4RXLA

Crystal structure of molybdenum abc transporter solute binding protein vc_a0726 from vibrio cholerae, target efi-510913, in complex with tungstate
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
229
structure length
229
Chain Sequence
TLHIYAASSMTNAVNALVADYSQQHDVKLVTVYGGSSSLARQIEAGAPADLFISANEEWANYLVEKGLVKPNKVVTLAANSLVLIRPTAQPVASFELQDAAAWQTALADSRLAVAQVDAVPAGMYAKQALQHAGVWPELESRLAQTNNVRLALALVERGESPLGIVYKTDALLSDKVTIVTAFSAQSHQPIRYPLAQLNDKAASAEWVAYLRSDAAQQILQRFGFESVS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal Structure of Molybdate Transporter Vc_A0726 from Vibrio Cholerae, Target EFI-510913
rcsb
molecule keywords Molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdenum-binding p
molecule tags Transport protein
source organism Vibrio cholerae
total genus 74
structure length 229
sequence length 229
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4rxlA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4rxlA02
1AH5A 4R6HA 3EHUA 4G8MA 3C34A 1MQDA 1GR2A 3TPAA 4OYVA 1N7XA 2HXWA 1ZU0A 4NF4A 2G93A 5F7VA 3TFLA 3A09A 3H7MA 3Q28A 3L6HA 5HPQA 3RTWB 2UXAA 2YPNA 1RKMA 2UVGA 3MWBA 4MH5A 1S9TA 2PT2A 3CFLA 3IOWA 3K00A 3GZGA 3M3LA 5I58B 3TUSA 1SYHA 1IZ1A 2FNCA 3PV0E 4DCYA 2OWTA 1MDP1 3OSQA 3K0VA 3K6UA 1N84A 1LAFE 4N13A 1NNKA 5DEXB 1OQHA 3E9XA 2Y7RA 1QUIA 4G8HA 3DP6A 4L17A 1VSOA 1ELJA 4LQ5A 4PFWA 4C0RA 4H0WA 3TELA 5EHSA 5TPAB 3MVZA 3TODA 2I0BA 2DP8A 3OXNA 5FHMA 3HHFA 4RPNA 3FJMA 3EN3A 2P2AA 1Y9UA 2V3QA 3S9LC 3VV5A 2PVUA 2X7PA 2O1LA 3PPQA 3F11A 3V8XB 5DTBA 4RPOA 1MXWA 2DE2A 2QS3A 4R73A 3CG3A 3T93B 2DS9A 3FUZA 2B65A 4BDOA 1MXYA 1P1NA 4U1ZA 1Z7NE 1IXIA 2REGA 1VR5A 1LSTA 1LCFA 3H6VA 4F1UA 3OSRA 4R6KA 4F3SA 3SEYA 3GBBA 2G29A 3SERA 3RGYA 4YB5A 3W9VA 4GQOA 2UVJA 3ZS6A 3E4RA 4KCDA 2X7QA 2D21A 5AA4A 3UIFA 2BJJX 1MQHA 