4F1VA

Subatomic resolution structure of a high affinity periplasmic phosphate-binding protein (pfluding) bound with phosphate at ph 8.5
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
MDINGGGATLPQALYQTSGVLTAGFAQYIGVGSGNGKAAFLNNDYTKFQAGVTNKNVHWAGSDSKLSATELSTYASAKQPTWGKLIQVPSVGTSVAIPFNKSGSAAVDLSVQELCGVFSGRINTWDGISGSGRTGPIVVVYRSESSGTTELFTRFLNAKCNAETGNFAVTTTFGTSFSGGLPAGAVAATGSQGVMTALAAGDGRITYMSPDFAAPTLAGLDDATKVARVGKNVATNTQGVSPAAANVSAAIGAVPVPAAADRSNPDAWVPVFGPDNTAGVQPYPTSGYPILGFTNLIFSQCYADATQTTQVRDFFTKHYGASNNNDAAITANAFVPLPTAWKATVRASFLTASNALSIGNTNVCNGIGRPLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Phosphate-binding protein
molecule keywords Putative alkaline phosphatase
publication title The molecular basis of phosphate discrimination in arsenate-rich environments.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas fluorescens
total genus 119
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f1vA02
3.40.190.260 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 4f1vA01
2HAUA 2FA7A 4ZEIA 4P0IA 1DPEA 5M2VA 2VOZA 3IAZA 3K1PA 2GFEA 1MXVA 3BBRA 4L17A 4EUOA 4ZDMA 5CBRA 4F3BA 2XXVA 2XX9A 4OEUA 2UYEA 3GXAA 2NWJA 3U94A 3MW0A 2V93A 2QS3A 1BP5A 4NWCA 4H5FA 3V8XB 3CSBA 1GV8A 4OYVA 3SEXA 1EZPA 1XS5A 3U93A 5L9OA 5A5XB 1UIUA 4OMBA 5ITOA 2AL4A 4BDLA 4ESWA 3IO4A 1Y3QA 4R73A 3QYTA 3ZKKA 3D4GA 3B6TA 3ZSFA 1QVSA 4XKQA 2ABHA 3FZVA 1WDNA 3QUJA 3HV1A 1AMFA 3TCFA 3LSXA 3OMBA 4POWA 3VVEA 4XKRA 4ZZAA 1AH5A 4GRKA 2R6GE 3R7XA 3T9VA 2FNCA 4K3FA 3JYRA 3FJ7A 4UA8A 4H1XA 3LSLA 4OFLA 3BKIB 3EHUA 4Z0IA 1II5A 2OCUA 1MRPA 3RUMA 3UN6A 3CR9A 4MLQA 1LAFE 2P2AA 3D4CA 3OSQA 4G8HA 4I9DA 4YKKA 2O1MA 3VLVA 4QF9A 1MQHA 1RKMA 2DVCA 4TOZA 1MQGA 1MDQA 2OWTA 3PGFA 4F31B 4ELOA 4EF1A 3PMVA 1B7ZA 3KG2A 1SI0A 1SYHA 3DP6A 4AB5A 1LSTA 4NF6B 2I3VA 3TZAA 4X9TA 3ILTB 