4EQ9A

1.4 angstrom crystal structure of abc transporter glutathione-binding protein gsht from streptococcus pneumoniae strain canada mdr_19a in complex with glutathione
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
240
structure length
240
Chain Sequence
KKEIIVATNGSPRPFIYEENGELTGYEIEVVRAIFKDSDKYDVKFEKTEWSGVFAGLDADRYNMAVNNLSYTKERAEKYLYAAPIAQNPNVLVVKKDDSSIKSLDDIGGKSTEVVQATTSAKQLEAYNAEHTDNPTILNYTKADFQQIMVRLSDGQFDYKIFDKIGVETVIKNQGLDNLKVIELPSDQQPYVYPLLAQGQDELKSFVDKRIKELYKDGTLEKLSKQFFGDTYLPAEADIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title 1.4 Angstrom Crystal Structure of Putative ABC Transporter Substrate-Binding Protein from Streptococcus pneumoniae strain Canada MDR_19A in Complex with Glutathione.
rcsb
molecule keywords ABC transporter substrate-binding protein-amino acid transpo
molecule tags Transport protein
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 84
structure length 240
sequence length 240
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4eq9A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4eq9A02
4N13A 2I49A 1BP5A 1LAGE 4R73A 4U22A 1XVYA 3K0VA 2XXVA 4Q0CA 3IOTA 1P1UA 2IA4A 4BDNA 5I2NA 3M3FA 1D4NA 4PP0A 4ND9A 1FCKA 5DEXB 2XXTA 1ZLQA 5AA4B 1PC3A 1USYE 1GVCA 3T9UA 2OK2A 4XTCQ 1N76A 1MQHA 3FJMA 4MFIA 5DYHA 4HCWA 4MLQA 2UYEA 4R9GA 3G3GA 4X1BA 3U93A 2NWJA 1OIBA 1JNFA 4GF8A 4MLVA 3SETA 1YPNA 4RNSA 4F22A 5L9OA 3G3IA 5CMCA 4LONB 4JWXA 1FTOA 1LB9A 5CMKA 4EUOA 2XX7A 2AL4A 2UXAA 5I56B 1NH8A 2DVCA 2PX1A 3HHGA 1LBCA 4OERA 3ILTB 3C34A 3HHFA 4G8MA 1M5EA 2VOZA 3KEIA 2QL3A 1R6ZA 4EF1A 2AYSA 4PFWA 3O66A 3U8QA 4PETA 2H9BA 1SW5A 4KFQA 3OELA 5AE4A 3KOSA 1A54A 4N07A 1EU8A 5JK4A 2I48A 1SI0A 2RC8A 3MVZA 3VFJA 3T96B 2XXIA 1LAHE 4OFOA 5M2VA 1Y3NA 3MAMA 2B65A 1DSNA 1NH7A 2NUVA 1WVJA 3KJTA 4ONYA 2AL5A 2QJEA 2XXRA 4Q5TA 