2H5YA

Crystallographic structure of the molybdate-binding protein of xanthomonas citri at 1.7 ang resolution bound to molybdate
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
232
structure length
232
Chain Sequence
TAPVTVFAAASLKESMDEAATAYEKATGTPVRVSYAASSALARQIEQGAPADVFLSADLEWMDYLQQHGLVLPAQRHNLLGNTLVLVAPASSKLRVDPRAPGAIAKALGENGRLAVGQTASVPAGKYAAAALRKLGQWDSVSNRLAESESVRAALMLVSRGEAPLGIVYGSDARADAKVRVVATFPDDSHDAIVYPVAALKNSNNPATAAFVSWLGSKPAKAIFARRGFSLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystallization, data collection and phasing of the molybdate-binding protein of the phytopathogen Xanthomonas axonopodis pv. citri
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal transport
source organism Xanthomonas axonopodis pv. citri
molecule keywords Molybdate-binding periplasmic protein
total genus 75
structure length 232
sequence length 232
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2h5yA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2h5yA02
2RCBA 3PGFA 1JW5A 5FHOA 4XIGQ 5TU0A 5CBSA 3RTFB 1SW5A 4QFPA 2O84X 3FV1A 5L9OA 4O3CA 4MBPA 4LZ7A 3RT8A 1DTZA 4OETA 2OWTA 1IITA 2H25A 3N5LA 4ZEIA 1QVSA 2ZYNA 2FA7A 2HXWA 1A8FA 1FQEA 1SI1A 2UVJA 5DT6A 3LUYA 3EPEA 3FVOA 3KBRA 1B0LA 3R26A 1B3EA 3S9NC 5H8HB 2GH9A 3C31A 4PFWA 3FZVA 4RA1A 2Y7PA 4F1VA 3BFTA 1ZIUA 4I9DA 2B3FA 4H1XA 3EN3A 4MFIA 2VHAA 4OWDA 1ZJLA 1LB8A 1NNFA 4IGTA 1N0TA 4GF8A 3KEIA 2PVUA 4NF5B 4GQOA 4Q0CA 1R6ZA 2R6GE 5BWJA 3E13X 3PUXE 2DWHA 4RPOA 3IX1A 2G29A 3FVGA 1AIVA 1R9LA 5F7VA 1FQDA 1N3WA 5AA3A 1JETA 2F78A 4KQPA 3VVFA 4F1YA 3N6UA 2DXYA 2O6AA 2CZLA 5KCJB 3H03A 1M5CA 4QFKA 2O1MA 4EF2A 1P1OA 2GFEA 1Y1MA 3N6TA 3JZJA 3MP1A 3OOAA 2ANJA 1OLCA 4NE4A 2UVIA 4H5GA 4EQBA 2V3UA 3K00A 1NL5A 4U2RA 3VVDA 3T22A 4Q30B 1GR2A 4G68A 4G68C 2Z22A 1XT8A 2ZNUA 3PD8A 1GGGA 1M5DA 