4MH5A

Crystal structure of the kainate receptor gluk3 ligand binding domain in complex with (s)-glutamate
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
GTNRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGSGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, kainate 3
publication title Binding site and interlobe interactions of the ionotropic glutamate receptor GluK3 ligand binding domain revealed by high resolution crystal structure in complex with (S)-glutamate.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Receptor/agonist
total genus 80
structure length 256
sequence length 256
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-08-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4mh5A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4mh5A02
4LQ5A 1ZLQA 1PDAA 2CMOA 2FNCA 4R9FA 5AE4A 2NUVA 4IO6A 2QS3A 4BDRA 2XXYA 1NNPA 3K02A 4BDLA 3FD3A 1FQFA 3VFJA 3QAXA 3PD8A 3RN8A 4U22A 4OWDA 3IR1A 5H8HA 2Y7KA 3FZVA 4LA9A 3KN3A 1UIUA 3HSTA 1EZ9A 1NKXA 2UVIA 1LB8A 5AA1A 4LZ7A 4NF8B 3JV9A 5IKBA 3MUQA 2REGA 4DDDA 1MRPA 3H6UA 3O6GA 1Y9UA 3MQ9A 5CMKA 3PUVE 3Q29A 2VHAA 1Y3QA 1I6QA 3T22A 2PBWA 4KYDA 5HBCA 1LAXA 1URGA 1IUDA 3H4ZA 2D21A 3DP6A 4LATA 3VLVA 2F7AA 1POY1 4N07A 1SI1A 5ICTA 4RJZA 2NOOA 1GTKA 3TYHA 5KCJA 4F1YA 3O66A 4EF1A 3U72A 4RYAA 1B3EA 3TCFA 4G2ZA 1DOTA 3WAFA 1Z7ME 2ANJA 1H43A 1XT8A 2O7UA 1NH7A 3MP8A 2XXHA 1SW4A 4H0WA 1XOCA 1B6HA 2ZMBA 1ZKBA 4RA1A 2DOJA 3C35A 3V8XB 1B0HA 1M5DA 1NNTA 5H8NB 5DT6A 4BDNA 5BWJA 3MBPA 5L8DA 2RCBA 4DE8A 5KDTA 1MPCA 2PYYA 5FTHA 1MG1A 3AXFA 2BJJX 1B40A 1NFTA 1B1HA 2D3IA 1ZJLA 1R9QA 4FAJA 2HEUA 4U23A 2OK2A 3MAMA 2P1SA 3V83A 3K1PA 4GL8A 4NF6B 2LAOA 2R6GE 2Z8EA 4MF3A 4I8CA 2IEEA 5CMCA 3H06B 2XX9A 4JWYA 4FJPA 2X26A 3HPIA 2Q8JA 4F22A 4HW8A 5H8QA 