4RXLA

Crystal structure of molybdenum abc transporter solute binding protein vc_a0726 from vibrio cholerae, target efi-510913, in complex with tungstate
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
229
structure length
229
Chain Sequence
TLHIYAASSMTNAVNALVADYSQQHDVKLVTVYGGSSSLARQIEAGAPADLFISANEEWANYLVEKGLVKPNKVVTLAANSLVLIRPTAQPVASFELQDAAAWQTALADSRLAVAQVDAVPAGMYAKQALQHAGVWPELESRLAQTNNVRLALALVERGESPLGIVYKTDALLSDKVTIVTAFSAQSHQPIRYPLAQLNDKAASAEWVAYLRSDAAQQILQRFGFESVS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdenum-binding p
publication title Crystal Structure of Molybdate Transporter Vc_A0726 from Vibrio Cholerae, Target EFI-510913
rcsb
source organism Vibrio cholerae
molecule tags Transport protein
total genus 74
structure length 229
sequence length 229
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4rxlA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4rxlA02
3TFLA 3TTNA 1MPBA 1MPDA 4MF3A 3VE1B 1ZBMA 4H5GA 5DEXB 4XKNA 4WKMA 5AA1A 2GHAA 3SEWA 2ZYKA 1ZJLA 2F7AA 4RA1A 1P1QA 3PD8A 4H6DA 4KI0E 3SETA 1N84A 1M5FA 1HSJA 4DCXA 4E0XA 5DVJA 2BJJX 1B3EA 1MY2A 5K2YA 4O3BA 2O7IA 5H8HB 3PPOA 4PFYA 4YKIA 3QUFA 4F3GA 5CBRA 3KN3A 4C1TA 2DSFA 3LUYA 4ZE8A 2XX8A 1B5IA 4TLMB 3B6QA 4YMAA 2X7PA 4FEDA 1JW5A 2DVCA 1NMUA 4R6HA 3MZ1A 2F5XA 3O6GA 4N6PA 5EHMA 2DXRA 4G68B 4OENA 4YB5A 3TDJA 4QRZA 5CM6A 1B4ZA 1MRPA 1ATGA 4ZEBA 3OO8A 4JWYA 1BIYA 2H4IA 3C33A 4BDLA 1MM7A 3U94A 2A5TB 2HZLA 3UORA 4LATA 1IIWA 2XXXA 3ODBA 3LSLA 1O63A 3FASA 4F1VA 1QVSA 2XD2A 4EDPA 1D3KA 4JSDA 1FTMA 3T22A 5CRYA 1Y4TA 3KSXA 2XXTA 1UTHA 3K1PA 1OIBA 1AIVA 5L9MA 4JBZA 2OK2A 4FE8A 3PV0E 3TTLA 4U2RA 1JW4A 1I6AA 1MH4A 2ABHA 2I4CA 1MXWA 4KD5A 1LFGA 4IY6A 3KBRA 3S9LC 1LGBC 3FD3A 2DWIA 4NF6A 1GTKA 2F6PA 2Y84A 5K2XA 1LB8A 4AB6A 2DWAA 5CI5A 3K4UA 2YLNA 