2KLFA

Pere nmr structure of maltodextrin-binding protein
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KTEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
source organism Escherichia coli
publication title Use of Relaxation Enhancements in a Paramagnetic Environment for the Structure Determination of Proteins Using NMR Spectroscopy
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 69
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-07-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2klfA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2klfA01
1M5DA 1I6AA 3VLWA 4GQOA 3UN6A 1RYOA 3PPOA 4OFLA 2NXOA 1FTMA 4JSDA 2XX9A 2I4BA 3OOAA 2O1MA 3MC2A 3MJNA 4XIGQ 3VXBA 1MRPA 2PT2A 1NNPA 4NF5B 2YPNA 2F97A 4GRKA 1B6HA 3H3GA 4MLQA 1LB8A 1R9QA 3IB2A 3QSLA 1H3DA 3T96B 3JYRA 4GF8A 2RCAA 4U23A 4WKMA 3FGSA 3F11A 3KJ7A 1MPDA 3HV1A 3G7WA 4ZEDA 3PMXA 1LAFE 4C0RA 1B3HA 1P1NA 3TTMA 5CMKA 3CFXA 1FCKA 1VR5A 4GXSB 3VFJA 3S9LC 1D9YA 3RPWA 4DZ1A 1SI0A 2P2AA 5H8SA 4FECA 3H6WA 4EQBA 4NF6B 4U1ZA 4C1UA 3H4ZA 4LZ7A 1B3FA 3JV9A 4KQPA 3W9VA 4RYAA 2OWTA 5FTIA 2FA7A 3FD3A 5DVIA 3TCFA 1IZ1A 4WEDA 1FTLA 4RK9A 1POTA 3E3KA 3Q28A 5DVJA 3OELA 3LSLA 1Y20A 1N04A 3Q29A 4R6HA 2O7IA 1XOCA 3OXNA 3FUZA 1UIUA 3IX1A 3G3KA 3L6HA 3PPNA 3RT6B 1JVYA 2O51A 3H6TA 3EHSA 1B7UA 4NF8A 3FV1A 3EHUA 2QJEA 4IO5A 4GL8A 4ECFA 3MP1A 3H7MA 2XX7A 2FYIA 1B0HA 2Z8DA 3IL1B 4BDOA 3CSBA 1AIVA 3O28A 2XXPA 1SI1A 4F29A 1MQIA 4G8MA 4KCDA 3FVGA 1XC1A 2DWJA 4PFTA 4Z0IA 1MY4A 2E1SA 3IOUA 2ONSA 2Q2CA 4IB2A 1SD3A 4P0GA 1B58A 2RCBA 4YZZA 4KR5A 3DP8A 5HBCA 1Q35A 3K6VA 4OMBA 1OLCA 1GVCA 3TCGA 3RGYA 2DSFA 2RC7A 4IO4A 3WAEA 1Y3QA 3E13X 3G3FA 5JK4A 4MH5A 1R9LA 1B1XA 4R2FA 5I58A 2CZLA 1J1NA 4I1DA 2I3VA 4JB7A 3QUJA 2WKYA 4JBZA 4K3FA 3QIMA 2UVIA 2OWSA 4GD5A 2H98A 4G8HA 3ILUB 4GL0A 2IA4A 4O3BA 5M2VA 1H44A 2DVZA 3BBRA 3CR9A 2DE3A 5I57A 4THIA 1MPBA 3KZGA 4UA8A 4PFWA 3O66A 3HO7A 1DPEA 3TEPA 3EPEA 1US4A 1URGA 3MAMA 4G68C 