2DOJA 4RPNA 4BDOA 1IEJA 2ZNUA 4R9FA 1SW2A 1MY4A 2ONKE 3E3KA 3RTFB 3T22A 3TTRA 4KD5A 3S9EA 1PEBA 1TWYA 3G3JA 2YLNA 4GF8A 5I56A 1B40A 3HHGA 4XKNA 4DLDA 4XXUA 1UTHA 2E1SA 3H6TA 3W9VA 2ANJA 2O7IA 4F1VA 3A3UA 3CI8A 4QHQA 3C36A 3C9HA 3BFTA 5CBSA 2O7UA 1PB8A 4ZS9A 1B5IA 2UXAA 1LBCA 3IB0A 3L6GA 5AA4B 5AA2D 1ZLQA 4PP0A 3FJMA 3MPLA 3H4ZA 5JTYA 1VFDA 3S4UA 5DVIA 3U92A 2HAVA 1MY2A 1LAGE 4DCXA 1I6BA 3TMGA 3TODA 3TCGA 1GVCA 4F22A 3QXMA 1QUJA 4EQ9A 4GXSB 4C1UA 1D9VA 4U4XA 3T9XB 5DT6A 2I49A 3MC2A 4EQ7A 4H65A 4BDQA 2A5TB 2XXXA 4ISUA 3FVGA 3OEKA 4E0XA 3RT8A 1ZTYA 3Q25A 4ELRA 4C0RA 2X7PA 2O69A 4FJPA 3JV9A 4NWDA 3A09A 4HCYA 4YB6A 5J1DA 1LCFA 3RQTA 1RYXA 2NXOA 3O29A 3T66A 1Y4TA 1NH7A 3HO7A 2UVHA 4LA9A 3DM0A 3N94A 2Z22A 1MDP1 2PBWA 4FAJA 4F39A 1LFIA 3MBPA 3FATA 1NFTA 2RINA 2XX7A 4R6YA 5L9MA 4R72A 5ELVA 1FQDA 4KYSA 4ZEBA 1FTMA 2DSFA 5ICQA 3EN3A 3V5AA 1N7XA 2AL5A 1JW1A 2ZYNA 2XX8A 4RA1A 4THIA 3PPRA 5AA3A 4ZE9A 4ELPA 4KFQA 1IXGA 3T96B 1L5TA 1LBBA 4QSCA 2WKYA 2Z8DA 4RYAA 4GQOA 1MPBA 1OQHA 1NNTA 3O97A 1MXZA 5IKBA 3EF7A 1HSJA 3N5LA 2QL3A 2V3TA 5CI5A 3FIRA 4OESA 1B51A 4GOTA 5I2KB 5H8HA 2G93A 3CFZA 3G3GA 5H8FA 4BDMA 3TPAA 3IX1A 4WKMA 3IR1A 2XXQA 3C31A 3S9NC 1YAEA 3I6VA 3LSFB 1Y3NA 2XXTA 4R2BA 1B46A 5EYFA 3F11A 3HHFA 2Y7KA 2QRYA 3H7MA 4IGTA 4JXIA 3TTNA 3OD7A 4FEBA 3CSGA 4QFPA 3GBAA 5DYHA 1NL5A 4YAHX 1A99A 4G68B 3OO7A 3FXRA 1OLAA 3TAJA 3U8QA 4MF3A 1H76A 4RNSA 1Z7ME 2DWHA 2NVUB 5TPAB 3KJ7A 1LFHA 5FTHA 3FXQA 1H3DA 1MH4A 1B4HA 1XC1A 5I58B 4PFTA 3MVWA 4IB2A 4GVOA 5I57B 3TKDA 4QFOA 1US4A 1I69A 2UVJA 3MVYA 3PU5A 1URSA 4JB7A 1R9LA 1IITA 1JEVA 1PB7A 1SYIA 5EHSA 1OVTA 2O68A 3GLBA 2F7BA 5DVJA 3IB1A 3QIMA 1IXHA 5AA2A 3K6VA 3DLNA 4ZECA 3KOSA 4H0WA 1TFAA 3OO8A 2ONRA 2HCAA 2UVGA 3FASA 4NEDA 4NF8B 1OIBA 2Y7RA 2HFBA 1NMUA 4IO6A 3O6GA 1A8EA 3EHTA 4YKIA 5A5XA 3RN8A 4MFIA 2UVIA 