1MY2A

Crystal titration experiment (ampa complex control)
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Probing the function, conformational plasticity, and dimer-dimer contacts of the GluR2 ligand-binding core: studies of 5-substituted willardiines and GluR2 S1S2 in the crystal.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my2A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my2A01
2R9JA 4KPTA 2E1SA 4QFPA 1B6HA 1QW0A 4YMBA 2DE4A 3N5LA 2NWJA 2I6EA 2DOJA 5AA4B 4GOTA 3BKIB 5AA4A 2XXWA 2QL3A 1M5BA 4POXA 5JK4A 2B3FA 4P0IA 4HTGA 3KJTA 1FW0A 4NF4B 2I0CA 2ABHA 3KSXA 4N6PA 2PT1A 3M3FA 3H6UA 1R6ZA 4YZZA 2XXQA 2DE3A 1QULA 1MQHA 3LUYA 4H65A 2QRYA 3H06B 1MM6A 3B7DA 4DCYA 4LZ5A 3D4GA 3KSJA 4ZZAA 4EUOA 4F3SA 3RT8A 4ZE9A 4FORA 4EDPA 1MM7A 3VLWA 2I48A 4Q5TA 1MXWA 4KCCA 3S9MC 5KCJB 1MPBA 3PUYE 3GBAA 2DWJA 2ZYMA 1B46A 1B4HA 4GD5A 1M5FA 3MC2A 1JETA 4X48A 1N76A 2HXWA 3K1PA 3K0VA 2F97A 4PFWA 3U93A 3U1OA 1B3GA 3TELA 4GXSB 4P0GA 1H76A 1O7TA 4FECA 5FTHA 1CB6A 5H8FB 5CM6A 1MQDA 4ELRA 2Y7IA 3E4RA 2RC7A 4LONB 1ZIUA 2OBGA 1QUJA 4EQ7A 1SW1A 4ISUA 4DXBA 4UA8A 1NNFA 3H4ZA 1AL3A 4ND9A 3S4UA 3VXCA 4HW8A 3TDJA 4XIGQ 1DTGA 3H3GA 1CE2A 3VXBA 4F3BA 3FIRA 2I58A 3ECRA 3HO7A 1LB9A 4EF2A 2Z23A 3K6VA 5HBCA 1XVYA 1O63A 4F18A 3PUWE 3RY3A 5H8QB 1XHYA 1RYOA 4F3GA 3KOSA 3BFTA 3N6TA 1DTZA 3OENA 2RF1A 3K00A 4KD5A 4NMYA 1UIVA 5EYFA 3ZKKA 4Z0IA 2DWIA 2UVIA 1B7HA 4PE5B 5M2VA 1IEJA 3CFXA 1URDA 3S9EA 3M8UA 3GBBA 5I84A 1M5EA 1MRPA 1JEUA 3MAMA 4U4XA 4ZS9A 1OQHA 3TCFA 2CMOA 1TFAA 1SW4A 1SYIA 2PBWA 2F36A 3G3GA 3V5AA 2D5WA 3CI8A 3LSXA 1VFDA 5IKBA 1POTA 4QFLA 3TPAA 3L6HA 1JNFA 3FATA 4G8MA 3T9XB 3I3VA 2A5SA 1IXGA 2AL4A 3DP6A 3PPRA 5J1DA 3C33A 2ALUA 2UYEA 