1FW0A

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with kainate at 2.0 a resolution
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanisms for activation and antagonism of an AMPA-sensitive glutamate receptor: crystal structures of the GluR2 ligand binding core.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
total genus 76
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fw0A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fw0A01
4MFIA 1LAHE 4RA1A 1N84A 4XKRA 2RCBA 4K3FA 4F3SA 1MY3A 1Y3NA 3M3FA 5J1DA 3C34A 3KSJA 4G8MA 4RYAA 2OBGA 5CMCA 2Q2AA 4DLDA 2ONKE 2REGA 4E0WA 3FZVA 3N26A 4DE8A 2RINA 4IGRA 5DEXA 5I59B 3VLUA 5H8HA 3MVZA 5EHMA 2Y7KA 3TQWA 3G7WA 1MS7A 1OVTA 4KCCA 2R71A 2OCUA 4U4SA 4ZEKA 4IY5A 4KYDA 1MQHA 2F6PA 3ILUB 3FVKA 1OIBA 4XTCQ 3WAFA 1RYXA 3TEPA 4GVOA 3IOVA 1BP5A 1R6ZA 2HFBA 2OJTA 3DLNA 3MVYA 3PUVE 4GL0A 4LQ2A 4RPNA 3G3FA 5H8HB 1UQWA 2Q88A 2VHAA 2XHDA 1MPDA 2Y7PA 3OO7A 4GL8A 1A8EA 3RPWA 4KFQA 3LR1A 3FVGA 4UA8A 2UXAA 1WVJA 1EZOA 3N94A 3TYHA 1RYOA 1QVSA 1Y4CA 3VDFA 2B65A 4BDQA 4TLMB 1DPEA 2AIXA 4FJPA 1LFHA 1SD3A 4WXJA 4Q30B 1D9VA 4JSDA 5AA2A 1IXCA 3C36A 2V25A 3FV1A 4PE5B 4FEBA 2OLBA 1DTZA 3RN8A 1SQYA 1B46A 3FD3A 4I1DA 4LVQA 3EHSA 5F1QA 4ZEIA 1MDP1 4IGTA 4M1VA 5DYHA 2QSXA 2B3FA 3IJOB 4EQBA 3SEXA 1FQFA 4LQ5A 3CG1A 2UVJA 3UA8A 1RKMA 3Q25A 1IITA 1B3EA 1LAFE 2ZNUA 4JDFA 2DE4A 4HS7A 1OLAA 2I6EA 4OHNA 1Y3PA 2DQVA 1H43A 4WKMA 2YLNA 3OD7A 2UYFA 3ONMA 4AQ4A 2D5WA 4LUBA 2O69A 3PPRA 2OZZA 3OMBA 3B6QA 3BKIB 3R7XA 2QL3A 5I59A 4NF6B 3H3GA 1B4HA 4EQ7A 1FTLA 5LOMA 5EHSA 5AA4A 3BFUA 2P1SA 2AL5A 3MBPA 3TELA 4F3GA 5CM6A 2HZKA 4DCYA 1MQDA 2XD2A 3FUZA 1AH5A 2ZYKA 3SEYA 2F34A 1B3GA 1B4ZA 4NF4A 3CFXA 3U92A 1XT8A 2DXRA 2WKYA 3KJ7A 1B2HA 2PX1A 4TOZA 4ZE8A 1OQGA 4EUOA 4QRZA 4RXLA 4XKPA 2F36A 5IKBA 1HSLA 1UTBB 2ESNA 3IOTA 2DOJA 3UGWA 5I56A 2A5SA 2UVGA 2XXQA 3G3JA 4JBZA 1QUJA 4KYEA 3SDFA 5I2NB 3K6XA 4N13A 1MY2A 5IAIA 5DTBA 