3T9HB

Kainate bound to a double cysteine mutant (a452c/s652c) of the ligand binding domain of glua2
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGCRDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDCGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Mechanism of AMPA Receptor Activation by Partial Agonists: DISULFIDE TRAPPING OF CLOSED LOBE CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 86
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9hB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9hB02
2F34A 1LLSA 5H8FB 2A5SA 1IIWA 3JV9A 4FEDA 3KN8A 3T93B 3U72A 4LATA 3N94A 3RGYA 2XD3A 3RTFB 4YU0A 3FV1A 5I84A 1JW4A 4F1VA 3GBBA 3K0VA 1SW5A 1Y3QA 3I6VA 1FCKA 5CBSA 5ELVA 4U2RA 1AIVA 1QUIA 4ELRA 2P2AA 4DIGA 3C33A 3MVXA 4F1UA 3FJGA 2D5WA 1BP5A 5I59A 4G8MA 4TQUQ 1JETA 2ONSA 2O51A 1P1UA 5H8NB 3O6HA 4GFRA 4YKKA 1MDP1 2Z22A 2NVUB 4GL8A 5I2KB 1NL5A 3OO9A 4C1TA 1AH5A 4F18A 1R9QA 3C34A 3KZGA 1NMUA 2ONKE 1N3XA 4F2OA 4H65A 4OENA 1POY1 5H8FA 3H3GA 4LA9A 3ZSFA 5HBCA 4R9GA 3VDFA 3VVEA 4FJPA 3VLUA 3PD9A 3H6UA 1H76A 1M5BA 1LFHA 3IX1A 4MLQA 4YMBA 3C32A 1O63A 1DTZA 1FTKA 3IORA 4GL0A 3V89B 4KR5A 1D9YA 2OZZA 4NF5B 4JXIA 3PPQA 2KLFA 4OESA 4U23A 2B65A 1B3FA 5TPAB 2DSFA 3PMWA 1HSEA 3HHFA 1LBCA 4AB5A 3VE1B 2XXUA 1B2HA 1LCFA 3SETA 5CI5A 5A5XB 4ZDMA 5BUUA 2R71A 2I6EA 3HCQA 3E3KA 5CC2A 4H5GA 1H3DA 3HPIA 2DS9A 5EHSA 3DLNA 3UP9A 3TELA 4IO2A 2FYIA 1TFAA 2GRVA 3EHSA 3W15C 1N76A 4OFLA 3KSJA 1Y1ZA 3MPLA 1B3EA 3IJXB 3IB1A 3V5AA 1H43A 4U21A 3T66A 1DPEA 2GHBA 1DOTA 3FVNA 2V25A 3CIJA 4U22A 4RYAA 4HW8A 3IJOB 2R9JA 1Y1MA 1NH8A 3TCGA 4UA8A 1VE4A 2HFBA 3K1PA 3K6VA 4ONYA 2PMSA 2UVJA 4JBZA 4GIZA 3RPWA 3DELB 1TT1A 1GGGA 3TTKA 5IKBA 1PBQA 4NF6A 4G4PA 3TODA 2A5TB 