3MAMA

A molecular switch changes the low to the high affinity state in the substrate binding protein afprox
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
270
structure length
270
Chain Sequence
b'ERVVIGSKPFNEQYILANMIAILLEENGYKAEVKEGLGGTLVNYEALKRNDIQLYVEYTGTAYNVILRKQPPELWDQQYIFDEVKKGLLEADGVVVAAKLGFRDDAALAVRADWAEENGVEKISDLAEFADQLVFGSDPEFASRPDGLPQIKKVYGFEFKEVKQMEPTLMYEAIKNKQVDVIPAYTTDSRVDLFNLKILEDDKGALPPYDAIIIVNGNTAKDEKLISVLKLLEDRIDTDTMRALNYQYDVEKKDAREIAMSFLKEQGLVK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Arg149 Is Involved in Switching the Low Affinity, Open State of the Binding Protein AfProX into Its High Affinity, Closed State.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Osmoprotection protein (ProX)
source organism Archaeoglobus fulgidus
molecule tags Transport protein
total genus 97
structure length 270
sequence length 270
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3mamA01
3.40.190.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Osmoprotection protein (prox); domain 2 3mamA02
4I62A 1MS7A 3C32A 4O3BA 1SQYA 1PB7A 2AL5A 3IR1A 3MZBA 4OXVA 1MDP1 3QUFA 1AMFA 1WODA 1SDXA 4KHZE 2I4BA 4QFOA 1D9YA 1Y3NA 4R72A 2XXRA 4PE5B 1B46A 2DE3A 4XKPA 3UA8A 3IO4A 1SW2A 1NMUA 2HZKA 4LZ7A 2UXAA 3TTMA 2REGA 4PFYA 1LAHE 1P99A 2FNCA 5HBCA 3PGFA 4R6KA 1JW1A 3ZSFA 1IEJA 1XVXA 3M3LA 1S9TA 4IO3A 5H8QA 5FHMA 4U4SA 1FTKA 4LZ8A 2Y84A 3RTWB 2P2AA 2CZLA 4GIZA 3DP4A 3KOSA 1VR5A 1B3HA 3HV1A 2D5WA 3WAFA 2I0CA 4ZZAA 3G3FA 1M5FA 3MVYA 3CI8A 4DXBA 4G8HA 4RJZA 3LBSA 1LAXA 3H7MA 1R1NA 4OFLA 1A8EA 1SW4A 3KSJA 4F3PA 4U1OA 3PUYE 3ONMA 3PMXA 4H67A 2QL3A 3DM0A 2V84A 4XKNA 1TWYA 5TP9A 2O7IA 2B3BA 5ITOA 1FTOA 5H8NA 2WKYA 3K6UA 3KN7A 3MPLA 5L9SA 4EXKA 3BFTA 4TLLB 4GRKA 3QIMA 3EPEA 2VGQA 2Y7IA 4OERA 4DE8A 1A7LA 1B58A 3N94A 4ZE8A 4JSOA 1B6HA 2FYIA 