2DSFA

Structure of the complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with xylose at 2.8a resolution
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
b'YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Lactotransferrin
publication title Structure of the complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with xylose at 2.8A resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
total genus 100
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-06-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dsfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dsfA02
1SYIA 1UTHB 2GH9A 4GL8A 3H6VA 3CI8A 1USYE 1NH8A 5I2KB 3FXQA 1FQCA 4TOZA 4QSCA 3VLUA 1MY4A 2DXYA 2RKMA 4K3FA 2H25A 4EUOA 3H3GA 4UA8A 4IO6A 5EYFA 3OXNA 1IXGA 1TFAA 1DSNA 4GL0A 3FXUA 3K02A 1FTKA 5I57B 4C0RA 3G3JA 3V83A 1XT8A 3A09A 3ZKLA 3O2AA 1N04A 3UGWA 2M8CA 3RTFB 2REGA 3CVGA 2VHAA 2XXWA 4POWA 4Z7EA 4GOTA 3IOUA 3I3VA 4TLLB 5CI5A 1SI0A 1LBBA 3LSXA 1N3WA 4YAHX 1Y4CA 4FEDA 4H0WA 4H67A 1VR5A 4LVQA 3O97A 2OZZA 1MY2A 1OMPA 3Q25A 1XS5A 4G68A 1I6BA 4QHQA 3MAMA 1M5BA 1Q1KA 1SD3A 3E9XA 1UTHA 5FHOA 3L6HA 3ZS6A 3CRBA 2IEEA 2ZMBA 3PGFA 5I2KA 5L9SA 3M3LA 1HSLA 4GFRA 4XKPA 3V5AA 3TAJA 1Y3NA 3SEWA 4PETA 4PFWA 2DWJA 3W15C 3H7MA 3MVZA 1PDAA 3T96B 3ILTB 3BKIB 3KZGA 4F2OA 3MPKA 4F3BA 3OO9A 2A5SA 1D4NA 4IB2A 5I57A 1TWYA 1FQBA 1I69A 1UTBB 3PPQA 4LQ5A 1JW4A 1DPPA 4IO2A 3EF7A 2XD3A 1MPDA 3OO7A 5I2NA 3C33A 3LSLA 2DWHA 4JSOA 1H45A 3M3FA 1NFTA 2ZXTA 3DP6A 1SW1A 4RXLA 2QS2A 4H8JA 2F6GA 1A99A 4ZEIA 3PUVE 2V84A 3C9HA 3RQTA 3GLBA 1R6ZA 2OBGA 2DVCA 3C35A 4OFOA 2UYFA 2Z23A 1A55A 1BLFA 3MWBA 3B6WA 3JZJA 3O6IA 5L8DA 5EHMA 3TQWA 2UVIA 2XXTA 4EF1A 4NMYA 2DYXA 2I49A 1B7ZA 1SW2A 4GF8A 3TFLA 1AOVA 1POY1 