4OVJA 4KCCA 2I4BA 3UIFA 1GVCA 1GV8A 2Y84A 1B52A 4XKPA 2XXQA 5A5XA 4LP2B 2I3WA 1DTGA 1IITA 4QFLA 1DMBA 1MQHA 2HCAA 3TDJA 4OEUA 4P0IA 3FVOA 1H44A 4U1OA 4LONB 1P1QA 3RQTA 4MBPA 1SW4A 3SEUA 2F78A 2F97A 2XXRA 5ITPA 1LAHE 5JTYB 1Q1KA 3HHGA 2Y7WA 1M5FA 1MXZA 2Z8DA 4K3FA 1R6ZA 4IGTA 2O84X 4HTGA 2F7CA 3IOVA 2XXTA 2M8CA 3IOUA 4OQOA 1RKMA 4DLDA 2R6GE 2RCBA 1N7XA 1MY0A 2RF1A 1JQFA 4O3BA 4EQ7A 1LFGA 2O1LA 3T9HB 1US4A 1WVJA 1JNFA 3FXUA 4HS7A 2I49A 2Q9TA 3C35A 2UXAA 4GXAA 3TQLA 4BDMA 3S9NC 4QFNA 4WXJA 4OYVA 2OBGA 4Q30B 5CM6A 4ELOA 2DYXA 2Y7IA 5H8SA 2P0SA 4O3AA 3C9HA 2ZYMA 1MXWA 2GH9A 3G3IA 2QL3A 3KFMA 4DXCA 4LQ2A 1B7HA 3KEIA 3MQ9A 1A8FA 1PEBA 4POXA 5FHOA 5BWJA 4RPOA 5H8QB 3G3GA 1M5DA 4LZ7A 2QS4A 4QFKA 5TP9A 3SKPA 1H45A 2Q8JA 1MQIA 4I1DA 4E0XA 3VV5A 2Z8FA 3U8QA 5KDTB 4XKRA 3AXFA 1OMPA 1P99A 4OERA 2DWJA 2F8DA 2H4IA 1OQHA 1A54A 4EUOA 5ITOA 5JK4A 4YB5A 4DCXA 3EN3A 1SD3A 4MFIA 3K1NA 2PT1A 5AA4A 2DOJA 1FQDA 4X1BA 2DWIA 1B58A 1B5IA 2ESNA 3K6WA 4KQPA 3K02A 4QSCA 1OLCA 3MAMA 2D3IA 1ANFA 4JWXA 4KYEA 2ABHA 3TEPA 1MPBA 3CI8A 1UQWA 3LC8A 4NF8A 4PQJA 4DXBA 5AA2A 2QSXA 3N5LA 1MPCA 4LZ8A 1QUJA 3TTNA 2VHAA 4N6PA 3OMBA 2YJPA 3K00A 3OEMA 2XX9A 4X9TA 3W9VA 1YPNA 5H8QA 3UORA 1D4NA 3KN7A 3ILUB 3OOAA 2F7AA 3OELA 5I59B 3SESA 3UN6A 1B6HA 1ZJLA 1HSJA 1NNPA 3CSBA 2V93A 4LQ5A 3TMGA 3TCHA 5I56A 5KDTA 4R2BA 2XD2A 1B3GA 3BKIB 1SI0A 4H6DA 4BDOA 4M4GA 3N6TA 1B5JA 1XVXA 2X7PA 1UTBA 4HCWA 2P1SA 2DQVA 4QRZA 2AIXA 3GBAA 3IK6B 2RC8A 1Y20A 1B40A 3KG2A 5IAIA 3EHTA 3QYTA 3WAEA 3ODBA 4LZ5A 2OJTA 2UVIA 1LBBA 4MLVA 5KCJA 4NWDA 2PYYA 4RA1A 3S2VA 2VD3A 4EDPA 1I69A 3KN3A 3Q28A 2NWJA 1YTVA 2VGQA 1N04A 1SVXB 5DEXA 3OO7A 3MVZA 4JDFA 3TPAA 4H1XA 3ZS6A 2ZXTA 4GWOA 2RINA 2RKMA 2H25A 3O9PA 1PC3A 3ZKKA 