2X7QA

The conserved candida albicans ca3427 gene product defines a new family of proteins exhibiting the generic periplasmic binding protein structural fold
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
306
structure length
306
Chain Sequence
LPTLKVAYIPEHFSTPLFFAQQQGYYKAHDLSIEFVKVPEGSGRLINLLNSNEVDIAIGLTEAFIADIAKGNENIHVLDTYVKSPLLWAVSTGSNRDDVTDAKQLKRIGVSRIGSGSYVMSFVLAHQLGVPSFDQFQVLSNFKNLRDSVNLKDGVEGSDAFMWEYFTSKKYYDNHEIKQIDQIYTPWSSWVVATSSDSLQAKSDVIKNFIDAVNQGIQYYNEHVDEAIEYISSNLDYSAEDAKEWTKTVEFNSRIGKTPLDWDTIVVKTKDTLKLAGVLAESDDVILKRLNSNVKKTNLQLDGDLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Conserved Candida Albicans Ca3427 Gene Product Defines a New Family of Proteins Exhibiting the Generic Periplasmic Binding Protein Structural Fold
pubmed doi rcsb
molecule tags Unknown function
source organism Candida albicans
molecule keywords POSSIBLE THIAMINE BIOSYNTHESIS ENZYME
total genus 104
structure length 306
sequence length 306
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-03-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF09084 NMT1 NMT1/THI5 like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2x7qA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2x7qA01
4KYSA 3OO9A 3T9HB 1B3HA 1Y3NA 2ONSA 4GQOA 3OO7A 3RTWB 2RC8A 3L6GA 4R2FA 3OELA 2OZZA 1FQEA 2XX8A 5L9SA 1IZ1A 1XS5A 5FTIA 3FJGA 4G68C 2YPNA 3TFLA 4GF8A 1AMFA 1EU8A 4N07A 1B7UA 3GLBA 5K2YA 2HZKA 4DXUA 3FIRA 4KCCA 4FATA 4RXLA 2UVHA 3H3GA 3HSTA 3MW0A 3TTKA 1NNTA 2Z22A 2DVCA 3C33A 3KZGA 1ANFA 2I49A 2O69A 1MM6A 3S9LC 4WXJA 5JK4A 3CSBA 4F19A 4YKJA 1MY1A 1N3XA 1SD3A 2D3IA 4NWCA 5L9MA 1AOVA 3VLVA 4EQBA 5KDTB 5CC2A 3DP6A 4Z0IA 4RK2A 2F34A 1FTLA 2F36A 5ELVA 3TMGA 2Q9TA 1LLSA 1MDQA 3USDA 2XX7A 4ZEKA 2ONKE 4NTLA 2GHBA 2AYSA 4BDNA 5I2NB 3TAJA 1JW1A 1P99A 2XXHA 3O66A 1H76A 4WEDA 5FHMA 1M5FA 1ZU0A 5KCJB 3TODA 1MH4A 3A3UA 3RQTA 3C31A 3Q29A 5H8FA 4ELPA 2ZNUA 1MQHA 1FTJA 4ONYA 3H6VA 4YU0A 4JWOA 2H4IA 3CR9A 2QS1A 4R6HA 1MXXA 2O51A 3PPQA 1IXIA 1MXWA 4HW8A 1FTOA 2D21A 1MRPA 3N5LA 2A5SA 4PQJA 3VVDA 3LC8A 3VV5A 3U92A 