5B70A

Oxyr2 e204g regulatory domain from vibrio vulnificus
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
219
structure length
209
Chain Sequence
GAMMQGQLKLGCIPTIAPFLLCDLVQEINQRFPQLNLLLREDTTTNLLTALRHGELDVLILALPVEIDGMESRVVGQDPFKMVISRHQAGAIKVPIKYDDLPDESVFLLEKGHCLTEHAVSACKLTDKEKINPFSATSLHTLVQMVANGLGTTFIPQMAIDHGLLDNQNLVVIEPPGQQAYRDIGLVWRPSSSRSKTFNQLAEVVSELL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription
source organism Vibrio vulnificus
publication title The hydrogen peroxide hypersensitivity of OxyR2 in Vibrio vulnificus depends on conformational constraints
pubmed doi rcsb
molecule keywords LysR family transcriptional regulator
total genus 58
structure length 209
sequence length 219
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5b70A01
1WODA 4DIGA 3G3IA 3GBBA 4FE8A 2ZYMA 2GH9A 2ONRA 1FW0A 3O6GA 5J1DA 1YCJA 3EPEA 1BP5A 3JYRA 2DWIA 1YTVA 3PUVE 4DCXA 1B5JA 3UA8A 1US4A 3CRBA 1J1NA 1FQCA 2ZNUA 3C34A 3LSXA 3EF7A 1JEVA 2RCAA 4DE8A 4ESWA 1NKXA 4Z7EA 2AL4A 5I59B 4RPNA 2I3WA 3V83A 3VDFA 3H06B 2OK2A 3K6XA 4H1XA 4KPTA 1NMUA 4R6KA 5CM6A 4Q5TA 3A3CA 4KYSA 2I6EA 2I0CA 4N13A 5EHMA 3OD7A 3MJNA 2R6GE 3VLVA 1N04A 1USYE 5KDTB 3FXRA 4DXBA 4NF6A 4F3GA 4HCWA 4H0WA 1AOVA 4OXVA 5CBRA 5JTYA 3IJXB 4EDPA 2QSXA 1S50A 2DS9A 4KCCA 4JWOA 3O2AA 2V3QA 3TFLA 1GGGA 2PT2A 1IXGA 2VD2A 2I49A 3OOAA 2V93A 2V84A 1LCTA 3TZAA 2YJPA 4NWDA 3TCGA 1B52A 3S4UA 3CSBA 4N6PA 1LB8A 4LONB 4NF5A 3R7XA 1FTJA 1N76A 2QS2A 1MS7A 1P1NA 1XT8A 2F78A 3RY3A 2H98A 3K4UA 4GOTA 4IO3A 3IORA 4ESXA 2QPQA 1F9BA 1B7HA 2DOJA 4OEVA 3HSTA 1N7WA 3FVKA 2V3TA 3MP8A 2QS1A 2M8CA 2H99A 5CMKA 4IO5A 4EQBA 4QSCA 1UTHA 4KCDA 3DP8A 1DPEA 1A7LA 1SW4A 1I6QA 2GRVA 2PVUA 1OQGA 3U1OA 1B4ZA 4RK9A 3LBSA 3KOTA 3KSJA 2X7QA 4OENA 5KZTA 1DTZA 1PEBA 4YB5A 