4RXLA

Crystal structure of molybdenum abc transporter solute binding protein vc_a0726 from vibrio cholerae, target efi-510913, in complex with tungstate
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
229
structure length
229
Chain Sequence
TLHIYAASSMTNAVNALVADYSQQHDVKLVTVYGGSSSLARQIEAGAPADLFISANEEWANYLVEKGLVKPNKVVTLAANSLVLIRPTAQPVASFELQDAAAWQTALADSRLAVAQVDAVPAGMYAKQALQHAGVWPELESRLAQTNNVRLALALVERGESPLGIVYKTDALLSDKVTIVTAFSAQSHQPIRYPLAQLNDKAASAEWVAYLRSDAAQQILQRFGFESVS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdenum-binding p
publication title Crystal Structure of Molybdate Transporter Vc_A0726 from Vibrio Cholerae, Target EFI-510913
rcsb
source organism Vibrio cholerae
total genus 74
structure length 229
sequence length 229
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4rxlA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4rxlA02
1B46A 3OEKA 3B7DA 5DVJA 3HV1A 3Q29A 1IXGA 1QUKA 4LQ5A 3I3VA 2F8DA 2F34A 1B32A 1GVCA 3W15C 3IORA 1DPEA 1ZBMA 1LB8A 1P1UA 3MJNA 3DP4A 3QUFA 3H3GA 3R6UA 2P0SA 2X26A 1FQEA 2XD2A 3C4MA 1B3FA 5KCJB 2B65A 4KCCA 3U94A 1JETA 2DSFA 2RC9A 4ZEDA 1M5DA 3FXRA 1MQGA 2IA4A 4RYAA 1FTJA 4OEVA 4EXLA 1FQCA 3T22A 2DS9A 1I6AA 1QUJA 4PFTA 2GH9A 1OVTA 3CR9A 2QS1A 1N04A 3MZ1A 3RLFE 4HCWA 2P1SA 4OHNA 1UIUA 3MW0A 4EF2A 4TLLB 4JWYA 3O29A 4MLVA 4O3AA 3R7XA 1SBPA 4X1BA 3IAZA 1JVYA 1B5IA 3GBAA 3H6WA 5B7DA 3MZBA 3FJGA 1HSLA 3BKIB 2A5TA 2I6EA 3I5OA 3TCFA 4KYEA 5EYFA 4NF5B 3VLUA 3S9LC 4JSDA 5H8QA 2GRVA 1A8EA 2XXRA 1IQ7A 1TT1A 4YICA 2V25A 2F35A 1FTOA 1MXUA 3IJXB 4XKQA 3BBRA 4H8IA 3QXMA 2QSXA 4RNSA 1PEBA 4K3FA 1ZKBA 1MQDA 4Q5TA 3LUYA 1RKMA 3S2VA 1H3DA 2QL3A 3OD7A 4DZ1A 4MFIA 3O97A 1IZ1A 2QJEA 2UVHA 2WKYA 3JV9A 2XXYA 3RT8A 2HXWA 2RCBA 4C0RA 4LA9A 3U72A 3G3KA 5H8FA 3PD9A 4U4SA 4GF8A 1I69A 