3K0VA 3O2AA 3O6GA 2FYIA 3PD8A 2D21A 5K2XA 3I6VA 3W15C 1NMUA 4BLAA 4LZ8A 4ONYA 2NXOA 2Y7RA 3FATA 3IORA 5I56B 2ALUA 3K00A 3H6WA 4YB7A 3UP9A 1GGGA 3RT6B 3Q28A 2DE2A 3C31A 2DSFA 3H6TA 3RTFB 1QUIA 2YPNA 3FASA 1QULA 3IB2A 4P0IA 3JZJA 1MY0A 4KD5A 3RT8A 2Z22A 1SI0A 3O6HA 1UTHB 2ANJA 3Q29A 4WEPA 5CRYA 1P1UA 2O84X 5JTYB 1IUDA 5HM4B 4FE8A 1IXIA 2XXRA 2O51A 4HCYA 4POXA 1GR2A 2Q9TA 4YB5A 3CFZA 1F9BA 3K1MA 4QSDA 3VVDA 4EQ9A 4ZEDA 2QS2A 1JVYA 3E9XA 3ZKLA 1B5JA 2QMXA 1T0KA 4R2FA 3P7IA 1Y3QA 3HHFA 2XXIA 3OEMA 3HN0A 1BIYA 2ZXTA 1GV8A 1YPNA 1O63A 1NH7A 2GFEA 3TFLA 1Y1ZA 3THIA 3O66A 1ZLQA 3K02A 5ITPA 1MY4A 1ZIUA 4I9DA 3GXAA 5AA4B 4F31B 3KBRA 1QUKA 1ANFA 3TDJA 1OLCA 5ISUA 2I0BA 3K4UA 3H6UA 1Y4TA 5KDTA 1MQIA 3PD9A 4DIGA 5FTHA 1LCTA 2LAOA 1JW5A 3KGCA 1B58A 1JW4A 3U1OA 3TZAA 4QSEA 1NFTA 2E0SA 3VE1B 5FHMA 3OOAA 4XKQA 4ZDMA 3TAJA 1A7LA 3C35A 3I5OA 3L6GA 3RQTA 1PB7A 2M8CA 1EZPA 1FTMA 3B6TA 4LONB 1I6QA 3LC8A 3LUYA 3O97A 4U2RA 5CMBA 1FQBA 3UIFA 1IXGA 4KHZE 4POWA 3VVEA 5B70A 4GXSB 4MLQA 4UACA 1NL5A 1PBQA 4X1DA 1ELJA 3SEUA 2PYYA 5AE4A 4KQPA 4G8HA 3EN3A 4GD5A 2VOZA 3TCGA 3TTLA 2E1SA 3USDA 3B7DA 3WAEA 1S9TA 4GWOA 4IO6A 4BDLA 2ONSA 4TQUQ 4KYSA 1N0TA 2XXTA 4PFYA 3CIJA 3HSTA 4NWCA 4P11A 1VR5A 3H6VA 1PC3A 3EHTA 2Z23A 3H4ZA 1H76A 1LB9A 1UTHA 2Q2CA 3ODBA 5ITOA 3VVFA 5CBRA 3K1PA 3O29A 1B1HA 1NH8A 3BFTA 1I6BA 4QF9A 1LCFA 2H98A 2HXWA 1VFEA 1HSJA 4G68B 4OESA 4X48A 5HBCA 1N04A 4Q5TA 1NNFA 5H8QA 4GFRA 5I84A 3IJXB 2A5TB 1VFDA 3OEKA 4OEVA 5JK4A 5DVIA 5HPQA 2V3QA 1DTGA 1US4A 4NF8B 5FHOA 3EF7A 3SETA 2QS1A 5FHNA 3B6WA 4PFTA 5KZTA 3QUJA 1FQEA 1FQDA 2CMOA 2DXYA 1DPPA 1OMPA 2PT2A 4G68C 5M2VA 3TQLA 4C1TA 1IEJA 2DYXA 1MG1A 3IX1A 1J1NA 4ZZAA 3DM0A 4ISUA 1MQGA 2X7PA 3F11A 3MWBA 3VV5A 1LSTA 2Z8DA 1KWHA 3KOTA 2QS3A 4GF8A 4YB6A 1A54A 5H8SA 4DDDA 1S50A 3FJGA 4R6HA 3IO4A 4IO7A 3T9VA 1AIVA 3K6UA 1XHYA 3MZ1A 3QAXA 1LLSA 1II5A 1N7XA 2DWIA 3LBSA 4IO2A 3PUXE 1LB8A 5DVFA 3PMWA 3VLVA 3TCFA 2NWJA 