4RXLA

Crystal structure of molybdenum abc transporter solute binding protein vc_a0726 from vibrio cholerae, target efi-510913, in complex with tungstate
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
229
structure length
229
Chain Sequence
TLHIYAASSMTNAVNALVADYSQQHDVKLVTVYGGSSSLARQIEAGAPADLFISANEEWANYLVEKGLVKPNKVVTLAANSLVLIRPTAQPVASFELQDAAAWQTALADSRLAVAQVDAVPAGMYAKQALQHAGVWPELESRLAQTNNVRLALALVERGESPLGIVYKTDALLSDKVTIVTAFSAQSHQPIRYPLAQLNDKAASAEWVAYLRSDAAQQILQRFGFESVS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Vibrio cholerae
publication title Crystal Structure of Molybdate Transporter Vc_A0726 from Vibrio Cholerae, Target EFI-510913
rcsb
molecule keywords Molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdenum-binding p
total genus 74
structure length 229
sequence length 229
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4rxlA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4rxlA02
2HZKA 5DVFA 1N3XA 1D9YA 2ZNUA 3MZ1A 2OZZA 2I3VA 1POY1 4PP0A 4R9GA 1A8EA 2HXWA 1EU8A 2OWSA 4YAHX 3B6QA 4OFLA 3T22A 1ZBMA 2PT1A 5DTBA 3KN7A 3ZKLA 1A8FA 2RINA 1B1XA 3SEWA 1MS7A 3TODA 3HV1A 3H06B 1VR5A 3T9UA 3O66A 3TEPA 4ZE9A 5H8SA 3MQ9A 4I1DA 1R6ZA 1II5A 4FE8A 1N76A 1F9BA 4ELOA 4R75A 3L6GA 4BLAA 1NH8A 5F7VA 1GGGA 3TFLA 5KDTA 1XT8A 5TU0A 3VV5A 2Z8FA 1TXFA 4R2FA 3Q27A 1DOTA 1JETA 3U92A 3KGCA 3V89B 1PB8A 5FHOA 1H76A 4TQUQ 1J1NA 1JNFA 1XOCA 2VD3A 1B3LA 5CMCA 4FORA 2PBWA 4X9TA 4IY6A 1B58A 4QFLA 3RGYA 3PPRA 4GQOA 4O3AA 4U23A 5AA1A 2DWIA 1VFEA 3ILUB 2Z23A 1FQEA 3ZSFA 1MRPA 1VE4A 4BDOA 1Y1MA 2V25A 1B1HA 1LFIA 2REGA 2UVIA 1FTJA 3VDFA 2V3UA 1RKMA 2Q88A 3QUFA 3HO7A 2E0SA 3MPKA 4C0RA 3K6WA 4P0IA 4C1UA 1DTZA 3MVYA 4UA8A 3DELB 4H1XA 3K01A 2B3BA 2A5TB 3CR9A 4DXUA 2VOZA 4LQ2A 5CI5A 1USYE 4RA1A 2XXXA 2AYSA 3IB2A 4F1YA 3PPQA 