1GR2A

Structure of a glutamate receptor ligand binding core (glur2) complexed with kainate
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
262
structure length
250
Chain Sequence
b'KTVVVTTILESPYVMMKKMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure of a glutamate-receptor ligand-binding core in complex with kainate.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (GLUTAMATE RECEPTOR 2)
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 80
structure length 250
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-09-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1gr2A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1gr2A01
3OELA 3MP6A 4G68B 1IXIA 1LB9A 2XX9A 3H6TA 4RA1A 3IK6B 2I0CA 2ZYMA 1N3XA 3TTKA 3GZGA 2HCAA 3EHSA 4GL8A 3KN8A 3G7WA 1I6AA 2DE3A 2RC7A 1MM7A 3TPAA 3PD8A 3SDFA 1NMUA 1SD3A 4QFNA 5CRYA 4BLAA 3OMBA 2XXVA 4C1UA 5H8NA 2D5WA 2PT2A 2PT1A 3EHUA 1LBBA 2RF1A 4IGTA 4QFOA 4WEDA 3TTNA 4PP0A 3MPLA 3VV5A 2Q2AA 2P1SA 1OLAA 1B4ZA 1BP5A 5H8QB 5DVJA 2O69A 3CSBA 1ELJA 1Q35A 3BFUA 2CZLA 3HN0A 2FNCA 4IO5A 4JXIA 3RT6B 1FQCA 5IAIA 5HM4B 4RPNA 3THIA 4OETA 1MQHA 5AA2B 4EQ7A 1OQGA 3FASA 3VLWA 5KCJA 4ZEBA 3LSLA 2W7YA 2F7CA 1B3LA 4E0WA 2DWIA 4ZE9A 3RLFE 3H06B 4YMBA 1FQFA 4GVOA 2NOOA 4RJZA 4ELQA 5EHMA 4NF8A 2NXOA 2WKYA 4H65A 3Q27A 1B2HA 4ZEFA 1B7HA 3LR1A 3JV9A 2R9JA 2XXHA 3UP9A 4UA8A 3PMXA 1EZ9A 1QUJA 1ZU0A 1USYH 2DWHA 4Z7EA 3HHFA 4YKJA 1XC1A 4OFLA 1ZLQA 3OEKA 3KOTA 2XXXA 3DM0A 1BKAA 3PD9A 1B7UA 1LGBC 1Y3PA 2OWSA 3LBSA 2A5TA 1FTKA 1UIUA 4YICA 1Y4CA 3K2DA 1MY1A 4PFWA 3MUQA 3RUMA 1FW0A 4JDFA 3C31A 1P1UA 4NE4A 1URSA 2HZKA 1MXUA 5CBRA 5TU0A 1SI0A 2RC9A 3RN8A 4F3GA 1XVXA 2I4CA 1NNTA 4WXJA 1RKMA 3DP8A 2FA7A 1IZ1A 5H8QA 5IKBA 2VD3A 1J1NA 5L8DA 5F1QA 1A40A 