3TDJA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j-l483y-n754s) in complex with glutamate and bpam-97 at 1.95 a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
b'KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECGS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Thermodynamics and structural analysis of positive allosteric modulation of the ionotropic glutamate receptor GluA2.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 82
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-11
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tdjA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tdjA02
3O28A 3IAZA 1MPCA 1B32A 3B6WA 4H0WA 4EXKA 2YJPA 4OQOA 3O6IA 2Q2AA 3PD8A 3ILUB 4G8NA 2QMWA 2DWAA 4BDOA 2D21A 4QHQA 4THIA 2XXQA 3Q28A 2Y7RA 2Z8FA 2UVIA 5B7DA 4IO6A 1R9QA 1I6QA 5L9OA 4EXLA 5CC2A 5HM4B 3HSTA 5KCJA 3VXCA 3LSFB 4ZEBA 4BDNA 4K3FA 4GIZA 3MQ9A 4GFRA 4GOTA 1MQGA 2UXAA 4FIMA 4YAHX 4R6KA 2V84A 3L6HA 3Q26A 3FIRA 4IB2A 5CMBA 5M2VA 2F7AA 3PV0E 1DSNA 1DTZA 4KHZE 1AL3A 5H8SA 5TP9B 2ONRA 1LSTA 4R6HA 4NF5B 2XXIA 1UTHA 5AA2B 3JV9A 4RA1A 2QS1A 4QFOA 4RPNA 3RTFB 2F35A 4R9GA 3G3GA 1IXIA 4ESWA 4G8HA 3PPOA 1B0HA 2R71A 3EHSA 3VXBA 2AYSA 4RJZA 1QJMA 1YAEA 4DCXA 2DS9A 4DZ1A 3BKIB 3N94A 3VVEA 1JW4A 1LB9A 3KOTA 5IKBA 1EZOA 1FQEA 3B6TA 2H9BA 4GD5A 1R6ZA 4ZS9A 2O68A 3CG1A 1N3WA 3OO6A 5CMCA 4M4GA 3PPNA 2O7UA 4GL0A 2I3WA 2P0SA 1FTJA 1N7WA 4ZEKA 1XS5A 3UORA 2F6GA 3GXAA 2VOZA 1B58A 3HV1A 5I56B 4ZDMA 4UA8A 5AA2D 5I57B 4DIGA 4EQ9A 1AH5A 1B3FA 1MG1A 5K2YA 1LAGE 2CMOA 3K4UA 4AQ4A 4FORA 4IGRA 2V25A 4H8IA 4GF8A 1EZPA 5JK4A 2VP1A 3KSJA 5KDTB 4KYEA 3S9NC 4GVOA 3MPLA 3UIFA 2G93A 3E13X 1QW0A 1OIBA 3GZGA 2FYIA 4F2OA 2A5TB 1SI0A 1Q1KA 5FTHA 3PPQA 3S9LC 4QRZA 4FATA 