3T9HB

Kainate bound to a double cysteine mutant (a452c/s652c) of the ligand binding domain of glua2
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGCRDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDCGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Mechanism of AMPA Receptor Activation by Partial Agonists: DISULFIDE TRAPPING OF CLOSED LOBE CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 86
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9hB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9hB02
4LUBA 1AIVA 1QW0A 4F1VA 3L6HA 2X7QA 5CMMA 1GTKA 2XXVA 3OELA 1Y9UA 5KDTB 2I0BA 4KPTA 1TT1A 2DWJA 4NWDA 1SVXB 4OMBA 3D4CA 2H9BA 1AH5A 3FXQA 4ELRA 4HTGA 3FATA 5FHOA 3CR9A 4JWXA 2Z8FA 2HAUA 5I57A 2XXTA 4KQPA 3LBSA 4YMBA 4Q0CA 4UACA 4FECA 3CG3A 3LSLA 2V3QA 3H4ZA 3O97A 1B7ZA 2CZLA 4Z0IA 4F2OA 3QK6A 3KEIA 5H8QB 4FAJA 4GF8A 4G8MA 3R7XA 3IK6B 3B6TA 4H65A 5A5XA 1MDP1 4G68A 2A5SA 4XKNA 4WKMA 4YKIA 3M3LA 1MXYA 3LR1A 1LAXA 3PU5A 4U4XA 4P11A 2XD3A 5H8NB 4DXUA 3IL1B 4ZECA 1NKXA 1OMPA 4IO6A 3Q26A 5KCJB 3T93B 3IOWA 1XHYA 1IITA 2AYSA 5CBRA 3A3CA 4F1YA 1MY0A 2GHBA 3RLFE 1MQJA 5H8HA 2Y7IA 1FQCA 1SW5A 3CIJA 1M5FA 1BTJA 5L9MA 1JW1A 1FTLA 2ALUA 1A54A 3UK4A 1EZOA 1B3GA 3TDJA 4Q30B 2HFBA 3G3JA 5AA4A 1B1XA 1FW0A 1UQWA 3OD7A 2QS2A 4RY1A 1P1WA 3S9NC 2R6GE 1LCTA 3OO6A 3O9PA 1XS5A 1IQ7A 3O29A 3K6XA 1LB9A 1QVSA 2XXRA 4I1DA 2RC9A 4ZS9A 3PPRA 3N94A 1US5A 2B3FA 3P7IA 1N3XA 4QSEA 3T66A 4YAHX 4PFWA 2DWHA 2YLNA 4RK2A 3V5AA 1Y4TA 2XXYA 2DQVA 3K0VA 4IO4A 1PB9A 4EXKA 1B51A 2H25A 4BDMA 5FHNA 3TCGA 3FXUA 1LAHE 3G3FA 3FJ7A 4NWCA 4OWDA 1MM7A 4XIGQ 2HCAA 4POXA 2UVIA 1B40A 2H99A 3I3VA 4DXBA 1B5IA 2P0SA 3TUSA 1IIWA 1OLCA 1P1QA 4XKRA 5JTYA 2M8CA 3SEXA 5K2XA 3SEVA 