1N04A

Diferric chicken serum transferrin at 2.8 a resolution.
Total Genus 197
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
197
sequence length
683
structure length
683
Chain Sequence
KSVIRWCTISSPEEKKCNNLRDLTQQERISLTCVQKATYLDCIKAIANNEADAISLDGGQAFEAGLAPYKLKPIAAEVYEHTEGSTTSYYAVAVVKKGTEFTVNDLQGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLLHRGAIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDPKTKCARNAPYSGYSGAFHCLKDGKGDVAFVKHTTVNENAPDQKDEYELLCLDGSRQPVDNYKTCNWARVAAHAVVARDDNKVEDIWSFLSKAQSDFGVDTKSDFHLFGPPGKKDPVLKDLLFKDSAIMLKRVPSLMDSQLYLGFEYYSAIQSMRKDQLTPSPRENRIQWCAVGKDEKSKCDRWSVVSNGDVECTVVDETKDCIIKIMKGEADAVALDGGLVYTAGVCGLVPVMAERYDDESQCSKTDERPASYFAVAVARKDSNVNWNNLKGKKSCHTAVGRTAGWVIPMGLIHNRTGTCNFDEYFSEGCAPGSPPNSRLCQLCQGSGGIPPEKCVASSHEKYFGYTGALRCLVEKGDVAFIQHSTVEENTGGKNKADWAKNLQMDDFELLCTDGRRANVMDYRECNLAEVPTHAVVVRPEKANKIRDLLERQEKRFGVNGSEKSKFMMFESQNKDLLFKDLTKCLFKVREGTTYKEFLGDKFYTVISSLKTCNPSDILQMCSFLEGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Metal transport
molecule keywords serum transferrin
publication title Structure of diferric hen serum transferrin at 2.8 A resolution.
pubmed doi rcsb
total genus 197
structure length 683
sequence length 683
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n04A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n04A04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n04A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n04A03
4IY6A 3CRBA 4YZZA 1FQCA 4P0IA 1XT8A 1M5FA 1NL5A 3IOWA 4WKMA 4ELOA 3TCGA 1B5IA 3OEKA 1USYH 3LR1A 2XXYA 2GH9A 3SDFA 2QS2A 1AL3A 3A09A 3FV1A 4BDMA 1MXVA 5FTHA 1LAGE 1OLCA 1FTLA 2H99A 2G93A 4F3GA 1SQYA 3G3FA 4ESXA 2W7YA 3TMGA 3RT8A 5DVJA 4EXLA 5K2XA 1MM6A 1MXYA 2QS1A 3HPIA 2VP1A 4DIGA 4X1BA 4YKPA 