4MH5A

Crystal structure of the kainate receptor gluk3 ligand binding domain in complex with (s)-glutamate
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
GTNRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGSGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Binding site and interlobe interactions of the ionotropic glutamate receptor GluK3 ligand binding domain revealed by high resolution crystal structure in complex with (S)-glutamate.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Receptor/agonist
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, kainate 3
total genus 80
structure length 256
sequence length 256
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-08-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4mh5A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4mh5A02
4Q8RA 1USYE 2F7AA 4LVQA 2O6AA 4QF9A 4BDOA 2UVIA 3O9PA 4DLDA 1NNTA 1GR2A 1P1QA 2Y7WA 3RPWA 4GIZA 4EF2A 4IB2A 3RNNA 1FTKA 3MP8A 3R26A 1WODA 4H8JA 4JSDA 3TKDA 3TYHA 4YB6A 3R7XA 2O69A 1EZ9A 1H45A 1QUIA 2F6PA 2X7PA 3K0VA 3OSQA 1JNFA 5H8HB 3ZKKA 5J1DA 3PPOA 2OLBA 1Z7ME 2Z8EA 5BUUA 4I1DA 3HHGA 3HCQA 1B2HA 1MPDA 4P0GA 1AH5A 3C36A 1SD3A 3WAEA 4NE4A 4ELRA 1J1NA 4LZ5A 3HO7A 4ONYA 1VFEA 5JEIA 3IL1B 1IIWA 3TTMA 2DWHA 4KD5A 1JQFA 3RUMA 4DIGA 4ZS9A 5CMKA 4WKMA 3S9EA 3FATA 2I49A 4ISUA 1NMUA 1LAHE 3A3UA 3KBRA 2I4BA 4RA1A 5ISUA 1HSLA 2V84A 1R9LA 2CZLA 1A40A 1AMFA 1PDAA 3IOTA 4JDFA 2V25A 1N0TA 2DP8A 2I4CA 2UVJA 3O97A 5L8DA 3Q29A 2B3FA 3K2DA 2P2AA 4QSCA 5DT6A 5KDTB 3KG2A 3RLFE 3EN3A 2THIA 4KCDA 1YCJA 3QYTA 3RTWB 1JVXA 1MQGA 3KSJA 5H8NA 3OXNA 1MXZA 3MVWA 3DELB 2Q2AA 1SYIA 4QFPA 1BKAA 2UXAA 2XXYA 4BDQA 2H25A 3IOWA 1MH4A 1VE4A 2O1MA 3U93A 1QVSA 3O6HA 3SDFA 4OQOA 1IITA 3OEMA 4X1DA 2ESNA 3DM0A 3K6VA 4E0XA 3EPEA 