2NXOA 1B05A 3U93A 1TFDA 4NEDA 2Y7PA 3KN8A 4YKIA 2DWHA 1GV8A 3O9PA 2OWTA 5TPAA 1Y1ZA 1WODA 1IXCA 2OWSA 4R75A 3SEUA 1N0TA 1AMFA 1A99A 1NNKA 1BLFA 3G3HA 2F36A 4P0GA 3N5LA 4IY6A 1ELJA 1R9LA 4H67A 2DVCA 1OQGA 1ANFA 2UVGA 3HHFA 2DE3A 4DE8A 2PVUA 3SEYA 4QSCA 2VD3A 5BUUA 3QIMA 4JB7A 1POY1 1SVXB 3HHGA 2XXHA 1B7UA 4P11A 5CMMA 3CR9A 2UVJA 2QS4A 4IO3A 4X48A 3IJXB 3QSLA 4JWOA 3PUZE 2Q2CA 2Z23A 4NF4A 1TWYA 4H1XA 1Y3NA 1US5A 1Y3PA 1OVBA 2GHAA 2X7PA 2OBGA 1MH3A 4R2FA 4OFJA 1A7LA 4QFKA 2QS2A 1A54A 3FVKA 4O3CA 1WVJA 5DVIA 4NMYA 3PUVE 3MVZA 3OO9A 4C0RA 4XKNA 4TQUQ 4U22A 4C1UA 2NOOA 3K6VA 2I58A 4LZ7A 4F3PA 5I2NB 4O3BA 2ESNA 3TTKA 3DLNA 4IO7A 1P1OA 1JEVA 5H8HB 3IB1A 3VDFA 2A5SA 3TTMA 4YICA 4L17A 4F29A 3OXNA 4EDPA 2GRVA 5L8DA 5CBRA 1IXGA 2PYYA 5CBSA 3ECRA 3U94A 1XC1A 4KCCA 3DELB 3AXFA 3TYHA 1NH8A 2AL4A 3SETA 1MQJA 2F5XA 3H7MA 4PE5B 5FHMA 1B3GA 4OXVA 1IIWA 4FJPA 3PD9A 2XHDA 3EN3A 1OLCA 1N7XA 4XKPA 2H99A 5AA1A 1MH4A 1SI1A 1B0LA 2YPNA 1ZLQA 1GTKA 3TKDA 1SYIA 3FVNA 5ITPA 4AB6A 5AA4A 5HPQA 2HEUA 3G3JA 4KFQA 1M5EA 2QRYA 3OO8A 1IEJA 2ZYKA 2ZXTA 3QAXA 1VFEA 3K0VA 4FEDA 3CFZA 5FHNA 5KCJB 3G3KA 1P99A 4TLMB 3CVGA 3OOAA 1NNFA 1MS7A 3TTNA 4YU0A 1UIUA 3OO7A 3TQWA 1B5IA 1FQCA 4F1UA 1VSOA 2DQVA 1IXHA 4KD5A 3LBSA 1BIYA 1GVCA 4U4XA 3MZ9A 4G68C 4Q0CA 3K00A 3SERA 5TU0A 3A3CA 3FXRA 5ITOA 1B51A 3QK6A 1UTHB 3CFLA 3IB0A 4Q5TA 3TZAA 1FQBA 3PPPA 2HZLA 3FGSA 3FJMA 4RPOA 3Q29A 4JBZA 2P1SA 2Q8JA 4LP2B 3VV5A 3B6QA 3S2VA 5CI5A 1OLAA 1SW2A 4XTCQ 1R1NA 5ELVA 1MXZA 3I6VA 2PT2A 2THIA 2XXYA 3VVFA 1M5FA 2O1LA 4IGTA 4ZEIA 1SW4A 3O29A 1MY3A 4ZECA 4EUOA 3TPAA 2P2AA 2OLBA 4KI0E 1IITA 1B9JA 4KPTA 1JVYA 4BLAA 1URGA 1LFIA 3OSQA 1MY4A 4BDLA 3H3GA 2VD2A 3GBBA 4FE8A 1URDA 3KN7A 3C34A 4POWA 3K1PA 4MLQA 2RKMA 2XX9A 3O97A 1Y1MA 