2DSFA

Structure of the complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with xylose at 2.8a resolution
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Structure of the complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with xylose at 2.8A resolution
rcsb
total genus 100
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-06-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dsfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dsfA02
1BTJA 2R6GE 2PVUA 2ZNTA 3FV2A 5M2VA 4GL0A 1H43A 3OO9A 3TCGA 1HSJA 2RCAA 1MXZA 1QUKA 5CMBA 4F19A 3SEUA 3K6VA 1ZLQA 3TYHA 4ND9A 3VLUA 3FJ7A 3UIFA 2UYFA 1M5CA 2H4IA 3MQ9A 4IGRA 4E0WA 2UXAA 1MPBA 1OQGA 3LSFB 3SETA 5I57B 4BDNA 3H3GA 4R2FA 2Z8DA 1GVCA 3SKPA 1Q1KA 2Q89A 4FATA 4GLIA 2DWIA 3T9HB 1MXXA 4F2OA 4I1DA 3E13X 3KSJA 4AQ4A 3H7MA 3H6TA 5BUUA 2F7BA 4OEUA 4P11A 4X9TA 4KYEA 1MXWA 1T0KA 2ALUA 1B3EA 1Y3QA 4EUOA 1URSA 4X1BA 4GF8A 3QIMA 3KG2A 2F78A 4BDOA 5I57A 1PB7A 3PD9A 4TLLB 4OTEA 3V8XB 3G7WA 1B1XA 4ESXA 3L6GA 4XKPA 5L8DA 3S9MC 3VDFA 3IO4A 4I62A 4ZZEA 4FIMA 4HTGA 1TT1A 3KGCA 4R2BA 4H0WA 4M1VA 1MY3A 2DWJA 3MZ9A 4GD5A 1B9JA 1LBBA 2PMSA 4PFWA 4XKRA 1J1NA 3TCFA 1FQEA 3JYRA 1SVXB 3S4UA 2Q9TA 4IB2A 3GXAA 1LBCA 3TTMA 1MM7A 5HPQA 1CB6A 3FXRA 2Q88A 1FTOA 4WKMA 4NWCA 2R71A 1IXCA 2G93A 3TCHA 4PE5B 2F35A 3ZKLA 2Y84A 3S9LC 4U21A 4NWDA 3PU5A 1EZOA 4GQOA 3V83A 2V84A 3A09A 4EXLA 4HW8A 2F7CA 3S9EA 4TOZA 4LZ7A 3DELB 3FVGA 1JVXA 3RTWB 1DTGA 4P0GA 4YMAA 3UK4A 4YKKA 3IOVA 3K0VA 3C9HA 4P0IA 4OEVA 2Z23A 3G3IA 4G2ZA 5J1DA 4G8NA 2O68A 1ZTYA 2PT1A 1USYE 2XXPA 1EU8A 2IA4A 3KSXA 1MXUA 1ANFA 2P2AA 3PGFA 2O1MA 3PPQA 4GIZA 3CR9A 1NMUA 3IOTA 1LFHA 3V89B 5A5XB 3KN3A 2I3VA 3FJGA 3FXUA 1IITA 3CG1A 4R72A 1M5EA 