3DP6A

Crystal structure of the binding domain of the ampa subunit glur2 bound to glutamate
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Structure of the S1S2 glutamate binding domain of GLuR3.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 85
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-07-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dp6A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dp6A02
2ONRA 3PD8A 4ELQA 3DP6A 3SERA 1R9LA 3C31A 1EZOA 2GHBA 4LVQA 4R6HA 4AB5A 4YB6A 2O51A 1JW4A 1F9BA 3IOTA 4LONB 1MDQA 2V84A 3QIMA 3SETA 2GHAA 3PPPA 5I56A 3TYHA 1IIWA 1XS5A 2XXHA 3FV1A 1LSTA 3OO8A 1MPBA 2Q89A 3EHTA 3OEKA 3V8XB 3G7WA 4GRKA 4I62A 4X1DA 5AA1A 4Q0CA 1QULA 3JV9A 5AA2B 3O97A 1DPEA 1MXWA 2P1SA 3CFLA 5H8FA 3IJOB 2AIXA 4TOZA 4KD5A 5BWJA 3GZGA 4G4PA 4JBZA 2DSFA 3IO4A 3SESA 1FTOA 1D9VA 5KCJB 1USYH 3K1PA 3MQ9A 4I9DA 2VGQA 1Y20A 2F78A 4PFWA 4N07A 3R7XA 1UIUA 3FASA 1RYXA 4KQPA 3M3KA 1NNPA 1FCKA 4YB7A 3RLFE 4C1TA 3IOVA 5DVIA 5CBRA 1GGGA 1N3XA 1N04A 1NNTA 2F97A 4WEPA 3GBAA 1BTJA 4H5GA 3ZKKA 3R6UA 5K2YA 2R71A 4WXJA 1LGBC 3UK4A 1ELJA 2AL4A 3CFZA 4MLQA 4IY5A 4FORA 2OJTA 2Q9TA 1OLCA 5I57B 3W9WA 4BDRA 3UA8A 1MY1A 2XX9A 4LP2B 1SW4A 3TCHA 1BKAA 4OQOA 3CI8A 3L6GA 4ESXA 3LC8A 1QKBA 3LSFB 4WEDA 3T9HB 3KJTA 4ELOA 3LSXA 2OWSA 3OENA 4XKPA 3N6UA 4EXKA 1URGA 2XXVA 3K6VA 5FTIA 3PUVE 1YCJA 3UORA 5BUUA 1SVXB 4BDOA 1EU8A 1AIVA 1IXCA 3EHSA 4YU0A 1MQIA 2F6PA 1UTHA 3W15C 5L8DA 3FV2A 3HHFA 3G3IA 1IXGA 1IQ7A 2I4CA 4DXBA 2O1LA 1HSLA 5I2KB 3K4UA 3A09A 3MZ1A 3PV0E 2IEEA 1MXVA 1Y3NA 1MXZA 2M8CA 2VP1A 4JWOA 4OENA 5L9SA 4PFTA 3KN8A 4X9TA 3BFUA 3MC2A 3TEPA 3I6VA 3VVEA 5M2VA 2PVUA 3SDFA 2UYFA 3U72A 4NF8B 3GLBA 1OVTA 1MRPA 1QUJA 