3KG2A 4RXLA 2XX7A 3FUZA 1VE4A 4YZZA 3FXQA 2F7CA 2BJJX 3T9VA 4NF6A 1MXXA 3W9VA 3EQ1A 3CSBA 4H5FA 2FNCA 1USYH 4LATA 4R72A 5H8QA 1F9BA 4ELPA 2NWJA 3D4CA 4YB5A 5I58A 4Q8RA 4RK9A 2D5WA 1NNPA 4G77A 5TPAB 4DLDA 2FA7A 3GLBA 2X7QA 4C1TA 1Y3QA 3MWBA 1LCTA 3H6WA 5EYFA 3PU5A 3M3LA 2XD2A 2UYEA 4LZ8A 4MF3A 3UK4A 3LSWA 1PBPA 1VFDA 2ZNSA 1TFAA 3S4UA 2O6AA 2PX1A 4BDQA 3EF7A 1PBQA 2HAUA 1FTOA 2DE2A 3U92A 2RCAA 4PFYA 1NMUA 3IORA 3C33A 4HS7A 4F2QA 3S9MC 3LSXA 4ND9A 3IOUA 3IB2A 3H6TA 1ZIUA 3FD3A 3DP8A 4LUBA 5I84A 1ZBMA 3PMWA 3U72A 1MXWA 2HAVA 1XVXA 2YLNA 2Z8EA 3MC2A 3VFJA 1XT8A 3H4ZA 3MVYA 2XXRA 1US4A 1LFGA 4YB7A 2ONKE 4QFNA 3Q25A 4LQ5A 1Y4TA 4NF4B 3K6UA 4WEDA 1SW5A 4NWDA 3RLFE 2O1MA 2ALUA 2OZZA 3F11A 2LAOA 1JW1A 3K6XA 4G68A 1UTBA 3JYRA 2GFEA 3DP4A 3T22A 4IO4A 3EHUA 3HO7A 3QXMA 2ZNTA 3VE1B 5B70A 1D9VA 2R9JA 1IQ7A 1LB8A 4GLIA 3CG3A 2XXXA 3FV1A 4XXUA 3G7WA 1B3LA 4LZ5A 4YMBA 1JW5A 1SQYA 1FCKA 5JTYA 2H5YA 3FJ7A 3H6VA 3LSLA 4P0IA 2Q88A 3KBRA 1NNTA 4NF8A 4X1DA 3KFMA 5HBCA 3G3IA 4N6PA 3E4RA 3MP6A 2RC9A 1ZMGA 3THIA 1MM7A 1O64A 3JZJA 3CI8A 4OEUA 4KYSA 3OEKA 4KCDA 3K1NA 4U21A 3LUYA 2REGA 1LAFE 4H5GA 3ILTB 5CRYA 4ZE8A 1B4ZA 3RN8A 1IZ1A 2HZKA 3H06B 4OZ9A 4OERA 4GXSB 4KQPA 3OMBA 3ZKKA 2XD3A 4Z0IA 3RT8A 5AA4B 3FATA 3R6UA 1PB9A 1KWHA 4QF9A 3TMGA 4MLVA 4F3SA 1O63A 1SD3A 1NFTA 1WDNA 4F31B 3ZSFA 4U1OA 1JQFA 2E1SA 1VR5A 4OESA 3PUYE 5DEXA 1PDAA 4F3BA 1ATGA 2M8CA 3FXUA 1B3EA 4IY5A 2IA4A 3CFXA 3OEMA 1B1HA 2Q89A 3A3UA 1ZTYA 3CRBA 1LBCA 3K02A 2I48A 3KEIA 4NTLA 1FQDA 2I49A 2O84X 4HCWA 2ZNUA 4ONYA 2HFBA 1USYE 2PT1A 4JWXA 3S9EA 1DOTA 3H6UA 4PQJA 4I1DA 3LC8A 1YTVA 3FVOA 2F7BA 2O69A 1Y20A 2XXPA 2QMXA 1M5BA 1LLSA 1JVXA 1URSA 4ZEFA 4Z7EA 3KJ7A 1A8EA 1LAXA 2I3VA 3T66A 1LBBA 1MY2A 3HPIA 3TFLA 5I59A 3TCHA 3SEVA 