5JEIA

Crystal structure of the glua2 lbd in complex with fw
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
264
structure length
264
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIACFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
publication title Mechanism of partial agonism in AMPA-type glutamate receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 84
structure length 264
sequence length 264
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-04-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jeiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jeiA02
3BFUA 3E13X 1QKAA 3CSGA 4P0GA 3ODBA 4G8HA 4U22A 1FQBA 3VLVA 1B6HA 1ZJLA 2NOOA 2XXRA 4UACA 3KOTA 2RCBA 3HSTA 3TCFA 2YJPA 3TELA 3IOTA 3DP4A 3PMVA 3DP6A 2Q88A 3FV1A 4KHZE 1B51A 1Q35A 4KCDA 1QUIA 3Q29A 2GRVA 5I2NB 4RK2A 1FQEA 3R26A 3TDJA 1LCTA 1CE2A 1BTJA 1TFDA 5CMBA 4EXKA 3PPPA 3PD9A 4OZ9A 3C4MA 1B0HA 3W15C 1D9YA 2CMOA 4F3PA 4G2ZA 5ITPA 3I6VA 3KEIA 3LR1A 4EQ7A 3SESA 4LUBA 3H06B 4QSCA 3AXFA 3Q27A 3TTRA 2DXRA 3H03A 3K00A 1POTA 2PX1A 4DXBA 3ILUB 4KPTA 2QPQA 4ZEKA 1POY1 1A8FA 2F5XA 3FJMA 4OFJA 3RY3A 5I84A 1B3GA 1SYIA 5AA2B 5F1QA 1MPCA 5CBSA 3O66A 3VXCA 4GL8A 3PGFA 2F36A 5I2KA 2OWTA 4RPOA 3VVEA 3N5LA 5EHMA 1IXHA 4LA9A 3RT8A 4F2OA 1F9BA 1PBPA 4XKRA 4R9GA 2QL3A 2H9BA 1FTJA 3CVGA 3PUZE 2VD3A 2Z8DA 4GL0A 2Y7WA 3D4GA 1MM7A 3T9HB 2RC9A 2THIA 4H5GA 5H8NB 5TPAA 1I6AA 2Q2AA 1JNFA 2D3IA 3FXQA 2UYEA 2WKYA 2DWAA 3PMWA 3JV9A 3OEKA 1I6BA 4LZ5A 2G93A 4Q30B 4IO5A 4X1DA 4GF8A 1USYH 3CFLA 4NMYA 2Q89A 5DEXB 4OEUA 4BDNA 5CMCA 4QFLA 3MZBA 3RGYA 1H44A 3K1NA 4YB7A 4RXLA 1Y1MA 4U1OA 2DVZA 3RT6B 1MPDA 5ELVA 2RKMA 4ZE8A 4QFNA 3RN8A 4G68B 2AYSA 2HEUA 1P99A 5CMMA 2XX8A 2VHAA 4IGRA 1MQIA 3G3KA 3H6UA 