1N04A

Diferric chicken serum transferrin at 2.8 a resolution.
Total Genus 197
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
197
sequence length
683
structure length
683
Chain Sequence
KSVIRWCTISSPEEKKCNNLRDLTQQERISLTCVQKATYLDCIKAIANNEADAISLDGGQAFEAGLAPYKLKPIAAEVYEHTEGSTTSYYAVAVVKKGTEFTVNDLQGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLLHRGAIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDPKTKCARNAPYSGYSGAFHCLKDGKGDVAFVKHTTVNENAPDQKDEYELLCLDGSRQPVDNYKTCNWARVAAHAVVARDDNKVEDIWSFLSKAQSDFGVDTKSDFHLFGPPGKKDPVLKDLLFKDSAIMLKRVPSLMDSQLYLGFEYYSAIQSMRKDQLTPSPRENRIQWCAVGKDEKSKCDRWSVVSNGDVECTVVDETKDCIIKIMKGEADAVALDGGLVYTAGVCGLVPVMAERYDDESQCSKTDERPASYFAVAVARKDSNVNWNNLKGKKSCHTAVGRTAGWVIPMGLIHNRTGTCNFDEYFSEGCAPGSPPNSRLCQLCQGSGGIPPEKCVASSHEKYFGYTGALRCLVEKGDVAFIQHSTVEENTGGKNKADWAKNLQMDDFELLCTDGRRANVMDYRECNLAEVPTHAVVVRPEKANKIRDLLERQEKRFGVNGSEKSKFMMFESQNKDLLFKDLTKCLFKVREGTTYKEFLGDKFYTVISSLKTCNPSDILQMCSFLEGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure of diferric hen serum transferrin at 2.8 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal transport
molecule keywords serum transferrin
total genus 197
structure length 683
sequence length 683
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n04A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n04A04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n04A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n04A03
1B0LA 1MDP1 1MH4A 2ZNUA 3FV1A 4GXSB 3SEWA 4FAJA 2V25A 3S4UA 3T9XB 3IOVA 1IXGA 4QSCA 2I3VA 1FQDA 1M5BA 4QFPA 3C35A 1B52A 4IO5A 3H6VA 3OSRA 3K6UA 3CG1A 1UIVA 3O28A 3T9VA 1EZ9A 2AIXA 2DWAA 1PB7A 4N13A 3RNNA 1MPBA 2NWJA 3L6GA 3T93B 1TWYA 2V3TA 4JSOA 1B1XA 4IO3A 3T9HB 2DE4A 1PDAA 3MWBA 4ECFA 1IXCA 