1QKAA 2RC7A 4OVJA 3TTKA 4IY5A 3PMVA 2F7AA 2QS1A 2LAOA 3TELA 4FJPA 3U8QA 2DXRA 2Z8EA 3OO7A 2F34A 4EXLA 3S9MC 4KI0E 3SEYA 2F7CA 3QUJA 3H6UA 1ZBMA 1MXWA 3USDA 5DEXB 4QSCA 1SD3A 3FJGA 3E3KA 3S9LC 2VD2A 5TP9B 1LB8A 2PX1A 4ZEBA 3EHTA 4EQ9A 4YKJA 5IAIA 3CI8A 4JXIA 1O7TA 1B3LA 4G77A 3UGWA 3TTRA 4F3PA 3IJOB 4IO5A 1NNFA 1N84A 3SEWA 2F36A 4LQ5A 2V3UA 3LC8A 3S9EA 4ZZEA 1BLFA 1NNPA 2XXPA 1A99A 4RJZA 2I6EA 4WXJA 3ZKLA 1N7WA 1D9YA 2NWJA 4U23A 2QS4A 1H44A 3PGFA 5I57B 3PUVE 1ZJLA 4F1UA 2OLBA 4MF3A 1URGA 3TMGA 3KGCA 3ONMA 2RINA 1VFDA 2GH9A 3K1PA 3EN3A 1S9TA 2A5TA 2XXXA 2QJEA 3JYRA 4ESXA 3PD8A 1Z7ME 2HXWA 1DMBA 3MC2A 3H7MA 3MZ1A 5A5XB 3TTNA 2Y7WA 4JDFA 2AIXA 2F6GA 5CC2A 3T96B 4G68B 1B0LA 1IXHA 4DCYA 5I59A 1B6HA 3DM0A 4H5GA 2Y7PA 5I56B 1OLAA 2DVZA 4F2QA 4LONB 3PPQA 3RTFB 2XXIA 4AB6A 3IB2A 2B65A 1M5CA 1XVXA 4PFTA 5AA2D 3MQ9A 4UA8A 3KBRA 2PVUA 3SDFA 1LAFE 3KN7A 2PBWA 2PT1A 3T9VA 1JEVA 3RT6B 4R72A 4YKPA 1PBPA 3PMXA 2Q88A 5ICTA 4LQ2A 4QRZA 3PMWA 4DE8A 2R9JA 1USYE 3FVNA 4N13A 3OMBA 3E9XA 1QJMA 5AA4B 4Q8RA 3Q27A 1MQIA 1B1HA 1WODA 4E0WA 4GQOA 3K02A 4R9FA 3QUFA 4GRKA 4GOTA 1YPNA 2Q2CA 2F5XA 4IGTA 2DSFA 3W9WA 3V83A 1H43A 4U1OA 1US4A 4BDLA 2XX8A 4KFQA 3KSXA 1JW4A 4NF8A 4OYVA 1QUJA 4HW8A 3GBAA 5I2NA 5FTIA 2AL4A 3OEMA 1VE4A 4H5FA 5H8SA 1L5TA 5FTHA 4GXAA 3UN6A 2UVGA 1SW2A 2B3BA 3CFXA 4E0XA 1I6AA 3KN8A 2HQ0A 3CVGA 3TCFA 1JQFA 1DPEA 4MBPA 3MJNA 3C4MA 4NMYA 3N5LA 1IXCA 3L6GA 4H8IA 4O3AA 4X48A 3GXAA 4NTLA 4YZZA 1NH7A 3RUMA 5ITPA 4QFPA 3TQLA 3RT8A 1B2HA 1LBCA 5JTYB 4EQBA 1FTOA 1FTKA 1DTGA 5FHMA 1H76A 3CSGA 2Q2AA 3K4UA 1Y4CA 3C32A 1DOTA 4QFKA 4KHZE 3QSLA 3K2DA 1EZPA 1YAEA 4NE4A 4KCCA 4LZ8A 4ELPA 4KR5A 1PEBA 1B52A 3UA8A 4BDQA 1SYHA 2IA4A 3TFLA 3TODA 4IY6A 4P0IA 3G7WA 3TTLA 