4F3GA 2HZKA 4ZS9A 1IXHA 3G3GA 1USYE 1D9VA 3IOWA 3GLBA 1A40A 3G3HA 4NF6A 3TCHA 2XHDA 3UP9A 2NUVA 4JXIA 2Q89A 4GVOA 5I2KB 2XXVA 4F2QA 5I57B 2V93A 1GVCA 2F35A 1IZ1A 4OERA 3IORA 2XXIA 1XVXA 3OEMA 3K0VA 3SESA 2OLBA 3PMWA 3K2DA 1A55A 1KWHA 2X26A 3B7DA 5ITOA 3Q28A 5L8DA 3VXCA 3TQWA 1DPPA 3O9PA 1D9YA 4AQ4A 2VD3A 4IY5A 5JEIA 4M1VA 4NEDA 3MVZA 1O64A 3K6XA 3MVYA 4BDLA 5H8NB 1JEVA 1OMPA 1B1HA 2O69A 1XC1A 2QRYA 1ANFA 5KZTA 2XXHA 1B3GA 3FASA 4FORA 4LVQA 4BDOA 1B7HA 1P1NA 4E0WA 1HSEA 1B52A 2PMSA 1MXXA 1HSLA 4LQ5A 1PEBA 2QS3A 1AL3A 3PUZE 3LSXA 3GXAA 4IO3A 5DVFA 4RK9A 5F1QA 2KLFA 3QK6A 4QHQA 1Y1ZA 3I3VA 1B58A 4F31B 5AA4B 3QUJA 1AOVA 4MLVA 4F19A 5DEXA 1ELJA 2I3VA 1N7WA 1LBCA 1JVYA 4ZEKA 1LBBA 2PT2A 2BJJX 1B32A 4H8JA 4YKPA 4AB6A 1QW0A 4P0IA 4R73A 3SERA 4QSEA 2DWIA 3FVNA 5FHMA 3C35A 5CMMA 3WAFA 3C32A 4YB5A 2ZYOA 5EHMA 4ZE9A 4ZEBA 2A5TA 5AA2D 5AA1A 3EF7A 4X9TA 5TPAA 2DYXA 1MPCA 1NFTA 1MG1A 4R75A 2Q9TA 1IEJA 2OZZA 1CB6A 1URSA 1RKMA 3TTMA 3K02A 3LC8A 3FIRA 1PB9A 3CR9A 1AH5A 1DOTA 1I6AA 1TFDA 2ZYKA 5A5XA 1JVXA 4DXUA 3K6UA 2Q88A 3VLVA 5K2XA 4M4GA 1URGA 3FXUA 1P1UA 2XXUA 1YCJA 1OQGA 1VE4A 3PPNA 4NF8A 2Q2AA 4OHNA 3EQ1A 2UXAA 4N07A 4GLIA 2M8CA 4F29A 1A8EA 4TLLB 2FNCA 3EHUA 3OELA 2F6PA 3OMBA 2AYSA 1LGBC 2NOOA 2P2AA 2DE4A 2DVCA 3RTWB 3Q26A 3T9VA 3O6HA 4RXLA 4KR5A 3V8XB 4XKQA 3FGSA 2UVHA 3TUSA 1P1QA 3RPWA 4F2OA 1ATGA 3O29A 3IJXB 3QYTA 4PFYA 2DWAA 3ZKKA 5I58B 3MZBA 2QS1A 1TT1A 3V5AA 1MM6A 3SEYA 1N84A 4PETA 3MAMA 3G3FA 2F7BA 1MM7A 2QSXA 5H8QB 3S4UA 2V25A 3H7MA 3KSXA 1UIUA 3N26A 1ZMGA 3P7IA 3SEXA 3SETA 4U22A 2QPQA 3C4MA 1MY2A 5H8FB 1FCKA 3THIA 4ONYA 3FXRA 3IB0A 1T0KA 4BDRA 3Q25A 4G77A 4G8MA 3T9HB 3A3UA 1OLAA 1NNPA 4KFQA 1IUDA 4NF5A 4U21A 3IOUA 3ZS6A 2D21A 1S50A 4FJPA 3VXBA 3QAXA 3PMXA 5IKBA 1Y4CA 5CRYA 2XX9A 1XOCA 3LSWA 3UN6A 1MY0A 4YZZA 5BUUA 1B46A 2GHAA 