3Q28A 4ZEDA 2AL4A 5I2KA 4X1BA 4EF2A 1MH3A 1UTHA 3LSFB 2ZYNA 4F18A 4KPTA 1M5FA 3TEPA 5EHSA 3PPQA 4YMAA 2QS4A 1SQYA 3PMVA 3KSXA 2G93A 3WAEA 4G8HA 1MXWA 5I59A 1B3GA 1CB6A 5I58A 2REGA 2PX1A 4XKNA 4TOZA 1LAXA 1PB8A 5I56A 5B7DA 3QUJA 3R6UA 2F36A 3M3KA 1VR5A 2BJJX 4U21A 4KYSA 4ESXA 2VGQA 3FXRA 2H25A 4DXUA 3IOTA 3OO8A 1MDP1 5KDTA 2F35A 3CFZA 3Q25A 3UN6A 3UGWA 4DCXA 3I5OA 3SEVA 1A7LA 1LLSA 3TCGA 3PUXE 4KR5A 5H8HA 3C34A 2Q9TA 4N07A 1OVTA 4U4SA 1P99A 1DSNA 3O6HA 3TCHA 2XX8A 2P0SA 3TYHA 1MRPA 5DT6A 3FXUA 5JTYB 4JB7A 3UORA 3VFJA 3IAZA 4MLVA 4NMYA 5TP9B 3IR1A 3FV2A 2B3FA 2OJTA 2RKMA 4U2RA 1B58A 2Q89A 3S9EA 1SW2A 2XX7A 4R6KA 3OOAA 1CE2A 3V5AA 2V3UA 1OMPA 1NH8A 3C36A 3S9LC 1A54A 3V83A 2F6GA 4XKQA 3CRBA 1M5EA 1QULA 4PFUA 4OEVA 1I69A 4PETA 5AA4B 3RPWA 4P11A 4GD5A 2NUVA 3DLNA 4I1DA 1B6HA 4IY5A 3PUYE 2ZYKA 5EYFA 3KEIA 3VVEA 4U1ZA 5L9OA 2NVUB 1S7YA 2QSXA 3ILTB 1GVCA 4OERA 2IEEA 1AH5A 3V89B 4KYEA 1IIWA 1LFIA 1JW4A 5DVIA 1D4NA 3K1PA 3MVXA 3SEXA 2XXRA 2XXTA 2HZLA 2V93A 4QF9A 4QSCA 3H6UA 2XXPA 3BBRA 4R75A 2O1LA 4H5GA 3TCFA 4IY6A 2GRVA 3TQLA 2A5SA 3IORA 3QUFA 1QUIA 3KOSA 2GHAA 2O6AA 5H8NB 1MQJA 1IEJA 4X1DA 3O6IA 1M5BA 2ONSA 3L6HA 3IJXB 4FEDA 1LB8A 3OSRA 3TKDA 4YAHX 1A8EA 1OIBA 4LZ8A 1Q1KA 5CM6A 3PGFA 3G3KA 4F19A 1SBPA 1AL3A 3ZSFA 5BUUA 5KCJB 3H03A 3BKIB 3K6VA 3ONMA 4LQ5A 1AMFA 5AA4A 2QS2A 4FECA 2DS9A 4ELRA 2ZYOA 3S9NC 4JWXA 4O3CA 1MY2A 1SW5A 1JEUA 3GBBA 2QS1A 2XHDA 3MC2A 1HSLA 1N3WA 1VE4A 4GOTA 2LAOA 1MQIA 2DQVA 1NL5A 4LZ7A 1R9QA 4LATA 5DEXA 3O97A 3A3UA 4P0GA 4I8CA 2A5TB 2D3IA 1JEVA 3SERA 2PYYA 3OENA 1P1QA 2V84A 1LAFE 3N6UA 4K3FA 2ZMBA 4GLIA 4Q0CA 5CMCA 3VVFA 1D9YA 4POWA 4THIA 4G77A 2Z23A 4YKPA 3USDA 2ZNTA 1Y20A 5ICQA 3I3VA 1VFDA 1AIVA 4RXLA 1UQWA 2B3BA 5I2KB 3ZKLA 2DP8A 1OLCA 1UTHB 1NNKA 