4GRKA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with ketorolac at 1.68 a resolution
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with ketorolac at 1.68 A Resolution
rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 113
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-08-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4grkA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4grkA02
3P7IA 1S9TA 2QS2A 4TOZA 3KJ7A 4JB7A 1KWHA 4RK2A 3CSBA 4NEDA 3TFLA 2O69A 4OXVA 2DYXA 3IOTA 4PFTA 4U4SA 1FTMA 3PMVA 4NMYA 1MXXA 3CSGA 4RYAA 2DOJA 3Q29A 2I58A 5I59B 4F1VA 4ZZEA 3T22A 5H8QB 1B05A 2UVGA 1GV8A 2OCUA 3K6UA 5TU0A 3T9UA 4HW8A 2RCAA 4FAJA 5ITPA 4RA1A 2QJEA 3C33A 3BFUA 2QPQA 2ZYMA 3TKDA 2F6PA 2OWSA 4ELQA 1EH3A 1MQJA 1SW1A 3A3CA 2H25A 3KOSA 3H6VA 3PGFA 5FHMA 3FVNA 1H43A 3IOVA 4H67A 4R6YA 2HQ0A 2H4IA 3G3IA 4BDMA 1SYIA 2I4CA 5DVJA 1MH4A 4OVJA 2V3TA 5BWJA 4ND9A 4WEPA 3OD7A 4NF8A 1LFGA 1R1NA 1RKMA 4NF5B 3O29A 2XXXA 1DTZA 3IOWA 4G4PA 4GXAA 3VXBA 2X26A 3PPRA 3PPPA 3ZKLA 4DZ1A 3JZJA 1ZU0A 4DDDA 1EZPA 4G8HA 1LAHE 3K02A 3QUFA 4GXSB 5LOMA 4R72A 4MLQA 3ZSFA 3HO7A 2P2AA 1AMFA 2X7QA 1ZBMA 2Y7KA 4FORA 3Q28A 1N7WA 4EF2A 3LUYA 5JTYA 3RPWA 5H8SA 1UIUA 1B3GA 1DPPA 1Z7ME 1HSEA 4NF6A 4U4XA 2HZLA 4DXCA 4F39A 5KCJB 3QXMA 4ELPA 3S9EA 1SQYA 4UA8A 3PUXE 2I4BA 1EU8A 4PFWA 4GVOA 4O3BA 5TPAA 4RJZA 1GGGA 1LAFE 1QJMA 2RC8A 1LAGE 3KJTA 1I6BA 3C9HA 2RKMA 2XX8A 2Y84A 2D21A 1II5A 3M8UA 4NWDA 5EHMA 3TPAA 4EQ9A 1D9VA 3I5OA 2QL3A 5DEXA 1LB9A 1ELJA 4LQ5A 2V3QA 2OZZA 3KSJA 2O1LA 3IORA 1WDNA 3O2AA 4KFQA 4OERA 2DXYA 5ITOA 2CZLA 1NNPA 1TXFA 3M3LA 1CB6A 4IY5A 3C31A 3E4RA 4IO2A 4R73A 3VLVA 5F7VA 1IIWA 1WVJA 3O9PA 1B6HA 3OO6A 3S2VA 4OHNA 3H6TA 1NH8A 5DEXB 4ZE9A 4GL0A 1A8FA 5IAIA 1IUDA 4GWOA 3N6TA 3OXNA 1LFIA 1OIBA 2B3BA 3FZVA 2AIXA 2HZKA 2D5WA 4KHZE 1MQDA 2KLFA 4IO7A 3QAXA 4U22A 4YKJA 5CI5A 4G77A 4HCWA 5EYFA 4F1YA 3PU5A 2NUVA 4I8CA 4GRKA 4X1DA 3U93A 