4F19A 4KYSA 4OFJA 2F8DA 1UTBB 3I6VA 1B5HA 4BDNA 1Q35A 4QFPA 4KPTA 1POTA 2O84X 1XHYA 4F31B 2V84A 2RCAA 1S7YA 3K1PA 1JEUA 2RKMA 2UYFA 3SEXA 3IOUA 1Y3PA 3VXCA 1WODA 4LONB 2Y7IA 5I2KB 1Y4CA 4Q30B 5F1QA 2HQ0A 4PFUA 1MY4A 1SQYA 2O6AA 5ISUA 2HAVA 3H03A 3O29A 4FATA 4U22A 1CB6A 1JVXA 3FXRA 1AMFA 3ZSFA 4TLLB 3KGCA 4K3FA 3Q27A 1B46A 4R72A 4QSDA 4EUOA 5I58A 5KZTA 2DE3A 1B05A 4HCWA 1SW1A 4GF8A 2F6GA 1LBBA 4I8CA 3PMXA 1MQGA 5I2NB 5DEXA 1P1OA 4TOZA 4XKPA 1QUKA 4YICA 3TEPA 1ZBMA 4RXLA 1LCTA 2ALUA 5TPAA 3S9MC 5BUUA 2F5XA 1PEBA 2V25A 1B4ZA 2VD2A 4F3GA 2ANJA 1PB8A 2OWSA 4F18A 4KFQA 2DE4A 2F7AA 2IA4A 1T0KA 2PT1A 1IUDA 3V5AA 3TYHA 1M5DA 4POWA 3ZKKA 1MXZA 1H3DA 5L9MA 3M3FA 1FTOA 5CBSA 4OEVA 3CIJA 1QJMA 1ZLQA 1HSEA 2O1MA 5ICTA 1P99A 3IX1A 1MH3A 1B9JA 4F2OA 3QXMA 4EF1A 4R74A 2I4BA 3IB0A 3SESA 3KZGA 5H8FB 2NXOA 3OELA 1P1QA 3V89B 4KQPA 3SKPA 2B3FA 2RINA 3TQWA 3PD9A 4F39A 3OO8A 4ZE9A 2E0SA 3Q29A 3MZBA 3M8UA 5IAIA 2O7IA 3PMWA 4IO2A 3BBRA 3UK4A 3RY3A 2ZYMA 2ZYKA 1S50A 1UTBA 4ECFA 2XX9A 5L9SA 2X26A 4F22A 1IIWA 2Y7PA 3N6UA 5B7DA 4JXIA 5CMBA 1XOCA 3RLFE 4U4SA 1NMUA 3G7WA 4THIA 1Y4TA 1FQDA 1LBCA 3N5LA 1TT1A 5I2KA 2D5WA 1GTKA 2OCUA 3IOVA 4OFLA 2F97A 1TWYA 4E0XA 4MBPA 4H6DA 3AXFA 4HCYA 5CMKA 2ONRA 4H1XA 4EXKA 4DXCA 1OVTA 1NNFA 3EPEA 4IO4A 3CSBA 1A8FA 2A5TB 1I6QA 1BIYA 1UQWA 3G3JA 4DXBA 3UN6A 5BWJA 1B2HA 4YZZA 3FVOA 4QF9A 1VFEA 5H8SA 3CSGA 3EQ1A 5I2NA 4LUBA 4QFKA 5L8DA 2ZNUA 4GFRA 3JYRA 1XS5A 4G68B 1IITA 4ONYA 4ZS9A 2AL4A 1ZIUA 1TXFA 1II5A 3PPRA 2XHDA 3RNNA 2F34A 1ZJLA 1R9QA 4JWXA 4MF3A 3E13X 5JTYB 1D9YA 2PX1A 4BDQA 3RQTA 1H44A 4RK9A 1H76A 1NNPA 4H5GA 2FA7A 4R75A 4O3CA 1EZ9A 3PGFA 4YB6A 3ZKLA 4U23A 3E3KA 4OERA 3K1NA 3T9HB 1URGA 2Z8EA 3TTMA 1FQBA 5KDTB 4Q0CA 4FEDA 1SVXB 2AYSA 5I57B 1URSA 3TZAA 3MQ9A 4GXAA 2NVUB 1P1WA 2I6EA 5H8FA 1N3XA 5AA2B 4ELPA 5AA3A 1UTHB 