1I6AA 2ZYNA 3VE1B 3FJMA 1SYHA 4DXUA 1PB8A 1SD3A 2VP1A 1PEBA 3EQ1A 4H5GA 2HCAA 2XXTA 4JSDA 3RUMA 4EXLA 3USDA 1H44A 4F2QA 4EF1A 3C31A 2HAUA 2V84A 3TTLA 2X7PA 4XTCQ 1N3XA 4U22A 2HQ0A 2V3QA 4OXVA 3EN3A 4NE4A 4ESWA 4GL8A 4AB5A 1MH4A 4BDQA 3CIJA 1IXIA 1B05A 1SVXB 4NEDA 3QXMA 4QRZA 1MS7A 2NXOA 2YPNA 4KHZE 1N7WA 1URGA 3QUJA 4JWYA 5KDTB 4LQ5A 5AE4A 1FTMA 3ODBA 2P0SA 3K6XA 4X1DA 1TT1A 5L9MA 1IQ7A 1B5IA 2ZMBA 4QSEA 1GGGA 5H8HB 4FE8A 5H8HA 3TQLA 3U8QA 1Y1MA 4R2FA 4DE8A 3O29A 2Y7RA 1RYXA 1MXUA 4OFJA 3IX1A 1MPCA 3KN7A 4OFLA 1FCKA 3B6TA 1B51A 1LCTA 1JW5A 1B3EA 4IY6A 4IGTA 4JXIA 4ELPA 5HPQA 4OHNA 1R9QA 1PBQA 2ONKE 3L6GA 2H5YA 3OOAA 1R1NA 4R6HA 1P99A 4OENA 1H45A 1SDXA 2DP8A 3U94A 2Z8EA 2Q9TA 3KN8A 1OMPA 3JV9A 2HFBA 3Q27A 3IB1A 3T9VA 4RJZA 4G68B 3FASA 4G68A 4TLMB 5FHMA 2GRVA 4RNSA 1I6QA 4Q30B 3FJ7A 2DVCA 2QMXA 4RXLA 2F35A 1MXXA 1URSA 4MLQA 2DE2A 1YCJA 2RKMA 2Z8DA 4G4PA 5A5XB 3SDFA 4KR5A 4U23A 3RNNA 4GFRA 4JSOA 3TTNA 1AOVA 4IY5A 1GVCA 4G68C 5BUUA 2Y7WA 2NVUB 5ELVA 2AIXA 1LBBA 1NNKA 1A99A 1GTKA 4I8CA 3JYRA 4POWA 4L17A 1ANFA 2GH9A 5CMBA 2V3TA 3G3FA 1FQAA 1NNTA 2I4CA 2H4IA 3SKPA 3UA8A 2QS4A 4M1VA 5AA3A 3FGSA 1UTHB 3IJXB 2PX1A 2OWSA 1UTHA 2O84X 1P1UA 3FV1A 2V3UA 2Z22A 1NMUA 3TCGA 4XKPA 2F5XA 4RK2A 2Q88A 1ZBMA 4NWDA 3AXFA 5TU0A 2REGA 1PBPA 4TQUQ 5DTBA 1B32A 5H8NB 3N26A 2UYFA 1UIUA 5H8NA 3TUSA 4R9GA 1A7LA 1OVBA 4OQOA 4DIGA 3B6QA 3PV0E 5CMKA 2E0SA 3O9PA 4PP0A 3SEWA 3HSTA 4OTEA 4BDNA 3TTRA 5H8SA 1D3KA 1XC1A 4WXJA 5CMCA 5L9OA 1MY1A 2Y7PA 3IORA 3PGFA 2VD2A 3K6UA 4ZE8A 2ZXTA 4O3BA 4NF4A 1ZKBA 2NOOA 1QJMA 1L5TA 3TODA 4OVJA 3H6WA 3M3KA 1WVJA 4QFOA 1NFTA 4FEBA 4NWCA 4FATA 3TKDA 3C36A 3FXRA 3PPPA 1FTKA 4R74A 4JBZA 4LVQA 1JEVA 3T9HB 4IB2A 4K3FA 