2H5YA

Crystallographic structure of the molybdate-binding protein of xanthomonas citri at 1.7 ang resolution bound to molybdate
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
232
structure length
232
Chain Sequence
TAPVTVFAAASLKESMDEAATAYEKATGTPVRVSYAASSALARQIEQGAPADVFLSADLEWMDYLQQHGLVLPAQRHNLLGNTLVLVAPASSKLRVDPRAPGAIAKALGENGRLAVGQTASVPAGKYAAAALRKLGQWDSVSNRLAESESVRAALMLVSRGEAPLGIVYGSDARADAKVRVVATFPDDSHDAIVYPVAALKNSNNPATAAFVSWLGSKPAKAIFARRGFSLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystallization, data collection and phasing of the molybdate-binding protein of the phytopathogen Xanthomonas axonopodis pv. citri
pubmed doi rcsb
molecule keywords Molybdate-binding periplasmic protein
molecule tags Metal transport
source organism Xanthomonas axonopodis pv. citri
total genus 75
structure length 232
sequence length 232
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2h5yA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2h5yA02
2XXQA 2P0SA 3FUZA 2BJJX 2XXIA 3FV1A 3TAJA 2XXUA 3C34A 4HCWA 4RNSA 3T66A 4QSEA 2O7IA 1USYH 4QFKA 3K02A 3PU5A 4X9TA 3PPOA 4OHNA 1FTJA 2ZYMA 1T0KA 4O3BA 4NEDA 5I56A 2AL4A 1PBPA 5KDTB 4OENA 3E4RA 3KOTA 4EQ7A 5JK4A 4ZEFA 1BKAA 4KCDA 4TOZA 1B3FA 2DXRA 2Q2CA 4O3AA 4JSOA 4HTGA 5DEXB 2XXRA 1URSA 4PFTA 3RGYA 3G3JA 4F29A 3BBRA 2GHBA 3O66A 4WKMA 3VLVA 3V8XB 1SYIA 4N13A 3P7IA 4NF6B 2FA7A 5LOMA 1EH3A 3ODBA 4EQBA 1MPBA 3IB2A 3MVZA 3K2DA 3OEKA 5H8SA 1PB8A 3IJOB 2XXTA 1OIBA 3RTWB 4JWOA 3TMGA 5M2VA 1DTZA 3DM0A 1SQYA 3QK6A 3E9XA 3A09A 2NVUB 2P1SA 3U92A 1QJMA 4RK2A 3R7XA 1B4ZA 1BP5A 2DXYA 3I5OA 1LBBA 2PBWA 4JXIA 1YPNA 2DWAA 2NOOA 1IITA 1D9VA 4ESWA 1B0HA 1MQHA 3GZGA 3C4MA 3MBPA 3B7DA 2ZNSA 4MLVA 4YAHX 5AA2D 1MXVA 1A8FA 1XHYA 4PFYA 3TODA 4NF4B 2FNCA 1A7LA 3FVKA 2DE2A 4KYDA 2I3WA 2PT2A 3FVOA 4FEBA 4GD5A 3FZVA 3KOSA 3T96B 3MQ9A 3LSFB 4YZZA 3O29A 1MQIA 4MF3A 1NNFA 1NNKA 1TFAA 3L6HA 4NF5B 5TU0A 5AA4A 5ISUA 1N0TA 2UYFA 1SW1A 3SEUA 3C35A 1B1XA 1MY4A 4QFNA 1N7WA 4IO5A 2UYEA 2ONKE 3E3KA 4F2OA 2Y7RA 2YJPA 3EF7A 2I48A 1B6HA 