3UORA 3CIJA 4N6PA 1DTGA 4FJPA 3IJXB 4GFRA 3FVOA 5I2NB 1MY1A 5IAIA 2O84X 2NVUB 3OEMA 3MAMA 4EXKA 3VVFA 1O63A 2DS9A 1P1QA 2X26A 3N6UA 3W15C 4EXLA 5JEIA 4ESWA 1L5TA 2YJPA 5H8QB 1GTKA 2ZYNA 2XXIA 1NNTA 4WEPA 4H67A 2CMOA 2DYXA 1MPDA 3KOTA 3EF7A 2GFEA 2QSXA 4I9DA 4C1TA 3C4MA 5DVJA 4THIA 4XKQA 2QS3A 1I6AA 2R9JA 2Q9TA 4GL0A 1A54A 3MBPA 3ILTB 3BBRA 4M1VA 4POWA 4DCYA 2NUVA 5AA3A 3DM0A 2V93A 3TMGA 1S7YA 2I49A 4OERA 3S9NC 1B7ZA 4LQ5A 1QUJA 2O69A 3KSXA 4OESA 3H3GA 4OETA 2F97A 4YKJA 1US4A 2RC7A 2V3QA 4G77A 3K6XA 5I58A 4F39A 2E1SA 1FQAA 4KCCA 3T93B 1LAGE 2A5SA 2ONSA 4EQBA 3MC2A 1FCKA 5ICQA 1JVXA 4KCDA 2XXPA 4RNSA 3BFTA 3LSXA 4DCXA 3PD9A 4QSDA 1MPBA 1LLSA 4PQJA 2LAOA 3TTMA 5HM4B 3CRBA 4YB6A 1FTOA 3B6WA 5H8HA 4U1ZA 3K1MA 4YMAA 3O6GA 4RPOA 1QW0A 5KCJB 1PB7A 1B46A 1AL3A 4ZEKA 2XHDA 3P7IA 2G93A 1NNPA 3HHGA 3G3FA 1B0HA 4QFKA 3QK6A 3FV2A 2FYIA 5IKBA 3OO7A 1MQHA 1SVXB 2Y7IA 3K0VA 4E0WA 3GXAA 3VVDA 3OOAA 1EH3A 1B05A 2OWTA 1SD3A 3OENA 3L6HA 3G3GA 4QF9A 3OMBA 3THIA 4JWXA 1Y3PA 1FTMA 2I4BA 2Y7RA 4G8NA 4MLVA 4RXLA 3ODBA 3FXRA 4R6HA 3A3UA 2NOOA 1M5FA 1QJMA 2YLNA 3CVGA 3MVWA 4X1BA 1Y3NA 1DMBA 3H6VA 4H65A 2UVJA 3RTFB 4AQ4A 4BDLA 5F1QA 1MXWA 5TP9B 2Z8DA 3FVKA 4MH5A 3VLUA 3VLWA 2P0SA 4MBPA 3HSTA 4XKPA 2ZYMA 2O68A 3LSWA 3TELA 5L8DA 2O7UA 3WAEA 4NF5B 3IOWA 4R6KA 1B51A 4IO4A 4GWOA 3MVXA 4M4GA 1LGBC 3KOSA 4PE5B 1JW1A 2DVZA 5M2VA 2GHAA 1P1UA 4F2QA 4ELQA 2IA4A 3IL1B 1SI1A 3U8QA 1ZJLA 1I6QA 2HZLA 2QS4A 1B6HA 1VSOA 3IO6A 3VVEA 5JTYA 4ZZEA 4U4SA 2O51A 4KYSA 2DWJA 1BKAA 4O3CA 4NF8B 1MXVA 5DYHA 3OO9A 2ONKE 4OQOA 1YTVA 1IXGA 3MVZA 5I56A 2Y7WA 1H43A 4HW8A 4EQ7A 4H8JA 1Z7ME 2XXTA 4HS7A 1ZTYA 1HSEA 1M5CA 2ZYKA 2UXAA 3K6VA 1DPEA 2RF1A 4QFOA 2OLBA 3V5AA 1N0TA 1UIUA 1I6BA 3KJTA 5BWJA 4BDRA 3LBSA 1OQGA 5H8FA 1YAEA 3RPWA 2D5WA 1P1OA 3FVNA 3C36A 4GVOA 5TPAA 1Y4TA 4G68A 