4GRKA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with ketorolac at 1.68 a resolution
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with ketorolac at 1.68 A Resolution
rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 113
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-08-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4grkA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4grkA02
1L5TA 4E0WA 1FTKA 2Z23A 1NH7A 4GL0A 2VP1A 4O3BA 5CI5A 5I56B 2ONSA 2ZNUA 3UIFA 1MXXA 1S9TA 1TWYA 3GXAA 2HAUA 1P1UA 4YB6A 2PYYA 1XT8A 3RTFB 4KYDA 5TP9B 3S9MC 3FV2A 2O69A 3K6WA 1D3KA 3G7WA 3LSXA 2GRVA 1JW1A 2RC9A 3M8UA 4O3CA 4M4GA 1FQFA 4LATA 3IB2A 4WEPA 1IXIA 2DE4A 1B2HA 4F18A 1B46A 2CMOA 1Y4CA 3IX1A 4BDLA 4NF4B 3S2VA 1KWHA 3KG2A 4GVOA 1B9JA 1ZTYA 2O6AA 4QFOA 3SDFA 4FIMA 1B0LA 1B7HA 3C4MA 3TTRA 4RK2A 4F29A 3UN6A 4ZZEA 2DXYA 2Y84A 4NWCA 4FE8A 3FJ7A 4MLQA 4O3AA 5AA1A 1B3HA 3CSBA 3FJGA 3ILUB 4F3PA 1BLFA 4QF9A 3DLNA 3T93B 3IL1B 5AA2A 4YICA 1JW5A 1N76A 3KN7A 3V8XB 4EF1A 1M5FA 1MPCA 1NH8A 2RINA 4GXSB 4IO3A 4JWYA 3QSLA 5TP9A 3GLBA 3PUWE 1MY4A 3EHUA 4NF5B 1JEUA 4NWDA 4HTGA 3QUJA 3K6VA 5HPQA 5I56A 1MRPA 1A54A 2ZMBA 4LVQA 1PB7A 3FV1A 4RXLA 5I2NB 4MLVA 5DTBA 1S7YA 1FTOA 4NF8A 1N3WA 3KOTA 3FIRA 4JBZA 2YLNA 1MXYA 4KR5A 2F6PA 5JEIA 2I3VA 5ITOA 2RCBA 3RGYA 2O68A 2A5TB 4YB7A 4ZE8A 3ZSFA 4GOTA 1YAEA 3MUQA 3T9VA 3IOUA 4QFPA 3QAXA 2O84X 3VLWA 3CFXA 4KCCA 3VE1B 2E0SA 1A7LA 3TPAA 4OERA 1MY0A 3PUXE 3P7IA 1NMUA 2F5XA 2E1SA 1EZOA 2F7AA 3C32A 5TPAA 4U22A 2XX8A 4G68C 4JWOA 4OTEA 4R9FA 3OSRA 1ZIUA 4RPNA 3FGSA 1GGGA 3IORA 1N84A 3O97A 4F3GA 2Q8JA 1LCFA 1P1WA 3ECRA 1CB6A 3Q25A 5CMMA 4IGTA 2HQ0A 2LAOA 1MXWA 5CRYA 3TTMA 4EQ9A 3LC8A 4PFYA 