1FW0A

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with kainate at 2.0 a resolution
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
publication title Mechanisms for activation and antagonism of an AMPA-sensitive glutamate receptor: crystal structures of the GluR2 ligand binding core.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 76
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fw0A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fw0A01
2X26A 3JV9A 3KEIA 3TZAA 3BFTA 1R6ZA 5TU0A 5I2NA 5H8QB 2ZYOA 3FV1A 1MY0A 1N3XA 1OQHA 3UORA 5I56A 5IAIA 1M5DA 4R6KA 2F6GA 3K4UA 2GRVA 2ZYMA 2NUVA 3O6GA 1A8FA 3IOTA 3FUZA 1P1QA 4UA8A 1MDQA 1N7WA 2ZNUA 1B40A 3B7DA 1UIVA 2GHBA 2ONKE 3ZKKA 3V89B 3K02A 1UTHB 4OHNA 4M1VA 2O7IA 1SI0A 1SQYA 2PBWA 4AB5A 4ZDMA 4LQ5A 3K6XA 5I2NB 2O6AA 3PUXE 1RYXA 3CSBA 4IO7A 5I56B 1GTKA 1OIBA 2XD3A 1LFGA 1Y3PA 2DOJA 4X1DA 1B0LA 3UGWA 3E3KA 4U4XA 3CI8A 4RPOA 1M5BA 2O1MA 3LBSA 4ZEDA 1H76A 2DWIA 3MPKA 2Y7PA 3ODBA 2QS3A 4Q8RA 4IY5A 3HSTA 2OZZA 1N84A 1ZTYA 3TAJA 3CVGA 2R6GE 4H67A 3W9WA 2DXYA 1MS7A 4LP2B 4F39A 4ZEKA 4ZEBA 3TTKA 3M3LA 2DS9A 4THIA 1CB6A 2HQ0A 2DVZA 4LZ7A 4MBPA 1XC1A 4BDMA 4NF6A 1QKAA 4NMYA 1JVYA 1JW5A 4N6PA 2XX8A 4QHQA 4ISUA 4I1DA 3PGFA 1B4HA 3H03A 3FJGA 3H3GA 4YKKA 4EXLA 5J1DA 3Q28A 2B65A 3C9HA 4FJPA 3SEXA 2XXQA 1XOCA 1B5IA 3IAZA 4PE5B 3FATA 4LONB 3DM0A 3R6UA 1NMUA 2F7BA 2WKYA 3TELA 2E0SA 3O29A 2RC8A 4BDNA 2Y7KA 4XKPA 3H4ZA 4AQ4A 4EQBA 3TODA 1B1XA 3BBRA 1LB9A 4I8CA 1TXFA 3PPRA 4NF6B 1YTVA 3K6WA 4TOZA 2F36A 5F1QA 3F11A 3G3FA 1DPEA 1MY4A 4JXIA 5CBSA 4RK9A 2QS2A 4TLMB 3MJNA 3C35A 1FQFA 3OSRA 3VLWA 1MY3A 3MUQA 5CI5A 1NKXA 3TYHA 4NF8A 2PMSA 3WAEA 1LBBA 3PD9A 4O3CA 1Y9UA 3K1PA 1B4ZA 1J1NA 