA 1MQGA 1RKMA 4HW8A 1IEJA 3PUZE 3DP6A 3HCQA 5I56B 3WAFA 1B51A 4R2FA 3TQWA 1R1NA 2H5YA 1PBPA 4WEPA 3G3IA 4JWOA 2I6EA 4ELPA 3OMBA 1B0LA 2Z23A 1FTLA 2AL4A 2UVHA 2Z8FA 5ELVA 3EHTA 2RCBA 1MQHA 1PDAA 2XXPA 5HPQA 3A09A 1A40A 2ZYOA 4L17A 1MXZA 1UQWA 1B5JA 1URDA 2ANJA 2O51A 4YU0A 2R9JA 3C35A 1B3FA 1HSJA 1MQJA 1B6HA 3QUJA 1NNFA 4NF6B 3VDFA 2PYYA 1B4HA 4IB2A 4OVJA 1QULA 3VVDA 2G93A 2HFBA 1MH4A 1A8EA 1DPEA 3HSTA 1GGGA 3PUWE 4QFNA 3IORA 2Q89A 5L9OA 4JDFA 3OEKA 2X26A 4N07A 1D4NA 1SW5A 2ZYMA 4OMBA 3GBBA 3OO7A 3IL1B 5TP9B 2QS1A 3TCFA 1B52A 2Y7RA 3B7DA 2XXIA 4DCYA 3OO9A 4ND9A 4R9FA 3PUVE 3P7IA 1M5DA 5EHMA 4ZE9A 3R7XA 2F78A 1MM6A 4PP0A 5HBCA 1JEVA 3TCHA 4Q5TA 4XTCQ 3KN8A 4R75A 4GOTA 4WKMA 3O28A 3Q25A 1B32A 3OEMA 2THIA 1ELJA 1FQCA 3SEXA 4OEUA 2XX9A 1Z7NE 5A5XB 1LB8A 1POY1 1JEUA 3T66A 4TLLB 5M2VA 1WDNA 2UXAA 1LFIA 1YAEA 3MAMA 1OQGA 3SETA 4FAJA 3KOTA 4DXUA 2B65A 2XD2A 1B5HA 2ZYNA 4ZS9A 4OERA 4GRKA 3OD7A 2PMSA 3E13X 5DVFA 5I59B 1PC3A 4BDNA 2DSFA 4OWDA 5CBSA 1YCJA 1LFHA 5CC2A 1R6ZA 5JK4A 3PPQA 3B6WA 3S4UA 1SW4A 5JTYA 4G68C 1LAXA 2VP1A 4DXBA 2BJJX 4YKJA 1BTJA 2REJA 3K6WA 3SEVA 1A99A 2OZZA 1S9TA 1GTKA 3MP1A 4F3SA 5AA2B 3THIA 1SVXB 2DYXA 3U72A 2QRYA 3OO6A 3FGSA 5KDTB 3RTWB 3MW0A 3LSFB 3S9LC 4LZ5A 3KJTA 3N94A 4EF1A 1Y1MA 3MPLA 1JVYA 5H8NB 5EYFA 3HHGA 3EHSA 2DWJA 1QKAA 1JQFA 4IO7A 4TOZA 3U8QA 4X9TA 3C4MA 1PB7A 4HCYA 3LSXA 2DP8A 3C31A 3GZGA 5AA1A 4NEDA 3KFMA 5IKBA 1ZMGA 3TELA 3OENA 2I3VA 1IITA 1WVJA 4JSDA 4JXIA 1IXGA 1DTGA 5I57B 4KCDA 4FEBA 1NNTA 2RC9A 3HV1A 1QUIA 3TPAA 4FE8A 4YKIA 1B0HA 2A5TB 3FV2A 4P11A 4N13A 3AXFA 3RPWA 1II5A 3IB2A 2ZXTA 4YMAA 5K2XA 4AB5A 5DEXA 4GFRA 3SESA 1DOTA 3LSWA 1MXYA 1VSOA 3CR9A 4GLIA 3T9XB 3V8XB 1IXCA 4RK2A 1ATGA 3D4GA 2Q88A 1BKAA 4RNSA 4XKRA 2Y7KA 1N7WA 3BKIB 1PB8A 4R73A 1FTJA 3H4ZA 4R74A 3RUMA 4TQUQ 3K2DA 4NF5A 3N6TA 2GRVA 3SERA 3IO6A 1LCFA 4OESA 4JSOA 3VVFA 3TKDA 3OELA 1SYIA 1EZOA 1T0KA 