3DP6A

Crystal structure of the binding domain of the ampa subunit glur2 bound to glutamate
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure of the S1S2 glutamate binding domain of GLuR3.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Signaling protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 85
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-07-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dp6A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dp6A02
1QW0A 1MM7A 1NNPA 3IOVA 3TDJA 3MPLA 2ZYOA 1OLCA 4RJZA 3ILTB 3PD8A 4JWYA 3A3UA 1AIVA 1FTKA 4OZ9A 3MP6A 2DOJA 1IIWA 2NUVA 2O1LA 3A3CA 4GRKA 2QMXA 4FEDA 3QK6A 3T93B 1OVTA 3P7IA 3SEWA 5H8SA 2ZNUA 3K6VA 4OMBA 1WODA 4XKQA 1QVSA 3TTNA 2XXIA 3E9XA 5TP9A 1WVJA 4LQ5A 4C1TA 1LBCA 1JEVA 2OZZA 3V83A 2DQVA 1GGGA 4NTLA 3IK6B 1YPNA 3LSWA 3O9PA 3QAXA 4TLMB 3O97A 4POWA 1POY1 1BLFA 3TUSA 1NFTA 2V84A 2QRYA 1B3GA 3RNNA 2F97A 4NF4A 4NE4A 3EN3A 1JW4A 1VSOA 2REGA 4MLQA 3N6TA 4TLLB 2D3IA 4DXUA 3FXRA 1ZIUA 2YJPA 3CG1A 1MY3A 4U1OA 3TEPA 3E13X 3L6HA 1JEUA 4QSEA 4AB5A 2AL5A 1A55A 2Q9TA 1LLSA 4OFJA 3TQWA 4OESA 5I58B 4YKIA 1BKAA 4QFNA 3LSXA 4E0WA 1AL3A 2HFBA 3UORA 4F22A 3S4UA 3O6HA 3FJ7A 1LGBC 1QKBA 3CSGA 1MRPA 1S7YA 2AIXA 1SYIA 1USYH 2XD2A 4YAHX 5M2VA 5JTYA 3K6UA 2F6GA 3KZGA 2DE4A 4OFLA 2DP8A 4DDDA 1JVYA 3RY3A 3IX1A 2Q2AA 4EF2A 3KSJA 5H8FB 1LB9A 3SEVA 3TELA 3MWBA 3T9UA 3PMWA 1Y3QA 2GRVA 1N7XA 1D9VA 3E4RA 3KSXA 5FTHA 2Y7PA 2R9JA 4IGTA 3IOTA 4H6DA 4LP2B 1SW2A 3FASA 2GHBA 3DM0A 4H5FA 2I3WA 1RYOA 3B6TA 4NF5A 1IZ1A 1B3FA 2Q2CA 2QL3A 2O84X 4U1ZA 3VLWA 3BKIB 4R6YA 1LFHA 4IO7A 3AXFA 1M5CA 4XKRA 3ZKKA 1ANFA 3QIMA 1L5TA 5A5XA 1UIUA 5EHMA 4BDMA 3C31A 3CVGA 2HAVA 3H3GA 1OQGA 1P1NA 2XXPA 4YMAA 3PUXE 3B7DA 4G4PA 1US4A 3MVZA 5CBSA 2V3UA 2I4BA 3IAZA 5AA3A 4U21A 3O6GA 5FHOA 2XX9A 5K2XA 4OXVA 2I0CA 3TZAA 1VE4A 3HPIA 3K2DA 3ZS6A 4F18A 5DVIA 3B6WA 1QUJA 2I48A 1P1QA 1SW4A 1YCJA 1S50A 2I6EA 3M8UA 5CC2A 