5H8QA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne8324
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
278
structure length
276
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A,Glutamate receptor io
total genus 81
structure length 276
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8qA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8qA02
2FA7A 4FATA 4DIGA 2HZKA 4PFUA 3N26A 3FASA 3CIJA 3K1PA 5I2KA 1MXXA 4H1XA 2QSXA 3DLNA 2H4IA 3QIMA 4GL0A 3SETA 4ZE9A 4XTCQ 4GXSB 3G3FA 1H76A 1Y20A 4AB5A 1GVCA 1B5JA 2O69A 3IK6B 2OJTA 2R71A 4N13A 3U72A 1PBQA 3IOWA 1MXZA 1P1OA 1B3FA 4EDPA 1UTHA 1XC1A 3OO7A 5H8QA 2Y7PA 3RT6B 3PD9A 2G93A 3KSXA 2X26A 4R6KA 3C32A 1N3XA 1SDXA 2THIA 4U23A 2Z22A 2G29A 4ZZAA 5L9SA 3GZGA 4YICA 4ISUA 2O84X 3LSWA 1O7TA 5EYFA 5B7DA 1DSNA 3DP8A 1JETA 4F1YA 4HTGA 3K01A 1MPCA 5KZTA 3BFTA 2Q89A 3OXNA 4IO5A 2UVIA 2PVUA 3RTWB 1B52A 3PGFA 4LA9A 1OLAA 3OMBA 4I1DA 4QSCA 1JW1A 5H8QB 3FVGA 1JVXA 1EZPA 5F1QA 2XX7A 4MH5A 1ATGA 1N0TA 4RK2A 1R1NA 4G8MA 2F78A 1PC3A 1LAGE 2F5XA 1OVTA 2UVJA 2VD2A 3Q29A 3T9XB 2HFBA 1XVXA 1BIYA 5EHSA 1H43A 3KOTA 4OMBA 3OO9A 4ELQA 3QXMA 4GD5A 1A99A 2XXTA 3T9HB 3Q26A 3GLBA 3TCHA 2DXRA 4XKRA 4ZEBA 2CMOA 5F7VA 4KFQA 4P0GA 1YPNA 4ESWA 3EHTA 1QUJA 4X9TA 2HXWA 1B05A 1FTMA 4LONB 1LCTA 1DMBA 3H6VA 1P1NA 2LAOA 2Z8EA 4QFNA 4Q5TA 2O68A 2E0SA 3TQLA 4F22A 1OQGA 3PU5A 3MW0A 4HW8A 2ALUA 4Z7EA 3E3KA 1B51A 3KGCA 1PEBA 4Q8RA 4QFPA 1LFGA 4ZEFA 1AL3A 3FJMA 3O97A 1LFHA 1DOTA 1TXFA 2R6GE 2O51A 4AQ4A 4ECFA 2VP1A 2ONKE 2OWSA 1JW5A 2ONSA 4O3CA 2I0CA 3TODA 1UIUA 2GHBA 1Y3QA 5EHMA 2B65A 3M8UA 2H25A 4OESA 4YKJA 5CRYA 1QKBA 2ZYMA 3K1NA 3SERA 1HSLA 3PUXE 2XX8A 3SKPA 4PFTA 3L6GA 2GH9A 4ND9A 4LVQA 4TLLB 3O2AA 2HQ0A 5H8SA 1FQFA 2IA4A 1LFIA 1KWHA 4Q30B 2DP8A 1B7ZA 2PT1A 2DWHA 2QRYA 3SEYA 1OMPA 2GFEA 4HS7A 3RGYA 4EQBA 3WAFA 4ESXA 3HN0A 4OVJA 3IOVA 4EF1A 1FQEA 4C1TA 5KCJB 2Y84A 1QW0A 4JSDA 3PMXA 2D3IA 2F97A 3MBPA 5I59A 3OELA 4KQPA 1O63A 5BUUA 3CSGA 1WVJA 3TYHA 1WODA 2ANJA 3IB1A 3R26A 4YZZA 2I49A 4RPNA 1II5A 1H45A 1NNTA 1YCJA 3MP1A 1SVXB 3E4RA 2DE2A 3K4UA 5FTIA 5CMKA 1Z7NE 5CMMA 5AA3A 3OSQA 5DEXB 