4RA1A 3SEXA 1N0TA 5KCJA 5JTYB 3MPLA 1WODA 3MP6A 4PQJA 2HAVA 1FTJA 3FVKA 3MBPA 1Y20A 4KYSA 1P1WA 3PUVE 1YAEA 1QUKA 5H8FA 3C32A 1LLSA 2ONSA 2P1SA 5L8DA 3WAFA 4IO6A 2QSXA 1MY0A 2ZYOA 2I0BA 1MY3A 3RN8A 4C1UA 3OELA 1Y3QA 4MBPA 3Q29A 3T66A 4F39A 1P1NA 1QUIA 4XKQA 2NUVA 2OLBA 2Q8JA 1BLFA 3HCQA 3Q25A 2AYSA 3T22A 4GL0A 1A55A 3HPIA 5H8QA 2XD2A 4NF6B 4U2RA 3ZS6A 1LAGE 3K1MA 4LP2B 1UTBB 3IO4A 3MVYA 1UTBA 1ZLQA 3I6VA 3O6IA 3ILUB 4H6DA 4TLLB 3KG2A 2A5TB 4O3CA 3W15C 2ESNA 3N94A 4QSDA 1B3LA 3OSQA 4ZEKA 5EHSA 1JQFA 3H03A 5B70A 3M3LA 1VE4A 2DYXA 5CBRA 3ZKLA 1MQGA 5EHMA 4C1TA 3S9LC 3S9NC 1XS5A 1N84A 3MZ1A 5I56B 2O6AA 1NL5A 1B9JA 2YLNA 1IIWA 1ZTYA 2DQVA 4OMBA 3MZ9A 3RTWB 5I56A 3MVWA 1A8EA 4OERA 1FTLA 3EF7A 5HM4B 4R72A 2F7AA 1B58A 2XXRA 2G93A 1Z7NE 1SQYA 1ELJA 4EXKA 2CZLA 2OJTA 3OO8A 1HSJA 3QYTA 4ELOA 2Y7KA 2ZYKA 4NTLA 1B7UA 3KGCA 1B0HA 1OLCA 2QS3A 1LBCA 2I49A 3VFJA 2THIA 4YB7A 4U4SA 3Q26A 1B7ZA 3KEIA 1FQCA 3FXUA 3LR1A 4MLVA 3KZGA 2XX9A 4H0WA 2XXXA 5L9SA 3DP8A 4G8HA 3P7IA 1II5A 2Q2CA 4GF8A 4I62A 2QMWA 2RC9A 3HHFA 2QJEA 5TP9B 5I59B 1BIYA 5TP9A 4F1UA 5I59A 3DELB 1AMFA 3C34A 3MJNA 4R73A 4ZDMA 4KQPA 3MP1A 3G3KA 4NF8B 1USYE 3KJ7A 4NF8A 2DVZA 4DDDA 5KDTA 3V8XB 1D9VA 1S50A 3C9HA 4LZ8A 1FTOA 3OD7A 1EZ9A 3OXNA 3BBRA 1YPNA 5BWJA 3GZGA 4ZEBA 3ONMA 1Y9UA 3TTKA 3MPKA 2O68A 4WEPA 2DSFA 3K02A 2XXUA 3H6TA 3VV5A 2HEUA 1MXYA 1MXZA 3ILTB 4X9TA 3EPEA 4F3PA 1N7XA 1F9BA 3N6UA 2XX7A 2R6GE 3K6WA 1MY4A 1QKBA 3A3CA 3K2DA 1MDP1 1Q1KA 3VVFA 4ESXA 5LOMA 3RT6B 2H98A 1TWYA 1VSOA 3TCHA 1LAFE 2G29A 2XXHA 1NNPA 3CG1A 3O2AA 4BLAA 1B0LA 1MH3A 5AA2B 3R6UA 4OZ9A 4ZZEA 3TAJA 4AQ4A 4YB6A 2REJA 3EHUA 3PPOA 2UVJA 4RK9A 4LZ7A 3MVZA 3OO6A 4I1DA 2F6GA 1LAXA 4Z7EA 4F2OA 4JDFA 5K2XA 