5DYHA

Ti(iv) bound human serum transferrin
Total Genus 188
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
188
sequence length
677
structure length
677
Chain Sequence
DKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAIAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Unusual Synergism of Transferrin and Citrate in the Regulation of Ti(IV) Speciation, Transport, and Toxicity.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Metal transport
molecule keywords Serotransferrin
total genus 188
structure length 677
sequence length 677
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dyhA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dyhA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dyhA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dyhA03
3MP1A 3QUFA 1BKAA 4KD5A 1B1HA 1Y9UA 4F3BA 4MF3A 1FCKA 3TCHA 3SESA 3T9VA 2V3QA 4JB7A 4BDNA 1IXIA 4R6HA 3OEMA 1B7ZA 4G68A 3B6TA 4RPOA 2E1SA 3S9EA 4OEVA 1FQEA 1HSEA 1BP5A 2O51A 2REGA 3TTNA 4OEUA 3UA8A 4H8JA 2GRVA 1GR2A 1Z7ME 4G77A 4C1TA 5JK4A 2DQVA 1QUJA 1VE4A 1Y4TA 1H76A 4OERA 3O97A 4EQBA 1P1OA 5I2NA 1NNKA 3PUWE 4E0WA 1FTJA 1B7HA 3Q27A 4IY6A 4R6KA 5DT6A 4F2OA 2ZNTA 1M5CA 1PBPA 2XXQA 3IB1A 4H65A 1MXWA 5TP9B 2XXTA 2OWTA 2RKMA 3AXFA 2DOJA 3MUQA 4EF2A 3H6WA 2OJTA 1MQIA 4RPNA 4ZEKA 5CM6A 3O6GA 1MQDA 1NH8A 3U93A 1LAGE 2R9JA 3DLNA 4ELPA 1ZTYA 4LZ5A 4ZEDA 1B5JA 1MDQA 4N13A 3D4GA 4ND9A 5CBSA 2Z23A 2RC9A 5DVFA 3OSQA 3RTFB 2DXYA 4ZECA 1B05A 3FJGA 3EPEA 5F1QA 1JEUA 1MDP1 1D4NA 3H4ZA 4Z7EA 3MPLA 2XXRA 4OETA 4NF4A 2BJJX 4LQ2A 4MBPA 3VVEA 3O28A 3G3IA 3SEYA 1RKMA 4R2BA 4F39A 4F3SA 1AOVA 3M3FA 4G2ZA 3IB0A 4GRKA 3RPWA 5IKBA 4M4GA 4U4XA 5EYFA 1NH7A 3MJNA 2G93A 4OMBA 4I62A 2P1SA 1UIVA 4JWXA 1SW2A 3KBRA 2RCAA 3RT8A 4OQOA 3I6VA 4WXJA 3GXAA 2YJPA 4TLMB 1GV8A 1MPDA 2XXUA 1XS5A 4HS7A 2ANJA 4RNSA 4YB7A 3VFJA 2XX8A 4NF6B 3H6TA 4GFRA 3C31A 4KPTA 4Q5TA 3MW0A 5JTYB 4ONYA 4OWDA 3E4RA 2QRYA 3BBRA 5DEXA 3H6VA 2ZMBA 2Q8JA 1URGA 3V83A 3N26A 5ITPA 2OCUA 2F34A 