3EHSA

Crystal structure of the extracellular domain of human corticotropin releasing factor receptor type 1 (crfr1)
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
457
structure length
457
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTNAAAEFSLQDQHCESLSLASNISGLQCNASVDLIGTCWPRSPAGQLVVRPCPAFFYGVRYNTTNNGYRECLANGSWAARVNYSECQEILNE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Membrane protein
source organism Escherichia coli
publication title Molecular Recognition of Corticotropin-releasing Factor by Its G-protein-coupled Receptor CRFR1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords fusion protein of CRFR1 extracellular domain and MBP
total genus 131
structure length 457
sequence length 457
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF02793 HRM Hormone receptor domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ehsA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ehsA01
4.10.1240.10 Few Secondary Structures Irregular Hormone receptor fold GPCR, family 2, extracellular hormone receptor domain 3ehsA03
2H5YA 2V3UA 3TAJA 4I62A 3SEYA 4FEDA 3G3GA 2Q88A 5KDTB 3FD3A 3FVNA 1SYHA 1BIYA 3G3FA 2PX1A 1D9VA 2XXQA 4G8MA 4MF3A 3FZVA 4HTGA 2NXOA 1SYIA 2DXRA 3OSQA 5CMBA 3K6WA 3GBAA 2O6AA 4QSEA 2F78A 4WEPA 3UP9A 1SI1A 1VE4A 4F1VA 5BWJA 2R6GE 4YU0A 3FVOA 1GR2A 3CVGA 4H5FA 3Q26A 2RCAA 5AA3A 3SKPA 1OMPA 3TDJA 4GQOA 5JK4A 1QVSA 3O2AA 3L2JA 1RKMA 1MPCA 5H8NA 3L6HA 2ESNA 1A40A 1I6BA 3LR1A 1QUKA 4EDPA 3T9HB 2RC7A 5H8FA 1ZLQA 3PGFA 3U94A 1B3LA 3OO6A 4BDLA 1A8FA 4LP2B 4U22A 4EF1A 5LOMA 1SDXA 4FATA 3MBPA 1SW5A 3RTFB 2DVZA 3RN8A 4FORA 5ISUA 4PFWA 4R6HA 4R74A 2F7AA 1GGGA 3C9HA 1B05A 4C1TA 2O84X 5JTYA 3E9XA 3Q27A 2I6EA 1EZOA 3AQFB 2L27A 3QSLA 4F22A 4GFRA 3EQ1A 4G2ZA 1T0KA 3TQWA 1LAFE 4ZZEA 3MC2A 3RY3A 4AB6A 5KCJA 3MUQA 3M8UA 4ONYA 2RC9A 4K3FA 2X26A 1IUDA 4N07A 1M5EA 3MWBA 5CBRA 5ICQA 3S4UA 4GXAA 3EPEA 4ZE9A 3Q29A 1UIUA 3MVYA 2ZNUA 4H65A 3Q28A 2B65A 2HCAA 1ATGA 3LSFB 3P7IA 2A5TA 3N6UA 3W9WA 1TXFA 3H06B 2XXVA 4KR5A 3N26A 4GRKA 3CFZA 2QMXA 4WXJA 5CBSA 5KDTA 4P0IA 