1NL5A 2QMXA 1XVXA 3EHTA 4GXAA 4DXUA 1Q35A 1I6QA 2O68A 1PC3A 3FXRA 4RNSA 1DTZA 4OZ9A 4QFKA 1JEUA 4DDDA 3FVKA 4G4PA 2QS4A 4YKPA 1SQYA 2Z8EA 3OEMA 1MPBA 5B70A 4FE8A 4F18A 2QJEA 2Z22A 1LCTA 1O7TA 3GXAA 3QYTA 4X1BA 2A5TB 2XXHA 3OSQA 2OWSA 4JWXA 2VOZA 3B6QA 4PFYA 3EHSA 2UXAA 2R9JA 4F22A 2GHBA 4XTCQ 3RUMA 4RK9A 1LAXA 1FTJA 1ZMGA 3MPLA 2F78A 4LZ7A 5AA1A 2BJJX 2F8DA 2V3TA 2F35A 4X48A 4KR5A 2D5WA 3MZ1A 1J1NA 3FVGA 4U2RA 1Z7NE 4YB7A 2O84X 2V3QA 1WDNA 3EN3A 4XIGQ 3N5LA 1D9VA 1BTJA 4YMBA 4BDQA 4POXA 1M5CA 1YPNA 1LGBC 3IB2A 3DM0A 1KWHA 1LLSA 2PT2A 5I84A 3ILUB 3CR9A 3I5OA 5H8NB 1DPEA 3MW0A 4R2FA 1LFGA 3ECRA 4GVOA 4F1UA 2XXRA 1EZPA 3IO6A 1B3FA 1MM7A 2AYSA 4WKMA 2X7QA 4F19A 1UIVA 5ICQA 3EHUA 1PB8A 2P2AA 1B3GA 5CM6A 1B51A 2F36A 3TODA 1MDP1 4ESWA 2R71A 3C34A 1D9YA 1MPCA 3S9LC 3TUSA 4F3PA 3TPAA 4O3AA 3TDJA 3ZSFA 4NF6B 1DOTA 2Y7IA 1JETA 4EDPA 2P1SA 1GVCA 5CC2A 2V93A 4AB6A 3BFTA 4IY6A 4MF3A 2F7CA 5BWJA 3FVNA 2I4CA 1B3LA 1MQGA 1B9JA 4OEUA 2PX1A 4F39A 2I0CA 2ABHA 3K6WA 1FQDA 5CMCA 4ZEDA 4UACA 2VP1A 1JEVA 5DTBA 1O63A 1LCFA 3IAZA 3MVXA 1SW4A 4BDRA 2OCUA 4KI0E 4PFTA 4BDMA 2XX9A 2ONKE 3O6HA 2I4BA 3G3GA 4BDOA 4FECA 3IB0A 5ITOA 4G8NA 4ELPA 1XOCA 4JWOA 3IB1A 1B3EA 5H8NA 1N76A 4YB5A 3OOAA 3LSWA 3UORA 5DYHA 3N6TA 2ZNTA 3FZVA 2ONRA 4IO5A 4ISUA 4QRZA 1N84A 3BBRA 1SDXA 3VFJA 3T66A 1QULA 2Q2CA 1UIUA 1MY1A 4EXKA 4QFLA 5CBRA 2Q2AA 3CFLA 2B65A 4JDFA 4YU0A 3LSFB 3KN7A 3DP8A 3CG1A 5ISUA 1TT1A 4LUBA 4NF6A 3A3CA 3GBAA 2Q89A 4YKKA 1B4ZA 4OQOA 5IAIA 3IO4A 1LAHE 2Q88A 3C36A 1FQFA 1AIVA 3RT8A 4IY5A 3PPRA 4L17A 3T22A 3MZ9A 1XVYA 2G93A 1VE4A 1P1NA 1GGGA 1MXYA 1QVSA 2PYYA 2DSFA 2B3FA 2H98A 2H9BA 2UVHA 1MXVA 3CFZA 4H6DA 2OK2A 1OLAA 2DVZA 5DVJA 4ELQA 3PD8A 1EH3A 4QSEA 3QUFA 2HXWA 1R9LA 3SEYA 4H5GA 2V3UA 