3DP6A

Crystal structure of the binding domain of the ampa subunit glur2 bound to glutamate
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure of the S1S2 glutamate binding domain of GLuR3.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Signaling protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 85
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-07-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dp6A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dp6A02
3EF7A 3R7XA 1MY3A 2KLFA 4ZECA 1ANFA 1R1NA 1Y3PA 3PMVA 3B6TA 4ZS9A 2ONRA 2V3QA 1NNFA 1FTOA 2QS2A 4WEPA 1DPEA 1YTVA 2Q9TA 2H5YA 4F19A 1EZ9A 2QMWA 2RINA 4Z0IA 2QL3A 1Q35A 4OFOA 4DXCA 2F97A 1LAGE 4N6PA 5EHSA 5H8SA 3GZGA 4EQBA 4RXLA 1B4ZA 2PVUA 4OENA 1B2HA 1US5A 3RGYA 3USDA 3PPNA 2DVZA 1SBPA 3FJGA 2F6PA 1R6ZA 2B65A 4JB7A 4JBZA 3KN8A 4TQUQ 1S9TA 1B58A 1P1OA 3TDJA 3DELB 3VFJA 2DWIA 3CI8A 1ZBMA 3O6HA 3VE1B 2XXXA 3UGWA 3TEPA 5L9MA 3WAEA 3T22A 3THIA 4G8HA 5K2XA 3N6UA 4F29A 2ANJA 2XXRA 4OZ9A 1MXVA 4LONB 1IXIA 4JWOA 3IAZA 1MPCA 1PEBA 3OO6A 2GH9A 2XXTA 2Y84A 3ECRA 3K1MA 1TFDA 3H3GA 1LSTA 4LQ2A 1F9BA 2X7PA 5DEXB 4ZE9A 2F7CA 1NL5A 3HV1A 3SESA 4DXBA 2CMOA 4OWDA 5TP9B 4L17A 1B6HA 3KGCA 2ZNUA 1R9QA 3FV2A 1B51A 4OYVA 1IITA 1R9LA 4UACA 1EU8A 4X48A 3MVXA 4XTCQ 5H8FB 5ISUA 3QK6A 2Y7PA 4DXUA 2OLBA 5EYFA 2FA7A 3O9PA 5TPAA 5AA4A 3SEYA 4AB6A 5CBRA 3P7IA 1POTA 1MXUA 3PMXA 3KJ7A 5JEIA 4DCXA 4YB5A 2F36A 1Y4CA 3UP9A 1DTGA 1URSA 4BDOA 3GBAA 1LBBA 4YB6A 1XHYA 3H03A 1DSNA 1A8FA 1QKBA 3KZGA 2XX7A 3TTRA 3UA8A 1FW0A 4LA9A 4QSDA 4X1BA 4HTGA 4ZEBA 4PE5B 3K01A 3C31A 4F18A 2QSXA 3MVZA 3QAXA 1B3HA 1PB9A 4YKPA 4ZEDA 2ABHA 4M1VA 1GV8A 3E3KA 4NF8B 5FTIA 4RJZA 2NOOA 4NEDA 3T93B 5KDTB 4THIA 