1UTHA 5CBRA 1UQWA 1JVXA 3TTLA 5KZTA 2DQVA 4FECA 3KZGA 3MPLA 3LUYA 5I58A 3V8XB 2PYYA 3SETA 3MPKA 3K00A 4KCCA 3RQTA 5DTBA 1FQBA 2HAUA 4RNSA 4BDLA 3PPOA 4MLVA 4ZZEA 4OERA 2IEEA 4LZ8A 3H03A 3HO7A 2AIXA 1BTJA 3KGCA 5DVIA 4OWDA 2D3IA 3VE1B 1B0LA 1VE4A 4U4XA 5I2NA 3PPRA 4NEDA 4KI0E 4GWOA 5BUUA 4G8MA 4R2FA 4KCDA 1B46A 2XXTA 3MVZA 1F9BA 3RTFB 3K6VA 3N26A 4XKRA 3RT6B 3KEIA 1FQDA 5JK4A 2O68A 3HCQA 1SW5A 4NF5B 1MM7A 2OWSA 4IGTA 4OXVA 2BJJX 2Q9TA 1XHYA 1IZ1A 1UIVA 2XXIA 1MPBA 4OEUA 2DWIA 3K4UA 4L17A 1B3FA 3RY3A 3PUYE 1HSJA 4RJZA 1P1QA 3O6GA 4GQOA 1WDNA 1EH3A 1PEBA 5DVFA 1Z7ME 4KYSA 4EXKA 1I69A 1NMUA 2NXOA 2Z23A 5AA4B 1JEUA 1N04A 4LVQA 1YPNA 3IK6B 3JV9A 2I3WA 4THIA 1B1XA 2O7UA 5JTYA 1URSA 4HS7A 1ZMGA 2UYEA 1SYHA 2CMOA 4FEDA 5FHMA 5I56A 2DS9A 2GHAA 4G4PA 4U4SA 5CRYA 3EPEA 5DT6A 5L9MA 3PMWA 1QULA 2H25A 1MY4A 1XC1A 1Y4TA 3C4MA 3TTNA 4LATA 1SW1A 3W9VA 2GRVA 5CI5A 5ICTA 3FUZA 1T0KA 2ZXTA 2R9JA 3L6GA 1MS7A 1LBBA 4EQ9A 1UTBA 2A5SA 4MBPA 3V89B 1QUJA 4G8NA 4GXSB 1LAFE 4YKJA 2HZLA 2DWAA 4Z7EA 3ECRA 3UIFA 2F5XA 3CFXA 3O6IA 1P1NA 4PETA 2V3TA 2XX8A 3R6UA 3G3JA 3Q26A 2DYXA 3OD7A 5I59A 3G7WA 3E4RA 1TWYA 5ELVA 1MY2A 3DELB 5F1QA 1JEVA 1US4A 1JW5A 5KDTA 2XXWA 3UORA 1A54A 3THIA 1VSOA 4IO6A 1PDAA 2ZNTA 4OYVA 1MQJA 2OWTA 2XXQA 1I6BA 1B05A 4GF8A 4DXCA 2V3UA 1MG1A 3KJTA 4EF2A 4HCYA 5CBSA 5H8FB 1NNFA 3VFJA 2RCBA 2DSFA 4IO3A 1R9LA 3OO9A 4JWXA 4EDPA 1IUDA 1WVJA 1H43A 4ELRA 3G3GA 3S9EA 5H8HB 2PX1A 3EHSA 1NNKA 1OQHA 1Y4CA 3SESA 3FATA 1FW0A 3KN7A 1IEJA 1A7LA 1B3HA 4OZ9A 1CE2A 2YLNA 4QF9A 3V83A 1A99A 5I2KB 3E9XA 3S9MC 5IKBA 4FAJA 4BDRA 1I6AA 4IO2A 3KSJA 3QK6A 3KFMA 3PUWE 1EZ9A 2Q88A 3T9UA 1QKAA 1II5A 2DE2A 3IAZA 4FORA 4LP2B 2DE3A 5KCJA 2M8CA 3IB2A 1BKAA 3TUSA 1N0TA 4NWDA 1AOVA 5TPAA 4FATA 3FJ7A 4E0WA 4RA1A 1MY0A 1USYE 3MW0A 