4R2BA

Crystal structure of sugar transporter oant_3817 from ochrobactrum anthropi, target efi-510528, with bound glucose
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
395
structure length
395
Chain Sequence
MQDKQNVEVLHWWTAGGEAAALDVLKKDLEKKGISWTDMPVAGGGGTEAMTVLRARVTAGNAPTAVQMLGFDIRDWAEQGALGNLDEIANKEGWEKVIPAPLQEFAKYDGHWIAAPVNVHSTNWMWINKAALDKAGGKEPTNWDELIALLDKFKEQGITPIAHGGQPWQDATIFDAVVLSFGTDFYKKAFIDLDPETLGSDTMKQAFDRMTKLRSYVDDNFSGRDWNLASAMVIEGKAGLQFMGDWAKGEFVKAGKKPGEDFVCMRYPGTQGAITFNSDMFAMFKVSEDKVPAQLEMASAIESPTFQSAFNVVKGSAPARTDVPDTDFDACGKKAIADEKEASEKGTMLGSMAHGYANPAAVKNAIYDVVTRQFNGQLSSEDAVKELVSAVEGAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Glucose Transporter Oant_3817 from Ochrobactrum Anthropi, Target EFI-510528
rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Ochrobactrum anthropi
molecule keywords Extracellular solute-binding protein family 1
total genus 154
structure length 395
sequence length 395
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-08-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4r2bA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4r2bA02
1P1UA 3JZJA 3O97A 3SERA 1AL3A 1ATGA 3G3FA 1M5DA 4I9DA 1N3WA 2O69A 2XXWA 3N94A 3N6UA 4F39A 1DTZA 4OFOA 2ZYMA 4YMAA 3HCQA 1FTJA 1QKBA 3T96B 3FJ7A 1R9LA 3QUFA 4AQ4A 1MPDA 5FTIA 4QFLA 3M8UA 4FAJA 1VR5A 2CZLA 3PUVE 1NH8A 4LZ5A 4TLMB 3KJ7A 4R6YA 1YCJA 3RUMA 2RINA 5B70A 3FIRA 3SKPA 4R74A 4MBPA 1ZLQA 2DVZA 3K6XA 2P1SA 4Q8RA 3SEXA 4PFTA 1USYH 1BKAA 1A7LA 2UVGA 1LAGE 4DXCA 1IXHA 3D4CA 4G68C 5DTBA 4THIA 1SD3A 3R26A 5TPAA 4E0WA 1NH7A 3O2AA 3VFJA 3U94A 1LGBC 1GTKA 1IEJA 5EHSA 1URGA 3TTKA 5CBSA 1LFHA 5DVJA 3G3KA 1ZTYA 4K3FA 4LA9A 1SI0A 4F3PA 4ECFA 1N7XA 4F29A 5JTYB 2HAVA 1CB6A 3O6IA 4ZECA 1MQHA 3MVZA 1ZBMA 3O9PA 3EF7A 3BFUA 1MM7A 1JW4A 3LSWA 3TQWA 2A5TA 5KDTA 3T9UA 2DE3A 2ZYOA 