1LAGE 2YPNA 3H3GA 3TODA 5JTYA 4G2ZA 4NTLA 1SQYA 2F34A 3VV5A 1TT1A 2DYXA 3C34A 2F7BA 3Q26A 4NF4A 5ITPA 1P1OA 3HV1A 4L17A 4EUOA 3O9PA 2QPQA 2I0BA 3BKIB 4U4SA 1MH4A 3W15C 3FD3A 2G93A 2B3BA 2PX1A 4DXBA 5K2XA 2UXAA 4HCYA 1HSLA 3TELA 3MP8A 2UVHA 2XXQA 3MZBA 2FA7A 4IO4A 4QSCA 4G77A 4ZDMA 1VR5A 2ZYNA 5K2YA 3TTKA 3FVNA 4YB5A 1FCKA 2ESNA 4AQ4A 1QUKA 3B6QA 1IEJA 5AA4B 1US5A 1MQGA 3MPLA 2DP8A 1N0TA 1ZBMA 2ZXTA 3H6WA 3H4ZA 3C9HA 2V3QA 1D9YA 5I58A 3JV9A 1PBQA 1FTMA 2RF1A 3FASA 1P1QA 3KN8A 2D5WA 4FECA 3RN8A 4C0RA 5A5XA 3MBPA 3O6HA 4G8MA 4WEDA 4H8JA 1QKAA 4HCWA 1SW4A 4IO6A 1N04A 2XHDA 3QYTA 2XXIA 4LZ8A 1R1NA 4JDFA 4UACA 5DVJA 3T96B 2V3UA 3TQWA 1HSEA 1IIWA 2XD3A 2DSFA 1LB9A 2ONRA 2XXUA 1Q35A 3KFMA 2FNCA 4HS7A 4MF3A 3CSGA 3SEUA 1WVJA 2HZLA 1MG1A 4R6KA 3HPIA 3IB0A 3K1MA 1Q1KA 2Z8EA 3K0VA 3HSTA 3QIMA 3CFZA 1MXVA 4POWA 1ZLQA 3N26A 3EN3A 3RT6B 4ZE9A 1POY1 2DWIA 3OO6A 1PC3A 1Y1MA 3PMXA 4P0GA 1YTVA 3DP4A 4TLMB 4YKKA 1DOTA 1B3GA 3KOSA 1I69A 2XXHA 4GWOA 4C1UA 1H43A 4R72A 2DOJA 4LQ2A 4OZ9A 4QSEA 3VVDA 5I57B 1A40A 4XXUA 2NWJA 4F2OA 1NNKA 2OCUA 4OEVA 4YMAA 1QJMA 4OQOA 4ZECA 1XC1A 2IEEA 3OEMA 1UTHA 3K00A 3OEKA 1POTA 4PQJA 3IJXB 4WXJA 4PE5B 3RNNA 4AB6A 4ELQA 1PEBA 3K6XA 2Y7RA 3SEWA 1MQHA 1LBBA 2DWHA 3C35A 3H6UA 3PPPA 3M3KA 2ZYMA 1ZU0A 4OWDA 4TOZA 2PT2A 1SI1A 4ZEKA 5JTYB 5M2VA 4ESXA 3TUSA 5B7DA 1FQCA 3R6UA 3DELB 4R9GA 4EF2A 3ZKKA 1SBPA 1N7WA 1OQHA 2DQVA 2AL5A 3FXRA 2Q2AA 3N94A 3OO9A 2A5TA 1MY2A 4IB2A 1HSJA 1LLSA 2XX9A 4PFTA 5DYHA 3MZ1A 1NKXA 3G3FA 2Q9TA 4KYSA 3C33A 2XXXA 4H65A 4U4XA 5DEXB 2D3IA 2PT1A 1M5DA 1WDNA 3TTNA 2HCAA 4F1UA 3GZGA 2O7UA 4R2FA 5L9MA 4F22A 1SVXB 3DM0A 3I5OA 2F6GA 3O6GA 3OENA 4OESA 4JWXA 4R75A 3S9EA 3IK6B 3G3KA 3PUZE 5JK4A 4WKMA 