1POY1 4G68C 1IITA 4OESA 4O3CA 1O63A 1MXWA 2F35A 1ZJLA 2GFEA 3IJXB 2ONRA 1LGBC 4QRZA 1SYIA 3IOTA 3QXMA 5I58B 3JZJA 3FVNA 4H67A 4ZZAA 3C32A 4P11A 4U1OA 4F19A 2QPQA 3ZSFA 3VLUA 3MZ1A 3QAXA 1NH8A 3QUJA 2I6EA 3IX1A 3ZS6A 3TELA 2QMWA 4OMBA 2Y7WA 3Q28A 4Q5TA 4YICA 2UVJA 3M8UA 5CMKA 1TFAA 3FXUA 3FIRA 2F78A 1MQHA 3HV1A 3R7XA 3OMBA 4F1UA 5TP9A 3TTMA 2IA4A 1B3LA 2VHAA 2Z8EA 2I49A 1QKBA 3OEMA 2A5TA 4RPNA 1B58A 5EHMA 3OELA 3TKDA 3USDA 3AXFA 2XXHA 3U93A 4R2BA 1M5BA 1JW4A 4I9DA 4F3SA 1S9TA 3OO6A 3PMVA 3C31A 4OVJA 2I3VA 3LSFB 3PUXE 2DOJA 1MY3A 2AL4A 4ZEDA 4G68B 3MP6A 4RY1A 4RK9A 3UK4A 1XOCA 3TFLA 5H8SA 3CI8A 3MUQA 3N5LA 4RPOA 4XTCQ 2HEUA 2XXPA 3K2DA 1LSTA 4G8HA 5JTYB 3RN8A 4YB6A 3HHFA 1LAHE 4N13A 3H6TA 1A8EA 3K6XA 4OFLA 3I3VA 3TQWA 4R9FA 1Q35A 3VXBA 3SEXA 3OOAA 3PD8A 2I0BA 4F3PA 4NF8A 3MBPA 1GV8A 3RGYA 3BBRA 1PC3A 3KN3A 1LFHA 3MQ9A 2YPNA 3H3GA 1UTBB 4OETA 4GOTA 1OLAA 2O6AA 4RK2A 2PMSA 4XKNA 1VFEA 3K6UA 4F1YA 1MXUA 2HZKA 2Q2AA 1LBCA 2DVCA 3PUVE 3O29A 3BKIB 3S9NC 1YTVA 3T9XB 2OK2A 3T96B 2I0CA 5I59B 1QVSA 3CFLA 4EQBA 1PBPA 5EYFA 3KJ7A 5L9SA 2VD2A 3K1MA 3IO4A 1LFIA 2XX7A 3FVGA 3M3LA 4MFIA 5DEXB 4RYAA 1UIUA 4QHQA 3R26A 1DTZA 4MLQA 3C35A 1MPDA 1H44A 3SEUA 1B7ZA 5A5XA 3Q25A 3H6WA 1ZIUA 4PFTA 3TCFA 4XKQA 1OVBA 3VLVA 1IQ7A 4F22A 3CSBA 4R72A 2XX9A 4PP0A 4C0RA 4R74A 3SEYA 3WAEA 2X7QA 3CVGA 3IORA 1NNTA 2P2AA 3ODBA 1JVYA 3N6UA 1B4HA 2VOZA 5I57A 4F1VA 3V5AA 2X7PA 1SW4A 2NWJA 1AH5A 4I1DA 4LZ5A 3A3CA 4TLLB 1B2HA 4ZEBA 4FEBA 2R6GE 4IO5A 4DZ1A 3MVYA 3G3HA 4POXA 3LSWA 4UA8A 5K2YA 3ILTB 1ATGA 3IOUA 3OO8A 2F7AA 1R6ZA 1ZLQA 3S2VA 4F2OA 4QSCA 3GLBA 3CG1A 3H7MA 2DXRA 3GBBA 3C36A 4EQ7A 1EZPA 2NVUB 4KPTA 4DLDA 1NFTA 4HW8A 4GL8A 4FJPA 3GZGA 3P7IA 1URDA 4QFLA 4ZEFA 5ISUA 1AIVA 1MDQA 1NH7A 1VFDA 5H8NB 4NMYA 4IY5A 4YU0A 4YKIA 