3TDJA 3TODA 5JEIA 3PMVA 1MPBA 2DOJA 4ELRA 1GR2A 2DSFA 4DXBA 1B5HA 1HSJA 4OETA 4YMAA 1B1XA 2HQ0A 2B3FA 1P1QA 1AIVA 4PFTA 4AB5A 4EF1A 2PBWA 5F7VA 2I4BA 4F3GA 3N6UA 2V3TA 3R26A 1UIVA 2XXUA 3UN6A 1QUIA 3K2DA 4GQOA 5KZTA 4F1VA 3HN0A 4NF6B 3I3VA 3ZS6A 1I6AA 2DVZA 5DT6A 5DVJA 3GBAA 2UYFA 3RGYA 4OHNA 3FZVA 5I58B 2CZLA 1NH7A 4WEPA 3HCQA 3IOWA 2HXWA 3M3KA 4N07A 4JSDA 2VGQA 3C9HA 4I62A 3U1OA 1MY1A 1N04A 1Y9UA 2ZYMA 2RINA 3IR1A 4EF2A 1NL5A 2OK2A 3T9XB 4BDMA 3C36A 2Y7KA 3SDFA 1S7YA 4PFUA 1CB6A 2B65A 4E0XA 1B46A 5K2XA 3ZKLA 2ONSA 2GHBA 3MVXA 1FTMA 4H65A 3IO6A 2ZYOA 3TEPA 3OD7A 2O7IA 4R9FA 3MZ1A 1I6BA 1FQFA 3UGWA 4ISUA 3ODBA 4KR5A 2RC8A 4O3AA 4BDRA 4H6DA 4ZE9A 4JSOA 3QUFA 4UACA 2I4CA 2AL5A 3KJTA 3VVDA 1MRPA 1QULA 1XHYA 4G8MA 1HSEA 4G68B 1UTBB 2B3BA 3IJOB 3L6GA 1EU8A 4MH5A 3U8QA 2AIXA 1JEUA 1MPDA 4G4PA 3I5OA 4DCYA 3RPWA 4KYDA 2Y7WA 2XXVA 3MAMA 1BKAA 2NVUB 3C35A 2DP8A 1QUJA 1AOVA 1QKBA 5H8NA 4OFOA 3UP9A 4ESXA 3SEXA 1N76A 1XOCA 5JTYB 3TTRA 2H25A 3TCGA 1MXYA 1MDQA 2F6PA 5IAIA 1J1NA 3MBPA 3V89B 4TLLB 4ZZEA 4NF8B 4M1VA 1Y4CA 4OWDA 1SDXA 3RQTA 2X26A 4GXAA 1UQWA 1Z7NE 3G3FA 4R6YA 1H76A 4TOZA 4PP0A 5I2KA 3UA8A 1PB8A 3MJNA 4ZEDA 1Z7ME 1QKAA 4Q30B 3VLUA 1B7ZA 4HCYA 2NUVA 3USDA 3MP8A 3FV2A 3QYTA 1N3XA 3RY3A 3PUWE 1II5A 3MPKA 3T96B 4U4SA 4WKMA 5ICTA 4I8CA 4F18A 3T9UA 5J1DA 3M8UA 3RNNA 1FQAA 4FEBA 2Q9TA 3ONMA 5DYHA 1MDP1 3WAEA 2ZYNA 3WAFA 1TXFA 3K6WA 4NE4A 1HSLA 3N6TA 1B7HA 4QSDA 1Q35A 1T0KA 3O6GA 4OEVA 2OJTA 2DE4A 2PMSA 5F1QA 1MQDA 3IOTA 5A5XA 5H8FA 1H45A 1B4HA 4EQBA 1A8FA 5DEXB 1ZU0A 2QSXA 1MM6A 1B6HA 4OENA 4LONB 3D4GA 4F1YA 3IOVA 1NKXA 4QFPA 3SESA 2Y7IA 2V3QA 1EH3A 3FJGA 4XIGQ 2DYXA 3W15C 1A55A 1DPEA 4GWOA 5CM6A 3V5AA 2WKYA 3KOSA 4R74A 1D3KA 4G2ZA 1SW1A 1RYXA 2H4IA 1S9TA 3IL1B 4JDFA 