5JEIA

Crystal structure of the glua2 lbd in complex with fw
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
264
structure length
264
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIACFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Mechanism of partial agonism in AMPA-type glutamate receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
total genus 84
structure length 264
sequence length 264
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-04-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jeiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jeiA02
3TKDA 1FTOA 3H6TA 1ZU0A 5CBRA 2VGQA 4O3BA 4F19A 2F7AA 3GXAA 2E0SA 3TAJA 3V5AA 1VSOA 3T93B 2GHAA 5F7VA 1JVXA 1MDP1 4HS7A 5B7DA 4P0IA 2AYSA 4FIMA 2Z22A 5JTYB 3CG3A 5BWJA 3HN0A 1NNTA 5I59A 3PUYE 2Q8JA 4FECA 4YICA 3L6GA 3B6TA 1GV8A 3A3CA 2VOZA 3DP8A 4GVOA 1LCFA 2VD3A 2VD2A 3PUZE 3PD8A 5H8HA 4H6DA 4YMBA 4F1UA 4MFIA 2NOOA 3K0VA 2XXIA 1M5DA 2XXWA 1P1UA 4WKMA 3OEMA 3K02A 2ANJA 3CR9A 4EXKA 4H1XA 2P1SA 1LSTA 1MXVA 1EZPA 2XXUA 1JW1A 1LFHA 4M4GA 5ICQA 1FQCA 1B2HA 2O51A 4XKQA 3M3KA 1Y1ZA 3HSTA 3TPAA 5CMMA 1DOTA 4DLDA 3H3GA 3VLVA 4H8IA 3EHTA 1NNFA 4PE5B 5H8NA 1FTLA 1R9LA 1SDXA 1B3LA 5K2XA 2DYXA 3KG2A 3KGCA 1PBPA 1LCTA 4MH5A 1RYXA 2B3FA 4POWA 1B4ZA 2GFEA 4DIGA 4GXAA 5TPAA 3E3KA 3N26A 4YMAA 2A5TA 1POTA 1MXWA 3FUZA 2I4CA 4R9GA 4ELOA 2M8CA 3SEVA 3OENA 1B0LA 3GBBA 1WVJA 1MQGA 1A7LA 3ECRA 4FORA 2R6GE 3UORA 2Z8FA 1B51A 1AL3A 2Z23A 3K4UA 4ESWA 1UTHA 3CIJA 3TDJA 1FQBA 3D4CA 2ZXTA 1ATGA 2GHBA 3RY3A 3FIRA 4U4XA 2RC8A 3T9HB 1IXGA 1MPCA 4X1BA 1EZ9A 4LQ2A 4RK9A 1WODA 1HSEA 2YJPA 4Q30B 3IJXB 1FQFA 2RKMA 4FEDA 2DXRA 4O3CA 2I6EA 4NF8B 4NF4B 4ZEBA 3L6HA 5I58A 3HV1A 2H25A 3T9VA 1N76A 4RA1A 2Y7RA 3IOTA 