4KYEA 3RUMA 5H8QA 2O7IA 5HBCA 5BUUA 3L6GA 3R26A 4OETA 3VXBA 1PB8A 5FTIA 2DE3A 3Q28A 5KDTA 3CRBA 4YU0A 4R6HA 4XKPA 4Z0IA 3RT8A 1PBPA 1SI0A 1URSA 2I48A 5H8NA 4KQPA 3ZKLA 4H67A 4NMYA 5I2NA 1PDAA 5F1QA 4K3FA 2FYIA 1VSOA 1MPBA 4N07A 4OHNA 4X1BA 4PFUA 1QULA 3N5LA 5DEXA 3N6TA 3O6IA 4M1VA 4F2QA 4F3SA 4OXVA 3MVWA 4MH5A 1JETA 4EQBA 5HM4B 3PPNA 3IR1A 1FTLA 2GH9A 4F3BA 5AA2B 2Q89A 2VD2A 4PP0A 2BJJX 4ZEDA 4QFKA 4DXCA 1I6BA 5I59B 2R71A 4KD5A 5LOMA 3MW0A 3FUZA 3HHFA 2XXWA 3TQLA 3TTLA 2V3TA 2HFBA 4MFIA 5EHMA 4ELRA 1RKMA 2Q88A 4U1ZA 4IO5A 1O7TA 2ZYOA 2X7QA 4KHZE 4LZ7A 4P11A 2F97A 3M3LA 5DVFA 5TU0A 4DCYA 1DPEA 3TYHA 3B7DA 1A55A 4YKIA 5I84A 2PBWA 3TFLA 4H5FA 5H8SA 3S4UA 3U1OA 1IXHA 4GL8A 4ELOA 5H8FA 1VFDA 1AMFA 2CZLA 4F1VA 2OWSA 1XVYA 2Q2CA 1UTHB 1SDXA 3VDFA 4RPOA 4ZZAA 3PPQA 3RLFE 2DVCA 4N6PA 4I62A 2I4BA 1MXUA 4NF8B 2REJA 3G3JA 3LUYA 1D4NA 4G68A 4G8HA 1B40A 4U2RA 3TKDA 1Z7ME 4HW8A 3PD9A 5AA3A 1B3FA 3TCFA 1M5EA 3HN0A 1AIVA 5I2KB 4KCDA 2HAVA 3PU5A 2O51A 3O29A 3SERA 3SEYA 4BDNA 3MZ9A 3PGFA 4FATA 4Z7EA 1LB8A 1QW0A 1LFGA 2OWTA 2DWJA 3CG1A 3FATA 3JZJA 4H8IA 5FHNA 2XX7A 1ZKBA 5H8QB 3U92A 1EZPA 1JVYA 4ELPA 2QMXA 5DT6A 3SEVA 2V84A 2F35A 2QL3A 3B6TA 5FHOA 3PPRA 1O64A 3V5AA 3V89B 5CMBA 2RCAA 4DXUA 5AA4A 4EXLA 1PB9A 2XXTA 3O66A 3PPOA 4IO2A 3AXFA 4YAHX 3UGWA 2XXRA 5J1DA 2Y7KA 2NXOA 3RTWB 3MPKA 5AA2D 3BFUA 3UP9A 5B70A 4EDPA 1LGBC 2HEUA 3RPWA 1OVTA 3TMGA 4P0IA 1NL5A 4XIGQ 3GBBA 4LA9A 3MP6A 4THIA 4ECFA 1TFDA 4Q8RA 4GXAA 3IO6A 4OFJA 2UYFA 4JXIA 1D9VA 2P2AA 1MQDA 1B1HA 4RY1A 4X1DA 1J1NA 1S50A 3N6UA 5FTHA 1GR2A 1B0HA 3K1PA 3VLVA 4AB5A 1BIYA 3FXQA 1MXZA 1Y9UA 3IOVA 3O28A 4LUBA 1QVSA 4YKJA 4DZ1A 4TQUQ 4YZZA 3MVZA 2Z22A 4BDQA 4ND9A 2AYSA 4KPTA 3KSJA 5H8HA 