3PUYE 1MH4A 2Z8DA 1OQHA 3K02A 3QIMA 1HSEA 1MPCA 3PMXA 2HQ0A 4U2RA 1KWHA 4F3SA 3PUWE 3W15C 1B7UA 2B3FA 1VFEA 4PFYA 2Q9TA 3MP1A 5ICTA 1A54A 3TCFA 4U21A 2QMWA 1A99A 5A5XA 3PUXE 1B5HA 3QAXA 3S9EA 1LFGA 1SW1A 2F7CA 4EQ7A 4G8MA 3S2VA 5I59B 5H8HB 2RC7A 3K6UA 2OBGA 5I2NB 4P0IA 1Y1MA 2GFEA 2F5XA 1FQCA 5CBRA 2FYIA 3VXBA 2RKMA 3FV2A 4OFLA 3FVOA 4NWCA 1YPNA 3CG1A 2VGQA 3K0VA 1B5JA 3GBBA 2I3VA 2HCAA 3V89B 1FQAA 3RGYA 3ODBA 4XKRA 1BLFA 2I3WA 4H6DA 4ZEFA 1AIVA 1B0HA 3G3GA 1GV8A 2DOJA 2Z8FA 4U1ZA 4KQPA 5CMKA 4NMYA 4I1DA 4DIGA 5CMBA 2OCUA 4HS7A 4YMBA 4F19A 1QJMA 5EYFA 4JWOA 2Q2CA 3RPWA 3TYHA 4F2QA 1POTA 3DP8A 5ITPA 1D3KA 4OTEA 5FHMA 4Q5TA 1SW4A 1LSTA 1PBPA 2UYFA 5I58A 2M8CA 3U8QA 2I48A 3PUZE 4GXAA 1ANFA 1NNKA 1NNPA 3RTWB 3E13X 4C1TA 4RPNA 4P0GA 2HEUA 3TZAA 5ITOA 4I8CA 3OENA 3G3JA 3IB1A 2REJA 1B1HA 1RYXA 4LP2B 3A3UA 2BJJX 5H8NB 1ZJLA 1PB7A 3QYTA 3ILUB 3SEVA 3N26A 2QS2A 2DVCA 3VV5A 5I57A 1IUDA 3M3KA 3DP4A 1OVBA 4LONB 2Q89A 1LAFE 1TFDA 3HPIA 3K01A 4KFQA 4IO2A 3Q27A 1VFDA 4WXJA 1J1NA 3RT8A 2F34A 2V93A 2Q88A 2Y7WA 4ZZEA 1R9QA 1N0TA 4H67A 1UTHB 3PPRA 4EF1A 5AA2A 3EHSA 4GLIA 3VDFA 1FTMA 2HZKA 3PPPA 3FATA 2NXOA 5DEXA 3FXRA 3FUZA 3CIJA 3C35A 4NF8B 1WDNA 4E0XA 2DE4A 1Y9UA 3D4GA 4MLVA 4G8NA 2D21A 1NMUA 3ECRA 2QS1A 2X7PA 3KSXA 1QW0A 3HSTA 2HAUA 3ONMA 4Z0IA 3L6HA 1R6ZA 3CG3A 3T66A 3MUQA 1MXXA 4X1DA 5CM6A 4R72A 4WEDA 1SQYA 3BKIB 4NF6B 1RKMA 3QXMA 1ZKBA 2FNCA 4YU0A 4PETA 4OHNA 3KFMA 2XXRA 4FJPA 2PBWA 2UVJA 2OZZA 4QSEA 3C34A 2Q8JA 4F1UA 1XOCA 4YKIA 4OENA 5AA3A 2THIA 1USYE 3MZ1A 1O64A 1FQEA 4OXVA 1OQGA 4MF3A 3IORA 4JXIA 3PGFA 4OETA 4F2OA 4OESA 1XT8A 4F18A 2DQVA 3FVNA 3IL1B 3TMGA 4BDNA 4LZ7A 1CE2A 2F6PA 3V83A 4MFIA 4QSCA 2Y7PA 2VOZA 4PE5B 4R9FA 3FZVA 3PU5A 3HHFA 1B3LA 1B3EA 1Y20A 3DELB 3I3VA 2X26A 2V3UA 3M3LA 4OYVA 4EQBA 2X7QA 4FEDA 1QUIA 1Q1KA 3TCGA 2O68A 4KD5A 1N3XA 4KYDA 5H8QA 1DPEA 