5DYHA

Ti(iv) bound human serum transferrin
Total Genus 188
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
188
sequence length
677
structure length
677
Chain Sequence
DKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAIAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Serotransferrin
publication title Unusual Synergism of Transferrin and Citrate in the Regulation of Ti(IV) Speciation, Transport, and Toxicity.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Metal transport
total genus 188
structure length 677
sequence length 677
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dyhA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dyhA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dyhA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dyhA03
2OWSA 5DEXA 3CIJA 4Z7EA 1WODA 2I58A 4PFYA 5H8FA 4JWYA 3K01A 3PPNA 5L9OA 4JB7A 3IB0A 4G68A 2F6GA 1Y4CA 3I6VA 3B6TA 3I3VA 1HSEA 4ZDMA 3WAFA 3QIMA 4C0RA 4GRKA 3M8UA 1TWYA 1B2HA 1MXVA 3PD8A 1B32A 2DE3A 3EQ1A 3G3IA 1SDXA 3P7IA 3FUZA 3LSLA 1T0KA 4IGRA 3H03A 3ONMA 4EF1A 1A8EA 2O7UA 3B7DA 4KCDA 4IO5A 3MVWA 4DIGA 4NWCA 4WXJA 3CR9A 4F3BA 4YB5A 1OQHA 1QW0A 4KCCA 1BTJA 5TPAB 2H9BA 1UIVA 4GWOA 1ZLQA 5L9MA 3LBSA 2ANJA 2DS9A 2F34A 3PU5A 3BFTA 1IXGA 3PPOA 3K0VA 2V3QA 4LZ7A 3SKPA 2DOJA 1Q1KA 1LAGE 1YAEA 3U94A 5ISUA 3K6WA 4QFKA 3V8XB 5H8QB 4WEDA 2PT2A 3G3FA 1CE2A 2I48A 5H8NB 3H6VA 1I6BA 1B05A 2DQVA 4KFQA 3TPAA 2XXPA 2DVCA 3MBPA 2AL5A 1NKXA 4QSEA 4LQ2A 4KPTA 2Y7RA 3B6QA 1MY2A 4YKJA 4NF6A 2XX8A 1OIBA 1P1WA 3VXCA 3RTFB 1UTHA 2QL3A 3N6UA 2NUVA 3FXUA 1UTBA 2THIA 3U72A 4DXUA 1LSTA 4RPNA 2A5TA 2F6PA 2D3IA 1B9JA 5CMCA 3O29A 3G3KA 2XXIA 2XXXA 3MP1A 3TODA 1JVXA 4OESA 3GXAA 1JQFA 4YU0A 5AA2D 2Y7WA 1IQ7A 3DELB 5I57B 2ZXTA 3KSXA 2F7AA 2OLBA 4EXKA 4RA1A 2VP1A 3CFXA 4HS7A 3TTLA 1H76A 4GL8A 4NF8A 3TDJA 4K3FA 1POTA 4FECA 1XT8A 1AH5A 1FCKA 5K2XA 4OENA 4IB2A 4OERA 1Z7NE 3H7MA 3IAZA 3MC2A 1VFDA 1B6HA 4F1YA 4ZE8A 5KCJA 5LOMA 2XXTA 3MUQA 3MZ1A 2F5XA 3PD9A 4C1UA 