4ESXA 1UTHA 4HS7A 2F8DA 2H98A 3ILUB 5I58B 4LA9A 1ZMGA 2O69A 1ZIUA 3KGCA 5I56B 2O84X 1FTJA 5TP9A 3KSXA 4PE5B 3TPAA 1NMUA 1QULA 1B3HA 2HEUA 4I8CA 1JQFA 1O63A 5AA2D 4TOZA 4FEBA 2PT1A 1Z7NE 1YCJA 2FA7A 3OEKA 1FTOA 4NF6A 3TFLA 4BLAA 3CSBA 3CSGA 4GL0A 3G3HA 4PFWA 3UORA 4O3CA 3USDA 2F78A 1FW0A 1LAHE 2Y7WA 3RTWB 1FTLA 2VP1A 3R7XA 5L9OA 3N6TA 3FD3A 4IGTA 2OCUA 3H6WA 1GVCA 3SEYA 2FYIA 4LZ5A 2VD2A 4BDLA 3H06B 4F1VA 5ITPA 1JEVA 2ONSA 4LZ8A 2H4IA 2V3UA 2XD2A 2YPNA 3LBSA 3QUFA 3JYRA 4YU0A 5H8FB 3TCGA 3DP8A 5HM4B 4U1OA 1I6BA 3HV1A 3UP9A 1EU8A 4AB6A 1DMBA 1H76A 1OVBA 2GFEA 1PC3A 2XX7A 4NTLA 3G3FA 5EHMA 4PQJA 1BLFA 1MS7A 3RY3A 1UIUA 2DVZA 1NKXA 1BIYA 2XX9A 3OO6A 4LONB 4PFUA 4YICA 2QS2A 2O68A 4F22A 4RPOA 2G93A 3IB0A 4FORA 4EF2A 3RLFE 1P1WA 1QUKA 3K1PA 3ZKKA 2Q88A 4EQBA 4THIA 5H8FA 3C34A 3HHGA 4M4GA 1JW4A 4IGRA 4QSEA 3QYTA 3MW0A 1PBPA 2H9BA 2Z8DA 1USYH 2AL4A 3IO6A 3O6IA 4FEDA 2XXTA 4GWOA 1MXXA 1PB8A 3G3IA 4ISUA 4JSDA 4U4XA 4XTCQ 3G3KA 3K02A 2BJJX 3G3GA 2RC7A 4H1XA 4JB7A 1LFGA 2E1SA 4LVQA 4U23A 2DE3A 3TZAA 3U92A 4EXLA 3SEVA 5H8QA 1ELJA 3VLUA 5KDTA 1QW0A 3N26A 2XXHA 4GRKA 2ZYNA 4HCYA 2D5WA 1B3GA 4L17A 3HO7A 4QRZA 5L8DA 3G7WA 4H8IA 1DPEA 1LLSA 1TFAA 2G29A 3RPWA 4NE4A 3OO8A 3RT6B 5ICQA 4ONYA 1ZU0A 3ZS6A 2B3BA 5KCJB 4ZEDA 2I0BA 1FQCA 1ZJLA 3PUZE 5F7VA 2F36A 4I1DA 4WEPA 1L5TA 2I48A 5B7DA 2CZLA 1BKAA 1B51A 1S7YA 1FQFA 2HAUA 3LR1A 3MAMA 4G8HA 4F19A 4G68A 1JW1A 3EHSA 3PMWA 4G68C 4GLIA 4KQPA 5FHNA 3DP4A 5AE4A 3Q28A 2DWHA 2RINA 1P99A 3FXUA 3I6VA 5H8HA 4OENA 2R71A 3K2DA 3TDJA 3H4ZA 3PPNA 1SW5A 3TODA 5M2VA 1M5CA 4MBPA 1ZBMA 4DXUA 4IO7A 1JW5A 1UTBB 2Q2AA 4X1DA 3U8QA 1SYHA 4RJZA 4YKJA 1XVYA 5FHOA 3FVNA 4KYDA 1NNPA 1NH7A 4IB2A 5H8HB 3C31A 3E3KA 1Z7ME 5ISUA 2X7PA 3Q25A 4G8NA 4H0WA 3MVWA 4K3FA 4QFKA 4BDNA 2H99A 2Y84A 