2DXYA 3FASA 3MC2A 3L6GA 1O63A 4PP0A 4GD5A 2Y7WA 3WAFA 3TTKA 2VD3A 4GRKA 4OMBA 3LC8A 3QIMA 2XXTA 2XXXA 4DE8A 1DPPA 4JWOA 3C9HA 4YKPA 3KFMA 2ZYOA 3P7IA 4YMBA 2DWHA 3C36A 4NF6B 3MZ1A 4G68C 4H8JA 4AQ4A 2Z8DA 5EHMA 4AB6A 4E0WA 1DOTA 5K2XA 3VLWA 1USYE 2RC9A 1JNFA 4OZ9A 3IR1A 4YB7A 2Q2CA 3K4UA 5CBRA 1HSJA 2F7CA 4AB5A 3FATA 4RA1A 5H8NB 1B4HA 3PPOA 3FGSA 2F78A 5CMMA 1GVCA 1SW2A 3PPNA 2FYIA 2F7BA 3VLUA 4OXVA 3ILTB 4PETA 4MLQA 5ITOA 4G8NA 1IXGA 1GGGA 2A5TA 3K6XA 1POY1 1BKAA 1MM6A 3PUYE 5FTIA 1Q1KA 3JZJA 3OO7A 3LBSA 3HO7A 1B3FA 1MPCA 1A40A 3G3IA 3TDJA 4YKJA 5CI5A 5DT6A 4GWOA 2XD2A 1MPDA 3O28A 4JBZA 4M1VA 4G68A 3KEIA 4RNSA 2HFBA 4PFTA 3SDFA 3H06B 4IY6A 1LB8A 3PUZE 3TTRA 3CVGA 2XX8A 3SEWA 4X1DA 4ZEKA 3C4MA 3H6TA 1SYIA 3U93A 1JEVA 3PPPA 5JTYA 1RYXA 4YKIA 5B70A 4JB7A 4RY1A 3HN0A 2XXVA 3UGWA 1B0HA 3S9EA 4IGTA 3ILUB 5FHNA 2IEEA 2QS1A 2Q8JA 5KDTA 4ELQA 1Y3NA 1PBPA 4ZEFA 1QW0A 2QJEA 5I57A 3C31A 1FTMA 4FECA 3MVYA 5ICQA 5AA2A 1MH4A 2O7UA 4GL0A 1UTHA 5L9OA 1SBPA 1MG1A 4ESXA 3R26A 1LB9A 3S9NC 1LAXA 3CG1A 5AE4A 3K6VA 4EXLA 1M5CA 4FJPA 4P11A 5AA1A 4JSOA 2QS2A 4WXJA 3CFZA 3K1MA 3H6UA 3FXQA 4F3PA 2M8CA 4GVOA 4Q8RA 3KOSA 4KI0E 2ONKE 4NF6A 3T9XB 2DVCA 3GLBA 1FTKA 1IEJA 3U8QA 2A5SA 3H4ZA 1H45A 1EH3A 4C1UA 3U72A 2RCBA 2XXYA 4ZE8A 2R6GE 3DP4A 4LATA 3R7XA 5H8NA 3KN3A 4TLMB 4NTLA 4XIGQ 5DVJA 3PMVA 3B6TA 4FIMA 1GV8A 4WEDA 4FEBA 2DXRA 3N6TA 3IO6A 4IO3A 1JW1A 4U21A 4N6PA 2Q2AA 4HS7A 3LSFB 1YPNA 3DP8A 4KR5A 4QFOA 4YMAA 1US5A 3CFXA 2HZLA 2F35A 4LVQA 3C35A 1B51A 1LFIA 1YCJA 4O3BA 4F2QA 1BTJA 4MLVA 3VVEA 2Z23A 3K02A 3OO9A 2UVIA 1NL5A 4IB2A 2VGQA 2DWAA 4F29A 3T9UA 3BFUA 2YLNA 4IO7A 4YU0A 2F6PA 2LAOA 4NWDA 3GXAA 3ECRA 3Q26A 1OIBA 3B6WA 2H98A 4ELRA 4KYDA 1B32A 3KJTA 4R9FA 4XKNA 1MM7A 3S2VA 3THIA 2GRVA 2WKYA 1J1NA 3WAEA 5IKBA 5A5XB 4H67A 1WDNA 1A7LA 3IK6B 5K2YA 