1R9LA 4H5GA 3TQLA 1NFTA 1GGGA 4YB6A 4G68B 1TT1A 2PVUA 1XT8A 5TP9B 1J1NA 5ITPA 5I57B 2Z23A 4NWCA 1B40A 4C0RA 5KDTA 3Q29A 2F36A 3O6IA 3PUWE 1OQGA 4EXKA 1B46A 4R73A 3PMWA 1FQAA 5DEXA 3UP9A 1JVXA 1R6ZA 5I59B 3FATA 1CB6A 3H6WA 3I3VA 4R2BA 3OSQA 2PT1A 4BDRA 4BDNA 3N6TA 4K3FA 4ELPA 4NF6A 3PMXA 2H5YA 3CVGA 3FJGA 3S9NC 5H8HB 5AA2B 4PFUA 5DVJA 4FEDA 3GLBA 2ZYOA 5FTIA 3OELA 3TTMA 4ZEIA 2DVCA 3FIRA 1UTHB 1Y1MA 4RY1A 1QUIA 4WEDA 2X7PA 5K2YA 4JDFA 2D5WA 3LSXA 3A3UA 4M4GA 3HHGA 5TPAB 2F7CA 3W9VA 2O1MA 1JW1A 2OBGA 4R6KA 1QW0A 1B7HA 4IGTA 4PE5B 2QS4A 3V5AA 2V84A 3CFLA 3K0VA 1GV8A 4ZZAA 3C9HA 1N84A 2KLFA 1VSOA 4DLDA 1NL5A 4I1DA 2DYXA 2Q88A 5DVFA 4NF4A 2ZNUA 2XX9A 2UVGA 3SEWA 2PX1A 3G3HA 4RK9A 3UK4A 2O51A 2V93A 4OFJA 4WXJA 1Y3NA 4NF5A 1LAGE 3F11A 4ELOA 1FTOA 2ZXTA 3PPPA 4FE8A 1MDP1 1S7YA 2F8DA 2QMXA 3HHFA 1DTGA 1I69A 5IAIA 1S9TA 3SETA 3K1NA 4R9FA 2IA4A 3S9EA 3U1OA 1B2HA 4TLLB 2PYYA 4G68A 1PB9A 3KJ7A 5TP9A 2WKYA 4QSCA 1DPEA 3N6UA 1IEJA 4QRZA 3JV9A 1LB9A 2GH9A 4OEVA 4QHQA 4C1UA 2I49A 2GFEA 2UVJA 4XXUA 4ISUA 1SW5A 3QUJA 1ZKBA 3TFLA 5I59A 3VE1B 3S4UA 4O3CA 2F7BA 1LSTA 1GTKA 3CG1A 4MH5A 4QFLA 3CR9A 1VFDA 1SDXA 1XS5A 5H8HA 1QULA 1R1NA 1R9QA 2Y7WA 2H98A 1D9YA 3RY3A 4IY6A 4OESA 5CRYA 4DIGA 4H8JA 1JVYA 1OLAA 1UTHA 3H6VA 4RA1A 4IO7A 3PD8A 3H6UA 5CC2A 3GBAA 2REGA 4OTEA 4XTCQ 4YB5A 3Q28A 5TPAA 4IB2A 2E0SA 4GRKA 3QXMA 2RC8A 2ZNTA 4KD5A 1N04A 2I6EA 1I6QA 3KN3A 1MXZA 4Q8RA 2F97A 3B6QA 5AE4A 3ILTB 1PBQA 1US5A 3MPKA 2A5TB 3OO9A 1USYE 4N6PA 2R9JA 1OLCA 3W15C 3PUVE 5DYHA 2Y84A 3IR1A 4G8NA 2DVZA 2H9BA 2OJTA 3THIA 3M3FA 3HCQA 4EF2A 4XKNA 1MM7A 1M5EA 4UACA 4GXSB 2R6GE 3CG3A 3EN3A 5FHNA 3ZKKA 1MG1A 1O7TA 3OD7A 4RPNA 2HZKA 1B3GA 5B7DA 4YKIA 2V3QA 3K6XA 3MVWA 2XXXA 3WAEA 3VLWA 1O63A 4ZE8A 1IXGA 3LSLA 2P2AA 5K2XA 3C36A 2QL3A 1B4HA 3IB1A 3PGFA 1B3HA 3RQTA 3B6WA 4AB6A 4EXLA 4FORA 4IY5A 1Y3PA 4JWXA 4MBPA 4LP2B 3UN6A 1XVYA 1JNFA 1RKMA 3W9WA 3QYTA 1D4NA 3T93B 1A99A 4EF1A 1MY3A 1EZOA 1CE2A 3RLFE 2VHAA 4N07A 3S2VA 2G29A 5CMKA 4P11A 1GR2A 2HZLA 4Q30B 1IUDA 3O97A 4JWYA 5ICTA 2AIXA 1B5IA 3TCFA 