2DE3A

Crystal structure of dszb c27s mutant in complex with 2'-hydroxybiphenyl-2-sulfinic acid
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
344
structure length
344
Chain Sequence
DTLTYSNSPVPNALLTASESGFLDAAGIELDVLSGQQGTVHFTYDQPAYTRFGGEIPPLLSEGLRAPGRTRLLGITPLLGRQGFFVRDDSPITAAADLAGRRIGVSASAIRILRGQLGDYLELDPWRQTLVALGSWEARALLHTLEHGELGVDDVELVPISSPGVDVPAEQLEESATVKGADLFPDVARGQAAVLASGDVDALYSWLPWAGELQATGARPVVDLGLDERNAYASVWTVSSGLVRQRPGLVQRLVDAAVDAGLWARDHSDAVTSLHAANLGVSTGAVGQGFGADFQQRLVPRLDHDALALLERTQQFLLTNNLLQEPVALDQWAAPEFLNNSLNR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords DIBENZOTHIOPHENE DESULFURIZATION ENZYME B
publication title Crystal structure and desulfurization mechanism of 2'-hydroxybiphenyl-2-sulfinic acid desulfinase.
pubmed doi rcsb
source organism Rhodococcus sp.
total genus 118
structure length 344
sequence length 344
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.13.1.3: 2'-hydroxybiphenyl-2-sulfinate desulfinase.
pdb deposition date 2006-02-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2de3A01
3.40.190.270 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 2de3A02
1B7UA 2PMSA 1YTVA 3FV1A 1M5FA 1QUJA 2UVHA 1VE4A 3S9MC 3CR9A 1Y1MA 4KYSA 1AOVA 1R9LA 3VLVA 4YMAA 3PUVE 1UQWA 3SESA 4KQPA 2RCBA 2DWAA 1UTHA 2V3TA 4DXBA 1ANFA 3C32A 2A5TA 4H0WA 1QUKA 2QS2A 4OTEA 1MPBA 1J1NA 5FHNA 1FQDA 3K4UA 4OFJA 1ELJA 1XVXA 4H5FA 4KFQA 2F36A 3OMBA 4EXKA 1Y4TA 2QS3A 3TCHA 1QULA 2GHAA 1PDAA 4IGRA 3H6UA 1B51A 1B32A 3L6HA 3RNNA 2I49A 3OEMA 3K00A 1M5CA 2O69A 4HTGA 3MUQA 5TPAB 5I56A 4OQOA 1B5IA 1NNKA 1NL5A 1B7ZA 4Q8RA 2XXHA 4ISUA 3R26A 4AQ4A 3H06B 4GFRA 3HO7A 4F39A 1VFEA 1N7XA 1VSOA 2O1MA 1IUDA 5AA2B 3G3JA 2XX7A 4G8MA 3FXUA 5H8QA 1FQFA 5ELVA 3OXNA 4LZ7A 4GIZA 1ZJLA 3FXQA 1Z7ME 1FCKA 3U8QA 4GXSB 2XXPA 4OVJA 1AL3A 1PBPA 3A3UA 1SI1A 5DYHA 4BDLA 2XXQA 1MQHA 3U92A 2DS9A 3TTLA 4QFLA 3SETA 3SEWA 1R9QA 2ALUA 1A40A 1B3EA 1D9VA 1M5DA 3JYRA 3RPWA 1SYHA 4PP0A 4YZZA 3B6WA 4F3GA 3O28A 2HAVA 2DWJA 4GVOA 5I59B 2KLFA 4P0IA 4ECFA 2XD3A 4E0WA 5IAIA 2DP8A 2RINA 3PMWA 