5JEIA

Crystal structure of the glua2 lbd in complex with fw
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
264
structure length
264
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIACFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
publication title Mechanism of partial agonism in AMPA-type glutamate receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 84
structure length 264
sequence length 264
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-04-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jeiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jeiA02
4DXCA 4TLLB 3FXQA 4ISUA 2PVUA 1TFAA 3MC2A 1R9LA 1M5DA 3WAFA 4GFRA 4IO7A 3OO8A 2GFEA 2RC9A 2F36A 4O3AA 1JEVA 4RK2A 2DVZA 3IOVA 1Q35A 2IA4A 4F1UA 3RN8A 4C0RA 3PPPA 3C34A 1UQWA 1B52A 1PBQA 3FUZA 1VR5A 1UTHB 2DWAA 4GLIA 4HCYA 3LUYA 4QF9A 3T9HB 3K00A 4LQ2A 2DE4A 4BDLA 5AE4A 2OCUA 4YKJA 1UTHA 2DSFA 1BKAA 1MH4A 3CFXA 3SEVA 1DMBA 2V25A 3TDJA 1VFDA 4GL8A 2XD2A 1OLCA 4YKKA 3T22A 4U23A 1AL3A 4LONB 2O51A 3VVEA 2D21A 3TAJA 1YTVA 3ZKKA 2VP1A 2XXPA 1XS5A 4GWOA 3FVNA 4N6PA 2Z23A 1B3HA 3MVWA 1JETA 4HW8A 4KQPA 4Z0IA 1N7XA 1DSNA 1MY2A 5H8SA 4ZEKA 4RXLA 5ITPA 2QSXA 1B32A 4KYEA 4DDDA 3CFZA 4OZ9A 1B2HA 1MXXA 1XVYA 3K0VA 3B6WA 5AA4B 1JNFA 1US4A 2NXOA 1PC3A 2DVCA 3KJTA 4QSEA 3TODA 5AA4A 1FTKA 1N3WA 3VLUA 3FVOA 2HZKA 3M8UA 3BKIB 3MP6A 3EHSA 1FTOA 1A8EA 1N7WA 2P2AA 4YKIA 5H8QA 4RNSA 3QIMA 4OFJA 3W9VA 3E3KA 1M5FA 1FQDA 2O6AA 2I6EA 4LP2B 3IX1A 3QUFA 4JWYA 1FTLA 2ZYOA 3U94A 1MXWA 2V93A 3RGYA 2F35A 4AB5A 2VD2A 1NH8A 2I58A 2RC7A 1B7UA 2RC8A 3MAMA 1KWHA 3G3GA 4G8MA 3TTRA 4P11A 2FNCA 1NFTA 5LOMA 1SDXA 4F3BA 3HHGA 2F7CA 1RKMA 5I58B 1S9TA 4IY5A 4L17A 5I2KB 4F3SA 1ZJLA 2XX7A 3LC8A 4XKPA 2QJEA 1WVJA 