3CFLA 4NF4A 1PB7A 2F8DA 3VE1B 2V3UA 2Y7PA 1IXHA 3G3GA 4O3CA 4IY6A 4JXIA 2B3BA 3RNNA 1TT1A 1JETA 1Y1ZA 3ZKKA 3TCHA 2F6PA 4R72A 1XS5A 2UVGA 3FJMA 4RPOA 3CG3A 5K2XA 3K1PA 1B40A 2ZNTA 4RXLA 3K6UA 5BUUA 3FXRA 1B2HA 4NF4B 3C33A 2Y7RA 1UTBB 1FTOA 5FHMA 4F3BA 2QSXA 1OVBA 2B65A 2OK2A 2G93A 5HM4B 3T9UA 1JQFA 4AB6A 3D4GA 1WODA 3L6GA 4X1DA 4DE8A 3KN8A 4DXUA 1FQCA 1FTKA 3SETA 3KG2A 5TP9B 3M8UA 1A99A 4PP0A 1P1WA 4F1UA 4X48A 4RY1A 2RF1A 5L9MA 4H6DA 4M1VA 1SQYA 1IITA 2Q88A 2ABHA 5AA1A 4JWOA 1P1QA 5H8FB 2D3IA 1XT8A 4X1BA 3PGFA 3QK6A 2OBGA 3C4MA 3PUZE 3MZ1A 1D4NA 2O84X 3OEKA 2ZMBA 1NL5A 4RPNA 3S2VA 1M5BA 3V8XB 3SKPA 4FEBA 3HCQA 1B7ZA 2DOJA 2I6EA 3QAXA 1NH8A 2XXHA 3LBSA 1JVXA 4JSOA 3U8QA 1BLFA 4OFJA 5TPAA 1B5HA 1OQGA 1DOTA 3K01A 4L17A 3UIFA 3KN7A 4IY5A 2HCAA 3M3KA 3CI8A 3DP4A 2HXWA 1A54A 1PB9A 5L9SA 3CSGA 4R6YA 1P1OA 3PU5A 5ISUA 3TTNA 4IO6A 1F9BA 1IXCA 2XXIA 2UVJA 2V93A 1QVSA 2XXYA 1ANFA 4QSEA 4FEDA 1YAEA 4ELRA 5EHSA 1FQDA 3TTLA 3CG1A 3BKIB 1S50A 3FJGA 4Q30B 3THIA 5CC2A 4DDDA 1LFHA 4YMAA 5H8HB 4KFQA 3DLNA 3UGWA 3R6UA 2O7UA 1DTZA 1MY2A 4YMBA 5JEIA 3MBPA 3RLFE 3H6UA 2X7PA 4OENA 3U93A 3PUXE 2H5YA 4NWCA 3KOSA 4H65A 3U94A 4LVQA 3TQLA 3T9HB 5CBRA 1IXIA 2KLFA 2I4CA 1OLAA 2YLNA 2Z23A 4IO7A 1SW1A 2OZZA 2DXYA 3TTRA 1TFAA 1NKXA 1ZLQA 1ZKBA 4HW8A 3MP6A 3KBRA 3KJTA 3IR1A 4F3SA 2RC8A 4TOZA 3HHGA 4EQ7A 1LCFA 4H5FA 1ZTYA 3AXFA 1DMBA 5H8QB 1MG1A 1EZOA 3GBAA 3M3LA 2F7BA 2REJA 1MM6A 4QFPA 4WEPA 1GTKA 2NOOA 2GRVA 4MBPA 3QXMA 5I2KA 3N6TA 5JTYA 1B7HA 4H8JA 3USDA 3HPIA 1MXVA 4G8NA 1QULA 2YJPA 5CMCA 2V25A 1OQHA 4GXAA 4KPTA 4ND9A 3FXQA 1M5FA 3C9HA 4BLAA 1PC3A 4DXCA 1P1UA 4BDMA 1ATGA 3A3CA 3TUSA 3O6IA 4LQ2A 1QW0A 1A8FA 1SW4A 4MLVA 4R2BA 4TLLB 4OTEA 1JEUA 3G3JA 2R71A 1N7WA 3KN3A 5CMBA 1JW5A 4LQ5A 3S9EA 1JNFA 4BDQA 4YAHX 4I9DA 3OD7A 1O64A 3ZS6A 2ZNSA 4FAJA 4QFNA 4N07A 2Z22A 4GLIA 1LBCA 1PB8A 3WAFA 4OHNA 5K2YA 4R74A 2HAUA 2H25A 4EF2A 1UQWA 5DVFA 4LUBA 2H4IA 4R6KA 1LAGE 4P0IA 3O6HA 4XKPA 3B6WA 4BDLA 4QHQA 