4R2BA

Crystal structure of sugar transporter oant_3817 from ochrobactrum anthropi, target efi-510528, with bound glucose
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
395
structure length
395
Chain Sequence
MQDKQNVEVLHWWTAGGEAAALDVLKKDLEKKGISWTDMPVAGGGGTEAMTVLRARVTAGNAPTAVQMLGFDIRDWAEQGALGNLDEIANKEGWEKVIPAPLQEFAKYDGHWIAAPVNVHSTNWMWINKAALDKAGGKEPTNWDELIALLDKFKEQGITPIAHGGQPWQDATIFDAVVLSFGTDFYKKAFIDLDPETLGSDTMKQAFDRMTKLRSYVDDNFSGRDWNLASAMVIEGKAGLQFMGDWAKGEFVKAGKKPGEDFVCMRYPGTQGAITFNSDMFAMFKVSEDKVPAQLEMASAIESPTFQSAFNVVKGSAPARTDVPDTDFDACGKKAIADEKEASEKGTMLGSMAHGYANPAAVKNAIYDVVTRQFNGQLSSEDAVKELVSAVEGAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords Extracellular solute-binding protein family 1
publication title Crystal Structure of Glucose Transporter Oant_3817 from Ochrobactrum Anthropi, Target EFI-510528
rcsb
source organism Ochrobactrum anthropi
total genus 154
structure length 395
sequence length 395
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-08-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4r2bA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4r2bA02
4PETA 1OLCA 4WEDA 5I84A 4QHQA 1D4NA 2F7CA 3HPIA 3FJMA 4H8JA 2O7UA 1B1HA 2ALUA 3TYHA 4R75A 1I6AA 2IEEA 5H8NA 3IORA 5FTIA 5FHNA 1OVTA 1OIBA 4F22A 1IXCA 1PC3A 2V3QA 4NWDA 1QUIA 3D4GA 4ELRA 2Q8JA 3EF7A 4OFLA 3MAMA 3ZSFA 2F8DA 2M8CA 1JVYA 1GVCA 3TQLA 4F18A 1B7UA 5I56B 1AL3A 3LC8A 4GLIA 3VXBA 4KHZE 4KYSA 1Z7ME 4R2FA 4N6PA 4F39A 4IGRA 3H7MA 1JW4A 4Q5TA 3W15C 4H65A 1Y1ZA 3FASA 1BTJA 1NNPA 5CMMA 4NF4A 3UGWA 1N7WA 2XXRA 4THIA 2I49A 2V84A 2XXYA 3LSWA 4RNSA 3T9VA 4H5FA 1FQBA 5A5XA 2OK2A 1M5BA 2HXWA 4U4XA 5BUUA 3V5AA 1A40A 2RCAA 4POXA 3S9NC 1BP5A 3G3KA 4AB6A 4DZ1A 5CMCA 3O2AA 5JTYB 1USYH 2DWIA 2DWHA 1MM6A 3RGYA 1YCJA 4OZ9A 2Q89A 3KJTA 4EUOA 3C36A 2F35A 1SBPA 2UYFA 1B51A 3MP6A 4JB7A 3GBAA 4UA8A 2OZZA 5L9MA 1IXGA 3PU5A 3VVFA 2XD2A 4ZZEA 1R9QA 4NF8A 4ZS9A 1QUKA 4P11A 3SERA 1XVYA 2ESNA 2ZNSA 3T9UA 2QS4A 1MQGA 2HAVA 1MH4A 2R71A 1O64A 4LQ5A 3PMVA 3DP4A 3DP8A 1B52A 5ITPA 1QULA 4FATA 1BKAA 