1IIWA 3FUZA 5DEXA 3U1OA 4F3PA 3PMWA 1L5TA 4RPOA 1NNKA 4Z7EA 4LP2B 3O28A 5L8DA 1PB7A 4IGRA 3PMXA 4ELPA 2BJJX 2PBWA 1Y1MA 4R6HA 4IY5A 1DTGA 1FCKA 3FXQA 2Z22A 5H8HB 5I57A 4DCXA 3U93A 1MQJA 1SYHA 1POY1 3A3CA 2AYSA 4ND9A 2AIXA 2DE2A 3SESA 3V83A 3B6QA 4YB6A 3N5LA 4H0WA 1O63A 3OO7A 3CG1A 1JW1A 3RQTA 2P2AA 3PPQA 4C1TA 3MAMA 3FGSA 1P1OA 4ECFA 3H6VA 1OLCA 1A40A 2XXIA 2ALUA 3UGWA 3DP6A 2GFEA 2HZLA 2DYXA 3KGCA 4LZ5A 1MY0A 3A3UA 3VVEA 2Q9TA 4IO4A 3Q26A 3FZVA 4ZEIA 3G3HA 2REJA 1QUIA 4ZEFA 3O9PA 2F7BA 3RTFB 1OLAA 5ICTA 3C31A 3QAXA 3DM0A 2DOJA 4NF8B 5IKBA 2R71A 4QSDA 2XXQA 5HM4B 5I2KB 3PPNA 2Q2CA 3KEIA 4LATA 1EZPA 3E4RA 3GXAA 4IO5A 3CIJA 4OETA 1B9JA 3PMVA 1VE4A 1IEJA 2OK2A 2I3WA 4YAHX 5F7VA 2XXHA 4BDMA 3T93B 4DCYA 4NF6B 5FHOA 4NF4B 1NKXA 1POTA 1QKAA 3OXNA 4YMBA 3TDJA 1OVBA 3EHSA 4OZ9A 3PD8A 1RYXA 4F31B 4FEBA 1ANFA 3VE1B 4L17A 3WAEA 2R9JA 5DYHA 2PVUA 2VD2A 3PUXE 3M3FA 3Q27A 1LAXA 4XTCQ 3PPPA 3I6VA 5H8HA 4TQUQ 1MXWA 1B7UA 2ANJA 2H98A 4KFQA 4PQJA 3TEPA 4RPNA 4F2OA 1B0HA 1LLSA 3LR1A 5ICQA 1Y3QA 2OZZA 1A7LA 1XC1A 3DELB 1R9LA 1NNFA 3IO6A 1WODA 2LAOA 1GGGA 1FQAA 2ZNTA 1Z7NE 2Z8FA 2OLBA 1SDXA 1MY1A 2H9BA 2UVIA 4AB5A 4FJPA 5H8NB 3QK6A 1XOCA 4NE4A 2H25A 3RY3A 5I56A 1DSNA 4G68B 4EDPA 3E3KA 1Y9UA 3D4CA 4RK2A 2ONRA 1B3EA 1LFGA 1Y3PA 4ZEKA 1MG1A 3KN3A 1MS7A 1B2HA 5JTYA 2B3FA 1B52A 1B3LA 2E0SA 1FQDA 2XXWA 5I2NA 4FEDA 1SD3A 2GHBA 3S9EA 3OOAA 1YAEA 1LB9A 3TCGA 4AB6A 4F22A 4RJZA 1D9VA 4N07A 2E1SA 1Z7ME 4EUOA 3H06B 4QF9A 2O84X 4QFKA 3LSWA 2VOZA 4PP0A 1ZJLA 1FTMA 2UYEA 1P99A 3PU5A 1ZU0A 1JW5A 5L9MA 3T96B 3UN6A 4G68C 2XXXA 2DXYA 5I58A 3H7MA 4KI0E 5CRYA 4NF6A 4GVOA 5L9SA 1VFEA 3FVKA 3O66A 4M1VA 4G8NA 4G8MA 5CMKA 3D4GA 4BDRA 1MH3A 5AA2B 3CSGA 3VXBA 3OEMA 3TTLA 3F11A 3MVYA 4E0WA 2ZNUA 5CMCA 5I59A 3FD3A 4F29A 4H5GA 2PMSA 1N76A 4ELRA 4R75A 2RKMA 