1S50A 5I56B 5EHMA 1N84A 2ZNUA 2XX8A 3GZGA 3M3LA 4U22A 4LATA 3U93A 3PUZE 5ICQA 3TUSA 3K1MA 2DSFA 1OIBA 2OLBA 1MXYA 2CMOA 1QUIA 4OESA 4QSDA 2GFEA 2HZLA 3DLNA 4R9FA 5H8QB 1I69A 4N07A 2DVCA 3G3KA 4NF6A 1R6ZA 5A5XA 3ECRA 3UN6A 4NF8B 4NWCA 1A7LA 1OVTA 2F7AA 3PPNA 4NTLA 2GRVA 5DVFA 4F1VA 1PEBA 3MBPA 3OO9A 3IOUA 1IXCA 1IXGA 5FTIA 4Z0IA 4NEDA 4DDDA 2Z8DA 2UVJA 4OYVA 1LSTA 1VFDA 3PD8A 3TPAA 2UVIA 5FHOA 1H43A 5AA4B 3PPOA 3ZS6A 4F3PA 4IO7A 4RK2A 3EF7A 3T66A 3FJGA 1MXVA 4IO6A 3IJXB 3UA8A 2ABHA 4DXUA 1RYOA 1P99A 2Q88A 1MY4A 2VD3A 4X1DA 2R71A 2Q8JA 4IGTA 3UGWA 1B3LA 4ELQA 4LZ5A 5DEXB 2HXWA 5CI5A 4X1BA 3KFMA 2XXIA 1H45A 3OO8A 2H99A 4KPTA 2IA4A 5CBSA 4F29A 3IB2A 3VXBA 4DE8A 3H6WA 4LONB 2I0CA 2O51A 4I8CA 3KGCA 4G68C 2RC8A 5ITPA 4FJPA 3KZGA 1MQIA 4DIGA 2R6GE 1UIVA 3IK6B 1MY1A 2O84X 2FYIA 4QSEA 3E4RA 2F8DA 3B6QA 4NF5A 3C34A 5JTYB 3MP1A 2VP1A 3PUYE 5A5XB 3BKIB 1B58A 4POWA 5LOMA 1PB8A 1WODA 4PFWA 3FATA 4GL0A 1MQDA 4F1UA 3MW0A 4PFYA 1JNFA 3ILUB 2ZNTA 4HCWA 1YAEA 1XVYA 4OENA 5TP9A 4YKPA 4ZECA 3OO6A 4ZE8A 5CMMA 1IQ7A 5DTBA 4IO4A 5CC2A 2NWJA 3DP8A 1URDA 4MLVA 3IOTA 1JVXA 4OMBA 4ESWA 1XT8A 3Q25A 2HZKA 1H3DA 2BJJX 2V3UA 2DQVA 4YKKA 4JWYA 5CMBA 4X48A 3W15C 4GWOA 4EF1A 1ATGA 1N3XA 1B3GA 2X7PA 3ODBA 1RYXA 3TTMA 4BLAA 2OWTA 1LFIA 2H4IA 1OQHA 4ZEBA 1SBPA 1A8FA 3EQ1A 3QIMA 4OWDA 5DVIA 1B6HA 3OENA 3SEVA 3SEYA 2AYSA 3M8UA 3N94A 1MM7A 2I6EA 2Y84A 3IB0A 2QMWA 3HHGA 3RGYA 4EF2A 3CFZA 3O6IA 1UTBA 3CG1A 2F35A 4NF5B 3B7DA 1LAXA 1MPDA 2F6PA 4NF4B 4KCCA 1D3KA 1JETA 3N6UA 1SQYA 1US5A 5CRYA 1XS5A 4FE8A 3UK4A 4QHQA 2QS1A 2VD2A 1DTZA 2O7UA 4C0RA 1HSLA 3R7XA 2DYXA 2ZYMA 3T22A 3MJNA 4QFOA 4DXCA 3UORA 3LSXA 1Q1KA 3N5LA 2QS4A 2HFBA 5TP9B 3OSQA 2DWHA 4UACA 5KDTA 5H8FB 2B3BA 2Q9TA 4H8IA 2Y7IA 4XTCQ 2XHDA 5AA1A 4XXUA 4F22A 3GLBA 3TEPA 5EYFA 3Q27A 3LSLA 2Y7KA 2ZYKA 4ND9A 5KCJA 1LCTA 2D5WA 3MVZA 3VXCA 4PE5B 2AIXA 3T9XB 2ONKE 3RY3A 5CMCA 3KOTA 2ZXTA 1AMFA 2E1SA 3C33A 1B46A 2VGQA 4GD5A 1POTA 3TODA 3O66A 4H5GA 3S4UA 4YB7A 3I5OA 3LC8A 1JVYA 2RF1A 3LSFB 3MZ1A 3RTFB 2I58A 4OXVA 1T0KA 1EZPA 3T9VA 5CMKA 1FQEA 1PB7A 2UYFA 