4GRKA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with ketorolac at 1.68 a resolution
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with ketorolac at 1.68 A Resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 113
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-08-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4grkA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4grkA02
3SDFA 4LZ8A 4HW8A 2I49A 1XOCA 4NF8B 4LZ7A 1M5DA 2HCAA 3IOWA 3QK6A 1HSLA 3N94A 3MPLA 3PMWA 2DQVA 3GBBA 2Q9TA 3KOSA 1JW4A 4OHNA 1I69A 2Q88A 2G29A 4RK9A 1QVSA 1IIWA 5M2VA 1M5FA 5KZTA 4E0WA 1PB9A 1POTA 1ANFA 3RY3A 3TYHA 2F36A 3LUYA 2XXPA 4U1OA 1MPDA 3RT8A 4F3SA 2X7PA 3OOAA 1OLAA 2NWJA 4KYDA 5A5XA 3K6UA 4JB7A 3UP9A 2QS1A 3ZSFA 2IEEA 1R1NA 1NKXA 3C32A 3KJTA 2Z8EA 3A3UA 2UYFA 5H8FA 2NOOA 1XVYA 2P2AA 3PGFA 3VVEA 3I3VA 1H3DA 2R6GE 4QFKA 4XXUA 5HM4B 3MVXA 5EYFA 5CM6A 1XVXA 1MDP1 3P7IA 1D9YA 2H4IA 1IITA 1P99A 5AA2B 2OWSA 1B3FA 2OK2A 3O29A 3T66A 2FYIA 1DMBA 1ZJLA 3CFZA 1QKAA 4LATA 3CSGA 5I2KA 1MY2A 3GXAA 1AH5A 4NF4A 1B46A 3S9EA 2GRVA 4PFUA 5DVJA 4DXUA 4R6KA 1WODA 2ONRA 4JXIA 5AA1A 3MBPA 1B05A 3KEIA 2DVZA 2I48A 3U94A 4PFWA 3SEWA 3HV1A 1ZMGA 1VR5A 4H67A 4POWA 1MH4A 4ZEFA 3QXMA 3EHUA 5DEXB 1SW1A 4YAHX 2DVCA 4LZ5A 3T96B 4QSEA 1LAHE 1A7LA 3KG2A 2NUVA 1SQYA 1AL3A 4G2ZA 4DDDA 3W9WA 2RC9A 3S2VA 3LR1A 5BUUA 1EU8A 1US5A 3FZVA 3LSLA 3K1PA 1OVBA 1MY0A 1PBQA 1XT8A 3FV2A 4RPNA 1PB7A 1UTHB 3FXQA 4IO7A 2XXYA 3OXNA 4DCYA 1B7UA 4OEUA 4I9DA 5FHMA 3FJ7A 5JTYB 2ZYNA 4Q30B 4N07A 1NNFA 4OQOA 1MXVA 4PFYA 5ITPA 1AIVA 1UQWA 1USYH 5AA4B 2GH9A 3R6UA 3TEPA 3IOUA 4FIMA 3IK6B 2XXRA 4FE8A 1AOVA 3T9UA 1NH7A 2Z8DA 3N5LA 2ZMBA 4XIGQ 4ZEKA 1SW5A 5I57A 3VLUA 