1FW0A

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with kainate at 2.0 a resolution
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
publication title Mechanisms for activation and antagonism of an AMPA-sensitive glutamate receptor: crystal structures of the GluR2 ligand binding core.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 76
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fw0A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fw0A01
5DVIA 3RPWA 4KI0E 3R6UA 1DTZA 2VGQA 4IGTA 1ATGA 1GV8A 1LAFE 4PE5B 3SEWA 3G3JA 4GFRA 4F3SA 5B7DA 4C1UA 2F7BA 2THIA 1SD3A 5AE4A 4DXUA 1LCFA 2Y84A 3TQWA 4XTCQ 1S9TA 3O29A 1JW4A 2AIXA 3D4CA 3FASA 1DTGA 4U1OA 3C31A 2XHDA 4QSDA 1II5A 2B3FA 4P11A 1OMPA 3K6VA 3LUYA 4OTEA 5FTHA 5BUUA 3K01A 4L17A 3WAEA 4FEBA 2GHAA 2F8DA 1URSA 3W9WA 4NWDA 4I9DA 4GOTA 1JEUA 1XC1A 2VD2A 4R9GA 1Z7ME 3M3LA 1F9BA 3U8QA 3IL1B 4GD5A 3BFTA 2B65A 3N6UA 2F78A 1TFAA 3HHFA 1N3WA 1QKAA 3BFUA 3OSQA 4NWCA 4NF6B 4YKJA 1JEVA 1B7HA 3MP8A 1N0TA 1N7XA 1D9YA 2HAUA 2XXWA 1OIBA 1FTKA 1USYE 2V93A 3MUQA 4UACA 4JWOA 4DCYA 4KQPA 1SW1A 3S9MC 3LSLA 3V83A 4GVOA 3VVEA 4KPTA 1UQWA 4JB7A 1OQGA 1SYIA 3FGSA 4MF3A 1R9QA 4F1VA 4IO7A 5ISUA 3H7MA 1JETA 2V25A 2HFBA 4OEVA 5H8NA 1LBBA 3PMWA 2O6AA 3W9VA 1LGBC 3KGCA 3IJXB 1N84A 1B3LA 3PV0E 2ABHA 4ZEDA 5I84A 1B0LA 1BTJA 4OEUA 4JDFA 3A3UA 1MH4A 4RPOA 2XXPA 1SBPA 1EU8A 1MH3A 4OENA 4O3BA 4GRKA 1BKAA 2H4IA 4XKNA 4N13A 4NF8B 4R2FA 4DZ1A 4OQOA 4F18A 2ZYNA 2I48A 5CMMA 3ZSFA 4YKIA 4O3CA 2A5TA 1FTLA 4OMBA 3CFLA 3T66A 2NUVA 3ZKLA 4EXKA 3G3FA 5I57A 1URGA 3OSRA 5CMCA 4G68A 2F97A 4YB6A 1EH3A 2DVCA 2Z8DA 3K1PA 2O68A 1MQIA 3MWBA 4OFLA 3PD8A 4MH5A 1QJMA 1WVJA 3UP9A 2ALUA 1SVXB 4YB5A 1A8FA 3TODA 1POY1 