2V25A 2UVHA 2QS3A 4P11A 3IOWA 4FE8A 3JZJA 4KCCA 2QJEA 4F22A 2AIXA 2O7IA 2KLFA 2ONSA 2I49A 4GL0A 4GXAA 4YICA 1N7XA 4IGRA 4X1DA 3SETA 3PMWA 4JWYA 5DVIA 2FA7A 3TTRA 4H8IA 2F36A 3U72A 4ELRA 4YU0A 3K01A 2I0BA 1FQFA 3A3UA 1B0LA 4YAHX 5CMCA 1N84A 2F7CA 4G8MA 1XVYA 3FUZA 4R74A 1LLSA 1R6ZA 2UVIA 3MBPA 4ZDMA 3PPRA 5CMBA 4TQUQ 1YTVA 1JQFA 2XD2A 1L5TA 1FQBA 3G7WA 5H8FA 2I48A 4N6PA 1IZ1A 4WEPA 5I2KB 5AA1A 2DVCA 2ZXTA 1HSLA 2AL5A 1PB8A 2XXHA 2DYXA 4H0WA 4NF6A 3IK6B 2GFEA 4U2RA 4WEDA 4ZS9A 4IO2A 2I0CA 4QRZA 1ELJA 3MP8A 3S4UA 3KJ7A 5I58A 5BUUA 2XX7A 5CMMA 1MM7A 4LP2B 2OLBA 1ANFA 1ZLQA 3VXBA 2OBGA 4O3CA 2CMOA 1B0HA 1BIYA 2RF1A 3TTLA 3U94A 1B40A 3QIMA 2Q2CA 3OO8A 1PB9A 4YB6A 4AB5A 4QFKA 3BFUA 3V8XB 3K4UA 1MY0A 3LSFB 4KHZE 4IY5A 3ECRA 3KEIA 5J1DA 3VE1B 1I6BA 2HXWA 3M8UA 4RK2A 2XXWA 1NNFA 2YPNA 3SDFA 1A8FA 1US4A 2NUVA 2PT2A 3IOTA 4G8HA 2DE4A 2XD3A 5K2XA 1AIVA 1EZ9A 3K2DA 4OYVA 1BTJA 1SDXA 5I2KA 3MZ1A 3S9NC 2PX1A 3WAEA 3MZBA 3S9MC 1UTBB 2OZZA 3ZKLA 1IQ7A 4KYEA 4UA8A 2F7AA 1ZU0A 2ZYOA 4G4PA 4X9TA 3PUYE 1N3WA 3TZAA 1Y20A 2XXPA 3MC2A 5FTIA 3K1MA 1P1UA 3HPIA 4BDMA 1HSJA 4MFIA 4FEDA 3V89B 5AA4A 3MVYA 3W9WA 2I4CA 3FATA 3DP6A 4OFOA 1B3GA 4LATA 2ZNSA 2PT1A 2UVJA 2Z8FA 4XIGQ 3TDJA 4RXLA 5HM4B 4OESA 2DP8A 4Q8RA 5AA2B 3IX1A 3MZ9A 3SEUA 4YMAA 3FGSA 4HTGA 1IITA 1IUDA 2F35A 3OO9A 4H5GA 3SERA 1B32A 5HBCA 3VV5A 3VXCA 4KCDA 1SW1A 3OMBA 2I6EA 3K0VA 3C36A 1I6AA 4C0RA 4OTEA 4NF5A 3N94A 4DCYA 3UN6A 4F19A 1RYOA 1Y1ZA 4F18A 2B3BA 1H44A 4DCXA 3RT6B 3USDA 4DXCA 3IL1B 3KZGA 3B7DA 2V3TA 1JVXA 2R6GE 1EZPA 2F6GA 2F6PA 5ICQA 1S50A 1TT1A 2ONRA 1LBBA 2O1MA 2ONKE 4X1BA 1FQDA 5JTYA 5L8DA 1POY1 1Y1MA 1M5FA 2DXRA 2I3VA 3O2AA 4GD5A 4ECFA 1B1XA 1OMPA 1JEVA 1Y4CA 1S7YA 4I8CA 2Y84A 3ILTB 3OOAA 4RYAA 3CG1A 5FHMA 3VDFA 1JW1A 3K6WA 2H5YA 3QXMA 2P2AA 1XC1A 2HQ0A 3K1NA 3ONMA 3HHGA 3HSTA 4YZZA 4XTCQ 3G3FA 1B6HA 2HCAA 1JETA 4HCWA 4IO5A 4MLVA 3TAJA 5ICTA 2VD2A 2Y7KA 1TFDA 5K2YA 2NOOA 1RYXA 4LZ7A 2B3FA 3R7XA 5ISUA 4NF5B 3PD8A 3D4CA 2O7UA 4ZE9A 4LONB 2DS9A 3OXNA 