1LSTA 1PBPA 3OOAA 1AL3A 1B51A 2XXUA 4GD5A 5I57A 3QK6A 3PUZE 2H5YA 1VR5A 2ZYNA 1DSNA 4JXIA 5AA3A 1B7UA 2O84X 1ZTYA 3K4UA 3S9LC 4NF5A 4OQOA 4QSCA 3KN3A 5I2NB 4OFJA 2DP8A 1MM7A 4R75A 1LGBC 3SEUA 3C4MA 4RNSA 1MXYA 3QIMA 3EHUA 4G68C 5JEIA 1XC1A 2THIA 1B9JA 3OEKA 4U23A 4TLLB 5CMBA 2ESNA 1AOVA 2GH9A 3IR1A 1N7XA 2Z8FA 2ONSA 3IB1A 1MG1A 2IEEA 2VGQA 3IX1A 5TPAB 5KDTB 3KN7A 4QFLA 1L5TA 3MVXA 3R6UA 1USYE 2QRYA 5F1QA 4F3GA 1D3KA 1VE4A 2VD3A 4G2ZA 1N0TA 4R74A 2R9JA 3EQ1A 3W15C 1B0LA 4ZEDA 2QSXA 1M5DA 1UIVA 2A5TB 3MJNA 4M4GA 5ICTA 1PDAA 2E1SA 3D4GA 1XT8A 4KCDA 5L8DA 3TCGA 1UTHB 3W9WA 1IXIA 1N84A 4OFLA 3O66A 4QSDA 4WKMA 4LVQA 1IXCA 4R6KA 4YMAA 1B4HA 3OO7A 4ZZAA 4IO4A 4NF4B 1MQGA 2F36A 3OO8A 1QW0A 2VOZA 1IZ1A 1JETA 2OBGA 3E9XA 1MPBA 3MP8A 3MWBA 3O6HA 3ODBA 4X9TA 1P1UA 1WODA 4OFOA 3QSLA 5IKBA 4YB5A 4H5FA 2Q8JA 3TAJA 1N3XA 1QUKA 4ZS9A 1B7HA 1D4NA 1J1NA 3PMXA 3RGYA 5I56B 1YCJA 2DVZA 3T9VA 2ONRA 3TEPA 4RY1A 4BDQA 3UGWA 1DOTA 2DWIA 2Q88A 3C32A 4KI0E 4X48A 2HXWA 5FTHA 2PX1A 2XXHA 4ZEIA 1B1HA 1URSA 4TLMB 1UQWA 5H8FA 3GBBA 2O51A 4FIMA 1M5EA 4MH5A 5CBRA 4ESWA 2XX7A 2HAVA 1Q35A 3TQWA 4KYDA 2F78A 3I3VA 2HAUA 1IQ7A 1I69A 4OWDA 3FVGA 5DVIA 4F22A 4YMBA 3H03A 1MXUA 2Z23A 3IJOB 3Q27A 4IGTA 1ZMGA 3O97A 3TTRA 4BDOA 4AQ4A 4LQ2A 4U21A 4Q30B 3K6XA 4H8IA 3PD9A 1H45A 1SW5A 2XXYA 4IO5A 1GVCA 1RYXA 3DP6A 1PEBA 3G3HA 3R7XA 3BFTA 1N04A 3DELB 2AYSA 2QS4A 4QFOA 3FD3A 3DM0A 4ISUA 4U2RA 4XTCQ 3SEVA 2F7AA 1A7LA 2Z22A 1DPEA 1R6ZA 3A3UA 5H8NA 3WAFA 3RY3A 4AB5A 4DCYA 2VP1A 5I58B 1SW4A 1PB7A 4KD5A 1FTJA 4P0GA 4FATA 2PVUA 4DIGA 2H99A 4RXLA 4OEUA 1FQCA 2YLNA 3H06B 4Q5TA 4BDNA 5AA4B 2G29A 5AE4A 3U8QA 5CM6A 2AL5A 2XXRA 3VV5A 3N94A 4JDFA 4QSEA 1H76A 2Q2CA 2ZNTA 5DVFA 3K0VA 4R9GA 2F35A 1B3HA 1IITA 5HPQA 4KPTA 1LLSA 1NMUA 1Q1KA 1B3FA 2V25A 2ZYOA 3MZ9A 4I62A 4NE4A 4EF1A 1QUIA 2ONKE 3G3KA 2DWAA 1JNFA 1Y4CA 5M2VA 2Y7IA 4F3SA 1B3EA 1Y3NA 1BP5A 4BLAA 2ALUA 1MXZA 2V93A 3HSTA 3KSXA 2F97A 