3C9HA 5AA2D 3K0VA 5EHMA 1JW5A 3O6IA 4YU0A 4U4XA 2AIXA 4THIA 1USYE 2F6GA 4JSDA 3PGFA 3QIMA 4Q0CA 1QUKA 4OXVA 3TTNA 3R7XA 2KLFA 2PT1A 5F1QA 1Q1KA 1OMPA 2HCAA 3BKIB 4H8JA 5I2KA 4NTLA 3A09A 3FVKA 4GQOA 4PP0A 1MM7A 3KJ7A 5EHSA 2XXIA 4ELQA 3VXCA 2GFEA 3GXAA 1TXFA 1MDP1 3KSJA 1N3WA 1QJMA 2RF1A 4ZEFA 2F97A 2R71A 1HSJA 4DLDA 3RY3A 4JSOA 4C0RA 4PFTA 5DVIA 1M5BA 1RYOA 4NWCA 1RKMA 3FXRA 4TOZA 3IO6A 2G29A 3S9EA 2UVHA 4RNSA 4FATA 3KZGA 2DSFA 5TP9A 1WDNA 3EQ1A 3OEMA 2H4IA 5FHNA 3PMWA 3ZKKA 3O97A 5CMMA 2ZYNA 4GL0A 4WXJA 2XXUA 3H6TA 1B5IA 4N6PA 3TZAA 2VD2A 1EH3A 4LZ5A 4OMBA 5CBSA 4P11A 4DCYA 2QS4A 1H44A 3KEIA 4I9DA 4PQJA 2Y84A 2XHDA 1AMFA 2DYXA 3JYRA 4G8MA 1FTJA 1UTBB 3G7WA 4FECA 1MY3A 1Y3NA 2F36A 4OZ9A 3T66A 1IZ1A 1VR5A 2W7YA 1O64A 1A40A 3SETA 2F78A 2ABHA 3U94A 2B3FA 4H8IA 3EHTA 1N3XA 1R1NA 3TEPA 3RUMA 3SERA 1LBCA 4R2BA 1FQDA 2I48A 4GRKA 4QSEA 3KBRA 1P1UA 2QRYA 3VVEA 4C1UA 3RT8A 1SBPA 1JEUA 1MY2A 3VLWA 4K3FA 5CMBA 2GHBA 1QKAA 1XVXA 1DTGA 3IOTA 3THIA 4OETA 4KFQA 5JK4A 3USDA 3T9HB 2REJA 3MZBA 1XHYA 2RC7A 1AH5A 5I56A 1B7ZA 1US5A 2PT2A 4DXCA 4YKJA 4DZ1A 4GXSB 3IJXB 5AA3A 4M1VA 2G93A 1IEJA 1B5HA 3R26A 5K2YA 4AB6A 4ZECA 4GIZA 4ONYA 2GHAA 1N76A 1R9LA 2A5TA 2F5XA 1GR2A 4XXUA 1NNFA 1T0KA 1JNFA 3MJNA 1JETA 3K6WA 4YB6A 4OESA 1MPDA 3OO6A 3W9VA 5HM4B 1FQCA 2O1LA 5ITOA 3SDFA 3K2DA 4E0WA 1PEBA 4HCYA 3UN6A 1OVTA 1SYIA 4AQ4A 2HQ0A 3FXQA 1I6AA 2DS9A 3SKPA 4BDOA 2FYIA 2Y7WA 5H8FA 3B6WA 4Z0IA 3N6TA 4FEDA 2OZZA 4G68A 3VLUA 2XX7A 4XKQA 3VE1B 1SQYA 1DSNA 1B32A 3TTMA 5I57A 3BFTA 3KSXA 1LBBA 2DQVA 3SESA 2OWSA 4E0XA 5L9OA 3TODA 2AL5A 1TFAA 2XD3A 4OFLA 1WVJA 2GH9A 3MVZA 1B4ZA 2O7IA 3IJOB 4U2RA 2F6PA 4MFIA 1JVXA 3M3LA 1B7UA 2P0SA 2PMSA 2QS1A 3CG1A 3O9PA 5LOMA 4HS7A 3CSGA 4F3BA 5EYFA 2GRVA 3MVYA 3UA8A 2HAVA 1LFGA 1II5A 2ONRA 3DELB 