1JEUA 1B58A 3FUZA 3KFMA 1O7TA 3KOSA 3SESA 1XVXA 1II5A 1M5FA 1US5A 3P7IA 4NF6B 2V3QA 5H8NB 3C33A 5ITOA 1A7LA 4ZEIA 3DP6A 3TTKA 4HW8A 3LC8A 3EHTA 3M3FA 3SDFA 3HN0A 3TTMA 1IXHA 2NUVA 2AYSA 3W9VA 5I57A 3PUWE 5K2XA 2ZXTA 2Q2CA 4R72A 2UVHA 2B65A 3CR9A 4GXAA 1NH8A 2NXOA 4OERA 4QFLA 5JTYA 1B4ZA 4KCCA 1B7HA 3R6UA 2QPQA 4ESWA 2Y7KA 2VGQA 3DELB 3FVOA 3MP6A 4OYVA 2PX1A 1TT1A 1XC1A 1FQBA 2Q9TA 3H6TA 4OZ9A 5I56A 2R6GE 3IR1A 3K1MA 3OENA 4XIGQ 4E0XA 1KWHA 1UTHB 1B7ZA 3TTLA 5EYFA 2PT2A 4N07A 4O3AA 4YMBA 3Q26A 3VXCA 2GHAA 1XS5A 4RNSA 1MY3A 1URSA 4MLVA 1Y1ZA 1DTGA 1BP5A 1LGBC 4GQOA 1SI1A 1I6AA 5H8NA 3VXBA 3FZVA 4Q30B 3A3CA 4OFOA 3LSLA 4LQ5A 3E9XA 4YZZA 3CFXA 5IAIA 3K4UA 3FATA 3KN8A 3IK6B 3PUVE 3MC2A 4G8MA 1A8EA 5DEXA 3S9MC 1FCKA 3K6WA 4F29A 2GHBA 3TUSA 1Q35A 4Q5TA 4DLDA 3S9NC 5FTIA 2A5SA 2I49A 4R9FA 3VFJA 3BKIB 1LFIA 1MH3A 3QSLA 4H67A 4QF9A 1S9TA 2HQ0A 2OZZA 4NWCA 4LQ2A 5DVJA 1O64A 1GTKA 1A8FA 1RYXA 3HPIA 3K6VA 4I9DA 2WKYA 2XXRA 3K6XA 4KYEA 4NF4A 4OQOA 1Y9UA 5FHMA 2F7AA 2DYXA 2KLFA 2VHAA 3B6TA 3EPEA 3LSXA 3TQWA 3CRBA 1WDNA 3FASA 4MFIA 5CMBA 5H8SA 5A5XA 4G2ZA 3K0VA 1B32A 5TPAB 2XXVA 2PVUA 1B3FA 1UTBA 3H03A 5AA3A 1JNFA 1B3LA 4MH5A 3FXRA 4F39A 4NWDA 4OTEA 1JETA 1VR5A 2OWSA 1YPNA 2DP8A 4KFQA 5K2YA 5JK4A 4RK2A 1OQHA 3N6UA 4H6DA 4R6KA 2O6AA 3IJOB 1HSLA 2HFBA 4IO2A 3Q29A 3VDFA 1A99A 4ZZAA 1US4A 3MP1A 1IITA 2RCAA 3SEUA 1MXWA 4EUOA 3OMBA 4R6HA 2E0SA 1URGA 5CRYA 3CI8A 4ELRA 2DE2A 1AH5A 2QS3A 2OLBA 1QKAA 2THIA 1WODA 3O97A 4HCWA 2H5YA 1PEBA 1DSNA 3KSJA 3QK6A 4POXA 1YTVA 4U1ZA 2ONRA 2QL3A 4XXUA 3LUYA 4C1TA 4F3GA 3MZBA 3IAZA 3VVEA 4PP0A 2OK2A 4EF1A 3EN3A 1MQHA 2VOZA 3IJXB 4FIMA 3QIMA 3T66A 1MM6A 1MY2A 3FGSA 5TU0A 3TTRA 3O6HA 4H65A 5ICTA 3UGWA 1MXVA 2R9JA 2REJA 5IKBA 1A55A 1IZ1A 3TCFA 4X9TA 1VSOA 3MQ9A 1EZOA 1Y3NA 