4YKPA 4HCYA 4U22A 4DXCA 3USDA 2ZYMA 2HCAA 2I0BA 4GL8A 4PFYA 2O1MA 3CI8A 1B51A 3EN3A 1YPNA 1EZ9A 1Y1ZA 3K6UA 4BDQA 4GQOA 2PT1A 3C35A 2Z8EA 3THIA 1UTBA 1H45A 4OFOA 3IOVA 2O6AA 3PPRA 3SEVA 1N84A 1B1XA 1ZTYA 2R6GE 3IB0A 1SYIA 4UACA 5FTIA 5KZTA 4JBZA 4N6PA 4EQ9A 2H4IA 5FHMA 2D5WA 2HAVA 1JEUA 3EQ1A 3TODA 4U1ZA 4QFNA 3R26A 4C1UA 1PBQA 1PDAA 5ITOA 1Y4CA 3FJMA 5ITPA 4JWOA 5A5XB 3CFLA 1R1NA 3S4UA 4EXKA 5CMMA 1IXHA 1CE2A 1PBPA 1ZMGA 2I58A 2V93A 3MQ9A 3N26A 1VR5A 4QFLA 4F2QA 2Q89A 2NVUB 4JXIA 5AA4B 4H8JA 4MF3A 1IXIA 3BFTA 1QKBA 1Y4TA 5I84A 5CBRA 5AA3A 3O6GA 4Z0IA 3DP8A 1I6QA 3CSBA 1EU8A 3MUQA 3ILTB 3KG2A 1F9BA 1D3KA 4E0XA 2O68A 3Q25A 4NEDA 3FV2A 1B40A 4XKPA 1OIBA 3SDFA 3VLWA 1PB9A 1II5A 5TPAA 4WEDA 4GOTA 4QFOA 3PV0E 1JVXA 2D21A 1DPPA 3RNNA 2CMOA 3KN7A 3MP8A 3IB1A 3JYRA 1NH8A 4IB2A 4HW8A 3S9MC 5F1QA 4DXUA 3DLNA 3IL1B 3MVZA 1FW0A 1Y3NA 1QJMA 4POWA 1T0KA 2NXOA 4ELOA 4G2ZA 2V3TA 3EPEA 5HBCA 3RTWB 4OFJA 2F36A 4R2FA 2NOOA 4PFUA 5IAIA 1NMUA 3VLVA 1Q1KA 2DQVA 5KCJA 1WVJA 3TTKA 5L9OA 2XHDA 1M5BA 2O51A 1LAFE 2Q8JA 4I9DA 4FORA 3HSTA 2YLNA 3VXCA 1MY3A 1CB6A 1NH7A 4ZEBA 1SVXB 4FIMA 4GD5A 3MVWA 1B0LA 4U2RA 1IITA 3MPLA 1HSJA 1URDA 4R2BA 3K1NA 3KN8A 3FJ7A 2HQ0A 3O6IA 4ELQA 2I4BA 5K2YA 3TCHA 4OQOA 2IEEA 2QMXA 3MPKA 2UXAA 4POXA 2UYFA 3SEUA 1KWHA 3ECRA 2QPQA 1LCFA 1VSOA 4XIGQ 5DVIA 1XT8A 4PE5B 3IOTA 1MDP1 2O7IA 3PUYE 1UTHB 1UQWA 1MXXA 4LUBA 4M4GA 4ESWA 2Y7WA 2X7PA 4NF5A 3CG3A 1JNFA 2DXRA 2NWJA 4IGTA 3TUSA 3OELA 4H5FA 1B4ZA 3TQWA 5AA1A 3KZGA 5DTBA 2GHAA 2PYYA 4QRZA 1MQIA 3FVOA 1B5JA 3SEXA 1N7WA 4ZDMA 2OBGA 3PUZE 4Q8RA 1N7XA 3IX1A 4F3GA 4LQ2A 3WAFA 3ODBA 3B6WA 5KDTB 3IO4A 2I48A 4ZZEA 2V3QA 1M5EA 2XXUA 5TP9B 1S9TA 1GV8A 1IUDA 2F5XA 4OESA 1A8FA 3LSFB 3AXFA 3C33A 5CM6A 3K6XA 4FE8A 4EF1A 3KJTA 1SW1A 3HHFA 4KR5A 4FECA 1SQYA 3RUMA 3QSLA 4PETA 