4LZ7A 1MXUA 3EHTA 2DP8A 3MBPA 4G8NA 3FVGA 1LCFA 4FIMA 3T9HB 5AA2B 3K6UA 3VE1B 2GFEA 1M5CA 3D4CA 3H7MA 1P1QA 4OZ9A 4FECA 1BIYA 3R26A 2QMWA 2P1SA 3RGYA 4F39A 1SYIA 3FGSA 1JW1A 1XHYA 3W9WA 1ZJLA 2VHAA 2DE4A 1IEJA 4ECFA 4BDOA 3O6HA 2HEUA 1S7YA 4JXIA 4YAHX 1GV8A 2XXIA 4YMAA 4NEDA 4NTLA 2QL3A 1JEUA 4X1DA 4EF1A 3IX1A 1KWHA 1VFEA 3VVEA 1MQHA 4O3AA 2F7CA 3C36A 4N07A 3ZS6A 1MH4A 1VSOA 1B51A 4M4GA 4YMBA 1PB9A 4QSEA 4XXUA 2B3FA 5TPAA 2F6PA 5CMBA 3ILTB 1PBPA 1B3EA 4FJPA 2Y84A 1YPNA 1D3KA 3QIMA 4IB2A 1A8FA 4PFYA 4ELRA 4QSDA 3GBAA 4LA9A 1LAXA 2HCAA 1BKAA 1VR5A 2F35A 1FQBA 2HAVA 4U22A 1MQIA 4KD5A 1M5DA 5KCJB 3HO7A 3M3FA 3D4GA 1B0LA 3KSXA 2VGQA 1MQJA 3H6UA 1GR2A 1B32A 4F2QA 1LFIA 3QUJA 2FYIA 2HXWA 1LGBC 3ILUB 4ZDMA 4JDFA 3U94A 4EXKA 1B7ZA 2Y7WA 4QFPA 2G93A 3RTWB 4G68A 4LVQA 1B7UA 3UN6A 4ZZEA 1MQGA 2O6AA 1BTJA 1IUDA 1IXHA 1MY4A 3Q26A 4KHZE 4XIGQ 3OENA 4XKRA 3FJMA 4G2ZA 5TP9B 4MF3A 4IY5A 2I4BA 4X9TA 5IKBA 3K6VA 3TTLA 3B6WA 3OO6A 4OYVA 3K0VA 1TFAA 5H8FA 5I56B 2VD3A 4EF2A 4P0IA 4YKKA 3SERA 3MPKA 4RPOA 4DXCA 4ELOA 4ISUA 1NFTA 3TTKA 1B1XA 1M5BA 1ZTYA 1LBCA 2DQVA 4RXLA 3TTRA 5ICQA 5I2NB 2NUVA 1N84A 4H8IA 3MWBA 1URGA 2DVCA 4F3SA 3E3KA 3RTFB 3R6UA 3PMVA 4H5FA 3MW0A 2R71A 4JB7A 3KN8A 2HQ0A 3M8UA 2OJTA 3JV9A 5ITPA 1A40A 1AH5A 5B7DA 3G3GA 4F2OA 3CG3A 1ELJA 5H8NB 3CIJA 4ELPA 2UXAA 5FHMA 3K2DA 5H8HA 1QKBA 2DE3A 3CI8A 4LP2B 2QS3A 4ZEDA 5ISUA 4IY6A 5JEIA 4RNSA 4R6YA 5I2KA 4QHQA 4DZ1A 4X48A 4E0WA 4JSDA 2VP1A 1NL5A 1FTKA 1A55A 2AIXA 4YZZA 3C9HA 1FTOA 1QUJA 4R73A 3G3KA 3UORA 3DP4A 5A5XA 3TCFA 5AA4A 2RF1A 3MVZA 4LQ2A 3S9MC 3FIRA 1ANFA 1VFDA 1H3DA 4MBPA 3TUSA 3KN7A 3B6TA 4Z0IA 1TWYA 2Z8DA 4U21A 2CZLA 2QMXA 3TDJA 1MG1A 2I3VA 1H76A 1WDNA 4G8HA 4QFNA 4F1UA 3TQLA 1OVTA 5TU0A 2XHDA 4F3PA 5I58A 1B6HA 4YB7A 5FHOA 3TYHA 4RY1A 2XXTA 