5AA2A

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa in complex with nam-pentapeptide.
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
419
structure length
419
Chain Sequence
KEGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFTQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Lyase
total genus 143
structure length 419
sequence length 419
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2015-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa2A02
2Z8FA 3FV1A 1QKBA 1IXHA 1MXXA 2XXRA 2OWSA 2H5YA 3W9VA 1B1XA 3BFUA 2QMWA 3H03A 4M4GA 3BKIB 3KZGA 5AA4A 3K1PA 3DP6A 1UTHA 2QS2A 2V84A 2VHAA 4NEDA 5ICTA 4G68C 1IXGA 1NL5A 4HCYA 3PUVE 1XHYA 1B6HA 3FVOA 4ELPA 1JEVA 5H8NA 1R9QA 3IB0A 2UYFA 2I0BA 1PDAA 4U21A 1B5HA 1S50A 2UYEA 4FJPA 5A5XA 1Y4TA 4OENA 2ALUA 3QAXA 4NWDA 4F1YA 1JQFA 5DTBA 1IEJA 3ZKLA 2F97A 2B3FA 1YCJA 3K1NA 2XD2A 1SVXB 1B3GA 3MP1A 3OSRA 4KPTA 3ODBA 1MY2A 2XXYA 5K2YA 3TZAA 3QUJA 3CFZA 4DE8A 1P1WA 4EF1A 1MPDA 3KSXA 5CI5A 3O66A 4RY1A 5H8HA 3SDFA 3IB2A 3K02A 1EH3A 3N6TA 4R6HA 3VXBA 3PUZE 1IUDA 3IOVA 4DZ1A 5KCJA 3CG1A 4UA8A 3K4UA 3UGWA 4EQ7A 5AA4B 3W15C 4ISUA 4G68A 4YKPA 2OZZA 4QFLA 3B7DA 1MS7A 3T9XB 2P2AA 3KOSA 2IA4A 5ITOA 2Y7RA 3QUFA 4POWA 1QULA 4QFNA 1OVTA 4NF5A 1MQHA 1B3HA 5H8NB 1PBPA 2V3TA 3AXFA 4GVOA 3DLNA 1SI0A 1OIBA 4YKJA 3B6WA 4YU0A 2DVCA 2CMOA 1NNKA 3TQLA 2HZKA 5BUUA 2GFEA 1D4NA 4GFRA 4PFWA 4RJZA 1EZ9A 4XIGQ 3ZSFA 1B2HA 3VLVA 5H8QB 4IO2A 4NF8A 4KFQA 4N6PA 1SQYA 3Q26A 3G3GA 3C9HA 2P0SA 4YKIA 4C0RA 3R6UA 2FNCA 2WKYA 3PPRA 1H45A 1B52A 3IX1A 2CZLA 2Q89A 4U2RA 4QFKA 4YMAA 5KCJB 4ECFA 2DWAA 5B7DA 3I6VA 3H06B 3LSWA 5KDTB 4K3FA 1IITA 1JVYA 1FQBA 4Q8RA 2O69A 1MY1A 1B46A 3V5AA 4HCWA 3MJNA 1DOTA 1MQIA 4KYDA 3CSGA 1JW1A 3VLUA 2B65A 3U1OA 4FIMA 3FZVA 1HSJA 1LFHA 4LONB 4ESWA 4WEPA 4ELRA 1QUJA 4N07A 2LAOA 3T9UA 4ELQA 4BDRA 3FUZA 4KQPA 2YPNA 4RPOA 4NMYA 3E3KA 1ZKBA 3VVDA 5DEXA 1P99A 1B3LA 5FHNA 3CG3A 3FJMA 3U8QA 