4F1VA

Subatomic resolution structure of a high affinity periplasmic phosphate-binding protein (pfluding) bound with phosphate at ph 8.5
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
MDINGGGATLPQALYQTSGVLTAGFAQYIGVGSGNGKAAFLNNDYTKFQAGVTNKNVHWAGSDSKLSATELSTYASAKQPTWGKLIQVPSVGTSVAIPFNKSGSAAVDLSVQELCGVFSGRINTWDGISGSGRTGPIVVVYRSESSGTTELFTRFLNAKCNAETGNFAVTTTFGTSFSGGLPAGAVAATGSQGVMTALAAGDGRITYMSPDFAAPTLAGLDDATKVARVGKNVATNTQGVSPAAANVSAAIGAVPVPAAADRSNPDAWVPVFGPDNTAGVQPYPTSGYPILGFTNLIFSQCYADATQTTQVRDFFTKHYGASNNNDAAITANAFVPLPTAWKATVRASFLTASNALSIGNTNVCNGIGRPLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Putative alkaline phosphatase
publication title The molecular basis of phosphate discrimination in arsenate-rich environments.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas fluorescens
molecule tags Phosphate-binding protein
total genus 119
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f1vA02
3.40.190.260 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 4f1vA01
4KI0E 3CFXA 1OLCA 3T22A 4Q0CA 3H4ZA 2H9BA 3FXUA 3TDJA 5CBRA 1LAHE 2GHBA 2VGQA 3PUXE 5I84A 4LQ5A 3CIJA 3TZAA 4H5FA 2V3QA 1VE4A 1DTZA 3MZ1A 1NNFA 3K4UA 4XKRA 3KFMA 4OHNA 1LAFE 1SD3A 4NF5A 4H67A 2E0SA 1GTKA 1NFTA 4OEVA 3M3LA 4OESA 4DLDA 4F18A 2HEUA 4N13A 2ONRA 4Q5TA 4ESXA 2D3IA 2GHAA 4F3PA 5I2NA 4E0WA 2GFEA 2O69A 3VVFA 2HZLA 3VVEA 5EYFA 4JXIA 1BP5A 4RK2A 1JW1A 2ZNUA 4KR5A 3MPLA 3S4UA 4ZEFA 5F7VA 3RLFE 2DWHA 3PMXA 2DXYA 4ZEBA 4YMBA 3I3VA 4YU0A 3T93B 1D3KA 1WDNA 3LSLA 4WEDA 3UGWA 4HS7A 1DSNA 5EHSA 2DQVA 1MRPA 1POTA 3IOTA 3I6VA 2X7QA 4MLQA 5IKBA 3C32A 2XD3A 3A09A 2O84X 1LAXA 1TT1A 1FCKA 4YKJA 4F19A 1NMUA 3K1PA 3CI8A 3EQ1A 2HQ0A 2H4IA 5HPQA 4NF4B 4OZ9A 2XXVA 3IB1A 4ELOA 4JSDA 4ZDMA 4WEPA 3AXFA 3RTWB 4H0WA 3O28A 1IUDA 3QUJA 3KN8A 3ECRA 3OEKA 1BIYA 1S9TA 2O1LA 