3CRBA 2PYYA 4OWDA 3VVDA 4EF1A 2XXWA 4U2RA 4F31B 1UIVA 2D5WA 1VSOA 3TDJA 3DM0A 4FIMA 4OXVA 1ELJA 1ZU0A 5I59A 4JWXA 1QUKA 1AMFA 4E0XA 4MF3A 4LP2B 2X26A 1A8EA 2DWAA 4H1XA 4MFIA 4OERA 3OENA 4RA1A 2ZYNA 1ZJLA 4ZEIA 5L8DA 1AH5A 1XHYA 1I6BA 4HS7A 1R1NA 3HN0A 4U1OA 3SEUA 2XXVA 4R9FA 4NF8B 5I59B 2V84A 5LOMA 1YCJA 2F5XA 3RN8A 2DQVA 5CM6A 5L9OA 4QSDA 3LSWA 5B7DA 5ITOA 2THIA 3OO7A 1URDA 3IOWA 4YB6A 1IIWA 3PV0E 4F1VA 4AB5A 3ILTB 4IO2A 4YB7A 1H76A 2OJTA 2UVHA 2V3QA 3TTKA 1B4ZA 4DLDA 3RTFB 4FATA 5H8NA 2O6AA 1B0LA 3MUQA 2F6GA 4QFOA 3K1MA 2R6GE 4I8CA 1MY1A 1Z7NE 2F34A 3SDFA 1MXYA 1I6QA 4F3PA 3SEVA 1LCTA 4GIZA 2I0CA 3MP8A 1UTHA 3MZBA 2DP8A 1FQBA 5AA4A 4G77A 3MPKA 2ZNUA 4KCCA 4DXBA 4BDNA 5I58B 3D4CA 2HZKA 3N5LA 1MPCA 4PE5B 3K02A 4NE4A 4ZE8A 3VV5A 2IEEA 3PMVA 4NEDA 3TMGA 4HCYA 5EHMA 1VFEA 5KCJA 3MVWA 5I57B 4IO3A 3KEIA 3TQWA 1MDQA 1JEVA 1AL3A 2RKMA 2RC9A 3DP6A 1H43A 2NUVA 2A5TA 1B51A 2F7AA 3TELA 1S7YA 2R9JA 2VD3A 5ICTA 3N26A 3T9XB 3E9XA 4YKIA 2I48A 4FORA 3T22A 1Y4TA 1Y1MA 1EU8A 5F7VA 2HEUA 3C31A 2GFEA 4G4PA 4WXJA 3V89B 2PMSA 1MQHA 4P11A 2Q9TA 3B6QA 1FQFA 1IEJA 2GHBA 2DE2A 2LAOA 2Y7KA 4PFUA 4LZ5A 2G29A 3UK4A 1MH3A 2VP1A 2ZYKA 4F18A 4EDPA 1N84A 2PT1A 4YB5A 1BP5A 1MDP1 3FIRA 4QRZA 3OEMA 3VXCA 3FVNA 2E0SA 2I58A 4GOTA 1B3LA 2ANJA 4OZ9A 1A40A 2D21A 3IB1A 3IK6B 3S9MC 1A55A 4RJZA 1SYHA 1B46A 3GXAA 2B3FA 1XVXA 1DSNA 3TYHA 1CE2A 1JW4A 3FVOA 2BJJX 3MVZA 2F7CA 5J1DA 4IGRA 2VD2A 1MQDA 3OSRA 2UYEA 3KSJA 4ZEBA 3VLVA 4YU0A 5DTBA 3GZGA 2GHAA 2XD3A 3MPLA 3OO9A 4KI0E 3U72A 4EXLA 1HSEA 3LSXA 5TPAB 3BFUA 1LGBC 1QJMA 3FJ7A 3TAJA 4G68A 3C36A 2HFBA 2RINA 3R7XA 3K6XA 5CMMA 1B3GA 4YKKA 2XX8A 2NWJA 3TFLA 4Z7EA 2P0SA 1JW1A 2W7YA 3RTWB 1TWYA 3A3UA 1WDNA 3E4RA 5AE4A 3QUFA 4ELQA 5I56A 1NNKA 3V5AA 1ZMGA 1Q1KA 4QF9A 1II5A 1Y3NA 4KYSA 1MXZA 1USYH 2AIXA 5AA2A 1SBPA 4PETA 1FQEA 1HSLA 4KHZE 2XXUA 4OEVA 3ODBA 3EQ1A 3IORA 5DEXA 4GVOA 1POY1 1P99A 1Y9UA 3TKDA 3DELB 3B6TA 3BFTA 1EZPA 3LUYA 1PBPA 1NMUA 3VDFA 3MW0A 