3OXNA 3U1OA 1EZ9A 2B3FA 2RF1A 4I9DA 1Y1ZA 4O3BA 3FJ7A 2I4BA 1O63A 4YKPA 2O1MA 5L9MA 3HN0A 4G77A 3PMVA 2VD2A 5ITOA 3FATA 2DOJA 3CVGA 2I0CA 3UN6A 4RK9A 3O2AA 2ALUA 4MLVA 2D3IA 3CG3A 3F11A 2V3UA 2Q2AA 3T96B 4NF4A 5EHSA 1M5CA 2D5WA 1IXHA 2Z8EA 3BFTA 3UP9A 4RYAA 5TPAB 2DE4A 4KPTA 2F36A 2Y7PA 4RJZA 3EN3A 4BDQA 1BIYA 2Q9TA 4GF8A 4DIGA 4MF3A 3KN7A 2PBWA 3SEYA 4EQ9A 3LR1A 1LB9A 2WKYA 1UIVA 1FQAA 4H1XA 3TZAA 1LLSA 1FTOA 1MXUA 2XXUA 1MH3A 3K6XA 3K02A 3O6HA 1P1OA 1MDQA 4ZEBA 3FJMA 4QSEA 1SBPA 4U1OA 3SEUA 3MZBA 2O84X 1N04A 4R2BA 1P1UA 5B7DA 1N7XA 4ZDMA 3VLUA 4ONYA 4NF8A 3MVYA 4F3GA 4YAHX 2Y7WA 1MG1A 4PE5B 2XXXA 4F3PA 2DS9A 1YTVA 3PU5A 4MH5A 4Z0IA 1PB9A 4GXAA 3K00A 4G2ZA 4F1YA 3KSXA 1UIUA 3GLBA 1N84A 3LBSA 1UTBA 5AA3A 3H03A 4AQ4A 2QPQA 2VOZA 4G8HA 4X48A 2H4IA 3KSJA 2GHAA 1L5TA 4F29A 4JWXA 3U94A 1IQ7A 4DE8A 2FNCA 1LSTA 4ISUA 4BLAA 1FQDA 3PPRA 4YB6A 3DELB 5I58A 2H9BA 3S2VA 3VE1B 2RC8A 1TXFA 3O9PA 1NNKA 2I0BA 3O29A 1D3KA 3IO4A 1M5EA 2O6AA 4QFOA 2R71A 3EF7A 2PT1A 3CG1A 5K2YA 3KG2A 3T93B 1JVXA 1AIVA 2NOOA 4NE4A 4UACA 2F7CA 4JB7A 1H43A 4O3CA 1LBBA 3QYTA 2QS2A 3WAEA 4P0GA 1YPNA 5H8FB 3PUXE 3JV9A 2OBGA 4XIGQ 3HPIA 3OSRA 4N6PA 3U93A 4GWOA 1ZIUA 3O6GA 4OQOA 1SI0A 5ICTA 2QS4A 3IAZA 1ZLQA 4YB7A 2ONSA 1NH7A 3IJXB 3UA8A 4MFIA 5AA2D 5AA4A 2DE3A 2GHBA 2ZMBA 3TEPA 1B58A 4DZ1A 1BLFA 3USDA 1Q1KA 3JZJA 1FQEA 4LQ5A 2RINA 3MBPA 4GL0A 2D21A 3T9UA 2XX7A 1VE4A 1B5IA 3PMXA 1Y3NA 5DYHA 2O68A 2DVZA 1SD3A 2I3WA 4PFUA 2P1SA 3ECRA 3H7MA 3TCGA 2QSXA 1PEBA 4HTGA 3ZKLA 3GBAA 2LAOA 3I5OA 3MP6A 2PT2A 3TTLA 2YLNA 4OXVA 2V3QA 3KN3A 3QSLA 1S50A 4QHQA 2A5SA 1USYH 1B7HA 3O66A 4PFWA 1D9YA 2DXRA 4MBPA 2XXHA 1TFDA 2Y7IA 2CZLA 1Y4TA 2E0SA 4NWCA 4XKNA 3DLNA 3KOSA 2QMXA 3H6TA 3C36A 5ICQA 3SDFA 4YICA 4ZZAA 4BDMA 1DSNA 1XOCA 1B05A 3H6UA 3W9VA 3EQ1A 5FHOA 3ILTB 4IO3A 3R6UA 2W7YA 4ELQA 5BUUA 4NWDA 3DP8A 2O1LA 3S9MC 4KCCA 4RPNA 3RLFE 4H8JA 1MY4A 1Q35A 