3PPOA 3SEUA 2PMSA 1MH4A 2H99A 1ZTYA 5K2XA 3MAMA 2FNCA 3C35A 1USYH 4EF2A 1LAXA 3B7DA 3I3VA 4KCDA 3IJXB 3B6TA 3RN8A 1TT1A 2AYSA 4F3BA 3A3CA 3QSLA 2R9JA 4AB6A 3QYTA 2Q88A 3VXBA 1PDAA 1S7YA 2V3UA 5DYHA 1B0LA 1S9TA 3CR9A 4R6YA 2XXXA 3OENA 5AA2D 4QSDA 4NWDA 2QJEA 2REJA 3CFLA 4UA8A 3FJ7A 3PPRA 3MP6A 3PPPA 3JYRA 3GBBA 3R6UA 3U92A 3SDFA 1FTOA 1IXHA 3KN3A 3O6GA 4KI0E 1B2HA 3S9MC 4H0WA 2A5SA 4LQ2A 4TOZA 4RPOA 1IXIA 1N76A 5K2YA 1MQDA 4IB2A 3E13X 1UTBA 3BBRA 4EXKA 2VHAA 4RY1A 2I48A 4FEDA 2DQVA 1IIWA 2ZNTA 2M8CA 4I9DA 1MQJA 5AA1A 5H8FA 1EZOA 3TTMA 4H8IA 3MZ1A 4F19A 2F6PA 4MLVA 4YMBA 3IAZA 1MDP1 1MH3A 2B3FA 1RKMA 2I4BA 1B58A 5AA2B 1MY4A 4IY5A 1O64A 5DVIA 3MC2A 4POXA 4YAHX 3C33A 1ZIUA 1DTZA 1B3LA 1AMFA 3EHSA 4ZE8A 4GOTA 1CB6A 1QJMA 2OBGA 3PD8A 2DYXA 1XOCA 1MM7A 3LSLA 4JWXA 1A8EA 4L17A 1DPEA 2UYFA 4R6HA 4E0XA 4LZ7A 1M5EA 1USYE 3OD7A 3PUZE 3Q25A 3OO6A 3SEVA 3KN7A 4KR5A 3G3KA 3M3FA 3UIFA 3BFUA 3U94A 1GTKA 1SI0A 3RQTA 3SESA 4MLQA 4H6DA 2QS1A 5ITPA 4DDDA 2RCBA 2DWJA 3CG1A 4NF8A 2DXYA 4R75A 2P0SA 1NKXA 2F7AA 3EN3A 3V89B 4YB7A 2ABHA 4NTLA 3IORA 3UGWA 2RC9A 1A8FA 3KOSA 3VVFA 1MY1A 5DT6A 3A09A 1ZBMA 4BLAA 4QF9A 1Y4TA 1A7LA 3TFLA 2DS9A 3H6WA 3VFJA 4I62A 1B1HA 3DP6A 3UP9A 1ANFA 1SYHA 4XKNA 1JVYA 1TFAA 3TMGA 3GXAA 3QK6A 3QAXA 1UIVA 3FJGA 5IAIA 3KSJA 2DSFA 3G3JA 4LP2B 4GWOA 4NF8B 5I2NB 2ESNA 3VV5A 3S9NC 4G8NA 3TELA 3UK4A 1IZ1A 2HCAA 4OWDA 3MWBA 1MPBA 3QUFA 2O6AA 4MBPA 3K1MA 1SI1A 4F3GA 2Q2AA 4PFWA 4YB6A 1N7XA 4R9GA 1MXYA 3TCFA 4EUOA 3OO8A 5I58A 2AL4A 3G3GA 1R6ZA 2XX9A 3VLWA 1A54A 1S50A 2QMWA 3N6UA 1FQCA 3M3KA 4LATA 3MZBA 3PUVE 4KCCA 1URSA 3FVKA 1SW4A 5DTBA 3FD3A 4Z0IA 2PT2A 2RC7A 1JEVA 5HM4B 3V5AA 4BDNA 4H67A 3C31A 1HSJA 2KLFA 4PQJA 2DE4A 2ZNUA 4XKPA 2NWJA 5CMCA 3I5OA 2WKYA 5AA4B 1SD3A 1POY1 3B6QA 3C9HA 1M5FA 4OXVA 2HAVA 4ZECA 4BDMA 5KDTA 3PUYE 4XIGQ 1I6QA 1MM6A 2YJPA 3USDA 1EU8A 1Y3NA 1XHYA 3Q28A 4FORA 5I58B 4KD5A 1XVYA 4G8HA 3U8QA 4NF4B 3IX1A 4YB5A 5L9OA 4R73A 1CE2A 3MZ9A 4RXLA 4QSEA 2UVGA 3HO7A 1MG1A 1MXWA 3H03A 2Q8JA 3IJOB 3WAEA 3FV2A 5LOMA 2QMXA 3LSXA 2F7CA 4F3PA 1B32A 2X7PA 4LZ8A 3JV9A 4OFJA 2UXAA 3H3GA 2I4CA 2OK2A 5DVJA 4YKIA 3T22A 