2H98A 3EN3A 4R6HA 3FJMA 3IR1A 3K6VA 3C9HA 4F31B 3L6HA 1MH3A 1UIVA 2HAUA 2UYFA 4YKJA 3N6TA 4EF1A 4U21A 4PQJA 5LOMA 1ZLQA 4EF2A 3CRBA 4XKQA 2B3BA 3W15C 4ND9A 1M5CA 1EH3A 1GR2A 3IB0A 1EZOA 3W9VA 4DE8A 1O64A 4FJPA 1QVSA 4RNSA 4RPNA 3MJNA 4H65A 3G3KA 2HCAA 3QYTA 1B7HA 4PFUA 3VV5A 2UVJA 5CRYA 2F7BA 3KEIA 2Z23A 1Y3QA 3I5OA 2A5SA 1TFAA 4NF5B 1BLFA 3TQLA 4PP0A 4KQPA 3VLWA 3RNNA 1M5FA 1A99A 4NF6A 3QXMA 4MFIA 1UTHB 1IEJA 4C0RA 2PBWA 3VXBA 2ONSA 3K02A 1B1XA 2ZYOA 1P1WA 2OK2A 3DP4A 5B7DA 4GL0A 3EPEA 5H8QA 1MPDA 4YZZA 2WKYA 1M5BA 3WAFA 3VDFA 5I59B 3H7MA 3RN8A 2XXVA 4KHZE 1IUDA 3HO7A 4JWXA 5L9SA 2DP8A 3U93A 2D3IA 4NTLA 2P0SA 1I6QA 2DS9A 4ONYA 4KR5A 1NNTA 1WODA 1A7LA 2O68A 5I56A 1P1UA 3TCGA 3SEXA 3CG1A 1NH8A 2ALUA 1RKMA 1FTKA 4G8MA 3HPIA 1DOTA 1USYE 2I0CA 3K1NA 1H43A 2GRVA 4E0WA 3KN7A 4XKRA 3ZKLA 3V83A 1B9JA 4XIGQ 1FTMA 4GRKA 4M4GA 4GOTA 4WKMA 4G68B 3RLFE 4HCYA 4H8IA 1MDQA 4G2ZA 1A40A 2Q2CA 1PB7A 3KSJA 3MWBA 3LSWA 2YJPA 5HBCA 4QFLA 4DIGA 1PC3A 1DMBA 2H9BA 4GXSB 4FIMA 2OWSA 3PD8A 3I3VA 1B3EA 5ITPA 3A3CA 1CB6A 2E0SA 1N84A 2PMSA 5ELVA 2Y7WA 3V5AA 1B1HA 4G4PA 5IKBA 2GFEA 1AH5A 4ECFA 3HHGA 2YPNA 4ZZAA 2V84A 4QSEA 3FUZA 2XD2A 3E9XA 1BKAA 3JZJA 1AMFA 3CSBA 4YAHX 1N3WA 2UXAA 3K0VA 2QS1A 4GLIA 4BDNA 2Z22A 2QMXA 2ZYNA 3B6QA 2HXWA 4XXUA 4KD5A 3HN0A 4YU0A 3ILUB 2DWAA 4OQOA 1MXYA 4POWA 1OLAA 2IEEA 4KYDA 3JV9A 3RT6B 5TU0A 3LUYA 4P0IA 4U1ZA 1TXFA 4Q8RA 2DWJA 3C34A 3TTNA 1QKAA 2O7IA 3GBBA 1MG1A 3PUXE 1VE4A 3MBPA 1PDAA 4TLLB 2NWJA 1FQBA 5AA4B 3IOWA 1NKXA 3KG2A 3O66A 2ONKE 5CM6A 1MXXA 4IO4A 2DXRA 1VR5A 4IGRA 4WXJA 5H8NB 2I4BA 4LUBA 4JWYA 4UA8A 1Z7NE 4JSOA 3O29A 2O51A 1H44A 1LFIA 3RY3A 5BUUA 1ZTYA 3K00A 5A5XA 2PT1A 4U22A 4JXIA 1Q1KA 4G8NA 1Y1ZA 3BFTA 5H8HA 1PBPA 