1MY4A 3FJMA 3S4UA 3SEYA 1Y1MA 3IORA 4F1UA 4R2BA 3MW0A 3QYTA 4DXCA 4POXA 5JTYB 1A99A 3LSFB 1MXXA 3ILTB 2B65A 5I56A 4LZ8A 4FORA 2Q89A 4QFNA 1O64A 1FTJA 4M1VA 5AA2B 4ZECA 3QK6A 1OQHA 2XXHA 3C34A 1Y4CA 4QHQA 3ZKKA 1N3WA 2V3UA 1QUJA 4I62A 4NWCA 3WAEA 4Q30B 5BUUA 4F39A 3KOTA 1O7TA 1B0LA 4NF8B 5DVIA 1NFTA 2RKMA 1HSEA 4U23A 2G93A 1Q1KA 2HEUA 1M5DA 3EF7A 4R73A 3T96B 4RPOA 4R75A 1USYH 3FXRA 4DZ1A 3KN8A 2DQVA 5TU0A 4RK2A 4ONYA 3USDA 5KZTA 2HCAA 3O9PA 1SVXB 2ANJA 4F19A 3G7WA 1DSNA 3RUMA 1LFIA 3CSGA 4BDMA 3IO6A 2VGQA 3U93A 1MY3A 3SKPA 3CSBA 2Y7WA 5TP9A 4QF9A 3KOSA 5DYHA 4F22A 4AQ4A 3M8UA 3IOTA 3EN3A 1FTLA 3K0VA 2Q9TA 4EF1A 1T0KA 1M5EA 1Y3PA 4DCYA 2OBGA 4YKJA 4EUOA 4DE8A 1B32A 1ZTYA 1UTBA 2GH9A 3RY3A 1SYHA 1VE4A 3HCQA 1P1OA 1MQIA 3C4MA 1II5A 3PMWA 1RKMA 3IJXB 3PUVE 1EZPA 3LC8A 5KCJB 2R71A 3ILUB 3CFZA 3TODA 1B3FA 4ELPA 5FTHA 3OSQA 3RPWA 3VXCA 2RCAA 3UGWA 5I59A 2A5SA 3OENA 4MLQA 5H8HA 4F1YA 4KCCA 3TTKA 1WODA 4MH5A 3O6HA 3EHSA 3K01A 1N7XA 4I8CA 2RCBA 3K00A 5JEIA 4NF6B 3G3FA 1SI0A 4TOZA 1I69A 3O66A 3O2AA 1VFEA 3P7IA 1B1XA 1VR5A 3KFMA 3W9VA 2HQ0A 1NL5A 3MWBA 4U1ZA 4YAHX 4GXAA 3RT8A 2GHBA 1YAEA 3V89B 4ZEIA 2ZYNA 2Y7KA 4N13A 3VLWA 5I56B 3IB2A 4JSOA 4LONB 4ECFA 5BWJA 2V3QA 3R6UA 1N76A 1US4A 5CMKA 3MVZA 2DYXA 3MVYA 3FATA 4R2FA 3A09A 3OSRA 2Z22A 4BLAA 4ZZEA 5A5XA 1ZIUA 4NF5A 4DXUA 4EQ7A 4FJPA 1B3GA 1SYIA 4N07A 5H8FA 3BKIB 1QKAA 2Y7RA 3OEKA 3TMGA 4DIGA 1NKXA 1B4HA 2I49A 4IO3A 2Z8FA 1IEJA 4GVOA 1Q35A 3UA8A 3OXNA 1RYOA 3O97A 4PE5B 4F18A 3SEVA 3TZAA 2QRYA 3IOWA 3TCGA 3IB0A 2ZNTA 2ZMBA 4M4GA 2UVIA 3THIA 3F11A 1LLSA 4EF2A 1IQ7A 3DM0A 4YB7A 4KR5A 2OLBA 5FHMA 3K6WA 4FECA 1B58A 4KYSA 4TLLB 4C1UA 1B7UA 2D5WA 4GXSB 2REGA 3GZGA 1FTOA 2ESNA 1TT1A 3TQLA 1US5A 3IR1A 4WEPA 2ALUA 3E3KA 3B6TA 4YKPA 1UTBB 4OEVA 1R6ZA 4K3FA 2H9BA 2DWHA 5ICQA 5CC2A 4U4SA 