3A3UA 1FQBA 4LATA 1BKAA 4YU0A 4KYEA 2LAOA 1Q35A 4H5FA 3FXQA 4BDLA 3FZVA 1B1HA 3TTMA 3O66A 1KWHA 1S7YA 4YICA 3T96B 4IO3A 1DMBA 1N04A 2B3BA 4G77A 1ZJLA 4XXUA 4BDOA 4JB7A 3FD3A 1US4A 5A5XA 4AB6A 3TQWA 2DXYA 1OLAA 4I9DA 3DLNA 3OEMA 1B3HA 3PD8A 4IO5A 1VFEA 3UN6A 4DCXA 4QFKA 3E13X 3THIA 1XT8A 1IUDA 4LQ2A 4U21A 4F31B 1LB8A 4OEVA 5AA2D 1B5HA 4BDMA 3UP9A 5I58B 1EH3A 1Y4TA 5AA1A 5I58A 4OESA 3D4CA 3R7XA 2O7IA 3TYHA 3O28A 3H7MA 4YKPA 1VR5A 4M4GA 2XX8A 4YMAA 3U92A 5I2NB 2PMSA 3U72A 2R71A 2X7QA 2DWAA 4QSCA 3H6VA 1SBPA 2UVGA 3OSRA 4H67A 2XXPA 1ZU0A 3V89B 3FV2A 1D4NA 4QHQA 3LSFB 4DLDA 1MG1A 1RKMA 4GQOA 3B6WA 4ELQA 3SETA 4YB5A 1Y3NA 3PUXE 4OFOA 3K4UA 3UIFA 1SW2A 1T0KA 2UXAA 2AL5A 2FYIA 3PU5A 1EZOA 1J1NA 1MXVA 4F1YA 2GHBA 4PFYA 1EU8A 1N3WA 2RC8A 1XOCA 1MQJA 3F11A 3MVXA 5DVFA 2I3WA 4KYDA 5DYHA 3PD9A 4O3AA 4YKJA 3QSLA 3G3JA 1Z7ME 1SW5A 3LC8A 5DT6A 3IOWA 3KN3A 4GVOA 4IO7A 2QPQA 4GWOA 1IITA 3C4MA 1Y3PA 3FVNA 2XD3A 3K01A 4YKKA 1LFHA 2X26A 4XKRA 4ZECA 4HCYA 4IGRA 1I6BA 3LSWA 1DOTA 3T9UA 5JTYA 2ONRA 3IO6A 1JVYA 2F7CA 1B5JA 4GRKA 3SEVA 2D21A 5ITPA 1TFDA 3QK6A 3VLUA 5I2KB 3V83A 2Q2AA 1D9YA 5I2KA 3IAZA 3A09A 5I57B 1SI0A 5DEXB 5I57A 2ZNSA 5DEXA 2H25A 4R75A 3TMGA 3LSLA 3SEYA 5ICTA 3G7WA 1B3FA 3W9WA 2XXVA 5TPAB 3RTFB 3OO9A 5TPAA 3TEPA 2HZLA 4OWDA 3TZAA 3EHTA 1GV8A 3O6GA 4DZ1A 4N07A 2F7BA 2QS1A 1IZ1A 4GLIA 2GHAA 4ZEDA 4ZEIA 3RLFE 4JWXA 2RINA 3MZBA 2YJPA 4NF6A 2QS2A 1B40A 4R6YA 2WKYA 3IOVA 2M8CA 3UK4A 2I4BA 2IA4A 4OETA 1OVTA 2A5TA 2OWTA 4G2ZA 3MP8A 3LBSA 3WAEA 5FTIA 3JZJA 3PPNA 3O6HA 2BJJX 2DS9A 4YKIA 1JW4A 1AH5A 2O69A 1PC3A 2ZNTA 2XXIA 4MF3A 4JWOA 3SERA 5CBSA 3IB2A 3RGYA 1ATGA 2PVUA 5ICQA 4X1BA 5FHNA 3CVGA 3IL1B 5DVIA 4G8NA 3CFLA 4Q8RA 1BP5A 