5CRYA 2XXXA 4OFOA 3SERA 4YKJA 2XHDA 2FNCA 2H5YA 3KJTA 3BBRA 3HO7A 2D21A 4N13A 5I58B 2QS3A 1IUDA 2W7YA 4FEBA 1CE2A 2HZKA 4DXUA 3PPNA 1MXXA 4KHZE 5I2NB 3OO8A 1DPPA 1QJMA 4KD5A 3EHUA 4EF1A 2DWAA 2I48A 2Q2CA 3PPOA 3IO6A 2NXOA 4F31B 4KCDA 1MM6A 1NNFA 1XT8A 4E0WA 3TYHA 5FHNA 1Y4TA 3ZKLA 2DE3A 3KOSA 4Q5TA 2Q2AA 4H8JA 2H99A 1AMFA 3TTRA 4R6YA 3LSWA 4F3PA 4ZEIA 1Y4CA 4ZEDA 4MF3A 1B32A 3T9VA 4F1YA 4G68C 1BLFA 3F11A 3IAZA 1N0TA 4NF6B 1SDXA 3EPEA 2PVUA 3PMXA 4G77A 1URSA 1PBPA 2CZLA 5DVJA 1FQBA 4BDRA 2DVCA 2NOOA 2V3TA 2F5XA 3G7WA 1ZKBA 4UACA 3M3FA 5I58A 4I8CA 2OWSA 1QKBA 3FVGA 2Q89A 1OVTA 3SDFA 2QMXA 1SYHA 3GZGA 3KSXA 4FATA 1EZ9A 5I2NA 4WEPA 4EXKA 1PB7A 4G2ZA 3MP6A 4L17A 4G8HA 4ZEFA 1ZMGA 1IQ7A 4PFWA 1FQAA 4ZECA 3Q25A 4YKPA 3TZAA 4C1UA 3LR1A 3QIMA 1XS5A 1YCJA 2DE4A 5FTHA 3CR9A 2G29A 1O64A 2DVZA 3JYRA 4YMAA 2ZMBA 3MP1A 3USDA 2QS2A 1EZOA 3E13X 3LSFB 3O28A 3H6TA 3CVGA 2F36A 1IXIA 4NEDA 3S9EA 1FTLA 3FUZA 4H5FA 3FV2A 4Q0CA 2X26A 4OEVA 1TWYA 1N84A 2ZNUA 5ISUA 1XOCA 1XVYA 3Q27A 4R73A 1VR5A 1B7UA 2OCUA 1QUKA 2HQ0A 4KYDA 3FVKA 4C0RA 2RC7A 3ONMA 1S7YA 2HZLA 3CSGA 2H9BA 4ND9A 1PB8A 3CFLA 3FXQA 4RY1A 4Z0IA 1B51A 4F3BA 4I9DA 4KPTA 2X7QA 1A8EA 4U1ZA 4GVOA 5CMBA 4GF8A 2F6GA 2I0BA 4OETA 5TP9B 1SQYA 4R6KA 3LBSA 2QPQA 2UYEA 1I6AA 3HN0A 3CFZA 4R72A 4TLMB 2OK2A 5FHMA 3MP8A 2XX8A 3TCFA 1P1OA 3T9XB 3K01A 2XXPA 3OENA 1SI1A 4TLLB 1B0HA 3BFUA 1LSTA 1Z7NE 4NF4B 4NE4A 3U93A 4FORA 5AA4B 3C4MA 4TOZA 4F2QA 3A09A 4WEDA 5AA1A 5L9SA 3G3FA 3PUVE 2O6AA 5F7VA 1EH3A 4XIGQ 3U92A 2F6PA 2H98A 3IOTA 2I4CA 4OHNA 4EQ9A 2HXWA 4Z7EA 4NWCA 1AL3A 1FTMA 3V8XB 3CRBA 1IXGA 2ZYOA 4IO5A 4NF8B 5AA2B 4ZE8A 1A55A 4Q8RA 2VD2A 1XHYA 4I62A 4U4XA 2IA4A 2ZNTA 1LFIA 1A40A 4R6HA 1MPDA 2PT2A 1JW5A 3IB2A 1MY3A 1OVBA 