1JVYA

Maltodextrin-binding protein variant d207c/a301gs/p316c with beta-mercaptoethanol mixed disulfides
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
371
structure length
369
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNATDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGGSVALKSYEEELAKDRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords maltodextrin-binding protein
publication title Crystine: Fibrous Biomolecular Material from Protein Crystals Cross-linked in a Specific Geometry
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 123
structure length 369
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-08-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jvyA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jvyA01
4Q0CA 4OXVA 5TP9A 5CMBA 2V3UA 1DTGA 1DPEA 2XXTA 2A5TA 5I2KB 1MXUA 1VFEA 3T9HB 1FTJA 1LB8A 4WKMA 2XXUA 3PPRA 1QUJA 1MY1A 2UVJA 4H8JA 1S50A 1MDQA 2O7UA 1QVSA 3KN8A 4QF9A 2ABHA 1N84A 1GGGA 3VLWA 1ANFA 1A8EA 5JK4A 1AIVA 2Q88A 4QRZA 4WXJA 1JETA 2REGA 4P0GA 3FGSA 4F3BA 2QPQA 5A5XB 3ZKKA 5ICTA 5AE4A 4U21A 5JTYB 2PYYA 1P99A 1DMBA 4QSCA 3MZ1A 3IB2A 1YCJA 3Q27A 3MP1A 2I49A 1NNFA 2PT1A 3QK6A 2V84A 5I59A 4IY6A 1P1NA 3VXCA 5FHMA 3R6UA 5HBCA 3MVYA 3OO7A 4THIA 1B2HA 3H6UA 2GHBA 3KOTA 3RLFE 4IGTA 2DOJA 3TCFA 3E9XA 5DTBA 2D21A 4F29A 1MG1A 3EPEA 3M3LA 1AL3A 4PQJA 2AYSA 3O2AA 4ONYA 3PMXA 5BUUA 1NNPA 4F2QA 1URSA 4YKJA 5H8FA 3LR1A 1VE4A 3OEKA 5F7VA 3O6HA 2AL5A 3TUSA 4G77A 1ZKBA 3K4UA 4WEPA 4IY5A 5I58A 4F1YA 3H03A 2M8CA 1A40A 3LSLA 4O3AA 4BDMA 1MPCA 3Q25A 3RGYA 5AA1A 4ISUA 2YLNA 3FJ7A 4BDOA 2A5SA 2H9BA 2Q9TA 4G8NA 1GVCA 1B3HA 3SEYA 3IL1B 1VSOA 3A09A 1B7UA 4EF1A 2H98A 1A7LA 1AH5A 4QFNA 4P11A 2DWJA 4UACA 1B9JA 1QULA 3IO6A 3RY3A 3O97A 4R74A 5ITOA 3TFLA 