3MW0A 3FV1A 3O28A 4R72A 3K6UA 2XD2A 4ZEDA 4Q8RA 3I3VA 3TPAA 3H3GA 1B05A 3EHUA 4G77A 5DEXA 4NEDA 1M5EA 4X48A 1PBPA 1Z7NE 4X9TA 4QSCA 4KD5A 4YKKA 1SW2A 2Y7RA 5M2VA 1MQIA 3U8QA 1P1WA 3W9WA 1MY1A 1KWHA 2Z8DA 4IO2A 4H5GA 4U21A 3OEKA 4ECFA 4YKPA 5CRYA 1S50A 4ISUA 4R6YA 3FIRA 3FV2A 1SI0A 3H03A 2ONSA 2F8DA 4EXKA 3K1NA 3DLNA 2HZKA 2HXWA 4H67A 4EUOA 3G3GA 1URDA 3FXUA 3PMVA 4WEPA 4MLVA 1MQDA 3G3JA 4QSDA 3S9MC 3C31A 2DXRA 4JDFA 3KN8A 5FHMA 4KCDA 3RQTA 3Q26A 2V3UA 3FASA 1D3KA 1YTVA 4MLQA 1B3FA 2Q88A 4KYSA 2Q9TA 5KZTA 1MM6A 2E0SA 4H6DA 4R74A 4XKNA 4ZS9A 3MZ9A 1PB9A 4F3PA 5AA4A 4PE5B 2R9JA 3FGSA 4FORA 1P1QA 2H9BA 2V93A 3G3IA 4R75A 5ITPA 4ELOA 3KFMA 3MVXA 1LGBC 2RC9A 3F11A 5H8SA 3IL1B 4ELRA 3MZ1A 2HFBA 1YPNA 3MC2A 2AL4A 1FQAA 2XXVA 3MPLA 3MVWA 4KR5A 3VVFA 1D4NA 3GLBA 3TQLA 3OENA 1Y3PA 4WEDA 1R6ZA 5DVJA 3MPKA 1ELJA 4YB7A 4OERA 2FA7A 4GXAA 2ESNA 3B7DA 4I62A 1FTMA 1LB9A 2O1MA 3ILUB 1BP5A 1B46A 2F34A 1B3LA 1PC3A 5H8HB 3S4UA 4EF2A 4GD5A 1O7TA 1HSEA 3QYTA 4NE4A 1POTA 1M5CA 1FTLA 4LQ2A 3RPWA 3V89B 3DP8A 2Z23A 1ZBMA 3CFZA 1ATGA 1LFIA 3IB2A 1B3HA 1OVBA 4L17A 2Q89A 4F18A 3LBSA 3E9XA 1CE2A 2QMXA 4QF9A 1MXZA 4DCXA 2XXWA 3O29A 3LUYA 5I59A 3S9NC 3CFLA 3PD9A 4YAHX 3UP9A 4ZE9A 1LAHE 3KN7A 2V84A 3RTFB 4KHZE 1HSLA 5KCJB 4LONB 4ESXA 3OD7A 5DYHA 1MXXA 3KG2A 1XC1A 2ALUA 2OJTA 3FVGA 3OMBA 1Y4TA 2OWTA 2VOZA 3O2AA 1LLSA 4GWOA 5A5XA 3RT6B 3N5LA 2DVZA 3PMXA 1MQJA 3LSLA 1SW1A 1UTHA 2E1SA 3Q27A 1ZIUA 4IY6A 1IXGA 3FUZA 4QHQA 2NXOA 3T9VA 3RLFE 5KDTB 3IORA 4IGTA 4P0GA 1B52A 1S9TA 3D4GA 3SEWA 2WKYA 3SEVA 3IOWA 5I58A 2I49A 5FHOA 4ZZEA 4PFUA 4PETA 1LSTA 3V5AA 1LCTA 5F7VA 4FIMA 4NF4B 4OFJA 4POWA 1QVSA 4YKIA 4BDMA 3KGCA 5JTYA 3RNNA 1N04A 2UYFA 4QFOA 5H8QB 1A8FA 3TAJA 5JEIA 1B3GA 3BFUA 1IXCA 3N94A 4X1DA 3HCQA 3OSQA 4EQBA 4DXBA 3CVGA 3K4UA 