3DP6A

Crystal structure of the binding domain of the ampa subunit glur2 bound to glutamate
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure of the S1S2 glutamate binding domain of GLuR3.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Signaling protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 85
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-07-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dp6A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dp6A02
4GIZA 3IB1A 4IO4A 4R2FA 4WKMA 2I0CA 4I1DA 4IO3A 3EF7A 2A5SA 1B3LA 4THIA 4YZZA 4OETA 1FTOA 5DT6A 3TTRA 1FQCA 1TXFA 4L17A 3TODA 1P1UA 2G93A 3QXMA 4EUOA 3UIFA 3G3FA 4QSCA 1SW1A 4LQ2A 3TMGA 3OSQA 3PPRA 1LCTA 1NNKA 3KJTA 1NKXA 4F2QA 1QUKA 2O6AA 1JETA 1JQFA 1GR2A 3PMXA 1M5EA 2F6PA 1MH4A 4NF4A 2ZNUA 1QKAA 2FA7A 5ITPA 2PT1A 2P0SA 1ZIUA 2ZYKA 1TT1A 1LAGE 2DVZA 3S9EA 3A3CA 3C33A 1NNFA 3K6WA 1JVYA 4LUBA 3PPNA 2NVUB 2X7QA 4ZS9A 3VFJA 1YPNA 4I8CA 1MXVA 1SDXA 3PUWE 3B6WA 3U92A 1N3XA 2O1MA 2PVUA 3DELB 4M4GA 4WEPA 3R26A 2PT2A 1Y4TA 4O3CA 2H99A 1SW2A 2DWHA 2H25A 4X48A 3TTKA 4TQUQ 3DP6A 1MXWA 1PB9A 3FXUA 1VFDA 3GBBA 4O3AA 3FUZA 4HW8A 4ZE9A 1AIVA 1MDQA 1M5CA 1USYH 1B32A 5KCJA 3OO8A 1I6QA 4HCYA 2THIA 3AXFA 4ISUA 4JWYA 3OEMA 3MVXA 4YICA 4C1UA 4DE8A 3TCFA 3MP8A 3VXBA 3PPPA 4MH5A 4P11A 2ALUA 1MDP1 2GFEA 2R71A 2YJPA 3CFLA 5H8HB 4DCXA 2QS2A 2F7CA 1F9BA 2H5YA 3FJMA 2Z23A 4R9GA 2HZKA 5FHNA 3SEVA 2GRVA 3T96B 4GL0A 3LR1A 2ONSA 2XXVA 1B6HA 3O2AA 4R6HA 1IXGA 4KCDA 3WAEA 4IB2A 4XKQA 2RINA 3IO6A 1NL5A 5AA1A 4RNSA 3LSWA 4Q5TA 3CSBA 4U22A 5TPAA 3K2DA 3MVWA 3MUQA 5CI5A 4DZ1A 1MQIA 4GQOA 1OVBA 2AL4A 1TFDA 2V3TA 4XKPA 1B05A 1PEBA 4YMBA 5AA4B 1QKBA 4AB5A 4F19A 3HO7A 3FIRA 3QUJA 3TDJA 