4KHZE 3IOVA 2D21A 3TAJA 3EHSA 1GGGA 1MH3A 3MVXA 4OFOA 1H44A 1Y3PA 1ZJLA 3FZVA 2QMXA 2W7YA 4DE8A 1MY4A 1FQFA 4DCXA 5CM6A 1MG1A 1D9YA 3E13X 3H3GA 1ELJA 3H6TA 4ELOA 2I49A 2Q2AA 1FQBA 1MQGA 3SETA 4OHNA 4PFUA 3ZKLA 1B58A 3BFUA 4POXA 4BDQA 3FVGA 2M8CA 4F1UA 3UK4A 3HN0A 4IGTA 5DTBA 3W9VA 1EH3A 2ZNSA 1A8FA 1OLCA 4BLAA 3IL1B 4F22A 3PUWE 3K1MA 1MDQA 3BKIB 2QS2A 5H8SA 3PGFA 1A7LA 3PUVE 3KOTA 4BDRA 2ZNUA 3C34A 1SYHA 5A5XA 1FTOA 1Y3QA 4FIMA 1II5A 2AIXA 1AIVA 2XX9A 2WKYA 3L6GA 2IA4A 4U1ZA 2H99A 3DP4A 4F1VA 5KZTA 4GXAA 4KYDA 4BDOA 1NNKA 2F97A 2O7IA 1DTGA 1VR5A 1IITA 2QS4A 2OK2A 4P11A 3UP9A 3MW0A 1N84A 3ZS6A 3HPIA 2O51A 3Q25A 1J1NA 3CI8A 1PC3A 5AE4A 1I6QA 3VDFA 1TFDA 4EQ7A 3T93B 3OELA 4RPOA 3UORA 1B4ZA 1NMUA 1O64A 4XKNA 3FXQA 1B5JA 5FTHA 3N6TA 1FQDA 1GV8A 2QSXA 3HO7A 5I59A 2ZNTA 3U92A 1HSJA 4U21A 5CBSA 4YKKA 1NNTA 3E3KA 1A40A 2A5SA 4QF9A 4YAHX 3G3JA 4H0WA 2OJTA 1FW0A 4AB6A 1JW5A 2XX7A 1RYOA 5CC2A 4EUOA 3IX1A 1VFEA 3TUSA 5FHOA 1YTVA 5I56B 2XXRA 3D4GA 3FJGA 5JK4A 2XD2A 3CSGA 3E4RA 3JZJA 3K6XA 4E0XA 3QK6A 2I4BA 1LFIA 1P1OA 3KN3A 3R26A 5DVJA 3VE1B 1A55A 4IO7A 4QSDA 2H5YA 4UACA 4RY1A 5F7VA 4ELPA 1MXYA 1ZU0A 2VHAA 4YICA 4YKPA 1PBPA 4H1XA 4IO3A 1Y4TA 3ODBA 4TQUQ 3VFJA 2GHAA 3DP6A 3IK6B 2FYIA 3IO4A 1NNFA 4RXLA 4F2QA 3LSFB 3OXNA 5TPAA 2P2AA 2RC9A 3M3KA 4NTLA 2Z8DA 3TELA 4NF4B 4FEBA 1N3WA 4JSDA 1B7HA 3KGCA 4EXLA 2RINA 2HXWA 1M5FA 1OMPA 1H3DA 2AYSA 1M5CA 1NNPA 4TLLB 1PBQA 3T9VA 3MVZA 1Y20A 3SERA 1MXZA 2D5WA 3O6HA 3U93A 1MPCA 5H8QA 2DP8A 1LFHA 3Q26A 1PDAA 3S9LC 2DWHA 2BJJX 4GL0A 5BWJA 1JETA 1AOVA 1A54A 4BDNA 1SW2A 3G3GA 1OLAA 1SI0A 3RGYA 2YLNA 1B40A 1XOCA 4N13A 3O6IA 5CRYA 5B7DA 3TYHA 1NH8A 4XIGQ 4GXSB 1S50A 3K2DA 1US5A 1P99A 4N6PA 4F2OA 4ZS9A 1B0HA 4H6DA 4R73A 3UN6A 3C36A 3SESA 4MBPA 4YMAA 5DT6A 3PPQA 4U22A 3PUXE 3VV5A 3SEYA 3TQLA 3AXFA 2V3TA 1RKMA 3RN8A 1LAHE 1UQWA 4LP2B 4ZECA 3MQ9A 3RNNA 1H43A 4O3AA 1WDNA 1QUIA 3TZAA 4YKIA 1SW5A 3RY3A 5I57A 3W15C 1B3HA 4U23A 4G8NA 2UVHA 2VD3A 1YCJA 3GZGA 2IEEA 1PEBA 4P0IA 5DVFA 3OOAA 