2XXUA 3FV1A 4OXVA 3UN6A 3T22A 3VVFA 1MRPA 3B6TA 3TAJA 2D21A 1P1QA 2Z8EA 4F2QA 4F3BA 3TCGA 4YU0A 5L9MA 2D5WA 1NH7A 1P99A 2PVUA 3N5LA 5J1DA 4OFOA 2NOOA 2I58A 4ELQA 1UTBA 1J1NA 4BDLA 1SQYA 2OLBA 4H6DA 2R71A 4N07A 3MVYA 3VFJA 3K1MA 3FJGA 3K6UA 1IEJA 4H67A 3Q27A 3W15C 4KR5A 3JYRA 3V8XB 1DOTA 3MC2A 4IO5A 4KYDA 3TTLA 2GH9A 3RTFB 3PPOA 3BBRA 1PBQA 3G7WA 2QS4A 1CE2A 3KSJA 2X7QA 2REGA 2QSXA 1KWHA 4OYVA 3KG2A 3C35A 3ECRA 1Q1KA 3PUZE 3OOAA 2HQ0A 4H5GA 4YZZA 4PQJA 1D3KA 1I6BA 3MVZA 4I1DA 3TCFA 1AL3A 4HCYA 5KCJA 4H65A 3SETA 4LONB 5JTYB 4G68C 2PT2A 4U4SA 3UORA 1SI1A 1LB9A 2OWSA 4FE8A 4IO3A 2I6EA 2G93A 1B3GA 4IO2A 5EHSA 4QFOA 1QUKA 1MY3A 1UIVA 1B4HA 2A5TB 1FW0A 1ZJLA 1M5CA 1NNKA 3MZ1A 3OO9A 1MY4A 1DMBA 4LVQA 2V84A 4BDQA 1MQHA 5DEXA 3OMBA 4QRZA 5I57B 3MJNA 5FTIA 2XX7A 2Z8FA 3KJTA 4M1VA 4LZ5A 4G68B 2UYFA 4O3AA 2F34A 3MBPA 4ESXA 2ESNA 1HSEA 1B9JA 3QSLA 4NF4A 4YAHX 3I5OA 2GFEA 1NNTA 2RC9A 5ELVA 4RA1A 3RQTA 4XXUA 4EF2A 3M8UA 1B51A 3QK6A 4HCWA 1I69A 1D9VA 2DYXA 1ZTYA 4I8CA 4IY5A 2OBGA 3HSTA 3S4UA 2X7PA 3TEPA 1MXZA 4ELOA 4LQ5A 3IR1A 3T96B 3G3KA 1Y4CA 3KEIA 4GXSB 1QUIA 4ZEBA 1B7UA 4MLQA 3PUYE 1R1NA 4TLMB 3SKPA 1NL5A 1S7YA 1O63A 1OVBA 1NNPA 1MPBA 3A3CA 2RF1A 3JZJA 3U94A 1UTBB 3O28A 4WKMA 1NH8A 3CSGA 4RXLA 3ONMA 3DELB 3CIJA 2P1SA 1QVSA 3QAXA 3IB1A 3T9UA 4DXCA 4KYEA 2AL4A 3K6XA 4TQUQ 3FVKA 1IXIA 2NXOA 1XS5A 5KZTA 4EQ7A 5F1QA 2O69A 1MDP1 1VFEA 1O64A 2W7YA 3EHSA 3TUSA 3K1NA 3EHUA 2RC7A 2RKMA 1SDXA 4M4GA 4PP0A 5I2KA 2GRVA 5CI5A 3C4MA 3KBRA 3MPKA 4ELRA 4ZZEA 5CMKA 5KCJB 1ZKBA 4IY6A 2CZLA 3I6VA 3PMVA 1B5JA 3H6UA 3ODBA 3H4ZA 1H3DA 4FORA 4POWA 1AIVA 3EQ1A 3FV2A 3SESA 3FXQA 1B0HA 3C36A 5L9SA 3T9HB 2UYEA 4G4PA 1A54A 3THIA 2NWJA 1A40A 1VE4A 4NTLA 5DEXB 2PMSA 