4F18A 5J1DA 3JV9A 3KFMA 4BDQA 2VOZA 3H03A 2O84X 3IX1A 3LBSA 4JWOA 1A55A 1M5FA 3ONMA 1MM7A 3MZ1A 5DVJA 5FHMA 3S2VA 1HSEA 1KWHA 3O28A 3MP1A 3VLVA 2XHDA 5KDTA 2F8DA 1A8EA 2REGA 2UYEA 4NF4B 3LUYA 4U4SA 2RCBA 1B1HA 2QRYA 5H8FB 2QS1A 4FIMA 3PPOA 2AIXA 3DLNA 4OVJA 2P2AA 5F1QA 4C1TA 3V5AA 5L9SA 4LQ5A 4F1UA 1B3HA 3U93A 3PD8A 1MH3A 4NTLA 4G68B 1A40A 2F5XA 3IJOB 3KG2A 3CIJA 4PFTA 3W9VA 3W15C 3W9WA 1FQEA 4F39A 1II5A 5FHOA 4C0RA 5H8QA 3C35A 3IR1A 2G29A 2B3BA 2OK2A 2Q2CA 3K6XA 5L9OA 2DWJA 1P99A 2B65A 1IXIA 1NNTA 4QFKA 1N04A 1BIYA 1LAFE 4G2ZA 1MXZA 4RYAA 5ELVA 4OHNA 1R9QA 4P0IA 1R1NA 3IL1B 4ELRA 4OMBA 5CC2A 4YU0A 4EQ9A 3FVGA 4F3BA 1D3KA 2PMSA 2XX9A 3TQWA 3TAJA 1JEUA 4NMYA 5AA2B 5IKBA 2ANJA 3TTLA 1I6AA 2HXWA 2QS3A 4NF8B 5JEIA 4OERA 1Y3PA 1FTMA 4N07A 4U2RA 1MRPA 5CRYA 3H3GA 5BWJA 1UTBB 3FVOA 2Z8FA 4G68A 1NH7A 3DP8A 3E13X 3T9HB 1B52A 2DP8A 2UVIA 5TP9A 1UIUA 5FTIA 1AOVA 4LA9A 1ZTYA 4UA8A 1LAHE 2F34A 2UYFA 1OLCA 1QULA 3KOSA 4QHQA 4GOTA 4TLLB 1DPEA 3D4GA 1ZLQA 1D4NA 2R6GE 1VSOA 4X1BA 3PUXE 2DQVA 3O6HA 1QUJA 4N13A 4OESA 2OBGA 4ZEIA 2ZYOA 4R73A 1I6BA 2DYXA 3LSXA 3UP9A 2OZZA 4GF8A 4IY5A 3CI8A 1N7XA 2ZMBA 5I2KB 3RN8A 4DIGA 2Y84A 2VD3A 1QVSA 3PUZE 4G8NA 4LVQA 1ANFA 4ELOA 1URGA 4IO7A 4NE4A 3P7IA 5EHMA 1MY3A 1A99A 2H4IA 2QPQA 1MS7A 3PU5A 1VFEA 5I56B 4FORA 4EXLA 3B7DA 2O69A 2O7IA 3MP6A 4R75A 1FQDA 3K1MA 4RK2A 5JTYB 5L8DA 1IXHA 3FXRA 5TPAB 5I58A 3OXNA 2OWTA 2V93A 2I58A 1O7TA 4PETA 1IZ1A 1Q35A 5AA4A 1SW4A 1MQHA 3VVFA 3MBPA 2UVHA 3UORA 4KR5A 1H76A 4MLVA 1HSJA 5LOMA 1OMPA 2Q9TA 1JW5A 2QS4A 1R6ZA 3OEKA 1Y3QA 3T66A 5DYHA 5ISUA 4GXSB 2E1SA 3G7WA 1UTHA 1FQAA 1QJMA 3S4UA 3FASA 1XVXA 2DVCA 1BP5A 1M5BA 2BJJX 1URSA 5DEXA 4BLAA 2NXOA 5AA2A 5I58B 3M8UA 5KCJB 1MY1A 1MPCA 