4F1VA

Subatomic resolution structure of a high affinity periplasmic phosphate-binding protein (pfluding) bound with phosphate at ph 8.5
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
MDINGGGATLPQALYQTSGVLTAGFAQYIGVGSGNGKAAFLNNDYTKFQAGVTNKNVHWAGSDSKLSATELSTYASAKQPTWGKLIQVPSVGTSVAIPFNKSGSAAVDLSVQELCGVFSGRINTWDGISGSGRTGPIVVVYRSESSGTTELFTRFLNAKCNAETGNFAVTTTFGTSFSGGLPAGAVAATGSQGVMTALAAGDGRITYMSPDFAAPTLAGLDDATKVARVGKNVATNTQGVSPAAANVSAAIGAVPVPAAADRSNPDAWVPVFGPDNTAGVQPYPTSGYPILGFTNLIFSQCYADATQTTQVRDFFTKHYGASNNNDAAITANAFVPLPTAWKATVRASFLTASNALSIGNTNVCNGIGRPLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Phosphate-binding protein
source organism Pseudomonas fluorescens
publication title The molecular basis of phosphate discrimination in arsenate-rich environments.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative alkaline phosphatase
total genus 119
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f1vA02
3.40.190.260 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 4f1vA01
1NMUA 1BTJA 1SBPA 3CG3A 1LAGE 1B1HA 4I62A 2E0SA 1DOTA 3EN3A 5H8QB 1R6ZA 3THIA 1OVTA 4MF3A 3ECRA 1PBQA 5DTBA 3S9MC 3MP1A 4YKPA 3IJXB 3TTRA 2QMWA 4GXAA 4ZEIA 1OQHA 3S9NC 1MXZA 3N6TA 3ONMA 1N04A 3DP6A 1DPPA 1GTKA 3K1PA 1YTVA 3TQLA 3H4ZA 2B3FA 4R9FA 3MP6A 2NXOA 3TELA 4Q0CA 3FGSA 3S2VA 3GZGA 3L6HA 3MP8A 3TTLA 3O28A 5KDTB 5A5XB 1NH8A 1B52A 4U2RA 5M2VA 3IAZA 5ICQA 4AB5A 4RPNA 3C34A 1GGGA 4OVJA 3KN7A 2VHAA 1A99A 4G8NA 4KFQA 3IOTA 2F35A 4QFKA 4H1XA 4GD5A 5JEIA 3PD8A 3OELA 3HO7A 1A40A 1B3HA 3A3UA 1MQGA 4IO6A 3A3CA 2PVUA 1SQYA 3TTMA 3MVWA 3F11A 4PETA 4FECA 2WKYA 1A8FA 3WAFA 3MC2A 2H9BA 4RYAA 1B7HA 3FVGA 2F7AA 1DTGA 1OLAA 2DYXA 5KZTA 3TZAA 2XXVA 3N26A 2F97A 1P1NA 1H44A 3MWBA 1JQFA 1N7WA 4DZ1A 4LQ5A 2AYSA 4OHNA 1DMBA 3FZVA 1SW1A 4E0XA 3V83A 2A5SA 4ONYA 