2ONRA 5KCJA 5JTYB 1MQHA 4R9FA 5CBSA 3VVDA 5TU0A 2F35A 3D4CA 4XXUA 4ELRA 4OENA 5KDTB 1FQBA 2HZLA 4BDRA 4YU0A 1M5CA 5I56A 5FHOA 1B46A 1LBCA 3KG2A 3MQ9A 4NE4A 3O6IA 2HAUA 3BKIB 3TEPA 1B3EA 1AIVA 1P1WA 2QS4A 3V83A 2QPQA 3ECRA 3MPLA 1JW4A 2NXOA 3RY3A 2I58A 3K2DA 1FTKA 4KYEA 1B4HA 1LGBC 2XXIA 4OYVA 3CVGA 4U4SA 3U93A 4GIZA 3W9WA 5TPAB 2NOOA 3K6WA 5DEXA 3AXFA 1B5IA 1OQHA 1QVSA 1XT8A 4ZZEA 4G2ZA 1B5HA 5JK4A 1MS7A 3TZAA 4MF3A 1Y3PA 1B4ZA 3O29A 5I56B 1NL5A 4M4GA 4DCYA 5H8NB 3MJNA 4EQ7A 4WKMA 3W15C 4N07A 2H5YA 3G7WA 3DM0A 3IB2A 2XXPA 2DWAA 4F1VA 2UYEA 1JNFA 5AE4A 4H5FA 3FV1A 1VSOA 2A5TB 1NFTA 1SW2A 4FE8A 4OERA 2CZLA 1EH3A 1QUIA 1RYXA 2I3VA 1LSTA 3K00A 2V84A 3O6HA 2HEUA 4RK9A 1M5DA 3CSBA 2BJJX 5H8HB 2V3TA 4GVOA 2V93A 5ICQA 3OOAA 3U1OA 4OFLA 3O66A 4IGTA 3VXCA 1R9LA 3OEKA 3G3HA 1F9BA 5L8DA 4G77A 2XXWA 3P7IA 3HV1A 5ELVA 4PETA 5HPQA 3S9EA 4GXAA 1GV8A 1L5TA 3ZKKA 4KPTA 4R2BA 1ZKBA 1Y4CA 5AA2A 1LCFA 3K6UA 2F34A 1PB9A 1Q35A 2V3QA 1N7WA 4R2FA 4F31B 4QHQA 3RT8A 4NF5B 1WDNA 4F3SA 4X1DA 4IY6A 3V8XB 2AL5A 1HSEA 3RPWA 1B9JA 3EHUA 3IOUA 4Q0CA 3N6TA 2Z8DA 1MPDA 2Y7KA 1T0KA 5A5XA 1NNFA 5ISUA 5CC2A 3H6TA 1QULA 1ZLQA 2ZYKA 1NMUA 4FAJA 4IO4A 3FZVA 4HCWA 1VR5A 1VFEA 4UACA 3FXRA 4U21A 1TWYA 3PMVA 1MY3A 4LQ5A 5FHMA 4ZEDA 4OTEA 2F8DA 4C1UA 1URDA 5IKBA 3LSFB 4IO6A 1XS5A 3MVYA 3ODBA 1P99A 2AIXA 3KFMA 4RJZA 3PPNA 1LLSA 3RLFE 4H8JA 4U22A 5A5XB 4POWA 1FCKA 2DWIA 4ZEKA 2DVZA 1I69A 2XXRA 4LZ5A 4ZEIA 1MY0A 2DOJA 1VE4A 4F18A 5DVFA 5TP9A 4F1UA 1YAEA 3ZSFA 2GRVA 3HHGA 3ONMA 3T96B 2GHAA 4GF8A 3K6VA 4PFYA 4WEPA 1GR2A 3S4UA 5I2NA 4HCYA 3T9UA 2PX1A 4H5GA 3TTNA 4GLIA 3H06B 4DLDA 3T9VA 2ZYOA 4RA1A 3GBAA 3IOTA 1D3KA 1LB8A 4GL8A 3M3LA 5HBCA 1H3DA 4X1BA 4U2RA 1MY2A 2XXUA 3Q27A 1IXCA 3IO6A 2D5WA 3KZGA 2NVUB 3TTRA 1US4A 4NMYA 4JBZA 4OZ9A 5TP9B 2X7QA 3CFZA 3LBSA 2O7IA 4FJPA 4R74A 4OEUA 4ONYA 4WEDA 5J1DA 4JWYA 5ICTA 2DE3A 2XHDA 4RYAA 3W9VA 4DE8A 1B40A 3HPIA 2Q2CA 1SW5A 2DVCA 3OSRA 1ZJLA 3F11A 4G68C 4DZ1A 1NH7A 1B6HA 1NH8A 5B70A 1D4NA 5I2KB 2RC8A 4YMAA 2Q9TA 1I6BA 2UVHA 5AA4A 1SQYA 4ZS9A 4U1ZA 3CI8A 3L6HA 3JZJA 5I57A 3KEIA 1PB8A 1MXVA 3T93B 3I6VA 4THIA 1FW0A 3QUJA 