1MY0A 1YAEA 3G3FA 2QPQA 2Y7PA 3WAEA 3IK6B 3QUFA 3C36A 3ZKLA 1PB8A 3FATA 5ICQA 3E13X 4OENA 5I2KB 2QS2A 5AA2A 3FVOA 3VV5A 1FQBA 5I2NA 1MXYA 4M4GA 4IO4A 3K01A 3K6XA 3K00A 2HAUA 3HN0A 3PPRA 3C4MA 1US4A 4RY1A 2P2AA 4NF5A 5TPAA 2D5WA 1B2HA 5CBRA 5I84A 5CI5A 3FJ7A 4H65A 4KCCA 4P0IA 2ZYMA 2NWJA 4ZEBA 1Y4CA 1RYXA 4IGRA 1PBQA 2IA4A 2H98A 5TP9B 4FEBA 4H1XA 4RPNA 4QRZA 1JW4A 3OELA 3PPPA 1BTJA 3PU5A 1A8EA 2NVUB 1H3DA 3T9UA 3IX1A 3OO9A 4EQ9A 1ZTYA 3PUXE 2ZYKA 3JZJA 3UGWA 3QK6A 1A54A 2ONKE 4G4PA 5B70A 4RPOA 2XXXA 4F31B 4NF8A 2AYSA 1TT1A 5B7DA 3TKDA 4JB7A 3A3CA 2DWJA 1MXUA 3OO8A 2O69A 4R6KA 2THIA 4RK9A 4GOTA 1EU8A 4BDQA 1B0LA 3DM0A 3M8UA 2OLBA 4QFPA 2YJPA 4KYEA 3D4CA 3I6VA 3GZGA 2XXPA 4IO3A 4HTGA 4OHNA 1MXWA 1Y20A 1BLFA 4KQPA 1IXHA 4OVJA 5K2XA 3RGYA 1B1XA 4UACA 1SD3A 1SW5A 3CR9A 2I6EA 5ELVA 1LAFE 4ESWA 2O6AA 4F3SA 2I0BA 1N7XA 3CRBA 2RINA 2CZLA 4FE8A 4Q5TA 5I56B 3IAZA 4G8HA 2H5YA 3SEXA 4LZ8A 4IY5A 5H8NA 5TU0A 3T96B 3R6UA 1SYHA 2H99A 1P1NA 1CB6A 2A5TB 3TCHA 4ZZAA 4GF8A 4F2OA 4Z7EA 3OXNA 1LFHA 3TELA 3C32A 3FJMA 1TFDA 4G68C 2DE2A 4LVQA 4UA8A 4JBZA 5L9MA 2F35A 3H6VA 3MP6A 4NF6A 3HV1A 2VP1A 3U1OA 1LAGE 3ILTB 3MP1A 2UVGA 4C1TA 2QMWA 2A5SA 3B6QA 3PUZE 1LCFA 5H8FB 1MS7A 2I0CA 2YPNA 1AOVA 3PV0E 4EQ7A 1JEVA 1VE4A 4G68B 4YMAA 1OLCA 4XTCQ 3B6TA 3LSWA 4OQOA 5I57B 1L5TA 5DVFA 4GFRA 1VFDA 1BKAA 2I58A 1JQFA 5CM6A 3ODBA 3PUYE 3UIFA 2ZNTA 3M3FA 1Y1MA 4JXIA 5CC2A 4R2FA 4XIGQ 4O3BA 2DP8A 3IO4A 3HO7A 3G3KA 2VGQA 1MH4A 3E4RA 4F29A 2I3WA 3E3KA 4ND9A 4NMYA 1AIVA 1B5JA 3DP4A 4LUBA 3CI8A 3MWBA 1IITA 1H76A 4TLMB 3G3HA 1QUJA 3H6WA 1USYH 1XS5A 3C33A 2QJEA 3S9LC 5IAIA 4LP2B 4N13A 1SDXA 4POXA 4O3AA 5DEXB 1QKBA 4F2QA 4ZEKA 4YMBA 1MQGA 4ZE8A 4ELPA 4YZZA 1VFEA 3TQWA 1OQHA 2DWIA 3EPEA 4OEVA 1ANFA 4RK2A 1IIWA 1FTOA 4R9GA 2I4BA 1MH3A 3BBRA 