3DP6A

Crystal structure of the binding domain of the ampa subunit glur2 bound to glutamate
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Structure of the S1S2 glutamate binding domain of GLuR3.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 85
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-07-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dp6A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dp6A02
3QAXA 4POXA 3G3JA 1A54A 1JW5A 5H8NB 4FIMA 2PBWA 5CBRA 1VSOA 4PP0A 1LBBA 3K0VA 4X9TA 2WKYA 4YKJA 3U1OA 2Q89A 2XXWA 4JWYA 2DP8A 2Z8FA 1IIWA 2DE3A 1ZKBA 3CR9A 1POTA 3K00A 5BUUA 3T93B 4OERA 3UP9A 2DVCA 4KCDA 3EN3A 3RTWB 1SI1A 4Q0CA 3WAFA 1Y1ZA 1R9QA 2PMSA 1SBPA 4LZ5A 2AL4A 1IXCA 2QS3A 2HEUA 4ZEIA 3ZS6A 3ZSFA 4PE5B 4NTLA 2DVZA 3VFJA 2YJPA 4MBPA 3SKPA 1MY1A 4TLMB 5FTIA 3HCQA 3LBSA 2PT1A 3TKDA 3FXUA 4LQ2A 3MW0A 3MVYA 4DE8A 5I58A 5EYFA 4X1DA 2RC7A 2UYFA 1A7LA 1I6QA 2QS1A 1US4A 2V3UA 4OFJA 1JVXA 1B3FA 1IQ7A 3D4GA 4QHQA 4LP2B 5HPQA 1LCFA 1UTBA 3T9UA 3LSFB 4F1UA 2QJEA 4FEBA 2B3BA 3OENA 4WEPA 4DLDA 4X1BA 2V3TA 2F78A 2RCAA 3PD9A 2GFEA 1B0HA 4DXBA 4EQBA 4XKNA 3SETA 3H6UA 3FXRA 2I3VA 3SEXA 3G3FA 4AB6A 3K6VA 2ZXTA 3O28A 1ZIUA 4U4XA 4R6HA 1O63A 2R9JA 5H8NA 4H0WA 4NE4A 4EF2A 1NH7A 1JEVA 2R71A 1N3WA 5K2XA 4L17A 4DZ1A 3TQLA 2A5TA 3CFXA 1A40A 2XXHA 3UGWA 4C1UA 1MRPA 2IA4A 2ZYMA 4F1VA 5JK4A 3F11A 1TWYA 1BTJA 3KSJA 2OLBA 3PPNA 3E13X 3W9VA 3OEMA 4G2ZA 1D9VA 3IOTA 3K1NA 2I49A 4YB7A 3VV5A 4ZDMA 1P1UA 1Y3PA 4ND9A 5I57B 3RQTA 3QIMA 2ZYNA 1YPNA 4Q8RA 1VE4A 2XD2A 2ONKE 2DXYA 3K01A 2F97A 1LFHA 1QUJA 2XX9A 2QSXA 3GLBA 4KPTA 2DOJA 1XVYA 4HW8A 4QRZA 5KZTA 3MPKA 1SQYA 1FQAA 3TPAA 1MQDA 1OLAA 1A99A 2XXUA 2G93A 4JWXA 1N04A 1UTHB 