2VP1A 4ESXA 4MLQA 3UK4A 2XXQA 1L5TA 1Y3QA 1UTBB 3H06B 1R1NA 3ILTB 4OESA 1LSTA 5FTHA 3U8QA 3QUFA 1TFAA 2DE3A 1MQIA 4NF4B 3DM0A 4R74A 3PV0E 4THIA 4RPNA 5I2KA 4YICA 1LAGE 2OBGA 4EQ7A 4OFJA 2VD2A 2I4BA 3KZGA 2F7AA 1MQHA 1MS7A 3DP6A 1J1NA 1FTJA 3HHFA 1SI0A 1B1XA 4X1BA 3TEPA 2ONRA 1SYIA 4XKNA 2NXOA 1Q35A 2F7CA 3IB1A 2ESNA 3FV2A 1FTLA 4GXSB 2YLNA 3MPLA 3IJOB 3A09A 2REJA 4DIGA 1M5EA 4R6HA 3VLWA 4C1TA 2ABHA 2AIXA 2DP8A 5DVJA 3OEKA 1LB9A 4ZDMA 2GHBA 3TCGA 5I56B 1I6BA 1UTHB 5H8SA 4Q5TA 2REGA 2O51A 3MWBA 2FYIA 4IY6A 3VLUA 4ISUA 3I6VA 1S9TA 1ZTYA 2GRVA 1NH7A 3RQTA 3E9XA 3BFUA 4IO7A 3T9XB 1A7LA 1Y9UA 2VOZA 5KDTB 1O63A 1LFHA 1SDXA 4XXUA 1B4HA 5AA4A 4NWDA 3MZ9A 2PT1A 3M3KA 5TP9A 4JWOA 2XX7A 3C9HA 4G8NA 2X7PA 4WXJA 1UQWA 3TCFA 1MXZA 5CMBA 1MPBA 5IAIA 2QJEA 4K3FA 3PUVE 3FJMA 1D4NA 4F22A 2HAVA 1MRPA 3PPOA 3TZAA 4IO2A 2DVZA 4IO5A 2Z8DA 4RY1A 1MH4A 4N6PA 2UVGA 4GOTA 3PMVA 1DMBA 3OSRA 1MQJA 2F5XA 1LFGA 3FATA 5EYFA 1US5A 1MH3A 4KCCA 3TQLA 3ECRA 4HCYA 1TXFA 1AMFA 3IO6A 4ELRA 4KI0E 4QFLA 4AB5A 1OVTA 3TTNA 3RN8A 3CG3A 4KHZE 3D4CA 5ELVA 3B6QA 2A5SA 3DP4A 2O7UA 1B2HA 4UACA 4Z0IA 1PBQA 5DTBA 1PB8A 1YTVA 1DTGA 1QULA 1SYHA 4P0GA 4RK2A 3FUZA 3MPKA 1I69A 4I8CA 3K6WA 2CMOA 4YAHX 3W15C 3OO7A 4QFOA 4ZE8A 3W9WA 3R7XA 4KCDA 3MW0A 3B6TA 1NNTA 5I59B 4U1OA 3RY3A 4LZ5A 2HEUA 2RCAA 1MY3A 3HO7A 4EQ9A 3S9LC 4G68B 4GD5A 3C34A 1H43A 4PQJA 3MJNA 2DWJA 3KN8A 1OQHA 3WAEA 4NF6B 3VE1B 1N76A 3A3CA 3ONMA 1B9JA 2DXRA 1B6HA 2E0SA 4DCYA 3ZSFA 2XXWA 2XXYA 4XTCQ 3K1NA 1SBPA 3K1MA 4FEDA 5CI5A 1MDP1 1Y3NA 3H3GA 3H4ZA 1VSOA 4WKMA 5L9SA 1MY1A 4IO4A 4JBZA 1B05A 2QS4A 3MUQA 3T93B 2I0CA 3T96B 3TODA 1PBPA 4ECFA 5LOMA 3LR1A 1DSNA 3G3KA 4QFNA 1MXYA 4OQOA 1QJMA 1P1WA 3CIJA 3DELB 2PBWA 3DP8A 4F3PA 2I48A 3L6GA 3U1OA 2YJPA 4JSDA 1Y4TA 2AL5A 4OEUA 4GL8A 4U23A 4DLDA 3LBSA 5HM4B 1LAHE 3OSQA 1A99A 3UA8A 