2R71A 3OELA 3HCQA 2PT1A 2ONSA 1R6ZA 1RYOA 4HW8A 4OTEA 1B3EA 1MQIA 3U72A 5CMCA 4IY6A 1NH8A 4YMAA 3DP8A 2PVUA 5I59B 2CMOA 3TEPA 2V3QA 2H25A 3QK6A 4ZEFA 1FTJA 1D3KA 2ZMBA 1DTGA 1MXUA 1LB9A 2R9JA 4OENA 1FQEA 2H98A 1A55A 4U23A 2QS2A 2RCAA 1S9TA 2G29A 2AYSA 3VLWA 3IB2A 3MVXA 2CZLA 3GZGA 1POY1 5ISUA 2THIA 2Z8EA 1P1UA 2XD2A 1EZ9A 4ZZEA 3UK4A 3ILUB 3VLUA 1B32A 4JSOA 3QAXA 3PUVE 3L6HA 1QW0A 1SVXB 1N3XA 3UP9A 3M3LA 4I8CA 5CMMA 3KN3A 4WXJA 4BDNA 1LGBC 1UTBB 3VE1B 4NF6A 4DXBA 3I5OA 2F6GA 3KFMA 5CRYA 2XXYA 3K6UA 5ICTA 4EDPA 1H45A 2I6EA 3M3KA 3MP1A 1N0TA 2ZYKA 4OFJA 4HCWA 3M3FA 3AXFA 4OZ9A 3MP6A 3FGSA 5K2XA 5H8QB 4AB6A 1SW5A 1FW0A 1JEUA 4OWDA 1P1OA 1PB9A 1N04A 4R74A 1P1NA 2OBGA 1O64A 3BFUA 4JWXA 3E9XA 4GFRA 1JNFA 3T9HB 1XHYA 2H9BA 4R6HA 2D21A 1VSOA 4XIGQ 5KDTB 3FUZA 4DE8A 4Q30B 1MXYA 4IO7A 3SEUA 3UA8A 2QSXA 1FTKA 5FHMA 4PFYA 2AIXA 3O28A 5AA4A 1GR2A 3HPIA 1B5JA 4OERA 4QFKA 2GH9A 3MZ1A 4Q8RA 1XOCA 3CG1A 4GL8A 2ZNTA 1N3WA 1ZKBA 1GTKA 3EQ1A 4NTLA 5I2NA 1QJMA 4KR5A 1PBPA 3CVGA 4BDRA 2I4BA 4R75A 4H6DA 5B70A 3PUXE 5HM4B 4AQ4A 3ZKLA 1HSLA 1SBPA 2YPNA 4HS7A 4O3BA 3I3VA 1H44A 2PMSA 3OO9A 2IA4A 1JVXA 5FHNA 2RC9A 4R2FA 4KYEA 1B3HA 1GGGA 3IOUA 3KN7A 2ALUA 2YJPA 4P0GA 3TCHA 1FQFA 4FEDA 4X1DA 2V84A 1Z7NE 4X1BA 5TP9B 4YMBA 1Y4CA 3UGWA 2REGA 1POTA 4F1YA 1IIWA 4E0WA 3IOTA 2HZLA 1B5HA 4WEDA 5I56B 4M4GA 1B2HA 3UIFA 1TFDA 4PETA 1QKAA 4LZ7A 1SW1A 2DWJA 2VGQA 1LLSA 1B0LA 4LONB 3K1NA 3HN0A 1UQWA 4C1TA 4FORA 2VD2A 1N84A 2PYYA 1CE2A 2XD3A 4U4SA 3MJNA 4FE8A 2HZKA 5HPQA 3R6UA 3KGCA 4GWOA 3T9UA 4M1VA 3CIJA 1I6AA 1B52A 3O6IA 5BWJA 2DWIA 4R9GA 1SQYA 5DEXB 4JSDA 4YICA 5I2KA 2RCBA 5F7VA 4KCCA 3VV5A 4LP2B 2Q89A 4MLVA 3QUFA 1NNKA 2PX1A 3KSJA 4OEVA 1XVXA 4ZEKA 2DE3A 3MPKA 2Q8JA 5KCJB 3LR1A 4NF5B 3C4MA 3PD8A 2VP1A 3K02A 4IY5A 4ECFA 5AE4A 1US5A 3DP4A 2OWSA 3SERA 3OOAA 4LATA 4DCYA 2I0CA 