5ISUA 2GH9A 3MVYA 3HHFA 3IL1B 4F1VA 2DE3A 1TFAA 1IZ1A 3O97A 1BIYA 3KBRA 3MVZA 4NE4A 4F3GA 3IJXB 2VOZA 4X48A 3Q27A 4F2OA 4FATA 1MQGA 3LUYA 3TFLA 1EH3A 2ESNA 5I2KA 2Y7WA 5I57A 5H8NA 1LBCA 1A99A 3UP9A 5CBRA 1Z7ME 3LC8A 2ZXTA 4NF8B 4Z7EA 4NWDA 3MZ1A 4R2BA 1MPBA 4DDDA 2R9JA 3VE1B 3VDFA 1EZPA 2V3UA 1B52A 4IO2A 1SW2A 3FVOA 2DE2A 1Y1MA 3MZ9A 4JBZA 2QL3A 3DELB 3QSLA 4QSEA 3ILTB 2OWSA 1IIWA 3U72A 2XXIA 4I62A 4TQUQ 4ZZAA 1ATGA 3H06B 2XXWA 1B3GA 4R74A 1TT1A 1N76A 2I4BA 2DWJA 3RGYA 1MPDA 4KD5A 5I2KB 1POTA 5I57B 5H8NB 3B6QA 2HZKA 4EQ7A 4L17A 3SKPA 3IOWA 4EQ9A 3H6VA 1H43A 5ELVA 3T9HB 2F35A 5DTBA 3PUVE 3SDFA 3PMVA 5TPAA 3RTFB 4HCWA 5TP9A 4R6HA 1MG1A 2Z22A 3MZBA 2DWHA 3CG1A 4PFTA 5H8SA 4F3SA 3RUMA 3IB0A 3K1MA 3T96B 2F7AA 5FTIA 4F19A 1SW5A 4GRKA 4OERA 1KWHA 1IXCA 3SETA 3GZGA 4ELPA 4PP0A 3KOTA 5CM6A 1MH3A 4EXKA 4MH5A 3VVFA 4GF8A 4U2RA 2Q89A 4R6YA 3GBBA 4ONYA 2X7QA 3U1OA 4GL8A 4YMAA 1FQCA 3LSWA 1IITA 3LSLA 1YCJA 4XKNA 5TPAB 5LOMA 2NWJA 3QYTA 5TP9B 1P1UA 4R73A 2Z23A 1IXIA 4RXLA 4YKIA 3FZVA 1L5TA 3OO8A 1PC3A 3QUJA 3S9LC 3HV1A 3KN7A 3C4MA 3N6UA 4WEDA 4DXUA 5A5XA 1QUJA 4Z0IA 2Z8FA 3OENA 3S4UA 2Q2CA 4OFJA 2CZLA 1N3WA 5L9MA 3OEKA 2H25A 4F22A 2PYYA 1M5FA 4QFLA 3T9VA 3C36A 5CC2A 1M5CA 4C1UA 1USYE 4LVQA 4DZ1A 4H8JA 4NEDA 1A54A 4G8MA 3CFLA 4ELRA 5FHNA 2HZLA 4O3AA 4G68A 1XVXA 4GL0A 4ZEIA 4GD5A 3VXCA 4QFOA 5A5XB 2QS4A 2M8CA 4GWOA 4KR5A 3FJMA 1XHYA 2R71A 3CRBA 3RY3A 4EUOA 3K01A 3K6VA 2HEUA 2OJTA 4G8HA 2HCAA 4RA1A 2E1SA 3OOAA 4RNSA 3OEMA 1PB8A 1D9VA 1VE4A 4OWDA 4IO4A 4F2QA 3DLNA 4ECFA 4QFNA 1EZ9A 1LAGE 3M3KA 4DIGA 1Y3QA 2DXRA 4IO3A 2X7PA 1T0KA 4H8IA 5L9OA 4G68B 1WODA 1LCTA 1US5A 3K1NA 4FECA 5CMKA 4OETA 3EHSA 3FIRA 2PX1A 3WAFA 4E0XA 4OZ9A 4OVJA 4QFPA 1ZLQA 