3OO8A 2F36A 3EPEA 3V83A 1NH8A 2Z8EA 3IO4A 4GIZA 3JYRA 2RCAA 3IOVA 2YLNA 4OENA 1IITA 3K1NA 1PC3A 1Y20A 1OVTA 3O2AA 3B7DA 4QFKA 1ZU0A 3TELA 3OSRA 1QJMA 4U1ZA 2Y84A 1JW4A 1KWHA 2OWTA 1B5IA 2I3VA 1WVJA 3FIRA 3FASA 5AA2B 3JZJA 1N7WA 3VXCA 2DXRA 3MP6A 2VHAA 3PMVA 3HSTA 1EZ9A 1N7XA 2O6AA 3OXNA 1TWYA 5IAIA 4RJZA 2HAUA 2DE2A 4F3BA 2FYIA 1B4HA 2X26A 1MS7A 3FJGA 4FAJA 2QSXA 4PFYA 3W9VA 4XTCQ 2Q89A 5CMMA 3D4CA 5H8SA 3G7WA 3VFJA 1MXWA 1Y3QA 2QS4A 3O6IA 3E13X 3EHTA 5FHMA 4ZE9A 3FZVA 4G4PA 4U23A 4PP0A 1B3GA 3IK6B 2Y7WA 4RPOA 2ZXTA 1Q1KA 4X1BA 1B7ZA 1EZOA 1XT8A 4Z7EA 1PDAA 2Z8FA 3TCFA 3OO7A 4G68B 2XXPA 2A5SA 2O68A 1A8EA 3IOWA 3VLWA 1NNTA 4NTLA 1B4ZA 1A55A 1II5A 3HV1A 4Q30B 2F7BA 4FEDA 3RNNA 2F6PA 1ZIUA 4KD5A 4PFTA 4R6HA 4QRZA 2RC7A 4EDPA 5KZTA 4NWCA 5H8HB 1A99A 4DIGA 2E1SA 4NE4A 1DMBA 4LQ2A 4NMYA 4GXAA 1IIWA 1I6BA 3E4RA 1RYXA 4LATA 4I1DA 3IB2A 2ZYOA 5BWJA 1FQEA 3TFLA 1MQHA 3CG1A 5KCJB 4R73A 1R9QA 4GRKA 2PX1A 1MH4A 3M8UA 2XX9A 2BJJX 2B65A 5AA4A 2THIA 4KFQA 3CSBA 2ABHA 3R26A 4EXLA 4TLMB 2GH9A 4JWYA 4H5GA 1IXGA 4DE8A 1LFGA 4JSOA 2ANJA 4OXVA 1GGGA 2V25A 5CI5A 4Z0IA 3K6UA 3C4MA 1XOCA 1LFHA 4C1TA 1MDP1 2VP1A 4LONB 1FTJA 3RUMA 4BDMA 3PUVE 4R6KA 3N6TA 1RYOA 1USYE 3CVGA 2Q88A 3FV1A 1CE2A 4RK9A 3PUYE 1MDQA 2I0CA 1Y9UA 2XHDA 1PB8A 1T0KA 3CRBA 4FECA 1JVYA 1H45A 3Q28A 1P99A 1D9VA 4KYEA 4NF8B 1UTBA 3VXBA 5I56B 1MXZA 1CB6A 2QS1A 4R2BA 5FTHA 1GV8A 3T96B 4YAHX 2RCBA 4ECFA 4IO7A 4E0XA 2F35A 2QS2A 3LSFB 2H98A 1USYH 2ONSA 4KQPA 4X1DA 5H8FB 4DCXA 2XXTA 5L9SA 3K6WA 1R9LA 2ONKE 1SW5A 3W9WA 4POXA 4FORA 2CMOA 2FNCA 5TU0A 4YMAA 3S2VA 5I57B 1M5CA 2Y7KA 3T9HB 4POWA 1MPDA 2V3UA 4OFLA 2OBGA 2PBWA 1JW5A 3TTKA 1B6HA 4JWXA 3MVXA 3THIA 2DWIA 5ISUA 3G3JA 2I4CA 1FQBA 4IY5A 1QKBA 2PT1A 3KJTA 2M8CA 1RKMA 4OVJA 1UIUA 4OWDA 5B70A 4C0RA 4O3BA 2NOOA 3BFTA 3FATA 1O7TA 3QUFA 4ZEDA 5HM4B 