4QF9A 3FJ7A 4R9FA 3IB0A 3L6GA 3PD8A 3TPAA 1IITA 3UK4A 3PMWA 3U8QA 3VV5A 5DVJA 3EHTA 2Y7PA 2DWAA 4I8CA 3KBRA 5AA2A 4QHQA 3H7MA 3B6QA 1MY4A 4R2FA 1FW0A 4OEUA 4ZEFA 5TPAA 3PPPA 1TFDA 4JSDA 5F7VA 5L9MA 1VFDA 1I6AA 2UVGA 4I9DA 2RKMA 2NWJA 3QXMA 1R9LA 1PB8A 1LB9A 3RT8A 3WAEA 2DS9A 2DE2A 1N3WA 3UORA 2G29A 1D3KA 4OXVA 1U34A 2V3QA 3G3IA 4DXCA 1PB9A 4GL0A 2XXTA 3HHFA 5H8HA 4KPTA 5F1QA 2Z8EA 4DIGA 1NH8A 4ZEDA 1EZ9A 3A3CA 4H8IA 3FV1A 3MZBA 4R9GA 2Q9TA 1DTGA 2XX7A 1NNFA 4GWOA 1N76A 1MQIA 1QW0A 3B7DA 1FTKA 4KYEA 3GZGA 2D3IA 4QFLA 3KZGA 3IO4A 3LBSA 3DP8A 4E0XA 4TLMB 2YLNA 4R72A 5II0A 3T22A 1LFGA 3IAZA 5H8QA 2DWJA 3N7PA 3V5AA 1ZBMA 1P1UA 3MW0A 3IB2A 4P0GA 3IR1A 4OERA 3H4ZA 3VXBA 1WDNA 3BFTA 1DOTA 2B3BA 2QS2A 2F97A 1QUJA 1Z7NE 3KOTA 1YPNA 2E1SA 4OFLA 1B3HA 2REGA 2I0CA 3ONMA 2F35A 1JETA 3VLUA 4TQUQ 5BUUA 3KN8A 3QIMA 1O7TA 3G7WA 3OXNA 2DOJA 3IL1B 4YZZA 1FQCA 4DLOA 4KYSA 4C1UA 3RLFE 4ZECA 3IJOB 3IORA 3JYRA 1LAHE 1NH7A 4N13A 1XHYA 1N84A 1SD3A 2ONSA 3RGYA 1B1HA 4R2BA 3TYHA 1B6HA 3IJXB 3BBRA 1POY1 3PUXE 2I49A 3MZ9A 4E0WA 4YKIA 4THIA 4LUBA 4POWA 3SERA 2Q89A 3HCQA 2H99A 3ILTB 2HAVA 1O63A 3EF7A 1IQ7A 3BFUA 4ELQA 1B0LA 3RT6B 1M5BA 3OENA 1MXYA 2NUVA 3PU5A 5ELVA 3S9EA 3KN7A 2HZKA 4NMYA 2P0SA 4G4PA 4YICA 2OZZA 2F6GA 1NFTA 3EN3A 2VOZA 4ZGMA 2HQ0A 4M4GA 4RA1A 1OQGA 2X7PA 4F3PA 1WVJA 5L8DA 4QRZA 4Z7EA 4HW8A 4QSDA 1XVXA 3D4CA 3M3FA 4X48A 5IAIA 2XXWA 1MH3A 1SW4A 4ELRA 2P2AA 1Y4CA 4QFKA 4NEDA 4DXBA 1A8EA 3B6WA 5EHMA 1UIVA 4IY5A 1DMBA 5I58B 4M1VA 5FHMA 3HSTA 5CI5A 3SEUA 1VR5A 2B3FA 1XOCA 2AL5A 2QKHA 1N04A 1EH3A 1YTVA 3S9NC 5I57A 2BJJX 3EHUA 4DZ1A 3DP4A 5ITPA 3H6WA 1Q1KA 3AXFA 3GXAA 3E3KA 1B5JA 1Q35A 3LSLA 3IOWA 4WKMA 2OCUA 4QSCA 1PBQA 2ANJA 2F34A 3RNNA 4JSOA 3KGCA 3H6VA 4YB7A 3UN6A 1YCJA 4QFPA 4Z0IA 3FJMA 1SVXB 3IOUA 5KZTA 3BKIB 3M3KA 4JWXA 3EHSA 1JQFA 1H43A 1S7YA 4RPOA 4R6KA 4G8NA 3S9MC 1OLCA 3B6TA 5L9SA 1BP5A 1Y3PA 5J1DA 3O6GA 1Y1MA 3LSWA 4IGRA 1MQGA 1QKBA 2DE4A 1F9BA 4F3BA 4AQ4A 3CFXA 3QYTA 2XD2A 1ZMGA 4NF5B 1FTMA 4PFTA 1BLFA 4QFNA 5A5XB 3TTRA 4PFUA 3TMGA 5AA1A 2H4IA 4QFOA 4OFOA 4FE8A 2UYEA 2Z22A 4FECA 1MDP1 