2FNCA 4H5GA 4GFRA 1LFGA 1N0TA 2P1SA 1N3XA 4HTGA 2QL3A 4NF5A 3I6VA 4R73A 4YICA 3IB0A 4XKNA 4ELPA 3S4UA 1URSA 2ESNA 1AOVA 1N76A 5KZTA 1XVYA 3SERA 4PQJA 4YKPA 3MZ9A 4QFLA 1MM7A 1O7TA 1VFDA 2DS9A 2GH9A 1MY0A 3FZVA 4ZZAA 3K00A 4FJPA 1PEBA 3MVYA 4EUOA 4DCXA 4U22A 3KOTA 4RK2A 4R9GA 4H67A 1FQAA 2VOZA 1LAHE 1IXGA 3C32A 3O2AA 1B5JA 4Q0CA 2F35A 4FE8A 4XKQA 3EHTA 3KFMA 1RYXA 5B70A 5A5XA 4NF6A 5I2KB 4EXKA 5JTYB 3FVKA 3SEYA 5F1QA 2DXRA 1NNTA 1N7XA 4Q8RA 3PMWA 4AQ4A 2V3TA 3A09A 3VVEA 4ZS9A 2ZYMA 1SW2A 3N94A 2QMXA 3O6GA 2Q2AA 2Z8EA 2PVUA 3C34A 4ZEFA 2DWHA 1QUJA 1DTGA 3CVGA 5A5XB 5DYHA 4KD5A 1B05A 3GBBA 4JWYA 3ZKLA 3PUVE 1MQJA 4H0WA 1Y4CA 5CBSA 1NH7A 2Y7IA 1HSJA 4KYDA 5FTHA 4POXA 3IJXB 4F1YA 4RNSA 1WVJA 2AL4A 3SEWA 4UACA 5AA3A 1SVXB 1LLSA 1QUIA 4OQOA 3TZAA 3KSXA 2UXAA 4ESWA 3O29A 3CFZA 2O68A 2QS3A 4LA9A 1M5EA 4ZDMA 1T0KA 4QFKA 4ELOA 3UA8A 4TQUQ 2XXXA 3JZJA 1S9TA 5I84A 1D9VA 4ONYA 3FXUA 1BKAA 4M4GA 3K6WA 3H6VA 4GWOA 4EQ9A 1H45A 3IO4A 1MS7A 2UYFA 3SEXA 1QKBA 4ESXA 4OEUA 3K2DA 1BTJA 2PX1A 3IAZA 4O3AA 2Y84A 4DIGA 1B52A 3R26A 4KYEA 3S9NC 4PFYA 3OO6A 4F2OA 3MWBA 3QYTA 1OIBA 1ZIUA 2VGQA 1OVTA 3PUWE 4ZE9A 1MQGA 3N6UA 1L5TA 5H8NB 4OYVA 2M8CA 2QS4A 2HZLA 2OLBA 1LSTA 5AA2D 4U4SA 1TXFA 3PD9A 3ZSFA 3K4UA 5CRYA 3IJOB 3IOTA 3ONMA 3K1NA 3ECRA 1UTHB 4R75A 1UTBA 4F22A 4NMYA 3LSFB 3G3IA 3EF7A 4ISUA 1GV8A 1N3WA 5AA4B 1NNFA 3TPAA 5CI5A 1O63A 1NFTA 4ZECA 1OMPA 4TLMB 3T93B 3RY3A 4U21A 1SYIA 5FHNA 1R6ZA 2QRYA 3C35A 1QKAA 3W15C 4F3GA 5TP9A 3UP9A 3MQ9A 5BWJA 5KCJB 3PUYE 4XKRA 4LATA 4QSCA 2DE4A 4NWDA 2Q8JA 5ITPA 2Y7WA 1B1HA 4Q5TA 4F19A 1B5IA 2A5TB 3Q27A 3FASA 1MH4A 4HCWA 2XXQA 3O9PA 4ZZEA 4C1TA 2DWIA 5H8FA 1YPNA 1DPPA 1LFIA 5IAIA 1B9JA 2ONKE 3G3HA 1LBBA 2ONRA 3I3VA 3VVFA 3KGCA 3MVXA 1B32A 4E0WA 2NVUB 3OO8A 1LB9A 3H06B 3P7IA 3T66A 5I2NA 2AL5A 4YKJA 2Q89A 2QPQA 2XD2A 5HPQA 4LZ8A 3GLBA 4BDRA 4G2ZA 1IQ7A 2CMOA 1MXWA 5DT6A 3SESA 1EZ9A 1B3EA 4N13A 2X7QA 4XXUA 4ZEKA 3LC8A 4N6PA 1CB6A 2VHAA 1IUDA 5I2NB 