1MPBA 4F2QA 4KYSA 4EXLA 4EDPA 2IA4A 3FZVA 3G7WA 3C4MA 3LSLA 4TOZA 1Y9UA 5AA2B 1MRPA 4MLVA 1LAFE 4R2BA 1IXHA 2AL4A 4OVJA 2DSFA 2PT2A 2ZYMA 1HSJA 1NH7A 1S7YA 4MH5A 3CFXA 3LR1A 4OEUA 1DPPA 1Y20A 3LSXA 1IXGA 3KJTA 4NWCA 3TPAA 1FQAA 3FJ7A 4Q5TA 3C33A 3PUYE 3G3GA 4IY5A 1LGBC 4AB5A 1H45A 4RYAA 2F7AA 2XXYA 4K3FA 3ONMA 1I6AA 3SEVA 1FCKA 2Y7RA 3FD3A 1MY2A 4HCWA 4U1OA 1ATGA 4PETA 4IO7A 3UIFA 1DTZA 2CZLA 4O3BA 4NF4A 2G29A 4JDFA 1M5DA 2QRYA 3TTLA 1UTBA 5DVFA 3S9MC 4LATA 1SYIA 4O3AA 3PUVE 5AA1A 4YMBA 2D21A 4OETA 1XS5A 3AXFA 4NF6B 2X7QA 4FE8A 3ZKKA 2X26A 1RYOA 3LSFB 3TFLA 3MZ9A 1JETA 4Q30B 3HSTA 1B5JA 5I2KB 4MBPA 1FTJA 5CBSA 3K4UA 3IB1A 4LP2B 5H8QB 2PX1A 4HS7A 4U4XA 1OVTA 2DE3A 3A09A 3L6GA 3RTWB 1MXWA 3KOTA 3ZSFA 1B40A 2AYSA 2VOZA 4KPTA 3S9NC 4LQ5A 3U92A 3PV0E 2OJTA 3MP8A 3T66A 3TAJA 4FORA 2HZLA 2FNCA 1KWHA 1B32A 1N04A 1B7ZA 3H6UA 4QHQA 3O97A 3OO7A 4TLMB 1IXCA 5I56B 5CMBA 2NVUB 4ZEFA 2Z8EA 3QSLA 2V3UA 3VVDA 3DP6A 2A5TB 1D4NA 3G3FA 4GVOA 1OMPA 2ZNTA 4KCDA 5FHOA 3MVWA 3C36A 2ZYKA 1MQGA 3VLUA 3MP6A 4JSDA 2F34A 4ZEIA 3TCHA 4HW8A 4H1XA 1II5A 5DEXA 3FXRA 4OFLA 4FEBA 4I62A 4R72A 3T9XB 3TODA 1Z7ME 5AA3A 5TP9A 4U4SA 1SYHA 5CMCA 3OEKA 3RTFB 3R26A 3SERA 3KFMA 2I0BA 1IQ7A 1XVXA 1OQGA 1S50A 1ELJA 4N07A 1SDXA 2QS3A 4EXKA 4RA1A 2I49A 1QW0A 4GXAA 3S9EA 2GHBA 5BWJA 4KYEA 1LAHE 2V93A 3CR9A 2PYYA 2LAOA 1JW5A 5M2VA 2VGQA 2UVHA 4GL8A 4R75A 1XVYA 4F3PA 1N7WA 3PD9A 4ESWA 2OCUA 3S2VA 4EQ7A 3M3FA 2RF1A 1J1NA 1ZJLA 3CSGA 1QUIA 3IO4A 2OWTA 5F1QA 2V3TA 1LCFA 4H5FA 1NNKA 2DWHA 4OEVA 3TTMA 1QULA 2XXHA 2DYXA 4NE4A 3DP8A 1URGA 3PPRA 5KCJA 4X1DA 4ELOA 2V25A 1B3GA 3TKDA 1D9VA 3VVFA 4OMBA 4ELRA 2VD3A 3OENA 2YLNA 3OMBA 5I58A 1M5EA 4R2FA 4I8CA 4F1YA 1XOCA 3IL1B 5HPQA 2QJEA 1O63A 4OERA 