3FVNA 5CI5A 5I84A 3ZSFA 1MY1A 3FD3A 4NF8A 2UVGA 3S2VA 3OEKA 2O1LA 1IXCA 3UIFA 3SKPA 1B46A 1FQAA 1MXZA 1QW0A 3N26A 2KLFA 2THIA 3OEMA 4R72A 1SYHA 2XXQA 1JVYA 3TKDA 3SEUA 5AA3A 4XKPA 1UQWA 3LSFB 1PC3A 3TELA 3DP6A 2V25A 4H67A 3MP6A 3SEWA 3B6QA 5DVFA 3FXQA 2I4CA 2E0SA 1RYOA 4RK2A 2XXVA 1B05A 1QVSA 2F5XA 2R9JA 4YKIA 1LSTA 1UIVA 1UTBA 2F34A 5H8QB 4QFLA 3EHSA 1D9VA 3FJ7A 2I48A 4EUOA 5AE4A 2UYEA 3HN0A 3CSGA 2Y7RA 3MVWA 1FQFA 4P0GA 3U72A 4OVJA 2FA7A 4IO6A 3I5OA 3PPOA 2Q89A 1H44A 3SEYA 3ZKLA 3UK4A 1Z7NE 1B3FA 4R9GA 3IOTA 1JNFA 3K00A 1SI0A 2ZMBA 3VXCA 1TXFA 2REJA 1RYXA 3C4MA 2AL5A 3RUMA 4X1BA 4OMBA 1EU8A 4DCYA 4I62A 1SBPA 3VVDA 5CBSA 4TLMB 1XVYA 3RN8A 4NF6B 1UIUA 5CC2A 4KQPA 5HPQA 1Y1MA 4ONYA 3OXNA 3MQ9A 2Z8FA 4F1YA 1Y20A 5JTYB 3M3KA 3H6VA 4U2RA 1QULA 4U4XA 1IZ1A 3O97A 3CFZA 4GVOA 4MLQA 2GHBA 1MDQA 1TT1A 3FASA 3TTNA 2F7AA 4JBZA 4R75A 1MDP1 1TFDA 1URDA 5DEXA 1R9LA 2O68A 2O51A 4NF5B 2NWJA 3EN3A 1A99A 3W9VA 1IIWA 1EZ9A 1QJMA 1JETA 1US5A 1I6BA 4ZEBA 3BFUA 1ZBMA 2F8DA 4Q30B 4DXUA 4GWOA 2H25A 5KCJA 5JK4A 1MPDA 3KG2A 2A5TA 4QFKA 1R6ZA 5F7VA 2XXHA 3G3JA 4OHNA 1N0TA 2RC7A 5I57A 1I69A 1XOCA 1N3XA 2QRYA 1AIVA 1XS5A 1DMBA 2HAUA 4K3FA 3IB0A 1UTHB 1Y4TA 3TODA 1B3LA 1O7TA 3Q28A 3G7WA 4YKPA 1MY3A 1D9YA 4F3BA 2UVJA 4YU0A 2Q2CA 3RPWA 2NVUB 3Q27A 3CR9A 3IR1A 1B9JA 1FTLA 2XD2A 4GL0A 3SETA 1ZU0A 3MZBA 3ODBA 1P99A 1HSEA 1EZOA 1B58A 5CRYA 3MVXA 1MY0A 1DTGA 3KJ7A 3EHUA 3JZJA 2PX1A 2HFBA 3GXAA 4GRKA 2ONKE 4YKJA 1Y3PA 5CMCA 1JW5A 2W7YA 2XXXA 2XXWA 3FVOA 4WEDA 3GLBA 4ZEIA 4LQ5A 3TCHA 3FATA 4G4PA 4GFRA 1P1OA 1ZMGA 3PUXE 2UVHA 4FATA 1MQDA 3LSWA 2XD3A 1GTKA 1Q1KA 3MVYA 4HTGA 3AXFA 3VVFA 2H5YA 1B40A 3FV2A 5B70A 4R2FA 3T9UA 3TQWA 1IXIA 1SDXA 4NE4A 1FQDA 3O28A 5TPAB 4U1OA 2XXUA 3VLWA 4THIA 4LZ8A 4OWDA 5L9MA 2O84X 3K1MA 3C35A 