1GR2A

Structure of a glutamate receptor ligand binding core (glur2) complexed with kainate
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
262
structure length
250
Chain Sequence
b'KTVVVTTILESPYVMMKKMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords PROTEIN (GLUTAMATE RECEPTOR 2)
publication title Structure of a glutamate-receptor ligand-binding core in complex with kainate.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 80
structure length 250
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-09-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1gr2A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1gr2A01
1MY1A 4U2RA 2F7CA 3ZSFA 5ITOA 1M5EA 4OMBA 1EZ9A 4AB5A 4FJPA 4YB6A 3G3GA 3H6TA 2HCAA 3TKDA 5HPQA 2IEEA 4POWA 1SD3A 2G93A 4PP0A 1MQDA 5F7VA 1YAEA 3V5AA 2OZZA 5J1DA 5KZTA 3QSLA 4QSDA 4ZEDA 3BFTA 3KN8A 3UGWA 1URSA 4EQ9A 2DQVA 3IR1A 1LAHE 3HHFA 4O3CA 2XXVA 4IO4A 3LSXA 2F6PA 3S4UA 2QMWA 1B3EA 3M3KA 4QF9A 3UK4A 1UQWA 3RQTA 1EZPA 1Y1ZA 1VFEA 3L6HA 1MH4A 3E4RA 3MQ9A 4G68B 2Y7KA 4HTGA 1SW2A 1NFTA 4GFRA 3SDFA 1QVSA 4FECA 5AA3A 1S9TA 3PPOA 3H06B 5HBCA 1OVTA 2O7UA 2ZYKA 5DTBA 1UTHA 3RGYA 3I3VA 1PBQA 4WXJA 5HM4B 3S9EA 1XVYA 2ONRA 4ELQA 1NNKA 3CR9A 2OWSA 2Q88A 1AH5A 2ZYOA 3K6UA 4LZ5A 2B3BA 4JBZA 3OO8A 2XXYA 1SBPA 4NF8A 1GV8A 2Y84A 5IAIA 2DYXA 2I49A 3DLNA 3C34A 5A5XA 1FQAA 4IGTA 3OXNA 1B7ZA 4KHZE 4EDPA 4C1UA 1XS5A 1ANFA 1FQBA 4G68C 5FTHA 1DTZA 3FJMA 4KYSA 4IO2A 1DPPA 3TQWA 5ITPA 4OERA 2D3IA 3G3HA 1ATGA 2ANJA 2H25A 4KD5A 4MBPA 1B05A 3PPQA 3TTLA 4KFQA 2H99A 4LA9A 2G29A 3H7MA 4F1YA 2THIA 4XXUA 1POTA 4FORA 2PX1A 2VHAA 5ISUA 2P2AA 4YAHX 2RC7A 4OXVA 4R9FA 3T96B 3MWBA 1B40A 3LUYA 3B7DA 3RY3A 4H5GA 3ONMA 3SEUA 3I6VA 4O3AA 4X9TA 4I1DA 5I58A 1NNPA 1MQGA 