1B46A 2WKYA 4IO7A 4OWDA 2XX7A 3VVFA 3E3KA 1FQCA 4ZDMA 3FVOA 3LSXA 2P2AA 4GIZA 3IJOB 3CSGA 4UA8A 4XKRA 1URGA 4YKKA 3DP8A 4JWOA 3MPKA 2HCAA 1XVXA 3IJXB 3K6XA 4FJPA 3GBBA 2XXIA 4JSDA 3B6WA 2REJA 1SW5A 2H4IA 3K1MA 3TQWA 2XX9A 4F3PA 3SERA 4ND9A 2I6EA 2Z8FA 2R9JA 4F31B 4H8IA 1T0KA 3G3JA 4RY1A 4U1ZA 1FTOA 1UTHB 5KDTA 3TAJA 1EU8A 3ODBA 4IO6A 4YMAA 1OQHA 5H8NA 5FHOA 3VFJA 1MXXA 1WDNA 3TMGA 4X1DA 1B7HA 4GQOA 1XHYA 1EZOA 4U23A 3LBSA 3IORA 4QFLA 2XD2A 1NNKA 3UP9A 5JEIA 4PP0A 2OWTA 1MXYA 4LATA 4NTLA 4ESXA 3TZAA 4MBPA 5L9MA 2I0CA 3VVEA 3IB1A 3H4ZA 4U4SA 1B0HA 4OETA 3OOAA 2KLFA 3IX1A 3FJGA 5KCJA 1ZTYA 2H99A 3GXAA 2HQ0A 1MY2A 4HCYA 3IOWA 3K00A 3OEMA 2RINA 1MXZA 4QSDA 3H6WA 1RYOA 3HV1A 3RT8A 4EUOA 4GVOA 4FEBA 3T9VA 1IUDA 4I62A 1S9TA 3ZKLA 3JV9A 1D3KA 3OXNA 5I2NA 4FEDA 1A55A 1UIVA 3BFTA 2ZYNA 1LGBC 3K1PA 1B1HA 4OZ9A 3MPLA 3MJNA 5K2YA 1OLAA 4F3SA 1JVYA 3PU5A 3USDA 4RNSA 4P0IA 4LA9A 1Z7ME 2Z8DA 3QIMA 3O28A 3PD8A 3KSJA 4HCWA 1VR5A 2ESNA 4OEVA 2UVGA 3O6GA 1UQWA 4G2ZA 1B58A 4YICA 2DWIA 2XXQA 4R9GA 1Y1MA 1N3XA 3N26A 2QS4A 3EQ1A 4YU0A 2D3IA 4X1BA 5F1QA 3RTWB 3IK6B 3B6QA 4ZEIA 4MLVA 3T22A 4RK9A 2F5XA 1TWYA 4MFIA 3K6WA 1ELJA 4JWYA 3MP6A 4H5FA 1SYIA 3GLBA 1Y1ZA 1RKMA 3VXBA 4F2OA 1JQFA 4PETA 1POY1 1OMPA 4H6DA 2D5WA 2Z8EA 3K01A 5H8QA 4NF5A 3S2VA 1B4ZA 2ZYOA 1B40A 1PB7A 4JSOA 4C0RA 1LSTA 3O29A 2ZXTA 3T66A 3UA8A 1TFAA 3PPQA 4AB6A 3G3GA 4Q30B 2I3VA 3D4GA 4TLLB 4I1DA 1SD3A 2I4BA 2O69A 2DE2A 5CMMA 4OQOA 1OVBA 1N7XA 3WAEA 1LAXA 3UK4A 3C33A 4G68A 3QAXA 3Q29A 1ZIUA 2UYEA 2DSFA 3HSTA 1PBPA 3T9XB 2ZNSA 1LFIA 1B0LA 1D9VA 4Z7EA 4HTGA 2ZNTA 1BIYA 4MF3A 5L8DA 4G8HA 4F18A 3SEUA 2DQVA 5DEXB 1SYHA 1N7WA 4H0WA 2X26A 2I4CA 1NNTA 5CM6A 3CIJA 4LZ5A 1MM6A 3MVXA 3HHGA 1H43A 1OVTA 3PMVA 3IOVA 4FECA 4KR5A 2O1MA 3OMBA 5I2KA 1R9LA 3HHFA 1MRPA 