1II5A 3I6VA 3W9VA 5AA4A 1M5BA 3B6TA 1JNFA 2ESNA 3N6TA 4ZEKA 3T9HB 3IK6B 3FGSA 1JVYA 3KEIA 1MM6A 4FIMA 1GV8A 5L9MA 2GHBA 3OEKA 2DP8A 1B4ZA 3O6GA 1AH5A 3TCFA 2IA4A 4XIGQ 1XHYA 1BIYA 4E0WA 1B3LA 3MZ1A 3FZVA 4F3SA 3EN3A 1B3EA 1DTGA 3PPOA 4ESXA 3N5LA 2E0SA 2O69A 3T96B 4IO2A 3FASA 2RC7A 1SYIA 1H3DA 2ZYKA 1B1XA 1URDA 4PETA 3SETA 4YKIA 4OESA 4R2FA 4GL0A 1SVXB 1D3KA 3A3CA 2QMWA 1Y20A 2DXRA 3OO8A 1GGGA 2H4IA 2PMSA 3AXFA 4LATA 5HPQA 5TP9B 4QF9A 1IXGA 3FXQA 3SERA 5H8NB 3TELA 3OO9A 5EHSA 4MFIA 4U2RA 1B5JA 1D4NA 4F19A 2QS1A 2ZNUA 1P1UA 1LFHA 3R6UA 2E1SA 2H98A 3IOWA 2A5TA 2VD2A 4G68A 5AA4B 4JWYA 1N7WA 4PFWA 1ZIUA 2ONKE 1VSOA 3K2DA 3HO7A 5CC2A 3MVZA 3HN0A 1B4HA 1MXXA 1H43A 2Y7RA 4N13A 2I49A 5I2KB 1QW0A 1IXCA 1A54A 5H8FA 2RF1A 5ELVA 1OIBA 4H8JA 1FTJA 2F5XA 4G4PA 4NF5A 3TTLA 4ZS9A 1B7ZA 1PB8A 4JSDA 1MXVA 4MLQA 4QFNA 2XX9A 1FQEA 3TTRA 4ONYA 4YKPA 1B7UA 4N07A 1JEVA 4G8NA 3MP8A 4OENA 3TMGA 1B0LA 3K6XA 3RT8A 3RLFE 3VFJA 3T9VA 4NF8A 4KYSA 4OMBA 1JVXA 2DE4A 2F7BA 2PBWA 4TLMB 2O84X 4MH5A 5FTIA 3VV5A 3ZS6A 4OWDA 2XXXA 5I2NA 1S50A 1NNTA 4HS7A 1JETA 4BDLA 4LA9A 4YICA 4YMBA 3EHUA 1FQDA 1PDAA 2Q8JA 2NXOA 2A5TB 3DP8A 2PX1A 3TCHA 1B1HA 3KOTA 5CMKA 4G68B 1LBBA 4Q0CA 2NWJA 2HAUA 3MBPA 3OO6A 3M3FA 1L5TA 3CSBA 3CIJA 3OSRA 1MY2A 5HM4B 2X26A 4HCYA 2Q88A 4YB5A 2B65A 1XS5A 3U8QA 4P0IA 1MG1A 2XHDA 3LSFB 1B40A 1OLAA 3MC2A 3IO6A 5B7DA 3V83A 4NF5B 3QYTA 4I1DA 2UVJA 1I69A 3V89B 1BTJA 3ECRA 2QS2A 4EDPA 1ZJLA 1IZ1A 3TAJA 4YMAA 4F1YA 3FV2A 4MF3A 1MPDA 3DELB 1NFTA 2R71A 3EF7A 4ELQA 4H65A 2DVZA 3KBRA 3E13X 2VOZA 1A55A 2OK2A 3KN8A 3G7WA 4C1TA 4U23A 4NF8B 3C33A 4ESWA 4EQ9A 3MW0A 1Y9UA 2Q2CA 1PBQA 4IB2A 2I6EA 2UYFA 3IOUA 4KQPA 4UA8A 1ZBMA 1SW5A 3BKIB 2HQ0A 1SYHA 4FE8A 2F7AA 2QRYA 2DQVA 3Q25A 1YTVA 5I2NB 5IKBA 3JZJA 4JDFA 1UQWA 2I48A 4PQJA 1TT1A 4XKRA 1A8FA 2A5SA 1P1OA 4DLDA 5F7VA 4DCYA 