1SW2A 4NWCA 5JEIA 4KQPA 3MW0A 1OVTA 3V89B 4F29A 3V83A 1LB8A 4JWOA 1NH7A 4LQ5A 4LZ5A 1N84A 1TFDA 3E4RA 1AOVA 1P1QA 1LFGA 1HSLA 2HAUA 1FQEA 1PEBA 2OWSA 4QHQA 4PFTA 2XXRA 4ESXA 2PX1A 5HPQA 1Z7ME 5FHMA 4GQOA 4U4SA 3KN8A 4IO5A 3QXMA 3CVGA 3RGYA 1ZJLA 1R9QA 4F3SA 3RNNA 3T9UA 2Q9TA 2F5XA 3O2AA 3G3KA 2ZYOA 4LP2B 5ISUA 4EQ7A 2DQVA 3K1NA 2X26A 1DPEA 1UIVA 3H7MA 4JB7A 1ZIUA 5L9SA 1B3FA 2QL3A 5DTBA 1D9YA 3DLNA 3O28A 2UXAA 4GFRA 1B5HA 3Q28A 4N07A 1QKAA 3E9XA 3RUMA 3RTFB 4OHNA 1QUKA 1USYE 5CC2A 2V93A 4GXSB 1B1HA 2HZLA 1JQFA 4QFKA 3TYHA 2ZYKA 4RYAA 4EQBA 3E13X 1NNKA 1UTBB 4OQOA 2QS3A 4U1ZA 3MJNA 4R75A 2PT1A 4OVJA 4F3PA 1MDQA 1N3XA 4IB2A 3LR1A 1MPDA 2I4BA 3H4ZA 2DVZA 1GR2A 1URDA 1CB6A 3N6TA 1M5FA 1O63A 3GZGA 3CSBA 3Q27A 2O84X 1FQAA 3OO6A 1GTKA 2V84A 3ZKLA 3G3FA 4E0WA 4KYDA 3PPPA 2XXHA 3K1MA 2GRVA 4P11A 3PUWE 1PBQA 5CMCA 4F31B 3PV0E 4K3FA 3ODBA 4QRZA 1MM7A 4QFOA 4BDNA 3N94A 4JSDA 1YPNA 1Y1MA 4MLVA 3H06B 1XHYA 3TTKA 3SKPA 3EQ1A 1IITA 4Q8RA 3U92A 1B5IA 2XXPA 1B3EA 1O64A 5AA4A 1EZOA 4NF6B 3U1OA 1P1OA 4BLAA 3VVFA 3TELA 3IAZA 2F8DA 4KI0E 1Q35A 3FASA 4QSDA 5JTYA 2XXTA 3IOVA 1SW1A 2VHAA 4WXJA 4C1UA 3O97A 4OFLA 2DWJA 2DOJA 3IB0A 5IAIA 2HXWA 4PQJA 3G3HA 1UQWA 3QYTA 3HO7A 3FV1A 3TTRA 3MVWA 1AMFA 2OWTA 1QULA 1QUJA 3JZJA 1F9BA 3TMGA 1B3GA 1US5A 4ELQA 3UIFA 2UVHA 5ITPA 1QVSA 3C36A 3LSLA 2THIA 1B7UA 3CFLA 1SYIA 3SESA 4WEPA 4THIA 2V3TA 4F22A 3D4GA 4ZEFA 1A8EA 2REJA 2OK2A 2ABHA 3BKIB 3ILTB 3PPOA 2OCUA 5AA4B 1XT8A 3LC8A 1FCKA 2I3VA 3B6QA 1SVXB 2O68A 4YKIA 1EH3A 2Y84A 4OXVA 2RCBA 4F2QA 3R26A 3ZKKA 3N6UA 3MAMA 3CFXA 4OFOA 1B5JA 4PFYA 1DPPA 3IOUA 3BFUA 2NXOA 3UN6A 1FTMA 2XXQA 1Y4CA 1OMPA 1BP5A 1AH5A 2XX9A 3VXBA 1Y4TA 4ELPA 4FE8A 2Y7PA 1LBBA 4QSCA 3I3VA 1M5EA 4PFWA 4R6KA 3MZ1A 2G93A 2D5WA 