1YCJA 3P7IA 1EZ9A 1CE2A 4U23A 1SBPA 1H44A 4MBPA 4DXCA 3V83A 4RK2A 1LFHA 1OVTA 1B3HA 3TUSA 4OMBA 4HW8A 1LCFA 5I59B 1PB7A 2F97A 2ZMBA 3R7XA 2W7YA 5AE4A 1DMBA 4PETA 2QL3A 4QFLA 4GRKA 5AA3A 4E0WA 4EQ7A 1S50A 1RKMA 1B52A 5TP9A 3CIJA 3DM0A 3IK6B 4NF5A 2V93A 3KZGA 1PEBA 3A09A 1IUDA 3W9WA 5AA2A 2REJA 3SKPA 4DXUA 2DXRA 2I6EA 1P1WA 1PC3A 1D9YA 4DDDA 2XXTA 4X9TA 4XKQA 1FTKA 5ISUA 2H98A 3DP6A 1B40A 3MVWA 4H8JA 2UVHA 3O6HA 2I0CA 1DTGA 3T93B 3C32A 2KLFA 2XX8A 4IO2A 2OCUA 3LR1A 4RY1A 3C31A 2R6GE 2RCBA 4JXIA 3QUJA 3BFUA 1OQHA 1I69A 2D3IA 3RUMA 3BBRA 5FHOA 4F22A 4GL8A 3TELA 1P1NA 1P1UA 2HCAA 2Z22A 5DVFA 1MXUA 3OSRA 2QJEA 3O2AA 5I56A 1SYHA 2ANJA 4F39A 5FTIA 5EHSA 3M3FA 3E3KA 5I57A 3O66A 3OENA 2G29A 5LOMA 4LQ2A 2QPQA 1YPNA 2VHAA 3RT6B 2Y84A 4R73A 3KN3A 5KDTA 2Z8DA 3MP1A 2F34A 3TCFA 1ZKBA 4ZZAA 4N13A 2A5TA 1H43A 4U1ZA 2O51A 1ZJLA 3PPRA 5L9SA 4LVQA 1M5DA 3RTWB 3K01A 3IX1A 4I9DA 2E0SA 4U2RA 4RNSA 3TTLA 1BTJA 4MFIA 4NWCA 5L9MA 2IEEA 3OELA 4YB6A 4FAJA 1N84A 4ELOA 2DWIA 2XXWA 3Q27A 4F19A 2RC7A 4OVJA 2F8DA 4FECA 1LGBC 1O7TA 1DPPA 3V8XB 3C4MA 3PUXE 5BWJA 5H8NB 3KSXA 2DWJA 3EHTA 1M5CA 3PGFA 2QS3A 2V3UA 5H8QB 1MQIA 1H3DA 1QUKA 1QVSA 4PFWA 3TAJA 2DXYA 2ABHA 4RYAA 3EPEA 4YKKA 1JETA 3E9XA 1MY0A 4OYVA 5I2KB 3FASA 5EHMA 3K1MA 4ECFA 1L5TA 1MQHA 1XVYA 5DTBA 3MUQA 4XKRA 1FTLA 1A40A 1LAHE 3TQLA 2GH9A 4IO5A 1B5JA 3N26A 4OFLA 4LA9A 1MXVA 4OTEA 4YKJA 2RF1A 5I2NA 1POTA 3MW0A 3VLVA 2I0BA 3H03A 4JWYA 1GGGA 1JNFA 3SEWA 5H8HA 1RYOA 4WXJA 1FW0A 3VLWA 1B2HA 1TT1A 1OMPA 3B7DA 4ELQA 4X1BA 4R2BA 5ICQA 5CMKA 3MZBA 1BP5A 3PMXA 4QSEA 3CSGA 3KGCA 3FVGA 3IO4A 3BFTA 5A5XB 4POXA 4HTGA 5H8FB 2F78A 4YKPA 3T9HB 1D4NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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