3UK4A 4X48A 3H03A 1JVXA 3OXNA 3MPKA 2B3FA 4PFYA 5I56B 1TFDA 3T9UA 2AL4A 3LSLA 1USYH 1URGA 2Z8EA 2OWTA 1D9VA 4ZE9A 3PPRA 1A99A 2I3VA 1MY2A 4NF4A 1UTBB 1QVSA 3PV0E 3H4ZA 1S50A 1MRPA 3MZ1A 3E9XA 5J1DA 1JEUA 3SEYA 3GLBA 4OWDA 4FIMA 1JVYA 3K1MA 5CMCA 3N26A 2DP8A 1LAXA 1S9TA 4FECA 3VLVA 4OXVA 1LGBC 5KCJB 3TFLA 3M3LA 4H0WA 1NNTA 3M8UA 2ALUA 5AA2D 3H6WA 2NUVA 3I3VA 3S9MC 3QAXA 1LB8A 3VFJA 4JB7A 2HAUA 3FD3A 3O97A 4F22A 1JEVA 5DEXB 1R9LA 1ZLQA 3IO4A 3RUMA 2AYSA 4F39A 1MXYA 4LUBA 5H8HA 2UVHA 2O68A 3D4GA 4RK9A 5FTIA 3KGCA 4OZ9A 3GXAA 3MZ9A 2ZNSA 5F1QA 3FJMA 1UIVA 5I57A 2GHAA 3VXBA 4IY5A 1QULA 1MM7A 3K6XA 2GFEA 3PGFA 3HV1A 1SYIA 5L9OA 3SEXA 3O29A 1L5TA 1NKXA 3OO6A 4RXLA 3VVDA 4XTCQ 3PUYE 5K2YA 1MS7A 2O1MA 2RC9A 4R9FA 4F29A 3P7IA 3TTLA 1SW2A 3CG3A 1FQFA 5AA3A 4PP0A 4R2FA 1MXUA 5DVFA 5HM4B 2I58A 3K6UA 1XC1A 2XXIA 2UVGA 1MQDA 4JWYA 2O69A 1B46A 3DP8A 1OQGA 3QUFA 3KOTA 4RNSA 4ECFA 1O7TA 3G3JA 5KZTA 4BDNA 1LAFE 3B6WA 4ELPA 3T96B 4YAHX 1I6BA 4NMYA 4KYSA 4M1VA 1ELJA 2HAVA 5AE4A 3FZVA 2QS1A 3RLFE 1YAEA 4F3SA 2AL5A 2G93A 1IEJA 4G68B 4XXUA 3U1OA 1MQJA 1B5HA 3R26A 2THIA 4N07A 4LVQA 4U4SA 4DDDA 3MC2A 3M3KA 1BIYA 2V84A 3O6GA 5L9MA 2ZYKA 4YICA 1FTJA 3O6IA 1B0LA 3IB0A 4YB6A 4P11A 1T0KA 3RY3A 3MJNA 3LUYA 1GTKA 3OSQA 2FA7A 1MXVA 3Q29A 3W9WA 1B1XA 4GXSB 3RTWB 4GD5A 1Y3PA 3O66A 5CMMA 3PUWE 4GRKA 1MDQA 2XXVA 3FASA 1KWHA 1TXFA 4ZEKA 1GR2A 4JSOA 2DXYA 3B6TA 3MW0A 4ZS9A 3UA8A 4X1DA 3K2DA 4RK2A 1MH4A 4IY6A 3I5OA 3QK6A 4IO7A 3VVFA 3ECRA 1EU8A 4IO6A 3PMVA 5DYHA 4G68A 2CMOA 3SEWA 2XXWA 2RCAA 4BDQA 1LB9A 4ESWA 4IGRA 2DWHA 5DTBA 4EQBA 3TUSA 3MUQA 4BDLA 2REGA 3ILTB 3DP4A 1IXHA 3RN8A 5H8NA 1FTOA 4ESXA 4KI0E 4PE5B 1ZIUA 5I2KA 1M5CA 3OSRA 5M2VA 4IB2A 1ATGA 3MVYA 4P0GA 4XKNA 2PBWA 4F19A 