2H5YA

Crystallographic structure of the molybdate-binding protein of xanthomonas citri at 1.7 ang resolution bound to molybdate
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
232
structure length
232
Chain Sequence
TAPVTVFAAASLKESMDEAATAYEKATGTPVRVSYAASSALARQIEQGAPADVFLSADLEWMDYLQQHGLVLPAQRHNLLGNTLVLVAPASSKLRVDPRAPGAIAKALGENGRLAVGQTASVPAGKYAAAALRKLGQWDSVSNRLAESESVRAALMLVSRGEAPLGIVYGSDARADAKVRVVATFPDDSHDAIVYPVAALKNSNNPATAAFVSWLGSKPAKAIFARRGFSLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Molybdate-binding periplasmic protein
publication title Crystallization, data collection and phasing of the molybdate-binding protein of the phytopathogen Xanthomonas axonopodis pv. citri
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas axonopodis pv. citri
molecule tags Metal transport
total genus 75
structure length 232
sequence length 232
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2h5yA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2h5yA02
1USYH 1IXCA 1ATGA 5A5XB 4C1TA 1D9VA 1WVJA 5BUUA 1D9YA 1SD3A 2NWJA 5DEXA 3IX1A 4YB7A 4OFOA 1IQ7A 2DXYA 3BKIB 3K4UA 3PPPA 2Q89A 2YLNA 4F19A 2Y84A 1B7UA 2RINA 1AOVA 1AIVA 1POTA 3TELA 3E9XA 4NWDA 3M3LA 4EXLA 3KN7A 5H8QB 2Z8FA 2I49A 1ZMGA 1B32A 1POY1 5EHMA 3OO7A 4JXIA 3OXNA 1NH7A 3RGYA 4U21A 2Z8EA 3O2AA 3S9NC 1XVXA 1H43A 1MM6A 3EHUA 3DP6A 5I59B 3G3IA 4YMAA 3FZVA 2D5WA 3SEWA 3FJMA 4FJPA 4XKPA 2UVHA 1M5EA 1JNFA 5CBRA 5L8DA 1HSLA 5DT6A 3CSBA 4TOZA 1FCKA 3LSFB 2VHAA 3RUMA 2F35A 4GXAA 4E0WA 2Y7PA 3IOVA 2V93A 3ZS6A 3B6QA 1H3DA 3K00A 3VDFA 2AL5A 3HSTA 3IB1A 2O84X 3QSLA 3F11A 2YJPA 4ZZAA 4DXCA 1NKXA 1B1HA 1M5CA 2BJJX 4ND9A 4JWOA 4NF6A 4QF9A 1A7LA 2FA7A 3MZ9A 3TQWA 3K6VA 2I3WA 3EQ1A 2PMSA 2XD3A 2THIA 1BTJA 4AB5A 4YMBA 1ZU0A 2P0SA 2QSXA 4KYEA 1QJMA 4DCYA 3G7WA 3N5LA 4DXUA 4P0GA 3IL1B 1JVXA 2RF1A 1DPEA 3EPEA 1N3WA 3DLNA 2OLBA 2XX8A 3LBSA 3VVDA 4LZ5A 3T9VA 3Q27A 1Y3QA 2O1LA 4JWXA 2XXHA 4MH5A 3USDA 1WODA 3MVXA 4U2RA 1MRPA 4F29A 5CI5A 2R71A 5CMKA 3RY3A 4KCDA 5I56A 4PQJA 4JSDA 5TP9A 2PVUA 