1OLCA 1LB9A 1POY1 4YKPA 2ZYOA 4WXJA 3K01A 2DWJA 3WAFA 1OQGA 3BFTA 2Q8JA 2IA4A 2Z8FA 2QSXA 3IORA 2B3FA 1MPCA 2I4CA 1B6HA 1A54A 3D4CA 3GBAA 4ZDMA 4ZEBA 5CBRA 5AA2B 2ZNTA 1B3EA 4UA8A 1R6ZA 1ZLQA 4XKNA 1I6QA 4WEDA 2A5TB 3K1NA 1SW1A 4QHQA 1FTKA 3V89B 2Z8EA 3KJ7A 3L6HA 5JTYB 3U94A 4OVJA 2W7YA 4NF8A 3UK4A 3WAEA 2XXWA 1LAGE 1D9VA 3RGYA 3W15C 3KEIA 4ZE9A 3DLNA 1N0TA 2P2AA 4ZZEA 1JVYA 3RQTA 4QFNA 3W9WA 2RCBA 4F1YA 4UACA 4P0GA 1SW2A 2DOJA 2O7UA 1LCFA 4GL8A 2F6GA 2PBWA 3V5AA 2RC9A 4O3BA 4OFJA 5I57B 4XKPA 2CMOA 2P0SA 5AA1A 1QVSA 4YB6A 3GXAA 4Q8RA 1NNTA 1EZPA 2H25A 4OMBA 3BBRA 3A3UA 3TQLA 1QKBA 1PBQA 4DCXA 4HTGA 3N94A 5HBCA 1MXYA 2X7QA 4EQ7A 4ELPA 4Z0IA 3FXQA 3C4MA 1N76A 4KYSA 4YB5A 4BDOA 1N84A 2HZLA 4BDMA 4IY5A 3F11A 3MBPA 4M1VA 4R2FA 3T22A 3IB2A 4R6YA 3M3KA 1LFHA 2DXYA 3ECRA 3GLBA 3FVGA 1MY4A 4LZ7A 3MVXA 4OEUA 1AOVA 1GR2A 1AL3A 3THIA 3IOWA 1WVJA 3OEMA 4G4PA 2XXYA 3D4GA 3SETA 2D21A 3GZGA 3KBRA 4IY6A 5JEIA 2ANJA 4XKRA 3CFLA 1MPDA 3PD9A 1ATGA 4FE8A 3ZKLA 1R9LA 1SW4A 1VE4A 3HHFA 1HSEA 5KDTB 2D3IA 4F31B 1IIWA 2XHDA 3C32A 1IEJA 1H3DA 2AL5A 3G3JA 3GBBA 4GOTA 3V83A 5LOMA 3RT8A 3QUJA 4OEVA 3RUMA 4JWXA 2ZNSA 2OWTA 3FJ7A 3S2VA 3V8XB 2XD3A 1JVXA 3KZGA 4U22A 4KR5A 1FQEA 1A40A 1D3KA 3AXFA 3BFUA 3QAXA 5EHSA 3CG3A 3ONMA 5I84A 1FQAA 1P1UA 3RN8A 4YMAA 3FJGA 4BDRA 2I3WA 3IO4A 5B70A 2QMWA 4RY1A 2DWIA 4OETA 3PU5A 1MQIA 4OXVA 3IB1A 3N5LA 3OO9A 4JBZA 4DE8A 1B1HA 2YLNA 4NF4B 1I69A 4YB7A 1MM7A 1NNKA 4JWYA 1LBBA 2HXWA 2V84A 3Q27A 2FNCA 4IO6A 1R9QA 1LSTA 2Y7RA 3VVFA 1SVXB 1VFDA 4NF8B 3EQ1A 5DVIA 4N6PA 3ODBA 5BUUA 5I2NA 4OWDA 1J1NA 5CBSA 2F7CA 3MPKA 2OBGA 3E13X 1DTZA 4XKQA 4RK9A 4YKIA 4R74A 4DZ1A 3DM0A 2HZKA 3ILTB 3MUQA 1RYOA 3PPPA 4ZS9A 3MJNA 3O9PA 1Y1MA 1BTJA 2NVUB 3UIFA 4C1UA 2REGA 1OIBA 3IOUA 3RTFB 4U21A 4OFLA 1LAXA 