4XIGQ 1EH3A 3BFUA 4QF9A 4F22A 3T22A 3S9NC 3U8QA 4F29A 5KZTA 3KOTA 3IORA 3MP8A 2QPQA 3FV1A 2F36A 4ZS9A 5I56B 3B6WA 4E0XA 3Q25A 3IK6B 4BDQA 4G8HA 4HS7A 2UYEA 4NE4A 2QMXA 3GLBA 3JZJA 4O3AA 2F8DA 1AH5A 4F18A 4NF5B 2D3IA 3MPLA 3MBPA 3FJMA 3OSQA 1VFEA 3RNNA 4GFRA 1OVBA 3KOSA 4OZ9A 3VVEA 5A5XA 1OMPA 1URGA 2DOJA 1MS7A 1LB9A 1JW4A 4Z7EA 3TTRA 4OVJA 1KWHA 2I6EA 3B6TA 3PUZE 5DYHA 1I6QA 5HM4B 1XVYA 1NH7A 3O28A 3TMGA 3GZGA 3MVYA 2Y7RA 3U94A 4YB6A 5K2XA 5I56A 4BDMA 3VXCA 3OMBA 4JB7A 2IEEA 2VD3A 3KZGA 1SDXA 1EZPA 4NF8B 3BBRA 2OWSA 4UA8A 3PMXA 4NF5A 3OENA 4H8JA 5FTIA 1JNFA 1IUDA 4LP2B 5H8NB 5DT6A 3ZSFA 5HBCA 5TP9B 4MLQA 3R6UA 4YKIA 3K4UA 4JWXA 4U1OA 2AIXA 1FQBA 2KLFA 3HHGA 3N6TA 2V3UA 3B6QA 4ZEDA 3LSXA 5CMCA 3FASA 4ELQA 4YB7A 4YICA 2QJEA 2B3FA 4DXCA 2XXRA 4GVOA 3TFLA 3VV5A 5I84A 4QRZA 1POTA 4NF8A 3MZ1A 3I6VA 2RINA 2FA7A 2QS2A 3K1NA 4QFPA 1QVSA 4G8MA 2DQVA 3IJOB 5EHSA 2A5SA 2QS1A 2XXQA 2O51A 5H8NA 1N04A 2QRYA 3PPNA 2O69A 5DVIA 5TP9A 1MY2A 3L6HA 1B0LA 3WAEA 1H76A 3RPWA 3SEWA 3EN3A 4QFKA 2ZYNA 5DVFA 2REJA 1GV8A 3IAZA 4QSEA 3H4ZA 3N26A 1I6AA 3BFTA 5ICTA 1MG1A 1H45A 3OXNA 3PPRA 4FEBA 4H5GA 4PETA 3D4CA 4U1ZA 4FORA 2XXWA 3CVGA 1B2HA 1IZ1A 3CFXA 1VFDA 3V5AA 3K2DA 2V93A 1WDNA 5DTBA 3RUMA 3E4RA 5AE4A 1FW0A 3C31A 4EQBA 3UORA 2HQ0A 4NF6B 5I59B 4ZECA 5JEIA 1IEJA 4F31B 2E0SA 2ZMBA 1QKBA 4OYVA 1MXVA 1N76A 1XHYA 2X26A 2NVUB 1IXGA 4WEPA 1D3KA 3U1OA 1IXIA 4DE8A 4QFLA 2X7PA 2RF1A 1LAXA 2WKYA 4JSDA 3RTFB 3FIRA 4OXVA 4IO3A 4ELPA 4ZEIA 5FHOA 3H6UA 2NWJA 1SD3A 5FTHA 3CI8A 2THIA 4XKNA 5AA2B 2DVZA 4QHQA 3O6GA 4JWOA 5I59A 4NF6A 2M8CA 1B52A 3MUQA 1D9YA 1ATGA 2DYXA 3CRBA 4N6PA 3VLWA 4YU0A 3QYTA 1PDAA 1B5HA 2RC9A 3MP6A 1N3WA 1MY1A 1B0HA 2NUVA 2FNCA 3HO7A 1OLCA 3M3LA 