1B4ZA 1DTGA 3PD8A 2Q9TA 1FTLA 2FNCA 1B32A 4HCYA 2NWJA 5I56A 2ANJA 4GIZA 3VE1B 5H8HA 3TTLA 4ZECA 1Y1ZA 3S9NC 4IO6A 4XKRA 1QVSA 2ZXTA 3VDFA 3K1PA 3FJ7A 4KQPA 5HBCA 1R9QA 2DE4A 3I6VA 1MY4A 3MPKA 4F18A 1JW5A 1VSOA 4IY6A 1T0KA 3ILTB 5I59A 1US5A 5HM4B 5CMMA 1MDP1 4JWOA 4F2OA 5I84A 4UACA 4K3FA 4DE8A 1B5JA 1H44A 2UVIA 1B58A 3EHSA 4P0IA 4E0XA 2HEUA 1MXWA 1FQDA 5KCJA 2Y7PA 4L17A 3MAMA 3VLWA 1N76A 3PPNA 2XXWA 4KYSA 4PQJA 1MY1A 1VFDA 2DWJA 2RCBA 1SD3A 4FEDA 3SEYA 4YU0A 1H3DA 4TQUQ 3L6GA 4G8NA 1MRPA 3UORA 3H7MA 2RC9A 3V5AA 1JVYA 2I3VA 3FJGA 3MP1A 4YAHX 1MY3A 3MPLA 3TUSA 3O28A 3EF7A 1BTJA 2XD3A 1PBQA 4KYEA 4N07A 2O68A 3N26A 1F9BA 1OQGA 4FJPA 3ECRA 5H8NB 5L9SA 1UTBB 2QS1A 3FV1A 3FVOA 4NWCA 2RC7A 3TCFA 1OMPA 2AL4A 3B7DA 4FE8A 4X1BA 4F1UA 2W7YA 4FECA 4LZ5A 3Q25A 2F6GA 3O6GA 3K00A 2Y7WA 1A8EA 1IEJA 1Y3PA 5TP9A 2F7BA 1MDQA 1N3WA 2ZNUA 4IGRA 1Y20A 4QFNA 1ZJLA 3IL1B 5JK4A 3SERA 3EHTA 2UVHA 2XD2A 3B6WA 3MQ9A 3VVFA 5I57B 2P0SA 3E13X 3JYRA 4GQOA 3TELA 1ANFA 1IXHA 4O3CA 2XXVA 1NFTA 3USDA 3K1MA 1TFDA 4KR5A 4OENA 4EQBA 3BBRA 2Q89A 3PMWA 5ISUA 3K2DA 2DE3A 1DMBA 2PT2A 3SKPA 4OMBA 3PUWE 4OYVA 3O6IA 4M1VA 3TQLA 5KZTA 1A40A 3U92A 1XHYA 1O64A 3K01A 3M3KA 4G8MA 4EXKA 4YKPA 3UIFA 5BUUA 5FHNA 4R2FA 2P1SA 2M8CA 3KG2A 3IB0A 1FQFA 2GHAA 1PC3A 3CIJA 4HTGA 4G68B 3ZKKA 4NTLA 2QMWA 4JWXA 1ATGA 3OSQA 1D9YA 3E3KA 2OK2A 3TMGA 3TODA 3G3GA 3THIA 3TTNA 1M5CA 4QF9A 2WKYA 2UYFA 4OEVA 3MC2A 3SETA 1P99A 3CG3A 2Y7RA 5K2YA 4H1XA 5L9MA 1BLFA 4F31B 4QRZA 5H8QA 2OJTA 4PFYA 3L6HA 1RYOA 2PMSA 2XXPA 1QKAA 3HCQA 3IK6B 1ZKBA 3OO9A 4GOTA 4NF4A 2ZNSA 1SYHA 1JEVA 2F34A 2VHAA 2XX9A 2UXAA 3U1OA 4ECFA 1MM6A 3HHGA 2G93A 2OWTA 1LBBA 3UA8A 1JVXA 2A5SA 3GLBA 4AB6A 3N6UA 3HPIA 3TTMA 4U1ZA 4KCCA 1AIVA 1FW0A 1S50A 5ELVA 3LR1A 4MLVA 4R6HA 3RUMA 3T9HB 3W9VA 2UYEA 1UTHA 1B5HA 4QHQA 5ICQA 1OLAA 4LA9A 2FYIA 1S7YA 2REGA 1MY2A 4OESA 2ZMBA 3CFXA 1P1WA 4EQ7A 3FIRA 1XOCA 2H98A 5H8FB 3RTFB 3TZAA 1M5FA 1POTA 