3H06B 1BP5A 2QS2A 5M2VA 3FZVA 4NEDA 2NWJA 4XKQA 3OELA 4G77A 1WDNA 4NF8A 4Q5TA 2X26A 1B1HA 1TWYA 4MLVA 1B6HA 5I59B 1NNFA 1H43A 2O1LA 2RINA 2X7QA 1SI1A 2XX7A 4YICA 3T66A 5FHOA 3LR1A 3M3FA 1LAFE 2RF1A 4OVJA 4F2OA 3RN8A 3D4GA 2XXQA 3O28A 4PQJA 1WVJA 4LVQA 3QAXA 3QIMA 4OFLA 4F3BA 1A40A 4OTEA 4HCWA 2ONSA 3C32A 2FA7A 4OESA 4PETA 4ISUA 2D3IA 4EQBA 1FQBA 3R26A 1B5JA 4YMBA 4FAJA 3HO7A 2NOOA 2I4BA 3OMBA 1JQFA 2VD2A 3MVXA 1PDAA 3FVOA 3S9MC 3IL1B 4U4XA 5A5XB 2H99A 4NF5B 4G2ZA 2QPQA 2PT2A 4GL8A 3O6IA 5H8FB 3SESA 5KCJA 3SDFA 3VLUA 1BLFA 5TPAA 2B3FA 2I6EA 3UK4A 3T9VA 4XXUA 4DLDA 4HTGA 4YKKA 2XXPA 3LSWA 5ITOA 3VLVA 4GD5A 1MY0A 3Q28A 2CMOA 4ZE9A 2HXWA 4ELQA 4ELRA 4EXKA 3CFLA 3KG2A 3KJ7A 3GBAA 5I57A 4JXIA 3VXBA 4LP2B 5ISUA 1Z7ME 3QUJA 2HFBA 3PUYE 4P0IA 3W15C 2NUVA 4AB5A 4NE4A 1Y9UA 1MDP1 3RTFB 1B2HA 3RLFE 5ICTA 4F3PA 4YZZA 2ZYMA 3TUSA 4EXLA 1NH8A 2GFEA 3TYHA 2PMSA 4IO5A 2O68A 3T93B 3MVWA 5EYFA 5CMBA 1JVYA 5CMMA 2Q2CA 4X1DA 1QUIA 2F36A 1LCFA 1HSLA 3QSLA 3IO4A 3V83A 2DP8A 3BFTA 3A3UA 2I58A 4GWOA 2PX1A 2O51A 4NF4A 3N6TA 4WXJA 2FNCA 1P1WA 1SW2A 2HZKA 4PP0A 5L8DA 2OCUA 2UYFA 3D4CA 3FVGA 3VVDA 1FQAA 3W9WA 4JDFA 1IUDA 4QSEA 3O29A 1M5BA 3ECRA 1RYXA 2UVJA 1JEUA 4ZS9A 4OQOA 2UXAA 1JW1A 2H98A 1UIVA 3H6TA 2THIA 4XKPA 1YTVA 1D4NA 3G3HA 1LAGE 1R9LA 5DTBA 3R7XA 2I48A 2HAVA 1FTKA 4ESWA 1MQDA 1Y20A 2Z8EA 1QJMA 4LUBA 4O3CA 3RNNA 3G3IA 3N5LA 2CZLA 1SD3A 1SQYA 1DOTA 4UA8A 3CVGA 1Y3NA 3ZKLA 2F97A 3DP8A 4HCYA 2KLFA 2Z8DA 3H3GA 1MQHA 1FW0A 3IB1A 4GLIA 2WKYA 4DDDA 2DE3A 4OYVA 3IAZA 3OD7A 4IO7A 4IGRA 4ELOA 1H3DA 4ZZAA 1B0HA 1CB6A 3MAMA 4F31B 1MXUA 4OFOA 3VVFA 5TPAB 1IXCA 3S9EA 1XHYA 4R72A 1SW1A 1P1UA 1B51A 2QS1A 3GXAA 1N0TA 2UYEA 4H8JA 5AA3A 1I6QA 3OO6A 3G3GA 2O7UA 4G68C 2F7CA 5KDTA 1LFHA 3KN7A 3TQWA 3VVEA 4ZDMA 5H8NA 4X48A 1ZU0A 2DVZA 2IA4A 3WAFA 2P1SA 