3KJTA 4WEPA 4R2BA 5FTIA 3A3CA 1XC1A 3RT8A 1B3GA 3FATA 1ATGA 4HTGA 1M5EA 4KI0E 3TTNA 1EZ9A 3UA8A 4FATA 3IO6A 2ZYKA 3WAEA 3ZSFA 4LATA 1O63A 3EHUA 4MLQA 5ITOA 5CI5A 4Z0IA 2I3WA 5FHMA 1USYH 1IXCA 4OFLA 3C32A 2I0BA 4I62A 4F18A 2XD3A 2HQ0A 1MS7A 1SVXB 3K00A 3PMXA 1POY1 1UIUA 1QULA 3OENA 2GHBA 2ONSA 3I5OA 3Q29A 4G77A 1SD3A 3OO8A 1MXXA 3GLBA 2E0SA 5BUUA 1TT1A 2ALUA 2RC7A 4Q5TA 4QRZA 3MZBA 1XS5A 3K6UA 4L17A 2GH9A 1AMFA 3R7XA 4GOTA 3MVYA 3KZGA 1JEVA 1SI1A 2UYFA 2KLFA 3VLUA 2UVJA 1QJMA 5CMMA 3KG2A 1MPBA 5CMKA 1ANFA 2O69A 3MAMA 3RUMA 1FTLA 2DE2A 4ISUA 4R6YA 3MWBA 3TQWA 4H65A 4X1BA 2ZMBA 5ICQA 2DSFA 2OZZA 3O66A 5TU0A 2DXYA 4PETA 2I4CA 1B46A 2X26A 3CVGA 2I0CA 3IOWA 4ZZEA 2R71A 4GVOA 3KN8A 3ZKKA 2O1LA 3K02A 3TTKA 2Y7PA 4U4XA 1B3LA 4FE8A 3O2AA 3K1NA 1GR2A 3KJ7A 4Q0CA 5I58B 3CFZA 2YPNA 2R6GE 3VXBA 2Z8FA 1FQCA 3JV9A 3SDFA 2FNCA 2REGA 3PPPA 5B70A 1VSOA 1B7UA 2O6AA 3TCHA 4ONYA 3FIRA 4LZ8A 3QXMA 2B3FA 4DCYA 4LONB 1SQYA 4RK9A 5M2VA 1DPPA 1FQEA 1UTBB 4U4SA 3MP6A 4ESWA 3TKDA 1MRPA 2DVZA 4PP0A 1N04A 4R9GA 1LB8A 2HEUA 3QYTA 1N7XA 3SEWA 5I56A 1FTKA 2PX1A 1B3FA 2ZYMA 3EF7A 3OSQA 3Q27A 1MY0A 1B51A 4H8JA 3RPWA 3VVDA 2Q8JA 4IY5A 1SW4A 3D4CA 3LR1A 4X9TA 4RYAA 1JW4A 2PVUA 2QRYA 1MM7A 1MPDA 4F29A 1DPEA 1JVYA 1DMBA 1WVJA 1B7ZA 2XXWA 3HV1A 4F3GA 4M1VA 3OSRA 3TMGA 3TCFA 4NF4A 2F36A 2QS1A 5I84A 3QAXA 5CBRA 4YB7A 3A09A 4OQOA 2DWJA 3KEIA 4WKMA 4F19A 4AB5A 5ELVA 4EDPA 1EZPA 2F8DA 4HW8A 4GF8A 1LAXA 1B4HA 4XKPA 5AA2B 2H4IA 1URDA 3FGSA 1S9TA 1MY3A 2R9JA 4ELQA 2HFBA 2Y7KA 4POWA 1F9BA 1N76A 4RJZA 4RK2A 1AL3A 2UVIA 3R6UA 2GFEA 4JWOA 1MDP1 5AA4B 1LBBA 3LUYA 2NWJA 3RLFE 1EZOA 3O97A 3HHGA 1ZTYA 3DLNA 2OBGA 2H98A 4LQ5A 1CB6A 2RKMA 2XXHA 3UIFA 3S9MC 2V3UA 4QFNA 5EHMA 4I8CA 4BDLA 5A5XB 4F3SA 1EU8A 2DWIA 1MQHA 3TTMA 1Y1MA 1QKAA 3FD3A 1IIWA 1BLFA 1PB7A 4R74A 4G8MA 1GTKA 1QVSA 3OD7A 4G2ZA 2Y84A 1KWHA 2PT1A 3VLVA 1Y1ZA 1NL5A 4PFWA 1HSLA 3C4MA 1FQAA 5I2NB 1ZIUA 4C1TA 3JYRA 3OO7A 2GRVA 4R75A 1TXFA 3ILTB 4U2RA 4X48A 3B6WA 3KBRA 2Y7IA 4G68C 5KDTB 2HZLA 