2RF1A 3QYTA 3TTKA 2I0CA 3V89B 2DS9A 3OELA 2F5XA 5CC2A 1B3LA 5DTBA 3B6QA 1LCFA 3F11A 3H3GA 3HV1A 5DYHA 1VFEA 3T96B 4WEDA 1CE2A 2XXIA 3ILUB 3VFJA 4XIGQ 2PYYA 5EHSA 4QFPA 3EN3A 4ELRA 3BKIB 3TCHA 5B70A 3KFMA 2QS3A 3LSWA 3CFZA 4U1OA 4IO3A 4DLDA 1URDA 3SDFA 4PFUA 3G3JA 4YB7A 3TDJA 4YB6A 4OETA 4LUBA 3KN8A 3IB2A 2XXQA 3KBRA 4JSDA 3UP9A 1B46A 4NF6B 4DCXA 5FHOA 5CMKA 4MBPA 3RTWB 1YTVA 3V83A 4GF8A 4OTEA 1B52A 1SI0A 3B6TA 3MVZA 3OENA 5CRYA 1FCKA 3IOUA 1EZOA 1ZLQA 2DVCA 2O7IA 1SBPA 4BDLA 3K6VA 4OZ9A 4RK9A 2R71A 1MH3A 4H5GA 1PB8A 1GR2A 4ZEFA 2V3UA 4ZE8A 2PT1A 2NVUB 2HCAA 4G68A 5A5XA 5L9OA 4YICA 1TFAA 1B1XA 3C36A 1Y9UA 3CR9A 4XKPA 1SW2A 2QMXA 3IAZA 1FQBA 2I6EA 3S4UA 2E0SA 3KOTA 3EPEA 2DSFA 3D4CA 3C35A 3T93B 1A99A 3MVWA 3H4ZA 2VD2A 1EZ9A 2FA7A 3FGSA 3KGCA 2DE2A 3G7WA 4JWYA 3U94A 4Q8RA 4N13A 4ONYA 4EXLA 3LBSA 1SDXA 1P1NA 3SEWA 4BDRA 1MPCA 5FTIA 4Q0CA 2R6GE 3KZGA 3MVYA 4P11A 3PUVE 3H6WA 4GLIA 1NNKA 1OVTA 4H65A 1NKXA 4POWA 2GHBA 3VXCA 3MP6A 4EDPA 1HSJA 4IB2A 2O6AA 4DXBA 4F29A 2B65A 4F2QA 1SI1A 1SVXB 3WAEA 4ZEKA 2V84A 3FXRA 4THIA 3DP8A 4QFKA 5AA4A 3OMBA 1JQFA 1XS5A 2I0BA 4YZZA 2YJPA 1R9LA 2B3FA 1O7TA 4I9DA 3SEXA 1OQHA 2DXRA 2GRVA 2OLBA 1OVBA 3V8XB 4C0RA 1NNTA 1USYH 1XVYA 4JSOA 3GZGA 4PE5B 4GFRA 4I1DA 2Q2AA 4MF3A 1MPDA 5I2KA 5B7DA 3G3FA 5AA2D 1JEUA 1BKAA 1NNFA 2LAOA 4H6DA 1ZIUA 3FATA 4Z0IA 5H8HB 1QKBA 3S9MC 3PPOA 1NL5A 3FXUA 5CMCA 1OLCA 3MW0A 1GTKA 2CMOA 2O7UA 4POXA 1I6AA 4H0WA 3FV2A 3TYHA 4E0WA 3RT6B 1LB8A 2I48A 4ZEBA 3UN6A 4XKQA 5I58A 1NH7A 2A5TA 2IA4A 3FUZA 3K1NA 4F3BA 2NXOA 3LC8A 1B40A 1MXVA 3FXQA 4H8JA 1JW4A 1LCTA 4HS7A 3VLUA 2F8DA 4PP0A 4F3PA 1US4A 3CRBA 4F19A 1FQEA 1HSLA 1P1QA 1PB9A 2Z8EA 3GXAA 3ONMA 3QUJA 3AXFA 4LONB 3C34A 3R26A 5DT6A 3MUQA 4C1TA 2DQVA 3CFLA 3KEIA 5AA2B 2RINA 4LZ7A 4FEBA 3RN8A 3RLFE 3PV0E 3DP4A 4GL8A 1TT1A 4RPNA 5KDTA 2ABHA 1AH5A 2I3WA 3FJMA 3IO6A 1IXGA 1M5BA 1JW1A 1XVXA 1MS7A 3OEMA 1YAEA 3OSRA 4N6PA 1UTBA 4RPOA 