2F7AA 1SBPA 1JQFA 2GRVA 4ELOA 4R9GA 1F9BA 1JEUA 4IY6A 4AB5A 2G29A 4O3CA 3PPNA 4ZDMA 1Y3QA 3IB0A 4IO6A 4KI0E 1S7YA 3KSJA 3H4ZA 1Y4CA 3S9MC 4ISUA 3IJOB 5CC2A 2Z22A 3RLFE 4IO5A 5L9SA 4YB5A 3G3HA 4PQJA 5M2VA 5IKBA 1B52A 2RCBA 3FVGA 2UVHA 5HBCA 1MH3A 3S4UA 3IO4A 3O6HA 3TTMA 3O6GA 2OK2A 3UN6A 1IITA 4F1YA 3C32A 1D9YA 4RPOA 2F78A 3T22A 2YLNA 3K6VA 3B6WA 2QRYA 5I2KA 3IX1A 5I56B 4OEVA 3IAZA 1WODA 2H99A 4IY5A 3K1MA 3H7MA 4OFJA 2XX7A 4YZZA 4RA1A 2QMXA 3KOTA 3UP9A 4X9TA 1IXGA 1URSA 1MXVA 2LAOA 2I6EA 1A8FA 1N7WA 2GHAA 1P1QA 3OXNA 3FXQA 4ZEDA 5F1QA 4OZ9A 4U23A 4FE8A 3OEKA 2D3IA 2F97A 4IB2A 1IZ1A 1US5A 1GGGA 4XTCQ 3S9NC 3KOSA 3E4RA 1LFIA 5F7VA 2ONRA 3H6VA 5BWJA 4FORA 4O3BA 4R2FA 1NNFA 2A5TB 1PDAA 3FJGA 3CFXA 1AOVA 3C33A 2DS9A 3TAJA 1DSNA 5ISUA 3B6TA 3EQ1A 4IGRA 4LUBA 2HFBA 2VD3A 5TU0A 1URDA 2Y84A 3LUYA 2ZXTA 4M1VA 3USDA 1B6HA 2XXYA 2VP1A 3UGWA 5LOMA 3N5LA 1B1XA 1XVYA 3K1NA 5A5XB 3ILTB 4HCYA 3MZBA 4JBZA 4TOZA 3U72A 3OO7A 3HO7A 3IB2A 5AA1A 1GVCA 2I4CA 1T0KA 3MVWA 4EQ9A 1MM6A 2H25A 3RTFB 5K2YA 1B2HA 2P2AA 4H65A 1UTBB 1UQWA 4LQ5A 3CSBA 4H5FA 1LBCA 1MY4A 2XX8A 1TFAA 4IO4A 4H8IA 3C31A 3FASA 2PT1A 4DXBA 3DLNA 3KN8A 4Q30B 2PT2A 3THIA 4OWDA 2AL4A 3H06B 3ZS6A 4QRZA 5I59A 3FJMA 5H8HA 2V84A 2B3BA 2O51A 4GD5A 4F22A 4RNSA 2UYEA 3KGCA 2Q2AA 1YAEA 4JDFA 3O66A 1SYIA 2OLBA 4C1UA 1LCFA 3VVFA 2QL3A 4HW8A 3LC8A 1Y1ZA 4ZE8A 1IQ7A 3MVXA 5TP9B 2QPQA 2REGA 4GL8A 4L17A 2RF1A 2PX1A 4UACA 2O7UA 5IAIA 3MP8A 3TELA 5KZTA 4Q0CA 3TDJA 4GF8A 2IEEA 2WKYA 1IXIA 4R73A 3LSLA 1B58A 3MPLA 2CMOA 1WVJA 3CSGA 4XKPA 2OJTA 5BUUA 3MP6A 4QFPA 3RN8A 3MJNA 1H3DA 4NTLA 3IJXB 4G68B 2I49A 3R6UA 2Y7KA 2ALUA 4BLAA 1I6QA 5DVIA 3TEPA 1Z7NE 5AA4A 4ELPA 3TTLA 5H8FB 1A40A 3KN3A 3SESA 5AA2B 2A5SA 4OEUA 1AH5A 5DYHA 2YPNA 4IO3A 4XXUA 2H98A 3TTRA 4RY1A 3L6GA 3RY3A 1UIVA 3K6WA 2O6AA 3P7IA 4NF5B 1DMBA 3W9VA 2H5YA 1EZPA 3T9HB 