4JB7A 3O2AA 2Q2CA 1D3KA 3TPAA 4U1ZA 2O7IA 5AA4A 3K1MA 3UORA 2HZKA 3IOVA 1TFAA 2PBWA 2PT1A 1MXWA 2V3TA 1JVXA 3KOSA 4F1YA 4QRZA 5I57B 2G93A 4YKIA 3U93A 5CC2A 4N6PA 1MQIA 3Q27A 2THIA 3GBBA 2UVIA 4H67A 5ICTA 4R6HA 4RJZA 1TFDA 1RYOA 3USDA 3T96B 4NF4B 1B2HA 2F6GA 4QSEA 3PUVE 4FEDA 4ESWA 1LAHE 1LGBC 4R2BA 3T9UA 5FTHA 3Q25A 3CRBA 1UTHB 3PD9A 5TP9B 4X48A 4ZEKA 1MDP1 4LZ7A 4RA1A 4KYSA 3U92A 1MXUA 1OMPA 2ZYKA 1Q1KA 4ZE8A 2ONSA 3PV0E 4IO5A 1B9JA 1FQEA 5AA1A 1DSNA 1ZJLA 1B46A 4IGRA 2AL4A 1OQGA 1YPNA 4R72A 4G68A 3K01A 5CMMA 2F7CA 1XVXA 2GFEA 4JSOA 3MBPA 3I6VA 1USYE 4BDNA 4YKJA 4KYDA 3D4CA 3VLWA 2RKMA 3EHTA 4RNSA 3C33A 5IAIA 4WKMA 3T66A 3LR1A 1P1UA 2AIXA 1GR2A 1Y4CA 1BIYA 1MXVA 4UACA 2NVUB 4QFPA 3UA8A 5DEXB 1R9QA 2B3BA 4Q30B 4WXJA 4H8JA 5CBSA 2G29A 3PPNA 3R7XA 1B7UA 1S9TA 5H8HA 3QXMA 1B4ZA 2I0BA 5LOMA 3H03A 4KHZE 1POTA 3OO9A 4FJPA 4F18A 3FASA 1B3FA 3BKIB 1GV8A 1MPCA 2HAUA 4F3GA 2XXTA 3RQTA 1ZIUA 2QS2A 2F78A 4KPTA 1ELJA 4GXSB 4NF6B 4ESXA 4F3BA 2O84X 3T22A 2ONKE 1JEVA 2P0SA 5IKBA 3IORA 3FJ7A 1Y9UA 3KJTA 4ZZAA 2Z23A 3GXAA 4F19A 3FVNA 4EQBA 1Y1MA 4PP0A 1YCJA 4BLAA 3HV1A 1JEUA 4I9DA 4IB2A 2A5TB 1WODA 4U22A 2ZNSA 4IY5A 1QJMA 3HSTA 5I56A 1UTBA 2DQVA 5TPAA 3ILUB 3OOAA 3M3LA 3MPKA 1MY4A 1II5A 2Y7WA 2O1LA 2I3WA 2F34A 1LCTA 2V3UA 4OFLA 3H3GA 4R6KA 2OCUA 3K1NA 3UP9A 3MVYA 5I59A 4OQOA 1NH7A 1WVJA 3N6UA 3CSGA 1FTMA 4OZ9A 2Q9TA 4TQUQ 1TWYA 3MQ9A 1FTLA 5DT6A 1US4A 4X9TA 4FATA 5ELVA 4GLIA 3G3KA 1UQWA 4ZE9A 5EYFA 4JWOA 1GVCA 2DXRA 3QK6A 3PPRA 3UIFA 4O3CA 5HPQA 1A54A 3K0VA 3C31A 2DXYA 5HBCA 2H98A 4NF5A 4MH5A 2FA7A 4G8MA 4R2FA 3WAEA 1LAXA 2QS3A 2ZYOA 1Q35A 4PE5B 1B58A 5H8SA 3FXUA 1MH3A 2X7PA 2VD3A 3FATA 1B5HA 4MFIA 2OLBA 1H45A 2OJTA 4IY6A 1Y4TA 3OEKA 3KZGA 4DCXA 3HN0A 4R74A 5AA2A 4PFYA 2PX1A 1Y3QA 4YU0A 2XXYA 2XD3A 1IEJA 1B4HA 2YPNA 3H06B 4GIZA 4NEDA 1B0HA 1I69A 5I58B 