1JVYA

Maltodextrin-binding protein variant d207c/a301gs/p316c with beta-mercaptoethanol mixed disulfides
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
371
structure length
369
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNATDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGGSVALKSYEEELAKDRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords maltodextrin-binding protein
publication title Crystine: Fibrous Biomolecular Material from Protein Crystals Cross-linked in a Specific Geometry
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 123
structure length 369
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-08-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jvyA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jvyA01
4IY6A 4ESWA 4YZZA 3EF7A 1JVYA 3TFLA 2F6GA 3QSLA 4XKNA 1ZU0A 2ZNSA 4XXUA 4O3BA 2E1SA 5L8DA 1POY1 1JW4A 1IXGA 3N94A 4QSDA 2Q89A 4GIZA 3S9NC 1P1OA 3RT8A 3C36A 4Z0IA 3C33A 4POWA 1OVBA 3O6HA 2Q8JA 4R2BA 2RINA 5ICTA 5ICQA 2YLNA 4AQ4A 3KN8A 1RYOA 3CIJA 4OESA 4R6YA 1OVTA 4JSOA 2ONRA 3G3IA 3MPLA 4O3AA 2XX9A 3H4ZA 3CG3A 2XXYA 2Y84A 4F29A 3BKIB 4POXA 1PC3A 4YKIA 1MH4A 4PFUA 3PPRA 2LAOA 1B3FA 3SDFA 2XHDA 4HS7A 4U2RA 3B7DA 2XXTA 2REJA 3K00A 3OO6A 2HZLA 3K4UA 3RN8A 5JTYA 3O2AA 4OMBA 1MDP1 1LFGA 4KQPA 2UVIA 1N7WA 4OWDA 1JW5A 3MQ9A 2RC8A 3HV1A 3MP1A 1SQYA 4EQBA 3TTRA 1O64A 4ZE9A 3R6UA 3K02A 1LFHA 5H8QB 2O1LA 1B1XA 4DDDA 1EU8A 3VLVA 3KN3A 2QSXA 4UACA 4LZ7A 5DVFA 2P2AA 2A5SA 4RPOA 1KWHA 3FGSA 2I49A 4DCXA 4LQ2A 4FECA 3VVDA 1POTA 1DOTA 4KCCA 4P11A 2F5XA 4GFRA 3FV1A 3IX1A 1MS7A 1URSA 2HEUA 3K0VA 5I84A 2V3TA 4KR5A 1PDAA 3HHGA 3W9VA 3CFXA 3C34A 3RUMA 5AA3A 3IJXB 1VE4A 4IO2A 1AMFA 1PBQA 3LSFB 2DXYA 2O68A 2VGQA 5A5XB 2R71A 5CBRA 4ZEFA 5I59B 2DWJA 4XKQA 