1MY2A

Crystal titration experiment (ampa complex control)
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
b'KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Probing the function, conformational plasticity, and dimer-dimer contacts of the GluR2 ligand-binding core: studies of 5-substituted willardiines and GluR2 S1S2 in the crystal.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my2A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my2A01
5BWJA 1B1XA 2OCUA 1Z7NE 3ZKKA 1LBCA 5ISUA 4R6YA 4R6KA 3SEUA 2PX1A 1ZLQA 3T96B 1JW4A 1URGA 3V8XB 3G3IA 5ICTA 1EZOA 4H8IA 2IEEA 4YKJA 2DSFA 2F7AA 2XXWA 3K6UA 4H0WA 3I3VA 5H8FA 4X48A 4N13A 3FXUA 2FYIA 1WDNA 3I5OA 3U72A 3TDJA 2AL4A 2X7PA 2F7BA 4YICA 3G3HA 2Y84A 4XTCQ 4QFPA 3K1PA 4QFLA 3HSTA 1SW1A 1P1QA 4F2QA 4DE8A 1QULA 3H6TA 2QS3A 3FD3A 1A7LA 3H06B 2Z23A 2IA4A 1R9QA 5H8HA 2PVUA 4AB6A 2FA7A 2D3IA 5L8DA 4FEBA 2XD2A 4XKQA 2O7UA 4BDNA 1Y4TA 3OXNA 4MLQA 2ESNA 1M5BA 3EHTA 3MVWA 1MQJA 2O68A 4OXVA 3SEVA 4RK9A 5J1DA 2F8DA 3C35A 4YZZA 1DPEA 4P11A 1CB6A 3CSBA 2DE2A 4GF8A 5L9SA 1SW4A 3B6QA 3UGWA 4O3BA 3LSLA 3OSQA 4F3BA 1M5DA 1DTGA 3H4ZA 3BKIB 2BJJX 4U4XA 4DIGA 2XXYA 4EQBA 3OEKA 1A8FA 4MFIA 1SI1A 4U4SA 3KN7A 4MLVA 4G8MA 2A5TB 4QF9A 1B40A 1XS5A 1F9BA 4XXUA 1J1NA 1NKXA 3RT8A 3W9VA 4DLDA 4XKRA 5L9OA 4IO4A 4FE8A 3VVEA 3SEYA 4FECA 1FCKA 4FIMA 5IAIA 4XKNA 3TCHA 2I0BA 4E0XA 3R7XA 2E0SA 4YAHX 3C4MA 4GWOA 3SESA 1H3DA 2NWJA 5AA2B 2RKMA 3K2DA 2R71A 4KQPA 3C33A 4OYVA 1QJMA 4QSEA 4WEDA 1US4A 4NTLA 3PPQA 3IO6A 4HS7A 2QMWA 2I0CA 2QS2A 3TQWA 4ESWA 4HCYA 4HW8A 1D3KA 3VLUA 2UYEA 4BDRA 3JZJA 3HPIA 3MPKA 2DVZA 1RKMA 1AIVA 1US5A 2QS4A 1VFDA 1FTOA 5TU0A 1MQDA 1OLCA 5AA4A 1UTHA 4DZ1A 2ONKE 3PUZE 4LZ5A 4JDFA 