3G7WA 3IO6A 1MXYA 2DWIA 4KFQA 3PUVE 3R26A 1FQFA 4X1DA 1SVXB 5I84A 3OO7A 4QFLA 2ZYNA 4I62A 2NOOA 3TCFA 4LATA 3TUSA 4Q8RA 4JSOA 4Q5TA 4FE8A 2DOJA 2Q2CA 3BBRA 3BFTA 3T9VA 3G3KA 2F5XA 1B4HA 2H25A 3SDFA 2A5TA 2GH9A 3MZBA 3IB0A 1ELJA 4NEDA 3S2VA 4ESXA 5DTBA 1IXCA 3PPQA 4IGTA 4JB7A 4YMAA 4NF5B 2XXVA 5TP9B 5JEIA 4O3BA 1QKAA 1B7ZA 2Z8FA 1MDQA 3GBBA 4R6KA 3WAEA 4TOZA 4NF5A 3U8QA 5BUUA 1EZ9A 4GQOA 2H9BA 3M3KA 4PE5B 3G3JA 3AXFA 3T96B 1PB9A 3O29A 4JDFA 4G77A 2HAVA 2ONKE 3OSQA 5F7VA 3F11A 2F7BA 3KSXA 1AH5A 4Q30B 1HSJA 3H7MA 2D5WA 4ONYA 3VV5A 1IZ1A 1FQCA 3HPIA 3QK6A 3QAXA 2PX1A 2HFBA 4HCWA 1RYOA 3K01A 3OMBA 2DE2A 5FTHA 2OWSA 4ZZEA 4F2OA 3D4GA 2UYEA 2ZNUA 3ONMA 2RKMA 3HV1A 1MQGA 3S4UA 4BDNA 1GTKA 3LSLA 3FVKA 5F1QA 4GXAA 1LAHE 2XXWA 3HN0A 4AB6A 1N84A 4RY1A 5FTIA 1MQJA 4YB7A 1LAFE 3K6WA 3PMVA 5TPAB 2QS3A 4G8NA 1BTJA 5TU0A 5JTYA 4LA9A 1MH3A 4MBPA 1DPPA 1LFHA 1M5CA 4XKNA 5TPAA 4DLDA 1R1NA 3T9XB 1TXFA 4NWDA 3EHTA 1XHYA 4R73A 2AYSA 3IR1A 4OERA 5FHOA 4NF6B 4TQUQ 3I3VA 3IOUA 4ELOA 2XX8A 4F3GA 5CMBA 1D3KA 4H6DA 3PPRA 1IXIA 3RUMA 4KCCA 4FEBA 4DCXA 4PFWA 5KCJB 2I49A 3PUZE 4X48A 4H65A 1B0HA 3QUJA 1ANFA 1JW4A 1HSLA 1LFGA 2I3VA 3VFJA 4WEDA 1JW5A 3RTWB 3GXAA 3SERA 2GHAA 3K1MA 4R9FA 3PUXE 2OWTA 4MLVA 1O63A 3O9PA 3JYRA 2QS4A 3LR1A 5DT6A 3K6VA 1Q1KA 3VVDA 1MDP1 4U1ZA 1URSA 4NTLA 5JK4A 2RCAA 1AMFA 1SW1A 2REJA 2F8DA 4K3FA 3TTNA 4U1OA 3VVFA 1USYH 1YAEA 3PV0E 2UXAA 3S9MC 4RYAA 4GVOA 4THIA 3VE1B 3RY3A 4FORA 1DOTA 3MBPA 1MG1A 5A5XA 3G3HA 1OVBA 3PUYE 2ANJA 4ZE8A 2VGQA 1TWYA 5DEXB 2OBGA 3MVXA 5HM4B 1B3GA 1NNPA 3KOTA 1OQHA 1P1UA 4EXLA 3MUQA 5CMCA 4KYDA 4YB5A 3I5OA 3PD8A 4FATA 4ZE9A 4U4SA 1D4NA 2XXXA 3ILTB 4QRZA 1US5A 3V8XB 3RTFB 3PPOA 1UIVA 4F22A 5ELVA 1IQ7A 3SKPA 4YAHX 3MJNA 1Y3NA 1URGA 4YMBA 