4XKNA 3EHTA 1EZ9A 4R6KA 4UA8A 3KZGA 4H8JA 2QJEA 3FD3A 3IOUA 2O1LA 4DLDA 2FA7A 2V3TA 3E9XA 3HN0A 3KBRA 1FW0A 1JW5A 1FTLA 3H6TA 1Z7ME 3VLVA 2B65A 1B40A 1FTOA 1M5EA 1MS7A 4PFUA 2AIXA 4YB7A 2Z8EA 1P1WA 2O1MA 4RJZA 4ZEBA 2V25A 4YKJA 4GL0A 2VD2A 4G2ZA 4BDQA 5HM4B 4NF4A 1JVXA 5DVFA 3N6TA 4EXKA 3AXFA 4WKMA 3I6VA 1DOTA 1LAXA 1B51A 5J1DA 1BIYA 3LSXA 3MW0A 5B7DA 1IXCA 4GRKA 1UIUA 2DP8A 3F11A 1MQIA 4EDPA 2IA4A 1QUKA 1NL5A 2I0CA 1O7TA 4KPTA 1US4A 2YJPA 4N13A 1JEVA 3A09A 1I69A 4Z7EA 2G93A 1ZIUA 4FATA 3S9LC 3ZSFA 3BBRA 1II5A 1B7ZA 4KR5A 1PEBA 1XVXA 2XD2A 1OMPA 1DPPA 3UA8A 1H43A 2XXPA 3KJTA 1N84A 3SEWA 2QS3A 2R6GE 2I58A 3Q28A 2AL5A 2XD3A 3QK6A 5H8QB 3IOTA 4GIZA 3RNNA 2Z23A 3HV1A 4H1XA 1QVSA 5KCJB 4YICA 1MXYA 1MQDA 3TKDA 1B3HA 4LQ2A 3TCHA 4OMBA 3C36A 3CVGA 1SVXB 1MY3A 4DE8A 3G3IA 2V3QA 1S9TA 3K4UA 4ZZAA 2AYSA 1MPBA 3V8XB 3KN7A 2XXXA 3VVDA 4FECA 3IOVA 1PB9A 3VLUA 1NKXA 3PMVA 4FIMA 4RXLA 1PBQA 1SW2A 3C9HA 4LZ8A 3SETA 3E3KA 3HHGA 1XHYA 1JNFA 3MPKA 3OSRA 3PMWA 2UVIA 3Q25A 5H8SA 4M4GA 4DDDA 2DE2A 2ZNTA 4DXUA 4DZ1A 5FTHA 4O3AA 1QUJA 4YKKA 5K2XA 1I6BA 4QF9A 5CMMA 2D5WA 3EPEA 1ZU0A 4POXA 3SDFA 1SYHA 3GZGA 5FHOA 3I5OA 3VLWA 3Q29A 4DCXA 3JYRA 4RK2A 2ANJA 1EZOA 4ZEKA 1SDXA 4GQOA 4YKPA 1OLCA 4NEDA 3T9XB 1M5CA 5I84A 2DWHA 4BDOA 1IIWA 2I4BA 4GWOA 3KG2A 4LATA 1ELJA 5TPAB 1S50A 2Y7RA 1LAHE 3G7WA 1P1OA 1L5TA 4HCWA 1MY2A 1LB8A 4U1OA 1D4NA 3M3FA 1LLSA 1D9VA 4U22A 1P1NA 5I56A 1BP5A 5ELVA 4N6PA 3QUJA 2UXAA 4R2BA 2ZNUA 1NNTA 2HZLA 4IGTA 3MQ9A 4WEPA 3OSQA 2NUVA 1MQJA 2ZYKA 5KDTB 5AA2D 4RYAA 5CMCA 2PYYA 3IK6B 1MRPA 5AE4A 3ZKLA 3VE1B 3GLBA 4HTGA 5CRYA 2GH9A 3LR1A 3VVEA 4NWDA 1PC3A 1MY1A 4POWA 2DSFA 1MXZA 1Y3PA 4ZS9A 3MAMA 2E1SA 3VXCA 1B4ZA 4QFNA 2QSXA 5JK4A 2R9JA 4PP0A 1LBBA 1YTVA 5JTYA 3OD7A 4ONYA 2DWJA 2ONKE 2ESNA 4JWXA 3CR9A 3FGSA 3LSFB 2P0SA 3O28A 5EHMA 1RYOA 4MH5A 4GFRA 4F3BA 3OELA 3CI8A 