3N5LA 4LUBA 2F7BA 2F36A 2R71A 2Q8JA 1B4ZA 3VXBA 1MY0A 1MH4A 1EZPA 3EF7A 3W9VA 2F6PA 5IAIA 1NMUA 3RT8A 3SERA 2GRVA 3VXCA 4F1YA 3FIRA 1JEUA 3PUVE 1TXFA 4DLDA 4E0XA 2QMWA 4F29A 3T22A 1S50A 4LA9A 1UTBB 5B7DA 1B7UA 4GIZA 3S9EA 5CMBA 1B7HA 4HTGA 1MY4A 3TTRA 2Z8EA 4LZ7A 1LCFA 3QK6A 1RYXA 2Y7PA 4GL0A 4JSDA 4FECA 2DYXA 3C9HA 2ONRA 1POTA 3O28A 2OLBA 5TP9A 3K02A 4ECFA 1FQEA 4ESXA 1I6AA 3PPNA 1AH5A 1JVYA 4ZEDA 1ZMGA 2ZNUA 5KCJB 2DXRA 2DWIA 1MQDA 2QS4A 1IITA 2WKYA 5ICTA 2B3BA 2X26A 3UN6A 2R6GE 3TYHA 1B0HA 1H45A 2F7AA 5TPAB 1KWHA 1URDA 2VHAA 1FQAA 4QSEA 3MUQA 1JETA 3N26A 4XKQA 4NE4A 3O9PA 4RPNA 2Y84A 2NOOA 5ISUA 3V8XB 1EH3A 2Q2AA 3KN8A 3JZJA 2CMOA 2Z8FA 4ZEKA 3GBAA 2F7CA 3Q25A 5JTYA 1QUJA 1IEJA 3PPOA 1JQFA 1F9BA 3VDFA 1CB6A 3TTLA 3THIA 2XXYA 5I2KA 4U2RA 5H8NA 3CVGA 1PDAA 1VR5A 3GZGA 3HPIA 2ZYOA 1LFHA 4N6PA 3PPQA 4R6YA 5H8FB 1DOTA 4YMAA 5L9MA 4UACA 2XD3A 4ELQA 2VD2A 3L6HA 1HSLA 4YB6A 4QF9A 3OOAA 3ZSFA 2OZZA 4LQ5A 4F2OA 4JB7A 4F3PA 4ISUA 1MDP1 1ATGA 1WDNA 3AXFA 1H76A 1LLSA 1J1NA 2I6EA 3WAFA 3FATA 3T9HB 3O29A 2G93A 3R7XA 3USDA 1LFGA 5DVJA 3MP6A 3SEWA 4F3BA 3H6TA 3PPPA 4ZDMA 1B52A 2O6AA 1B0LA 4WXJA 4G8HA 1LBBA 5AA2B 4QFPA 5ITOA 4NF5A 1US5A 2PMSA 3T9VA 2DWJA 3KG2A 1OQHA 3VVDA 3C4MA 4JWOA 1LFIA 3HSTA 3ONMA 4TLMB 4H67A 3OO7A 3KN7A 2XXWA 2HQ0A 4RYAA 4NMYA 2A5TB 2QSXA 2XD2A 5HBCA 1A55A 2F8DA 4U21A 2QMXA 3WAEA 3FVNA 1FW0A 4WEDA 4U23A 4EDPA 4NF4A 4PQJA 4OXVA 4XKNA 3VV5A 2Q88A 4PFYA 5AA1A 1DPPA 4JXIA 2PYYA 3TQLA 1ZJLA 2HAVA 4H0WA 5HPQA 3TTMA 4THIA 1NNPA 3IORA 1MG1A 4OEUA 1FTLA 2F6GA 5CM6A 3E9XA 1ZKBA 1LGBC 3TMGA 1QUKA 4O3BA 3U92A 4OZ9A 1B4HA 5I84A 1JEVA 3VE1B 1T0KA 4QFOA 4XKRA 1O63A 3MZ1A 1M5BA 4FATA 1O64A 3W15C 2FNCA 1RYOA 4O3CA 5K2XA 1HSEA 4YKPA 2I3WA 1MY2A 1GTKA 2DVZA 3OEMA 2PVUA 3QXMA 3BBRA 4BDOA 1IXCA 4KPTA 3PPRA 1NNFA 3PUZE 5CC2A 4XXUA 2E1SA 4WKMA 1SD3A 3H06B 2X7PA 