2B65A 4DCYA 4IO5A 2PYYA 2V3TA 4RPNA 4IY6A 4IB2A 4JBZA 5DVIA 2Z22A 2ZYMA 1SBPA 4G68B 5EHMA 5L9MA 1B1HA 1AIVA 4IO6A 1ZBMA 4OVJA 3G3IA 4GXSB 4KR5A 4IO4A 4DZ1A 4R75A 4U4XA 3C36A 4ELQA 5ICQA 3VXBA 4R72A 3K6UA 3OSRA 3O2AA 3T93B 5HBCA 1SW4A 1OVTA 1XOCA 4MF3A 3RNNA 5H8FB 1B46A 1MY4A 4NMYA 1P99A 3IAZA 4EUOA 3TFLA 3E13X 5I56B 1NL5A 5H8FA 1R9QA 3FJGA 1UTBB 1Y3PA 5I56A 3FXUA 4EF2A 2RF1A 4RPOA 1MM7A 5M2VA 1QKBA 2G93A 4EQ9A 5L9SA 1MXVA 2ONRA 4WXJA 4FIMA 4IO2A 1P1OA 2HAUA 4DXUA 2ABHA 3K02A 4PP0A 2DXRA 3LSXA 4N07A 1NNFA 2NWJA 3TKDA 3FV2A 5CC2A 1NNTA 2DXYA 1B40A 3UK4A 1Z7ME 4P0GA 4M1VA 4OWDA 3RQTA 2R71A 3MP1A 4ZZAA 2XXHA 4H67A 4PFTA 1IEJA 2DS9A 2DP8A 1CE2A 4OTEA 1Y4CA 2I4BA 2ESNA 1R6ZA 3VLVA 3L6GA 3TYHA 2M8CA 3KFMA 3VLWA 3PMXA 2XX9A 3DLNA 1GGGA 1P1NA 2VD3A 4OESA 2XD3A 2DWJA 4EDPA 5H8HB 4QFPA 1GVCA 4YZZA 3H3GA 4BDQA 3GLBA 3R6UA 1Y20A 1JQFA 5H8HA 5I58A 4H5FA 3RLFE 4BDRA 5I2KA 3FXRA 2HZLA 4PFYA 2PT2A 1MY3A 4F31B 4OFOA 5B7DA 2I48A 1LCFA 1JVYA 1Y4TA 2QS1A 4NF4B 2UVJA 3FVGA 1MM6A 4FJPA 2VHAA 2O1MA 2V84A 3PU5A 3PPNA 3M3LA 2RCBA 2AIXA 3GZGA 4NF4A 4F39A 5CBRA 3Q27A 4H8JA 1S50A 3LBSA 1MPBA 5L8DA 2XXUA 4F19A 3TELA 2X7QA 3DELB 3DP8A 2QPQA 3H6UA 4H8IA 1FW0A 2O68A 2UVHA 3QSLA 3UIFA 4PFUA 1EZPA 1NH7A 1B5HA 4EQ7A 2HQ0A 1QUJA 4GF8A 4RK9A 1OQGA 3MWBA 4MH5A 1B7HA 3MPKA 3OEMA 1PB7A 3SETA 2W7YA 5AA2B 5TP9A 2BJJX 1A55A 2E0SA 1YCJA 5BWJA 3UA8A 2AL5A 5AA2A 1I6QA 4KD5A 2UVIA 4DXBA 3KBRA 2DE3A 3JZJA 5FHNA 1O64A 1B4ZA 3BFUA 4JWOA 1JEUA 3C33A 3OELA 2ZNTA 3E9XA 1F9BA 3DP6A 3CSGA 3ZKLA 4MFIA 3LSFB 4H5GA 3CFLA 2O7IA 4JWXA 1JW1A 4BDMA 2X26A 1EZOA 2Y7IA 3OEKA 3K4UA 3ZSFA 1I6AA 5ISUA 2AL4A 5K2XA 1LSTA 5K2YA 5IKBA 5DVJA 3PMWA 2Y7RA 3MZ1A 1IUDA 4FAJA 5FHMA 1IIWA 1MPDA 2UVGA 1T0KA 4G4PA 4I8CA 1YPNA 1ZIUA 