1Z7ME 5DVIA 3OMBA 4ECFA 1N7WA 3HSTA 3TCGA 3BBRA 3M3FA 1S7YA 4YB6A 3IB2A 5H8NA 1IEJA 4EQ9A 1OVTA 1BP5A 1N0TA 4XTCQ 1DSNA 2V93A 3FVOA 4QFPA 4JSOA 1DOTA 2F35A 2QPQA 4DLDA 1B1HA 4OFJA 3GBAA 3KN7A 3OO6A 3IJXB 4DXBA 4KYSA 5F1QA 2X7QA 4DZ1A 5CMBA 4FEDA 4MH5A 3M3LA 4UA8A 4M4GA 1QUKA 3EPEA 4LZ5A 5TP9B 3FXRA 3C31A 2HCAA 4XXUA 1PB9A 1Y3NA 1ZBMA 1RYXA 4THIA 4NF5B 5I2KB 1MQDA 2REJA 5H8HB 1QUJA 2G29A 5ITPA 1P1UA 3HHFA 1IXHA 4DDDA 2Q89A 3N94A 1TFAA 1P1NA 2VGQA 4ESXA 4H67A 4IO4A 2LAOA 1R6ZA 3V5AA 1OVBA 2RC8A 3KSJA 3FV1A 3KOSA 1IUDA 4NWDA 2RF1A 1US4A 2XHDA 1XVYA 1R1NA 5JTYB 2XXVA 1P1QA 1URSA 5DEXB 5HM4B 2P0SA 3ECRA 3K6VA 3RQTA 4Q30B 5H8FB 4PE5B 4HCYA 3Q28A 2Z22A 4G68B 4MF3A 2Q2CA 5I58A 4ZEBA 1I69A 3S2VA 5J1DA 3UGWA 3USDA 3FVNA 1N3XA 1XHYA 3E9XA 4ZE9A 3VVFA 3OO9A 4F3PA 4IY6A 3CG1A 3EHTA 1NFTA 2E1SA 4PFTA 3EN3A 1VE4A 4GLIA 4R2FA 5EHSA 1D4NA 4R6KA 5JEIA 4R9FA 2XXQA 3LSWA 3FJ7A 3W9WA 3CFLA 2F7CA 5HPQA 1MQIA 2ESNA 3S9EA 5AA1A 2V25A 3N5LA 2HZKA 1BKAA 3IR1A 4KD5A 2O68A 4FJPA 2P1SA 3L6HA 3O9PA 2CZLA 2NOOA 3GBBA 1LB9A 5ICTA 2G93A 5IKBA 1LLSA 3FASA 3G3HA 5L8DA 2Z8EA 4ZEKA 3PPRA 1LFGA 2HAUA 4YZZA 2B3BA 1IZ1A 1I6AA 1IXIA 3HCQA 3C35A 1LGBC 3V83A 4F39A 1MQJA 1ZKBA 3O28A 2PBWA 3CG3A 3DM0A 3U8QA 3S9NC 3IOUA 3PUZE 3IB1A 3QUJA 4HCWA 2PYYA 4H5GA 2UXAA 4JXIA 4OXVA 3S4UA 4LUBA 1NH7A 1JW1A 3MPKA 3MP8A 4H8IA 3IOTA 4G8HA 3T9HB 2ZYNA 1B5IA 3CSBA 4NF6B 3LC8A 1LCTA 1MH4A 1QKBA 1BIYA 3CRBA 3PMVA 3F11A 1UTHB 3MJNA 4ZEDA 5IAIA 3QSLA 4PQJA 4LVQA 2DWAA 4O3BA 1MXUA 2H25A 4OMBA 4Q8RA 1R9LA 3SEVA 5AA2A 4AQ4A 4ND9A 1Y9UA 4N07A 2A5TB 2ABHA 4BDMA 4ZZAA 3RT6B 2PMSA 2DE4A 5L9SA 1FTMA 3T22A 4JDFA 4QHQA 3TTRA 2I6EA 2NVUB 3PMWA 1R9QA 3OEKA 2F78A 3KFMA 4JWXA 1URGA 1B5HA 4I9DA 1B52A 2ZYOA 4GIZA 2V84A 5AA4A 2YJPA 3T9XB 3H6UA 4OVJA 2Z23A 4X1DA 3IJOB 2UVGA 3C9HA 4H5FA 2OWTA 4NF8B 2F7BA 2XXUA 2AL4A 4GQOA 3N26A 3OEMA 1JNFA 4ZEFA 3TEPA 1H45A 1MXWA 3MZ9A 4U1OA 4DXCA 3IORA 3MPLA 4FAJA 5KCJB 5FHNA 4KR5A 4NMYA 4TOZA 3V89B 4E0WA 2UYEA 1GVCA 3G7WA 4NE4A 4ZEIA 4QFLA 