2DE3A

Crystal structure of dszb c27s mutant in complex with 2'-hydroxybiphenyl-2-sulfinic acid
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
344
structure length
344
Chain Sequence
DTLTYSNSPVPNALLTASESGFLDAAGIELDVLSGQQGTVHFTYDQPAYTRFGGEIPPLLSEGLRAPGRTRLLGITPLLGRQGFFVRDDSPITAAADLAGRRIGVSASAIRILRGQLGDYLELDPWRQTLVALGSWEARALLHTLEHGELGVDDVELVPISSPGVDVPAEQLEESATVKGADLFPDVARGQAAVLASGDVDALYSWLPWAGELQATGARPVVDLGLDERNAYASVWTVSSGLVRQRPGLVQRLVDAAVDAGLWARDHSDAVTSLHAANLGVSTGAVGQGFGADFQQRLVPRLDHDALALLERTQQFLLTNNLLQEPVALDQWAAPEFLNNSLNR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords DIBENZOTHIOPHENE DESULFURIZATION ENZYME B
publication title Crystal structure and desulfurization mechanism of 2'-hydroxybiphenyl-2-sulfinic acid desulfinase.
pubmed doi rcsb
source organism Rhodococcus sp.
molecule tags Hydrolase
total genus 118
structure length 344
sequence length 344
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.13.1.3: 2'-hydroxybiphenyl-2-sulfinate desulfinase.
pdb deposition date 2006-02-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2de3A01
3.40.190.270 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 2de3A02
1PC3A 4BDNA 3EF7A 4ZEKA 1MM6A 1GGGA 2F36A 5H8QA 2F35A 4H6DA 4QFPA 2XX8A 1CE2A 1M5BA 1UTHA 2QS4A 3KZGA 4ZECA 1ZTYA 4YZZA 1Q1KA 4UACA 1Y20A 4X48A 1Y3PA 4OWDA 4BLAA 2H9BA 4NF6B 1IITA 3KSJA 4NF5B 4TQUQ 5FHOA 4JWYA 4C1UA 3UORA 2VP1A 4GL0A 3VLWA 5BWJA 3MPKA 4NWDA 1NNTA 3TTKA 3O6IA 4EQ9A 1IXHA 3LBSA 3FV2A 4GOTA 1LFIA 4OFJA 2XXWA 3IR1A 4C1TA 4OVJA 2DVZA 1VR5A 3M3LA 1ELJA 2PYYA 1URSA 2I4CA 4XKQA 3OD7A 4R9FA 3FJ7A 4KQPA 3QAXA 2KLFA 2NWJA 4AB6A 1MH4A 4RXLA 2QPQA 4ZZAA 2RF1A 1SD3A 1UIUA 1UTBA 1MXXA 1US4A 4RK2A 1P1OA 5LOMA 4FATA 3DLNA 2FNCA 3K01A 3IOWA 1LLSA 5CMCA 3SEUA 3BFTA 3B6WA 5ISUA 4G68C 3TPAA 4ZE9A 3GBBA 2RKMA 4AQ4A 4KFQA 4KCCA 2I4BA 3IB0A 3USDA 3HCQA 4OMBA 2V93A 2ONSA 3PPPA 3SETA 4KYDA 4ZEBA 1GVCA 5BUUA 5I2NA 3O2AA 3S4UA 3UGWA 3E3KA 1SYIA 3QSLA 4JWOA 2ANJA 1R6ZA 2OCUA 1EZPA 3O28A 1JEUA 3OO9A 2V25A 3OELA 1ZMGA 3THIA 2RC7A 1PB9A 3Q25A 2Q2CA 