5DYHA

Ti(iv) bound human serum transferrin
Total Genus 188
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
188
sequence length
677
structure length
677
Chain Sequence
DKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAIAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Metal transport
molecule keywords Serotransferrin
publication title Unusual Synergism of Transferrin and Citrate in the Regulation of Ti(IV) Speciation, Transport, and Toxicity.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 188
structure length 677
sequence length 677
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dyhA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dyhA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dyhA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dyhA03
1LAHE 3W9WA 5I2KB 1GR2A 3C4MA 3PMXA 4MFIA 4NF4A 4QFKA 4FECA 3T9VA 4U1OA 1QUJA 4DXBA 1JVXA 5H8FA 3T66A 5CM6A 1R1NA 3C35A 3KN3A 1N3XA 5K2XA 1URSA 4RY1A 1R9LA 1M5FA 3O97A 4O3BA 1H44A 2Y7PA 3N5LA 2V3TA 4YB5A 1VFDA 1EH3A 1QULA 1L5TA 1US5A 1MDP1 4QFNA 2NWJA 1H3DA 1DSNA 1JEVA 1B7HA 3QK6A 3TODA 4G77A 2F97A 3U1OA 3C32A 3DM0A 4POWA 1MH4A 1TFAA 2X7PA 1MQDA 1LAGE 1XS5A 2F78A 4OETA 5JEIA 4PETA 1B4HA 1ZIUA 4LVQA 3C9HA 4ND9A 4EXLA 1MS7A 3G3KA 4IO4A 1HSJA 3MPKA 4M4GA 4WXJA 1RYXA 1MQHA 1FQFA 1LGBC 3PMWA 3RTFB 1M5CA 3JYRA 5L9OA 5DTBA 5EHSA 3HN0A 5JTYA 1PBPA 1Y1MA 3ZKKA 3USDA 4JSDA 4ZEIA 4DDDA 4U21A 1P1NA 3RNNA 2VOZA 4KHZE 3TTMA 1O7TA 4XXUA 4EDPA 4DCYA 1UTBA 4XKRA 1VR5A 4QRZA 4XIGQ 1UQWA 4NF8A 3K2DA 3DP4A 2H4IA 3RT6B 4NTLA 3O2AA 1PC3A 3O6HA 2ZYKA 3IJXB 3CIJA 1URGA 1B46A 1LBBA 1DMBA 1N7XA 2XXQA 2Y7WA 1PB7A 3B6QA 3S2VA 1ZKBA 1SW5A 1SI1A 4GLIA 4EF1A 2GHBA 2CMOA 3RLFE 5KDTA 1MH3A 2AL5A 3AXFA 2HFBA 2I6EA 2HQ0A 3TZAA 1B4ZA 5ITOA 1H43A 