4MF3A 2ESNA 3U72A 1IXHA 2GHBA 2D21A 4QFKA 2Y7WA 3ECRA 1N7XA 3S2VA 3FJGA 3MP8A 4BDMA 3PU5A 5I59B 5I58B 3N26A 4OVJA 1GV8A 4R9FA 2F8DA 2HAVA 5I56B 1IITA 4GIZA 1F9BA 3ZKKA 3BFTA 2V3TA 5KZTA 2O1MA 4GXAA 1JETA 3H7MA 3IO6A 1Y1ZA 1O7TA 4F31B 5ISUA 2XXIA 4DXCA 3A09A 3VE1B 1SYIA 2XD2A 5KDTB 1ZIUA 2H99A 5FTIA 4ZS9A 4GF8A 3F11A 2G29A 4GQOA 3M3FA 3V8XB 4RNSA 5H8HB 4IGRA 5BWJA 1N76A 3FGSA 5H8FA 2X7PA 3O66A 3CIJA 1DTGA 3TZAA 3W15C 1S9TA 4L17A 2FYIA 1QW0A 5L9SA 3KBRA 1DTZA 2AL5A 1LCTA 1URGA 3K02A 3QK6A 4MFIA 4PFYA 4EF1A 1PBPA 1GTKA 2F7BA 4QSDA 3D4GA 1Z7NE 1TT1A 4F1UA 1JW1A 3MBPA 4F3SA 2F7AA 5F7VA 1NKXA 3MAMA 3DP6A 1A99A 1B51A 3RY3A 1B46A 1B5JA 4LZ5A 3QSLA 1WVJA 1MS7A 4JBZA 1MXVA 3M8UA 4NF6A 3T9VA 4R9GA 4PE5B 4BDQA 4JSOA 4U23A 4ELOA 4OTEA 3LSXA 2UYFA 3E9XA 3TDJA 1XS5A 3W9VA 4HTGA 4JWOA 1MPBA 1EZOA 1FCKA 2THIA 2KLFA 1FQEA 3O9PA 4GWOA 2Y7RA 3CFLA 3PMWA 1TXFA 4N13A 1B5IA 5CMMA 4NF4A 1NFTA 3TTLA 1H45A 1WDNA 4Q30B 3OXNA 2I48A 3T66A 3MZBA 4JSDA 2Z8DA 4O3BA 2ZNUA 1RYOA 3SETA 3G3GA 4O3AA 3G3JA 2B65A 2DE2A 1I6BA 4H8IA 2E0SA 5CI5A 3DELB 2R71A 3FVKA 3TELA 1WODA 2VHAA 3OEMA 3LC8A 1B3FA 2X7QA 2Y7KA 1N7WA 5I84A 4OQOA 3TAJA 4F1YA 4POXA 3G3HA 1NNFA 2F6PA 4WEPA 3EF7A 3TQWA 2XD3A 3IL1B 2ANJA 1LAGE 1T0KA 2Z8EA 1JW5A 5K2XA 4YB5A 1OVBA 2DWAA 3SEYA 2OLBA 3KFMA 3ZS6A 5DYHA 2HFBA 3MZ1A 2Y7IA 4KD5A 3IB2A 4F1VA 4GXSB 1FTLA 5L9MA 1P1NA 4FAJA 5TPAA 2H5YA 2YPNA 2ZNSA 3QIMA 3D4CA 2F97A 3PPRA 1MPDA 2PVUA 1B1XA 3CR9A 4OESA 4R6HA 3K4UA 3S9MC 4EXKA 1R9LA 5JEIA 3CFXA 4DDDA 3HSTA 1LAHE 1MH4A 3GXAA 3RTWB 4GRKA 4LP2B 2ABHA 3U93A 2OK2A 1ZBMA 3GBAA 1H43A 3C32A 5DTBA 2F5XA 4G4PA 3T9XB 4G8MA 3RTFB 4M1VA 4FJPA 1N0TA 1O63A 2GFEA 4IO3A 4OHNA 3IX1A 3HPIA 3IB1A 5DEXB 1R1NA 1EZPA 1KWHA 3CSGA 2CMOA 4ZECA 4KCCA 2UVIA 3UK4A 