3TZAA 3EQ1A 1IUDA 1GTKA 1H76A 1SW2A 3PMVA 3KZGA 3MVYA 4H5GA 1MDQA 2V25A 1P99A 4TLLB 1BP5A 2QMWA 3KSXA 4GD5A 4GQOA 5ELVA 1LAHE 2F78A 2D21A 2R9JA 4DLDA 3IOWA 3SKPA 3G3HA 3QXMA 4GF8A 1AOVA 1R6ZA 3U8QA 3KEIA 3A09A 2NVUB 4BDMA 5BWJA 1FQAA 2H5YA 1B51A 3T9HB 2ABHA 3TEPA 4LONB 2THIA 3SEXA 4OFLA 2GFEA 5CBRA 4FAJA 3D4GA 2OBGA 1T0KA 1Z7NE 2QSXA 3ILTB 3MAMA 2HXWA 2DWAA 3FVKA 1XHYA 1LBCA 3KJTA 3H03A 3A3UA 1AL3A 4OVJA 2F7CA 1NNTA 3G3IA 4N13A 4X48A 4YMBA 2UYEA 4OMBA 2OLBA 3MP1A 3MQ9A 2PMSA 2XXVA 4X9TA 3U93A 4FEDA 3H7MA 1DTZA 1TXFA 1MDP1 2XXPA 3K2DA 3FVGA 4Q5TA 3Q29A 1NNFA 1B52A 4RA1A 4XKQA 1OVBA 1RYXA 5IAIA 1JEVA 3CIJA 1B32A 3I6VA 5H8HB 2B65A 2DVZA 4PETA 3S9LC 3BFTA 3HHGA 4GFRA 5F7VA 5ISUA 2YJPA 2ZNSA 3DP8A 1URDA 3C36A 2IA4A 1VFEA 1IZ1A 4LP2B 1GVCA 2NOOA 2PVUA 3LSLA 5DVIA 2G29A 1B5IA 3CG3A 3DP6A 4ZEBA 1UQWA 2Z8FA 1B4ZA 3VVFA 1Y1ZA 2XXYA 1I6QA 3OO8A 4ZS9A 3W9VA 4JSDA 5CBSA 1EU8A 4R2BA 3KBRA 3UA8A 3LSWA 1JQFA 1SW1A 1IQ7A 1MM6A 4NF6A 1IITA 3VLUA 4E0XA 5I57A 2QS4A 5L9OA 1LAXA 2DE2A 3LSFB 1LCTA 3GBAA 2UVGA 2W7YA 4NEDA 1FW0A 1WODA 3FJMA 2H99A 3Q27A 2VOZA 3QK6A 4I9DA 4RNSA 4F1YA 1A8EA 3HCQA 5L8DA 5A5XB 3C31A 3VVEA 5ICQA 3LBSA 1JVXA 2F36A 2X7PA 4XTCQ 3PV0E 4RJZA 4ZEFA 1UIVA 2X26A 3T9XB 4F19A 1UIUA 4FJPA 4G68B 1B05A 1M5BA 1FQDA 2REGA 1DMBA 1F9BA 2KLFA 3LR1A 3HO7A 5CM6A 1N7XA 1ELJA 1I6AA 2QS1A 4H6DA 1VE4A 4IO7A 4JB7A 4JSOA 1II5A 4BDRA 5KDTB 1JW4A 1O63A 3K6UA 4RYAA 3B6WA 3V83A 4ISUA 1BTJA 4LZ5A 1DTGA 1FQEA 3JYRA 1MY3A 3O2AA 4IY5A 1FQBA 1YCJA 2H25A 3FVOA 4QSDA 1SD3A 3T22A 4NE4A 3OO7A 3U94A 4DCXA 1M5CA 2I4CA 2GHAA 3OSQA 1MPDA 2HZKA 4OENA 4F39A 4GIZA 5KZTA 5ICTA 1NFTA 2ANJA 2QJEA 2H9BA 3E4RA 5I2KA 1QKBA 2OJTA 4FORA 4IY6A 2ALUA 3IB1A 4H1XA 4QHQA 