2DSFA

Structure of the complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with xylose at 2.8a resolution
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Lactotransferrin
publication title Structure of the complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with xylose at 2.8A resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
total genus 100
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-06-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dsfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dsfA02
4R75A 1LBCA 4QFKA 3K1NA 3CFXA 3ZS6A 1UTBA 2V84A 3VLVA 3U93A 3RUMA 3OXNA 1XVYA 3KBRA 1MH3A 5I59B 4F3BA 2F7BA 3ODBA 4LUBA 2O7IA 3RQTA 4LZ8A 3MZBA 1Y3PA 3T93B 2AL5A 4PFUA 4EF2A 3H06B 4Q8RA 2XXXA 1AH5A 3I5OA 1QW0A 4NF6A 2ABHA 1CB6A 1NNTA 1OVBA 3ZKLA 2XXYA 4IO4A 4R9GA 1TT1A 4KPTA 2G29A 3K1MA 1TXFA 1URGA 2F34A 4BDRA 4H5GA 1NNFA 4F29A 1VSOA 2O84X 4YMBA 1WDNA 4ZE8A 3H6UA 3E9XA 3HCQA 5A5XB 1M5CA 4H67A 1LFHA 5HM4B 4KCDA 1B32A 1IQ7A 1B05A 3RGYA 3ILTB 3PUVE 3RTFB 4ESXA 4GWOA 1SYHA 2PX1A 3T9VA 2HZLA 5EYFA 2OZZA 5DEXA 1MG1A 3GLBA 2ZYNA 2ZNUA 3S9MC 1SI1A 2H99A 2UVJA 3O66A 4F2QA 3TQWA 1A8FA 4ZZEA 1IXCA 3T96B 1EU8A 1P1UA 2QJEA 3G3GA 2ZYKA 1NKXA 2F6GA 2I4BA 1OIBA 5A5XA 1IXHA 4RA1A 3FGSA 3OEKA 3FVOA 4ZEDA 2KLFA 2V3UA 1GV8A 5LOMA 3K00A 3KN8A 4FJPA 3VV5A 3Q28A 5DVJA 1T0KA 5BWJA 4QSCA 1MXVA 5FTIA 4U4XA 3JYRA 3CRBA 4PFTA 3SEYA 4LQ5A 1R6ZA 2IEEA 4X9TA 3S9LC 4YKJA 1FQFA 5I2KB 1JNFA 3QUJA 3SKPA 1LBBA 2B3BA 1VFEA 4GXAA 3N94A 3TODA 4F18A 1N7WA 4H65A 4G68C 2F97A 2DWHA 3KN3A 3BKIB 4XXUA 1US4A 3MVXA 3C36A 4N13A 4G77A 3OO7A 5JTYB 1QUIA 2XD2A 4F31B 3KZGA 3K6VA 4ONYA 4R72A 4OHNA 1QULA 3MZ9A 1IZ1A 2ONSA 1NL5A 1D3KA 1SW5A 3CVGA 3HV1A 3E3KA 2DWIA 