3T66A 3FJMA 3MQ9A 3ZKKA 3RGYA 4NE4A 3PUVE 3IOVA 1BLFA 4Z7EA 1NH8A 3KJTA 1OMPA 2F78A 3H6VA 1FQCA 3TQLA 3ZKLA 3O66A 3TKDA 1DPPA 4H5GA 3K1MA 3B6QA 1GR2A 4MLVA 3FVKA 4AB5A 3UIFA 2B3FA 3IB2A 4OEUA 1EH3A 1UIVA 2UYEA 4YAHX 4R6YA 1EZ9A 1MY1A 4ND9A 3HPIA 3H03A 3UK4A 2XX8A 1JEUA 3O97A 5I59A 3CFLA 1MQDA 4X48A 3FXUA 2HCAA 4RY1A 2OZZA 2OLBA 2GFEA 3G3GA 1TFAA 2P0SA 4FORA 4F3BA 2QJEA 3N26A 3PV0E 1US5A 2ABHA 4X1DA 2RCAA 3K4UA 4KR5A 1IUDA 3IAZA 2ALUA 1RYXA 4X9TA 1B32A 5FTHA 3RY3A 3CFXA 5I58A 3GXAA 1B52A 5CMBA 1QVSA 4ZE9A 3TFLA 4F1VA 1M5EA 3SEWA 3K6WA 5FHNA 4QHQA 1POY1 2F6PA 1UIUA 1H76A 4KPTA 2UVGA 3FATA 5CBSA 3E3KA 1QUIA 1YAEA 5EYFA 3PUZE 4GXSB 2XD3A 4NWCA 5DT6A 3MUQA 3K0VA 2I3WA 5LOMA 4KYEA 3PPRA 2ZMBA 1PBPA 5CI5A 5IAIA 4F2OA 1MH4A 2HEUA 4G8MA 2NVUB 2XXHA 3U72A 1NNKA 2XXUA 2KLFA 1GTKA 4GWOA 3Q27A 1ZKBA 3UP9A 5ICQA 4I9DA 3S9LC 3L6GA 4GVOA 1ATGA 3OXNA 2Z23A 4DXCA 2ONSA 4H6DA 2LAOA 3CG3A 5I59B 1SI0A 3MAMA 1Z7ME 1BKAA 3R26A 4G77A 4QSDA 1Y1MA 4KCDA 2F97A 4RYAA 3U94A 1OLCA 1Z7NE 4IO4A 3KZGA 3JYRA 4G68C 1FTLA 4QFKA 3VXCA 2M8CA 2G29A 5DVJA 3TQWA 3UGWA 1HSJA 3S9MC 1O64A 5I2KA 4R2BA 3IORA 3V8XB 1NNPA 4XKQA 4DZ1A 4GQOA 2AYSA 3FJGA 2H25A 3GBAA 1IIWA 4BDMA 5I58B 1O63A 1M5CA 3USDA 4NF4A 1ZU0A 3W15C 3QSLA 1JQFA 4GOTA 3P7IA 3KN3A 2XXPA 4H0WA 4OFOA 3N6UA 3SKPA 2VP1A 2D3IA 1LFIA 4KD5A 4PFUA 1N3WA 2DWAA 3O2AA 2QPQA 4ELPA 2XD2A 2PYYA 3MWBA 4ZEBA 3C4MA 1B51A 2NUVA 1PC3A 2R9JA 1ZLQA 3S9EA 3S9NC 3I3VA 3H4ZA 5H8SA 3MVWA 4F18A 4Q8RA 4G2ZA 4LVQA 4KFQA 4IO6A 4EF1A 4NWDA 4RK9A 3IJOB 3ILUB 4IO7A 4YKJA 3FJ7A 4DCXA 4R9FA 3IJXB 1MXWA 1Y3QA 3UORA 4O3AA 4WKMA 5I57A 2I3VA 2Q9TA 2OJTA 2Z8EA 4F22A 5I56A 4LONB 3C36A 4LQ2A 1AL3A 1LCFA 1QKAA 1J1NA 2F34A 2ZXTA 3O9PA 2H5YA 2DXYA 3SEYA 4NF4B 3F11A 1LSTA 4IGTA 1LBCA 4RPNA 3K1PA 5AA3A 2OWTA 4R74A 4IY5A 4KYDA 3ODBA 3VDFA 3PU5A 2Z22A 4Q5TA 3TDJA 