5I56B

Agonist-bound glun1/glun2a agonist binding domains with tcn201
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
280
structure length
280
Chain Sequence
DDNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 280
sequence length 280
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i56B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i56B02
2VD2A 4QSEA 4JSOA 4QF9A 5CC2A 3C36A 2OZZA 1URDA 4NF5B 1QKBA 3RT6B 2QSXA 1AL3A 1SW4A 1Y4TA 2Y7WA 1A7LA 1FQCA 3FGSA 2UYEA 2DQVA 1GGGA 4R9GA 4OTEA 3H6TA 2ANJA 2B3FA 4JWOA 2ZNSA 3G3KA 4OESA 1BP5A 3PUWE 3MAMA 1QKAA 3M8UA 3T93B 1B52A 5I57A 1BIYA 1SQYA 3OXNA 1DSNA 5F1QA 3K02A 2AYSA 2GFEA 1A55A 4IY6A 2I3WA 2GH9A 2QMXA 4MH5A 5L9MA 2PMSA 2ONRA 2Y7RA 4YKPA 3GZGA 2IEEA 3DP8A 5H8HA 4BDNA 3SESA 1XVYA 5JTYA 1HSEA 4G8HA 1Y3PA 3CG3A 3OEKA 2DP8A 3F11A 1MXUA 2VOZA 2QS1A 3CIJA 1SDXA 4E0WA 1JEUA 5FHOA 3TFLA 3KG2A 4GVOA 1CE2A 4ZEIA 1QUJA 4OFJA 2Q9TA 4JDFA 4KI0E 1L5TA 3G3FA 3FV2A 4R2FA 4OQOA 1A8FA 2UVGA 4G2ZA 3R6UA 1FQAA 3G7WA 2D3IA 4O3BA 1QULA 1IXHA 1LB9A 5CMKA 5H8QB 5I58B 3UP9A 5KCJB 3U94A 3VVDA 4X48A 1Y3QA 1SI0A 1B1XA 3LC8A 3FJMA 1IQ7A 3TZAA 4BLAA 5I59B 1B7UA 1OMPA 5ICTA 5AE4A 2H25A 1OVBA 2UXAA 3ZSFA 3FIRA 2OWSA 4MLVA 1B9JA 4FJPA 1Y9UA 3CR9A 2RINA 4YU0A 3UK4A 3SEWA 1AH5A 2Q2AA 2I6EA 1FCKA 2DWJA 3FVKA 3KFMA 4NF5A 3E9XA 5CMBA 3PPOA 3TPAA 3USDA 4P0IA 1M5EA 5H8NB 1USYE 3WAFA 2W7YA 4LZ8A 1A54A 1P1WA 4IGTA 3VV5A 4PFUA 1IXGA 3QUFA 1B5HA 3K6XA 2OK2A 4KD5A 4H0WA 4R73A 1MY4A 1XT8A 1B6HA 3T9XB 4GD5A 3TCGA 1AIVA 1S7YA 1MDQA 1B51A 4OEUA 4I1DA 2XXVA 2ABHA 2P0SA 2F8DA 3DLNA 2QS3A 3OOAA 4R6HA 1R1NA 3C4MA 5TPAB 1F9BA 4P0GA 2A5SA 4H6DA 4ZE9A 4ELPA 1DPPA 4U21A 2A5TB 1QUKA 4ZEFA 4G8NA 3SERA 