2QMXA 1MY4A 3OO6A 4F22A 2XXQA 4WKMA 4NEDA 1LCFA 5LOMA 1DMBA 3U94A 4LQ2A 1P1WA 3E3KA 3MPKA 1B3EA 4OYVA 4PQJA 4U22A 4FORA 5HBCA 3U92A 2O7UA 1B52A 1A8FA 3KJ7A 1US5A 1Y9UA 2DSFA 1URDA 3KZGA 3OD7A 5AA2D 3H3GA 3A3CA 3FJ7A 1XHYA 4DLDA 3IJOB 1D3KA 4Z0IA 3T9UA 2VD2A 4QHQA 1VFEA 4XTCQ 4C0RA 3KGCA 4XKRA 1RYXA 3SESA 4H1XA 4F3PA 1QUKA 1QKAA 4NF5A 1D9VA 5I57B 2DVZA 3MQ9A 4AQ4A 2I6EA 1YTVA 1Y3QA 3O29A 2I0BA 1QVSA 1H76A 4KQPA 3OO9A 2VP1A 2DE4A 3PPPA 4XXUA 3TTMA 1DOTA 5CC2A 3PUZE 4YKIA 3LUYA 4F2QA 1YCJA 4FE8A 3PUWE 3K0VA 4IO7A 2DVCA 1IUDA 3R26A 3FATA 2Z22A 4U4XA 1Y1MA 2RCAA 1FTOA 2OWTA 1TFAA 4ND9A 3PPOA 2RCBA 4X48A 4LVQA 3L6GA 1XOCA 3MVZA 3VXCA 4OEUA 1O64A 2Z8FA 4RPOA 3O6GA 1B3HA 4KYDA 2AIXA 4OXVA 3CG3A 5H8FB 3B6WA 2YLNA 2UVGA 3SEWA 3MWBA 4YB7A 3Q26A 2F78A 2HAUA 4U1OA 2Q88A 1II5A 3FXQA 2UXAA 4R73A 4TLLB 4MH5A 4QSEA 2QRYA 2PBWA 3MVYA 3WAFA 3UA8A 3KG2A 4IB2A 5FHNA 2XXYA 3I6VA 3B6TA 4EQ9A 3FUZA 1MXYA 2Q8JA 5A5XA 4ISUA 4GL0A 4YB6A 4F39A 2YJPA 1B4HA 3H4ZA 1I6QA 3TUSA 2H98A 3SKPA 3TMGA 1B9JA 2RC8A 1VSOA 5I57A 2HXWA 5I2NB 1ZJLA 1LSTA 4F3BA 4NF6B 3LSWA 2E1SA 4EDPA 2I3WA 4NWDA 2DYXA 1HSEA 3VLUA 4ELPA 4XKPA 1S50A 5FTHA 3VLVA 5J1DA 2Y84A 4OENA 4IO2A 2UYEA 3E4RA 3VVDA 3HO7A 4M4GA 4E0XA 2UVHA 3T93B 3JYRA 1PBQA 1MG1A 4R2FA 3FV1A 2O51A 3CG1A 2IA4A 3N6TA 4ZEKA 4EUOA 4F2OA 1OQHA 1BIYA 4NTLA 1A55A 3IOUA 3T22A 2VOZA 4NF4B 1M5CA 2UVJA 3FZVA 5FHOA 4ZEIA 1UTBB 3RNNA 2H4IA 3KN7A 4KFQA 3H6VA 3MP1A 4G68A 3FD3A 1FTJA 1US4A 1SVXB 1GR2A 3G3FA 1SYHA 3U8QA 1B0LA 3M3LA 1N84A 2HQ0A 4C1TA 3MW0A 4YZZA 4ONYA 4MLQA 2M8CA 1B0HA 1FQDA 1MPCA 4RK2A 5AA1A 5JK4A 2DOJA 3T9HB 1MQDA 3K6UA 5M2VA 4OFJA 1B40A 4DXBA 3HCQA 4ZZEA 1TFDA 1PB7A 1HSJA 4OWDA 1H44A 3K01A 1AOVA 4KI0E 4XIGQ 5I2NA 3DP4A 3KSJA 3KJTA 4I9DA 5TPAB 4N6PA 5HPQA 