1BP5A 2H5YA 4LA9A 1TWYA 4YICA 4ZDMA 1SW1A 2Q89A 2H99A 4DE8A 3PUZE 4R2BA 4PE5B 1DTGA 1MY4A 1B5IA 3JV9A 2O68A 1S50A 2I49A 5JTYB 3EF7A 5DEXA 4ZEBA 3FXQA 4R9GA 3SERA 3OD7A 1A8FA 1Q1KA 3LSFB 2HAVA 2THIA 5ELVA 1JW1A 3Q29A 3EN3A 1XVXA 2XD2A 1MY3A 2PX1A 4F3SA 2REGA 4X48A 5FHOA 5HPQA 4YKIA 4M1VA 3CSBA 3ONMA 4WEDA 3Q26A 4DZ1A 2OBGA 3MWBA 1FQBA 4OENA 4NWDA 5KDTB 3H06B 3I5OA 2F7BA 4HS7A 5TPAA 1UTHA 3C36A 4G2ZA 1P1OA 2XXYA 4IY6A 4TLMB 2DWAA 5CMBA 3VLUA 1YPNA 1LFHA 5CBSA 1B3GA 5AA2D 1I6AA 3KSXA 3GLBA 4H5FA 2G29A 4ESWA 2ZMBA 4OXVA 3PU5A 3IOTA 1N84A 1SQYA 4GOTA 2HCAA 4R6KA 2Z23A 4G8NA 1OQHA 4DLDA 3DLNA 2XXUA 3B6TA 1MY0A 4H1XA 3FATA 3FJMA 2V3UA 1NNPA 5ISUA 1VE4A 4BDRA 4G68A 2GFEA 4ZZEA 3ZS6A 3MC2A 3G3JA 3T22A 3MZ1A 4HTGA 1B58A 2KLFA 4IO5A 3CSGA 2OWTA 4H6DA 4YAHX 4FATA 3FXUA 3V83A 4JDFA 4YMAA 2XXTA 3GXAA 1PB8A 2FNCA 3R26A 4IO2A 5FTIA 3CI8A 4F19A 4P11A 4F1YA 4C1UA 1B1HA 5TPAB 1VFEA 1UTHB 3CFXA 4H5GA 1MXUA 3UP9A 2XXRA 4U2RA 1XHYA 1EZPA 2A5TA 1AL3A 4NE4A 4OEVA 1B3LA 2PMSA 1IXCA 3TQLA 3CG3A 3M3LA 2I0BA 4K3FA 3KN7A 3SEVA 4C1TA 2V84A 1LB9A 1FQDA 1LFGA 2F34A 2ZYMA 2HXWA 3PV0E 2DP8A 1IUDA 3CG1A 3SEUA 1A54A 4AB6A 2HEUA 2OWSA 1NNFA 4NEDA 3CFZA 3PUVE 1IQ7A 4ZECA 5K2YA 3H03A 4F2QA 1N04A 3FV2A 1D4NA 1I6BA 2ABHA 2ONKE 4ELRA 2QS1A 4R72A 1GV8A 4X9TA 4KYEA 2HAUA 2ZYNA 4POXA 5B7DA 4R74A 4Q30B 4PFTA 4GWOA 1XC1A 3TDJA 3VLVA 1IIWA 2RC7A 2F6PA 3MZBA 3FVOA 3R7XA 3VDFA 3IB0A 4ZEKA 1P1QA 1JQFA 1D3KA 5L8DA 4EUOA 2A5TB 4R73A 5F7VA 4U1ZA 5H8HA 5HM4B 3K0VA 4PQJA 2I3WA 4H67A 4HCWA 1EZOA 1OVTA 3IOWA 4MF3A 3TCGA 3BBRA 3QSLA 2XD3A 4GQOA 4OFJA 3TKDA 3OO7A 4OMBA 4DXCA 4QFOA 3OXNA 2UYEA 3VXBA 3SEXA 1J1NA 3OEMA 1AOVA 2ANJA 3IR1A 4OYVA 1SYIA 4OESA 3VXCA 4EF2A 4EQBA 2E1SA 4H0WA 2ZYOA 2Y84A 1YAEA 1OIBA 3MP1A 4R2FA 3A3CA 5CMCA 2QJEA 2O6AA 4U4XA 4ISUA 