1ANFA 3PMXA 5DVIA 5I2NB 1R9QA 1RYXA 2PMSA 1IXHA 1POTA 3SDFA 2ZYNA 1MDQA 1RYOA 4THIA 2DOJA 2QRYA 1M5FA 3H4ZA 4OERA 4TLMB 2VD2A 2XXYA 5H8FB 2FNCA 4MFIA 1XHYA 4FATA 2DE2A 2QL3A 3VLWA 1MQJA 5I59B 1Y3QA 4M4GA 2ZYMA 4R9GA 3TMGA 3QXMA 2ONSA 1P99A 3D4CA 1MQDA 1ZKBA 1HSEA 3RTWB 3C31A 1MS7A 2RINA 5AA3A 4RY1A 3U8QA 3MP1A 1NNTA 2Y7PA 4JB7A 1USYH 3G3IA 3PD9A 3R7XA 4PP0A 2F7AA 1B32A 5ITPA 4OFLA 4BDNA 4U21A 3RNNA 3MP6A 4MH5A 3UK4A 1LBCA 2Z8FA 1B0LA 3M3KA 2XX7A 5FTIA 4Q8RA 2XXIA 2ESNA 1L5TA 4HCYA 3IOWA 3MZBA 3PUZE 4U4XA 4R6YA 3SKPA 3W9VA 4OEVA 4FAJA 4ZZAA 3IX1A 4LQ2A 2PVUA 3HV1A 4E0XA 3UP9A 3VXCA 3MVYA 1B2HA 2PBWA 5H8FA 1B5HA 1IZ1A 4KHZE 4ZDMA 5I59A 3U92A 3KOTA 1JNFA 4RYAA 3KSJA 1B40A 4XKRA 3D4GA 3IJOB 2Y7RA 4R2BA 5CMMA 4ZEKA 3IOTA 1BP5A 3FV1A 2G29A 3EPEA 3P7IA 1AMFA 5FHNA 1ELJA 3K4UA 4AQ4A 5F1QA 3LR1A 1MQHA 1Y4TA 3LC8A 2NVUB 3CG3A 4R74A 2I3VA 5BUUA 2PT1A 1N7XA 1CE2A 3B7DA 4YZZA 4C1UA 1YTVA 1B46A 4OETA 4P0GA 3Q26A 4U1ZA 1PBPA 1IXIA 2GHAA 1GTKA 1P1OA 3IL1B 3R26A 3QK6A 4OFJA 3KEIA 3K6UA 2F7BA 3IOVA 5CMBA 5CRYA 1LFIA 4MBPA 3WAEA 3RGYA 3U72A 3VV5A 4GXSB 3OO8A 3S9EA 4N13A 3K00A 2Q9TA 5KCJB 4R9FA 3RN8A 2O51A 3PPOA 1FCKA 3PUXE 1RKMA 3T9UA 1OVBA 4GRKA 5AE4A 4JXIA 5DT6A 3H6UA 2REJA 3KJ7A 3FV2A 4XKNA 1FQAA 1B5IA 4HW8A 4DXBA 2DE4A 3HN0A 4R6KA 4NWCA 4NEDA 3JV9A 4HTGA 1B0HA 1B05A 2E0SA 4PQJA 3GZGA 3RLFE 3O6GA 3USDA 4MLQA 3MVWA 2UVJA 3K0VA 2RF1A 3TTMA 4KCDA 3OD7A 5AA4B 4F3GA 4ELOA 2DQVA 3A3UA 3IORA 2XXQA 3O29A 2DXRA 1URGA 1T0KA 3OELA 1TFDA 3HO7A 3MQ9A 1LB8A 1LFHA 2OWTA 2ZNUA 5DEXB 4QF9A 2OJTA 1NMUA 1A8FA 2D21A 1SYHA 3LBSA 1OVTA 5CBSA 4U1OA 4X1DA 2Y84A 5B7DA 5KCJA 2HAUA 2XD2A 4H65A 4HCWA 4ZE8A 3PU5A 4I1DA 4FEBA 3HHFA 2RC9A 4GQOA 4TQUQ 1MXXA 3FD3A 1DTGA 3FGSA 4N6PA 1JW5A 1PEBA 3T9VA 