1L5TA 4R6YA 3PPNA 1DPPA 4BDLA 4TLMB 1FQAA 1N04A 5AA2A 3HV1A 1B32A 3S4UA 3FVNA 3TFLA 2DWJA 4MBPA 4AB6A 4FIMA 4ECFA 1IXGA 4H8JA 4HS7A 2Y7PA 5FHMA 4G8NA 3C35A 2GH9A 4EXLA 1Z7ME 3R7XA 3FVGA 1MXZA 2DXYA 2ALUA 4YU0A 5AE4A 1ZKBA 4RY1A 3TTRA 1B05A 1POY1 5B70A 2NWJA 1PDAA 2O68A 3U1OA 1NH7A 3EPEA 2QMWA 1UTBA 1Y3NA 1B5HA 3SEUA 1JVXA 3FJMA 4KCDA 1Y4TA 3B6QA 2XXWA 3CVGA 1GGGA 3C9HA 4PFTA 4X9TA 1LBCA 3C33A 1P1OA 3IB0A 2I58A 5AA3A 4RYAA 4G2ZA 2QPQA 1R6ZA 4OZ9A 4OFOA 4RK9A 1B7ZA 3FVOA 2QL3A 5ITPA 4GFRA 2V3QA 3K1MA 2AYSA 5CMBA 2REJA 1BLFA 4DZ1A 1XVYA 3K6WA 4P0IA 1EH3A 1LFHA 4DIGA 2P2AA 3IO4A 3PV0E 1XT8A 1ZTYA 3EN3A 2HEUA 4NF5B 3RQTA 3PUVE 3KN3A 1PB9A 3RGYA 4ZZAA 5DVFA 2XXUA 4HCWA 1LFGA 4BDOA 2F34A 2O84X 4JWYA 4QRZA 1MM6A 5ITOA 1DPEA 1PEBA 4FATA 4HW8A 2PMSA 2QJEA 3OO7A 2QS3A 4UACA 1JQFA 3N5LA 2H9BA 4EQBA 1M5DA 3VXBA 3TODA 3MJNA 1MQGA 2DXRA 3T96B 1USYE 4LONB 1JVYA 1MY0A 4KHZE 5ELVA 4NWCA 5CBSA 3GLBA 4H67A 4AB5A 3P7IA 1POTA 3Q29A 4Q5TA 1SDXA 1SW1A 1UIVA 3JZJA 3ODBA 4I62A 4Q8RA 4BDRA 4LUBA 2X26A 3O2AA 3UIFA 5CMKA 3W9WA 3C4MA 3K6XA 3AXFA 1MDQA 4ESWA 2O7IA 3H6WA 1ATGA 1B1HA 4IO4A 1MY3A 1TWYA 4QFPA 1QJMA 1SI1A 1JNFA 4R2BA 4LA9A 5ICTA 4R72A 4G68C 5JTYA 3VDFA 2R6GE 1BTJA 2OBGA 1YAEA 5K2YA 3MVWA 5TP9A 5A5XB 2V25A 2Q2CA 3HHGA 4F29A 1ZMGA 1QKBA 3MZ9A 3ILUB 4IO6A 1SW4A 1NNPA 3K00A 2I3VA 2I49A 4H6DA 3K1NA 3E13X 2OZZA 1ANFA 4OMBA 3QYTA 2OCUA 4QFLA 4FEBA 1H3DA 4DE8A 1MXXA 3EQ1A 1FTMA 3QXMA 3FIRA 3QAXA 1IQ7A 2I4BA 3IOWA 3OSQA 4R74A 4DCYA 3B7DA 4YKKA 4ZE8A 3CI8A 3G3IA 1IXCA 4TQUQ 3RT8A 3O28A 4NF8B 4ZDMA 1YPNA 2ZXTA 3EHTA 2RINA 4H0WA 2ONKE 3IOVA 4HCYA 4H5FA 5H8SA 3N94A 4BDNA 1PC3A 2ONRA 1EU8A 1FQBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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