1P1WA

Crystal structure of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) with the l483y and l650t mutations and in complex with ampa
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTTDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Tuning activation of the AMPA-sensitive GluR2 ion channel by genetic adjustment of agonist-induced conformational changes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2 precursor
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-04-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p1wA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p1wA01
1LCTA 3DP4A 4LZ7A 1NNKA 1XVXA 3FV1A 5I2NB 5I2KB 1ZLQA 2ABHA 3KOSA 4F3GA 3QIMA 5DVIA 1Y3PA 2DE4A 1I6BA 3OSQA 4G68C 1S7YA 2V3TA 4H1XA 3MC2A 1MQJA 4QFPA 2REGA 5CMKA 4NMYA 2O7UA 4POWA 2NUVA 3UGWA 3HPIA 3MZBA 2DVCA 1PB9A 4QFOA 3G3FA 1LAHE 5B7DA 3N26A 4GL0A 3SERA 4R6YA 2HAUA 2VOZA 2ZMBA 4LONB 4C1UA 4MLQA 3TQLA 4F2OA 3LSXA 3A3UA 4NWCA 4GRKA 1GGGA 4ZZEA 2OZZA 2D21A 3D4CA 1IIWA 2Q2CA 3RUMA 4O3CA 3LBSA 1SDXA 2O1MA 1NMUA 1PBPA 2I48A 3W9VA 3W15C 3G3GA 4PFWA 3EQ1A 1MY4A 4U4XA 1HSJA 3Q28A 4U1ZA 2ZYMA 3T9UA 2FNCA 5AA2B 3JYRA 1LBBA 3PPNA 4LVQA 3MVXA 3T96B 1SYHA 3Q25A 3A09A 4IO6A 3KN8A 5FHOA 3C9HA 1I6QA 1IZ1A 3RTFB 4FECA 2QJEA 2H5YA 2ZYOA 5L9OA 2P0SA 3CRBA 2BJJX 4OFOA 4QSEA 5IKBA 2GHBA 1PB8A 2F97A 3E9XA 2DVZA 3RLFE 1AOVA 3I6VA 2OWSA 2DE3A 2D3IA 3L6HA 3QAXA 3TUSA 3MWBA 3IO6A 5I59B 3TDJA 1POY1 2I58A 3MVWA 2DWJA 1B32A 4MLVA 4F3BA 4FEDA 2O51A 5H8NB 1LFGA 3C33A 1P1NA 2DQVA 2HXWA 4YMBA 2XXHA 3HHFA 3KN3A 3TTKA 1USYH 2PX1A 1MQIA 3Q29A 4KHZE 4P11A 1MM6A 4K3FA 1YTVA 3SEVA 2PBWA 2O84X 3M3FA 2VD2A 4ZE8A 1ZKBA 3OO9A 1B5HA 1UTBB 3SEWA 4KYSA 5CC2A 4ZS9A 1QULA 4R2FA 3TPAA 3GLBA 3IX1A 1P1QA 5DTBA 4YB7A 3OELA 4JWOA 2OK2A 1DOTA 1B46A 4WEPA 2G93A 1SVXB 4R9GA 3H06B 5B70A 1I69A 4YB5A 3EHUA 1NNTA 4Q0CA 1WODA 2O6AA 1HSEA 1H44A 2IEEA 3TTLA 1B0LA 4IGRA 5M2VA 2PVUA 3TAJA 2QS4A 1FW0A 1Y9UA 3OMBA 1B7ZA 4NEDA 5F1QA 