4F1VA 3VLWA 1MXVA 1LFGA 3W9WA 1JVYA 1B3HA 3SETA 2QS4A 3VDFA 3W9VA 4O3CA 2I3VA 2XX8A 3EF7A 3TODA 3K2DA 3FJ7A 4DXCA 1UTBB 4R72A 5LOMA 2VHAA 4ZEBA 3UGWA 3S9EA 5J1DA 1N76A 1IXIA 2I0CA 2F7AA 3PPPA 3TTMA 3H4ZA 2H98A 3EQ1A 1M5FA 1B5IA 3I5OA 4GFRA 1QUIA 1MXWA 1MDP1 3OEMA 1NKXA 2GHBA 3IJOB 4KFQA 1JETA 1BLFA 4IO4A 4RPOA 2ALUA 1VFDA 3RNNA 4EF1A 3M3KA 2NVUB 1B0LA 5I59A 4IO5A 1LAHE 1ZTYA 3HN0A 4EQ7A 2HEUA 4HCWA 2Q88A 2AL5A 3IOUA 4F3SA 2DXRA 4QFNA 4MBPA 1JW4A 3RY3A 4YMAA 2ZYNA 2ZNUA 1UIVA 3MP8A 4EXLA 3T9HB 5I57B 2BJJX 1R9QA 3IK6B 1I6QA 1B3GA 3SEVA 1Z7NE 5H8FB 3MVXA 1H44A 5JEIA 1OQGA 1R6ZA 1WVJA 2DS9A 3FVOA 3Q27A 4H65A 2F97A 4ZZAA 1M5BA 5H8NA 4JXIA 2QMWA 4OMBA 1EU8A 3T9VA 1AMFA 1FQEA 5ELVA 5H8HB 3LBSA 5IKBA 4PFWA 4ZS9A 1MY0A 3Q28A 4GOTA 3OSQA 2ZXTA 3V89B 4C1UA 2DE4A 4GQOA 1O63A 4I8CA 3MP1A 3RGYA 2CZLA 3KN3A 1VSOA 4GIZA 1B3FA 3K1PA 3RUMA 1YTVA 3KGCA 4H1XA 4YAHX 1ZIUA 5TPAA 1I6BA 4LATA 1B40A 3KBRA 4ZEDA 3PPRA 3OO8A 3L6HA 4LP2B 1B3LA 3AXFA 1EZPA 2YLNA 3TCFA 1JW1A 3OELA 4H8IA 1LFHA 1H43A 4PETA 2YPNA 2R9JA 3V83A 3N6TA 1NMUA 4X1BA 1YCJA 5BUUA 4QSCA 3MQ9A 3O28A 2HZKA 4K3FA 5CI5A 4QSDA 1UTBA 4MFIA 4YB7A 1IUDA 4NF4B 1XVXA 3ECRA 3K0VA 3C35A 3A3UA 2PT2A 4JB7A 3CI8A 4IO7A 4FEBA 3OO9A 1SVXB 4GRKA 3S2VA 4NWDA 1I6AA 4HS7A 2XXRA 2ZMBA 2DWAA 1ZU0A 1GTKA 4RXLA 1POY1 5DVJA 4OWDA 4KQPA 3K1MA 1N84A 3PMWA 5BWJA 3CSGA 4G4PA 3EN3A 3SEYA 4XKPA 5CM6A 1Q1KA 2H4IA 1URGA 1ZKBA 3UN6A 4DLDA 1ANFA 3M3LA 1H3DA 1Z7ME 1MY2A 3U92A 2H99A 4TQUQ 4NE4A 1AOVA 4Z7EA 3KSJA 5H8FA 5CMCA 1FQFA 4RYAA 4PE5B 4EF2A 3CSBA 4UACA 4PFTA 5CBRA 3IL1B 2RC8A 3P7IA 1Y20A 2I48A 4OEVA 3BFTA 2ONKE 3UIFA 5L8DA 2HAUA 4YKIA 2M8CA 2R6GE 1A40A 1OLAA 4DIGA 2VD3A 4I62A 4EUOA 3QSLA 3O6GA 