1POTA 3KSXA 3T9UA 5H8FA 5FHMA 2VD2A 3EHTA 4U23A 4EQBA 1MXUA 3SESA 2PT1A 1N04A 4I9DA 2XXHA 1MY2A 4G2ZA 1MDQA 1N0TA 4GL0A 4MBPA 3FASA 2DYXA 2I3VA 3I6VA 1PB7A 4OXVA 3MVWA 3QUFA 3H6WA 1B2HA 3SEXA 1R1NA 1ZTYA 1JW1A 1MQJA 1EZOA 1Y4TA 4ZEFA 4ISUA 3FVNA 5ISUA 2DQVA 3TYHA 1SBPA 4NTLA 2Z23A 3G3JA 5FTHA 5CBRA 3T9XB 1B6HA 3IL1B 1UTHB 1LFGA 5H8HA 5EHSA 2I48A 4R6KA 1GTKA 1MXYA 4TOZA 5TP9B 4EXLA 3V89B 5KCJB 3N26A 3V8XB 4K3FA 4IGRA 4JSOA 2X7PA 2QS3A 5K2XA 1FTOA 1SVXB 4IO3A 1VR5A 1EZPA 3MP8A 2AL4A 4R6YA 2FYIA 3IB2A 3EN3A 1UIVA 4HCWA 4ELPA 1B3FA 1LAXA 3U8QA 2RC7A 4X1DA 1KWHA 1IEJA 2RCAA 2V25A 3K6WA 4OMBA 4FORA 1FTKA 3DLNA 1S7YA 4LZ5A 1QJMA 1FQDA 3OO9A 1UQWA 2PVUA 3FJMA 1UTHA 3W9WA 2XX8A 2UVIA 1XOCA 1LAHE 1DMBA 2F7AA 3K4UA 4DE8A 1SD3A 3K2DA 4G8MA 1JETA 4KCCA 5KCJA 4JWXA 1FW0A 1A7LA 4I8CA 3H6TA 2VOZA 2P1SA 2ZNTA 1MXWA 4F22A 3GZGA 3CIJA 2GHAA 3RY3A 3DP8A 2O51A 1R9QA 1PDAA 1HSEA 1Y3NA 3O29A 3DELB 1B3EA 1MY1A 3QIMA 4FE8A 3MPKA 3FXQA 4U2RA 1JW4A 3F11A 5F1QA 4OZ9A 4IO5A 2O1LA 4QRZA 2QSXA 3T9HB 1OVTA 4QHQA 5L9MA 1MXXA 3VFJA 3RPWA 3TCHA 2HXWA 2GH9A 1GGGA 1SW1A 4YMAA 3IOUA 5AA1A 2F6PA 3QAXA 2VHAA 3HHGA 4KYEA 2I0CA 1DSNA 5DTBA 2O1MA 1JQFA 1GR2A 2Z8FA 3FV2A 2VGQA 3ONMA 2V3TA 1AOVA 4OFJA 1PBPA 4JWYA 4F3GA 4BLAA 4KQPA 1URSA 3S4UA 2XXIA 3PUYE 1POY1 2H4IA 2V93A 2E0SA 3RLFE 2F7CA 4YU0A 5I58B 1OQGA 2NWJA 3UP9A 4OFOA 4G4PA 1ZU0A 2QRYA 4MFIA 4WXJA 1B9JA 3B6WA 4ZE9A 5CMBA 1TFDA 4G68B 2UXAA 4IO7A 3C35A 4RK9A 3K02A 1LCFA 3ZKKA 1UIUA 3B6QA 1D4NA 1XT8A 3KN7A 2B3FA 3E4RA 5DT6A 4DIGA 2BJJX 4HCYA 4P0IA 5I57B 3BFTA 2NOOA 1B1HA 3H7MA 1MPBA 3K6UA 1RYOA 1S50A 5AA3A 1B7ZA 1JEVA 3OEMA 3UIFA 4DCYA 1B0LA 2DOJA 4YKKA 3TTKA 5I58A 4OVJA 3IK6B 1FQEA 2RCBA 2Z8DA 4GL8A 4FAJA 4ESWA 1N7XA 2DE4A 3QYTA 