4P0GA 2HCAA 2PMSA 3G3IA 1LBBA 2NWJA 3N5LA 4YKKA 1QULA 4HS7A 5FTIA 4EQ9A 1XS5A 1FQDA 1Y1MA 1B58A 1B32A 2XXYA 3LSLA 3QSLA 5AE4A 3VV5A 4MH5A 1ZBMA 2ONRA 4G68B 5DTBA 3MP8A 4H1XA 2I0BA 4GOTA 4OETA 2E0SA 1NH7A 5L8DA 4F3GA 1TFDA 3PPNA 2F6PA 2OK2A 4XIGQ 3JYRA 1EZOA 2VHAA 2HXWA 3OO8A 4THIA 5DT6A 2OBGA 3VXBA 2F7CA 2FA7A 2Y7RA 4AQ4A 3MVXA 4NWCA 3I5OA 1O63A 2DS9A 3G3GA 4IO3A 4YKJA 1P99A 5H8NA 5ITPA 4BDOA 4ELPA 5DVFA 4G2ZA 1FQEA 2P0SA 1R9LA 5ELVA 1MPBA 3TMGA 1EZPA 3IOWA 1H3DA 2O6AA 2QS2A 3N6UA 5ITOA 4HW8A 3CG3A 3H06B 5FHMA 5I2KB 1DPPA 2O51A 2UXAA 3G3JA 4YKPA 3TTRA 3SEXA 2LAOA 3EHTA 3IORA 4KYDA 4EUOA 1LAXA 2UVGA 3PPQA 1POTA 3CFXA 1MG1A 4PP0A 3K1PA 2H25A 2G29A 3O66A 4FORA 4NWDA 4OTEA 2ZYNA 3KEIA 3KN3A 3FXQA 2RCAA 3PD9A 4NF6B 3QUFA 4LATA 1SD3A 4QFPA 4U22A 4ELOA 3O29A 4GD5A 3MZ9A 2VOZA 1SI0A 3KN8A 3UIFA 3VXCA 1SQYA 2V3TA 3WAEA 4XXUA 1Q35A 1BP5A 2W7YA 2PVUA 1LAHE 5L9SA 1PBPA 4NF8A 5KCJA 1XT8A 3H4ZA 2XXXA 3MZBA 1IUDA 1SBPA 2PYYA 4PFWA 2Y7WA 1MXVA 3SDFA 4FEBA 3HV1A 4DXBA 1NNKA 4K3FA 4DLDA 4HCYA 1XHYA 4FATA 3O6IA 3KFMA 1Z7ME 1IITA 3FVGA 4N07A 2ESNA 2QJEA 2FNCA 2HZLA 1B0LA 1RKMA 3CI8A 1LFGA 3DP8A 3RTFB 3FIRA 4F1VA 5JTYB 5I57B 3GXAA 3LUYA 4FECA 4R6HA 4OYVA 1EH3A 5BUUA 1B3EA 1JQFA 1OVBA 5CI5A 4YICA 3Q28A 2DSFA 3QXMA 4Q5TA 2F34A 4MBPA 5AA1A 2D21A 1PBQA 2V3QA 3K01A 2CZLA 4G77A 4G8NA 4WXJA 2X26A 3GZGA 3OEMA 5DYHA 3EF7A 4GL0A 3OXNA 2X7PA 2RKMA 2DXYA 3C35A 2H5YA 2ZMBA 3MVWA 2XX7A 1O7TA 4OFOA 1EU8A 1N3XA 2I4CA 1GR2A 2VD2A 2XXTA 2YPNA 1FTMA 4H8IA 4JSDA 4OEUA 2HAUA 1A8FA 1MXWA 1MY0A 1AOVA 3FATA 2YLNA 3H7MA 3PMXA 3KG2A 4RNSA 3SETA 3FVKA 3KN7A 3MPKA 3OO7A 4F39A 1B7HA 4PFUA 1JW5A 3U93A 5A5XB 5JK4A 3CFZA 3S9MC 1Y3NA 1XC1A 3A09A 4GWOA 4IGRA 4WEDA 1FTOA 3IL1B 4XTCQ 2F5XA 2OCUA 3R26A 4DIGA 2X7QA 3T9VA 4EQ7A 5I2KA 2ZNTA 4JSOA 3G7WA 2IEEA 2QS1A 3CR9A 4QFKA 1MM6A 4M1VA 1LB8A 4U4SA 1NL5A 4N13A 3FJMA 3PPPA 4BDRA 3MW0A 2ABHA 4FJPA 5CMMA 2I58A 3K1MA 3USDA 4G8HA 4GXAA 3W9VA 3KGCA 