3BBRA 2H9BA 2XX8A 2X7QA 1M5BA 1FW0A 5EHSA 2THIA 1JW4A 3H6UA 4JWYA 4EUOA 3L6HA 1UTBA 1N7XA 3JYRA 3Q27A 4KYDA 1POTA 3B6WA 4KPTA 5CM6A 3FXQA 4U4XA 3SEUA 1ZKBA 3TKDA 4OYVA 4GXAA 3CVGA 4TOZA 1PDAA 4TQUQ 1ZBMA 3HHGA 4GRKA 4OFOA 4OENA 1IQ7A 3UIFA 1H76A 4R2BA 2V3TA 3MVXA 1LAXA 3QIMA 1Y3PA 5DYHA 4BDNA 5I2NB 3TYHA 3K01A 1BTJA 2XXTA 2O7IA 2Q2CA 1VFEA 3PUYE 4ZZEA 1II5A 3CSBA 3CRBA 1EH3A 3GBBA 5H8HA 2HAUA 3KG2A 1US4A 3O6GA 5J1DA 3PUWE 3MVWA 4R6YA 3HV1A 1XHYA 2V84A 3H6TA 2Y7RA 2DS9A 2A5TB 5TPAB 5ICQA 4Q8RA 4F3SA 2R9JA 1IIWA 3ILUB 3TPAA 5JTYB 2B65A 5L9MA 4NTLA 4ZECA 1IXGA 3IR1A 5CBRA 4R72A 2QMXA 1JEUA 2O68A 3RGYA 5A5XB 1PC3A 1SD3A 2Z8EA 2ZMBA 2I3WA 3UGWA 1LLSA 3G3IA 5KCJA 2Y7KA 4YMBA 2LAOA 4KD5A 2ZYMA 3KOTA 4DXCA 4E0XA 1BKAA 1NH8A 4ZEFA 5I84A 3LSFB 3IOVA 3USDA 3GBAA 3OO6A 1S7YA 4NF8B 3K1PA 4FATA 2UYFA 4HS7A 4I62A 1UIVA 1WVJA 3H6WA 3FJGA 3HPIA 3EHTA 1FQBA 3VFJA 4F3BA 4NWCA 1BLFA 1O7TA 4G4PA 3CFXA 1PB7A 3MQ9A 5CMCA 2Y7WA 2ONSA 1OVBA 4BLAA 2ZXTA 5I57A 3ODBA 2ALUA 1WODA 3S9MC 3RLFE 3K4UA 2H99A 4JWXA 3R6UA 5K2YA 4PFUA 4EF1A 2Q8JA 5JK4A 3G3JA 4JB7A 5FTIA 1D3KA 4WEPA 5ICTA 3KN7A 2F6GA 2R71A 5AE4A 1IXIA 4OEVA 4C0RA 1H3DA 4RJZA 3OXNA 1LCTA 2Z8FA 4MH5A 4FECA 4PFTA 2OK2A 2I0BA 3FJ7A 5AA2B 2RINA 4ELPA 4H67A 3QXMA 1MQDA 3M3LA 4ZEDA 4FE8A 5H8NA 4LUBA 3KJTA 4R2FA 1B3HA 5ISUA 4MF3A 3S9EA 4YB7A 1VR5A 2RC7A 1JNFA 4KYSA 1SW1A 3SKPA 4DDDA 1MQGA 4IGRA 4O3BA 4G8HA 2DE2A 3T66A 2QS2A 4QRZA 3SEWA 1QKBA 1SQYA 1EU8A 3Q29A 3OD7A 1NNKA 1B4ZA 3C36A 3QSLA 5DVIA 1Y20A 3CG1A 2H5YA 1FQFA 2XD3A 5I59A 2RC8A 4H6DA 1BP5A 4FAJA 1NKXA 4OZ9A 3TFLA 1B7UA 1B3FA 4Z7EA 3OO8A 4HCWA 4OVJA 3PPPA 4EXKA 3KGCA 4YU0A 3ZKLA 4U1ZA 3IAZA 2O1LA 4C1UA 3MC2A 1N04A 2Z23A 4LATA 3TMGA 4I1DA 4LONB 2AL4A 3F11A 4OMBA 1H44A 5CC2A 2B3BA 4RNSA 3HN0A 4BDMA 3EHSA 1VFDA 2ZNTA 3M8UA 4LA9A 4NMYA 2I58A 3VDFA 3GZGA 