2W7YA 3IAZA 3T22A 3LSLA 4G68A 1URDA 4X1BA 4AB5A 1HSLA 1B7UA 2NVUB 2PBWA 1MQDA 5L9SA 3O2AA 3MAMA 1WODA 4F2OA 3ZSFA 3PUXE 4THIA 4NE4A 4WEDA 1Y3QA 2XXPA 1HSJA 2I4CA 3C34A 2XXVA 5I59A 1Y1MA 1MPDA 3MVYA 5DVIA 2G93A 4R6HA 1I6BA 1B1XA 3SEUA 4E0WA 4ECFA 4ZEIA 2X7QA 3FZVA 2OWTA 1PB8A 5EHMA 3RNNA 3U92A 3SDFA 4QSDA 3QXMA 4OTEA 4RPNA 3PUZE 3VXBA 2WKYA 1A40A 4MLQA 2I3WA 3LSWA 4XIGQ 1LFIA 4DDDA 3IOWA 4RYAA 3PGFA 1DTZA 5M2VA 2R71A 2Q88A 1MM6A 4NF5B 5IAIA 2A5TB 3U94A 3L6GA 4ELQA 3MC2A 4POXA 3RT8A 2OWSA 2ZYOA 1N84A 1P99A 2H25A 3V83A 1H43A 3MUQA 1OLCA 2DWAA 3OMBA 3W15C 3CSBA 4YKIA 3MZ1A 1MRPA 3MBPA 1LAFE 1WVJA 4RNSA 2DVZA 5ITOA 1FQAA 2ANJA 2HAUA 1MY3A 1USYH 3EF7A 3S9EA 1B52A 3TELA 1Y4CA 3M3FA 2Y7WA 3IO4A 2DP8A 3EPEA 4O3CA 2H9BA 2YJPA 3KEIA 2A5TA 2H98A 3GBAA 4C1UA 2ONRA 4YAHX 4OESA 3MP1A 3OD7A 4Q30B 3PMXA 3A09A 3VVEA 1YPNA 3KFMA 2O69A 3M3KA 3VLWA 4YZZA 4PE5B 2Z22A 4PFWA 2XXQA 2PYYA 1EZ9A 3LR1A 4DXCA 2REGA 1B46A 4JBZA 3OSQA 2YPNA 3TAJA 4N6PA 5I2KA 1H45A 4JXIA 2Q8JA 1VE4A 3C32A 5CMKA 3DP6A 3H6VA 4BDQA 1S9TA 3U72A 1MS7A 3PUWE 4NF8B 1OLAA 3TFLA 4F39A 5JK4A 2UYFA 1QUJA 1B5JA 4FATA 2Q89A 4U22A 5JTYA 2D5WA 3W9VA 3FXRA 5H8NB 2I6EA 4QFNA 4H1XA 4HW8A 3PPPA 1NNKA 5DYHA 2UVHA 1PB9A 4Q0CA 4NF4B 4YB6A 1MQIA 4Z0IA 3UORA 4GFRA 3RTWB 3VVFA 2I0BA 1GVCA 4QFPA 3Q26A 2XX7A 5KZTA 3R6UA 1XHYA 2THIA 5ITPA 4EQ9A 3CFZA 1NH7A 2ALUA 4BDNA 5I56B 4Q5TA 4UA8A 3CSGA 4KYDA 1TFAA 4AQ4A 2PT2A 4F3PA 4F19A 3M3LA 1Y1ZA 5H8NA 1TWYA 1VFDA 3KG2A 5H8SA 4EF1A 3TZAA 1MQHA 3FV1A 4GIZA 2OLBA 1B40A 3TDJA 4X48A 4O3AA 3O6HA 1LGBC 2CMOA 1R9LA 1ANFA 4NF4A 1B4ZA 3R7XA 2HFBA 3O28A 4LA9A 3S2VA 3KOSA 3IOTA 5TP9A 4OEUA 4OWDA 3HSTA 1PEBA 4H0WA 2F5XA 3G3FA 3PPRA 1NH8A 4IB2A 2GHBA 2P2AA 3IO6A 4TLMB 4YB5A 4ELOA 