3H6VA 4F3GA 3B6WA 5BUUA 1LAXA 5CM6A 2HFBA 2QS2A 1MXXA 2XX9A 4QRZA 2Q89A 3VVEA 1PEBA 3KSXA 4F3BA 4RXLA 5I58B 2PMSA 4HS7A 1OQGA 3O2AA 4F2OA 3N94A 3PUYE 2GHBA 1A8FA 1WDNA 1HSLA 3PMXA 3GZGA 4G77A 2XX7A 2O68A 3S9MC 3K02A 4JWXA 3TODA 5K2XA 3FIRA 1RYXA 2DXRA 2I3WA 3QAXA 4FAJA 1Y1MA 1ZTYA 1URGA 1Y20A 1B46A 3L6GA 1YPNA 1KWHA 1B5HA 3IOWA 3FJGA 4RJZA 1SW1A 2W7YA 3EHUA 1Q35A 3IB2A 5EHMA 2QL3A 3QK6A 4K3FA 1A7LA 4LONB 1NL5A 2WKYA 3MJNA 4RYAA 4EQBA 5AA4B 3IJOB 2UVIA 4H5FA 1RKMA 4Q0CA 3PMWA 5H8HA 2UVGA 1CB6A 4NWCA 3LR1A 1S7YA 1M5DA 4XKNA 2I0BA 4BDQA 5B7DA 3U94A 1XC1A 1FQCA 4ZZEA 1Y3NA 4OFLA 1M5BA 4LVQA 4NF4A 3H3GA 1MY4A 2O1MA 4Q5TA 3CRBA 1MPBA 4YMAA 1B3GA 1TXFA 4BLAA 1RYOA 4KYDA 1J1NA 1O64A 3B6TA 1NNTA 2PYYA 4EUOA 2DVZA 2PT1A 4F1UA 3EHTA 3RNNA 4OVJA 4R6HA 1JW4A 3KOSA 2AIXA 3P7IA 3ODBA 4XKRA 3H6WA 1B51A 1UTBA 5EHSA 4DCXA 3T9VA 3SEVA 3T93B 4GLIA 1PB7A 3MP8A 4U23A 2ZMBA 2DSFA 1LCTA 1UTBB 3UORA 5CC2A 1MDP1 3FUZA 1LFHA 3QUFA 2ALUA 4NEDA 4KYEA 5CI5A 1N0TA 3TCGA 3FGSA 2F7BA 3MAMA 2H98A 4Q8RA 1N3XA 1B5JA 2A5TA 4ND9A 3PGFA 2OLBA 1BTJA 4HCYA 3WAFA 2OCUA 1IXGA 1BP5A 1SW5A 1US5A 3G3KA 4ESWA 3LSFB 1D4NA 4PFWA 1B0LA 4G2ZA 3OD7A 3SEWA 3MC2A 2V3QA 2X7PA 3SEXA 4ONYA 3VLUA 5DEXA 4FATA 2Q8JA 2QJEA 2GHAA 4NMYA 1OLCA 1DSNA 3CFLA 1HSJA 3PD8A 3GLBA 5FTIA 4RPNA 4G8HA 4ELRA 4KI0E 1BKAA 1Z7ME 4OESA 4ZS9A 1LB8A 3U8QA 1XHYA 4ZE8A 1ZKBA 5L9OA 2B3FA 5EYFA 4JB7A 4NF5B 2I3VA 3IO4A 5JK4A 3PV0E 2Y7WA 3B6QA 1MM7A 4F18A 2VD2A 4XKPA 3PUVE 1JEUA 4UA8A 3S2VA 5CMBA 5KCJB 4IO7A 4ESXA 3W15C 4PQJA 1USYE 1B1HA 3FVKA 4XTCQ 4F19A 4DXUA 1GGGA 4QFNA 3ILUB 3MBPA 4GIZA 5ELVA 1Q1KA 3C4MA 2DE4A 3A3CA 4IY6A 3VVFA 3IAZA 1H3DA 5JTYB 3ZKLA 3K6VA 5I56A 3AXFA 3O28A 2Q2AA 1II5A 4R74A 4QFOA 3FV2A 3Q25A 3OO9A 3TYHA 4EQ7A 1A54A 1S50A 