1MY2A

Crystal titration experiment (ampa complex control)
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Probing the function, conformational plasticity, and dimer-dimer contacts of the GluR2 ligand-binding core: studies of 5-substituted willardiines and GluR2 S1S2 in the crystal.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my2A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my2A01
4TLLB 1OVTA 3P7IA 1EZPA 4IB2A 3KSXA 1GV8A 2UYFA 1Y20A 4E0XA 4NF5B 1JW1A 1XT8A 4FE8A 3LC8A 3M3FA 3OSRA 4IO6A 1B5HA 3K1MA 3I5OA 1NH7A 3K6UA 3PV0E 2NVUB 3T66A 3LR1A 1SW1A 1S7YA 1R6ZA 3CIJA 2F7AA 3OOAA 4OEVA 3IOVA 3Q27A 4AB5A 4BDRA 3MPLA 3OMBA 4U22A 3G3JA 4FEBA 4U1ZA 3OELA 2H25A 1NNTA 1JVYA 1TFDA 2O1MA 4RJZA 3RTWB 4F31B 1IEJA 3VLUA 4NEDA 1SDXA 5HBCA 2DVCA 4X1DA 1HSLA 5KCJB 4WEPA 1NFTA 2DVZA 5BWJA 4QRZA 4OQOA 2I58A 1EH3A 1RYOA 2D5WA 5CMKA 3FGSA 2P0SA 2O51A 1OIBA 3KZGA 4U4SA 1B7HA 2Y7WA 1YTVA 5H8NA 3SESA 4DCXA 1FCKA 5FHMA 3OD7A 1H76A 3H06B 1B0LA 3L6GA 2HEUA 2FNCA 4AB6A 4KHZE 1FTLA 1QULA 1B1HA 5ITPA 1MDP1 1P1NA 1P1OA 2XXIA 2O1LA 4BLAA 1IITA 1FTOA 3FXUA 4NF4B 3S2VA 4PFYA 1B40A 2Z8DA 1OQHA 2AL4A 4G68A 4BDMA 5A5XB 3VXCA 3H6TA 2QSXA 5H8HA 3H4ZA 1LSTA 1NL5A 5H8SA 4JWYA 4RPOA 1PB8A 3TODA 5I2NA 5B7DA 1FQCA 2B3FA 3E13X 3IL1B 3IORA 4ZEBA 3SERA 4DCYA 3E3KA 3PUXE 4R9GA 1QKAA 2HAVA 3MZBA 4THIA 1I6QA 2F6PA 3K0VA 1B9JA 4PFWA 3FXRA 5DVIA 1M5EA 3LSFB 4ESWA 4MLQA 3M8UA 5ELVA 1QUIA 5DVJA 4LP2B 2DWIA 2O68A 2RF1A 2YLNA 3MZ1A 4G68B 4KYDA 4RXLA 4F22A 4XKQA 2YJPA 4F3GA 2DXYA 5H8QB 2RCBA 3N6UA 2H99A 4TQUQ 5AA2D 2XHDA 4OERA 1ZMGA 2I4BA 4P0GA 3D4CA 3MZ9A 1A7LA 1XC1A 2DQVA 4L17A 1OVBA 2QMWA 3VLVA 1UIVA 1SW4A 4EQ7A 1DPPA 1I6BA 4ND9A 4OWDA 4F3SA 5AE4A 3BKIB 4LUBA 2BJJX 1B2HA 3M3KA 5HM4B 2Y7IA 3VFJA 1N76A 2RINA 1FQBA 1SW5A 3K6XA 4BDOA 4NWDA 4EUOA 3CVGA 4JWOA 4JDFA 1VFEA 3GBBA 1USYE 3PMXA 3RQTA 3MUQA 1B3EA 3OXNA 2GFEA 3H03A 1VFDA 3IX1A 3PMVA 4I62A 4U2RA 3LSXA 