1YCJA 3CFLA 4BDLA 5I56A 4RK2A 3QK6A 2GFEA 5HBCA 1P1NA 4Z7EA 5I2NB 1LAGE 2ESNA 4IY6A 2XHDA 5L8DA 2NUVA 1XC1A 1USYE 3PPNA 2RC9A 4ND9A 4OENA 3K6XA 2OK2A 3EQ1A 4R2BA 4G8HA 5J1DA 2ZMBA 4YB7A 3EHSA 3P7IA 3FXUA 1J1NA 3Q25A 4OEVA 2LAOA 2PMSA 4XKNA 4NWCA 4E0XA 1SI0A 3PU5A 1LCTA 3FVGA 3TTMA 2QMXA 3THIA 1ATGA 5CI5A 1H76A 3A3UA 3JZJA 4HTGA 1Z7ME 4JDFA 2RINA 1JEUA 1BTJA 5AA2B 2HCAA 2XXRA 1QKAA 3OO8A 3D4CA 4PP0A 3VLUA 3HPIA 3FJGA 3MWBA 3O97A 1DPEA 3G3HA 5L9OA 1UTBB 3FUZA 4MH5A 4IY5A 4G8NA 1B51A 2F78A 4OERA 1ELJA 2QMWA 4NEDA 4F1VA 2XXWA 1FQCA 3K01A 3TCFA 4P0GA 3USDA 3S9NC 4GQOA 1LB9A 3O6IA 4LZ7A 1PBQA 3OOAA 3CI8A 2RKMA 2VD3A 4PETA 2E1SA 3Q27A 5AA2A 3OSRA 2O68A 2Y7PA 5ELVA 4ZEBA 5CC2A 2DE3A 3B7DA 2DXRA 2GRVA 2AIXA 2DVCA 4XKQA 3TEPA 4EUOA 3LSXA 3FJ7A 1US5A 4U21A 5B70A 2Q2CA 3IB1A 1FQBA 3IJOB 1FTMA 3VDFA 1M5BA 1A54A 4M1VA 4WEPA 2HQ0A 5TPAB 5DEXB 4F3SA 4KFQA 4KR5A 1ZLQA 4IO2A 5IKBA 4GD5A 4OQOA 5CM6A 5I57A 3SEWA 1A55A 1N76A 3OELA 3G3KA 4KYSA 1I6AA 4HS7A 3KGCA 2ZXTA 3PD8A 4PFYA 3FIRA 2XX9A 2VP1A 4LATA 1P1QA 4H8IA 1LSTA 3T66A 2OBGA 2R6GE 3N5LA 4YKPA 1JVXA 4QFOA 3DM0A 4MLVA 4PQJA 2I49A 2Y7RA 2DXYA 2DS9A 2X26A 4U1ZA 2UYEA 3RN8A 3EHUA 1N3WA 4QF9A 2XD3A 5TPAA 4TQUQ 3TTRA 2P0SA 4DCXA 1CE2A 3U1OA 1EH3A 3TCGA 3PD9A 1IIWA 4H6DA 2Y7IA 1IUDA 3CG3A 3WAEA 3IORA 1NMUA 3TPAA 3N6TA 3LSFB 3C31A 1JW5A 1MY4A 1B3GA 4M4GA 3MJNA 4XTCQ 2A5SA 1M5FA 2D21A 2F35A 4LQ2A 1Q1KA 1A8EA 4R2FA 4R9FA 5AA2D 1P1WA 5BUUA 3MVZA 3N6UA 2Q2AA 4OYVA 4NWDA 4U4SA 1JVYA 4GF8A 3C33A 2QS2A 2QS4A 3G7WA 1I69A 4JSDA 1FTJA 3HO7A 3KOTA 3RT6B 3BFUA 3MP6A 4OETA 1IXGA 1RYXA 3VE1B 3Q29A 4NF5A 1A99A 3UN6A 4H8JA 2Z8EA 5H8FB 3FD3A 1AIVA 1Y20A 3JV9A 4RPOA 2HZKA 4IO6A 2ZYMA 1B3HA 1BLFA 1SYIA 4QFLA 4LONB 3TQLA 5ICQA 3H3GA 