1FCKA 1LFGA 4R6YA 4ZEBA 5AA3A 4R75A 4DIGA 2XD3A 3TFLA 4UACA 4EDPA 3QSLA 1P1NA 3FIRA 3FVGA 3FVNA 3VDFA 1A55A 2NVUB 1TXFA 5TPAA 1UTBB 5I59A 4G8HA 3PUYE 4G2ZA 2FA7A 4I62A 3RT8A 3S2VA 4EQBA 3HV1A 3UP9A 3RQTA 3GZGA 1LBCA 1SD3A 3T93B 3MAMA 1LCTA 3EHUA 4FE8A 1SW1A 1AMFA 1AH5A 2RCBA 3ONMA 2H25A 2THIA 2D21A 4P11A 1QVSA 4L17A 1A54A 4JSOA 4YZZA 1LSTA 3PPPA 2V3UA 2I0CA 4HW8A 3H6WA 4IY5A 4NWCA 4P0IA 5DEXB 2UVJA 4RNSA 3I3VA 4LZ8A 2Z8EA 1MY3A 3K0VA 4MBPA 3S4UA 3HO7A 4U23A 4H65A 1SW4A 4IO5A 3KN3A 4KCDA 1N3XA 4O3CA 4KYEA 3DP8A 3FJ7A 3IAZA 4R9FA 4ZECA 1POTA 2PT1A 3M3LA 1OQGA 1T0KA 3FVKA 4KHZE 5I57B 1B7UA 1USYH 3RGYA 4Q5TA 1ZMGA 5I2NB 2VGQA 1LAHE 2ZNUA 5ELVA 1DPEA 1OLCA 3OSQA 2REJA 1XS5A 4OFOA 3G3HA 1RYOA 3IK6B 4OWDA 5TPAB 1IXIA 4EF2A 3Q29A 1DTZA 3MZ1A 4Z7EA 1B3FA 3TTMA 3S9EA 5JK4A 1I69A 4LUBA 4OERA 2HXWA 3SERA 3H3GA 3C36A 4JXIA 3IORA 4JWYA 5EYFA 3U92A 1Y3PA 1S7YA 1ANFA 1JW5A 4U4SA 3GBBA 3RT6B 4ZEDA 3UORA 4Q30B 2XXWA 1SW2A 3K00A 3SESA 3G3JA 2I48A 1UIVA 5FTHA 3PD8A 2QS3A 3CRBA 3VVEA 2Y7WA 1YTVA 3CFLA 3LBSA 5CBSA 4XKPA 2O84X 1FTOA 2DXYA 3K1MA 3PMVA 2A5TB 3O28A 1SW5A 1LGBC 2REGA 4IB2A 1LAGE 4R2FA 4WEDA 5ISUA 2PVUA 3CVGA 1Q1KA 3O2AA 4YB5A 3M3FA 5L9MA 4ZEFA 1B4ZA 2XXQA 4H8JA 1B5IA 4EXKA 1GR2A 2F7CA 3KFMA 2F8DA 5TP9B 2O51A 3SKPA 2I3WA 3VV5A 5H8SA 1SYIA 4O3AA 2H9BA 2H4IA 3FV2A 3R26A 3M8UA 3KBRA 1MXUA 1B7ZA 3H6UA 4F2OA 1XT8A 3MBPA 1H44A 2VP1A 4LVQA 4NE4A 3G3FA 3IB1A 3K6WA 4OFJA 1A40A 4E0XA 2OWTA 4YMBA 2OK2A 4IY6A 2ZYKA 1WDNA 4X1BA 3PUWE 3KG2A 3OEKA 1US4A 1Y3QA 1II5A 3VE1B 5I58B 4R2BA 4ZEIA 2QL3A 3FXQA 2OLBA 2HZLA 5H8QA 1MPCA 2ZNSA 3OO8A 5I84A 4DCYA 2ONKE 2ONSA 4GL8A 4FECA 2V3QA 3C32A 4JWXA 4YKKA 4BDMA 4U22A 4PFTA 1R6ZA 1URSA 4GF8A 1CE2A 1LB9A 2XXHA 4GOTA 3ECRA 5CM6A 4OQOA 4F3PA 1LLSA 4GWOA 4YB7A 5L9SA 4RYAA 5KDTA 1EU8A 1JVXA 3BFTA 1XC1A 3PV0E 1XVYA 4LZ7A 1MPBA 2G29A 2VD3A 3A3UA 2DVZA 2X26A 2X7PA 4NF4B 4LA9A 5AA1A 3MPLA 3L6GA 1SI1A 1SDXA 3SEYA 3TMGA 4MLVA 1L5TA 