3K4UA 1L5TA 1XVXA 2B65A 2X7PA 4KQPA 5EYFA 4JBZA 2DXRA 4XKQA 2VOZA 2Q88A 5I2NA 3T66A 1D3KA 5AA3A 4FORA 3U1OA 1Q35A 4QSCA 5KDTA 4F31B 4TLMB 3LSXA 2DYXA 1B1XA 1LAFE 3FVKA 1USYE 4G4PA 3VVEA 1FTJA 3H06B 3TFLA 3H6WA 2XXYA 1A99A 1JEUA 4OEVA 2I3VA 3O6GA 5DYHA 2QMWA 2HAVA 3QUFA 3T96B 3K1PA 4MFIA 1MM6A 4OWDA 4P0GA 3RTWB 1M5BA 1SYIA 4QFOA 1MY1A 1OQGA 4R72A 4YMBA 4OETA 3FJMA 4OYVA 4R6HA 4LA9A 1PB8A 4O3CA 4GD5A 4GFRA 4XKRA 4EF2A 2O84X 5K2YA 5HBCA 4KYEA 4OZ9A 2ONKE 4ELRA 1M5DA 3C33A 2CMOA 4OTEA 1YPNA 4EQBA 5TP9A 2QS3A 1LBCA 4NEDA 1SW1A 4MLVA 3SEUA 4RNSA 4NF5A 5I2KA 3H4ZA 1ZMGA 1B3EA 3VLWA 2FA7A 3PUYE 2O1MA 5H8HA 3DP8A 2OCUA 2RCBA 4I1DA 3ILUB 2ONRA 3T9UA 3THIA 1SBPA 1O7TA 4IO2A 3A3UA 1B0LA 2NXOA 2VD2A 3SEXA 2Q9TA 4OEUA 2QJEA 1DTZA 2RCAA 1D9VA 3PV0E 1LCFA 5I59B 5JTYA 4IO6A 3FV2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2OWSA 1K9ZA 5DEXA 3B50A 3CIJA 4Z7EA 1WODA 3MSTA 2I58A 4N81A 2VT5A 4JVCA 4PFYA 5H8FA 4JWYA 4JVDA 3K01A 4PDHA 3PPNA 5L9OA 4JB7A 3IB0A 5EYGA 4G68A 5IGAA 4P56A 4UABA 2F6GA 1Y4CA 3I6VA 3B6TA 3ROJA 3KC1A 3I3VA 1FPKA 1HSEA 5LTCA 4ZDMA 3WAFA 4P47A 3QIMA 1NV3A 4C0RA 4GRKA 3M8UA 4P1EA 1TWYA 1B2HA 1MXVA 4NX1A 3PD8A 1B32A 2DE3A 3EQ1A 3G3IA 1SDXA 3P7IA 3FUZA 3LSLA 1T0KA 4IGRA 3CHGA 3H03A 3ONMA 4EF1A 4HE1A 1A8EA 2O7UA 1FBGA 3B7DA 4KCDA 4IO5A 3MVWA 4DIGA 4NWCA 4WXJA 5ET5A 3CR9A 4F3BA 2MKZA 4YB5A 1OQHA 1QW0A 3RPLA 4KCCA 1BTJA 5TPAB 2H9BA 1UIVA 4GWOA 4I3EA 1ZLQA 1XI6A 5L9MA 3LBSA 2ANJA 3KC0A 4PF6A 2DS9A 2F34A 3PU5A 3BFTA 1IXGA 3PPOA 5IZ3B 3K0VA 2V3QA 2CEYA 2P3NA 4LZ7A 3SKPA 2DOJA 1Q1KA 1LAGE 1YAEA 3U94A 5ISUA 4NN3A 3K6WA 4QFKA 3V8XB 5H8QB 4WEDA 1FSAA 2CZHA 2PT2A 3G3FA 1CE2A 2I48A 5H8NB 3H6VA 1I6BA 4O7MA 1B05A 2DQVA 4KFQA 3TPAA 2XXPA 2DVCA 3MBPA 2AL5A 1NKXA 4QSEA 4LQ2A 4PBQA 4KPTA 5EYHA 2Y7RA 3B6QA 1MY2A 4YKJA 4NF6A 2XX8A 1OIBA 1P1WA 3VXCA 3RTFB 1UTHA 2QL3A 3N6UA 2NUVA 3FXUA 1UTBA 1K9YA 2THIA 3U72A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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