2UVGA 4MF3A 1QVSA 1B58A 2DSFA 3PMWA 3SERA 1N3XA 3VXCA 4JWOA 4N07A 2XXTA 2R9JA 4GRKA 1ZMGA 4AB6A 2O7UA 1B5IA 1LB8A 3G3IA 1ZBMA 4ZECA 2REJA 5H8HB 3ECRA 5H8QB 3WAFA 1AMFA 4FECA 1B5HA 4LVQA 2NXOA 1MPCA 3LBSA 4C0RA 2HAVA 1XVXA 4RY1A 4DXUA 4C1TA 1ZIUA 3D4GA 1MXZA 2QPQA 2F8DA 3LUYA 1YAEA 4KI0E 1RKMA 3OO6A 1DOTA 5B7DA 3SEVA 3H4ZA 2B65A 5TU0A 1Y9UA 3GBBA 1L5TA 1O63A 4FIMA 4RXLA 1MDP1 5AA4B 2QS1A 3CR9A 4GVOA 4NF8A 3FATA 5DVFA 5FHNA 1F9BA 2FA7A 1M5DA 4ZEKA 1II5A 5H8QA 1OQHA 2ZNSA 1MQGA 1B0HA 3MQ9A 1BKAA 1D9YA 1Q35A 1ZJLA 3HHFA 1D9VA 2Y84A 2OJTA 4LP2B 4L17A 2DWJA 1QUKA 4BDOA 3K1PA 3SETA 4R73A 2OCUA 2YLNA 4RJZA 4U1OA 4H5FA 3UGWA 5I84A 2ONKE 2DE2A 2Y7KA 5CMMA 1YTVA 4I62A 1SQYA 5AA4A 3PPQA 4QSEA 5JEIA 4IGTA 1FTLA 3IOVA 3A3CA 1SDXA 2FNCA 4F1UA 3TKDA 5AE4A 1B7HA 2RC8A 4ZDMA 4R74A 1M5EA 5CRYA 1LLSA 5FHOA 5F7VA 4UACA 1OMPA 4XKRA 1NNPA 4GOTA 2HEUA 3OENA 1MY0A 3H03A 3KJTA 4EXKA 3MW0A 3O6GA 3LC8A 3FVKA 3PV0E 3L6HA 4YICA 3KJ7A 1B4HA 1O64A 4NMYA 2IA4A 4EDPA 1B3LA 3AXFA 4WKMA 4POWA 3B6TA 1BP5A 2O6AA 1MM7A 1AL3A 5KDTB 3PMVA 4GXSB 1O7TA 2XXUA 4DLDA 2CZLA 4OFLA 3BBRA 1PC3A 4I1DA 4FEDA 3IJXB 3O9PA 1ZKBA 3GXAA 3V5AA 3I3VA 4BDMA 3C4MA 3R26A 1MH4A 3MPLA 5I2NA 3TMGA 3VVDA 3UK4A 3K0VA 4ZS9A 3E13X 3IR1A 4KHZE 3DP4A 3IX1A 1H44A 3IB0A 4GLIA 2RF1A 4KD5A 4XKPA 4FEBA 4F1YA 2H5YA 3TUSA 3HN0A 4ZZAA 2M8CA 4DZ1A 5KDTA 3M8UA 1I6QA 3TTLA 3TTNA 4EQ7A 2QL3A 5CMCA 3ILUB 1DPPA 5CBSA 2I58A 2Q9TA 1SW2A 1IXIA 1XS5A 4NF6B 1BIYA 1NFTA 4JB7A 5K2YA 2AYSA 2F36A 1IITA 1DTGA 3UA8A 3PPOA 1QKBA 5HPQA 1P1OA 4DXBA 3CG1A 1H3DA 4P11A 4TLLB 5ICTA 2V3QA 3KSJA 4O3BA 1FCKA 1SW4A 4ELRA 1Z7NE 3C9HA 2D3IA 3QSLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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