2YPNA 4E0WA 1H45A 4LQ5A 5HPQA 1DOTA 3KN3A 4G2ZA 1J1NA 4OFJA 4R2BA 4H8IA 3CVGA 5A5XB 2Y7IA 1FW0A 5JK4A 2HCAA 4EDPA 3PUXE 1P1OA 1CB6A 1YPNA 3IORA 4L17A 2NXOA 1Y4TA 4HTGA 3G3JA 4G77A 3SEVA 1MH3A 3MVYA 4I1DA 3N94A 3D4CA 4FAJA 2YLNA 3WAFA 1KWHA 1NNKA 3MPLA 3ZSFA 5H8HB 4KYSA 2B3BA 2VD2A 1Y1MA 2RINA 2ZYOA 1PB9A 2XD3A 3FGSA 3OD7A 3PPRA 2O6AA 1OQHA 3OOAA 2ONSA 3S9EA 1O63A 5FHNA 1JETA 4NF4A 1I6QA 4U2RA 2PYYA 4PFUA 4KFQA 4G68B 3MVZA 4NF5B 1LFGA 4F3BA 2XXPA 4LUBA 4H65A 4TLLB 4FATA 2XXUA 5AA2D 5H8QB 4P0IA 1TXFA 4F1YA 4IO3A 4N13A 4PE5B 1OVBA 4IO6A 2UVJA 4YKKA 2Q2AA 4JWYA 1R1NA 2ZMBA 4O3CA 4NF6B 4EQ9A 3R26A 3QUJA 3H4ZA 4O3BA 4OFLA 4H1XA 5AE4A 1POTA 4HS7A 1NMUA 3DP8A 2QS1A 3TUSA 1ZU0A 3TQWA 1P1NA 4MBPA 5JTYB 1B5JA 1P1UA 1M5EA 5H8NB 1B0HA 3UIFA 4FEDA 4Q5TA 3K01A 4U1OA 2NUVA 1FQDA 3A3CA 3CRBA 4P11A 2RF1A 4R2FA 2V93A 4OEVA 1B6HA 4F2OA 2H4IA 4GWOA 4IGTA 1RYOA 1B3HA 3VE1B 2Z22A 3PMVA 3FVNA 2Y7KA 4G8MA 2GRVA 2I48A 3FJGA 2XXIA 3L6HA 4F18A 5IAIA 4ECFA 4XKNA 3TCGA 2D3IA 1GR2A 4IO5A 4IB2A 1A7LA 2I49A 1M5BA 4U22A 3M3LA 3MZBA 2V25A 1FTKA 3PGFA 1US4A 3Q28A 1SD3A 3FJMA 1B7HA 4HCYA 4DCYA 3CSBA 1S9TA 2E1SA 3TZAA 1AMFA 2XHDA 3DM0A 1UIVA 3MZ9A 5L9OA 4RXLA 2Y7WA 1P1QA 1Z7NE 2Q88A 2ONKE 1PC3A 4E0XA 1B3FA 2V3UA 3HN0A 2PMSA 5I57A 1HSJA 4OESA 4BLAA 5KZTA 1ANFA 1A8FA 3A3UA 3QAXA 4F3SA 3FXUA 3H6WA 2F35A 1ZIUA 2RKMA 4ZDMA 4KYDA 1LB8A 4UA8A 4ELPA 4AQ4A 2Q8JA 4HCWA 5DEXB 3CG3A 5I84A 4F1VA 3MP8A 1MY3A 2O84X 2D5WA 5FHMA 3EN3A 2RCAA 2O1MA 3HV1A 5I2KA 2I3WA 3PUYE 4ZZAA 1H43A 4XKQA 2XX8A 1FQAA 1SYHA 1Y4CA 5F1QA 2RCBA 4Z7EA 4YB5A 4F2QA 1DPPA 2H25A 4NF8A 3MBPA 4Z0IA 3KG2A 4IGRA 3LSLA 2QL3A 3VLWA 4AB6A 2ESNA 5A5XA 2R9JA 4KI0E 1NH7A 4QSDA 3N6TA 4ISUA 4JXIA 1WVJA 5TPAB 4EXLA 