3U94A 1H3DA 1HSEA 4C1UA 3SEVA 1P1WA 1H76A 5F7VA 4GFRA 2D5WA 1RKMA 3ZKLA 3U92A 1SW2A 3OSQA 1LAXA 2ZNSA 4H8JA 4U22A 3O66A 3OENA 4F18A 1MPCA 2RINA 3MZ9A 1FTKA 5IAIA 3PGFA 4C1TA 5J1DA 4F39A 1MRPA 5ITOA 2RC9A 4N6PA 1L5TA 4Z0IA 4NTLA 2UXAA 4Q0CA 2QS4A 2F8DA 2QRYA 3FJMA 3HSTA 1RYOA 4AB5A 1GGGA 1OVTA 4JXIA 5CMCA 3BFTA 1M5DA 1AMFA 1WODA 3O2AA 2R71A 1XS5A 3QYTA 2Y7IA 1B7HA 4YB7A 5TP9B 2H5YA 3UA8A 1IXCA 3W9WA 1ZKBA 1H45A 4JBZA 2A5TB 1OQGA 1B5JA 3LBSA 3DP6A 2LAOA 3K6WA 5AA1A 1DPPA 2V3QA 1SVXB 3MC2A 3FXRA 4WEPA 1Y3NA 2RF1A 1EU8A 4NF5A 4KR5A 4TLMB 4M4GA 3B6TA 3K1NA 2O69A 2I58A 5I84A 4YKKA 3SKPA 1Z7NE 3MZBA 1SDXA 2UVHA 2O7IA 5AA2A 1TT1A 2DXYA 2F6GA 2O51A 2QJEA 4EF1A 2Q89A 1SI0A 4ND9A 5ICQA 2P1SA 2XHDA 4R6YA 1B9JA 2QS3A 1D4NA 3B7DA 2CZLA 1KWHA 5HBCA 4OTEA 1DPEA 5AA4A 1A40A 2FNCA 4LONB 3QSLA 5LOMA 1Y3PA 3S4UA 2Y7RA 4PFUA 4I8CA 1IXGA 2ABHA 4F2QA 2AL5A 5HPQA 3M3FA 1O64A 2F6PA 3IB0A 1JQFA 4NF8B 5DYHA 4DCXA 4F3BA 2DE4A 4ZDMA 3C9HA 3W15C 2REJA 3EHTA 1FTMA 1Y1MA 3C33A 4GXAA 4DXBA 3D4CA 4ISUA 5JEIA 1UTHB 3U1OA 4MF3A 3LSLA 3Q27A 4YAHX 2HAVA 2H98A 1O7TA 1SBPA 4H6DA 3DP8A 3Q29A 4EUOA 2F34A 1MH3A 3I5OA 3HHGA 2ZYKA 4HTGA 1N7WA 3MAMA 3RUMA 3TEPA 3T9VA 1ELJA 4N07A 4BDOA 3IB1A 4U23A 2ZMBA 1YCJA 3I6VA 3U72A 4X9TA 5I2NB 5BWJA 3SERA 1M5CA 2Z8FA 3VVDA 3TDJA 5FHOA 5B70A 1NNPA 5A5XB 2V25A 1LFGA 4RXLA 3T93B 2ONSA 1M5EA 2HQ0A 1B4ZA 5FHNA 3UN6A 4DXUA 1LCTA 3MJNA 2WKYA 1DSNA 5L9OA 2OJTA 5H8FA 4GD5A 2V84A 4NF6A 1MDP1 2ESNA 1P1OA 3IO6A 3IL1B 3MWBA 2B3BA 5I57B 2HXWA 1J1NA 2H9BA 5CMMA 4AQ4A 3PMXA 1FQFA 3KG2A 1LLSA 1DOTA 3FXQA 5H8HA 2FYIA 3DLNA 4DE8A 1ANFA 1MQGA 3FASA 4F31B 2PVUA 4ELPA 2F97A 4HCWA 3HN0A 5FTIA 4BDNA 5I56B 4O3AA 4R9GA 1DTGA 3LC8A 3O97A 4MH5A 1N84A 3ONMA 1FTOA 2O1MA 2E1SA 1B0HA 3PD9A 1OMPA 4IO7A 3VXCA 1MXZA 3TPAA 