1M5FA 3V5AA 1TWYA 4OVJA 3ZKKA 4IO7A 4G77A 4JWYA 3CFLA 2HXWA 4QSDA 1N76A 3U92A 3TODA 1Y4TA 3SEUA 3WAFA 4MLQA 5I2NA 3UK4A 1H76A 3IOWA 3PPOA 5DT6A 1MXUA 2I0BA 4GVOA 4BDRA 2NVUB 5HPQA 1UTBA 2PVUA 3OO8A 4H5GA 2ZYNA 5I58B 2H4IA 1XC1A 2DWAA 3OEMA 4ESWA 2RC9A 1O63A 4R6HA 1JW1A 4TQUQ 1JETA 1I6AA 4JB7A 1FQFA 5ICQA 4G4PA 2XX9A 4LVQA 1MDQA 4JSDA 3U93A 4R75A 5L9MA 3U1OA 3K00A 2PMSA 5I57B 5AA4B 4QHQA 3R7XA 1GR2A 1VSOA 3GBAA 3PPQA 3TFLA 5TP9A 4C0RA 3H03A 4U4XA 3FXUA 1FQDA 1B05A 1JVYA 4G8HA 1HSJA 3OMBA 1ZMGA 4KHZE 2W7YA 2H9BA 1QULA 1FQBA 3DM0A 3DP6A 1FCKA 3EN3A 5DEXB 3WAEA 3UORA 4ESXA 2DXYA 3MBPA 3MVYA 5CI5A 1AMFA 4BDMA 1B7HA 5H8NA 1VE4A 4G68A 1SI1A 2O84X 4GOTA 4X48A 4KYSA 1MDP1 4RK9A 5H8FA 1POY1 4X1BA 1M5BA 3OOAA 3KEIA 2F36A 3OO9A 4NE4A 3RT6B 1Y3NA 1B32A 2DWIA 3QSLA 3H6UA 3Q26A 4GXSB 4NF5A 3PD8A 3K2DA 3TUSA 1B9JA 4NF4B 1UTHA 1B3GA 4KCDA 2XXUA 2XXIA 4F31B 1XS5A 2Y7IA 4OQOA 1OLAA 2XXTA 4EXLA 1PB8A 3MZ9A 1EU8A 1OVTA 2ABHA 4I62A 1B5IA 4NF8A 4OERA 1A55A 2XHDA 2F6GA 4P11A 2ZMBA 2XXVA 3UIFA 1Q35A 3TQLA 4AB6A 1P99A 1LCTA 1TT1A 2E0SA 4YAHX 1HSLA 1DTGA 1H44A 3OO6A 4BDLA 4PFWA 2RCAA 4N07A 2R71A 1SW5A 5JEIA 1MQGA 3H6WA 4NF6A 2GHBA 4JSOA 1B3FA 1OIBA 4ZE9A 1NFTA 3PD9A 3B6QA 3SEYA 3O29A 3K1PA 2F7BA 2NWJA 1B0LA 2F8DA 4QFKA 1FTKA 1N04A 4TLLB 4U4SA 3T93B 3C4MA 1A8EA 1H45A 3BFTA 3TTNA 4ELQA 2NOOA 3PV0E 3FVKA 3CRBA 2XXHA 3JV9A 3H3GA 1B46A 3CFZA 1EH3A 1MXWA 5FHNA 4FEBA 1R1NA 2RC8A 4KYEA 3RQTA 2O7IA 4ELRA 4DCYA 3A3CA 1MY0A 3B7DA 2OWSA 1QKAA 2ZNSA 3IR1A 1B4HA 3EHUA 1BTJA 2VHAA 3T9VA 3MC2A 4KCCA 4XIGQ 2XXQA 3TPAA 4XKQA 2F35A 3IO6A 4YB6A 2DYXA 3W9WA 2DXRA 5KCJA 4EUOA 4EF2A 5L8DA 3FV1A 4ZEIA 1MG1A 1LB9A 2OWTA 4ND9A 2QS4A 3GXAA 3LBSA 4H0WA 3MWBA 4F3GA 1TXFA 5L9OA 4QFOA 2KLFA 4F1VA 5I2KB 2ONSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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