3U93A 4NF4A 2Z8FA 4R73A 1UTBA 3LSXA 3EHSA 4TLLB 1FQEA 2DE4A 2ZXTA 3IOVA 4OFOA 4U1ZA 2F7BA 2Y7IA 3LC8A 1EZOA 3ZS6A 4QFNA 1IXIA 4Q30B 1GGGA 1OQGA 3KJTA 4MBPA 3IB1A 2ZNSA 4XKPA 3Q25A 1EZPA 2V25A 4JWOA 1D9YA 1NL5A 5L9SA 3KOSA 4F19A 1DPPA 4OYVA 4YICA 3K1MA 1WODA 4U4SA 3U92A 1JW1A 2RKMA 3ONMA 5HPQA 2XXRA 4U1OA 5AA4B 3OO7A 3QUJA 3GBAA 1NH8A 3UK4A 3FJGA 2XX8A 3OOAA 2H25A 5J1DA 1MDQA 1A55A 3OSRA 4WKMA 1P1OA 2UVJA 2PX1A 3PPQA 3SEUA 4F39A 3Q28A 1H45A 4O3CA 2UXAA 4BLAA 1MY4A 4F3GA 1FCKA 4GLIA 2Z22A 2I4CA 1OIBA 1J1NA 3QXMA 4GVOA 2O51A 4EXLA 4ZEIA 1ZMGA 1D9VA 1FTKA 2O84X 3O6HA 5DTBA 3UORA 2VD3A 2V3TA 3HHFA 3VXBA 3TTKA 3W15C 3LSFB 1BIYA 2DXYA 1B4HA 1A99A 2XXQA 4PFWA 1F9BA 4HCWA 4F1VA 1B58A 3EF7A 2M8CA 1O63A 4JWXA 3TFLA 1GVCA 1I69A 3T93B 3FVNA 1B9JA 1DMBA 2OBGA 4OEUA 3N6UA 2XXTA 2V3QA 1N84A 2DVCA 3PUWE 3HHGA 5I59B 3L6HA 3GBBA 3KOTA 1ZU0A 4KI0E 4PFYA 1OLAA 4G8NA 3S2VA 4EDPA 1XVYA 3A3UA 2DE3A 2ZYOA 4YB5A 3I5OA 3RTWB 1B51A 3CSBA 1MQHA 5BUUA 1B7HA 1TWYA 2DWAA 2X7PA 1URSA 5A5XB 1JVYA 4KPTA 3T9XB 3QSLA 2HZLA 5FTIA 2X7QA 1UTHB 2UYEA 1MPBA 1Y1ZA 4H5FA 1M5FA 2QL3A 3VVDA 3H7MA 2ZNUA 3SEYA 3TCGA 2OCUA 1DTZA 1NMUA 1GV8A 3PPNA 3TTRA 4NWDA 5I58B 2PVUA 1NNKA 2Q2CA 4R6HA 2B3BA 4ZDMA 3TMGA 2RCAA 4IO7A 1UQWA 5JTYB 4OTEA 4XKRA 2O68A 3TTLA 4DXUA 1VSOA 1DPEA 3CFXA 3CG3A 3L6GA 5ISUA 4RXLA 1IQ7A 1N0TA 2YLNA 2Q2AA 2I3VA 4QFKA 1QW0A 2F7CA 3M3KA 4I1DA 1Q35A 4TQUQ 4F1UA 3C34A 4DIGA 3N26A 1MXVA 4IB2A 3TDJA 3ECRA 4IO5A 3LR1A 2DWHA 1QUIA 5AA2B 2QSXA 1AL3A 3CIJA 1I6BA 1QULA 3VDFA 1PB7A 1YCJA 5I2NB 1N7WA 3ZSFA 3TUSA 4QFLA 2RC8A 1P99A 3IB0A 4NF5B 5TPAB 3EN3A 4MH5A 1FW0A 1A7LA 2B65A 1S7YA 4X1BA 3PPOA 3IOUA 4AB5A 1UIVA 1SVXB 3K6VA 3P7IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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