5H8NB 1MM7A 3KOTA 4QSCA 2NVUB 2QS4A 3UN6A 4QRZA 3Q28A 4LATA 1Z7ME 2VGQA 3PUXE 3CFZA 4BLAA 3C33A 5ITOA 3AXFA 4Q5TA 1YTVA 2GRVA 3RT8A 1A99A 4U1ZA 4AQ4A 5I57A 3T93B 4R73A 1MQIA 1MH3A 3B7DA 3R6UA 2HZKA 5ITPA 4OETA 4NTLA 2UVGA 3TPAA 2OWSA 4NF6B 5AE4A 1P1WA 3U72A 3OSRA 4KHZE 3FJGA 4FECA 3PGFA 1F9BA 3SEXA 3A09A 3FATA 2Q2CA 2YPNA 1H76A 3T9XB 2XXUA 4OERA 4AB6A 3THIA 5TU0A 4IO4A 3H4ZA 1PBQA 4NF4A 3G3JA 1I6AA 1OQHA 1FTKA 2XXRA 1DMBA 1LLSA 1B3HA 4K3FA 4G8NA 1B6HA 1O63A 2ANJA 4I1DA 2P2AA 4OFLA 3D4CA 4F2QA 4KI0E 1MPCA 1B3FA 4X9TA 1A40A 4ZS9A 4OESA 4Q0CA 2ZMBA 4BDQA 2RC7A 3R7XA 1EZ9A 3T22A 1HSEA 1SW2A 4HS7A 5I84A 1SW1A 3WAEA 3MP1A 3FASA 3K1NA 3CVGA 1B7ZA 2OK2A 4IB2A 5L9SA 2XXVA 1S7YA 3ONMA 2F36A 2XHDA 1USYE 3OD7A 2ZNTA 2F6GA 4G68A 2I6EA 1MG1A 4ONYA 1ZLQA 1NNKA 4YKKA 3JV9A 2ONKE 1B52A 4F31B 4PFYA 1RYXA 1NMUA 2V84A 3UORA 3Q29A 4WEPA 2UVJA 5FHMA 1N84A 4ESWA 3ZKLA 1TT1A 3QK6A 2W7YA 4YU0A 4NF8A 3KG2A 5IKBA 1FTOA 2LAOA 4IO2A 4DXBA 5TPAA 2DWAA 3G3KA 4H67A 3EHTA 3PU5A 3MBPA 3MUQA 3HHGA 4F3PA 4BDLA 2QJEA 3O6HA 4ZDMA 3JZJA 2UVIA 3LC8A 1DTZA 2WKYA 1L5TA 2Y7WA 1FQFA 3RPWA 4R75A 3HO7A 4NE4A 5K2XA 2F34A 1D4NA 2D21A 4JWYA 3OOAA 2B65A 3DM0A 1PC3A 4G2ZA 3C4MA 4F1VA 4RPNA 2REJA 3ZKKA 2ONSA 2HZLA 4IY6A 1MY4A 3SESA 4LVQA 4PFWA 2VD2A 4I9DA 1EZOA 4F2OA 1II5A 1UTBB 4NWCA 4WKMA 3U94A 2XXIA 3MPKA 1ZIUA 3O97A 1BLFA 3O66A 2DYXA 4KYSA 2DSFA 1A8EA 1LCTA 2H5YA 3I3VA 3KN8A 3T9HB 1SYHA 3ILUB 3W9WA 3FXRA 2DXRA 4IY5A 1JEUA 1H45A 4HW8A 4EF1A 1D3KA 2DE3A 5TPAB 4LZ8A 4QFLA 3PUWE 3RT6B 4N6PA 1MXZA 4FEBA 1Y4TA 3IORA 3ZSFA 1OIBA 5KDTA 4YKIA 4GOTA 1OVTA 1SVXB 1B5JA 2Q2AA 4ELPA 1N0TA 4Z0IA 2Y7RA 4I62A 2GFEA 3K0VA 2H4IA 1B2HA 3RTWB 4GVOA 4Q30B 3KEIA 1ELJA 2OCUA 1P1OA 3OELA 3TFLA 1HSJA 1ZJLA 3CFLA 4YZZA 4RNSA 3MVYA 1BKAA 1MXWA 4ZE9A 3O29A 4FATA 2VOZA 4H0WA 1GGGA 4H5GA 5FTIA 3VFJA 1SYIA 4KCCA 3MVZA 4ZE8A 1URSA 5AA4B 3MW0A 3H7MA 4LQ2A 5AA2D 2I0BA 4FIMA 1QKAA 2O68A 1XOCA 2H9BA 1MQHA 1MQJA 4PE5B 5EYFA 5AA3A 1US4A 3VV5A 4LA9A 2M8CA 4F3BA 3WAFA 2B3FA 1VFDA 2X7PA 1LAHE 4IO5A 3DP8A 4R2FA 1LFHA 4TLLB 