3N5LA 4KHZE 1R1NA 4JWXA 1B46A 3W15C 4P11A 1QW0A 2AL4A 3LR1A 4KI0E 5JK4A 3IOVA 4OESA 1MXUA 1HSEA 1Y3NA 2LAOA 4Q30B 4YZZA 3R7XA 1HSJA 3KG2A 4OFLA 5EHMA 3RN8A 1VFDA 1LAXA 3ZS6A 3KSXA 4QRZA 3A3UA 4POWA 4OENA 1UIUA 2I3WA 1II5A 1LFIA 3RNNA 2XX7A 1JNFA 1DPPA 1MQIA 3TTMA 4H1XA 2UYEA 1NNFA 4X9TA 5ICTA 5HPQA 4JWOA 1MXWA 3MAMA 1IXGA 3RLFE 3P7IA 4MLQA 4O3BA 1NH7A 4ELOA 3A3CA 4K3FA 5ITPA 1SYHA 3G3IA 1PEBA 1AMFA 3ZKLA 3MQ9A 1B7ZA 2Y84A 3UN6A 4PETA 3FASA 4ZE8A 3VVEA 3H6WA 1RYOA 4Q0CA 4R75A 4AB6A 1PBPA 3S9EA 4G77A 4LZ8A 4FE8A 4PFYA 4GQOA 2RF1A 1AH5A 1SW4A 3MP8A 3TDJA 4LATA 3OXNA 1M5EA 1PDAA 3KZGA 2RC7A 5AA4A 3I6VA 1H3DA 3HHGA 2DQVA 3ECRA 2A5TA 4YKJA 3H7MA 1B3FA 3SEUA 3KJTA 1LGBC 2F78A 1DMBA 3MBPA 3V5AA 4KYSA 3CFXA 3HPIA 1FQEA 3RTWB 5HM4B 1ANFA 4F1UA 2O7UA 2DVCA 2G29A 2IEEA 2W7YA 4OMBA 2FNCA 3U93A 3CIJA 2HFBA 3RT6B 1JEVA 3USDA 3G3KA 5AA4B 5CMBA 5HBCA 1XVYA 5AA2D 2A5TB 1SD3A 3C33A 1BKAA 1TWYA 3VLVA 4P0GA 1DTGA 2F6PA 4I9DA 2V84A 3UA8A 3U94A 2F7CA 1DSNA 4KYEA 4U22A 2I0CA 3M3FA 4HS7A 1B3LA 3SEWA 1MH4A 4KFQA 2UYFA 3MWBA 1LCFA 3VFJA 3N6TA 1MM6A 3IOUA 4KCCA 1Q35A 3L6GA 3FXRA 4FIMA 2QS1A 3L6HA 2I4CA 2UXAA 2Q88A 5CRYA 5M2VA 3TQLA 2I49A 1OLCA 1B5JA 4H5FA 3IX1A 1F9BA 3KOSA 2UVJA 3MW0A 3VV5A 5BWJA 1B7HA 4GVOA 2YPNA 3DP6A 1QULA 3UK4A 3S2VA 3VLUA 1MY1A 3O28A 4PFUA 1SBPA 1B2HA 4NF5A 4YAHX 1B3EA 1A7LA 2ZNSA 3SEVA 1JQFA 3I3VA 2I0BA 2KLFA 2REJA 4YKPA 2Q8JA 4C1TA 1OVTA 1MXVA 3W9VA 1MM7A 4EDPA 5F7VA 1YAEA 4YB5A 4R2FA 1GGGA 4YB6A 2D5WA 5AE4A 3QK6A 3ONMA 1IEJA 1NNPA 2O68A 1JW1A 1NFTA 2ZYKA 3PPPA 2XHDA 2HXWA 2RKMA 4C0RA 2QJEA 2V25A 4NWCA 4IGRA 1R9LA 4G4PA 2O51A 3G7WA 2NXOA 2QSXA 3O66A 2Y7IA 2F34A 4NF5B 1AIVA 1JW4A 2B3FA 2O69A 2HAVA 4F31B 4HCYA 3D4CA 3FJ7A 5DVFA 1SYIA 