3R7XA 2Y7KA 3QSLA 3G3KA 3MVWA 3L6HA 1B05A 3FIRA 1NFTA 3TKDA 5ICQA 4AB6A 1B1HA 3C31A 3VXCA 2ANJA 4THIA 4OTEA 3K4UA 1CB6A 3CG1A 3DM0A 1P1WA 1J1NA 1Y3NA 1RYOA 3B6QA 1UIUA 1IZ1A 2Z23A 3Q26A 3EF7A 3HSTA 3A3CA 3S4UA 1ZBMA 1BTJA 1P1NA 3RT8A 1II5A 2E0SA 3IR1A 5EYFA 1SW1A 4NF5A 4GLIA 2I0CA 5CMKA 2F35A 5K2XA 1RYXA 3A3UA 2UYFA 4FAJA 1USYE 5TPAA 5CBRA 1URDA 2V3UA 3WAFA 3IL1B 1QKAA 3DP6A 3QUJA 2WKYA 4RPNA 1Y9UA 1MY4A 1MG1A 3TAJA 4ISUA 5EHMA 1M5EA 4F3GA 3R6UA 1BKAA 1US5A 4XKQA 1B3LA 1Q35A 2YPNA 4QF9A 1MY1A 1OLAA 2REJA 4QSDA 4AQ4A 3H6VA 4HCYA 3TTMA 3FXRA 4WKMA 3UGWA 4GQOA 4KFQA 1F9BA 1WDNA 1A7LA 5JEIA 2ZYNA 2F7BA 1ZU0A 4GOTA 3H7MA 3FGSA 1DSNA 1UTHB 2XXHA 3B7DA 4QFPA 2A5TA 2PX1A 3TQWA 4MH5A 5B7DA 4BLAA 1B4ZA 4JSDA 5B70A 4R74A 4PETA 1D3KA 2LAOA 1B9JA 5DVIA 3KJ7A 3QXMA 1POTA 5LOMA 4H8IA 4ZEBA 3H06B 1QW0A 1ZTYA 2VOZA 4POWA 3U94A 3OD7A 3G3HA 1FQCA 3MZBA 1Z7ME 5H8HB 4IO4A 2OLBA 4IO3A 3MBPA 1JW1A 3RT6B 1SBPA 3FJ7A 1B3HA 3LSXA 3MWBA 1B7ZA 2XX7A 5JTYA 5I57B 1VFDA 2YLNA 4ZZEA 3O2AA 1OIBA 4YB7A 2V3QA 4PFTA 2QMWA 2O7UA 1LCTA 3KBRA 2Y7PA 3N6UA 3THIA 2Q88A 4JWOA 1PDAA 1VSOA 3EQ1A 3SEVA 4QFOA 3RNNA 1HSLA 3D4CA 4G8NA 3T22A 1NNKA 5L8DA 3S9LC 3FATA 3VLWA 1UTHA 2IEEA 3PU5A 1FQEA 2HEUA 1I6QA 3IOWA 1WODA 2B3BA 4RJZA 2BJJX 3L6GA 2QJEA 1N3WA 3C36A 1PB9A 2Y7RA 4QHQA 4FE8A 4PFUA 4ZZAA 3PD8A 4H67A 3E4RA 1N7WA 2ONRA 4YKIA 2XXYA 4DCYA 4NTLA 5TU0A 4EF2A 1LAGE 1MQGA 2O7IA 2VP1A 1AOVA 5DT6A 4OFJA 2E1SA 3BFTA 1EZPA 1R1NA 1NH7A 4OMBA 3OEKA 1IXCA 5ICTA 4R75A 3PUXE 3V83A 5HPQA 4EXLA 4QSEA 2DE2A 2DXRA 3JZJA 4ELQA 4DZ1A 3PUZE 4DE8A 1FW0A 4YZZA 1VFEA 2QRYA 4O3CA 1MH3A 3PPPA 3CFXA 1B4HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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