1H44A 2YPNA 3USDA 1HSEA 2VGQA 3F11A 2GFEA 2HQ0A 3MUQA 2DP8A 4XTCQ 1LCTA 2H25A 1YPNA 1B40A 5L8DA 2OZZA 2F78A 3K6XA 2Q8JA 3I6VA 1D3KA 2Q2CA 3AXFA 2I3VA 2PVUA 2R71A 4MH5A 2XX8A 3HHFA 4FEDA 3G3HA 3TELA 2F7CA 5EHSA 4KI0E 3ILUB 4GLIA 5CBRA 2E1SA 2QSXA 2XX9A 1NNTA 3PD9A 3KGCA 4ZE8A 2XXTA 1Y1ZA 5I2NB 2QL3A 1LFHA 4R6YA 4Z7EA 4X48A 3MWBA 1Y3QA 3E3KA 2HEUA 3FGSA 4O3CA 3RLFE 3L6HA 4KFQA 2UYEA 4GQOA 3BBRA 2O84X 1IXHA 2XXVA 3BKIB 4DXCA 1FQDA 1B6HA 4FORA 1MY1A 5JTYA 1B32A 5AA2D 4HS7A 4BDMA 1SYIA 2Y7RA 3WAFA 3T9HB 3FJGA 1TFDA 3CG1A 2OCUA 3OSRA 3K0VA 4KR5A 4EQ7A 4KPTA 4R9GA 3QUFA 5J1DA 4YKPA 2WKYA 2ZNTA 3K6WA 1P1QA 1B3HA 1LBBA 1I6BA 3MVZA 3MP1A 3H6WA 4ESXA 3JZJA 4OERA 1MPCA 4F29A 1FTLA 4AB5A 4JSDA 4BDLA 3C36A 1LFIA 4PP0A 4C1UA 5I58B 1JVYA 4QHQA 2VHAA 2GHAA 2PYYA 1GVCA 1PEBA 3VXBA 2UVIA 2Z8FA 3U92A 2NVUB 3B7DA 1MG1A 4P0IA 2A5TB 1QW0A 4OFJA 2ZNUA 2DWHA 1B5JA 1PDAA 5ELVA 5K2XA 1N3WA 4U22A 3TCGA 3FV1A 4I1DA 3Q25A 4G4PA 2HFBA 3SEVA 4GXSB 1TFAA 1OMPA 1M5CA 1QUJA 4ZZEA 1RYXA 1MM7A 1LAFE 3SEYA 3E9XA 4NF5B 4O3AA 4RNSA 5F7VA 2HXWA 3O6IA 1WVJA 4HCWA 4F3PA 1IZ1A 4IB2A 1XHYA 3TQWA 2B3BA 3S4UA 4IGTA 1MS7A 4JBZA 1O7TA 4MBPA 1SDXA 4OETA 1QUKA 4F1YA 3C9HA 1B0LA 3FJMA 3H03A 1VFEA 1B51A 1TT1A 3KN8A 1SW2A 2ONSA 2QMXA 1MRPA 2OLBA 3QAXA 4R2BA 2XXHA 3KZGA 4YKJA 2CMOA 1MQIA 3ODBA 4RYAA 4H8JA 2REGA 4Z0IA 4ELQA 3DP8A 3TCFA 1RYOA 2XD3A 5AA3A 1FQEA 2UVJA 1DPPA 5I58A 2Z22A 4DLDA 5AE4A 4FAJA 1NMUA 3FVNA 1XS5A 2LAOA 5BWJA 3CFXA 3FVGA 3RPWA 1A8EA 2AIXA 3N6TA 1F9BA 2A5TA 4ESWA 2H9BA 4OESA 2W7YA 3FIRA 3BFUA 1PC3A 5I2KB 5K2YA 4ELRA 4YZZA 4RPOA 4NF4B 1LAXA 1JW5A 1T0KA 2DSFA 4NF5A 3M3LA 1NL5A 3K1MA 4F18A 1JQFA 1MXXA 1B4ZA 5L9MA 2QJEA 3SEXA 1EH3A 3S9LC 3C33A 1NNKA 1NNPA 