3U8QA 1B3FA 4NF8A 1MY1A 5KDTA 3CFZA 2QPQA 3MAMA 5EHMA 3H6VA 1QJMA 1CE2A 3TYHA 2W7YA 1BIYA 2R71A 2REJA 2H25A 2AIXA 4QFNA 1A55A 4NWDA 3PPOA 2I58A 4G77A 3T9VA 2DE4A 1SVXB 2I6EA 4F2OA 4GWOA 4LVQA 3CFLA 4POXA 3MP1A 4R6KA 4YB7A 3IOVA 2HFBA 3IORA 2D5WA 3DM0A 1WVJA 2OZZA 3S4UA 3H6WA 1AIVA 1SW5A 4Q0CA 3JYRA 3T9UA 5ICTA 3K2DA 4QF9A 4BLAA 2REGA 1BP5A 2ESNA 5FHMA 3EHTA 3IOTA 4MLQA 4NF5A 1PBQA 3UK4A 1D9YA 4FECA 3C35A 3O2AA 1Y4TA 4DLDA 3SETA 4QSCA 2RC7A 5FTHA 3MW0A 4XKPA 1FQEA 1B05A 4IO5A 4IB2A 1MM7A 1YCJA 4F39A 2P1SA 3RQTA 1N76A 2F5XA 1NFTA 1JNFA 4LZ8A 4DCYA 2AL5A 4F3GA 1JVXA 2THIA 3G3HA 5JK4A 3TTKA 1MS7A 3MZ1A 5B70A 4C1TA 4F22A 2XXWA 5I59A 3TMGA 4OXVA 1N3XA 4LZ5A 2G93A 3TZAA 1LBCA 1IZ1A 2ZMBA 4R73A 3T9HB 1GTKA 4NF4B 3QUFA 1Y3NA 4ZE8A 1MQHA 2I4CA 5TPAB 4RK2A 1UTBB 3Q28A 3FVNA 1A54A 3FASA 3LBSA 5KZTA 3EQ1A 3OSRA 1QUJA 1TWYA 3IOUA 3PPPA 1SI1A 4F1VA 3I6VA 1I69A 4OTEA 1B3LA 3RUMA 5CMMA 2F35A 4IO6A 3B7DA 1MM6A 4QFKA 1FQCA 3TUSA 1QUKA 3HHFA 4R6YA 1VFEA 4ELQA 5I57A 2NUVA 3H06B 4GQOA 3BKIB 3MZBA 3MVYA 1NMUA 4FAJA 5DVJA 3TELA 2I48A 4G68A 3PPQA 2RKMA 3RT8A 1LFHA 1XT8A 1LB8A 2Y7IA 3FIRA 3V8XB 1I6BA 5ICQA 4P0GA 3U72A 4IGTA 3ZS6A 3MPLA 4QFOA 1WDNA 3IK6B 3V89B 4ESXA 1POY1 3MPKA 3CVGA 2F78A 2FYIA 3IO6A 1SQYA 1URDA 2XX8A 3B6WA 4O3CA 1OLCA 5I2NA 2DQVA 2XXPA 1LB9A 1OIBA 3OD7A 3VLVA 2UVIA 4XKNA 4GFRA 2RCAA 1L5TA 3KN3A 3VXCA 4I9DA 4RY1A 4U23A 1AL3A 5JTYA 3O6GA 5I84A 2Z8DA 4ISUA 4YKIA 3MQ9A 4MF3A 2DOJA 2M8CA 4DDDA 3EHSA 4QFPA 3FATA 3CIJA 2UVGA 1VFDA 3MC2A 4IO2A 3D4GA 5CMKA 3PUWE 2HQ0A 4C1UA 2VP1A 2NXOA 2H99A 3RPWA 4PFWA 3IX1A 4GF8A 4PFYA 1JEVA 1JQFA 1MQJA 3H6TA 3SEWA 3SEUA 1JW1A 1ZMGA 4KI0E 3LC8A 2Q8JA 1P1NA 1MY4A 1AOVA 2OBGA 3O28A 1PB8A 3FVOA 3G3IA 3TQWA 1USYH 