4NF8A 1MG1A 4P0IA 2PVUA 2HZLA 4G68B 1Y1MA 1MM7A 4KYDA 4GIZA 1A8FA 2PBWA 1J1NA 2CMOA 5I59A 1XT8A 3H6WA 2O68A 2A5TA 2Q88A 4GWOA 3RT8A 1LFGA 4RPNA 4DCYA 1TFDA 4IO5A 3E4RA 3TZAA 3OO6A 4H1XA 3BFUA 4GVOA 3F11A 1R9QA 4QHQA 3UGWA 3LSXA 2YLNA 5AA4B 4IGRA 4EDPA 4X48A 1USYH 1XVXA 3UORA 4LP2B 3FXQA 3K1MA 4OERA 1POY1 4GXSB 2XXVA 1Y3PA 4NF6A 3TDJA 1SW5A 4ESWA 4FEDA 5H8NA 2P0SA 5DVJA 1SBPA 4ZS9A 3SEWA 1JW4A 4P0GA 2DYXA 4ELRA 4WEPA 4RNSA 5I56B 5CMMA 1JNFA 4U22A 1OLCA 4FEBA 2REJA 4C1TA 2RC9A 2O1MA 2XXWA 4DDDA 3KG2A 4XKRA 4QRZA 4F2OA 4YMAA 3G3GA 2QMWA 4AB5A 1UTBA 1H45A 5ITOA 5I2KA 4OETA 3P7IA 2HQ0A 3V83A 1KWHA 1URDA 1ZMGA 3LSFB 2DWIA 3O9PA 4H65A 3EPEA 2B3FA 4GL0A 3QK6A 4X1DA 1QW0A 3CG3A 1H3DA 3IX1A 3OENA 4NWDA 5DVIA 5FTHA 4G2ZA 5H8HB 4HTGA 4YB6A 4IO3A 1IIWA 1HSEA 1AH5A 4Q5TA 4IO4A 1B46A 2DVZA 3O28A 2DWHA 1MY0A 1ZBMA 4XKQA 1Y9UA 5JEIA 1O7TA 3L6HA 2G93A 1RYXA 1SQYA 3RN8A 3IORA 3E13X 3M3LA 3HV1A 3PMWA 4R72A 3SEVA 5TPAB 1USYE 2OCUA 5H8SA 5CM6A 3M3FA 2FA7A 3FVGA 4ZDMA 2W7YA 2PT2A 1ZKBA 4NF5B 5I58A 3K00A 2F7BA 4HCWA 3DLNA 4R6YA 3V89B 5FHOA 5J1DA 2I0BA 3SDFA 2Y7PA 2Z8DA 3K4UA 1B5HA 3H6TA 1BLFA 1ELJA 2R71A 2HFBA 4XKPA 3KN8A 3ZS6A 5L8DA 4TLMB 1MPBA 3K0VA 4MFIA 1Q1KA 1PB8A 4DLDA 3PD8A 3I5OA 4OEUA 3QSLA 1L5TA 2QSXA 2IA4A 5TP9B 3A3CA 2Y7KA 1MY4A 5AA2D 3C34A 3C32A 1M5EA 4GLIA 3RUMA 1UQWA 3KGCA 4NF4A 3GZGA 3MVZA 1B1XA 4JWYA 5DEXA 2REGA 2QS2A 1B58A 2VP1A 1VFDA 1ZJLA 4JWXA 3N26A 4H67A 1NH8A 4OESA 2NWJA 2X26A 3JYRA 2VHAA 1EZ9A 3BFTA 4I1DA 3K02A 5CMCA 3FVKA 2GHAA 4EUOA 1M5BA 4NMYA 4OYVA 4MLQA 3PUXE 3W15C 3T93B 1SW4A 4U21A 2QJEA 2Z8FA 3MZBA 4EQ9A 1Z7ME 2Z8EA 1PB7A 1LSTA 3LBSA 1OMPA 4MF3A 3LR1A 3R26A 3TEPA 5HM4B 4M1VA 2V84A 1B3GA 1FW0A 1FTMA 4OFOA 4YMBA 1QVSA 1XOCA 4JSOA 1B32A 4THIA 3FXRA 3U8QA 4YB5A 1NKXA 2RKMA 3DM0A 2PT1A 1H43A 2QMXA 4RJZA 4WKMA 3U1OA 4R75A 1UTHB 4H8IA 4OMBA 4LZ7A 4ZZAA 1MQDA 4EQ7A 2UYFA 1MQGA 4QF9A 5A5XA 2DP8A 1DMBA 2Y7IA 5HBCA 1XHYA 1OVBA 4QFOA 1Z7NE 3K6XA 1GVCA 1PBPA 5BUUA 3S4UA 1I69A 2F6PA 4OQOA 2Y7WA 1B2HA 5H8QB 4ZEIA 1SVXB 1SI0A 2NUVA 3CG1A 1A40A 1B5IA 4U4SA 2KLFA 2I58A 3FUZA 3HCQA 3VE1B 