3IK6B 3MPKA 4ZEFA 3PGFA 2RCAA 4JBZA 1CE2A 3ECRA 3CFZA 3CR9A 5FTIA 3VLUA 1MXWA 1B3GA 5FHOA 2GH9A 3FVOA 1B3FA 4NF6A 1B40A 3IB0A 2I58A 3UIFA 3ZS6A 4IO5A 3K6WA 2RCBA 4F2QA 1NKXA 4FEBA 5ELVA 4YKIA 3IOWA 3BFUA 4PFUA 5BWJA 5ITPA 3H6UA 2P1SA 3MVXA 4FAJA 4F18A 1MS7A 4UA8A 1GGGA 2DE2A 3G7WA 3TTKA 4I9DA 1NNTA 3RY3A 3UORA 4E0WA 5TU0A 1B51A 2Q2CA 4F1UA 5EYFA 4P0IA 4HW8A 1FQDA 4Z0IA 1B3HA 5I2NB 1QW0A 2HCAA 3OEKA 4LP2B 2O84X 2M8CA 2DS9A 4AB5A 4QSDA 3MQ9A 4TOZA 4POWA 4AB6A 1H44A 1VSOA 4FE8A 4GFRA 3EPEA 5LOMA 2YJPA 2LAOA 3O2AA 4ESWA 4GRKA 2A5SA 4OETA 1M5CA 4ZZEA 5JEIA 1MXZA 1SDXA 5A5XA 4H8IA 1FQFA 4IO6A 2VP1A 1B5IA 1URSA 2Y7IA 3FASA 3KSJA 4YMBA 1N7XA 1PBQA 2H98A 4G68A 4X9TA 1QKBA 1BKAA 3MVWA 3K6VA 3GXAA 4RA1A 5J1DA 3MP1A 4K3FA 2HFBA 3HCQA 3N6TA 3ODBA 1B1HA 4C1TA 1P1NA 4H8JA 2GFEA 4GLIA 3K6XA 3F11A 1A7LA 5FHNA 3IO4A 3SEXA 1QJMA 2XX8A 3E3KA 1QULA 4WEPA 1R1NA 2X7QA 3M8UA 1SW4A 3PU5A 3CSBA 1JVXA 3M3KA 4M1VA 3TELA 3B6QA 2REJA 3E13X 3QAXA 4BDLA 5HM4B 4YKJA 4OVJA 4OQOA 4FIMA 3TZAA 4ELOA 2F34A 3MWBA 2R9JA 5KZTA 2ONKE 2V93A 1IXGA 4IGRA 5L8DA 1AOVA 3V5AA 1UQWA 3T93B 3K1PA 4KD5A 4IGTA 4GWOA 4LQ2A 3T9XB 1OLAA 1O7TA 1D9YA 4H5FA 2I0BA 2VGQA 1A8FA 3QYTA 1GV8A 3FJ7A 4KYDA 4BDRA 1UTHA 4ELRA 1I6QA 3O6HA 4IO2A 1D9VA 3N6UA 4IB2A 2Z8DA 3K1MA 1B7ZA 3TFLA 4G68C 4TLLB 3BKIB 1ELJA 1MQIA 4MBPA 4ZE9A 3I5OA 4DIGA 3EQ1A 2F78A 4I62A 3QUFA 3P7IA 5I57A 5TP9B 1OMPA 3Q27A 1ZBMA 4I1DA 4TQUQ 3O97A 1UTHB 1P99A 1Z7NE 3RT6B 4FEDA 2XXXA 1SQYA 2UVGA 3MJNA 3DP8A 3TPAA 3KOTA 1GR2A 4YAHX 2XXPA 5I59A 1MDQA 2D5WA 2V3QA 2QPQA 4L17A 4OFLA 3C32A 3LC8A 2F35A 2HAUA 2DWAA 3IAZA 3OO9A 4HS7A 4OMBA 3LR1A 4C1UA 3FXUA 2B3FA 2F5XA 4YKKA 5EHMA 3HV1A 3M3LA 3OSQA 3RLFE 2OWSA 5JTYB 2UVHA 3S4UA 3LSLA 1PBPA 2P2AA 3UGWA 1Y1ZA 3PMVA 4I8CA 4G77A 5I2KB 2YLNA 5H8NB 1FQBA 4R2FA 3G3HA 4F31B 4C0RA 3S9MC 1EZOA 4OTEA 3U1OA 4QFLA 