4UACA 5I57B 2QJEA 1F9BA 1PB9A 1DPEA 2REJA 3H7MA 1MH3A 4OEUA 2Y7IA 2OWSA 3CI8A 4R9FA 3H6UA 2ONRA 3K2DA 1FQEA 3I6VA 4DXBA 1A8EA 4WEDA 2XXUA 3EHTA 2FYIA 3JZJA 3DP4A 2F6GA 4R6KA 3G3JA 3FV1A 4Z7EA 1GVCA 2V84A 1AH5A 1DPPA 2I0BA 3PUZE 1QW0A 2F34A 1LBCA 2DOJA 3K1NA 1GV8A 2QMWA 2V3TA 2XXRA 4MBPA 3V5AA 2D21A 4GRKA 4LZ5A 4BDOA 1A7LA 3K6UA 1Y3QA 3E9XA 4O3AA 4FIMA 3QXMA 1J1NA 1B05A 5IAIA 4THIA 1PEBA 4NF4B 1DTGA 1B5HA 3CFXA 3PPQA 3V8XB 4P0GA 1L5TA 2ZNSA 5CBSA 2DXYA 4ZEFA 3FJGA 4PFWA 1EZ9A 2RC7A 1R1NA 3L6GA 4G8HA 1I6BA 1ELJA 5H8QA 5HPQA 1TFAA 4JWXA 2DS9A 4ZEDA 1MQJA 2QS4A 4I9DA 5CMCA 1PB7A 3H6WA 3TKDA 1IXGA 4IY5A 1MXYA 5I2KA 4G8NA 4L17A 1N7WA 3M3LA 1H76A 3K1MA 1VSOA 4IB2A 4H1XA 2F78A 2ZNUA 3H03A 2E1SA 5I2NA 3RGYA 1S9TA 3SEXA 4GL0A 1EH3A 2E0SA 3S2VA 3MP6A 4ND9A 3C35A 1URGA 3BBRA 3Q26A 4H8IA 4OWDA 2DWJA 2PYYA 3HV1A 4G8MA 3MZ9A 1B9JA 2Z23A 4BDQA 2P2AA 4GIZA 4FEBA 1IXIA 3PMVA 1FCKA 1PBQA 3RQTA 3PPNA 1OLCA 2VD3A 3JV9A 4LQ2A 3C31A 5IKBA 1A8FA 4YB6A 2H5YA 3C36A 5KDTB 1MXZA 1FQCA 4IO4A 3TPAA 3SEUA 4LZ7A 2AL5A 4C0RA 1MDQA 2XXYA 5H8NB 5B7DA 1B46A 2W7YA 5FTIA 3KGCA 1P1NA 2YPNA 3MP1A 1BKAA 2RC9A 4PFUA 2NXOA 3AXFA 3TTRA 3PPRA 4GOTA 3VV5A 4RY1A 2UVGA 3GLBA 1URDA 1Y1ZA 3Q29A 3CR9A 2M8CA 4RYAA 3MZBA 4XTCQ 4XKRA 3FV2A 4NWDA 3PGFA 4P11A 1CE2A 4JB7A 1TFDA 4U21A 1TXFA 1OLAA 1XOCA 3IOVA 1IXHA 1AL3A 3MJNA 4FATA 4MFIA 2XXVA 4H0WA 1POTA 2O6AA 1FQFA 4OETA 1MS7A 1YCJA 3T9HB 2AIXA 2QSXA 3N94A 3U92A 3T9UA 3CRBA 5HM4B 2B3BA 1QULA 1S50A 1N04A 4Z0IA 3UIFA 1KWHA 1MY1A 3GBBA 4OFJA 1NNTA 2I3VA 1S7YA 2NVUB 1LCTA 1MM6A 2QL3A 3FJ7A 1D9YA 1ANFA 4PFTA 2V93A 5F1QA 3ZS6A 1EZOA 5H8QB 3TCHA 1D9VA 3MPKA 3FVNA 3LSXA 4NMYA 1DTZA 1GR2A 2RC8A 5B70A 4BDRA 3DP6A 1URSA 5I2KB 2XHDA 3PUWE 3SERA 3EHUA 2XXIA 2Y7PA 1POY1 4I1DA 1B40A 3TTMA 3H6VA 5I2NB 2PT1A 1IITA 3TCFA 2IEEA 