3HO7A 5F7VA 1D3KA 3SEXA 3OO6A 1LAGE 2XXYA 1ATGA 1BTJA 1GV8A 1WDNA 5AA4B 3KN8A 3IR1A 1A99A 5EYFA 4WKMA 3FVGA 3E13X 4LONB 4WEPA 3KJTA 4YMBA 3IO4A 4IY5A 3S9NC 2ESNA 5HBCA 2V3TA 1ZBMA 3OSRA 1JVXA 3K6WA 1MXYA 3KZGA 4YKKA 3FXRA 4RK9A 5A5XB 4G68C 4DZ1A 3LSFB 2UVHA 4GWOA 1MXXA 2FA7A 4NF6B 2AIXA 4ZE8A 5HPQA 2HQ0A 2YJPA 3VVFA 1B5JA 3UA8A 5I2NB 1QW0A 4E0XA 1PB8A 1SI1A 2DVZA 3G3HA 4NF4A 4R2BA 1MM7A 3VE1B 3VLUA 1RYOA 2O69A 3T9UA 2F34A 3KEIA 3PPNA 1MH3A 1EZ9A 3IAZA 4F3GA 4R6YA 1A8EA 4IB2A 3R26A 1O64A 3SDFA 1B3EA 1N04A 2HFBA 3PUZE 3B6WA 3Q29A 5EHMA 5TP9B 1QJMA 2F35A 4GXAA 2E1SA 2I4CA 3BBRA 2UVIA 4H5FA 3TUSA 2KLFA 3TDJA 1SYHA 1SW5A 4F31B 4QFPA 1LFIA 2O1MA 2PX1A 2Q8JA 1GR2A 3MBPA 1NNKA 4ONYA 2DOJA 3C33A 2F7BA 3GLBA 1RKMA 3IOTA 1DMBA 3KSXA 2NWJA 4BDMA 4JBZA 1S50A 3TQWA 3IX1A 3MPLA 2O84X 1B58A 1B1HA 2HCAA 4H8JA 4M1VA 3C31A 3T22A 5EHSA 1NH8A 3BFUA 1H76A 1PB9A 5K2XA 2DSFA 2RC9A 1FTOA 3GBAA 3U1OA 2OLBA 3H7MA 3L6GA 4U4SA 3RPWA 2D5WA 1LAFE 3K6VA 2O51A 4RJZA 1MQGA 2P2AA 4FORA 2RCBA 2HXWA 3N26A 3RN8A 4U4XA 4MLQA 2Z8EA 1FTKA 3MP6A 2QS2A 2XXTA 5AA4A 1ZLQA 1B0HA 4Q5TA 2F6GA 3I6VA 4LZ7A 4XKNA 3FJGA 1UTHB 1QVSA 3MUQA 1DTZA 1LBCA 2P1SA 3OENA 3O2AA 2QJEA 4QHQA 1PBQA 2B3BA 1SYIA 3N94A 3CG1A 3W15C 2XD2A 2H5YA 3KJ7A 4OXVA 3B6TA 5A5XA 3ILUB 1XC1A 3OD7A 4GLIA 5AA2D 1NFTA 3QXMA 3VFJA 5DT6A 4NF6A 3PMXA 5ISUA 1DPEA 4FEDA 3B6QA 4OFLA 4XKQA 4ECFA 3QIMA 3V5AA 3PMVA 3THIA 4WEDA 2OWTA 2RKMA 4LA9A 4F1YA 5I2NA 4C0RA 3D4CA 4GF8A 4TOZA 3HSTA 4GXSB 5H8SA 4HW8A 3LSWA 4N13A 5ICQA 3ILTB 4RK2A 1B46A 1SD3A 3DELB 2F78A 4LQ5A 3TKDA 2DWIA 4RA1A 1IIWA 5ITOA 1MQDA 3U93A 3S4UA 4GL0A 5L9SA 5DYHA 1LSTA 4F29A 2Z22A 1ZJLA 5FHMA 5TP9A 4F19A 1B05A 4I9DA 3SKPA 1TWYA 