2VP1A 3H06B 2ZYNA 4DDDA 1LB8A 4GFRA 1IEJA 1M5DA 1J1NA 1A7LA 3LSFB 2XX7A 1B40A 2A5TB 1OQHA 3IOVA 3O66A 2QJEA 4FE8A 1JEVA 2NOOA 3RNNA 1N3WA 4G8MA 2ZNSA 3N6UA 1IQ7A 1HSLA 4X9TA 3MAMA 5A5XB 2IEEA 3ZS6A 3MQ9A 4OZ9A 3T22A 4F2OA 3MPKA 2HCAA 4XIGQ 2XXTA 3N26A 1B51A 1IITA 2QMWA 1TFAA 3O97A 1Y9UA 4AB6A 3H4ZA 1OLAA 1P1OA 3Q25A 4DCYA 4POWA 3TYHA 5KDTB 3G3HA 4DXBA 2E0SA 4PQJA 4E0XA 3G3IA 4ND9A 4PFWA 3CFXA 4AQ4A 2F6GA 5I2KA 3TQLA 4KYEA 4QFPA 3A09A 4ELQA 1B4HA 2XXXA 3TFLA 4KI0E 1Y20A 4QFOA 4EQBA 1B5HA 3U1OA 3USDA 1B7UA 3M3FA 3LSLA 1ELJA 1ZKBA 2V84A 4OWDA 3U72A 4F29A 4OENA 5ITOA 4EXKA 2YLNA 4IGTA 1SYIA 3KN8A 4K3FA 4GLIA 3TTMA 4FAJA 1LFHA 3S9LC 4QFLA 1L5TA 1CB6A 1Y3NA 1H3DA 3FV2A 1MXUA 3C4MA 1ZBMA 1JW1A 3KSXA 3RT8A 5TP9B 4E0WA 4ESWA 4XKRA 3VE1B 3IAZA 1FCKA 3RY3A 5I57B 3Q26A 4ZZEA 1A54A 2HQ0A 1DSNA 3RPWA 4IO6A 2O68A 2D3IA 3K1NA 4NF8A 4I62A 3G3JA 3MZBA 4U21A 4R72A 4XKNA 3O6GA 4M1VA 4NWCA 3MPLA 3HHFA 4UACA 1S7YA 2XXRA 3RT6B 3QSLA 3SETA 1OIBA 3SEUA 3KN7A 1DPPA 5F7VA 3SKPA 3H6VA 5H8QB 4EF1A 4IY6A 3FJGA 3PUYE 2ESNA 3OO6A 4NF6A 2QSXA 1EZOA 3RLFE 3C9HA 1JVXA 4FEBA 4MLQA 4OEVA 4TOZA 4KPTA 3HCQA 2I4CA 5H8HA 3TCGA 1YCJA 3FGSA 3KSJA 4GD5A 1CE2A 1SI0A 2Y7KA 3HV1A 3Q29A 4HCWA 3GLBA 1UIVA 1EH3A 3F11A 2UVGA 4IO2A 1MQDA 3JZJA 5FTHA 4IO5A 4JSOA 4OFOA 1GTKA 2HFBA 2IA4A 5EYFA 3T9UA 1S9TA 1FTJA 3KOTA 3V8XB 1LAXA 5IAIA 5DVIA 3BKIB 2Q88A 2CMOA 2RF1A 3D4CA 3FXQA 2DS9A 5K2YA 1US4A 1B2HA 2W7YA 3PMWA 3Q27A 1H43A 4KHZE 2Q2AA 4U23A 4YKIA 1O63A 1P1NA 3KEIA 3OELA 4FEDA 2PYYA 4WXJA 3PUVE 2F97A 4ZEKA 5I56A 1RKMA 1YTVA 2X7PA 3FV1A 3OD7A 4XXUA 4Q8RA 3K00A 3UGWA 4GWOA 5L9MA 4ZZAA 3MWBA 4H5GA 3VV5A 5CBRA 2O51A 2A5TA 1JW4A 4PFYA 1ATGA 2X26A 2UXAA 1POTA 2LAOA 2NUVA 3DP4A 4H0WA 4JSDA 4YB5A 