1UTBB 2D3IA 1MQGA 1ZLQA 1PB9A 3TMGA 4ELPA 4LZ8A 1NKXA 4YB6A 4JSDA 2OK2A 4R6KA 1OVBA 4FIMA 3Q29A 1B3HA 3K1PA 1XOCA 4ZEIA 2OCUA 5B70A 3CRBA 3FJMA 3PUWE 4YKIA 4H8JA 3OELA 2OJTA 2RC7A 2H25A 4KYDA 3FJ7A 1A54A 2RC9A 4TLMB 4ZEFA 4QSCA 3U94A 5HM4B 3H6TA 2LAOA 1SW5A 3H6VA 2PVUA 3LSWA 4F2OA 5KDTB 3PMXA 3PPQA 3O2AA 4IB2A 3TTRA 1B5HA 5FHMA 1ZIUA 4OFOA 1DSNA 1BP5A 3W9VA 3MQ9A 4HS7A 1GVCA 4ZZEA 4G8HA 4EDPA 1ZMGA 5BUUA 3A3CA 1UTHB 1XC1A 5KCJB 1P1QA 5M2VA 1DOTA 2A5TB 2D21A 1B0HA 2O1LA 2UVGA 4M4GA 5JEIA 3MC2A 2CZLA 2ONRA 3PPPA 5EHSA 4LQ2A 1MS7A 3IR1A 4KD5A 4OEVA 2GHBA 2DWIA 2THIA 4U1ZA 4MBPA 1DPEA 2PT2A 3IOWA 3FD3A 4WXJA 2I3WA 1QKBA 3QSLA 2NXOA 4HW8A 5I2KA 3C9HA 1IEJA 3S9EA 1FTKA 4OFLA 2PT1A 5I58A 5ITOA 5HPQA 3KOSA 4GXAA 1MY3A 3QK6A 3C35A 1B05A 2H5YA 2Z8FA 1QW0A 2AL5A 1ZU0A 4Q30B 4R9GA 3VV5A 3VVFA 3DP6A 1A8EA 1D4NA 1LB9A 4H67A 3ONMA 4BDQA 2XD2A 4UA8A 3KEIA 3FV2A 1MQJA 2IEEA 1B3FA 1JW4A 1SW2A 3PMVA 3KJTA 4RPNA 1AIVA 3PU5A 1LBCA 4U2RA 4LP2B 3E9XA 1OLCA 4M1VA 3O9PA 1B1XA 3OSRA 2XXUA 2DVZA 4IO2A 4U4SA 2UYEA 3TELA 4WKMA 2NVUB 2REJA 1WDNA 1MDQA 3VVDA 4EXLA 4FATA 4PFTA 3K1NA 1O64A 3H03A 3UIFA 4F31B 2YJPA 4AB6A 5K2YA 2ZMBA 1MDP1 3A09A 1MXXA 2PX1A 5HBCA 4NMYA 4BDMA 2VOZA 3TKDA 4ZEKA 3U72A 1ZTYA 3V5AA 1LAGE 3FIRA 3S2VA 4C1TA 1IXHA 2FNCA 3QYTA 1MPCA 1TFAA 1TWYA 5I2KB 4F18A 4FAJA 3B6TA 3DELB 2V3QA 1B52A 1H44A 4ZZAA 2B3FA 5L9OA 1EU8A 3LBSA 1SW1A 3T96B 2VHAA 3THIA 1SI0A 4JBZA 2AL4A 4ZEDA 2Y7WA 1LFHA 2F5XA 4R73A 1II5A 3FVGA 3JV9A 1Y9UA 3KN7A 4K3FA 1IIWA 4NF6B 1SDXA 3ILTB 3IO4A 1B0LA 1YPNA 2XXTA 4F1YA 4KHZE 1LAFE 1LLSA 3IORA 3P7IA 4YAHX 1MRPA 3ZSFA 3MVXA 4OHNA 1PBQA 1HSJA 1GTKA 1Y4CA 5TU0A 3VFJA 3PGFA 1MXWA 5AE4A 3K6VA 3OO7A 4R2BA 3OOAA 4C1UA 4EQ7A 3S9LC 1BIYA 3O6HA 1A55A 3H4ZA 1Y1ZA 1JW1A 1Z7NE 4OETA 2ZYNA 3K6WA 4LUBA 3KSXA 5H8NA 5K2XA 5KZTA 2O7IA 4KI0E 4GRKA 4EUOA 1MG1A 1MM6A 2ONSA 2GH9A 4YU0A 4DLDA 5CM6A 4JWOA 4NWDA 4QFPA 4NE4A 1TFDA 4R6YA 4H1XA 4DCYA 5J1DA 3GBBA 1GGGA 1DTGA 1B2HA 2XXRA 3MP8A 3HCQA 2OZZA 3TFLA 4YMBA 1CE2A 2F6GA 3RUMA 5IKBA 1VR5A 4HCYA 3G7WA 2M8CA 1BTJA 4XKRA 4WEPA 2DOJA 