1LB8A 5AA4A 4YKPA 2FA7A 3H4ZA 4Q30B 1B52A 2ZMBA 5I57A 1UTBA 1I69A 3ECRA 5A5XA 1B5JA 2R6GE 2O7IA 2PMSA 2V3TA 5AE4A 3SDFA 2O1LA 3H6TA 3G3KA 4PFWA 2XD2A 3SKPA 2F8DA 1SYIA 3CSGA 3QIMA 3F11A 3I6VA 1B2HA 2HCAA 4G2ZA 1US5A 3V8XB 4YKKA 2Z22A 4Z7EA 4GIZA 4RK9A 1M5BA 4TLMB 4RYAA 3M8UA 1R9LA 2PX1A 2XXYA 2D3IA 5CMKA 3QAXA 2GH9A 3R6UA 1QVSA 1PB9A 3K2DA 3PMWA 1ZLQA 3FXQA 2XXUA 4JDFA 1CB6A 1IUDA 5CBSA 1YCJA 3S9EA 1MY0A 4XIGQ 2F6GA 5FHMA 3PUWE 3ZS6A 4U22A 1B9JA 4OZ9A 3T9VA 3K1NA 4ZECA 3TAJA 4BDMA 1GV8A 1R9QA 5HPQA 4HCWA 4RPNA 3TZAA 2ALUA 5DT6A 4NEDA 4KPTA 1ATGA 4XKNA 1UTHA 3EN3A 1WDNA 1SBPA 3OSRA 5I2KB 5L9SA 4R72A 5I59B 4EDPA 2QJEA 2VGQA 3TTKA 1JW5A 2DSFA 1S9TA 3T96B 1PBPA 2AL5A 1LAXA 4KHZE 5CMMA 1TFAA 4F29A 1D4NA 5AA2B 2UYFA 4FEBA 1NH7A 3VE1B 3MP1A 3G3JA 3E13X 4OENA 4ELPA 1XHYA 1NL5A 2XXQA 4F3GA 2M8CA 3A3CA 3H7MA 4IY5A 2B65A 4IO7A 2DE3A 1JVYA 1M5DA 5ISUA 4JBZA 1M5EA 2HAVA 1IXIA 4NF4B 3CFZA 2RC9A 3CFXA 4YMBA 2VD2A 3PU5A 3WAFA 3K6UA 3M3FA 1EZOA 4GOTA 4G8HA 1Y1ZA 3KFMA 1IITA 1Y20A 3O97A 4H5FA 2DE4A 3SEUA 4IO3A 3JV9A 1H45A 3QYTA 5CRYA 4ZEIA 2Q2AA 3UK4A 1D3KA 3TTRA 4LVQA 3K4UA 3OO8A 3K00A 2CZLA 2I0BA 4KFQA 1B4HA 1MDP1 4QFPA 3PPOA 1P1WA 1N7WA 5DEXB 1RYXA 3O2AA 3W9WA 2H4IA 3KN8A 3ONMA 2I6EA 4X1DA 1MG1A 3UP9A 1XVYA 2DXRA 4LP2B 4LA9A 2RC8A 4DLDA 2HEUA 4R73A 4BDQA 1MXZA 2XX8A 5KZTA 2A5TA 4ZEFA 4NTLA 2OCUA 4ELRA 3TTLA 4ECFA 3IB1A 4JB7A 1SW1A 3OO6A 4LZ7A 4IGTA 3TCFA 3PMVA 3KG2A 1LB9A 5K2XA 4KYEA 4U1OA 4ZEDA 3E3KA 3LSFB 5I84A 1SI0A 1OVBA 2DXYA 3FVGA 4EF1A 1H44A 3MW0A 2UVHA 5FHNA 1FQBA 1LBBA 5H8QA 1UQWA 2XXWA 4ZDMA 4KYDA 4OFOA 4ZS9A 1QKAA 5ITOA 2XX9A 2QPQA 3LC8A 4I62A 4TLLB 4JWOA 3U1OA 5LOMA 3FIRA 4NWDA 4FAJA 3M3LA 3T66A 1MH4A 1A99A 2YPNA 1ELJA 1LFHA 1B3EA 1ZU0A 3H6WA 3RY3A 2UVGA 4NF6B 1IXHA 1URDA 5JTYB 2H5YA 1XS5A 1JW4A 4WXJA 1QUIA 5H8NB 4QFNA 