5JEIA 1SI1A 1VE4A 5DTBA 1B1HA 1ZMGA 4G68A 3SEVA 3IJOB 1MQDA 1LCTA 2GRVA 1YCJA 2X7QA 1FCKA 1EH3A 1OQGA 3B7DA 2QJEA 5I84A 2XXRA 3RPWA 2DE4A 3MVZA 5TPAA 1NNFA 5FHOA 4OETA 3V89B 3PV0E 1MS7A 2I0BA 3DELB 3P7IA 4R6KA 2LAOA 3G3FA 1A54A 5I58A 3M8UA 3LSWA 3ECRA 3KJTA 3TYHA 5I57A 1TT1A 4LUBA 4F2QA 3LBSA 4U1ZA 4I62A 4LQ2A 3KBRA 3EHSA 2F7CA 3VDFA 3W9WA 3SKPA 1DMBA 1OLCA 5JK4A 1ZIUA 2F7AA 3GBBA 3FV2A 3N26A 1YTVA 3RTWB 1ATGA 1Y1MA 2ESNA 2XXUA 4F19A 3IO6A 2X26A 3N6TA 3G7WA 1QULA 1JVYA 3SESA 4EQBA 5ITPA 3RNNA 4NF8A 1Y20A 2A5SA 1ZBMA 2VHAA 2P1SA 3OENA 2Y84A 2XXIA 3Q26A 1QKBA 4G77A 3LC8A 3B6WA 3MAMA 5H8SA 1Y3PA 4X48A 3CFLA 2ZYMA 3K0VA 4GIZA 5I59A 3WAEA 1JETA 1MM6A 4QFNA 1MY1A 1M5DA 4KQPA 1MG1A 3FD3A 3U1OA 5H8NB 3PPNA 2P0SA 4KPTA 2O6AA 4DZ1A 1MY0A 3PMWA 4F1UA 1D9YA 4LVQA 1I6QA 1VR5A 1O7TA 4XKPA 4H8IA 3V83A 1P1QA 4U22A 1A8FA 3H6UA 1FQCA 2HEUA 2F5XA 1USYH 2O1LA 4NF4B 3T93B 4GLIA 1JW5A 3RY3A 1PDAA 1OVBA 2F8DA 4Q0CA 1MPCA 3O9PA 3E4RA 2RKMA 1AIVA 3RGYA 4ESXA 4IO3A 4TLLB 4ND9A 2F34A 3K2DA 3K6WA 4YB5A 1M5FA 1SW4A 1B05A 3PD9A 3PUZE 4P11A 2Q9TA 4JWOA 1SD3A 5KZTA 1UTBA 1N76A 5AA2B 1NNPA 2E0SA 1R9QA 1MY3A 2RF1A 2M8CA 3MQ9A 4OVJA 2H4IA 3RLFE 1B3FA 3LUYA 4KYDA 3G3KA 1LAXA 3Q28A 3H6WA 3QSLA 4YZZA 3IORA 4PFUA 3RT6B 1B0HA 2QMXA 2RC8A 1B7UA 5H8QA 3TTLA 4RPOA 1T0KA 4IO2A 1S50A 2H99A 3KSXA 1TXFA 3CG3A 4KCDA 4UACA 4JDFA 1WVJA 1QUIA 2DE2A 5KDTA 1PC3A 3C35A 4WEPA 2F78A 4HTGA 1S7YA 3K4UA 1IXIA 2DS9A 1M5CA 3Q29A 3O66A 1ZU0A 3ZS6A 4DXCA 2NUVA 4BLAA 3G3HA 3H06B 4ZE8A 3OO6A 4ZEDA 4OQOA 5CC2A 3TQWA 4RK2A 4RK9A 3IOVA 4EF2A 4YKPA 4ONYA 2BJJX 4H8JA 4G4PA 2IEEA 3VXBA 2RC7A 5K2YA 1B3GA 3KZGA 1F9BA 4DDDA 1R1NA 1FTLA 1P1WA 4Q5TA 5HBCA 2B65A 1HSEA 4H67A 3KOTA 5F1QA 3SEWA 3TUSA 3PPOA 4I1DA 1DTZA 4F3SA 4U2RA 4G8MA 2DP8A 1DPPA 3KN8A 3MWBA 2I48A 2B3FA 5TP9A 4NE4A 2F35A 3PUYE 1O63A 4O3CA 