4N13A 4FECA 4MH5A 3C36A 3SERA 5F7VA 3TQWA 1B7HA 2HAUA 2YPNA 4R72A 3D4CA 5DVJA 2X26A 4JDFA 3K6UA 2F34A 1WVJA 1POY1 2OBGA 2Z22A 3ZKKA 4P11A 1O7TA 3KG2A 4OZ9A 3UP9A 2F7CA 4YB5A 1MY2A 4RNSA 1PC3A 2Q89A 1JEVA 1JW5A 3USDA 1M5EA 3IB1A 3CFLA 2PYYA 3DM0A 3EHUA 2E0SA 2HCAA 4PQJA 2UXAA 3Q28A 3D4GA 2I4BA 3K6XA 2REGA 4Q5TA 4QF9A 1N04A 3FUZA 3VDFA 5H8NB 2Q2AA 1MY0A 3L6GA 1UIUA 1B1HA 3RT6B 1FQCA 3FZVA 4THIA 3CSGA 4YKJA 1S9TA 3TQLA 1TXFA 3N26A 3U1OA 5ISUA 3G3HA 4FEBA 2QL3A 2QJEA 3RN8A 1LFGA 3MP6A 4GOTA 1LGBC 3SKPA 2X7QA 4R75A 2RCAA 1MH4A 3IAZA 4P0GA 4FORA 5DT6A 3PPRA 2V25A 4IY5A 3G3IA 3HV1A 4F3BA 3C31A 5H8HA 4MLQA 5I59A 3KBRA 2H9BA 2XX9A 1P1NA 1Q35A 3QUFA 3ZKLA 3RTWB 2XXVA 1QVSA 1KWHA 4PETA 4LVQA 3TCFA 3IX1A 4QFNA 1N7WA 1FTOA 1NFTA 1ZBMA 4RPOA 1MH3A 1L5TA 4X9TA 5L9MA 1FQBA 3IO6A 3MPLA 1R1NA 4U23A 3N6TA 2Z8EA 3DP4A 4RA1A 1URSA 1LBBA 1P1OA 2PBWA 3HN0A 3WAFA 3TYHA 1YCJA 4RK9A 3SEXA 4R6HA 3VVEA 4GLIA 3E3KA 3PV0E 4I62A 1B40A 3LR1A 3CVGA 3H7MA 4GQOA 3E13X 1I6QA 3HHFA 3V89B 5CBRA 4NF8A 4JSOA 1JEUA 3M3FA 1P1UA 4PFUA 2R9JA 1QKAA 1B5JA 3H3GA 3K0VA 1FW0A 4U4XA 3MPKA 2I48A 3OD7A 2V93A 5I2NA 3SEUA 3LUYA 1NNPA 3SDFA 5JK4A 2O6AA 4I1DA 5AA4A 5I57A 3CFXA 1IXIA 4DCXA 1BLFA 5L9SA 3OEKA 4F2QA 1BKAA 3EPEA 3KN8A 3GXAA 1FTLA 1NH7A 3PD9A 3IOVA 5H8HB 2O68A 2NUVA 4OEUA 4KCDA 3I3VA 4RXLA 4QFKA 2DE3A 5DEXA 4TOZA 3GBAA 4ELRA 1Y20A 2QSXA 3TCGA 3C4MA 2B65A 4XIGQ 4BDNA 1NNFA 2Z23A 2Y7RA 4QRZA 3EHSA 3FASA 3O97A 1ZKBA 3BFTA 3RLFE 4IO5A 4G2ZA 4H65A 3TZAA 1EH3A 4ONYA 2DXYA 4N6PA 3QXMA 2Y7PA 3CG3A 2HEUA 5JTYA 3KJ7A 2V84A 1NH8A 3HSTA 1H76A 2P0SA 4KYEA 2F7BA 1N0TA 1OLAA 1MXZA 3IL1B 3PUXE 3MVWA 4Z7EA 2P2AA 4ZDMA 4TQUQ 3T93B 2DE2A 1S7YA 4GF8A 4G77A 5F1QA 4IO3A 4U21A 3FXRA 4H6DA 5I2NB 4G8NA 4O3BA 3TAJA 3KN3A 5I57B 4R74A 1DPPA 1HSEA 1MXUA 5H8SA 5B7DA 4E0XA 4WEDA 1TT1A 2HQ0A 1P1WA 3MZBA 2XXXA 2W7YA 4RY1A 3S9NC 4FEDA 4ZS9A 2G93A 1EZ9A 4O3AA 3RQTA 2QRYA 4XKPA 3K02A 5I58B 4O3CA 1Y3PA 3FVKA 4EQ9A 2H98A 1Y3NA 3G3FA 3VE1B 1N3WA 3MAMA 3WAEA 4OERA 1B4HA 1LCFA 1O63A 2ANJA 1FQAA 4BDRA 4ESXA 1I6AA 2F97A 4BDOA 4ELOA 1SD3A 3K01A 4L17A 