2M8CA 3E3KA 3H03A 5AA2D 1RYOA 5ITOA 2HAVA 1LFIA 5K2XA 4X48A 2QL3A 3HCQA 5ICTA 3BKIB 4GL0A 4OETA 2RC8A 4NF4B 1IZ1A 3T9VA 4PETA 3PPNA 2V3QA 2LAOA 4AB6A 4BDOA 4EF1A 3PMXA 4TOZA 3DP8A 2IA4A 3K4UA 1XOCA 4Q30B 1MS7A 3KN8A 2ZYOA 4PFUA 2Z22A 3FVGA 4F2OA 3MPLA 5AA4A 2PT1A 4F29A 3VLVA 5CC2A 3FVNA 3S9LC 2O1LA 3CI8A 1PB7A 2QS1A 3MQ9A 4RYAA 1QKBA 3TMGA 3P7IA 1MXXA 4DE8A 3RUMA 5ITPA 3R26A 4BDRA 4F1YA 3VLUA 4ISUA 2ZXTA 4THIA 3KFMA 4FECA 4KFQA 1YPNA 1FQBA 2Q9TA 1TT1A 2RINA 4AQ4A 1NFTA 1IIWA 4G8NA 2QJEA 1OLCA 3VXCA 1A7LA 3D4GA 4QF9A 3AXFA 4OVJA 1B5IA 4ND9A 4N6PA 3C32A 3N6TA 4F31B 3LBSA 5KDTA 1D4NA 1BIYA 4ELPA 2V3UA 1DPEA 1GTKA 4FAJA 2ONRA 4LZ8A 3H6TA 1LBCA 2E1SA 5I2NA 4R73A 5CBRA 4OWDA 4LZ7A 3U93A 1GVCA 3FUZA 3T93B 4X1DA 1MM6A 3HO7A 4U4XA 4GIZA 2B3BA 4F3GA 2F36A 5IAIA 2OJTA 5I58A 2QMWA 4H8JA 3RT6B 1B1HA 3ILUB 4WEDA 1B2HA 2I4BA 1QUJA 4JWYA 1EZ9A 3EF7A 1ZLQA 1LCTA 3QUJA 3OELA 4H5FA 3QXMA 3Q28A 3KOTA 2WKYA 3TZAA 1LFHA 1Y20A 1FQCA 3G3HA 2DWJA 4F39A 2XX8A 5H8FA 1MG1A 2DWIA 5AA4B 4Q0CA 2XXRA 1H44A 1XHYA 1B40A 3LSWA 1IXCA 4DDDA 3VDFA 1OQHA 1LB8A 5ICQA 2OCUA 3H6WA 3MAMA 3PD9A 1JQFA 3E4RA 3H6VA 3WAFA 4IGRA 3K6WA 2F7CA 4R9FA 5DYHA 5EHMA 4BLAA 1TXFA 3TFLA 3N26A 2A5SA 1TFDA 3FZVA 2DXRA 4LP2B 2R9JA 2XXQA 3H06B 1LAGE 5CMBA 5B70A 1B3EA 3SEXA 5KDTB 1PB9A 1B3HA 3ZS6A 4NE4A 2I3VA 2QS2A 5FHMA 1MDQA 1MQGA 4RK2A 3LR1A 5H8QA 5H8NB 5I2NB 5CM6A 2VP1A 1H43A 2XXTA 3Q29A 1Y9UA 1B52A 3DP4A 4WEPA 3C33A 5M2VA 4KHZE 3I3VA 4QSCA 1UTHA 3JV9A 3LSFB 3L6GA 2FA7A 3KN7A 1MY0A 2HZLA 3G3GA 1GR2A 2DE3A 2Q2CA 4OZ9A 1PB8A 4H1XA 3TTNA 1B05A 1FQDA 3GBAA 1US5A 3KSXA 4QHQA 1IXGA 1FTJA 3UIFA 1LAHE 4YKPA 4F19A 2REJA 4G8HA 3CG1A 4LUBA 2Y7KA 1R9LA 5I59A 1P1WA 4JSOA 4R2BA 4DLDA 1DPPA 3UK4A 5AA1A 