3K6WA 4ZE9A 1BKAA 1NL5A 1BP5A 3MP6A 4IO7A 1B7HA 3UORA 3K1PA 3G3GA 4U23A 2QS3A 3MC2A 1LFIA 3PUWE 2DVZA 4H6DA 3K02A 3RGYA 4IO2A 3MP1A 4R6KA 1LCTA 3VDFA 4TOZA 4H65A 4BDOA 4YMAA 1TFAA 3TPAA 1FQFA 3HCQA 5J1DA 1BTJA 4NTLA 4R73A 1Y20A 2QS4A 3C36A 3MVXA 1A54A 2QMWA 4JB7A 2O1LA 1MM7A 4WXJA 4N13A 2I0CA 1AMFA 2ONSA 2Y7PA 4YKIA 1LGBC 1WDNA 4YKJA 5DVFA 3K4UA 5BUUA 3O6HA 1SW5A 3H03A 3S9NC 4HS7A 3M8UA 4I62A 1LAGE 1TFDA 3FATA 3G7WA 3LSXA 3VVFA 2DWAA 1H76A 1USYE 4KCDA 4LONB 5B70A 1DMBA 4ESXA 4GXSB 4NF8A 3PPOA 5I2KA 4RXLA 4Q0CA 3HPIA 3RT6B 4Q30B 2A5TB 2XXVA 1B7ZA 4OYVA 3VFJA 3KFMA 4OVJA 3UP9A 3T9XB 1GR2A 2VD3A 5H8QB 1MXYA 4U21A 3LBSA 5LOMA 2F6GA 3RN8A 3K2DA 3KSXA 4FAJA 4DLDA 5AE4A 2G29A 1EZOA 2OJTA 4NF4A 3CVGA 2ZXTA 3ZS6A 3UK4A 2VP1A 1IXCA 1AOVA 4GWOA 3O2AA 4R9FA 1MY2A 2Z8DA 1DOTA 4ZZAA 4ZECA 4OTEA 4XKNA 3N6UA 1P1NA 2HAUA 1S50A 3B6TA 4KHZE 5CI5A 1MXVA 4YZZA 1FTKA 4WEPA 1DTZA 4R6YA 1FTLA 2OWTA 4ZE8A 4G77A 1J1NA 2DE3A 3RPWA 4UA8A 4GXAA 3SKPA 1Q35A 1LFHA 1M5CA 1MPDA 2F7AA 5H8FB 5DEXB 1RYOA 4U1OA 1JEVA 2HZKA 2RINA 3IR1A 3K1MA 3TYHA 4OXVA 3IJOB 1NNPA 4ISUA 3C34A 4XKRA 3ZSFA 2H5YA 4THIA 5I57B 4DE8A 1H44A 5H8SA 2XX7A 5H8NA 3TMGA 4I8CA 4ZS9A 3OO8A 3CFZA 4G68A 5BWJA 1EH3A 2KLFA 3C9HA 1OQHA 4ONYA 4YB5A 1ATGA 5AA2D 2B3BA 2DE4A 3K0VA 1LSTA 3FVNA 4JSOA 3T9VA 1TWYA 1ELJA 4F1UA 4QFPA 3G3JA 1LBBA 3EHUA 3FXUA 4IO3A 2FNCA 1MXZA 3EHTA 5FTHA 4KYDA 1H43A 2XXTA 1MH4A 2RC8A 2I4CA 1SI1A 1AL3A 3M3LA 1URSA 4R74A 3H4ZA 1NFTA 3H6TA 5ISUA 2OCUA 2RC7A 4GLIA 1UIVA 4EQ7A 1FQBA 2F97A 3PUVE 2FYIA 3GLBA 1N3XA 4DDDA 4NMYA 1B58A 3M3KA 2CZLA 1JQFA 1JW4A 1B3HA 4RA1A 2V84A 3TZAA 4DIGA 4R9GA 2PX1A 2ZYOA 3FV1A 2ZYNA 3OSQA 3C32A 3LC8A 2H99A 4F39A 1SW4A 5AA2A 2ONKE 3ZKKA 4X1DA 4O3BA 4OWDA 4TLMB 1MM6A 2F6PA 3TKDA 4F1VA 1BLFA 1QULA 3V5AA 1NNTA 4HTGA 1N3WA 4KYSA 3K00A 