5L8DA 1FQDA 4KD5A 2QRYA 4NWCA 5J1DA 1LBBA 1ZKBA 5EHSA 4NF8B 4Z0IA 1O64A 1MS7A 2XHDA 3P7IA 4IO4A 1P1QA 4DLDA 3TFLA 3R26A 1QUKA 3FVOA 4PFTA 3RN8A 4FAJA 3TUSA 3IL1B 4PQJA 4ELRA 3ODBA 4R75A 4NWDA 2I49A 3HHFA 3R6UA 3H6VA 3W9VA 1I6QA 3V8XB 4XKPA 1IQ7A 2M8CA 1NNPA 1Y3NA 3N5LA 3LSFB 1LFHA 4OYVA 4JWYA 3EQ1A 1MM7A 3PUYE 3O6HA 3OSRA 3TYHA 3OD7A 1A7LA 4OESA 3QIMA 5CMKA 4RPOA 2NOOA 2O6AA 4I8CA 3QSLA 3UGWA 2AL5A 1IXHA 4BDLA 4GQOA 1EU8A 2LAOA 3IOWA 1MXYA 2PMSA 4U23A 1IXGA 4F31B 3DP8A 2Q88A 2RC7A 1HSEA 1P99A 4O3AA 3O29A 3UN6A 3K6WA 1LAFE 3MPLA 5I84A 1RYXA 4ELQA 4F2OA 2X26A 5CM6A 4OEVA 3FVKA 3ZKKA 3VVDA 5L9OA 4KYEA 2I3VA 4GRKA 1M5EA 4QF9A 1QKAA 4H5FA 3VLUA 3SEUA 1B1XA 1M5CA 5I2KB 1S50A 3LBSA 2UVJA 3RT6B 4DXCA 4TLLB 4XKQA 5KCJA 3LUYA 1HSJA 4HCWA 2HFBA 1JW5A 1NFTA 1SW5A 3S4UA 2PT2A 1SVXB 1M5DA 3OXNA 4ISUA 4BDRA 1NNFA 1ATGA 3FXRA 4ELOA 3M3KA 3K00A 4EUOA 3LSXA 2UYEA 5H8NB 1ZMGA 4OETA 3C9HA 4ZEFA 3Q29A 2DSFA 4FE8A 2OWSA 1NNTA 3C35A 3PU5A 2QMXA 1B51A 1EH3A 1Y20A 2DWIA 2F5XA 3FJGA 4ZEBA 4THIA 2VGQA 4DCYA 3JYRA 3VFJA 2XX9A 1US5A 2HEUA 3G7WA 3TDJA 4OMBA 2REGA 1FQFA 2VD2A 3IR1A 3TKDA 1BLFA 2Z8DA 4Q5TA 1JETA 2GHBA 4ZDMA 5H8FA 5L9SA 3O6GA 2Y7RA 1HSLA 3TEPA 3H6WA 3SETA 4ECFA 1AMFA 3E3KA 4KQPA 5I2NB 5FHNA 2DWHA 4XKRA 5H8QA 2D5WA 1FTKA 2DWJA 4UA8A 3VVEA 2QS1A 2CZLA 3QUJA 2DOJA 1NNKA 3FV1A 3RT8A 3OENA 1MM6A 4JXIA 2VOZA 1N76A 3FIRA 5F1QA 1IUDA 4X1DA 4F3SA 2QJEA 4H0WA 4G2ZA 2I4CA 2DS9A 5DVIA 3L6GA 3IJOB 4JDFA 1MQJA 2XXPA 3G3HA 4H8IA 2R6GE 1B6HA 1M5BA 1IITA 1JW1A 2DVCA 2UVHA 1OIBA 3IX1A 3K6VA 3OO6A 1QVSA 3U8QA 2HQ0A 3O9PA 1B3GA 3IB0A 1QKBA 1MPBA 2QPQA 5A5XA 1URSA 3MVXA 3U72A 1MXXA 3MZ9A 1OVBA 1UIUA 1IXIA 3RNNA 3IB2A 4QSDA 1NL5A 4F22A 3A09A 4YB6A 1LLSA 4MLQA 2R71A 2NWJA 2QS4A 1PEBA 4PFWA 4BDQA 4ZZEA 1ZLQA 1XOCA 3IOUA 2FYIA 5FHMA 3G3GA 2Q8JA 4QFNA 5FHOA 3KFMA 3KN8A 