4G68A 3OOAA 3OSRA 2QSXA 5I56B 3FVNA 2FNCA 1XVXA 1FTKA 1ZBMA 4RNSA 1B6HA 5LOMA 4YB5A 1I6QA 4EXKA 4C0RA 4C1TA 1MXWA 5FHOA 1JW5A 3CFZA 4F3PA 5ICTA 2I48A 3JZJA 2HQ0A 3EF7A 3CG3A 1JETA 2F5XA 3FXQA 3T9XB 3S9NC 2RCBA 1BLFA 3U93A 3G3IA 2P0SA 3DP6A 2O51A 4H0WA 2DE3A 4DCYA 1Y3QA 3U1OA 3SESA 3VXCA 4PFUA 2YJPA 4ZEBA 1P1UA 3M8UA 4RA1A 1P1WA 4NF6A 5DT6A 5I2KB 5H8SA 3K6WA 4LP2B 1D9YA 5BWJA 3H03A 2RC9A 4PE5B 4NF6B 3PUXE 1H43A 3Q27A 3MZ1A 3K1MA 1VE4A 4H1XA 1OMPA 2GH9A 4DZ1A 4YKIA 1UIUA 2F35A 1IIWA 3SERA 1B2HA 4JSDA 4QSEA 1N7XA 2QS3A 3T9HB 4R2BA 2P1SA 4YU0A 4PFYA 2HAVA 3N6UA 1A99A 1PB8A 2ZNSA 3KOTA 3MZBA 3HN0A 4POXA 4IB2A 1H44A 1MPCA 2CMOA 4DLDA 3WAEA 3HSTA 1TFDA 5I2NA 1M5CA 4H65A 5IKBA 2V3UA 3N5LA 1LBBA 5DYHA 2DWAA 1D3KA 3MVYA 1NH7A 1ZMGA 3TFLA 1FTMA 3OELA 2ZNTA 2KLFA 5I2NB 3KSJA 1OIBA 5AA2B 2R9JA 3DP8A 3T9UA 2DWHA 4F1VA 3JV9A 3FXRA 3FATA 2UVHA 4FE8A 2OWTA 3TZAA 1LB9A 1DMBA 1POY1 3H4ZA 4GL8A 4ZE9A 3GBBA 1VFDA 3PPNA 4LQ2A 4X1DA 2DWJA 4EF2A 3W9VA 5H8FB 5DVJA 3UN6A 3TAJA 3A3UA 3S9LC 2XXIA 3MUQA 3TDJA 1B9JA 1B32A 3O6GA 1BIYA 4YICA 5TP9B 1YCJA 2QS4A 3CSBA 1Y9UA 3KN7A 1Y4CA 2QS1A 3IORA 5CMKA 3V8XB 4FIMA 1TFAA 3OENA 1EZOA 4MLQA 4U1OA 4L17A 4JXIA 4BDLA 5AA4A 4UACA 3IK6B 3A09A 2I0CA 4KQPA 3KZGA 4OFJA 2O1LA 5TPAB 1MQHA 1QUIA 1JW1A 2GFEA 2ZYNA 4RK9A 2R6GE 2AL5A 3MPKA 1H76A 2AL4A 1TWYA 4JDFA 4R73A 1MRPA 2HZKA 1LCFA 2YPNA 2UYEA 4R75A 1MY3A 3TTRA 2DP8A 4R72A 4G8MA 3BFUA 2B65A 1QULA 3DELB 1LAGE 4YKKA 4XIGQ 3IX1A 4TOZA 5AA2D 1B3HA 2DVCA 4THIA 4HW8A 3CIJA 4LATA 1B4ZA 5CRYA 5F1QA 1XT8A 3PD9A 3ZS6A 4I9DA 4F29A 2X26A 3Q28A 4EXLA 2XXHA 4P11A 1B52A 3PUWE 3R6UA 4RK2A 4BDRA 3BKIB 3IO6A 1Y4TA 2I58A 4LZ8A 2Z8FA 4G4PA 4LZ7A 2Z8DA 1SYHA 3T66A 3OEMA 1MPDA 1WODA 4PFTA 2UXAA 3CI8A 3Q29A 4E0XA 2A5SA 1R9QA 5CBSA 