1A54A 4WXJA 1Y1MA 3DLNA 5A5XB 1B2HA 1FTOA 1LFHA 4LP2B 1B0HA 2XXTA 3JV9A 4R9FA 2I49A 3HHFA 3IJXB 1Z7NE 4PETA 3RT8A 2YPNA 2O1MA 1Y3QA 4ZDMA 3T9XB 3MZBA 3CG1A 5CBSA 3ZS6A 3RNNA 1TWYA 3CVGA 1I6QA 5K2XA 1QUJA 2F7CA 4YKKA 3MZ1A 3U72A 3GBAA 4C1UA 5J1DA 1BIYA 3N5LA 3CI8A 3H6UA 4LZ8A 3K6WA 5I2NA 3FASA 3LSLA 2Z8DA 3A09A 1URGA 1MY0A 1O63A 1FTKA 4O3AA 1B7ZA 3IO4A 5JTYB 5AA1A 2H9BA 2GFEA 3MBPA 3PPQA 4Z7EA 3T66A 4LATA 1LAXA 5TP9B 4ELOA 5AA2A 2REJA 4EUOA 4XKNA 2NOOA 2X7PA 2XHDA 3UK4A 1Y4TA 2DWHA 3HN0A 1MQIA 2UVJA 1YPNA 4XXUA 4ESXA 2PBWA 4MFIA 1A55A 3LSFB 3VVEA 4NF8B 3FVKA 4DXUA 1B5IA 4R2BA 3SESA 1P1OA 2D3IA 2ZYKA 1FQAA 3M3FA 3VVDA 4JBZA 3RQTA 3PUYE 1QULA 1MQHA 1POY1 3Q26A 2HFBA 3LSXA 2BJJX 1LBCA 4YKIA 5I2KB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4N8GA 2QS2A 1KZ8A 4JB7A 3TFLA 2FIEA 4U4SA 4F1VA 3T22A 1B05A 2OCUA 3K6UA 5ITPA 2RCAA 1IMDA 1EH3A 1MQJA 5EQ9A 4R6YA 2CEYA 2HQ0A 3G3IA 4WEPA 3OD7A 2OX3A 4NF8A 3O29A 4G4PA 3VXBA 2X26A 3PPRA 4GXSB 3LUZA 4FORA 2P2AA 2X7QA 2Y7KA 4EF2A 5JTYA 3RPWA 1UIUA 1B3GA 1Z7ME 1HSEA 4NF6A 4U4XA 2HZLA 3QXMA 4N91A 4ELPA 2I4BA 1IMAA 5TPAA 1GGGA 1LAFE 4GL8A 4I40A 2QL3A 3KSJA 2O1LA 4KFQA 4OERA 3M3LA 4IO2A 1IIWA 3O9PA 1NV1A 3H6TA 1NH8A 5IAIA 3OXNA 2B3BA 2HZKA 2KLFA 4IO7A 4GX6A 5CI5A 4F1YA 1LEVA 4N6KA 1LSTA 4JVCA 5I57A 4OVPA 1ZTYA 4NF5A 4OQOA 3KN3A 2DP8A 3C4MA 3EHUA 4G68C 4KXPA 4U23A 4TLLB 5EYHA 4MCOA 1MG1A 5TPAB 3KN7A 1L5TA 3MVXA 3R6UA 2QRYA 3W15C 2QSXA 2A5TB 3MJNA 5EQ7A 2WX9A 1IXIA 4OFLA 4QSDA 1B4HA 4UABA 4ZZAA 1MQGA 3MWBA 1MPBA 3O6HA 5IKBA 1N3XA 4MEVA 5IM2A 1J1NA 4NHBA 1DOTA 3C32A 1NUYA 1UQWA 2L5VA 4MH5A 4ESWA 2HAVA 1Q35A 3TQWA 5ET8A 4F22A 3H03A 3TTRA 1ZMGA 2XA5A 4Q30B 4H8IA 1H45A 3G3HA 3R7XA 3DELB 4XTCQ 1A7LA 5H8NA 3WAFA 5I58B 1FPKA 2VP1A 4FATA 3FXBA 1DBZA 5AA4B 2G29A 5AE4A 3U8QA 4QSEA 5DVFA 1NMUA 4I62A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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