3ILTB 1BKAA 3H6WA 3FD3A 1PB8A 1NNKA 1MY2A 3HCQA 3VXCA 3A3UA 4NF6A 4F3BA 1R9LA 1P99A 5F1QA 1MY3A 1NL5A 1B7UA 1B5HA 2H98A 5AA2B 4GIZA 4F3GA 4R6HA 4EDPA 3B6WA 3OO8A 4JSDA 3U93A 1NFTA 4F31B 3FUZA 4G68C 3VDFA 4U2RA 2GHAA 1SQYA 4F19A 3IB1A 1B3FA 2D5WA 4QF9A 1FCKA 3FIRA 3N6TA 2ONRA 3KG2A 1HSJA 2F35A 2A5TB 2Z22A 3H03A 5K2YA 3LSFB 2I3WA 3IOVA 4ZZAA 4H0WA 2I3VA 5TPAA 2WKYA 4F3SA 5IKBA 4R9GA 4G8HA 3SERA 2QSXA 2P1SA 4MLQA 1UTBB 3PUZE 2H4IA 4ZEKA 3EHSA 1JVXA 3IX1A 4PQJA 3MVZA 3O6HA 3BFUA 2GRVA 3MAMA 3PUYE 2PYYA 1FTJA 3MVWA 4XTCQ 4ZE8A 4ONYA 4MH5A 1RYXA 5EYFA 4OQOA 4FIMA 2OCUA 4ZEDA 4L17A 4R75A 1GV8A 2OK2A 4K3FA 1MY4A 5ELVA 1EZ9A 1DTZA 4G4PA 5CMCA 4XXUA 1JEUA 2VGQA 3EPEA 1SI1A 1B4HA 1S50A 2AL5A 2XX7A 3ZS6A 2DVCA 5JEIA 4RA1A 1EH3A 5TU0A 1JETA 2NXOA 3SEUA 3VVFA 1URDA 1VSOA 5AE4A 4NF4A 4IO7A 2GFEA 4R6YA 4F22A 4OERA 1I6BA 4HCYA 3FV2A 1II5A 2Y84A 2F7BA 2Z23A 3C33A 4PE5B 5HPQA 2VHAA 3K01A 2HZLA 1Y3PA 2ZNSA 4F39A 3G3KA 1LFIA 2DE3A 1B46A 2YJPA 3MW0A 1URSA 3FV1A 4H8JA 4C0RA 4DCXA 5ITOA 1PBQA 2PMSA 2REGA 4JWYA 5ICQA 3C34A 2F8DA 1MH3A 3M3KA 1MQDA 5KDTA 3G3GA 2O1MA 3UIFA 1P1OA 3RTWB 1B4ZA 1TFAA 3PD9A 4DZ1A 4EQ7A 4R2BA 5HM4B 3IORA 2ZYNA 2HEUA 4AB5A 1SW4A 1VR5A 4OEUA 1POTA 3MP1A 3MVYA 3CFLA 1UIVA 1LGBC 3C31A 1Q35A 3CFZA 5I84A 1MXVA 3HN0A 3ECRA 2V25A 4R2FA 4XKPA 4ZEIA 4NF5A 5B7DA 1A7LA 3MVXA 4TLMB 1AL3A 4X1BA 2DXYA 1AOVA 4PFYA 3B7DA 3PUXE 4LZ7A 1Z7NE 4KD5A 4RYAA 1ZU0A 3A09A 4YU0A 3U92A 3QXMA 3I6VA 4WEPA 1R6ZA 1AMFA 4MLVA 4ZDMA 5KZTA 2X26A 2O84X 3ODBA 1B3HA 2RF1A 1IEJA 1MPCA 1FQFA 4DXCA 3THIA 3C35A 1A8FA 3OO9A 4U21A 4TLLB 5H8NA 2RCBA 1MXXA 3K1NA 4OFLA 1YTVA 2ZNUA 4NF6B 4N6PA 2ANJA 5KCJA 4ND9A 1MXUA 3ZSFA 5CI5A 1Y1MA 1B3EA 4KYSA 4YB7A 3U72A 1SYIA 3PPOA 3RQTA 1FQAA 2NVUB 