1SI0A 4YU0A 4FATA 4F18A 1ZLQA 3QIMA 4GIZA 3FVGA 2Z23A 4KD5A 3VVDA 4LZ7A 1US5A 3N6TA 1D4NA 5CBSA 3L6HA 1O7TA 1URGA 3H6UA 3KBRA 1B5HA 1OQGA 2FA7A 2AL5A 4AQ4A 4JWXA 2REGA 1PC3A 4G8HA 1P1QA 3SERA 3T9HB 3G3FA 3U92A 1B1HA 3FIRA 3U8QA 4KPTA 3CFXA 1N0TA 4NWCA 4YKKA 5JEIA 1A99A 5DT6A 5A5XA 2RCAA 3OO9A 2Q88A 3P7IA 1A55A 1QW0A 3KOSA 1US4A 3L6GA 4H1XA 4MBPA 1USYH 3ZKLA 4IY6A 3K01A 5I56B 2YJPA 3CRBA 4JDFA 3KJ7A 2UVJA 2OWSA 1AH5A 1XS5A 5HPQA 2ZNSA 4QSCA 2X7QA 1B05A 4P0GA 4H67A 5AA4A 3FASA 4BLAA 3K6VA 2W7YA 2VGQA 1M5FA 1OMPA 3HN0A 2DWHA 4RY1A 1TXFA 5JTYB 1ZIUA 2DP8A 5I2NB 2VHAA 3MWBA 1PB8A 4O3CA 1B4HA 1QVSA 3UA8A 1VFDA 4YB7A 4F1YA 3T66A 1O64A 4RK9A 4EQBA 2ABHA 1LAHE 5M2VA 1R9QA 3OMBA 3LSLA 3MZ9A 3ONMA 5I58B 5TU0A 2Y84A 3TTMA 3BFUA 1B6HA 4X9TA 5EHMA 4BDLA 2V3UA 4MH5A 1XVYA 2Q2AA 3TFLA 4LZ8A 5CMBA 3T9UA 3E9XA 1YCJA 4MLQA 2F7CA 4P11A 3HO7A 3TAJA 1I6BA 1MRPA 2O69A 2ZMBA 4PFWA 1AIVA 4OEUA 3SEWA 2I3VA 4GL0A 3V89B 5I59B 3V8XB 2ESNA 2DVCA 3JZJA 2A5SA 3GZGA 3TTRA 2QS2A 3VV5A 2DWJA 5K2XA 1MPBA 2HEUA 2D3IA 3TELA 2AL4A 2HFBA 4KQPA 4X48A 3E13X 3EF7A 4QHQA 2XD3A 4BDNA 4I1DA 2Y7RA 4OFLA 3QUJA 5JK4A 1UTBB 3MBPA 3IB2A 4F3BA 4U4XA 3G3IA 2Y7IA 1MPCA 2YPNA 1BIYA 3TTNA 2G93A 4OENA 4NWDA 4LVQA 4F19A 1S7YA 3OENA 1UTHA 1D9YA 3KSJA 4OERA 3SEYA 4GFRA 3UIFA 2NUVA 3W9WA 2ZYKA 2Y7KA 4GRKA 4XXUA 1HSEA 1GTKA 3OSRA 1XHYA 4OMBA 2XXPA 4R72A 1LBCA 2THIA 2RF1A 1MDQA 3A09A 2XX9A 2F78A 3QYTA 3HHGA 1R6ZA 1SW2A 2XX8A 4F3SA 4G4PA 3KOTA 5CC2A 3IK6B 5KDTA 2DWIA 3TQLA 4WKMA 1P1WA 2PT2A 4QSEA 5TP9A 5EHSA 3Q28A 2QRYA 3W9VA 3IOWA 1B3GA 1YTVA 1XVXA 2I49A 5ELVA 3SETA 5TPAB 1MY4A 4DXBA 2O7UA 3PGFA 1MQHA 2M8CA 2UVGA 5FHNA 3ILUB 4IO6A 3N94A 3IOUA 3OO6A 3GBBA 4P0IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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