4RK2A 2O84X 1US5A 3O66A 3QYTA 1NMUA 1B5HA 1IXCA 1RYXA 3KN3A 4RYAA 3MP8A 5HPQA 2DS9A 3A3UA 2RCBA 3KOSA 4NMYA 3C31A 4KHZE 3U92A 1H3DA 1HSJA 2QSXA 2PMSA 4LZ8A 1B3GA 3FXRA 4EQ9A 4PFYA 1MPDA 5A5XA 3EN3A 2B3FA 4KQPA 3VE1B 4NF4B 4GL8A 3CI8A 4IO5A 4QSEA 3UIFA 2OBGA 4G68C 2I48A 1AMFA 2Z22A 4ZEBA 4BDRA 4R6HA 3AXFA 3L6HA 2F7BA 1QUIA 3TDJA 4E0XA 3DLNA 2DVZA 1Y4CA 4JDFA 3TELA 4U22A 3V8XB 1N0TA 1BTJA 1NL5A 3G3IA 4ECFA 4DXUA 1LBBA 5I58B 4OVJA 4M1VA 2NXOA 2QS2A 3O6IA 3VV5A 4BDLA 2ANJA 1FTMA 1POTA 3H6TA 2OWSA 5DT6A 4BLAA 1MQDA 3FUZA 4BDNA 1H45A 4R6KA 3UN6A 3U93A 2ONSA 2Y7RA 3KJTA 4OEUA 3PUVE 1DSNA 3HCQA 4LQ5A 3T93B 2O7IA 4DCXA 5ISUA 2XXRA 4N07A 1AOVA 4H1XA 3O9PA 2Y7KA 1FCKA 2QL3A 3TEPA 4Q5TA 1F9BA 1TT1A 1B5IA 3KN7A 3L6GA 3U8QA 3DP4A 3OSRA 3SDFA 4JBZA 1ATGA 5H8SA 1LAFE 1D4NA 1OQGA 4GD5A 3SEVA 1Y20A 2F6PA 2NWJA 1M5DA 5DVJA 4LZ7A 1FQDA 4X9TA 2VD2A 5FHNA 4ZECA 4R9FA 3MVWA 4DXCA 2NUVA 4R75A 4H65A 3QXMA 5I57A 3CG3A 2UYFA 2THIA 3BFUA 4PFTA 3W15C 5AA4B 4GF8A 5AA2B 3TCHA 1QW0A 3FIRA 1LBCA 1IITA 3IOUA 3KJ7A 5I84A 4K3FA 2R6GE 4DE8A 2ONRA 1NH7A 1B52A 3PV0E 3TODA 3R7XA 2F36A 5H8NB 5HM4B 3OD7A 1WVJA 3PPOA 4NF6B 2UXAA 4Q8RA 1EH3A 2W7YA 2Z23A 1UTBB 5DYHA 2QRYA 1UTHA 1N3WA 2QMXA 4FATA 3QSLA 4DLDA 3TTMA 3SEWA 3K2DA 2GFEA 3FVGA 3VDFA 4F1VA 2DWAA 3OO8A 1Y9UA 2VP1A 2XXVA 4ELRA 2F97A 4NWCA 1IXIA 2XXHA 3H06B 3G3FA 1LAGE 2UVIA 4KCDA 3T9UA 1XT8A 3K0VA 2PT2A 3DP6A 3VLVA 4YAHX 3MZBA 3N94A 3RT6B 3PGFA 1FTKA 3K6VA 4PFUA 1IEJA 4XTCQ 2Y7WA 5M2VA 4AQ4A 3EHUA 1SW1A 4ESWA 1ZBMA 2GHAA 3RNNA 4AB5A 3I6VA 2NVUB 3K6UA 1TXFA 1DOTA 1OIBA 2IA4A 2V93A 4N13A 4G8MA 1PB8A 4ZS9A 3CFZA 5FTIA 3EHTA 4N6PA 1R6ZA 1B4HA 3BKIB 4YKPA 2HZLA 1Y3PA 4TQUQ 1MS7A 4KI0E 3B7DA 2H25A 4U2RA 3TKDA 3FZVA 1XVYA 3C36A 1BP5A 5AA3A 3M3FA 2O51A 3TYHA 1QKBA 1US4A 3H7MA 