4XXUA

Moda - chromate bound
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
GKITVFAAASLTNAMQDIATQFKKEKGVDVVSSFASSSTLARQIEAGAPADLFISADQKWMDYAVDKKAIDTATRQTLLGNSLVVVAPKASVQKDFTIDSKTNWTSLLNGGRLAVGDPEHVPAGIYAKEALQKLGAWDTLSPKLAPAEDVRGALALVERNEAPLGIVYGSDAVASKGVKVVATFPEDSHKKVEYPVAVVEGHNNATVKAFYDYLKGPQAAEIFKRYGFTIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Metal binding protein
source organism Escherichia coli (strain k12)
publication title Structure of chromate bound ModA from E.coli at 1.43 Angstroms resolution.
rcsb
molecule keywords Molybdate-binding periplasmic protein
total genus 78
structure length 231
sequence length 231
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-01-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4xxuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4xxuA02
3V5AA 4GD5A 4OEUA 4OFLA 4RPOA 1R9LA 3MPLA 4G68A 3H3GA 4YZZA 5F1QA 1SW4A 2XXWA 4RYAA 4LONB 5JEIA 4G8NA 1PB7A 4DLDA 4DCXA 2YLNA 3N94A 1A8FA 3DELB 1AH5A 3K00A 4NF4B 4GL0A 2HCAA 3FXUA 1B5IA 3R6UA 3SDFA 4YB5A 3OO7A 2Y7KA 1N04A 2Y7IA 1HSLA 2DOJA 1B40A 1XC1A 2AL4A 3B6QA 2DXRA 4QF9A 4OFJA 3LSLA 4U2RA 4F39A 3KSXA 4MF3A 4ZZEA 3UK4A 1IXHA 2PBWA 3EQ1A 3FJMA 4RK2A 2QS4A 2LAOA 1DOTA 4KD5A 4F2OA 2UVIA 2Z8FA 4YU0A 4E0XA 4ND9A 4RY1A 2THIA 4ELQA 4PQJA 4F2QA 3KN8A 3O28A 4OVJA 1YCJA 3TODA 1SVXB 4BDQA 2UXAA 4DZ1A 1LBCA 4I8CA 2HAUA 1O63A 1SI1A 4LZ5A 5EHSA 3H03A 2X7QA 5K2XA 3LC8A 1D9YA 2DS9A 3K1PA 1IIWA 3BBRA 3U94A 3O2AA 3O66A 1QUKA 1DMBA 2QS1A 5I84A 2R9JA 3MP6A 3A3CA 1WDNA 3D4GA 3TEPA 4C1TA 1BIYA 4EDPA 1LAHE 5FHMA 2PYYA 3UORA 4YAHX 2H25A 5BWJA 4FAJA 3U8QA 2XXXA 4R2FA 2RCAA 3MQ9A 4FE8A 1ZTYA 4QSCA 3FJ7A 4ELRA 2O7UA 2Y84A 3K6UA 1AIVA 4EQBA 2F7CA 1JEUA 4H8IA 4PP0A 3EF7A 1POTA 4F3SA 1AMFA 1MQGA 3SEVA 1H3DA 1OVTA 5CM6A 