4F2OA 1NNTA 4PE5B 1N04A 4MF3A 4LVQA 3HN0A 1A8EA 1B5JA 3PUYE 2F7BA 2P1SA 1B6HA 1AMFA 2QS4A 4JDFA 4UA8A 5TPAA 1ATGA 4QF9A 5HBCA 3V89B 3SEYA 3T9HB 1IEJA 2B3BA 2Q8JA 4DE8A 2Z8DA 3T66A 4AB6A 3ECRA 4X9TA 1QUIA 3L6GA 4KI0E 2THIA 3OO6A 3U1OA 1SI1A 1B51A 3M3KA 2DWHA 3E3KA 2PBWA 2PT2A 4F29A 1PB8A 5H8FA 4QSDA 4GF8A 1IXIA 3CRBA 3DLNA 3UA8A 1IXHA 2M8CA 3PUVE 4EF1A 3OMBA 4O3CA 2E1SA 4YU0A 3K6WA 1B7UA 3SEUA 3PU5A 1US5A 1UTBA 2VP1A 4IY6A 4U23A 3RN8A 3PGFA 2WKYA 2UYFA 1H43A 3I3VA 5CMCA 1XVYA 2ZNSA 4ONYA 5F1QA 3T22A 4HTGA 1R9QA 3VVEA 1QUKA 2B65A 1B5HA 1XVXA 3U72A 1FTLA 4H67A 3MP1A 1ZKBA 3W15C 4GXSB 1B40A 1IXCA 5L9OA 3VVFA 3OSRA 1B52A 1B5IA 2A5TA 2CMOA 4G68C 3WAFA 2RF1A 4GLIA 4KCDA 4EXKA 1JNFA 2QSXA 4U2RA 2Z22A 3THIA 4ISUA 3TKDA 2G93A 2KLFA 1Y20A 1PC3A 4KPTA 1HSJA 4LZ8A 5CRYA 2DWAA 4KYEA 2XXUA 3QYTA 3DP4A 4H5GA 4RA1A 1B2HA 1FQAA 1O64A 5H8QA 1MXUA 3RPWA 3TCGA 2Q88A 3FVOA 3BBRA 1MDP1 3V8XB 4R75A 4N6PA 5TP9B 4XKNA 2Q89A 3G3HA 3FXUA 4IY5A 1HSLA 1USYE 4X48A 5H8QB 4ZEBA 2Y7IA 5B7DA 3KBRA 3O28A 1SVXB 4HCWA 3TQLA 1JVXA 3FD3A 5AA2B 2OWSA 2ZXTA 2XXWA 5KCJB 1CB6A 4ZZAA 1NNFA 1B4HA 4QRZA 4BLAA 1NKXA 4NEDA 4I62A 4LZ5A 3S9LC 3MJNA 3OELA 2F35A 1HSEA 1MDQA 2O68A 3QUJA 4ELQA 4RPNA 3U8QA 4UACA 5K2YA 3HO7A 3HHFA 5H8HA 3TAJA 5I2NB 3CSBA 1MXYA 1WDNA 2IA4A 1S9TA 4MLVA 5I58A 3IB1A 3VFJA 4TQUQ 2QPQA 5H8HB 5I2NA 5I59A 5JEIA 2R71A 1NH8A 3K00A 3TCFA 1A99A 1N76A 4E0XA 1LFIA 3PMVA 1JETA 1PDAA 3FV1A 2XD3A 3IO6A 1R6ZA 4OEVA 4QFLA 3SKPA 4F31B 4O3AA 4ZS9A 2RC7A 3K02A 3EQ1A 4ESWA 4ZZEA 4C0RA 3UN6A 4EXLA 1MQIA 2QS3A 1MQJA 4PETA 1SDXA 2XXRA 1D4NA 1Q1KA 2ONSA 3EHSA 3MUQA 2OWTA 3ILUB 4I1DA 2DE2A 4KR5A 4F3SA 1TXFA 2UVJA 1DOTA 3K6XA 4QHQA 1LCFA 3IB2A 1UTBB 1F9BA 1MQHA 1JW1A 2DWJA 2R6GE 3M3LA 4I8CA 2V93A 1MPCA 4Q30B 5EYFA 3TTMA 4R2BA 4MFIA 3U92A 4JWXA 5IAIA 3ONMA 3S9NC 2DWIA 2RC8A 4KQPA 2DVZA 4DZ1A 4NF8B 4ZEDA 2XHDA 2HZKA 1YAEA 3PPOA 5KZTA 4WEPA 1MQGA 1B9JA 3BFTA 4BDLA 1M5DA 3OSQA 3RQTA 3OD7A 4Z0IA 