2E1SA 5H8HA 3Q26A 1A54A 1JW5A 1Y9UA 4IO6A 3C34A 3RN8A 1P99A 5DVFA 5I2KA 1I6BA 2HQ0A 2REGA 1URDA 4MLVA 5I58B 1FTMA 1LSTA 4RK2A 3K2DA 3TCGA 1R1NA 1DOTA 4OVJA 3SEVA 1RYOA 1P1QA 3TMGA 2QS3A 3KN3A 5DEXB 3FUZA 1B3EA 5BWJA 1GV8A 2F6PA 2PT1A 2V3UA 3B6TA 4RYAA 3P7IA 1Y1MA 2VP1A 1FQDA 1NL5A 1B7HA 5F1QA 1AL3A 1YCJA 3C31A 4G4PA 5DTBA 5CBSA 4H8JA 1FW0A 4LZ7A 4QFNA 2B3BA 3PV0E 3KZGA 3ILTB 4GL0A 5ELVA 3TTMA 2HXWA 3O28A 3QUJA 5LOMA 1BIYA 4PP0A 4MLQA 4KQPA 2QMWA 1JQFA 3BFUA 4I8CA 1FQEA 2DE2A 2PT2A 1GTKA 1MDP1 1ZTYA 2QS1A 1Y3PA 3MPLA 4R6HA 3TKDA 3OMBA 1B3GA 1O64A 3VVFA 4KPTA 3OEMA 3HCQA 4JDFA 4JSOA 5EHSA 2O51A 1MS7A 4H5FA 2F7BA 3GLBA 2OZZA 3QAXA 4XTCQ 1IXHA 3VVEA 1UIUA 4RXLA 4HCWA 3VXBA 3UGWA 5H8HB 4ZZEA 2ZYMA 4TQUQ 1I6QA 1OLAA 3K02A 3FXQA 3PUVE 3PUYE 1A55A 1LFGA 5DVJA 1RKMA 3OO8A 1MXYA 2DOJA 5K2YA 1OVBA 2QPQA 2RKMA 2OWTA 3IJOB 4QHQA 2ZYNA 4EQ7A 3HN0A 1QUIA 3IK6B 4R9GA 2CZLA 2FYIA 4F1UA 1DTGA 3S9EA 4GIZA 1SI1A 1B4HA 3IJXB 3CR9A 1QULA 4Z7EA 1IUDA 4XIGQ 4X48A 4R2BA 3QIMA 3MZ1A 1XT8A 4QFPA 4LONB 3GBAA 1OMPA 4POWA 3KSJA 1B0LA 1N76A 1VE4A 1P1NA 1JVYA 3C35A 5I56B 1MXVA 4U23A 3OO9A 3K01A 5TP9B 4RA1A 5CC2A 3HPIA 3KJTA 5FHNA 1JW4A 2Q88A 4GD5A 2F97A 2XXWA 2XXYA 2ALUA 1EZPA 4MBPA 3DELB 4F1YA 3UIFA 2ONRA 1I69A 5HM4B 2QS2A 3V5AA 1VR5A 3FVGA 3EHSA 3H6TA 1QW0A 5HPQA 4QFOA 4RPOA 1M5DA 2DVCA 1R9QA 5I57B 1SI0A 1MY2A 3CG1A 3T9UA 2ZNSA 1R6ZA 3ODBA 1FTLA 2DE4A 3RTFB 1JEVA 4M4GA 4XXUA 4U1OA 4ELRA 1ZBMA 2F7CA 4OTEA 3OEKA 4G8MA 4F18A 4EUOA 2QL3A 4PFTA 5H8FA 1T0KA 3CI8A 4O3CA 4F22A 1B0HA 1NH8A 4BDNA 1SBPA 1AMFA 4ELQA 1QUJA 4GRKA 4NF4B 1ZKBA 4OZ9A 1LAXA 3GXAA 1MDQA 1XS5A 4ISUA 3PMVA 1MQDA 4ELOA 3QUFA 1GVCA 4ESXA 1O7TA 5A5XA 3M8UA 3IO4A 3B6WA 3UP9A 4FAJA 4OMBA 2RCAA 3VXCA 3VE1B 5CMMA 1ANFA 5L9OA 3CRBA 5CMCA 1MY3A 1TFAA 4ZEFA 3W15C 2RC9A 4EQBA 4KD5A 2G93A 4ZEIA 5H8SA 1B40A 2DWJA 2NUVA 4G68B 2I3VA 2I4CA 3U8QA 1P1UA 4KFQA 3CIJA 1N04A 3TTKA 4IO3A 3TODA 3MAMA 4H8IA 2DP8A 5DVIA 4NMYA 1S50A 5M2VA 4WXJA 5I59A 1FQAA 3TYHA 3N26A 1IXGA 3TUSA 1LAGE 1CE2A 1Q1KA 3PPRA 2HEUA 4KYDA 4DDDA 