3OO6A 2Q88A 3RLFE 4JSDA 1FQAA 4KPTA 4DDDA 4OQOA 3WAFA 2F6PA 1Y1MA 3H7MA 3TQWA 3CG1A 4QHQA 1TWYA 4NF6B 5L9MA 1P1UA 4H8JA 4OWDA 4NEDA 2RC9A 4OMBA 1JVXA 3K0VA 2G29A 2UYFA 2UVJA 4ECFA 4NF6A 3G3GA 2I6EA 3ECRA 5BUUA 3OMBA 3LR1A 3IK6B 4R9FA 2RKMA 3CFLA 3IO4A 4LZ8A 1UTBB 3U1OA 1B7HA 2X7PA 2D21A 4IO6A 3EN3A 4R72A 2D5WA 3N5LA 3S9LC 3P7IA 3F11A 3MZ1A 1POY1 3IL1B 2V84A 1QKBA 1FQBA 4IO4A 4ISUA 2RCBA 4QFOA 4BDOA 3HHGA 2HXWA 5TP9B 1MXUA 4G4PA 1LAFE 4WEDA 1LB8A 3IOVA 4IB2A 1B3FA 2WKYA 2XXYA 4LATA 4XKRA 2Y7WA 3BFTA 4H0WA 1MDP1 4G68C 3TYHA 1B3HA 3GBBA 3S9MC 2Y7PA 2XXUA 3LBSA 1Y9UA 3KSJA 2DQVA 2PVUA 5CMBA 3EHUA 4NF5A 3RPWA 2XXVA 4PE5B 4YKIA 1MQHA 1MH4A 3MZBA 3OOAA 3K6WA 1USYH 1JETA 5JTYB 2F7BA 3C36A 1R1NA 1S7YA 5CBSA 3WAEA 2RINA 2DWHA 4JDFA 1TXFA 1ZKBA 4R75A 3EHSA 2R6GE 5DEXA 1EZPA 1LGBC 4OERA 2DE4A 5CBRA 2QS2A 3K2DA 3ZS6A 4NF8B 3O9PA 1B0LA 2VOZA 4LA9A 2GRVA 3PUWE 1NMUA 4YKPA 5HM4B 3IO6A 4R6KA 1MH3A 3JZJA 4MLQA 2H5YA 4F31B 4DXBA 3B7DA 2NUVA 4OYVA 5EYFA 4N13A 1RKMA 4OHNA 4KQPA 1SYHA 3PD8A 3O6IA 3MBPA 2XXTA 2XD2A 2OZZA 4G2ZA 4N6PA 4ZECA 4GOTA 1Y3QA 4EF1A 5DVFA 1UIUA 4JWOA 4H6DA 3QUJA 3GXAA 4OFOA 4UACA 4UA8A 2XXRA 1B4ZA 2ZYOA 4P11A 3V89B 3KG2A 1LFGA 1IXIA 2CMOA 2OWTA 1QULA 1PBQA 3FV1A 4FATA 5H8QA 1MQIA 3TCFA 3TMGA 1NH7A 3FV2A 4M4GA 2G93A 1J1NA 2BJJX 1LCTA 3Q28A 1L5TA 4F18A 4HS7A 1US5A 3QUFA 5I56B 3C31A 1MY1A 4U22A 3U93A 4I9DA 5J1DA 3OXNA 5AA2B 5CRYA 3TELA 3VE1B 3PUYE 5I56A 3U92A 2V3TA 1JW5A 1O7TA 5I57A 3HCQA 5K2YA 2XX9A 2DWIA 3B6WA 5FTIA 4U4SA 2HZLA 4FEBA 4ZZAA 5HBCA 5F7VA 2P0SA 2R71A 4PFTA 3L6HA 3TTNA 4KHZE 3GBAA 3KJ7A 1NNPA 2XD3A 1OIBA 1GTKA 3SESA 5ITPA 4P0GA 2NOOA 2DSFA 4AB6A 3K02A 4O3CA 5A5XB 4X48A 3HSTA 1N76A 3KJTA 2UYEA 3QXMA 3O6HA 3O6GA 4QRZA 2DWJA 4Q30B 4XIGQ 4O3AA 5A5XA 3PPPA 3VXCA 5AA4B 1JEVA 4BDNA 3JYRA 