5K2YA 3RPWA 2RC9A 4R6KA 4U4XA 1JW5A 1R9LA 1ZIUA 1QVSA 2ESNA 3FJGA 1RKMA 3IOVA 1ZTYA 3PV0E 5F7VA 1DTZA 5B70A 3FXRA 3TUSA 4RPOA 1EZ9A 3MVYA 1OQGA 3MW0A 4ELPA 1II5A 5L9SA 3KJ7A 1MXUA 3H6VA 1POY1 1AMFA 4R74A 3TAJA 3CFLA 4QFKA 2QS3A 3VVFA 3TTNA 3OSRA 1Y20A 3CSGA 3RTWB 5H8HA 4NF5B 1B58A 1DTGA 4YB7A 5CRYA 1MPDA 3S9NC 2D3IA 3IOUA 1MM6A 5CMMA 1B5HA 2E0SA 1B3LA 1XT8A 4LATA 4RXLA 4NF8A 3SEUA 1B32A 4F39A 3RTFB 1FTKA 3PD8A 4KR5A 1I6BA 1DPEA 1R9QA 4IO3A 3LSFB 3HO7A 3RN8A 3H03A 2XXQA 2PBWA 4NF4B 2RINA 5BUUA 1Y9UA 4KCDA 3FV2A 3TCHA 2O51A 4ZZAA 5EHSA 3ZKKA 2P0SA 3D4GA 4GQOA 1Z7ME 5H8HB 3MZ9A 3R6UA 1URGA 4LVQA 3ILUB 2Q89A 4QHQA 3FGSA 5FTHA 1PEBA 3FXQA 4R72A 3IJOB 1MY3A 3IJXB 4NF8B 1MQGA 3C33A 3MBPA 4FJPA 4H65A 5DEXA 4Q8RA 3CFXA 4G8NA 3KBRA 5AA4A 1IIWA 1MPBA 3QUJA 2REGA 4EQBA 2CZLA 2DOJA 3Q26A 5KDTA 1TFAA 1MXVA 2H99A 5IKBA 1AL3A 4F3GA 3GBBA 1S9TA 2YPNA 3IR1A 1TFDA 1LAFE 3FVGA 3V89B 1H43A 1M5DA 2V3UA 2O7UA 1IQ7A 2GHBA 4EF2A 2XXUA 1NL5A 4LZ8A 2DXYA 4EXKA 4BDMA 3U94A 3OO8A 1NNKA 1B3EA 5I56A 4ZEBA 4DXCA 2DE3A 4NEDA 4GXSB 1L5TA 2KLFA 1IZ1A 4ZECA 4ZS9A 4NWCA 3G3JA 4JWYA 3SEVA 1P1OA 5KDTB 2ZMBA 1PB8A 2XXHA 1HSJA 3PMWA 3OD7A 3EHSA 4OWDA 3SEYA 3TEPA 4NF6B 4XIGQ 4Q30B 1H3DA 3IB1A 3EHTA 5I58A 3IX1A 3IO6A 3L6GA 1JW1A 5DVFA 5H8SA 3DP6A 2H5YA 1OVTA 4GL8A 2GHAA 3BFTA 2ABHA 3C31A 3I6VA 4ZEIA 1N84A 2H25A 3IB2A 4EQ9A 4DZ1A 4DXUA 4Z7EA 3LSXA 3O6GA 2BJJX 4F3SA 2I4CA 4G2ZA 1D3KA 4MF3A 1LSTA 1MH3A 1FTJA 1YCJA 4IO7A 5CBRA 4OEVA 3MZBA 1B2HA 3OENA 2DWHA 5DVIA 1A40A 3R26A 4PE5B 3OXNA 5I58B 1B6HA 3V83A 2VD3A 2RF1A 3H6WA 1MXYA 4EQ7A 1US4A 4F1VA 4KHZE 4OHNA 5FHMA 3ZKLA 1YTVA 2RKMA 4ZE8A 4OYVA 1UTBA 1Q1KA 2UVIA 2OBGA 3KFMA 4GD5A 3G3KA 3EN3A 3KZGA 3CI8A 4R2BA 3Q29A 4OESA 3B6WA 4QRZA 2O7IA 2DP8A 5A5XB 1IUDA 4R9FA 3CRBA 2FYIA 2QS2A 1MRPA 3OMBA 1LCTA 3HN0A 3TCGA 3Q28A 4YU0A 3RUMA 3TKDA 3O6IA 