2THIA 1NKXA 3U72A 4GXSB 2HFBA 2F6PA 3G3HA 3O29A 3VXBA 4KI0E 2ZYOA 3KJ7A 2AL4A 3M3KA 4OTEA 3C34A 3I5OA 3TCGA 4PFUA 4OEUA 4H8IA 2X7PA 5KCJA 3CSBA 1IQ7A 2OK2A 1XVXA 1Y9UA 4O3BA 4LONB 3FUZA 3MWBA 1ZMGA 2I48A 1IIWA 1BP5A 2ZXTA 4ZEBA 2ZNTA 1XC1A 3FV1A 4IGRA 5TPAB 4IO5A 5CC2A 1URSA 4OEVA 3USDA 5AA4B 3LSLA 4OYVA 1OIBA 3VLVA 3KZGA 5FTHA 1LAHE 1NFTA 3IJOB 3IOVA 3SEVA 1UIVA 3QSLA 3T9HB 3SERA 2PVUA 3TTNA 1EZPA 1A55A 1BIYA 4R2BA 3Q25A 2Q2CA 2F5XA 3TPAA 3IORA 3HN0A 4FATA 1PEBA 5KDTB 1AH5A 2DP8A 3OSQA 4R6YA 3E4RA 3VXCA 5ITPA 3PUVE 4GF8A 3RLFE 1WODA 4N13A 4K3FA 4G68C 3C35A 1MY4A 2HAUA 3IOUA 3SETA 1MPCA 3IO4A 2OBGA 3IB0A 4OMBA 1O64A 4JSDA 1B5IA 4Q0CA 4G4PA 4R9FA 3MUQA 1LSTA 5TP9A 3FJMA 3N26A 4QSCA 3VFJA 4YICA 4F1VA 1LBCA 4DXBA 5JK4A 1TFDA 4ZZAA 1LFGA 1Q1KA 2AIXA 2ZNSA 4ONYA 2F78A 4KD5A 4NF5A 1ZIUA 4FIMA 4P11A 1OLCA 1USYH 3BFUA 1BTJA 4DDDA 5FTIA 2XXHA 1O7TA 3ZKKA 2P2AA 1MXUA 1UTHB 4HTGA 2G29A 2XXRA 1MQGA 3EHUA 3S9LC 3PD8A 1DPPA 2QS2A 2DOJA 2Q8JA 1KWHA 1MQIA 1MM7A 3GLBA 3OXNA 2NXOA 3BKIB 2H9BA 3HCQA 4LZ5A 3Q29A 3C31A 4EQ9A 4U4XA 2XX7A 1N84A 3PV0E 1NNFA 3PUXE 4LZ8A 2H99A 4L17A 2F7AA 1SDXA 2QMXA 5DVIA 4XXUA 3V83A 2RCAA 3CFLA 2B3FA 1WVJA 4NF8A 3SEYA 1AOVA 4IO2A 3TKDA 1PDAA 3N94A 4FEDA 4MLQA 2F36A 4AB6A 1R1NA 3MZBA 3MZ9A 3TYHA 3Q28A 4U21A 3IR1A 3FZVA 3TCHA 4GD5A 3EQ1A 4OFJA 3EHTA 1OMPA 1Y3QA 4F3PA 1MQDA 1T0KA 3RT6B 2H25A 1AIVA 4F3SA 5BUUA 2REJA 3AXFA 1PC3A 2UYEA 3LUYA 3N6TA 1GVCA 3R7XA 1P99A 4OXVA 3T9XB 5B7DA 1JEUA 3K02A 4AB5A 3IX1A 2KLFA 3GZGA 2BJJX 4GLIA 4RK2A 2DQVA 2HQ0A 3SESA 2PT2A 5CMBA 1NNKA 1MDQA 4WEDA 4PFTA 2V84A 4DE8A 1MM6A 1B3FA 1FW0A 5B70A 4YKIA 3U94A 3QXMA 4OVJA 5EHSA 1CE2A 1B7UA 1OLAA 2GRVA 3KN3A 3E9XA 1MY3A 3IK6B 2Z8EA 3GBBA 1SQYA 3H6UA 5I58B 3C9HA 2VP1A 4F3BA 2F7CA 3UA8A 2O6AA 1FQCA 3PGFA 1QULA 4F19A 1OVTA 1JEVA 5CBRA 2ABHA 