4LVQA 3IL1B 3KBRA 3GBBA 4FEDA 4U21A 1YCJA 2DS9A 3TUSA 4IO7A 3O29A 4AB5A 4IO6A 2I3VA 4GRKA 1B3GA 1MQIA 3O6GA 4XTCQ 1ZTYA 2ONSA 2ZYOA 3IOWA 4KPTA 1LAHE 4YMAA 1FQCA 5DVJA 4LONB 1FCKA 1B4ZA 2XXRA 1B58A 3O66A 2IA4A 3I6VA 4LP2B 2UVHA 5TPAA 2ALUA 3TCHA 5EYFA 4YKJA 1MY1A 1N84A 4FEBA 1JNFA 1H3DA 3PPQA 2X7PA 2O69A 3U1OA 3JV9A 3M3FA 1SVXB 2OWSA 3LR1A 1FTOA 1OMPA 1YTVA 3N6TA 2REGA 4OERA 3TTMA 1BKAA 1OQGA 1WODA 4OYVA 1UTBA 4H5GA 1B3LA 2XXPA 4MFIA 5AA4B 4Q0CA 1EZOA 2ZYNA 4KYSA 5KCJA 1NMUA 2RCAA 2RKMA 3U72A 5CC2A 3QK6A 3FXRA 5KDTB 4F22A 4IO5A 2GHBA 4X1DA 2QJEA 3CFZA 2HAVA 2PVUA 2YPNA 4EQ7A 4NF8B 1UQWA 1FTLA 2VP1A 3DP4A 1B1HA 2QPQA 1M5DA 4DXBA 3PUYE 3V8XB 1P1QA 5EHMA 1ZIUA 1BP5A 3TCGA 1B7HA 1GV8A 5ITOA 4H8JA 1D9VA 5H8HA 2Z8EA 4U22A 4YB6A 1ANFA 2QS4A 4F18A 4EF1A 3MVYA 1P1NA 3KOTA 3V83A 4IGTA 2RC9A 1LCTA 2UVGA 5ELVA 1NNKA 3IOTA 1Y3PA 2DVZA 1NNFA 3IAZA 4ONYA 4BDNA 1AIVA 3FUZA 3QUFA 1MRPA 4NWDA 3O6IA 3IO6A 5BUUA 3R26A 1ATGA 5FHMA 4HW8A 5I2NA 3QYTA 4OHNA 5AA1A 3HSTA 2ZXTA 2V93A 2O51A 4LUBA 3MZ1A 3UA8A 5I2KA 3TQLA 3M8UA 4U4SA 4KD5A 1VFDA 3SEVA 3CI8A 1D4NA 4WXJA 4H5FA 1B6HA 3MZBA 4GD5A 2FYIA 2Z23A 2NWJA 4OXVA 5FTHA 2XXIA 2Q9TA 4I1DA 3TDJA 3D4CA 4JWYA 2PT2A 4DE8A 2DQVA 4ECFA 3RPWA 3TZAA 1D3KA 2ZMBA 1XS5A 3RTWB 3T9HB 3HHFA 1GVCA 1SW4A 3FJGA 1B9JA 2Q2CA 4H65A 4N6PA 3BBRA 3DLNA 2H25A 1B3EA 3K1PA 1IUDA 3H03A 5DEXA 3VV5A 3VLUA 4R2FA 3TELA 4DCYA 3MVXA 4RYAA 2DOJA 1I6BA 2KLFA 4OFJA 4NTLA 4E0WA 2X7QA 2PT1A 5ISUA 2DP8A 1XVYA 4NF6A 1HSEA 3EN3A 4KYEA 5CMKA 3ECRA 2RC7A 3GXAA 4MLQA 4BDQA 1B5JA 1MPCA 4H6DA 3SKPA 3PMXA 1ZMGA 3MP8A 4YB5A 4ZEBA 4G68B 1MQGA 1FQEA 5HBCA 2AL5A 3S4UA 3O28A 1B0LA 3LUYA 1GTKA 4U4XA 3MP6A 3T9VA 4HCYA 4P0IA 1N04A 1BTJA 1B46A 2VD2A 3VFJA 3FZVA 5AE4A 1DTGA 3B6TA 2THIA 3TQWA 5M2VA 4OFLA 4M4GA 1QW0A 4BDOA 