2KLFA

Pere nmr structure of maltodextrin-binding protein
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KTEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
publication title Use of Relaxation Enhancements in a Paramagnetic Environment for the Structure Determination of Proteins Using NMR Spectroscopy
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 69
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-07-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2klfA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2klfA01
4GVOA 4IO7A 1VFDA 3TODA 1Z7ME 1IXIA 4ZZEA 1S9TA 1GTKA 3A3UA 3TZAA 3QAXA 2O7UA 2CMOA 2RINA 4GL0A 4EF1A 3E9XA 2DWJA 3LUYA 4C1UA 1WDNA 2Q2CA 1YCJA 1A55A 5DVFA 2Z23A 5AA2B 4TQUQ 4GL8A 4BLAA 4F2QA 4QFOA 2ONRA 1MM7A 5DVJA 3W9WA 3QXMA 3K0VA 2QMWA 1H3DA 3TCHA 2XXWA 3IB2A 1N7XA 3HV1A 5CMBA 1A99A 3H3GA 1EH3A 3T22A 5A5XB 2QJEA 3T96B 1EZ9A 1BLFA 3DP8A 4TLLB 3S9MC 4GIZA 1QJMA 3VV5A 1H45A 1N3XA 4N13A 3GZGA 2Z8EA 2D5WA 3K6UA 2Q8JA 4ECFA 1YPNA 1FTKA 2OK2A 1SBPA 3VLVA 1A54A 4GF8A 1P1OA 5I59A 4H6DA 4JB7A 5ICTA 3CSBA 3C31A 2UYEA 4QHQA 1MQDA 2DVCA 3KJ7A 1AL3A 4ESWA 2HZLA 2Z8DA 2I3VA 4YMAA 1ATGA 3ZKKA 1M5EA 3L6GA 4O3CA 3N94A 4PP0A 3ILTB 5I58B 4R2BA 2CZLA 4EUOA 2B3BA 2DE2A 3SKPA 5DTBA 2G29A 3S9EA 1GR2A 3QUFA 2OJTA 4G8HA 2Y7RA 1US4A 4LA9A 2F8DA 3UORA 3FIRA 4FORA 2F6GA 3IR1A 5KCJB 3O6IA 1UTHA 3IAZA 3E13X 4OERA 2NOOA 4IY5A 5TPAB 4NWCA 4H5FA 1FQDA 3C32A 3LSWA 3IB0A 4C0RA 3EN3A 2QMXA 5H8SA 2I3WA 1LAHE 3ZSFA 1MS7A 3OD7A 3IOWA 3A09A 2IEEA 1MXUA 4LQ2A 3B6TA 3SDFA 3H03A 4F1VA 1DPEA 3IL1B 5TU0A 1Q1KA 1VSOA 1JETA 1M5BA 3BKIB 1NKXA 1IEJA 1GVCA 4FEBA 4NE4A 4WEDA 2ZNSA 4FEDA 3FJ7A 2XHDA 4GFRA 4R9FA 5DYHA 3O6GA 4OZ9A 4NF4A 4MFIA 2DSFA 2OWTA 3ECRA 3ILUB 1NNFA 3OSQA 2B65A 3RY3A 4NF6B 3WAFA 3G7WA 3FXRA 3K4UA 3RPWA 2R6GE 1MXVA 3K01A 3IX1A 3S2VA 3CG3A 2WKYA 2A5SA 2ALUA 2M8CA 3EQ1A 3PPOA 2P1SA 2PBWA 2O7IA 1DTGA 3RN8A 4O3BA 1ANFA 3IJOB 4Z7EA 1DSNA 1B32A 