3P7IA 3IB0A 1JVXA 2F7CA 3LC8A 1EZPA 3IJXB 2YLNA 2UXAA 2ZYMA 3U92A 4U23A 4EUOA 5AA3A 2A5TB 1N7WA 1MQGA 1ZU0A 3KFMA 4EQBA 2UVHA 4U2RA 2RCAA 2V3QA 2AIXA 4NWCA 4Q0CA 1Y4CA 3K2DA 2Z22A 3QK6A 5CMKA 5I2NA 3E3KA 4X48A 2CZLA 4FEDA 3K6VA 2F97A 2NWJA 1TXFA 1Y9UA 3KN8A 1BKAA 4RYAA 1PC3A 1Q1KA 1IXCA 1HSEA 3EQ1A 2XXQA 2YPNA 3LSFB 1MY0A 2Y7RA 3T66A 4ZEFA 4BLAA 4F3GA 3TTKA 1ZIUA 4EF2A 1FCKA 1P1QA 3ILTB 4OHNA 1IEJA 3K4UA 4ND9A 2P0SA 2FNCA 5TU0A 3BBRA 3ZKKA 1B7UA 4NF6B 3OELA 4OYVA 1EZ9A 1JVYA 4M1VA 2V84A 1ANFA 2H4IA 1B9JA 3O6GA 2XXUA 3BFTA 4QF9A 1MXUA 1B1HA 1URGA 2XXVA 1B2HA 3O9PA 1JEVA 1LB9A 5AA2A 2DWHA 3A3CA 4H67A 3V83A 3MP1A 3OSQA 3ONMA 1VSOA 1MQHA 3KN3A 3U93A 3GBAA 4GWOA 4K3FA 2P2AA 4BDMA 4DZ1A 1SW1A 1LAFE 4QRZA 3QUFA 4XXUA 4ZDMA 3O97A 2QS2A 4Q8RA 4OERA 4DDDA 5H8NA 1OQHA 2XXXA 4ELPA 3TFLA 3EHTA 3M3KA 2VD2A 4LONB 5H8QB 3C34A 4MFIA 2O1LA 3LSLA 3MW0A 1MXZA 1Y1ZA 2GFEA 4IO7A 4H65A 1LFIA 1PB9A 5DEXA 2PMSA 5K2XA 4LATA 4O3BA 4ESXA 4F3SA 3QSLA 1LGBC 1US5A 4X9TA 5I56B 3N6UA 2OK2A 1B4HA 4MH5A 4H5FA 4G68A 1YTVA 2KLFA 4LQ2A 4YB5A 4ZE9A 5IKBA 1PBQA 1JETA 4MBPA 5FHNA 2UVGA 2F8DA 5KCJB 4G8MA 3ZKLA 1NH7A 1UTBB 2QS1A 3ECRA 4F31B 1A99A 2O51A 2A5TA 1N3XA 1PEBA 3EN3A 3OXNA 2A5SA 4LZ8A 3OO6A 2BJJX 3PUVE 5M2VA 4ZS9A 5FHMA 3G7WA 4YKIA 4EXLA 2I4BA 1D9VA 2F7BA 3K6XA 3PMXA 3PPOA 3MBPA 5HBCA 3B6QA 3IB1A 5DT6A 3T22A 4G68C 1HSLA 4YMBA 4JWXA 1HSJA 4KFQA 1R6ZA 5FTHA 4P11A 3KOSA 3MVXA 3VFJA 5AA2D 2FYIA 2F78A 3IB2A 2I48A 1B3HA 3KZGA 3H6TA 2REGA 3QYTA 1XVXA 3FVOA 1NNPA 3KGCA 3LSWA 3HO7A 2DP8A 1QW0A 4F3BA 3T93B 3HV1A 3FD3A 4NF6A 3VV5A 4RK9A 3TQWA 1B32A 4U21A 2V93A 1DSNA 2HZKA 4OETA 3VXBA 3V8XB 4BDOA 2RC7A 2HZLA 3K6WA 4C1UA 3IX1A 3FGSA 3OEMA 1XC1A 3QIMA 1XT8A 3M8UA 4N13A 3UA8A 5F7VA 5L9MA 3FIRA 3CR9A 