2V3QA 3OMBA 4KPTA 3K1MA 4JB7A 1MY0A 4GVOA 5KDTB 3VVDA 3TCFA 1MPCA 4G8NA 4Q8RA 2E0SA 3IO6A 3C9HA 5ITPA 2H5YA 3MW0A 3TTMA 3FD3A 2HZKA 3C34A 3P7IA 5H8HA 4ND9A 5CBSA 1Y1ZA 3ZS6A 3IOWA 4QRZA 2FYIA 1XOCA 1ZTYA 3QSLA 1USYE 3HHGA 2DWAA 1MM6A 3LR1A 2XX7A 3O6GA 1B3EA 1MXYA 4G68A 4NF5A 3SEUA 5F7VA 3U92A 3MVWA 5CC2A 4NMYA 5EYFA 3Q26A 4DDDA 4H8JA 5H8QA 2ABHA 4ZE8A 4OVJA 2F34A 4DXUA 4QF9A 2B3FA 4FJPA 3EPEA 4NF6A 4JSOA 3SEWA 5H8SA 2H99A 2A5TB 3S4UA 3TTLA 3TFLA 2D21A 4X1BA 4F29A 5I59B 3CSGA 2O69A 4KHZE 3O9PA 5HM4B 1HSEA 1UTBB 3MAMA 1MG1A 3T96B 3LUYA 5JTYA 1FQCA 2IA4A 5H8NA 1OIBA 3IJXB 3V89B 5B70A 1QW0A 1QJMA 4DLDA 2ZNSA 4MH5A 3TTKA 4YKPA 2V3TA 1B9JA 1ZMGA 4BDMA 1LBCA 1EZ9A 1QKAA 5I58B 4C0RA 3O6IA 4FEBA 1ATGA 3DP4A 3O6HA 4QSCA 1URDA 3VXBA 2XXXA 2P2AA 5DT6A 3SEYA 1B0LA 1ZBMA 3WAEA 4QFNA 3K1NA 4I8CA 3PU5A 4OEUA 1B4HA 4OXVA 4XKRA 2RC7A 1Y9UA 1N76A 1I6AA 1N3WA 5FTHA 3BBRA 5AA4A 2XXQA 4EQBA 4DE8A 1IXIA 3E3KA 1NKXA 2QS4A 1N0TA 4ZEBA 4K3FA 2O7IA 2HXWA 4GFRA 2ZYMA 3CR9A 1BIYA 2P0SA 3VDFA 4RPOA 4YKJA 3PPOA 4NEDA 3U1OA 2XXRA 3TELA 2XXYA 3K2DA 2G29A 4U21A 1LAXA 1FTLA 1B40A 1SW1A 3KOTA 1B3GA 4IO4A 2PBWA 5CI5A 3TTRA 4ZEKA 2VOZA 3K6XA 5H8FB 3RY3A 1NFTA 1LAGE 4M4GA 2NOOA 4LZ5A 2A5SA 3GXAA 1B05A 3H03A 3PPNA 3B6QA 4ZEFA 2QMWA 3QYTA 4LA9A 5DEXA 4M1VA 1TWYA 2REJA 4OYVA 3DLNA 4FE8A 4LZ7A 1P1WA 2Q2CA 2GFEA 2VD3A 4C1UA 1S50A 2I6EA 3H6VA 1A40A 4RJZA 1TT1A 1SYIA 2QSXA 4OZ9A 1MQHA 4FECA 1FTJA 2O7UA 3QK6A 3CIJA 1TFAA 2WKYA 1SI0A 3MP6A 3C4MA 1Q1KA 3BKIB 3IK6B 4GL0A 1D4NA 2OLBA 4HW8A 1VR5A 4YMAA 1H3DA 3RN8A 5DYHA 4RA1A 1VE4A 2QRYA 5EHSA 4U1ZA 4LZ8A 1A54A 1AOVA 4F3GA 3KFMA 4N6PA 2DWIA 1LCTA 3OO6A 2F5XA 2I0CA 3TAJA 1LBBA 3M3FA 4WKMA 1NH8A 1MQJA 5CMBA 1I6BA 5J1DA 