3TCGA 5CBRA 5I57B 1Y9UA 4JWYA 4PFYA 2XXPA 2XX9A 4IO3A 3EHTA 2FNCA 3BFUA 3VVFA 2DXYA 5J1DA 1NNKA 5I56A 4OHNA 2Q9TA 2P2AA 1ZBMA 4G8MA 1DOTA 4I62A 2F7CA 4F3PA 4HS7A 4R73A 3MWBA 3C35A 3KZGA 2RCBA 4ZEIA 1Y4CA 4LZ7A 4FIMA 3HHFA 2XXRA 3TMGA 3MJNA 3RT6B 5A5XA 1MPCA 4YB7A 2H5YA 4U1OA 3TEPA 1SW2A 3S9NC 1MXWA 3K6XA 4LVQA 2PT2A 1LB9A 1SW4A 2X7PA 3C9HA 3FJGA 4PFUA 5ELVA 4IY6A 3T66A 1IIWA 3VFJA 3MVXA 4ESXA 2F7AA 3CSGA 3GLBA 3GBBA 2BJJX 4G2ZA 1D4NA 1B3LA 3O6HA 2QS4A 3MVYA 1SD3A 3H6WA 4Q8RA 4PFWA 3KEIA 1N3WA 5FHOA 4WEPA 3O97A 4YB5A 1LLSA 3G3HA 4MLVA 4NEDA 2ESNA 5AA4B 4ZE9A 3MP1A 1YTVA 1XHYA 3MBPA 4KQPA 3T9HB 1S50A 2GRVA 1B4ZA 2O69A 1JQFA 1N84A 1USYH 5KDTA 3RGYA 1MQJA 4F31B 3A3CA 2QPQA 5DT6A 4ZS9A 4KCCA 4XTCQ 5FTHA 4ND9A 2VD3A 3E3KA 1D9YA 4Q0CA 1OLCA 2GHAA 2QRYA 1PC3A 1FTJA 1GGGA 1B6HA 2HXWA 3G3GA 3U72A 2FA7A 3KSJA 2DWHA 1H44A 5L9SA 2VHAA 3BFTA 3ZS6A 3VE1B 1MM6A 3QK6A 2F78A 4Z0IA 4EXLA 2YLNA 1S7YA 4F18A 1SYIA 2V93A 4OETA 5CM6A 1UIUA 1MH4A 1FQCA 4QFNA 3FGSA 4U4SA 2V25A 2F35A 5DVIA 3TTRA 4R72A 4LZ5A 3VLUA 5I84A 4JDFA 4K3FA 2QS1A 1EU8A 1TFDA 4XKQA 4R2FA 5H8FA 4JWOA 4KCDA 1XVYA 3K1NA 1WVJA 2DP8A 2PMSA 2HAUA 2UVJA 1FQBA 4RA1A 3WAEA 5I2KA 1MXYA 3O9PA 1O64A 3K6VA 4ZEDA 3R26A 4Q5TA 3M3FA 3EHUA 1NNPA 4OFJA 4I1DA 1MXZA 4HCWA 3ZKLA 1UTBB 2YPNA 1FCKA 3B7DA 3OO9A 3PV0E 5CMKA 4GRKA 1UQWA 5I57A 1MH3A 3IO6A 4YB6A 4EDPA 4GXSB 1F9BA 2XXYA 3E4RA 1SDXA 1A40A 1B40A 1IXHA 5ITOA 3G3FA 4H8JA 3VXBA 4H5GA 3PPQA 3TQLA 1B7HA 1TXFA 3LSFB 1R9LA 1Y4TA 4FE8A 2QSXA 2V84A 2O1MA 4XIGQ 1D3KA 4YKJA 4KFQA 4OWDA 2F6PA 5L9OA 3TTMA 1P1NA 3H6VA 2D3IA 5CRYA 2RC9A 4XKNA 1A8FA 1MQGA 4OXVA 4HTGA 1JNFA 4U1ZA 4XKRA 3FVOA 2I4BA 2RC8A 2E1SA 4OFLA 3U8QA 3LSXA 4ZZAA 2XXTA 1CB6A 3CR9A 1Y20A 5AA2D 3U93A 4DIGA 3TTKA 1VFEA 1B3HA 2NUVA 3TKDA 2X7QA 4IGTA 3TUSA 1ZU0A 2XD3A 1FQAA 2ABHA 1MDP1 1MY2A 2A5TA 3FJMA 4BDNA 3OO8A 1Y3PA 3RT8A 4KI0E 3IJXB 4F19A 3IORA 3TPAA 4YAHX 4BDOA 4JSOA 2XXVA 3TTNA 3JZJA 4PE5B 5I2NB 4YMBA 1LFGA 