3IJOB 4MFIA 2P0SA 2VD2A 2AYSA 2V93A 1ZJLA 5I58A 2ANJA 1QJMA 5JEIA 3OO9A 3MVWA 1P1OA 4YICA 3TCHA 4WKMA 1NH8A 1VR5A 1ZIUA 1MQHA 5AA1A 3CFZA 4YU0A 3OMBA 1I6AA 3FVKA 4U21A 3PPNA 1CE2A 4IO6A 2H98A 3JYRA 3SESA 3O6IA 4DLDA 2H4IA 2QPQA 2Z8EA 2DSFA 2THIA 1TFDA 1URSA 4JB7A 4XTCQ 3FVGA 2DE4A 1NNTA 5BUUA 2Z8DA 2I48A 2F97A 3A09A 4XXUA 1S7YA 5I58B 3PUYE 4G68C 4OFOA 2XXTA 2XX9A 1B32A 4F1YA 4KCDA 2PT2A 4GOTA 4F3BA 3O2AA 3QXMA 3OD7A 1OMPA 5DVJA 2OK2A 1US4A 1PB7A 4LQ2A 4ZECA 2XXUA 3BKIB 3TUSA 3KN8A 1POY1 1I6BA 4PFWA 2Q9TA 1URGA 1B6HA 4QSCA 4U4SA 3T66A 1FQAA 1FQBA 1FCKA 3K6UA 2CMOA 3EN3A 1MXXA 1LFHA 5FHMA 2BJJX 2OBGA 3FXUA 2ZYNA 4KYDA 3EQ1A 1PB9A 3G3HA 1R9QA 1N04A 1OVBA 4LA9A 4RY1A 2I58A 4FEBA 3E9XA 3MP1A 2OLBA 1WDNA 1SDXA 3T22A 1JEUA 3IK6B 1ZMGA 1EU8A 1SI1A 3U8QA 4JWYA 4RJZA 1A40A 3QAXA 3FGSA 4ND9A 3EF7A 4G2ZA 2ABHA 1ELJA 1QUKA 1GVCA 1N7XA 2H5YA 4KPTA 1S9TA 4IO5A 1QKBA 1QUIA 1AOVA 4UACA 3K00A 3O9PA 1B3HA 2NVUB 4U23A 2VHAA 4U1ZA 3PPQA 5FHOA 3TCFA 4YB7A 1LAHE 2D3IA 3RPWA 1PBQA 1SVXB 2ZMBA 3G3JA 5CMCA 3UIFA 3GXAA 2VD3A 5H8FA 4ESXA 4WEPA 3FVNA 2YJPA 4JDFA 2V3QA 2XXRA 4ESWA 3SERA 4DCXA 1I6QA 3IO6A 3S9NC 1OLAA 3PUWE 1P1NA 5AA3A 5AA2A 4NF4A 2A5SA 1EZOA 2DP8A 4LUBA 3TEPA 3KSJA 1VFEA 2PVUA 2F8DA 1B0HA 2NOOA 1Q1KA 2XXHA 1VSOA 1XT8A 4M4GA 1D3KA 5JTYA 4DE8A 4ZEFA 2PT1A 1O63A 3GLBA 3QUFA 4TLLB 4OXVA 3KN3A 1ZKBA 3C34A 1XS5A 5H8FB 4HTGA 1ZBMA 2RCAA 4GIZA 2XXPA 5I59A 3T93B 1FTMA 4POXA 5KZTA 1FTOA 5AA2B 4NF4B 3ZSFA 3ILUB 3IO4A 4DXBA 5DT6A 1N0TA 2QRYA 4GXSB 3IB1A 3TPAA 4ZS9A 1BLFA 4QF9A 4GLIA 4H65A 2O1LA 3MC2A 2RINA 3E13X 1P99A 1HSLA 3TTNA 5JTYB 1MDP1 2ALUA 1IXHA 2ONSA 5DEXA 1B58A 1B9JA 3Q25A 1P1WA 1JVXA 3QIMA 1WVJA 3OSQA 1B5HA 4GXAA 3FV2A 1A8EA 1B05A 4H0WA 2V3TA 