3ILUB 2Y7PA 1FW0A 4X48A 2P0SA 3FD3A 1IZ1A 4OFLA 1MDP1 2XD3A 2DE3A 2CMOA 2FYIA 1I6AA 3PPPA 1PC3A 4XKPA 1FTLA 3MC2A 4GXAA 3SETA 2XXWA 5J1DA 3U94A 4QHQA 3IAZA 3OO9A 4GL0A 4ZEKA 3CVGA 3IR1A 3H6VA 2F78A 3TTKA 2I58A 4OESA 4KYSA 3C34A 3IB0A 1CB6A 2E0SA 2XHDA 5CI5A 5I56B 1NFTA 3CR9A 3N6UA 1MPBA 3HN0A 4M4GA 5H8QB 2E1SA 4QFPA 4YKIA 3H3GA 1LFHA 3C35A 3N6TA 4RJZA 2GH9A 4EQ7A 4KCCA 2F7AA 4HW8A 4YMBA 3IOTA 1Q35A 1B6HA 1MH4A 1BKAA 3M3KA 3OENA 2Y84A 3I5OA 4DXBA 5CC2A 3TCGA 1B51A 5H8HB 3JZJA 3RTFB 1B3EA 1NKXA 3EHSA 1Y3NA 1SDXA 2B3BA 2RF1A 1GV8A 3V83A 2R71A 1JEUA 2QS1A 3FV2A 1HSEA 4NF8B 1R9QA 1LCFA 3G3KA 1SW4A 2OCUA 5TPAB 4TOZA 3ONMA 3KZGA 4RXLA 2VOZA 4DCYA 5ICQA 5K2XA 4GXSB 3PUWE 3U72A 2ONKE 1QJMA 5DVFA 1P1QA 3E13X 4U1OA 4L17A 4LVQA 5TP9B 4GLIA 1P1OA 3PUZE 2A5TB 3MW0A 1MQJA 1DTZA 3MUQA 4IO4A 4ELOA 3VLUA 3V5AA 1MM7A 1I69A 4IGRA 4ZEDA 2DVCA 3S4UA 5TU0A 5DEXA 4NE4A 4OENA 4YZZA 4ELPA 4LUBA 4IO3A 4QFOA 4RA1A 1O64A 2G93A 1CE2A 3THIA 1JW5A 2VD3A 2ZYMA 3P7IA 3IO4A 2DWHA 2XX8A 1XS5A 2XXPA 2UVHA 4XXUA 2DYXA 4ZZAA 1QUKA 3MQ9A 1LB9A 1WODA 3RUMA 5I59B 1USYH 4DDDA 1O63A 1XOCA 4EQBA 2AL4A 2Q2CA 5JTYA 5CMCA 1XC1A 2QMWA 1ZU0A 3FXQA 3K1NA 3G3HA 3TTRA 2VHAA 1IQ7A 3TPAA 1YPNA 4FORA 3LC8A 3JYRA 4BDQA 1MQHA 3V89B 1YAEA 2PVUA 4LONB 1OLCA 3QUFA 2G29A 4NF4A 5H8FB 3UGWA 2I0BA 3FV1A 1N04A 3OSQA 3PUYE 2X7PA 4HS7A 1N76A 2DE4A 1A99A 3EF7A 3SEXA 1LCTA 3PPNA 4I9DA 1VFDA 4OHNA 4U4XA 2O68A 1H44A 3C32A 1TFDA 1ZJLA 3TTLA 3M8UA 1B5JA 2ALUA 2ZMBA 4OTEA 1MH3A 2F35A 1MQGA 3OO6A 4F3GA 1BLFA 2RC8A 2CZLA 3ZSFA 1B3FA 4EF2A 2F34A 2DXYA 2P1SA 4KD5A 3A3CA 1JW1A 5IAIA 2V3TA 3FXUA 3CFLA 1MXWA 5B70A 4H5GA 1IXHA 1NH8A 1PEBA 4EDPA 3MBPA 2ZNUA 4DIGA 4RPOA 3BBRA 4R2FA 4E0WA 4R72A 4XKQA 3ECRA 3KSXA 4RPNA 3OELA 3MVZA 3MZ9A 2OZZA 3C9HA 1B05A 2F7CA 3E4RA 1EZ9A 