3VLVA 3FXQA 4AQ4A 4C1UA 5H8HB 2Y84A 3TODA 3MVXA 3V83A 1UTBB 5H8QB 4OEUA 3TCGA 3OO8A 1JQFA 1VR5A 3JV9A 4RXLA 2HEUA 1SW5A 3BFTA 4MF3A 5DYHA 2QMXA 2DVZA 3K01A 1CB6A 1WVJA 4U2RA 2O51A 2DXYA 5L8DA 1JW1A 5I2NB 4G8HA 1B40A 1S9TA 3PPOA 1B9JA 4BDQA 3FXUA 3A09A 1MQJA 4U22A 1FTLA 5HM4B 4F2OA 3UA8A 4BDMA 4KYDA 2THIA 3DP6A 2R6GE 4DE8A 3IR1A 2CZLA 3B6TA 2XX8A 5AA4B 1B46A 1POTA 4YKKA 2NOOA 2XXXA 2DSFA 3IOWA 4TLLB 1FTKA 1MRPA 3RT8A 3FV2A 1MPBA 1N76A 2BJJX 1SI0A 4TQUQ 3CFZA 3DLNA 1GV8A 4PE5B 2H99A 1NH7A 4DCXA 4WEPA 1B0HA 4NEDA 5HBCA 3IL1B 1HSEA 3CVGA 4AB5A 3O28A 2XHDA 1DOTA 5DEXA 1URGA 2IA4A 1XC1A 3RN8A 3ZKLA 4F3SA 1SI1A 2VHAA 1PDAA 5KDTB 2DXRA 2CMOA 3N6TA 4F2QA 3JZJA 1TT1A 3S9MC 2E1SA 4R9FA 1LBCA 1J1NA 2OWTA 3EHTA 4DXCA 3PD8A 4JSDA 5AA3A 4KPTA 3E3KA 4LZ5A 3TMGA 4H6DA 1MDQA 2XXIA 3RTFB 4OMBA 4IB2A 3FVNA 4QSCA 3UORA 1Q35A 4XKRA 1Y1MA 1GGGA 4JWOA 1XOCA 1FQCA 3TTKA 3A3CA 3S9LC 2P2AA 4XXUA 1LBBA 1TXFA 4GF8A 5CRYA 4GD5A 4YMBA 5CBSA 1IXHA 4MBPA 4KFQA 1ZTYA 3EN3A 4BDLA 5HPQA 1AOVA 1IQ7A 1NFTA 3VFJA 2D5WA 3MBPA 4IY6A 4NTLA 3EQ1A 3QAXA 1SW1A 3S2VA 4EF2A 4IO6A 1N7XA 4LONB 1VE4A 4KI0E 5KCJA 3RTWB 1ZKBA 1B3FA 5AE4A 3KSJA 3TTNA 4G77A 5DVFA 1H3DA 4YKPA 3PGFA 4OTEA 1US4A 3HHFA 2GHAA 4RPNA 1II5A 3QXMA 3KSXA 3PV0E 3ILTB 3TQWA 1I69A 2O69A 1B7ZA 4ONYA 4QFPA 1OVBA 3LSXA 2Z23A 3KFMA 3K6VA 4ZE9A 4ISUA 3PUZE 2F7BA 5EHSA 3ECRA 4X48A 4G68A 2V3TA 1Z7NE 2DQVA 3MJNA 1GTKA 1ANFA 2VGQA 4OXVA 3G3HA 2I3WA 3H6TA 2YLNA 1B05A 5I57A 1B5IA 4NF4B 4G4PA 1A8FA 2W7YA 2Q88A 3KEIA 3SDFA 3JYRA 3C35A 2Q9TA 1UIUA 3ZKKA 4R74A 1EZOA 5H8FB 1B32A 2I0BA 3VE1B 1ELJA 3ZS6A 3FJ7A 2NWJA 1IIWA 1NNFA 4U1OA 3PUYE 5J1DA 2XXTA 3H6WA 1B3EA 1P1QA 1AIVA 5I58A 3PUWE 1JETA 1MXWA 3PD9A 1B0LA 4FAJA 2HZKA 1XS5A 2PVUA 4YB6A 1JNFA 4XKPA 4F3BA 3V89B 2F97A 4IGTA 1YTVA 3HHGA 4F31B 5TPAA 4ZEBA 5EHMA 3H03A 4GXSB 1B5JA 3C32A 4GRKA 4TLMB 2A5TA 3SEWA 2UYEA 3M3LA 4U1ZA 4YAHX 4I9DA 4ELQA 4LVQA 1LAHE 5ITOA 3FV1A 1RKMA 2DE3A 1NNKA 3U94A 1VSOA 2DWJA 4F3PA 2F78A 4JSOA 1JEUA 5FHOA 5I59A 2GFEA 2ZMBA 3IOUA 3TTMA 4EXKA 3DELB 4KCCA 3FXRA 2HAUA 2HFBA 3C9HA 4LZ7A 