4FECA 3OD7A 4H5FA 3TTMA 1QULA 1UTBB 4MF3A 5CRYA 4IO2A 2Y7WA 2I3WA 4N13A 5ICQA 2V3TA 3IB0A 1S50A 3O66A 2UXAA 4H8IA 4JWYA 3SETA 1DTZA 3TUSA 3B6TA 4AB6A 3V89B 2RKMA 1MXZA 1BKAA 3QSLA 1JVXA 3ZS6A 4U2RA 4UACA 2Y7PA 3L6GA 3IJXB 4RY1A 3H6VA 3HHGA 3OELA 2THIA 2DS9A 4ZS9A 4H65A 3TTKA 2B3FA 1ZLQA 2F5XA 4FEBA 1M5BA 3ILTB 4OENA 3FVOA 1CE2A 4YKKA 2P1SA 1IQ7A 4XKRA 1LB9A 3CSBA 5I57B 3WAEA 4R73A 4RK2A 4R6HA 2XXQA 1WDNA 3VLVA 2ZYMA 1LAGE 2Y7IA 4IO5A 1R9QA 4YMAA 4BDOA 3KJ7A 3H06B 4R74A 1A55A 1JEVA 5CMKA 3KN7A 3O9PA 1OVTA 3O28A 1UTBA 2H98A 2O7IA 2Y84A 4GD5A 1SW4A 2R9JA 3OO6A 4IO4A 4FATA 2QS3A 2O1LA 2B65A 1FTKA 3RGYA 1MXWA 4LUBA 3OO8A 1LFGA 3CR9A 5EHMA 4H5GA 3UK4A 4ZEBA 3EHTA 1D9VA 3MZ1A 5TP9A 3IB2A 5L9OA 2RCAA 5JK4A 3DP4A 1A54A 1MDQA 3S9NC 5ICTA 4OYVA 1A99A 1N76A 1FTJA 3VV5A 5DVFA 3VVFA 4NWCA 5TPAA 4JDFA 2F97A 3KN3A 4GVOA 4F3GA 1N04A 3HSTA 1ZU0A 1US4A 3U8QA 4U23A 1S7YA 1Q1KA 3I5OA 3IORA 3S9MC 3T9XB 4ECFA 4JSOA 2ONKE 1ZIUA 1Q35A 3K00A 3MVYA 3W15C 3PD8A 1OQHA 2I4BA 2DWJA 2DOJA 3PPRA 4G8HA 4KHZE 3IAZA 1XC1A 1I6QA 3N6UA 4Q5TA 4WEPA 3IOVA 1POY1 1L5TA 1IXCA 3N26A 3E13X 4PE5B 5ISUA 1FW0A 3C35A 2VD2A 3KSXA 3PV0E 4QFNA 2O68A 3B6QA 4QFPA 5B70A 3MVWA 4GIZA 3R7XA 1QUIA 4TQUQ 3M3KA 3Q26A 5FTHA 2ALUA 3H3GA 4YICA 1GR2A 3G3FA 2VP1A 2Z23A 5KCJA 5FTIA 3TTNA 4H6DA 3H4ZA 1MQHA 1LLSA 3TKDA 3U72A 5CMCA 1FTOA 3JV9A 1PB8A 4ZZAA 1ZBMA 3GZGA 3IX1A 4PQJA 5CBSA 2DE2A 3DELB 3TQLA 4R75A 2D21A 2H99A 3RQTA 1S9TA 1KWHA 4XKNA 3EHSA 5H8NA 3TFLA 3HO7A 3KBRA 4RA1A 1FQBA 3H7MA 2Y7KA 3FASA 2FA7A 5CI5A 5HBCA 4KQPA 3EQ1A 1SI0A 2CZLA 1Y1MA 3U93A 1B5HA 3IR1A 1B0HA 1B7HA 1B3LA 5IAIA 4IY6A 3HPIA 3MP8A 1N84A 1YAEA 2QS4A 4QRZA 1MQJA 4M1VA 2OBGA 1Y4TA 1B58A 1FTMA 3ZKLA 2Q89A 