5DEXA 4NWCA 4EXLA 3SERA 1SI0A 3GBAA 3IJXB 1JW5A 4ZE8A 3ONMA 4C1UA 3IORA 1PDAA 4I62A 4OFJA 1KWHA 3S9EA 2NXOA 5KDTA 5BUUA 1N04A 1B9JA 5H8NA 4U22A 2UVJA 3FVOA 2A5SA 3V83A 5B70A 3OEMA 3KZGA 4EQ7A 4KD5A 5TPAB 3OO6A 3SDFA 3N6UA 4EF1A 4OHNA 2HAUA 4WXJA 1Y4CA 3QXMA 5I58B 1N3XA 1URSA 4PFWA 4C1TA 4EDPA 3TTRA 4PQJA 2RC9A 1N0TA 4Q8RA 3K6XA 2O84X 3E3KA 5JTYB 1OVBA 3GZGA 1XOCA 1FW0A 2KLFA 4F39A 4BDQA 5A5XB 2HFBA 2UVHA 2LAOA 4G68B 3MWBA 4BLAA 3RQTA 1DOTA 2Y7IA 4F3GA 5HBCA 1ATGA 3IK6B 1MPBA 3LBSA 4YMAA 3AXFA 3KSXA 3PGFA 5ITOA 4P0GA 4G68C 4RPNA 4AQ4A 3SKPA 4LATA 3OMBA 3RY3A 1ZBMA 3KSJA 1TXFA 2Q2CA 1MPDA 1R9LA 5CMKA 4GQOA 4ZE9A 1XHYA 1BTJA 3UK4A 4OEUA 2QPQA 3TYHA 4RY1A 3QUFA 4YU0A 5I2NB 5ICQA 2F35A 3FATA 3OENA 1B3HA 3OO9A 3PMXA 3IJOB 3PMWA 3TCFA 3MJNA 4GL8A 1H44A 4LQ5A 1FTLA 4G8NA 1Y3QA 1IXHA 3H3GA 3IAZA 1GV8A 3S9MC 3MZ9A 5KCJB 1DSNA 3PPRA 2P1SA 3T66A 3N6TA 3DP4A 2OWTA 4IO2A 2OWSA 3ZKLA 3CFXA 4YB6A 2UVGA 4LA9A 1MXVA 1OMPA 3O6HA 2RCBA 3EF7A 4Q5TA 1YTVA 4GVOA 4E0WA 1B3FA 4POWA 1LAXA 2F5XA 3O66A 1MY0A 4LP2B 1QVSA 1AMFA 3VLVA 1I6QA 2F6PA 4ONYA 4AB5A 1VFEA 4F1UA 1MS7A 4NWDA 3IL1B 3VE1B 4FEDA 3DELB 3JYRA 3LC8A 4G2ZA 1XT8A 5ITPA 1S9TA 5I57B 2DWJA 5I56B 4OQOA 4EQ9A 1IUDA 3TODA 3LR1A 4PE5B 1FQDA 1PEBA 3TAJA 2VD2A 5JK4A 4YB7A 2REJA 3RUMA 2D5WA 3B6TA 1ZIUA 3K1MA 3MBPA 4U2RA 3O2AA 2OK2A 3S9LC 1TFDA 2G29A 5CBRA 2DVCA 1B7ZA 4TLMB 3TTNA 2GRVA 4H6DA 4PP0A 5FHMA 4IO5A 1XC1A 2Y7PA 1MY1A 4OESA 5CM6A 3HHGA 3EHUA 4I1DA 4OZ9A 1B58A 4DCXA 1JEVA 1PBQA 4FORA 1I6AA 3G3GA 2DS9A 1MXUA 1LB9A 5M2VA 2I48A 4F29A 4U1OA 4YMBA 2Q9TA 1NH8A 3VXBA 1IITA 2Z8FA 2Y7RA 4GD5A 3WAEA 3VFJA 2DE3A 2ZYOA 5DTBA 1MY3A 3C9HA 3K6WA 4F19A 5CC2A 1BKAA 3SETA 4ISUA 1MXYA 1TT1A 2RCAA 1HSLA 3TZAA 1POY1 