4QSDA 4EQ9A 3Q25A 1NH8A 1FQFA 5ITPA 3EN3A 3R7XA 5H8FB 4BLAA 1MRPA 4PP0A 3UIFA 4H0WA 4PETA 4KD5A 4DLDA 2F36A 3ZKKA 3VXCA 2Q8JA 3MP6A 4H5FA 4AB5A 1H3DA 3THIA 3O9PA 1POY1 2ZNTA 3O6IA 2Q88A 5CC2A 3W9WA 4I1DA 4FATA 3E13X 5BWJA 2PYYA 3TTKA 1GTKA 1UTBA 4LATA 1Y1ZA 4ESXA 2F6GA 5TU0A 1OVBA 4JSDA 2ANJA 4I9DA 1TFAA 3G7WA 2Y7PA 2ZYMA 2AIXA 3S9NC 5FHMA 3LR1A 5HM4B 2UVHA 2F35A 1Y20A 5CMMA 4GQOA 4PFYA 1TFDA 1D9YA 4GL0A 1N04A 5CMKA 1F9BA 3K01A 1OQHA 1IXCA 1M5DA 2QRYA 1Q35A 3KSJA 2UVGA 1PC3A 5I2KB 1FTKA 4QHQA 4QSCA 3O29A 3B6QA 4RK2A 3JV9A 2F78A 5K2XA 4FAJA 4PFUA 4G8NA 2OJTA 1I6AA 2NUVA 3PUXE 1FW0A 1MY4A 1SBPA 3TTNA 5EHMA 2GHAA 3HHFA 5I57A 3TUSA 1WVJA 3HN0A 4GXSB 5CMBA 5I2NA 3EPEA 2AYSA 4X9TA 1VR5A 4F29A 1B32A 4XKRA 3RNNA 2I49A 1PB9A 4KR5A 3SEVA 1ZBMA 1FTLA 2DXRA 1FQCA 4X1DA 4DXBA 1MXWA 1O63A 2HCAA 3N5LA 1RKMA 4P0GA 4F22A 2XX7A 1Y9UA 3OMBA 5IKBA 3DELB 2DWHA 3QYTA 1LAFE 3OXNA 1ZJLA 1WODA 4OTEA 4O3BA 3IOWA 1USYE 2DP8A 3EF7A 1ATGA 1MDP1 1YPNA 4IGRA 1BKAA 1MQJA 2RC9A 4X48A 3FXUA 4R74A 4IO3A 3KN8A 3DM0A 3ILUB 3PPNA 1SYHA 1MQDA 2DS9A 1URGA 1B9JA 2QS4A 2O68A 4R73A 1N0TA 4NTLA 1PEBA 1FQEA 3TCFA 4GLIA 3M3KA 4F19A 2PT2A 4QRZA 3C34A 2A5TA 5DVJA 2R9JA 3FD3A 2F7AA 1N7WA 2RKMA 4POXA 2Q9TA 2PBWA 2Z22A 5DYHA 2DE2A 1UIUA 3VLWA 4H1XA 1QUKA 4EXLA 3MPKA 3KJTA 1NFTA 3GXAA 3OENA 1JW4A 4R9GA 1MXVA 5TP9A 3HHGA 3LSLA 1YAEA 4THIA 4TQUQ 1D3KA 3MUQA 4IO4A 3KEIA 2D5WA 1BP5A 3C33A 3E4RA 1MH3A 1B40A 1P1UA 3TYHA 1FTMA 3RTWB 2XXIA 3JYRA 3OO6A 5HPQA 4OHNA 4JDFA 3UN6A 2HAVA 1MXZA 3TTLA 5JTYB 3CIJA 4BDLA 4RPNA 3S9MC 3B6TA 3IOTA 2I4BA 4XKQA 1B0LA 4TOZA 1GVCA 1B3EA 3TCGA 3T66A 1LB8A 3RPWA 2HAUA 3Q28A 4F3BA 2DE3A 1ELJA 1DMBA 3MVZA 2XX8A 3H7MA 2AL4A 3RLFE 5I58A 1Y4CA 3LUYA 4OEUA 3EQ1A 5DT6A 4U1ZA 1TWYA 1NNPA 2O1LA 5HBCA 3IOUA 3EHSA 1MY0A 4IO7A 1AL3A 3BBRA 3OOAA 4I8CA 3RY3A 3TPAA 1QUIA 3TDJA 5M2VA 2QMXA 5AA2B 1GV8A 5ICQA 5DVIA 3TCHA 2ONRA 4MFIA 1N7XA 1O64A 1BTJA 3OELA 4KI0E 4F1UA 3LSXA 2D3IA 