3H6VA 2Q89A 2XXTA 3S9NC 4EQBA 1PB8A 3MZ9A 4E0XA 5CBSA 3U92A 1BIYA 5I2NB 2B3FA 2YLNA 2Z8EA 2F97A 3PGFA 5I2NA 1DTGA 4O3CA 4OMBA 3Q28A 3IJOB 4U21A 3IORA 3O97A 2Y7WA 2CMOA 3O66A 3U1OA 3H6TA 1D9YA 3K1NA 4X9TA 3GBAA 2G29A 1S7YA 3HHFA 2IEEA 4WEPA 4ZEDA 2HCAA 4QFNA 1OLAA 1A40A 2Y7PA 1MQIA 3Q25A 1B1XA 5AA3A 3UP9A 4R2BA 2HXWA 3KG2A 1QUKA 1MRPA 4EF1A 4F2QA 4OEVA 4Z7EA 2ZXTA 4NF6A 1P1WA 2I0BA 3TEPA 1EU8A 4G68C 3V83A 1ZLQA 3H6WA 4XIGQ 3B7DA 1SYIA 3G3FA 2XHDA 3N6UA 4XKQA 5KCJA 3P7IA 1MS7A 1N0TA 3VDFA 3O28A 3CVGA 1N3XA 1NMUA 2I0CA 1ZMGA 2F34A 3O6GA 2Y7KA 3TTKA 2XXQA 1FTJA 2HEUA 3MVZA 5CMKA 4BLAA 2D3IA 5B70A 5IAIA 4KYSA 4ECFA 4XKRA 4H0WA 3CR9A 5L9OA 3UGWA 4LVQA 1FCKA 4U22A 4QFKA 1J1NA 1BP5A 4P0IA 4R2FA 5DVFA 1QULA 4OYVA 4F3PA 3KEIA 4F1YA 3OXNA 4PETA 4QSDA 1USYE 3DP4A 3D4CA 4KCDA 2Q88A 2F78A 3B6QA 4FECA 1H76A 2R6GE 5DEXA 1O7TA 4F1VA 3W9WA 4XTCQ 2PBWA 4G8HA 3VXCA 2LAOA 4DIGA 3O6HA 3EHUA 3QYTA 5AA1A 2CZLA 3USDA 1DTZA 1MQHA 2ZNSA 1A7LA 3U93A 1IXGA 2PMSA 2XXIA 3UN6A 1ZKBA 1VFEA 5CRYA 4ZEBA 2NVUB 1BLFA 2E1SA 4DE8A 1H3DA 5J1DA 1XVXA 1FQBA 3MW0A 3MVYA 4G68A 3CRBA 4POXA 2YPNA 2O7UA 1SI1A 4KPTA 4OETA 1WDNA 1AOVA 5H8NB 3S9LC 2V3QA 3K6XA 3ZS6A 3FD3A 3N5LA 4HS7A 5H8NA 3FASA 5ICTA 3KN7A 1Z7NE 1URDA 4ELPA 2ALUA 1B6HA 4ELRA 2UYFA 2PT1A 3PD9A 1SI0A 3OENA 4PQJA 3RPWA 1B3FA 3H06B 4C1UA 1DPEA 1UTBA 2GRVA 3A09A 3RT8A 1N76A 4OHNA 4R74A 2OJTA 5I59B 4C1TA 1TFDA 4NF8B 2P0SA 4GL0A 1LLSA 1GR2A 2O69A 2V3UA 5KDTB 3K1PA 1POTA 5I59A 5H8QB 1A54A 4NF8A 4IO3A 4WKMA 1SD3A 4F29A 1PEBA 5KDTA 1XC1A 3O6IA 3N26A 1SQYA 3IOWA 3IB2A 1TT1A 4EXKA 3C4MA 1VE4A 4MLQA 1I69A 3KN8A 3TCHA 4QHQA 1A8FA 3ODBA 3V89B 1JVXA 3A3UA 1B05A 3IK6B 4OENA 4ESWA 4N13A 3OO9A 1POY1 3TPAA 4ZS9A 1QJMA 3EPEA 5AA2D 1B5JA 3CI8A 3TMGA 3TTLA 