4EF2A 1ZU0A 4JSDA 3B6WA 1LAFE 1GR2A 3VXBA 5I59B 2I3VA 2XXYA 4BDOA 4E0WA 1MXZA 4QFKA 4OEVA 4Q5TA 1B51A 4DCYA 1Y4TA 1NL5A 4MLVA 5ICQA 1IUDA 2FA7A 4OYVA 2DWAA 1SW1A 2Q2AA 4H6DA 4MF3A 1D9YA 3TQWA 1USYH 3TTLA 4RPNA 5DEXB 3BFUA 4PQJA 3MVXA 3V83A 3LSXA 1MQJA 3Q26A 5K2YA 3G3GA 4RYAA 1Y1ZA 3C32A 3B6TA 2OWTA 1MXYA 3RT8A 2F5XA 2OCUA 3PUZE 1BTJA 4ZZEA 4JSOA 3HCQA 4YMBA 1DTZA 1GV8A 1FQDA 3T9XB 3MP6A 4F3PA 5CMMA 4FEDA 1B1HA 2P2AA 3EHTA 3E4RA 3TTRA 2QMWA 1I69A 5I84A 1FTJA 4HW8A 2UVHA 5L8DA 3C31A 5EHSA 3KJ7A 4RK2A 3GBAA 2I6EA 3PD8A 2O84X 3EHUA 3EPEA 3IB2A 4WXJA 1LB8A 3IORA 1O64A 2DYXA 4GFRA 4DXCA 3VVDA 3HO7A 1URDA 3PPOA 4QSDA 3S9MC 5H8HA 4KQPA 5ITOA 3RQTA 4R72A 3K0VA 2B3BA 2FYIA 1FW0A 4EF1A 4N07A 4IY6A 3THIA 2RCBA 1YPNA 2UVGA 5KDTA 1Z7NE 3R26A 2Y7RA 4R9FA 5B70A 3FXQA 2UVIA 1OQGA 3CSGA 3OO7A 5FTHA 1UTBA 5EYFA 4NTLA 3U92A 1FTLA 2XXVA 2VP1A 1LSTA 2AIXA 1IQ7A 2XXXA 3I5OA 1UQWA 5KCJA 2H99A 1D4NA 3V8XB 3KGCA 3N26A 2HAUA 5H8HB 1O7TA 4G8NA 1S50A 3M8UA 3JZJA 1FTKA 1H45A 1AL3A 4IB2A 2AL5A 1H44A 1MQDA 1BP5A 1Y20A 3CR9A 1Y4CA 5L9SA 1DOTA 2G93A 2VGQA 2QMXA 1NNKA 3O6HA 3N94A 3PMWA 5IKBA 2ONRA 5KDTB 3D4GA 3H6TA 1MRPA 4BDQA 4F29A 1QVSA 4FAJA 4BLAA 2P1SA 1UTBB 3CG3A 3DP8A 1MY2A 4XKRA 4F18A 5KCJB 4U1OA 1MPCA 5DYHA 4P0IA 4BDRA 4FORA 5B7DA 4ELQA 3OO6A 3Q29A 2RC9A 3FD3A 2GHAA 4XIGQ 3PU5A 2H9BA 3KFMA 3TMGA 3PMXA 4XKQA 4IGTA 5H8QA 4BDLA 2YLNA 5K2XA 2D21A 3IR1A 4R9GA 3H6UA 4N13A 1B7UA 4OTEA 4X1BA 5DVIA 1JETA 4H5GA 3OELA 1A55A 4LZ5A 3LSFB 3K2DA 3SEYA 3TKDA 2IA4A 3AXFA 4OQOA 3MPLA 1LLSA 3T9UA 3DP4A 4OEUA 3PV0E 1UTHA 2XD2A 3HN0A 1RKMA 2GFEA 4ZE9A 2REGA 2ZNTA 3TCGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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