4KR5A 1FQEA 4OZ9A 2NOOA 1GR2A 4PFTA 3MPLA 1D9YA 2AL5A 2ZNUA 3I3VA 1LLSA 4IY6A 3BFTA 1PBQA 3PV0E 3MC2A 2RF1A 4EF1A 4BLAA 4Q30B 4NMYA 3DELB 5HBCA 4U2RA 5DYHA 3Q25A 4H65A 1A55A 2XXXA 4IO2A 1UIUA 5KDTA 4OYVA 3IB0A 2Q2AA 4ISUA 3IJXB 1HSJA 5JEIA 1N7XA 4AQ4A 3K6XA 1RKMA 1WODA 4YICA 4YB6A 2ZNTA 4IGTA 2W7YA 1XC1A 1NH8A 1A8EA 1A8FA 5AA2A 4KQPA 2H99A 3G3GA 4R6KA 4H5GA 1MXYA 5L9OA 2DWAA 1B1XA 3TZAA 2OK2A 1F9BA 4RNSA 5I57A 1B52A 1MXWA 1FQDA 3VVFA 2D5WA 2XX7A 2I0BA 4F19A 3MP6A 4ELQA 1LAXA 1SW1A 1LAHE 3MQ9A 1ZMGA 3RT6B 4N07A 1QKAA 3EHUA 1MXVA 3S2VA 5FHMA 5DEXB 4JB7A 4R9GA 4GOTA 4YKPA 1IZ1A 1ZJLA 1N84A 2HQ0A 1URDA 1URSA 3TQWA 3OD7A 4KD5A 5F7VA 2ABHA 2Q88A 3FV2A 1B05A 4FECA 4OHNA 1MPCA 2CZLA 2XXYA 1OQGA 4M4GA 1B3GA 1QW0A 1SVXB 3SDFA 2V3QA 4C0RA 1MY2A 3VE1B 3Q27A 1EH3A 1QJMA 3U92A 1MY4A 3FXQA 4RPNA 1CE2A 1USYE 5TPAA 1N0TA 3CFZA 4OETA 1NFTA 2XHDA 3O6GA 2O84X 2DQVA 3E9XA 1LB8A 2RINA 4OMBA 3DP8A 4JSDA 1MQGA 3U94A 1H76A 3PUWE 4JXIA 2X7QA 2Y84A 1WVJA 3ZKLA 2QPQA 2DWIA 4LA9A 1QVSA 2UYEA 1D4NA 5I84A 4ZEKA 2E0SA 4R75A 4Z7EA 2QS2A 1EZOA 3GBBA 1Y20A 2OWSA 2ONSA 4NWDA 2I48A 4YU0A 3MBPA 4M1VA 4OWDA 4IO3A 3MP1A 4H8JA 4AB5A 1BIYA 2F6GA 4FORA 4IO7A 4GFRA 2Y7WA 3MP8A 5TP9B 1JETA 3P7IA 3V83A 1MM6A 1OQHA 3TCGA 3Q28A 1BP5A 2GHBA 3PMWA 3MZ9A 2A5SA 1B7UA 1YTVA 4OVJA 5LOMA 5K2YA 1IXHA 3FJGA 4F3PA 3C31A 2KLFA 4GVOA 1T0KA 1DTZA 1B5IA 3OSQA 2FNCA 4UACA 4YAHX 4IY5A 3KZGA 4JDFA 2QMXA 3PU5A 4XKQA 4XXUA 4F3GA 1SYIA 4QFNA 2Y7IA 4N13A 1FTOA 4ELOA 1QUIA 2AYSA 1H3DA 3H4ZA 2VD3A 3H06B 1MXXA 4NF4A 3MVXA 3O66A 2AIXA 4XTCQ 5ELVA 3M8UA 3QUFA 3TTKA 3D4CA 1NKXA 3DP4A 4R74A 1XS5A 3Q29A 1DSNA 1Y1MA 1LAFE 1D3KA 2ESNA 4KCCA 4DIGA 2F34A 5DVIA 3UA8A 3FIRA 1P1QA 2LAOA 4OEVA 3JYRA 3W9WA 