4F2QA 1A8EA 4R9GA 4IY6A 5CRYA 1MXUA 5JTYA 5ISUA 3O6GA 1I6QA 2XXIA 1Y4TA 1AIVA 4C1UA 4EXKA 4GD5A 2XX9A 3THIA 2NXOA 4OENA 2OK2A 1ZIUA 2AL5A 1BKAA 4F1YA 5AA2A 3IJXB 4ECFA 4PFTA 2RCBA 1VFEA 4H8JA 4IO6A 3G3JA 2Y84A 1QULA 1LAXA 1M5DA 1MQJA 3TCFA 3O2AA 2O84X 4OTEA 3DELB 4G77A 1Y3QA 3V5AA 1S50A 3A09A 1CB6A 4AQ4A 5DYHA 1DPPA 2F78A 1MH3A 2Q2CA 2ZNSA 1DTZA 4F39A 2ESNA 4H0WA 1VSOA 3T22A 3SEUA 2RC7A 3K6WA 2H99A 3I6VA 3MVYA 2HEUA 4KD5A 3CFLA 3T96B 4F1VA 1A54A 3PUVE 3IOUA 5TU0A 3OO8A 4AB6A 1Q35A 2UYEA 2XXYA 4U1ZA 3ODBA 2QRYA 1M5CA 1LGBC 1SYHA 2E0SA 2H5YA 3G3KA 3Q27A 4YAHX 2NVUB 1LCFA 4YB7A 2DWAA 1D4NA 3WAEA 2AL4A 4RA1A 1YAEA 1B7ZA 1JVXA 2RINA 3O6HA 4JB7A 3ZSFA 2HXWA 3SERA 3RGYA 4RYAA 1AL3A 4PFWA 2XHDA 4R74A 3MBPA 1POTA 1DSNA 1NNKA 3U94A 1JW5A 2DE2A 2H9BA 5F7VA 4DIGA 1OQHA 3PGFA 4NF5A 1NL5A 3OMBA 1LFHA 1ATGA 3CIJA 3O29A 3VFJA 5M2VA 4R9FA 2O7IA 2I48A 4E0XA 1MS7A 2QL3A 3TYHA 1CE2A 3MZ1A 1P1NA 3QIMA 2DXRA 4KCDA 1O64A 4FORA 1ZTYA 4JSDA 2ABHA 4ZEFA 1PB9A 2UVGA 3N6UA 1NMUA 4EF2A 4LVQA 2F6GA 2F35A 5TP9A 2XXPA 4UA8A 4MLVA 5I57A 3HPIA 2O7UA 4JBZA 3JV9A 5H8FB 3K01A 2B65A 4NEDA 5AA1A 3PMVA 1ZLQA 3C36A 3G3FA 3T9UA 4YICA 3ILUB 1FTKA 1URSA 4ND9A 4OFJA 3KSJA 3PUZE 1SW1A 1YPNA 2PYYA 1MQIA 3H03A 1GGGA 3QXMA 4Q8RA 4KYEA 2Y7RA 4LATA 3FATA 4YKPA 3PUWE 1II5A 3U72A 2R9JA 3KJ7A 1N3WA 3CVGA 1N76A 3HHFA 5I59B 3TKDA 2XXRA 1GTKA 3IOVA 2XD2A 2DOJA 3S2VA 2A5TB 3TTMA 2V3UA 2V3TA 1BIYA 4FE8A 4RPOA 3UA8A 2NOOA 3T9XB 1SI1A 4DZ1A 5IAIA 1MY3A 3ZKKA 4LONB 5ICQA 1NNPA 2RF1A 3K1PA 4FIMA 2AIXA 1B1HA 3EHTA 2FYIA 3EF7A 3TQWA 3Q28A 4L17A 4GRKA 2OLBA 1QUJA 3N94A 3EHSA 4NF6B 2YJPA 2VOZA 4H5GA 1LBCA 2DSFA 5H8NB 4G8NA 1JQFA 5CBRA 4O3CA 4GFRA 1B6HA 3H7MA 4DXCA 2I4BA 1B3EA 3CRBA 3FJ7A 1US4A 3MAMA 3FVNA 1B3LA 1N0TA 4BDOA 4Q0CA 1LB8A 4F3SA 4KQPA 4R2BA 3TPAA 1TWYA 3PPRA 1XVYA 2OBGA 5CBSA 1XC1A 1TXFA 1UTBB 3FD3A 3FZVA 5I2KB 2Q2AA 4PP0A 1JEUA 4ZEBA 1JETA 3H06B 4F3GA 2VD3A 1IITA 3MC2A 1D9VA 4QSCA 4OHNA 4OEVA 2I0CA 1P1WA 1Y20A 3B6WA 3TTNA 4OFLA 4R73A 5KDTA 1DOTA 1BTJA 4QFNA 5HPQA 3KJTA 3MUQA 1UIVA 5LOMA 3TELA 4U1OA 3W9VA 3D4GA 3UP9A 3FVOA 3G3HA 