3S9MC 3DP4A 3MP8A 2Y7IA 2DP8A 1M5FA 4P11A 3RGYA 4O3AA 3VLUA 1PBPA 4PETA 3CFLA 5CMKA 4P0GA 3U8QA 3GBBA 4BDNA 3VVDA 1OMPA 1S50A 1FW0A 4G8HA 2RC8A 2O1MA 3W15C 2OLBA 2QMXA 4I9DA 1AH5A 4H8IA 3FVKA 4IGTA 1J1NA 3O9PA 1LGBC 2I3WA 2F7AA 1XHYA 2F97A 1R6ZA 1B9JA 4DDDA 3OMBA 3H6WA 1B3LA 4M4GA 3EF7A 1SBPA 2VOZA 5ITOA 2Y7PA 4XXUA 3USDA 5DVIA 3H7MA 3OSQA 4EXKA 1JEVA 5AA1A 5K2YA 5A5XB 1B0LA 4QSDA 1Y4TA 4P0IA 3MBPA 4R75A 3UN6A 3B6QA 1GR2A 3M3FA 4LZ5A 3E3KA 3PD8A 3N6UA 1GVCA 1MXXA 1O64A 5TPAA 2F78A 2QS3A 5I59B 4KCDA 1SYIA 3TPAA 4LZ8A 1JEUA 1B7HA 4ZE8A 2XXXA 4OERA 3KOSA 3HCQA 3TTLA 3CSGA 4OFJA 3LUYA 3QK6A 3FXQA 4DCYA 4I62A 4EUOA 1M5EA 3ZKKA 3HO7A 3G3HA 1XVXA 3KGCA 3QIMA 1P1QA 3PPNA 5AA2D 2UVGA 2QPQA 2D5WA 4HCWA 1QULA 2I49A 3TYHA 5H8NA 1B40A 3TCGA 4C1UA 2AIXA 1MQJA 5HBCA 2REGA 5JK4A 5CMBA 4RNSA 3D4GA 1BLFA 1SDXA 5KDTA 3VV5A 3DP6A 3GBAA 4PQJA 4QFLA 1DTGA 5DTBA 1N0TA 1LCFA 3IL1B 1TFAA 4QF9A 4GFRA 5TP9A 2RF1A 1B3EA 3V8XB 1MY1A 3L6HA 1BKAA 1N04A 1LB9A 1MH3A 1H3DA 1MXYA 1Y4CA 3T9VA 2Q8JA 1B46A 4BDOA 4DZ1A 2R71A 4YKPA 3N5LA 2Z23A 4ZECA 1SI0A 1SW1A 3TEPA 5ICTA 3JV9A 3RN8A 1PEBA 2AL5A 2F34A 1H76A 2QJEA 1HSEA 3KZGA 4QHQA 4R72A 1FQDA 1IQ7A 3KJ7A 3SEWA 3ZKLA 1UQWA 3LSXA 1NNKA 1D4NA 2RC9A 3S9EA 4LVQA 1Z7NE 4XIGQ 1DPPA 4F3GA 3PUZE 1FTOA 3TAJA 5ELVA 4H6DA 3H06B 3GLBA 4ELQA 2H25A 2A5TA 2ZYMA 4K3FA 3IOUA 4KYSA 4F2QA 5JTYA 3A3CA 5M2VA 1MXUA 3C31A 3SKPA 5H8HA 2X7PA 1A7LA 2UXAA 3KOTA 2P0SA 4BLAA 4LUBA 3B6WA 4IO2A 1UIVA 2I4BA 1DOTA 4LA9A 3H6VA 3RPWA 3OD7A 5DEXA 3KEIA 1B0HA 1QUJA 4GVOA 3QXMA 4U22A 3RQTA 3VLVA 1VR5A 3T9UA 4ZZAA 1B52A 1SYHA 1SW4A 5KCJA 1H43A 4ND9A 5I2KA 4ELRA 3G3KA 5DVFA 3OENA 3K2DA 4FIMA 4GF8A 1B5JA 5EHMA 2R9JA 3B6TA 4PE5B 1R1NA 4G8MA 1Y3NA 1OQGA 2DE3A 1B32A 1FQFA 3GZGA 3PPOA 3PU5A 2NUVA 3UA8A 2UYFA 1EU8A 3MJNA 3LR1A 4KYDA 1I6QA 1OLAA 2O51A 3OOAA 1N76A 