1B9JA 4XKNA 3CIJA 4KR5A 4Q0CA 4POXA 4MFIA 4G68A 1GR2A 2A5SA 3RT8A 1SW4A 1B4ZA 2ESNA 4NF4A 4G4PA 5I84A 2I4CA 1DMBA 1FTJA 1JQFA 1IITA 3MVYA 3TDJA 1LAHE 4GL8A 4EQBA 1USYH 1N76A 3AXFA 2F78A 3T9UA 3I6VA 1FTMA 2XXYA 3QUJA 1URGA 3T9HB 3FVNA 1Y3QA 3FGSA 3R6UA 5FTHA 2WKYA 4JXIA 5H8FA 2QPQA 4F3SA 2RKMA 4TLLB 1A99A 1IZ1A 1USYE 2NOOA 2YLNA 5BWJA 2ZNSA 2Q2CA 1NNTA 3TTNA 3BFUA 1US4A 3MWBA 4I9DA 3G3GA 1SVXB 3EHTA 3M3KA 3O6GA 1D9YA 5AA2D 2I3VA 4RYAA 5L8DA 2G29A 1OMPA 2DE4A 1I6BA 4LQ5A 3QAXA 1AH5A 3IJOB 3Q26A 4JWXA 4DZ1A 1XHYA 2QMXA 4LA9A 4RJZA 1CB6A 4YICA 1LB8A 1RKMA 3FVOA 3K2DA 3O29A 2FA7A 2DXRA 4JB7A 3JZJA 2I0BA 3HPIA 5TPAA 3VLUA 4U1OA 3KSJA 2ZYOA 5ICTA 1OQGA 4G68B 3W9WA 3CI8A 3VLWA 4F19A 3CSBA 2P1SA 1EZOA 4AB5A 3F11A 2XXWA 1GV8A 1SYIA 5AA3A 5AA2A 3MZ9A 2OWSA 3V83A 1NMUA 4R2FA 4ZE9A 1M5BA 3BBRA 3TTKA 4IY6A 1QJMA 4MF3A 3V8XB 3EN3A 1F9BA 4XKQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1B7UA 2PMSA 1YTVA 3FV1A 1M5FA 1QUJA 4PE3A 1QGXA 2UVHA 1VE4A 3S9MC 3CR9A 1Y1MA 4KYSA 4JVIA 1AOVA 1R9LA 3VLVA 4YMAA 3PUVE 1UQWA 3SESA 4KQPA 2CEXA 2RCBA 2DWAA 4PDDA 1UTHA 2V3TA 4DXBA 1ANFA 5EQ8A 3C32A 2A5TA 4H0WA 1QUKA 2QS2A 4OTEA 1MPBA 1J1NA 5FHNA 1FQDA 3K4UA 4OFJA 1ELJA 1XVXA 4H5FA 4KFQA 1FPIA 2F36A 4MEVA 3OMBA 4EXKA 1Y4TA 2QS3A 3TCHA 1QULA 2GHAA 1PDAA 4IGRA 3H6UA 1B51A 1B32A 3L6HA 1NV2A 3RNNA 2I49A 3OEMA 3K00A 1M5CA 2O69A 4HTGA 3MUQA 5TPAB 5I56A 4OQOA 2ZZXA 3B8BA 1B5IA 4PDHA 1NNKA 3LUZA 1NL5A 1B7ZA 4Q8RA 2XXHA 4QBAA 4ISUA 3R26A 4AQ4A 3H06B 4GFRA 1LBWA 3HO7A 3LV0A 1YYZA 4F39A 1VFEA 1N7XA 1VSOA 2O1MA 1IUDA 5AA2B 3G3JA 2XX7A 4G8MA 3FXUA 5H8QA 1FQFA 4PAKA 5ELVA 4GWXA 3OXNA 4LZ7A 5ET7A 5LTCA 4GIZA 2QVRA 2XA5A 4I3YA 1ZJLA 4AS4A 2XWIA 3FXQA 1Z7ME 1FCKA 3U8QA 4GXSB 3CHGA 2XXPA 4OVJA 2P3VA 1AL3A 1PBPA 3A3UA 1SI1A 2V4CA 5DYHA 4BDLA 4MNIA 2XXQA 1MQHA 2VPOA 3U92A 2DS9A 3TTLA 4QFLA 3SETA 3SEWA 1R9QA 2ALUA 1A40A 1B3EA 1D9VA 4GWSA 3PTYA 1M5DA 3JYRA 4MNPA 4GX3A 3RPWA 1SYHA 4PP0A 4YZZA 3E79A 1D9QA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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