4IB2A 3G7WA 2ZMBA 3QAXA 3I3VA 3RLFE 2H98A 2DS9A 5L9OA 2M8CA 2F5XA 5EYFA 5I2NA 3UN6A 1D9YA 1URGA 3H4ZA 2Q8JA 4YKKA 5I58B 1H44A 1MPCA 5KCJA 3V8XB 1S9TA 3IB2A 1EZPA 1P1OA 3B6TA 2FNCA 3DP8A 2XXTA 5EHMA 2WKYA 1RKMA 4EXLA 1B4HA 3CSGA 4JDFA 4PFUA 4XXUA 3M3KA 4TQUQ 2I3VA 1A99A 2VD2A 4QFPA 3Q26A 1B52A 1VR5A 1HSLA 5BWJA 3PV0E 4LZ5A 3TUSA 3IO6A 4BDQA 4LA9A 1HSJA 1QUKA 4OWDA 4G68A 2QS4A 1NFTA 5DT6A 4ZE9A 4KHZE 4XKNA 4O3AA 3KN3A 3ZKLA 4QSEA 1R9LA 5CMKA 3IB0A 1FCKA 1N04A 3PU5A 3BKIB 2HAUA 3GBBA 4OZ9A 3HN0A 5AA3A 3FJMA 4NF4B 4KFQA 2Z23A 4BDLA 1EZOA 3IOTA 3W9WA 5DEXB 5FHNA 4IO7A 2G29A 3SKPA 3VXCA 2PMSA 2DXYA 1OVTA 2R6GE 3CI8A 4Z7EA 4XIGQ 3OOAA 3TTLA 4ELOA 3RY3A 5AA4A 2GH9A 2O1LA 1GR2A 4N6PA 1B0HA 1PEBA 1B5JA 3RT6B 4LQ5A 3K1NA 4EF1A 3M8UA 4OVJA 1PDAA 1D3KA 1MXYA 4FECA 4PE5B 2DQVA 1B7HA 1NNFA 3OXNA 2HAVA 4KPTA 4OXVA 2ZYNA 1O63A 3IB1A 1TFAA 3B6QA 1FQCA 5I56A 4LZ8A 4GXAA 2UXAA 4E0WA 3FXUA 4FJPA 3T9VA 4GOTA 3RPWA 1F9BA 3OEMA 4XTCQ 4MBPA 1B51A 4P11A 1MDP1 3MVXA 4BDRA 4ISUA 1A7LA 4ZEDA 3FGSA 4X9TA 4X1BA 1I6BA 4G4PA 3KFMA 5K2XA 3UIFA 1N84A 3IO4A 5F1QA 4POWA 3VXBA 2V25A 3PMXA 1IXHA 1N7WA 2XXXA 1S7YA 3SEXA 4RK9A 3MZ9A 3C35A 5A5XB 3JZJA 1PBQA 2B3BA 5H8HA 1IXGA 1US5A 1FQBA 2ZYMA 2CZLA 3WAFA 2I3WA 3B7DA 4O3BA 1PC3A 2OWSA 1NH7A 3O6IA 3GBAA 4LUBA 3PUYE 1T0KA 1Y1ZA 3U93A 3TCHA 1B05A 3OSQA 1DPEA 5TPAA 2X7QA 4UACA 3C4MA 4H6DA 2O6AA 3IK6B 2ONRA 2RCAA 3D4CA 3E9XA 5JTYB 4POXA 2F7CA 2QS3A 1WODA 1QKAA 1B3FA 4F18A 2XD3A 3MPLA 1OLAA 4KR5A 3C9HA 1LAFE 4IY5A 2DWJA 1SDXA 2HCAA 5AA2B 1OIBA 3RNNA 1DTGA 3ILTB 4PETA 1GV8A 4U23A 1TT1A 2ALUA 3QUJA 1R1NA 1QKBA 4ZZEA 3MP8A 4YZZA 3PPOA 1YCJA 3KEIA 2I6EA 3K2DA 2ZNTA 2X7PA 3VLWA 1QUIA 1P1UA 1JVYA 3LSWA 3SETA 1MY2A 3Q25A 3MP1A 3PD9A 2GFEA 1A55A 3ECRA 4F31B 4JXIA 1RYOA 4I62A 4F3BA 5IKBA 1IUDA 3PPPA 3TCGA 4ELQA 2ZYOA 3KOSA 3E3KA 3K6VA 1B40A 3MPKA 4F3PA 4F22A 3IL1B 4RY1A 1Y4CA 4QFLA 2V3QA 4H5FA 1FQAA 4NF8B 3VLUA 3S9NC 1B0LA 5B70A 4TOZA 5CMBA 4F1UA 1FQFA 1R6ZA 1LAGE 2P2AA 3KOTA 5I84A 5KZTA 2LAOA 3SEYA 1IXCA 3KBRA 2OWTA 4LQ2A 5B7DA 2I4CA 3VVEA 3MVWA 3R7XA 4HCYA 3OD7A 1YTVA 3KN7A 4GL8A 