1MXUA 4GIZA 4HTGA 3T66A 4ZECA 3N94A 2ZYKA 4LZ5A 2H99A 5EHSA 3V5AA 3KZGA 1SW2A 2H98A 3OD7A 2A5TB 4LZ8A 4TLMB 1LAGE 3KJ7A 5HPQA 4POWA 4LZ7A 1H45A 4Q0CA 2OZZA 2R9JA 1FQEA 3KOSA 3TQWA 1Y9UA 3PUWE 2DQVA 1NKXA 3Q29A 1MQDA 3KGCA 3FJ7A 2QRYA 3SEXA 1GV8A 4R6YA 5CM6A 2XXYA 1MY1A 3TZAA 1OIBA 3EN3A 3FJMA 1Y1ZA 4M4GA 1B58A 1FQAA 1PBPA 3C35A 1PDAA 1QW0A 3IOTA 4RA1A 1QUIA 3FIRA 4OQOA 1H44A 1LBCA 3OOAA 1LB9A 4X1BA 4KI0E 3SEYA 4AQ4A 3HCQA 4XXUA 2X7PA 1LFIA 2F6PA 1WODA 3HO7A 3SEWA 1M5EA 2I3WA 2P1SA 1SYHA 4OXVA 3C32A 1IXHA 1B9JA 2ONSA 3FGSA 4GRKA 2XXRA 2RINA 4ZEFA 4OEUA 4F18A 3Q26A 1EH3A 3THIA 1QVSA 2QMWA 2Q8JA 2REGA 4JXIA 3EF7A 3S9EA 3OO6A 1MXZA 4QSCA 2QL3A 4IGRA 3UORA 3W15C 4GOTA 2Y84A 3MP8A 3SEUA 5DYHA 1MY0A 2DWHA 1I6BA 3T9UA 3TTMA 2QMXA 2DYXA 3H4ZA 2OLBA 5JTYB 3KN3A 1NNKA 5CI5A 1RYXA 1B3EA 4BDOA 4OFLA 5ITOA 3TQLA 2VOZA 2Q2AA 4NE4A 2H4IA 3MPLA 3CIJA 1L5TA 1MPCA 3U72A 2GHBA 3H03A 3R7XA 1SW5A 4I1DA 1B51A 1LB8A 3CSBA 2H5YA 3FATA 4ZDMA 3DM0A 3KSJA 3I6VA 3FZVA 2Q9TA 4ZEIA 3C9HA 2B3BA 3TCGA 3ECRA 4H1XA 3LSWA 2WKYA 2THIA 3IL1B 4LUBA 1LGBC 1LCTA 3A3CA 2NUVA 4UACA 1D9VA 2I4CA 2O84X 4R6HA 4UA8A 4ND9A 1ATGA 1CB6A 3SESA 2Z8DA 4YICA 4U2RA 4I9DA 3L6HA 2O1LA 3C31A 3JV9A 1H43A 4LQ5A 4YU0A 1Y3QA 3E4RA 4GD5A 2YJPA 1VSOA 1FTMA 4YKPA 3CG3A 5KZTA 4R9GA 4JSDA 1LBBA 1P1QA 3EQ1A 3CG1A 1OMPA 1ZU0A 2QS2A 1LAXA 1HSEA 4E0WA 1M5BA 1A99A 2OK2A 3HSTA 4RJZA 5CMMA 1IITA 3FV1A 3N6TA 4QFOA 2FYIA 4KHZE 3QXMA 3B6TA 2F7AA 3IJXB 3ILUB 3IO4A 5EYFA 2A5SA 1Y1MA 1B5IA 1B0LA 4YB6A 4NWCA 1XT8A 1ZTYA 3M3FA 2ZMBA 3K2DA 1UIUA 3RT6B 1N04A 1II5A 5I57B 5A5XB 2F6GA 4G2ZA 2FA7A 3MQ9A 2KLFA 3IB1A 1B3LA 4FEDA 5I57A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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