1MY1A 2F5XA 3RT8A 4R6KA 1N3XA 4IB2A 3KBRA 2E0SA 3MQ9A 3SEWA 5JEIA 4FIMA 2QJEA 1IQ7A 5DVIA 3UK4A 4DE8A 2OWTA 2QMXA 5FHMA 3ILTB 1FW0A 2O1MA 2XXHA 3CIJA 4QFLA 4LQ5A 5EYFA 4OEUA 1LCFA 2UXAA 2P0SA 3RTFB 4OENA 1B7UA 1EZOA 3VXBA 2Y7KA 1XC1A 3D4CA 3SEYA 1YAEA 3WAFA 2O7IA 4QSCA 1II5A 2VD2A 3QXMA 1F9BA 2DS9A 1B3EA 3N94A 4X1BA 2A5TB 3K6WA 1OLAA 5KDTA 3E4RA 3KG2A 4YMAA 5CMKA 1PBPA 3ODBA 1NH7A 2NUVA 3IO6A 2ZYKA 5H8NB 3TELA 2F7BA 4GFRA 3H4ZA 1WVJA 4QHQA 3VXCA 3C33A 1TFAA 4PP0A 4ESWA 1YTVA 5L9MA 4N6PA 3H6TA 1B6HA 1D9VA 3EPEA 3MUQA 4P0IA 4PFYA 5CRYA 4DXUA 1N7XA 5DT6A 5TU0A 1N84A 4WKMA 1H44A 2IA4A 3C9HA 3OOAA 1US5A 3OEKA 4Z0IA 5JK4A 5I59A 3M3KA 2R9JA 1QVSA 4G2ZA 3A3CA 4OESA 1BLFA 1B5IA 1B52A 1OQHA 2QRYA 4JWXA 1YCJA 3OSQA 4DIGA 3SERA 4QSEA 1M5EA 1BKAA 2UYFA 5AA1A 2V3UA 2F34A 3H7MA 1PB7A 1A8EA 2YJPA 5AE4A 1EH3A 2VOZA 4O3AA 5KZTA 5AA2D 4F22A 1B9JA 3EHTA 4PFUA 5H8FB 4RA1A 1MPCA 1AIVA 1B3HA 1B1XA 2GHAA 2ONKE 5JTYA 2XXTA 3O66A 4EXKA 3K6UA 4H1XA 4LA9A 3TODA 3O6HA 4IO3A 5CBSA 4JDFA 2XXVA 3I6VA 1R1NA 2RCBA 3PMVA 3KJ7A 3RY3A 5FHNA 2P1SA 3PUYE 2XHDA 2GFEA 2CZLA 3O97A 2PVUA 4U1OA 2I49A 1ZLQA 3M8UA 3T93B 5KCJB 1FQFA 5I56B 2VHAA 2ZYMA 2RC9A 3W9WA 5A5XA 4YKIA 3PUZE 4H8JA 3HHFA 2F6PA 1N7WA 3S9LC 4IGRA 1P1QA 1DMBA 3PV0E 1Y4TA 3U93A 4NF8A 3S9EA 3GXAA 4OHNA 3N6UA 1BIYA 2I0CA 2V84A 2XXRA 4C0RA 4TOZA 2Q89A 1SYHA 2B3BA 2GH9A 4F18A 2DE2A 2F7AA 1B40A 2PX1A 3U94A 4E0WA 4Q0CA 2OBGA 3H6UA 1MPDA 4F3BA 1B1HA 1MQHA 5EHSA 1Y1ZA 1MG1A 4GIZA 3IL1B 1FQCA 4LZ7A 3FVGA 5L9OA 3U72A 2D21A 1B58A 4FEDA 4M4GA 5DYHA 4H67A 3QYTA 1B7HA 2HXWA 5IAIA 4LVQA 2Z8EA 3IK6B 5CMBA 2E1SA 1RYOA 1POY1 3C4MA 2O68A 3KN3A 3IOTA 3OO7A 4Q8RA 3IB2A 1RKMA 3FVNA 1LBBA 4HCYA 4H5GA 3SDFA 4QFOA 2NXOA 5I84A 2XXUA 2O6AA 5B7DA 3CR9A 2DWHA 5H8HA 1JVYA 4ZDMA 5AA2A 3FUZA 3MC2A 2XXPA 4KYSA 3BKIB 3HN0A 1LFGA 3K1NA 4OZ9A 2GRVA 3G3IA 4IO4A 3K1PA 2O84X 5H8QB 1N04A 5F7VA 1A55A 1A7LA 4MLQA 4ELOA 4G77A 4FORA 4I9DA 1GR2A 3MZ9A 3ZKKA 2HAVA 3H06B 4F39A 3N5LA 1GV8A 2I48A 4F29A 4H65A 1N76A 3U8QA 2QS2A 4EQBA 3IOVA 2O51A 2DE3A 3FD3A 3JV9A 2HCAA 4ONYA 2PBWA 4NTLA 4OFOA 4PFWA 