1LFGA 3M3LA 2XHDA 4ELPA 1TT1A 4E0XA 5H8NA 3UORA 2O84X 4KCCA 1B5HA 2ZNSA 3F11A 3UN6A 2I3WA 2H4IA 3O6IA 2DVCA 3FXUA 1N0TA 2ZXTA 2BJJX 4LZ7A 1YAEA 3C32A 1JEUA 1MDP1 2F6GA 3E4RA 2XD3A 3PMWA 4WEDA 4QRZA 2Q88A 3Q29A 3A3UA 1BTJA 5KCJB 4IO3A 4YKKA 1B7UA 4R9GA 4AQ4A 2R6GE 3BBRA 1B4HA 1XC1A 2Q89A 5I58B 4N13A 1RYXA 3FXQA 3S9LC 2P2AA 3KSXA 2O69A 4DZ1A 3OO9A 4I1DA 2RC8A 5AA2A 1B0LA 4GD5A 4R74A 3PUZE 3OXNA 3OSQA 2R9JA 2VD2A 1FQDA 4U2RA 3OOAA 3ODBA 3E13X 1VSOA 1UIUA 3OO8A 3HCQA 4NMYA 1SW4A 1FTLA 1GVCA 2HZKA 4RPOA 5L9OA 3H4ZA 2I3VA 4EUOA 4H5GA 2F8DA 5DTBA 3BFUA 5AA2D 1OVBA 4BDMA 3FVGA 3U94A 5DYHA 1OQHA 1B5IA 1MY0A 4ZDMA 3FV1A 4H67A 4YICA 4H6DA 1SW2A 3KBRA 3EHUA 1ZKBA 5H8FA 2E1SA 2O1LA 1HSLA 3MUQA 5J1DA 5HM4B 1SI0A 1ZU0A 1B52A 5F7VA 4EQ9A 1EZPA 2GHAA 2RCBA 5IAIA 3IB2A 2XXQA 2RC9A 1US4A 1JVYA 2HAVA 5I2KA 5L8DA 3VVEA 4F3SA 3GXAA 4OFJA 1UQWA 1YPNA 3CG3A 1MH4A 1A8EA 4ZEKA 3W9WA 3U1OA 3QIMA 5ITOA 3KOSA 4GIZA 3K6XA 2DXYA 3Q27A 5AE4A 4H0WA 4R9FA 3IJXB 3GLBA 2QS4A 3N26A 3ILTB 1JW4A 5FHNA 3M8UA 3N94A 1SD3A 3Q25A 2Z8FA 4G68C 1N7XA 3TCFA 3OEMA 2A5TA 5I57B 1FQFA 1LCTA 4X9TA 5A5XB 1P1QA 1IIWA 3M3KA 3FVKA 1Y1MA 4BDRA 4F3BA 2Y7KA 5CC2A 5H8HB 5CI5A 4YMAA 3IJOB 3Q26A 4KFQA 4FEDA 4OHNA 4F1UA 1H3DA 1ZIUA 4P11A 2Q2AA 3D4CA 1D3KA 1MQIA 2UYEA 1T0KA 4ZZEA 3SDFA 5K2YA 1NNPA 3FGSA 3PGFA 3PU5A 4BDQA 2B3FA 5DVIA 3OELA 1B0HA 1UTHA 1LAXA 2XXIA 4H8JA 1O7TA 5I2NB 2VHAA 2DE2A 1MQDA 4RK9A 3G3JA 3QUJA 2O1MA 4PFTA 4FATA 1HSEA 1H76A 1SW1A 3T96B 4IY6A 4OESA 2O6AA 2HEUA 4BDLA 5JTYB 3K6WA 2XXUA 5DT6A 1B46A 3DLNA 3K1PA 3K6UA 1LLSA 3R6UA 4Z7EA 3N5LA 2XX9A 1MXZA 3SKPA 1P99A 2O7UA 1GGGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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