4F19A 3RNNA 4F18A 1NNPA 1BLFA 3I6VA 2F97A 2ALUA 4G77A 2Y7IA 1B3GA 2NOOA 2DWHA 3WAFA 4UA8A 1NNKA 4LZ5A 4L17A 2DXYA 1URSA 1MM7A 4GQOA 4BLAA 2IA4A 4DDDA 3CG1A 4PP0A 3IO6A 1AMFA 2DSFA 3MP1A 4R9FA 4G68C 2O1MA 4NF4A 1IITA 1LLSA 2XXPA 2HZKA 3G3HA 3CFLA 1M5EA 5BWJA 4G68B 2I0BA 3OMBA 1PDAA 5FTIA 3C32A 2Z8EA 2RKMA 3LSLA 3H4ZA 5L9OA 4IO7A 5H8FB 3MUQA 1JW4A 3ZKKA 2ZYOA 2BJJX 2PYYA 4GL8A 2I58A 4UACA 1B4HA 4F31B 2UVIA 4R74A 2DE2A 2X26A 3QUFA 1II5A 4KFQA 4C1TA 2XX7A 4IO2A 1CB6A 4LUBA 2DWJA 3SESA 3MC2A 3KN3A 2QS4A 1LFHA 5I59A 4OERA 3EQ1A 1MRPA 1VE4A 1POTA 3PUWE 3FJGA 4GXSB 1H43A 1Y3NA 5H8HB 3K1NA 2ZNSA 1NH8A 3KBRA 3KFMA 4I1DA 3U8QA 1P1UA 3PMXA 4ZEKA 3BBRA 4O3BA 4H6DA 2ANJA 5KDTA 1DSNA 2B65A 5I2KB 4QFOA 2FNCA 3IAZA 4XTCQ 3B7DA 1ZLQA 2B3BA 3M3LA 3K02A 4KI0E 4WXJA 1HSJA 3OELA 2XXRA 3V8XB 2O69A 3OO9A 1MH3A 3UP9A 1LAFE 3DELB 2CMOA 1N7XA 2XX9A 4ZEFA 1QKAA 2ZYKA 1L5TA 1O63A 4PETA 1SW1A 4GF8A 1XVXA 5DVJA 3N5LA 3TEPA 3PMWA 4HCYA 1EH3A 5A5XB 2WKYA 3Q29A 4POXA 1HSLA 1SW5A 5AA4B 3QK6A 4Q8RA 4HS7A 1OMPA 4GXAA 1NH7A 3TAJA 1ATGA 2Y7KA 2G29A 3DM0A 2P2AA 1OQHA 4G8MA 4I8CA 3THIA 2OLBA 2F6GA 4WEPA 4ZE8A 1MXVA 2PT1A 3FXUA 4C1UA 2A5SA 1LFGA 3VV5A 4OTEA 5I58B 3T66A 3FUZA 5AA1A 3V5AA 1SD3A 2ZNTA 1NNFA 4KYDA 2YLNA 3TMGA 4TOZA 4TQUQ 3IL1B 2Z22A 4NF8B 4IGRA 4EXLA 4U23A 1RKMA 2Q8JA 3A3UA 3TTMA 1SI1A 4ND9A 3IB2A 1A8EA 1QUKA 2E1SA 4PE5B 5CMMA 1MXWA 3N94A 5L8DA 3QYTA 3O29A 5ICTA 3MZ1A 4XKNA 4QRZA 5AA2A 3GZGA 2OWTA 3S9EA 3LUYA 4R6HA 1OVBA 2ZYNA 3IK6B 5DYHA 5ELVA 3HPIA 3LC8A 1NNTA 4O3CA 2D21A 3CVGA 1CE2A 3H6TA 5M2VA 3VLUA 1I6AA 1R1NA 1FCKA 4FEDA 2ABHA 1LB9A 2GHAA 3KOSA 2V3UA 4RJZA 1B5HA 3PD8A 4DLDA 3HHFA 1YAEA 1B1HA 4E0XA 3QAXA 2PBWA 5DT6A 2D3IA 1SW2A 1OIBA 3L6GA 4RYAA 1DPPA 4OETA 1UTBB 1H45A 3L6HA 4H5GA 1MM6A 4PQJA 4AB6A 4AQ4A 4ZZAA 