3TQLA 3IJOB 4PE5B 5AE4A 4R6KA 3TTRA 4LUBA 1B6HA 1D9YA 1GTKA 4IB2A 5CM6A 3KBRA 3DM0A 4BLAA 3PV0E 4U2RA 1PB8A 4QSEA 4F29A 1R1NA 3TODA 1PB9A 4TOZA 1S50A 3H4ZA 4R6HA 2PT1A 3GXAA 3VLWA 4OQOA 3MP1A 3B6QA 2B65A 3JYRA 1B51A 3A3UA 3N6TA 3OXNA 5HM4B 1CB6A 3KN8A 3CG3A 1Q1KA 2F7BA 1PB7A 3FD3A 3UP9A 4GL0A 5ITPA 3VV5A 5KDTB 2VGQA 2XD3A 1ZBMA 3FV2A 1P1UA 4FIMA 4GLIA 3K1PA 3M3KA 3O28A 2F7CA 3QUFA 1US5A 4KHZE 2DWHA 3RNNA 2XXVA 2Z8DA 4Q8RA 4POWA 2Q2CA 2YJPA 4JSOA 3FVOA 1VR5A 4PFYA 4R73A 4H5FA 1I6QA 1MQDA 4G2ZA 2HCAA 4XXUA 4KYEA 4DDDA 1N3WA 4QFKA 2ANJA 2O1LA 3EHUA 2Q8JA 4LQ5A 5AA2D 1GVCA 4OFJA 5AA2B 4ZEIA 3RTWB 3FGSA 5H8QA 1Y1ZA 4ECFA 3PUZE 2UVIA 3VVFA 1PBQA 4JWYA 4G68A 4H8IA 5L8DA 2XXUA 4GIZA 3TAJA 2D21A 4PQJA 2OLBA 3KSXA 1S7YA 2V93A 1B5HA 2QMXA 4NF4A 5CMBA 3TZAA 5KCJB 4ELQA 4XIGQ 1QUKA 4ONYA 1Y9UA 4QSDA 4XKPA 1MH4A 5TPAB 3ZKKA 2OZZA 4IO4A 2I4BA 2GHBA 4JDFA 2FA7A 1YAEA 1QJMA 3KOSA 3RPWA 5B7DA 1QW0A 1NKXA 2REGA 1D9VA 4BDQA 4JSDA 2O84X 1FTJA 1FCKA 4YMAA 1BIYA 4ZS9A 3BFUA 5AA3A 2I4CA 1JETA 5CC2A 3L6HA 3N94A 1POTA 4ZECA 1XVYA 2XXXA 4ZEKA 1MY1A 3VVEA 2Y84A 1FQEA 3K01A 4OENA 3EQ1A 3GBAA 2THIA 2XD2A 1RYXA 1N7XA 3UGWA 4KYDA 1Y3QA 4WXJA 3LSXA 3O9PA 3F11A 4K3FA 3EN3A 2PT2A 5DEXA 2KLFA 1SD3A 1BLFA 2HFBA 1LB9A 3MP8A 3TYHA 1IXHA 1P99A 4O3BA 2G29A 3DP4A 3IOVA 2RCAA 1SI1A 2RKMA 3H6UA 4NF6B 3KOTA 1JNFA 3CIJA 3CR9A 4FE8A 2F36A 2ZYMA 4TQUQ 1HSLA 1GR2A 3E3KA 4R75A 3MVWA 3K0VA 2DP8A 4YB5A 1IIWA 3B6WA 1QUIA 4ESWA 2NOOA 5TU0A 3C34A 4PFWA 3OO7A 4AB6A 3EF7A 2DVZA 5EHSA 1B52A 3PPPA 1OIBA 3TTKA 4ZE9A 3U8QA 3K02A 1N76A 4OHNA 1JW1A 3S9LC 1MXXA 1ZTYA 2ONKE 3MVXA 4ZE8A 3SEWA 1B32A 4JWOA 4QFOA 2ZNUA 3O6HA 4X1DA 1N3XA 3G3KA 1XVXA 1IXIA 3FZVA 4KFQA 3PPQA 2RC7A 1LCFA 3QIMA 4G77A 3IR1A 1B3GA 3TCHA 4P0GA 2QL3A 1D3KA 1A8FA 5H8NA 4U21A 