5H8FA 3F11A 1DMBA 3MUQA 3MP1A 1N0TA 4DXBA 3MZ9A 1LBCA 2DVCA 3PUVE 1T0KA 1J1NA 5L9MA 2I0CA 1IEJA 3GLBA 3IO6A 1B1XA 4PP0A 4GOTA 2RC7A 4OMBA 4OENA 1JW4A 1POY1 3B6WA 5I56A 5DVFA 1RKMA 1VFDA 5I2NA 4ISUA 4TQUQ 5L8DA 3IJOB 2IA4A 1I6BA 1SD3A 4R6HA 3TTMA 4MBPA 1FQDA 3FVGA 3KZGA 4G8NA 3TTLA 2PBWA 4R73A 1B6HA 4PFUA 4FAJA 5AE4A 1MS7A 2RINA 3OSRA 4NTLA 4NF8A 3U8QA 1D4NA 4NF4A 1I69A 1A8FA 1B32A 4XTCQ 4DDDA 4KD5A 4F2OA 4F1YA 2PT2A 1Y3NA 3CRBA 3UGWA 2HCAA 1BLFA 4IO2A 3SEUA 3ZSFA 1RYOA 4R2FA 5H8FB 1TWYA 3LSXA 4H65A 3UA8A 5CMKA 5TP9B 3UK4A 3TZAA 2GH9A 3I6VA 3K01A 2AL5A 5ICTA 3M8UA 3FJGA 2ZNUA 1ZLQA 3H6VA 1R6ZA 4U21A 1OQHA 1B4HA 3OXNA 3P7IA 1MQJA 5I56B 3KSXA 2H9BA 5I2NB 1MH4A 1PDAA 4R9FA 2Z8EA 3R6UA 3U72A 5I2KB 3K2DA 1P1WA 3TQLA 4RPNA 1FW0A 2H99A 3IORA 4G68B 2PVUA 4KYSA 1LFIA 4ZE8A 2ZNSA 5FHNA 4OETA 4UACA 3C35A 4I62A 4DXUA 4IY5A 4IO3A 4IO6A 4YKKA 4QF9A 3C4MA 5B70A 1PB7A 1USYH 4OESA 2RC9A 3VDFA 1XVYA 3K00A 5CBSA 1B46A 1YTVA 2FNCA 3MVXA 3DELB 3QK6A 4Z0IA 2UVGA 1LB9A 3CG1A 4IY6A 4C0RA 3KBRA 4ZDMA 3FVKA 1D9VA 1N04A 1B58A 2Q88A 3MZBA 3KSJA 4YAHX 5F1QA 3QSLA 3VVDA 2RCAA 1UTBA 2F34A 4KCCA 2DXYA 4IO4A 1QUIA 3BFTA 1TXFA 3OSQA 2ALUA 4I8CA 3DP4A 4HTGA 1KWHA 3OO7A 4P0GA 4YB6A 3W9WA 1PB9A 1ZKBA 1B7ZA 3FJMA 4LZ7A 1JNFA 3C33A 4IGTA 4I9DA 4ONYA 4DE8A 4IO7A 3PMWA 1NMUA 4AQ4A 1MY3A 2R9JA 1A99A 1OVBA 4HW8A 3WAEA 1TT1A 3FV2A 1O7TA 5DEXA 4M1VA 1WDNA 4G68C 1QKBA 2PMSA 5KDTB 4AB6A 3SEXA 4NF6A 3O6IA 4G2ZA 3M3LA 4EDPA 1OQGA 2XXXA 5J1DA 3O66A 5M2VA 3O6HA 3MBPA 3TCHA 4R72A 1N7WA 3OOAA 1S7YA 4DCYA 4R74A 3C31A 1DTZA 3O29A 3K6WA 2XD2A 2PYYA 3MP8A 2OJTA 3IO4A 4KCDA 3JV9A 1SW4A 3A09A 4F18A 1MM6A 4LA9A 1JW5A 5JK4A 3K6UA 1SBPA 4BDOA 4C1TA 4AB5A 4BDRA 4ZZEA 1IQ7A 5HM4B 1PB8A 2XXVA 1Y9UA 4KPTA 4YB5A 