3G3IA 3VLWA 4M4GA 2OBGA 1MDQA 1JW4A 3OO6A 4LATA 4ZEFA 1DMBA 1MY3A 3UP9A 3MUQA 4PFUA 1ZJLA 5BWJA 5B70A 1EH3A 5I56A 4U22A 3VLUA 1AIVA 3G3GA 4EXLA 5CMMA 1A8FA 1Q1KA 4QFNA 2AIXA 4XKNA 3PPQA 5M2VA 2XD3A 2RC8A 4TLLB 5KZTA 1QUKA 1RYOA 4AB5A 2FA7A 2HAVA 4H1XA 3Q25A 3MVXA 4U1OA 4G77A 4QFLA 1SW4A 5DYHA 4F3GA 5TP9A 3LSXA 5L9SA 4C0RA 3IB1A 3E4RA 1B4ZA 3U72A 1SW2A 3C4MA 1RYXA 4GXAA 4Q0CA 4X9TA 1B3GA 2XD2A 4GQOA 2HZLA 4RYAA 1M5DA 5CBSA 4NF4A 4THIA 2Z23A 3U94A 4PQJA 1FTMA 3BKIB 3FVKA 3O2AA 1LB9A 3OO7A 4DXBA 1ZLQA 3MPLA 2YLNA 1MXYA 2QPQA 1UIVA 1D9YA 2QMWA 5L9MA 3H4ZA 3QXMA 3VV5A 2OZZA 3QUJA 1CE2A 5I59B 5I2NA 1ZTYA 1B46A 2I3VA 2DQVA 1URDA 1B51A 3KZGA 3M3KA 4OTEA 4XKQA 5AA1A 2XXVA 4Z0IA 3FXQA 5CI5A 3QIMA 5ITPA 4FATA 4NWDA 4GL0A 4LZ8A 1JW1A 2E0SA 2O51A 4P0IA 1ZMGA 3R6UA 1VR5A 3T22A 4NF4B 1NNFA 2ONSA 4R6KA 3O6GA 3EF7A 3V8XB 2F97A 2HEUA 3P7IA 4R2BA 2AL4A 4XXUA 5FHOA 5AA2B 3CSGA 4G68A 5LOMA 1MY4A 2PT2A 1FCKA 1ANFA 1B5JA 2OK2A 3IOUA 3LSWA 4X1BA 4FE8A 4KI0E 1LFGA 2GHBA 3C31A 3CG3A 3IOVA 4JXIA 3IX1A 3U8QA 5CRYA 5IAIA 3SEUA 1IXHA 2F8DA 2ZYNA 5DEXB 2B3BA 4KQPA 1XOCA 3PUVE 4OYVA 3VE1B 1LGBC 4FEDA 4F18A 3M3LA 3UK4A 1OMPA 3VXBA 4R74A 1FW0A 1I6BA 2D5WA 2NXOA 2X7QA 1Y4CA 3FVNA 5DVFA 3HV1A 2RC7A 3M8UA 4GF8A 4M1VA 1WVJA 4PFTA 1IQ7A 1B05A 4QHQA 4U23A 5H8HA 3ZSFA 3K02A 1ELJA 2GH9A 5F1QA 4XKRA 4F3BA 1UTBA 2E1SA 2OWSA 4R9GA 1B3EA 1QKAA 1POY1 5B7DA 3DP4A 1LCTA 2DE3A 4U4XA 2Q89A 1B32A 1D4NA 1N3WA 1VFDA 2XXXA 2AYSA 3C32A 3EHUA 3FZVA 1H44A 5DTBA 2Z22A 4BDRA 2H98A 4O3BA 1M5CA 1GVCA 5L9OA 4O3AA 1NNKA 4U2RA 3WAFA 1KWHA 3K6XA 4DE8A 5TP9B 4LZ7A 1TT1A 1B3FA 2I0CA 4IO5A 5DVIA 4ZE9A 3PUXE 3TTRA 2DSFA 4Q30B 2I58A 4IO2A 2LAOA 3QK6A 4HTGA 1LBCA 2QL3A 3HN0A 4F29A 5AE4A 4OEVA 2XXUA 3O6IA 4OVJA 4WEDA 2DE2A 4OESA 3E3KA 4YU0A 5CBRA 4PETA 1DTZA 2QS1A 1MY2A 