1DPEA 4H5FA 1XT8A 3QAXA 1MXZA 4BLAA 5B70A 1ZMGA 4IGRA 2F7CA 4F31B 5KZTA 4ELOA 4UACA 1B3FA 1B9JA 3K02A 3VVEA 3TODA 2PT2A 4QSCA 2ZYNA 3H6TA 5JEIA 3SEVA 4BDQA 5H8HA 2DOJA 2ZYOA 4M4GA 5AA1A 3LC8A 3FIRA 4YB7A 5L8DA 3PD8A 4XXUA 5A5XA 4QFLA 4GLIA 1SBPA 5AE4A 3SDFA 5CM6A 5I57B 3M8UA 3OMBA 1OVTA 3DLNA 4EXLA 5K2YA 1QUKA 1R9LA 4QSEA 3H6UA 4F1UA 1Q1KA 4EF2A 1LB8A 5KDTA 3THIA 3JV9A 5I56B 1O7TA 3EHTA 3K1NA 2YLNA 1XOCA 3K00A 1MY0A 2O7UA 5L9OA 2I0BA 1M5DA 3KG2A 2GRVA 3GZGA 3Q26A 2QS4A 2AIXA 3MZ9A 1FTMA 1B2HA 1MY4A 1AIVA 1I6BA 4RXLA 1US4A 3ILTB 3PMVA 4ISUA 1B7HA 3O6IA 5CMMA 1N76A 4QFPA 1B3GA 5M2VA 4POWA 4Q30B 3R7XA 4NF6A 1SW1A 2YPNA 4KI0E 4LQ5A 5JK4A 1FQBA 2QS3A 3CFZA 4QRZA 3IOTA 5H8HB 2DWIA 1EZPA 3VXBA 2O6AA 1N84A 2DSFA 3OOAA 3CVGA 3CRBA 3B6WA 2I58A 4ZEFA 4LZ5A 2O51A 2XXIA 1VFDA 5A5XB 1H44A 4RPOA 1MM7A 3M3KA 3LSLA 4JXIA 1CB6A 3HHGA 5AA2B 1MQIA 2D21A 1MQGA 3PUWE 2RKMA 1MRPA 5KDTB 5AA2D 3FVNA 2HXWA 4THIA 4FATA 1IXHA 2DS9A 3TCGA 3V5AA 3SEXA 2G93A 4OETA 3MP1A 3KJ7A 4AQ4A 4LP2B 4GXAA 1A99A 1RYOA 3RN8A 1SI1A 1R6ZA 4IY6A 4OEVA 2XXYA 1B5HA 3KGCA 3D4CA 3PPNA 2V3UA 3MVXA 2Y7WA 1DTZA 1MH3A 1OQHA 1YCJA 4YKKA 3CR9A 2VD3A 4FJPA 4U21A 2I4CA 1Y4CA 3PUXE 1LAFE 3H06B 4R75A 3B7DA 4NF6B 5TPAA 4HCWA 3LSWA 4DDDA 3FVGA 5BUUA 3TEPA 4FAJA 3VLVA 2H99A 4OHNA 5DEXA 3GLBA 3S4UA 4WXJA 2DWHA 4C0RA 1B5IA 1HSEA 3D4GA 3MJNA 2YJPA 1EZOA 1ZTYA 2ZYMA 1UTHA 1Y3PA 3PMWA 4YU0A 1XC1A 4ZECA 3TYHA 1N04A 2PT1A 3QK6A 4GFRA 4TQUQ 4E0XA 1DSNA 3OO7A 2V25A 3GBBA 2HAVA 2THIA 2O1LA 1HSLA 3SEUA 3LR1A 2GHAA 2V3QA 5CBRA 3HHFA 3VLWA 1IXIA 2XXVA 4N6PA 4YB6A 3TTKA 4ZEIA 3O28A 2Q2AA 4DIGA 5CRYA 3S2VA 4ZDMA 1MPBA 3G3HA 3W9WA 1FW0A 2F36A 4F39A 3T9UA 2XX7A 3FUZA 3MPKA 5F1QA 1LGBC 1FCKA 3CSGA 2DWJA 5TPAB 4C1UA 4NTLA 4WEPA 4BDOA 4LUBA 4HTGA 2Y7KA 3VVDA 4YZZA 4OFJA 5DEXB 1R9QA 2GH9A 1UTBA 3T93B 2IEEA 4HW8A 3IB1A 2OCUA 