3PD9A 4ZZAA 1BKAA 2P0SA 2OLBA 5DEXB 5LOMA 3PUXE 3OO8A 1A55A 4FATA 3CFZA 2YPNA 4LZ8A 5CMBA 4GL0A 3AXFA 3MC2A 4I1DA 2A5SA 3U94A 4OFJA 2HEUA 4RJZA 1GGGA 1MXYA 1IXHA 3OD7A 4IGRA 1MY0A 1JETA 4OERA 1URSA 4EF2A 3SEWA 2I48A 2NWJA 4JBZA 3UP9A 3I5OA 1H3DA 5DVIA 3MVYA 4BDQA 4QFNA 4YZZA 1VE4A 2H5YA 3A3UA 3FVOA 3CSGA 3KJTA 3KN7A 5H8SA 2NVUB 4ZEKA 5KCJB 2DWHA 2ESNA 3RLFE 2XX7A 2V3UA 3FJ7A 1II5A 5HBCA 4GLIA 3W15C 3RTWB 2ZMBA 1HSJA 1ZBMA 4QFLA 3OELA 2HFBA 1Y3PA 1SI0A 2QS2A 3LSFB 5ELVA 1I6AA 1EU8A 1S50A 3Q26A 4NWDA 3G3JA 2DE4A 4XKPA 2B65A 2G29A 4LVQA 2YLNA 3M3FA 5KZTA 3H03A 4EQ9A 3IL1B 4G8HA 3S9NC 5K2YA 1MG1A 5EYFA 1QW0A 1N3WA 4U1OA 4GRKA 1QJMA 1TFAA 3IB1A 1FTJA 2O1LA 5DYHA 5FTHA 1LLSA 3S9LC 3C32A 4KHZE 4L17A 5TU0A 4KFQA 4U2RA 1I6QA 4LONB 1Y3QA 4JWYA 1H44A 3FGSA 3T96B 2Q2AA 4Q0CA 2ZYMA 3QIMA 4EUOA 4OTEA 1B05A 1JEUA 4BDLA 2QS1A 3OO9A 5A5XA 4NEDA 2QPQA 3FXRA 3PPNA 2Y7WA 3VE1B 5EHMA 2I0BA 1US4A 1B7HA 5H8QB 2I49A 3BBRA 2HZKA 2F78A 4G77A 4YU0A 4H0WA 4OEUA 3EF7A 1IXCA 4N13A 3MWBA 3N5LA 4DCXA 1OLCA 4E0XA 5TP9A 3FVNA 1SW5A 1B9JA 3QAXA 1MY2A 2E1SA 1H76A 1MY4A 2F6PA 4JDFA 3TCFA 3IK6B 3MPKA 3H6WA 3KOTA 2HQ0A 5BUUA 2Q2CA 1MQIA 3O6GA 5I2KA 4FEBA 1SI1A 1H45A 3KFMA 4HCWA 3TUSA 5CM6A 3LBSA 3QUJA 2QMXA 3EN3A 4KR5A 3MP6A 3KEIA 4U22A 4QSEA 1DSNA 4G68A 3FXQA 4ZECA 3PGFA 3IB2A 1BTJA 1XVXA 4GL8A 2F7CA 1XOCA 4G8MA 3C34A 3HHFA 4RXLA 2O1MA 3TQWA 2QRYA 5A5XB 3PPQA 3DP6A 3O9PA 2NUVA 3IR1A 2O6AA 4O3AA 2F36A 4R6YA 5I59B 3ZS6A 4H8JA 1Z7NE 1MQDA 2XXYA 2LAOA 2Z8DA 4R2BA 1AIVA 3S9EA 5IKBA 3FXUA 3Q29A 2V25A 2DSFA 2W7YA 4FJPA 1XC1A 5H8HB 1LGBC 1XS5A 3FZVA 2F35A 1LAXA 1SQYA 3WAFA 2ONRA 1OIBA 5I57A 2ZNTA 2UVJA 1NFTA 1Y20A 3SETA 4UA8A 3THIA 5AA2D 4QFPA 3PMVA 4WEDA 1B3HA 3VVEA 4NE4A 2R71A 3PMXA 1JEVA 3VXCA 