3PUWE 3KOTA 4MFIA 4I8CA 1Q1KA 1USYH 1QULA 4H67A 4WEDA 4Z7EA 3W9VA 1HSEA 3K6VA 1XT8A 3H06B 3IO4A 1YCJA 1TXFA 1ZKBA 2I0CA 1NNTA 1B32A 2XHDA 4JB7A 5H8HB 1N0TA 4BDOA 1QUKA 4QSDA 4F18A 2Q89A 3FVGA 4BDNA 5LOMA 4F29A 1OVBA 5DTBA 1Y20A 4QFNA 4ELQA 4LP2B 3OXNA 1UTHA 2I48A 3HHGA 3KN3A 3HPIA 2H5YA 4LA9A 1OVTA 2RKMA 2ZYOA 2I58A 4EUOA 2XXWA 3HHFA 1TFDA 2REJA 3VLWA 2ZYMA 1DPPA 3JZJA 1IXGA 1FTMA 1Y1ZA 1MH4A 4POWA 2DYXA 1LAGE 5CM6A 3VLVA 2QMXA 2V3TA 3KOSA 4M1VA 1SI0A 4G2ZA 5CMKA 1T0KA 1MXZA 3MZBA 4PETA 3MP6A 4GL8A 3FVOA 4U4SA 3VV5A 3W15C 4GD5A 4YB5A 3IJXB 1FQEA 1MPDA 4IGRA 4OENA 2XXUA 1JW5A 4GFRA 2FA7A 3KZGA 3K00A 4THIA 4FORA 1ZIUA 2IEEA 4NF4B 3KJ7A 4YKKA 3VFJA 4KYEA 1RYOA 5AA1A 4ZEFA 2OWSA 5CBSA 3H6TA 1WVJA 2NUVA 4LVQA 1N3WA 1FQDA 1BP5A 3H3GA 3RN8A 3FGSA 5DT6A 4X1DA 1JNFA 2D21A 1OIBA 1A55A 5B70A 1R1NA 4NEDA 1GVCA 3MP8A 3M8UA 5L8DA 4ECFA 2QRYA 2OBGA 2OJTA 4R73A 4I62A 4Q5TA 1QUIA 1MM6A 3R26A 3LUYA 1B0HA 3O28A 2O1LA 4KCDA 1NMUA 1M5BA 2VOZA 3T9XB 4OZ9A 4DLDA 3BBRA 3HV1A 2D3IA 3EF7A 1MY1A 3ILUB 3S2VA 4RNSA 2RCAA 5DVFA 4NF5B 2THIA 3SETA 1MRPA 3DELB 1B05A 3FZVA 3D4GA 1MG1A 4EF1A 2ZYKA 4U1ZA 3EQ1A 4FE8A 4R74A 3CG1A 3VXBA 4H1XA 2DP8A 2Q9TA 4YMAA 3OOAA 5M2VA 1CB6A 5I2KA 2F78A 3KFMA 2YPNA 3O6IA 3IOTA 4HS7A 5I58A 5L9OA 2ESNA 2R71A 2F97A 2I49A 3H6VA 2NOOA 1VFEA 3MZ9A 3N26A 4IO2A 1M5EA 5I56A 2DS9A 4RPOA 3LSXA 1WDNA 1XVYA 4LZ5A 2ONSA 2UVHA 3R6UA 2HAVA 2XX9A 2DE2A 1IXIA 1N7XA 1PDAA 3OSQA 1M5DA 3RNNA 4IO3A 4QFLA 3MUQA 4EF2A 4U22A 1CE2A 5HBCA 5CRYA 5I59B 5JK4A 4FEDA 3O2AA 1POY1 3V8XB 4QFOA 1F9BA 4OESA 1LFGA 4OEVA 3DP6A 3FJMA 4G8NA 1SW1A 2F6PA 1OQGA 1SBPA 5H8FA 3U94A 3WAEA 1XC1A 1MDQA 4JWOA 3SKPA 2O6AA 4OETA 1LSTA 1EU8A 2O68A 3K1MA 3E13X 3SESA 4JSOA 3C9HA 4OFOA 2O7UA 3S4UA 