4YKKA 3E13X 2V3QA 2RINA 3KOTA 1XC1A 2FNCA 5B70A 4GOTA 4QHQA 2DE4A 1USYH 3CG1A 2RC9A 1MY3A 3CR9A 3CI8A 1DPEA 4K3FA 2V84A 1VSOA 4YMAA 5CBRA 1J1NA 1MY2A 2D21A 4Z7EA 4C1TA 2OZZA 2XX7A 2I48A 4OENA 3RTFB 4EXKA 3MAMA 3G3FA 3RGYA 4XIGQ 2E1SA 2RC8A 3KN3A 3OMBA 4IO2A 4EDPA 2I6EA 4TOZA 4JBZA 3PUWE 4JWXA 2BJJX 1A55A 4U21A 4DDDA 1PBPA 5BWJA 5AA4B 3H6TA 1FQCA 2ZNTA 3DLNA 4LQ2A 4N07A 4DXBA 4C0RA 1M5FA 2Z22A 4U1OA 5I57A 5CI5A 2IEEA 4GF8A 1VFDA 4WEPA 4N13A 4P0GA 3T93B 3H7MA 3MW0A 1N3WA 1TXFA 5JTYA 1I6AA 2H5YA 4WEDA 3SEYA 1MPDA 4NF4A 4FIMA 1LB9A 3VDFA 4AB6A 3MVZA 1Y1ZA 2O51A 2DP8A 1LBCA 1Y3PA 1P1WA 4YICA 1R1NA 1UTHA 2UXAA 5TP9A 1L5TA 4LP2B 4L17A 3O6IA 5ITOA 4KCCA 3KJ7A 2I0CA 1F9BA 3RUMA 4RY1A 3G3IA 4RK9A 3T9XB 4P0IA 1ZU0A 2ANJA 1B40A 2HCAA 3SDFA 2Q89A 4GL8A 4HW8A 2I58A 4POWA 3V89B 3FV2A 1SI1A 3TMGA 1FTJA 2REJA 3LC8A 1N0TA 4G68B 4LA9A 4F1UA 5AE4A 4GVOA 4F29A 3N94A 2Y7KA 5CRYA 4EF1A 4HTGA 2H25A 1XVYA 5K2YA 2IA4A 1JNFA 2B65A 3ZKLA 1IZ1A 4EQ9A 1POY1 3K4UA 2Y7PA 3FUZA 2DVZA 1B3EA 3PGFA 3UK4A 3HCQA 5DEXA 4BDMA 3SKPA 2Y7IA 1MH4A 2V93A 3SERA 2P1SA 3CFXA 2Z8EA 4POXA 3EF7A 1BP5A 2RCBA 1PDAA 3IK6B 2NUVA 1QW0A 1Z7NE 4LZ8A 5H8HB 1SYIA 3PMVA 2ALUA 3VV5A 4QFOA 4QFLA 4DIGA 3K02A 3IB1A 5AA3A 1H76A 4F2QA 3BFTA 4NF6A 2ONRA 4ELPA 3QUFA 4RK2A 4OWDA 4H5GA 4P11A 1N3XA 5FTIA 3VE1B 3FJMA 3B6WA 1XHYA 5DVJA 3CIJA 4NE4A 4EF2A 5F7VA 4LVQA 2A5TA 4ND9A 4LUBA 4TLMB 1D9VA 3B6QA 3B6TA 3C32A 4H65A 3K2DA 4H6DA 1SI0A 3HPIA 1LSTA 5I56B 1UTBB 1VR5A 5TPAB 1B5IA 1SD3A 2X7QA 1MY0A 2OWTA 3OEMA 4R73A 4XXUA 2XXRA 2XXUA 1D4NA 1LB8A 2H99A 2O7UA 1URGA 3I5OA 4GWOA 3KSJA 3TCHA 3HHGA 4I1DA 4KI0E 2I4BA 1H3DA 3OSQA 3EHUA 3RLFE 5I59B 3T9VA 1B0LA 2O69A 5CMCA 3K6XA 3O97A 2DWAA 3KGCA 5DYHA 2VP1A 1O7TA 4Q8RA 1BKAA 3G3JA 4MBPA 1D9YA 3TQWA 2QL3A 3PUZE 1IXCA 4F3PA 1XT8A 3M3FA 2ZXTA 3S9LC 4YAHX 1CB6A 3VXCA 2XX8A 