3AXFA 3OEKA 2V93A 3TQLA 3ONMA 4F29A 4DE8A 3TTRA 3UK4A 1BP5A 2GRVA 4Q30B 4BLAA 1EH3A 1SYIA 1N7XA 2PX1A 4HS7A 3PPNA 3QUFA 1MXZA 5CI5A 5DTBA 4G8HA 2F8DA 2ZXTA 3MWBA 2DE4A 2D5WA 1P1QA 3OSRA 1OQGA 3DP4A 2IEEA 1WVJA 1SW2A 1UTHA 3IAZA 2DE3A 1B9JA 4N13A 1VE4A 5AE4A 5ITPA 3MP6A 4K3FA 2E1SA 4I8CA 2UVIA 1LAHE 4ESXA 3GXAA 2VGQA 5DVFA 1IEJA 4MH5A 4G8MA 3MQ9A 5H8QA 3VVFA 4FAJA 3CFZA 5I57B 4U4XA 2H25A 3N6TA 4ZE8A 4YKIA 1MPDA 4R6KA 2BJJX 2F97A 2QPQA 3O97A 5EHSA 1LBBA 3HHGA 4M4GA 1LFIA 4QFKA 4DXBA 1IQ7A 4I9DA 4QSDA 2THIA 3QYTA 4NE4A 3IJOB 4TLLB 4U2RA 3FASA 4ZECA 4PFYA 4KI0E 4DCXA 2F7AA 3FV1A 2XXQA 3IOWA 3FV2A 4C0RA 1LB9A 4IO2A 2Q89A 3HO7A 1LCTA 3LUYA 2ZYKA 2P1SA 3R6UA 1JEVA 2XXUA 1FQDA 3KSXA 2ANJA 2OJTA 3LSLA 3S9EA 1UIUA 1WDNA 3G3IA 3EN3A 3SESA 3CFXA 3K6UA 3IR1A 3EQ1A 2UVJA 3S9MC 1B4ZA 3T66A 3MJNA 1MXVA 3EHUA 3H6UA 4BDMA 3RTFB 3VDFA 1QJMA 5ICTA 4IGTA 1I6AA 3BBRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HHMA 4KYSA 2CZHA 4N6KA 3OO9A 3T9HB 1B3HA 1Y3NA 2ONSA 4GQOA 3OO7A 3RTWB 2RC8A 3L6GA 4R2FA 3OELA 2OZZA 2ZZWA 4LN5A 1FQEA 2XX8A 2F3DA 5L9SA 1IZ1A 1XS5A 4N8GA 1NV3A 3BIHA 3IFAA 5FTIA 4MEVA 3FJGA 4G68C 2YPNA 4P9KA 3TFLA 2Y5LA 4GF8A 1AMFA 2DDKA 1EU8A 4N07A 1FTAA 1B7UA 3GLBA 5K2YA 2HZKA 4DXUA 3FIRA 4KCCA 4P47A 4FATA 4RXLA 2UVHA 3H3GA 3HSTA 3MW0A 3TTKA 1NNTA 2WBDA 2Z22A 2DVCA 3C33A 3KZGA 2QFLA 1ANFA 2I49A 2O69A 1MM6A 3S9LC 3IFCA 4WXJA 5JK4A 4GBWA 2QVUA 3CSBA 4F19A 4YKJA 1MY1A 2MKZA 1N3XA 4XFEA 1SD3A 2D3IA 4NWCA 5L9MA 1AOVA 3VLVA 4EQBA 5KDTB 1RDZA 5CC2A 3DP6A 4Z0IA 4RK2A 2ZZVA 2F34A 1FTLA 2F36A 5ELVA 3TMGA 1LBWA 2Q9TA 1LLSA 1MDQA 3USDA 2XX7A 4P56A 2WYKA 4ZEKA 2ONKE 4NTLA 2GHBA 2AYSA 4BDNA 1FBHA 5I2NB 2BJIA 3TAJA 1JW1A 1P99A 2XXHA 3O66A 1H76A 4WEDA 1NI9A 5FHMA 1M5FA 1ZU0A 5KCJB 3TODA 1MH4A 3A3UA 3RQTA 3ISPA 3C31A 3Q29A 5H8FA 4ELPA 4XEQA 2ZNUA 1MQHA 1FTJA 4ONYA 3H6VA 4YU0A 4JWOA 5A5LA 2H4IA 3CR9A 2QS1A 4PGNA 4PAIA 4R6HA 1MXXA 1FRPA 2O51A 3PPQA 1LBVA 1IXIA 1MXWA 4HW8A 1FTOA 4HE1A 5ET5A 2D21A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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