4QF9A 2PYYA 3MP6A 2YJPA 2QS1A 3BKIB 1MS7A 4RXLA 5H8QB 3ZKLA 4KR5A 1R6ZA 2Q8JA 3MAMA 4U2RA 2Y7KA 1QKBA 1BKAA 1MXYA 4ZE9A 3P7IA 3ZKKA 3PUXE 1N84A 3B6TA 2F7AA 1B9JA 4LQ5A 3LSWA 3K6XA 2XX8A 4TQUQ 3GBBA 4DXUA 2XXUA 4XKQA 2F35A 4OERA 2ALUA 4R9FA 1H3DA 4EUOA 1ATGA 2NXOA 4JSOA 4OYVA 3MVYA 1B52A 3FATA 4I1DA 2Q88A 5I2NA 5I58B 5I2KA 2O7IA 1JNFA 3A3CA 2KLFA 4LZ5A 4F19A 3M8UA 4KFQA 1J1NA 4GL8A 1FTMA 3CFXA 4U22A 2X26A 1NKXA 4LP2B 1MQGA 3IOUA 1IQ7A 2VGQA 2GFEA 3MW0A 1N7XA 5DYHA 4DE8A 4O3BA 1R9QA 3IK6B 3U92A 4ELQA 1MXXA 1T0KA 4GLIA 4EXKA 2AIXA 1XVYA 4G8HA 1N0TA 4YKPA 3T66A 3VE1B 4NE4A 1Y20A 4YMAA 2CMOA 5JEIA 4YKIA 2ONKE 4IY6A 4F3SA 1ZMGA 4F39A 3FXQA 1I6AA 1MM7A 4H0WA 5AA2D 3EF7A 5L9SA 4ECFA 4GD5A 3RPWA 2GRVA 2I4CA 4IGTA 2DE2A 3TODA 1GV8A 3R26A 4IO2A 4OENA 2QMXA 2F78A 4ESXA 1O64A 5AA2A 4DZ1A 4JWYA 2I4BA 1PEBA 3TCGA 2RC8A 2ZYNA 5ITPA 3OO7A 4AQ4A 2DWHA 1LGBC 2UVGA 1EZPA 1SW4A 1B51A 2O68A 4R6KA 3T9HB 2I0CA 4NTLA 1N3WA 3TEPA 1SBPA 4LZ8A 5FHNA 4R74A 5IAIA 2XD3A 1WDNA 3U8QA 3OO8A 1VR5A 1SI0A 2XD2A 2Q9TA 2F34A 1OMPA 4YKJA 5I59A 3THIA 3G3HA 5FHMA 4OEVA 1B3EA 3K4UA 1XT8A 2P2AA 2AYSA 3OD7A 2UYEA 3PMWA 1B5IA 1MQHA 1VFDA 1D9YA 4GWOA 2DWIA 2XXIA 3PUZE 5H8NA 2UVJA 4OTEA 2Y7RA 3DELB 4BDLA 4R72A 3GZGA 4AB6A 4GOTA 2M8CA 3QSLA 2DS9A 4E0XA 5AA1A 1D4NA 3T9XB 4PE5B 3K2DA 4ZDMA 1H45A 4H5GA 3E13X 1MPCA 1UTBA 2ZNSA 3W9WA 5BWJA 2XXTA 5FTIA 2H99A 2Y84A 2PMSA 5FTHA 3U94A 1IXIA 3K6UA 1YAEA 1FQBA 5K2YA 1R1NA 3RN8A 3H6WA 1LAGE 3ECRA 3PD9A 5AA4B 3IJXB 3U72A 3KSXA 3AXFA 1JETA 4H8JA 5CMMA 2ZNUA 4G68B 2P1SA 5ICTA 3SEUA 1OQGA 1QUJA 3FUZA 3MBPA 4GIZA 3SESA 3K1NA 2F36A 3KSJA 4G77A 3IJOB 1LFHA 1NFTA 1UTHB 1M5DA 2YPNA 1VFEA 3K1PA 1P1UA 3PUWE 4FAJA 1D9VA 3FJ7A 4QHQA 4GFRA 2F8DA 3K00A 5J1DA 3CFLA 4OFLA 5H8QA 1MH4A 4PFUA 1MXVA 4HTGA 4IB2A 1OQHA 1N76A 3E3KA 4C0RA 4F22A 3MJNA 1NL5A 2HEUA 1N3XA 2PT2A 3O2AA 3R7XA 1PB7A 4I62A 5HPQA 3O29A 4GF8A 3PD8A 1LB8A 3TTRA 3USDA 3VFJA 4HS7A 4F2QA 4DXCA 3QK6A 3CSBA 4R6HA 4NF6B 1JVYA 1A40A 4XKNA 