2QRYA 3THIA 3VXCA 1LFIA 1RYOA 1SYIA 5I59A 1B7UA 3KN3A 2QS2A 1H45A 1QUJA 4R6YA 2DXRA 1MQIA 1JNFA 1OQGA 4LQ5A 1EZ9A 3W9WA 2Y7IA 2A5SA 1B4HA 1US4A 1R9QA 1NNPA 3IJOB 3OOAA 2H98A 3TDJA 4DDDA 3S9NC 2GHBA 4G4PA 3PMWA 1GV8A 1OLAA 3OD7A 1Y3QA 2ZNTA 2Z8DA 3EPEA 1B3LA 2P1SA 5KCJB 3EHSA 3G3GA 1Y4TA 3KGCA 4UA8A 1MY1A 4DE8A 3U72A 3CI8A 3H06B 1OMPA 2M8CA 2R6GE 1UTBA 1DSNA 2F8DA 1LSTA 1XS5A 3MVXA 3T9UA 2H4IA 2O1MA 2UVIA 1Y20A 3TAJA 1QUIA 3SETA 3T66A 1B6HA 2VD3A 3SESA 5IKBA 4KI0E 5H8NB 2Y7PA 5FHMA 4ZEIA 1MH3A 3E3KA 5CMKA 4F31B 4EXKA 5TPAB 1N3XA 3UORA 1B7ZA 1SW5A 1Y3PA 4IGRA 2QS3A 3EF7A 3RQTA 2Y7WA 3MC2A 4U21A 1XVXA 3FXUA 3ONMA 4Q30B 1B3EA 1LAFE 3L6HA 4OFOA 2B3FA 2RC8A 5EHSA 5EYFA 5L9SA 3IOTA 1XOCA 3UK4A 4I1DA 1YPNA 4GRKA 4QRZA 3MJNA 1TFAA 3E9XA 4OEUA 1SYHA 2XD2A 1UTBB 2VHAA 3K1NA 3ZS6A 4YKPA 1OLCA 5H8FB 1ATGA 3OXNA 5I58B 3FZVA 3OELA 3H6TA 3K01A 2I0CA 4QFLA 4EQ7A 2WKYA 1IXGA 2I58A 5KCJA 4NF6B 3VFJA 1EH3A 1BKAA 2OZZA 2VGQA 3MWBA 4XKNA 3EHTA 4DIGA 2OK2A 2I6EA 3I3VA 3PUYE 4QFNA 4NF5A 4XKRA 3RY3A 3ODBA 4R74A 1B1XA 3CR9A 1H3DA 1A8FA 2I49A 2V93A 5CMCA 4BLAA 3QUFA 3IAZA 4RK9A 1CE2A 1ZJLA 4POXA 3PUVE 2I3WA 2RKMA 3K4UA 1MQJA 3M3FA 4KFQA 2O1LA 2NUVA 1R9LA 3IO4A 1Y3NA 4Q0CA 2RC7A 2P0SA 1B58A 2UVJA 3TCGA 3BBRA 3E13X 4MBPA 3TCHA 3OMBA 4ONYA 3USDA 5AE4A 1ANFA 1B5JA 4U23A 5CC2A 1URGA 2ZYKA 1ZMGA 4GLIA 3WAFA 3WAEA 4OYVA 3F11A 2DS9A 3PD8A 4ESWA 1LFHA 1USYE 3CVGA 1DPPA 1B5HA 2ONKE 4H0WA 4FEBA 1FTJA 3R7XA 3H6VA 1MM7A 2AIXA 2AL4A 1IXCA 1P1NA 3A3CA 1USYH 3D4CA 1OIBA 4G8NA 4R73A 4BDOA 3KJ7A 1A99A 3CFLA 4C1TA 1MS7A 4U1OA 1AH5A 1H44A 3K02A 4PFWA 4I8CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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