4RY1A 1UQWA 2DE2A 3T96B 3OSRA 4ELOA 2R9JA 3C34A 2Y7IA 3K00A 4F39A 1DPEA 2Z22A 3FVKA 1SQYA 3RGYA 2V25A 2ANJA 3EHTA 4F3GA 3CSBA 3LC8A 1YTVA 3T9XB 5AA2A 4H5FA 2NOOA 4Q8RA 4QFOA 1NNKA 4FAJA 2XXIA 2DXYA 4MH5A 2UVGA 4C1TA 1FTMA 2I0BA 2F6PA 3RT8A 3SEVA 1I69A 5CI5A 1URDA 3EQ1A 1MRPA 4X1DA 4H6DA 1VR5A 4LONB 1QULA 2DVCA 5TPAB 4ONYA 2CMOA 3TODA 3RQTA 3T9VA 1A40A 1MQIA 4U2RA 1N7WA 2VP1A 1Y20A 1B58A 2I3WA 3PPOA 2UVHA 1MH4A 4POXA 2O7IA 2PT2A 1A7LA 2DS9A 1UTBB 3HHFA 3U72A 1QUIA 3Q27A 5B70A 5JTYB 1IIWA 2ABHA 3EHUA 4KCCA 5H8FB 1LAGE 1ELJA 5H8QB 3VVFA 1POY1 2FYIA 4X48A 3K6XA 5TPAA 4BDLA 4GXAA 1LCTA 3TAJA 5I2KB 3K01A 4ELRA 5ICQA 1D9VA 2YLNA 4KPTA 4RYAA 5FHNA 3HSTA 4PFYA 4GXSB 4DXUA 3LSLA 1B4ZA 1LSTA 3Q29A 4TLMB 3ILUB 5B7DA 1UTBA 3T66A 5K2YA 1R6ZA 3USDA 2F7AA 1B32A 1S50A 3LUYA 1BLFA 5JTYA 4JXIA 2DE3A 2O1LA 5H8FA 4NTLA 5H8QA 1HSLA 4LUBA 4PFTA 1B6HA 4G77A 1B3HA 1PB9A 5I2KA 1S9TA 5CMKA 3ECRA 2D21A 3E9XA 2VOZA 1UIUA 5I58B 4IY6A 1ZJLA 4ZE8A 2PYYA 5EHMA 4QFNA 2XHDA 1LFGA 4RXLA 5CBRA 2W7YA 1MM6A 4LQ5A 2OJTA 3UGWA 4OETA 2YPNA 3PV0E 3ZKKA 3GBBA 3N5LA 1DOTA 2VHAA 1B51A 1B7UA 1B46A 3I3VA 2ESNA 2OZZA 3O9PA 4RJZA 1TFDA 3ONMA 2P1SA 3GBAA 3N6UA 2DP8A 1LCFA 1FQFA 3K6UA 1GR2A 3R26A 3FZVA 1N7XA 2VD2A 5I58A 3FATA 4H1XA 3CIJA 3M8UA 3FXQA 1YAEA 3K02A 4G68C 1IXHA 1XS5A 2LAOA 3HN0A 1Y1MA 1B7HA 1O64A 4OERA 4F3PA 1P1NA 3OEMA 4IO5A 5L9SA 2HEUA 4QSDA 1NNFA 3RT6B 4OWDA 1MY4A 1DSNA 4IY5A 4R75A 3O6IA 4YAHX 1MPCA 1Y1ZA 3K1MA 4MLVA 2RC8A 1US4A 2B3BA 3M3KA 2ZYOA 5IAIA 1MQDA 2XXUA 1QW0A 3O97A 4HCWA 2O6AA 5L9MA 4OFJA 1PEBA 3O2AA 1FTLA 3EHSA 1SW2A 1B7ZA 1RKMA 5IKBA 3P7IA 4WXJA 1F9BA 3OEKA 4GL8A 1B40A 4OFOA 3F11A 3OD7A 3VLVA 4F1VA 4RPOA 1LAFE 2YJPA 3T9UA 5LOMA 1D4NA 2OWTA 1QKAA 4I8CA 