3K01A 1A54A 2PBWA 4F18A 2I0CA 1A8FA 4GQOA 1SW2A 2OZZA 3TCHA 4K3FA 3CR9A 2QL3A 4WXJA 2F34A 1B58A 4HTGA 3FXQA 2AYSA 1M5FA 4NF5A 5CMBA 1II5A 3KN3A 2D21A 2DE4A 5I59A 1WODA 4ZS9A 3FVGA 2F97A 4QF9A 1LB9A 1Y4TA 3EN3A 2E1SA 1I6AA 3JV9A 1EU8A 1AL3A 2CZLA 2PT2A 2REGA 3ONMA 4YAHX 1SVXB 1JW5A 3SEWA 3I3VA 3O2AA 1DTGA 2GHBA 4RPNA 3IAZA 3SEYA 3EHSA 1QJMA 3B7DA 4OYVA 2R9JA 2NWJA 2R6GE 3FV2A 3QSLA 4PFUA 4EDPA 1LFIA 5DTBA 1SBPA 2RKMA 2QRYA 2Q9TA 1DOTA 2PX1A 2ZXTA 3O66A 4YICA 3HHGA 3U92A 2GH9A 2HZKA 1Y3PA 5KDTA 3C32A 4QFNA 3TCFA 4NF6B 1JVXA 5LOMA 4R9FA 5KCJA 3H6VA 2QMXA 3T9XB 1SQYA 2PMSA 3FV1A 3TTKA 3OO8A 1QUKA 2V3TA 4G77A 3FJ7A 4LA9A 1FTKA 1FTMA 2ZNSA 4GFRA 3T93B 1T0KA 1B05A 1USYH 3HSTA 3FJGA 2Y84A 4PE5B 2UVGA 2DXRA 3I6VA 4GL8A 4H1XA 4H6DA 2Y7KA 4H5FA 4NMYA 1URDA 1AOVA 2UVIA 3CRBA 3ILTB 2Q88A 1PDAA 1SD3A 5TU0A 5I2NB 3W9WA 1CB6A 3IOWA 1DPEA 1B5IA 2DE3A 4H0WA 1Y1MA 1MQDA 1SI1A 3DM0A 1P1UA 3FUZA 2A5TB 4R2BA 4YKJA 1HSEA 4ELOA 4PQJA 3IJXB 2G93A 1GR2A 3TPAA 2THIA 1IZ1A 2H98A 1MXWA 1YPNA 4QFOA 3VE1B 3B6TA 3VDFA 4YU0A 3A09A 3O6HA 3PPQA 1RKMA 3PUZE 3RUMA 4BDNA 2ZYMA 4C0RA 2H5YA 3RGYA 2Z8EA 3TYHA 4EQBA 4EXLA 1MXUA 1PB9A 4F3PA 4Z0IA 4F3BA 4U4XA 3QIMA 3DP8A 2X7PA 3K4UA 4ZEKA 4ZE9A 1MQJA 4GOTA 4LQ5A 4OFLA 3TTMA 4HW8A 4MF3A 2PYYA 1JNFA 1MDQA 4TLMB 3HPIA 5CMMA 4O3BA 3TEPA 2OCUA 4P11A 2XD3A 5F7VA 1B6HA 3TTNA 4EXKA 5H8FA 3EF7A 3MVXA 1Y3QA 1ZIUA 1MM7A 3MC2A 3MPKA 3QAXA 3G3IA 4G4PA 3O6IA 4IGTA 4U21A 2VP1A 1LGBC 5KDTB 5KZTA 3MQ9A 1BKAA 5I57A 4IGRA 4I8CA 2XXRA 3MP6A 4QFKA 1MRPA 1KWHA 3FVNA 4LVQA 5TP9B 2ESNA 5FTIA 4N07A 2DE2A 4N13A 4O3CA 3MW0A 1UIUA 4UA8A 1AIVA 3IO6A 3K1NA 5H8HB 2YPNA 2ZMBA 1US5A 3B6QA 3PPRA 1MXVA 3N5LA 1DTZA 2QS3A 2RC9A 3VV5A 3MVZA 3TZAA 1PBQA 4POXA 1VSOA 1LAHE 2F7BA 1BIYA 4JSOA 4R6KA 3W15C 1B3HA 1ZKBA 3PUWE 5AA4B 4IO3A 2REJA 2DOJA 5B70A 1AH5A 2Q2AA 1N7XA 2HFBA 4GXAA 4OHNA 1UTHA 1NNFA 3L6HA 4M4GA 4DZ1A 2I48A 3TKDA 1OLCA 3EQ1A 4FJPA 4ZDMA 