3A09A 1Q35A 4RK2A 3M3KA 3TELA 5L9MA 3CSGA 3FJGA 1Q1KA 4OVJA 3IOUA 3Q26A 1OLAA 3UP9A 1MPCA 4ZDMA 1B46A 1NNPA 1SW2A 2UXAA 3FUZA 4RNSA 4QFNA 1D9YA 2VHAA 4RJZA 4MF3A 4HTGA 1SVXB 4DCYA 1LFHA 3EQ1A 3MVXA 3H6UA 4JSDA 4F31B 1ZTYA 3A3CA 1I69A 4ZZAA 1USYH 4U21A 1Y1ZA 1AOVA 3PUXE 2F97A 1B4ZA 4DXUA 3BFTA 2XHDA 4GXAA 2PBWA 3CRBA 4YKPA 5FTIA 4OFOA 3IB2A 1AH5A 3TMGA 1RYOA 2H9BA 2ZYKA 3IB1A 3IOTA 3PD9A 1FTMA 1FTKA 4RXLA 3ZSFA 1LGBC 3HN0A 4NEDA 4IO7A 1Y3NA 3TEPA 4ZEKA 1P1WA 3KOSA 2Z8DA 3L6HA 3MZ1A 4I8CA 4ZEDA 3PUYE 2NVUB 2CZLA 1NNFA 1B2HA 1IIWA 1MQIA 1VE4A 2I3WA 3PPNA 4ZS9A 1URDA 4R75A 2A5TA 3ODBA 1T0KA 3TTKA 3DP6A 3L6GA 1D9VA 3MP8A 4QFOA 2F34A 1Y1MA 3LSFB 1FQEA 4LQ2A 2HCAA 1MDP1 2DOJA 4PFYA 4DDDA 2AIXA 3C31A 3DM0A 1UIUA 2DXYA 3QUJA 4F3PA 2HZKA 4DXBA 3Q27A 2ZNSA 3FV2A 3G7WA 3T9VA 3PUWE 3B7DA 5DVIA 2V3UA 3K02A 4G8HA 2ALUA 1PB8A 2O1MA 3W15C 5JEIA 5AA2A 4NF5B 4O3AA 1NL5A 3KGCA 1LFIA 5AA2D 3MVZA 3C34A 1YAEA 1LAHE 4C0RA 3TQLA 4POXA 1YPNA 5AA3A 1MXXA 1PC3A 1N76A 2FNCA 1QKAA 3T93B 2ABHA 3THIA 5DT6A 1EZ9A 3K4UA 4OFLA 4WKMA 1QUIA 4H65A 5F7VA 1H76A 4DXCA 1GR2A 3PD8A 4G77A 3WAFA 1L5TA 4RYAA 1B5HA 1VSOA 1OIBA 2HAVA 3GXAA 3MW0A 2XXRA 5TP9B 1JW1A 5EYFA 3LSWA 4GXSB 4I9DA 3MP6A 1O63A 2GHBA 3FIRA 5B7DA 1IQ7A 2DYXA 3F11A 3RTWB 1B3LA 1QUKA 3T9XB 2PMSA 3FJMA 5TPAA 4RPOA 1B51A 2Q8JA 3HHFA 4LZ7A 2Y7KA 5I58A 3U92A 2ANJA 2WKYA 4H67A 5JTYA 4GIZA 2AL5A 1O64A 3CVGA 1ZJLA 5A5XA 2QRYA 4R72A 1LB8A 2GH9A 4G68A 1FQAA 2O6AA 2DXRA 2OBGA 3D4GA 1IEJA 4ZEFA 1A99A 4R6HA 2O51A 1D4NA 1WVJA 1CE2A 3KEIA 4KPTA 3EN3A 3QYTA 3M8UA 3FVKA 1FQFA 5CMBA 1NNTA 2AYSA 2VGQA 4JB7A 4JWXA 4OENA 2PT2A 2YLNA 4R9GA 4FATA 2ZMBA 5I2NA 1LAGE 5FHNA 3O28A 3QIMA 1EH3A 3MC2A 2HZLA 5AE4A 2PYYA 2Z8EA 4Q30B 