5FTIA 2XXXA 4WXJA 4KYSA 4NF6A 5I56B 1B58A 1NKXA 2V25A 4F31B 3N26A 3GLBA 4KCCA 4ONYA 4C1UA 2NXOA 1AOVA 4F3SA 1LBBA 1O7TA 3CR9A 3PU5A 1ZIUA 4YICA 4NF4A 3OEMA 2UXAA 4H5GA 2FYIA 4R6KA 4U4XA 4OZ9A 4GD5A 3TELA 3TKDA 2XXTA 3IJXB 2R6GE 2QJEA 3GBAA 2ESNA 1JETA 4PE5B 2NOOA 1N76A 2NWJA 3FASA 3FJGA 5JEIA 3K6UA 5H8FA 4H6DA 4OFLA 3SEXA 1Y1MA 1URDA 4G4PA 4QSEA 3U93A 3OO7A 1NNTA 5AE4A 4JB7A 3A3CA 4F2QA 1IQ7A 4BDQA 2YJPA 4BDNA 3H4ZA 3VVFA 3C4MA 4ZE8A 5L8DA 3C35A 4F39A 1CB6A 3EHTA 3MWBA 1US5A 4NF6B 5IAIA 2IEEA 1TT1A 3T9VA 2I3VA 3A09A 3HCQA 4ZZAA 1S9TA 4G8MA 3OO9A 1MDQA 1UTHB 4F1VA 1BIYA 3T22A 4ND9A 1GGGA 4OESA 3U94A 3I5OA 4XKNA 3RUMA 1B05A 3TAJA 1P1QA 2O7IA 4QF9A 3VFJA 4F3GA 1VFDA 2Q2AA 3K2DA 3PPQA 1FQDA 5KZTA 1FQAA 4RA1A 2ZYOA 3FGSA 4OMBA 4ZE9A 1AIVA 5A5XB 2I4CA 5I2KA 1KWHA 5J1DA 4OVJA 1QW0A 4ZS9A 2HEUA 3MVXA 3ILTB 1I6BA 5LOMA 4XXUA 5CBRA 4FORA 4RK9A 4JBZA 3KGCA 2XX9A 3T96B 5H8HB 3OD7A 1DPPA 3F11A 3HSTA 2BJJX 3IO6A 3V83A 2QS1A 2RC8A 3TTRA 4C1TA 1Y3NA 4AQ4A 1OMPA 3HPIA 2ZYNA 3K6XA 3IO4A 3LC8A 3SEUA 2RINA 2W7YA 2R71A 3D4GA 3H6VA 2GHBA 2Y84A 3V89B 1PBQA 3MZ9A 4GXAA 4G68B 3DP4A 4DCXA 4E0WA 4TLLB 2F34A 3MC2A 3V8XB 3CI8A 1QKAA 4NF5B 4RXLA 1B1HA 1RYXA 4DXCA 1B0HA 1LAXA 4OXVA 3TQWA 3UK4A 1VE4A 4JWOA 5FHOA 2Z8DA 3USDA 1EZOA 2Y7IA 2DWIA 2KLFA 2HQ0A 3O97A 4ZEKA 1HSEA 3JZJA 3PMWA 1MM6A 4FEBA 1MXYA 2O6AA 3PPOA 1PB8A 1R9LA 1B51A 3MVWA 4LP2B 1N84A 4H67A 4U1OA 3C31A 2I58A 1UQWA 4LQ2A 4NF8B 1ZU0A 3SEWA 1M5FA 1HSLA 3MVYA 1DSNA 3TODA 4BDOA 5F1QA 1Z7ME 2AL5A 3IL1B 2PX1A 5DVFA 3PGFA 2O7UA 3PD9A 1D9VA 3N6UA 1XOCA 2QPQA 1N3WA 3O6HA 2P1SA 2ZMBA 3D4CA 1I6QA 4GIZA 1MG1A 2G93A 4XTCQ 2DYXA 2XHDA 2I6EA 2DSFA 1JEUA 4FEDA 1R1NA 1NH7A 1PB7A 3RTFB 3SETA 3P7IA 1IIWA 4M1VA 1LFIA 1A99A 4YB6A 1JNFA 2HFBA 3N94A 5JTYA 1P1OA 1H76A 2DWJA 3G3IA 4TLMB 2X7QA 3TEPA 1XVXA 2M8CA 4HTGA 5AA2D 2O1MA 2B3BA 3G3KA 1VSOA 2PMSA 3FATA 3CSBA 4OYVA 3S9LC 1MQGA 2E1SA 3QXMA 4F18A 4EUOA 4Z0IA 2YLNA 2VD2A 4ELOA 