1WODA 2PYYA 4RPNA 1FTLA 3MPKA 1LB8A 3MVZA 1VE4A 3O28A 3UN6A 2XX7A 4F3GA 5FHNA 4ZEKA 3JV9A 4GXAA 5EHMA 4NF5A 4H1XA 5DEXB 3MQ9A 3K6WA 3FV1A 1PDAA 5JTYB 1LAXA 1QULA 5HBCA 1LGBC 2VD2A 4NMYA 5TP9A 1MY4A 2DXRA 4IGRA 5H8QA 3EPEA 4DE8A 3N5LA 3TCFA 2F34A 1GV8A 2Y84A 3O66A 3W15C 2ZYKA 4E0WA 3MZBA 4X1BA 1QW0A 1B3EA 3KJTA 3T9XB 4G68A 1M5CA 2AYSA 1JEVA 5H8NB 3FUZA 1QKBA 1QKAA 3R7XA 3SEXA 3HSTA 3USDA 3KN3A 4F39A 1FW0A 3N6TA 2I0CA 2H9BA 3P7IA 2I58A 3H6TA 4Q30B 3FXQA 3HPIA 1JW4A 4EQ9A 4WKMA 3UA8A 4ELQA 3K1PA 2HCAA 2HEUA 2DQVA 3FZVA 1P99A 3Q27A 2H25A 4G4PA 5M2VA 3SEVA 5AA1A 1PB7A 3PUVE 2H99A 3SEYA 2ZYOA 1URDA 4GLIA 2O1LA 5H8HB 1LSTA 3HO7A 4F3BA 1MDQA 1EZOA 1NH8A 3FD3A 2F97A 3TELA 4IO2A 3FVKA 1IXGA 2OWSA 3OENA 2QS3A 4N07A 2OZZA 4GWOA 4DXCA 2D21A 3KGCA 1TFAA 1BP5A 1QUIA 2AL5A 1I6AA 3PMWA 1SYHA 4H0WA 4UACA 5AA2A 4PQJA 1NNTA 5AA3A 4MBPA 1Q35A 4RPOA 1SW1A 1M5DA 5EHSA 1B0LA 2DVZA 4R75A 3VVDA 3FVNA 4YKKA 2O6AA 2Y7KA 3CI8A 4R9GA 1MQIA 4QF9A 3FATA 1OIBA 3RQTA 2X26A 3FASA 4YZZA 4KD5A 3DP6A 3G3IA 3OSRA 3H7MA 2RKMA 1H76A 2DWAA 3RUMA 2Z22A 4H65A 4LUBA 3Q25A 4IO5A 1OLAA 3C4MA 1US5A 3KOSA 2FYIA 3PUWE 1XVXA 1JEUA 4WXJA 1IXCA 2DS9A 4RK9A 3H06B 3MP8A 1ZTYA 4DXBA 4C1TA 3PGFA 3KOTA 1HSLA 3CIJA 5CMCA 5BWJA 1I69A 2DE4A 1B58A 1MY3A 2H98A 3K2DA 1XOCA 4DDDA 2O68A 4U21A 3N26A 3GBAA 5I2NA 5F7VA 4R74A 2VP1A 3UGWA 3KSXA 4UA8A 3U94A 5I58A 3O2AA 3DP4A 2Y7IA 1LAFE 5FHMA 5I59B 2V3QA 1M5FA 3FV2A 4JBZA 4G77A 4TLMB 5L9MA 4F2OA 3LSLA 2OBGA 5DEXA 1UIVA 1QUJA 2PVUA 4ELPA 2Y7WA 3FXUA 1B1XA 3HN0A 4OESA 4MLQA 3CVGA 5KCJA 3PU5A 3QIMA 1FTMA 3PUZE 4GQOA 4QRZA 5TPAA 3VLWA 2P0SA 5HM4B 2Y7PA 1OVBA 4U23A 3LBSA 3PD8A 2ZMBA 4OENA 4F1UA 1B05A 1RYXA 4U22A 5H8NA 3UP9A 1OMPA 1B1HA 2XXHA 3SEUA 3K1MA 3S9LC 2DE3A 4OVJA 5F1QA 1A8EA 1UTHB 3F11A 1OQHA 1BTJA 5EYFA 4HCYA 3OEMA 4FAJA 3Q26A 5K2XA 2Q2AA 3FVGA 2O84X 4E0XA 5LOMA 4NF6A 3PMXA 2Q88A 1PEBA 4GD5A 4KYEA 1PB9A 1AMFA 4IO4A 2ZXTA 1LAGE 5B70A 4AQ4A 2HAVA 1NFTA 2I0BA 3L6HA 