4TLMB 1SDXA 1MDQA 1A8FA 3MUQA 5DYHA 1QULA 4QHQA 4F1VA 4H1XA 2V25A 4PE5B 4JSDA 4OENA 4F2OA 1LAXA 4R74A 4FORA 2F36A 2RCBA 4WKMA 1XVXA 3T9UA 2UYEA 1B5IA 4PQJA 5J1DA 3G3HA 4U1ZA 1PB9A 4KCDA 4FAJA 4X1BA 4NF4B 3SERA 2OK2A 1Q35A 1IIWA 2H4IA 1S9TA 4F2QA 2A5TB 3GZGA 5I56A 1GGGA 2P1SA 4QFOA 1L5TA 1J1NA 5B7DA 1FTMA 4YB7A 5H8FA 3BFUA 4R6HA 1FQBA 1MY3A 4ZDMA 2Z8DA 4FE8A 3C31A 3T22A 3KN7A 4NF5B 3PUVE 1LCFA 3MJNA 2DSFA 4KYDA 3HCQA 4EDPA 3LSWA 4QFKA 3MVWA 5F1QA 3MAMA 3SETA 4THIA 5TP9A 3PUZE 1MY0A 2HFBA 4F3BA 1US5A 2Y7RA 1LGBC 3QIMA 5BWJA 3VVFA 3AXFA 4OZ9A 3K6WA 3T66A 2QS2A 2F7AA 1BIYA 5AA2A 1SD3A 1MXZA 2DWAA 1OIBA 1QUJA 1LB9A 1JVXA 4G4PA 3B6WA 3CSBA 1MM6A 4G8NA 1WVJA 3THIA 4ZECA 2GRVA 3EPEA 3IR1A 4Q30B 1Z7ME 3L6GA 3B6QA 2QRYA 1S7YA 3WAEA 1Y1ZA 1R9LA 3S2VA 3TMGA 1II5A 3USDA 5HPQA 3K1MA 4ELPA 3SEYA 4ZEKA 4JBZA 1ZBMA 3I5OA 5ITPA 2R9JA 4X48A 3FVGA 2VHAA 1ZJLA 1UTHA 5FHOA 4YU0A 4GLIA 4JWXA 3SEXA 4IO3A 4N07A 1HSLA 3PUWE 4MF3A 3KG2A 2O7UA 3IJOB 1Z7NE 3QXMA 3IOUA 3DP6A 1LB8A 2E0SA 5DT6A 3KSXA 4BDLA 5I58A 1M5CA 3Q28A 2H98A 1MPDA 5H8NA 3G3FA 1I6AA 3UORA 3VE1B 4LATA 3SESA 3LBSA 2AIXA 1MY2A 3D4GA 2DE4A 1N3WA 4EQ9A 2ONKE 1B05A 4ESXA 1MPBA 2CZLA 2XX7A 3FVOA 3VVEA 4F3GA 2HQ0A 1SBPA 1XHYA 3C35A 5JTYB 3TYHA 4H67A 2AYSA 4R72A 5FHNA 2Q88A 5H8SA 1URGA 2HCAA 4YKKA 4H8IA 2XXHA 3PD9A 1N76A 3K6UA 3IK6B 1TFDA 2DXRA 3C32A 3K2DA 2XXQA 2R6GE 1XOCA 4AB6A 3CRBA 3H6WA 4GXAA 4ZS9A 3TTNA 3CR9A 4PFTA 3PPPA 2DVCA 1IEJA 1MQDA 3TCFA 1CB6A 3LSLA 2OZZA 1IXIA 1MXYA 2QL3A 3U93A 1ELJA 4PFYA 1YAEA 1ZKBA 3L6HA 3E3KA 5I57B 3N6UA 3ZKKA 3U92A 5CM6A 4M1VA 2VD3A 2G93A 2I58A 4R9FA 1SW2A 4DXCA 3IO4A 3TODA 2VOZA 1I69A 2Z8FA 3K1NA 3K6VA 4QFLA 2Q2AA 1DSNA 1PB8A 4MH5A 3T96B 3V5AA 1FQFA 1QJMA 3IORA 3GBAA 5DTBA 1USYH 3PMWA 4EXLA 2V3QA 1RYXA 2D21A 1A54A 