4DLDA 4U1ZA 1R1NA 2UVJA 3EHUA 4G8NA 4F1VA 3T96B 4N6PA 1MG1A 2HXWA 1PDAA 4H0WA 2Z23A 3U72A 3TPAA 4H8JA 1A54A 3BKIB 5I59B 2F7AA 4POXA 3HHFA 2NUVA 1LBBA 1NKXA 4F29A 3OOAA 1ZLQA 2O7UA 4ECFA 4H6DA 5H8QA 3SERA 4YAHX 4E0XA 3TTNA 3WAFA 3MUQA 5I58B 1OVTA 2I0CA 4PFUA 3C35A 4F22A 3H3GA 2VGQA 2E1SA 5IAIA 3G3HA 1MPBA 3WAEA 2ONSA 4KR5A 1UTHB 1A55A 3UK4A 3IR1A 4QFKA 3W9VA 4KYDA 3SDFA 3VDFA 2HAVA 4IO6A 4IY6A 4KQPA 4EDPA 3C36A 1EU8A 1B5JA 5ICTA 3IL1B 2I0BA 4TQUQ 5H8FB 2V3UA 2VP1A 4G4PA 3V5AA 4C0RA 3S9NC 1FTLA 4TLMB 5KCJA 1DTGA 3FXRA 1B4ZA 1SYHA 2E0SA 1WVJA 1SW5A 1UTBA 2VOZA 4QHQA 2ZXTA 3ZS6A 1Z7NE 2ZNUA 3FVNA 3VVFA 3N26A 2I3VA 3MVZA 1GVCA 2Z8EA 2DWJA 3T9VA 1SW4A 5CC2A 3IOVA 4QSEA 2DSFA 1QULA 1S50A 2LAOA 3VVDA 4R75A 3OENA 1SQYA 4P0IA 3IOWA 1QUJA 3MZ1A 3S9EA 3JYRA 2H99A 4OENA 5K2YA 4XIGQ 3PV0E 3M3LA 2X7QA 2O69A 4YZZA 2OCUA 4JXIA 4AQ4A 1MDQA 3MPKA 4JDFA 4R74A 4PFWA 3HCQA 4PE5B 3IOUA 2H5YA 4JWYA 4ZEBA 2B65A 2OWSA 3EPEA 4KYEA 2F6PA 3OD7A 5L8DA 1OVBA 1SD3A 2Z8FA 2NXOA 2I3WA 1R9QA 3DELB 4YMAA 2XXHA 4KD5A 3RPWA 5J1DA 3UGWA 2QS3A 1Y4TA 4RA1A 4DXCA 2PT2A 4ZECA 1FTKA 1ZMGA 3IK6B 3TCGA 4DCXA 1MRPA 3MAMA 1MY2A 4OTEA 4KCCA 1AOVA 3OSRA 1NNKA 3TODA 2ESNA 3C33A 1VR5A 1WDNA 1TT1A 4F19A 5AE4A 4YB6A 3G3JA 1B3FA 3TZAA 3OMBA 1SVXB 1A7LA 2HFBA 5EHSA 4XKNA 4YKPA 2F6GA 5I59A 1B3LA 1B7ZA 1B52A 1TFAA 2F34A 3H6WA 1O63A 1NNTA 1DMBA 4YKJA 3PPRA 2DXYA 1DPEA 4AB5A 1N0TA 4EQ9A 1Y3NA 4DXUA 4PP0A 1NH8A 1TWYA 2ZYOA 4BDQA 2I58A 3CRBA 1LFHA 4LP2B 4Z7EA 5I58A 4YICA 3VE1B 3S9LC 1XS5A 1D4NA 1GV8A 4R2FA 3GBBA 4U4SA 1L5TA 3TUSA 3V89B 2ZYNA 2Y7IA 1UTHA 1B05A 1FTOA 1QUKA 5AA4B 4RY1A 4TOZA 2ONKE 3S4UA 3LBSA 3FJ7A 1OLCA 1S7YA 1OQGA 4JWOA 1WODA 1OIBA 2QS4A 4HS7A 3QXMA 4QFPA 5DVJA 3SEUA 2DOJA 2GHBA 2Y7PA 1BLFA 3U8QA 