2D3IA 2D21A 3OMBA 3G3IA 2KLFA 4OEVA 3VV5A 2AIXA 3QUFA 1P1NA 3RT8A 1R1NA 3U93A 5H8NB 5DVJA 1MXXA 2FA7A 3S9MC 3TCGA 4ZE9A 2AL4A 2BJJX 2DWIA 4X48A 1NKXA 1D3KA 3USDA 4DZ1A 2DS9A 4H5FA 4ND9A 3HHGA 5KDTA 3LSWA 4HCYA 1MXZA 2O69A 5ITOA 2OZZA 2OBGA 2QJEA 3EPEA 4ZEDA 5DT6A 5TPAB 3SERA 1MQHA 2A5TB 4OYVA 3TEPA 1S9TA 4LUBA 4ZEIA 4GF8A 1VFEA 1NL5A 4YB7A 2O7UA 3GBAA 2B3BA 1MH3A 2UYEA 2Q89A 5I57B 3OEKA 5I84A 5EHSA 1UIUA 3C9HA 3EHUA 5CRYA 1M5CA 1B52A 1UTHB 1NH8A 3CI8A 3H6UA 4H67A 4LATA 2CMOA 1ZTYA 3IOWA 1PC3A 4RPOA 1A40A 3HCQA 3HPIA 1N7XA 4EF1A 3R7XA 4TLLB 2DE3A 2I3WA 4TLMB 2O7IA 3FD3A 1ZMGA 3T22A 5AA3A 2F7BA 1IIWA 3B7DA 5FHOA 1H43A 5I58B 4XKNA 2ONSA 2ZYNA 3JYRA 3MPLA 4Z7EA 3T9XB 1M5BA 4POXA 1LAFE 4MF3A 4EXLA 3V8XB 1CE2A 2F6GA 3PPRA 1Q1KA 2QSXA 3K1PA 4KYEA 4ZS9A 1OLAA 1ANFA 4RNSA 3RPWA 3S2VA 4JSOA 5AA2A 3W9VA 3MQ9A 3VFJA 4TOZA 3SDFA 1BIYA 2RF1A 1IXIA 5KCJA 2X7PA 4ECFA 1FTKA 1IZ1A 4NF5A 3KJ7A 1YCJA 3VLWA 1A54A 2DE2A 4Q5TA 3RQTA 4JXIA 4F39A 3RT6B 2F97A 2DP8A 2UVIA 5L9OA 4H5GA 4MLQA 2XX8A 1MPBA 1MRPA 2DWAA 3MVZA 4U23A 2H98A 1LAGE 4RY1A 3FATA 2REGA 1URGA 3KN3A 3PU5A 4RK2A 4X9TA 4F1VA 2H4IA 4GD5A 3KOSA 2XD3A 3TTNA 1YAEA 2I58A 5AA1A 4BDMA 5AA2B 4XIGQ 3RN8A 2CZLA 4YKJA 3S4UA 3K6VA 2WKYA 2Y7KA 1P99A 1B40A 1SYHA 4YKPA 4F3GA 3T66A 3TODA 1B0HA 3LUYA 2QMWA 4OZ9A 4ELRA 4N6PA 2UYFA 2HAVA 4XKRA 3K6XA 4NF5B 2V3QA 1IUDA 4JWXA 2VP1A 1MY1A 5H8QA 1L5TA 4GWOA 1DTGA 5FTIA 1MXUA 3TFLA 2IEEA 4GIZA 1GVCA 4DXCA 4OWDA 2QS4A 3G7WA 3Q25A 2Y7IA 3DM0A 3ILUB 1VR5A 2X7QA 1LAHE 3ONMA 2P2AA 3VLUA 4G4PA 4F3BA 1JVYA 2ONKE 3G3GA 4PETA 1ELJA 4NMYA 3IX1A 2XHDA 2FYIA 4X1DA 1NNPA 3SEYA 5CI5A 4XXUA 3EHSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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