2OWSA 3MZ9A 5AE4A 4TQUQ 2XXIA 4HTGA 1ZLQA 2AL4A 3Q26A 3FJMA 3KBRA 3OO6A 4ZEIA 1WODA 1FQAA 5AA4B 1B51A 2VD2A 1Y1ZA 4DXBA 1SQYA 3MWBA 1IXHA 1OIBA 4BDQA 4THIA 3RT6B 1MY0A 3K01A 3C9HA 4U4SA 2DYXA 5I58A 4TLLB 3DP8A 2NWJA 3IX1A 1YTVA 2ZYKA 4O3CA 3G3FA 3FGSA 4NF8A 4QSCA 1IZ1A 3E9XA 1H44A 1MPBA 2DWAA 4LP2B 3BBRA 1EZPA 3G3IA 2HFBA 3LSWA 4IGRA 3R6UA 1B1HA 4KCCA 3TUSA 3SETA 2Q9TA 1N3WA 4UACA 1F9BA 5H8FA 2V84A 1MY4A 3S9NC 1LBCA 3HHFA 1ANFA 3KN7A 2Q2AA 3PV0E 2W7YA 5DT6A 1O63A 4NF6A 3WAEA 1JETA 1UTHA 4EQ9A 4U4XA 5I57A 2ZNTA 4F1UA 3H6UA 5FHOA 1VSOA 3FD3A 4F1VA 2FA7A 3C34A 4RYAA 2F6GA 4R9FA 4YKKA 3M3KA 2ALUA 1QKAA 1AIVA 3O6GA 1OVBA 4FATA 3S9LC 1JNFA 5AA3A 4PFUA 1HSJA 3U94A 3QYTA 1B1XA 1MY3A 5H8QB 1MG1A 3VDFA 1AMFA 2OCUA 3OELA 4L17A 2NVUB 1B3HA 1LFIA 1MXVA 1OQHA 1IXIA 4KHZE 1XS5A 3TMGA 1DPEA 3K02A 3C33A 4JDFA 1MQDA 3TTMA 1A8FA 3IO6A 4N6PA 1US4A 2Y7RA 4JBZA 1XVYA 4OETA 3O66A 3SESA 5L8DA 4NF5B 3FUZA 1FTMA 2HAVA 4YB6A 3T66A 3H03A 4ONYA 2ESNA 3EN3A 1A40A 1P1NA 1VFDA 1AL3A 4OMBA 4QFOA 5K2XA 5I2NB 4MF3A 2DVZA 2GRVA 4H1XA 4G2ZA 4YZZA 4OFOA 2OK2A 2DOJA 2UVHA 1URDA 5F1QA 3ZSFA 4F39A 3CG3A 1I6AA 2ZMBA 1B05A 3C35A 3O29A 2XXRA 4GLIA 3MVYA 3IR1A 3SDFA 2RINA 5L9OA 4G77A 5A5XA 4YICA 1ZBMA 1QW0A 2Z22A 3ILTB 3U92A 3ONMA 5CM6A 2V93A 4KPTA 4FEBA 1Y3PA 1MY2A 4Q8RA 3L6GA 2H99A 4ZEKA 2QRYA 3MAMA 5I59A 2XD2A 2G93A 2F5XA 4F2OA 4EQ7A 4DXCA 3SEXA 2G29A 5CMCA 1NL5A 2O7UA 4NF4A 3HPIA 3PPRA 2AYSA 2RKMA 3N94A 3DELB 3K1MA 4X9TA 2Q2CA 1IXCA 4JWOA 1NH7A 4R9GA 3FXRA 1N84A 1ZMGA 2I58A 4BDRA 5ITPA 4IY6A 4MH5A 3RT8A 4F29A 4AQ4A 2V3TA 4BDLA 3DLNA 5TPAB 4YKIA 3HN0A 4U2RA 3SEVA 3MP1A 1IEJA 2I0BA 4XKQA 3DM0A 4H65A 4G8NA 4GD5A 3U72A 3O6HA 1MQGA 4HW8A 1Q35A 3EHSA 4WKMA 2QL3A 3UORA 3Q27A 4F3SA 1QVSA 3OEMA 4QFNA 5CBSA 3Q25A 1B5HA 4EF2A 5B7DA 2I6EA 2PT2A 4X48A 3N26A 3GXAA 3FVOA 1LSTA 2F8DA 