5H8FA 3U1OA 4JBZA 4NF8B 2DVCA 2UVIA 4OQOA 5ITOA 1B3EA 3QAXA 2O84X 4DCYA 4WKMA 1P1UA 1P1WA 4FJPA 4GXAA 4C1TA 5KDTB 3Q26A 3PU5A 4I8CA 5JK4A 2XXTA 2FA7A 1LSTA 3GXAA 2QRYA 2I4CA 3O29A 2R6GE 1S9TA 2XD3A 1BP5A 3IORA 3RNNA 1JW5A 1B40A 3C9HA 1B1XA 5L9SA 4ELOA 3PUWE 2O6AA 2XHDA 2XXPA 3Q25A 4NWDA 1XVYA 4PQJA 2XD2A 1N84A 4OWDA 4GD5A 1CB6A 3FV2A 1XHYA 3G3GA 4DE8A 4KYSA 3HHGA 3T9XB 3TTMA 1II5A 3KN7A 1MXYA 3SEVA 1MY1A 2XXWA 3MJNA 1SDXA 4THIA 4IO3A 1LB8A 4FAJA 1T0KA 1EZOA 5AA1A 4GOTA 4QFOA 2XX9A 3UN6A 3O6IA 2M8CA 1JQFA 4H8IA 1B5HA 4IO4A 2REJA 4Z0IA 1MH3A 5L9OA 1MDP1 4WXJA 4NF5B 3TCHA 1Y3QA 3FZVA 3G3IA 3QUJA 4N07A 2ALUA 2OJTA 3C31A 1DPPA 4R72A 1NL5A 1D3KA 2I6EA 3TAJA 2H98A 4ZZAA 4R6YA 1FQAA 1MQDA 1USYE 3A09A 4ELQA 3VLWA 3KSJA 1NNFA 4LZ7A 2ONRA 3MC2A 5B7DA 4FE8A 4YU0A 1SBPA 1AL3A 1M5CA 3Q28A 1B58A 1XOCA 2QJEA 1MQJA 4HTGA 1RYOA 3G3FA 3C32A 4EF1A 2XXIA 3RTWB 5I57B 2XXYA 3W9WA 2AL4A 4F1UA 1MM6A 2X7PA 1P1OA 3TMGA 3FATA 1UQWA 3FJGA 3VLUA 5DVIA 3N94A 4OESA 4G77A 3MQ9A 1GR2A 3T9UA 1FQFA 1LAHE 1M5FA 2PVUA 3CSBA 4NF4B 3K01A 4HW8A 5AA4A 2D5WA 3E9XA 3KG2A 3EHSA 4PETA 4LVQA 4GIZA 4M4GA 2ZMBA 1MS7A 3IO6A 4XKPA 3LUYA 3MPLA 4I9DA 3KBRA 3N6TA 4NF8A 1JEUA 3CI8A 1LBCA 1H45A 3CFXA 5ISUA 5KZTA 1Z7ME 2DE2A 4FORA 4PFTA 3K1MA 3IAZA 5BUUA 4OVJA 4RNSA 5TP9B 5KDTA 1LCFA 1RKMA 2OLBA 3OO8A 3TTLA 4NE4A 1A8EA 3B6TA 2AL5A 1M5EA 3IO4A 1DTZA 1N7XA 4R2BA 3OO7A 1H43A 3O6HA 5FTIA 3GZGA 5I56A 1MXWA 1YAEA 4HCWA 5DYHA 3UIFA 2P1SA 3SKPA 1PB7A 5A5XB 5LOMA 3H6VA 4OEVA 3GLBA 1MXXA 4F39A 1LLSA 1GGGA 2ANJA 4O3CA 4DIGA 3F11A 4MLQA 3FASA 2O68A 1H3DA 1SI1A 3MVWA 3SEYA 1OMPA 2Q8JA 3HPIA 5B70A 1B5IA 4R6KA 2Y7KA 3KJ7A 2Q9TA 4UA8A 4XKQA 4WEPA 4JSDA 4IGTA 4XTCQ 1FQCA 1MXVA 3MP8A 2ABHA 5DTBA 1FW0A 2X26A 3RTFB 4R9FA 4NF5A 