1LFGA 3OEMA 4MH5A 4Z7EA 2A5TA 4GXAA 5B7DA 2OZZA 3K01A 4YB7A 3K1MA 3SEYA 3MZ9A 1FQBA 1N7WA 3ODBA 4DIGA 4QRZA 2Y7WA 4OXVA 4FECA 5CMBA 4RY1A 1PBQA 4JWYA 3VVFA 2QS1A 1B3LA 1BIYA 1XT8A 3CFXA 1MXWA 3C32A 3PUWE 1Q35A 3K00A 1MH3A 2Z23A 1B1XA 1MXXA 3FV1A 5AA1A 2W7YA 3B6QA 4F3GA 4MBPA 2ZYOA 2O84X 4XTCQ 4YKJA 3JZJA 4IGRA 5I2NB 3A3CA 3ONMA 5DEXA 1UTHB 2QMWA 3SDFA 1Y9UA 3FXUA 2Q2AA 4F2OA 4FIMA 4U21A 3TTMA 2OLBA 1B6HA 4OHNA 1ZJLA 3MUQA 3TELA 1B4ZA 3OSRA 5KCJA 1UIVA 5DVFA 1J1NA 4G68C 2UYFA 4NF5A 4EXLA 3K6XA 2OK2A 3SETA 3O6HA 3TFLA 1USYE 1JW4A 2DQVA 5JTYB 2Y7IA 1Y1ZA 4PFWA 2D3IA 3MZBA 3VXCA 2D5WA 1IQ7A 1B9JA 1NKXA 2B3BA 4TLMB 4LQ5A 4FATA 2DVZA 2DXRA 4DXUA 1BTJA 2V25A 3R26A 3FJGA 4F3PA 2XXWA 2F36A 2F97A 2DYXA 3FVOA 1QUKA 3FVKA 3PMXA 1FTOA 1MPDA 3TQLA 4PE5B 2VD3A 4LZ8A 2NOOA 4N13A 3TDJA 1MQJA 2QPQA 4PQJA 3MP8A 4N6PA 3G3IA 3O2AA 1P99A 4G8NA 2Q88A 2XXHA 1IUDA 1BKAA 4JBZA 2XXPA 4O3AA 4GL0A 1H43A 1B58A 2DWAA 2DXYA 5CM6A 5IAIA 1M5EA 3THIA 3TTKA 5CMKA 4IO5A 2XHDA 5TU0A 1ELJA 1URGA 3S9MC 3S9LC 4LZ5A 1OMPA 3FVNA 4RJZA 4QSDA 4H5GA 4IO4A 3W15C 1LB8A 1DOTA 2I3WA 2HQ0A 3OXNA 2Y7PA 4F18A 2V3UA 5EHMA 4U1OA 3EPEA 3CRBA 1FQAA 2GHAA 4KI0E 2GHBA 3N6UA 4NMYA 3H6VA 2QS4A 4QSEA 3KEIA 3H03A 4QFLA 2H5YA 1SDXA 1VFEA 1A40A 2HXWA 3HSTA 2REJA 5H8HB 2Z8FA 5H8NA 4OFOA 5H8FB 5BUUA 1AOVA 1Q1KA 1CB6A 4EXKA 2O51A 2Q2CA 1AL3A 1LAHE 4G2ZA 4ELQA 2I4CA 1MM7A 1IXCA 2FYIA 1XVYA 3IOWA 3UORA 4NF4A 2I58A 3C34A 5LOMA 3PPPA 3H3GA 4YU0A 1EU8A 1JQFA 4N07A 3IK6B 1YPNA 4TQUQ 3USDA 4KHZE 1URDA 1B7HA 2ZXTA 2ZNSA 5L9SA 1IZ1A 1EZOA 3PPQA 4GD5A 3E13X 3VVDA 3VFJA 1DSNA 1WODA 3C33A 1D4NA 1M5BA 3Q27A 3WAFA 1ANFA 2PT2A 1A7LA 3IL1B 1KWHA 5FTIA 2OJTA 4RXLA 1BLFA 4POXA 2KLFA 2F6PA 4F29A 3S2VA 5L8DA 3IJXB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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