5EHSA 2Q88A 1JEUA 3KBRA 1IXCA 3MPLA 1QW0A 2RC8A 5KCJA 3TFLA 1LLSA 3S2VA 2UYFA 1HSJA 2XXHA 2HQ0A 4Z0IA 2Q89A 2V3QA 2ZYMA 4LONB 4OEVA 1SQYA 2ONSA 2VOZA 1OQHA 3FZVA 3N26A 3KJTA 3FV1A 2B3FA 4KCCA 1II5A 1USYE 1XVYA 1UQWA 3UN6A 1NMUA 3KN3A 3W9WA 1B5IA 2V93A 4JSOA 1B0HA 4QFKA 1M5FA 1H43A 1JNFA 3PPOA 4OMBA 3H6VA 5I59B 3E4RA 4G4PA 4NE4A 4KYSA 5I57A 4IGRA 1P1UA 3P7IA 2ZYNA 4EF2A 5I56A 2V3TA 3BBRA 4KCDA 4PFUA 1N7XA 1LAFE 2XXQA 3K6VA 3KG2A 2P2AA 3UIFA 4R2BA 2G93A 3CFZA 3IOWA 3GLBA 4KYDA 1PBPA 2XXUA 3E13X 4MBPA 4IGTA 3I6VA 3LUYA 2B3BA 2H98A 4Q0CA 4NMYA 4ND9A 3B6WA 3RGYA 4FAJA 1UTBB 1A54A 3CIJA 1ZKBA 2XXXA 1JETA 4NF4B 4ELQA 3UA8A 2DP8A 4F1VA 1BIYA 2F7CA 1MG1A 3H7MA 4NF6B 1LCTA 4OETA 1FQCA 4KHZE 3KFMA 3U94A 4FJPA 4GL0A 2R9JA 1WODA 2I4CA 2XXVA 2O1LA 3FXQA 3V5AA 4KYEA 3FVGA 1S50A 4F22A 3C36A 1XVXA 5FTHA 3MQ9A 1FQBA 2YJPA 1DTZA 3O29A 4RA1A 4XIGQ 2HXWA 3MZBA 2CMOA 4JBZA 5H8FB 1N7WA 3IOVA 4ZZEA 3TTLA 2RC7A 3RTFB 4F18A 1M5CA 3PUVE 4HCWA 3O6GA 1NFTA 2ZXTA 2B65A 4EUOA 3HV1A 4ECFA 1B7HA 3LSXA 4EXKA 5H8QA 1MM6A 4M4GA 5H8QB 4H1XA 4LZ8A 1A40A 1ELJA 4ZEBA 4JWYA 1ZU0A 5H8HB 3IO4A 1B32A 4KI0E 3TTMA 1Y20A 3HO7A 4BDLA 4H5FA 4KR5A 2R6GE 2Z22A 1POTA 1Y3PA 3QAXA 4BDOA 2F6GA 3N5LA 2QS1A 4QSCA 4TOZA 3U93A 1PB9A 2RINA 4YKIA 3IR1A 1I6BA 1AL3A 1SYHA 1SBPA 2M8CA 4O3CA 3RPWA 3MVYA 4R2FA 1SDXA 1DPPA 2NUVA 1A8EA 3G3KA 3Q29A 4UA8A 1B1HA 3PV0E 1MH4A 2DE4A 3VV5A 1MH3A 2QMXA 1OQGA 1JVYA 3JV9A 2THIA 3E9XA 2V25A 4M1VA 5CRYA 2O7IA 5EHMA 3ECRA 4QHQA 2ONRA 1YCJA 4QRZA 4LUBA 2DWHA 3RLFE 3G3JA 1P1OA 1LSTA 3O9PA 4NF5A 1M5EA 4TLLB 3U1OA 3VXCA 2H99A 3VVFA 3H6WA 5ELVA 4ELOA 3C32A 1MRPA 4QSDA 4U1ZA 2YPNA 3EPEA 2HEUA 3K1NA 3R26A 5AA1A 3A3UA 2I4BA 3FXRA 2XXTA 3G3FA 4X9TA 4H8JA 3PMVA 