3EHTA 1AL3A 2W7YA 3ILTB 1LBCA 3Q26A 1Q1KA 1IQ7A 2O7IA 1Y1MA 2HXWA 3OSQA 2I6EA 1GR2A 3K6XA 3FATA 3KGCA 1CE2A 2M8CA 1FTKA 1B0HA 4C1TA 4GL0A 3KOSA 1MXXA 4GQOA 5TU0A 2F6PA 1JW1A 3PGFA 3KSJA 1NH7A 1Y4CA 4LZ5A 5K2XA 2F7CA 1AH5A 2H99A 3MPKA 5TPAB 2I0BA 3C9HA 3FVNA 1TFAA 5L9MA 1D9YA 4GOTA 2AL4A 4U23A 5CI5A 3UP9A 2F7BA 1B5HA 1XT8A 1FTJA 1A40A 4RXLA 1T0KA 4RK2A 3H7MA 2H5YA 4FATA 1M5FA 1URDA 4NE4A 1UTBB 1B7UA 3MBPA 4K3FA 4I9DA 1O7TA 1R9QA 3R7XA 3KZGA 1UIUA 3MWBA 5H8QA 2HZKA 2UYFA 5KCJB 3U8QA 3EQ1A 3SEUA 1QKBA 1EH3A 3A3UA 3DELB 3SEWA 3ODBA 3EHUA 1N0TA 4GWOA 3GLBA 4F3PA 4OEUA 1US4A 4LZ8A 1JEVA 3G3KA 3MZ9A 4PFWA 1NL5A 1LSTA 3A09A 3FV2A 1XC1A 3OO9A 3EHSA 2XXVA 4G8MA 2NUVA 5IAIA 3FIRA 4MLVA 3LC8A 1R1NA 2D3IA 3PUXE 3VXBA 4NMYA 4QSEA 3VDFA 1B4HA 1N7XA 1Y9UA 2B3BA 2OJTA 4R9GA 3LSXA 5A5XA 1QVSA 4G8HA 3PV0E 5I59A 5H8HB 1HSJA 1SW5A 1OLCA 3U94A 1Y20A 3N26A 1N3XA 3PD8A 2XXUA 3DP8A 4IGRA 1A7LA 1LAGE 2F35A 3JZJA 3O9PA 3OXNA 2Y7IA 5CMCA 3MVZA 4I8CA 1P1WA 3E4RA 5B70A 2QMXA 3QUJA 4R6KA 4RPNA 1QKAA 1B2HA 4HCWA 3W9WA 1QUKA 1IITA 5I2NB 4N13A 2ESNA 2XXXA 4YMBA 4ZEIA 4G2ZA 4C0RA 3BFTA 4U1OA 3I3VA 2XX8A 5I2KB 3KEIA 1TXFA 4TQUQ 1MG1A 2V3UA 4FJPA 4OFOA 4BDRA 4ZZEA 3ZKLA 4XKRA 3DM0A 1VSOA 3OMBA 4HTGA 3H06B 4GL8A 3T9XB 4QFPA 4F19A 4QRZA 4ND9A 4WEPA 1LBBA 5AA4A 4L17A 2YJPA 3E9XA 4RK9A 4JB7A 1H43A 3QAXA 4IY5A 3CG1A 2XD2A 4DIGA 4WEDA 1Y3QA 4BLAA 2WKYA 3IOVA 2F78A 2I4BA 4Q8RA 1MQHA 5KDTA 3UGWA 1H44A 1EZ9A 3OEKA 3KJTA 3P7IA 3ILUB 2V84A 3V89B 4NF8A 2NOOA 1WDNA 1YPNA 1DMBA 2I48A 4P0GA 3A3CA 5IKBA 3C4MA 1DPEA 5DEXB 2XD3A 3TKDA 1NNTA 5L9OA 4OETA 3OOAA 1R6ZA 3S9LC 4IO4A 5I57A 5CBSA 3OD7A 3TPAA 5LOMA 2NVUB 2PBWA 2B65A 2ANJA 1MM7A 4GXSB 4NF6B 4PP0A 2DE3A 1SI1A 4IB2A 1B52A 3H6UA 3TEPA 4QF9A 2BJJX 4OTEA 1RKMA 2I4CA 1PBPA 4QFNA 2ZNTA 3K01A 