1PC3A 1LGBC 1JETA 1ZKBA 2I3WA 4LZ7A 1B7ZA 3W9WA 1XC1A 2KLFA 3FD3A 4EF2A 2DQVA 1FQEA 4KHZE 2ZNSA 1N04A 2GHBA 3H3GA 3HSTA 3O6IA 1TFDA 2VOZA 5J1DA 3QUJA 2Y84A 4BDRA 3KBRA 1JW5A 1ZMGA 4PE5B 4Q5TA 4I9DA 2OZZA 1LAHE 4BLAA 1VE4A 1MY3A 2I49A 3O2AA 3RT8A 3MUQA 1A54A 4IY5A 5DVFA 3OEMA 3LSLA 1MXVA 1I6AA 3C32A 1USYH 2D3IA 3N94A 2QMXA 2OBGA 1JQFA 3TCFA 4ZEDA 2HAUA 4EQ7A 2R9JA 3MJNA 3OEKA 4QRZA 4IO5A 1MQJA 2XXUA 2NWJA 4NE4A 4YKKA 3TQLA 4NMYA 3UP9A 1IXHA 1WVJA 3IORA 2XXIA 5TP9B 1FTJA 2I4CA 3U1OA 1N3WA 4UACA 1LAGE 1R9LA 3SETA 1IQ7A 3QK6A 2QL3A 4R2FA 1B7UA 1Y1MA 5I56B 3TCHA 3QAXA 4ZZAA 4I1DA 3DELB 1A8EA 3MVXA 1O7TA 1Y20A 1D9VA 1XVXA 1B7HA 4KYEA 3KN7A 1MDQA 3RUMA 1A99A 1OLCA 1PB9A 5DYHA 1ATGA 3O6HA 1SW4A 1URDA 1CE2A 1XT8A 2XXPA 5H8QB 2O51A 2ZYNA 4QSEA 5H8HB 3TAJA 4Z0IA 2Z22A 3DLNA 1L5TA 1A55A 3QUFA 4EDPA 5A5XA 2V3TA 3IAZA 2VHAA 3FIRA 4HW8A 3S4UA 3MBPA 3T66A 2W7YA 4RJZA 4G2ZA 5CRYA 4NEDA 4R6YA 3A3CA 3K6WA 4NF5B 3IB1A 1KWHA 3RT6B 4OQOA 2CZLA 3RPWA 3HV1A 4ND9A 4FORA 4G77A 1LFGA 3DM0A 4MFIA 1MXXA 1NH8A 3O66A 3C33A 5FHOA 4RK2A 4QFNA 2H99A 4QFLA 2ZMBA 4LZ8A 1EZPA 4G4PA 3IJXB 4F1VA 3D4GA 3FVKA 5JK4A 1B3HA 4KD5A 1R1NA 4N07A 3PUVE 3IOTA 4NF8B 1US4A 1QUJA 3FV1A 4EQ9A 1OLAA 1MRPA 2HEUA 4OWDA 1MY2A 3FXUA 2RC8A 3LUYA 3KSJA 2RC7A 4X1BA 1QULA 4YAHX 4C1TA 5HM4B 3RN8A 3MP6A 5TP9A 2ZNTA 4OETA 4QSCA 4OENA 4ZEBA 2H25A 2DYXA 5I56A 2PYYA 1SW5A 1XVYA 3MPKA 3HCQA 3T9VA 4ZECA 2DWJA 5I84A 3USDA 3EHSA 4BDMA 4KCCA 4I62A 1BP5A 1R6ZA 1B5IA 4DZ1A 5CMCA 1AOVA 2DOJA 3A3UA 1MPBA 3MP8A 3TTLA 3UORA 3VVDA 1LFHA 1N76A 3VLVA 5I59B 3OMBA 1SI1A 1OVBA 3H6WA 3PUWE 2OK2A 4U2RA 2Q89A 3LSWA 4FE8A 4GIZA 4PFYA 4Z7EA 4P0GA 3HHGA 3G3FA 1UIVA 2QS4A 1FQAA 1ANFA 1FTLA 2XXRA 4ISUA 3EF7A 3W15C 5H8QA 3FJ7A 1ZTYA 5H8HA 3V83A 5FTHA 1BLFA 3SEUA 5CM6A 1RYOA 1DTZA 1DMBA 2GHAA 3CR9A 4UA8A 1EZOA 4ZDMA 