5L9SA 1AMFA 4K3FA 1NKXA 1MY4A 2DWIA 2Z8DA 2XXQA 1SW5A 2X7PA 4NF6A 1MQJA 3PMWA 1OQGA 3CVGA 3LSXA 3PD9A 3ILUB 4RJZA 4BDOA 1B51A 4OXVA 1VSOA 3BFUA 3TCHA 1USYH 2I3VA 4XXUA 3CSGA 2XXYA 4RY1A 2HEUA 3R6UA 3LC8A 4I62A 4ELPA 3PPOA 5FTHA 4DXCA 3SEXA 3L6GA 4LUBA 2YLNA 2G93A 1O63A 3PU5A 4KD5A 3S9NC 3T9UA 3K0VA 1LAGE 4E0XA 5TPAB 4YU0A 3UP9A 4G8HA 1XHYA 4LP2B 3O29A 1P99A 4LZ5A 4BDLA 2ZNUA 3CI8A 3MWBA 2H5YA 1B32A 1A40A 1MS7A 3QUJA 1OIBA 2XXIA 4NEDA 1AH5A 1FQBA 3A09A 5CC2A 3CFZA 1NNKA 3IX1A 3MZ1A 2ZNSA 3MVWA 1D9YA 1SI1A 2QSXA 5AA4A 3KGCA 4GWOA 4O3BA 3TKDA 3U92A 4OQOA 4U1ZA 4EF2A 5M2VA 2FA7A 2UVIA 1B4ZA 4R9GA 4QRZA 3O6GA 4G8NA 4G68A 3TTNA 4OEVA 3VVEA 1M5FA 1NH8A 4TLLB 4ELQA 1Y1MA 2I3WA 4MBPA 1H76A 4QF9A 4THIA 1XOCA 2VD3A 4OYVA 1IXIA 5DTBA 2QL3A 2HZLA 4P11A 2DXRA 1ZJLA 1LSTA 1L5TA 4MFIA 1QKAA 3OXNA 4DCXA 3EQ1A 4F1YA 1S50A 3K02A 5KDTB 3FXQA 4EF1A 4GL8A 3N6TA 1MDQA 4JXIA 1CB6A 2V3TA 2X26A 2F97A 4I1DA 2H98A 1RYXA 2Q8JA 3C32A 4JSDA 4LZ8A 3DM0A 1AOVA 1PB8A 1T0KA 2A5TA 2YPNA 1Z7NE 3RGYA 4IO2A 3W9VA 3DP4A 4H5FA 3CG3A 1D4NA 2ZNTA 4R75A 3TFLA 1FQDA 2UVJA 4XKPA 3VFJA 1DPEA 1ZBMA 4YMBA 1Q35A 5I58B 4BDMA 2H4IA 3IO4A 4N07A 1Y4CA 4ELRA 1DTGA 1LAXA 3HSTA 1LAFE 3G3FA 5IKBA 2AL5A 1H45A 3EHSA 3VV5A 1JETA 4BDRA 3TTMA 1MXZA 2H25A 4F19A 3OMBA 3RN8A 5DVFA 1XVXA 3ZSFA 3V8XB 4YKKA 2AL4A 2F7CA 3E9XA 5CMMA 2ESNA 1SDXA 1LB8A 4IO6A 4F2QA 1Y3QA 2Y84A 3W15C 3B6TA 3LSLA 1OVBA 4RK9A 4OTEA 2OWSA 5HBCA 3G3JA 1KWHA 3UIFA 5H8FA 4ZS9A 3MW0A 4PFTA 1A54A 3MZBA 1LB9A 1I6QA 4AB5A 3VE1B 1MY0A 4G8MA 2F8DA 3FV1A 1TFDA 4NF4B 5ITPA 5A5XB 4KYEA 1Z7ME 1MQDA 1S9TA 1P1WA 3TEPA 3TTLA 3RUMA 2ONRA 1FTKA 3G3HA 4GXSB 5I2KB 1USYE 4GF8A 1SW1A 5ICQA 1B0HA 4NF8B 4HTGA 2I6EA 3M3FA 1MH3A 1SBPA 2Y7IA 1IIWA 4PETA 1JW1A 3IORA 4JBZA 4H0WA 1R9LA 2QS1A 1ANFA 3RLFE 4NE4A 1NNFA 3H3GA 1WDNA 4GD5A 4EXLA 3UA8A 1B7ZA 1B0LA 4IY6A 3T9VA 4F3SA 4HCWA 4GRKA 1B46A 2UVHA 3VLVA 5I57B 3PUWE 1QW0A 3KSXA 3PUVE 1ZIUA 4EQ7A 3H6WA 1JW5A 3WAEA 2B65A 3E13X 3GLBA 4RYAA 1AL3A 4FJPA 1P1NA 2ALUA 3DP6A 2Z22A 1IEJA 5HM4B 5DEXB 2Y7PA 3Q27A 1P1UA 5CI5A 1DPPA 5H8SA 2O1LA 2LAOA 