1XT8A 3S9MC 1BKAA 2O7UA 2XXYA 2AYSA 3KJ7A 2B3FA 3Q28A 4H1XA 2FNCA 2VD2A 3FZVA 3OOAA 4RA1A 1MXXA 1A8FA 2F35A 4F22A 3IJXB 1MY2A 4YKKA 1EZPA 1N7WA 4JDFA 2O1LA 3FVNA 4TLMB 1FW0A 2XXUA 3E4RA 3K0VA 2RC7A 3K4UA 3PD9A 4POXA 2HAUA 4Q0CA 3ZSFA 4EQ7A 2Y7RA 3CRBA 3PGFA 1FQBA 1LSTA 4KYDA 3UK4A 1B7ZA 2ABHA 2I4BA 1JNFA 4R6KA 2RC9A 3M3KA 3IB0A 4OYVA 4U1ZA 2RC8A 1LCFA 4H67A 4Z0IA 2I48A 1LB9A 3K02A 1D9VA 2QL3A 2HEUA 5CMBA 2PBWA 3C36A 3CR9A 1IXCA 3FJ7A 3G3KA 3HPIA 3IOTA 2NWJA 1MY0A 3RTWB 4FECA 3SEXA 1NNPA 3VVEA 5H8NA 2XD2A 3V89B 4F1VA 3RQTA 4X1DA 1IIWA 2KLFA 1BLFA 3CVGA 4QSDA 4G8HA 4F31B 2AL5A 3K01A 3QK6A 3OSRA 5I59B 1NMUA 2XXQA 4Q30B 5I84A 1H45A 2Q8JA 5I2NB 2XXIA 4P0GA 1PC3A 1SW5A 2XD3A 5JTYA 1Y4CA 2F7BA 2HAVA 3PPQA 3MVZA 4F3GA 5JK4A 3L6HA 5HBCA 4RXLA 3SDFA 1B9JA 3WAFA 3FD3A 1LFGA 1O64A 1LLSA 4FJPA 2XXHA 3KBRA 4H65A 4ECFA 4YB7A 4BDOA 5HPQA 2XXWA 3E9XA 1WDNA 3I5OA 4R6YA 3MZ9A 4JBZA 5EHSA 3U94A 3IB2A 4QFNA 4RJZA 3KGCA 4H8JA 3O9PA 2DWAA 3OENA 4GRKA 5TU0A 5I2NA 4HTGA 3DM0A 3TCHA 3K1PA 3JYRA 3E3KA 1B7HA 4NF6B 4LZ5A 4RPOA 2GHBA 3UN6A 1Z7NE 2VHAA 2Z8EA 3A3UA 3C32A 1WODA 4MBPA 2H9BA 3QIMA 5CMCA 3I6VA 4F3PA 1VR5A 4BDLA 5H8NB 5A5XA 1LBCA 3O29A 3FATA 1AH5A 4KD5A 3ECRA 1B5IA 2M8CA 3GBAA 3K6VA 4ZEBA 3RUMA 3CSGA 5K2XA 4JXIA 3HN0A 1FQFA 4QF9A 4Z7EA 1EU8A 4NF5B 4RY1A 4PE5B 1EZ9A 1LBBA 1SYHA 4G68C 1DTGA 1N0TA 1SI1A 1ZJLA 5DVFA 3ILUB 1B0LA 1IUDA 2DXYA 1WVJA 4NF5A 3L6GA 3BBRA 5AA2D 2OCUA 3BFUA 4LATA 1NFTA 1UTHB 2CZLA 2HZLA 2REJA 3CFZA 1DMBA 4O3BA 4YKPA 3VVDA 2RKMA 4ONYA 1MPBA 4JWXA 3H7MA 3N5LA 3EHUA 1ZU0A 2H98A 4N6PA 5CMKA 1Q1KA 3IO4A 1VE4A 3FVKA 3IK6B 3TEPA 1T0KA 4PP0A 4JB7A 3OO9A 4LONB 1GV8A 4YKJA 1B3EA 3MC2A 1B5JA 2DSFA 2DOJA 2FYIA 2XXPA 1DTZA 2DXRA 3MVYA 4OEUA 