1ZMGA 4ZECA 1SW5A 2PYYA 3HN0A 4XKRA 4EXLA 5H8FB 1VR5A 3IB0A 3OO6A 2F7AA 5H8HA 2AL5A 3Q25A 4C1TA 1A8EA 4F22A 3C9HA 2XX9A 4H8IA 3SDFA 3O6HA 4IO4A 1RYXA 4R6HA 4G8MA 1JNFA 2O7IA 3O9PA 1POTA 4X9TA 2FYIA 1M5EA 2I3WA 3EPEA 3OO8A 4MLVA 4ZE9A 4ESWA 2QRYA 3ZKKA 1TWYA 1VFDA 3PPQA 1MXYA 1H76A 1FTMA 4OERA 4JXIA 4QFKA 1JVYA 2ONKE 3GZGA 1B7ZA 4ZE8A 4U21A 1AMFA 3FVOA 2DWHA 2RCAA 5L8DA 2P2AA 3MP1A 1B4ZA 4YMBA 1EZPA 4ZEKA 4HW8A 1US4A 2DP8A 3IO4A 2Z23A 5F7VA 3QUFA 2IEEA 3RLFE 5H8QB 1QW0A 3V89B 4U2RA 3FIRA 4HTGA 3S2VA 4OESA 3RNNA 3IOUA 2DQVA 3USDA 2UXAA 5I56A 3LSXA 1UTHB 4DXBA 4GLIA 3DLNA 4QFPA 4RY1A 4PFYA 2HEUA 4GWOA 4YMAA 3IJOB 2UVHA 1MQJA 2I0CA 4TLLB 1PEBA 4JWXA 3TTKA 3FJ7A 4UA8A 4XIGQ 1P1UA 3UGWA 3S9NC 3VV5A 1Y3QA 3O6GA 5LOMA 3B7DA 5I59B 1Z7NE 1SI0A 4F3PA 2H9BA 3E13X 1QULA 5TU0A 1I6AA 4OFJA 2CMOA 3M3FA 1R6ZA 5JK4A 3PPRA 1MXUA 2DVZA 2Q2AA 2QS3A 3KZGA 1ZU0A 1DSNA 2DS9A 2F6PA 3HHGA 2BJJX 5H8HB 3IO6A 3U1OA 4QFNA 2X26A 1XT8A 4KYSA 4R75A 3HV1A 2UVJA 4LATA 4KCDA 1B46A 1B6HA 2XXIA 3TTRA 2DXYA 4AB5A 3SEUA 1LSTA 4IO6A 2VOZA 5DVJA 3MVXA 4QFLA 4U22A 2QPQA 4U1ZA 1AH5A 4POXA 3MZBA 1M5BA 1OVTA 2ONSA 3O2AA 4PFTA 3N94A 1LLSA 3KOSA 3TELA 3S9EA 1JVXA 5HM4B 3R7XA 1Y1ZA 5A5XA 3CSBA 4Z7EA 4ZZAA 2H99A 1B5HA 3PGFA 1B32A 2VHAA 3PUWE 1L5TA 4NEDA 3IK6B 3IOTA 4E0WA 4MBPA 2Y7RA 3IOWA 3MP6A 4JBZA 1XVYA 4P0GA 5I2KB 4WXJA 1N04A 4Q8RA 2O1MA 2O7UA 3RY3A 5HPQA 4LA9A 1NNFA 2Q8JA 4NMYA 5JEIA 1YTVA 1BP5A 4ZEIA 5I56B 3M3KA 1B58A 2UVIA 4RK9A 3DM0A 1A55A 5K2YA 5HBCA 2Q88A 5TP9A 2I4CA 2HXWA 1FCKA 1HSJA 3TKDA 2DOJA 3MW0A 5CRYA 1ZIUA 2VD3A 2UVGA 5H8SA 2YPNA 3OENA 1ELJA 1GGGA 3F11A 1ZBMA 1UIUA 3PPPA 2R6GE 3C34A 3RGYA 3GXAA 5JTYA 1YCJA 1NMUA 2V3TA 3FXUA 3G3IA 1EZOA 1I6QA 1MPCA 3MZ9A 1LFGA 