4F19A 3MPLA 3ZS6A 1QKAA 4HCWA 2O6AA 1URDA 3QK6A 4R73A 3MUQA 4OENA 5I57B 4RY1A 5TPAA 2THIA 4RJZA 4G77A 1B7UA 2H5YA 4GIZA 2KLFA 4GQOA 5TP9B 3UK4A 4Q8RA 3IAZA 3DP8A 4OQOA 1XOCA 2OK2A 4QFKA 3ZSFA 5KDTB 1Y9UA 3FV2A 4JWYA 3GZGA 4ELOA 3CR9A 1L5TA 4R9FA 4ESWA 4GRKA 3IR1A 3IK6B 4NEDA 3V5AA 4F3PA 4P0GA 1D3KA 2FNCA 4F2QA 1EH3A 3ILTB 2F7AA 4MF3A 1URSA 4OEUA 1QKBA 3MW0A 2NVUB 3SESA 1XVYA 4JB7A 3CG3A 2I0CA 1D4NA 1N3XA 4DCXA 1LGBC 2F7CA 4XKNA 1ZMGA 1I69A 4N6PA 1LBBA 2RC8A 3M3KA 3A3CA 3CI8A 3O9PA 2XD3A 3A09A 1GVCA 4JWOA 1MPBA 3K2DA 2FA7A 2DE3A 3PPPA 3S9EA 3FIRA 4U21A 2F35A 3HO7A 3KG2A 1O64A 4ZS9A 1PBPA 4LZ5A 4Z7EA 1A8FA 2GHAA 1B32A 2HZLA 1R9QA 4R2BA 4ELRA 1P1QA 3N5LA 1AOVA 3G3GA 3KN3A 4R6YA 3R26A 4X9TA 5BUUA 3R6UA 4QFPA 1A40A 1EZ9A 5ELVA 5I2KA 4NE4A 1B40A 3MP1A 3GLBA 4ND9A 3S2VA 2O68A 1M5DA 1I6AA 2XXPA 3MZBA 3DP4A 4FECA 4ECFA 1YTVA 2UVIA 4ELQA 1SBPA 1Y20A 3GBAA 4DXBA 5CMKA 4XXUA 3T9UA 4OMBA 3OO9A 2ABHA 1IIWA 2F6GA 3SEWA 5ICQA 1QW0A 2NUVA 2V3TA 4H8IA 5AA3A 1NNPA 5BWJA 3D4CA 1TXFA 2A5TA 2XX8A 1BKAA 3MAMA 2QS4A 2UVHA 1MPCA 4KCDA 4OZ9A 4U1OA 4FAJA 1JVXA 1B5IA 1SYIA 3H7MA 5CI5A 5CC2A 5KCJB 4YKKA 1TFDA 3KFMA 2O1LA 1B51A 4NF4B 2HCAA 2RC9A 4L17A 4RK2A 2XX9A 2V3UA 5L8DA 2GH9A 4F3BA 4KR5A 5AA2B 2NOOA 3CSBA 3RUMA 3S9MC 4LA9A 3OELA 4NF6A 1LFGA 1UTBA 1Q1KA 5I2KB 3C32A 3I3VA 1P1NA 1B3LA 1LBCA 3A3UA 3ECRA 4QFNA 5TP9A 4KI0E 3C33A 1SW2A 2DVZA 3C9HA 3SEVA 3T66A 1B3HA 1DOTA 1R9LA 2B3BA 2XXYA 3S9LC 3QYTA 2XXWA 4OTEA 5CMMA 3OO8A 3TMGA 4MH5A 5B7DA 3S4UA 2Z8FA 1URGA 4IY6A 1B7ZA 3QSLA 1MDQA 1AL3A 1BTJA 4ZE9A 1MY1A 2H9BA 3G3KA 2HAVA 3PGFA 3UORA 4DXCA 3D4GA 3RTWB 3OSRA 4DXUA 4ELPA 4YMAA 5KCJA 1ZTYA 3PPQA 4YAHX 1JEVA 2VGQA 1NNTA 4F18A 3MVXA 1GTKA 1PB8A 1JW1A 2REJA 4EXLA 2Z8EA 4OWDA 2DWHA 3LSLA 3FGSA 4OETA 4PQJA 3SKPA 5H8FA 1P1OA 1WODA 1MXXA 3IL1B 4PFWA 4R72A 3TUSA 2RCAA 3RY3A 3W9VA 1B1XA 3PUYE 3U94A 1MXYA 4BDNA 3K1NA 1US5A 2PBWA 2I49A 3CFLA 2G29A 4G8NA 4FATA 3TTKA 1A99A 5H8FB 