2HCAA 3TTNA 4O3BA 1VSOA 4ZEBA 4RK9A 3KJ7A 3JYRA 3IB2A 5KZTA 1EU8A 3G3GA 1A8FA 4NF8B 1B46A 4GLIA 3MP6A 5JTYA 4MF3A 3TTLA 4HCYA 4M1VA 4DZ1A 2O6AA 1TXFA 1GR2A 3L6HA 4U22A 5J1DA 3PMXA 4DCXA 3SERA 4DIGA 2KLFA 5CM6A 3K6UA 3PUZE 3MVWA 3OO6A 5KCJA 1FTJA 3IAZA 1N7XA 3E3KA 5HBCA 5JEIA 3OENA 4DE8A 3HHFA 4DLDA 2Z8DA 2F8DA 2PX1A 2GHAA 3HV1A 2Y7IA 1XC1A 2XX9A 2AL4A 3IB0A 1PDAA 1URGA 2F5XA 3FV1A 2ZYKA 4BDRA 4G68C 4POXA 2ABHA 3MP8A 2I4BA 2Z22A 4F39A 3RNNA 2QMXA 1NNFA 2P1SA 5I2NA 3M3FA 3KGCA 2H99A 3E13X 4TLMB 5CMBA 1B4ZA 3C36A 3TAJA 5F7VA 2E0SA 3U92A 4LUBA 3CFXA 5CRYA 3A3UA 3BBRA 2PBWA 1Y1ZA 4GXSB 4EQ9A 4RJZA 3TDJA 3C9HA 2Y7KA 2R9JA 1M5BA 4NF5A 3I6VA 5H8NA 2RCBA 2GHBA 2XX7A 4THIA 5IAIA 3H03A 3K6XA 4OEVA 5JTYB 3M3KA 3S9MC 4OENA 4G77A 3G3HA 4Q8RA 3FVOA 5KDTB 1PEBA 3H6UA 3IR1A 4UACA 5B7DA 4OWDA 2G29A 4YKPA 3FD3A 4PETA 5KCJB 1B5IA 2AYSA 3FJ7A 1MY1A 4C1UA 1B05A 2XXTA 4ZEDA 2NXOA 2ESNA 1N7WA 4U4XA 2ZXTA 3O6GA 2XXQA 1SW4A 2QRYA 1TFDA 1KWHA 2X26A 2F78A 3ECRA 1PBPA 1B9JA 4FE8A 1DSNA 3PPOA 4OFJA 5B70A 1AH5A 1B3LA 1Y4CA 2Z23A 1LGBC 4FEDA 1Q35A 1N3XA 4MFIA 3K1PA 3V89B 4YAHX 3S9LC 4JB7A 3TTRA 2O7UA 3SEUA 5I2NB 3PMWA 3I5OA 2O7IA 3FIRA 4YKJA 2UYFA 1IXIA 3MZBA 3A3CA 1NNPA 3OSQA 2PYYA 4R74A 4OQOA 1Z7NE 1DPPA 4X1BA 1SDXA 1LBCA 4NF5B 2CMOA 3V8XB 1EH3A 2ZNUA 4N13A 2V3QA 4PFUA 1MQGA 3KFMA 4LP2B 3RQTA 5I2KB 2OJTA 4G8HA 3LSXA 5ISUA 4OHNA 2VD3A 4XKQA 1PB7A 1OQGA 1NFTA 5AA1A 3GZGA 3E4RA 3S2VA 1B1XA 1YPNA 3U1OA 2AIXA 1Y3NA 2I0CA 4BDOA 3FGSA 2UYEA 4L17A 3RLFE 1UQWA 4HTGA 2HAUA 1MXXA 3QXMA 1Y20A 3D4GA 2Q9TA 1TWYA 1MH4A 5FTHA 4GFRA 3TEPA 3U93A 3VLVA 2R6GE 2UXAA 1MPBA 3TCHA 3PD8A 1MXUA 3MWBA 3MQ9A 3S4UA 3IO6A 1IZ1A 4BDMA 3V83A 4H65A 3DP4A 1JW1A 4NEDA 4FORA 5L9MA 1UTHA 4IGTA 3R26A 1WDNA 5DYHA 3MJNA 4E0XA 1FQCA 4H1XA 2HFBA 2O1MA 4H6DA 1B58A 1H44A 4GL8A 3O6IA 4KR5A 4OXVA 1S9TA 3QYTA 4R9FA 4YICA 4GQOA 1MPDA 3KSXA 4QFKA 2V25A 1XVYA 2DVZA 3LSWA 4ZEKA 3CSGA 2H25A 3LSLA 4N07A 3SDFA 3PPNA 4OYVA 3VLWA 2DWIA 4QSEA 4XKRA 1NNTA 1VFEA 4P11A 1OLCA 1UTBA 1LFIA 3G3FA 4QSDA 3PPQA 4IO7A 5ICTA 