4JXIA 1SW5A 1URDA 3H6TA 5L9MA 2O69A 3RLFE 5DVJA 3TTKA 1Y1ZA 3D4CA 1GV8A 5AA4A 3KJTA 1T0KA 1TFAA 3K1NA 4GFRA 4H0WA 2I3VA 1MH3A 1FQFA 1M5EA 1RYXA 4R73A 4R74A 5I56A 2ALUA 5I56B 3KOSA 4KYSA 3ODBA 3M3FA 1A40A 1ELJA 3JV9A 4KCCA 1GVCA 1B1HA 3T96B 3U94A 2RCBA 4OWDA 4I9DA 3VLVA 4F1YA 2VGQA 4Q8RA 4H8JA 3JZJA 1I6AA 3O2AA 4X1DA 1OIBA 1MH4A 1UIVA 4IO4A 4NMYA 5CMKA 4P0IA 4FAJA 1I69A 3ZKLA 4OQOA 4LQ2A 1MPDA 5CBRA 5EHSA 4YB6A 3PUWE 3GBAA 1FQCA 1DSNA 1MY1A 1MY4A 3H6UA 1URGA 2D5WA 3ZSFA 4OVJA 5HPQA 3IOUA 2F36A 1LCTA 5DEXA 5AA2D 4GL8A 3IB0A 5LOMA 1QJMA 2HQ0A 3UP9A 1UQWA 3BFUA 4PFTA 4R72A 1I6BA 2Y84A 1P1OA 1H44A 3IJOB 1CE2A 2XXHA 4Q0CA 4RYAA 3C4MA 3PV0E 1SYHA 2V25A 3FZVA 3HHGA 2XXVA 1N84A 2NOOA 3HSTA 3Q29A 1A7LA 3Q26A 1B46A 1B3LA 1FW0A 1FQBA 4JWOA 4KFQA 4R6KA 3R7XA 2F7AA 3TCHA 4F3PA 5BWJA 3VVDA 5KDTB 2PT1A 5I84A 4X1BA 5TU0A 1Y3PA 3C33A 1ZLQA 1M5BA 1KWHA 1J1NA 3G3FA 1TWYA 3FJGA 2H98A 3MQ9A 1B4ZA 5ISUA 2REJA 2F78A 5AA4B 4BDQA 2ZYKA 2A5TB 3EHUA 1XOCA 3TODA 3RUMA 5ICQA 2Z8FA 3B6QA 3S2VA 1SW1A 4BDNA 1P1UA 2GHAA 4KHZE 3D4GA 4LZ7A 1D9YA 3LSFB 2FYIA 3CIJA 4ELRA 1DMBA 1UTHB 2AL4A 2UVHA 3C9HA 1BTJA 3HCQA 4O3BA 4R9GA 1OLAA 4QSCA 3LBSA 3MC2A 5IKBA 3VLUA 1VR5A 1MXXA 2DXRA 3FV2A 4ZECA 2I49A 1ZMGA 4ZEKA 4ZE9A 5AA2A 4OERA 4L17A 2RINA 3FUZA 4G68A 4R9FA 2Z8EA 4EDPA 4F19A 4PFYA 3Q27A 1Y9UA 2RC9A 1OQHA 3H6VA 3OENA 4LONB 1LSTA 5HM4B 4EQBA 3F11A 5H8NB 5TPAB 2ZYMA 4RXLA 5I57A 1DPEA 3MAMA 4WKMA 5CM6A 3RT8A 2OLBA 3IR1A 3PUZE 3R6UA 2H99A 3FVNA 4R2FA 3FGSA 3TPAA 4F1UA 1TT1A 1MXZA 4P11A 3EPEA 1IXGA 2XX8A 1PB9A 5ICTA 3SESA 4ND9A 1MQDA 1PB7A 3V5AA 2DE3A 1II5A 3DELB 3C32A 3MBPA 4QFOA 4F3BA 3OO9A 1GTKA 4RK9A 4GVOA 3IO4A 1BIYA 4ZEFA 3UK4A 3N94A 1MS7A 2ANJA 3IJXB 2HEUA 1IQ7A 3OEKA 1Z7NE 4NF6A 1AH5A 2ONKE 4RK2A 4JBZA 4M4GA 4DCYA 3MVYA 4DCXA 3RGYA 4DXCA 5KDTA 1ZJLA 3H03A 4ESXA 4YMBA 1N0TA 1PEBA 1D3KA 1UTHA 2O7UA 1EZ9A 2DVCA 1B3HA 2H4IA 2O7IA 3PPRA 3SERA 1FTJA 2A5SA 3GBBA 4Z7EA 4F2QA 4U4XA 