4GIZA 4JSOA 3RT6B 3RNNA 2VGQA 1CE2A 1GV8A 3O2AA 1B5HA 2YPNA 2QL3A 4F1UA 4GFRA 2OJTA 3C33A 4OTEA 4OXVA 3G7WA 3PPQA 1EZ9A 3RUMA 4HTGA 2RF1A 3BKIB 4F18A 1XS5A 4POXA 2XD2A 3O6IA 4YKKA 1MY4A 4POWA 1QUIA 4WEDA 1ZLQA 1P99A 4N13A 1I6QA 3UORA 1M5FA 4GWOA 4YKIA 2W7YA 1RYXA 4OFLA 2F97A 2HCAA 4XKRA 4ZZAA 2PX1A 4EXLA 2F8DA 4BDQA 4QF9A 1URDA 2E1SA 3IL1B 1B51A 4X1DA 1POY1 4GL0A 2IA4A 4ELQA 4U4SA 1GTKA 2DQVA 3KFMA 4R6KA 3KN3A 2NVUB 2Y7IA 5I58A 1FTMA 4KYEA 1B3LA 5TP9B 1WDNA 3MP6A 4IB2A 4LQ2A 1NMUA 3E3KA 1QKAA 1MXVA 5H8QA 1F9BA 2UYEA 2RC9A 5I2NA 2V3QA 1OIBA 4PP0A 1IXCA 3OENA 3IK6B 3H6VA 1MDQA 4LP2B 1SVXB 5H8FA 5CMKA 4HW8A 4ESWA 2H4IA 2DSFA 1EZPA 4O3AA 5B7DA 3U94A 2HQ0A 1YAEA 3KSJA 1B5IA 2OCUA 3N94A 2IEEA 1FTKA 1FTOA 1XVYA 3V83A 3S2VA 5JTYA 3T9UA 4ELOA 1B7ZA 5FHNA 1Z7NE 4DCXA 3VV5A 3OO9A 2I4CA 4DZ1A 1A54A 4PE5B 3VVEA 3PU5A 4RYAA 4XKPA 2XXRA 2H98A 4P11A 1FQAA 2D3IA 3TTRA 2I49A 3PD9A 2F36A 3TDJA 3IO4A 2Y84A 4H65A 3W9VA 1LFIA 2HZLA 3KJ7A 1LAFE 4G2ZA 3IB2A 1SW2A 3O28A 4X48A 4R9FA 3CSGA 3LSLA 2ONKE 4DE8A 1USYH 3D4GA 2WKYA 1Z7ME 3IOTA 1B40A 4IO6A 1YPNA 3TAJA 2DOJA 1SW4A 3HSTA 2NWJA 4ND9A 4NF4A 1MPDA 3SEVA 3K6VA 4TLMB 3PPRA 5M2VA 5DEXB 4LZ8A 1EZOA 1RYOA 4F39A 1JW1A 3DLNA 4R9GA 3MBPA 4FEBA 3TTKA 3M3FA 2D5WA 3E4RA 1TWYA 3CI8A 1R9QA 1QUJA 3O97A 1FQCA 1QUKA 3MP8A 3TTLA 4H0WA 1Q1KA 4DXBA 3O66A 1BIYA 1B0HA 4H5FA 2I6EA 2G93A 3U93A 4L17A 5B70A 2HFBA 5AA2A 3U92A 1B5JA 2XXXA 4QSDA 3FD3A 1HSJA 3CFZA 3JV9A 4YB6A 1JQFA 3V89B 5I56A 4UA8A 3KOSA 1UTHA 3CFLA 3TELA 1H45A 2P0SA 2F34A 4QSCA 4H8IA 2PYYA 2P1SA 2XXPA 5HPQA 3I5OA 2QMWA 1MXUA 2ZNSA 4EDPA 1ZU0A 5KDTA 3FVKA 4YKJA 3SDFA 5ITPA 1N3XA 2OWSA 4FIMA 4YMAA 3MZ1A 3U72A 5HBCA 1LCFA 4JDFA 3HCQA 1MXWA 1DPEA 2RKMA 3AXFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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