5TPAA 4H5FA 2PBWA 3TODA 5A5XA 1MY1A 1PEBA 2QMXA 2GH9A 1MY2A 3BKIB 1P99A 5FHNA 4RY1A 4DXUA 1JW4A 3N6TA 3CFZA 5HPQA 1B52A 3OO6A 4FEBA 1EH3A 2B65A 3UK4A 3TELA 1GGGA 4XKRA 1MXZA 1SI1A 1R9QA 2HFBA 1B3FA 3E13X 4IO6A 3RLFE 3TTMA 2Q89A 3PMXA 1PC3A 4LQ5A 5I57A 1F9BA 2H99A 2Z22A 2I3WA 1SW5A 3OD7A 4JSOA 1IXCA 1N3XA 1B5HA 3HV1A 4H67A 1QW0A 3UIFA 3KN7A 3VLWA 4O3AA 1LSTA 2H25A 3O9PA 4KR5A 1M5DA 1MM6A 3CSGA 1P1QA 4EXKA 1FQCA 1OLCA 2Q88A 2D21A 3FJ7A 3T96B 4AQ4A 4QFPA 4PETA 1QJMA 4RK9A 5B7DA 3Q29A 4GIZA 1JVYA 2V84A 5KDTA 1B4HA 1B5IA 3FVOA 4NF4B 1XHYA 2QPQA 4U4SA 1AMFA 3G3JA 5AA4B 4GVOA 1SYHA 3FASA 1MY3A 4H1XA 3EHTA 3TCGA 3I5OA 4MLQA 1ZBMA 1GTKA 2RCBA 2F97A 4PFWA 4QSDA 1SI0A 3V5AA 5CMKA 1N0TA 1I6QA 3KN8A 2D3IA 3FXUA 5KDTB 2M8CA 1N76A 3MQ9A 1MPBA 1QUKA 1MH4A 3KOSA 3PPNA 4LVQA 3T9UA 3N5LA 4PE5B 4DLDA 1WDNA 2PYYA 3QYTA 5L9SA 4OENA 2A5SA 3BFTA 4KQPA 1O7TA 1NKXA 2QS1A 3CI8A 5CBRA 5EHSA 4I1DA 2QS2A 3HCQA 5H8QB 1Q1KA 3G3GA 3RQTA 4EDPA 3LC8A 4ESXA 3H06B 4THIA 2PMSA 3FXRA 5I59A 3PMVA 4U1OA 1OQHA 1TFAA 3ZKKA 4IGTA 2DWAA 3HN0A 3W9VA 4XKPA 1DSNA 3PPOA 3MVXA 4YKIA 1DTZA 5FTHA 4NF8B 1YCJA 3U8QA 4TLLB 5JEIA 4XKQA 4OFJA 3C34A 1MH3A 4ISUA 3S9LC 3CG3A 2I58A 1IEJA 1P1WA 2X7PA 1UTHA 1XOCA 3C33A 2XXYA 1FTLA 2VOZA 3P7IA 3QAXA 1B2HA 1A99A 4FECA 5AA2D 1LB8A 5KCJA 4H6DA 1XT8A 2F78A 4PQJA 5AA2A 4GWOA 2LAOA 3CVGA 3QUJA 4RJZA 1FTKA 1YAEA 5H8QA 3PUVE 3RNNA 2HAUA 1UTHB 2O84X 3RGYA 5ELVA 1UIUA 2I4BA 1WVJA 3SEWA 2Y7IA 1A7LA 3R6UA 1MY4A 2V93A 2DE2A 1MQGA 5CI5A 1A54A 4ZEFA 2X26A 2R71A 1B9JA 2YLNA 2Z8EA 1GVCA 1KWHA 4R6YA 1BLFA 1B3LA 3L6HA 3H3GA 3ZS6A 4DDDA 1Y3NA 1D3KA 2HZLA 4ZZEA 3FJMA 4PP0A 3RN8A 3TQLA 5H8NA 4JXIA 4ELQA 2D5WA 4NF8A 1R1NA 2E0SA 3O6IA 4F3PA 2DWHA 1YPNA 3TCFA 4FAJA 5TP9A 1QKBA 2AL4A 4F3GA 4BDRA 4OZ9A 4KI0E 3DP4A 3KOTA 4GLIA 2F5XA 1OIBA 5TPAB 3RY3A 5I58B 3KSJA 1LCFA 1URSA 3LUYA 1MXYA 3A3CA 5CRYA 5H8NB 2DE3A 1MPCA 4F1VA 1LAXA 1B3EA 1NNPA 1OVBA 3FD3A 4KYSA 1FW0A 4QHQA 4QFLA 4Q0CA 2ESNA 3MVWA 1AH5A 2ZYMA 3QSLA 2XXXA 4IO3A 3UGWA 5DEXB 