3U1OA 1ZTYA 1HSJA 1D4NA 5FTHA 4MLQA 2UVIA 1IXIA 1LBCA 2A5TA 3FVKA 1SD3A 2RC8A 4DCYA 1NFTA 3T96B 1YAEA 1T0KA 4JWOA 5I58A 2F6PA 1M5EA 3S9EA 2PMSA 3C36A 3HCQA 3TELA 2M8CA 5CMMA 1F9BA 4G77A 1QJMA 4JXIA 4R73A 1MY0A 1XHYA 3CVGA 4H5FA 2UYFA 3A09A 5CMKA 4U2RA 4ZECA 5AA2A 4KI0E 3EF7A 1POTA 5DVFA 2GH9A 5I59B 2I58A 5I2KB 1SDXA 2XX8A 3VV5A 1ZKBA 3SERA 1LCTA 1CE2A 4KCDA 3PPOA 4POWA 5CMCA 4PFYA 1PB9A 1MDQA 3O6GA 1H45A 3O29A 5KCJA 1Y3QA 3MVZA 1MY1A 1NL5A 2XXPA 4NEDA 2UVGA 1MQJA 2YJPA 1B0HA 4NF5A 2ZMBA 2O1MA 4ND9A 2I4BA 4YAHX 4DIGA 3FIRA 1B5IA 3MP8A 3I3VA 2ZYKA 3E4RA 4KHZE 2NOOA 3TTNA 1AIVA 3S9LC 2QRYA 2F34A 3O2AA 1EH3A 3FJMA 5TPAA 2Q89A 5I2NB 5AA4A 5KZTA 3B6QA 4YKKA 2LAOA 4OESA 2RF1A 1MQGA 4RA1A 4TLMB 4ZEFA 4F18A 1SI0A 4RPNA 1N7WA 1B5JA 2GRVA 4FECA 4ELQA 4F3PA 2DS9A 2F7BA 1XOCA 3PMXA 3OXNA 4FJPA 4NF5B 3QXMA 1N7XA 2VD3A 3R26A 4F2OA 5I59A 3O66A 1DOTA 1MXZA 2F35A 1N3XA 1USYE 1B05A 5L9MA 5A5XB 3M3LA 3OO7A 1B5HA 3CFZA 3KN3A 1B2HA 3VE1B 1Y4CA 4R9GA 3UA8A 2UVJA 1OLAA 4TQUQ 1B46A 4Z7EA 5L9SA 3SEXA 2IEEA 4F1UA 4QSDA 2DQVA 2ABHA 4F2QA 1RKMA 1M5DA 2ALUA 4LATA 4I62A 1QUJA 1XT8A 3HSTA 5J1DA 3C9HA 5H8QB 1N04A 1P1NA 4OHNA 2Y7IA 2Z23A 3PD8A 4RXLA 1CB6A 3TEPA 2O7IA 3K00A 2ESNA 4NMYA 4P11A 4TLLB 1SYIA 1H43A 2DVCA 3KJTA 4G68B 2QMXA 3B6WA 4GFRA 3U72A 3IX1A 4Q0CA 4PFTA 3KOTA 1VFEA 1FTMA 3FV2A 5DYHA 4MF3A 4AQ4A 5I2KA 3EHUA 1QUIA 4H8JA 5F1QA 1Y4TA 3LSFB 2DSFA 1Q1KA 1B7UA 1R1NA 2F5XA 1SBPA 3JZJA 4EQ9A 2XXQA 2OJTA 4DXBA 3OD7A 3PMVA 1P1QA 3KG2A 3SKPA 1B40A 3MVYA 5ELVA 4R75A 5CM6A 3PPRA 2UYEA 3I5OA 3OSQA 5CI5A 3T9UA 2P1SA 1OMPA 2O51A 2RKMA 3H6UA 4IO4A 4RYAA 1TFDA 2HAVA 1LAFE 5DTBA 3TKDA 4DXCA 1DPPA 2HCAA 1B9JA 4PETA 4LP2B 3H7MA 2QJEA 3M8UA 4GVOA 1NNFA 3MZ9A 4R2BA 2DXRA 3H3GA 2ONKE 2V93A 3U93A 5CC2A 2QS1A 3PUYE 1IQ7A 5DEXB 