4NF4A 3WAFA 4OWDA 2WKYA 2O7IA 1US4A 3IJXB 3N94A 1H44A 2RCAA 3K1NA 3VVDA 3L6GA 1FTLA 5L9OA 2YJPA 2O1MA 4FJPA 4ZS9A 1Y1MA 4WEPA 4NWDA 5AA2A 3QSLA 1UQWA 1QUKA 1YAEA 1LAFE 3DP4A 5AA4A 3AXFA 3K2DA 1JQFA 3KOSA 2RCBA 1AH5A 5TPAB 2ZYKA 3FASA 1SBPA 3PMWA 1FQEA 1P1WA 4F1YA 2NOOA 1P1QA 3MP8A 4ZE9A 4OVJA 3KSXA 4FIMA 4LATA 3G3FA 1MXZA 4KQPA 5DEXA 4C1TA 3RT6B 2LAOA 1VFEA 4OTEA 3SEUA 4OENA 3T9XB 4WEDA 4IGTA 1QW0A 3B6TA 3PPNA 4JSDA 1NNKA 4KCCA 2QMWA 1B7HA 2I0BA 1PB9A 1ZTYA 2YLNA 3TYHA 3HCQA 3UIFA 4OXVA 3FJGA 1S9TA 4DCXA 3OENA 2RC8A 2FA7A 4EQ9A 4M1VA 4RJZA 4O3CA 3OEKA 1MXWA 1M5DA 1MG1A 3Q29A 1AL3A 1URDA 3TELA 4KPTA 1ZLQA 3FJ7A 4F2QA 1NNPA 2ZYOA 4JBZA 2CMOA 3H6WA 1FTOA 1N0TA 2FYIA 2B3BA 1A40A 3MBPA 1Y1ZA 2NWJA 2KLFA 4QSDA 1MQIA 4MLVA 1B58A 5A5XB 5TPAA 1IIWA 2Z8DA 4RK2A 3VVEA 2YPNA 1B7UA 2VD3A 3UN6A 5HPQA 1VSOA 1VFDA 3FVOA 5L9MA 4JWYA 2HAVA 2HEUA 4R73A 3TCGA 4U23A 2V25A 1II5A 1IEJA 2QS1A 5AA2D 1HSJA 1SI1A 4I9DA 2W7YA 2DE3A 4YMAA 4H8IA 4ZECA 2DS9A 1MM6A 3RY3A 5H8HB 4IO4A 5K2YA 1H76A 3O66A 3C32A 4EQ7A 2GFEA 4QFOA 5I58B 2XXVA 1S7YA 1F9BA 1OQHA 1TXFA 2DP8A 2QPQA 1ZU0A 4F1VA 4P11A 4DCYA 2I6EA 4YB6A 1BIYA 5H8QB 1IQ7A 3OMBA 3OSRA 3CSBA 3K1MA 4QFNA 3MC2A 2I58A 1B3HA 1US5A 1Y3PA 5A5XA 4F3SA 4ZEFA 3CFXA 2O6AA 4O3BA 4OMBA 4IO7A 3M8UA 4P0IA 2ALUA 1OLCA 1A7LA 2XX8A 4LONB 4BLAA 1A54A 3KJTA 3RPWA 1QJMA 1ATGA 4Q5TA 4PFUA 5FHMA 3V8XB 3E4RA 3BFUA 1MH4A 3Q27A 3G3HA 1QKBA 1URSA 3SEVA 5J1DA 5ELVA 3S9NC 3T93B 3HSTA 5H8HA 2Q8JA 3KFMA 1QKAA 1I6AA 4NF5B 3THIA 5I58A 1S50A 3FJMA 4LA9A 3U94A 3HHGA 4HS7A 3U1OA 4RA1A 4DZ1A 5H8QA 5EHSA 4I8CA 4ESXA 4DXCA 1MXUA 3K01A 1EZ9A 1JVYA 5LOMA 4XKQA 4GWOA 3V89B 4F31B 1QUJA 2HZLA 2IA4A 4G8MA 4U4SA 5JTYB 4RPNA 1GV8A 1N7WA 4YKIA 3IK6B 5ICTA 1P1UA 3H06B 3ONMA 