3N94A 3TTNA 4ZEIA 3N7SA 3N6TA 4GLIA 1UTBB 4ZE8A 3C33A 4KI0E 2OWTA 4BDQA 1Y20A 3SEXA 2YJPA 1B5HA 1FQFA 1H44A 2GHBA 3C35A 1P1NA 2PT2A 3O6HA 1B1XA 4FAJA 1J1NA 4BLAA 3K02A 3K0VA 3FV2A 4KCCA 1PEBA 3S9LC 3FASA 3G3KA 2H98A 4NF8B 2THIA 1FQAA 3O9PA 5TP9B 2Y84A 3T96B 4EXLA 1JNFA 1L5TA 2RF1A 1B7HA 3MPKA 2ZYOA 2NVUB 3F11A 1MXUA 3C4MA 1FQDA 3N5LA 4GD5A 1MPDA 5I59B 4F29A 1FTJA 1CB6A 1B32A 3K1NA 2HFBA 4DLQA 2O51A 1M5DA 3T9VA 3UGWA 4JBZA 1SI0A 1IXCA 2DXYA 2XD3A 3RTWB 4LQ2A 4F3GA 3C31A 3PPQA 4IO5A 3PUYE 4F39A 4PQJA 4HJ0A 3H6UA 1H3DA 4H5GA 2FYIA 2IA4A 4LQ5A 1B52A 3CSBA 2XX8A 2PBWA 4TOZA 4IO2A 4MH5A 3W9VA 4JDFA 4ELOA 4DXUA 2AIXA 3IX1A 3A3UA 4JB7A 1ZJLA 1B51A 4NF5A 5I2KB 2DWHA 5A5XA 2PYYA 4YKPA 4FJPA 4G68B 4KFQA 2QS3A 2GFEA 3DLNA 2XXHA 3O28A 2V25A 3O6IA 2F6PA 3KSJA 4OYVA 2GRVA 4ZZAA 1XVYA 1UTBA 4KD5A 1USYE 1GVCA 3PMXA 3USDA 1JVXA 5CRYA 2OLBA 2XXRA 1DTZA 1NNTA 2H9BA 1URGA 1AOVA 2KLFA 4FEBA 1O64A 1LGBC 3CFLA 4H1XA 2REJA 4DCYA 1R9QA 1QUIA 4NF8A 4DE8A 5TP9A 4DLDA 2R9JA 3TTLA 4GF8A 1QJMA 2GH9A 4ECFA 3MP6A 4NWDA 1Y9UA 3IO6A 2QRYA 2O68A 2M8CA 3MAMA 1YAEA 4R73A 5L9OA 3TTMA 4IY6A 1URSA 3OEMA 3C5TA 3UA8A 4XKRA 1A55A 1MQHA 1SQYA 5I59A 4F3SA 1OQHA 2I4BA 1URDA 5FHOA 1DPPA 3QUFA 1JVYA 3T9UA 4U4SA 4YKKA 1JW4A 4X9TA 4FIMA 4LZ7A 4JWOA 1DSNA 2I48A 3OOAA 1MM7A 2H25A 4OWDA 4XIGQ 4EF2A 2ONKE 4XXUA 1S9TA 1FQEA 1UTHB 3C32A 1B9JA 3FUZA 1MQJA 1PBPA 4U23A 4MLQA 4NF6B 3PUWE 4O3AA 3E13X 1PC3A 1LBBA 1N3XA 3C59A 3CSGA 1AH5A 4KHZE 4I1DA 4IO7A 1LCFA 1NKXA 4YMAA 2E0SA 2O7IA 5I2KA 4L17A 3PMVA 4YMBA 3V89B 4TLLB 4G68A 1B0HA 3CRBA 1VFEA 2O69A 1GV8A 4OMBA 2UXAA 2I4CA 5DEXB 1OVTA 4OENA 2Z23A 4N6PA 5HM4B 2ZXTA 1D4NA 2ZNTA 1MXZA 1N0TA 3PPNA 3ZSFA 4LZ5A 4PETA 1A7LA 3LC8A 2F7CA 3KG2A 4U4XA 4RK9A 1Y3QA 4ERSA 1AIVA 1A99A 3I3VA 2A5SA 3VDFA 4LZ8A 4O3CA 1JEUA 2UVHA 3K01A 3ZS6A 3MVZA 3IOTA 3OMBA 1MM6A 2QJEA 4F1YA 4ZS9A 3U92A 4RNSA 2Q2AA 3GBBA 2QS1A 2HZLA 3N7RA 5K2XA 4P11A 1XC1A 3FATA 4OHNA 4YKJA 1HSLA 4PE5B 4IGTA 5H8NB 1MRPA 2DWIA 1LB8A 3HN0A 3K00A 1IXGA 2ZYKA 4MFIA 5H8FB 4UACA 3PV0E 1TFAA 4RK2A 3TTKA 3MQ9A 4KCDA 1PB7A 5I84A 3HV1A 3CG3A 