3ODBA 1VE4A 4LONB 4H8JA 3O28A 1FQFA 1NMUA 2PVUA 3FIRA 4OEUA 3OENA 3U1OA 3V89B 3DP6A 3UP9A 5L9SA 3OO9A 1TXFA 4QHQA 1N3WA 2DYXA 4Q30B 3EHTA 3QXMA 2B65A 3TQLA 3K00A 4BDLA 3PPNA 4NF6A 3LUYA 5F1QA 1POTA 5AA1A 1A8EA 2P1SA 4FEDA 2QS2A 1B32A 1ZLQA 4F1YA 1H45A 3KN7A 5JTYA 2I4CA 4U1OA 2XXWA 3PUYE 5HPQA 4RNSA 1N84A 5M2VA 3MP8A 2XXPA 5FHNA 2NXOA 1PBPA 4EF1A 3FASA 1MQGA 1Y9UA 1B1XA 4KYSA 2ONKE 3LSLA 1IXHA 1M5BA 4X48A 1QKBA 2Z23A 1IIWA 3Q25A 5DT6A 4DE8A 5I58A 1ZTYA 2XX8A 4OVJA 3E9XA 1MS7A 4EQ9A 1FQEA 1B3FA 2I0BA 2O7IA 1LBBA 5H8QA 5ICQA 1ZBMA 4G8MA 1CE2A 1NNPA 3H7MA 3MAMA 2VGQA 4H5GA 1ZJLA 2I6EA 3QYTA 3CFZA 4JSDA 4QFPA 2XXUA 3C9HA 2IEEA 2NOOA 2O69A 2V25A 2B3BA 3O97A 3OSQA 3T96B 5K2YA 2NUVA 3MJNA 1P1WA 2V3QA 3Q28A 2DS9A 2GRVA 2WKYA 4GRKA 4X9TA 3SETA 3VVDA 4BDQA 1H43A 4LATA 1AMFA 5I56A 1PB7A 3GZGA 3SEUA 4KFQA 2I3VA 5J1DA 4X1BA 5DEXB 1MXXA 4IO5A 3CSGA 3HHFA 3HCQA 4GWOA 4F2QA 2ZYKA 3CG1A 2QJEA 4NF4A 4XKNA 1Y1ZA 3D4GA 3EHUA 5L9OA 3PPPA 5A5XA 1R1NA 3R6UA 1XOCA 4IY5A 3PGFA 2XXYA 4HCYA 4F1UA 3A3CA 3H6UA 2Z8FA 3MVYA 4AQ4A 3IO4A 1O7TA 2QS4A 1FQAA 2W7YA 3RTFB 3SKPA 5AA2A 4OFOA 1Q1KA 4PP0A 5L8DA 1LB8A 3TFLA 4EF2A 5EYFA 3K6VA 4ELPA 1WDNA 4YKKA 5I57B 1B4HA 5I2KB 2Q2CA 3MVWA 2XXXA 3BFUA 2F35A 4LZ5A 1N7WA 3G3HA 2UVHA 4G8NA 4JWXA 1MQHA 1Z7ME 3GLBA 4PFTA 2F5XA 3TTLA 2DWJA 4R72A 4RY1A 5L9MA 1BLFA 3LSWA 1GVCA 1YAEA 2E0SA 3W9VA 1MPBA 4KPTA 1A99A 4OESA 4R73A 5FTHA 3VVFA 3HO7A 1LAXA 4IO4A 4R75A 2DP8A 1D4NA 1UTHB 1WVJA 4ISUA 5DVFA 2VHAA 4MH5A 5CM6A 3H6WA 4QSDA 4ZZEA 1OLAA 3UORA 1I69A 1EZ9A 4POWA 4YB5A 1QVSA 1S9TA 3UA8A 3IK6B 4RA1A 4YB7A 1FW0A 4QSCA 4C1TA 4TOZA 2I49A 3KOSA 1P1QA 1ANFA 1D9VA 1LCTA 2Y7RA 3AXFA 5AA3A 4KR5A 1GGGA 1Q35A 3HV1A 4YKIA 1H44A 3FVKA 4OTEA 4ECFA 3S9LC 3RLFE 4Q0CA 2XXHA 1RYXA 1YCJA 3KGCA 4KCCA 4F2OA 5EHMA 2Y7PA 1H3DA 4NTLA 5TP9A 1MG1A 3TAJA 2ANJA 4C1UA 5H8NB 2DSFA 1MY4A 3OEKA 2X7QA 2OWSA 3G7WA 4ZEFA 4YMAA 1OQGA 2GHAA 3A3UA 1IXIA 3C31A 