1D9YA 1URDA 4P0IA 4X1BA 1S50A 3OELA 4GD5A 2Z22A 4AB5A 1OVTA 2UXAA 4WKMA 1UQWA 1Y20A 3LSWA 5TP9B 4X48A 1MQDA 1N3WA 2XXXA 3TMGA 1Y3PA 3ZSFA 3B7DA 1MXUA 3PPQA 4DDDA 4EDPA 3UN6A 5AA4B 5BWJA 5DT6A 2XXUA 1AMFA 2F97A 3PV0E 4F3BA 1MG1A 4E0WA 4JDFA 4KPTA 2O1LA 2XXIA 3TCHA 3PGFA 4QFOA 1B4HA 1IUDA 3JV9A 3TYHA 4ZE8A 3PUXE 2ZYMA 1TXFA 3IL1B 2Y7PA 4H5GA 4GF8A 4FATA 4GIZA 3CIJA 3VLWA 4C0RA 4F3SA 2PYYA 3IOTA 4KD5A 1ANFA 2QS4A 3VLVA 3TAJA 1H44A 1GV8A 2I0CA 3MPLA 1SQYA 3OOAA 1LB8A 4BDQA 4ELOA 5HPQA 4U4SA 3VVDA 3KN7A 4EXKA 1MRPA 4ZEKA 1P1OA 4LUBA 2I6EA 1GGGA 2X26A 3MZ1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1B0LA 1MDP1 2ZNUA 1IXGA 1PB7A 4N13A 5I2NA 2V3TA 2DE4A 1IXCA 2F8DA 5I56B 2O84X 1B3HA 1O63A 4FEBA 2PT1A 1Z7NE 3BIHA 1FTOA 4NF6A 5B7DA 2F78A 2Y7WA 4N15A 3R7XA 5IGAA 2OCUA 4BDLA 3H06B 1JEVA 4N4UA 2H4IA 2YPNA 1FJ9A 5H8FB 4MHFA 3HV1A 1EU8A 1DMBA 1H76A 4P9KA 1PC3A 2WEFA 4NTLA 4PQJA 4PFUA 4RPOA 1P1WA 3RYDA 1QUKA 3K1PA 2Q88A 4M4GA 2H9BA 3O6IA 1PB8A 4ISUA 4JSDA 3K02A 2BJJX 3FBPA 2RC7A 4N8YA 4U23A 1K9YA 2XXHA 1B3GA 1TFAA 1AOVA 5ICQA 1BK4A 1NV7A 1INPA 1ZJLA 4I1DA 2KQZA 2CZLA 1S7YA 5ET8A 3LR1A 3DP4A 5H8HA 2R71A 3PPNA 4IO7A 4KYDA 1NNPA 4G8NA 4MX6A 2H99A 2Y84A 2VT5A 1XVXA 1US5A 2V3QA 3C33A 3TTKA 3HN0A 3TTMA 2NUVA 3A29A 5K2XA 2ZXTA 4GXAA 1NUWA 4KCCA 1FPDA 2QPQA 3FVOA 3MP6A 1XC1A 1FBCA 4E0XA 3K1MA 4XIGQ 1UTHB 4N07A 4PDHA 1Q9DA 2GHAA 1Y1ZA 4O7MA 5H8NA 1FPLA 3FZVA 4Q30B 4LQ5A 4G8MA 3IK6B 1EYIA 5FTIA 2A5SA 2I49A 2HQ0A 2OZZA 1NV1A 4NF4A 1FBEA 2L5VA 2QFLA 2F7AA 2DYXA 3ROJA 3K0VA 2PVUA 3H03A 4NWDA 4OTEA 1OQHA 3N6UA 4H6DA 2HFBA 1A99A 4ZZAA 1MXWA 4R6HA 2Q74A 2QS3A 2OLBA 2H5YA 3QK6A 3KSJA 1YTVA 4C1TA 3LUYA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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