3CSGA 1MG1A 3RLFE 3M3FA 4HS7A 4FATA 3ONMA 2V93A 2ZNSA 4I1DA 1S7YA 3T22A 1MQJA 4WXJA 2I3WA 3HHFA 3UORA 3I5OA 4U21A 1ELJA 1SW2A 5AA4A 2ZMBA 3IO6A 4G68A 5I59A 3G3HA 1VFDA 4F2QA 1MS7A 3FD3A 1PDAA 4LUBA 4PFYA 4NEDA 2XD3A 5A5XB 1IXGA 2THIA 2DE4A 3QXMA 3H7MA 1ANFA 3C33A 4H67A 5I2KB 3THIA 4DXCA 3KN7A 3RT8A 3TODA 4IO4A 4KHZE 4EXKA 1DPPA 4FAJA 4FJPA 4GQOA 4ESXA 3TAJA 4YMAA 3BKIB 2V25A 2OCUA 3B6WA 2B3FA 3T9VA 1TT1A 3FJ7A 5JTYA 2NUVA 1P1NA 2Y7RA 4X48A 2CMOA 1BLFA 1PB7A 2F8DA 3CI8A 3OEKA 1EU8A 2UVIA 3T9HB 3CVGA 2O1LA 2F5XA 4C1TA 1SDXA 2PYYA 1M5DA 4KYDA 5H8QB 3T96B 1B7HA 2F7BA 2XXQA 2ONRA 1PBPA 4IGRA 3IAZA 1MY3A 3PPOA 3VLUA 3LR1A 3VVDA 3KN8A 2F36A 3O2AA 4F22A 3KOSA 3TEPA 1PEBA 3HHGA 4OXVA 3W15C 3K1MA 3ILUB 4JSOA 3IORA 4ZEBA 5IKBA 4G8MA 5L8DA 1M5CA 5CMCA 3VXCA 1MDP1 1Z7ME 2I58A 5I2NB 3T66A 1S50A 4I9DA 1AIVA 1FQFA 1MXZA 2ANJA 3CIJA 4ZZEA 3IOWA 2DWJA 3IR1A 3KJTA 1TFAA 3U93A 3G3KA 3GXAA 4ZZAA 4E0WA 4KFQA 1HSEA 3MWBA 2OJTA 4OFOA 1IITA 2REJA 3C32A 3IOVA 3K6WA 4QSDA 3OO9A 1O7TA 3S9MC 3MJNA 1FQCA 4QFLA 3V89B 3E3KA 1PC3A 1ATGA 3TTNA 5KCJB 4G8HA 5AA3A 2Q2CA 3FASA 4GL8A 3AXFA 5B70A 4YB5A 1AH5A 4EDPA 4F18A 3LSXA 4OESA 5H8QA 4EXLA 3MUQA 4MH5A 3R6UA 3OO6A 1DOTA 1I6AA 2Y7KA 1L5TA 1VR5A 3T9XB 1OIBA 4QF9A 4QFPA 1ZLQA 3CFLA 3O6IA 4U23A 5H8FB 3VDFA 3C9HA 3FJMA 1MPBA 2XXIA 1LFGA 3EHSA 3VLVA 5L9SA 2I4CA 1JW1A 1US5A 1Q35A 3KGCA 1DPEA 5I2NA 2D3IA 2F6PA 4O3CA 1B3EA 5CI5A 1N7WA 3OO7A 4RY1A 3DM0A 3HSTA 1XT8A 1Y3QA 2OZZA 1NNTA 3ECRA 4NF8B 1LFIA 2X7PA 3S9NC 1UTHA 2HFBA 4ZECA 3TTLA 3MZ1A 2X26A 3RY3A 4BDRA 4DXUA 5H8HB 5CBSA 1I6BA 2P1SA 3RGYA 1JW4A 4P0IA 2HAVA 2Z22A 4WEDA 2DXRA 3C35A 4XKPA 4FEDA 1SYHA 1UQWA 1TXFA 1B58A 2REGA 2R6GE 3C34A 3IJOB 4ZE8A 1MDQA 3RN8A 