3B7DA 4L17A 2RC9A 2A5TB 1ZU0A 4ELOA 5H8HB 3UIFA 2NOOA 5EHMA 4EQ7A 1L5TA 5I58A 1NH8A 1URGA 1LCFA 5I56B 4EXLA 1SW1A 3OXNA 5KDTB 3IB2A 1FQCA 3QUJA 4KI0E 2VHAA 4OMBA 4JDFA 3HCQA 1MH3A 2Z8DA 5EHSA 1DTGA 2FYIA 3H6VA 4LUBA 4ZZAA 1IUDA 4F1VA 3FVKA 3TMGA 3FZVA 3FJGA 1JQFA 4FORA 5L8DA 1BIYA 2CZLA 4IO5A 3SEXA 2PT1A 3KZGA 3OEKA 3E4RA 4E0WA 4EQ9A 3FXRA 4Q5TA 4QFNA 5CRYA 1B1HA 4IO3A 1LB9A 1B4HA 2UVIA 4NF8B 3Q26A 2R6GE 1USYE 1MXUA 5BUUA 3KJ7A 3OEMA 5DEXA 1SI1A 3V83A 1ELJA 1TXFA 4P0IA 3PV0E 4OXVA 2G29A 3O6GA 3VXBA 2XXVA 1HSLA 1IITA 2V84A 2ONRA 3S4UA 1A99A 2XXRA 4DDDA 1MY3A 1MY2A 4N6PA 2XXQA 4BDNA 1B2HA 3ZSFA 4WXJA 4EDPA 2RC7A 1M5CA 4FIMA 4OESA 4BDMA 2B3BA 2F7CA 4TLLB 3MPKA 2X7QA 1JW4A 1SYIA 3TCFA 1QJMA 1DSNA 2VP1A 3H6UA 1LLSA 2Q2AA 2RINA 4UA8A 3TZAA 4OFJA 4BDRA 1UIUA 3ONMA 4G8NA 1B5JA 3QYTA 3F11A 4QFLA 1JVXA 4ND9A 1MPDA 5H8FB 3KGCA 2QL3A 3HHGA 1AIVA 3K6WA 1OLAA 2Y7IA 4DCXA 5CMBA 4IO7A 3MUQA 2DXYA 2HQ0A 3CIJA 4X1BA 1JEVA 2Z8FA 3G7WA 1YCJA 3VVEA 2ESNA 1RYOA 1UQWA 3G3JA 3WAFA 4EF1A 4FJPA 1TWYA 1NNPA 4R2BA 4AB5A 3TKDA 5CBSA 4Z0IA 2I6EA 2B3FA 1TFAA 4NF4B 1FQAA 1QW0A 3WAEA 3FD3A 5I84A 3MZ1A 3RQTA 1B58A 5KCJA 3KEIA 3LSFB 2UXAA 4YZZA 3I5OA 3IAZA 3VLVA 4OHNA 4RJZA 2ZNTA 4POXA 1POTA 5AA4A 1AMFA 3HSTA 1GTKA 2RCAA 2O1LA 4DLDA 1MG1A 4OZ9A 4G68A 4MFIA 3FIRA 2DOJA 4X48A 4I9DA 1DPPA 3GBAA 3O97A 3IOVA 4XKPA 1FQFA 3UK4A 3TTNA 4HW8A 3TELA 2I3WA 1M5FA 4KQPA 2QPQA 1B40A 2OJTA 3N5LA 4X1DA 4ELRA 1EU8A 5ITOA 1UTHA 4HCWA 4ZEIA 4WKMA 1II5A 4M4GA 3BFUA 4H65A 2F5XA 2F6PA 1FCKA 4ISUA 3D4GA 4RYAA 1FTOA 1N04A 2NWJA 5DEXB 5I57A 1B3LA 3KBRA 1JW5A 2E0SA 5JTYA 1IEJA 1IXHA 4QSCA 4H5FA 3LR1A 5A5XA 1H76A 2UVHA 2ANJA 2I3VA 1OVTA 4U1OA 1DTZA 4NF6A 4OQOA 2QRYA 5AE4A 1MQDA 5KZTA 3U93A 3CR9A 2A5TA 1B3FA 3BBRA 5H8HA 1Y4TA 1A8FA 3LUYA 5CM6A 1EZOA 4ZECA 5I56A 1P99A 1O7TA 4XTCQ 5KDTA 4F18A 3TCHA 1JEUA 3QXMA 4ESWA 4QFKA 4JSDA 1P1OA 2Z23A 1URDA 3MQ9A 3UA8A 1CB6A 4NF5B 2DP8A 1Q35A 5DVJA 1BTJA 1M5EA 4Z7EA 2A5SA 2O69A 3VVDA 5TPAA 1B3GA 