2DWIA 4AB5A 3PV0E 2F34A 2H99A 1NH7A 1QUIA 3U93A 1IITA 5TP9B 2R6GE 4PE5B 5TU0A 3TKDA 1B5JA 3QAXA 3GBBA 1DMBA 4OESA 2HFBA 4GIZA 3DLNA 2D3IA 4KD5A 4LZ8A 4KFQA 3K6VA 1OQGA 2F6PA 1EZOA 4H5FA 1EU8A 5HBCA 3KG2A 1NNFA 3VDFA 2AIXA 1UTBA 4DLDA 3JYRA 3FUZA 3VLVA 4EF2A 1JVXA 1MY0A 3KBRA 2AL4A 1PB7A 4OHNA 1MY3A 1LAGE 2QS3A 3TTKA 4OYVA 3LUYA 4ZEBA 5K2XA 4NF5A 5JK4A 2DWAA 1H43A 3S4UA 4NF8B 2X26A 4LZ5A 3UA8A 3KGCA 2Y7WA 3Q28A 4E0WA 4R75A 4Q30B 1YCJA 3SEXA 4NF4B 3K1PA 3K6XA 1R1NA 3VE1B 3S2VA 5FTHA 4H1XA 5KDTB 4KYSA 2UVGA 1ZBMA 2UYEA 1D3KA 3CIJA 1ZJLA 2GRVA 3TQLA 3R6UA 3SERA 1PBQA 4ONYA 4WXJA 5JTYA 5AA2B 1CB6A 3N6UA 3G3KA 3MUQA 3O9PA 2XXUA 5F7VA 3E3KA 3E13X 3W9WA 1LSTA 2X7PA 3FIRA 4I62A 3TCFA 5TP9A 3FATA 2VGQA 3F11A 4XXUA 3TZAA 3TTLA 3CSGA 2CZLA 1SVXB 1Y20A 3H03A 5I56B 4DIGA 3N26A 3C4MA 5H8SA 3PPPA 3H6TA 4R6HA 5DVFA 3TTRA 1JW1A 4Z0IA 2XHDA 3QUJA 4ELRA 1B1XA 3VXBA 3IR1A 3S9MC 4YICA 3G7WA 4NF8A 2Y7KA 1Y9UA 5M2VA 2RC7A 3MJNA 5KZTA 1WODA 5IKBA 2A5TA 1B4HA 5KDTA 1B6HA 3KN8A 3OO6A 4ECFA 2O1LA 4G68C 3ODBA 4F29A 1LB9A 4LP2B 1FW0A 1MH3A 3PUYE 4N07A 2I3WA 3T9HB 5CMKA 1N3XA 1O64A 3QIMA 2OLBA 4ND9A 2THIA 4GLIA 4GD5A 3SETA 4KYEA 1IUDA 1MRPA 1B1HA 1B52A 3EQ1A 2O69A 2QSXA 4FORA 3TTNA 1WVJA 4DE8A 4RPOA 3HPIA 2HCAA 2F5XA 4NE4A 2NXOA 5I56A 2XXXA 3VVFA 3I6VA 1BKAA 4X9TA 4G77A 2O7UA 4U22A 2HQ0A 4EXLA 1Z7ME 1XC1A 2ZNSA 2AL5A 4YKJA 4ZZEA 1OIBA 1ZIUA 1H3DA 4IGRA 1FTMA 2H4IA 4NTLA 3KN3A 1M5EA 2P0SA 4IO3A 4G2ZA 5JEIA 1GR2A 4R72A 3O28A 2F97A 2XXPA 5HM4B 1SW5A 3PUWE 3PMVA 1A8EA 2E1SA 3ZKKA 3TCHA 1NKXA 2HZKA 2H5YA 4BDLA 4KYDA 4EQBA 1IXCA 4G68B 3TEPA 4G8HA 4QFPA 2ANJA 3SESA 2I48A 3DELB 2NUVA 4Q0CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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