4OHNA 4EQBA 2YJPA 2G29A 4Q0CA 2AIXA 3CR9A 1URDA 2H5YA 2VD3A 4OERA 4IY5A 3U8QA 1QKAA 3TZAA 1M5EA 2X7QA 3RT6B 4RK2A 2X26A 2V25A 1LGBC 3KOTA 4OWDA 4G8MA 4ZEDA 1MQDA 4QSDA 5AA1A 5ICQA 2O68A 5I2KB 4GQOA 3Q28A 4R72A 2ZXTA 5L9OA 2GH9A 3N94A 1ZU0A 2Q2CA 2O7IA 5TP9A 2A5SA 2PT2A 3E4RA 1YAEA 3N5LA 1FQAA 1O63A 2XXUA 3N26A 1B58A 2P1SA 2V93A 4IO5A 4MLQA 3OO7A 2OBGA 1QJMA 4GWOA 1DPEA 5DEXB 4PQJA 3IO6A 3G3GA 1LAGE 4WXJA 1MQHA 4GL0A 3VVDA 4NF6A 1Y4CA 4XKQA 5AA2A 1B4ZA 3LUYA 1H43A 3RNNA 4GFRA 4EQ9A 4BLAA 5DVIA 4Z7EA 3FVGA 2DE2A 2NUVA 4DXBA 4YKIA 3MUQA 4YMAA 4NF5B 3QUJA 1LCFA 3B7DA 4MFIA 1MY1A 4YB5A 3PMXA 3RY3A 1H44A 1MY3A 4N13A 3K1PA 1MS7A 2Y7RA 5CBRA 3OD7A 3Q25A 3CI8A 4FECA 2XX7A 2GHBA 4M1VA 2QS2A 2F7AA 2ZYNA 3T22A 1OQHA 3SETA 4MH5A 3I3VA 1MY0A 3ILUB 3U72A 1IZ1A 3KG2A 3N6UA 4YZZA 2DS9A 4F29A 1SQYA 2FYIA 4KR5A 3G3JA 3HN0A 3RUMA 1MG1A 3FZVA 3G7WA 4QRZA 2H4IA 1IITA 5ELVA 3VXCA 5KCJB 3D4CA 3IJXB 3I6VA 3MP8A 5M2VA 4DDDA 2QRYA 2AL4A 4GL8A 1A7LA 1QUJA 1US5A 4OYVA 4PFYA 5ICTA 5CM6A 3TELA 1GR2A 5CMBA 1FTJA 4N07A 3WAFA 3TTRA 4RJZA 1N3WA 2QS1A 3H4ZA 3KOSA 1MY2A 3C31A 4EXLA 5JTYA 2O84X 3SEXA 4H67A 2P0SA 3Q27A 4L17A 5F1QA 3OSRA 2RC8A 4U23A 3K02A 3UN6A 3G3FA 4TOZA 1SYIA 3PPRA 1EZPA 2I0CA 2WKYA 2X7PA 4QFNA 5TU0A 1LB8A 4F19A 1TWYA 3KN3A 2YPNA 3LSFB 2XX9A 1P1NA 1SYHA 5LOMA 1NKXA 4KQPA 2QJEA 4F1VA 4RPOA 3CSGA 4DXUA 1DTZA 1A8EA 3HSTA 1N0TA 1UIVA 5I58B 1FQEA 2Z22A 4LZ8A 1RYOA 3H3GA 3BKIB 3TTLA 4OENA 1VFDA 2AYSA 2Q2AA 3O66A 2Y7WA 1B3HA 3IB0A 3Q26A 5H8HA 4R9GA 3T9XB 2VD2A 3TFLA 3K1MA 2I4CA 4X1DA 1R1NA 3T96B 1I6BA 3MZ1A 1IXIA 2HCAA 4E0WA 1NNTA 4ELOA 5I2NA 3IB1A 3F11A 3L6HA 4KD5A 4WKMA 3CFLA 3M3KA 1UTHA 2E0SA 1BIYA 1SW4A 5DTBA 4LATA 1PBQA 4C1TA 1FTOA 4NMYA 4OESA 1UQWA 3K2DA 2OJTA 4GVOA 3OOAA 5H8NB 1B1XA 2OWSA 3FATA 1HSLA 5I59B 2D21A 2PMSA 1JVXA 1LB9A 1RYXA 3IJOB 2ABHA 5B7DA 2XXWA 3CIJA 1PB8A 1MXVA 5CI5A 3IAZA 1QKBA 1MXXA 4LUBA 4R2BA 4FEBA 1IEJA 2PBWA 1ZMGA 4YU0A 1WDNA 2B65A 5KZTA 4ZEIA 1LCTA 1NMUA 3MWBA 3K00A 2RCBA 1ATGA 2VP1A 2PYYA 2V3UA 1CE2A 4KCDA 1B6HA 1PBPA 1Y3PA 3TAJA 2KLFA 4NE4A 4HTGA 5A5XB 