3HN0A 1F9BA 3B6WA 3I3VA 1OIBA 4H8IA 2HAVA 1MY0A 4BDQA 3C32A 4LQ2A 1B05A 2Z8EA 4NF8A 2X7PA 1ZBMA 3C31A 4OEUA 2XX7A 1US5A 1LSTA 4MBPA 3S2VA 2WKYA 1UIVA 2F7BA 4DCYA 4U23A 2AL4A 1FTKA 3PU5A 3M3LA 1BLFA 1XS5A 4PETA 3R6UA 5KCJB 3IB1A 1H43A 4G4PA 3RNNA 1FQEA 1RKMA 2GHAA 4XIGQ 4F3PA 4JWXA 4RPOA 1SQYA 2HZKA 3OSRA 1Y1ZA 3SEYA 1MPBA 3TYHA 3SKPA 4X9TA 3PPRA 1Y3QA 3B6QA 2HFBA 5ELVA 3V5AA 4UACA 3PPPA 1Y4CA 3EPEA 4ZEBA 4TLMB 3S9MC 2XXXA 4FE8A 3SDFA 5H8FA 2LAOA 2VD3A 3K6VA 5EYFA 4PFTA 3H4ZA 3O6HA 2OWTA 1RYXA 3CSGA 1CE2A 2XXPA 2YLNA 4ZEDA 2QS3A 5I57B 3UN6A 4PFYA 3CI8A 3LC8A 5JTYB 4F31B 4JXIA 3IOTA 4LATA 1D3KA 3G3KA 5A5XB 1NH7A 5DVFA 3H03A 3CFZA 1QUKA 2Y7WA 2E1SA 2R71A 4IY5A 4N07A 3PMVA 5CMCA 4NF4A 3BFTA 1MXZA 2Q89A 1OVBA 4OVJA 1B6HA 3TQWA 2D5WA 3CVGA 4GXSB 3FASA 2XX9A 3RY3A 4Q30B 4U21A 1VE4A 3RT6B 4ELPA 3K0VA 3TFLA 3TTMA 1ANFA 5TP9B 3KFMA 5ISUA 3DP6A 1BP5A 5LOMA 1S9TA 3MP1A 2ZXTA 4PP0A 2H4IA 1Y3NA 4RNSA 3V89B 2RCBA 3FJMA 4RA1A 3C34A 4KD5A 1DMBA 4G2ZA 4ZEKA 1QVSA 3VV5A 2DYXA 4MF3A 1R9LA 1PDAA 5TPAB 3JV9A 4RK9A 2DSFA 3H7MA 1FQDA 1SW2A 4GQOA 2ONSA 3N94A 5HM4B 3HO7A 4KCDA 5DT6A 3FVGA 2OCUA 3PPQA 1B7HA 3MP8A 2V93A 1B7UA 3RT8A 3JZJA 4O3AA 3EN3A 2GH9A 2THIA 5AA3A 3FV2A 4TOZA 3PUVE 3O28A 1GR2A 1S50A 1LFIA 4R73A 4F1YA 5K2XA 4KYEA 3PPOA 4FEBA 1KWHA 1M5BA 4KYDA 3LSLA 3T9VA 4XKRA 1LAXA 4JBZA 1B0HA 1EH3A 4YICA 2RKMA 2XHDA 1Z7ME 3O9PA 1Q1KA 4N13A 1US4A 2FA7A 1OLCA 4NF5A 3ILTB 3IOWA 1SD3A 1GVCA 4YAHX 3MZ9A 2V3UA 3GXAA 4BLAA 3MVZA 5HBCA 4RY1A 4I8CA 1SW5A 3RGYA 2R9JA 1TFDA 1A8EA 3H3GA 4EQBA 2QMWA 2ZYKA 3UORA 2Y7PA 3G3IA 3O66A 2REJA 2W7YA 3FVOA 3EHSA 3OOAA 1B3HA 4YKKA 3DM0A 3FGSA 1YPNA 4HCYA 3T93B 4FATA 4H67A 4RK2A 5H8SA 2I0BA 4XXUA 1Z7NE 3PGFA 1B1XA 3KOTA 3IR1A 4DXBA 2DXRA 4YB6A 2XXYA 1QUIA 5ICQA 2I49A 3VXCA 3KJTA 2NVUB 1P1WA 3VDFA 3DLNA 1IXCA 2QSXA 1NNFA 3C36A 3KG2A 4C1TA 1FTLA 1MXWA 2RF1A 3H6TA 4THIA 1A55A 1XOCA 1ZJLA 1LBCA 1MRPA 3O6IA 1O63A 1WVJA 1PBQA 1N7WA 1VSOA 4F29A 3QUFA 1XHYA 4YU0A 3C4MA 3PUYE 