3WAFA 4ELOA 1PC3A 1GGGA 3HO7A 3FASA 4LATA 1ZLQA 4OHNA 1B58A 1UTHB 2P2AA 1QKBA 5EHSA 1B5JA 4R6KA 3PV0E 1BIYA 2KLFA 3GLBA 2ONKE 4GWOA 1FQBA 4XKQA 1P1UA 1DSNA 4TQUQ 3JV9A 1S7YA 1D9VA 3G3IA 4NF8B 1LBBA 2UXAA 3FVKA 1MPBA 1O63A 5I2NB 2QMWA 2V93A 1Y3QA 4I9DA 1ELJA 4O3BA 3KJTA 3IAZA 5EHMA 2BJJX 1I6QA 5ISUA 1H3DA 2ZNTA 3K6UA 1OQHA 3O66A 3TKDA 4P0GA 2RC8A 1IUDA 1MS7A 2Y7KA 3DP4A 3VVDA 2UYEA 3MWBA 1MQHA 2O51A 2UVJA 3E4RA 1LFHA 3VLUA 1A40A 4DIGA 3TAJA 3PPNA 4YICA 1JVYA 4O3CA 4GLIA 1UIUA 3QYTA 4AQ4A 3U1OA 3LSWA 3CSBA 3VE1B 3GBBA 2FYIA 3RY3A 5J1DA 3TEPA 4N07A 3CRBA 5L9SA 1HSLA 3DLNA 3QAXA 5BWJA 4H6DA 5H8QA 3OENA 3TPAA 2O69A 4PP0A 4ISUA 5AA2A 1ATGA 3G3HA 4FEBA 1D3KA 3IB0A 3MPLA 1LCFA 1LLSA 2QPQA 2OZZA 2FNCA 3TTMA 3PPPA 1SDXA 3MBPA 1B7HA 3ZKKA 3HSTA 3QIMA 3IR1A 1D4NA 3UP9A 4BLAA 2VP1A 5DVIA 4GXSB 1TWYA 1I69A 1J1NA 2Z8DA 3OEKA 1B9JA 4GVOA 4QHQA 5I2KB 4TOZA 3K6WA 5I58B 2XXQA 2QL3A 3BKIB 1UTBA 1ANFA 2CMOA 3N6UA 4OFJA 2W7YA 4YB6A 4IB2A 3T9HB 1MQGA 1Y3NA 3Q28A 2DWAA 2I4CA 4RXLA 2VD3A 1XOCA 1P1NA 3IOUA 5TPAB 3RPWA 2Y7RA 2V84A 3TZAA 4C1UA 2DWIA 5DVJA 2XXHA 3KSJA 4C1TA 4HCWA 1H45A 2ABHA 4ZE9A 3GZGA 3EHUA 2E1SA 2OWTA 3B6QA 3O6GA 3Q25A 5F7VA 3T9UA 2PT2A 2QS3A 3MPKA 3TQWA 4JBZA 1N76A 3I5OA 3VVEA 4KYDA 1RKMA 3C36A 2UYFA 1IZ1A 5H8FB 4PFUA 5BUUA 3T22A 3Q29A 3TCHA 3V89B 1GR2A 4OTEA 1O64A 2XD2A 4FATA 3AXFA 3DP8A 1N04A 1ZTYA 2Q8JA 2E0SA 3TYHA 2ZMBA 2X7PA 5AA3A 3BFTA 3OSRA 2G93A 3F11A 1ZMGA 2DOJA 2G29A 5DYHA 2O7IA 1R9QA 1NH8A 2HZKA 1PB7A 4BDRA 3UORA 4DDDA 2DE4A 4M4GA 5CMBA 4OXVA 2I4BA 4RPNA 5DEXA 4X9TA 3IO6A 3RGYA 1KWHA 3FXRA 4RK9A 5TP9A 3M3FA 4GL0A 4ESWA 1A8EA 2ZXTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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