2I58A 5AE4A 4PFWA 1JNFA 4KCCA 2H9BA 3UIFA 4LZ7A 1O63A 3H7MA 1SD3A 4KQPA 4YKJA 1JETA 4MH5A 3K1MA 4Q5TA 4IGRA 3KGCA 2V25A 4EQ7A 3Q28A 5DT6A 3I3VA 1D9YA 5H8HB 1MY2A 5H8QB 5AA2A 2H98A 3ILTB 2DXYA 3ECRA 4PFUA 1O64A 4RPNA 4I8CA 1M5DA 4JBZA 5HBCA 3MZ9A 1NNTA 3RN8A 1II5A 4IO6A 3EHSA 4LZ5A 5ITPA 1WODA 4BDOA 3CRBA 4X1DA 3QUFA 2LAOA 1POTA 2Y7IA 2B3FA 4U4SA 5I2NA 4KPTA 1MPCA 5CBRA 4F1UA 1BIYA 1BTJA 4N13A 1B1XA 4LP2B 1PB9A 3K6UA 4ELOA 3W9VA 2QMXA 1SVXB 3FV1A 5I84A 4KR5A 2G93A 1P99A 1XVYA 2QS2A 1Y4TA 1R9QA 5KCJB 5EYFA 2V93A 2F7CA 3TUSA 3K4UA 3BFUA 3T9XB 3DELB 4Z0IA 2ZNTA 2RC8A 3DP8A 4Q0CA 3TMGA 1ZTYA 4GFRA 1QKBA 4KI0E 1NFTA 4ELPA 3PUXE 5AA2B 2AIXA 4IO3A 3IAZA 3UK4A 1JW5A 1MM7A 4QHQA 3E3KA 3S9NC 3M3FA 4BLAA 3PD8A 4BDQA 4ZS9A 2RC9A 1TT1A 5DVIA 4QFLA 3L6GA 3TYHA 2I48A 1B7UA 2UVJA 3SEYA 3FVGA 4GL0A 1EU8A 1MM6A 4RNSA 4NMYA 5I2NB 2VD2A 3EHTA 2X7QA 5CRYA 3A09A 2QMWA 2R9JA 3Q27A 1H76A 3WAFA 2R71A 4JB7A 3OMBA 3H3GA 1B5HA 3KG2A 4KFQA 3GZGA 4F39A 3SETA 3O9PA 4ESXA 1LSTA 3LR1A 3P7IA 3EHUA 4HCYA 5A5XB 1F9BA 4GXAA 1MXXA 4F3BA 2ALUA 2I3VA 1NH7A 4P0GA 1POY1 3K6XA 2I4CA 1NKXA 1I6QA 3TFLA 3T96B 4F2OA 1ZLQA 2HZLA 1NNKA 3IB2A 1IXIA 1IXGA 3I6VA 3K02A 1NL5A 2QS4A 5IAIA 4FE8A 2PT2A 1LBCA 1OMPA 3S4UA 5I57B 3N26A 4ZE8A 4X1BA 1URDA 2DWIA 3L6HA 3S9LC 3FD3A 5ICTA 3HPIA 3THIA 3CR9A 4KYSA 5H8NB 4FIMA 2RKMA 3TEPA 3UN6A 1Y3NA 4O3AA 1Y3PA 4YMBA 3PPRA 3KJTA 4I1DA 2P1SA 2O7UA 3OSRA 5I58A 3U8QA 1CB6A 3IO4A 3V8XB 3IK6B 3B6WA 3H4ZA 3UGWA 4LONB 4YB7A 2DQVA 3HV1A 1RKMA 2QSXA 1MPBA 3FASA 1FTOA 4LUBA 3JZJA 3KOSA 3PPOA 3U92A 1ZU0A 4FEBA 4G4PA 4OWDA 2XX8A 5IKBA 5KZTA 4H65A 3O28A 4O3CA 3FZVA 2OK2A 3T9UA 1B6HA 1MXYA 5H8SA 1BLFA 2DXRA 1AIVA 4MLQA 4E0WA 3K00A 2RINA 3H6VA 1LAXA 2DYXA 3PGFA 3OELA 3K1PA 4NF6A 5I58B 4EQ9A 4UACA 3EQ1A 1MQIA 3HO7A 1R6ZA 