3IX1A 3UK4A 3TUSA 5CMKA 1DSNA 3W9VA 1DTGA 5K2XA 4MLVA 5K2YA 5JK4A 3E13X 2OCUA 3B6WA 3R26A 2F36A 3QUFA 2ZNUA 4IO3A 1PB7A 3FVKA 3CSBA 1ZJLA 1DMBA 1P1UA 3K0VA 5DVJA 4K3FA 1TFDA 2REJA 4NF6B 1A55A 5AA2B 1MPDA 4X1BA 2ONRA 3A3UA 3LBSA 4NF8B 1MDP1 4GOTA 4IO4A 3OELA 5IKBA 1B4HA 1EH3A 4UACA 4IO2A 3KZGA 4RYAA 2B3FA 2DWAA 1H76A 1FTMA 3TEPA 3HV1A 1MQIA 4O3AA 3S4UA 3MC2A 4YICA 3VVEA 2FNCA 2LAOA 3T66A 1B5HA 2XXHA 2H25A 3C33A 1YPNA 4PP0A 4DIGA 3C4MA 1L5TA 2I48A 2PX1A 3UIFA 3LR1A 2RF1A 2UVJA 1N84A 5H8SA 3RQTA 3FIRA 1MXUA 3PUVE 4H1XA 4FORA 5F7VA 3U92A 1S50A 3MVWA 1NH8A 3IO4A 3KN7A 3E9XA 4F3GA 1DPPA 2HZLA 2UVIA 3S9EA 3FGSA 4OFOA 5BWJA 4PFTA 3UP9A 4DLDA 2Y7IA 2QSXA 4RA1A 2Y7PA 3SEYA 4PFWA 4ESWA 2Y7KA 4G68C 1R9LA 3QK6A 3GZGA 1EU8A 2DVCA 3VDFA 5H8FA 4M4GA 3T9HB 2REGA 2QPQA 3CG1A 3T93B 2DP8A 4Z0IA 5ISUA 4ESXA 4Q30B 1LAXA 4OETA 5AA2D 4OEVA 3O9PA 1D9VA 1MXZA 1XVXA 4O3CA 1AMFA 2H9BA 5IAIA 3TDJA 4HCYA 4BDOA 1BLFA 4GIZA 4P0GA 4ZEFA 3MVYA 4R6HA 2O6AA 3G3IA 2ZYMA 3IOVA 4X9TA 4U4SA 2F5XA 1FCKA 5FHMA 3VV5A 3B6QA 3PPNA 4R6KA 5EYFA 4HS7A 1O7TA 3M8UA 1SD3A 1Y4TA 3MW0A 4OQOA 3O29A 2Z8FA 2F6GA 5DT6A 4BDRA 2ZNTA 2D3IA 4C0RA 4PFUA 4OFJA 3L6GA 3TKDA 3V8XB 3HCQA 2RC9A 5CC2A 3SKPA 3MZBA 2QL3A 1P1WA 4FE8A 4I62A 3U1OA 2UVHA 3TPAA 2PT1A 3MQ9A 1SVXB 4OVJA 2FA7A 3VLUA 3DM0A 4XTCQ 3OO6A 3H6VA 3KN8A 1UTHB 2ONSA 2ZYOA 3OEKA 5I56A 3C34A 1ZLQA 4LP2B 2I3VA 4JXIA 2DYXA 1LFGA 3PPPA 3THIA 1H45A 3EHSA 3R7XA 3ONMA 3K4UA 3MZ9A 1Y3QA 3SEUA 3K1NA 2XD3A 1SW2A 2ANJA 3TCFA 4IO7A 5I2KA 5JEIA 3USDA 2F6PA 4JWXA 4ZECA 3MVZA 4XKNA 2UVGA 1SDXA 4YKJA 4ND9A 3FUZA 2RKMA 1VFEA 4G68B 2AL5A 1N3XA 3H6UA 4QSEA 2ZYKA 2B3BA 1B3GA 1XT8A 3OO9A 4KYEA 5I57B 1MPCA 1T0KA 1A99A 3FJGA 3CG3A 1MM7A 1MY4A 4EQ7A 2GRVA 1LAFE 3MPLA 2QMWA 1OMPA 1D9YA 3U93A 1MH3A 3BFUA 4GXAA 4LQ2A 4YB7A 4JBZA 2XXPA 2O1MA 1FQDA 4QF9A 2DOJA 1N04A 2RC7A 4NF5A 3AXFA 3K6XA 3IB2A 4POWA 4ECFA 2Z8EA 1M5DA 3O6IA 1HSJA 5TPAB 1UTBA 5H8QA 2NVUB 4G2ZA 5L9SA 3KGCA 1XHYA 1LFIA 1TFAA 2UXAA 3VLWA 1S7YA 3M3FA 4ZZAA 1Q1KA 1OLAA 2QS3A 4QFKA 2I4BA 2A5TB 4QFLA 3IK6B 4RY1A 4F1UA 4FJPA 