4GL8A 3OENA 3G3KA 2O68A 1JW5A 3FD3A 1AOVA 5H8QB 2H9BA 5BWJA 5DVFA 4OYVA 3Q28A 1UTHB 3E4RA 3IL1B 1N7XA 2FA7A 4RNSA 3TPAA 1LCTA 1VFEA 2ANJA 4R6HA 2CMOA 4K3FA 5JTYA 3TZAA 5ICTA 1MPCA 1Q35A 4PP0A 2REJA 4ECFA 1P1QA 3U92A 3H6WA 1IQ7A 2P1SA 4RK2A 4NMYA 1NKXA 1LAGE 3VLUA 4OTEA 1URGA 3VVFA 2DYXA 1KWHA 4FECA 1N0TA 4P11A 2W7YA 1USYH 1H45A 2RC9A 4BDRA 5J1DA 5KCJA 5ISUA 1MXUA 4R9GA 3RTFB 5FHOA 3CG1A 1T0KA 4POXA 3BBRA 4OVJA 4FEDA 3OSQA 4OZ9A 4TOZA 1I6AA 2X7PA 3KFMA 1B0HA 1EU8A 3OD7A 1RKMA 4ZEDA 3K6VA 3RQTA 2VHAA 1UTBB 1JW4A 3PPPA 2Z8DA 2ZNTA 2RINA 3FVOA 1MDQA 1MQHA 1CE2A 4X1BA 3FXRA 1BP5A 3UN6A 4U22A 4WEDA 3RPWA 4F3GA 2F8DA 2XXQA 1NL5A 4L17A 3C34A 1QKBA 1Y4TA 3OEMA 4DXUA 2OBGA 5CMCA 3BFUA 2QMXA 1P1NA 3HCQA 4M1VA 1A40A 1MXYA 5JTYB 3FV1A 1WVJA 4U4XA 3Q29A 5DYHA 1NNFA 3HSTA 1TFDA 2V3TA 4JB7A 4U1ZA 2ONRA 3PPQA 3C9HA 4R73A 1WDNA 2ZNSA 3EHSA 3C31A 2HZLA 5DVIA 4AB6A 3RT6B 4F2QA 2XXTA 4P0GA 4XTCQ 2F35A 4BDNA 3A09A 1PEBA 1TXFA 2Y7PA 4H1XA 5KCJB 3MP6A 3T22A 1IITA 5AA2A 1LLSA 3U1OA 3L6HA 3LUYA 1DOTA 1FQFA 1YPNA 4ZZEA 5EHMA 3WAEA 1F9BA 3EQ1A 3O6HA 4NEDA 4JBZA 3SESA 2RC8A 4EQBA 3T9XB 5DTBA 2UVHA 4Z0IA 1GVCA 1XVYA 2PVUA 5TU0A 5K2XA 5H8FB 1OVBA 1Y1ZA 2RCBA 4ELRA 2DE2A 1I6QA 1LFGA 1MY3A 3IB0A 1VE4A 4GD5A 2O1MA 5ITPA 3OELA 4JWOA 3U93A 3RNNA 2OWSA 2XXWA 2F6GA 1SD3A 3KSXA 3O29A 2AL4A 4MBPA 4EUOA 1P1WA 1USYE 1QULA 5I84A 4H8IA 4O3CA 4JWXA 4FEBA 2QSXA 1N3XA 3VE1B 2HFBA 2NOOA 4GF8A 2R6GE 3DP6A 3I5OA 1D9VA 3K01A 1PB9A 4EQ7A 3PD9A 4PFTA 3LSXA 2Q89A 3QXMA 3IX1A 1QJMA 3G3IA 2UVIA 1FQAA 3QUJA 2X7QA 3TTNA 4KCCA 2BJJX 3C35A 1OQGA 3TUSA 1ELJA 1MQJA 4RA1A 3E9XA 4F29A 3H3GA 3A3UA 4OQOA 1S7YA 2V93A 2DVCA 4IO5A 1POTA 4I8CA 1DMBA 1NH7A 1LB9A 3G3JA 2Z8FA 1URSA 1ANFA 1B05A 1QUJA 3RUMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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