3IB1A 3QK6A 1QJMA 1ATGA 3FIRA 3G3GA 2ZXTA 1EZ9A 3EHUA 3CRBA 3K1MA 3HV1A 1O7TA 3K2DA 1OVTA 4H8IA 3TTRA 2HZKA 4U22A 4F2OA 5TP9A 2XD2A 3FASA 4GQOA 3RT6B 3MP1A 2XD3A 3TZAA 1VFEA 1UTHB 2V3QA 4U23A 1LGBC 3I3VA 4F1UA 3PPNA 4QFKA 2VGQA 1URDA 3P7IA 1FTMA 3PPQA 2PT1A 3R26A 2PT2A 2F6GA 3TQLA 3FJGA 1YPNA 2ZYOA 3TCGA 5DVJA 2XX7A 3LSFB 2D3IA 4EDPA 5EHMA 4R2FA 1JVXA 2WKYA 4YB6A 1JQFA 3CG1A 1N0TA 1URGA 1LCTA 4NWCA 1OMPA 1B3GA 3KOTA 3FGSA 5ICTA 3MBPA 1DOTA 5ELVA 3KFMA 1FQAA 2QS3A 4NF5A 4L17A 1M5DA 3IJXB 4G4PA 3MJNA 3MVYA 3KN8A 3MP8A 1FQEA 1A99A 4YB5A 1Y3NA 4ISUA 2OLBA 1H3DA 2DXYA 2RC8A 4Q5TA 4F3GA 1UTBB 3L6HA 2Y7WA 1B05A 1MM7A 4KCDA 3T22A 4MLVA 2ZMBA 3IAZA 3TCFA 2REJA 3S9MC 4R6HA 3VDFA 3T9XB 4YB7A 1LFHA 4O3CA 4POWA 3U1OA 1MY3A 1MRPA 3H6VA 4XTCQ 3T9HB 4XKRA 4R72A 1PDAA 1UQWA 4MH5A 2P2AA 3N26A 3PMXA 4R74A 3GBAA 4FE8A 5I2NB 1GTKA 3FATA 1J1NA 1FTOA 3FXRA 1JW4A 1SVXB 2OJTA 3K00A 3OO6A 2HFBA 1MDP1 5TPAA 4ND9A 2W7YA 4UA8A 2UYEA 1DTZA 4HS7A 1BTJA 1VE4A 2HQ0A 4ZEDA 2XXXA 1IXGA 3LR1A 1Y9UA 4I8CA 4F3PA 4U21A 4DZ1A 2NOOA 1B5HA 2DVCA 1MXWA 5AA4B 1QUJA 4LONB 3LSWA 3G7WA 4YKPA 3RNNA 4KHZE 4XKNA 2XX9A 3OSRA 2IEEA 3S2VA 4FAJA 3FVKA 4YAHX 3V89B 5ITOA 3MVXA 4KPTA 1PEBA 4G68B 3KJTA 2O7UA 4IGTA 1QULA 3ZKLA 2GHBA 4Z7EA 2AIXA 1MXYA 1XS5A 4OFLA 1I6AA 3HPIA 1TWYA 2QMWA 2ABHA 3A3UA 3RPWA 2I58A 3AXFA 4F1VA 5J1DA 2Z23A 2I0BA 3KN7A 3Q28A 3TUSA 1JEVA 4R73A 3ECRA 1B5JA 4FECA 3C34A 2DSFA 3R7XA 5L8DA 3T66A 3MAMA 4QSDA 1I6BA 3RTWB 1N3WA 3OO8A 3TAJA 3V83A 1H43A 1NL5A 1QKBA 3OEMA 3ZS6A 4OERA 3BBRA 2H99A 3HHGA 2NVUB 4ZEIA 4RPNA 3SEVA 4ESXA 3QUFA 1O64A 3KEIA 1EU8A 1MQIA 1VFDA 3RQTA 2BJJX 4WEDA 3FXUA 2AYSA 4PQJA 1POTA 1MPBA 2DWAA 5H8NA 5I59B 1NNPA 1IUDA 2OK2A 1B3LA 3K6VA 1JNFA 4GLIA 3MP6A 2THIA 3Q29A 3IOUA 4POXA 1B2HA 5K2XA 2G29A 5FTIA 1QUKA 2Q88A 3EN3A 4R6YA 4GVOA 4R2BA 3T96B 4IO5A 3PPRA 2F78A 3OENA 1ZU0A 2RCAA 4ZZEA 3LUYA 3TYHA 1R9QA 3CFXA 4PE5B 2DWJA 3H03A 4JB7A 5I58A 4KR5A 1NMUA 1SI0A 1NFTA 5JTYB 1S7YA 5HPQA 4F31B 1XT8A 4U4SA 1MQGA 2OZZA 3B6QA 1D3KA 1B3FA 3K6XA 3KOSA 4KI0E 4OETA 2Q2AA 1LAHE 1M5CA 2R6GE 1OLCA 3CFLA 