3SKPA 1B2HA 5TPAA 3KEIA 3KSJA 2QS2A 1UQWA 3KN7A 5AA2A 1DTGA 5KDTA 1MXXA 2DE3A 1B4ZA 2QPQA 1T0KA 4JDFA 3B6TA 4OMBA 3T66A 3EF7A 4YZZA 1R6ZA 3T9XB 4MFIA 1LB9A 3ILTB 4NE4A 1WODA 1LAHE 4G8HA 1JW5A 4POWA 1JW1A 5KCJA 3G3FA 1B7UA 2ZXTA 3PUZE 3HO7A 2Z8FA 3H3GA 2DVZA 2HQ0A 2YJPA 3G3KA 1LLSA 2HAUA 3MJNA 4Q30B 4OHNA 4R6KA 4H0WA 2XXWA 1JVYA 4OFOA 2KLFA 1IUDA 3LSWA 4BDLA 2F7BA 4QFOA 3U93A 3FUZA 4YMBA 1MY2A 4EF1A 5I2NB 4RK9A 5DTBA 2Y7RA 5ELVA 2A5TA 3FXRA 4U23A 3K6UA 1H76A 4QFLA 3UP9A 2QJEA 3JZJA 4IO7A 4TLMB 4R75A 2H9BA 4R9FA 3VV5A 1MH4A 5ISUA 2VHAA 3MUQA 4F19A 3PMWA 4MF3A 5LOMA 1PBPA 3VVFA 3K6WA 3OSQA 4OETA 2OWTA 5CMKA 2RC9A 3OO7A 2ALUA 2UYEA 2HFBA 3KOSA 1XT8A 2CZLA 3AXFA 1MPDA 2X26A 4PETA 1IITA 4XIGQ 1B5IA 1GVCA 1JQFA 4LATA 2PT1A 4GIZA 3H6UA 3RT6B 1LFIA 3RGYA 5FHOA 3O66A 3M8UA 4GQOA 4KCCA 1VFDA 3T22A 2XD2A 4FIMA 4U4SA 1NNFA 2UVIA 4F22A 4H67A 1P99A 1Y3QA 1B1HA 5B7DA 4X48A 3OEMA 1JVXA 1PB7A 3GBBA 5L9MA 3C36A 3FIRA 3IX1A 3K0VA 1N7XA 4ONYA 1M5DA 2OCUA 3N26A 1QVSA 4PP0A 3I5OA 3FVGA 1MQGA 3DELB 3S9MC 1FQFA 1B5HA 1SDXA 4YKIA 1R9QA 1DTZA 4YICA 1ZLQA 1JEUA 2REGA 2UVGA 5DVJA 1B7ZA 3B6WA 1AH5A 1B32A 3OSRA 3U8QA 4H6DA 1AL3A 2PX1A 5DVFA 3N5LA 4OTEA 3IAZA 3W9VA 2QS3A 3QUFA 3VLUA 4XTCQ 2DXYA 2F6GA 3JYRA 1QUIA 2CMOA 3K02A 4ZEIA 1H44A 3THIA 1FTMA 2ANJA 4KR5A 1URSA 2PT2A 1MDP1 1MS7A 2Z8DA 4R74A 1JNFA 3OELA 4NTLA 5EHMA 3EHUA 3TPAA 3IR1A 3MPKA 3I3VA 3IOUA 1ZKBA 3TMGA 3HSTA 1LFHA 3H7MA 4KCDA 3HPIA 4ESWA 3KZGA 1XC1A 4LQ2A 2FA7A 4QFPA 1IZ1A 3RPWA 1US5A 1PBQA 3ODBA 5IKBA 3O28A 4P0GA 3G3HA 3RUMA 2XXTA 1PEBA 1YTVA 3IB2A 2OZZA 2DE2A 3D4GA 2ZNUA 4JWXA 3CG1A 3KBRA 3S2VA 4JSDA 1N84A 4DIGA 1LAFE 3RT8A 4F3PA 2G93A 3T9UA 1LCFA 1N7WA 5TP9B 2HEUA 1OQGA 4PFYA 5CM6A 