4GXSB 1FTOA 2ALUA 1QUJA 4U23A 1MRPA 4FECA 3OD7A 3H6UA 4QFNA 4QSDA 3T9VA 1MPCA 1FTJA 1XVXA 2QL3A 4NMYA 1Y3NA 1UTHB 2O6AA 4FIMA 5ELVA 4ELPA 1FTMA 3OSQA 4HTGA 4R74A 4GVOA 4R6YA 2HFBA 3KN7A 2OK2A 1URDA 3SEUA 3M3KA 3UN6A 4YMBA 4OXVA 2Q89A 2ZNTA 3C32A 3TPAA 2XXIA 3I3VA 4NF4A 3LSXA 1NNFA 3ZSFA 2AL5A 1DTZA 1XOCA 1SYIA 1Z7ME 3M8UA 3FIRA 2A5TB 4NE4A 2CZLA 2V3QA 1Y3PA 2OWSA 2V25A 5FHNA 2RC8A 3ZKKA 3UP9A 4R6HA 3TTMA 4Z7EA 1PB8A 1F9BA 4EF2A 2O69A 2Z23A 3T9HB 1PDAA 2V93A 3VLWA 1YAEA 2O68A 3R7XA 1XS5A 3HO7A 3Q29A 3CSGA 5TU0A 2ZYMA 3RN8A 1MDQA 4KCDA 2Q8JA 1MS7A 1MQDA 4BDLA 3H6TA 3FVKA 3U72A 1XVYA 3G7WA 5ITOA 3EPEA 1B6HA 1P1NA 4EXKA 3MW0A 2ONSA 4IO5A 2VD3A 3DM0A 3SEYA 1EU8A 4JWYA 1P1QA 5H8NB 3MVZA 3VVDA 5I58B 3E13X 2OCUA 3KBRA 1MXYA 3PPOA 2B3FA 1TFAA 1Y4CA 3TUSA 3C9HA 1B58A 5L9SA 3FD3A 5H8FB 2I3WA 1B46A 2ZMBA 3EHTA 3LSWA 3IR1A 1O64A 2M8CA 2RC7A 3T66A 3TTRA 4BDRA 3MPKA 1AL3A 2OBGA 3LSFB 1LFIA 4TOZA 1IEJA 2A5SA 2GH9A 1P1WA 1ZLQA 3W9WA 4I62A 1QKAA 4ZS9A 4QSEA 1DSNA 2Q2CA 1ZIUA 4F1VA 4HCWA 1CE2A 3THIA 4AB5A 4ZEIA 1FW0A 3MP8A 5I59B 1GR2A 1IITA 4U1OA 3IOWA 1FQEA 4N07A 3VDFA 2HEUA 3USDA 1A55A 2KLFA 3VLUA 4JSOA 1H43A 3CG3A 4KR5A 4Z0IA 3T9XB 2H4IA 4HW8A 5IKBA 3HN0A 5AA2D 1M5CA 3FGSA 1MY3A 3TAJA 2F36A 1ELJA 3PPNA 5AA3A 2FNCA 4WXJA 3CFXA 1IUDA 3PUXE 4XKPA 5KCJB 2XX8A 3BKIB 3IORA 5H8SA 4F22A 1M5EA 5L9OA 2O1MA 1B3LA 2VGQA 2REJA 1XT8A 1B2HA 2DVCA 1UTBA 4LQ2A 2ONKE 4DE8A 4LP2B 2ABHA 1MXWA 2Q2AA 5AA1A 1HSJA 3FVOA 3PMVA 1R9QA 5ISUA 1PEBA 4YMAA 1SD3A 2RF1A 1SI0A 5TP9A 2AYSA 1JW4A 3RGYA 2Q9TA 1LSTA 3RTFB 2O7IA 3G3JA 2X26A 1Q1KA 3CSBA 3K4UA 1RYXA 3FJGA 4G77A 2B65A 1VSOA 4DXCA 1GVCA 1M5DA 2F35A 1GGGA 2QMXA 1EZ9A 3KGCA 3GZGA 4IY5A 1KWHA 2I48A 2XXPA 1CB6A 3SEXA 1FTLA 2QPQA 2DVZA 2HQ0A 3S4UA 2H99A 2B3BA 5JTYA 2I4CA 1N84A 3KFMA 3I5OA 