3D4CA 4XKRA 4E0WA 3HN0A 3DP6A 4ZEDA 1P99A 1VFEA 1MXWA 4E0XA 1Q1KA 2B3FA 1EZPA 3OO8A 3C32A 4AQ4A 1WVJA 1B05A 1DMBA 1HSEA 1MY0A 2UVIA 1ELJA 4OYVA 5F1QA 1OMPA 4IO4A 3VVFA 1MPDA 1H44A 1MRPA 4LQ2A 5ICQA 3PPQA 1IXIA 1FTLA 1ZIUA 4LUBA 4LATA 3C33A 3FJMA 1NMUA 2A5TA 2Y7PA 1B1HA 1B7UA 5L9MA 4MFIA 2Q2AA 3H4ZA 2DOJA 5I84A 3LBSA 4PETA 2RC7A 4NWDA 5I2KB 4R6YA 4F1UA 3MP6A 3E13X 1UQWA 3HSTA 1N76A 1O64A 1YTVA 2O84X 3FXQA 2HEUA 3MZ1A 2IEEA 3Q26A 1AOVA 2FYIA 4P0IA 4LA9A 1SW4A 3TPAA 2F7AA 2H99A 4LZ5A 1II5A 4GF8A 1M5BA 2QS2A 5CI5A 1BLFA 2F78A 1JW5A 2QS3A 2UXAA 4G8HA 4YMBA 3OENA 4R72A 2OZZA 3KBRA 3GBBA 3M3LA 4DDDA 4BDOA 2O69A 3KSXA 2QMWA 3MZ9A 5CMBA 4F19A 2I4BA 4NF8B 4POWA 4ELQA 3TTRA 4RPOA 3AXFA 3K1PA 2XD2A 1N3WA 3C31A 4KCCA 5ELVA 4OEUA 3QSLA 1I6BA 2ESNA 1JW4A 2F34A 3M8UA 1F9BA 4NMYA 4UA8A 1B7ZA 3VLUA 2OLBA 1SVXB 3KN7A 4OXVA 4DE8A 2DSFA 3I6VA 3OSRA 5I2NB 5L9OA 5J1DA 3M3KA 1QKBA 3SESA 5AA1A 4ZE9A 2HAVA 3MAMA 3TELA 1BTJA 3CI8A 1B51A 3ZKLA 2GHAA 1P1WA 1XVXA 3VDFA 3EQ1A 3LUYA 2NUVA 3SKPA 1YAEA 3Q27A 4Q0CA 3MW0A 1ZU0A 5F7VA 1H76A 1MQDA 5I58A 5B70A 4YU0A 4ESXA 3BFUA 1ZBMA 2RCBA 4QF9A 2W7YA 3O9PA 2XX8A 4JSDA 1H45A 4QSDA 1A8EA 3QUFA 2YPNA 3JYRA 5I2KA 4KFQA 3U94A 1MXXA 1PEBA 3IO4A 4F3GA 3TKDA 4Z0IA 4U1ZA 1JETA 2CMOA 4ZZEA 2HFBA 2THIA 1LBCA 4NTLA 3TZAA 1H3DA 1M5DA 3IJXB 2GRVA 1Y9UA 2Z8EA 2H25A 3LR1A 1URDA 4GFRA 1SI1A 4F1YA 1S50A 1MY2A 3MPLA 2RC9A 1QKAA 1Y4CA 3PPRA 3IK6B 4R9GA 4ZDMA 3T9HB 1MY1A 4F2QA 3RTFB 1PB7A 4NF8A 1QVSA 4GL8A 1IXCA 4OFOA 1LCTA 3IAZA 4DCYA 3MVXA 3EPEA 3GXAA 3H6TA 4U21A 4HS7A 3IO6A 4RXLA 2OWTA 3TUSA 3TCHA 2XXVA 1DOTA 3RNNA 5BUUA 3H7MA 4P0GA 1SI0A 4DXCA 5BWJA 3SEXA 3V89B 4ELRA 5CBRA 3FASA 1PC3A 3TEPA 1VE4A 5FTHA 3OOAA 4H5FA 5I2NA 3CIJA 4GQOA 4DXUA 4GXAA 4F3PA 3U8QA 2HCAA 3QIMA 2RKMA 2V3TA 2XX7A 1JEVA 1IIWA 4OFLA 3EHUA 4G4PA 3MVYA 2ALUA 3Q25A 3U72A 3V83A 5CMMA 3VV5A 2F35A 2DWHA 3PPNA 1ANFA 1UIUA 4U2RA 1FTKA 2REJA 4YKJA 1OQHA 2QPQA 1LGBC 3RPWA 5EHSA 2R71A 3KSJA 1ZMGA 5AA3A 4EQ9A 1M5CA 4YKKA 2XXWA 4OVJA 2Q89A 1FCKA 3ECRA 1Y4TA 1NKXA 4DXBA 3S9LC 1B52A 