3RT6B 3W9WA 4RY1A 4H65A 4YZZA 4XKPA 2NVUB 4C1UA 3GLBA 1VFEA 3RTWB 4NF4B 1N7WA 4JB7A 2Y7KA 1OMPA 3G3KA 1H45A 3UGWA 5B70A 4LA9A 3C36A 4OENA 1ZTYA 1P1WA 1Y4TA 4LUBA 4FIMA 4IO6A 1N3WA 2OJTA 1URSA 4ZDMA 2Z23A 4YB5A 3OOAA 4GIZA 2BJJX 2AYSA 4OHNA 1DTZA 5CMBA 2XXQA 1A54A 3CFLA 3KJ7A 3Q25A 4IO5A 2P2AA 4RPOA 4FE8A 4POXA 4ZE8A 4IB2A 5I59B 3TFLA 4PQJA 3K0VA 3LC8A 3N26A 3LR1A 4ZEIA 3VE1B 3K4UA 1H76A 1LAFE 2PX1A 5FHNA 1B7ZA 3S9EA 1I6QA 1ZU0A 1MY2A 2H9BA 2UYEA 3MZ1A 2F8DA 4IO2A 1VFDA 2QMWA 5F7VA 1FCKA 2O1MA 3KOTA 3VDFA 1NMUA 2NXOA 3TYHA 1DTGA 4YB7A 1YTVA 2VD3A 3T9XB 2DYXA 4ECFA 2UVIA 1B0HA 1QKAA 1B05A 4TOZA 3I6VA 2B3FA 3TTLA 1LAGE 1B1XA 1M5FA 2GFEA 2GH9A 1R1NA 4KD5A 5J1DA 4NF5B 4GQOA 3DP6A 5DEXB 4G8MA 1Y4CA 3H6WA 3C34A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TDJA 3MPLA 2ZYOA 4RJZA 4JWYA 3GYYA 4RPNA 1IIWA 4DI3D 4FEDA 3SEWA 1WODA 4XKQA 4C1TA 3E9XA 2F3DA 1WVJA 4LQ5A 1GGGA 3O9PA 4TLMB 2WX9A 1POY1 4NF4A 1JW4A 2HPGA 1VSOA 4MLQA 4U1OA 1JEUA 4O7MA 4OFJA 1A55A 1BKAA 3O6HA 1QKBA 3CSGA 2Q8MA 2AIXA 4MCOA 3K6UA 2F6GA 2DE4A 3RY3A 3SEVA 3T9UA 2GRVA 1D9VA 5FTHA 3IOTA 4JVCA 4U1ZA 3VLWA 1RDZA 4R6YA 1LFHA 3AXFA 3ZKKA 4BDMA 1QGXA 3H3GA 1P1NA 4YMAA 2I4BA 5FHOA 3U65A 4OXVA 4N6KA 3HPIA 4F18A 5EYHA 1QUJA 2CZHA 1YCJA 3G3IA 4YKKA 1QULA 2DDKA 1XS5A 2XXYA 3VV5A 4MH5A 4OETA 1NH7A 4F3GA 2F6PA 2OK2A 4XIGQ 2VHAA 4THIA 3VXBA 3G3GA 4IO3A 4YKJA 1P99A 4BDOA 1FQEA 2L5VA 3TMGA 2QS2A 3H06B 2UXAA 3G3JA 2LAOA 2V4CA 1LAXA 2G29A 3PD9A 3FXQA 2RCAA 4PGNA 4U22A 3WAEA 4HE2A 2V3TA 1LAHE 1EYIA 3H4ZA 2PYYA 3HV1A 4FATA 3KFMA 1IITA 3FVGA 4I40A 1K9ZA 2HZLA 1LFGA 5EYGA 5JTYB 5I57B 4FECA 1EH3A 1FJ9A 3QXMA 4Q5TA 2V3QA 2CZLA 4WXJA 2QVVA 2X26A 3GZGA 2QVRA 5ET7A 2XX7A 2YPNA 2VD2A 2XXTA 1FTMA 4JSDA 3SETA 1NV6A 4HE1A 5A5XB 4PFUA 2XWIA 5JK4A 4GWOA 4NX1A 3IL1B 2F5XA 3R26A 4DIGA 4O7IA 2ZNTA 3G7WA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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