4UA8A 2Z23A 3IOUA 5KCJA 2H25A 1FQBA 2VD2A 3TDJA 3TCFA 5DT6A 3SEUA 2O7IA 2RC9A 1RYXA 1LBCA 4EQ7A 3A3CA 3B6QA 1B3HA 3KFMA 5DVJA 4ZEFA 4F3SA 4R2FA 4GL0A 1SI0A 1Y4CA 1ZTYA 3VVEA 2F35A 4HTGA 4R2BA 3LSLA 1R9LA 1KWHA 4ESWA 5L9MA 1XVXA 4BDNA 2VGQA 3PUXE 1DMBA 3PD8A 5DVFA 3FUZA 4PFWA 1EZ9A 5I58B 4LZ7A 3KN3A 3C4MA 4R73A 4EQ9A 3TELA 2H4IA 2DYXA 4I62A 1LAGE 4H5FA 3JZJA 3BBRA 3SEVA 1B9JA 1UTBB 5DEXA 5EHSA 4GRKA 1R1NA 2O51A 4TQUQ 2XXTA 2I4BA 4F31B 2DE2A 4TOZA 4YMBA 1IXIA 1B7ZA 1RYOA 4LZ8A 4Q5TA 3EHTA 3IX1A 3FATA 4R6YA 4ZEDA 3K02A 4G68C 2PVUA 1H43A 3TUSA 4GIZA 4NF8A 3H03A 3OXNA 4OQOA 1MPDA 2YPNA 1P1OA 3GBAA 5CMMA 4THIA 5H8HA 3KG2A 1TFDA 4RPOA 5H8SA 2UXAA 2A5TB 1ZU0A 3G7WA 1Z7NE 3H6WA 1Y4TA 4QFKA 3DLNA 4RK9A 3N26A 3PPPA 4RJZA 3ILTB 3K2DA 2H9BA 4G77A 1M5BA 1NNKA 2ZYOA 3OELA 2Y7PA 4ZS9A 1JVYA 4U1OA 2XXPA 3GZGA 2RKMA 4P0GA 5FHNA 1N3XA 4FE8A 1URGA 3KJ7A 3RPWA 3MAMA 3PUZE 3TFLA 4NF6B 1B1HA 4EUOA 1B51A 1B5JA 1LGBC 5J1DA 3PMVA 1M5EA 1SW5A 3KBRA 3IO4A 1B6HA 5AA1A 4JWOA 3FVOA 3A09A 2YLNA 3BFUA 2GHAA 2FA7A 5TP9A 1H44A 3SESA 4BDMA 2UVHA 1PB8A 1SD3A 2O68A 4NWCA 2XX8A 1SW4A 3C36A 2ZYKA 4BDLA 2HCAA 1MQIA 2G29A 4IO5A 2HXWA 5CM6A 5F1QA 5ITOA 1LB9A 3E4RA 1MH4A 2UVGA 4IO6A 3FVKA 3PPQA 5FTHA 1LSTA 4I8CA 3K6UA 4MFIA 1II5A 2QMWA 2I6EA 1NNFA 5IAIA 3PMXA 4YKKA 2OBGA 1JQFA 4PFUA 2P0SA 3LSWA 1CB6A 4POWA 3UK4A 4RXLA 3UIFA 4BDOA 4KYEA 3A3UA 2NWJA 2IEEA 1IUDA 2RCBA 4H1XA 1O64A 5CMBA 1QUKA 3VLWA 3TCHA 4QSEA 5KDTB 4PETA 5ITPA 4G8NA 3ZKKA 1OMPA 4OFLA 5AE4A 2QS4A 1OLCA 4NF5B 3H6TA 2D21A 1GGGA 1B5HA 2QL3A 4RA1A 3EF7A 1XHYA 4O3BA 4OEUA 1B46A 3M3KA 5AA2B 3CRBA 1B40A 1P1WA 4GLIA 3SEYA 4MF3A 3O9PA 2DWHA 1NNPA 3S4UA 3RTFB 1MH3A 4JBZA 3EQ1A 3PPRA 4NF6A 3RNNA 1N76A 4F2OA 