2XXIA 3FXUA 3KOSA 1NNTA 1MXZA 2QRYA 4U2RA 2RCAA 4OERA 3T96B 1H45A 2ZYOA 3MVWA 2O7UA 3PUYE 3DM0A 2NUVA 3RQTA 3ONMA 4PP0A 4MF3A 3MPKA 1PB7A 1D4NA 3IB1A 1UIUA 3JYRA 4KYDA 2UYFA 2Z23A 3FZVA 4XIGQ 5IAIA 4Q0CA 4O3AA 4ZECA 4POXA 2XX9A 3IJXB 3FASA 4F39A 4OFOA 4FE8A 2O6AA 4QRZA 4ESWA 4XXUA 4U23A 3QK6A 1MY1A 3C34A 5FHNA 4ELQA 4YZZA 3VLVA 5CBSA 2HAVA 4F1UA 3ODBA 1GVCA 2I0BA 2XXWA 3K00A 2HZLA 1IEJA 3MC2A 3ZKKA 3A09A 1P1OA 4HTGA 1EZOA 1R9LA 2QL3A 3JZJA 1RYXA 3CVGA 2OCUA 1UQWA 5K2YA 1IITA 1UTHA 4GL8A 3T66A 2OJTA 3PGFA 1M5CA 3H6VA 2THIA 4U1OA 3WAEA 1PEBA 1OLCA 2Q2CA 4HCYA 3G3IA 4KCDA 3E4RA 2PVUA 4JWXA 5JK4A 4L17A 3RT8A 4U1ZA 3K6UA 5KDTB 3ZKLA 4PFYA 3Q25A 1LAXA 4X9TA 1DTGA 5CRYA 1N3XA 4OETA 2AL4A 1POTA 1ZMGA 3IO6A 4DCYA 1KWHA 2X7PA 3CRBA 3PD9A 4G68A 2PBWA 4EXKA 3HCQA 4KHZE 3QAXA 3GXAA 1MPBA 4N6PA 4QFOA 3TTLA 4H67A 4X1DA 1HSJA 3FATA 4DXUA 2V3UA 3HV1A 3UORA 3H3GA 2REGA 3TTKA 1MPCA 4PQJA 1B32A 1P1UA 4Q30B 3IB2A 2E0SA 3ZS6A 1DOTA 3OMBA 3CFLA 1IXCA 3FV1A 2O1LA 4NF8B 4BDRA 3VVEA 3N6UA 4TLMB 3PPQA 3CFXA 4OHNA 3H03A 2GRVA 1PDAA 5ITPA 3IOWA 1XS5A 3S9MC 2VGQA 2Y7PA 1NNPA 2IA4A 2Y84A 4ISUA 2V3QA 1MQJA 1P99A 4LUBA 1XOCA 4FAJA 4BDOA 1NL5A 2LAOA 4KCCA 2OBGA 4R74A 3OO7A 1USYH 4P11A 2I58A 2RF1A 1MRPA 3O6IA 3K01A 2I49A 3GBBA 3O29A 5I56B 2B65A 4F22A 2WKYA 1MG1A 3D4GA 4BDLA 4EDPA 2GHAA 2XD3A 1WODA 1N7WA 3PUXE 4RPNA 5AA1A 1T0KA 4POWA 1Q35A 4IGRA 2QPQA 5M2VA 2V93A 3MW0A 1B7ZA 2Y7KA 3G3JA 1MY3A 3KOTA 1ELJA 2NXOA 2O7IA 4LVQA 3FVNA 4F18A 4JSDA 2ZNTA 1US4A 2F36A 4WXJA 4AB5A 4G77A 3IORA 3U72A 4YB5A 3MJNA 4FATA 1O7TA 2XXPA 2G29A 3O6HA 1JNFA 2DE3A 3I3VA 1TT1A 5KDTA 3O9PA 2Z8DA 2PT1A 3MVZA 4XTCQ 2DVCA 2XXQA 1PC3A 5AA2A 2Z8FA 4YKJA 3SEUA 4UA8A 2G93A 