3IO6A 1MQJA 4LATA 3RGYA 4U22A 4R75A 3TPAA 4H6DA 4WEDA 1SW5A 4I8CA 2P0SA 1B0HA 3RNNA 4F29A 4M4GA 5CBSA 3MP6A 4HTGA 3FXRA 1M5FA 1TT1A 2Q89A 1MM7A 2I58A 4H67A 3IB0A 3H06B 2VD2A 2OWTA 4F1VA 3V83A 1LFIA 2I48A 2ZNSA 3DP6A 3QIMA 3QXMA 2RC7A 2X26A 2UYEA 5I58B 1LAXA 4KPTA 2ZYMA 4O3CA 2P2AA 2XXHA 1Q35A 2Y84A 1H3DA 4U1ZA 3PV0E 2PMSA 4H5FA 2ONRA 4I62A 2X7QA 1B3FA 1UIUA 4DZ1A 3VLWA 1M5EA 3K6VA 1R1NA 2QMWA 1OQHA 1MH3A 1S7YA 3AXFA 3FVOA 4O3BA 4TLLB 1IXHA 5AA1A 1XVXA 5L9SA 2XXVA 2XXUA 2BJJX 3TTMA 5H8NB 3KSXA 1SDXA 4JXIA 4OXVA 5AA2D 4RPOA 3MZ9A 1B6HA 4YICA 2VP1A 3TTNA 3HHGA 3TODA 3QUFA 2F8DA 4NF8A 5EYFA 4F39A 1N7WA 2DVCA 1H44A 1MRPA 3M8UA 1B05A 4YU0A 1FQCA 3IOWA 3TTRA 2O7IA 2ZMBA 4BDRA 2F78A 3U93A 2HQ0A 2F7BA 3H03A 1POTA 3N6UA 4G2ZA 4YZZA 1AMFA 4H5GA 1BLFA 2F97A 3L6HA 4QFLA 4RNSA 5TU0A 3T9HB 3T93B 4HW8A 3M3LA 4PP0A 2I4CA 1EU8A 4PETA 1PDAA 1SW1A 2F5XA 4YMBA 4GXAA 2H99A 3OO6A 3UN6A 1JQFA 3OXNA 4OVJA 4NF5B 4H1XA 1SVXB 4FORA 4PFUA 2V84A 1ZJLA 2QPQA 3GBBA 4LP2B 5I2NA 3HPIA 1A55A 1JETA 1PB9A 1Z7ME 3KZGA 1P1WA 2VD3A 4QFOA 4N07A 4ZEFA 3PUZE 5H8NA 5I57A 1TWYA 3MP8A 4IB2A 1FW0A 3BBRA 1XS5A 3O28A 3MC2A 1CE2A 3E4RA 4IO3A 4OFLA 4XIGQ 1MXZA 1SYHA 4R74A 4JWXA 4ZZEA 3U72A 4YKPA 3LSXA 4F1UA 4H0WA 4IO5A 3ZKKA 2I3VA 1IZ1A 3FJMA 3Q26A 1YCJA 3TCHA 4EXKA 3CRBA 2QJEA 3IB1A 4ZEBA 3HCQA 4BDMA 4F2OA 1UIVA 2PT1A 2GHBA 3KJTA 3KOSA 4G4PA 4U23A 2XX7A 2AL4A 3CSGA 3EPEA 2W7YA 2CZLA 3KN8A 4IO4A 4OERA 5TPAB 4NF5A 1DSNA 5L9MA 3T96B 5ICTA 1B52A 3C4MA 5K2YA 5A5XB 1USYE 3O6IA 1M5BA 3CVGA 3DELB 4GLIA 5FTIA 1ZU0A 1OVBA 1QJMA 3PPNA 2Q8JA 3VFJA 3G3HA 2H4IA 3TKDA 3OSQA 1FTOA 4U4XA 2R6GE 4GOTA 2O1MA 1FQAA 2YJPA 2ZYOA 1VSOA 3PMVA 2D3IA 4YKJA 1P99A 2V93A 4O3AA 1ATGA 1N76A 1B7HA 1TFAA 4R6KA 1MXWA 4LZ7A 3U8QA 3JYRA 1HSEA 3LSWA 2H25A 3MVWA 4Z0IA 1MH4A 4ESXA 3EQ1A 4FIMA 3VXCA 2IA4A 5DEXB 2PVUA 1H45A 5H8QB 1O7TA 4R9GA 5DVJA 4MLVA 1VE4A 4X1BA 1PEBA 4C1UA 4F1YA 3EHUA 2AYSA 2DWJA 1ZKBA 2DP8A 1D9YA 