4LQ5A 3MAMA 1NNKA 3T96B 3H4ZA 3TTKA 1XHYA 3IJOB 1N3WA 2O84X 2F97A 3PU5A 3RY3A 2DE3A 1FCKA 2QJEA 4RA1A 5I2KB 1D9VA 4NF8A 2DP8A 3M3LA 1A8EA 5KDTB 1SW5A 4RK9A 3DLNA 4ZE9A 3K1MA 3CRBA 1QJMA 5JK4A 2O51A 1AOVA 1OLAA 3TZAA 4KYEA 4EXLA 1DPPA 4C0RA 4GF8A 1WVJA 3HHFA 4XTCQ 5DTBA 2H9BA 2HZKA 2PT2A 2F8DA 1I6AA 4IO2A 3H6WA 3E9XA 2NXOA 1B7UA 1TT1A 4R73A 2XXQA 3N6UA 4GRKA 1ATGA 3KOSA 3M3FA 1P99A 2GFEA 3QK6A 1NH8A 4YB7A 4BLAA 1FQFA 1SQYA 4Q0CA 3FXRA 2QRYA 2FYIA 4QFLA 3FXQA 2PT1A 4RPNA 3VV5A 4H1XA 5CI5A 1QUIA 2NWJA 4GLIA 4YB6A 4MBPA 4MLVA 2IEEA 4XKQA 4FEDA 4IO7A 1USYE 1NL5A 2I4BA 1B52A 5LOMA 3GLBA 4GXAA 1Q35A 3DP6A 4IY6A 5EHMA 5AA2A 2VD2A 1JQFA 3DP4A 2AIXA 3O97A 2I0BA 3AXFA 4P0IA 4EUOA 3H6VA 1B3EA 1MXVA 3QAXA 2DYXA 2O1LA 4HCYA 4GWOA 2QS3A 2NVUB 5DYHA 1FTKA 4PFUA 1US4A 4PETA 3G3FA 4Q5TA 4OETA 4F19A 3PMXA 3FASA 3CVGA 4QFPA 4F1UA 2PMSA 2P2AA 3K01A 4THIA 3IB1A 3KZGA 1JVYA 4WKMA 4KYDA 3ILUB 2UVGA 1B0HA 3SERA 4ZEDA 1SBPA 4MFIA 5HPQA 1SW1A 4MH5A 1B4HA 3QSLA 3SETA 4DIGA 5AA4A 1OVBA 2FA7A 1MPDA 1EH3A 1H45A 1BTJA 3V8XB 3IOTA 4G68B 3OSRA 2YPNA 5FTHA 1B32A 3CI8A 4NWDA 3K6XA 3MJNA 1UTHA 2QMWA 2OLBA 4X1BA 1IXGA 3N6TA 3HPIA 3FVGA 3FVNA 4F1YA 3C34A 4OEVA 1GV8A 4G8HA 5B7DA 3PUZE 4XXUA 4U1ZA 3KOTA 3OENA 4OESA 4F3PA 4JB7A 3OO9A 4G8MA 1I69A 5H8HB 2I49A 1MXZA 3VFJA 3MVXA 1RYOA 2A5TA 1M5FA 2F78A 5H8HA 3TCGA 1B51A 1JW1A 1ZJLA 4JWXA 4R9GA 1I6BA 4ONYA 4EQ9A 1A40A 2F7AA 1URSA 3RT6B 5TPAB 3LUYA 3PV0E 1LFHA 1Y4TA 3G3HA 3SKPA 2D3IA 3K1NA 3TTLA 1B1HA 5I2NB 5TPAA 1VFDA 1H76A 2Z8DA 4IGRA 5IAIA 3A3UA 4Q8RA 3V83A 1ZMGA 2GHBA 3VXBA 2IA4A 4GL8A 5I2NA 3MVWA 4F29A 3HV1A 4ESWA 3UIFA 4LUBA 4OENA 3H06B 1SW2A 1D4NA 3QIMA 3MZ9A 5KZTA 1A54A 1NKXA 5H8NA 5I58A 2Z8EA 3TDJA 1QVSA 3JV9A 1FQDA 3T9UA 3TKDA 3OO8A 4GIZA 3IAZA 1BP5A 2ESNA 1OQHA 2ZNSA 3T22A 4JBZA 