1II5A 3OENA 4EQBA 3UA8A 1TXFA 4BDRA 4THIA 2QRYA 3A09A 1URSA 2F7BA 1Y3NA 4EXLA 1B2HA 2RC8A 4BDQA 4Q0CA 4NEDA 4QFOA 3LSFB 3VE1B 1Y9UA 3V83A 4EF2A 3U1OA 3EPEA 4KCDA 1IXGA 4YB7A 3RTFB 1MM6A 1TWYA 4XKPA 3G3IA 4DXBA 1I6AA 2DE3A 2F34A 4OXVA 3H6UA 3IJOB 3SEUA 3THIA 2VD3A 4ZDMA 4EUOA 5DT6A 2X26A 1MQDA 4OFLA 2REJA 4QF9A 5I84A 5DYHA 1N0TA 4LONB 2D5WA 2XXIA 3O6GA 2V84A 2XHDA 3CIJA 1CB6A 4G68B 2V3UA 2F6PA 3VXCA 3ECRA 3SERA 3IB1A 2QMWA 3CG3A 2AL5A 4C1TA 4G77A 4K3FA 1B9JA 1DPEA 1UIUA 2D3IA 2AYSA 1DOTA 4ZECA 1GGGA 2HZLA 1VSOA 1QKBA 1MXUA 1URDA 4NF6A 1P1WA 4TLMB 2ZYOA 4R72A 3VVDA 4F3BA 2F7AA 1OLCA 3DLNA 2BJJX 4MFIA 4IGRA 1MQGA 4OTEA 1P1OA 4U1ZA 1LBCA 2PX1A 5FHNA 2I0CA 4EXKA 3D4GA 4F1VA 3IOTA 4DE8A 3TCHA 3PPPA 2HAUA 1ZTYA 3IL1B 4X9TA 4UA8A 1M5EA 3BFTA 2UVGA 3MP6A 2X7QA 4EQ9A 4IY5A 4JWXA 2O51A 2I6EA 2XXXA 1O63A 2V3QA 3M3FA 4ELOA 1B3GA 3Q27A 2A5SA 5TP9B 3KSJA 1VE4A 4C0RA 1P1NA 2DWIA 2HZKA 3PUXE 1EZ9A 1B3EA 4H1XA 2YLNA 4MLQA 4ZE9A 3OMBA 2PT2A 5DTBA 3E4RA 1BLFA 2DXYA 3QYTA 5TPAB 4G68A 3OO9A 3CVGA 3MZ9A 1H76A 5CMMA 4GOTA 1SBPA 4F31B 4ZEIA 2IA4A 1N7XA 4NMYA 1ATGA 3QUJA 3LBSA 2RC7A 3KFMA 3PUZE 1SVXB 4IO6A 5H8QA 3Q28A 4U4XA 1J1NA 4GFRA 1JW1A 4OWDA 2YJPA 4KD5A 2I4CA 1AMFA 4KYEA 5I56B 4NF8A 2XX7A 4L17A 3PPOA 1BTJA 1P1UA 4F2OA 4PFTA 3PMXA 1B1XA 2I0BA 3RT6B 3B6WA 3G3GA 1H45A 2PMSA 5B7DA 3M8UA 3PPNA 2O7UA 4X1BA 4DCXA 2ANJA 3CFLA 1EZPA 1MY3A 2QPQA 4GXAA 4F1UA 3FVKA 4WEDA 4JWOA 1B7ZA 2XXUA 4RXLA 2ESNA 3T93B 4NWDA 4OZ9A 1B1HA 3MZBA 4G8NA 1GTKA 1Y4CA 3VLWA 5KCJB 5H8HB 1MY4A 3DM0A 4DIGA 1B5IA 3PMVA 5HPQA 1IXIA 4KCCA 5ITOA 2RF1A 3OSQA 1JEUA 4R2FA 3UORA 1MH3A 4OMBA 4POXA 3RN8A 1OIBA 2DE4A 4F19A 4BDNA 4MLVA 3OEMA 3PUWE 5F1QA 4F39A 2NXOA 5H8NB 3Q29A 4EDPA 