2XXYA 2FNCA 1A8FA 2F8DA 2OZZA 1AIVA 1YTVA 1JW1A 4H8IA 1A54A 1LFGA 4HS7A 3C35A 4NF5B 4PFTA 4RPOA 4NF5A 4XKNA 2KLFA 5KZTA 2XHDA 4EQBA 2DWHA 3O97A 1US5A 2OK2A 3PMXA 5JEIA 3PMVA 4LA9A 4LUBA 1OQGA 5CMMA 4F1VA 3G3HA 4P11A 2D3IA 1NKXA 3EHSA 1GR2A 4MFIA 4U1OA 3VVDA 4E0WA 3OMBA 2ZNUA 3PMWA 3HHGA 1BTJA 4U1ZA 4F19A 2FA7A 2O7UA 3CRBA 4F22A 3GLBA 3CSGA 3MUQA 3S2VA 5IAIA 1USYH 3IJOB 1IXHA 2V25A 4THIA 3CFZA 4QFNA 1QVSA 2W7YA 1TXFA 4YAHX 1NH7A 3E3KA 3RQTA 3UORA 5ITOA 3T93B 1LGBC 2DXRA 3FVGA 2VGQA 1UQWA 4FJPA 1B52A 4GXAA 4N13A 1A40A 4MH5A 3DM0A 3KBRA 1PB7A 1NH8A 3FVOA 2RCBA 1PDAA 4DXCA 5F7VA 2Y84A 3R26A 3QIMA 5K2YA 3BFUA 5ISUA 2O51A 4FAJA 2H99A 4KCDA 4C0RA 1HSEA 5AA2A 1DSNA 4IO4A 3FUZA 3HN0A 2PT2A 3I5OA 3SEUA 3G3IA 3ZSFA 2F78A 4HCWA 1LSTA 1LAHE 4RPNA 5DVJA 3PUZE 5CC2A 4PETA 3IOUA 2B65A 1DPEA 3MWBA 4GIZA 1OIBA 3DP4A 4R2BA 4R9FA 2V93A 3UGWA 3TFLA 1MY2A 4H1XA 4ECFA 4FIMA 3K1NA 1ZMGA 1H43A 1LFIA 1B2HA 1MQIA 4ONYA 3KOTA 1Y1ZA 1P1OA 1IXCA 2ANJA 3VLVA 4R6KA 2IEEA 3OEKA 2P2AA 2I3VA 1FQFA 3CR9A 1EZPA 2O1MA 4WKMA 3VVEA 4EQ9A 3CSBA 5CRYA 1B4ZA 1FQDA 1POY1 3QUFA 1DPPA 2VHAA 1MDQA 1S9TA 2Z8FA 5F1QA 3KFMA 2HZKA 4PFUA 1HSLA 2PYYA 4Q0CA 2OCUA 2O1LA 1SI1A 4ZEFA 2RCAA 3GXAA 1R9LA 2GFEA 1M5DA 1WDNA 4KFQA 1I69A 5FHOA 5I2NA 3VDFA 4F29A 1O64A 3RPWA 3MQ9A 3E9XA 1XVXA 3IR1A 1H3DA 3IK6B 2Q89A 2VD3A 2F6PA 3PPQA 4RYAA 3Q28A 2F34A 4H8JA 4QF9A 4E0XA 3MW0A 1QKAA 1MPDA 4OYVA 4RY1A 1M5CA 1P1QA 3SESA 1Y4CA 3CG3A 4FEDA 5B7DA 4KI0E 3FJGA 1PB9A 4UACA 2VOZA 4BDRA 4TOZA 5CI5A 1B1XA 3IB0A 4IO2A 1FQEA 3OO7A 1JVXA 3HV1A 3QAXA 4OEUA 2H9BA 2UVHA 4WEDA 3W9VA 1LCFA 3IOTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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