4F1UA 1DPEA 4OWDA 3VLUA 1AH5A 3ILUB 5F7VA 3DP8A 5JK4A 1ZIUA 4QRZA 4RPNA 4MH5A 4NWDA 2F6GA 4ZEFA 1MDP1 4EF2A 2H9BA 5CI5A 4BDOA 2QS2A 3HV1A 1B4ZA 2OLBA 3N6UA 1XC1A 4M1VA 4JB7A 4IO4A 4R75A 1A54A 3ZS6A 1URSA 2OBGA 3CG3A 3K02A 3FVNA 3IL1B 4WEDA 4G8MA 1Y1MA 4KPTA 1EZ9A 4H6DA 2H25A 1IXGA 2H98A 5TP9A 3N6TA 3CG1A 3Q27A 1AL3A 3IORA 4GVOA 2XXWA 4LA9A 1QKAA 3UP9A 3T22A 4OETA 3EHTA 3K1MA 2DWAA 1PC3A 3VLWA 3S9EA 4QSDA 3PMXA 3L6GA 5TU0A 4Q8RA 1TT1A 1ZTYA 3IO4A 3MPLA 2V25A 3V8XB 2HZLA 3RTWB 1MDQA 3K01A 3M3KA 4GXAA 3C35A 2Z22A 5L9MA 3OENA 3OO6A 1A7LA 1FTJA 2HCAA 4KCCA 2AL5A 2B65A 3IB0A 3KN7A 4ONYA 3S9NC 3VVFA 3FXUA 2UYFA 1MY1A 1LAFE 4PQJA 1JW1A 4P0GA 2V3QA 4U4SA 3S9LC 3SETA 5CBRA 3ODBA 4DIGA 3U1OA 2IA4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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3MWBA 3IO6A 5I59B 4O7MA 3TDJA 2XWKA 1POY1 4NHBA 2I58A 3MVWA 2DWJA 1B32A 4MLVA 4F3BA 4FEDA 3LUZA 2O51A 1K9YA 5H8NB 1LFGA 3C33A 1P1NA 2DQVA 2HXWA 4YMBA 2XXHA 3HHFA 3KN3A 1FPGA 3TTKA 1USYH 2PX1A 1MQIA 3Q29A 2FIXA 4KHZE 5T3JA 4P11A 1MM6A 4K3FA 1YTVA 3SEVA 2PBWA 1KA1A 2O84X 3M3FA 2VD2A 4ZE8A 1ZKBA 3OO9A 1B5HA 1UTBB 3SEWA 4KYSA 5CC2A 4ZS9A 1D9QA 1QULA 4R2FA 3TPAA 4OANA 3GLBA 3IX1A 1P1QA 5DTBA 4YB7A 3OELA 4JWOA 2OK2A 1FBGA 1DOTA 1B46A 4WEPA 5EYGA 2G93A 1SVXB 4R9GA 2XWOA 3H06B 5B70A 1I69A 4YB5A 3EHUA 1NNTA 4Q0CA 1WODA 2O6AA 1HSEA 1H44A 4MAGA 2IEEA 3TTLA 1B0LA 4IGRA 3PTYA 5M2VA 2PVUA 3TAJA 2QS4A 1FW0A 1Y9UA 3OMBA 1B7ZA 4NEDA 5F1QA 4QF9A 2FIEA 3D1RA 2PYYA 3MP6A 4MNIA 2YJPA 2QS1A 3BKIB 1MS7A 4RXLA 5H8QB 3ZKLA 4KR5A 1R6ZA 2Q8JA 3MAMA 1FPDA 4U2RA 2Y7KA 1QKBA 1BKAA 1MXYA 2Q74A 4ZE9A 3P7IA 3ZKKA 3PUXE 1N84A 3B6TA 2F7AA 4IR8A 1B9JA 4LQ5A 4G61A 4XFEA 3LSWA 3K6XA 2XX8A 4TQUQ 4X04A 3GBBA 4DXUA 2XXUA 4XKQA 2F35A 4OERA 2ALUA 4R9FA 1H3DA 4EUOA 1ATGA 2NXOA 4JSOA 4OYVA 3MVYA 1B52A 2CZHA 3FATA 4I1DA 2Q88A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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