3KJTA 4POWA 1PBPA 4LQ5A 2LAOA 5AA2D 4Q8RA 5JK4A 2AYSA 2XXWA 1OMPA 4IO2A 2PBWA 3RTWB 2R9JA 3TELA 3IK6B 1SBPA 1LSTA 5AA4A 4G4PA 1JEVA 2I3WA 4HW8A 1QKBA 2Q88A 3CG1A 2G29A 1MQGA 3PD9A 4Q0CA 2I0CA 4RJZA 1AMFA 3ZSFA 3TEPA 3VFJA 3MC2A 4EQ9A 3CG3A 5I58A 4BDNA 4QSCA 1USYE 3E13X 3PPPA 4YU0A 4XIGQ 1B3LA 5ITPA 4RK9A 3BFUA 4U22A 2XD3A 4QFKA 3K6XA 1VFDA 4R9GA 3KZGA 2AL4A 2DE4A 4KPTA 1NNKA 4OZ9A 3OOAA 3IX1A 5F7VA 3MPLA 3N6UA 3K6VA 4E0WA 1ZKBA 4LA9A 4IO6A 2VOZA 3Q25A 1OVTA 4QFPA 1ZMGA 3MUQA 1LBBA 5DVFA 1LB9A 1SW5A 2DE2A 1MG1A 4QFLA 1EU8A 1JETA 2QMXA 4KYEA 3H4ZA 3FGSA 4OERA 3S9NC 4KYDA 4R74A 1B3HA 3HHGA 3TAJA 1H44A 2O1MA 1A54A 2ZYOA 2R6GE 5DEXA 1XT8A 2F8DA 4F29A 3IJOB 2XX9A 3FVKA 1YPNA 4U1OA 1R9QA 2VHAA 3HPIA 1UTHB 1PB8A 4HS7A 2V25A 3ONMA 3LBSA 1AOVA 1NNPA 3MP8A 1A55A 3HN0A 2UVHA 1NH7A 5L9OA 3A3CA 4ZEKA 4F3SA 1XS5A 2OZZA 4KCDA 5H8SA 3U8QA 3VDFA 3MBPA 2ONKE 1UIUA 3PU5A 3OEMA 4H67A 1M5CA 3FXUA 2O84X 1MXVA 3CIJA 2ZXTA 5I84A 1SW4A 3UN6A 3U72A 2H25A 4G68A 1Z7NE 5L9SA 4R6YA 3OO7A 4TQUQ 4H65A 4KFQA 1B7HA 2Q2AA 3I5OA 3EQ1A 2OWTA 1N3XA 3HSTA 5EHSA 3C9HA 1MPCA 5AA4B 4RXLA 2OJTA 1GGGA 3Q27A 2A5TA 4GF8A 1SDXA 3PUXE 4KQPA 4QFOA 3HHFA 4X1BA 1B52A 1UQWA 5AE4A 2PVUA 3FXQA 3KSJA 2HAUA 3MQ9A 4RPNA 5FHNA 1B7ZA 1OVBA 5I58B 1ZLQA 3KEIA 5J1DA 3EPEA 3OO9A 4RNSA 3L6HA 3DLNA 3B6WA 4OXVA 3G3KA 3UP9A 2F35A 3RT6B 1BTJA 1PC3A 1XVXA 1LAXA 1H45A 1DMBA 3M3KA 2GRVA 2P0SA 1QUKA 1LAHE 1XC1A 3FUZA 2Q8JA 4NTLA 4GFRA 4GQOA 1JVXA 4X9TA 2F7BA 3IOUA 3N26A 3B7DA 2YJPA 3E4RA 4F2QA 2O69A 2QS3A 4OMBA 1JNFA 3T9XB 5JTYA 1XVYA 5DT6A 3DELB 5TP9B 5ELVA 4ESXA 3K02A 4IGTA 5HBCA 4QSDA 4OHNA 4H5FA 1OQGA 4JWOA 1FQDA 3U1OA 3PMXA 1P99A 5AA2A 1IZ1A 4KHZE 3I3VA 3JYRA 3FIRA 2VP1A 5LOMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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