1DMBA 3TKDA 1SYIA 1N04A 2NVUB 1B58A 1Z7NE 3CR9A 3OENA 3UP9A 2O68A 1JW5A 2A5TB 2AYSA 1R9LA 2DWJA 2ZYNA 3H6UA 3M3KA 4XXUA 1TWYA 4IO4A 3IOUA 4POWA 5FHOA 4HW8A 1LFHA 2CZLA 1SVXB 4R73A 4R9GA 2O1LA 4IO7A 4ESWA 3SEXA 3TUSA 2XXVA 1AL3A 3FZVA 5H8HB 3OO7A 4C1UA 1A40A 2OWSA 3TEPA 2P0SA 1IXHA 3IAZA 1FTOA 1N7WA 1O64A 2A5TA 1MQHA 3IO6A 2NWJA 4OFLA 5F7VA 1MRPA 1LCTA 4WKMA 3DP8A 4IB2A 1LGBC 4NWDA 2UYFA 2XXIA 4YKKA 4FATA 1T0KA 3G3HA 4PFUA 5KZTA 1USYE 1EZOA 1A8EA 3EHUA 5AE4A 3W15C 4YB5A 3ODBA 2XHDA 3C32A 1VR5A 1LFGA 1LB9A 1PB7A 1ZKBA 4PFYA 1B51A 3EQ1A 3IB2A 4KYDA 5A5XB 2O69A 1DPPA 4P0GA 4YMBA 3M3LA 1FTMA 3FV1A 4ZEBA 4EUOA 1LBCA 5M2VA 3Q26A 2UXAA 2X7QA 3FVGA 3PPQA 3FV2A 1DOTA 4G68B 4POXA 1CE2A 2RC8A 4NTLA 4FIMA 4R2FA 3OSRA 3SEVA 5ITOA 4ELOA 1Q35A 1MS7A 1NL5A 2XX9A 1SD3A 2VP1A 5H8HA 1IIWA 2Y7WA 5I56B 4FJPA 5I84A 2HEUA 2VD3A 3K6UA 1QKAA 4JSDA 4OXVA 4RA1A 3CRBA 4JDFA 3TYHA 3K1PA 2RC7A 5LOMA 4GQOA 3HHFA 3C9HA 2H98A 4QF9A 3IOVA 1Y3QA 3KN3A 3PD9A 2DSFA 3T22A 4OVJA 1D9VA 1VSOA 3DELB 2IA4A 1POTA 4NWCA 4R75A 4U22A 3KSXA 3S2VA 3THIA 4F1YA 1NFTA 5KCJB 4E0XA 3U1OA 4GF8A 1UTBA 5AA3A 1UQWA 1P1NA 2F7BA 1ZMGA 3ILUB 4QFNA 1SQYA 2F8DA 2HAVA 1MXUA 4G68C 2FYIA 4R72A 4BDLA 1NNTA 4DZ1A 2GHAA 1QVSA 2QS4A 3H7MA 4GXSB 4EQ9A 1B7UA 1XVXA 3K6VA 4F2QA 3JYRA 3TQWA 1H3DA 1OQGA 4DXBA 5I2NB 3A09A 4BDQA 3L6GA 5TU0A 2ALUA 4O3BA 4LA9A 3GLBA 3TTKA 3TFLA 1ATGA 3DM0A 4K3FA 3K00A 4NE4A 4BDOA 4F31B 3TMGA 4M1VA 3LR1A 1M5BA 4G8NA 4I9DA 4PFTA 3IR1A 4YKJA 3E3KA 3LSWA 3MWBA 3EF7A 3T9XB 1IXGA 2DVZA 5I59B 2QMWA 4GL8A 3IJOB 3ZSFA 3C4MA 3EN3A 2VHAA 1LFIA 3OEKA 1B4ZA 4QSCA 3RUMA 3RTWB 3CFLA 3H03A 2ZNUA 4DIGA 3KFMA 1CB6A 1MG1A 3KGCA 1DTGA 3OELA 1FQAA 3PV0E 4F1UA 3IJXB 2HZKA 3K6XA 3LBSA 5H8FB 2Y7RA 3GZGA 2PVUA 3B6QA 4YKPA 2REJA 2Y7PA 3CIJA 3IORA 1I69A 1SBPA 2H9BA 3QK6A 4L17A 3GBBA 2UVGA 1MXVA 3MAMA 4GOTA 3FIRA 4ZEIA 3SKPA 2ZYKA 3JV9A 3LSLA 3T93B 1URDA 3R26A 4TOZA 5B70A 4DE8A 3K02A 2Z8DA 3T66A 1VFEA 1DPEA 2IEEA 3IO4A 3E9XA 3O66A 1Y3PA 3PGFA 4NEDA 4ZE8A 5I57B 3TPAA 