1P1NA 4F1YA 2XXIA 2D21A 2OLBA 5DYHA 4GFRA 2O69A 1Z7ME 1ANFA 3N94A 3R6UA 1JQFA 5TP9A 1BLFA 3S4UA 1GTKA 3H03A 3EHSA 1IXIA 3MUQA 5KZTA 4R74A 4OTEA 2ZNTA 1B4HA 5AA4B 3QK6A 1MXZA 2H4IA 1UTHB 3CI8A 1IZ1A 3M3FA 5DEXB 1N84A 2I3VA 4IO6A 2F78A 4PFTA 3FJ7A 3D4CA 1B5JA 2OZZA 4R73A 4THIA 5CMMA 3TUSA 3DLNA 3TKDA 4IY6A 5KDTB 2QL3A 5CI5A 3OSRA 1LFGA 1MDQA 4N07A 2RF1A 3OD7A 3VLWA 3HCQA 2REGA 5H8NB 1TFAA 2QSXA 4IB2A 3O6IA 2Q2AA 4LVQA 1B52A 1S7YA 4K3FA 3OOAA 3T22A 1MY4A 1SYIA 4N6PA 2ZNUA 1B0LA 1MQGA 1UIVA 1QUJA 4BDMA 4GLIA 1HSEA 4IO3A 4YB5A 1NH7A 3T9UA 3KN8A 1A55A 4Z7EA 1B3EA 2P0SA 4ELPA 3FASA 3USDA 1QKBA 4P0IA 4F3SA 3K0VA 1B6HA 3CFLA 1RYXA 5DVJA 2DWIA 3CG1A 4WEPA 1IXGA 4YKKA 1TWYA 4OWDA 1MM7A 3CG3A 3VDFA 3K00A 2X26A 4ZEIA 3M3LA 1LCFA 1GVCA 4JWOA 1SD3A 4GRKA 3BFUA 3KOTA 4NF8A 3OO8A 4X1DA 5FHOA 4NF8B 4X1BA 1GGGA 4ESXA 2GHAA 4XKPA 1DMBA 1JVXA 3V89B 4UACA 2XD3A 3RNNA 4GOTA 4TQUQ 3IX1A 3ZS6A 2H25A 2XX8A 3TCGA 1P99A 2GFEA 2XX7A 1MXWA 3VVDA 5CMCA 1N3WA 2DQVA 1R6ZA 4MH5A 1EU8A 2VP1A 3RT6B 2QJEA 5CBSA 1Y9UA 5I2KA 5K2YA 2VD3A 5I2KB 5LOMA 3CR9A 3ILUB 3PPPA 1ZMGA 2W7YA 5F1QA 5IKBA 3ILTB 3T9HB 1EZPA 1H45A 4ZECA 1SW5A 4PETA 4IY5A 1BP5A 4JXIA 2PT1A 5I59A 2Y7WA 3OO7A 1MY2A 2UVIA 2NOOA 2I6EA 3PU5A 5H8SA 4OERA 5HPQA 3RN8A 3Q28A 4L17A 1O7TA 3K01A 2I58A 3GBBA 4F2OA 4KFQA 4U23A 3DP8A 3SEWA 5K2XA 4ELRA 3O97A 5DVFA 1B05A 3MAMA 1R1NA 2H5YA 1VR5A 5HM4B 3OELA 1LBBA 2OJTA 2V84A 3KJ7A 2DWAA 1MQHA 2X7QA 3FGSA 3SEXA 1B3GA 1OVTA 3MP1A 3U8QA 1UTBA 1B7UA 2XXPA 3Q25A 3FVNA 3IB0A 5I84A 3TPAA 4NF4A 1NNKA 4H5GA 2E1SA 2F36A 2I49A 1FTJA 4NF6A 3UORA 2XX9A 4R9FA 3QSLA 1PB7A 3S9NC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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