3PUYE 2F34A 4ESXA 1D9VA 3EPEA 4N07A 4E0XA 2DWHA 1TWYA 3A09A 4ND9A 5H8HB 2I58A 4NMYA 1B3GA 1Q35A 3O6IA 2Q89A 3TQLA 1B40A 1IXCA 2ONRA 3OD7A 1MXYA 4WKMA 2Y84A 3K1PA 3DP8A 1FTLA 2DE2A 5CM6A 4ISUA 5ICTA 3KBRA 4OHNA 3S9MC 4IO6A 3FGSA 3RNNA 5I2KA 5I59A 3MP8A 3HPIA 2W7YA 4YB5A 3GBAA 4MFIA 2R71A 2PYYA 4IB2A 5AA2A 3PPPA 1LAFE 2Y7KA 1JQFA 4EUOA 4DXCA 2O1MA 3RN8A 4F31B 1SW2A 4HCYA 3H03A 4GRKA 4ZE8A 4GXAA 3B6TA 4P0GA 5L9OA 4H0WA 2QMWA 2P1SA 3CI8A 3R26A 4NF4A 4I8CA 4YU0A 5I2NA 2X7QA 2RCBA 3LR1A 1MXXA 3FJGA 1A40A 3MP6A 3IOTA 4KR5A 1FQFA 2VHAA 1YPNA 3PUZE 3O28A 4LATA 4F18A 3C33A 3G3IA 3FD3A 3UGWA 2QS1A 1IZ1A 1LCTA 1OQHA 4Z0IA 1FTKA 4BDNA 4NWCA 1POTA 2FNCA 3W9VA 4F22A 2WKYA 2XD3A 2GHBA 3N5LA 4JWYA 3PMXA 2NWJA 1HSJA 2ANJA 1QUKA 1BLFA 3RUMA 1P1NA 3KSJA 1PBQA 4EF2A 3PPNA 3QUJA 4MF3A 1B5HA 3OEKA 2I4CA 5DEXA 3MJNA 1HSLA 4DIGA 4F1UA 4POXA 3FATA 4U2RA 1A7LA 3D4GA 4H6DA 1SW4A 4LUBA 5EYFA 2QL3A 2D21A 4G8MA 4X48A 3O6HA 1B0LA 3KEIA 4XKRA 2IEEA 5K2YA 3S4UA 1AMFA 4DZ1A 2OJTA 4KQPA 3TQWA 4JXIA 1DSNA 3IAZA 4NE4A 5I56B 4QSEA 4PETA 4RJZA 1Z7NE 4OWDA 1SYHA 5J1DA 2ESNA 5L9MA 1N7XA 1QKBA 2QRYA 3O9PA 1N04A 3EHSA 3DP4A 3FASA 4Q8RA 3B7DA 1B3HA 1B4ZA 3Q26A 2XXVA 1B32A 2I0CA 4PFYA 2I3WA 5AA2D 3JYRA 1GR2A 1MQJA 4Q5TA 1S50A 1ANFA 5HBCA 3TDJA 5H8FB 1EZ9A 1IEJA 3TUSA 3OELA 4RY1A 4TOZA 3S2VA 5ELVA 2DWAA 3JZJA 1SW5A 1FQDA 1MY2A 2Y7PA 1ZKBA 3C32A 4JSOA 4G68B 1URGA 4QRZA 4F2OA 1B7HA 1RYOA 5I57B 2F35A 1UTBB 5A5XB 3G7WA 3RQTA 1Y4CA 2F7BA 3MPLA 1LCFA 3UN6A 3D4CA 2DVCA 3DLNA 3DP6A 3UIFA 3CG3A 4YB7A 1N3WA 3U93A 1MH3A 4NF6A 3FJ7A 4QHQA 4H5GA 4R74A 2RKMA 3HHFA 5H8NA 1NMUA 3SEXA 1VFDA 5EHMA 4YZZA 3CG1A 1TT1A 3RTWB 4FECA 1H3DA 3RT8A 3I3VA 4GL8A 4XTCQ 4UACA 3FXUA 2H98A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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