1USYH 4IY5A 2Y7KA 1SYHA 1FTKA 4I62A 2AYSA 1A7LA 2E0SA 3RGYA 3PUYE 4F3GA 4G8HA 2X26A 4OQOA 2DE2A 1FQAA 1FTMA 1ZJLA 3CVGA 3G3GA 4OHNA 1B0LA 4TOZA 2Y7RA 4F1VA 3ILUB 3SDFA 4ZE9A 3TQWA 1MRPA 4KYDA 5DVJA 5L9SA 4GXSB 2D3IA 5J1DA 3QIMA 3IB1A 1QVSA 3UA8A 5BUUA 2VD3A 2VGQA 4RA1A 1A40A 1PDAA 4BDNA 2XXWA 2O1LA 3EPEA 4L17A 1MPDA 1B40A 1I69A 3D4CA 3KZGA 5H8QA 1US4A 4NF6B 1B3FA 4GD5A 2B65A 4JWXA 2ONRA 1ZBMA 2DWJA 2XX7A 2UXAA 3A3UA 3PPQA 2V3QA 1Q35A 3TCFA 2W7YA 1JEUA 1TFDA 2XXPA 5JK4A 3TAJA 3ZSFA 4OFOA 2O84X 4F22A 3F11A 4TLLB 4AQ4A 3VVFA 4LATA 3QUJA 3T9HB 3LSWA 1P1UA 1XT8A 2WKYA 4TQUQ 1B3HA 3FVNA 4WEPA 2IEEA 4LQ2A 5CC2A 2D5WA 1H45A 3H6TA 3K01A 1N76A 3PPNA 5FHNA 2DVCA 5FHMA 3MBPA 4EXKA 5KCJA 4RK2A 2NUVA 2OLBA 3OO9A 4F31B 1ZMGA 1QUKA 4R6YA 1A99A 1DPEA 4Q8RA 4YZZA 2P0SA 3E9XA 2DE4A 1OLCA 4RK9A 2F5XA 4Z7EA 3V5AA 5BWJA 1LAFE 4PP0A 3OENA 1OQGA 4U22A 1LCTA 1B5JA 3FGSA 1B9JA 2B3BA 3TELA 4OVJA 4U23A 5TU0A 4N07A 5TP9A 3OOAA 1DOTA 4UA8A 5M2VA 2DOJA 1MY1A 4LZ8A 1JW4A 1OVBA 3E13X 5EHMA 1MG1A 3V89B 2F36A 4QF9A 1RYOA 1D9VA 4RYAA 4QFPA 4OEUA 5DYHA 3K6VA 4I9DA 1SI0A 4HW8A 1AH5A 1LFIA 3N6UA 3IO6A 3VVDA 1P1WA 1ATGA 3RTWB 1Y1ZA 1FTLA 2Z8FA 3OEKA 1QJMA 4NF4B 1DTZA 1N7WA 5H8FB 1ANFA 2PVUA 1M5EA 4IGTA 4FAJA 5CMKA 1YTVA 4QSEA 3LSXA 3MPLA 1QW0A 4NF5A 3G7WA 5A5XA 1KWHA 1QKAA 2Q88A 2XXVA 1FTJA 1LB8A 3BKIB 2I4BA 3PD9A 4LQ5A 1SDXA 2ZXTA 3PPPA 1S9TA 3MW0A 3G3IA 3MJNA 1WVJA 3RQTA 1UIUA 3FJ7A 2RCBA 4YU0A 1FQEA 1B51A 4XTCQ 3SKPA 2PBWA 4RXLA 4BDMA 1BKAA 3H6UA 4JWOA 1AMFA 3IOUA 3PUWE 5I59A 2UVHA 2GHAA 3GBAA 5I57A 4XKPA 2ESNA 1CE2A 2I0CA 3KN8A 4DCXA 3C31A 3HSTA 3MP8A 1B2HA 2ZNSA 1T0KA 3MVYA 2M8CA 5TP9B 4XKNA 1MXWA 4DIGA 4H8JA 5H8NA 3QYTA 4IB2A 2F35A 2PT1A 1TXFA 2F6GA 2XXHA 2VP1A 2YJPA 4AB5A 3N6TA 2O69A 3KEIA 4MLVA 3SEWA 1USYE 1S7YA 1Y4CA 