1B7UA 1XHYA 3O6GA 4GIZA 3TCGA 1O64A 2V3UA 2V84A 5ICTA 3ZKKA 1O63A 1MM6A 1LLSA 2VOZA 5CMCA 3ZSFA 4Q5TA 1MXZA 3RNNA 3M3LA 1XVYA 3CFXA 5JEIA 1MPCA 2OK2A 3DP4A 3KG2A 5DEXA 3CFLA 3N26A 3G3GA 4ZECA 3JZJA 4YB6A 4IO7A 4FIMA 2O7UA 3H3GA 3KBRA 4MFIA 3K02A 4P0IA 5JK4A 1M5DA 5I56B 4WKMA 1JQFA 1UQWA 4RK2A 2AL5A 1FQDA 2A5TA 1NKXA 5FHOA 1IUDA 2ZYOA 4Z7EA 4O3AA 5I59B 1URGA 2UVJA 4N6PA 4IY6A 4XTCQ 1OMPA 2QPQA 4R74A 3ZKLA 1SYIA 4FATA 1DMBA 5CRYA 1IQ7A 2HXWA 1ATGA 5I58B 3FD3A 4ZEDA 2ONRA 2OWTA 1JEUA 3K1PA 2PT1A 3C34A 3IB2A 2FA7A 2UXAA 1NH8A 1DSNA 3ILUB 2ZYNA 1F9BA 1A55A 1LBCA 1L5TA 3U72A 3G3FA 3IR1A 4YKPA 4LZ8A 4DXUA 3KEIA 4F29A 2ZNUA 2O84X 1JW4A 4YZZA 5K2XA 3QUJA 3OEMA 1P99A 3R26A 2Q8JA 2R71A 3RT6B 4E0WA 3PMWA 1EZOA 4F1VA 2XD2A 2H4IA 3GBAA 4ZE8A 1POY1 3TTRA 3Q26A 4R6HA 4WEDA 2RCAA 3O9PA 3OO7A 4G8HA 5H8FB 3R7XA 3ECRA 1LFHA 4KQPA 1PEBA 3E4RA 4DXBA 1MXYA 4ZZAA 2RC7A 2XXQA 3SDFA 5CC2A 5I84A 2G29A 1URSA 3G3KA 1UTBB 4ELQA 4NWCA 2V93A 3WAEA 1MY2A 2ONSA 3KJTA 1MQIA 3ZS6A 4DIGA 1Y3NA 5CBRA 2VD3A 2HCAA 4I9DA 1MY3A 1N3XA 3FATA 4XXUA 2IA4A 3K6WA 4QFLA 4HCWA 1JETA 1R9LA 3IOUA 3PD8A 4H8IA 3T9UA 3KOTA 4F19A 1QW0A 3PUVE 3HN0A 1SYHA 3S4UA 3USDA 1D3KA 1N04A 1MPDA 1B51A 4KYEA 3IOTA 3TELA 5AA4A 1QUJA 1LCFA 1ZU0A 3MWBA 4H65A 3C33A 3VXBA 2OBGA 2F6GA 2HAUA 1R9QA 1GTKA 1B3LA 2FYIA 2P2AA 4GD5A 1UTBA 3RY3A 4FECA 3TQWA 3O29A 4MLVA 4NE4A 5I2KA 4MBPA 3PPOA 3T9VA 3U8QA 1MY1A 2XX7A 3Q29A 2Q89A 3S9NC 4FAJA 2O6AA 1Z7NE 3MP1A 4GVOA 4JBZA 3VLWA 4I1DA 4NF8A 2UYEA 3QUFA 5TPAA 3RPWA 3V8XB 2F36A 4UACA 3C35A 3KN8A 1TWYA 3DLNA 1MH4A 1VR5A 3N6TA 3GXAA 3S9MC 4G68C 4KI0E 3U94A 1MY0A 2HQ0A 4OENA 4OZ9A 2X26A 2F78A 4NF8B 2VD2A 5TPAB 3UN6A 2ZNTA 5CBSA 3SEVA 1B46A 2XXTA 3OO6A 4H67A 4R6YA 4Q8RA 4HS7A 1LAFE 4RK9A 3V83A 5ISUA 1S50A 5DYHA 3SEXA 1IXGA 1JEVA 3BBRA 3N94A 3FVOA 3TUSA 4QSEA 4XIGQ 3T9HB 5BUUA 2ALUA 1US4A 1TFAA 2ABHA 1BP5A 3RT8A 1IXCA 4ESXA 3C4MA 1N0TA 3K2DA 2DWAA 3VVEA 4YMBA 1BTJA 