3I5OA 3WAFA 2H99A 4IO4A 4N13A 2AYSA 4JDFA 2I48A 4U4XA 2XXVA 1FQAA 1XT8A 4DDDA 4YB5A 3MWBA 4KYSA 4R9FA 3ODBA 3Q26A 1FQCA 1R9LA 1O7TA 4RK9A 2Q8JA 2DWHA 1Y9UA 4MBPA 4G68B 1B3FA 1A99A 4KCDA 3C36A 4EF1A 3SEXA 3PMWA 3MVWA 3QUJA 4G4PA 3G3JA 3UA8A 1LFIA 3E3KA 5AA2D 3KN7A 4RK2A 1Z7NE 1ZIUA 4KFQA 1QJMA 4LATA 1M5FA 1GGGA 1PC3A 5AA4B 4PFUA 2QL3A 4FECA 4R9GA 4YKPA 1FTKA 3OO6A 1JETA 1SW4A 2ZYMA 2REGA 4ESWA 4MF3A 3ILTB 3FUZA 1FQDA 3MP1A 1R1NA 1Y4CA 3VFJA 2F34A 3A3CA 4LVQA 2ZXTA 3RY3A 1H3DA 4DCXA 1SBPA 3DP8A 2XD2A 2OLBA 2GHAA 4G68A 4R6YA 4ZE9A 4N07A 1P1OA 2QSXA 3PPPA 1MPDA 4OFLA 4AB5A 3H06B 4F1YA 1WODA 4PP0A 4R6KA 1Q35A 2O84X 1B1HA 4LZ5A 1IQ7A 1MXYA 4XTCQ 3CG3A 3DP6A 5AA4A 2HZLA 3FVOA 5CBSA 1B5IA 2QS4A 3IX1A 1Y3PA 3B7DA 3RN8A 4NMYA 4JWYA 2I4BA 5CM6A 4Q30B 1P1WA 3O66A 4UACA 1A54A 1S7YA 3OO7A 3PUVE 2OBGA 1L5TA 4I9DA 4JSOA 1GTKA 2OK2A 2PBWA 3ZS6A 2GRVA 1JEVA 1LB8A 1XOCA 3SESA 3H03A 5F7VA 4ZZAA 1BIYA 2H98A 4F3SA 4KHZE 4Q5TA 1BP5A 3EF7A 1R9QA 1ZKBA 2DXRA 1LLSA 1UTHA 3OELA 4GWOA 3QK6A 5L9OA 3AXFA 3C4MA 3KFMA 3MPKA 1JVYA 1BKAA 1UIVA 4YZZA 4GRKA 3PMVA 5TU0A 1SYHA 1P1QA 2F97A 1SI0A 3TQLA 1DMBA 4THIA 5AA3A 3QSLA 2RC7A 3EPEA 4KQPA 3VE1B 4BLAA 1JQFA 1Z7ME 3G3FA 1M5BA 2ONKE 3IL1B 3T93B 3A3UA 1VE4A 2XXXA 2ZNUA 5CC2A 4C0RA 4JBZA 3OO8A 1Y4TA 4ECFA 4YMBA 3HV1A 2A5TB 4IO6A 1MQJA 1ZMGA 3THIA 1SI1A 1QUJA 1PB8A 3C33A 1JEUA 2PX1A 1SYIA 3UP9A 3W9VA 2CZLA 3IB2A 4MFIA 4FE8A 4F3BA 4EDPA 4H8IA 5I2NB 1DPPA 2DE4A 4EQ9A 5DEXB 3RLFE 4XXUA 3CFLA 2HCAA 1N3XA 2UVIA 4KD5A 3G3HA 2V3TA 3TELA 4OQOA 2V3QA 1MDQA 5ELVA 2E1SA 4WEDA 2A5TA 4Z0IA 3S2VA 3IOWA 2Q2CA 3KJTA 4KI0E 2UVJA 4BDRA 3LR1A 1O63A 4FEDA 5CMMA 4C1UA 1WVJA 3H6WA 1AMFA 2Q2AA 1FCKA 2GH9A 4YKJA 1SW5A 2XX8A 2DWAA 5I2NA 