3Q25A 2VHAA 2D21A 5F1QA 1IITA 4P0IA 4QSCA 4KCDA 3H6WA 2AL4A 5FTHA 3RT8A 2CZLA 4NF5B 3FIRA 3HCQA 3R6UA 1Y9UA 3O29A 4H8IA 3OO6A 2REJA 5AA1A 4GIZA 1MQGA 1NH8A 2YLNA 4JSOA 3C33A 2Q8JA 1UTBB 3TCHA 4ECFA 2NXOA 4NF8B 5I59B 1DPPA 3IX1A 4FJPA 3TPAA 2O51A 3O6IA 4G8MA 3MVWA 1FQCA 5AA4A 3FJGA 4OTEA 3MQ9A 3SESA 2Q9TA 2F7AA 1M5BA 4DXUA 2QS3A 1MXVA 3VV5A 4MBPA 3S9EA 4E0XA 1QUIA 1IEJA 1HSEA 3U72A 1GVCA 2O1MA 3HHGA 1JVYA 4JXIA 2XXIA 4OERA 3TTRA 1B3EA 3W15C 2XHDA 5AA3A 2IA4A 1WDNA 3MAMA 4KD5A 3VVEA 4NWCA 3TTKA 3KOTA 1HSLA 3G3FA 4F3PA 3GBBA 4N6PA 2YPNA 3VE1B 1IZ1A 1FCKA 1MQJA 2OJTA 2XXXA 3FVKA 3TTNA 3D4GA 4PFYA 4ZEDA 1LLSA 3O6GA 4OFLA 2RCAA 5DEXB 3K6WA 5CMMA 1B7ZA 2ZNUA 3BFTA 3RUMA 1UIVA 3IORA 3B7DA 2UVGA 3ODBA 2DSFA 4R75A 2F8DA 2PYYA 2Q2CA 4RPOA 1PEBA 4ZEFA 4GRKA 4RJZA 2OZZA 5I56A 4C0RA 3OSQA 2OCUA 5AA4B 1B32A 3RY3A 3G3HA 1Z7NE 3O66A 2BJJX 1GGGA 3QAXA 4QSDA 1LCFA 1OLAA 3E4RA 2FA7A 1ELJA 3MVZA 3M8UA 4THIA 2UYFA 3KBRA 1SW2A 4GF8A 3LC8A 4GL8A 3MUQA 1N3WA 3LBSA 2A5SA 1A8EA 1B0HA 5L9MA 2FYIA 2QPQA 4R6HA 3KSJA 3IJOB 4ZZAA 2RF1A 1YCJA 2P2AA 2Z8DA 3T93B 4GVOA 1EZ9A 4G68C 2HZKA 1IXHA 1Y20A 3WAEA 1MXZA 4IO7A 5B70A 2DWHA 4ONYA 3U94A 3K1NA 3LSLA 3S9MC 4R9FA 5I2KA 2GRVA 4JWYA 2H25A 3VFJA 2DS9A 3TTLA 3C34A 2QL3A 3LUYA 2ONSA 4G68B 3M3KA 3PMVA 1FW0A 2NOOA 1VSOA 1Y3QA 3CFLA 5I56B 3KJ7A 3FUZA 1N0TA 2Z22A 5DVFA 3IL1B 3KFMA 2XX9A 1MDQA 1A55A 4FORA 5CI5A 2UVIA 4XKQA 3MVXA 1B52A 1XOCA 3IOVA 1B05A 2R6GE 1GTKA 4YKKA 4F18A 2O7IA 4WKMA 2Q2AA 3UORA 4BDLA 3OO8A 3HHFA 4FEDA 3N94A 3QXMA 1NMUA 4ELQA 2GH9A 3VLWA 3MP6A 1SW4A 5LOMA 2NVUB 2Z8EA 4OZ9A 3RPWA 5ICQA 4YKPA 4F29A 4YB6A 3U93A 2QRYA 1SBPA 3DP6A 3ZKLA 1PBQA 2DE3A 3FXRA 2DVZA 1Z7ME
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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