3FUZA 3Q26A 1II5A 4KPTA 4ESXA 1LBBA 2Q89A 3IB0A 4ZDMA 4YICA 3TYHA 3E3KA 1N7XA 1Y4CA 2DXYA 2R71A 4KYSA 1Y3NA 3O66A 2REJA 1CB6A 1OQHA 4NWCA 4ND9A 1EH3A 3PV0E 2RC7A 2PYYA 5I2KB 4LZ5A 3H6WA 4NF8A 4AB6A 1LB8A 1SBPA 1TXFA 1N0TA 2O68A 3TEPA 1TFDA 2DE2A 4OENA 3JV9A 3LSXA 4THIA 3EHTA 3CFZA 4KYEA 4NMYA 3RTFB 1XHYA 3MZ9A 3V8XB 2F6PA 1D9YA 2ONSA 1MH4A 1D9VA 1OVTA 1VR5A 5B70A 1FTJA 2UVJA 2DYXA 4XKRA 5FTIA 4C1TA 4OVJA 1JQFA 3S9LC 1B4ZA 1N3WA 1PBPA 1MM6A 3KN7A 5I56A 4IO2A 1US5A 3TTRA 3C32A 5TU0A 1JW5A 5DEXB 1YPNA 4NTLA 3QYTA 3TQLA 3TCHA 4DXBA 1P1NA 1NNFA 3TELA 4NEDA 3M3FA 4G68B 1Y1MA 1LGBC 2CMOA 3LUYA 3K1NA 5H8QA 1P1QA 2FNCA 5I58A 5KCJA 2H9BA 3N5LA 3LR1A 1BKAA 3K4UA 2NOOA 4OYVA 4M4GA 4R75A 2ZYKA 3C9HA 3PU5A 5DTBA 3HPIA 1I69A 3RTWB 5HM4B 3VXCA 3EHSA 4YB6A 3O97A 2XXHA 4DE8A 4G8MA 2FYIA 3FD3A 3HHGA 1B4HA 1FTLA 3RLFE 1HSLA 1SW1A 4FECA 3R7XA 3H06B 1FQDA 4Q8RA 3TTNA 4AQ4A 4ZZEA 1MQIA 2X7QA 4ZEKA 4R6KA 5CMMA 1MS7A 1SW2A 5FTHA 4R9FA 3MWBA 3LSLA 1TFAA 5KZTA 4IO3A 2F5XA 3U8QA 2V84A 1MPDA 5JTYB 1IZ1A 5I2KA 3VXBA 1LLSA 1FTMA 3H6UA 1FQBA 1URSA 5AA3A 3QUJA 3B7DA 4ELOA 3MZBA 3G3GA 4F3PA 3MVYA 5B7DA 5DVIA 1S9TA 2XXXA 2XXUA 2A5TA 4F2QA 1YAEA 3PUVE 3FXQA 4EQ9A 4F2OA 1NH7A 1OIBA 5L9OA 4TLLB 3DP4A 4RY1A 1JEVA 4KR5A 4U22A 4ELRA 2XHDA 3EHUA 4DDDA 3A3CA 1J1NA 4DCXA 3EPEA 4RNSA 4Z0IA 4BDQA 4JWYA 1M5DA 4F3BA 3MZ1A 5DVFA 2I4BA 3HHFA 1MQHA 4OZ9A 5I84A 4FIMA 1VFEA 2D21A 4LQ2A 1VE4A 4IO6A 3TAJA 3DP6A 2X26A 3IOVA 2F7CA 4QFLA 2VP1A 1B2HA 3BKIB 2Y7IA 1FW0A 5DEXA 1B7HA 3PD8A 4QFKA 4EQBA 1LCTA 2ZYMA 4N07A 2XX7A 1Y1ZA 2V25A 5AA2B 3TMGA 2DWHA 1LCFA 4H5GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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