4LQ2A 2XX9A 4DIGA 2OCUA 4OMBA 5DEXA 1PBQA 4H65A 1AOVA 2RKMA 3BKIB 3UN6A 3VVDA 1RYXA 4F1UA 1B3LA 3Q28A 2I49A 4NF4B 5F1QA 5KCJB 1JW5A 3K6WA 4PQJA 3SERA 3SDFA 1I6BA 3TPAA 3C35A 3TTLA 4EXKA 3FGSA 2H25A 4OHNA 4O3BA 3SEYA 2I58A 4M4GA 1US5A 1MY0A 1TXFA 1B5JA 3DLNA 3IB1A 1OLAA 1LGBC 1A8FA 4U22A 1OIBA 5CRYA 1MDP1 3TEPA 3KEIA 3TUSA 3PUWE 3H6VA 1VSOA 2B65A 1HSEA 5AA1A 1OQHA 3TZAA 2Y7KA 3IJXB 2AL5A 4K3FA 1B4HA 1P1UA 1NNPA 1MQGA 4IO2A 2XX7A 4L17A 1ZBMA 3KN8A 1B05A 4ZEKA 3U93A 1M5DA 2P0SA 4ZDMA 3MJNA 4ISUA 1A8EA 1RYOA 2H9BA 3VXBA 1JW1A 4NF4A 5KCJA 4TQUQ 3CSGA 4U4SA 3IOUA 3QXMA 2I0CA 4FJPA 5EYFA 3TDJA 2F6GA 1N0TA 1B3GA 2GFEA 1AIVA 3PD8A 1XVXA 1EZ9A 3KBRA 2ONSA 1XC1A 4XKQA 1ZU0A 4ZEBA 2D5WA 4LZ8A 4IO7A 3G3GA 1NKXA 1NNTA 5ITPA 4EF2A 3FD3A 4OESA 2XXHA 5ISUA 2ONRA 1LAHE 4EQ7A 4RA1A 1TWYA 3QUFA 2BJJX 4IGTA 3HCQA 2Y7WA 3W15C 2HAVA 3MC2A 4H67A 4Q0CA 1YCJA 3IR1A 1OVTA 2QS3A 4NEDA 5BWJA 1TFAA 2X7QA 1AL3A 5ITOA 3QAXA 4DCYA 4DLDA 5H8HB 5JK4A 1YPNA 1II5A 2VGQA 4AB6A 1FTJA 4LA9A 2HZKA 2ZNSA 2GHBA 1NFTA 3LBSA 2O7UA 3N94A 2NXOA 3M3FA 3R7XA 2Z8FA 2XXYA 5H8SA 4R73A 3DP4A 2HAUA 5KDTB 4RNSA 1Y3NA 2HXWA 2RCBA 2DSFA 3DM0A 3TKDA 4O3CA 3MVXA 4U23A 5H8HA 3LSWA 4KYDA 2G29A 2I4CA 1MH3A 3FVNA 2ZYKA 3TTNA 2XD3A 3MZBA 5DVJA 1A55A 2F5XA 4OENA 3IB0A 3HPIA 4KR5A 4R6HA 3TTKA 1H44A 2Z8EA 5FHMA 3OOAA 1CE2A 2HFBA 3C32A 5KDTA 3CFZA 1SW1A 3O6HA 3K1PA 3PUXE 2AL4A 3MAMA 3D4GA 3JV9A 3KJ7A 4F2QA 3O29A 4HCYA 1USYH 3U92A 2QMWA 3MVZA 1DTZA 3IO6A 3W9WA 1NH8A 1PBPA 4DZ1A 1NL5A 2H5YA 1MQHA 1P99A 3MW0A 1N84A 4RPNA 3G3KA 4POWA 3TQWA 4QSCA 3PUYE 4DXBA 4R74A 4ZEFA 1UTHB 2Y7PA 2XXTA 4GOTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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