2R9JA 2QSXA 3VVFA 3PPQA 3VLVA 1QULA 1XS5A 2OK2A 4EQ7A 1SW2A 1EZOA 4NF5B 4LZ5A 1JVYA 5JTYB 3CFLA 2DE2A 1SW4A 4XKNA 1SDXA 2ZYMA 3IO4A 1ZBMA 3Q28A 4G68C 4YMBA 2CMOA 4NMYA 4MLVA 4YB7A 2ESNA 5HM4B 3KEIA 3BBRA 4G4PA 4PFUA 3MUQA 3MZBA 4OFOA 3H6UA 1ZTYA 2Q2AA 3MJNA 2W7YA 2F8DA 3GLBA 1VE4A 5EHMA 2UVGA 1KWHA 4M1VA 3TTKA 5AA2B 1B5JA 1PB7A 3TCGA 3TTNA 5I58A 3KG2A 1R9LA 1DTZA 1FW0A 5ITPA 3K6UA 4HCYA 1UIVA 4GFRA 5CMBA 4AQ4A 1EZ9A 2DE3A 1B7ZA 5ISUA 1MY1A 1MDQA 4NF8A 1Z7ME 2XXWA 2YJPA 4KCDA 3LSLA 2YLNA 3TODA 1B05A 3I3VA 1I6BA 4C1UA 2H4IA 2KLFA 4IO7A 2O1MA 1AOVA 3Q26A 3SESA 2V25A 4QSCA 1MRPA 1NKXA 1PC3A 3KSXA 3QAXA 1FCKA 4YZZA 1H43A 1N84A 2PYYA 4O3BA 4FORA 5K2XA 1RKMA 4EXLA 3BFUA 3GBAA 4ZS9A 4OEUA 5KDTA 3V5AA 2XXHA 1JW4A 3PMWA 1EZPA 1WDNA 1IIWA 4NTLA 3SEVA 2F6PA 4E0WA 3M8UA 3ZS6A 2HZLA 4FEBA 4LONB 4KR5A 3EPEA 3JV9A 3E4RA 3TAJA 3ZSFA 2GRVA 3RY3A 1ANFA 4U4SA 3IO6A 2ZYNA 1FQAA 4OXVA 1B3LA 1O63A 1TT1A 3O66A 3TCFA 1P1OA 3E9XA 3RPWA 4OERA 3PPPA 4G77A 4R9GA 1PB8A 1LFIA 2UYFA 3W15C 3FD3A 3C4MA 4YB5A 3PPOA 2Z8FA 3OO8A 3T9HB 1SYHA 4RXLA 1VFEA 1QUIA 4OTEA 1A8EA 5I2KA 2RF1A 1B32A 3LSWA 2F36A 5AA2D 3SEXA 3CVGA 5BUUA 3KBRA 2XXIA 4LATA 4M4GA 3RTWB 3QYTA 3W9WA 2F7BA 3DELB 2ZMBA 2Y84A 1FTOA 1FQBA 3ILTB 5KCJB 4G8HA 4IO3A 1N7XA 2D3IA 4XTCQ 2XXQA 4JSDA 5TU0A 1S7YA 2GHAA 2XD2A 2HAVA 1CE2A 3S9EA 4F39A 3DM0A 4ZEDA 4BDOA 2P2AA 5H8NA 4DXUA 1AL3A 3DP4A 2OBGA 3MZ1A 1T0KA 3CSBA 1AH5A 3JZJA 4GL0A 1MG1A 4U4XA 2ZNUA 1URDA 1AIVA 4X1BA 4F1VA 4ZECA 4DE8A 2HXWA 2ABHA 2O68A 3FXQA 5JK4A 1QUJA 2GH9A 1LCFA 3C36A 4R6YA 3B7DA 1MQHA 3OO7A 1MQDA 3EHSA 4HS7A 3U1OA 3VXBA 3PUXE 2RCAA 5B7DA 3U94A 3SEWA 5I2NA 1OLCA 3AXFA 1PB9A 3D4GA 4OFJA 5L9MA 5DVFA 1YAEA 5H8FB 3PMXA 1LFGA 4IGTA 2XXXA 3CFZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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