1D9VA 4NF4A 2OZZA 4NEDA 1UTHB 2I6EA 1ZMGA 4LUBA 4I8CA 4RNSA 2XXQA 3C36A 1B7UA 1FTJA 2VGQA 3RUMA 2QS2A 1MRPA 1IEJA 4P0IA 2B3BA 3B6WA 4FEBA 1Z7ME 1US5A 4OHNA 1J1NA 4JXIA 1TFDA 3EQ1A 5JEIA 5JTYA 5I57B 2VD3A 1B1XA 2O7UA 3PV0E 3VLVA 4OETA 3R7XA 1BKAA 3IL1B 4H65A 2P1SA 2I0BA 4FECA 4M1VA 2O1LA 4QRZA 1JQFA 3VDFA 2OLBA 4PE5B 5L9MA 3UN6A 1R9QA 1YTVA 3ZKLA 3TUSA 1IQ7A 3N94A 1DPPA 3O28A 3IR1A 4GFRA 4JB7A 3TPAA 3S9LC 3FVNA 3LC8A 4ZDMA 5TPAA 4WXJA 3TDJA 4IO2A 3MVZA 5FHNA 1LB9A 4ELOA 1MQIA 2YLNA 4N6PA 3H6UA 4X48A 3TAJA 1JEUA 3UA8A 2F36A 3HHFA 4TLMB 2PBWA 1B3HA 1SBPA 5H8NA 3KBRA 3E9XA 4MFIA 1OVBA 3TKDA 3FXUA 2FYIA 1P1QA 1ZU0A 1FQDA 3HSTA 2A5TA 4E0WA 2REGA 1I6AA 1IXGA 3OEMA 3G3IA 1N3WA 4IGRA 1N84A 2QL3A 3A3UA 1DTGA 3LR1A 3PPQA 1A40A 2Y7IA 1Q1KA 3K0VA 3CG3A 4F2OA 5H8HA 3ZS6A 2ZYNA 2Y7RA 2F6GA 1FTLA 2YPNA 3PMWA 1M5BA 4DXCA 5CMBA 1P1UA 1GGGA 1Y1ZA 5I84A 4NWCA 4F29A 3PUWE 4R72A 2XD3A 3HCQA 3TQWA 1Y9UA 3C4MA 4YKKA 2V25A 4EXLA 4NF6A 1D9YA 3C34A 1IITA 4BDLA 4OQOA 3TTKA 4IO7A 2OCUA 1LAHE 4F2QA 4G68A 4O3BA 2PYYA 4NF5A 4QFLA 3EF7A 3SEXA 3TTLA 4GQOA 5CBRA 3SEWA 3KN8A 1B0HA 3IB0A 5FTHA 2XXHA 1MXUA 4TQUQ 3MUQA 1UQWA 3T66A 2W7YA 3IO4A 3K6XA 3CRBA 1VFDA 3FVOA 3KJ7A 5BWJA 3FATA 4BDOA 2NUVA 2RF1A 2ZXTA 2Z8FA 4BDQA 1IUDA 5I59B 4NF6B 3THIA 3MP8A 4F39A 1QUKA 3VE1B 1EZ9A 4FIMA 3RTFB 4DXBA 4U4XA 4EQ9A 4G68B 1LAFE 3MVWA 3VVEA 3TCGA 3RNNA 1BP5A 1Y1MA 1N04A 1MDQA 1PB7A 3H4ZA 1FQAA 2O1MA 2XD2A 3ILTB 1OLCA 2IEEA 3D4GA 3DP4A 1H44A 1MQGA 4DCXA 2E1SA 4OEVA 1B3GA 1QKAA 2XXYA 3O9PA 4U1OA 1AOVA 1SW1A 3MPKA 4C0RA 4GRKA 2H9BA 2ZMBA 2RINA 1OIBA 1LBBA 1BLFA 3ILUB 2Z23A 1ELJA 4O3AA 2OWTA 1NNKA 3LUYA 5CM6A 3FXQA 4KYSA 4PP0A 3MVXA 3S2VA 3FGSA 1NNPA 4IO3A 3FIRA 3FUZA 1POTA 4KHZE 4JSOA 2H98A 1PBPA 2I3WA 1B7HA 3EPEA 1SYIA 3DELB 4DXUA 3KJTA 3UORA 4ELPA 3K02A 4QFOA 2Y7WA 4G4PA 1A55A 2P2AA 1AH5A 1UTBB 5CI5A 4OFOA 2ZNSA 5ITOA 4JDFA 4K3FA 1RYOA 3VLUA 2F7BA 4P11A 2RCAA 5M2VA 4JWOA 1BTJA 4KYDA 1URGA 5H8FB 3N5LA 3CFXA 4QFKA 4YKPA 2VOZA 2D21A 2XXVA 2QS3A 2RKMA 3H7MA 4XKQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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