4ZEKA 5IKBA 1ZU0A 2D21A 2ONRA 4OQOA 3MVXA 2Y7KA 2QPQA 3G3JA 4IO6A 3FXUA 1LBCA 2DYXA 2ZYNA 4RYAA 3K4UA 3CI8A 3SETA 3R6UA 3FXQA 2YPNA 5JTYB 1Y1ZA 2DVCA 3SDFA 5ICTA 2I3VA 4U1ZA 1PDAA 2DSFA 2XHDA 5KCJB 3CR9A 4XKPA 2HAUA 3O66A 5CMKA 4H0WA 5CMCA 5HPQA 2O1LA 2PVUA 3E4RA 1MXXA 2F36A 3KEIA 4OTEA 4BDMA 2NOOA 2A5TB 4U21A 5DEXA 2QSXA 1B3EA 3VXCA 2RINA 4XTCQ 4EQBA 1GTKA 3A09A 1MY2A 3V83A 4UA8A 3SEWA 4HCYA 3RPWA 1IZ1A 3GLBA 1LFHA 3H03A 3CG1A 4G77A 3ECRA 3THIA 4GXSB 5AA2B 1ZIUA 3PPRA 3TEPA 3VLVA 1XS5A 2Z8FA 4RPNA 1UQWA 1TT1A 4ELPA 1ELJA 2P1SA 5TPAB 4JXIA 1P1OA 1ANFA 3TCGA 2O1MA 3WAFA 4NWCA 3TCHA 4KYDA 4PP0A 2O7UA 1B3GA 2XXIA 4RY1A 5EHSA 1IXHA 1RYXA 1HSJA 4AB5A 4F19A 3TODA 4G8HA 4IB2A 4R6YA 4WEDA 4EQ9A 2LAOA 3HHGA 4BDRA 3G3HA 4NF4B 5I58A 5H8HB 4X1BA 2WKYA 1Y4TA 2CMOA 5B7DA 2JODA 3QUJA 1US5A 3DM0A 1RYOA 2FNCA 4H8JA 1H45A 4F31B 3FXRA 2V93A 1R6ZA 4IO4A 1MPBA 5FTIA 2F5XA 3TCFA 3VVEA 1AL3A 4XKQA 4OETA 1N7XA 3K6UA 1II5A 1P1QA 4ND9A 4HS7A 4Q5TA 2CZLA 3KFMA 1FCKA 3O29A 4DDDA 4NTLA 5H8QB 1B5IA 3VLWA 1MH4A 2QS4A 2OJTA 3PUZE 3OO7A 1OVBA 1NNPA 1MY0A 1P99A 5EYFA 1QKAA 2OWSA 4F18A 5FHNA 5AE4A 1US4A 3UIFA 1JW5A 3D4GA 3SEVA 3T9XB 2AL4A 4DCXA 2Y7WA 3IOVA 3O97A 1S50A 1AMFA 4OFJA 2RCBA 1IIWA 2ZYMA 3TUSA 2VP1A 2G93A 4ESXA 2V84A 1NNKA 3H6TA 5JEIA 5I56B 3ZKLA 4F2QA 4PFYA 2UYFA 3DELB 2ABHA 1HSEA 3ZKKA 1Z7ME 4XKNA 2VGQA 3LUYA 5DVFA 3C36A 1R1NA 4F1UA 3KJTA 1QULA 2VD2A 3HPIA 3OO8A 2HEUA 3K1PA 1TWYA 2ZNSA 5DYHA 2JNDA 3FGSA 5K2YA 5CC2A 1B4HA 1B4ZA 2UVIA 3T66A 1B3FA 3TQLA 3JV9A 1POTA 4HCWA 2OK2A 4YB6A 4NF4A 1SBPA 1LAXA 4ESWA 3KSXA 2XDGA 4POXA 4G68C 4LA9A 1FTLA 3JZJA 4YAHX 3IK6B 3H3GA 1B7UA 1DPEA 2AYSA 3MPLA 1NMUA 3KJ7A 4BDOA 1FQBA 5AA4B 5DTBA 2R71A 3RUMA 3FVKA 4LONB 4MBPA 3VVFA 1B58A 4X1DA 2VHAA 2FA7A 3IB1A 3K1MA 1Y3NA 2DE3A 1B7ZA 1MXVA 1I6QA 1MQDA 4OVJA 2RC8A 1LCTA 3IOLA 1SW1A 1I69A 3K2DA 3I6VA 1WODA 5M2VA 3QAXA 1M5FA 3KN3A 5AA2D 2Y7RA 2UVJA 4KQPA 1OLAA 5DVIA 1LLSA 2I0BA 1MDQA 3OD7A 4GVOA 4EUOA 4U2RA 1N7WA 1B2HA 5TU0A 1LFIA 2ALUA 1M5CA 4Q0CA 5CMMA 5B70A 5I57B 5HBCA 4C0RA 4GIZA 4H6DA 1USYH 3MVWA 1IXIA 2W7YA 4EQ7A 