2UVJA 3FASA 4F2QA 4ZEKA 5I84A 3C31A 4GQOA 1L5TA 3MVWA 2NVUB 4ELPA 1LSTA 3O6IA 3VV5A 1F9BA 1LAFE 1MQIA 3RT8A 4X48A 4QFKA 3KG2A 3K01A 1PBPA 3VE1B 3VDFA 1FTJA 4P0GA 2XXPA 5DVIA 2RINA 4BDMA 2DS9A 4MLVA 4KCDA 1P1QA 5H8NA 5L8DA 3SETA 2H5YA 2XX8A 4GF8A 2HZLA 1JVXA 4GXSB 2HEUA 4WEPA 3MVZA 3QYTA 4H8IA 2E1SA 2V25A 5H8NB 1JVYA 4OETA 3CVGA 1NKXA 2Z8EA 4H67A 2AYSA 2F8DA 4NF5A 1T0KA 3RUMA 4LQ5A 1OQHA 2H9BA 4F22A 4M4GA 5JEIA 1MDQA 2Q9TA 1B1XA 1P1NA 3EHSA 3Q26A 3TQLA 2IA4A 4KPTA 2I4CA 4YKPA 5KDTA 5KCJA 3UP9A 3IB1A 1MXUA 2O7IA 3F11A 2XXTA 4OWDA 4DXBA 3U72A 4P0IA 3TPAA 1FW0A 1MH3A 1ZIUA 3MZ9A 2QPQA 4U4XA 1DOTA 4OEUA 5KDTB 1FQDA 3M3FA 2Y7RA 3CSGA 3G3FA 2LAOA 4TQUQ 1LFGA 1B5IA 3FZVA 4FEDA 5JTYA 1ZJLA 3KEIA 3V89B 2XD3A 3G7WA 1IITA 2VGQA 3E9XA 1NH8A 4PETA 1FTOA 4OQOA 2OK2A 1SW4A 4TLMB 2PT2A 2I4BA 1SQYA 3TCFA 1JQFA 2VOZA 1P1OA 3TUSA 4DIGA 1TT1A 3KGCA 1XOCA 1I69A 3MVXA 3HHGA 1ZU0A 2ABHA 5I59A 2DXYA 1N3WA 1AL3A 3N26A 4BDOA 4N13A 3IOVA 1B3LA 3IOUA 3TMGA 2PVUA 4WEDA 3VVDA 4IO3A 2XXRA 4QFLA 3CG1A 4U21A 3D4GA 5I59B 3FD3A 3ZKKA 5B70A 2NXOA 3DM0A 3K0VA 4OHNA 4ELOA 4OEVA 1N7WA 1AOVA 2VP1A 1QUJA 3D4CA 1US4A 4F3SA 1ZLQA 3TTNA 3ECRA 2D5WA 1R1NA 1MQJA 1EU8A 1DTGA 2V84A 3PU5A 4ZEFA 3IL1B 3EQ1A 4I62A 1IEJA 5I2KA 2REGA 4R9GA 5CBRA 3K2DA 5AE4A 3UA8A 3SKPA 2RCAA 1MXYA 4YMBA 4N07A 4KCCA 4AQ4A 2Y7PA 1LBCA 2CZLA 4M1VA 2NUVA 3O9PA 2NWJA 4NWDA 4O3BA 4MFIA 4ZDMA 1UTHB 1ELJA 3OSQA 2UYFA 4KR5A 3KJTA 3TTMA 3FV1A 1QUKA 3JYRA 3IB0A 1LLSA 3RT6B 4DE8A 2XXUA 3BBRA 1O7TA 4MH5A 3O66A 4Q30B 3CFXA 1I6BA 1MY2A 4NF8B 1AIVA 1IQ7A 1VR5A 3QXMA 3I5OA 1P99A 3FXUA 4U22A 2DOJA 5A5XB 3VLWA 5AA1A 1MM6A 3PUZE 3UIFA 1FTLA 3PPRA 4G8NA 3VFJA 3N6TA 1H45A 3VXBA 1NMUA 4IO5A 2OBGA 1QJMA 4E0WA 3W9WA 3C32A 1MXVA 5AA2A 1B4HA 2D21A 3R26A 