1RYXA 3CFXA 5HBCA 2RF1A 1RYOA 3PMVA 3T9XB 3KEIA 4ZEBA 4YICA 1H43A 4F1VA 3ZSFA 4FECA 4FIMA 1EZ9A 3D4GA 5JEIA 4ZS9A 2E1SA 2HXWA 3FXRA 3HV1A 5A5XB 3VVDA 2M8CA 1FQFA 5DT6A 3PUYE 1DPPA 4KYSA 4X1BA 2DP8A 4F3SA 4I9DA 3IOVA 2DQVA 3KGCA 3O2AA 4FAJA 4LZ7A 2DE4A 2DWJA 4U4SA 1TFDA 1B5JA 4KR5A 4U23A 1A55A 3SERA 1L5TA 4L17A 1MXYA 4F39A 3L6GA 3R26A 3VFJA 1Y20A 2I0CA 1DSNA 2XD3A 2HAUA 4KI0E 4DCXA 1D3KA 5L9SA 4EDPA 4IO3A 1EU8A 2ZYKA 3TYHA 4M1VA 3K4UA 1ZJLA 1P1NA 3A3CA 3UGWA 3O6GA 1FQDA 1AMFA 4QFOA 3T9UA 1B3EA 3G3FA 3TTNA 1FTMA 1XOCA 4ZECA 1P1OA 3PUZE 4XKPA 2I3VA 3OXNA 2QRYA 3IOWA 5L8DA 2ZMBA 3ILUB 3H03A 4G2ZA 4X48A 3QAXA 5KZTA 1AL3A 5HM4B 3BKIB 1KWHA 3HPIA 4R75A 1B3LA 1B5HA 4R6HA 4FATA 4ONYA 4Q5TA 2F5XA 3PD9A 2UVHA 2G93A 1LCFA 3PV0E 2VP1A 3DP8A 2Y7KA 3O28A 4G68C 3K1MA 5I58B 4ND9A 3MP1A 5JTYB 3OO6A 1JQFA 2ANJA 3VVEA 2OCUA 4LZ8A 1LLSA 3PUXE 2RINA 1Z7ME 3TTKA 4R2FA 2B3BA 3FXUA 2I58A 1XC1A 1UIVA 1POY1 2VGQA 4R74A 5HPQA 1LAHE 5H8QB 3N26A 4U1OA 1Y1ZA 2O6AA 4NE4A 3KN8A 3CRBA 4QFPA 1MM6A 3G7WA 1B32A 4BLAA 3IOUA 4RYAA 4ECFA 3USDA 2H4IA 2F6PA 2DS9A 4GLIA 5A5XA 3HO7A 5DVIA 2Q8JA 4KQPA 4OMBA 1TXFA 3VXBA 2QS1A 1UTBB 4I8CA 3UIFA 2XXYA 4JB7A 4H67A 5DTBA 2O68A 3VXCA 1AH5A 3H06B 1LFHA 1MQJA 4ZEKA 5KCJB 4RJZA 4GWOA 1FW0A 3KJTA 1MS7A 2F6GA 1ZTYA 3SDFA 3G3GA 4IO6A 4GIZA 1B0LA 3CSBA 4U4XA 1QUJA 3K01A 2XXPA 3FV2A 4OWDA 1N7XA 3OO7A 3ZS6A 3MP8A 4HW8A 3RT8A 4H8IA 3G3IA 3FVNA 3R6UA 3T9VA 5H8NB 4YB7A 1URGA 1WDNA 3MWBA 4X1DA 1FQCA 4BDQA 2DWIA 4I62A 4G77A 2ONRA 1LAFE 3B6TA 3EHTA 3RN8A 4KYEA 5H8FB 4LQ5A 2RCAA 2X26A 3KZGA 1M5FA 2AL5A 2A5SA 4BDLA 4OZ9A 4JBZA 2VD2A 5FHOA 1P1QA 3TQWA 1VR5A 1IXHA 4BDMA 1JEUA 4PQJA 2V3UA 1IQ7A 5JTYA 3CFZA 5ITOA 1NNTA 2AYSA 5EYFA 4KHZE 4C1TA 3N94A 4TQUQ 4U22A 1P1UA 3T22A 4IO2A 4F22A 1BIYA 3DP4A 1NH8A 2QSXA 1I6AA 4H0WA 2YLNA 2Z22A 2I4CA 3KFMA 3DELB 5H8QA 4XKQA 3N5LA 3WAFA 4THIA 2ABHA 2Z8DA 3FD3A 3TCGA 1NH7A 2VOZA 3LSWA 2D3IA 5CM6A 1N3XA 1QUKA 3BFTA 1TWYA 2VD3A 4GL0A 1SYHA 1Y3QA 2Q9TA 1B58A 2CZLA 1IZ1A 1LFGA 4OQOA 2B65A 1B9JA 3JZJA 2OK2A 4KPTA 4GVOA 4F31B 5CBSA 