1MXYA 3GBAA 3ZKKA 3GLBA 4M4GA 2V25A 1LSTA 3G3JA 4F2QA 1R9LA 5AA2A 3SKPA 3RTWB 4X1DA 5I56A 1A40A 4XKQA 1MPBA 3SESA 1VFDA 4OEVA 3MQ9A 4LQ5A 2ZNSA 4N6PA 4QFLA 4WXJA 4BLAA 3MC2A 2ZYKA 1HSJA 5FHOA 4IO3A 4GRKA 2XD2A 4HCYA 5I59B 4OFOA 4P0GA 3TTRA 3R26A 2FNCA 4RJZA 4I62A 1Z7ME 4Q8RA 2I58A 5KDTB 2M8CA 1YTVA 1Z7NE 3TPAA 3K1NA 3UIFA 5DEXA 1D4NA 4I8CA 3VFJA 5H8HA 4YU0A 1LGBC 1IUDA 2Q2AA 1UIVA 1B52A 4OVJA 2ZXTA 2VOZA 3VDFA 3K01A 4AQ4A 3CI8A 1UTHA 3D4CA 3OEKA 5JEIA 3PUVE 4O3BA 1BIYA 1QJMA 1LCFA 2GHBA 2QS2A 4NE4A 3T22A 4ISUA 2PT1A 3QIMA 3HN0A 1SYHA 4U21A 3TODA 3LSXA 2AL4A 1N7WA 1O64A 2ABHA 2H5YA 1PBPA 3C4MA 5AA4A 1N3XA 1Y3PA 1ZKBA 1LB8A 3A3CA 4ND9A 3TZAA 3EN3A 3FUZA 3O2AA 2E0SA 3EF7A 2RCBA 3PU5A 2DWAA 3UGWA 2KLFA 2OJTA 5DVIA 2UVHA 4YMBA 5L9SA 4ELPA 4LA9A 1RKMA 1B4HA 4G68C 1R6ZA 3JYRA 1IEJA 4R9FA 3C34A 3FATA 5I59A 1EZOA 3K2DA 1SD3A 1ELJA 2RINA 2HAVA 1USYE 1DSNA 2OWTA 4NF6B 5IKBA 1FQAA 5KDTA 4QSDA 3K6VA 3IO4A 2V93A 2F35A 3IO6A 2G93A 1H43A 3PUYE 3C31A 3LSWA 4FJPA 2F6GA 4QSCA 4LVQA 1JNFA 1YCJA 1JETA 4YB6A 5I2NA 4U4SA 3UN6A 4EF1A 3DP6A 3MJNA 4KYSA 2P0SA 3TMGA 3V5AA 3RNNA 3FD3A 3LC8A 3PPQA 2XXWA 4TOZA 3V8XB 1BP5A 1FQFA 1NH8A 2O1MA 4TLLB 4GL8A 3CRBA 1FQCA 1NFTA 4NTLA 3OO7A 4H0WA 4WKMA 4LQ2A 4ONYA 3ONMA 4HTGA 3FXUA 1URGA 3O6HA 5TU0A 4GWOA 5A5XB 3MPKA 2O6AA 3TDJA 1FCKA 3MW0A 4LP2B 5CC2A 3KOTA 2DYXA 1A8FA 2PBWA 4F22A 3RUMA 3K4UA 4E0XA 4ZEDA 2F8DA 3HCQA 5H8FB 2O69A 4PETA 5CMBA 3W9VA 3G3KA 4YKIA 2DXRA 1GV8A 5H8SA 3TAJA 3MAMA 3K02A 4P11A 4YB5A 3TTLA 5LOMA 4G8MA 4GL0A 1OQGA 3T9VA 1Y20A 5H8QB 1SI1A 3FXRA 3H6TA 4GF8A 4DZ1A 3G7WA 1DTGA 3O97A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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