2Z22A 1BP5A 4X48A 4WEDA 4DCYA 4Q30B 4QFPA 1TXFA 3T66A 2Y7PA 1ZU0A 4KQPA 2DWJA 4LQ2A 2H4IA 4KD5A 3CFZA 1A55A 4H5GA 1MQIA 2ZYNA 3E13X 4NE4A 3FVKA 2AYSA 4OEVA 4IGRA 2ALUA 4JB7A 4E0XA 2XXRA 1Y20A 3G3IA 3PPNA 4UACA 3CSGA 3T9HB 2PBWA 3T22A 1LB8A 2NUVA 2UVGA 1TFDA 3PU5A 4M1VA 4OFOA 1EZOA 4H65A 4LA9A 2X26A 1DMBA 4NWCA 1B7UA 3WAFA 1B40A 2VD3A 3H6VA 4H0WA 5M2VA 1B1HA 2ZYOA 2I48A 2OBGA 4GVOA 2E0SA 3OSRA 2B3FA 2QSXA 4QFNA 3FJGA 4U1ZA 4H1XA 1URGA 4I62A 1B3EA 5H8QB 2P0SA 4LZ7A 3ILUB 3RLFE 4YMBA 3VDFA 1FQAA 1R9QA 2RC8A 2Y7KA 3D4GA 3H06B 2OCUA 4NF4B 5I2KA 4GRKA 2UYFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4IY6A 3CRBA 4YZZA 1FQCA 4P0IA 1XT8A 1FPLA 1M5FA 1NL5A 4PE3A 3IOWA 4WKMA 4GWXA 4ELOA 3TCGA 1B5IA 3OEKA 1USYH 3LR1A 2XXYA 2GH9A 3SDFA 2XXKA 2QS2A 1AL3A 3A09A 3FV1A 4BDMA 1MXVA 5FTHA 1LAGE 1OLCA 1FTLA 2H99A 2G93A 4F3GA 1SQYA 3G3FA 4ESXA 2W7YA 3TMGA 3RT8A 2BJIA 5DVJA 4IR8A 4EXLA 2WX9A 5K2XA 1MM6A 1MXYA 2QS1A 3HPIA 2VP1A 4DIGA 4X1BA 4GX6A 4YKPA 1UTHA 5CBRA 1UQWA 1JVXA 1FPKA 4NX1A 3TTLA 5KZTA 5IZ3A 2DQVA 4FECA 3KZGA 3MPLA 3LUYA 5I58A 3V8XB 2PYYA 3SETA 3MPKA 3K00A 1FBGA 4KCCA 3RQTA 5DTBA 1FQBA 2HAUA 4RNSA 4BDLA 3PPOA 4MLVA 2CEYA 4ZZEA 4OERA 1LBYA 2IEEA 4LZ8A 1FPBA 3H03A 3IFCA 3HO7A 2AIXA 1BTJA 3KGCA 5DVIA 4OWDA 2D3IA 3VE1B 1B0LA 1VE4A 4U4XA 5I2NA 3PPRA 4NEDA 1K9YA 4KI0E 4GWOA 5BUUA 4G8MA 4R2FA 4KCDA 1B46A 2XXTA 3MVZA 1F9BA 3RTFB 3FBPA 4GWZA 3K6VA 3MSTA 3N26A 4XKRA 3RT6B 3KEIA 1FQDA 5JK4A 2O68A 3HCQA 1SW5A 4NF5B 1MM7A 2OWSA 4IGTA 4OXVA 2BJJX 2Q9TA 1XHYA 1RDZA 1IZ1A 3SZPA 1UIVA 2XXIA 1MPBA 4OEUA 4PF6A 2DWIA 3K4UA 4L17A 1B3FA 3RY3A 3PUYE 4I3YA 1HSJA 4RJZA 2PFYA 4O7IA 1P1QA 3O6GA 1BK4A 4GQOA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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