1N3WA 1M5BA 1QKBA 1YCJA 4I1DA 2Q2CA 1IITA 3MVYA 1YPNA 3MP6A 2G29A 3FVKA 1ZBMA 2XX7A 5JTYB 1NMUA 4MF3A 1P1NA 3LSXA 3TYHA 2OBGA 4GLIA 4O3AA 1UIVA 2ZNSA 3JZJA 4ELRA 4QSDA 2DWIA 1B46A 1VE4A 3PPQA 1FTMA 5BWJA 3H4ZA 4Q5TA 2Y84A 1SI0A 3THIA 1I69A 1O7TA 5CBRA 2DYXA 2GH9A 2DQVA 4ESWA 5DVFA 2ZYKA 2O1MA 2I49A 3FUZA 3R7XA 1VFEA 5I57A 2D21A 2IEEA 1VFDA 1GTKA 3A3UA 3O2AA 1IZ1A 1A40A 4OXVA 2IA4A 2DE3A 4JSOA 4OMBA 3M3FA 1QVSA 4PFYA 5H8HB 3OO9A 4YKKA 2F35A 3KSXA 2V3TA 3PUYE 4NF4A 3K0VA 3D4CA 3CIJA 1US4A 1UIUA 3RLFE 1OLAA 1BIYA 2QMXA 3B6WA 4KI0E 4POWA 3TKDA 3K02A 4ISUA 1M5DA 1KWHA 5CRYA 1LFGA 2DS9A 1AMFA 1DOTA 4OFOA 3I3VA 3MWBA 2R71A 3SEXA 2HQ0A 3S2VA 1RYXA 4FEBA 4WEDA 1MY3A 3B7DA 3HN0A 5TP9A 1URDA 1ZKBA 3RUMA 1IXIA 5HPQA 1B7HA 4F2QA 3PD8A 3TQLA 4R73A 1Y3PA 3U94A 3KJTA 4U4XA 3ZSFA 4BDRA 3USDA 5JEIA 1JW4A 2RC8A 4I62A 1R9LA 4NTLA 1ATGA 5A5XA 4GRKA 4H1XA 1JW1A 4BDLA 5FHOA 3CG3A 3FXUA 4F1YA 2PYYA 4AB6A 4HCYA 1URSA 4JB7A 4TLLB 1Y20A 5ICQA 4IB2A 1PB8A 4ZEDA 4R6HA 1MY4A 3DP8A 3FVGA 1IXGA 4ZZEA 2R9JA 4L17A 3TEPA 2B3FA 4FECA 2B3BA 2OZZA 5HM4B 4X1BA 2GHAA 3E4RA 1N76A 3H7MA 1J1NA 3MZ9A 4RPNA 3CFZA 4FATA 1IIWA 1AH5A 4FIMA 3L6HA 3IJOB 4GQOA 5JTYA 5I2KB 1ZTYA 1EH3A 3K1PA 2UYFA 4OFLA 4RJZA 5EYFA 1QJMA 1NFTA 3K6UA 2ZNTA 3O28A 3CG1A 2RF1A 2HAUA 3I5OA 1LAXA 3UORA 1SW2A 1H76A 3DLNA 3RQTA 2DE4A 5TPAB 3SETA 3DM0A 2HCAA 2V25A 1ELJA 2QMWA 2PT1A 1N04A 3S9MC 1I6QA 4F18A 2RINA 5H8SA 3L6GA 3EF7A 5H8HA 3PPNA 1B0LA 1IQ7A 1IUDA 2QSXA 3SEWA 1AIVA 4NEDA 4GVOA 4IO2A 4LQ5A 1MH4A 4IY5A 2W7YA 4GXSB 4MLVA 1O64A 5CM6A 2PBWA 4GFRA 4ONYA 2O7IA 3PUXE 4ZEIA 1FQDA 2NVUB 1LAGE 3R6UA 4E0WA 2H25A 5CI5A 3UP9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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