1EU8A 3KG2A 4EXLA 1OLAA 4QSEA 5EHMA 4AB6A 1II5A 1J1NA 1LAHE 3VVFA 4F29A 4JWOA 1OVTA 3O29A 2THIA 3Q25A 3EHSA 2VGQA 3I3VA 3B6WA 4LUBA 3N6UA 3MPKA 1H45A 2OK2A 4Q30B 3Q28A 5DYHA 5L9OA 1USYH 3F11A 1A55A 1S9TA 5I56A 3U92A 1ZIUA 3WAFA 2O6AA 4QFOA 4EF1A 3CFXA 4ZZAA 3C35A 3PPPA 3PUXE 4NMYA 1H43A 1PBQA 5CC2A 3HO7A 2RINA 1VFDA 1QULA 1O63A 1LAFE 4MH5A 1D9YA 1MXXA 4XKNA 3T9HB 3O6HA 4HCYA 1TXFA 5DVJA 4EQ7A 3LSXA 2QL3A 4U1ZA 1MQJA 1B3HA 4X48A 4OHNA 2FNCA 1JNFA 4P0IA 4FORA 2V3UA 3MVZA 1US5A 4N07A 5H8SA 3PU5A 1WODA 2WKYA 3CSBA 3FVNA 3G3KA 4LZ8A 5L9MA 2UYEA 3UORA 2G29A 4R9FA 5DTBA 2GHBA 3VLVA 1SW4A 4U23A 4U21A 2Q9TA 3FVKA 3VLUA 1NMUA 1QUIA 4JBZA 4KFQA 5IAIA 2ABHA 2QSXA 2Q2AA 2NXOA 4BLAA 3MP6A 5BWJA 2H4IA 3GBAA 4Z0IA 2W7YA 1PDAA 1ZJLA 2DWIA 3FXQA 4UACA 3VVDA 1M5EA 3PUZE 3KJTA 1B46A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BKAA 1Y9UA 1G0IA 1FCKA 3TCHA 3SESA 1IXIA 3OEMA 2ZZXA 4G68A 4RPOA 3S9EA 1FQEA 4H8JA 1VE4A 1IMAA 1P1OA 2KR0A 4IY6A 3IB1A 1MXWA 5TP9B 2XXTA 3AXFA 3QMFA 2DOJA 2OJTA 1MQIA 4RPNA 4ZEKA 3O6GA 1MQDA 3U93A 5BWJA 4LZ5A 2Z23A 2DDKA 2DXYA 3EPEA 3VVEA 3O28A 1AOVA 3SEYA 3M3FA 4N6DA 3IB0A 4M4GA 4U4XA 5ET5A 2G93A 4JWXA 3KBRA 1GV8A 4TLMB 2YJPA 4YB7A 4NF6B 4KPTA 4Q5TA 5DEXA 4OA4A 3H6VA 3N26A 4P11A 2L5VA 3JZJA 4F22A 2O7IA 2QVVA 4P1EA 2VT5A 4YAHX 1B0LA 4R74A 2UVIA 3MBPA 4ZDMA 1FBEA 2XD2A 4N6PA 5I2KB 1PB8A 2GFEA 1FRPA 5DW8A 2HXRA 5BUUA 2CEXA 1ZLQA 2OBGA 2CMOA 2Q2CA 4AB5A 2CZHA 3BFUA 4P1LA 3KEIA 5A5LA 3VE1B 1FPJA 1IMCA 4NG7A 3K2DA 4OYVA 1BTJA 5I2KA 3MZBA 4GX4A 3ZKLA 1N3WA 1AWBA 3K1MA 1P1UA 1HSJA 1KA0A 4GWYA 3MVYA 3W9WA 3TDJA 1EYJA 4Q8RA 3IX1A 4YMAA 3FGSA 4HTGA 4PAFA 4KCDA 4GX3A 2I6EA 3K0VA 1FSAA 4C0RA 4NF5A 3N94A 2FIXA 4DCXA 4DXCA 3U65A 2R6GE 1TT1A 5JTYA 3B8BA 5L8DA 1Y1MA 1M5FA 2DXRA 2I3VA 2P3VA 1B1XA 4P8BA 5FHMA 3VDFA 3CG1A 1JW1A 4YZZA 3TAJA 3G3FA 4IO5A 3D4CA 3OXNA 4JVDA 4H5FA 5IZ3B 1MY1A 1PEBA 2GH9A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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