2F7CA 4FORA 4M1VA 4ZEIA 3F11A 4G2ZA 3KFMA 3S9EA 2KLFA 1B5JA 4DLDA 4OETA 3UIFA 4LZ7A 2AIXA 3DELB 3IB0A 2OLBA 3KJ7A 4OXVA 2M8CA 2A5SA 3IB1A 3PU5A 4DDDA 3C36A 4GL0A 4ELRA 4RYAA 1B3GA 1B4ZA 4OMBA 1D9YA 5ITOA 3U93A 1LAGE 3WAFA 4ONYA 5IAIA 4LQ2A 2XXVA 2QS1A 4GF8A 5EHSA 3EPEA 3RN8A 5JTYB 2CMOA 4PETA 4JXIA 2LAOA 2HZLA 1B7ZA 3CSBA 3MBPA 1A40A 4OFJA 4XKPA 3THIA 3TMGA 3FZVA 3IJOB 3UK4A 5IKBA 3T22A 2Z22A 1HSJA 1M5CA 3B6WA 1XS5A 3CI8A 1NNKA 4DXCA 5AA2B 3KSJA 5CI5A 4IO2A 3UGWA 3LBSA 1FTJA 1TT1A 2DWHA 2H9BA 3QK6A 4GLIA 4XKRA 3FJMA 3TDJA 1PC3A 2F8DA 2RC8A 2OJTA 3BFTA 1ELJA 2I3WA 2XX9A 1J1NA 4GXSB 1Y4CA 4R2FA 1XVXA 4U23A 4F39A 1B0HA 3JYRA 4JB7A 1B52A 3PD9A 2D3IA 4KD5A 1MH3A 1LFGA 3V5AA 3CG3A 1SI0A 4KCDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4IB2A 1GV8A 4NF5B 1JW1A 1QGXA 1XT8A 3M3FA 3OSRA 2XA5A 1NH7A 3IOVA 4AB5A 3OELA 1K9YA 1IEJA 1SDXA 4X1DA 1HSLA 4WEPA 1EH3A 4U4SA 4DCXA 4AS4A 3OD7A 4PCDA 1B0LA 2HEUA 1B1HA 1MDP1 2XXIA 1IITA 4NF4B 4PFYA 4BDMA 5A5XB 1OQHA 4JWYA 4RPOA 3TODA 3IL1B 3SERA 2Q74A 4R9GA 1QKAA 4OVRA 5DVIA 1M5EA 1FJ6A 3M8UA 5DVJA 2O68A 4G68B 5H8QB 2RCBA 2H99A 1FPGA 1ZMGA 2I4BA 3D4CA 2FVZA 4L17A 2DQVA 2QMWA 1DPPA 5AE4A 1EYIA 2BJJX 3VFJA 1FQBA 4NWDA 4JDFA 3GBBA 1USYE 3MUQA 4U2RA 4I62A 4KXPA 1A54A 1NV5A 4K3FA 3SZPA 2QL3A 1B58A 2F3DA 4OVPA 3FXQA 2AYSA 4ZS9A 3FVGA 4QF9A 4MHFA 1LB9A 1I6AA 3JV9A 1EU8A 2REGA 1FBDA 4YAHX 3SEYA 3B7DA 2NWJA 4GX4A 5DTBA 1DOTA 3HHGA 2GH9A 2OWZA 1JVXA 5LOMA 3BIGA 4MNCA 3T93B 3I6VA 2DXRA 4H1XA 3ILTB 2DDKA 5I2NB 1CB6A 1MQDA 1P1UA 1HSEA 3IJXB 1IMDA 3O6HA 3PPQA 1RKMA 3TYHA 2Z8EA 1RDZA 3LV0A 4F3PA 4U4XA 2JJKA 4ZE9A 4GOTA 4TLMB 4N6DA 5CMMA 2XD3A 3TTNA 3MVXA 1Y3QA 4MNPA 4U21A 3O6IA 1LGBC 4IGRA 1AWBA 2DE2A 4N13A 3N5LA 1DTZA 1VSOA 5AA4B 3PUWE 5B70A 2Q2AA 1N7XA 2ZZXA 2HHMA 3L6HA 2ZZVA 3O28A 3FIRA 4OEUA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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