1LB9A 1QKBA 3FVKA 3H6WA 3KBRA 2D3IA 3LUYA 3FV2A 4ECFA 2GH9A 4YB5A 3VLUA 4GWOA 2IEEA 5AA2A 4JBZA 3N94A 1IIWA 2DQVA 3W9VA 4R6KA 2A5TA 3Q25A 1B51A 1J1NA 5JK4A 2X7QA 2FNCA 1XHYA 5ICQA 4RY1A 4R72A 3BFTA 4P0IA 1MY0A 4WEDA 2DS9A 3UA8A 3SKPA 3L6GA 3SETA 1CB6A 3K6WA 3CG3A 1JETA 4C0RA 3IOUA 1R9LA 3TCFA 3TQLA 4R6YA 1SW5A 1UTHB 3N6UA 1BP5A 2RC8A 2H98A 4U4SA 1M5FA 4OEUA 1US5A 2I48A 2XXXA 2XD2A 3FXUA 3KOSA 2I58A 2HAVA 5H8QA 4IGRA 2O69A 3FVNA 3TZAA 3C32A 2A5SA 1PB9A 2NOOA 1PB8A 3PD9A 3LR1A 2Q8JA 4X1DA 3H6VA 4LQ5A 5AA4A 1LAFE 2XXPA 4YB6A 4UA8A 2ZYOA 1B5HA 3H06B 1QVSA 3H3GA 3IOWA 1FQBA 5FHOA 3EN3A 4XKNA 1UIVA 3N6TA 1QUKA 4EF2A 3SEYA 4GF8A 4EDPA 1LB8A 4F3SA 3K1MA 3IOTA 4ZECA 5H8FB 5AA2B 2DWHA 1LBBA 1LCFA 2V3TA 2A5TB 3T96B 1IEJA 4F3GA 1IITA 2OBGA 1YAEA 2IA4A 2F7AA 3UK4A 3T66A 3MC2A 1SQYA 3EF7A 4O3AA 5I58A 3GBBA 3O9PA 4EXKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1USYH 1IXCA 1ATGA 5A5XB 3FXBA 4C1TA 4I3YA 1D9VA 1WVJA 3E78A 5BUUA 1D9YA 1SD3A 4JVIA 2NWJA 5DEXA 4JVCA 3IX1A 4YB7A 4OFOA 1IQ7A 2DXYA 3BKIB 3K4UA 3PPPA 4O8MA 2Q89A 2YLNA 4F19A 2Y84A 1B7UA 2RINA 1AOVA 1AIVA 1POTA 3TELA 3E9XA 4NWDA 3M3LA 4EXLA 3KN7A 5H8QB 2Z8FA 2I49A 1ZMGA 1B32A 1POY1 5EHMA 3OO7A 4JXIA 3OXNA 2XXKA 1NH7A 1EYJA 3RGYA 4U21A 2Z8EA 3O2AA 3S9NC 1XVXA 1H43A 1MM6A 3EHUA 3DP6A 5I59B 5EYGA 3G3IA 4PE3A 4YMAA 3FZVA 2D5WA 3SEWA 3FJMA 4FJPA 4XKPA 2UVHA 1M5EA 2XWKA 1JNFA 5CBRA 5L8DA 1FPDA 1HSLA 5DT6A 3CSBA 4TOZA 1FCKA 3LSFB 2VHAA 3RUMA 2F35A 4GXAA 4E0WA 1KZ8A 2Y7PA 3IOVA 2V93A 1NUZA 3ZS6A 3B6QA 1H3DA 3K00A 1FPBA 3VDFA 2AL5A 4OVRA 3HSTA 3IB1A 2O84X 3QSLA 3F11A 2YJPA 4ZZAA 4DXCA 1NV0A 1AWBA 1NKXA 1B1HA 2CEYA 1M5CA 2BJJX 1FBCA 2ZZVA 2B4LA 4KXPA 4ND9A 4JWOA 4NF6A 4QF9A 1A7LA 1LBYA 2FA7A 3MZ9A 4N81A 3TQWA 5IZ3B 3K6VA 2I3WA 3EQ1A 2PMSA 4X8RA 2XD3A 2THIA 1BTJA 4AB5A 4YMBA 1ZU0A 2P0SA 2QSXA 4KYEA 4PAIA 1NUWA 1QJMA 4DCYA 3G7WA 3N5LA 4P0GA 4DXUA 3IL1B 1JVXA 2RF1A 1DPEA 3EPEA 1N3WA 3DLNA 2OLBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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