1MXYA 1I6QA 3R6UA 3MP1A 2HQ0A 4ZDMA 2I58A 4O3BA 1JW5A 1FQFA 1USYE 4I8CA 3OMBA 2G93A 1QVSA 4EF1A 3RLFE 1PEBA 3PMWA 5AA4A 1M5CA 5FTHA 4I1DA 3IOTA 3GBBA 3GLBA 1R6ZA 3QIMA 4ZE8A 1ZIUA 1M5FA 3SEVA 4ZEKA 3RPWA 3H06B 1F9BA 4F1YA 4H0WA 1URSA 3TCHA 3BBRA 1WODA 4QFOA 1FW0A 4BDNA 4EDPA 3Q29A 3WAEA 3O6HA 1POY1 2RINA 4E0XA 4G8NA 1KWHA 1P1OA 3QSLA 3FVOA 3CFXA 4Q8RA 1P99A 1B2HA 3SESA 1Y9UA 1OQGA 3FD3A 1IUDA 3QYTA 4P0IA 2H98A 1EZ9A 5KDTA 4ELPA 3OEMA 1LLSA 4FEDA 5B70A 5TP9B 3ODBA 1QW0A 4JWYA 2Z8DA 3EHUA 3I5OA 1LSTA 3KBRA 4JDFA 3P7IA 1Y3NA 2DE4A 1AH5A 4U21A 1A54A 4RK9A 4HW8A 4R73A 3O97A 1NL5A 2R9JA 1JEVA 3CRBA 3K6WA 4LA9A 2ONKE 3O6GA 3MPKA 3PPQA 3K6UA 3HO7A 2NXOA 3W9WA 2O1LA 3OENA 2XXVA 2I6EA 3PUXE 1PB9A 3OSQA 1Y20A 3GXAA 4H8IA 4H5GA 4XIGQ 2OLBA 3KJ7A 4HCWA 1ZBMA 3OXNA 4NWCA 4R6YA 2F34A 2VOZA 1B7HA 1LFHA 3EPEA 1B3LA 4FIMA 1D3KA 4DCYA 3LSLA 2XXQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PETA 3GYYA 1OLCA 4WEDA 5I84A 4QHQA 1D4NA 2F7CA 4MAGA 3HPIA 3FJMA 4H8JA 2O7UA 1B1HA 2ALUA 4GX4A 3TYHA 2VT5A 3PTYA 4R75A 1I6AA 2IEEA 5H8NA 3IORA 5FTIA 5FHNA 1OVTA 1OIBA 4F22A 1IXCA 1PC3A 2V3QA 4NWDA 1QUIA 4JVDA 3D4GA 1FBHA 4ELRA 1NV1A 3EF7A 2Q8JA 4OFLA 1BK4A 4G61A 3MAMA 3ZSFA 4O7MA 2F8DA 2M8CA 1JVYA 1GVCA 3TQLA 4F18A 1B7UA 5I56B 1AL3A 3LC8A 4GLIA 3VXBA 4KHZE 4KYSA 1Z7ME 4R2FA 4N6PA 4F39A 4H45A 4IGRA 3H7MA 1JW4A 4Q5TA 3W15C 4H65A 1Y1ZA 3FASA 1BTJA 1NNPA 5DW8A 5CMMA 4NF4A 3UGWA 1N7WA 2XXRA 4THIA 2I49A 2V84A 2XXYA 3LSWA 4OVRA 4RNSA 3T9VA 4H5FA 1FQBA 5A5XA 2OK2A 1M5BA 2HXWA 4U4XA 4XEQA 5BUUA 3V5AA 1A40A 2RCAA 4POXA 3S9NC 1FPIA 1BP5A 3G3KA 4AB6A 4DZ1A 5CMCA 3O2AA 5I3SA 4GWZA 5JTYB 1IMFA 4N81A 1USYH 1NUYA 2DWIA 2DWHA 1MM6A 3RGYA 1YCJA 4N91A 4OZ9A 2Q89A 2CZKA 3KJTA 4EUOA 3C36A 2F35A 1SBPA 2UYFA 1RDXA 1B51A 3MP6A 4JB7A 2DDKA 3GBAA 4UA8A 2OZZA 5L9MA 1IXGA 3PU5A 3VVFA 2XD2A 4ZZEA 1R9QA 4NF8A 4ZS9A 1FPKA 1QUKA 4P11A 3SERA 1XVYA 2ESNA 2ZNSA 3T9UA 4GWXA 1FJ9A 2QS4A 1MQGA 2HAVA 1MH4A 2R71A 3CHGA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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