3IOWA 1MDP1 3L6GA 1P1NA 1GV8A 2HEUA 1B7ZA 1MXVA 1FQBA 1CE2A 4EQ7A 5H8HA 4BDLA 3VVEA 4GQOA 4KYDA 1PBQA 1H45A 2UYEA 3H6VA 3K6VA 4E0WA 4HS7A 1JNFA 1MY2A 3M3KA 3IOTA 3TTKA 1O7TA 5H8NA 4GD5A 4ZE8A 2DWIA 4RY1A 2OK2A 2VGQA 2F6GA 5DVJA 4U2RA 4G4PA 2HAUA 5CMKA 3FXRA 2VD3A 4P0IA 1N76A 1LFGA 5F7VA 5H8QA 1JW1A 4DXCA 2H25A 4RA1A 2F6PA 4U23A 3FXQA 1GR2A 1FTMA 1IIWA 5DEXB 3MC2A 1SDXA 2OCUA 3ZKKA 4EUOA 2F7AA 3W9WA 4F39A 1ANFA 2ONKE 1NFTA 3K4UA 1B2HA 2AL5A 1FW0A 1P99A 3A3UA 4YMBA 3IK6B 4H5GA 1OIBA 4DDDA 3A3CA 2F8DA 2REGA 4NF5B 1XC1A 4WEDA 1DTZA 2RC7A 4OEVA 1QUJA 3MVXA 4EQBA 2I48A 3U92A 4OFJA 4YZZA 4IGTA 4KYEA 1OQHA 1SW2A 4QRZA 5L8DA 1B7UA 3MZ1A 1B3LA 5FHNA 1LGBC 3MQ9A 1B1XA 3QK6A 2F34A 4KYSA 3T9HB 5B70A 3E9XA 1H44A 4F1UA 4LZ8A 1GVCA 5FTHA 1URSA 5I2KA 1EZPA 5DVIA 1R9QA 1Y4CA 4GXSB 3C9HA 5CM6A 3V5AA 4NF4B 5BWJA 2UVGA 3O97A 3FIRA 3KGCA 3K1NA 2ONRA 3ONMA 3VFJA 3CSGA 3PPPA 1LAGE 4FIMA 2NUVA 4FJPA 4GL8A 3K0VA 1HSEA 3VLWA 3IB0A 1URGA 3FUZA 2B3BA 3PD8A 4LZ7A 3MP8A 2ESNA 4GVOA 3RGYA 3CSBA 3PD9A 1P1WA 4XKQA 4U21A 3TODA 5I2NA 4EDPA 1MQIA 1LAFE 3C33A 3TQLA 5H8SA 3SKPA 4E0XA 2QJEA 2X7QA 1US4A 2QMWA 1DPPA 1VFEA 5DTBA 3KBRA 1AL3A 4R6HA 4KQPA 3E4RA 4X1BA 2OJTA 3FZVA 3I3VA 4KHZE 3SEWA 3TDJA 4POXA 1UTHA 4IGRA 5CI5A 1QJMA 1I6QA 1XS5A 4F22A 2O7IA 3TTMA 1NH8A 2YJPA 2G29A 3G3GA 4IY6A 3N26A 4LUBA 4G8MA 4JWYA 3LUYA 4NTLA 1ZTYA 1I6AA 3FXUA 1UTBB 1OMPA 3TUSA 2V84A 4BDOA 4G68A 2Q8JA 4ZEDA 1Z7ME 3M8UA 4U4XA 4KFQA 5KCJA 3RT8A 1B40A 3UGWA 1B3GA 3TMGA 4OFLA 3RQTA 3FV1A 5I58B 3G3HA 3K1MA 3V89B 1JETA 3K1PA 3C34A 2XXQA 5I56A 2UVIA 2V3TA 3D4CA 4O3AA 2XD3A 4H8IA 4F19A 2F5XA 4KR5A 3M3FA 3RY3A 1JW5A 1WODA 1QW0A 2OWTA 4LA9A 3BFUA 3TTNA 2FA7A 2Z8DA 5CMBA 4IY5A 5I84A 2IA4A 3ODBA 3RT6B 3PGFA 3VXCA 4H65A 4OETA 4OTEA 4ZEKA 4ZEIA 1P1QA 4YKKA 1A54A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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