3U92A 3TODA 5EYFA 1FTJA 1RKMA 3RUMA 2H9BA 4F39A 3H03A 2I3WA 3EN3A 2F78A 3IO6A 1GGGA 4U4XA 1USYE 1LAXA 1YTVA 3PD8A 5TU0A 4JDFA 2H99A 2XHDA 1BIYA 1ZBMA 1FW0A 2ALUA 3I5OA 1VE4A 2HAVA 2Z8FA 1SW5A 2O1LA 2QS2A 3UORA 1KWHA 2XXTA 1EH3A 1D3KA 2DVCA 3LR1A 5KDTA 2HQ0A 5H8HA 3O97A 1MY3A 3PPPA 2A5SA 4OESA 2I0BA 4OFOA 2PBWA 3PPQA 2AYSA 1PBQA 5IKBA 3RQTA 3HHFA 3FV2A 2QS1A 3U1OA 2QMWA 2O69A 3CIJA 2OCUA 4G68B 3RT8A 4I62A 3OMBA 1PDAA 3VLUA 1Z7ME 1TFDA 3Q25A 5KDTB 3HSTA 4DCYA 2DYXA 1I69A 1MXXA 4OVJA 3T9VA 4X9TA 3V83A 4LONB 4IGTA 1A7LA 2F36A 3M3FA 5FHOA 3K0VA 1MXUA 1GR2A 4OETA 5I56B 2REGA 4F2QA 4XTCQ 4NTLA 2I49A 3PPRA 1Y3PA 4POWA 3B7DA 2XXRA 5AA2B 1B4HA 4H8IA 3FATA 1US5A 3Q26A 3W9WA 5H8QA 1M5CA 2ZXTA 3OSQA 2ZYOA 1SDXA 5ICQA 5ELVA 5DEXB 3IOVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1M5DA 3SZPA 1I6AA 3FBPA 3VLWA 4GQOA 3UN6A 1RYOA 3PPOA 4OFLA 2NXOA 4AS4A 1FTMA 4JSDA 2XX9A 2I4BA 3OOAA 2O1MA 3MC2A 4HE2A 3MJNA 4XIGQ 3VXBA 1MRPA 2PT2A 1NNPA 4NF5B 1FPKA 4PAKA 2YPNA 2F97A 4GRKA 1B6HA 3H3GA 4LN5A 4MLQA 1LB8A 1R9QA 3IB2A 3QSLA 1H3DA 3T96B 4UABA 3JYRA 4GF8A 2OX3A 2RCAA 4U23A 4WKMA 3FGSA 3F11A 3KJ7A 1MPDA 3HV1A 3G7WA 4ZEDA 3PMXA 1LAFE 4C0RA 1B3HA 1P1NA 3TTMA 5CMKA 3CFXA 1FCKA 4N6DA 1VR5A 4GXSB 3VFJA 3S9LC 1D9YA 3RPWA 4DZ1A 1SI0A 2P2AA 4DI3D 4N17A 5IM2A 5A5LA 5H8SA 4FECA 4N6KA 3H6WA 4EQBA 3IFCA 4NF6B 4U1ZA 4C1UA 3H4ZA 2WX9A 4LZ7A 2VPOA 1B3FA 3JV9A 4KQPA 5EQ8A 3W9VA 1IMAA 4RYAA 2OWTA 5FTIA 4JVCA 2FA7A 3FD3A 2CZIA 5DVIA 3TCFA 1IZ1A 4WEDA 1FTLA 4RK9A 4GX3A 1POTA 3E3KA 3Q28A 5DVJA 3OELA 3RPLB 3LSLA 1Y20A 1N04A 3Q29A 4R6HA 2O7IA 1XOCA 3OXNA 3NOHA 3FUZA 1UIUA 3IX1A 2VT5A 2WBBA 3G3KA 3L6HA 3PPNA 3RT6B 1JVYA 2O51A 4P1EA 1G0HA 3H6TA 4XF5A 3EHSA 1B7UA 4NF8A 3FV1A 3EHUA 2QJEA 3EKIA 4PDDA 4IO5A 4PDHA 4GL8A 4ECFA 3MP1A 1KA1A 3H7MA 2XX7A 2FYIA 1B0HA 2Z8DA 3IL1B 5EQ7A 4O7IA 4BDOA 3CSBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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