2UXAA 1LFIA 4LQ5A 3UK4A 4F1YA 1SW1A 2XXWA 4O3CA 3TTKA 2Y7PA 4YICA 4TLLB 3RY3A 1MXVA 3VLWA 2FNCA 3Q25A 3OEMA 1NFTA 2ABHA 3S9MC 3ZSFA 3M3LA 4F31B 3O97A 2GFEA 1Y4TA 2ZYKA 4X9TA 1LAFE 4KHZE 1TT1A 3ONMA 2QMWA 3G3GA 1PB7A 3FD3A 4DXUA 3PMVA 1USYE 1DTZA 2I0CA 4XKPA 3TTLA 5JK4A 4ELOA 4TOZA 3JYRA 2DWIA 3T93B 4GF8A 3FXQA 4EUOA 1BLFA 1MQJA 3FASA 4NWCA 5L9SA 5KZTA 2X26A 4UA8A 3M3KA 4ZZAA 1JQFA 5I56B 4LA9A 1IXHA 2PYYA 3CSGA 4I62A 3ZS6A 4ELRA 3IB0A 4JWOA 5H8FB 3N5LA 3IB1A 1IXCA 1QUIA 3MC2A 1AOVA 1FW0A 1JETA 2UVJA 5AA2D 4G77A 3CVGA 1I6QA 3OELA 3OENA 2PMSA 5FTIA 4F1UA 5HM4B 1IZ1A 4QSCA 2CMOA 4DZ1A 2O84X 3RT6B 2RF1A 4ZE8A 1B3HA 2IEEA 3G7WA 3IB2A 2Y7WA 5TP9B 4YKPA 3H6VA 3UIFA 1FQDA 1P99A 2PX1A 1LLSA 4XIGQ 1Y3NA 3PPOA 1UIVA 1O63A 1JEUA 5AA2B 1B51A 1MH3A 2GH9A 4G68A 2G29A 1ZLQA 4KI0E 5EHSA 3OSRA 1PEBA 2F34A 4Z7EA 4C1UA 4RJZA 3G3JA 2O6AA 3PPNA 3Q27A 2GHAA 1B40A 3H6TA 2Y7KA 3Q29A 2OBGA 4ELQA 1NKXA 3CFLA 4ZEDA 2D5WA 1B32A 1A99A 2P0SA 4R73A 2ZNUA 4OEVA 3E13X 2ZYMA 2OWTA 3HPIA 1A55A 1VFEA 4GVOA 2DYXA 4F3SA 4JDFA 2QS3A 2QS1A 2OLBA 5F7VA 1H45A 5JEIA 5CRYA 4YAHX 1F9BA 4G68C 3PU5A 3H3GA 3FJ7A 1UTHB 1EZPA 3FXUA 1OLAA 4ISUA 3HN0A 2F8DA 4NF4A 2I3WA 1TWYA 3RTFB 1S50A 4PETA 4E0XA 3OO7A 4H0WA 4NEDA 4OQOA 3W15C 1MXUA 1SYIA 2B3FA 2A5TA 4RNSA 3UN6A 2DWHA 4MBPA 2NXOA 4KFQA 4EXKA 5CMMA 2HAUA 2O1MA 1DPPA 3OO8A 5I58B 2H9BA 3KFMA 1B7ZA 3RLFE 1A8EA 5H8NB 4OVJA 3RNNA 2DE2A 4F39A 1H76A 3S9EA 3F11A 3FJMA 3MW0A 1SYHA 1VR5A 4Q5TA 4NF5A 4R75A 1OQHA 2Z22A 4EF2A 1SI0A 1MXWA 1NNPA 3HO7A 1FQAA 1P1UA 4DLDA 3WAFA 3KJ7A 4FIMA 5DVIA 2F97A 4JXIA 3RQTA 5CMBA 1NH8A 3VXCA 1M5BA 4RA1A 3FVKA 3TAJA 1M5EA 3RGYA 4RY1A 4BDMA 2OCUA 5K2YA 2FA7A 1MY4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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