4R6YA 3LR1A 1B7HA 1DOTA 1TFAA 1P99A 2VGQA 4GL8A 3ILTB 4DCXA 3HPIA 3T9VA 3Q28A 3KN3A 2Y7RA 3F11A 2ZMBA 3E9XA 1FTOA 3LBSA 1F9BA 3MQ9A 4HCYA 3RT8A 3SEVA 3W9VA 3TEPA 3L6HA 3PUWE 4PFYA 2Y7IA 4JWXA 5H8FA 3FXUA 3KOTA 4OXVA 2Q8JA 1GV8A 2FYIA 2NVUB 1XVXA 3TODA 5CC2A 1I6AA 1MXUA 1Y3PA 1DTGA 2XXIA 3GZGA 5CMCA 1TWYA 3CR9A 4F39A 1MPBA 1D3KA 4JWYA 4HW8A 2F7CA 4RY1A 1H76A 5EHMA 2XXPA 1MQJA 3OOAA 3IO6A 3KN8A 4N13A 4YAHX 2HCAA 3FVOA 3UGWA 1RKMA 1B3LA 1ZKBA 3H7MA 3TPAA 4ELPA 5ICQA 3DLNA 2A5TB 5EHSA 1PBQA 3C9HA 2NOOA 4KFQA 4ZEKA 3TQWA 1OVBA 5TU0A 2X26A 1LB8A 1LSTA 3W15C 2ZNSA 3MAMA 3MBPA 2Y7PA 4R75A 4XKPA 2W7YA 3TCGA 4EQ9A 4H5FA 4GWOA 4JB7A 4WXJA 4YZZA 1M5FA 3TDJA 5KCJB 1R6ZA 2PVUA 1MY1A 2ZYOA 1NFTA 4IY5A 4L17A 3OENA 1O64A 3GXAA 4MH5A 1US4A 2H9BA 1B6HA 1B7ZA 4LQ2A 4ESXA 1ATGA 2AL5A 3OELA 4F19A 4KCCA 2D3IA 2VOZA 1MH3A 3MZBA 4F3SA 2OCUA 1UIUA 5CM6A 5IKBA 2ALUA 1MM7A 3KSXA 4I62A 5ELVA 3OO9A 1FTJA 2HQ0A 1UTBB 3IR1A 3KGCA 1Y3NA 1H43A 3MJNA 4ZEDA 1XS5A 1XVYA 4RK9A 4F22A 4Z7EA 1LAXA 1I69A 1PB7A 3IB0A 4GLIA 4RPNA 1BIYA 4IY6A 2QMXA 5A5XB 2DVZA 3TAJA 4F2OA 2Q88A 3QAXA 3A3CA 4H65A 1PB9A 3TTNA 3I6VA 4DXCA 1XHYA 3UIFA 3USDA 1Y1ZA 4KYSA 2F78A 4N6PA 4YKIA 3V89B 3BBRA 4IO3A 4FECA 3D4CA 3TMGA 3PUYE 4NF8A 3SEXA 1B5HA 3W9WA 2DXRA 1EZOA 1O7TA 2XXQA 1R1NA 3EHTA 1B1HA 2O7UA 4G68B 4H6DA 4U4SA 3UA8A 3TCFA 4UA8A 4G2ZA 2HAUA 5I84A 3K00A 4H67A 3GLBA 4R73A 3SESA 5AA2D 2HFBA 2XHDA 4JWOA 3ONMA 1NKXA 4PP0A 2HZKA 2O84X 4OETA 1TXFA 3UORA 2OWTA 1ZU0A 4UACA 1OQHA 3N5LA 4ND9A 5FHMA 3K01A 1SW1A 2R71A 3FUZA 3Q27A 4IGTA 4QSDA 1IZ1A 1EU8A 3Q26A 4YKPA 4YMBA 1B3HA 1Y9UA 3MP6A 3CIJA 1LFHA 4MLQA 4H8IA 4ESWA 3IK6B 4KPTA 1LAGE 3PMXA 3LC8A 1S9TA 4GXSB 4POWA 3TUSA 1ZIUA 4EDPA 4ZZAA 2I0BA 3EQ1A 4ZEBA 3RY3A 1Q35A 1LFIA 2RINA 3TTKA 5I58B 2B65A 3CFLA 1QW0A 4NEDA 