4G2ZA 2YJPA 4K3FA 2ZNTA 3H3GA 4GQOA 4E0XA 4Z0IA 3L6HA 1USYH 2ZMBA 1PBPA 3GLBA 3K0VA 4ONYA 4PFWA 3CFXA 1Y4TA 1WDNA 3U92A 5DTBA 1IQ7A 3VE1B 3FATA 3CVGA 4YICA 2ZNUA 2DSFA 4HS7A 1FQEA 4EUOA 1N7WA 4LQ2A 1P1OA 5A5XB 1T0KA 2D3IA 1CB6A 4ZDMA 3Q26A 1H45A 5FHOA 4C0RA 1FQAA 3FD3A 4EQBA 3VVDA 3TDJA 4RNSA 1Y1MA 4KCCA 3UA8A 2FNCA 4YKKA 3CG3A 5AA2A 3QYTA 4NF5A 4JSDA 2XD2A 5FHNA 3O66A 3B6WA 5TP9B 4FJPA 3FJMA 3SEYA 1MM7A 1N76A 3U72A 2QMXA 3GBBA 1JW1A 1JW5A 2H25A 4GL8A 3IOVA 2O51A 2OK2A 3IB2A 2OWTA 2F5XA 3O97A 1RKMA 2G29A 2I0BA 4RJZA 4BDMA 4GXAA 5EYFA 3ILTB 4EDPA 5DT6A 5BWJA 1IUDA 4R6KA 3KJ7A 2H5YA 5I58B 4X1BA 3CRBA 4R6YA 4ZEFA 2H98A 3TQLA 3IORA 4ECFA 3IX1A 1BLFA 3MVWA 2DE4A 3FXRA 4GF8A 4RPNA 3O6IA 1NKXA 3EHTA 2DWAA 2YLNA 2RCBA 3CFZA 2GHBA 2Q89A 1M5DA 4U23A 5TPAA 3OXNA 1SYHA 2NVUB 1AOVA 3RTWB 4FEDA 1XVXA 2HCAA 1HSLA 3OD7A 4G77A 3PUVE 3SEVA 4FIMA 3IAZA 4ZS9A 3TPAA 1MXVA 1P1NA 1ANFA 1PDAA 4IB2A 3E9XA 2XXXA 2KLFA 3VXBA 2ZNSA 4XKPA 3TYHA 3K00A 3VLWA 3RN8A 1LAXA 2I49A 1PC3A 1Y3PA 4P0IA 2XXHA 4YB7A 2Y7IA 2OZZA 2AYSA 3LC8A 4QSEA 3PUXE 2ZYKA 3RT8A 1SW4A 5DVFA 2XD3A 3PU5A 5L9OA 4FATA 1MY1A 4EQ9A 5AA2B 1M5FA 3K02A 4NF5B 5IKBA 3EN3A 2ANJA 3A09A 3V5AA 1FTOA 4NF6A 1B3FA 3B6QA 1N3XA 2P0SA 1IITA 1FQFA 2XXYA 1YAEA 4XKQA 3TTMA 2ZYMA 4OHNA 3CR9A 1O7TA 2PBWA 2Y7PA 1MPDA 3T9XB 3TCHA 1Q35A 3HPIA 4F1UA 2Y7WA 1MY2A 2F35A 1URDA 1S50A 4Q5TA 3OO7A 3SERA 1VSOA 5CBSA 1Y3NA 4R72A 4DCXA 2HZKA 1OLAA 5AA3A 3OEKA 2O84X 1WODA 1A99A 4MFIA 4BDNA 1B1XA 1MQDA 4I62A 2E0SA 2XXVA 4H0WA 3KN3A 3K2DA 1MXWA 4DIGA 4R74A 1SW2A 4KD5A 3DP6A 3QIMA 4NF8A 2PX1A 1IXHA 2DE2A 3OEMA 2F6GA 5TPAB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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