1O64A 2NXOA 2RC9A 4H65A 2IEEA 3IOUA 4MFIA 3OO8A 4OFOA 4M1VA 4GIZA 2DYXA 3PPRA 5DTBA 5HBCA 4BDLA 3HV1A 3VXBA 3O6IA 3OSQA 1SVXB 2OZZA 1JQFA 1D4NA 3KZGA 5L9SA 5H8SA 4BDMA 2X7PA 1GVCA 2RINA 1SQYA 4BDNA 3T22A 2DWAA 4P11A 3UGWA 3U92A 5DVIA 1A54A 1WVJA 1PBQA 3HCQA 5TP9A 3H6WA 1B0HA 3SDFA 1MY2A 3N6TA 5I56A 2QJEA 3T9VA 3P7IA 4NWCA 1XC1A 3T9XB 2AYSA 3OO7A 1OLAA 4PFWA 2PMSA 1MPBA 1P1WA 1Y3QA 4PFUA 5I2NA 5DEXB 4QF9A 3QXMA 1OLCA 3OSRA 1AL3A 4LATA 4ZECA 3C33A 5FTHA 1ZKBA 3W15C 2F7BA 3WAEA 4EQ7A 5BUUA 4C0RA 2DVZA 1IQ7A 3SEXA 3RLFE 1PB7A 1FTMA 4GLIA 4HW8A 5H8NA 3ONMA 2A5TB 3TPAA 4JWYA 2F36A 4IO4A 2LAOA 4OESA 1LBBA 4JWXA 5I57B 1R9QA 2YPNA 3MPLA 1MXYA 3V89B 4OQOA 1Z7ME 3PU5A 3BKIB 2OWSA 4OFJA 3T93B 4BDRA 2O7UA 2UYFA 3IB1A 2Q9TA 2HZLA 1Y4CA 4BDQA 3H03A 3KJTA 2XXYA 4KYEA 3KEIA 5ITOA 3F11A 4OFLA 5K2XA 4TLLB 5HM4B 1M5FA 3E9XA 4ZS9A 3PPQA 3QSLA 4YICA 2D5WA 3O9PA 1JVXA 1QUIA 1N3WA 1S9TA 3N6UA 3SEVA 4KR5A 3T96B 3FV1A 1FQEA 1Q35A 1T0KA 2RCBA 1B3HA 5EYFA 3FZVA 2H4IA 4RA1A 4F1VA 3PV0E 2Q88A 3IOVA 5IAIA 4POWA 4F22A 3USDA 3K6WA 1Y1ZA 1POY1 5K2YA 4GD5A 4H8JA 4MH5A 2DXRA 4FORA 4OEUA 4YB6A 2Q2AA 3HHGA 1USYH 3RT6B 3A09A 2OBGA 2ONSA 3IOWA 5FHNA 5EHSA 1ZIUA 4I9DA 3C31A 3KGCA 2RC8A 1B2HA 5F1QA 2P0SA 3G3FA 3E13X 4XKQA 4WKMA 2ESNA 3VFJA 4AB5A 3MZ9A 2XX8A 3BFTA 3IJOB 4FAJA 3PUYE 3RT8A 3PPNA 4FEBA 1MPCA 3LR1A 2OCUA 3ECRA 1LAGE 2REGA 3PUZE 4U4SA 4R2BA 1Y9UA 4F29A 2Z23A 3H3GA 4PFTA 3U93A 5LOMA 1B5IA 4EQ9A 3I3VA 3PD9A 4MLVA 4ELQA 2H9BA 2O7IA 4Q0CA 2Y7PA 3K01A 4U1ZA 4ZE9A 3S9LC 3Q25A 1PB8A 3CFXA 3PPPA 4JSOA 3MAMA 1EZPA 1LAHE 4NF4B 4NMYA 1DOTA 3E4RA 1MXXA 5AA2D 3K1PA 3DLNA 3RQTA 2ZXTA 3IO4A 3O66A 2VOZA 4IGTA 3PGFA 5H8QA 3S9NC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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