3QIMA 4OETA 2F7BA 2E0SA 1ZLQA 2Q2CA 4DDDA 1BLFA 4LZ5A 5CRYA 4ZZEA 1FTJA 2DQVA 2RF1A 2XXPA 2F6PA 2RCAA 1A7LA 3WAFA 4IGTA 2VOZA 5EHSA 1ZTYA 2Z23A 1DTGA 4LQ5A 2ABHA 4R72A 5AA2A 2OBGA 3Q27A 4MF3A 2V93A 1B4HA 2ZXTA 4IO6A 4WKMA 3H6TA 2H98A 1NNFA 4QFPA 3MW0A 3RN8A 5I59B 1NMUA 1OLAA 5F7VA 3U72A 3L6HA 1B7HA 4YAHX 5I56A 2Y7KA 1IZ1A 3QK6A 2XXVA 4H8IA 1M5CA 3E9XA 1Z7NE 2XXUA 3FXRA 2F5XA 2DE4A 1MM7A 1J1NA 3KOTA 2DOJA 3O6GA 2GH9A 1A8EA 2UVIA 1B5JA 1M5EA 2OCUA 3T9HB 4AB6A 3MP8A 3CFXA 4QFOA 1H43A 4ZDMA 1VFEA 1QJMA 1EZPA 4MLQA 4N13A 2QSXA 1A8FA 5L9OA 2RC7A 3LSFB 3IJOB 3UA8A 2A5SA 3K6VA 3IR1A 3KN7A 2GRVA 4HS7A 3PMXA 5CMCA 4MH5A 1M5BA 2H99A 1LCFA 3MQ9A 5B70A 1MH4A 4GRKA 3MZBA 4OEVA 3ZS6A 3WAEA 4PQJA 3KJ7A 4G77A 4DXUA 4Q0CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Z8FA 3FV1A 1QKBA 1IXHA 2B4MA 1MXXA 2XXRA 2OWSA 2H5YA 3W9VA 1B1XA 3BFUA 1FBHA 2QMWA 3H03A 4M4GA 3BKIB 1FPLA 3KZGA 5AA4A 3K1PA 5EQ7A 3DP6A 1UTHA 2QS2A 2V84A 4OVPA 2VHAA 4NEDA 5ICTA 4G68C 1IXGA 5J16A 1NL5A 2XWOA 4HCYA 3PUVE 1XHYA 1B6HA 3FVOA 4ELPA 4GX6A 1JEVA 5H8NA 1R9QA 3IB0A 2UYFA 1SPIA 2I0BA 1PDAA 4U21A 1B5HA 1FPJA 1S50A 2UYEA 4FJPA 5A5XA 1NUZA 1Y4TA 4OENA 2ALUA 3QAXA 4XF5A 4NWDA 4F1YA 1JQFA 5DTBA 1IEJA 3ZKLA 1IMDA 2F97A 2B3FA 1YCJA 3K1NA 2XD2A 5EYGA 1SVXB 1B3GA 3MP1A 3OSRA 4KPTA 3ODBA 1MY2A 2XXYA 5K2YA 3TZAA 3QUJA 3CFZA 4DE8A 1P1WA 4EF1A 1MPDA 3KSXA 5CI5A 3O66A 4RY1A 5H8HA 3SDFA 3IB2A 3K02A 2WEFA 4GWWA 3EKIA 3E79A 2WBBA 1EH3A 3N6TA 4R6HA 3VXBA 4PGNA 3IFAA 3PUZE 1IUDA 3IOVA 4DZ1A 5KCJA 3CG1A 4UA8A 3K4UA 3UGWA 4EQ7A 5AA4B 3W15C 1YZ0A 4ISUA 4G68A 4YKPA 2OZZA 4QFLA 3B7DA 3RYDA 1MS7A 3T9XB 2P2AA 3KOSA 4OVTA 2IA4A 5ITOA 2Y7RA 3QUFA 4POWA 1QULA 4QFNA 1OVTA 4NF5A 1RDYA 1MQHA 1B3HA 5H8NB 1PBPA 2V3TA 3AXFA 4GVOA 3DLNA 1SI0A 1OIBA 4YKJA 3B6WA 4YU0A 2DVCA 4MNCA 2CMOA 3B8BA 1NNKA 3TQLA 2HZKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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