3D4GA 1WODA 2FYIA 3MVZA 4IO7A 3CSBA 3TDJA 1B4HA 1FTLA 4DCYA 3HO7A 3Q26A 1IXCA 1SW2A 3PD8A 3DELB 1MXUA 3VVDA 2REGA 3GZGA 3PUXE 3G3KA 4DDDA 3QIMA 2X7QA 2O69A 3DP8A 3C35A 3TMGA 1PBQA 3F11A 2CMOA 3O9PA 4DXBA 5F1QA 5CM6A 4X9TA 2UVGA 4YKJA 4N13A 4DLDA 3FZVA 2D5WA 1HSJA 2DP8A 3C31A 4ZEFA 1LBCA 1A8FA 4NF4A 2B3FA 5KCJA 3JYRA 5I56A 4BDQA 3VVFA 2HAUA 5CBRA 1UIVA 1SW4A 1ZKBA 5I2KA 1IZ1A 1HSLA 4LATA 2ZYNA 1MY2A 4WXJA 2RINA 3K4UA 2Y7RA 1XVYA 1MXVA 2Z8FA 2M8CA 4XIGQ 2A5SA 3FJMA 1FCKA 2Q9TA 2DE4A 3B7DA 3I5OA 3V5AA 4LQ2A 3PGFA 4EUOA 4U4XA 4IY5A 4MF3A 4FEBA 4P0GA 1TT1A 3MPLA 4ECFA 4NMYA 2DYXA 3VLUA 4U2RA 4RPOA 1QUIA 4YICA 1SQYA 4Q30B 3SESA 4HW8A 2PMSA 5I57A 4ZE8A 3C36A 1TXFA 5K2YA 5H8HB 5B70A 3JZJA 5AA2B 3IJOB 4TLMB 3ONMA 5AA3A 2DQVA 5DEXA 5TP9B 3UN6A 4QFNA 1DSNA 4GXAA 1BP5A 3SKPA 4M1VA 2DOJA 3FVOA 4JSOA 1FTJA 1I69A 1HSEA 4X1DA 2R71A 4RNSA 3TQWA 4WEPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1PC3A 1NV2A 4BDNA 3EF7A 4ZEKA 1MM6A 3IFCA 1GGGA 2F36A 1FPBA 5H8QA 2F35A 4H6DA 4QFPA 2XX8A 1CE2A 1M5BA 1UTHA 4GBWA 2QS4A 3KZGA 1KZ8A 4ZECA 1ZTYA 4YZZA 1Q1KA 4UACA 4OVRA 4I3YA 4GX3A 2CZKA 1Y20A 4P47A 4X48A 1Y3PA 4OWDA 4BLAA 2H9BA 4NF6B 1IITA 1INPA 3KSJA 4NF5B 4TQUQ 1IMCA 1FBPA 5FHOA 4JWYA 4C1UA 4XFEA 3UORA 2VP1A 4QBAA 4GL0A 3VLWA 2VPOA 2V4CA 5BWJA 3MPKA 4NWDA 1NNTA 3TTKA 3O6IA 4EQ9A 1IXHA 3LBSA 3FV2A 4GOTA 1IMEA 1LFIA 4OFJA 4AS4A 2XXWA 3IR1A 4C1TA 4OVJA 2DVZA 1VR5A 1RDYA 3M3LA 1ELJA 2PYYA 1URSA 2FVZA 2I4CA 3QMFA 4XKQA 4OVPA 3OD7A 4R9FA 3FJ7A 2XWVA 4KQPA 4MHFA 1EYJA 3QAXA 2KLFA 1EYKA 2NWJA 4AB6A 1MH4A 4RXLA 2HXRA 4ZZAA 2RF1A 1SD3A 1UIUA 1UTBA 1FBHA 1MXXA 1US4A 4RK2A 5ET5A 1P1OA 5LOMA 4FATA 3DLNA 2FNCA 3K01A 3IOWA 1LBYA 1LLSA 5CMCA 3SEUA 3BFTA 3B6WA 5ISUA 4G68C 3TPAA 4ZE9A 2HHMA 3GBBA 2RKMA 4AQ4A 4KFQA 4KCCA 2I4BA 3IB0A 3USDA 3HCQA 1K9ZA 4OMBA 2V93A 2ONSA 3PPPA 3SETA 4KYDA 4PE3A 4ZEBA 1GVCA 5BUUA 5I2NA 3O2AA 3S4UA 3UGWA 3E3KA 1SYIA 2MKZA 3QSLA 4JWOA 2ANJA 1R6ZA 2OCUA 1EZPA 3O28A 1JEUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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