4JB7A 4AB6A 1QUIA 3TTRA 4MLVA 4ELPA 1QUKA 3ZS6A 3MW0A 5AA2A 1Y1MA 2XXYA 3H6TA 4YB7A 1M5BA 3PUWE 3I5OA 3KSJA 3MQ9A 4U1OA 5H8NB 3K0VA 3K6XA 2PVUA 1B58A 1MM6A 3MVZA 2H5YA 5DVJA 3SEYA 4LZ7A 1LCTA 1JVXA 3LC8A 4QSEA 2DWJA 3EHUA 4DXUA 3UK4A 5KDTB 2I48A 1JQFA 4GL0A 1ZTYA 2HXWA 1TXFA 2P2AA 5CRYA 3C36A 1US5A 5TP9B 2DS9A 4IO5A 2UVIA 4OTEA 1YCJA 3FJ7A 2O7IA 3PPPA 4F1YA 3CFZA 4IB2A 3F11A 3MC2A 2F7CA 4F31B 5FHNA 3G3GA 2XX7A 4ZZEA 4G68A 1FQCA 3V5AA 5BUUA 2DE4A 4XKPA 4IO3A 2UYEA 3U93A 1MQIA 4XKNA 1MPCA 4ISUA 3TQLA 2PYYA 1YPNA 3UIFA 3FVNA 2XXWA 4ZS9A 3WAFA 3T9XB 1ZJLA 1LBBA 2D21A 3IORA 2B3BA 1B3FA 1VFEA 4OEUA 3O97A 4QFPA 2NXOA 3MVWA 1SVXB 2KLFA 3PMWA 2YPNA 3R7XA 4IO6A 2A5TB 2QMWA 4OYVA 3QAXA 1FTKA 4R2FA 1MM7A 5CC2A 5JTYB 4IO4A 4GL8A 2XXQA 3ILUB 4FE8A 2PMSA 3FV2A 3BFUA 4N07A 3K6VA 2WKYA 2P1SA 5DEXB 3P7IA 3QSLA 2IA4A 3KSXA 2XX8A 4GWOA 3K00A 4H8JA 4EQBA 4F22A 2UVJA 3IAZA 2ZYNA 1SI1A 3OO9A 2DSFA 4TOZA 3BKIB 4GXSB 2LAOA 5I2KB 1SW2A 1TFDA 4GOTA 1LAGE 3UP9A 1ZKBA 4M1VA 3IB0A 4R74A 5ICQA 1EH3A 1N3XA 1I69A 3RY3A 3V89B 3PD9A 1S7YA 1A54A 3FVGA 4I8CA 4OQOA 1PB7A 4GQOA 4YB5A 1YAEA 4NEDA 1URGA 2CZLA 2OZZA 3VE1B 1M5DA 3TQWA 4RPNA 2DVCA 5LOMA 1BTJA 4PFWA 4U21A 3TCHA 3KN3A 1FTLA 3TKDA 1XC1A 4RY1A 2XXUA 4NWDA 2Z8DA 2R6GE 2VD3A 4MBPA 1P1WA 1PBQA 4FJPA 5I56A 1URSA 1HSLA 3TTNA 3U1OA 1ELJA 1D9YA 3IJXB 5I58B 2ZNSA 3SEUA 1NKXA 1B2HA 4HCYA 4R6YA 1L5TA 1P1UA 5JEIA 2B3FA 3MPKA 4RA1A 1NNPA 3MZBA 2HZKA 3H3GA 3A3UA 3PPQA 2XXHA 1LLSA 3CR9A 1UTBB 3LBSA 1POY1 1Z7ME 2OJTA 3MUQA 5DYHA 3IJOB 4EF1A 4RXLA 1LB8A 4G68C 2REJA 5FTIA 5J1DA 2IEEA 3SERA 3TODA 1PB9A 3HHGA 4ESWA 3RTFB 3PGFA 1AOVA 1ATGA 2YJPA 3ODBA 3Q29A 4NF6B 1UTHB 1B7UA 2HCAA 5H8QA 4MFIA 4WXJA 4UA8A 1P1OA 5L9MA 3KG2A 4AB5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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