4H67A 3R26A 4YB5A 4O3BA 1P1WA 1ZTYA 5I2NB 2X7QA 2VD3A 3I5OA 5I56A 1FTOA 3W15C 1VSOA 1B46A 3FVGA 3MP1A 4OZ9A 3VFJA 3K6VA 3K6XA 1JW1A 3OELA 2Z8DA 3T93B 1EU8A 4Q30B 2D5WA 3M3LA 4R75A 5ITOA 3PUVE 4EXKA 2DQVA 3OEKA 5CM6A 2XXPA 3QK6A 4ZEBA 2ZMBA 3PPOA 3SESA 4NE4A 3TKDA 2QMWA 5FTHA 3MZ1A 1EZPA 1H76A 1B40A 4IO3A 2XX9A 3FIRA 3ILUB 1A54A 3MJNA 2JNCA 1SW2A 4JWYA 3VE1B 2F8DA 3V8XB 4LATA 2GHAA 4LVQA 3U1OA 2PT1A 3OO9A 2XXXA 5AA4A 2I3WA 3RQTA 3Q25A 4U1OA 3HO7A 1BTJA 4Q8RA 4GL8A 1JEVA 3U72A 2OBGA 2QL3A 2HXWA 3LSXA 3VVDA 4GOTA 1LSTA 1ZKBA 5DT6A 3PD9A 2V3TA 3TELA 3CIJA 3TFLA 2IEEA 2I58A 1MY1A 2XXUA 2PMSA 3U93A 1MY3A 4ZDMA 2Q2CA 4MLVA 3MP8A 3C34A 1UTHA 2DP8A 3S2VA 1LAGE 2Q8JA 1CE2A 4ISUA 3DP6A 4NF6A 4LF3C 5H8SA 3FJGA 3TZAA 4RJZA 1IEJA 2F7BA 3R7XA 4F2OA 1KWHA 1BKAA 4OEVA 1OIBA 1NL5A 4RXLA 2XXYA 1MG1A 1XT8A 1MXWA 3ODBA 5I2NA 1D9YA 1MS7A 4BDNA 3KOSA 4OESA 2Y7IA 3OSRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2H5YA 2V3UA 2KQZA 1FPDA 5ET5A 1FBPA 3TAJA 4I62A 3SEYA 4FEDA 3G3GA 2KR0A 2Q88A 5KDTB 3FD3A 3FVNA 1SYHA 1BIYA 3G3FA 4HE2A 3B8BA 2PX1A 1D9VA 2XXQA 4G8MA 4MF3A 3FZVA 4HTGA 2NXOA 1SYIA 2DXRA 4MJOA 3OSQA 1EYIA 5CMBA 3K6WA 3GBAA 1YZ0A 2O6AA 4QSEA 1NV4A 2F78A 4WEPA 3UP9A 1SI1A 1VE4A 4GX3A 4F1VA 5BWJA 2R6GE 4PBHA 4YU0A 3FVOA 1GR2A 3CVGA 4H5FA 3Q26A 2RCAA 4OVQA 5AA3A 3SKPA 1OMPA 3TDJA 4GWXA 4GQOA 5JK4A 1QVSA 3O2AA 3U65A 3L2JA 1RKMA 4OVPA 1MPCA 5H8NA 4H45A 3L6HA 2ESNA 1A40A 1I6BA 3LR1A 1QUKA 4EDPA 3T9HB 2RC7A 4PAIA 5H8FA 1ZLQA 3PGFA 2GQ1A 3U94A 1B3LA 3RPLB 3OO6A 4BDLA 1A8FA 4LP2B 4U22A 4EF1A 5LOMA 1SDXA 4MNIA 4FATA 3MBPA 1SW5A 3RTFB 2DVZA 3RN8A 4FORA 2XA5A 5ISUA 4PFWA 4R6HA 4R74A 2VPOA 2F7AA 1GGGA 1DCUA 3C9HA 4O94A 1B05A 4C1TA 2O84X 5JTYA 3E9XA 3Q27A 2I6EA 1EZOA 3AQFB 2L27A 3QSLA 4F22A 4GFRA 3EQ1A 4G2ZA 1T0KA 4GWSA 3TQWA 1LAFE 4ZZEA 3MC2A 3RY3A 4AB6A 5KCJA 3MUQA 3M8UA 4ONYA 2RC9A 2V4CA 4K3FA 5EQ7A 2X26A 4PF6A 1IUDA 4PAFA 4N07A 1M5EA 3MWBA 5CBRA 5ICQA 3S4UA 4GXAA 3EPEA 4ZE9A 3Q29A 1UIUA 3MVYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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