3PMWA 3CI8A 3OO8A 4RPOA 4OENA 5HPQA 3LSLA 1B7UA 1NNPA 1TFDA 2H4IA 2UVHA 1R9QA 3M3FA 3T96B 4BLAA 1MG1A 3G7WA 4E0WA 2RKMA 2V3UA 1PBPA 2Z8DA 2F7BA 3PMVA 3ZKLA 2P0SA 1YPNA 1QUJA 1IXCA 1PC3A 1UQWA 3PUZE 4G8HA 1US5A 4DZ1A 1LCFA 3ECRA 3IORA 2KLFA 1MXXA 4OFOA 2DS9A 5HBCA 3S2VA 5I56B 1ZBMA 2V3TA 1MXWA 3B6TA 3GBAA 3FXRA 1DPPA 3LSFB 4OEUA 4I9DA 3VXCA 3CRBA 4NTLA 5AA3A 4JSOA 1B40A 1O63A 3K1MA 3BFTA 1MRPA 2GFEA 4H5GA 3I5OA 3FGSA 4TOZA 4QFKA 1MQHA 5I2KA 2UVGA 2XX8A 1LLSA 4ZE8A 3U92A 1Y20A 3CFZA 2Y84A 4EQ7A 2XX7A 1HSEA 2RCAA 3ZS6A 4ELOA 3D4GA 3GBBA 3H3GA 2M8CA 3MPKA 4AB6A 3IJXB 1SQYA 2OJTA 1MPCA 3DP8A 1SDXA 1MQDA 1D9VA 4KYEA 1IUDA 2GRVA 3PGFA 1LAFE 4AQ4A 4YKKA 2I48A 4GOTA 1Z7NE 2ZXTA 2F36A 4MF3A 4NF8B 4QRZA 3UN6A 4EXKA 5AA4A 2R6GE 1FQCA 2PBWA 1GTKA 2PYYA 5CMBA 4ZZEA 4R6HA 1IXGA 2NWJA 3N6TA 1MXVA 3SKPA 5I57A 4LP2B 2RC9A 4G68C 4OFJA 1JVYA 4G8MA 2QSXA 2DYXA 5I58A 3FVGA 2O7IA 3G3HA 3JZJA 3RN8A 4ECFA 4R9FA 1DPEA 3S4UA 3TFLA 3QSLA 1SI1A 1N7XA 2REGA 3SETA 3V83A 4KHZE 1UTHA 1USYH 1Y1MA 2QRYA 3HHFA 3O29A 4TQUQ 3MC2A 1M5EA 2FNCA 3N6UA 4OWDA 1QJMA 4F1UA 2BJJX 5I57B 2HXWA 3B6WA 4O3CA 4OERA 4EF1A 3FASA 2QS2A 2I3WA 2VP1A 4POXA 1Y4TA 1A99A 2ABHA 2H5YA 3DP6A 3IO4A 3MVZA 1P1WA 2G29A 4YB5A 3B6QA 3N26A 4MLVA 1PEBA 3BFUA 2DWAA 2Z8FA 3MZ9A 3TZAA 4OFLA 5AA2A 2RF1A 3TQLA 2VHAA 3PD8A 3MW0A 3O66A 2IEEA 1FQAA 2QS3A 4N07A 3CSBA 3RGYA 1Y3QA 2F5XA 1POTA 2QS4A 2VD3A 3RQTA 1NH7A 3THIA 4MBPA 3FV1A 3H6TA 3KN7A 2IA4A 2REJA 3ODBA 1OQGA 2H99A 4F3PA 3OMBA 1OLAA 2ONRA 2Q9TA 3K1PA 3FIRA 4PE5B 4F1VA 4NWCA 4JBZA 3S9MC 1B0HA 1SBPA 3SERA 1SI0A 2F6GA 3H6VA 4QSEA 5H8QA 4EUOA 2ONKE 4QFOA 5DVJA 4YKJA 1B5IA 4X48A 1URSA 1A8EA 3IB2A 1JEVA 3U1OA 2NUVA 2A5SA 3ILUB 1SYHA 1YTVA 4G4PA 5TPAA 2CMOA 2DVCA 3T9XB 1A55A 4PFWA 1OLCA 2ANJA 1URGA 1P1OA 1YAEA 4Q5TA 4U1ZA 