4ZEFA 4XTCQ 2I49A 1B1XA 2P1SA 4R9FA 1MQGA 4R2BA 2Z8DA 1P1WA 1SVXB 1US5A 2DE2A 4BDRA 1TWYA 1B58A 1QW0A 1UQWA 3QYTA 2PX1A 4H5FA 1MG1A 4H6DA 5H8SA 3TPAA 3MJNA 1NH8A 1PBPA 3PV0E 4RK9A 3R7XA 2OJTA 3RGYA 3U8QA 1I69A 3OMBA 3KN3A 3MW0A 4GL8A 1SD3A 3S9NC 5I59A 3VLUA 1D9YA 2ZXTA 3VLWA 1B3GA 3B6QA 3I3VA 1SBPA 4LZ7A 3SEWA 3H6TA 4LP2B 5B70A 1Y1MA 2ONKE 3QAXA 5CM6A 3O6IA 1R9LA 2Q89A 1B4ZA 1MPDA 4DXUA 1MY4A 3ILTB 5B7DA 1XS5A 1B46A 1LGBC 1SQYA 2OLBA 2VGQA 3EPEA 1MXYA 2DWIA 3G3GA 3EHTA 3BFTA 4NWDA 4PFUA 1OVTA 1XVYA 2D21A 4HS7A 3TZAA 3V83A 5ICQA 3R6UA 5BUUA 2UVJA 4ZDMA 3M3LA 3CG3A 4MF3A 4EF2A 1AMFA 2I3WA 3TKDA 4G77A 4U4XA 3T93B 4YMAA 3GZGA 4YAHX 4DXCA 1S50A 3ZKLA 2GH9A 3N94A 4RPNA 3EN3A 4GVOA 4KCCA 3OO7A 1RYOA 3THIA 2OWSA 4G4PA 3VDFA 4EDPA 2V25A 4OFJA 1LFIA 4QSEA 5AA3A 4IGRA 3ODBA 2D5WA 3SESA 2YPNA 2F78A 2F7AA 4OTEA 4DLDA 3TUSA 5DTBA 4ZECA 4ELPA 1ZMGA 3RTFB 4OQOA 1POY1 2F36A 3TELA 2I3VA 3C34A 2XX8A 3B6TA 1FTLA 1MM6A 1PBQA 1MQJA 1B0HA 2I6EA 2ZYMA 3CG1A 3IORA 3K6UA 5H8FA 1PDAA 1AL3A 4GXAA 1Y1ZA 2RCAA 2WKYA 2Y7IA 4QRZA 3VXCA 1PB7A 4NEDA 5CMMA 2V3UA 3T9XB 3ZKKA 1P1QA 1XC1A 3N6TA 3PMVA 1N76A 3T9VA 5ICTA 1URDA 3EHSA 5M2VA 2V3QA 4ZEDA 1XHYA 2Y7PA 1UTBA 1QUIA 3IOUA 4U1OA 3HHGA 2R9JA 1GGGA 2ZNTA 1YAEA 1Z7ME 4ZE8A 3IOWA 4LZ8A 2ONRA 4MFIA 4ESXA 5KZTA 2QMXA 2I0BA 2Y7WA 4KQPA 1USYE 2Z22A 4FATA 1BTJA 1RYXA 2GHAA 4H8IA 4I9DA 4BDNA 1OQGA 5I57A 4KYSA 3GXAA 1H44A 3TTNA 3SERA 1N84A 4R74A 5DEXB 4KFQA 3LC8A 1FTKA 4F3SA 4YB6A 3H6UA 3HSTA 4OFLA 4OXVA 4WEDA 3KZGA 1PB8A 1XOCA 2DE4A 3QUFA 3SEYA 5CBSA 5HM4B 2DE3A 1DOTA 3C31A 1GVCA 3UA8A 4F1YA 1B3FA 5AE4A 4BDMA 3H6WA 3EQ1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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