4C1UA 4F39A 3SKPA 1A54A 1GTKA 3TTNA 5CRYA 1SI0A 4FE8A 5AA2D 1JVXA 3FVNA 3DELB 1MQIA 1PB9A 1D9YA 5I57B 4QFKA 1I6QA 5ELVA 3CRBA 3RQTA 1EZPA 2I3WA 2Q2AA 4KPTA 4EXKA 1B7ZA 1MY0A 3TQLA 1II5A 3Q28A 3I3VA 2F8DA 3Q26A 4NWDA 5AA4A 2HFBA 1Y3QA 5KDTB 1IXGA 1P1UA 5AA2A 5KZTA 4TLMB 4O3BA 4XKNA 2GRVA 3KGCA 4YB6A 3S9EA 2LAOA 3DM0A 4R2BA 2Y7IA 4H67A 2IEEA 3N5LA 3LSFB 4GWOA 5EHSA 2PBWA 2X7QA 4ELQA 1GR2A 4NF6A 1FQAA 4NEDA 4LP2B 2NOOA 4YB5A 3CFXA 3PD9A 1UTBA 3LUYA 4PE5B 2DP8A 1O7TA 1ZLQA 3PMWA 5KCJB 4DZ1A 1ZMGA 5EYFA 4JB7A 1SI1A 4OMBA 2RC9A 4ZEFA 2Q8JA 3T96B 1IIWA 5BWJA 3HO7A 2O1LA 2YPNA 4JXIA 1SQYA 5L9SA 1R1NA 3VVDA 1SVXB 3RPWA 4GRKA 3SESA 4FIMA 3D4CA 3F11A 1FQFA 5I2NB 2HAUA 2B65A 4I8CA 5ITPA 3FATA 3HPIA 3ILTB 4R6YA 1FQEA 2RKMA 1M5BA 3FJMA 4KYDA 4O3CA 5CBSA 4ZZEA 3KEIA 5L9OA 2QJEA 5DVIA 5B7DA 4GFRA 3RN8A 4F22A 1M5FA 5CMKA 3C4MA 1LLSA 1B1XA 4C1TA 1P1WA 3KBRA 5EHMA 1FQBA 2O6AA 2FNCA 2AIXA 3FVKA 2V3QA 1JNFA 3FASA 1M5CA 1PBQA 2HAVA 2V25A 3PUXE 1SW2A 4XIGQ 4YB7A 2BJJX 1LAHE 3QUJA 3G7WA 4F1UA 1HSLA 2VGQA 1B3LA 1L5TA 1MXVA 1LFGA 2XXYA 3LSWA 1S7YA 2OLBA 3MAMA 4OYVA 3KFMA 1J1NA 2F6GA 2XXXA 4GOTA 4NF5B 2OK2A 3K02A 3GBAA 1Z7NE 1I6BA 1UIUA 1B32A 5CBRA 1JW4A 4Z0IA 3MWBA 3R26A 5I56A 4OERA 2HXWA 1A8FA 2HZKA 4EXLA 4OFOA 4POXA 2HEUA 3WAFA 1Y4TA 4F19A 4FAJA 3KG2A 2RC7A 4LQ2A 5FTHA 3U1OA 4G4PA 3UORA 2Q89A 4JWXA 4MH5A 4IB2A 5LOMA 1Q1KA 4G68B 4MLQA 5H8HA 1JEVA 4WEDA 5IKBA 1YTVA 2ZYKA 3GZGA 4OFJA 3S9LC 1MY3A 2OJTA 3S9NC 2RCAA 3W9WA 3S9MC 3ZS6A 4KYEA 3W9VA 3CSBA 2PX1A 2QS3A 4ZE9A 4NF8A 2YJPA 4POWA 1USYE 2H5YA 4PFWA 5TPAA 1MY4A 1KWHA 2DXRA 1M5EA 4R73A 1PDAA 1H76A 1QKAA 1SBPA 1URDA 4IO2A 3CG1A 1DPPA 4ZE8A 3B6TA 4KFQA 2FA7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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