2DE4A 3TODA 3BFTA 3MWBA 2F36A 3OXNA 1Q35A 1M5CA 1GV8A 3VFJA 3MP1A 2I58A 4ZE9A 4EUOA 3TDJA 1EZPA 1MQDA 1SW5A 3HCQA 5HBCA 2ZNTA 4F39A 5AA3A 2Z8EA 3RTFB 3Q27A 2X7QA 1SI1A 4QFKA 2HAVA 2Y84A 4ELRA 5I2NA 1OMPA 5I56B 1WDNA 3CFXA 4DXCA 5CMCA 3S9NC 2BJJX 1B52A 2H98A 3E9XA 1L5TA 2GH9A 1GTKA 3TTNA 1D3KA 1DMBA 1MXUA 2W7YA 3KJ7A 2X7PA 1CE2A 1POY1 3KGCA 4KYEA 3T93B 4DZ1A 4OERA 2DP8A 1PDAA 4IY6A 1MY4A 3LBSA 1XVXA 2QMXA 1NL5A 4R72A 2OBGA 1D9YA 3KSXA 2FNCA 3K00A 4F31B 2B65A 3ECRA 3V83A 2RC8A 4TQUQ 3V5AA 4GL8A 1FQEA 3MVXA 4RY1A 2AYSA 4GXAA 1B58A 1M5FA 3UGWA 5ICQA 1XHYA 5K2XA 1B3LA 2LAOA 4BDNA 3ONMA 1IXHA 1XVYA 4RNSA 5TU0A 1JEVA 4RYAA 4G68C 4YAHX 3PPQA 2R6GE 2F8DA 2DS9A 3FVOA 4R6YA 1EH3A 3C35A 2Z23A 1Y3PA 4U4XA 1IEJA 3ZKLA 4EQ7A 1B46A 3VXCA 3UN6A 3EQ1A 1S7YA 1B51A 4THIA 1O64A 4ZZEA 1SW2A 4R9GA 1A55A 3B7DA 1BLFA 3PUWE 3RTWB 1BP5A 4O3AA 5CMMA 3RQTA 2DWHA 3O2AA 3SEXA 4RPNA 4RK2A 4ZEDA 2DVCA 2DYXA 3FZVA 4ZECA 4GOTA 3RNNA 1I69A 1UTHB 2DOJA 4XXUA 3O29A 2OK2A 4DCXA 5CRYA 1MM7A 2Y7PA 4UACA 4NWCA 1II5A 3TKDA 1VFEA 2F7CA 2HZLA 3PD9A 1PB8A 1O7TA 3FVKA 2DQVA 3OO9A 4POXA 1FQBA 3FXQA 4IO2A 5ITOA 2ZYNA 5AA4B 3C33A 4QHQA 4EF2A 1Z7ME 4GXSB 4BDQA 1A8EA 3USDA 2O68A 1OLAA 1DSNA 3T9VA 2AL5A 3H06B 3G3GA 2F7AA 3E4RA 5I59A 3IB0A 2DWJA 3IL1B 2I3VA 1RKMA 4H5FA 1UTBA 4QSEA 3FJ7A 4OWDA 4ZS9A 3Q29A 3ILUB 1B1XA 4NWDA 1QUKA 2NVUB 1SQYA 3TQLA 4GF8A 2THIA 4F1UA 1A99A 3QXMA 3IB1A 4PQJA 3S9LC 3PMXA 4MLVA 3C32A 5JEIA 1VSOA 2NWJA 5TP9A 2UXAA 5I58A 4GD5A 4R73A 1SBPA 1ZJLA 1TFDA 3VLVA 3FATA 3Q25A 1YAEA 2ZYKA 3E13X 2I4BA 4NF4B 2I0BA 5ICTA 2UVHA 4GLIA 3H6TA 2DXRA 3U94A 3F11A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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