5H8FA 3VLVA 1OQGA 5DT6A 1P1OA 4GFRA 4PFYA 1S9TA 2E0SA 3MUQA 2F6GA 1OMPA 4H67A 1JNFA 1YPNA 1B7ZA 1ZBMA 2I58A 3PGFA 1MM6A 2ZYNA 4F3GA 1LCFA 1NNTA 3S9EA 1LLSA 1OLCA 2YJPA 2W7YA 2I3VA 2ONRA 2OJTA 2QSXA 5L8DA 3B6TA 1WODA 5I59A 2XHDA 2ZYKA 3K6VA 3OEKA 3A09A 2ZXTA 4YKKA 4O3BA 1R6ZA 2Y7RA 2P1SA 4I1DA 4KCCA 3RT8A 4XKNA 3O29A 3E3KA 1LB9A 3MC2A 1MG1A 1Z7NE 1TFDA 2UVHA 3C4MA 4IO3A 1NFTA 1EZOA 5CMKA 1MY0A 3PMWA 4OTEA 4KFQA 4JXIA 3RQTA 5KCJA 1MQJA 1D3KA 4RJZA 2GHAA 1N7XA 2E1SA 3C35A 4POWA 4H65A 1DPEA 5B70A 3ILTB 4ESXA 1ZU0A 1FQCA 4GQOA 3RUMA 4EQ7A 3BFUA 1A99A 5DVJA 1YTVA 1PC3A 4PFWA 4ZDMA 3N26A 3PPQA 1MY2A 3CIJA 5ICTA 4TLLB 3FUZA 4X9TA 2VP1A 3T93B 1LBBA 3W9VA 3Q26A 1MY4A 3IX1A 3C33A 1B5JA 1N3XA 3G3IA 5AE4A 4K3FA 2H98A 2Z22A 4NF5B 1H44A 4H5FA 3FATA 5CC2A 4KI0E 2ZNUA 4AQ4A 2HAVA 2ANJA 1UQWA 1IZ1A 3MWBA 1BKAA 2I0CA 5CMCA 4ZEBA 3IJXB 1UIVA 4LVQA 4NWCA 3TFLA 3Q27A 3MVYA 3I6VA 5DEXB 1DTGA 1MM7A 1SDXA 1B05A 4RNSA 3UGWA 1VR5A 1QW0A 4M1VA 2XX7A 3QYTA 2REGA 4TLMB 4L17A 4LZ7A 3CFZA 3RNNA 3OELA 5I2KA 3ZKLA 2F34A 3TCHA 3IOUA 5KDTA 2V3UA 5FHOA 4KYSA 4ZEKA 4U21A 1HSEA 4YICA 3TQLA 1IXCA 3ODBA 2XXHA 1LAGE 4YKJA 4U4XA 1N0TA 4X1DA 4QFKA 4H5GA 4TQUQ 3L6GA 1VE4A 3OEMA 3VVFA 3W15C 3IB0A 3RTWB 3E4RA 3S2VA 4RXLA 5H8QB 1M5BA 3D4CA 4NTLA 4IGTA 4C1UA 4R2BA 3FZVA 3R26A 1URGA 3SEWA 1BLFA 4F3BA 1I6QA 1B9JA 2PX1A 3G3KA 3ONMA 1Y1ZA 5I57B 3PPRA 3S9NC 5CMMA 1B5HA 4DXUA 1B1XA 1PB9A 1LAXA 4WEPA 1N7WA 2DWAA 1Y20A 2F5XA 1T0KA 4ZEFA 3DP8A 5ICQA 1ANFA 3IB2A 4FORA 4DCYA 1IQ7A 3PUVE 1B3GA 3Q25A 4BDMA 1MPBA 3MP1A 4E0WA 1MXXA 3CR9A 4POXA 1S50A 3UA8A 2DXYA 1PBPA 3PD9A 1A7LA 4ZE8A 5DVIA 4ELOA 3KEIA 1VFEA 4OZ9A 2DE2A 1II5A 3VVEA 3KN3A 5M2VA 2VHAA 4FJPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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