3SERA 1XC1A 3N6TA 4AB6A 2RKMA 3JV9A 3FXQA 5I58A 1NNKA 3S9NC 1POY1 1Z7NE 1ZBMA 1SW4A 2RF1A 3E13X 4QSCA 4EF1A 5JEIA 1B9JA 5JTYA 5DT6A 2R9JA 4NMYA 4RK9A 3T22A 4F22A 1MXUA 3FVNA 3T9XB 4C0RA 1MXVA 1JNFA 3PPOA 1SI1A 2XXXA 2Y7WA 1Y1MA 3KEIA 3K01A 1M5CA 3RLFE 3V8XB 5L9OA 2IEEA 4EF2A 5F7VA 3G3IA 4ZECA 2Y7IA 4G68A 4MBPA 3V89B 1WDNA 3FJ7A 3MQ9A 2HAUA 4NWDA 4BDOA 1FCKA 2I4BA 3VXBA 4YKIA 2ZYNA 4EDPA 5A5XA 4NTLA 2ZNTA 1FTJA 1B0LA 1JEUA 1YAEA 1MM6A 3LSFB 3MPKA 4FEDA 3KN7A 4E0XA 4JSOA 2O7UA 3E3KA 4H8JA 3OENA 3HV1A 3FXUA 1LAGE 3MJNA 2GRVA 4QHQA 3PUWE 3Q27A 2OWSA 1N3WA 1DMBA 3K6WA 1IQ7A 3IOUA 4OFJA 4OYVA 3W9WA 4AB5A 4H65A 1B5HA 4OFOA 2G93A 4THIA 1USYH 2DWAA 2QRYA 1NKXA 2HEUA 1FTKA 3PU5A 2I3WA 2DS9A 1CB6A 4Q0CA 3PMXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4MFIA 4RA1A 4QBAA 2RCBA 4F3SA 1Y3NA 3KSJA 4G8MA 4DLDA 2OBGA 2Q2AA 4P3LA 4DE8A 5DEXA 3TQWA 2OCUA 1NUWA 3IOVA 1BP5A 1R6ZA 2OJTA 4GL0A 3BIGA 5H8HB 4GL8A 3RPWA 4HE0A 3LR1A 3FVGA 3TYHA 3VDFA 2B65A 1DPEA 1LBXA 1LFHA 1SD3A 2WYPA 3FV1A 4GBWA 4OVTA 2QVRA 1FQFA 3CG1A 3Q25A 4PDDA 4LN5A 4JDFA 1FRPA 2ZNUA 2DE4A 1EYJA 3EKIA 4WKMA 3OD7A 3OMBA 2QL3A 1KZ8A 4NF6B 5EHSA 2AL5A 3TELA 2XD2A 2ZYKA 4NF4A 3UK4A 3CFXA 1XT8A 5LDZA 4ZE8A 2WBBA 2F36A 2Q74A 3SDFA 2UVGA 3HFUA 3RPLB 1QUJA 4N4UA 1MY2A 1FBHA 3K0VA 3O2AA 1YXIA 5K2XA 3I6VA 3W15C 1NMUA 4ONYA 3FATA 3K00A 2DSFA 1QUIA 1FBEA 3FASA 3RT8A 4KD5A 1UTHB 2O84X 4FE8A 5EYGA 3VVDA 2Q9TA 4QSDA 3K1MA 1DK4A 3ZKLA 1Y3QA 3O66A 2ZZVA 1QUKA 1OLCA 5ISUA 3H6UA 5KDTA 1MQIA 4DIGA 2LAOA 1JW4A 3TAJA 1A7LA 4U2RA 3LUYA 4KHZE 5B70A 4X1DA 1ELJA 3EN3A 4IO6A 2ONSA 4P1LA 1VR5A 3EHTA 3LV0A 1UTHA 3K1PA 1B1HA 1NH8A 1LCFA 2H98A 2HXWA 1VFEA 5AA3A 4OESA 1NNFA 3OEKA 1FBPA 3EF7A 2QS1A 1FBFA 5KZTA 2DXYA 5JEIA 4G68C 5EQAA 1MG1A 2X7PA 3VV5A 1LSTA 4GF8A 3FBPA 5H8SA 4MX6A 3T9VA 4R6HA 1AIVA 4IO2A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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