3KN7A 3TTLA 1URSA 4KHZE 3SERA 1POY1 4NF4B 2F7BA 2PT1A 2ONKE 2ZNTA 3VVEA 4EXKA 4JSDA 2V3TA 2RF1A 5K2YA 2UVIA 3C34A 1USYE 4ONYA 3S4UA 3GXAA 1LFHA 1MPDA 1ELJA 4N6PA 1MY1A 1P1WA 4ZEFA 2LAOA 4F29A 1OVTA 1O63A 3AXFA 1B4HA 3EF7A 4AB5A 3H6UA 3PPPA 5ISUA 4IB2A 5ITPA 3OOAA 1MG1A 3IOUA 4BDMA 4G68C 2W7YA 3B6QA 2F5XA 3QSLA 4RJZA 1B3FA 4U4XA 3B6WA 4U2RA 5I56B 3HHGA 1LCTA 3LR1A 3PPNA 1ZMGA 2AIXA 3BBRA 2R71A 4OYVA 2XXUA 1MY0A 4FJPA 1FQEA 5CBSA 3PPRA 1N7WA 4QFLA 1PB8A 3IOVA 4DXUA 3SETA 1SVXB 1II5A 5L8DA 2QL3A 5IAIA 5HPQA 3K00A 5AA4A 4P0IA 3MPLA 4I9DA 2F36A 1SI0A 2OLBA 4POWA 1MXXA 4RNSA 4M1VA 3THIA 5JK4A 1N0TA 2B3FA 2THIA 3TAJA 4ELRA 1FTOA 5AE4A 1N76A 1IUDA 4P11A 1ZJLA 1B7UA 3IOTA 5FTIA 4ZECA 3QYTA 1MQHA 1QVSA 3D4CA 2KLFA 4QFPA 1SQYA 4ZE8A 1LCFA 1SI1A 1POTA 3KG2A 5KDTB 2DWIA 4NF8B 4X48A 1DPPA 3W9VA 1RYOA 4X1DA 2Q89A 1JW5A 4OEVA 2NWJA 3KN8A 3T9VA 1JW1A 2UVGA 1B52A 4PFTA 3Q28A 1JVYA 2HFBA 3C33A 4TOZA 1B46A 4YU0A 3CFLA 4ZEBA 1HSEA 5BUUA 4RK2A 1BIYA 3MW0A 3QUJA 4EF2A 4R6YA 3OMBA 4ELOA 1AOVA 1IZ1A 3K02A 1FQFA 3R6UA 4BDQA 1AH5A 3V83A 4KYDA 3PD9A 3I3VA 1PBQA 1DTZA 3D4GA 4OMBA 3CFZA 3U92A 1A7LA 3SESA 3IB1A 4AB6A 1OQGA 4JWXA 3MZ1A 3ODBA 3M3LA 4RY1A 2NVUB 3H4ZA 4QSCA 3PUXE 1B0HA 5KZTA 3DELB 3U1OA 3SEWA 5H8FB 1UTBA 2IA4A 4QSEA 4EQ7A 4YICA 3VDFA 3MC2A 3TQWA 4POXA 1XS5A 2ZYMA 4KR5A 1B9JA 3RTFB 1R9QA 4LATA 5JEIA 1PBPA 4R6KA 5I2KB 2GH9A 2XXQA 4F1YA 4G8NA 3CRBA 3V89B 3PMVA 3T93B 4H8IA 1Y3QA 1R6ZA 3OO6A 2NXOA 1J1NA 1BKAA 4XXUA 4MF3A 1Y3NA 1Z7NE 2AL4A 1D9VA 1P1QA 4LZ8A 1NMUA 3V5AA 3I6VA 2HQ0A 1AIVA 4RXLA 3IO4A 2QS2A 4NWDA 3MAMA 1MPBA 3O29A 5ICQA 4DCXA 3KBRA 1I6QA 4IO6A 4M4GA 1HSJA 1TT1A 3I5OA 1LBBA 3CG1A 4LONB 1LFIA 3G3KA 2VGQA 1TWYA 4LP2B 1DMBA 4O3AA 2I4CA 3DM0A 1CE2A 3TFLA 4GOTA 1B2HA 4BDLA 3RNNA 3UK4A 3HCQA 1YAEA 3JYRA 1B5IA 4DCYA 4YKPA 2H4IA 3IK6B 4F3SA 3OEKA 3RLFE 2E0SA 1VR5A 1L5TA 2ZNUA 1NL5A 3KFMA 4FATA 3C36A 4BDRA 4ISUA 2XXIA 4KYSA 4R6HA 1URGA 3DLNA 4OEUA 2A5TB 1XT8A 2YJPA 