3RUMA 3H3GA 1UTBA 3OMBA 3G3KA 3KG2A 4H6DA 3ONMA 3K6UA 2V25A 1SD3A 4PFWA 5KCJA 2XXHA 3MC2A 3MZBA 3IOTA 5I57A 1SW2A 5CMCA 3K6VA 1MH3A 1LB8A 4EUOA 4H1XA 3SEVA 2ONSA 1US4A 3TTLA 5I56B 1MQGA 3FVGA 3IORA 4OERA 2HQ0A 4GOTA 4WEPA 3TDJA 3DLNA 4IGRA 3K6WA 1GVCA 5FHMA 3FGSA 2ZYNA 4FJPA 4AB5A 3OEMA 5H8NA 3S9MC 4Z7EA 3U93A 1SBPA 5AA2A 2O1LA 4F3BA 3RT6B 5H8FA 3K00A 1MH4A 3O6HA 4YMAA 3FJ7A 1AIVA 2QJEA 4LVQA 4POXA 1A54A 2LAOA 4DZ1A 1ATGA 2DE3A 4PP0A 5EHMA 3LC8A 1HSJA 3IB0A 3UORA 3EHSA 4HCYA 3UA8A 4TLMB 1ZLQA 4G8MA 3IX1A 1A40A 2I0BA 1OVBA 1OVTA 1Q35A 4XIGQ 3CSGA 2X7QA 2NWJA 1Z7NE 1LAXA 1NNPA 4YKPA 2PMSA 2NXOA 1YCJA 4MLQA 1PDAA 1MPCA 4H65A 3MUQA 3MJNA 1FQBA 3SEYA 2O7UA 2D21A 1MDQA 5IKBA 1HSLA 4F18A 1LFIA 4OETA 2XHDA 4LONB 2Y7IA 1FQEA 1WODA 3IL1B 1POTA 1MXUA 2OWSA 2Z8FA 5AA4B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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3KOSA 3T96B 4OA4A 3MQ9A 3LSFB 2OWZA 4YZZA 3O29A 1MQIA 4MF3A 1NNFA 1NNKA 1TFAA 3L6HA 4NF5B 5TU0A 5AA4A 5ISUA 1N0TA 2UYFA 1SW1A 3SEUA 3C35A 1B1XA 1MY4A 4QFNA 1N7WA 4IO5A 2UYEA 1NV5A 4MIJA 4GX6A 2ONKE 1FPLA 3E3KA 5EQAA 1FPGA 4F2OA 2Y7RA 2YJPA 3EF7A 1RDYA 2I48A 1B6HA 1R9LA 4H5GA 3TQLA 1NFTA 1GGGA 4YB6A 4G68B 1TT1A 2PVUA 1XT8A 5TP9B 1J1NA 5ITPA 5I57B 2Z23A 4NWCA 1B40A 2WYKA 4C0RA 5KDTA 3Q29A 2F36A 3O6IA 3PUWE 1OQGA 3SZPA 3IFCA 4EXKA 1B46A 4R73A 3PMWA 1FQAA 2PFZA 5DEXA 3UP9A 1JVXA 1R6ZA 5I59B 3FATA 1CB6A 3H6WA 3I3VA 4R2BA 2MKZA 5A5LA 4O7MA 2HXRA 3OSQA 1INPA 2PT1A 4BDRA 4BDNA 3N6TA 4K3FA 4ELPA 3FXBA 1JP4A 1IMAA 4NF6A 3PMXA 2H5YA 3CVGA 1G0HA 3FJGA 3S9NC 5H8HB 5AA2B 4PFUA 5DVJA 4FEDA 3GLBA 3KC1A 2ZYOA 5FTIA 2XXKA 3OELA 3TTMA 4ZEIA 2DVCA 3FIRA 1UTHB 1Y1MA 4RY1A 1QUIA 4WEDA 2X7PA 5K2YA 4JDFA 2D5WA 3LSXA 3A3UA 4M4GA 4UABA 3HHGA 5TPAB 2F7CA 3W9VA 2O1MA 1JW1A 2OBGA 4R6KA 1QW0A 1B7HA 4IGTA 4PE5B 2QVRA 2QS4A 3V5AA 2V84A 3CFLA 3K0VA 1GV8A 1K9ZA 4ZZAA 1YYZA 3C9HA 1N84A 2KLFA 1VSOA 4GBWA 1NL5A 4DLDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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