1B0LA 3K01A 1LLSA 2THIA 3QYTA 4WKMA 1MXUA 3O97A 4LZ5A 3VXBA 3GBAA 4H8IA 1FW0A 3ODBA 2Z8FA 4XKRA 1M5EA 1YAEA 4QHQA 2H9BA 3B7DA 3LSXA 3O6GA 3U94A 3MPLA 4EQBA 4NF5A 1IXCA 3TCGA 1UIUA 4GL8A 1AIVA 2I0CA 4WEPA 1YTVA 5CC2A 2GFEA 3K2DA 3FVNA 1H43A 3EHTA 1QVSA 2HCAA 3IL1B 5KCJB 3JV9A 4HTGA 3KG2A 1B3LA 2AIXA 4ZZEA 4POXA 1OQGA 5AA2D 4JWYA 1D4NA 2H5YA 4GXSB 1Y3QA 3R6UA 2R71A 4DXUA 4DDDA 1D3KA 1B40A 1F9BA 2DVZA 1I6BA 1SI0A 1Y1ZA 4LA9A 4GLIA 5DVIA 4OTEA 1FQFA 2E1SA 3T96B 1JVYA 3MW0A 3I5OA 4IGRA 5HBCA 1O64A 4NF8A 3Q25A 3KSXA 3KJ7A 2DSFA 1N7WA 2P1SA 2NUVA 1SD3A 3MP1A 3O9PA 4F3BA 5TU0A 3KN8A 2PMSA 4F1YA 5M2VA 3IB2A 2OLBA 1EU8A 3RTFB 1FQCA 3LR1A 1DPEA 1B52A 2RF1A 3VVFA 3MVWA 4TQUQ 3VE1B 4PQJA 1B3EA 2V93A 2B3BA 2NOOA 1P1UA 2CMOA 3FV2A 2DWIA 1NH7A 1B3GA 2Y7KA 4FAJA 1AL3A 5JEIA 4M4GA 2O68A 4LP2B 2P0SA 4IO6A 2REJA 4XKQA 2QSXA 2QMWA 3IJOB 2O69A 4RYAA 5I59A 2GH9A 4JSDA 4NF4B 4O3AA 2ONSA 2OJTA 4OVJA 3UA8A 4X9TA 3HPIA 2ZXTA 1NNTA 2UVHA 1QKBA 3OD7A 3FZVA 3FVGA 2H4IA 3B6QA 5LOMA 2I58A 4DIGA 4ELOA 3OOAA 3TMGA 3U92A 2ESNA 2HZKA 1DSNA 1B1HA 2XXWA 3IO4A 3I3VA 4OESA 4P0IA 3SEVA 1SDXA 3ONMA 3PD8A 5ITPA 3VFJA 4R2BA 1B5JA 1JW4A 1NKXA 3QSLA 3PU5A 3T22A 4DCXA 5EYFA 4XXUA 2I3VA 1MS7A 2AL5A 3CRBA 5KCJA 2ABHA 3OO6A 1M5FA 1MY1A 3M3KA 2UYEA 2YJPA 2PBWA 2VP1A 4H65A 2QRYA 4OFOA 1DTGA 2I48A 4ZEIA 2XD3A 3G3GA 4U4XA 4NWCA 1B58A 3D4CA 3KOTA 1B6HA 1HSLA 1FCKA 4LQ2A 1I69A 3VDFA 2Q9TA 3BKIB 3G3KA 1N0TA 3MZ9A 3MAMA 1PBQA 1Z7ME 4H5FA 1VFDA 1MQIA 4X48A 4DLDA 1QKAA 3OENA 3TTNA 1PDAA 2Q88A 3CI8A 1MY0A 3G3HA 2QPQA 2V3UA 3FJGA 3TKDA 4U1OA 3N26A 2XXQA 4XTCQ 2XX7A 3BFTA 1M5BA 4BDLA 4OHNA 5ELVA 5AA4B 4ESWA 1NFTA 2F36A 4GOTA 4R9GA 1B1XA 1TFAA 3PUXE 4OEUA 1OMPA 4JDFA 1PB7A 2XXHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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