2Z8FA 4X9TA 3OXNA 1RKMA 4NF8A 5JTYA 3OELA 2I48A 4EQBA 4QFKA 3OO7A 2RCAA 4H67A 1B3GA 2OCUA 4DLDA 3RTWB 1B7ZA 3MVWA 2PX1A 1XC1A 3G3JA 1QUKA 2G93A 4NTLA 3TDJA 1N04A 3M8UA 1B51A 1NH7A 4OQOA 1ZKBA 5CI5A 1H43A 3Q29A 4QSDA 5CC2A 2ANJA 2UXAA 1Y1ZA 2DYXA 4HW8A 4THIA 3MP6A 4NF5B 3PUYE 3VXCA 1ZIUA 4DZ1A 3ONMA 4ZDMA 2UVHA 2ZYNA 5TP9B 2V3UA 2UYFA 4P0GA 5H8QB 2XD2A 1SW5A 4RYAA 2R9JA 1P1UA 2GFEA 1Y1MA 2XXXA 4G68B 3T9UA 3MZ9A 4L17A 2DOJA 3UIFA 2I49A 5B7DA 4JXIA 3MUQA 5H8HA 2REJA 3EHSA 1LBCA 3LC8A 5IKBA 1R1NA 4LQ5A 3TYHA 5CMMA 1T0KA 3M3KA 1EZPA 2VOZA 1B5HA 4KPTA 1B5JA 4XKPA 2REGA 1ZLQA 4F22A 3N6UA 2O51A 1I6BA 1KWHA 2RC7A 3V8XB 4YKIA 2GHBA 4PETA 1IITA 3CFXA 2HZKA 2I6EA 2XX8A 4OFOA 2ONSA 1IQ7A 4FECA 4I8CA 1O7TA 1JVXA 1MRPA 4MH5A 4OTEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GVOA 4IO7A 1VFDA 3TODA 1QGXA 3BIHA 1Z7ME 1IXIA 2ZZXA 4ZZEA 1S9TA 1GTKA 3A3UA 3TZAA 3QAXA 2O7UA 2CMOA 2RINA 4GL0A 4EF1A 4PCDA 3E9XA 2DWJA 3LUYA 2WX9A 1K9YA 1INPA 4C1UA 1WDNA 2Q2CA 4AS5A 1A55A 1YCJA 5DVFA 2Z23A 5AA2B 4TQUQ 2Y5LA 1YZ0A 4I3YA 4GL8A 4BLAA 4F2QA 4QFOA 2ONRA 1MM7A 5DVJA 3W9WA 3QXMA 3K0VA 4PFIA 4X8RA 2QMWA 1H3DA 3TCHA 2XXWA 3IB2A 1N7XA 3HV1A 5CMBA 1A99A 3H3GA 2ZZVA 1EH3A 3T22A 3RPLA 5A5XB 3A29A 2QVUA 2QJEA 3T96B 1EZ9A 4LN5A 1BLFA 3DP8A 4TLLB 3S9MC 1NV5A 4GIZA 1QJMA 3VV5A 1H45A 1N3XA 4N13A 3GZGA 2Z8EA 2D5WA 3K6UA 2Q8JA 4ECFA 1YPNA 1FTKA 2OK2A 1NV1A 4FBPA 1SBPA 3VLVA 1A54A 4GF8A 1P1OA 5I59A 4H6DA 4JB7A 2Q8MA 5ICTA 3CSBA 1FPBA 3C31A 2UYEA 4QHQA 1MQDA 2DVCA 3KJ7A 1AL3A 4ESWA 2HZLA 4DI4B 4QBAA 2Z8DA 2I3VA 4OA4A 4YMAA 1ATGA 1KA1A 3ZKKA 1M5EA 3L6GA 4O3CA 3N94A 4PP0A 3ILTB 5I58B 4R2BA 4N91A 5EYHA 2CZLA 4EUOA 4NN3A 4GBVA 2B3BA 2DE2A 2XWVA 1EYKA 5DTBA 3SKPA 2G29A 3S9EA 1GR2A 3QUFA 2OJTA 4G8HA 2Y7RA 1US4A 4LA9A 4P56A 2F8DA 3UORA 3FIRA 4FORA 2F6GA 3IR1A 2GQ1A 5KCJB 3O6IA 4IR8A 1UTHA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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