4IO7A 1NH8A 1VSOA 2I6EA 3OSRA 1OVTA 5JTYA 5ICTA 1A7LA 1SW5A 3S9NC 2R9JA 4TLMB 5HM4B 2DWJA 4IO4A 1OIBA 2XXWA 4ZECA 2PMSA 3H06B 4LONB 5TPAB 4I8CA 1MM6A 1MDP1 3MWBA 5F7VA 1N84A 4NMYA 3PV0E 4FEBA 4U21A 2XXHA 3IAZA 5H8QB 3VFJA 4FAJA 2V3QA 4GFRA 4OZ9A 1A54A 3TELA 3FV2A 3H6UA 2VD2A 3KEIA 4K3FA 4EQBA 4KYDA 3A09A 3N94A 1MS7A 2DXYA 4NF6B 4ZDMA 3TTLA 1QKBA 4P11A 1S7YA 1L5TA 3T66A 4YMAA 1EZPA 2O1LA 2GHAA 3KJTA 3KOSA 4IGRA 4YICA 1B52A 3RT6B 3FJGA 5H8NB 1T0KA 3PPRA 1JW5A 3K1NA 5FTIA 2ZNUA 3CG1A 1I6QA 4MFIA 3T93B 4XTCQ 3SEYA 1AOVA 2Q2CA 4GRKA 1WDNA 2QJEA 2O68A 2RCBA 2ZYMA 3C33A 3KJ7A 3MVYA 3OD7A 4NF6A 4BDNA 4C1UA 3PU5A 4DCYA 4RNSA 2XXRA 3CFXA 4BDLA 1B0LA 2DOJA 3H6WA 4HCWA 3FJ7A 1FQDA 2PT1A 4RK2A 5FHNA 1JEUA 1LBBA 3VDFA 5KCJA 4DDDA 1GGGA 3E13X 2YJPA 3O28A 5H8SA 5K2XA 5AA4B 4F1YA 5A5XA 4KR5A 3S9LC 4FORA 3FD3A 3G3FA 3V5AA 4IO6A 5ITOA 1IEJA 2XXTA 1JETA 3MZ1A 4XIGQ 3SEWA 3VVDA 4G8NA 1MY0A 2G93A 1UTHB 3K4UA 4HS7A 1XC1A 1P1UA 3T9UA 3VVEA 5KDTA 4FJPA 1P1NA 2F35A 3G3KA 4H0WA 5DEXA 4RXLA 3I3VA 3MP1A 4ZEIA 5JTYB 5H8FB 1B1XA 4F2QA 2XX9A 2PX1A 2YPNA 4GD5A 3EHSA 4ELQA 4OHNA 5EYFA 1FQEA 1FQBA 2F34A 3FJMA 3K6WA 3OEKA 4OMBA 1FTLA 1N04A 2UYFA 4C1TA 1CB6A 2D21A 1SVXB 2P1SA 1HSJA 3JYRA 1B4HA 4LA9A 5I2KB 3HSTA 3QUFA 1MQIA 1B9JA 1XT8A 1II5A 3C34A 4NF5B 3H03A 5I2NB 4BDMA 5I59A 1IXIA 2ZYKA 3G3JA 3IJOB 1N7WA 4FIMA 4LUBA 1S50A 3L6GA 2V93A 3AXFA 3C35A 3PD9A 4LQ5A 4R72A 1BLFA 3RTFB 3PPPA 1N76A 3VLVA 2Y7KA 3CVGA 1FQFA 1AL3A 4F31B 1DSNA 2A5TA 1M5BA 1PB8A 5JK4A 4GVOA 1B58A 3PPNA 5K2YA 3T9HB 2DWIA 3TCHA 2UYEA 4DXUA 3LUYA 4WEPA 1H3DA 4RJZA 3VVFA 1BTJA 3JV9A 4NF5A 3KFMA 4R2FA 3K6UA 4YB7A 1N3XA 2ZNTA 1QULA 2WKYA 5FTHA 1BP5A 1NL5A 2DE4A 3B7DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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