4P11A 1FTJA 3HN0A 3L6HA 5ICQA 1MXUA 2VP1A 3PUYE 1B4HA 3KSXA 4GD5A 5ICTA 3R7XA 1HSLA 1Q1KA 2PX1A 2PT2A 1NMUA 2NXOA 3H3GA 4G4PA 5A5XA 3U8QA 4HCYA 2OWTA 3VXBA 1AL3A 1GV8A 3SEWA 4DCYA 1B0LA 5I2KA 2GRVA 3IK6B 2O7UA 3PGFA 1MQHA 5EHMA 1GTKA 2Q9TA 5ISUA 3ODBA 2BJJX 1OVTA 4LONB 1P99A 4H8IA 1IEJA 5AA2D 2VOZA 2RC8A 3N6UA 1R6ZA 4BDQA 3TTMA 2XXRA 5B7DA 5I56B 4RK2A 5BWJA 3FVGA 3OO8A 1USYH 2H5YA 1H45A 3M3LA 1UIVA 1B2HA 4ONYA 4KYSA 3MZBA 4DDDA 3DP6A 3V8XB 4LQ5A 1NL5A 5TPAB 5M2VA 1B32A 1YAEA 1M5FA 1I69A 4YKIA 1AMFA 3KOTA 5TU0A 3LC8A 4DCXA 1S9TA 3K1PA 4XIGQ 4NF5A 1JEUA 3N6TA 3N5LA 3CG3A 3HO7A 1PB9A 3S9LC 3OMBA 1LCTA 1OVBA 1JNFA 4F39A 2Q8JA 3QK6A 3FVNA 4GWOA 3K4UA 3QUJA 2O1MA 2O69A 3MVWA 5CRYA 4ECFA 2B65A 3IL1B 3KEIA 4RYAA 1FCKA 2O6AA 3QYTA 1FTKA 2V84A 4HCWA 2FYIA 4OENA 2VHAA 2DSFA 2QRYA 1FTLA 4R72A 3OSRA 3S9EA 3LUYA 3TTRA 3EPEA 3R26A 2HZLA 1BKAA 1DTGA 4E0XA 3L6GA 4YZZA 3MVZA 1MY0A 3OOAA 4ELPA 1QULA 3FZVA 4KI0E 1XOCA 2F7AA 3B7DA 4O3AA 4OTEA 5DTBA 1VFEA 1FW0A 3U72A 3UN6A 4GF8A 4U4SA 4NF4B 5I56A 3N94A 2XXVA 2Z8DA 3CSBA 1POY1 3TMGA 3HV1A 4LVQA 2I0CA 3O6HA 4LATA 4WKMA 3IB1A 5HM4B 4R9FA 2DS9A 3QSLA 4XKRA 4F3BA 2F7CA 4ELRA 3SERA 4U1ZA 2P2AA 1MM7A 3H6VA 1Y9UA 3V5AA 4K3FA 2HZKA 4MLQA 1WDNA 2E1SA 3JV9A 3PUVE 3RUMA 2H98A 1FTMA 4N6PA 3O29A 4GXSB 4PQJA 4ZE9A 4H6DA 4IB2A 1B3LA 4QSCA 4TLLB 2Z8EA 3B6TA 2UVJA 3HPIA 4QFOA 1J1NA 3G3IA 5AA4B 3CG1A 5H8FA 4G68B 5I59B 4F1YA 4Z0IA 1AOVA 3FGSA 2HAUA 2M8CA 3USDA 5CC2A 3O97A 3FV1A 3I6VA 1QKBA 4GXAA 2ALUA 3IB2A 5CMKA 2GH9A 3TYHA 1ZBMA 1EZPA 4MLVA 3Q26A 1GVCA 5FHOA 1B4ZA 3WAEA 4U22A 1YCJA 1Y3NA 2NVUB 4F29A 5JTYB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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