4G68B 2O69A 4IO4A 1N3WA 4KYSA 1A8EA 5KCJA 4GXAA 5DT6A 5CBSA 4G4PA 2O1LA 2O1MA 3S9LC 1N0TA 4H1XA 3S2VA 2V84A 4DCXA 1N7WA 2ONSA 3JYRA 3RGYA 5TPAA 2QS1A 1Y4CA 1XOCA 4JDFA 2ZXTA 2PT2A 3FV1A 2DE4A 1N3XA 4P0GA 3JV9A 3N94A 3TDJA 4O3AA 2H4IA 4KI0E 3K2DA 3FVKA 2THIA 2PT1A 1MXXA 4QFNA 3OO6A 1BIYA 2DQVA 3CIJA 1SW1A 2Y7KA 4RK9A 2QRYA 1ANFA 4RY1A 2UVJA 4RJZA 4DDDA 1SYIA 2XHDA 4NWDA 5H8FA 1I69A 2ZYKA 1A99A 2OCUA 2ZNTA 3C36A 4X1DA 3UK4A 3QSLA 3DM0A 3A3UA 1B46A 1QUIA 3GLBA 3D4CA 3PUYE 1IXHA 3EHUA 4GOTA 3LBSA 4PFTA 2F97A 2Z22A 2I0CA 3VLVA 4YB5A 5AA2D 2V25A 2ZYMA 2ALUA 1UIVA 4DCYA 1XVXA 4R75A 2XX9A 1NFTA 1MM7A 1DMBA 2RC7A 1Y1MA 3I3VA 3FZVA 3U72A 2I4BA 1PB9A 1LB8A 5F1QA 3TCFA 3DP4A 4YZZA 2D21A 4H6DA 4IY5A 1OLCA 2HZKA 3LUYA 5AA2A 3IL1B 3G3FA 3MC2A 5I57B 3FUZA 3CG3A 3T66A 5DTBA 4OFJA 2NVUB 3DLNA 4BDQA 2IEEA 5ICQA 4EXLA 2Q9TA 2A5TA 3H3GA 4GVOA 2OWTA 2DSFA 3PMXA 5H8QA 4U4SA 1TWYA 5I59B 1SI1A 1SYHA 1SW2A 1LAXA 2I3VA 1QKAA 4FORA 1B1XA 3K6UA 4JSOA 3KSXA 1SVXB 3MP8A 2HZLA 2OJTA 2ZYNA 1OVBA 4LZ5A 1AIVA 3B7DA 1S7YA 2Y7WA 1XHYA 3K1NA 3KN3A 3SESA 3RNNA 2ZNSA 1VFEA 3PD9A 1VE4A 1FTMA 4OENA 3UA8A 4XKPA 2V3TA 4HCYA 3W9WA 1FQCA 1Y4TA 2Y7RA 5H8QB 3H4ZA 4P11A 3CG1A 3K4UA 2O68A 3MPLA 4IY6A 3KGCA 4NTLA 2G29A 4QSCA 3K01A 3B6TA 2Z23A 4U1OA 1ZU0A 3SDFA 3FD3A 1BTJA 1B9JA 1Y3PA 4DE8A 4KCCA 1XC1A 3RQTA 2FA7A 3QIMA 1UIUA 2ANJA 2NXOA 3A09A 4R6HA 1WODA 3A3CA 1IXIA 1MQJA 4KQPA 4U1ZA 4RK2A 2HXWA 2HEUA 1XS5A 4AQ4A 4M4GA 4H5GA 1USYH 3UP9A 1B05A 1SBPA 1JW4A 1VFDA 4F19A 4YICA 1TT1A 2UYFA 3K00A 1Y3QA 1MY1A 1BLFA 4MH5A 1P1QA 1N04A 3H7MA 3DELB 1M5FA 3PUWE 4POXA 1P1WA 1B5JA 2AIXA 2W7YA 4BLAA 4DXBA 3VVEA 1MPCA 1PB7A 5CI5A 1Q35A 3SKPA 5AA3A 3VLWA 3PUXE 3E4RA 4KYEA 3TODA 1YAEA 3LSWA 3C35A 4X48A 3TQWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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