3GBAA 3OMBA 1IXCA 3DP4A 4IO6A 4GXAA 3IOTA 1B3FA 1WVJA 3V83A 3O29A 4ISUA 1SDXA 3TTKA 4R2FA 3IJXB 2E0SA 4OYVA 5H8FA 1QKAA 1PB9A 4YKJA 1FQEA 1PDAA 1LFIA 4DXCA 2F97A 2ZXTA 1VSOA 1YTVA 4TLLB 3USDA 1R9LA 5TP9A 4N6PA 1D9VA 4GOTA 4HCWA 1B0HA 2M8CA 4FEBA 1N76A 2Z22A 1GR2A 4U1ZA 1URDA 4X1BA 3FVGA 2O6AA 4LUBA 1IUDA 3K1PA 4GVOA 3FJ7A 5ICQA 2X7QA 1MS7A 1O63A 3ILTB 2XXQA 5TPAA 2NOOA 2DWIA 2HXWA 2ZNUA 3C9HA 4XKQA 4IY5A 2H4IA 3KBRA 5H8QA 3RTWB 4OENA 1IXIA 1CE2A 4RY1A 4R6YA 1USYH 5K2YA 2HAUA 4WKMA 3THIA 3RLFE 1N04A 5FHNA 3HCQA 5H8QB 4GL0A 1FCKA 1OVBA 1SYIA 3K00A 2F6GA 4GRKA 1DPEA 4OZ9A 4JWYA 3QUJA 4IGRA 3E13X 1B7UA 1B58A 3RTFB 3QIMA 1MG1A 2VD3A 2V3TA 1NNFA 2YLNA 3MP1A 3MP6A 4I8CA 2ESNA 4H6DA 3LSWA 1GVCA 4OFOA 1EH3A 4OTEA 1I6AA 3TEPA 3HV1A 2DE2A 1LGBC 2Z23A 1IXHA 4AB6A 5CMCA 5H8HB 4JWOA 4Z0IA 3OO7A 1HSEA 2Y7IA 4GD5A 2RF1A 3VLVA 3EN3A 3C35A 2F34A 3SEYA 1MXZA 2QRYA 2XXXA 4DDDA 5M2VA 3O97A 4NF4B 2QMXA 2XXWA 4YZZA 2GRVA 3TELA 5I57A 3R7XA 2OJTA 1Y3PA 3MW0A 2BJJX 4R6KA 3LSLA 2ONSA 1FQFA 4QFPA 4YB7A 2XD2A 1A40A 3TCHA 4QHQA 5TU0A 5I57B 3PMVA 2ZYMA 1GTKA 1UIVA 2XHDA 3KFMA 4ZEIA 2FA7A 3M3LA 3MPLA 2O69A 3HPIA 4EF1A 4F31B 3RN8A 4ZZAA 1A55A 3OEKA 4NE4A 1QKBA 3OO6A 4F39A 2F7AA 3E3KA 4MF3A 2Q2CA 1R6ZA 4GWOA 4BDNA 3K6XA 3K4UA 2FYIA 3H6UA 2REJA 4QSCA 5L9MA 2ONKE 1N84A 2A5TB 3O6HA 1PC3A 3HO7A 2I6EA 5DVFA 4ZECA 3K1NA 2F36A 5FHMA 1Z7NE 1B7HA 2PBWA 1IZ1A 1JEVA 2V93A 4U4SA 4JSOA 1JNFA 2RKMA 1OLAA 1A8EA 4ECFA 3GXAA 3C33A 3T22A 3C36A 1M5FA 3FVOA 1QW0A 2RC8A 5DEXB 2R71A 3PPPA 3EPEA 3U92A 2F78A 1MY0A 1SI0A 3KN3A 4H8JA 2O84X 5L9SA 3G3JA 5CMMA 4NTLA 1SVXB 4RPOA 1SI1A 3LBSA 3RPWA 4Z7EA 3KJ7A 1AMFA 3LC8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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